デハロゲナーゼ活性を有する酵素およびその利用方法
【課題】高いpHおよび温度で高い活性および安定性を有するデハロゲナーゼを提供する。
【解決手段】デハロゲナーゼ活性があるポリペプチドを符号化する特定の配列から構成される単離された核酸、配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約１００残留物の範囲に、上記特定配列の核酸の少なくとも1つに対して少なくとも約５０％の相同性のある変異体、上記特定配列に対して相補的な配列、及び配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約１００残留物の範囲に上記変異体に対して相補的な配列。
【解決手段】デハロゲナーゼ活性があるポリペプチドを符号化する特定の配列から構成される単離された核酸、配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約１００残留物の範囲に、上記特定配列の核酸の少なくとも1つに対して少なくとも約５０％の相同性のある変異体、上記特定配列に対して相補的な配列、及び配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約１００残留物の範囲に上記変異体に対して相補的な配列。
Notice: Undefined index: DEJ in /mnt/www/gzt_disp.php on line 298
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列が次から成る群から選択された、デハロゲナーゼ活性があるポリペプチドを符号化する配列から構成される単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項２】
単離された核酸が次から成る群から選択された配列へ高厳密性の条件下でハイブリッド形成し、相補的な配列を構成する、請求項1記載の単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体。
【請求項３】
単離された核酸が、次から成る群から選択された配列に、中程度の厳密性の条件下でハイブリッド形成し、相補的な配列を構成する、請求項1記載の単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体。
【請求項４】
単離された核酸が、次から成る群から選択された配列に、低程度の厳密性の条件下でハイブリッド形成し、相補的な配列を構成する、請求項１記載の単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体。
【請求項５】
上記の変異体が、配列比較アルゴリズム分析で決定されるように、少なくとも約 200 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１記載の単離された核酸。
【請求項６】
上記の変異体が、全配列に 配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１記載の単離された核酸。
【請求項７】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 55％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項８】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 60％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項９】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 65％ の相同性を持つ、請求項1〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１０】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 70％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１１】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 75％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１２】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１３】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 85％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１４】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１５】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１６】
配列比較アルゴリズムがデフォルトパラメータを備えた FASTA バージョン3.0t78 である請求項１記載の単離された核酸。
【請求項１７】
次から成る群から選択された配列の少なくとも 10 連続の塩基のある単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項１８】
上記の配列が、少なくとも約 200 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１７記載の単離された核酸。
【請求項１９】
上記の配列が、全配列に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１７記載の単離された核酸。
【請求項２０】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 55％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２１】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 60％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２２】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 65％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２３】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 70％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２４】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 75％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２５】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２６】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 85％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２７】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２８】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２９】
次から成る群から選択されたポリペプチドを符号化する単離された核酸：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列があるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸配列があるポリペプチド。
【請求項３０】
次から成る群から選択された精製ポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択されたアミノ酸配列があるポリペプチド、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも 10 連続のアミノ酸配列があるポリペプチド。
【請求項３１】
アミノ酸配列が、少なくとも約 200 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項３０記載の精製ポリペプチド。
【請求項３２】
アミノ酸配列が、全配列に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項３０記載の精製ポリペプチド。
