クロマトグラフィ／質量分析／質量分析装置における動的信号選択
物質の質量スペクトログラム・データを得るための方法と装置である。この方法は、（ａ）物質にクロマトグラフィ・プロセスを行ってその出力をイオン化し、（ｂ）出力の現在の質量スペクトログラムを得、（ｃ）ステップ（ｂ）で得た現在の質量スペクトルと出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、（ｄ）同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する。質量分析計装置は、クロマトグラフィ・カラムと、質量分析計であって、クロマトグラフィ・カラムの出力をイオン化するためのイオン源を含み、選択された質量のイオンを分離し、フラグメント化し、質量分析する機能を有する質量分析計と、質量分析計を動作させるようプログラムされたデータ依存のデータ収集コントローラであって、出力の現在の質量スペクトログラムを得て、現在の質量スペクトルと出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録するコントローラと、を含む。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は一般に質量分析計の分野に関するものであって、特に、クロマトグラフィ／質量スペクトル装置内で溶出する化合物を同定するためのデータ依存収集法を用いた自動ＭＳ／ＭＳ収集に関するものである。本発明は複雑な混合物内の関心のある種を同定するときの収集後のデータ処理にも用いることができる。
【背景技術】
【０００２】
質量分析計は、しばしばクロマトグラフィ装置と連結し、テスト・サンプルから溶出する種（ｓｐｅｃｉｅｓ）を同定して特徴付ける。かかる結合装置では、溶出する溶剤をイオン化して、後でデータを分析するために、指定された時間間隔（例えば、０．０１−１０秒の範囲）で、溶出する溶剤の一連の質量スペクトログラムを得る。テスト・サンプルは多くの種または化合物を含んでよいので、関心のある種または化合物を溶出するに従って自動的に決定し（すなわち、同定し）、ＭＳ／ＭＳ分析を行ってそれらを特徴付けるのが望ましいことが多い。しかし、複雑な混合物内の関心のある種を実時間で同定することはなかなか困難である。
【０００３】
この目的を達成するために、質量分析計に関連する種々の自動化ツールとデータ取得および分析ソフトウエアとが開発されてきた。周知の自動化ツールは、ＭＤＳ Ｓｃｉｅｘ Ｉｎｃ．およびＡｐｐｌｅｒａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎが販売しているＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｄｅｐｅｎｄａｎｔ ＡｃｑｕｉｓｉｔｉｏｎTM（ＩＤＡTM）である。データ収集プロセス中、このツールは質量スペクトログラム内の質量ピークを同定してプリカーサ・イオンを選択する。このツールは質量分析の１つ以上の後段階（ＭＳ／ＭＳまたはＭＳ／ＭＳ／ＭＳ）を行って、選択されたプリカーサ・イオンをフラグメント化する。得られたＭＳ／ＭＳ（または更に高次の）スペクトルは、エネルギー的に可能な全てのフラグメンテーション・プロセス（プリカーサ・イオンからフラグメント・イオンへ、更にフラグメント・イオンから他のフラグメント・イオンへ）の合成物である。スペクトル・データベース（すなわち、ＭＳ／ＭＳライブラリ）を探索しまたは化合物を特徴付けるのに用いられる構造情報を与えるとき、後のＭＳ段階により解明されるスペクトルの豊富さおよび／または解離経路は化合物を同定するのに非常に有用である。
【０００４】
他の質量分析計装置のメーカも同様の実時間のデータ依存切替え機能を提供している。例えば、カリフォルニア州サンホゼのＴｈｅｒｍｏ Ｆｉｎｎｉｇａｎ ＬＬＣはＤａｔａ Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔTM（ＤＤＥ）ツールを販売し、またＷａｔｅｒｓ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（ＭｉｃｒｏｍａｓｓTM）はデータ向け分析（ＤＤＡ）ツールを販売している。
【０００５】
上に述べた実時間のデータ依存切替え機能は、関心のある質量ピークの検出がかなり容易な、試験管内サンプル分析または単一蛋白質消化分析などのアプリケーションでは良い結果を与える。しかし生物体液（例えば、尿や血漿溶出物）または消化された蛋白質の混合（例えば、消化された細胞分解物）などの更に複雑なサンプル集合を処理するときは、同時に溶出される多くの他の主成分や種があって、関心のある（しかし信号強度が弱い）被分析物や種の信号を「さえぎる」（すなわち、隠す）ことが多く、実際に関心のある（イオン化された）種を効率的に選択することが不可能になる。本質的に、低レベルの濃度で溶出する種を自動的に検出するのは困難なことが多い。
【０００６】
ＩＤＡTMツールでは、包含リストの使用に依存することにより、または本質的にこの技術で周知のニュートラル・ロスおよびプリカーサ走査などの更に特殊な調査走査を用いることにより、ＭＳ／ＭＳ用の装置で「選ばれた」質量ピークの選択を改善することができる。しかし、常にそうではないが、かかる方法は分析するサンプルの或る知識を妨げる。または、動的除外プロセスを活動化してよい。すなわち、或るイオンを解離のために選択すると、次の数回の走査ではそのイオンを無視して、次に大きな強度のピークを有するイオンを解離のために選択する。しかしこれは、多数の他の主成分と同時に溶出する弱い濃度の種の問題を解決しない。
【０００７】
認識されるように、プリカーサ・イオンを正しく選択することは種の同定において重要なステップである。イオンを正しく選択すると、データ依存収集方式で集められる情報の有用でしかも最小の量も保証するので、種の同定および特徴付けを迅速にかつ簡単に行うのに役立つ。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
一般的に述べると、本発明は、速く立ち上がる質量信号を有するイオンを同定することにより、多数の他の主成分と同時に溶出する弱い濃度の種を同定する。これは、好ましくは、質量スペクトルと、１つ以上の前に収集された質量スペクトルを含むスペクトログラム背景とを比較することにより行う。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
