アルツハイマー病の診断方法およびそのためのキット

【課題】高い精度でアルツハイマー病を診断し得る方法およびそのためのキットを提供する。
【解決手段】６５の塩基配列のいずれかに示される核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る、および／または該塩基配列に相補的な核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸の中から、特定の３以上の遺伝子を組合わせてアルツハイマー病マーカー遺伝子とするアルツハイマー病の診断方法；ならびにそれらの遺伝子の発現レベルを検出するための試薬を含むキット。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
アルツハイマー病の発症または発症リスクの判定用キットであって、配列番号ｎ（ｎは１〜６５の整数）のいずれかに示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する３以上の試薬の組み合わせを含んでなり、当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、
（２）配列番号１８または配列番号４９に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、および
（３）配列番号３３または配列番号４５に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬
を少なくとも含む、キット。
【請求項２】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、
（２）配列番号１８に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、および
（３）配列番号３３または配列番号４５に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬
を少なくとも含む、請求項１記載のキット。
【請求項３】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、
（２）配列番号１８に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、および
（３）配列番号４５に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬
を少なくとも含む、請求項２記載のキット。
【請求項４】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、
（２）配列番号１８に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、および
（３）配列番号３３に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬
を少なくとも含む、請求項２記載のキット。
【請求項５】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、
（２）配列番号４９に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬、および
（３）配列番号４５に示される塩基配列を含む塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸、および／または該塩基配列に相補的な塩基配列からなる核酸とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸を含有する試薬
を少なくとも含む、請求項１記載のキット。
【請求項６】
前記試薬に各々含有される前記核酸がプローブであり、当該キットが、該プローブが固相に固定化されたチップを含む、請求項１〜５のいずれか１項記載のキット。
【請求項７】
アルツハイマー病の発症または発症リスクの判定方法であって、以下のステップ：
（Ｉ）対象とする個体から採取された生体試料について、配列番号ｎ（ｎは１〜６５の整数）のいずれかにそれぞれ示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる３以上の遺伝子の発現レベルを測定するステップ；および
（ＩＩ）ステップ（Ｉ）において得られた各遺伝子の発現レベルと、アルツハイマー病の発症または発症リスクについての与えられた判別基準とに基づいて、対象とする個体におけるアルツハイマー病の発症または発症リスクを決定するステップ
を含み、当該判別基準は、アルツハイマー病を発症しているかまたは発症リスクを有することが既知である個体からそれぞれ採取された１以上の生体試料およびアルツハイマー病を発症しておらずかつ発症リスクを有しないことが既知である個体からそれぞれ採取された１以上の生体試料について、ステップ（Ｉ）において発現レベルを測定される遺伝子の発現レベルを測定し、個体ごとに得られた各遺伝子の発現レベルを用いて多変量解析を行うことによって得られたものであり、かつ、
ステップ（Ｉ）において発現レベルを測定される遺伝子の組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、
（２）配列番号１８または配列番号４９に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、および
（３）配列番号３３または配列番号４５に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子
を少なくとも含む、方法。
【請求項８】
多変量解析が主成分分析および線形判別分析を含み、与えられる判別基準が下記式：
【数１】

（式中、
【数２】

であり、
ｋはステップ（Ｉ）において発現レベルを測定される遺伝子の個数であり、
ε_iはステップ（Ｉ）で得られたi番目の遺伝子の発現レベルであり、
a、b、cおよびdは線形判別分析によって決定される定数であり、
P_1i、P_2i、P_3iは、i番目の遺伝子に対して、主成分分析によって決定される固有ベクトルの、第１〜第３主成分にそれぞれ対応する構成要素であり、
μ_iおよびσ_iは、それぞれ、当該判別基準の決定のために前記の各遺伝子の発現レベルを測定される全ての試料についてのi番目の遺伝子の発現レベルの平均および標準偏差である。）
であって、前記ステップ（Ｉ）で得られた各遺伝子の発現レベルを用いて算出される値Ａについて、Ａ＞０であればアルツハイマー病を発症しているかまたはその発症リスクを有すると、Ａ＜０であればアルツハイマー病を発症しておらずかつその発症リスクを有しないと、Ａ＝０であれば判別不能であると決定し得るものである、
請求項７記載の方法。
【請求項９】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、
（２）配列番号１８に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、および
（３）配列番号３３または配列番号４５に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子
を少なくとも含む、請求項７または８記載の方法。
【請求項１０】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、
（２）配列番号１８に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、および
（３）配列番号４５に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子
を少なくとも含む、請求項９記載の方法。
【請求項１１】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、
（２）配列番号１８に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、および
（３）配列番号３３に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子
を少なくとも含む、請求項９記載の方法。
【請求項１２】
当該組み合わせが、
（１）配列番号３に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、
（２）配列番号４９に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子、および
（３）配列番号４５に示される塩基配列と同一もしくは実質的に同一の塩基配列を含む塩基配列からなる遺伝子
を少なくとも含む、請求項７または８記載の方法。
【請求項１３】
前記３以上の遺伝子の発現レベルの測定が、それらの遺伝子の発現レベルを各々検出し得る核酸を固相に固定化したチップを用いて為される、請求項７〜１２のいずれか１項記載の方法。

【図２】