【請求項３３】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 55％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３４】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約60％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３５】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 65％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３６】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 70％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３７】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 75％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３８】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３９】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 85％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項４０】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項４１】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項４２】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択されたアミノ酸配列のある、請求項３０記載の精製ポリペプチドであって、配列が、全配列に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、精製ポリペプチド。
【請求項４３】
次から成る群から選択されたポリペプチドを特に結合する精製抗体：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列を構成するポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸配列があるポリペプチド。
【請求項４４】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択されたポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸があるポリペプチドに特に結合する、請求項４３記載の精製抗体。
【請求項４５】
抗体が多クローン性である請求項４３記載の抗体。
【請求項４６】
抗体が単クローン性である請求項４３記載の抗体。
【請求項４７】
次から成る群から選択されたポリペプチドを生成する方法：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列があるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸配列があるポリペプチドであって、ポリペプチドの発現およびポリペプチドの回復を可能にする条件下で、ポリペプチドを符号化する核酸を宿主細胞へ導入するステップを含むポリペプチド。
【請求項４８】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列の少なくとも 10 のアミノ酸配列を構成するポリペプチドを生成する方法であって、ポリペプチドの発現およびポリペプチドの回復を可能にする条件下で、操作可能なようにプロモーターにリンクされているポリペプチドを符号化する核酸の宿主細胞へ導入するステップを含む方法。
【請求項４９】
次の工程から成る変異体を生成する方法：
次から成る群から選択されたポリヌクレオチドを含む核酸を得る工程：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
上記配列の少なくとも 30 連続のヌクレオチドを含む断片、
を得る工程、及び
上記ポリヌクレオチドの1つまたは複数のヌクレオチドを別のヌクレオチドに修飾する、上記ポリヌクレオチド中の1つまたは複数のヌクレオチドを欠失する、あるいは上記ポリヌクレオチドに1つまたは複数のヌクレオチドを追加する工程。
【請求項５０】
請求項４９記載の方法であって、修飾が、エラープロ−ンPCR、シャフリング、オリゴヌクレオチドを標的とした突然変異誘発、アセンブリ PCR、有性 PCR 突然変異誘発、生体内での突然変異誘発、カセット式突然変異誘発、連続的全体突然変異誘発、指数関数的な全体突然変異誘発、部位特異的突然変異誘発、遺伝子再集合、遺伝子部位飽和突然変異誘発、およびその組み合わせ、交換、反復プロセスから構成される群から選択された方法によって導入される、方法。
【請求項５１】
修飾がエラープロ−ンPCR によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５２】
修飾がシャフリングによって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５３】
修飾がオリゴヌクレオチドを標的とした突然変異誘発によって導入される請求項５０記載 の方法。
【請求項５４】
修飾がアセンブリ PCR によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５５】
修飾が有性 PCR 突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５６】
修飾が生体内での突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５７】
修飾がカセット式突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５８】
修飾が連続的全体突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５９】
修飾が指数関数的な全体突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６０】
修飾が部位特異的突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６１】
修飾が遺伝子再集合によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６２】
修飾が遺伝子部位飽和突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６３】
次から成る群から選択された配列が格納されているコンピュータ読み取り可能媒体：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な核酸配列、及び
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項６４】
上記のデータ記憶装置に、次から成る群から選択された配列が格納されている、プロセッサおよびデータ記憶装置を含むコンピュータシステム：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な核酸配列、
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項６５】
さらに配列比較アルゴリズム、そして少なくとも1つの基準配列が保管されているデータ記憶装置を含む、請求項６４記載 のコンピュータシステム。
【請求項６６】
配列比較アルゴリズムに多形性を示すコンピュータプログラムが含まれる、請求項６５記載のコンピュータシステム。
【請求項６７】
上記配列の 1 つあるいは複数の特徴を識別する識別子をさらに含む、請求項６４記載のコンピュータシステム。
【請求項６８】
次のステップを含む、第一配列と第二配列を比較する方法：
配列を比較するコンピュータプログラムを使用して第一配列と第二配列を読むステップ、そして
コンピュータプログラムで第一配列と第二配列間の差違を決定するステップであって、ここでは、上記の第一配列が、次から成る群から選択された配列であるステップ：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体に対して相補的な核酸配列、
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項６９】
第一配列と第二配列間の差違の決定に多形性の識別が含まれる、請求項６８記載の方法。
【請求項７０】
次のステップを含む、配列の特徴を識別する方法：
配列の 1 つあるいは複数の特徴を識別する配列を比較するコンピュータプログラムを使用して配列を読むステップ、そして
コンピュータプログラムで配列の 1 つあるいは複数の特徴を識別するステップであって、ここでは、配列が、次から成る群から選択されるステップ：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、そして
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体に対して相補的な核酸配列、
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項７１】
炭素ハロゲンリンケージの加水分解を促進する条件下で、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46、48 およびそれと実質的に同一な配列から成る群から選択されたポリペプチドを備えた炭素ハロゲンリンケージを含む物質との接触を構成する炭素ハロゲンリンケージを加水分解する方法。
【請求項７２】
ハロアルカンあるいはハロカルボン酸の分解を促進する条件下で、次から成る群から選択された配列があるポリペプチドで、ハロアルカンあるいはハロカルボン酸を含むサンプルと接触するステップを含む、ハロアルカンあるいはハロカルボン酸の分解に触媒作用を及ぼす方法：
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項７３】