１つの態様では、本発明は物質の質量スペクトログラム・データを得る方法を提供する。この方法では、物質にクロマトグラフィ・プロセスを行ってその出力をイオン化する。これにより、現在の出力の質量スペクトログラムが得られる。次に、現在の質量スペクトルと、出力の１つ以上の前に収集された質量スペクトルを含むスペクトログラム背景とを比較することにより、最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンを同定する。次に、同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する。これらのステップを好ましくは動的に繰り返して、クロマトグラフィ・カラムからの実質的に全ての溶出する種を質量で同定し、フラグメント化して追加の質量スペクトル情報を得る。
【００１０】
最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンは、現在の質量スペクトルから前に収集した質量スペクトルの１つまたは平均を引くことにより同定してよい。または、最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンは、出力の前に収集した質量スペクトルの１つ以上の値または平均値に対する現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の百分率変化を決定することにより同定してよい。
【００１１】
必要であれば、同定されたイオンは動的除外リストに載せてよい。その後このイオンは最も速く立ち上がる質量信号とは考えないので、２次質量分析で次に速く立ち上がるイオンを同定して選択することができる。必要であれば、最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンを同定する前にプリカーサまたはニュートラル・ロス走査も行ってよい。
【００１２】
質量スペクトログラム・データを収集すると、同定されたイオンのフラグメンテーションから得られる質量スペクトルと質量スペクトルのデータベースとを比較して、溶出する化合物を自動的に同定し、または化合物の特徴付けに用いることができる。
上記の方法とプロセスを行う装置と機器も開示する。
【実施例】
【００１３】
図１は液体クロマトグラフィ、質量分析（ＬＣＭＳ）装置１０の基本的構成を示す。装置１０は、本来この技術で周知のように、多段の質量分析法を行うことのできる質量分析計１４に、本来この技術で周知のように結合するクロマトグラフィ・カラム１２を含む。かかる装置の一例はＭＤＸ Ｓｃｉｅｘが販売するＡＰＩ３０００TMまたはＡＰＩ４０００TMＬＣ／ＭＳ／ＭＳ装置である。ただし当業者が認識するように、本発明はＭＳおよびＭＳ／ＭＳ機能（例えば、３Ｄトラップ）を有する任意の装置に適用することができる。データ依存のデータ収集コントローラ１６により、自動化されたＭＳおよびＭＳ／ＭＳで、１回のＬＣ／ＭＳの運転から情報を最大に取り出すことができる。
【００１４】
図２は、ＡＰＩ３０００TM装置を用いて人の生長ホルモン（Ｈｇｈ）消化について行った或るＣＬ／ＭＳの運転からのデータ出力の一部を示す。図に示すデータは５７分から６３分の運転に関する。信号４０は運転の全イオン強度（ＴＣＩ）をプロットする。これは全ての溶出する種の全濃度を表す。質量分析計１４は予め定められた範囲の質量（より特定すると、ｍ／ｚ範囲）のイオン強度と、質量６９４ｍ／ｚ、５７８ｍ／ｚ，７１３ｍ／ｚ，７３４ｍ／ｚ，７４８ｍ／ｚ，９１３ｍ／ｚのイオンの溶出されたイオン・カウントの信号４２から５２のそれぞれのプロットも記録する。これらの信号はこの期間にわたる種々の（しかし全てではない）溶出する種の強度を示す。
【００１５】
約５８．５分から５９分の運転の間に多数の溶出する種があることに注意していただきたい。その部分集合を図２に示す。時刻ｔ0とｔ1に得られたこれらの溶出する種のＭＳスペクトログラムを図３（時刻ｔ1）と図４（時刻ｔ0）に示し、それぞれの時刻でのイオン強度を下の表１に示す。
【００１６】
スペクトル内に多数の質量ピークがほぼ同時に表れるので、コントローラ１６が実行するソフトウエアは２次質量分析を行うための質量ピークを選ぶのが困難である。イオン６９４ｍ／ｚが生成する高い強度の信号と共に多数の低い強度の信号（特に質量５７８ｍ／ｚ，７１３ｍ／ｚ，７４８ｍ／ｚのイオン）が存在するので、この問題は更に難しくなる。図５は、５７．１６分と６０．７６分の間の運転を示す。従来のデータ収集コントローラ（ＩＤＡTM装置）なら２次質量分析を行うのにイオン６９４ｍ／ｚだけを選択したはずである（この装置が動的除外評価基準を適用するようプログラムされていないとき）。
【００１７】
対照的に、好ましい実施の形態は最も新しく収集したＭＳスペクトログラムと動的「スペクトログラム背景」とを比較することにより、任意の所定の時点で最も速く立ち上がる信号を同定しようと試みる。分かりやすくするため、図３（遅い時刻）と図４（速い時刻）とを比較すればこの方法の簡単な例を理解することができる。この比較から、質量７４８ｍ／ｚが最も速く立ち上がる信号（これは図２の信号５０に対応する）を有することが分かる。
【００１８】
この現象は２つの簡単な数量化方法を用いて数量化することができる。すなわち、（１）前に収集したＭＳスペクトログラム内の信号の値から信号の現在の値の引き算と、（２）信号の値の百分率変化とである。表１はこれらの評価基準のどちらかを用いて、イオン７４８ｍ／ｚと７１３ｍ／ｚとを共にＩＤＡ選択のためのリストのトップに動かしたものを示す。
【００１９】
【表１】
【００２０】
このようにして質量７４８ｍ／ｚと７１３ｍ／ｚのイオンを選択したので、コントローラ１６は本来この技術で周知のように分析計を動的に動作させて、これらのイオンをフラグメント化し、得られた質量スペクトルを記録することにより２次質量分析を行う。好ましい実施の形態では予め定められた数の選択されたイオンをフラグメント化するが、別の実施の形態では「最も良く」合致するもの（例えば、イオン７４８ｍ／ｚ）だけをその後のフラグメンテーションのために選択してよい。
【００２１】
上に述べた２つの数量化方法は次の利点を有する。すなわち、増加の速度に焦点を当てるときは百分率（すなわち、相対的利得）が好ましい方法であるが、引き算法により計算する絶対利得は大幅に増加する種に焦点を当てる。「速く立ち上がる信号」という用語は、相対的な意味で（すなわち、増加の速度で計算して）または絶対的な意味で（すなわち、引き算法で計算して）、早く立ち上がる信号を含むと明確に定義される。
