説明

イソプロパノールならびに第一級アルコール、ジオールおよび酸の共生成のための微生物ならびに方法

本発明は、n−プロパノールおよびイソプロパノールの経路、1,4−ブタンジオール(14−BDO)およびイソプロパノールの経路、1,3−ブタンジオール(13−BDO)およびイソプロパノールの経路、またはメチルアクリル酸(MAA)およびイソプロパノールの経路を有している天然に存在しない微生物を提供する。上記微生物は、n−プロパノール、14−BDO、13−BDOまたはMAAとイソプロパノールとの経路のそれぞれにおける酵素をコードしている外来性の核酸を少なくとも1つ含んでいる。本発明は、n−プロパノールおよびイソプロパノール、14−BDOおよびイソプロパノール、13−BDOおよびイソプロパノール、またはMAAおよびイソプロパノールを共生成させる方法をさらに提供する。当該方法は、n−プロパノールおよびイソプロパノールを共生成する微生物を培養することを包含し得る。当該微生物は、n−プロパノール経路、イソプロパノール経路、14−BDO経路、13−BDO経路および/またはMAA経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を、各産物を生成させるために十分な時間にわたって、各産物を生成させるための十分な量において発現している。


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【特許請求の範囲】
【請求項1】
n−プロパノール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記n−プロパノール経路は、プロパノール脱水素酵素、プロピオンアルデヒド脱水素酵素、プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、プロピオニル−CoA加水分解酵素、プロピオニル−CoA転移酵素、プロピオニル−CoA合成酵素、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸還元酵素、またはリン酸プロピオニル還元酵素を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノール脱水素酵素、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ、アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA加水分解酵素、アセトアセチル−CoA合成酵素、またはアセト酢酸脱水素酵素を含んでいる、天然に存在しない微生物。
【請求項2】
アセチル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるアセチル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでいるアセチル−CoA経路をさらに含んでおり、
上記アセチル−CoA経路は、ピルビン酸キナーゼ、ピルビン酸脱水素酵素、ピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素、ピルビン酸蟻酸リアーゼ、ピルビン酸蟻酸リアーゼを活性化させる酵素、または蟻酸脱水素酵素を含んでいる、請求項1に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項3】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
上記プロピオニル−CoA経路は、PEPカルボキシキナーゼ、PEPカルボキシラーゼ、リンゴ酸脱水素酵素、フマラーゼ、フマル酸還元酵素、スクシニル−CoA転移酵素、スクシニル−CoA合成酵素、メチルマロニル−CoA転位酵素、メチルマロニルCoAエピメラーゼ、またはメチルマロニル−CoAデカルボキシラーゼを含んでいる、請求項1に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項4】
上記プロピオニル−CoA経路は、ピルビン酸カルボキシラーゼまたはメチルマロニル−CoAカルボキシ転移酵素をさらに含んでいる、請求項3に記載の天然に存在しない微生物
【請求項5】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
上記プロピオニル−CoA経路は、PEPカルボキシキナーゼ、PEPカルボキシラーゼ、スレオニン脱アミノ酵素または2−オキソブタン酸脱水素酵素を含んでいる、請求項1に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項6】
上記n−プロパノール経路は2−オキソブタン酸デカルボキシラーゼをさらに含んでいる、請求項5に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項7】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
上記プロピオニル−CoA経路は、アセチル−CoAカルボキシラーゼ、マロニル−CoA還元酵素、マロン酸セミアルデヒド還元酵素またはプロピオニル−CoA合成酵素を含んでいる、請求項1に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項8】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
上記プロピオニル−CoA経路は、乳酸脱水素酵素、乳酸−CoA転移酵素、ラクチル−CoA脱水酵素またはアクリロイル−CoA還元酵素を含んでいる、請求項1に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項9】
n−プロパノール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、
プロピオンアルデヒド脱水素酵素およびプロパノール脱水素酵素;
プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、リン酸プロピオニル還元酵素およびプロパノール脱水素酵素;
プロピオン酸キナーゼ、リン酸プロピオニル還元酵素、プロパノール脱水素酵素およびプロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;または
プロピオン酸還元酵素、プロパノール脱水素酵素およびプロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素またはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;ならびにイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項10】
アセチル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるアセチル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるアセチル−CoA経路をさらに含んでおり、
外来性の核酸の上記第3の組は、(a)ピルビン酸キナーゼ;ならびに(b1)ピルビン酸脱水素酵素もしくはピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素、または(b2)ピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素および蟻酸脱水素酵素をコードしている、請求項9に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項11】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