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列の断片によって符号化された機能的なポリペプチド断片あるいは変異体を識別するためのアッセイであって、ここでは、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列のポリペプチドの少なくとも 1 つの性質をもち、上記のアッセイが、次のステップ：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列のポリペプチドの接触、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47によって符号化されたポリペプチド断片あるいは変異体、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列、及び前述のいずれかの配列に対しても相補的な配列を、特定のポリペプチドが機能することを可能にする条件下で基質分子と接触させるステップ、及び
前述のポリペプチドと基質間の反応に起因する基質レベルの低下あるいは反応製品レベルの上昇のどちらかを検知するステップであって、基質レベルの低下あるいは反応製品レベルの上昇が、機能的なポリペプチドを示すステップ、
とを含むアッセイ。
【請求項７４】
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から構成される群から選択され、そして検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中から高度の厳格な条件で核酸目標範囲へハイブリッド形成する、核酸配列の核酸目標範囲に対して少なくとも約 50％ 相補的な、長さが約 10〜50 のヌクレオチドで少なくとも10の隣接するヌクレオチドのセグメントがあるオリゴヌクレオチドを含む核酸プローブ。
【請求項７５】
オリゴヌクレオチドが DNA である請求項７４記載のプローブ。
【請求項７６】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 55％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項７７】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 60％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項７８】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 65％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項７９】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 70％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８０】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 75％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８１】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 80％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８２】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 85％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８３】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 90％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８４】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 95％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８５】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して完全に相補的な、少なくとも10の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８６】
オリゴヌクレオチドが長さ 15〜50 の塩基である請求項７４記載のプローブ。
【請求項８７】
プローブに検知できるアイソトープラベルがさらに含まれる請求項７４記載のプローブ。
【請求項８８】
蛍光分子、化学ルミネセンス分子、酵素、補助因子、酵素基質およびハプテンから構成される群から選択した、検知できる非アイソトープラベルがさらにプローブに含まれる請求項７４記載のプローブ。
【請求項８９】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 90％ 相補的な、少なくとも 15 の隣接するヌクレオチドのセグメントがあり、また検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中から高度の厳格な条件で、核酸目標範囲にハイブリッド形成する、請求項８６記載のプローブ。
【請求項９０】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 95％ 相補的な、少なくとも 15 の隣接するヌクレオチドのセグメントがあり、また検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中から高度の厳格な条件で、核酸目標範囲にハイブリッド形成する、請求項８６記載のプローブ。
【請求項９１】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 97％ 相補的な、少なくとも 15 の隣接するヌクレオチドのセグメントがあり、また検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中〜高度の厳格な条件で、核酸目標範囲にハイブリッド形成する、請求項８６記載のプローブ。
【請求項９２】
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の 1 つの少なくとも断片に対して、同じあるいは完全に相補的な配列があるデハロゲナーゼ遺伝子の単離あるいは識別のためのポリヌクレオチドプローブ。
【請求項９３】
次から成る群から選択されたポリペプチドを含む蛋白質製剤であって、蛋白質製剤が液体であるタンパク質製剤：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列のあるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも 10 連続のアミノ酸のあるポリペプチド。
【請求項９４】
次から成る群から選択されたポリペプチドを含む蛋白質製剤であって、蛋白質製剤が固形であるタンパク質製剤：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列のあるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも 10 の連続するアミノ酸のあるポリペプチド。
【請求項９５】
次から成る群から選択されたポリヌクレオチドによって符号化された少なくとも 1 つのポリペプチドを、少なくとも 1 つの生体触媒反応を媒介として、少なくとも 1 つの修飾小分子を生成するために、少なくとも 1 つの小分子と混合するステップを含む、小分子を修飾する方法であって、少なくとも 1 つのポリペプチドにデハロゲナーゼ活性がある、方法：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
前述のポリペプチドのいずれかの断片。
【請求項９６】
少なくとも 1 つのポリペプチドがポリペプチドの複数個を構成し、また少なくとも 1 つの小分子が小分子の複数個を構成する請求項 95 記載の方法であって、それによって、修飾された小分子の複数個が、修飾された小分子のライブラリを形成するために、多くの生体触媒反応を媒介として生成される、方法。
【請求項９７】
望ましい活性を示す、特定の修飾された小分子がライブラリ内に存在することを決定するために、ライブラリをテストするステップを更に含む、請求項９６記載の方法。
【請求項９８】
次のステップを更に含むライブラリをテストする請求項９７記載の方法：
望ましい活性のある修飾された特定の小分子が存在あるいは欠如することを、修飾された小分子の一部をテストし、また望ましい活性のある特定の修飾された小分子を生成する特定の体触媒反応を識別することにより、ライブラリ内で修飾された小分子の複数個の一部を生成するために使用される、生体触媒反応の1つ以外をすべて系統的に除去するステップ。
【請求項９９】
望ましい活性のある修飾された小分子を生成する特定の生体触媒反応が繰り返される、請求項９８記載の方法。
【請求項１００】
少なくとも 1 つの小分子内に発見された別個の構造の一部で反応する生体触媒の群で生体触媒反応が処理される、請求項９３記載の方法であって、
各生体触媒が、特定の構造の一部あるいは関連する構造の一部の群に特有であり、
各生体触媒が、特定の生体触媒に特有の特定構造の一部を含む小分子の複数個と反応する、方法。
【請求項１０１】
デハロゲナーゼ活性、次から成る群から選択された前述の配列がある、ポリペプチドを符号化する配列を含むクローンベクター；