【００２２】
図６は、５７．１６分と６０．７６分の間の運転で得られたデータにこれらの方法を適用した結果を示す。各ブロック６０は、２次ＭＳ分析を行うためにコントローラ１６が異なるイオン質量ピークを選択した１つ以上の連続的な走査を表す。
【００２３】
これまで述べた例はスペクトログラム背景を決定するのに１つの直前のＭＳスペクトログラムを用いた。しかし別の実施の形態では、比較のためのスペクトログラム背景を得るのに多数のＭＳスペクトログラムにわたる質量信号を平均してもよい。例えば図７は、信号６２，６４，６６でそれぞれ示す質量６６８．５ｍ／ｚ，１４１２．０ｍ／ｚ，１４６６．０ｍ／ｚのイオンについて５１．４分から５３．６分の間のＬＣ／ＭＳの運転で得られた種々の溶出イオン・カウントを示す。図７のブロック７０ａ，７０ｂ，７０ｃで示すように、信号の平均背景値を決定するのに用いられたスペクトルの数が、カバレージの範囲（すなわち、質量ピークの全域で選択されたデータ点の数）を決定する。例えばブロック７０ａでは、時刻ｔ4での信号６２の背景平均値は１つの直前のスペクトログラム（５秒前に得られたもの）から得られ、したがってコントローラは信号内の立上りだけを考慮する。信号がそのピーク値を過ぎると、時刻ｔ4での信号６２の値を時刻ｔ3でのその値から引けば分かるように、引き算を用いても百分率変化を用いても結果は負の数である。
【００２４】
しかしブロック７０ｂでは、３つの直前のスペクトルを用いて信号６２の背景の値を決定し、その結果、カバレージの範囲（すなわち、質量ピークの全域で考慮したデータ点の数）が大きくなった。ブロック７０ｃは、１０の前のスペクトルを用いて信号６２の背景の値を決定したときのカバレージの範囲を示す。これらの方法は、移動平均と同様に、信号内の急激な変動（したがって偽の結果）を平滑するのを助ける。質量信号の平均背景値を決定するのにコントローラが用いるスペクトルの数は、好ましくはユーザが編集可能なパラメータである。
【００２５】
好ましい実施の形態では、２次ＭＳ分析用のイオンの選択は、最も速く立ち上がる質量信号の評価基準に加えて、またはこれと組み合わせて、他の評価基準に基づいてよい。例えば、必要であれば、上に説明した動的背景比較と動的除外とを組み合わせてよい。この方法では、或るイオンが最も速く立ち上がる質量信号を有すると決定すると、そのイオンを除外リストに載せて、その後のＭＳ走査の予め定められた数には考慮しない。或るイオンが最も速く立ち上がる質量信号を有するものとして予め定められた連続回数選択されるまではそのイオンを除外リストに載せるのを遅らせることにより、この方法を更に強化してよい。また必要であれば、コントローラは動的背景比較を適用する前にプリカーサおよびニュートラル・ロス走査を用いてよい。
【００２６】
本発明は、濃度の更に高い種が存在するときに、共に溶出する低い強度の種の検出を改善する。したがって、アイソトープおよびアイソトープ比の完全性が保存されると期待される。また本発明により、コントローラをプログラムするのにユーザが入力する必要のある評価基準の数を少なくすることができる。
【００２７】
また本発明により、有用な情報を収集する効率が改善されると共に、収集されるデータの量が最小になる。これにより、選別しなければならない情報の量が小さくなるという追加の利点が得られる。
【００２８】
好ましい実施の形態について、１つの反応を監視する走査を参照して説明した。理解されるように、本発明は、本質的にこの技術で周知の、選択されたイオンの監視（ＳＩＭ）、選択された反応の監視（ＳＲＭ）、多重反応の監視（ＭＲＭ）（イオン変換の多重生成の監視を含む）、多重荷電走査（ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｃｈａｒｇｅｄ ｓｃａｎ）に適用できる。また理解されるように、本発明はキャピラリ電気泳動質量分析装置（ＣＥ−ＭＳ）およびガス・クロマトグラフ質量分析装置（ＧＣ−ＭＳ）に適用することができる。当業者が認識するように、本発明の精神から逸れることなく好ましい実施の形態に種々の変更を行ってよい。
【図面の簡単な説明】
【００２９】
本発明の上記の態様は、特定の実施の形態の説明と、制限するのではなく単なる例として本発明の原理を示す添付の図面とから明らかになる。
【図１】ＬＣ／ＭＳ装置の略ブロック図である。
【図２】或るＬＣ／ＭＳの運転の一部にわたって時間（分）の関数として検出される種々の質量の強度（ｃｐｓ）をプロットするグラフである。ＴＩＣ、６９４ＸＩＣ（参照番号４２）、５７８ＸＩＣ（参照番号４４）、７１３（参照番号４６）、７３４ＸＩＣ（参照番号４８）、７４８ＸＩＣ（参照番号５０）、９１３（参照番号５２）。
【図３】図２に示すＬＣ／ＭＳの運転の部分の第１の時刻（ｔ1）で取った質量スペクトログラムである。
【図４】図２に示すＬＣ／ＭＳの運転の部分の第２の時刻（ｔ0）で取った質量スペクトログラムである。
【図５】５７．１６分と６０．７６分の間に、動的背景信号除外のない従来のデータ依存収集ツールを用いれば２次質量分析のために選択されるはずのイオンを示す略図で、ＩＤＡのために質量６９４だけが選択される。しかし、この時間中に溶出されたクロマトグラフィ挙動を持つ他の質量はリストされた影のついた領域で溶出された質量を表わす。
【図６】任意の所定の時点で最も速く立ち上がる質量信号を同定しようとする好ましい実施の形態の下で２次質量分析のために選択されたイオンを示す略図である。動的背景信号除外を行うと、より多くのイオンがＩＤＡのために選択される。質量スペクトルのベース・ピークでない場合でも、他のイオンより速く立ち上がる信号を有する場合は検出される。
【図７】最も速く立ち上がる質量信号の検出において考慮してよい質量ピークの割合を示す略図である。動的背景信号除外を行うと、平均背景を決定するのに用いられるスペクトルの数はＬＣピークの全域で選択される点の数を決定する。
【技術分野】
【０００１】
本発明は一般に質量分析計の分野に関するものであって、特に、クロマトグラフィ／質量スペクトル装置内で溶出する化合物を同定するためのデータ依存収集法を用いた自動ＭＳ／ＭＳ収集に関するものである。本発明は複雑な混合物内の関心のある種を同定するときの収集後のデータ処理にも用いることができる。
【背景技術】
【０００２】
