オートインデューサー−２の定量方法
【課題】オートインデューサー−２を定量するための手段を提供する。
【解決手段】本発明は、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とするオートインデューサー−２の定量方法に関する。
【解決手段】本発明は、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とするオートインデューサー−２の定量方法に関する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、オートインデューサー−２の定量方法およびオートインデューサー−２調節剤のスクリーニング方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
自然界において、微生物は様々な環境下で生存しなければならない。貧栄養、低温度、高温、ｐＨ変化はもちろんのこと、生体内においては貪食細胞または抗菌性液性因子（補体、抗体、リゾチーム等）が存在する環境での生存を余儀なくされる。このような状況下で、細菌は自らの存在環境の変化を敏感に感知する機構を獲得してきた。そのような機構の１つとして、微生物は特異的な情報伝達物質を介して環境における自らの濃度を感知し、その濃度に応じて自らの様々な生物活性を巧妙に制御していることが明らかとなっている。このような細胞間の情報伝達機構は、クオラムセンシングシステムと称される。
【０００３】
クオラムセンシングは、発光性海洋細菌であるビブリオ・フィシェリおよびビブリオ・ハーベイにおいて最初に報告された。しかし、最近では、多くの細菌における一般的な遺伝子調節機構であると認識されている。この現象により、細菌は、生物発光、スウォーミング、バイオフィルム形成、タンパク質分解酵素の産生、抗生物質の合成、遺伝子受容能の発達、プラスミド接合伝達、病原因子産生および胞子形成などといった活動を一斉に行うことができる。
【０００４】
クオラムセンシングシステムを有する細菌は、オートインデューサーと呼ばれるシグナル伝達分子を合成し、放出し、そのシグナル伝達分子に応答して、遺伝子発現を細胞密度の関数として制御する。これまで、アシルホモセリンラクトンがオートインデューサー−１として、４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオンがオートインデューサー−２として同定されている。
【０００５】
ビブリオ属細菌、緑膿菌、セラチア、エンテロバクターなど臨床上重要な細菌がクオラムセンシングにオートインデューサー−１を利用することが報告されている。また、ビブリオ・ハーベイが、種内連絡には種特異性の高いオートインデューサー−１を利用し、種間連絡には種特異性の低いオートインデューサー−２を利用することが報告されている（非特許文献１）。
【０００６】
さらに最近の研究では、オートインデューサー−２による病原性細菌の種間でのクオラムセンシングが、病原因子の産生を調節していることも示されている（非特許文献２）。したがって、オートインデューサー−２を定量すること、ならびにオートインデューサー−２活性を阻害する化合物を同定することが求められている。
【０００７】
オートインデューサー−２を定量する方法として、オートインデューサーを認識することにより発光する細菌を用いたバイオアッセイが報告され、オートインデューサー−２にのみ応答して発光することのできるビブリオ・ハーベイのレポーター株が構築されている（非特許文献３および４）。上記のような細菌を用いるバイオアッセイでオートインデューサー−２を定量するためには、標準試料を用いて検量線を作成する必要がある。しかし、測定対象であるオートインデューサー−２は不安定な構造を有するため入手が困難であり、検量線を作成するための標準試料として用いるのは現実的ではなかった。従って、これまでオートインデューサー−２の測定は相対値として測定されているに過ぎなかった。
【０００８】
非特許文献５には、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン（ＨＭＦ）がオートインデューサー−２活性を有することが記載されている。しかし、上記のようなビブリオ・ハーベイのレポーター株を用いるバイオアッセイでは、ＨＭＦはオートインデューサー−２としての４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオン（ＤＰＤ）と比べてかなり高濃度でしか活性を検出できないことが示されており、オートインデューサー−２を定量するための標準物質としては適していないと考えられていた。
【０００９】
【非特許文献１】Bassler et al., Bacteriol.179:4043-4045,1997
【非特許文献２】Xavier KB. et al., Nature 437 :750-753, 2005
【非特許文献３】Bassler et al., Mol.Microbiol.9:773-786, 1993
【非特許文献４】Bassler et al., Mol.Microbiol.13:273-286,1994
【非特許文献５】Keersmaecker et al., J. Biol. Chem. 280, 20: 19563-19568, 2008
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
本発明は、オートインデューサー−２を定量するための手段を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明者らは、鋭意検討を行った結果、オートインデューサー−２の代謝産物である４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することにより、オートインデューサー−２の定量的な測定が可能になることを見出し、本発明を完成するに至った。
【００１２】
すなわち、本発明は以下の発明を包含する。
（１）被検試料におけるオートインデューサー−２の定量方法であって、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とする前記方法。
（２）定量方法がオートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイである、（１）記載の方法。
（３）オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイにおいて、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する、（１）または（２）記載の方法。
（４）レポーター細菌が、オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌である（２）または（３）記載の方法。
（５）レポーター細菌がビブリオ・ハーベイである、（２）〜（４）のいずれかに記載の方法。
（６）ａ）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンと、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する工程、
ｂ）被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定する工程、および
ｃ）ｂの工程で得られた測定値から、ａの工程で得られた検量線に基づき、オートインデューサー−２を定量する工程
を含む、（２）〜（５）のいずれかに記載の方法。
（７）ｃ）の工程において、ａの工程で得られた検量線、ならびに同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線の２つの検量線を用いてオートインデューサー−２を定量する、（６）記載の方法。
（８）被検試料から夾雑物を除去する工程をさらに含む、（１）〜（７）のいずれかに記載の方法。
（９）被検試料を吸着性の低い容器を用いて調製および／または保存する、（１）〜（８）のいずれかに記載の方法。
（１０）被検試料をガラス容器を用いて調製および／または保存する、（９）記載の方法。
（１１）検量線の作成を吸着性の低い容器を用いて実施する、（１）〜（１０）のいずれかに記載の方法。
（１２）検量線の作成をガラス容器を用いて実施する、（１１）記載の方法。
（１３）（１）〜（１２）のいずれかに記載の方法によってオートインデューサー−２を定量することを含む、オートインデューサー−２調節剤のスクリーニング方法。
（１４）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２を定量するためのキット。
（１５）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキット。
（１６）吸着性の低い容器をさらに含む、（１４）または（１５）記載のキット。
（１７）吸着性の低い容器がガラス容器である、（１６）記載のキット。
【発明の効果】
【００１３】
本発明により、オートインデューサー−２を定量的に測定することが可能になる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１４】
本発明は、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とするオートインデューサー−２の定量方法に関する。
【００１５】
本発明におけるオートインデューサー−２（ＡＩ−２）としては、式（I）：
【化１】
で表される４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオン（ＤＰＤ）が挙げられる。
【００１６】
式（I）のオートインデューサー−２は、細菌のオートインデューサー−２受容体と結合するときにボロンを取り込んで、以下の式（II）：
【化２】
で表されるフラノシルボレートジエステルに変換される。
【００１７】
本発明においてオートインデューサー−２には、上記式（II）で表されるフラノシルボレートジエステルも包含される。
【００１８】
上記オートインデューサー−２は、不安定な構造を有するため、保存が難しく、試薬として入手することは容易ではない。従って、標準試料として使用することは困難である。
【００１９】
４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ）−フラノン（ＨＭＦ）は、以下の式（III）：
【化３】
で表され、式（I）のオートインデューサー−２が代謝される際に構造変化することにより生成される。ＨＭＦは、オートインデューサー−２活性を有し、オートインデューサー−２と異なり安定であり、試薬として市販のものを容易に入手可能である。ＨＭＦは、例えば、ＳＩＧＭＡ−ＡＬＤＲＩＣＨから入手できる。
【００２０】
本発明においてオートインデューサー−２活性は、オートインデューサー−２がクオラムセンシングシステムを有する細菌に影響を及ぼす活性、すなわち、オートインデューサー−２を介するクオラムセンシングによりもたらされる細菌の機能を促進する活性をさす。細菌は、オートインデューサー−２を介するクオラムセンシングにより発光、スウォーミング、バイオフィルム形成、タンパク質分解酵素の産生、抗生物質の合成、遺伝子受容能の発達、プラスミド接合伝達、病原因子産生および胞子形成を行うことが知られている。従って、オートインデューサー−２活性は、換言すれば、オートインデューサー−２を認識する細菌、すなわちオートインデューサー−２受容体を有する細菌による生物発光、スウォーミング、バイオフィルム形成、タンパク質分解酵素の産生、抗生物質の合成、遺伝子受容能の発達、プラスミド接合伝達、病原因子産生および胞子形成の活性ということができる。本発明においてオートインデューサー−２活性は、特に、細菌の病原因子産生活性をさす。
【００２１】