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項１０２】
デハロゲナーゼ活性を有するポリペプチドを符号化する配列を含む宿主細胞であって、配列が、次から成る群から選択される、宿主細胞：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項１０３】
配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9、 配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9 に対して相補的な配列、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、また低、中および高厳密性の条件で、前述の配列のいずれかを持つ核酸をハイブリッド形成する単離された核酸からなる群から選択された配列のあるポリヌクレオチドを含む宿主細胞内で複製することができる発現ベクター。
【請求項１０４】
ベクターが、ウィルスベクター、プラスミドベクター、ファージベクター、ファージミドベクター、コスミド、フォスミド、バクテリオファージ、人工染色体、アデノウィルスベクター、レトロウィルスベクターおよびアデノ随伴ウィルスベクターから成る群から選択された、請求項１０１又は１０３記載のベクター。
【請求項１０５】
請求項１０３記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１０６】
宿主が、原核生物、真核生物、菌類、イースト、植物および代謝の豊かな宿主から成る群から選択された、請求項４７、１０２、１０３又は１０５のいずれか１項記載の宿主細胞。
【請求項１０７】
請求項１記載の単離された核酸であって、変異体が、エラープロ−ンPCR、シャフリング、オリゴヌクレオチドを標的とした突然変異誘発、アセンブリ PCR、有性 PCR 突然変異誘発、生体内での突然変異誘発、カセット式突然変異誘発、連続的全体突然変異誘発、指数関数的な全体突然変異誘発、部位特異的突然変異誘発、遺伝子再集合、遺伝子部位飽和突然変異誘発、およびその組み合わせ、交換あるいは反復プロセスから選択された方法によって生成される、核酸。
【請求項１０８】
1 つあるいは複数のヌクレオチドの修飾が随意で1回以上繰り返される請求項４９〜６２のいずれか１項記載の方法。
【請求項１０９】
修飾が修飾された塩基の導入である請求項４９記載の方法。
【請求項１１０】
修飾された塩基がイノシンである請求項６４記載の方法。
【請求項１１１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成り、そして(R)- (±)-3-ハロ-1,2-プロパンジオールを生成する条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとの1,3 ジハロ-2-プロパノールの接触を含む、(R)- (±)-3-ハロ-1,2-プロパンジオールを生成する方法。
【請求項１１２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１６】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そしてグリセリンを合成する条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのトリクロロプロパンあるいはジクロロプロパノールの接触を含む、グリセリンを合成する方法。
【請求項１１７】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１１６記載の方法。
【請求項１１８】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１１６記載の方法。
【請求項１１９】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１１６記載の方法。
【請求項１２０】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１１６記載の方法。
【請求項１２１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そして活性ハロ乳酸を光学的に生成させるための条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのジハロプロピオン酸の接触を含む、活性ハロ乳酸を光学的に生成させる方法。
【請求項１２２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２６】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成り、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとの環境サンプルの接触を含む、生物学的浄化能力のための方法。
【請求項１２７】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１２６記載の方法。
【請求項１２８】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１２６記載の方法。
【請求項１２９】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１２６記載の方法。
【請求項１３０】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１２６記載の方法。
【請求項１３１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成り、デハロゲナーゼ活性のある群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのサンプル接触を含む、サンプルからハロゲン化された汚染物質あるいはハロゲン化された不純物を取り除く方法。
【請求項１３２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３６】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そしてジオールを合成させるための条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのジハロプロパンあるいはモノハロプロパノールの接触を含む、ジオールを合成させるための方法。
【請求項１３７】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１３６記載の方法。
【請求項１３８】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１３６記載の方法。
【請求項１３９】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１３６記載の方法。
【請求項１４０】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１３６記載の方法。
【請求項１４１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そしてジオールを合成させるための条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのハロ置換環式ヒドロカルビルの接触を含む、ハロ置換環式ヒドロカルビルをデハロゲナーゼ化するための方法。
【請求項１４２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１４１記載の方法。
【請求項１４３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１４１記載の方法。
【請求項１４４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１４１記載の方法。
【請求項１４５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１４１記載の方法。
【請求項１】
配列が次から成る群から選択された、デハロゲナーゼ活性があるポリペプチドを符号化する配列から構成される単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項２】
単離された核酸が次から成る群から選択された配列へ高厳密性の条件下でハイブリッド形成し、相補的な配列を構成する、請求項1記載の単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体。
【請求項３】
単離された核酸が、次から成る群から選択された配列に、中程度の厳密性の条件下でハイブリッド形成し、相補的な配列を構成する、請求項1記載の単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体。
【請求項４】
単離された核酸が、次から成る群から選択された配列に、低程度の厳密性の条件下でハイブリッド形成し、相補的な配列を構成する、請求項１記載の単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体。
【請求項５】
上記の変異体が、配列比較アルゴリズム分析で決定されるように、少なくとも約 200 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１記載の単離された核酸。
【請求項６】