質量分析計は、しばしばクロマトグラフィ装置と連結し、テスト・サンプルから溶出する種（ｓｐｅｃｉｅｓ）を同定して特徴付ける。かかる結合装置では、溶出する溶剤をイオン化して、後でデータを分析するために、指定された時間間隔（例えば、０．０１−１０秒の範囲）で、溶出する溶剤の一連の質量スペクトログラムを得る。テスト・サンプルは多くの種または化合物を含んでよいので、関心のある種または化合物を溶出するに従って自動的に決定し（すなわち、同定し）、ＭＳ／ＭＳ分析を行ってそれらを特徴付けるのが望ましいことが多い。しかし、複雑な混合物内の関心のある種を実時間で同定することはなかなか困難である。
【０００３】
この目的を達成するために、質量分析計に関連する種々の自動化ツールとデータ取得および分析ソフトウエアとが開発されてきた。周知の自動化ツールは、ＭＤＳ Ｓｃｉｅｘ Ｉｎｃ．およびＡｐｐｌｅｒａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎが販売しているＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｄｅｐｅｎｄａｎｔ ＡｃｑｕｉｓｉｔｉｏｎTM（ＩＤＡTM）である。データ収集プロセス中、このツールは質量スペクトログラム内の質量ピークを同定してプリカーサ・イオンを選択する。このツールは質量分析の１つ以上の後段階（ＭＳ／ＭＳまたはＭＳ／ＭＳ／ＭＳ）を行って、選択されたプリカーサ・イオンをフラグメント化する。得られたＭＳ／ＭＳ（または更に高次の）スペクトルは、エネルギー的に可能な全てのフラグメンテーション・プロセス（プリカーサ・イオンからフラグメント・イオンへ、更にフラグメント・イオンから他のフラグメント・イオンへ）の合成物である。スペクトル・データベース（すなわち、ＭＳ／ＭＳライブラリ）を探索しまたは化合物を特徴付けるのに用いられる構造情報を与えるとき、後のＭＳ段階により解明されるスペクトルの豊富さおよび／または解離経路は化合物を同定するのに非常に有用である。
【０００４】
他の質量分析計装置のメーカも同様の実時間のデータ依存切替え機能を提供している。例えば、カリフォルニア州サンホゼのＴｈｅｒｍｏ Ｆｉｎｎｉｇａｎ ＬＬＣはＤａｔａ Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔTM（ＤＤＥ）ツールを販売し、またＷａｔｅｒｓ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（ＭｉｃｒｏｍａｓｓTM）はデータ向け分析（ＤＤＡ）ツールを販売している。
【０００５】
上に述べた実時間のデータ依存切替え機能は、関心のある質量ピークの検出がかなり容易な、試験管内サンプル分析または単一蛋白質消化分析などのアプリケーションでは良い結果を与える。しかし生物体液（例えば、尿や血漿溶出物）または消化された蛋白質の混合（例えば、消化された細胞分解物）などの更に複雑なサンプル集合を処理するときは、同時に溶出される多くの他の主成分や種があって、関心のある（しかし信号強度が弱い）被分析物や種の信号を「さえぎる」（すなわち、隠す）ことが多く、実際に関心のある（イオン化された）種を効率的に選択することが不可能になる。本質的に、低レベルの濃度で溶出する種を自動的に検出するのは困難なことが多い。
【０００６】
ＩＤＡTMツールでは、包含リストの使用に依存することにより、または本質的にこの技術で周知のニュートラル・ロスおよびプリカーサ走査などの更に特殊な調査走査を用いることにより、ＭＳ／ＭＳ用の装置で「選ばれた」質量ピークの選択を改善することができる。しかし、常にそうではないが、かかる方法は分析するサンプルの或る知識を妨げる。または、動的除外プロセスを活動化してよい。すなわち、或るイオンを解離のために選択すると、次の数回の走査ではそのイオンを無視して、次に大きな強度のピークを有するイオンを解離のために選択する。しかしこれは、多数の他の主成分と同時に溶出する弱い濃度の種の問題を解決しない。
【０００７】
認識されるように、プリカーサ・イオンを正しく選択することは種の同定において重要なステップである。イオンを正しく選択すると、データ依存収集方式で集められる情報の有用でしかも最小の量も保証するので、種の同定および特徴付けを迅速にかつ簡単に行うのに役立つ。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
一般的に述べると、本発明は、速く立ち上がる質量信号を有するイオンを同定することにより、多数の他の主成分と同時に溶出する弱い濃度の種を同定する。これは、好ましくは、質量スペクトルと、１つ以上の前に収集された質量スペクトルを含むスペクトログラム背景とを比較することにより行う。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
１つの態様では、本発明は物質の質量スペクトログラム・データを得る方法を提供する。この方法では、物質にクロマトグラフィ・プロセスを行ってその出力をイオン化する。これにより、現在の出力の質量スペクトログラムが得られる。次に、現在の質量スペクトルと、出力の１つ以上の前に収集された質量スペクトルを含むスペクトログラム背景とを比較することにより、最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンを同定する。次に、同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する。これらのステップを好ましくは動的に繰り返して、クロマトグラフィ・カラムからの実質的に全ての溶出する種を質量で同定し、フラグメント化して追加の質量スペクトル情報を得る。
【００１０】
最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンは、現在の質量スペクトルから前に収集した質量スペクトルの１つまたは平均を引くことにより同定してよい。または、最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンは、出力の前に収集した質量スペクトルの１つ以上の値または平均値に対する現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の百分率変化を決定することにより同定してよい。
【００１１】
必要であれば、同定されたイオンは動的除外リストに載せてよい。その後このイオンは最も速く立ち上がる質量信号とは考えないので、２次質量分析で次に速く立ち上がるイオンを同定して選択することができる。必要であれば、最も速く立ち上がる質量信号を有するイオンを同定する前にプリカーサまたはニュートラル・ロス走査も行ってよい。
