先天免疫を調節することによる感染の処置および予防を含む、免疫関連疾患障害の処置および予防のための新規ペプチド
【課題】被験体において先天免疫を調節するのに用い得る、および／または、先天免疫を調節することによる感染の処置および予防を含む免疫関連障害の処置のために用い得る、単離された新規ペプチドの提供。
【解決手段】提供されるのは、そのペプチドと反応性がある因子、そのペプチドを含む薬学的な組成物、そのペプチドをコードする単離された核酸分子、その核酸分子を含む組み換え核酸構築物、組み換え核酸構築物を含む少なくとも一つの宿主細胞、およびその宿主細胞を用いてそのペプチドを生産する方法である。本発明はさらに、被験体に本発明のペプチドを投与し、その結果被験体における先天免疫を調節することにより被験体において感染を処置および／または予防するための方法を提供する。加えて、本発明は、被験体が本発明のペプチドを用いた処置に反応性であるか否かを予想するための方法を提供する。
【解決手段】提供されるのは、そのペプチドと反応性がある因子、そのペプチドを含む薬学的な組成物、そのペプチドをコードする単離された核酸分子、その核酸分子を含む組み換え核酸構築物、組み換え核酸構築物を含む少なくとも一つの宿主細胞、およびその宿主細胞を用いてそのペプチドを生産する方法である。本発明はさらに、被験体に本発明のペプチドを投与し、その結果被験体における先天免疫を調節することにより被験体において感染を処置および／または予防するための方法を提供する。加えて、本発明は、被験体が本発明のペプチドを用いた処置に反応性であるか否かを予想するための方法を提供する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願）
本出願は、２００５年１０月４日に出願された米国仮特許出願６０／７２２，９６２号；同第６０／７２２，９５８号；および同第６０／７２２，９５９号（全て「Ｎｏｖｅｌ
Ｐｅｐｔｉｄｅｓ Ｆｏｒ Ｔｒｅａｔｉｎｇ Ａｎｄ Ｐｒｅｖｅｎｔｉｎｇ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ Ｂｙ Ｍｏｄｕｌａｔｉｎｇ Ｉｎｎａｔｅ Ｉｍｍｕｎｉｔｙ」と題し、そして、本明細書により、その全体が参考として援用される）に対する優先権を主張する。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、先天免疫を調節することによる感染の処置および予防を含む、免疫関連障害の処置および予防において用いるためのペプチドに関する。一つの局面において、本発明は、先天免疫を調節するための組成物およびその使用に関する。別の局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ活性を減少させるうえで効果がある新規ペプチドおよびその使用を提供する。
【背景技術】
【０００３】
（発明の背景）
ウイルス、細菌、真菌、および寄生体を含めた多様な微生物が、疾患をひきおこし得る。微生物の細胞は、動物および植物の細胞と異なり、それらは、自然界では単独では生存できず、多細胞生物の一部分としてのみ存在する。微生物の細胞は、その微生物およびその宿主の状態に一部分依存して、病原性または非病原性であり得る。例えば、普通は無害な細菌が、免疫無防備状態の宿主において病原体となり得る。宿主細胞への侵入は、細胞内環境において複製する細菌性の病原体の生存にとって重要である。細胞外の部位で複製する生物に関しては、宿主細胞への細菌の侵入のその重要性はよくわかっていない。
【０００４】
薬剤耐性は、感染と戦う進行中の努力において、障害として残っている。例えば、ペニシリンは、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓの処置において、その細菌が耐性となるまでは、有効であった。２０世紀の後半をとおして、新しい抗生物質（例えば、バンコマイシンおよびメチシリン）が、開発された；これらは、成功裡に、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染を治療した。しかしながら、Ｓ．ａｕｒｅｕｓのメチシリン耐性株が、１９７０年代に進化し、そしてそれ以来ずっと世界中の病院を悩ませている。より最近、Ｓ．ａｕｒｅｕｓのバンコマイシン耐性株が表面化した。
【０００５】
抗微生物薬への耐性の、増大する脅威および新しい感染性疾患の出現にともない、新しい治療用化合物の、継続的な必要性が存在する。病原体にではなく、宿主に作用する治療薬が、望ましい。なぜならば、それらは病原体の耐性を助長しないからである。特に、先天免疫系を介して宿主に作用する薬剤は、治療薬の将来有望な供給源を提供する。
【０００６】
微生物に対する宿主の防御は、宿主の体の上皮のバリアおよび先天免疫系で開始され、そして適応免疫応答の誘導に達する。その宿主の先天免疫応答は、微生物の感染を認識し迎え撃つ、ひとそろいの、高度に保存された機構を含む。先天免疫の要素は、低いレベルで連続的に維持されており、そして刺激を受けたとき非常に迅速に活性化される。その先天免疫応答は、微生物病原体に曝された直後に起こる事象で始まる。免疫グロブリンレセプター遺伝子の再配列のような、適応免疫に関連する事象は、その先天性の反応の一部とは考えられない。
【０００７】
先天性の反応が、大抵の感染症の調節において助けになり、そしてまた、炎症反応の一因となることを示す証拠がある。感染によって引き起こされる炎症反応は、疾患の病因の中心となる構成要素であることが知られている。その先天免疫応答におけるＴｏｌｌ様レセプター（ＴＬＲ）の重要性もまた、特性がよくわかっている。ＴＬＲの哺乳動物ファミリーは保存された分子を認識し、その多くは、微生物病原体の表面で見られるか、または微生物病原体によって放出される。宿主の先天性の防御を開始する、および／または先天性の防御に寄与する、特性がよくわかっていない多くの他の機構がある。
【０００８】
その先天免疫系は、上皮のバリア機能ならびにサイトカインおよびケモカインの分泌を含む、ある範囲の防御メカニズムを提供する。現在までのところ、四つのファミリーのケモカインが、保存されたＮ末端のシステインモチーフ（Ｃ、ＣＣ、ＣＸＣ、およびＣＸ３Ｃであり、Ｘは非保存アミノ酸残基である）の数により、類別されている。ＣＸＣケモカインは、ＣＸＣＲ３レセプターを持つ細胞（単球、活性化Ｔ細胞（Ｔｈ１）およびＮＫ細胞が挙げられる）に関して走化性があることが知られている。ヒト気道上皮初代細胞、および１６−ＨＢＥ細胞株は、ＣＸＣＲ３レセプターおよびそのリガンドであるＩＰ−１０、Ｉ−ＴＡＣ、およびＭＩＧを構成的に発現している（例えば、非特許文献１を参照のこと）。さらに、ＣＸＣＲ３リガンドは、走化性応答およびアクチンの再構成を、１６−ＨＢＥ細胞において誘導する（例えば、非特許文献１を参照のこと）。
【０００９】
さらに、ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰＩＶ）は、ＣＤ２６またはアデノシンデアミナーゼ結合タンパク質としても知られており、免疫機能を含めた多様な生理的過程の主要な調節因子である。ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶは、１１０ｋＤの細胞表面の糖タンパク質であり、成熟胸腺細胞、活性化Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、マクロファージ、および上皮細胞上で主として発現している。ＤＰＰＩＶは、少なくとも二つの機能（シグナル伝達機能および蛋白分解機能）を持つ（例えば、非特許文献２を参照のこと）。ＤＰＰＩＶの、細胞での役割のうちの１つとしては、ケモカインのＮ末端からジペプチドを切断することによる、ケモカイン活性の調節が挙げられる。ケモカインのＮＨ２末端の調節は、それらのレセプターへの結合およびその後の反応のためだけではなく、そのプロセシングされたケモカインのレセプター特異性を変えるうえでも、非常に重要である。ＤＰＰＩＶ活性は、多くの、免疫関連状態と関連付けられる。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【００１０】
【非特許文献１】Ｋｅｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｈｅ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ＣＸＣＲ３ ａｎｄ ｉｔｓ ｓｐｌｉｃｅ ｖａｒｉａｎｔ ａｒｅ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｉｎ ｈｕｍａｎ ａｉｒｗａｙ ｅｐｉｔｈｅｌｉａｌ ｃｅｌｌｓ， Ａｍ． Ｊ． Ｐｈｙｓｉｏｌ． Ｌｕｎｇ Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ． Ｐｈｙｓｉｏｌ．，２８７：Ｌ５８４，２００４
【非特許文献２】Ｍｏｒｉｍｏｔｏ Ｃ，Ｓｃｈｌｏｓｓｍａｎ ＳＦ．Ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｏｆ ＣＤ２６ ｉｎ ｔｈｅ Ｔ−ｃｅｌｌ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ． Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖｉｅｗ．１９９８，１６１：５５−７０．
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１１】
（発明の要旨）
本発明者たちは、表１で列挙され記述されたペプチドのうちの一つのアミノ酸配列を持つペプチド、またはそれの類似物、誘導体、または変異体が、宿主の先天免疫を増強し得ることを、発見した。一つの局面において、本発明のその免疫調節性ペプチドが、抗微生物活性を欠くが、一方で、感染した宿主の生存を改善する能力を示すことが見いだされた。別の局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ活性を調節するペプチドを提供する。一つの局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ活性を減少させるペプチドを提供する。さらに別の局面において、本発明は、免疫学的障害（例えば、ＤＰＰＩＶ活性および／または先天免疫と関連したもの）の診断、処置または予防において用いられ得るペプチドを提供する。