外来性の核酸の上記第3の組は、PEPカルボキシキナーゼまたはPEPカルボキシラーゼ;リンゴ酸脱水素酵素;フマラーゼ;フマル酸還元酵素;スクシニル−CoA転移酵素またはスクシニル−CoA合成酵素;メチルマロニル−CoA転位酵素;ならびにメチルマロニル−CoAデカルボキシラーゼをコードしている、請求項9に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項12】
外来性の核酸の第3の組は、メチルマロニル−CoAエピメラーゼ、ピルビン酸カルボキシラーゼまたはメチルマロニル−CoAカルボキシ転移酵素をさらにコードしている、請求項11に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項13】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
外来性の核酸の上記第3の組は、PEPカルボキシキナーゼまたはPEPカルボキシラーゼ;スレオニン脱アミノ酵素;ならびに2−オキソブタン酸脱水素酵素をコードしている、請求項9に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項14】
外来性の核酸の上記第3の組は、メチルマロニル−CoAカルボキシ転移酵素またはピルビン酸カルボキシラーゼをさらにコードしている、請求項13に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項15】
外来性の核酸の上記第2の組は2−オキソブタン酸デカルボキシラーゼをさらにコードしている、請求項13に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項16】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
外来性の核酸の上記第3の組は、アセチル−CoAカルボキシラーゼ;マロニル−CoA還元酵素;マロン酸セミアルデヒド還元酵素;およびプロピオニル−CoA合成酵素をコードしている、請求項9に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項17】
プロピオニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるプロピオニル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるプロピオニル−CoA経路をさらに含んでおり、
外来性の核酸の第3の組は、乳酸脱水素酵素;乳酸−CoA転移酵素;ラクチル−CoA脱水酵素;およびアクリロイル−CoA還元酵素をコードしている、請求項9に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項18】
n−プロパノール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、(a)PEPカルボキシキナーゼもしくはPEPカルボキシラーゼ、リンゴ酸脱水素酵素、フマラーゼ、フマル酸還元酵素、スクシニル−CoA転移酵素またはスクシニル−CoA合成酵素、メチルマロニル−CoA転位酵素、メチルマロニル−CoAデカルボキシラーゼ、プロピオンアルデヒド脱水素酵素およびプロパノール脱水素酵素;(b)プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素およびリン酸プロピオニル還元酵素;(c)プロピオン酸キナーゼ、リン酸プロピオニル還元酵素、プロパノール脱水素酵素およびプロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;または(d)プロピオン酸還元酵素、プロパノール脱水素酵素およびプロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、(e)ピルビン酸キナーゼ;(f)ピルビン酸脱水素酵素もしくはピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素;またはピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素および蟻酸脱水素酵素;(g)アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;(h)アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素またはアセトアセチル−CoA合成酵素;(i)アセト酢酸デカルボキシラーゼ;ならびに(j)イソプロパノール脱水素酵をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項19】
外来性の核酸の上記第1の組は、メチルマロニル−CoAエピメラーゼ、ピルビン酸カルボキシラーゼまたはメチルマロニル−CoAカルボキシ転移酵素をさらにコードしている、請求項18に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項20】
n−プロパノール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、以下の(a)〜(c):
(a)PEPカルボキシキナーゼまたはPEPカルボキシラーゼ;
(b)スレオニン脱アミノ酵素;ならびに
(c)以下の(c1)〜(c5)のいずれか:
(c1)2−オキソブタン酸デカルボキシラーゼおよびプロパノール脱水素酵素;
(c2)2−オキソブタン酸脱水素酵素、プロピオンアルデヒド脱水素酵素およびプロパノール脱水素酵素;
(c3)2−オキソブタン酸脱水素酵素、プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、リン酸プロピオニル還元酵素およびプロパノール脱水素酵素;
(c4)2−オキソブタン酸脱水素酵素;プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸キナーゼ;リン酸プロピオニル還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素;または
(c5)2−オキソブタン酸脱水素酵素;プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、(d)ピルビン酸キナーゼ;(e)ピルビン酸脱水素酵素もしくはピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素;またはピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素および蟻酸脱水素酵素;(f)アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;(g)アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;(h)アセト酢酸デカルボキシラーゼ;ならびに(i)イソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項21】
外来性の核酸の上記第2の組は、メチルマロニル−CoAデカルボキシラーゼまたはピルビン酸カルボキシラーゼをさらにコードしている、請求項20に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項22】
n−プロパノール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、以下の(a)〜(g):
(a)ピルビン酸キナーゼ;
(b)ピルビン酸脱水素酵素もしくはピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素;またはピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素および蟻酸脱水素酵素;
(c)アセチル−CoAカルボキシラーゼ;
(d)マロニル−CoA還元酵素;
(e)マロン酸セミアルデヒド還元酵素;