【００１２】
質量スペクトログラム・データを収集すると、同定されたイオンのフラグメンテーションから得られる質量スペクトルと質量スペクトルのデータベースとを比較して、溶出する化合物を自動的に同定し、または化合物の特徴付けに用いることができる。
上記の方法とプロセスを行う装置と機器も開示する。
【実施例】
【００１３】
図１は液体クロマトグラフィ、質量分析（ＬＣＭＳ）装置１０の基本的構成を示す。装置１０は、本来この技術で周知のように、多段の質量分析法を行うことのできる質量分析計１４に、本来この技術で周知のように結合するクロマトグラフィ・カラム１２を含む。かかる装置の一例はＭＤＸ Ｓｃｉｅｘが販売するＡＰＩ３０００TMまたはＡＰＩ４０００TMＬＣ／ＭＳ／ＭＳ装置である。ただし当業者が認識するように、本発明はＭＳおよびＭＳ／ＭＳ機能（例えば、３Ｄトラップ）を有する任意の装置に適用することができる。データ依存のデータ収集コントローラ１６により、自動化されたＭＳおよびＭＳ／ＭＳで、１回のＬＣ／ＭＳの運転から情報を最大に取り出すことができる。
【００１４】
図２は、ＡＰＩ３０００TM装置を用いて人の生長ホルモン（Ｈｇｈ）消化について行った或るＣＬ／ＭＳの運転からのデータ出力の一部を示す。図に示すデータは５７分から６３分の運転に関する。信号４０は運転の全イオン強度（ＴＣＩ）をプロットする。これは全ての溶出する種の全濃度を表す。質量分析計１４は予め定められた範囲の質量（より特定すると、ｍ／ｚ範囲）のイオン強度と、質量６９４ｍ／ｚ、５７８ｍ／ｚ，７１３ｍ／ｚ，７３４ｍ／ｚ，７４８ｍ／ｚ，９１３ｍ／ｚのイオンの溶出されたイオン・カウントの信号４２から５２のそれぞれのプロットも記録する。これらの信号はこの期間にわたる種々の（しかし全てではない）溶出する種の強度を示す。
【００１５】
約５８．５分から５９分の運転の間に多数の溶出する種があることに注意していただきたい。その部分集合を図２に示す。時刻ｔ0とｔ1に得られたこれらの溶出する種のＭＳスペクトログラムを図３（時刻ｔ1）と図４（時刻ｔ0）に示し、それぞれの時刻でのイオン強度を下の表１に示す。
【００１６】
スペクトル内に多数の質量ピークがほぼ同時に表れるので、コントローラ１６が実行するソフトウエアは２次質量分析を行うための質量ピークを選ぶのが困難である。イオン６９４ｍ／ｚが生成する高い強度の信号と共に多数の低い強度の信号（特に質量５７８ｍ／ｚ，７１３ｍ／ｚ，７４８ｍ／ｚのイオン）が存在するので、この問題は更に難しくなる。図５は、５７．１６分と６０．７６分の間の運転を示す。従来のデータ収集コントローラ（ＩＤＡTM装置）なら２次質量分析を行うのにイオン６９４ｍ／ｚだけを選択したはずである（この装置が動的除外評価基準を適用するようプログラムされていないとき）。
【００１７】
対照的に、好ましい実施の形態は最も新しく収集したＭＳスペクトログラムと動的「スペクトログラム背景」とを比較することにより、任意の所定の時点で最も速く立ち上がる信号を同定しようと試みる。分かりやすくするため、図３（遅い時刻）と図４（速い時刻）とを比較すればこの方法の簡単な例を理解することができる。この比較から、質量７４８ｍ／ｚが最も速く立ち上がる信号（これは図２の信号５０に対応する）を有することが分かる。
【００１８】
この現象は２つの簡単な数量化方法を用いて数量化することができる。すなわち、（１）前に収集したＭＳスペクトログラム内の信号の値から信号の現在の値の引き算と、（２）信号の値の百分率変化とである。表１はこれらの評価基準のどちらかを用いて、イオン７４８ｍ／ｚと７１３ｍ／ｚとを共にＩＤＡ選択のためのリストのトップに動かしたものを示す。
【００１９】
【表１】
【００２０】
このようにして質量７４８ｍ／ｚと７１３ｍ／ｚのイオンを選択したので、コントローラ１６は本来この技術で周知のように分析計を動的に動作させて、これらのイオンをフラグメント化し、得られた質量スペクトルを記録することにより２次質量分析を行う。好ましい実施の形態では予め定められた数の選択されたイオンをフラグメント化するが、別の実施の形態では「最も良く」合致するもの（例えば、イオン７４８ｍ／ｚ）だけをその後のフラグメンテーションのために選択してよい。
【００２１】
上に述べた２つの数量化方法は次の利点を有する。すなわち、増加の速度に焦点を当てるときは百分率（すなわち、相対的利得）が好ましい方法であるが、引き算法により計算する絶対利得は大幅に増加する種に焦点を当てる。「速く立ち上がる信号」という用語は、相対的な意味で（すなわち、増加の速度で計算して）または絶対的な意味で（すなわち、引き算法で計算して）、早く立ち上がる信号を含むと明確に定義される。
【００２２】
図６は、５７．１６分と６０．７６分の間の運転で得られたデータにこれらの方法を適用した結果を示す。各ブロック６０は、２次ＭＳ分析を行うためにコントローラ１６が異なるイオン質量ピークを選択した１つ以上の連続的な走査を表す。
【００２３】
これまで述べた例はスペクトログラム背景を決定するのに１つの直前のＭＳスペクトログラムを用いた。しかし別の実施の形態では、比較のためのスペクトログラム背景を得るのに多数のＭＳスペクトログラムにわたる質量信号を平均してもよい。例えば図７は、信号６２，６４，６６でそれぞれ示す質量６６８．５ｍ／ｚ，１４１２．０ｍ／ｚ，１４６６．０ｍ／ｚのイオンについて５１．４分から５３．６分の間のＬＣ／ＭＳの運転で得られた種々の溶出イオン・カウントを示す。図７のブロック７０ａ，７０ｂ，７０ｃで示すように、信号の平均背景値を決定するのに用いられたスペクトルの数が、カバレージの範囲（すなわち、質量ピークの全域で選択されたデータ点の数）を決定する。例えばブロック７０ａでは、時刻ｔ4での信号６２の背景平均値は１つの直前のスペクトログラム（５秒前に得られたもの）から得られ、したがってコントローラは信号内の立上りだけを考慮する。信号がそのピーク値を過ぎると、時刻ｔ4での信号６２の値を時刻ｔ3でのその値から引けば分かるように、引き算を用いても百分率変化を用いても結果は負の数である。
【００２４】
しかしブロック７０ｂでは、３つの直前のスペクトルを用いて信号６２の背景の値を決定し、その結果、カバレージの範囲（すなわち、質量ピークの全域で考慮したデータ点の数）が大きくなった。ブロック７０ｃは、１０の前のスペクトルを用いて信号６２の背景の値を決定したときのカバレージの範囲を示す。これらの方法は、移動平均と同様に、信号内の急激な変動（したがって偽の結果）を平滑するのを助ける。質量信号の平均背景値を決定するのにコントローラが用いるスペクトルの数は、好ましくはユーザが編集可能なパラメータである。