細菌の病原因子としては、例えば、エンテロトキシン、アデニル酸シクラーゼ毒素、アドヘシン、アルカリプロテアーゼ、溶血毒、炭疽毒素、ＡＰＸ毒素、α毒素、β毒素、δ毒素、Ｃ２毒素、Ｃ３毒素、ボツリヌス毒素、束状線毛構造サブユニット、Ｃ５Ａペプチダーゼ、心臓毒、走化性、コレラ毒素、毛様体毒素、クロストリジウム細胞毒、クロストリジウム神経毒、コラーゲン接着遺伝子、細胞溶解素、嘔吐毒素、内毒素、表皮剥脱毒素、外毒素、細胞外エラスターゼ、フィブリノゲン、フィブロネクチン結合タンパク質、線維状赤血球凝集素、フィンブリア、ゼラチナーゼ、赤血球凝集素、ロイコトキシン、リポタンパク質シグナルペプチダーゼ、リステリオリシンＯ、Ｍタンパク質、神経毒、非フィンブリアアドヘシン類、浮腫因子、透過酵素、百日咳毒素、ホスホリパーゼ、線毛、孔形成毒素、プロリンパーミアーゼ、セリンプロテアーゼ、志賀毒素、破傷風毒素、チオール活性化細胞溶解素、気管細胞溶解素、ウレアーゼなどが挙げられるがこれに制限されない。
【００２２】
本発明のオートインデューサー−２定量方法は、オートインデューサー−２を認識することにより発光するレポーター細菌またはその処理物を用い、その発光強度を測定することにより、オートインデューサー−２活性を測定するものである。本発明においてオートインデューサー−２の定量には、オートインデューサー−２活性の定量が包含され、本発明の方法は、上記オートインデューサー−２活性のうち、細菌の病原因子産生活性を定量するために特に好適に用いられる。ＨＭＦは、オートインデューサー−２活性を有することから、オートインデューサー−２と同様に上記レポーター細菌を発光させることが知られている。しかし、ＨＭＦによるレポーター細菌の発光強度は、オートインデューサー−２による発光強度より低いものである。
【００２３】
本発明の方法で用いるオートインデューサー−２を認識することにより発光するレポーター細菌は、好ましくはオートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌である。細菌がオートインデューサー−１をも有する場合は、オートインデューサー−１による発光も同時に検出されてしまい、オートインデューサー−２による発光の測定の妨げとなるため、オートインデューサー−１受容体を有しない細菌をレポーター細菌として用いることが好ましい。細菌がルシフェラーゼを有するとは、細菌がルシフェラーゼを産生し、ルシフェラーゼ活性を発現することをさす。
【００２４】
レポーター細菌の処理物は、オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを含みオートインデューサー−２と接触して発光するものであれば特に制限されない。レポーター細菌の処理物の具体例として、菌体破砕物、菌体抽出物、菌死体、菌体懸濁液、菌体培養液および菌体培養上清などが挙げられる。
【００２５】
オートインデューサー−２受容体を有する細菌としては、例えば、ビブリオ（Vibrio）属細菌、シュードモナス（Pseudomonas）属細菌、ポルフィロモナス（Porphyromonas）属細菌、エルシニア（Yersinia）属細菌、エシェリキア（Escherichia）属細菌、サルモネラ（Salmonella）属細菌、ヘモフィルス（Haemophilus）属細菌、ヘリコバクター（Helicobacter）属細菌、バシルス（Bacillus）属細菌、ボレリア（Borrelia）属細菌、ナイセリア（Neisseria）属細菌、カンピロバクター（Campylobacter）属細菌、デイノコックス（Deinococcus）属細菌、ミコバクテリウム（Mycobacterium）属細菌、エンテロコッカス（Enterococcus）属細菌、ストレプトコッカス（Streptococcus）属細菌、シゲラ（Shigella）属細菌、エロモナス（Aeromonas）属細菌、エイケネラ（Eikenella）属細菌、クロストリジウム（Clostridium）属細菌、スタフィロコッカス（Staphylococcus）属細菌、ラクトバチルス（Lactobacillus）属細菌、アクチノバチルス（Actinobacillus）属細菌、アクチノマイセス（Actinomyces）属細菌、バクテロイデス（Bacteroides）属細菌、カプノサイトファガ（Capnocytophaga）属細菌、クレブシエラ（Klebsiella）属細菌、ハロバチルス（Halobacillus）属細菌、フゾバクテリウム（Fusobacterium）属細菌、エルウィニア（Erwinia）属細菌、エルベネラ（Elbenella）属細菌、リステリア（Listeria）属細菌、マンヘイミア（Mannheimia）属細菌、ペプトコッカス（Peptococcus）属細菌、プレボテラ（Prevotella）属細菌、プロテウス（Proteus）属細菌、セラチア（Serratia）属細菌およびベイロネラ（Veillonella）属細菌などが挙げられる。より具体的には、ビブリオ・ハーベイ（Vibrio harveyi）、ビブリオ・フィシェリ（Vibrio fischeri）、コレラ菌（Vibrio cholerae）、腸炎ビブリオ（Vibrio parahaemolyticus）、ビブリオ・アルギノリチカス（Vibrio alginolyticus）、シュードモナス・ホスホレウム（Pseudomonas phosphoreum）、ポリフィロモナス・ジンジバリス（Porphyromonas gingivalis）、エルシニア・エンテロコリチカ（Yersinia enterocolitica）、大腸菌（Escherichia coli）、ネズミチフス菌（Salmonella typhimurium）、インフルエンザ菌（Haemophilus influenzae）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）、枯草菌（Bacillus subtilis）、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgfdorferi）、髄膜炎菌（Neisseria meningitidis）、淋菌（Neisseria gonorrhoeae）、ペスト菌（Yersinia pestis）、カンピロバクター・ジェジュニ（Campylobacter jejuni）、デイノコックス・ラジオデュランス（Deinococcus radiodurans）、結核菌（Mycobacterium tuberculosis）、エンテロコッカス・フェカリス（Enterococcus faecalis）、肺炎レンサ球菌（Streptococcus pneumoniae）、化膿レンサ球菌（Streptococcus pyogenes）、ストレプトコッカス・ミュータンス（Streptococcus mutans）、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）、箕田赤痢菌（Shigella flexneri）、シゲラ・ボイデイ（Shigella boydii）、セレウス菌（Bacillus cereus）、バチルス・クブチリス（Bacillus cubtilis）、エロモナス・ハイドロフィラ（Aeromonas hydrophila）、チフス菌（Salmonella enterica）、エイケネラ・コロデンス（Eikenella corrodens）、ヘリコバクター・ヘパティカス（Helicobacter hepaticus）、ウェルシュ菌（Clostridium perfringens）、スタフィロコッカス・ハエモリティカス（Staphylococcus haemolyticus）、ラクトバチルス・ガセリ（Lactobacillus gasseri）、ラクトバチルス アシドフィラス（Lactobacillus acidophilus）、ラクトバチルス・ロイテリ（Lactobacillus reuteri）、ラクトバチルス・サリバリウス（Lactobacillus salivarius）、ラクトバチルス・カゼイ（Lactobacillus casei）、ストレプトコッカス・サンギニス（Streptococcus sanguinis）、ストレプトコッカス・アンギノーサス（Streptococcus anginosus）、ストレプトコッカス・オラリス（Streptococcus oralis）、ストレプトコッカス・ボビス（Streptococcus bovis）、ストレプトコッカス・ゴルドニ（Streptococcus gordonii）、ストレプトコッカス・ミティス（Streptococcus mitis）、アクチノバチルス・アクチノマイセテムコミタンス（Actinobacillus actinomycetemcomitans）、ビブリオ・ブルニフィカス（Vivrio vulnificus）、ビブリオ・ミミクス（Vibrio mimicus）、ビブリオ・アングイラルム（Vibrio anguillarum）、ラクトバチルス・ラムノサス（Lactobacillus rhamnosus）、エルウィニア・アミロボラ（Erwinia amylovora）、エルウィニア・カロトバラ（Erwinia carotovara）、ハロバチルス・ハロフィラス（Halabacilus halophilus）、セラチア・ピムチカ（Serratia pymuthica）、セラチア・マルセセンス（Serratia marcescens）、バクテロイデス・フラジリス（Bacteroides fragilis）、バクテロイデス・ブルガタス（Bacteroides vulgatus）、バクテロイデス・ディスタソニス（Bacteroides distasonis）、リステリア・モノサイトジェネス（Listeria monocytogenes）、スタフィロコッカス・エピデルミディス（Staphylococcus epidermidis）、クロストリジウム・ディフィシル（Clostridium difficile）、アエロモナス・ハイドロフィリア（Aeromonas hydrophilia）、マンヘイミア・ハエモライティカ（Mannhemia haemolytica）、クレブシエラ・ニューモニアエ（Klebsiella pneumoniae）、バチルス・アンスラシス（Bacillus anthracis）、カンピロバクター・コリ（Campylobacter coli）、カンピロバクター・レクタス（Campylobacter rectus）、プロテウス・ミラビリス（Proteus mirabilis）、アクチノマイセス・ナエスランディ（Actinomyces naeslundii）、ペプトコッカス・アナエロビウス（Peptococcus anaerobius）、フゾバクテリウム・ヌクレアタム（Fusobacterium nucleatum）、ベイロネラ・パルラ（Veillonella parvula）、カプノサイトファガ・スプティゲナ（Capnocytophaga sputigena）、プレボテラ・インタメディア（Prevotella intermedia）およびフォトバクテリウム・ホスホレウム（Photobacterium phosphoreum）などが挙げられる。
【００２６】
オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌として、ビブリオ・ハーベイ、ビブリオ・フィシェリおよびフォトバクテリウム・ホスホレウムが好ましく用いられる。
【００２７】
本発明の方法に使用するレポーター細菌は、遺伝子組換え技術により作製された細菌でもよい。例えば、オートインデューサー−２受容体遺伝子および／またはルシフェラーゼ遺伝子を宿主細菌に導入することにより得られる組換え細菌を用いることができる。組換え細菌としては、オートインデューサー−２受容体を有する宿主細菌にルシフェラーゼ遺伝子を導入したもの、ルシフェラーゼを有する宿主細菌にオートインデューサー−２受容体遺伝子を導入したもの、オートインデューサー−２受容体遺伝子およびルシフェラーゼ遺伝子の双方を導入したものが挙げられる。このような組換え細菌は、上記遺伝子を適当なベクターに連結し、得られた組換えベクターを当該遺伝子が発現し得るように宿主細菌中に導入することにより得ることができる。
【００２８】
細菌ゲノムから所望の遺伝子を得る方法は、分子生物学の分野において周知である。例えば遺伝子の配列が既知の場合、制限エンドヌクレアーゼ消化により適したゲノムライブラリを作り、所望の遺伝子配列に相補的なプローブを用いてスクリーニングすることができる。配列が単離されたら、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）のような標準的増幅法を用いてＤＮＡを増幅し、形質転換に適した量のＤＮＡを得ることができる。
