がん関連遺伝子LGN/GPSM2
本発明は、LGN/GPSM2遺伝子の発現レベルの決定を含む、がんを検出および診断するための方法を提供する。さらに、本発明は、がんの治療または予防において有用な治療剤をスクリーニングする方法、および乳がんを治療するための方法を提供する。さらに、本発明は、がんの治療または予防において有用な、LGN/GPSM2遺伝子を標的化するsiRNAを提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項1】
対象由来の生物試料におけるLGN/GPSM2遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む、対象におけるがんまたはがん発症の素因を診断するための方法であって、
前記遺伝子の正常対照レベルと比べた前記発現レベルの増大が、前記対象ががんに罹患しているかまたはがんを発症するリスクがあることを示唆する、方法。
【請求項2】
発現レベルが正常対照レベルよりも少なくとも10%大きい、請求項1記載の方法。
【請求項3】
発現レベルが
(a)LGN/GPSM2遺伝子のmRNAを検出すること;
(b)LGN/GPSM2遺伝子によってコードされるタンパク質を検出すること;および
(c)LGN/GPSM2遺伝子によってコードされるタンパク質の生物活性を検出すること
からなる群より選択される方法のいずれかによって決定される、請求項1記載の方法。
【請求項4】
対象由来の生物試料が生検材料である、請求項1記載の方法。
【請求項5】
がんが乳がんである、請求項1記載の方法。
【請求項6】
LGN/GPSM2遺伝子の転写産物または翻訳産物に結合する検出試薬を含む、がんを診断または検出するためのキット。
【請求項7】
がんが乳がんである、請求項6記載のキット。
【請求項8】
(a)LGN/GPSM2ポリペプチドまたはその断片と試験化合物とを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチドまたは断片と試験化合物との間の結合を検出する段階;および
(c)前記ポリペプチドまたは断片に結合する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項9】
(a)LGN/GPSM2ポリペプチドまたはその断片と試験化合物とを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチドまたは断片の生物活性を検出する段階;
(c)前記ポリペプチドまたは断片の生物活性を、試験化合物の非存在下で検出された生物活性と比較する段階;および
(d)前記ポリペプチドの生物活性を抑制する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項10】
生物活性が細胞増殖活性またはDNA合成増強活性である、請求項9記載の方法。
【請求項11】
(a)LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞と試験化合物とを接触させる段階;
(b)LGN/GPSM2遺伝子の発現レベルを検出する段階;
(c)前記発現レベルを、試験化合物の非存在下で検出された発現レベルと比較する段階;および
(d)前記発現レベルを低減する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項12】
(a)LGN/GPSM2遺伝子の転写調節領域と該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターを導入した細胞に、試験化合物を接触させる段階;
(b)前記レポーター遺伝子の発現レベルまたは活性を測定する段階;
(c)前記発現レベルまたは活性を、試験化合物の非存在下で検出された発現レベルまたは活性と比較する段階;ならびに
(d)前記発現レベルまたは活性を低減する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項13】
(a)試験化合物の存在下で、TRIOBP/taraポリペプチドのLGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドとLGN/GPSM2ポリペプチドのTRIOBP/tara結合ドメインを含むポリペプチドとを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチド間の結合を検出する段階;および
(c)前記ポリペプチド間の結合を阻害する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項14】
TRIOBP/tara結合ドメインを含むポリペプチドが、LGN/GPSM2ポリペプチドを含む、請求項13記載の方法。
【請求項15】
LGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドが、TRIOBP/taraポリペプチドを含む、請求項13記載の方法。