(f)プロピオニル−CoA合成酵素;ならびに
(g)以下の(g1)〜(g4)のいずれか:
(g1)プロピオンアルデヒド脱水素酵素およびプロパノール脱水素酵素;
(g2)プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、リン酸プロピオニル還元酵素およびプロパノール脱水素酵素;
(g3)プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸キナーゼ;リン酸プロピオニル還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素;または
(g4)プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸還元酵素およびプロパノール脱水素酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項23】
n−プロパノール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、以下の(a)〜(e):
(a)乳酸脱水素酵素;
(b)乳酸−CoA転移酵素;
(c)ラクチル−CoA脱水酵素;
(d)アクリロイル−CoA還元酵素;ならびに
(e)以下の(e1)〜(e4)のいずれか:
(e1)プロピオンアルデヒド脱水素酵素およびプロパノール脱水素酵素;
(e2)プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、リン酸プロピオニル還元酵素およびプロパノール脱水素酵素;
(e3)プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸キナーゼ;リン酸プロピオニル還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素;
(e4)プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、(f)ピルビン酸脱水素酵素もしくはピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素;またはピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素および蟻酸脱水素酵素;(g)アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;(h)アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;(i)アセト酢酸デカルボキシラーゼ;ならびに(j)イソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項24】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項1〜23のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項25】
実質的に嫌気性の培養培地に入れられている、請求項1〜23のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項26】
n−プロパノールおよびイソプロパノールを生成させるために十分な期間にわたって、n−プロパノールおよびイソプロパノールを生成させる条件において、請求項1〜23のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物を培養することを包含している、n−プロパノールおよびイソプロパノールを生成させる方法。
【請求項27】
上記条件は実質的に嫌気性の培養条件を包含している、請求項26に記載の方法。
【請求項28】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項26に記載の方法。
【請求項29】
n−プロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記n−プロパノール経路は、プロパノール脱水素酵素、プロピオンアルデヒド脱水素酵素、プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素、プロピオニル−CoA合成酵素、プロピオン酸キナーゼ、プロピオン酸還元酵素、またはリン酸プロピオニル還元酵素を含んでいる、天然に存在しない微生物。
【請求項30】
n−プロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記n−プロパノール経路は、n−プロパノールを生成させるための十分な量において発現されるn−プロパノール経路の酵素をコードしている1組の外来性の核酸を含んでおり、
上記1組の外来性の核酸は、(a)プロピオンアルデヒド脱水素酵素およびプロパノール脱水素酵素;(b)プロピオニル−CoA:リン酸プロパノイル転移酵素、リン酸プロピオニル還元酵素およびプロパノール脱水素酵素;(c)プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸キナーゼ;リン酸プロピオニル還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素;または(d)プロピオニル−CoA水素化酵素、プロピオニル−CoA転移酵素もしくはプロピオニル−CoA合成酵素;プロピオン酸還元酵素;およびプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項31】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項29または30に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項32】
実質的に嫌気性の培養培地に入れられている、請求項29または30に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項33】
n−プロパノールを生成させるための十分な期間にわたって、n−プロパノールを生成させるための条件において、請求項29または30に記載の天然に存在しない微生物を培養することを包含している、n−プロパノールを生成させる方法。
【請求項34】
上記条件は実質的に嫌気性の培養条件を包含している、請求項33に記載の方法。
【請求項35】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項33に記載の方法。
【請求項36】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記1,4−ブタンジオール経路は、4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素、スクシニル−CoA還元酵素、コハク酸還元酵素、4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成)、リン酸4−ヒドロキシブチリル還元酵素、4−ヒドロキシ酪酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ、4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素、または4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノール脱水素酵素、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ、アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素、アセトアセチル−CoA合成酵素、またはアセト酢酸デカルボキシラーゼを含んでいる、天然に存在しない微生物。
