【課題】前立腺癌の検出および治療に有用なさらなるマーカーの同定とその利用。
【解決手段】優先的に前立腺および前立腺癌において発現される、前立腺腫瘍細胞表面のヘビ状膜貫通抗原の新規のファミリーにおける２つのＳＴＥＡＰ−２およびＳＴＥＡＰ−３タンパク質とその核酸配列。これらの抗原フラグメント、および、これらに対するモノクロナール抗体またはそのフラグメント、該核酸配列をふくむ薬学的組成物、アッセイへの利用。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
図９Ａ〜Ｄに示されるアミノ酸配列（配列番号８）を有するＳＴＥＡＰ−２タンパク質。
【請求項２】
ＳＴＥＡＰ−２ポリペプチドであって、ここで該ＳＴＥＡＰ−２ポリペプチドが、図９Ａ〜Ｄに示されるアミノ酸配列（配列番号８）のアミノ酸１〜２４５、２〜２０４、１００〜１０８、１２１〜４５４、１５３〜１６５、１８２〜４５４、１８３〜３８７、２２７〜２３５、２７６〜４５３、３０６〜３１４、３０７〜３１５、３４５〜３５８、４０２〜４１０、および４１９〜４５４からなる群からから選択されるアミノ酸配列の少なくとも１０個連続したアミノ酸を含む、ＳＴＥＡＰ−２ポリペプチド。
【請求項３】
図９Ａ〜Ｄに示されるアミノ酸配列（配列番号８）に、その全長にわたって少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド。
【請求項４】
（ａ）図９Ａ〜Ｄに示されるような配列（配列番号７）を有するポリヌクレオチドであって、ここでＴがまたＵであり得る、ポリヌクレオチド；（ｂ）配列が、受託番号ＰＴＡ−３１１としてアメリカン タイプ コレクションに寄託されたプラスミド９８Ｐ４Ｂ６−ＧＴＤ３に含まれるｃＤＮＡによってコードされるＳＴＥＡＰ−２ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；（ｃ）請求項１に記載のＳＴＥＡＰ−２タンパク質をコードするポリヌクレオチド；および（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のポリヌクレオチドに十分に相補的であるポリヌクレオチドからなる群より選択される、ポリヌクレオチド。
【請求項５】
請求項２に記載のフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項６】
請求項４または５に記載のポリヌクレオチドを含む、組換え発現ベクター。
【請求項７】
請求項６に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項８】
検出可能なマーカーで標識された、請求項４または５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項９】
ＳＴＥＡＰ−２タンパク質を生成するプロセスであって、該プロセスは、ポリペプチドの生成に十分な条件下で請求項７に記載の宿主細胞を培養する工程および該培養物から該ＳＴＥＡＰ−２タンパク質を回収する工程を包含する、プロセス。
【請求項１０】
請求項１に記載のＳＴＥＡＰ−２タンパク質のアミノ酸１〜２４５、２〜２０４、１００〜１０８、１２１〜４５４、１５３〜１６５、１８２〜４５４、１８３〜３８７、２２７〜２３５、２７６〜４５３、３０６〜３１４、３０７〜３１５、３４５〜３５８、４０２〜４１０、または４１９〜４５４内のエピトープに特異的に結合する、抗体またはそのフラグメント。
【請求項１１】
モノクローナルである、請求項１０に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項１２】
請求項１１に記載のモノクローナル抗体の抗原結合領域を含む、組換えタンパク質。
【請求項１３】
検出可能なマーカーで標識された、請求項１０または１１に記載の抗体またはそのフラグメント、あるいは請求項１２に記載の組換えタンパク質。
【請求項１４】
請求項１３に記載の抗体またはそのフラグメントまたは組換えタンパク質であって、ここで前記検出可能なマーカーが、放射性同位元素、金属キレート剤、酵素または蛍光化合物、生物発光化合物もしくは化学発光化合物を含む、抗体またはそのフラグメントまたは組換えタンパク質。
【請求項１５】
Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、ＦｖまたはＳｆｖフラグメントである、請求項１３に記載の抗体フラグメント。
【請求項１６】
ヒト抗体である、請求項１０、１１、１３または１４のいずれか１項に記載の抗体もしくはそのフラグメント。
【請求項１７】
マウス抗原結合領域残基およびヒト抗体残基を含む、請求項１０、１１、１３または１４に記載の抗体。
【請求項１８】
請求項１１に記載のモノクローナル抗体を産生する、トランスジェニック動物。
【請求項１９】
請求項１１に記載のモノクローナル抗体を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項２０】
請求項１１に記載のモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む、単鎖モノクローナル抗体。
【請求項２１】
請求項２０に記載の単鎖モノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチドを含む、ベクター。
【請求項２２】
毒素、放射性同位元素または治療薬剤に結合される、請求項１１に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項２３】
請求項２２に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメントであって、ここで、前記毒素が、リシン、リシンＡ鎖、ドキソルビシン、ダウノルビシン、メイタンシノイド、タキソール、エチジウムブロマイド、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ジヒドロキシアントラシンジオン、アクチノマイシン、ジフテリア毒素、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）Ａ、ＰＥ４０、アブリン、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、αサルシン、ゲロニン、マイトジェリン、リストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン、キュリシン、クロチン、カリーチアミシン、サパオナリアオフィシナリスインヒビター、またはグルココルチコイドを含む、モノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項２４】