上記の変異体が、全配列に 配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１記載の単離された核酸。
【請求項７】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 55％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項８】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 60％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項９】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 65％ の相同性を持つ、請求項1〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１０】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 70％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１１】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 75％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１２】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１３】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 85％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１４】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１５】
上記の変異体が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１〜６のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項１６】
配列比較アルゴリズムがデフォルトパラメータを備えた FASTA バージョン3.0t78 である請求項１記載の単離された核酸。
【請求項１７】
次から成る群から選択された配列の少なくとも 10 連続の塩基のある単離された核酸：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項１８】
上記の配列が、少なくとも約 200 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１７記載の単離された核酸。
【請求項１９】
上記の配列が、全配列に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項１７記載の単離された核酸。
【請求項２０】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 55％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２１】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 60％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２２】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 65％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２３】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 70％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２４】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 75％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２５】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２６】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 85％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２７】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２８】
上記の配列が、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１７〜１９のいずれか１項記載の単離された核酸。
【請求項２９】
次から成る群から選択されたポリペプチドを符号化する単離された核酸：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列があるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸配列があるポリペプチド。
【請求項３０】
次から成る群から選択された精製ポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択されたアミノ酸配列があるポリペプチド、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも 10 連続のアミノ酸配列があるポリペプチド。
【請求項３１】
アミノ酸配列が、少なくとも約 200 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項３０記載の精製ポリペプチド。
【請求項３２】
アミノ酸配列が、全配列に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、請求項３０記載の精製ポリペプチド。
【請求項３３】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 55％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３４】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約60％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３５】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 65％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３６】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 70％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３７】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 75％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３８】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項３９】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 85％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項４０】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項４１】
アミノ酸配列が、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列に対して少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項３０〜３２のいずれか１項記載の精製ポリペプチド。
【請求項４２】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択されたアミノ酸配列のある、請求項３０記載の精製ポリペプチドであって、配列が、全配列に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性を持つ、精製ポリペプチド。
【請求項４３】
次から成る群から選択されたポリペプチドを特に結合する精製抗体：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列を構成するポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸配列があるポリペプチド。
【請求項４４】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択されたポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸があるポリペプチドに特に結合する、請求項４３記載の精製抗体。
【請求項４５】
抗体が多クローン性である請求項４３記載の抗体。
【請求項４６】
抗体が単クローン性である請求項４３記載の抗体。
【請求項４７】