【００１２】
それゆえに、一つの局面において、本発明は、表１のどれか一つのアミノ酸配列またはそのアミノ酸配列の類似物、誘導体、もしくは変異体を含む単離されたペプチドを提供するか、またはそれらの明白な化学的な同等物を提供するか、または上記ペプチドを含むペプチドを提供する。一つの実施形態において、そのペプチドは、上記ペプチドを含めて１０アミノ酸以下である。例として、その単離されたペプチドは、改変されたＣ末端（例えば、アミド化されたＣ末端）および／または改変されたＮ末端を持ち得る。本発明のその単離されたペプチドは、Ｄアミノ酸の少なくとも一つの置換により改変された表１のそのアミノ酸配列を、さらに含み得る。その単離されたペプチドは、例として、改変された骨格をさらに含み得、それはそのＮ末端がアミドからＮ−メチルに改変されている。一つの局面において、親ペプチドの免疫学的な活性を保持する、それらの改変されたペプチド、および上記活性を保持する、それらのペプチドの明白な化学的な同等物は、本発明の範囲に含まれる。
【００１３】
別の局面において、本発明はさらに、表１のアミノ酸配列を含む単離されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含む単離されたペプチドと反応性のある因子を提供する。一つの実施形態において、その因子は、天然に存在しない抗体（例えば、ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体）である。一つの実施形態において、その抗体は、ＭＡＰＳ抗原を用いて作製され、そのＭＡＰＳ抗原は本発明のペプチドにそのペプチドのＣ末端に挿入された二つのグリシン残基を介して取り付けられている。その構築物は、そして、動物（例えば、ウサギ）に投与され得、そしてその抗体は当該分野で周知の手順により採取される。一つの局面において、そのような因子は、標識され得るか、または本発明のペプチドを標識するために用いられ得る。別の局面において、そのような因子は、診断方法およびスクリーニング方法において、ペプチドの活性を調整し得る因子をモニターするか、またはそのペプチドの量を定量するために使用され得る。
【００１４】
さらに別の局面において、本発明は、単離された核酸分子を提供し、その核酸分子は、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含む単離されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含む単離されたペプチドをコードする。そしてまた提供されるものは、組み換え核酸構築物であり、この組み換え核酸構築物は、発現ベクターに作動可能に連結された核酸分子を含む。
【００１５】
さらなる局面において、本発明は、少なくとも一つの宿主細胞を提供し、その細胞は、本発明の組み換え核酸構築物を含有する。そしてまた提供されるものは、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含むペプチドを生産するための方法であり、この方法は、（ａ）そのペプチドの発現を許容する条件下で、少なくとも一つの宿主細胞を培養すること；そして（ｂ）そのペプチドを、少なくとも一つの宿主細胞またはその培養培地から取り出すことによる。
【００１６】
さらに別の局面において、本発明は、薬学的組成物を提供し、その組成物は、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含む単離されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体（薬学的に受け入れられる塩、付加塩、または上記のいずれかのエステルもしくは多形体を包含する）を持つかもしくは含む単離されたペプチドを、薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤、または賦形剤との組み合わせで、含む。
【００１７】
別の局面において、本発明は、被験体における感染（例えば、微生物感染）を処置および／または予防するための方法を提供し、その方法は表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含むペプチド、またはそれらの明白な化学的な同等物を被験体に投与することによる。例として、その被験体は、感染していてもよく、または感染のリスクを持っていてもよい。一つの実施形態において、そのペプチドは、その被験体において先天免疫を調節し、それにより、被験体における感染を処置および／または予防する。本発明は、さらに、本発明のペプチドで処置し得る微生物感染を同定するための方法を提供する。別の局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ関連状態またはＤＰＰＩＶ関連障害を、処置または予防するための方法を提供する。
【００１８】
本発明の方法により処置および／または予防され得る典型的な感染は、細菌（例えば、グラム陽性細菌またはグラム陰性細菌）による感染、真菌による感染、寄生体による感染、およびウイルスによる感染を包含する。本発明の一つの実施形態において、その感染は、細菌感染（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．、またはバンコマイシン耐性腸球菌による感染）である。別の実施形態において、その感染は真菌感染（例えば、糸状菌、酵母、または高等真菌による感染）である。さらに別の実施形態において、その感染は寄生体感染（例えば、Ｇｉａｒｄｉａ ｄｕｏｄｅｎａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ ｃａｙｅｔａｎｅｎｓｉｓ、およびＴｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉを包含する、単細胞寄生体または多細胞寄生体による感染）である。さらに別の実施形態において、その感染は、ウイルス感染（例えば、ＡＩＤＳ、鳥インフルエンザ、水痘、単純疱疹、感冒、胃腸炎、伝染性単核球症、インフルエンザ、麻疹、ムンプス、咽頭炎、肺炎、風疹、ＳＡＲＳ、および下気道感染または上気道感染に関係するウイルス（例えば、ＲＳウイルス）による感染）である。
【００１９】
本発明の方法に従って、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含むペプチドが、被験体に直接的に（すなわち、そのペプチドそのものを投与することにより）、または間接的に（例えば、被験体においてそのペプチドの発現を許容する方法で、そのペプチドをコードする核酸配列を被験体に投与することにより）、投与され得る。本発明のそのペプチド（またそれをコードする核酸）は、被験体に、経口的に、非経口的に（例えば、皮内に、筋内に、腹腔内に、静脈内に、または皮下に）、経皮的に、鼻腔内に、肺への投与により（例えば、気管内投与により）、および／または浸透圧ポンプにより投与され得る。
【００２０】
さらに別の局面において、本発明は、被験体の診断サンプルのＤＰＰＩＶ活性を測定することにより、被験体が、表１のアミノ酸配列を含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを用いる処置に反応するか予測するための方法を提供し、ここで、ＤＰＰＩＶ活性の減少のような調節は、その被験体がそのペプチドによる処置に反応することを示す。一つの局面において、被験体は、ＤＰＰＩＶ関連状態またはＤＰＰＩＶ関連障害を持っているか、または持つ疑がいがある。
【００２１】
本発明のさらなる局面および利点は、以下に続くその説明を考慮すれば明らかである。詳細な説明およびその特定の例は、しかしながら、本発明の好ましい実施形態を示しているとはいえ、例示のためにのみ与えられることが理解されるべきである。なぜならば、本発明の意図および範囲における多様な変化および改変は、この詳細な説明から当業者には明白となるからである。
例えば、本願発明は以下の項目を提供する。
（項目１）
表１のアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体もしくは変異体を含む、単離されたペプチド。
（項目２）
項目１に記載の単離されたペプチドであって、改変されたＣ末端および／または改変されたＮ末端を持つ、ペプチド。
（項目３）
項目２に記載の単離されたペプチドであって、改変されたＣ末端を持つ、ペプチド。
（項目４）
項目３に記載の単離されたペプチドであって、アミド化されたＣ末端を持つ、ペプチド。
（項目５）
項目１に記載の単離されたペプチドであって、Ｄアミノ酸の少なくとも一つの置換により改変された表１のアミノ酸配列を含む、ペプチド。
（項目６）
項目１に記載のペプチドと反応性のある、因子。
（項目７）
項目６に記載の因子であって、抗体である、因子。
（項目８）
項目７に記載の因子であって、モノクローナル抗体である、因子。
（項目９）
項目１に記載のペプチドをコードする、単離された核酸分子。
（項目１０）
発現ベクターに作動可能に連結された項目９に記載の核酸分子を含む、組み換え核酸構築物。
（項目１１）
項目１０に記載の組み換え核酸構築物を含む、少なくとも一つの宿主細胞。
（項目１２）
表１に列挙されたアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを生産するための方法であって、該方法は、以下の工程：
（ａ）該ペプチドの発現を許容する条件下で項目１１に記載の少なくとも一つの細胞を培養する工程；および
（ｂ）該少なくとも一つの宿主細胞またはその培養培地から該ペプチドを回収する工程を包含する、方法。