【００２９】
遺伝子を導入するためのベクターは、宿主細胞で複製可能なものであれば特に限定されず、例えばプラスミドＤＮＡ、ファージＤＮＡ、コスミドＤＮＡ等が挙げられる。プラスミドＤＮＡとしては、例えばｐＢＲ３２２、ｐＳＣ１０１、ｐＵＣ１８、ｐＵＣ１９、ｐＵＣ１１８、ｐＵＣ１１９、ｐＡＣＹＣ１１７、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＩＩ ＳＫ（＋）、ｐＥＴＤｕｅｔ−１、ｐＡＣＹＣＤｕｅｔ−１等が挙げられ、ファージＤＮＡとしては、例えばλｇｔ１０、Ｃｈａｒｏｎ ４Ａ、ＥＭＢＬ−、Ｍ１３ｍｐ１８、Ｍ１３ｍｐ１９等が挙げられる。宿主としては、目的とする遺伝子を発現できるものであれば特に限定されないが、一般にグラム陰性細菌が好ましく、例えば、ビブリオ属細菌（ビブリオ・ハーベイ、ビブリオ・フィシェリなど）、エシェリキア属細菌（大腸菌など）などが挙げられる。
【００３０】
オートインデューサー−２受容体としては、例えば、ＬｕｘＰやＬｓｒが挙げられ、ＬｕｘＰ遺伝子の塩基配列は、例えば、公開されたデータベース（ＧｅｎＢａｎｋ、ＥＭＢＬ、ＤＤＢＪ）において、アクセションＮｏ：ＮＣ＿００９６５４、ＮＺ＿ＡＡＷＰ０１００００１０、ＮＺ＿ＡＡＷＱ０１００００１０、ＮＺ＿ＡＡＷＧ０１００００４６、ＮＺ＿ＡＡＷＦ０１０００００１、ＮＺ＿ＡＡＷＥ０１０００００１、ＮＺ＿ＡＡＷＤ０１００００６９、ＮＺ＿ＡＡＵＵ０１０００００６、ＮＺ＿ＡＡＵＳ０１０００００１、ＮＺ＿ＡＡＵＲ０１００００５１、ＣＰ０００７４９、ＤＳ２６５２２８、ＤＳ２６５３５９、ＡＡＷＱ０１００００１０、ＡＡＷＦ０１０００００１、ＡＡＷＰ０１００００１０、ＡＡＷＧ０１００００４６、ＮＣ＿００９４５６、ＢＡ００００３２、ＣＰ０００６２６、ＡＥ００３８５３、ＡＡＷＥ０１０００００１、ＡＡＷＤ０１００００６９、ＤＳ１７９７３５、ＤＳ１７９６１１、ＡＡＵＵ０１０００００６、ＡＡＵＳ０１０００００１、ＡＡＵＲ０１００００５１、ＮＺ＿ＡＡＫＪ０２０００００１、ＡＡＫＪ０２０００００１、ＮＺ＿ＡＡＵＴ０１０００００１、ＡＡＵＴ０１０００００１、ＡＢ０８６４０８、ＡＢ０８６２２９、ＤＱ７７５９４４、ＮＺ＿ＡＡＰＳ０１０００００４、ＡＡＰＳ０１０００００４、ＮＣ＿００６８４０、ＡＢ１１３２４４、ＮＺ＿ＡＡＮＥ０１０００００９、ＡＡＮＥ０１０００００９、ＮＺ＿ＡＡＮＥ０１００００２１、ＡＡＮＥ０１００００２１、ＮＣ＿００４６０５、ＡＹ９６２２８８、ＣＰ００００２０、ＶＨＵ０７０６９、Ｘ５４６９０として登録されている。Ｌｓｒ遺伝子についても、ＮＣ＿０００９１３、Ｕ０００９６、ＮＣ＿００５１２６などで登録されている。ルシフェラーゼ遺伝子としては、例えば、ホタルなどの昆虫、発光性海洋細菌などの発光細菌、海洋性甲虫類および藻類などの生物に由来するルシフェラーゼ遺伝子が挙げられる。
【００３１】
また、オートインデューサー−１受容体を有しない細菌を作製するために、オートインデューサー−１受容体遺伝子をノックアウトした組換え細菌を作製してもよい。オートインデューサー−１受容体遺伝子をノックアウトした組換え細菌とは、オートインデューサー−１受容体遺伝子が破壊されて発現できないような状況にある細菌を意味する。遺伝子をノックアウトする方法としては、標的遺伝子の任意の位置で相同組換えを起こすベクター（ターゲティングベクター）を用いて当該遺伝子を破壊する方法（ジーンターゲティング法）や、標的遺伝子の任意の位置にトラップベクター（プロモーターを持たないレポーター遺伝子）を挿入して当該遺伝子を破壊しその機能を失わせる方法などがある。
【００３２】
本発明の方法に好適な組換え細菌として、オートインデューサー−２にのみ応答して発光することのできるビブリオ・ハーベイの株（ＢＢ１７０株およびＭＭ３２株）を好ましく用いることができる（Bassler et al, Mol.Microbiol.9:773-786, 1993、Bassler et al, Mol.Microbiol.13:273-286,1994）。
【００３３】
本発明者らは、ＨＭＦによるレポーター細菌の発光強度とオートインデューサー−２（特に、４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオン）による細菌の発光強度とが高い相関関係を有することを見出した。本発明の方法は、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とレポーター細菌の発光強度との相関を示す検量線を作成し、該検量線に基づいてオートインデューサー−２を定量するものである。
【００３４】
より具体的には、本発明の定量方法は、以下のａ）〜ｃ）：
ａ）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンと、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する工程、
ｂ）被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定する工程、および
ｃ）ｂの工程で得られた測定値から、ａの工程で得られた検量線に基づき、オートインデューサー−２を定量する工程
を含む。
【００３５】
標準試料である４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ）−フラノンまたは被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させることには、標準試料または被検試料の存在下、レポーター細菌を培養することも包含される。その場合、レポーター細菌の培養条件は、特に制限されないが、通常、振盪培養または通気攪拌培養などの好気的条件下、好ましくは１０〜４０℃、より好ましくは２０〜３７℃で、好ましくは１〜１０時間、好ましくは２〜６時間培養を行う。培養後の発光強度の測定は、例えば、培養液、培養上清、菌体破砕物、菌体懸濁液、菌体抽出物の発光強度を測定することにより実施することができる。
【００３６】
被検試料としては、特に限定されないが、動物（カビ、放射菌等の微生物を含む）および植物の抽出物、化合物、ならびに人工合成物が挙げられる。
【００３７】
４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線は、様々な濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンとレポーター細菌とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度に対して測定された発光強度をプロットすることにより作成する。発光強度の測定は、当技術分野で通常用いられる測定器、例えばケミルミネッセンス計を用いて実施できる。
【００３８】
ｃの工程におけるオートインデューサー−２の定量は、ａの工程で得られた検量線（一次検量線と称する）、ならびに同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線（二次検量線と称する）の２つの検量線を用いて実施できる。すなわち、ｂの工程で被検試料について測定された発光強度を、一次検量線に基づいていったんＨＭＦ濃度に換算し、さらに二次検量線に基づいてＨＭＦ濃度をオートインデューサー−２濃度に換算する。
【００３９】
二次検量線において、ＨＭＦによる発光強度とオートインデューサー−２による発光強度は、ＨＭＦ濃度で０．０１〜１０μＭ、ＤＰＤ濃度で０．０１〜０．１μＭの範囲で特に良好な相関を示すことから、本発明の方法は、０．０１〜０．１μＭの濃度範囲のオートインデューサー−２およびそれに相当するオートインデューサー−２活性の定量に特に好適に用いられる。
【００４０】
本発明の方法では、被検試料とレポーター細菌またはその処理物とを接触させる前に、被検試料に含まれる夾雑物を除去することが好ましい。夾雑物の除去方法は特に制限されないが、オートインデューサー−２は低分子であることから、高分子夾雑物を除去し低分子の精製度を向上する方法を利用するのが好ましい。従って、夾雑物の除去は、濾過によって実施するのが好ましく、例えば、限外濾過および精密濾過などにより実施することができる。本発明においては限外濾過により夾雑物を除去することが好ましく、限外濾過膜としては、分画分子量（分子量カットオフ値）が通常３０００以下、好ましくは１０００以下のものを用いる。低カットオフ値の場合、分画時間に影響が出るため作業性を考慮して決定すればよい。予め夾雑物を除去することにより、測定試料におけるオートインデューサー−２の純度が高まり、より高精度なオートインデューサー−２の定量が可能になる。
【００４１】
本発明の方法では、被検試料を吸着性の低い容器で調製および／または保存することが好ましい。また、検量線の作成も吸着性の低い容器を用いて実施することが好ましい。本発明における吸着性の低い容器とはＡＩ−２および／またはＨＭＦの作用に対する減弱作用が少ないものを意味する。このような容器であれば、容器の素材や表面処理方法は特に限定されない。吸着性の低い容器としては、ガラス容器、金属容器、フッ素化合物により表面処理した容器、シリコナイズしたプラスチック容器などが挙げられ、特にガラス容器を用いることが好ましい。
【００４２】
一般に生化学の実験ではガラス容器の方がタンパク質など様々な物質の吸着が懸念されることから、ディスポーザルチューブなどはプラスチック容器が用いられるが、オートインデューサー−２の定量においては、ガラス容器の方がプラスチック容器に比べてオートインデューサー−２およびＨＭＦの吸着を抑制することが明らかとなった。ガラス容器はＨＭＦの吸着を抑制することから、検量線の作成をガラス容器で実施することにより、１μＭ以下、さらには０．１μＭ以下の濃度でもバイオアッセイにおいてＨＭＦを検出することができ、ＨＭＦ濃度と発光強度との相関を示す検量線、ならびに同じ発光強度を示すＨＭＦ濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を、ＨＭＦ濃度１μＭ以下、さらには０．１μＭ以下という低濃度範囲でも正確に作成することができる。さらに、ガラス容器は、オートインデューサー−２の吸着を抑制することから、被検試料をガラス容器で調製およびまたは保存することにより低濃度のオートインデューサー−２を検出し、定量することができる。
【００４３】
ガラス容器としては、通常用いられるものを使用でき、例えば、ガラス、石英ガラス、溶融石英、合成石英、アルミナ、サファイア、セラミクス、フォルステライトおよび感光性ガラス等のガラス材料製の容器を使用することができる。
【００４４】
オートインデューサー−２の測定は、レポーター細菌の種類、培地の種類、ｐＨおよび温度といった条件によって測定値が変動するバイオアッセイを利用するため、これまでオートインデューサー−２の測定は相対値としてしか測定することができなかった。しかし、本発明においては入手容易な標準試料を用いることにより、オートインデューサー−２濃度およびオートインデューサー−２活性を絶対値として測定することができる。従って、本発明の方法により、異なる条件下で測定された発光強度から求められる値を絶対値として比較することが可能になる。また、対照試料を繰り返し測定する手間を省くこともできる。
【００４５】
本発明のオートインデューサー−２の定量方法により、オートインデューサー−２濃度の定量、ならびにオートインデューサー−２活性の定量が可能になる。従って、既知濃度のオートインデューサー−２およびオートインデューサー−２調節剤と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、すなわち、上記ｂの工程において、既知量のオートインデューサー−２を含む試料にオートインデューサー−２調節剤を加えた被検試料とレポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、オートインデューサー−２調節剤のオートインデューサー−２調節活性を定量することもできる。
【００４６】