次から成る群から選択されたポリペプチドを生成する方法：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列があるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも10連続のアミノ酸配列があるポリペプチドであって、ポリペプチドの発現およびポリペプチドの回復を可能にする条件下で、ポリペプチドを符号化する核酸を宿主細胞へ導入するステップを含むポリペプチド。
【請求項４８】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列の少なくとも 10 のアミノ酸配列を構成するポリペプチドを生成する方法であって、ポリペプチドの発現およびポリペプチドの回復を可能にする条件下で、操作可能なようにプロモーターにリンクされているポリペプチドを符号化する核酸の宿主細胞へ導入するステップを含む方法。
【請求項４９】
次の工程から成る変異体を生成する方法：
次から成る群から選択されたポリヌクレオチドを含む核酸を得る工程：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
上記配列の少なくとも 30 連続のヌクレオチドを含む断片、
を得る工程、及び
上記ポリヌクレオチドの1つまたは複数のヌクレオチドを別のヌクレオチドに修飾する、上記ポリヌクレオチド中の1つまたは複数のヌクレオチドを欠失する、あるいは上記ポリヌクレオチドに1つまたは複数のヌクレオチドを追加する工程。
【請求項５０】
請求項４９記載の方法であって、修飾が、エラープロ−ンPCR、シャフリング、オリゴヌクレオチドを標的とした突然変異誘発、アセンブリ PCR、有性 PCR 突然変異誘発、生体内での突然変異誘発、カセット式突然変異誘発、連続的全体突然変異誘発、指数関数的な全体突然変異誘発、部位特異的突然変異誘発、遺伝子再集合、遺伝子部位飽和突然変異誘発、およびその組み合わせ、交換、反復プロセスから構成される群から選択された方法によって導入される、方法。
【請求項５１】
修飾がエラープロ−ンPCR によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５２】
修飾がシャフリングによって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５３】
修飾がオリゴヌクレオチドを標的とした突然変異誘発によって導入される請求項５０記載 の方法。
【請求項５４】
修飾がアセンブリ PCR によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５５】
修飾が有性 PCR 突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５６】
修飾が生体内での突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５７】
修飾がカセット式突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５８】
修飾が連続的全体突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項５９】
修飾が指数関数的な全体突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６０】
修飾が部位特異的突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６１】
修飾が遺伝子再集合によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６２】
修飾が遺伝子部位飽和突然変異誘発によって導入される請求項５０記載の方法。
【請求項６３】
次から成る群から選択された配列が格納されているコンピュータ読み取り可能媒体：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な核酸配列、及び
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項６４】
上記のデータ記憶装置に、次から成る群から選択された配列が格納されている、プロセッサおよびデータ記憶装置を含むコンピュータシステム：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な核酸配列、
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項６５】
さらに配列比較アルゴリズム、そして少なくとも1つの基準配列が保管されているデータ記憶装置を含む、請求項６４記載 のコンピュータシステム。
【請求項６６】
配列比較アルゴリズムに多形性を示すコンピュータプログラムが含まれる、請求項６５記載のコンピュータシステム。
【請求項６７】
上記配列の 1 つあるいは複数の特徴を識別する識別子をさらに含む、請求項６４記載のコンピュータシステム。
【請求項６８】
次のステップを含む、第一配列と第二配列を比較する方法：
配列を比較するコンピュータプログラムを使用して第一配列と第二配列を読むステップ、そして
コンピュータプログラムで第一配列と第二配列間の差違を決定するステップであって、ここでは、上記の第一配列が、次から成る群から選択された配列であるステップ：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体に対して相補的な核酸配列、
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項６９】
第一配列と第二配列間の差違の決定に多形性の識別が含まれる、請求項６８記載の方法。
【請求項７０】
次のステップを含む、配列の特徴を識別する方法：
配列の 1 つあるいは複数の特徴を識別する配列を比較するコンピュータプログラムを使用して配列を読むステップ、そして
コンピュータプログラムで配列の 1 つあるいは複数の特徴を識別するステップであって、ここでは、配列が、次から成る群から選択されるステップ：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の核酸配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な核酸配列、そして
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 対して少なくとも約 50％ の相同性のある核酸配列の変異体に対して相補的な核酸配列、
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも 1 つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項７１】
炭素ハロゲンリンケージの加水分解を促進する条件下で、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46、48 およびそれと実質的に同一な配列から成る群から選択されたポリペプチドを備えた炭素ハロゲンリンケージを含む物質との接触を構成する炭素ハロゲンリンケージを加水分解する方法。
【請求項７２】
ハロアルカンあるいはハロカルボン酸の分解を促進する条件下で、次から成る群から選択された配列があるポリペプチドで、ハロアルカンあるいはハロカルボン酸を含むサンプルと接触するステップを含む、ハロアルカンあるいはハロカルボン酸の分解に触媒作用を及ぼす方法：
ポリペプチド配列 配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的なポリペプチド配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のあるポリペプチド配列の変異体に対して相補的なポリペプチド配列。
【請求項７３】
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列の断片によって符号化された機能的なポリペプチド断片あるいは変異体を識別するためのアッセイであって、ここでは、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列のポリペプチドの少なくとも 1 つの性質をもち、上記のアッセイが、次のステップ：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列のポリペプチドの接触、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47によって符号化されたポリペプチド断片あるいは変異体、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47に対して少なくとも約 50％ の相同性のある配列、及び前述のいずれかの配列に対しても相補的な配列を、特定のポリペプチドが機能することを可能にする条件下で基質分子と接触させるステップ、及び
前述のポリペプチドと基質間の反応に起因する基質レベルの低下あるいは反応製品レベルの上昇のどちらかを検知するステップであって、基質レベルの低下あるいは反応製品レベルの上昇が、機能的なポリペプチドを示すステップ、
とを含むアッセイ。
【請求項７４】
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 から構成される群から選択され、そして検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中から高度の厳格な条件で核酸目標範囲へハイブリッド形成する、核酸配列の核酸目標範囲に対して少なくとも約 50％ 相補的な、長さが約 10〜50 のヌクレオチドで少なくとも10の隣接するヌクレオチドのセグメントがあるオリゴヌクレオチドを含む核酸プローブ。