（項目１３）
項目１に記載のペプチド、および薬学的に受け入れられる、キャリア、希釈剤、または賦形剤を含む、薬学的組成物。
（項目１４）
被験体における感染を処置および／または予防するための方法であって、表１に列挙されたアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを、該被験体に投与する工程を包含する、方法。
（項目１５）
項目１４に記載の方法であって、前記ペプチドが配列番号１、３〜１６、１８〜６０のアミノ酸配列を持つ、方法。
（項目１６）
項目１４に記載の方法であって、前記被験体における先天免疫を前記ペプチドが調節し、その結果、該被験体において、前記感染が処置および／または予防される、方法。
（項目１７）
項目１４に記載の方法であって、前記感染は微生物感染である、方法。
（項目１８）
項目１７に記載の方法であって、前記感染は、細菌による感染、真菌による感染、寄生体による感染、およびウイルスによる感染からなる群より選択される、方法。
（項目１９）
項目１８に記載の方法であって、前記細菌は、グラム陽性細菌またはグラム陰性細菌である、方法。
（項目２０）
項目１９に記載の方法であって、前記細菌は、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ
ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．、またはバンコマイシン耐性腸球菌からなる群より選択される、方法。
（項目２１）
項目１８に記載の方法であって、前記真菌は、糸状菌、酵母、または高等真菌からなる群より選択される、方法。
（項目２２）
項目１８に記載の方法であって、前記寄生体は、単細胞寄生体または多細胞寄生体である、方法。
（項目２３）
項目２２に記載の方法であって、前記寄生体は、Ｇｉａｒｄｉａ ｄｕｏｄｅｎａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ ｃａｙｅｔａｎｅｎｓｉｓ、およびＴｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉからなる群より選択される、方法。
（項目２４）
項目１８に記載の方法であって、前記ウイルスは、ＡＩＤＳ、鳥インフルエンザ、水痘、単純疱疹、感冒、胃腸炎、伝染性単核球症、インフルエンザ、下気道感染、麻疹、ムンプス、咽頭炎、肺炎、風疹、ＳＡＲＳ、および上気道感染に関係するウイルスからなる群より選択される状態に関連している、方法。
（項目２５）
項目２４に記載の方法であって、前記ウイルスは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）である、方法。
（項目２６）
項目１４に記載の方法であって、前記被験体は、感染しているか、または感染のリスクを持っている、方法。
（項目２７）
項目２６に記載の方法であって、前記ペプチドは、経口的に、非経口的に、経皮的に、鼻腔内に、肺への投与により、または浸透圧ポンプにより投与される、方法。
（項目２８）
被験体が、微生物感染または免疫関連障害のための処置に反応するか否かを予想するための方法であって、該処置は、表１のアミノ酸配列またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドの該被験体への投与を含み、該方法は、ＤＰＰＩＶ基質の存在下で、ＤＰＰＩＶが該基質と反応することを許容する条件下で、本発明のペプチドを該被験体の診断サンプルに投与することにより該被験体の診断サンプルをＤＰＰＩＶ活性に関してアッセイする工程を包含し、ここで、該ペプチドなしでの対照と比較してのＤＰＰＩＶ活性の減少は、該被験体が該処置に対して反応性であることを示す、方法。
（項目２９）
配列番号１〜６０からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたペプチド。
（項目３０）
項目２９に記載の単離されたペプチドであって、前記アミノ酸配列が、配列番号１、３〜１６、１８〜６０からなる群より選択される、単離されたペプチド。
（項目３１）
項目３０に記載の単離されたペプチドであって、前記アミノ酸配列が、配列番号１、３〜１６、１８〜５４からなる群より選択される、単離されたペプチド。
（項目３２）
項目２９または項目３０のいずれか一項に記載の単離されたペプチドであって、免疫学的活性を持つ、単離されたペプチド。
（項目３３）
項目３２に記載の単離されたペプチドであって、１０までのアミノ酸からなる、単離されたペプチド。
（項目３４）
ＤＰＰＩＶ関連状態の処置における、項目３２または項目３３のいずれか一項に記載の単離されたペプチドの使用。
（項目３５）
感染の処置または先天免疫関連状態の処置のための、項目３２または項目３３のいずれか一項に記載のペプチドの使用。
【図面の簡単な説明】
【００２２】
本発明が、ここで図面に関して記述される。
【図１Ａ】図１Ａは、実施例２において記述された実験の結果を描く。生存率％＝ベヒクル対照（トリス）に対する細菌の増殖の量であり、対照の細菌生存率を１００％として、配列番号５のペプチドとともに示す；Ｅｒｙｔｈｒ．＝エリスロマイシン。
【図１Ｂ】図１Ｂは、実施例２において記述された実験の結果を描く。生存率％＝ベヒクル対照（トリス）に対する細菌の増殖の量であり、対照の細菌生存率を１００％として、配列番号４７のペプチドとともに示す；Ｅｒｙｔｈｒ．＝エリスロマイシン。
【図２Ａ】図２Ａは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号１＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｂ】図２Ｂは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号１＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｃ】図２Ｃは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号５＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｄ】図２Ｄは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号４７＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｅ】図２Ｅは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号４＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｆ】図２Ｆは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号６＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｇ】図２Ｇは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号４５＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図３Ａ】図３Ａは、実施例４において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に、１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号１＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図３Ｂ】図３Ｂは、実施例４において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に、１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号５＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【発明を実施するための形態】
【００２３】
（発明の詳細な説明）
（定義）
本明細書で用いられる場合、「ＤＰＰＩＶ関連障害」または「ＤＰＰＩＶ関連状態」または「ＤＰＰＩＶに関連した状態」とは、ＤＰＰＩＶ活性と相互に関連付けられている任意の医学的な状態を意味しており、そして上記活性の調節は上記状態を処置および／または予防または診断するために用いられ得る。そのような状態の例としては、ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、自己免疫状態（例えば、関節リウマチ）、多発性硬化症、癌（例えば、大腸癌および肺癌）、糖尿病、およびグレーヴズ病が挙げられるが、それらに限定されない。
【００２４】
「免疫関連障害」は、免疫系の活性化または阻害のどちらかによって、被験体の免疫系と関連した状態、あるいは、被験体における免疫応答（例えば、先天免疫応答）の特定の構成要素を標的とすることによって、処置、予防または診断され得る状態である。
【００２５】
本明細書で用いられる場合、「免疫学的に活性」は、先天免疫活性（例えば、被験体において、先天免疫応答またはその構成要素を調節する能力）またはＤＰＰＩＶ活性を調節する能力を指す。
【００２６】
本明細書で用いられる場合、「調節する」または「調節」（例えば、ＤＰＰＩＶ活性の調節または特定の反応の調節のような）は、特定の条件下での対照または正常もしくは基準線のレベルの活性もしくは反応に対する、活性もしくは反応の増大もしくは減少を包含する。それはまた、そのペプチドの活性のレベルを通常は増大もしくは減少させる条件下での活性もしくは反応のレベルの維持を包含しうる。
【００２７】