【請求項37】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3ブタンジオール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記1,3−ブタンジオール経路は、3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素、スクシニル−CoA還元酵素、コハク酸還元酵素、4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素、4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ、4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素、クロトナーゼ、3−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA水素化酵素、3−ヒドロキシ酪酸還元酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成)、または3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノール脱水素酵素、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ、アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素、アセトアセチル−CoA合成酵素、またはアセト酢酸デカルボキシラーゼを含んでいる、天然に存在しない微生物。
【請求項38】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記メチルアクリル酸経路は、4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素、スクシニル−CoA還元酵素、コハク酸還元酵素、4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素、4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ、4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA脱水酵素、メタクリリル−CoA転移酵素、メタクリリル−CoA合成酵素、メタクリリル−CoA水素化酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA合成酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水素化酵素、3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素、メチルマロニル−CoA転位酵素、メチルマロニル−CoAエピメラーゼ、メチルマロニル−CoA転移酵素、メチルマロニル−CoA合成酵素、メチルマロニル−CoA水素化酵素、メチルマロン酸還元酵素、メチルマロニル−CoA還元酵素(アルデヒド形成)、3−ヒドロキシイソ酪酸脱水素酵素、メチルマロニル−CoA還元酵素(アルコール形成)、または3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている少なくとも1つの外来性の核酸を含んでおり、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノール脱水素酵素、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ、アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素、アセトアセチル−CoA合成酵素、またはアセト酢酸デカルボキシラーゼを含んでいる、天然に存在しない微生物。
【請求項39】
アセチル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるアセチル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つ外来性の核酸を含んでいるアセチル−CoA経路をさらに含んでいる天然に存在しない微生物であって、
上記アセチル−CoA経路は、ピルビン酸キナーゼ、ピルビン酸脱水素酵素、ピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素、または蟻酸脱水素酵素を含んでいる、請求項36〜38のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項40】
スクシニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるスクシニル−CoA経路の酵素をコードしている少なくとも1つ外来性の核酸を含んでいるスクシニル−CoA経路をさらに含んでいる天然に存在しない微生物であって、
上記スクシニル−CoA経路は、PEPカルボキシキナーゼ、PEPカルボキシラーゼ、リンゴ酸脱水素酵素、フマラーゼ、フマル酸還元酵素、スクシニル−CoA転移酵素、またはスクシニル−CoA合成酵素を含んでいる請求項36〜38のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項41】
上記スクシニル−CoA経路は、ピルビン酸カルボキシラーゼまたはメチルマロニル−CoAカルボキシ転移酵素をさらに含んでいる、請求項40に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項42】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項43】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸還元酵素;および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項44】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項45】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、
スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;リン酸4−ヒドロキシブチリル還元酵素;および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項46】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;および4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項47】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;および4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項48】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項49】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸還元酵素;および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項50】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項51】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;リン酸4−ヒドロキシブチリル還元酵素;および4−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項52】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;および4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項53】