【００２５】
好ましい実施の形態では、２次ＭＳ分析用のイオンの選択は、最も速く立ち上がる質量信号の評価基準に加えて、またはこれと組み合わせて、他の評価基準に基づいてよい。例えば、必要であれば、上に説明した動的背景比較と動的除外とを組み合わせてよい。この方法では、或るイオンが最も速く立ち上がる質量信号を有すると決定すると、そのイオンを除外リストに載せて、その後のＭＳ走査の予め定められた数には考慮しない。或るイオンが最も速く立ち上がる質量信号を有するものとして予め定められた連続回数選択されるまではそのイオンを除外リストに載せるのを遅らせることにより、この方法を更に強化してよい。また必要であれば、コントローラは動的背景比較を適用する前にプリカーサおよびニュートラル・ロス走査を用いてよい。
【００２６】
本発明は、濃度の更に高い種が存在するときに、共に溶出する低い強度の種の検出を改善する。したがって、アイソトープおよびアイソトープ比の完全性が保存されると期待される。また本発明により、コントローラをプログラムするのにユーザが入力する必要のある評価基準の数を少なくすることができる。
【００２７】
また本発明により、有用な情報を収集する効率が改善されると共に、収集されるデータの量が最小になる。これにより、選別しなければならない情報の量が小さくなるという追加の利点が得られる。
【００２８】
好ましい実施の形態について、１つの反応を監視する走査を参照して説明した。理解されるように、本発明は、本質的にこの技術で周知の、選択されたイオンの監視（ＳＩＭ）、選択された反応の監視（ＳＲＭ）、多重反応の監視（ＭＲＭ）（イオン変換の多重生成の監視を含む）、多重荷電走査（ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｃｈａｒｇｅｄ ｓｃａｎ）に適用できる。また理解されるように、本発明はキャピラリ電気泳動質量分析装置（ＣＥ−ＭＳ）およびガス・クロマトグラフ質量分析装置（ＧＣ−ＭＳ）に適用することができる。当業者が認識するように、本発明の精神から逸れることなく好ましい実施の形態に種々の変更を行ってよい。
【図面の簡単な説明】
【００２９】
本発明の上記の態様は、特定の実施の形態の説明と、制限するのではなく単なる例として本発明の原理を示す添付の図面とから明らかになる。
【図１】ＬＣ／ＭＳ装置の略ブロック図である。
【図２】或るＬＣ／ＭＳの運転の一部にわたって時間（分）の関数として検出される種々の質量の強度（ｃｐｓ）をプロットするグラフである。ＴＩＣ、６９４ＸＩＣ（参照番号４２）、５７８ＸＩＣ（参照番号４４）、７１３（参照番号４６）、７３４ＸＩＣ（参照番号４８）、７４８ＸＩＣ（参照番号５０）、９１３（参照番号５２）。
【図３】図２に示すＬＣ／ＭＳの運転の部分の第１の時刻（ｔ1）で取った質量スペクトログラムである。
【図４】図２に示すＬＣ／ＭＳの運転の部分の第２の時刻（ｔ0）で取った質量スペクトログラムである。
【図５】５７．１６分と６０．７６分の間に、動的背景信号除外のない従来のデータ依存収集ツールを用いれば２次質量分析のために選択されるはずのイオンを示す略図で、ＩＤＡのために質量６９４だけが選択される。しかし、この時間中に溶出されたクロマトグラフィ挙動を持つ他の質量はリストされた影のついた領域で溶出された質量を表わす。
【図６】任意の所定の時点で最も速く立ち上がる質量信号を同定しようとする好ましい実施の形態の下で２次質量分析のために選択されたイオンを示す略図である。動的背景信号除外を行うと、より多くのイオンがＩＤＡのために選択される。質量スペクトルのベース・ピークでない場合でも、他のイオンより速く立ち上がる信号を有する場合は検出される。
【図７】最も速く立ち上がる質量信号の検出において考慮してよい質量ピークの割合を示す略図である。動的背景信号除外を行うと、平均背景を決定するのに用いられるスペクトルの数はＬＣピークの全域で選択される点の数を決定する。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
物質の質量スペクトログラム・データを得る方法であって、
（ａ）前記物質にクロマトグラフィ・プロセスを行ってその出力をイオン化し、
（ｂ）前記出力の現在の質量スペクトログラムを得、
（ｃ）ステップ（ｂ）で得た前記現在の質量スペクトルと前記出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、
（ｄ）前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する、
物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項２】
前記出力の異なる部分についてステップ１（ｂ）から１（ｄ）を繰り返すことを含む、請求項１記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項３】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記前に収集した質量スペクトルの１つを前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項４】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、複数の前記前に収集した質量スペクトルの平均を前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項５】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、前記前に収集した質量スペクトルの１つ内の値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項６】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、複数の前記前に収集した質量スペクトル内の信号の平均値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項７】
動的除外リストに少なくとも１つの同定されたイオンを載せて、他の速く立ち上がるイオンの同定を可能にすることを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項８】