【請求項16】
(a)試験化合物の存在下で、PBK/TOPKポリペプチドのLGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドとLGN/GPSM2ポリペプチドのPBK/TOPK結合ドメインを含むポリペプチドとを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチド間の結合またはLGN/GPSM2ポリペプチドのPBK/TOPK結合ドメインを含むポリペプチドのリン酸化レベルを検出する段階;および
(c)前記ポリペプチド間の結合またはLGN/GPSM2のリン酸化レベルを阻害する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項17】
PBK/TOPK結合ドメインを含むポリペプチドが、LGN/GPSM2ポリペプチドを含む、請求項16記載の方法。
【請求項18】
LGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドが、PBK/TOPKポリペプチドを含む、請求項16記載の方法。
【請求項19】
(a)リン酸化に適した条件の下、試験化合物の存在下でタンパク質キナーゼとLGN/GPSM2ポリペプチドまたはその機能的等価物とを接触させる段階;
(b)SEQ ID NO:53のアミノ酸配列中のSer401、Thr519、および/またはSer558に対応する一つまたは二つのセリン残基および/またはトレオニン残基での、LGN/GPSM2ポリペプチドまたはその機能的等価物のリン酸化レベルを検出する段階;
(c)前記リン酸化レベルを、試験化合物の非存在下で検出された発現レベルまたは活性と比較する段階;ならびに
(d)前記リン酸化レベルを低減する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項20】
がんが乳がんである、請求項8、9、11、12、13、16、または19のいずれか一項記載の方法。
【請求項21】
センス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖分子であって、センス鎖がSEQ ID NO:20または21からなる標的配列に対応するヌクレオチド配列を含み、かつアンチセンス鎖が該センス鎖に相補的なヌクレオチド配列を含み、かつ前記二本鎖分子が、LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞に導入された場合に、該遺伝子の発現を阻害する、二本鎖分子。
【請求項22】
センス鎖が標的配列の位置でアンチセンス鎖とハイブリダイズして、19〜25ヌクレオチド対の長さを有する二本鎖分子を形成する、請求項21記載の二本鎖分子。
【請求項23】
一本鎖ヌクレオチド配列を介して連結されたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む単一のオリゴヌクレオチドである、請求項21記載の二本鎖分子。
【請求項24】
ポリヌクレオチドが一般式5’−[A]−[B]−[A’]−3’を有し、
式中[A]が、SEQ ID NO:20または21を含むヌクレオチド配列であり;[B]が、約3〜約23ヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり;かつ[A’]が[A]に相補的なヌクレオチド配列である、
請求項21記載の二本鎖分子。
【請求項25】
センス鎖核酸およびアンチセンス鎖核酸を含むポリヌクレオチドの組み合わせの各々または両方を含むベクターであって、センス鎖核酸がSEQ ID NO:20または21のヌクレオチド配列を含み、かつアンチセンス鎖が該センス鎖に相補的なヌクレオチド配列を含み、該センス鎖および該アンチセンス鎖の転写産物が互いとハイブリダイズして二本鎖分子を形成し、かつ前記ベクターが、LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞に導入された場合に、該遺伝子の発現を阻害する、ベクター。
【請求項26】
センス鎖核酸およびアンチセンス鎖核酸を含むポリヌクレオチドの組み合わせの各々を含むベクターであって、センス鎖核酸がSEQ ID NO:20または21のヌクレオチド配列を含み、かつアンチセンス鎖核酸がセンス鎖に相補的な配列からなり、該センス鎖および該アンチセンス鎖の転写産物が互いとハイブリダイズして二本鎖分子を形成し、かつ前記ベクターが、LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞に導入された場合に、該遺伝子の発現を阻害する、ベクター。
【請求項27】
ポリヌクレオチドが、約19〜25ヌクレオチドの長さのオリゴヌクレオチドである、請求項25または26記載のベクター。
【請求項28】
二本鎖分子が、一本鎖ヌクレオチド配列を介して連結されたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む単一のヌクレオチド転写産物である、請求項25記載のベクター。