1,4−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,4−ブタンジオール経路は、1,4−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,4−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;および4−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項54】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項55】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシブチリル−CoA水素化酵素;3−ヒドロキシ酪酸還元酵素;および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項56】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項57】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシブチリル−CoA水素化酵素;3−ヒドロキシ酪酸還元酵素;および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項58】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;および3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項59】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;および3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項60】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項61】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシブチリル−CoA水素化酵素;3−ヒドロキシ酪酸還元酵素;および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項62】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項63】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;3−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシブチリル−CoA水素化酵素;3−ヒドロキシ酪酸還元酵素;および3−ヒドロキシブチルアルデヒド還元酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項64】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;クロトナーゼ;および3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項65】
1,3−ブタンジオール経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記1,3−ブタンジオール経路は、1,3−ブタンジオールを生成させるための十分な量において発現される1,3−ブタンジオール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA脱水酵素;クロトナーゼ;および3−ヒドロキシブチリル−CoA還元酵素(アルコール形成)をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項66】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水素化酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項67】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA脱水酵素;およびメタクリリル−CoA転移酵素、メタクリリル−CoA合成酵素もしくはメタクリリル−CoA水素化酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項68】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水素化酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項69】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、スクシニル−CoA還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA脱水酵素;およびメタクリリル−CoA転移酵素、メタクリリル−CoA合成酵素もしくはメタクリリル−CoA水素化酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項70】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水素化酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項71】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転移酵素もしくは4−ヒドロキシブチリル−CoA合成酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA脱水酵素;およびメタクリリル−CoA転移酵素、メタクリリル−CoA合成酵素もしくはメタクリリル−CoA水素化酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項72】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA転移酵素、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA合成酵素もしくは3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水素化酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項73】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、コハク酸還元酵素;4−ヒドロキシ酪酸脱水素酵素;4−ヒドロキシ酪酸キナーゼ;4−ヒドロキシブチリルリン酸転移酵素;4−ヒドロキシブチリル−CoA転位酵素;3−ヒドロキシイソブチリル−CoA脱水酵素;およびメタクリリル−CoA転移酵素、メタクリリル−CoA合成酵素もしくはメタクリリル−CoA水素化酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項74】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、メチルマロニル−CoA転位酵素;メチルマロニル−CoA還元酵素(アルデヒド形成);3−ヒドロキシイソ酪酸脱水素酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項75】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、メチルマロニル−CoA転位酵素;メチルマロニル−CoAエピメラーゼ;メチルマロニル−CoA転移酵素、メチルマロニル−CoA合成酵素もしくはメチルマロニル−CoA水素化酵素;メチルマロン酸還元酵素;3−ヒドロキシイソ酪酸脱水素酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項76】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、メチルマロニル−CoA転位酵素;メチルマロニル−CoA転移酵素、メチルマロニル−CoA合成酵素もしくはメチルマロニル−CoA水素化酵素;メチルマロン酸還元酵素;3−ヒドロキシイソ酪酸脱水素酵素;および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項77】