ステップ１（ｂ）から１（ｄ）を実行する前にプリカーサ走査を行うことを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項９】
ステップ１（ｂ）から１（ｄ）を実行する前にニュートラル・ロス走査を行うことを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項１０】
同定されたイオンのフラグメンテーションから得られた質量スペクトルと質量スペクトルのデータベースとを比較して、溶出する化合物を自動的に同定することを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項１１】
質量分析計装置であって、
（ａ）クロマトグラフィ・カラムと、
（ｂ）質量分析計であって、前記クロマトグラフィ・カラムの出力をイオン化するためのイオン源を含み、選択された質量のイオンを分離し、フラグメント化し、質量分析する機能を有する質量分析計と、
（ｃ）前記質量分析計を動作させるようプログラムされたデータ依存のデータ収集コントローラであって、
１）前記出力の現在の質量スペクトログラムを得て、
２）前記現在の質量スペクトルと前記出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して、速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、
３）前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する、
コントローラと、
を含む質量分析計装置。
【請求項１２】
前記出力の異なる部分について、前記コントローラは前記出力の現在の質量スペクトログラムを繰り返して得て、前記現在の質量スペクトルと前記出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して、早く立ち上がる質量信号を有する１つ以上のイオンを同定し、前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１３】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記前に収集した質量スペクトルの１つを前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１４】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、複数の前記前に収集した質量スペクトルの平均を前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１５】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、前記前に収集した質量スペクトルの１つ内の値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１６】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、複数の前記前に収集した質量スペクトル内のその平均値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項１１記載の物質の質量分析計装置。
【請求項１７】
動的除外リストに同定されたイオンを載せて、他の速く立ち上がるイオンの同定を可能にする、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１８】
速く立ち上がる質量信号を決定する前にプリカーサ走査を行うことを含む、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１９】
速く立ち上がる質量信号を決定する前にニュートラル・ロス走査を行うことを含む、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項２０】
同定されたイオンの前記フラグメンテーションから得られた質量スペクトルと質量スペクトルのデータベースとを比較して、溶出する化合物を自動的に同定する手段を含む、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１】
物質の質量スペクトログラム・データを得る方法であって、
（ａ）前記物質にクロマトグラフィ・プロセスを行ってその出力をイオン化し、
（ｂ）前記出力の現在の質量スペクトログラムを得、
（ｃ）ステップ（ｂ）で得た前記現在の質量スペクトルと前記出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、
（ｄ）前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する、
物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項２】
前記出力の異なる部分についてステップ１（ｂ）から１（ｄ）を繰り返すことを含む、請求項１記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項３】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記前に収集した質量スペクトルの１つを前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項４】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、複数の前記前に収集した質量スペクトルの平均を前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項５】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、前記前に収集した質量スペクトルの１つ内の値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項６】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、複数の前記前に収集した質量スペクトル内の信号の平均値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項７】