【請求項29】
ポリヌクレオチドが一般式5’−[A]−[B]−[A’]−3’を有し、
式中[A]が、SEQ ID NO:20または21を含むヌクレオチド配列であり;[B]が、約3〜約23ヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり;かつ[A’]が[A]に相補的なヌクレオチド配列である、
請求項28記載のベクター。
【請求項30】
LGN/GPSM2遺伝子に対する二本鎖分子またはそれをコードするベクターの薬学的有効量、および薬学的に許容される担体を対象に投与する段階を含む、対象においてLGN/GPSM2を発現しているがんを治療または予防する方法であって、前記二本鎖分子が、LGN/GPSM2遺伝子の発現のみならずLGN/GPSM2遺伝子を発現している細胞との接触により細胞増殖も阻害する、方法。
【請求項31】
二本鎖分子が請求項21記載の二本鎖分子であり、かつベクターが請求項25または26記載のベクターである、請求項30記載の方法。
【請求項32】
LGN/GPSM2を発現するがんが乳がんまたは肝細胞がんである、請求項30記載の方法。
【請求項33】
LGN/GPSM2遺伝子に対する二本鎖分子またはそれをコードするベクターの薬学的有効量、および薬学的に許容される担体を含む、がんを治療または予防するための組成物であって、前記二本鎖分子が、LGN/GPSM2遺伝子の発現のみならずLGN/GPSM2遺伝子を発現している細胞との接触により細胞増殖も阻害する、組成物。
【請求項34】
二本鎖分子が請求項21記載の二本鎖分子であり、かつベクターが請求項25または26記載のベクターである、請求項33記載の組成物。
【請求項35】
がんが乳がんである、請求項33記載の組成物。
【請求項36】
SEQ ID NO:39のヌクレオチド配列を含む単離された核酸。
【請求項1】
対象由来の生物試料におけるLGN/GPSM2遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む、対象におけるがんまたはがん発症の素因を診断するための方法であって、
前記遺伝子の正常対照レベルと比べた前記発現レベルの増大が、前記対象ががんに罹患しているかまたはがんを発症するリスクがあることを示唆する、方法。
【請求項2】
発現レベルが正常対照レベルよりも少なくとも10%大きい、請求項1記載の方法。
【請求項3】
発現レベルが
(a)LGN/GPSM2遺伝子のmRNAを検出すること;
(b)LGN/GPSM2遺伝子によってコードされるタンパク質を検出すること;および
(c)LGN/GPSM2遺伝子によってコードされるタンパク質の生物活性を検出すること
からなる群より選択される方法のいずれかによって決定される、請求項1記載の方法。
【請求項4】
対象由来の生物試料が生検材料である、請求項1記載の方法。
【請求項5】
がんが乳がんである、請求項1記載の方法。
【請求項6】
LGN/GPSM2遺伝子の転写産物または翻訳産物に結合する検出試薬を含む、がんを診断または検出するためのキット。
【請求項7】
がんが乳がんである、請求項6記載のキット。
【請求項8】
(a)LGN/GPSM2ポリペプチドまたはその断片と試験化合物とを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチドまたは断片と試験化合物との間の結合を検出する段階;および
(c)前記ポリペプチドまたは断片に結合する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項9】
(a)LGN/GPSM2ポリペプチドまたはその断片と試験化合物とを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチドまたは断片の生物活性を検出する段階;
(c)前記ポリペプチドまたは断片の生物活性を、試験化合物の非存在下で検出された生物活性と比較する段階;および
(d)前記ポリペプチドの生物活性を抑制する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項10】
生物活性が細胞増殖活性またはDNA合成増強活性である、請求項9記載の方法。
【請求項11】
(a)LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞と試験化合物とを接触させる段階;
(b)LGN/GPSM2遺伝子の発現レベルを検出する段階;
(c)前記発現レベルを、試験化合物の非存在下で検出された発現レベルと比較する段階;および
(d)前記発現レベルを低減する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項12】
(a)LGN/GPSM2遺伝子の転写調節領域と該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターを導入した細胞に、試験化合物を接触させる段階;