前記放射性同位元素が^２１２Ｂｉ、^１３１Ｉ、^１３１Ｉｎ、^９０Ｙ、または^１８６Ｒｅである、請求項２２に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項２５】
生物学的サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−２タンパク質の存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイが該サンプルと請求項１３に記載の抗体を接触させる工程、および該サンプルにおけるＳＴＥＡＰ−２タンパク質の該抗体への結合を検出する工程を包含する、アッセイ。
【請求項２６】
生物学的サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチドの存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイが、以下：
（ａ）該サンプルと請求項４に記載のポリヌクレオチドに特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブを接触させる工程；および
（ｂ）該サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチドと該プローブとのハイブリダイゼーションによって形成されるハイブリダイゼーション複合体の存在を検出し、ここで該ハイブリダイゼーション複合体の存在が該サンプル中のＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチドの存在を示す、工程、を包含する、アッセイ。
【請求項２７】
生物学的サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−２ ｍＲＮＡの存在を検出するアッセイであって、該アッセイが、以下：
（ａ）少なくとも１つのプライマーを使用する逆転写によって該サンプル由来のｃＤＮＡを生成する工程；
（ｂ）そのように生成される該ｃＤＮＡを、センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとしてＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチドを使用して増幅し、それによって該生物学的サンプル内でＳＴＥＡＰ−２ ｃＤＮＡを増幅する工程；
（ｃ）該増幅されたＳＴＥＡＰ−２ ｃＤＮＡの存在を検出する工程、
を包含し、ここで、該センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして使用されるＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチドが、図９Ａ〜Ｄに示されるポリヌクレオチド（配列番号７）を増幅し得る、アッセイ。
【請求項２８】
薬学的組成物であって、該薬学的組成物が、請求項１０、１１、１５、１６または１７に記載の抗体もしくはそのフラグメント、請求項１または２に記載のＳＴＥＡＰ−２タンパク質、あるいは請求項４または５に記載のＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチド、および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
【請求項２９】
請求項１もしくは２に記載のＳＴＥＡＰ−２タンパク質、または請求項４もしくは５に記載のＳＴＥＡＰ−２ポリヌクレオチド、および薬学的に受容可能なキャリアを含む、ワクチン組成物。
【請求項３０】
患者においてＳＴＥＡＰ−２を発現する癌の発生または進行を阻害する、請求項２９に記載のワクチン組成物。
【請求項３１】
患者においてＳＴＥＡＰ−２を発現する細胞の増殖を阻害する、請求項２９に記載のワクチン組成物。
【請求項３２】
患者においてＳＴＥＡＰ−２を発現する細胞を殺す、請求項２９に記載のワクチン組成物。
【請求項３３】
請求項２に記載のＳＴＥＡＰ−２タンパク質に特異的に結合するモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む単鎖モノクローナル抗体をコードするベクターであって、該ベクターが、ガン細胞に該単鎖モノクローナル抗体コード配列を送達し、そして該コードされた単鎖抗体が、該ガン細胞の細胞内に発現される、ベクター。
【請求項３４】
ＳＴＥＡＰ−２を発現する細胞の増殖を阻害するための、請求項３３に記載のベクター。
【請求項３５】
ＳＴＥＡＰ−２を発現する細胞を殺すための、請求項３３に記載のベクター。
【請求項３６】
図１０Ａ〜Ｅに示されるアミノ酸配列（配列番号１０）を有するＳＴＥＡＰ−３タンパク質。
【請求項３７】
請求項３６に記載のタンパク質の少なくとも１０個連続したアミノ酸配列のポリペプチド。
【請求項３８】
図１０Ａ〜Ｅに示されるアミノ酸配列（配列番号１０）に、その全長にわたって少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド。
【請求項３９】
（ａ）図１０Ａ〜Ｅに示されるような配列（配列番号９）を有するポリヌクレオチドであって、ここでＴがまたＵであり得る、ポリヌクレオチド；（ｂ）請求項３６に記載のＳＴＥＡＰ−３タンパク質をコードするポリヌクレオチド；および（ｃ）（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドに十分に相補的であるポリヌクレオチドからなる群より選択される、ポリヌクレオチド。
【請求項４０】
請求項３６に記載のＳＴＥＡＰ−３タンパク質に特異的に結合する、抗体またはそのフラグメント。
【請求項４１】
モノクローナルである、請求項４０に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項４２】