「薬学的に受け入れられる塩」は、製薬産業で一般的に用いられる非毒性のアルカリ金属塩、アルカリ土類金属塩、およびアンモニウム塩を指しており、ナトリウム、カリウム、リチウム、カルシウム、マグネシウム、バリウム、アンモニウムおよびプロタミン亜鉛の塩を包含し、それらは、当該分野で周知の方法により調製される。その用語はまた、本発明の化合物を適切な有機酸または無機酸と反応させることにより一般的に調製される、非毒性の酸付加塩を包含する。代表的な塩としては、塩酸塩、臭化水素酸塩、硫酸塩、重硫酸塩、酢酸塩、シュウ酸塩、吉草酸塩、オレイン酸塩、ラウリン酸塩、ホウ酸塩、安息香酸塩、乳酸塩、リン酸塩、トシラート、クエン酸塩、マレイン酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、ナプシラート（ｎａｐｓｙｌａｔｅ）、トリフルオロ酢酸塩などが挙げられる。
【００２８】
「薬学的に受け入れられる酸付加塩」は、遊離塩基の生物学的な効果および特性を保持し、かつ生物学的にも他の点でも望ましくないわけではない塩を指しており、それらは、無機酸（例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸など）ならびに有機酸（例えば、トリフルオロ酢酸、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、リンゴ酸、マロン酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、桂皮酸、マンデル酸、メンタンスルホン酸（ｍｅｎｔｈａｎｅｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ）、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸など）より形成される。プロドラッグとしての薬学的に受け入れられる酸付加塩の詳細に関しては、Ｂｕｎｄｇａａｒｄ， Ｈ．，ｅｄ．，（１９８５）Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ， Ａｍｓｔｅｒｄａｍを参照のこと。
【００２９】
「薬学的に受け入れられるエステル」は、エステル結合が加水分解されたときに、カルボン酸またはアルコールの生物学的な効果および特性を保持し、かつ生物学的にも他の点でも望ましくないわけではないエステルを指す。プロドラッグとしての薬学的に受け入れられるエステルの詳細に関しては、上記のＢｕｎｄｇａａｒｄ，Ｈ．を参照のこと。これらのエステルは、対応するカルボン酸およびアルコールから典型的には形成される。一般的に、エステル形成は、従来の合成技術を介して達成され得る（例えば、Ｍａｒｃｈ， Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， ３ｒｄ Ｅｄ．， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８５）ｐ．１１５７、およびその中で援用された参考文献、ならびにＭａｒｋ ｅｔ ａｌ．， Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆
Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８０）を参照のこと）。そのエステルのアルコール構成要素は、（ｉ）一つまたはそれより多くのの二重結合を持っていても持っていなくてもよく、そして分岐した炭素鎖を持っていても持っていなくてもよい、Ｃ．２〜Ｃ．１２脂肪族アルコール、または（ｉｉ）Ｃ．７〜Ｃ．１２芳香族またはヘテロ芳香族アルコールを、一般に含む。本発明は、ここで記述されるエステルであると同時に、薬学的に受け入れられるそれらの酸付加塩でもある組成物の使用もまた企図する。
【００３０】
「薬学的に受け入れられるアミド」は、アミド結合が加水分解されたときにカルボン酸またはアミンの生物学的な効果および特性を保持し、かつ生物学的にも他の点でも望ましくないわけではないアミドを指す。プロドラッグとして薬学的に受け入れられるアミドの詳細については、上記のＢｕｎｄｇａａｒｄ，Ｈ．，ｅｄ．を参照のこと。これらのアミドは、対応するカルボン酸およびアミンから、典型的に形成される。一般的に、アミド形成は、従来の合成技術を用いて達成されうる（例えば、Ｍａｒｃｈ， Ａｄｖａｎｃｅｄ
Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， ３ｒｄ Ｅｄ．， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８５）ｐ．１１５２およびＭａｒｋ ｅｔ ａｌ．， Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，
Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８０））。本発明はまた、ここに記述したアミドであると同時に、薬学的に受け入れられるその酸付加塩でもある組成物の使用を企図する。
【００３１】
「薬学的または治療上で受け入れられるキャリア」は、活性な成分の生物学的な活性の効果に干渉せず、かつ宿主にも患者にも毒性ではないキャリア媒体を指す。
【００３２】
「立体異性体」は、別のものと同じ分子量、化学的組成および構造を持つが、原子が異なってグループ分けされている化学的化合物を指す。すなわち、特定の同一の化学的部分は、空間において異なる配向にあり、それゆえ、純粋な場合、偏光面を回転させる能力がある。しかしながら、いくつかの純粋な立体異性体は、非常にわずかであるゆえに現在の計測装置では検出できない光学回転を持ちうる。本発明の化合物は、一つまたはそれより多くの不斉炭素原子を持ってよく、そしてそれゆえ、多様な立体異性体を包含しうる。全ての免疫的に活性な立体異性体が、本発明の範囲に含まれる。
【００３３】
本発明の組成物に適用される場合、「治療上または薬学的に効果的な量」は、望ましい生物学的結果を誘導するのに十分な組成物の量を指す。その結果は、徴候、症状、もしくは疾患の原因の軽減、または生物学的システムにおけるほかの任意の望ましい変化であり得る。例えば、本発明では、その結果は、先天免疫応答の増強、ＤＰＰＩＶ活性の減少、および／または感染もしくは組織の傷害に対する炎症反応の調節（例えば、阻害または減少または非刺激）を典型的には包含する。
【００３４】
ペプチドにおけるアミノ酸残基は、以下のように略記される：フェニルアラニンはＰｈｅまたはＦであり；ロイシンはＬｅｕまたはＬであり；イソロイシンはＩｌｅまたはＩであり；メチオニンはＭｅｔまたはＭであり；バリンはＶａｌまたはＶであり；セリンはＳｅｒまたはＳであり；プロリンはＰｒｏまたはＰであり；スレオニンはＴｈｒまたはＴであり；アラニンはＡｌａまたはＡであり；チロシンはＴｙｒまたはＹであり；ヒスチジンはＨｉｓまたはＨであり；グルタミンはＧｌｎまたはＱであり；アスパラギンはＡｓｎまたはＮであり；リジンはＬｙｓまたはＫであり；アスパラギン酸はＡｓｐまたはＤであり；グルタミン酸はＧｌｕまたはＥであり；システインはＣｙｓまたはＣであり；トリプトファンはＴｒｐまたはＷであり；アルギニンはＡｒｇまたはＲであり；そしてグリシンはＧｌｙまたはＧである。加えて、略語Ｎａｌは１−ナフチルアラニンを示すのに用い；オルニチンはＯｒｎまたはＯであり、Ｃｉｔはシトルリンであり、Ｈｃｉはメチレン基をもう一つ持つシトルリンであり、そしてＶｘまたはバリンｘ、ここで、「ｘ」は、アミノ酸の骨格における変化を指し、アミノ酸結合はもはやアミド結合ではないが、しかしメチル化されたアミンであり、このことは「ｘ」の表示をもつ他のアミノ酸に同様に適用される。また、２，４−ジアミノ酪酸はＤａｂであり；２，３−ジアミノプロピオン酸はＤｐｒまたはＤａｐａであり；Ｎ−（４−アミノブチル）−グリシンはＮｌｙｓであり；ｈＳｅｒはホモセリンであり；Ｈｙｐはヒドロキシプロリンであり；Ｖａｌ（ｂｅｔａＯＨ）はヒドロキシバリンであり；Ｄ−Ｐｒｏは３，４−デヒドロプロリンであり；Ｐｙｒはピログルタミン（環中にＣ＝Ｏをもつプロリン）；その環にフッ素置換をもつプロリン；１，３−チアゾリジン−４−カルボン酸（環中にＳをもつプロリン）であり；Ｔｈｉはベータ−（２チエニル）−アラニンであり；Ａｂｕは２−アミノ酪酸であり；Ｎｖａはノルバリンであり；Ｎｌｅはノルロイシンであり；Ｈｏｌはホモロイシンであり；そしてＡｉｂはアルファ−アミノイソ酪酸である。
【００３５】
天然に存在するアミノ酸のみからなるペプチドに加えて、ペプチド模倣薬またはペプチド類似物もまた提供される。ペプチド類似物は、鋳型ペプチドの特性に類似の特性を持った非ペプチド薬として、製薬産業において、一般的に用いられる。これらのタイプの非ペプチド化合物は、「ペプチド模倣物（ｐｅｐｔｉｄｅ ｍｉｍｅｔｉｃｓ）」または「ペプチド模倣薬」（Ｆａｕｃｈｅｒｅ，Ｊ．，Ａｄｖ． Ｄｒｕｇ Ｒｅｓ．１５：２９（１９８６）；Ｖｅｂｅｒ ａｎｄ Ｆｒｅｉｄｉｎｇｅｒ， ＴＩＮＳ ｐ．３９２（１９８５）；およびＥｖａｎｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ．３０：１２２９（１９８７）、これらは本明細書により参考として援用される）と呼ばれる。治療上で役に立つペプチドに構造的に類似しているペプチド模倣物が、等しいかもしくは増強された、治療上もしくは予防上の効果を生じるために用いられ得る。一般的に、ペプチド模倣薬は、模範ペプチド（すなわち、生物学的または薬理学的活性を持つペプチド（例えば、天然に存在するレセプター結合ペプチド））に構造的に類似するが、しかし、以下からなる群より選択された結合によって必要に応じて置き換えられる一つまたはそれより多くのペプチド結合をもつ：−−ＣＨ２ＮＨ−−、−−ＣＨ２．Ｓ−−、−−ＣＨ２＝ＣＨ２−−、−−ＣＨ＝ＣＨ−−（シスおよびトランス）、−−ＣＯＣＨ２−−、−−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２−−および−−ＣＨ２ＳＯ−−。その置き換えは当該分野で既知の方法、および以下の参考文献にさらに記述された方法により行われる：Ｓｐａｔｏｌａ， Ａ． Ｆ．，ｉｎ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ｏｆ Ａｍｉｎｏ Ａｃｉｄｓ， Ｐｅｐｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ， Ｂ． Ｗｅｉｎｓｔｅｉｎ， ｅｄｓ．， Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ｐ．２６７（１９８３）；Ｓｐａｔｏｌａ， Ａ． Ｆ．， Ｖｅｇａ Ｄａｔａ（Ｍａｒｃｈ １９８３）， Ｖｏｌ．１， Ｉｓｓｕｅ ３， ＰＥＰＴＩＤＥ ＢＡＣＫＢＯＮＥ ＭＯＤＩＦＩＣＡＴＩＯＮＳ（ｇｅｎｅｒａｌ ｒｅｖｉｅｗ）；Ｍｏｒｌｅｙ， Ｔｒｅｎｄｓ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ（１９８０） ｐｐ．４６３ ４６８（ｇｅｎｅｒａｌ ｒｅｖｉｅｗ）；Ｈｕｄｓｏｎ， Ｄ． ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｔ Ｊ Ｐｅｐｔ Ｐｒｏｔ