(b)前記レポーター遺伝子の発現レベルまたは活性を測定する段階;
(c)前記発現レベルまたは活性を、試験化合物の非存在下で検出された発現レベルまたは活性と比較する段階;ならびに
(d)前記発現レベルまたは活性を低減する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項13】
(a)試験化合物の存在下で、TRIOBP/taraポリペプチドのLGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドとLGN/GPSM2ポリペプチドのTRIOBP/tara結合ドメインを含むポリペプチドとを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチド間の結合を検出する段階;および
(c)前記ポリペプチド間の結合を阻害する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項14】
TRIOBP/tara結合ドメインを含むポリペプチドが、LGN/GPSM2ポリペプチドを含む、請求項13記載の方法。
【請求項15】
LGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドが、TRIOBP/taraポリペプチドを含む、請求項13記載の方法。
【請求項16】
(a)試験化合物の存在下で、PBK/TOPKポリペプチドのLGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドとLGN/GPSM2ポリペプチドのPBK/TOPK結合ドメインを含むポリペプチドとを接触させる段階;
(b)前記ポリペプチド間の結合またはLGN/GPSM2ポリペプチドのPBK/TOPK結合ドメインを含むポリペプチドのリン酸化レベルを検出する段階;および
(c)前記ポリペプチド間の結合またはLGN/GPSM2のリン酸化レベルを阻害する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項17】
PBK/TOPK結合ドメインを含むポリペプチドが、LGN/GPSM2ポリペプチドを含む、請求項16記載の方法。
【請求項18】
LGN/GPSM2結合ドメインを含むポリペプチドが、PBK/TOPKポリペプチドを含む、請求項16記載の方法。
【請求項19】
(a)リン酸化に適した条件の下、試験化合物の存在下でタンパク質キナーゼとLGN/GPSM2ポリペプチドまたはその機能的等価物とを接触させる段階;
(b)SEQ ID NO:53のアミノ酸配列中のSer401、Thr519、および/またはSer558に対応する一つまたは二つのセリン残基および/またはトレオニン残基での、LGN/GPSM2ポリペプチドまたはその機能的等価物のリン酸化レベルを検出する段階;
(c)前記リン酸化レベルを、試験化合物の非存在下で検出された発現レベルまたは活性と比較する段階;ならびに
(d)前記リン酸化レベルを低減する試験化合物を、がんを治療または予防するための候補化合物として選択する段階
を含む、がんを治療または予防するための候補化合物をスクリーニングする方法。
【請求項20】
がんが乳がんである、請求項8、9、11、12、13、16、または19のいずれか一項記載の方法。
【請求項21】
センス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖分子であって、センス鎖がSEQ ID NO:20または21からなる標的配列に対応するヌクレオチド配列を含み、かつアンチセンス鎖が該センス鎖に相補的なヌクレオチド配列を含み、かつ前記二本鎖分子が、LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞に導入された場合に、該遺伝子の発現を阻害する、二本鎖分子。
【請求項22】
センス鎖が標的配列の位置でアンチセンス鎖とハイブリダイズして、19〜25ヌクレオチド対の長さを有する二本鎖分子を形成する、請求項21記載の二本鎖分子。
【請求項23】
一本鎖ヌクレオチド配列を介して連結されたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む単一のオリゴヌクレオチドである、請求項21記載の二本鎖分子。
【請求項24】
ポリヌクレオチドが一般式5’−[A]−[B]−[A’]−3’を有し、
式中[A]が、SEQ ID NO:20または21を含むヌクレオチド配列であり;[B]が、約3〜約23ヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり;かつ[A’]が[A]に相補的なヌクレオチド配列である、
請求項21記載の二本鎖分子。
【請求項25】