メチルアクリル酸経路およびイソプロパノール経路を有している微生物を包含している天然に存在しない微生物であって、
上記メチルアクリル酸経路は、メチルアクリル酸を生成させるための十分な量において発現されるメチルアクリル酸経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第1の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第1の組は、メチルマロニル−CoA転位酵素;メチルマロニル−CoA還元酵素(アルコール形成);および3−ヒドロキシイソ酪酸脱水酵素をコードしており、
上記イソプロパノール経路は、イソプロパノールを生成させるための十分な量において発現されるイソプロパノール経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第2の組を含んでおり、
外来性の核酸の上記第2の組は、アセチル−CoAアセチルチオラーゼ;アセトアセチル−CoA転移酵素、アセトアセチル−CoA水素化酵素もしくはアセトアセチル−CoA合成酵素;アセト酢酸デカルボキシラーゼ;およびイソプロパノール脱水素酵素をコードしている、天然に存在しない微生物。
【請求項78】
アセチル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるアセチル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるアセチル−CoA経路をさらに含んでいる天然に存在しない微生物であって、
外来性の核酸の上記第3の組は、(a)ピルビン酸キナーゼ;ならびに(b1)ピルビン酸脱水素酵素もしくはピルビン酸フェレドキシン酸化還元酵素、または(b2)ピルビン酸蟻酸脱離酵素、ピルビン酸蟻酸脱離酵素を活性化させる酵素および蟻酸脱水素酵素をコードしている、請求項42〜77のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項79】
スクシニル−CoAを生成させるための十分な量において発現されるスクシニル−CoA経路の酵素をコードしている外来性の核酸の第3の組を含んでいるスクシニル−CoA経路をさらに含んでいる天然に存在しない微生物であって、
外来性の核酸の上記第3の組は、PEPカルボキシキナーゼ、PEPカルボキシラーゼ、リンゴ酸脱水素酵素、フマラーゼ、フマル酸還元酵素、スクシニル−CoA転移酵素およびスクシニル−CoA合成酵素をコードしている、請求項42〜77のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項80】
外来性の核酸の上記第3の組は、ピルビン酸カルボキシラーゼまたはメチルマロニル−CoAカルボキシ転移酵素をさらにコードしている、請求項79に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項81】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項36〜38および42〜77のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項82】
実質的に嫌気性の培養培地に入れられている、請求項36〜38および42〜77のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物。
【請求項83】
1,4−ブタンジオールおよびイソプロパノールを生成させるために十分な期間にわたって、1,4−ブタンジオールおよびイソプロパノールを生成させるための条件において、請求項36および42〜53のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物を培養することを包含している、1,4−ブタンジオールおよびイソプロパノールを生成させる方法。
【請求項84】
上記条件は実質的に嫌気性の培養条件を包含している、請求項83に記載の方法。
【請求項85】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項83に記載の方法。
【請求項86】
1,3−ブタンジオールおよびイソプロパノールを生成させるために十分な期間にわたって、1,3−ブタンジオールおよびイソプロパノールを生成させるための条件において、請求項37および54〜65のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物を培養することを包含している、1,3−ブタンジオールおよびイソプロパノールを生成させる方法。
【請求項87】
上記条件は実質的に嫌気性の培養条件を包含している、請求項86に記載の方法。
【請求項88】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項86に記載の方法。
【請求項89】
メチルアクリル酸およびイソプロパノールを生成させるために十分な期間にわたって、メチルアクリル酸およびイソプロパノールを生成させるための条件において、請求項38および67〜77のいずれか1項に記載の天然に存在しない微生物を培養することを包含している、メチルアクリル酸およびイソプロパノールを生成させる方法。
【請求項90】
上記条件は実質的に嫌気性の培養条件を包含している、請求項89に記載の方法。
【請求項91】
上記外来性の核酸は、異種の核酸である、請求項89に記載の方法。

【図1】
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【図2】
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【図3】
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【図4】
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【図5】
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【図6】
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【図7】
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【図8】
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【公表番号】特表2013−504326(P2013−504326A)
【公表日】平成25年2月7日(2013.2.7)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2012−528907(P2012−528907)
【出願日】平成22年9月9日(2010.9.9)
【国際出願番号】PCT/US2010/048318
【国際公開番号】WO2011/031897
【国際公開日】平成23年3月17日(2011.3.17)
【出願人】(504356052)ジェノマティカ・インコーポレイテッド (8)
【氏名又は名称原語表記】Genomatica, Inc.
【Fターム(参考)】