請求項４１に記載のモノクローナル抗体の抗原結合領域を含む、組換えタンパク質。
【請求項４３】
検出可能なマーカーで標識された、請求項４０または４１に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項４４】
請求項４３に記載の抗体またはそのフラグメントまたは請求項４２に記載の組換えタンパク質であって、ここで前記検出可能なマーカーが、放射性同位元素、金属キレート剤、酵素または蛍光化合物、生物発光化合物もしくは化学発光化合物を含む、抗体またはそのフラグメントまたは組換えタンパク質
【請求項４５】
毒素、放射性同位元素または治療薬剤に結合される、請求項４１に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項４６】
請求項４１に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメントであって、ここで、前記毒素が、リシン、リシンＡ鎖、ドキソルビシン、ダウノルビシン、メイタンシノイド、タキソール、エチジウムブロマイド、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ジヒドロキシアントラシンジオン、アクチノマイシン、ジフテリア毒素、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）Ａ、ＰＥ４０、アブリン、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、αサルシン、ゲロニン、マイトゲリン、リストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン、クリシン、クロチン、カリケアミシン、サパオナリアオフィシナリスインヒビター、またはグルココルチコイドを含む、モノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項４７】
前記放射性同位元素が^２１２Ｂｉ、^１３１Ｉ、^１３１Ｉｎ、^９０Ｙ、または^１８６Ｒｅである、請求項４１に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項４８】
Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、ＦｖまたはＳｆｖフラグメントである、請求項４１に記載の抗体フラグメント。
【請求項４９】
ヒト抗体である、請求項４０、４１、および４３〜４８のいずれか１項に記載の抗体もしくはそのフラグメント。
【請求項５０】
マウス抗原結合領域残基およびヒト抗体残基を含む、請求項４０、４１、および４３〜４８のいずれか１項に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項５１】
請求項４１に記載のモノクローナル抗体を産生する、トランスジェニック動物。
【請求項５２】
請求項４１に記載のモノクローナル抗体を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項５３】
請求項４１に記載のモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む、単鎖モノクローナル抗体。
【請求項５４】
請求項５３に記載の単鎖モノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチドを含む、ベクター。
【請求項５５】
生物学的サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−３タンパク質の存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイが、該サンプルと請求項４３または４４に記載の抗体を接触させる工程、および該サンプルにおけるＳＴＥＡＰ−３タンパク質の該抗体への結合を検出する工程を包含する、アッセイ。
【請求項５６】
生物学的サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−３ポリヌクレオチドの存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイが、以下：
（ａ）該サンプルと請求項３９に記載のポリヌクレオチドまたはその相補体に特異的にハイブリダイズするポリヌクレオチドプローブを接触させる工程；および
（ｂ）該サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−３ポリヌクレオチドと該プローブとのハイブリダイゼーションによって形成されるハイブリダイゼーション複合体の存在を検出する工程、を包含し、ここで該ハイブリダイゼーション複合体の存在が該サンプル中のＳＴＥＡＰ−３ポリヌクレオチドの存在を示す、アッセイ。
【請求項５７】
生物学的サンプルにおいてＳＴＥＡＰ−３ ｍＲＮＡの存在を検出するアッセイであって、該アッセイが、以下：
（ａ）少なくとも１つのプライマーを使用する逆転写によって該サンプル由来のｃＤＮＡを生成する工程；
（ｂ）そのように生成される該ｃＤＮＡを、センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとしてＳＴＥＡＰ−３ポリヌクレオチドを使用して増幅し、それによって該生物学的サンプル内でＳＴＥＡＰ−３ ｃＤＮＡを増幅する工程；
（ｃ）該増幅されたＳＴＥＡＰ−３ ｃＤＮＡの存在を検出する工程、を包含し、ここで、該センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして使用されるＳＴＥＡＰ−３ポリヌクレオチドが、図１０Ａ〜Ｅに示されるポリヌクレオチド（配列番号９）を増幅し得る、アッセイ。
【請求項５８】
薬学的組成物であって、該薬学的組成物が、請求項４０〜５０のいずれか１項に記載の抗体もしくはそのフラグメントまたは組換えタンパク質、請求項３６に記載のＳＴＥＡＰ−３タンパク質、あるいは請求項３９に記載のＳＴＥＡＰ−３ポリヌクレオチド、および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。