Ｒｅｓ １４：１７７ １８５（１９７９）：（−−ＣＨ２ＮＨ−−、ＣＨ２ＣＨ２−−）；Ｓｐａｔｏｌａ ｅｔ ａｌ．， Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ３８：１２４３ １２４９（１９８６）：（−−ＣＨ２−−Ｓ）；Ｈａｎｎ Ｊ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ． Ｐｅｒｋｉｎ Ｔｒａｎｓ．Ｉ３０７ ３１４（１９８２）：（−−ＣＨ−−ＣＨ、シスおよびトランス）；Ａｌｍｑｕｉｓｔ ｅｔ ａｌ．， Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ２３：１３９２ １３９８（１９８０）：（−−ＣＯＣＨ２−−）；Ｊｅｎｎｉｎｇｓ−Ｗｈｉｔｅ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ２３：２５３３（１９８２）：（−−ＣＯＣＨ２−−）：Ｓｚｅｌｋｅ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ．ＥＰ４５６６５ ＣＡ：９７：３９４０５（１９８２）（−−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２．）；Ｈｏｌｌａｄａｙ ｅｔ ａｌ．， Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ ２４：４４０１ ４４０４（１９８３）：（−−Ｃ（ＯＨ）ＣＨ２−−）；およびＨｒｕｂｙ
Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ３１：１８９ １９９（１９８２）：（−−ＣＨ２−−Ｓ−−）であり；そのそれぞれが参考として援用される。一つの局面において、非ペプチド結合は、−−ＣＨ２ＮＨ−−である。そのようなペプチド擬似物は、ポリペプチドの実施形態を超える顕著な利点（例えば、より経済的な生産、より高い化学的安定性、増強された薬理学的特性（半減期、吸収、効力、効能、その他）、改変された特異性（例えば、広いスペクトルの生物学的活性）、低減された抗原性などが挙げられる）を持ち得る。ペプチド模倣薬の標識は、定量的な構造活性データおよび／または分子モデリングにより予想されるペプチド模倣薬上の非干渉位置への、直接あるいはスペーサー（例えば、アミド基）を介した、一つまたはそれより多くの標識の共有結合による付加を通常は含む。そのような非干渉位置は一般的に、ペプチド模倣薬が結合して治療上の効果を生じる高分子（例えば、免疫グロブリンスーパーファミリー分子）と直接の接触を形成しない位置である。ペプチド模倣薬の誘導体化（例えば、標識）は、そのペプチド模倣薬の望ましい生物学的な活性または薬理学的な活性を、実質上妨げるべきではない。一般的に、レセプター結合タンパクのペプチド模倣薬は、そのレセプターに高い親和性で結合し、かつ検出可能な生物学的活性をもつ（すなわち、レセプターにより媒介される一つまたはそれより多くの表現型の変化に対して、アゴニストまたはアンタゴニストとして作用する）。
【００３６】
コンセンサス配列の一つまたはそれより多くのアミノ酸の、同じ型のＤ−アミノ酸（例えば、Ｌ−リジンの代わりのＤ−リジン）による系統的な置換が、より安定なペプチドを生じるために用いられうる。そのペプチドの免疫学的な活性が保持されるＤ−アミノ酸置換が望まれることは理解される。
【００３７】
（説明）
ここに記述するように、本発明者達は、表１に示されたアミノ酸配列を持ち、かつ／もしくは含む新規ペプチド、または表１に開示されたアミノ酸配列の類似物、誘導体、もしくは変異体を持ち、かつ／もしくは含む新規ペプチドを同定した。本発明者達はまた、表１のアミノ酸配列のうちの一つおよびアミド化されたＣ末端を持つかもしくは含むペプチドが、先天免疫の増強において、治療上の有用性を持つことを明らかにした。特に、本発明者達は、表１のアミノ酸配列を含むペプチドが、Ｓ．ａｕｒｅｕｓに対する抗微生物効力を欠くが、Ｓ．ａｕｒｅｕｓを感染させたマウスにおいて生体内での防御をなお提供することを示した。そのペプチドは、感染に対する宿主の反応を増強し、結果として、細菌除去および宿主の生存を改善した。したがって、記述されたその新規ペプチドは、感染症の処置のための治療剤として使用されうる。別の実施形態において、本発明のペプチドが、ＤＰＰＩＶ活性を減少させることが示されており、ＤＰＰＩＶ活性は多くの免疫関連障害（例えば、ＡＩＤＳの進行およびＨＩＶ病の進行（Ｂｌａｚｑｕｅｚ ｅｔ ａｌ．１９９２；Ｖａｎｈａｍ ｅｔ ａｌ．１９９３；Ｓｃｈｏｌｓ ｅｔ ａｌ．１９９８ Ｏｒａｖｅｃｚ ｅｔ ａｌ．１９９５）、グレーヴズ病（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．１９８９；Ｎｉｓｈｉｋａｗａ ｅｔ ａｌ．１９９５）、ならびに癌（Ｓｔｅｃｃａ ｅｔ ａｌ．１９９７）（例えば、肺癌および大腸癌）、ならびに糖尿病（Ｈｉｎｋｅ ｅｔ ａｌ．２０００；Ｍａｒｇｕｅｔ ｅｔ ａｌ．２０００）に関与することが示されている。さらに、Ｔ細胞活性化のインジケーターとしてＤＰＰＩＶは、関節リウマチ（Ｎａｋａｏ ｅｔ ａｌ．，１９８９）および自己免疫性甲状腺炎（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ
ａｌ．，１９８９）のようないくつかの自己免疫疾患と並行して変動することが示されている。ＤＰＰＩＶは、これらの疾患の活性のレベルとよく相関するマーカーとして記述されている。さらに、ＤＰＰＩＶは慢性進行性多発性硬化症における疾患進行のインジケーターとして研究されている（Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｅｓｃｕ ｅｔ ａｌ．，１９９５）。本発明のペプチドは、そのような状態の処置において使用され得る。
【００３８】
（本発明のペプチド）
したがって、本発明は、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含む単離されたペプチド、または免疫学的に活性である、その類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含む単離されたペプチドを提供する。また提供されるものは、本発明のペプチド、そのペプチドの類似物、誘導体、および変異体であるペプチドの薬学的に受け入れられる塩、酸付加塩、およびエステルであり、本明細書に記述されたもの（例えば、本明細書に記述された、保存性の置換、ならびにＮ末端およびＣ末端の改変、ならびに骨格の改変である）を包含する。本明細書で用いられる場合、本発明の「単離された」ペプチドは、天然に存在する対応物を持たないか、またはそれに天然に付随する成分から分離もしくは精製されたペプチドである。本発明の単離されたペプチドは、例えば、そのペプチドをコードする組み換え核酸の発現により、または化学的な合成により得られうる。化学的に合成されたペプチドは、本来、それに天然に付随する成分から隔てられているため、その合成ペプチドは「単離」されている。
【００３９】
一つの局面において、本発明の単離されたペプチドは式「Ｘ１Ｘ２Ｐ」（配列番号５５）を持つアミノ酸配列を含み、ここでＸ１は、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、Ｎ末端において塩基性官能基で置換されたグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｒ、Ｓ、Ｏ、およびＣｉｔからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｒ、およびＳからなる群より選択されるかもしくはＲであり、またここでＸ２はＶ、Ｉ、Ｋ、Ｐ、およびＨからなる群より選択される。一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、配列番号５５である。別の局面において、本発明の単離されたペプチドは、配列番号５５のアミノ酸配列を含む１０アミノ酸までのペプチドである。一つの実施形態において、配列番号５５の単離されたペプチドは、配列番号８、９、２６、３９、４０、４１および４５〜５３であるか、または、上記配列を含む１０アミノ酸までの単離されたペプチドである。別の実施形態において、配列番号５５を含む単離されたペプチドは、配列番号４４であり、それは１３アミノ酸までである。
【００４０】