動的除外リストに少なくとも１つの同定されたイオンを載せて、他の速く立ち上がるイオンの同定を可能にすることを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項８】
ステップ１（ｂ）から１（ｄ）を実行する前にプリカーサ走査を行うことを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項９】
ステップ１（ｂ）から１（ｄ）を実行する前にニュートラル・ロス走査を行うことを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項１０】
同定されたイオンのフラグメンテーションから得られた質量スペクトルと質量スペクトルのデータベースとを比較して、溶出する化合物を自動的に同定することを含む、請求項２記載の物質の質量スペクトログラム・データを得る方法。
【請求項１１】
質量分析計装置であって、
（ａ）クロマトグラフィ・カラムと、
（ｂ）質量分析計であって、前記クロマトグラフィ・カラムの出力をイオン化するためのイオン源を含み、選択された質量のイオンを分離し、フラグメント化し、質量分析する機能を有する質量分析計と、
（ｃ）前記質量分析計を動作させるようプログラムされたデータ依存のデータ収集コントローラであって、
１）前記出力の現在の質量スペクトログラムを得て、
２）前記現在の質量スペクトルと前記出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して、速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、
３）前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する、
コントローラと、
を含む質量分析計装置。
【請求項１２】
前記出力の異なる部分について、前記コントローラは前記出力の現在の質量スペクトログラムを繰り返して得て、前記現在の質量スペクトルと前記出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して、早く立ち上がる質量信号を有する１つ以上のイオンを同定し、前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１３】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記前に収集した質量スペクトルの１つを前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１４】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、複数の前記前に収集した質量スペクトルの平均を前記現在の質量スペクトルから引いて同定する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１５】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、前記前に収集した質量スペクトルの１つ内の値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１６】
速く立ち上がる質量信号を有するイオンを、前記現在の質量スペクトル内の各質量信号の値の、複数の前記前に収集した質量スペクトル内のその平均値に対する百分率変化を決定して同定する、請求項１１記載の物質の質量分析計装置。
【請求項１７】
動的除外リストに同定されたイオンを載せて、他の速く立ち上がるイオンの同定を可能にする、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１８】
速く立ち上がる質量信号を決定する前にプリカーサ走査を行うことを含む、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項１９】
速く立ち上がる質量信号を決定する前にニュートラル・ロス走査を行うことを含む、請求項１１記載の質量分析計装置。
【請求項２０】
同定されたイオンの前記フラグメンテーションから得られた質量スペクトルと質量スペクトルのデータベースとを比較して、溶出する化合物を自動的に同定する手段を含む、請求項１１記載の質量分析計装置。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【公表番号】特表２００６−５２２９９９（Ｐ２００６−５２２９９９Ａ）
【公表日】平成１８年１０月５日（２００６．１０．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５０４１０６（Ｐ２００６−５０４１０６）
【出願日】平成１６年４月８日（２００４．４．８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＣＡ２００４／０００５４０
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０９０９３３
【国際公開日】平成１６年１０月２１日（２００４．１０．２１）
【出願人】（５０５３７７１９７）エムディーエス インコーポレイテッド ドゥーイング ビジネス スルー イッツ エムディーエス サイエックス ディヴィジョン (12)
【出願人】（５０３２２９７４２）アプレラ コーポレイション (8)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１８年１０月５日（２００６．１０．５）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年４月８日（２００４．４．８）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＣＡ２００４／０００５４０
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０９０９３３
【国際公開日】平成１６年１０月２１日（２００４．１０．２１）
【出願人】（５０５３７７１９７）エムディーエス インコーポレイテッド ドゥーイング ビジネス スルー イッツ エムディーエス サイエックス ディヴィジョン (12)
【出願人】（５０３２２９７４２）アプレラ コーポレイション (8)
【Ｆターム（参考）】
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