【図１Ａ】

【図１Ｂ】

【図１Ｃ】

【図１Ｄ】

【図４Ａ】

【図４Ｂ】

【図９Ａ】

【図９Ｂ】

【図９Ｃ】

【図９Ｄ】

【図１０Ａ】

【図１０Ｂ】

【図１０Ｃ】

【図１０Ｄ】

【図１０Ｅ】

【図１０Ｆ】

【図１１Ａ】

【図１１Ｂ】

【図１１Ｃ】

【図１１Ｄ】

【図１１Ｅ】

【図１７】

【図１８】

【図２Ａ】

【図２Ｂ−Ｃ】

【図３Ａ】

【図３Ｂ】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図１２Ａ】

【図１２Ｂ−Ｃ】

【図１３】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１５Ａ】

【図１５Ｂ】

【図１５Ｃ】

【図１６】

【図１９】

【図２０】

【図２１Ａ】

【図２１Ｂ】

【図２１Ｃ】

【図２１Ｄ】

【図２２Ａ】

【図２２Ｂ】

【図２３Ａ】

【図２３Ｂ】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２Ａ】

【図３２Ｂ】

【図３３】

【公開番号】特開２０１１−６２２０１（Ｐ２０１１−６２２０１Ａ）
【公開日】平成２３年３月３１日（２０１１．３．３１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−２１２３３４（Ｐ２０１０−２１２３３４）
【出願日】平成２２年９月２２日（２０１０．９．２２）
【分割の表示】特願２００１−５４１０３１（Ｐ２００１−５４１０３１）の分割
【原出願日】平成１２年１２月６日（２０００．１２．６）
【出願人】（５００５５３６５９）アジェンシス，インコーポレイテッド (35)
【Ｆターム（参考）】