別の実施形態において、本発明は、式「Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐ」（配列番号５６）を含む単離されたペプチドを提供し、ここでＸ１はＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、またはＮ末端において塩基性官能基で置換されたグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、およびＯからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、およびＯからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＲ、Ｈ、Ｋ、およびＳからなる群より選択される。ここでＸ２は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ｋ、Ｐ、Ｇ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｏ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ａｂｕ、Ｎｖａ、およびＮｌｅからなる群より選択され、Ｘ２はＮ−メチル化されてもよく、あるいは別の実施形態においては、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ｋ、Ｐ、Ｇ、Ｈ、およびＲからなる群より選択され、ここでＮ−メチル化されてもよく、ここでＸ３はＩ、Ｖ、およびＰからなる群より選択され、ここで一つの実施形態においてＸ３はＮ−メチル化されていない。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号１、３〜７、１０〜１６、１８、２１〜２５、２７、２８、３１〜３９、４２、４３、または４７を含め、配列番号５６を含む１０アミノ酸までのアミノ酸配列でも、または配列番号５４を含む１１アミノ酸までの単離されたペプチドでもよい。しかしながら、一つの実施形態において、配列番号５６が六量体である場合、それは配列番号２ではなく、あるいは一つの実施形態における場合、配列番号５６が五量体である場合、それは配列番号１７ではない。一つの実施形態において、本発明で単離されたペプチドは、配列番号２または配列番号１７を含むペプチドを含まない。
【００４１】
別の実施形態において、本発明は、配列番号５６の式を含むペプチドを含む単離されたペプチドを五量体または六量体において提供する。一つの実施形態において、上記ペプチドは、免疫学的に活性である。
【００４２】
一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、式「ａＸ１Ｘ２Ｘ３Ｐ」（配列番号５７）のペプチドを含み、ここでＸ１、Ｘ２、およびＸ３は配列番号５６について定義されたとおりであり、かつ「ａ」はＳ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、Ｃ、Ｔ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｃ、Ｍ、およびＦからなる群より選択されるか、または別の実施形態においては、Ｓ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、Ｃ、Ｔ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｃ、およびＭからなる群より選択されるか、または別の実施形態においては、Ｓ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、およびＣからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＳである。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５７を含むか、または上記配列を含む１０アミノ酸までのペプチドである。別の実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号４、４７であるか、または単離されたペプチドが六量体の場合は、配列番号３９であるか、または上記配列を含む１０アミノ酸までの単離されたペプチドである。
【００４３】
別の実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、式「Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐｂ」（配列番号５８）のペプチドを含み、ここでＸ１Ｘ２Ｘ３は配列番号５６で定義されたとおりであり、かつ「ｂ」は、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｆ、Ｋ、Ｃ、Ｉ、Ｖ、Ｔ、Ｙ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、およびＭからなる群より選択されるが、しかし一つの実施形態においてはＰではなく、あるいは別の実施形態においては、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｆ、およびＫからなる群より選択され、あるいは別の実施形態においては、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｋ、およびＣからなる群より選択され、あるいは一つの実施形態においては、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、およびＫからなる群より選択される。ここでＡ＊は、アラニンのＤアミノ酸を表す。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５８を含む１０アミノ酸までのアミノ酸である。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５〜８、１０、１１、１３〜１６、２１〜２５、２７、２８、３１、３３〜３８および４２〜４３であるか、またはそれらを含む。別の実施形態において、そのペプチドは、配列番号５８のペプチドであり、ここで「ｂ」はＰでもＹでもないか、またはＲＩＶＰＰ（配列番号１７）ではないか、あるいはここでＸ３はＧではないか、またはＲＩＧＰＡではなく、あるいはＸ３は、ＶｘではなくまたはＸ３はＲＩＶｘＰＡではない。
【００４４】
一つの実施形態において、配列番号５８に類似のペプチドであるか、あるいはそれを含むペプチドであるが、しかしここでＸ１は、かわりに、Ｇ、ＧＧ、またはＣｉｔからなる群より選択されるか、あるいはここで「ｂ」はＡであり、Ｘ２はＩであり、Ｘ３はＶであり、Ｘ１はＧ、ＧＧ、もしくはＣｉｔであるが、あるいはそのペプチドは配列番号１９、２０、および３６である。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号３１を含む。別の実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５８の逆の配列を含むかまたは配列番号３０を含む。
【００４５】
一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、配列番号２９のアミノ酸配列を持つペプチドであるか、あるいはそのペプチドを含むペプチドである。
【００４６】
本発明のペプチドはまた、式「ａ１ａ２Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐ」（配列番号５９）を含む単離されたペプチドを提供し、ここでＸ１、Ｘ２、およびＸ３は配列番号５６で定義されたとおりであり、かつａ１は、Ｋ、Ｉ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、およびＧからなる群より選択されるか、または一つの実施形態においては、ＫおよびＩからなる群より選択されるか、または一つの実施形態においてＫであり、かつａ２はＳ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｈ、Ｋ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｓ、およびＩからなる群より選択され、または一つの実施形態において、Ｓ、Ｐ、およびＲからなる群より選択されるか、または別の実施形態において、ＳおよびＰからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＰである。一つの実施形態において、ａ１はアセチル化されておらず、あるいはａ１がＫの場合、Ｋはアセチル化されておらず、また配列番号２でもない。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号１および４７であるか、または配列番号５９を含む１０アミノ酸までのペプチドであるか、あるいはそれらを含むペプチドである。
【００４７】
別の実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、式「ａＸ１Ｘ２Ｘ３Ｐｂ」（配列番号６０）のペプチドであるか、あるいはそのペプチドを含むペプチドであり、ここでＸ１、Ｘ２、およびＸ３は配列番号５６で定義されたとおりであり、かつここで「ａ」はＳ、Ｒ、Ｋ、Ｈ、Ｏ、Ｔ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇからなる群より選択されるか、あるいは別の実施形態において、Ｓ、Ｒ、およびＩからなる群より選択されるか、あるいは別の実施形態において、ＳおよびＲからなる群より選択され、かつここで「ｂ」はＡ、Ｖ、Ｉ、Ｌ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｓ、Ｔ、Ｆからなる群より選択されるか、あるいは別の実施形態においてはＡである。別の実施形態において、配列番号６０のペプチドは、配列番号３、１２、および３９であるか、あるいは配列番号６０または配列番号３、１２もしくは３９を含む１０アミノ酸までのペプチドである。
【００４８】