オートインデューサー−２調節剤は、オートインデューサー−２活性を調節する活性を有する物質をさし、オートインデューサー−２活性を阻害するオートインデューサー−２阻害剤およびオートインデューサー−２活性を促進するオートインデューサー−２促進剤を包含する。
【００４７】
また、既知濃度のオートインデューサー−２および被検物質と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、すなわち、上記ｂの工程において、既知量のオートインデューサー−２を含む試料に被検物質を加えた被検試料とレポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングすることもできる。当該スクリーニング方法においては、被検物質のオートインデューサー−２調節活性を合わせて定量することができる。
【００４８】
本発明はまた、オートインデューサー−２を定量するためのキットおよびオートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキットに関する。本発明のキットは、既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む。さらに本発明のキットは、試料を調製および保存するための容器、好ましくはガラス容器、検量線の作成に使用するための容器、好ましくはガラス容器、濾過膜、バッファー、試料希釈液等を含みうる。オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキットは、陽性対照として、既知のオートインデューサー−２調節剤、例えば、既知のオートインデューサー−２阻害剤およびオートインデューサー−２促進剤を含んでいてもよい。既知のオートインデューサー−２阻害剤としては、例えば、３−フェニルー２−プロペナール、２−ペンチル−２−シクロペンテン−１−オン、２−メトキシ−２，４−ジフェニル−３（２Ｈ）−フラノン、５−メチル−２−エチル−４−ヒドロキシ−３（２Ｈ）−フラノンおよび２，５−ジメチル−４−ヒドロキシ−３（２Ｈ）−フラノンなどが挙げられる。
【００４９】
以下、本発明を実施例により説明するが、本発明は実施例の範囲に限定されない。
【実施例】
【００５０】
（実施例１）検量線の作成
ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株（ＡＴＣＣより購入、３０℃、好気条件下にてマリン培地（ディフコ）で培養）をオートインデューサー−２（ＡＩ−２）レポーター細菌とし、最終濃度として０．００１〜１０００μＭになるようにＨＭＦ標品（ＳＩＧＭＡ）およびＤＰＤ標品（ＯＭＭ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃに合成検討を依頼し、同社で合成したものを購入した）を添加した。ＡＩ−２活性の指標である発光強度をKeersmaecker S.C.J. et al., J. Biol. Chem., 280(20), 19563-19568, 2005と同様に測定した。すなわち、ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株をＡＢ培地（Bassler et al, Mol. Microbiol. 9: 773-786, 1993参照）にて終濃度が５０００倍希釈になるように調製し、レポーター細菌液：標品の容量比が９：１になるように混合し、３０℃にて好気振盪培養し、４時間後の発光強度をケミルミネッセンス計（ベルトールド、Ｍｉｔｈａｒａｓ ＬＢ９４０、化学発光を検出）で測定した。ＨＭＦ標品およびＤＰＤ標品の濃度と発光強度との相関を図１に示す。ＨＭＦ標品およびＤＰＤ標品はガラス容器で調製した。図１の結果から、同じ発光強度を示すＨＭＦ濃度とＤＰＤ濃度との相関をとることにより作成した検量線を図２に示した。
【００５１】
図２から、ＨＭＦ濃度とＤＰＤ濃度は発光強度を介して高い相関係数を有していることがわかる。従って、被検試料と共存させたときレポーター細菌の発光強度を、ＨＭＦを標準試料として作成した検量線に基づいてＨＭＦ濃度に換算することにより、最終的にはＤＰＤ濃度を定量することが可能となることが示された。
【００５２】
（実施例２）試料調製用および試料保存用容器の検討
ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株の培養上清を粗精製したものを試料として、一般実験用のプラスチック容器またはガラス容器に入れ、１〜３回連続してそれぞれ新しい容器に移し替えた。移し替えるたびに、試料中のレポーター細菌の発光強度をＡＩ−２活性の指標として、実施例１と同様に測定した。容器を移し移し替える前の試料における発光強度を１００として相対値で示した（図３）。
【００５３】
プラスチック容器に入れた試料におけるＡＩ−２活性が移し替えによって著しく低下する一方、ガラス容器に入れた試料におけるＡＩ−２活性は移し替えによって変化しなかった。
【００５４】
一般に生化学の実験ではガラス容器の方がタンパク質など様々な物質の吸着が懸念されることから、ディスポーザルチューブなどはプラスチック容器が用いられているが、ＡＩ−２の定量においては、ガラス容器の方がプラスチック容器に比べてＡＩ−２の吸着を抑制すること、従ってＡＩ−２の定量にはガラス容器が適していることが示された。
【００５５】
（実施例３）被検試料の前処理
ヒト舌苔を市販の舌ブラシによりかきとりＰＢＳによる遠心洗浄（３０００ｒｐｍ，１０分，４℃）したものを被検試料とした。１．５ｍｌ ＰＢＳに舌苔を再懸濁した後、超音波破砕（Ｂｒａｎｓｏｎ、Ｓｏｎｉｆｉｅｒ１５０、氷冷下１分×５回）および遠心処理（４℃、１５０００ｒｐｍ、１０分）に付し、粗抽出液を得た。更に粗抽出液を限外濾過（分子量カットオフ値５０００、３０００、１０００）（ミリポア、Ｍｉｃｒｏｃｏｎ）に供し、各限外濾過溶液のＡＩ−２活性を、レポーター細菌の発光強度を指標として、実施例１と同様に測定した。結果を図４に示す。
【００５６】
限外濾過のカットオフ値が小さくなるにつれてＡＩ−２活性が上昇することから、高分子夾雑物の除去などにより低分子であるＤＰＤ（分子量１３２．１１）の精製度が向上し被検試料中のＡＩ−２の定量が適正に行われると考えられる。
【００５７】
（実施例４）ＡＩ−２活性阻害剤の評価
ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株と任意濃度に調製したシンナムアルデヒド標品（３−フェニル−２−プロペナール）（ＳＩＧＭＡ）とをプレインキュベートした後、ＤＰＤを終濃度１０μＭになるように添加した。ＡＩ−２活性を、レポーター細菌の発光強度を指標として、実施例１で作成した検量線を用いて定量した。すなわち、ＤＰＤが何μＭ存在するときのＡＩ−２活性に該当するかを測定した（図５）。
【００５８】
シンナムアルデヒドはＡＩ−２阻害活性を有する化合物として知られているが（Niu C. et al., Lett. Appl. Microbiol., 43(5), 489-494, 2006）、本発明の方法により、そのＡＩ−２阻害活性を定量的に測定できることが示された。従って、本発明により、被検物質のＡＩ−２阻害活性の強度を含めて、定量的かつ精緻なＡＩ−２阻害物質のスクリーニングが可能であることが示された。
【図面の簡単な説明】
【００５９】
【図１】ＨＭＦ標品およびＤＰＤ標品の濃度と発光強度との相関を示す。
【図２】図１の結果から、同じ発光強度を示すＨＭＦ濃度とＤＰＤ濃度との相関をとることにより作成した検量線を示す。
【図３】ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株の培養上清を粗精製したものを試料として、プラスチック容器またはガラス容器に入れ、新しい容器に移し替えるたびに、試料中のレポーター細菌の発光強度を測定した結果を示す。
【図４】舌苔検体の粗抽出液を限外濾過（分子量カットオフ値５０００、３０００、１０００）に供し、各限外濾過溶液のＡＩ−２活性を、レポーター細菌の発光強度を指標として測定した結果を示す。
【図５】ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株とシンナムアルデヒド標品とをプレインキュベートした後、ＤＰＤを添加し、ＡＩ−２活性を、実施例１で作成した検量線を用いて定量した結果を示す。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、オートインデューサー−２の定量方法およびオートインデューサー−２調節剤のスクリーニング方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
自然界において、微生物は様々な環境下で生存しなければならない。貧栄養、低温度、高温、ｐＨ変化はもちろんのこと、生体内においては貪食細胞または抗菌性液性因子（補体、抗体、リゾチーム等）が存在する環境での生存を余儀なくされる。このような状況下で、細菌は自らの存在環境の変化を敏感に感知する機構を獲得してきた。そのような機構の１つとして、微生物は特異的な情報伝達物質を介して環境における自らの濃度を感知し、その濃度に応じて自らの様々な生物活性を巧妙に制御していることが明らかとなっている。このような細胞間の情報伝達機構は、クオラムセンシングシステムと称される。
【０００３】
クオラムセンシングは、発光性海洋細菌であるビブリオ・フィシェリおよびビブリオ・ハーベイにおいて最初に報告された。しかし、最近では、多くの細菌における一般的な遺伝子調節機構であると認識されている。この現象により、細菌は、生物発光、スウォーミング、バイオフィルム形成、タンパク質分解酵素の産生、抗生物質の合成、遺伝子受容能の発達、プラスミド接合伝達、病原因子産生および胞子形成などといった活動を一斉に行うことができる。
【０００４】
クオラムセンシングシステムを有する細菌は、オートインデューサーと呼ばれるシグナル伝達分子を合成し、放出し、そのシグナル伝達分子に応答して、遺伝子発現を細胞密度の関数として制御する。これまで、アシルホモセリンラクトンがオートインデューサー−１として、４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオンがオートインデューサー−２として同定されている。
【０００５】
ビブリオ属細菌、緑膿菌、セラチア、エンテロバクターなど臨床上重要な細菌がクオラムセンシングにオートインデューサー−１を利用することが報告されている。また、ビブリオ・ハーベイが、種内連絡には種特異性の高いオートインデューサー−１を利用し、種間連絡には種特異性の低いオートインデューサー−２を利用することが報告されている（非特許文献１）。
【０００６】
さらに最近の研究では、オートインデューサー−２による病原性細菌の種間でのクオラムセンシングが、病原因子の産生を調節していることも示されている（非特許文献２）。したがって、オートインデューサー−２を定量すること、ならびにオートインデューサー−２活性を阻害する化合物を同定することが求められている。
【０００７】
オートインデューサー−２を定量する方法として、オートインデューサーを認識することにより発光する細菌を用いたバイオアッセイが報告され、オートインデューサー−２にのみ応答して発光することのできるビブリオ・ハーベイのレポーター株が構築されている（非特許文献３および４）。上記のような細菌を用いるバイオアッセイでオートインデューサー−２を定量するためには、標準試料を用いて検量線を作成する必要がある。しかし、測定対象であるオートインデューサー−２は不安定な構造を有するため入手が困難であり、検量線を作成するための標準試料として用いるのは現実的ではなかった。従って、これまでオートインデューサー−２の測定は相対値として測定されているに過ぎなかった。
【０００８】
非特許文献５には、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン（ＨＭＦ）がオートインデューサー−２活性を有することが記載されている。しかし、上記のようなビブリオ・ハーベイのレポーター株を用いるバイオアッセイでは、ＨＭＦはオートインデューサー−２としての４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオン（ＤＰＤ）と比べてかなり高濃度でしか活性を検出できないことが示されており、オートインデューサー−２を定量するための標準物質としては適していないと考えられていた。