【請求項７５】
オリゴヌクレオチドが DNA である請求項７４記載のプローブ。
【請求項７６】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 55％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項７７】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 60％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項７８】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 65％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項７９】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 70％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８０】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 75％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８１】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 80％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８２】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 85％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８３】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 90％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８４】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 95％ 相補的な、少なくとも 10 の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８５】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して完全に相補的な、少なくとも10の隣接するヌクレオチドのセグメントがある請求項７４記載のプローブ。
【請求項８６】
オリゴヌクレオチドが長さ 15〜50 の塩基である請求項７４記載のプローブ。
【請求項８７】
プローブに検知できるアイソトープラベルがさらに含まれる請求項７４記載のプローブ。
【請求項８８】
蛍光分子、化学ルミネセンス分子、酵素、補助因子、酵素基質およびハプテンから構成される群から選択した、検知できる非アイソトープラベルがさらにプローブに含まれる請求項７４記載のプローブ。
【請求項８９】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 90％ 相補的な、少なくとも 15 の隣接するヌクレオチドのセグメントがあり、また検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中から高度の厳格な条件で、核酸目標範囲にハイブリッド形成する、請求項８６記載のプローブ。
【請求項９０】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 95％ 相補的な、少なくとも 15 の隣接するヌクレオチドのセグメントがあり、また検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中から高度の厳格な条件で、核酸目標範囲にハイブリッド形成する、請求項８６記載のプローブ。
【請求項９１】
オリゴヌクレオチドに、核酸目標範囲に対して少なくとも約 97％ 相補的な、少なくとも 15 の隣接するヌクレオチドのセグメントがあり、また検知できる目標：二重のプローブを形成するために、中〜高度の厳格な条件で、核酸目標範囲にハイブリッド形成する、請求項８６記載のプローブ。
【請求項９２】
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の 1 つの少なくとも断片に対して、同じあるいは完全に相補的な配列があるデハロゲナーゼ遺伝子の単離あるいは識別のためのポリヌクレオチドプローブ。
【請求項９３】
次から成る群から選択されたポリペプチドを含む蛋白質製剤であって、蛋白質製剤が液体であるタンパク質製剤：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列のあるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも 10 連続のアミノ酸のあるポリペプチド。
【請求項９４】
次から成る群から選択されたポリペプチドを含む蛋白質製剤であって、蛋白質製剤が固形であるタンパク質製剤：
次から成る群から選択されたアミノ酸配列のあるポリペプチド：
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 から成る群から選択された配列があるポリペプチドの少なくとも 10 の連続するアミノ酸のあるポリペプチド。
【請求項９５】
次から成る群から選択されたポリヌクレオチドによって符号化された少なくとも 1 つのポリペプチドを、少なくとも 1 つの生体触媒反応を媒介として、少なくとも 1 つの修飾小分子を生成するために、少なくとも 1 つの小分子と混合するステップを含む、小分子を修飾する方法であって、少なくとも 1 つのポリペプチドにデハロゲナーゼ活性がある、方法：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、及び
前述のポリペプチドのいずれかの断片。
【請求項９６】
少なくとも 1 つのポリペプチドがポリペプチドの複数個を構成し、また少なくとも 1 つの小分子が小分子の複数個を構成する請求項 95 記載の方法であって、それによって、修飾された小分子の複数個が、修飾された小分子のライブラリを形成するために、多くの生体触媒反応を媒介として生成される、方法。
【請求項９７】
望ましい活性を示す、特定の修飾された小分子がライブラリ内に存在することを決定するために、ライブラリをテストするステップを更に含む、請求項９６記載の方法。
【請求項９８】
次のステップを更に含むライブラリをテストする請求項９７記載の方法：
望ましい活性のある修飾された特定の小分子が存在あるいは欠如することを、修飾された小分子の一部をテストし、また望ましい活性のある特定の修飾された小分子を生成する特定の体触媒反応を識別することにより、ライブラリ内で修飾された小分子の複数個の一部を生成するために使用される、生体触媒反応の1つ以外をすべて系統的に除去するステップ。
【請求項９９】
望ましい活性のある修飾された小分子を生成する特定の生体触媒反応が繰り返される、請求項９８記載の方法。
【請求項１００】
少なくとも 1 つの小分子内に発見された別個の構造の一部で反応する生体触媒の群で生体触媒反応が処理される、請求項９３記載の方法であって、
各生体触媒が、特定の構造の一部あるいは関連する構造の一部の群に特有であり、
各生体触媒が、特定の生体触媒に特有の特定構造の一部を含む小分子の複数個と反応する、方法。
【請求項１０１】
デハロゲナーゼ活性、次から成る群から選択された前述の配列がある、ポリペプチドを符号化する配列を含むクローンベクター；
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項１０２】
デハロゲナーゼ活性を有するポリペプチドを符号化する配列を含む宿主細胞であって、配列が、次から成る群から選択される、宿主細胞：
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47、
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 の少なくとも1つに対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、
配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して相補的な配列、及び
配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列。
【請求項１０３】
配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9、 配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体、配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9 に対して相補的な配列、そして配列比較アルゴリズムあるいは目視検査による分析で決定されるように、少なくとも約 100 残留物の範囲に、配列番号: 1、3、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、43、45 および 47 と 9 に対して少なくとも約 50％ の相同性のある変異体に対して相補的な配列、また低、中および高厳密性の条件で、前述の配列のいずれかを持つ核酸をハイブリッド形成する単離された核酸からなる群から選択された配列のあるポリヌクレオチドを含む宿主細胞内で複製することができる発現ベクター。