本明細書で用いられる場合、「表１の配列のアミノ酸配列を含むペプチド」または「表１の配列のアミノ酸配列を含むペプチド」は、そのペプチドそのもの、そのペプチドの明白な化学的同等物、そのペプチドの異性体（例えば、それらの異性体、立体異性体、レトロ異性体、レトロインベルソ異性体、全ての−［Ｄ］異性体、全ての−［Ｌ］異性体、または混合された［Ｌ］異性体および［Ｄ］異性体）、そのペプチドの保存性の置換物、そのペプチドの前駆体形、そのペプチドのタンパク分子内プロセシング形（例えば、Ｎ末端もしくはＣ末端からの一つのアミノ酸の切断物または本発明のペプチドの免疫学的に活性な代謝産物）、そのペプチドの薬学的に受け入れられる塩およびエステル、および翻訳後修飾の結果生じる他の形であるペプチドを包含する。また包含されるものは、長さが１０、９、８、７、６、５、および４アミノ酸まで、およびそれを含む、（環状化した、または直線状の、または中心となる親配列から分岐した）任意の親配列であり、そのうち指定された配列は部分配列である。表中におけるペプチドは三量体であるが、それが１０、９、８、７、６、５、および４マーの部分配列であり得ることを、一方、もし表１に記載されたペプチドが六量体でも、それが１０、９、８、および７マーの部分配列であり得るが、５マーでも４マーでもないことを、当業者は認める。加えて、本発明は、１０マーより大きい配列（配列番号４４および配列番号５４）を含む。本発明のペプチドの免疫学的活性を保持する改変されたペプチドは、本発明の範囲内に含まれる。
【００４９】
明細書でさらに用いられる場合、本発明のペプチドの「明白な化学的同等物」は、明細書で記述されたペプチドと同じ望ましい活性（例えば、明細書で記述されたペプチドと同じ免疫学的活性）を持ち、かつささいな化学的相違を示す分子であるか、あるいはマイルドな条件下で本発明のペプチドに転換される分子（例えば、本発明のペプチドのエステル、エーテル、還元産物、および複合体）である。
【００５０】
加えて、明細書で用いられる場合、「保存性の置換」は、類似した極性または立体的配置を持つか、または置換された残基と同じクラス（例えば、疎水性、酸性、または塩基性）に属するかのどちらかであることにより、置換されたアミノ酸残基と機能上同等であるアミノ酸置換である。明細書で定義された用語「保存性の置換」は、本発明のペプチドの先天免疫増強能力への取るに足らない影響を持つ置換を包含する。保存性の置換の例は、極性（親水性）残基による別の残基の置換（例えば、アルギニン／リジン、グルタミン／アスパラギン、またはスレオニン／セリン）、非極性（疎水性）残基（例えば、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、またはバリン）による別の残基の置換、酸性残基（例えば、アスパラギン酸またはグルタミン酸）による別の残基の置換、または塩基性残基（例えば、アルギニン、ヒスチジン、リジンまたはオルニチン）による別の残基の置換を含む。
【００５１】
明細書で用いられる場合、用語「類似物」は、明細書で記述される配列に実質上同一のアミノ酸配列を持つ任意のペプチドであって、その少なくとも一つの残基が機能上類似の残基によって保存性の置換がされているペプチドを包含する。「類似物」は、６０％またはそれより大きい（好ましくは、７０％またはそれより大きい、８０％またはそれより大きい、８５％またはそれより大きい、９０％またはそれより大きい、９５％またはそれより大きい、または９９％の）アミノ酸配列のホモロジーが、表１のアミノ酸配列とあり、そして表１のアミノ酸配列の機能上の変異体である。さらに明細書で用いられる場合、用語「機能上の変異体」は、明細書で記述されるように先天免疫を増強するか、またはＤＰＰＩＶ活性を減少させる能力を示すペプチドの活性を指す。「類似物」は、表１のアミノ酸と類似した三次元の立体配座を持つ、表１のアミノ酸の変異体を包含する。「類似物」は、明細書に記述されるとおりの類似物の任意の薬学的に受け入れられる塩をさらに含包含する。「変異体」は、明細書に記述されるとおりの変異体の任意の薬学的に受け入れられる塩をさらに包含する。
【００５２】
「誘導体」は、明細書で用いられる場合、官能性の側基の反応により化学的に誘導された一つあるいはより多くのアミノ酸を持つ本発明のペプチドを指す。模範的な誘導された分子としては、遊離アミノ基が、アセチル基、アミン塩酸塩、カルボベンゾイル基、クロロアセチル基、ホルミル基、ｐ−トルエンスルホニル基、またはｔ−ブチルオキシカルボニル基を付加することにより、塩またはアミドを形成するように誘導されたペプチド分子が挙げられるがこれらに限定されない。遊離ヒドロキシル基は、Ｏ−アシル誘導体またはＯ−アルキル誘導体を形成するように誘導され得る。さらに、遊離カルボキシル基は、塩、エステル（例えば、メチルエステルおよびエチルエステル）、またはヒドラジドを形成するように誘導され得る。従って、「誘導体」は、さらに、明細書に記述されるとおりの誘導体の薬学的に受け入れられる任意の塩を包含する。
【００５３】
本発明の一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、改変されたＣ末端および／または改変されたＮ末端を持つ。例えば、単離されたペプチドは、アミド化されたＣ末端を持ち得る。例えば、アミノ末端は、アセチル化（Ａｃ）され得るし、あるいはカルボキシ末端はアミド化（ＮＨ２）され得る。しかしながら、本発明の一つの実施形態において、仮にそのような改変が、望ましい免疫学的活性の消失を結果として生じる場合は、本発明のペプチドは、好ましくはアセチル化されない。アミノ末端の改変としては、メチル化（すなわち、−−ＮＨＣＨ３または−−ＮＨ（ＣＨ３）２）、アセチル化、カルボベンゾイル基（ｃａｒｂｏｂｅｎｚｏｙｌ ｇｒｏｕｐ）の付加、またはカルボキシレートの官能性を持つ（ＲＣＯＯ−−で定義され、ここでＲはナフチル基、アクリジニル基、ステロイジル基、および類似の基からなる群より選択される）任意のブロッキング基でアミノ末端をブロックすることが挙げられる。カルボキシ末端の改変としては、遊離酸をカルボキサミド基で置き換えること、または構造的な制約を導入するためにカルボキシ末端で環状ラクタムを形成することが挙げられる。
【００５４】
一つの実施形態において、骨格の置換（例えば、ＮＣＨ３へのＮＨの置換）がされうる。単離されたペプチドはまた、表１のアミノ酸配列のペプチドの改変物（例えば、１挿入もしくは１欠失のような点変異、または先端の切断）でも、または表１のアミノ酸配列を含む改変物（例えば、挿入もしくは欠失のような点変異、または先端の切断）でもよい。例として、そのペプチドは、望ましい免疫学的活性が保持されさえすれば、Ｄアミノ酸の少なくとも一つの点挿入により改変される表１のアミノ酸配列を含み得る。特に、プロリン残基の環の大きさが５員から４員、６員、または７員に変えられたプロリン類似物が用いられうる。環状基は、飽和でも非飽和でもよく、そして非飽和の場合、芳香性でも非芳香性でもよい。
【００５５】
２０種類の遺伝的にコードされたアミノ酸（またはＤアミノ酸）の天然に存在する側鎖を、類似の特性を持つ他の側鎖（例えば、アルキル、低級アルキル、環状４員アルキル、環状５員アルキル、環状６員アルキル、環状７員アルキル、アミド、アミド低級アルキル、アミドジ（低級アルキル）、低級アルコキシ、ヒドロキシ、カルボキシ、およびそれらの低級エステル誘導体）で、ならびに４員複素環、５員複素環、６員複素環、７員複素環で置き換えることができる。
【００５６】
そのような置換は、以下のものを含み得るが必ずしもそれに限定はされない。（１）正に荷電した非標準アミノ酸（例えば、オルニチン、Ｄａｂ（２，４−ジアミノ酪酸（それはオルニチンからメチレン基を一つ除いたようなもの（またはリジンからメチレン基を二つ除いたようなもの）である）、ＤｐｒまたはＤａｐａ（２，３−ジアミノプロピオン酸（それはオルニチンからメチレン基を二つ除いたようなもの（またはリジンからメチレン基を三つ除いたようなもの、またはヒドロキシルのかわりにアミノ基を持つセリンのようなもの）である））、Ｎｌｙｓ（（Ｎ−（４−アミノブチル）−グリシンであり「Ｎ末端」に取り付けられたリジン側鎖およびグリシンのアミノ基に取り付けられたアミノプロピル基またはアミノエチル基を持つ化合物を持つ））（２）電荷を持たない、アルガニン様の非天然のアミノ酸。例えば、Ｃｉｔ（シトルリン）およびＨｃｉ（メチレン基をもう一つ持つシトルリン）。（３）ＯＨをもつ（例えば、セリンのように）、非標準の天然には存在しないアミノ酸（例えば、ｈＳｅｒ（ホモセリン（メチレン基をもう一つ持つ））、Ｈｙｐ（ヒドロキシプロリン）、Ｖａｌ（ベータＯＨ）（ヒドロキシバリン）、Ｐｅｎ（ペニシラミン）（Ｖａｌ（ベータＳＨ））。（４）プロリン誘導体（例えば、Ｄ−Ｐｒｏ。例えば、３，４−デヒドロプロリン、Ｐｙｒ（ピログルタミン、環中にＣ＝Ｏを持つプロリン）、環上にフッ素置換を持つプロリン、１，３−チアゾリジン−４−カルボン酸（環中にＳを持つプロリン））。（５）ヒスチジン誘導体（例えば、Ｔｈｉ（ベータ−（２チエニル）−アラニン））。または（６）アルキル誘導体（例えば、Ａｂｕ（２−アミノ酪酸（Ｃアルファ上にエチル基））、Ｎｖａ（ノルバリン（Ｃアルファ上にプロピル基））、Ｎｌｅ（ノルロイシン（Ｃアルファ上にブチル基））、Ｈｏｌ（ホモロイシン（Ｃアルファ上にプロピル基））、Ａｉｂ（アルファ−アミノイソ酪酸（メチレン基を持たないバリン））。それらの置換が親ペプチド／配列の免疫学的な活性を保持することを当業者は認める。
【００５７】
別の代わりになる実施形態において、Ｃ末端カルボキシル基またはＣ末端エステルが、それぞれ、カルボキシル基の−−ＯＨまたはカルボキシルエステルのエステル（−−ＯＲ）のＮ末端アミノ基による内部置換により環化して環状ペプチドを形成するよう誘導され得る。例えば、ペプチド酸を与える合成と切断後、遊離酸は、（例えば、塩化メチレン（ＣＨ２Ｃｌ２）、ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）混合物中の）とけたジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）のような適切なカルボキシル基のアクチベーターにより、活性化されたエステルに変えられる。環状ペプチドが、その後、活性化されたエステルのＮ末端アミンによる内部置換により形成される。重合と対照的に、内部環化は、非常に希薄な溶液の使用により増進されうる。そのような方法は、当該分野で周知である。
【００５８】