【０００９】
【非特許文献１】Bassler et al., Bacteriol.179:4043-4045,1997
【非特許文献２】Xavier KB. et al., Nature 437 :750-753, 2005
【非特許文献３】Bassler et al., Mol.Microbiol.9:773-786, 1993
【非特許文献４】Bassler et al., Mol.Microbiol.13:273-286,1994
【非特許文献５】Keersmaecker et al., J. Biol. Chem. 280, 20: 19563-19568, 2008
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
本発明は、オートインデューサー−２を定量するための手段を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明者らは、鋭意検討を行った結果、オートインデューサー−２の代謝産物である４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することにより、オートインデューサー−２の定量的な測定が可能になることを見出し、本発明を完成するに至った。
【００１２】
すなわち、本発明は以下の発明を包含する。
（１）被検試料におけるオートインデューサー−２の定量方法であって、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とする前記方法。
（２）定量方法がオートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイである、（１）記載の方法。
（３）オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイにおいて、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する、（１）または（２）記載の方法。
（４）レポーター細菌が、オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌である（２）または（３）記載の方法。
（５）レポーター細菌がビブリオ・ハーベイである、（２）〜（４）のいずれかに記載の方法。
（６）ａ）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンと、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する工程、
ｂ）被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定する工程、および
ｃ）ｂの工程で得られた測定値から、ａの工程で得られた検量線に基づき、オートインデューサー−２を定量する工程
を含む、（２）〜（５）のいずれかに記載の方法。
（７）ｃ）の工程において、ａの工程で得られた検量線、ならびに同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線の２つの検量線を用いてオートインデューサー−２を定量する、（６）記載の方法。
（８）被検試料から夾雑物を除去する工程をさらに含む、（１）〜（７）のいずれかに記載の方法。
（９）被検試料を吸着性の低い容器を用いて調製および／または保存する、（１）〜（８）のいずれかに記載の方法。
（１０）被検試料をガラス容器を用いて調製および／または保存する、（９）記載の方法。
（１１）検量線の作成を吸着性の低い容器を用いて実施する、（１）〜（１０）のいずれかに記載の方法。
（１２）検量線の作成をガラス容器を用いて実施する、（１１）記載の方法。
（１３）（１）〜（１２）のいずれかに記載の方法によってオートインデューサー−２を定量することを含む、オートインデューサー−２調節剤のスクリーニング方法。
（１４）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２を定量するためのキット。
（１５）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキット。
（１６）吸着性の低い容器をさらに含む、（１４）または（１５）記載のキット。
（１７）吸着性の低い容器がガラス容器である、（１６）記載のキット。
【発明の効果】
【００１３】
本発明により、オートインデューサー−２を定量的に測定することが可能になる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１４】
本発明は、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とするオートインデューサー−２の定量方法に関する。
【００１５】
本発明におけるオートインデューサー−２（ＡＩ−２）としては、式（I）：
【化１】
で表される４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオン（ＤＰＤ）が挙げられる。
【００１６】
式（I）のオートインデューサー−２は、細菌のオートインデューサー−２受容体と結合するときにボロンを取り込んで、以下の式（II）：
【化２】
で表されるフラノシルボレートジエステルに変換される。
【００１７】
本発明においてオートインデューサー−２には、上記式（II）で表されるフラノシルボレートジエステルも包含される。
【００１８】
上記オートインデューサー−２は、不安定な構造を有するため、保存が難しく、試薬として入手することは容易ではない。従って、標準試料として使用することは困難である。
【００１９】
４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ）−フラノン（ＨＭＦ）は、以下の式（III）：
【化３】
で表され、式（I）のオートインデューサー−２が代謝される際に構造変化することにより生成される。ＨＭＦは、オートインデューサー−２活性を有し、オートインデューサー−２と異なり安定であり、試薬として市販のものを容易に入手可能である。ＨＭＦは、例えば、ＳＩＧＭＡ−ＡＬＤＲＩＣＨから入手できる。
【００２０】
本発明においてオートインデューサー−２活性は、オートインデューサー−２がクオラムセンシングシステムを有する細菌に影響を及ぼす活性、すなわち、オートインデューサー−２を介するクオラムセンシングによりもたらされる細菌の機能を促進する活性をさす。細菌は、オートインデューサー−２を介するクオラムセンシングにより発光、スウォーミング、バイオフィルム形成、タンパク質分解酵素の産生、抗生物質の合成、遺伝子受容能の発達、プラスミド接合伝達、病原因子産生および胞子形成を行うことが知られている。従って、オートインデューサー−２活性は、換言すれば、オートインデューサー−２を認識する細菌、すなわちオートインデューサー−２受容体を有する細菌による生物発光、スウォーミング、バイオフィルム形成、タンパク質分解酵素の産生、抗生物質の合成、遺伝子受容能の発達、プラスミド接合伝達、病原因子産生および胞子形成の活性ということができる。本発明においてオートインデューサー−２活性は、特に、細菌の病原因子産生活性をさす。
【００２１】
細菌の病原因子としては、例えば、エンテロトキシン、アデニル酸シクラーゼ毒素、アドヘシン、アルカリプロテアーゼ、溶血毒、炭疽毒素、ＡＰＸ毒素、α毒素、β毒素、δ毒素、Ｃ２毒素、Ｃ３毒素、ボツリヌス毒素、束状線毛構造サブユニット、Ｃ５Ａペプチダーゼ、心臓毒、走化性、コレラ毒素、毛様体毒素、クロストリジウム細胞毒、クロストリジウム神経毒、コラーゲン接着遺伝子、細胞溶解素、嘔吐毒素、内毒素、表皮剥脱毒素、外毒素、細胞外エラスターゼ、フィブリノゲン、フィブロネクチン結合タンパク質、線維状赤血球凝集素、フィンブリア、ゼラチナーゼ、赤血球凝集素、ロイコトキシン、リポタンパク質シグナルペプチダーゼ、リステリオリシンＯ、Ｍタンパク質、神経毒、非フィンブリアアドヘシン類、浮腫因子、透過酵素、百日咳毒素、ホスホリパーゼ、線毛、孔形成毒素、プロリンパーミアーゼ、セリンプロテアーゼ、志賀毒素、破傷風毒素、チオール活性化細胞溶解素、気管細胞溶解素、ウレアーゼなどが挙げられるがこれに制限されない。
【００２２】
本発明のオートインデューサー−２定量方法は、オートインデューサー−２を認識することにより発光するレポーター細菌またはその処理物を用い、その発光強度を測定することにより、オートインデューサー−２活性を測定するものである。本発明においてオートインデューサー−２の定量には、オートインデューサー−２活性の定量が包含され、本発明の方法は、上記オートインデューサー−２活性のうち、細菌の病原因子産生活性を定量するために特に好適に用いられる。ＨＭＦは、オートインデューサー−２活性を有することから、オートインデューサー−２と同様に上記レポーター細菌を発光させることが知られている。しかし、ＨＭＦによるレポーター細菌の発光強度は、オートインデューサー−２による発光強度より低いものである。
【００２３】
本発明の方法で用いるオートインデューサー−２を認識することにより発光するレポーター細菌は、好ましくはオートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌である。細菌がオートインデューサー−１をも有する場合は、オートインデューサー−１による発光も同時に検出されてしまい、オートインデューサー−２による発光の測定の妨げとなるため、オートインデューサー−１受容体を有しない細菌をレポーター細菌として用いることが好ましい。細菌がルシフェラーゼを有するとは、細菌がルシフェラーゼを産生し、ルシフェラーゼ活性を発現することをさす。
【００２４】
レポーター細菌の処理物は、オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを含みオートインデューサー−２と接触して発光するものであれば特に制限されない。レポーター細菌の処理物の具体例として、菌体破砕物、菌体抽出物、菌死体、菌体懸濁液、菌体培養液および菌体培養上清などが挙げられる。
【００２５】
オートインデューサー−２受容体を有する細菌としては、例えば、ビブリオ（Vibrio）属細菌、シュードモナス（Pseudomonas）属細菌、ポルフィロモナス（Porphyromonas）属細菌、エルシニア（Yersinia）属細菌、エシェリキア（Escherichia）属細菌、サルモネラ（Salmonella）属細菌、ヘモフィルス（Haemophilus）属細菌、ヘリコバクター（Helicobacter）属細菌、バシルス（Bacillus）属細菌、ボレリア（Borrelia）属細菌、ナイセリア（Neisseria）属細菌、カンピロバクター（Campylobacter）属細菌、デイノコックス（Deinococcus）属細菌、ミコバクテリウム（Mycobacterium）属細菌、エンテロコッカス（Enterococcus）属細菌、ストレプトコッカス（Streptococcus）属細菌、シゲラ（Shigella）属細菌、エロモナス（Aeromonas）属細菌、エイケネラ（Eikenella）属細菌、クロストリジウム（Clostridium）属細菌、スタフィロコッカス（Staphylococcus）属細菌、ラクトバチルス（Lactobacillus）属細菌、アクチノバチルス（Actinobacillus）属細菌、アクチノマイセス（Actinomyces）属細菌、バクテロイデス（Bacteroides）属細菌、カプノサイトファガ（Capnocytophaga）属細菌、クレブシエラ（Klebsiella）属細菌、ハロバチルス（Halobacillus）属細菌、フゾバクテリウム（Fusobacterium）属細菌、エルウィニア（Erwinia）属細菌、エルベネラ（Elbenella）属細菌、リステリア（Listeria）属細菌、マンヘイミア（Mannheimia）属細菌、ペプトコッカス（Peptococcus）属細菌、プレボテラ（Prevotella）属細菌、プロテウス（Proteus）属細菌、セラチア（Serratia）属細菌およびベイロネラ（Veillonella）属細菌などが挙げられる。