【請求項１０４】
ベクターが、ウィルスベクター、プラスミドベクター、ファージベクター、ファージミドベクター、コスミド、フォスミド、バクテリオファージ、人工染色体、アデノウィルスベクター、レトロウィルスベクターおよびアデノ随伴ウィルスベクターから成る群から選択された、請求項１０１又は１０３記載のベクター。
【請求項１０５】
請求項１０３記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１０６】
宿主が、原核生物、真核生物、菌類、イースト、植物および代謝の豊かな宿主から成る群から選択された、請求項４７、１０２、１０３又は１０５のいずれか１項記載の宿主細胞。
【請求項１０７】
請求項１記載の単離された核酸であって、変異体が、エラープロ−ンPCR、シャフリング、オリゴヌクレオチドを標的とした突然変異誘発、アセンブリ PCR、有性 PCR 突然変異誘発、生体内での突然変異誘発、カセット式突然変異誘発、連続的全体突然変異誘発、指数関数的な全体突然変異誘発、部位特異的突然変異誘発、遺伝子再集合、遺伝子部位飽和突然変異誘発、およびその組み合わせ、交換あるいは反復プロセスから選択された方法によって生成される、核酸。
【請求項１０８】
1 つあるいは複数のヌクレオチドの修飾が随意で1回以上繰り返される請求項４９〜６２のいずれか１項記載の方法。
【請求項１０９】
修飾が修飾された塩基の導入である請求項４９記載の方法。
【請求項１１０】
修飾された塩基がイノシンである請求項６４記載の方法。
【請求項１１１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成り、そして(R)- (±)-3-ハロ-1,2-プロパンジオールを生成する条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとの1,3 ジハロ-2-プロパノールの接触を含む、(R)- (±)-3-ハロ-1,2-プロパンジオールを生成する方法。
【請求項１１２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１１１記載の方法。
【請求項１１６】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そしてグリセリンを合成する条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのトリクロロプロパンあるいはジクロロプロパノールの接触を含む、グリセリンを合成する方法。
【請求項１１７】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１１６記載の方法。
【請求項１１８】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１１６記載の方法。
【請求項１１９】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１１６記載の方法。
【請求項１２０】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１１６記載の方法。
【請求項１２１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そして活性ハロ乳酸を光学的に生成させるための条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのジハロプロピオン酸の接触を含む、活性ハロ乳酸を光学的に生成させる方法。
【請求項１２２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１２１記載の方法。
【請求項１２６】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成り、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとの環境サンプルの接触を含む、生物学的浄化能力のための方法。
【請求項１２７】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１２６記載の方法。
【請求項１２８】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１２６記載の方法。
【請求項１２９】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１２６記載の方法。
【請求項１３０】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１２６記載の方法。
【請求項１３１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成り、デハロゲナーゼ活性のある群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのサンプル接触を含む、サンプルからハロゲン化された汚染物質あるいはハロゲン化された不純物を取り除く方法。
【請求項１３２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１３１記載の方法。
【請求項１３６】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そしてジオールを合成させるための条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのジハロプロパンあるいはモノハロプロパノールの接触を含む、ジオールを合成させるための方法。
【請求項１３７】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１３６記載の方法。
【請求項１３８】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１３６記載の方法。
【請求項１３９】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１３６記載の方法。
【請求項１４０】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１３６記載の方法。
【請求項１４１】
配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る、そしてジオールを合成させるための条件下で、デハロゲナーゼ活性を持つ群から選択された配列に少なくとも約 70％ の相同性のあるポリペプチドとのハロ置換環式ヒドロカルビルの接触を含む、ハロ置換環式ヒドロカルビルをデハロゲナーゼ化するための方法。
【請求項１４２】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 80％ の相同性を持つ、請求項１４１記載の方法。
【請求項１４３】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 90％ の相同性を持つ、請求項１４１記載の方法。
【請求項１４４】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに実質的に同一な配列から成る群から選択された配列に少なくとも約 95％ の相同性を持つ、請求項１４１記載の方法。
【請求項１４５】
ポリペプチドが、配列番号: 4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、44、46 および 48 やそれに保存性の置換、欠失あるいは挿入がある配列から成る群で示された配列がある、請求項１４１記載の方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６Ａ】
【図６Ｂ】
【図６Ｃ】
【図６Ｄ】
【図６Ｅ】
【図６Ｆ】
【図６Ｇ】
【図６Ｈ】
【図６Ｉ】
【図６Ｊ】
【図６Ｋ】
【図６Ｌ】
【図６Ｍ】
【図６Ｎ】
【図６Ｏ】
【図６Ｐ】
【図６Ｑ】
【図６Ｒ】
【図７】
【図８】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６Ａ】
【図６Ｂ】
【図６Ｃ】
【図６Ｄ】
【図６Ｅ】
【図６Ｆ】
【図６Ｇ】
【図６Ｈ】
【図６Ｉ】
【図６Ｊ】
【図６Ｋ】
【図６Ｌ】
【図６Ｍ】
【図６Ｎ】
【図６Ｏ】
【図６Ｐ】
【図６Ｑ】
【図６Ｒ】
【図７】
【図８】
【公開番号】特開２０１０−２６８７９６（Ｐ２０１０−２６８７９６Ａ）
【公開日】平成２２年１２月２日（２０１０．１２．２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−１３３３１８（Ｐ２０１０−１３３３１８）
【出願日】平成２２年６月１０日（２０１０．６．１０）
【分割の表示】特願２００２−５６８６７９（Ｐ２００２−５６８６７９）の分割
【原出願日】平成１３年１１月３０日（２００１．１１．３０）
【出願人】（５０３０８９４８９）ヴェレニウム コーポレイション (31)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２２年１２月２日（２０１０．１２．２）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年６月１０日（２０１０．６．１０）
【分割の表示】特願２００２−５６８６７９（Ｐ２００２−５６８６７９）の分割
【原出願日】平成１３年１１月３０日（２００１．１１．３０）
【出願人】（５０３０８９４８９）ヴェレニウム コーポレイション (31)
【Ｆターム（参考）】
[ Back to top ]