センス鎖核酸およびアンチセンス鎖核酸を含むポリヌクレオチドの組み合わせの各々または両方を含むベクターであって、センス鎖核酸がSEQ ID NO:20または21のヌクレオチド配列を含み、かつアンチセンス鎖が該センス鎖に相補的なヌクレオチド配列を含み、該センス鎖および該アンチセンス鎖の転写産物が互いとハイブリダイズして二本鎖分子を形成し、かつ前記ベクターが、LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞に導入された場合に、該遺伝子の発現を阻害する、ベクター。
【請求項26】
センス鎖核酸およびアンチセンス鎖核酸を含むポリヌクレオチドの組み合わせの各々を含むベクターであって、センス鎖核酸がSEQ ID NO:20または21のヌクレオチド配列を含み、かつアンチセンス鎖核酸がセンス鎖に相補的な配列からなり、該センス鎖および該アンチセンス鎖の転写産物が互いとハイブリダイズして二本鎖分子を形成し、かつ前記ベクターが、LGN/GPSM2遺伝子を発現する細胞に導入された場合に、該遺伝子の発現を阻害する、ベクター。
【請求項27】
ポリヌクレオチドが、約19〜25ヌクレオチドの長さのオリゴヌクレオチドである、請求項25または26記載のベクター。
【請求項28】
二本鎖分子が、一本鎖ヌクレオチド配列を介して連結されたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む単一のヌクレオチド転写産物である、請求項25記載のベクター。
【請求項29】
ポリヌクレオチドが一般式5’−[A]−[B]−[A’]−3’を有し、
式中[A]が、SEQ ID NO:20または21を含むヌクレオチド配列であり;[B]が、約3〜約23ヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり;かつ[A’]が[A]に相補的なヌクレオチド配列である、
請求項28記載のベクター。
【請求項30】
LGN/GPSM2遺伝子に対する二本鎖分子またはそれをコードするベクターの薬学的有効量、および薬学的に許容される担体を対象に投与する段階を含む、対象においてLGN/GPSM2を発現しているがんを治療または予防する方法であって、前記二本鎖分子が、LGN/GPSM2遺伝子の発現のみならずLGN/GPSM2遺伝子を発現している細胞との接触により細胞増殖も阻害する、方法。
【請求項31】
二本鎖分子が請求項21記載の二本鎖分子であり、かつベクターが請求項25または26記載のベクターである、請求項30記載の方法。
【請求項32】
LGN/GPSM2を発現するがんが乳がんまたは肝細胞がんである、請求項30記載の方法。
【請求項33】
LGN/GPSM2遺伝子に対する二本鎖分子またはそれをコードするベクターの薬学的有効量、および薬学的に許容される担体を含む、がんを治療または予防するための組成物であって、前記二本鎖分子が、LGN/GPSM2遺伝子の発現のみならずLGN/GPSM2遺伝子を発現している細胞との接触により細胞増殖も阻害する、組成物。
【請求項34】
二本鎖分子が請求項21記載の二本鎖分子であり、かつベクターが請求項25または26記載のベクターである、請求項33記載の組成物。
【請求項35】
がんが乳がんである、請求項33記載の組成物。
【請求項36】
SEQ ID NO:39のヌクレオチド配列を含む単離された核酸。
【図1】
【図2】
【図3A】
【図3B】
【図3C】
【図3D】
【図3E】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9A】
【図9B】
【図9C】
【図9D】
【図9E】
【図9F】
【図10】
【図11】
【図2】
【図3A】
【図3B】
【図3C】
【図3D】
【図3E】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9A】
【図9B】
【図9C】
【図9D】
【図9E】
【図9F】
【図10】
【図11】
【公表番号】特表2012−501169(P2012−501169A)
【公表日】平成24年1月19日(2012.1.19)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2011−509345(P2011−509345)
【出願日】平成21年8月21日(2009.8.21)
【国際出願番号】PCT/JP2009/004017
【国際公開番号】WO2010/023854
【国際公開日】平成22年3月4日(2010.3.4)
【出願人】(502240113)オンコセラピー・サイエンス株式会社 (142)
【Fターム(参考)】
【公表日】平成24年1月19日(2012.1.19)
【国際特許分類】
【出願日】平成21年8月21日(2009.8.21)
【国際出願番号】PCT/JP2009/004017
【国際公開番号】WO2010/023854
【国際公開日】平成22年3月4日(2010.3.4)
【出願人】(502240113)オンコセラピー・サイエンス株式会社 (142)
【Fターム(参考)】
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