より具体的には、ビブリオ・ハーベイ（Vibrio harveyi）、ビブリオ・フィシェリ（Vibrio fischeri）、コレラ菌（Vibrio cholerae）、腸炎ビブリオ（Vibrio parahaemolyticus）、ビブリオ・アルギノリチカス（Vibrio alginolyticus）、シュードモナス・ホスホレウム（Pseudomonas phosphoreum）、ポリフィロモナス・ジンジバリス（Porphyromonas gingivalis）、エルシニア・エンテロコリチカ（Yersinia enterocolitica）、大腸菌（Escherichia coli）、ネズミチフス菌（Salmonella typhimurium）、インフルエンザ菌（Haemophilus influenzae）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）、枯草菌（Bacillus subtilis）、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgfdorferi）、髄膜炎菌（Neisseria meningitidis）、淋菌（Neisseria gonorrhoeae）、ペスト菌（Yersinia pestis）、カンピロバクター・ジェジュニ（Campylobacter jejuni）、デイノコックス・ラジオデュランス（Deinococcus radiodurans）、結核菌（Mycobacterium tuberculosis）、エンテロコッカス・フェカリス（Enterococcus faecalis）、肺炎レンサ球菌（Streptococcus pneumoniae）、化膿レンサ球菌（Streptococcus pyogenes）、ストレプトコッカス・ミュータンス（Streptococcus mutans）、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）、箕田赤痢菌（Shigella flexneri）、シゲラ・ボイデイ（Shigella boydii）、セレウス菌（Bacillus cereus）、バチルス・クブチリス（Bacillus cubtilis）、エロモナス・ハイドロフィラ（Aeromonas hydrophila）、チフス菌（Salmonella enterica）、エイケネラ・コロデンス（Eikenella corrodens）、ヘリコバクター・ヘパティカス（Helicobacter hepaticus）、ウェルシュ菌（Clostridium perfringens）、スタフィロコッカス・ハエモリティカス（Staphylococcus haemolyticus）、ラクトバチルス・ガセリ（Lactobacillus gasseri）、ラクトバチルス アシドフィラス（Lactobacillus acidophilus）、ラクトバチルス・ロイテリ（Lactobacillus reuteri）、ラクトバチルス・サリバリウス（Lactobacillus salivarius）、ラクトバチルス・カゼイ（Lactobacillus casei）、ストレプトコッカス・サンギニス（Streptococcus sanguinis）、ストレプトコッカス・アンギノーサス（Streptococcus anginosus）、ストレプトコッカス・オラリス（Streptococcus oralis）、ストレプトコッカス・ボビス（Streptococcus bovis）、ストレプトコッカス・ゴルドニ（Streptococcus gordonii）、ストレプトコッカス・ミティス（Streptococcus mitis）、アクチノバチルス・アクチノマイセテムコミタンス（Actinobacillus actinomycetemcomitans）、ビブリオ・ブルニフィカス（Vivrio vulnificus）、ビブリオ・ミミクス（Vibrio mimicus）、ビブリオ・アングイラルム（Vibrio anguillarum）、ラクトバチルス・ラムノサス（Lactobacillus rhamnosus）、エルウィニア・アミロボラ（Erwinia amylovora）、エルウィニア・カロトバラ（Erwinia carotovara）、ハロバチルス・ハロフィラス（Halabacilus halophilus）、セラチア・ピムチカ（Serratia pymuthica）、セラチア・マルセセンス（Serratia marcescens）、バクテロイデス・フラジリス（Bacteroides fragilis）、バクテロイデス・ブルガタス（Bacteroides vulgatus）、バクテロイデス・ディスタソニス（Bacteroides distasonis）、リステリア・モノサイトジェネス（Listeria monocytogenes）、スタフィロコッカス・エピデルミディス（Staphylococcus epidermidis）、クロストリジウム・ディフィシル（Clostridium difficile）、アエロモナス・ハイドロフィリア（Aeromonas hydrophilia）、マンヘイミア・ハエモライティカ（Mannhemia haemolytica）、クレブシエラ・ニューモニアエ（Klebsiella pneumoniae）、バチルス・アンスラシス（Bacillus anthracis）、カンピロバクター・コリ（Campylobacter coli）、カンピロバクター・レクタス（Campylobacter rectus）、プロテウス・ミラビリス（Proteus mirabilis）、アクチノマイセス・ナエスランディ（Actinomyces naeslundii）、ペプトコッカス・アナエロビウス（Peptococcus anaerobius）、フゾバクテリウム・ヌクレアタム（Fusobacterium nucleatum）、ベイロネラ・パルラ（Veillonella parvula）、カプノサイトファガ・スプティゲナ（Capnocytophaga sputigena）、プレボテラ・インタメディア（Prevotella intermedia）およびフォトバクテリウム・ホスホレウム（Photobacterium phosphoreum）などが挙げられる。
【００２６】
オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌として、ビブリオ・ハーベイ、ビブリオ・フィシェリおよびフォトバクテリウム・ホスホレウムが好ましく用いられる。
【００２７】
本発明の方法に使用するレポーター細菌は、遺伝子組換え技術により作製された細菌でもよい。例えば、オートインデューサー−２受容体遺伝子および／またはルシフェラーゼ遺伝子を宿主細菌に導入することにより得られる組換え細菌を用いることができる。組換え細菌としては、オートインデューサー−２受容体を有する宿主細菌にルシフェラーゼ遺伝子を導入したもの、ルシフェラーゼを有する宿主細菌にオートインデューサー−２受容体遺伝子を導入したもの、オートインデューサー−２受容体遺伝子およびルシフェラーゼ遺伝子の双方を導入したものが挙げられる。このような組換え細菌は、上記遺伝子を適当なベクターに連結し、得られた組換えベクターを当該遺伝子が発現し得るように宿主細菌中に導入することにより得ることができる。
【００２８】
細菌ゲノムから所望の遺伝子を得る方法は、分子生物学の分野において周知である。例えば遺伝子の配列が既知の場合、制限エンドヌクレアーゼ消化により適したゲノムライブラリを作り、所望の遺伝子配列に相補的なプローブを用いてスクリーニングすることができる。配列が単離されたら、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）のような標準的増幅法を用いてＤＮＡを増幅し、形質転換に適した量のＤＮＡを得ることができる。
【００２９】
遺伝子を導入するためのベクターは、宿主細胞で複製可能なものであれば特に限定されず、例えばプラスミドＤＮＡ、ファージＤＮＡ、コスミドＤＮＡ等が挙げられる。プラスミドＤＮＡとしては、例えばｐＢＲ３２２、ｐＳＣ１０１、ｐＵＣ１８、ｐＵＣ１９、ｐＵＣ１１８、ｐＵＣ１１９、ｐＡＣＹＣ１１７、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＩＩ ＳＫ（＋）、ｐＥＴＤｕｅｔ−１、ｐＡＣＹＣＤｕｅｔ−１等が挙げられ、ファージＤＮＡとしては、例えばλｇｔ１０、Ｃｈａｒｏｎ ４Ａ、ＥＭＢＬ−、Ｍ１３ｍｐ１８、Ｍ１３ｍｐ１９等が挙げられる。宿主としては、目的とする遺伝子を発現できるものであれば特に限定されないが、一般にグラム陰性細菌が好ましく、例えば、ビブリオ属細菌（ビブリオ・ハーベイ、ビブリオ・フィシェリなど）、エシェリキア属細菌（大腸菌など）などが挙げられる。
【００３０】
オートインデューサー−２受容体としては、例えば、ＬｕｘＰやＬｓｒが挙げられ、ＬｕｘＰ遺伝子の塩基配列は、例えば、公開されたデータベース（ＧｅｎＢａｎｋ、ＥＭＢＬ、ＤＤＢＪ）において、アクセションＮｏ：ＮＣ＿００９６５４、ＮＺ＿ＡＡＷＰ０１００００１０、ＮＺ＿ＡＡＷＱ０１００００１０、ＮＺ＿ＡＡＷＧ０１００００４６、ＮＺ＿ＡＡＷＦ０１０００００１、ＮＺ＿ＡＡＷＥ０１０００００１、ＮＺ＿ＡＡＷＤ０１００００６９、ＮＺ＿ＡＡＵＵ０１０００００６、ＮＺ＿ＡＡＵＳ０１０００００１、ＮＺ＿ＡＡＵＲ０１００００５１、ＣＰ０００７４９、ＤＳ２６５２２８、ＤＳ２６５３５９、ＡＡＷＱ０１００００１０、ＡＡＷＦ０１０００００１、ＡＡＷＰ０１００００１０、ＡＡＷＧ０１００００４６、ＮＣ＿００９４５６、ＢＡ００００３２、ＣＰ０００６２６、ＡＥ００３８５３、ＡＡＷＥ０１０００００１、ＡＡＷＤ０１００００６９、ＤＳ１７９７３５、ＤＳ１７９６１１、ＡＡＵＵ０１０００００６、ＡＡＵＳ０１０００００１、ＡＡＵＲ０１００００５１、ＮＺ＿ＡＡＫＪ０２０００００１、ＡＡＫＪ０２０００００１、ＮＺ＿ＡＡＵＴ０１０００００１、ＡＡＵＴ０１０００００１、ＡＢ０８６４０８、ＡＢ０８６２２９、ＤＱ７７５９４４、ＮＺ＿ＡＡＰＳ０１０００００４、ＡＡＰＳ０１０００００４、ＮＣ＿００６８４０、ＡＢ１１３２４４、ＮＺ＿ＡＡＮＥ０１０００００９、ＡＡＮＥ０１０００００９、ＮＺ＿ＡＡＮＥ０１００００２１、ＡＡＮＥ０１００００２１、ＮＣ＿００４６０５、ＡＹ９６２２８８、ＣＰ００００２０、ＶＨＵ０７０６９、Ｘ５４６９０として登録されている。Ｌｓｒ遺伝子についても、ＮＣ＿０００９１３、Ｕ０００９６、ＮＣ＿００５１２６などで登録されている。ルシフェラーゼ遺伝子としては、例えば、ホタルなどの昆虫、発光性海洋細菌などの発光細菌、海洋性甲虫類および藻類などの生物に由来するルシフェラーゼ遺伝子が挙げられる。
【００３１】
また、オートインデューサー−１受容体を有しない細菌を作製するために、オートインデューサー−１受容体遺伝子をノックアウトした組換え細菌を作製してもよい。オートインデューサー−１受容体遺伝子をノックアウトした組換え細菌とは、オートインデューサー−１受容体遺伝子が破壊されて発現できないような状況にある細菌を意味する。遺伝子をノックアウトする方法としては、標的遺伝子の任意の位置で相同組換えを起こすベクター（ターゲティングベクター）を用いて当該遺伝子を破壊する方法（ジーンターゲティング法）や、標的遺伝子の任意の位置にトラップベクター（プロモーターを持たないレポーター遺伝子）を挿入して当該遺伝子を破壊しその機能を失わせる方法などがある。
【００３２】
本発明の方法に好適な組換え細菌として、オートインデューサー−２にのみ応答して発光することのできるビブリオ・ハーベイの株（ＢＢ１７０株およびＭＭ３２株）を好ましく用いることができる（Bassler et al, Mol.Microbiol.9:773-786, 1993、Bassler et al, Mol.Microbiol.13:273-286,1994）。
【００３３】
本発明者らは、ＨＭＦによるレポーター細菌の発光強度とオートインデューサー−２（特に、４，５−ジヒドロキシ−２，３−ペンタンジオン）による細菌の発光強度とが高い相関関係を有することを見出した。本発明の方法は、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とレポーター細菌の発光強度との相関を示す検量線を作成し、該検量線に基づいてオートインデューサー−２を定量するものである。
【００３４】
より具体的には、本発明の定量方法は、以下のａ）〜ｃ）：
ａ）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンと、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する工程、
ｂ）被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定する工程、および
ｃ）ｂの工程で得られた測定値から、ａの工程で得られた検量線に基づき、オートインデューサー−２を定量する工程
を含む。
【００３５】
標準試料である４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ）−フラノンまたは被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させることには、標準試料または被検試料の存在下、レポーター細菌を培養することも包含される。その場合、レポーター細菌の培養条件は、特に制限されないが、通常、振盪培養または通気攪拌培養などの好気的条件下、好ましくは１０〜４０℃、より好ましくは２０〜３７℃で、好ましくは１〜１０時間、好ましくは２〜６時間培養を行う。培養後の発光強度の測定は、例えば、培養液、培養上清、菌体破砕物、菌体懸濁液、菌体抽出物の発光強度を測定することにより実施することができる。
【００３６】
被検試料としては、特に限定されないが、動物（カビ、放射菌等の微生物を含む）および植物の抽出物、化合物、ならびに人工合成物が挙げられる。
【００３７】
４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線は、様々な濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンとレポーター細菌とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度に対して測定された発光強度をプロットすることにより作成する。発光強度の測定は、当技術分野で通常用いられる測定器、例えばケミルミネッセンス計を用いて実施できる。
【００３８】
ｃの工程におけるオートインデューサー−２の定量は、ａの工程で得られた検量線（一次検量線と称する）、ならびに同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線（二次検量線と称する）の２つの検量線を用いて実施できる。すなわち、ｂの工程で被検試料について測定された発光強度を、一次検量線に基づいていったんＨＭＦ濃度に換算し、さらに二次検量線に基づいてＨＭＦ濃度をオートインデューサー−２濃度に換算する。
【００３９】
二次検量線において、ＨＭＦによる発光強度とオートインデューサー−２による発光強度は、ＨＭＦ濃度で０．０１〜１０μＭ、ＤＰＤ濃度で０．０１〜０．１μＭの範囲で特に良好な相関を示すことから、本発明の方法は、０．０１〜０．１μＭの濃度範囲のオートインデューサー−２およびそれに相当するオートインデューサー−２活性の定量に特に好適に用いられる。
【００４０】
本発明の方法では、被検試料とレポーター細菌またはその処理物とを接触させる前に、被検試料に含まれる夾雑物を除去することが好ましい。夾雑物の除去方法は特に制限されないが、オートインデューサー−２は低分子であることから、高分子夾雑物を除去し低分子の精製度を向上する方法を利用するのが好ましい。従って、夾雑物の除去は、濾過によって実施するのが好ましく、例えば、限外濾過および精密濾過などにより実施することができる。本発明においては限外濾過により夾雑物を除去することが好ましく、限外濾過膜としては、分画分子量（分子量カットオフ値）が通常３０００以下、好ましくは１０００以下のものを用いる。低カットオフ値の場合、分画時間に影響が出るため作業性を考慮して決定すればよい。予め夾雑物を除去することにより、測定試料におけるオートインデューサー−２の純度が高まり、より高精度なオートインデューサー−２の定量が可能になる。
【００４１】
本発明の方法では、被検試料を吸着性の低い容器で調製および／または保存することが好ましい。また、検量線の作成も吸着性の低い容器を用いて実施することが好ましい。本発明における吸着性の低い容器とはＡＩ−２および／またはＨＭＦの作用に対する減弱作用が少ないものを意味する。このような容器であれば、容器の素材や表面処理方法は特に限定されない。吸着性の低い容器としては、ガラス容器、金属容器、フッ素化合物により表面処理した容器、シリコナイズしたプラスチック容器などが挙げられ、特にガラス容器を用いることが好ましい。
【００４２】
一般に生化学の実験ではガラス容器の方がタンパク質など様々な物質の吸着が懸念されることから、ディスポーザルチューブなどはプラスチック容器が用いられるが、オートインデューサー−２の定量においては、ガラス容器の方がプラスチック容器に比べてオートインデューサー−２およびＨＭＦの吸着を抑制することが明らかとなった。ガラス容器はＨＭＦの吸着を抑制することから、検量線の作成をガラス容器で実施することにより、１μＭ以下、さらには０．１μＭ以下の濃度でもバイオアッセイにおいてＨＭＦを検出することができ、ＨＭＦ濃度と発光強度との相関を示す検量線、ならびに同じ発光強度を示すＨＭＦ濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を、ＨＭＦ濃度１μＭ以下、さらには０．１μＭ以下という低濃度範囲でも正確に作成することができる。さらに、ガラス容器は、オートインデューサー−２の吸着を抑制することから、被検試料をガラス容器で調製およびまたは保存することにより低濃度のオートインデューサー−２を検出し、定量することができる。
【００４３】
ガラス容器としては、通常用いられるものを使用でき、例えば、ガラス、石英ガラス、溶融石英、合成石英、アルミナ、サファイア、セラミクス、フォルステライトおよび感光性ガラス等のガラス材料製の容器を使用することができる。
【００４４】
オートインデューサー−２の測定は、レポーター細菌の種類、培地の種類、ｐＨおよび温度といった条件によって測定値が変動するバイオアッセイを利用するため、これまでオートインデューサー−２の測定は相対値としてしか測定することができなかった。しかし、本発明においては入手容易な標準試料を用いることにより、オートインデューサー−２濃度およびオートインデューサー−２活性を絶対値として測定することができる。従って、本発明の方法により、異なる条件下で測定された発光強度から求められる値を絶対値として比較することが可能になる。また、対照試料を繰り返し測定する手間を省くこともできる。
【００４５】
本発明のオートインデューサー−２の定量方法により、オートインデューサー−２濃度の定量、ならびにオートインデューサー−２活性の定量が可能になる。従って、既知濃度のオートインデューサー−２およびオートインデューサー−２調節剤と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、すなわち、上記ｂの工程において、既知量のオートインデューサー−２を含む試料にオートインデューサー−２調節剤を加えた被検試料とレポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、オートインデューサー−２調節剤のオートインデューサー−２調節活性を定量することもできる。
【００４６】
オートインデューサー−２調節剤は、オートインデューサー−２活性を調節する活性を有する物質をさし、オートインデューサー−２活性を阻害するオートインデューサー−２阻害剤およびオートインデューサー−２活性を促進するオートインデューサー−２促進剤を包含する。
【００４７】
また、既知濃度のオートインデューサー−２および被検物質と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、すなわち、上記ｂの工程において、既知量のオートインデューサー−２を含む試料に被検物質を加えた被検試料とレポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定することにより、オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングすることもできる。当該スクリーニング方法においては、被検物質のオートインデューサー−２調節活性を合わせて定量することができる。
【００４８】
本発明はまた、オートインデューサー−２を定量するためのキットおよびオートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキットに関する。本発明のキットは、既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む。さらに本発明のキットは、試料を調製および保存するための容器、好ましくはガラス容器、検量線の作成に使用するための容器、好ましくはガラス容器、濾過膜、バッファー、試料希釈液等を含みうる。オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキットは、陽性対照として、既知のオートインデューサー−２調節剤、例えば、既知のオートインデューサー−２阻害剤およびオートインデューサー−２促進剤を含んでいてもよい。既知のオートインデューサー−２阻害剤としては、例えば、３−フェニルー２−プロペナール、２−ペンチル−２−シクロペンテン−１−オン、２−メトキシ−２，４−ジフェニル−３（２Ｈ）−フラノン、５−メチル−２−エチル−４−ヒドロキシ−３（２Ｈ）−フラノンおよび２，５−ジメチル−４−ヒドロキシ−３（２Ｈ）−フラノンなどが挙げられる。
【００４９】
以下、本発明を実施例により説明するが、本発明は実施例の範囲に限定されない。
【実施例】
【００５０】
（実施例１）検量線の作成
ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株（ＡＴＣＣより購入、３０℃、好気条件下にてマリン培地（ディフコ）で培養）をオートインデューサー−２（ＡＩ−２）レポーター細菌とし、最終濃度として０．００１〜１０００μＭになるようにＨＭＦ標品（ＳＩＧＭＡ）およびＤＰＤ標品（ＯＭＭ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃに合成検討を依頼し、同社で合成したものを購入した）を添加した。ＡＩ−２活性の指標である発光強度をKeersmaecker S.C.J. et al., J. Biol. Chem., 280(20), 19563-19568, 2005と同様に測定した。すなわち、ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株をＡＢ培地（Bassler et al, Mol. Microbiol. 9: 773-786, 1993参照）にて終濃度が５０００倍希釈になるように調製し、レポーター細菌液：標品の容量比が９：１になるように混合し、３０℃にて好気振盪培養し、４時間後の発光強度をケミルミネッセンス計（ベルトールド、Ｍｉｔｈａｒａｓ ＬＢ９４０、化学発光を検出）で測定した。ＨＭＦ標品およびＤＰＤ標品の濃度と発光強度との相関を図１に示す。ＨＭＦ標品およびＤＰＤ標品はガラス容器で調製した。図１の結果から、同じ発光強度を示すＨＭＦ濃度とＤＰＤ濃度との相関をとることにより作成した検量線を図２に示した。
【００５１】
図２から、ＨＭＦ濃度とＤＰＤ濃度は発光強度を介して高い相関係数を有していることがわかる。従って、被検試料と共存させたときレポーター細菌の発光強度を、ＨＭＦを標準試料として作成した検量線に基づいてＨＭＦ濃度に換算することにより、最終的にはＤＰＤ濃度を定量することが可能となることが示された。
【００５２】
（実施例２）試料調製用および試料保存用容器の検討
ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株の培養上清を粗精製したものを試料として、一般実験用のプラスチック容器またはガラス容器に入れ、１〜３回連続してそれぞれ新しい容器に移し替えた。移し替えるたびに、試料中のレポーター細菌の発光強度をＡＩ−２活性の指標として、実施例１と同様に測定した。容器を移し移し替える前の試料における発光強度を１００として相対値で示した（図３）。
【００５３】
プラスチック容器に入れた試料におけるＡＩ−２活性が移し替えによって著しく低下する一方、ガラス容器に入れた試料におけるＡＩ−２活性は移し替えによって変化しなかった。
【００５４】
一般に生化学の実験ではガラス容器の方がタンパク質など様々な物質の吸着が懸念されることから、ディスポーザルチューブなどはプラスチック容器が用いられているが、ＡＩ−２の定量においては、ガラス容器の方がプラスチック容器に比べてＡＩ−２の吸着を抑制すること、従ってＡＩ−２の定量にはガラス容器が適していることが示された。
【００５５】
（実施例３）被検試料の前処理
ヒト舌苔を市販の舌ブラシによりかきとりＰＢＳによる遠心洗浄（３０００ｒｐｍ，１０分，４℃）したものを被検試料とした。１．５ｍｌ ＰＢＳに舌苔を再懸濁した後、超音波破砕（Ｂｒａｎｓｏｎ、Ｓｏｎｉｆｉｅｒ１５０、氷冷下１分×５回）および遠心処理（４℃、１５０００ｒｐｍ、１０分）に付し、粗抽出液を得た。更に粗抽出液を限外濾過（分子量カットオフ値５０００、３０００、１０００）（ミリポア、Ｍｉｃｒｏｃｏｎ）に供し、各限外濾過溶液のＡＩ−２活性を、レポーター細菌の発光強度を指標として、実施例１と同様に測定した。結果を図４に示す。
【００５６】
限外濾過のカットオフ値が小さくなるにつれてＡＩ−２活性が上昇することから、高分子夾雑物の除去などにより低分子であるＤＰＤ（分子量１３２．１１）の精製度が向上し被検試料中のＡＩ−２の定量が適正に行われると考えられる。
【００５７】
（実施例４）ＡＩ−２活性阻害剤の評価
ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株と任意濃度に調製したシンナムアルデヒド標品（３−フェニル−２−プロペナール）（ＳＩＧＭＡ）とをプレインキュベートした後、ＤＰＤを終濃度１０μＭになるように添加した。ＡＩ−２活性を、レポーター細菌の発光強度を指標として、実施例１で作成した検量線を用いて定量した。すなわち、ＤＰＤが何μＭ存在するときのＡＩ−２活性に該当するかを測定した（図５）。
【００５８】
シンナムアルデヒドはＡＩ−２阻害活性を有する化合物として知られているが（Niu C. et al., Lett. Appl. Microbiol., 43(5), 489-494, 2006）、本発明の方法により、そのＡＩ−２阻害活性を定量的に測定できることが示された。従って、本発明により、被検物質のＡＩ−２阻害活性の強度を含めて、定量的かつ精緻なＡＩ−２阻害物質のスクリーニングが可能であることが示された。
【図面の簡単な説明】
【００５９】
【図１】ＨＭＦ標品およびＤＰＤ標品の濃度と発光強度との相関を示す。
【図２】図１の結果から、同じ発光強度を示すＨＭＦ濃度とＤＰＤ濃度との相関をとることにより作成した検量線を示す。
【図３】ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株の培養上清を粗精製したものを試料として、プラスチック容器またはガラス容器に入れ、新しい容器に移し替えるたびに、試料中のレポーター細菌の発光強度を測定した結果を示す。
【図４】舌苔検体の粗抽出液を限外濾過（分子量カットオフ値５０００、３０００、１０００）に供し、各限外濾過溶液のＡＩ−２活性を、レポーター細菌の発光強度を指標として測定した結果を示す。
【図５】ビブリオ・ハーベイＢＢ１７０株とシンナムアルデヒド標品とをプレインキュベートした後、ＤＰＤを添加し、ＡＩ−２活性を、実施例１で作成した検量線を用いて定量した結果を示す。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被検試料におけるオートインデューサー−２の定量方法であって、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とする前記方法。
【請求項２】
定量方法がオートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイである、請求項１記載の方法。
【請求項３】
オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイにおいて、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する、請求項１または２記載の方法。
【請求項４】
レポーター細菌が、オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌である請求項２または３記載の方法。
【請求項５】
レポーター細菌がビブリオ・ハーベイである、請求項２〜４のいずれか１項記載の方法。
【請求項６】
ａ）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンと、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する工程、
ｂ）被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定する工程、および
ｃ）ｂの工程で得られた測定値から、ａの工程で得られた検量線に基づき、オートインデューサー−２を定量する工程
を含む、請求項２〜５のいずれか１項記載の方法。
【請求項７】
ｃ）の工程において、ａの工程で得られた検量線、ならびに同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線の２つの検量線を用いてオートインデューサー−２を定量する、請求項６記載の方法。
【請求項８】
被検試料から夾雑物を除去する工程をさらに含む、請求項１〜７のいずれか１項記載の方法。
【請求項９】
被検試料を吸着性の低い容器を用いて調製および／または保存する、請求項１〜８のいずれか１項記載の方法。
【請求項１０】
被検試料をガラス容器を用いて調製および／または保存する、請求項９記載の方法。
【請求項１１】
検量線の作成を吸着性の低い容器を用いて実施する、請求項１〜１０のいずれか１項記載の方法。
【請求項１２】
検量線の作成をガラス容器を用いて実施する、請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
請求項１〜１２のいずれか１項記載の方法によってオートインデューサー−２を定量することを含む、オートインデューサー−２調節剤のスクリーニング方法。
【請求項１４】
既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２を定量するためのキット。
【請求項１５】
既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキット。
【請求項１６】
吸着性の低い容器をさらに含む、請求項１４または１５記載のキット。
【請求項１７】
吸着性の低い容器がガラス容器である、請求項１６記載のキット。
【請求項１】
被検試料におけるオートインデューサー−２の定量方法であって、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として検量線を作成することを特徴とする前記方法。
【請求項２】
定量方法がオートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイである、請求項１記載の方法。
【請求項３】
オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物の発光強度を測定するバイオアッセイにおいて、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを標準試料として４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する、請求項１または２記載の方法。
【請求項４】
レポーター細菌が、オートインデューサー−２受容体およびルシフェラーゼを有する細菌である請求項２または３記載の方法。
【請求項５】
レポーター細菌がビブリオ・ハーベイである、請求項２〜４のいずれか１項記載の方法。
【請求項６】
ａ）既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンと、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定し、４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度と発光強度との相関を示す検量線を作成する工程、
ｂ）被検試料と、レポーター細菌またはその処理物とを接触させて発光強度を測定する工程、および
ｃ）ｂの工程で得られた測定値から、ａの工程で得られた検量線に基づき、オートインデューサー−２を定量する工程
を含む、請求項２〜５のいずれか１項記載の方法。
【請求項７】
ｃ）の工程において、ａの工程で得られた検量線、ならびに同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線の２つの検量線を用いてオートインデューサー−２を定量する、請求項６記載の方法。
【請求項８】
被検試料から夾雑物を除去する工程をさらに含む、請求項１〜７のいずれか１項記載の方法。
【請求項９】
被検試料を吸着性の低い容器を用いて調製および／または保存する、請求項１〜８のいずれか１項記載の方法。
【請求項１０】
被検試料をガラス容器を用いて調製および／または保存する、請求項９記載の方法。
【請求項１１】
検量線の作成を吸着性の低い容器を用いて実施する、請求項１〜１０のいずれか１項記載の方法。
【請求項１２】
検量線の作成をガラス容器を用いて実施する、請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
請求項１〜１２のいずれか１項記載の方法によってオートインデューサー−２を定量することを含む、オートインデューサー−２調節剤のスクリーニング方法。
【請求項１４】
既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２を定量するためのキット。
【請求項１５】
既知濃度の４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノンを含む標準試料、オートインデューサー−２を認識して発光するレポーター細菌またはその処理物、および同じ発光強度を示す４−ヒドロキシ−５−メチル−３（２Ｈ)−フラノン濃度とオートインデューサー−２濃度との相関を示す検量線を含む、オートインデューサー−２調節剤をスクリーニングするためのキット。
【請求項１６】
吸着性の低い容器をさらに含む、請求項１４または１５記載のキット。
【請求項１７】
吸着性の低い容器がガラス容器である、請求項１６記載のキット。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【公開番号】特開２００９−１１５７９１（Ｐ２００９−１１５７９１Ａ）
【公開日】平成２１年５月２８日（２００９．５．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−２６９０４９（Ｐ２００８−２６９０４９）
【出願日】平成２０年１０月１７日（２００８．１０．１７）
【出願人】（００００００９１８）花王株式会社 (8,290)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２１年５月２８日（２００９．５．２８）
【国際特許分類】
【出願日】平成２０年１０月１７日（２００８．１０．１７）
【出願人】（００００００９１８）花王株式会社 (8,290)
【Ｆターム（参考）】
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