末端アミノ基または末端カルボキシル基が存在しないように、本発明のペプチドを環化するか、またはペプチド末端へデスアミノ残基を組み込むか、もしくはペプチド末端へデスカルボキシ残基を組み込むことによって、そのペプチドのプロテアーゼに対する感受性を減少させるか、またはそのペプチドの立体配座を制限することもまた可能である。本発明の化合物のＣ末端官能基としては、アミド、アミド低級アルキル、アミドジ（低級アルキル）、低級アルコキシ、ヒドロキシ、およびカルボキシ、ならびにそれらの低級エステル誘導体、ならびに薬学的に受け入れられるそれらの塩が挙げられる。
【００５９】
また、Ｎ末端システインおよび／またはＣ末端システインを付加し、そしてジスルフィド結合または他の側鎖の相互作用を介してそのペプチドを環化することによってそのペプチドを環化し得る。
【００６０】
末端アミノ基または末端カルボキシル基が存在しないように、デスアミノ残基またはデスカルボキシ残基をペプチドの末端に組み込んで、そのペプチドのプロテアーゼに対する感受性を減少させるかまたはそのペプチドの立体配座を制限することも可能である。
【００６１】
（ペプチドの製造方法）
本発明は、ペプチドの類似物、誘導体、および変異体を含むペプチドであって、合成により生産されたか、組み換えにより生じたか、または天然の細胞から単離されたペプチドを企図する。本発明のペプチドは、当業者に周知の方法により合成され得る（例えば、Ｍｏｄｅｒｎ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ｏｆ Ｐｅｐｔｉｄｅ ａｎｄ Ａｍｉｎｏ Ａｃｉｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，１９８１）、およびＢｏｄａｎｓｋｙ， Ｍ．，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ Ｎ．Ｙ．，Ｉｎｃ．，１９８４）に記述されたとおり）。本発明のペプチドの合成において用いられ得る方法の例は、固相ペプチド合成、溶液または液体法ペプチド合成、および任意の商業的に入手できるペプチド合成装置を用いた合成を含むが、しかしそれに限定はされない。一つの実施形態において、本発明のペプチドはインビトロで合成される（例えば、化学的な方法またはｍＲＮＡのインビトロトランスレーションにより）。別の実施形態において、本発明のペプチドは、従来技術およびペプチドをコードするｃＤＮＡを用いて、組み換えにより生産される。本発明のアミノ酸配列は、ペプチド配列の合成において用いられる当業者に周知のカップリング剤および保護基をさらに含み得る。
【００６２】
本発明のペプチド類似物、誘導体、および変異体は、当業者に周知の、広い種類の異なる変異誘発技法により作られ得る。これらの技法は、任意の分子生物学実験室マニュアル（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ−Ａ
Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ ｅｄ．（Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ，ＮＹ：Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，１９８９）、またはＡｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．， Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ）が挙げられる）において見いだされ得る。変異キットはまた、多くの商業的な分子生物学の供給者から入手できる。初めのアミノ酸配列において部位特異的変異誘発、領域特異的変異誘発、またはランダム変異誘発を行なう方法が入手できる。類似物、誘導体、および変異体が生産された後、それらは、明細書に記述されたように、先天免疫を増強する望ましい能力に関してスクリーニングされ得る。
【００６３】
（ペプチドと反応性のある因子）
本発明は、表１のアミノ酸配列を含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドと反応性のある因子をさらに提供する。明細書で用いられる場合、「反応性の」は、本発明のペプチドに親和性があるか、結合するか、または指向する因子を意味する。さらに、明細書で用いられる場合、「因子」は、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡが挙げられる）、天然には存在しない抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、分子、化合物、抗生物質、薬物、およびそれらの任意の組み合わせを包含するものとする。Ｆａｂ断片は、抗体の一価の抗原結合断片であり、パパイン消化により産生される。Ｆ（ａｂ’）２断片は、抗体の二価の抗原結合断片であり、ペプシン消化により産生される。好ましくは、本発明の因子は、検出可能なマーカーまたは標識で標識される。天然に存在しない抗体は、二つのＣ末端グリシン残基およびＭＡＰＳのような、別の化合物と結合したペプチドを用いて生成される抗体を意味する。ＭＡＰＳ抗原は、本発明のペプチドに、そのペプチドのＣ末端に挿入された２個のグリシン残基を介して取り付けられる。その構築物はその後、ウサギのような動物に投与され得、そして、抗体は、当該分野で周知の手順を用いて収集され得る。
【００６４】
本発明の一つの実施形態において、本発明のペプチドと反応性のある因子は、抗体である。明細書で用いられる場合、本発明の抗体は、ポリクローナルでもモノクローナルでもよい。加えて、本発明の抗体は、当業者には周知の技術により生産され得る。例えば、ポリクローナル抗体は、マウス、ウサギ、またはラットを本発明の精製されたペプチドで免疫することにより生産され得る。次に、モノクローナル抗体は、免疫した動物から脾臓を取り出し、脾臓細胞を骨髄腫細胞と融合させ、培養して増殖させた場合、モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを形成させることにより生産されうる。例えば、Ｊ．Ｇ．Ｒ．Ｈｕｒｒｅｌ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ｈｙｂｒｉｄｏｍａ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ （Ｂｏｃｏ Ｒａｔｏｎ， ＦＬ：ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ Ｉｎｃ．，１９８２）を参照のこと。
【００６５】
本発明の抗体は、検出可能なマーカーまたは標識で標識され得る。抗体の標識は、ペルオキシダーゼ標識、当該分野で公知の化学発光標識、および当該分野で公知の放射性標識を含めた多様な標識技術のうちの一つを用いて実行され得る。本発明の検出可能なマーカーまたは標識は、例えば、非放射性マーカーまたは蛍光マーカー（例えば、ビオチン、フルオレセイン（ＦＩＴＣ）、アクリジン、コレステロール、またはカルボキシ−Ｘ−ローダミン）であり得、それらは当該分野で容易に知られる蛍光イメージング技術または他のイメージング技術を用いて検出され得る。あるいは、検出可能なマーカーまたは標識は、例えば放射性同位体を含め、放射性マーカーでもよい。放射性同位体は、検出可能な放射線を放射する任意の同位体（例えば、３５Ｓ、３２Ｐ、１２５Ｉ、３Ｈ、または１４Ｃ）でありうる。放射性同位体により放射される放射能は、当該分野で周知の技術により検出され得る。例えば、放射性同位体からのガンマ放射は、ガンマイメージング技術、特にシンチグラフィーイメージングを用いて検出され得る。好ましくは、本発明の因子は、検出可能なマーカーまたは標識で標識された高親和性抗体である。
【００６６】
（単離された核酸分子）
加えて、本発明は、表１のアミノ酸配列を含むペプチドをコードする単離された核酸分子を、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド（結合ペプチド（例えば、キャリアペプチド構築物）を含む）をコードする単離された核酸分子を、または他のペプチドをコードする単離された核酸分子を、または免疫学的に活性な表１のペプチドへと代謝される、または切り離されるプロペプチドをコードする単離された核酸分子を提供する。遺伝コードの縮重により、本発明の核酸分子は、本発明のペプチドをまたコードする多数の核酸置換物を含む。本発明はさらに、表１のアミノ酸配列またはその類似物、誘導体、もしくは変異体をコードする単離された核酸分子にハイブリダイズする核酸を提供する。
【００６７】
本発明の核酸分子は、ＤＮＡまたはＲＮＡであり得る。それらは、当業者に公知の多様な技術により調製され得、それらの方法としては、商業的に入手可能なオリゴヌクレオチド合成装置（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｍｏｄｅｌ ３９２ ＤＮＡ／ＲＮＡ 合成装置）を用いたオリゴヌクレオチドの自動化された合成が挙げられるが、これに限定されるわけではない。加えて、本発明の核酸分子は、一つまたはそれより多い検出可能なマーカーまたは標識で標識され得る。核酸分子の標識は、当該分野で公知の多くの方法のうちの一つ（例えば、ニックトランスレーション、末端標識、フィルイン末端標識、ポリヌクレオチドキナーゼ変換反応、ランダムプライミング、または（リボプローブ（ｒｉｂｏｐｒｏｂｅ）調製のための）ＳＰ６ポリメラーゼ）を、多様な標識（例えば、３５Ｓ、３２Ｐ、もしくは３Ｈのような放射性標識、またはビオチン、フルオレセイン（ＦＩＴＣ）、アクリジン、コレステロール、もしくはカルボキシ−Ｘ−ローダミン（ＲＯＸ）のような非放射性標識）のうちの一つとともに用いて実行され得る。
【００６８】
本発明はまた、発現ベクターに作動可能に連結された本発明の核酸分子を含む組み換え核酸構築物を提供する。明細書で用いられる場合、「発現ベクター」は、適切な宿主においてそのＤＮＡの発現をもたらす能力のある適切な調節配列に作動可能に連結されたＤＮＡ配列を含むＤＮＡ構築物である。例えば、ベクターは、プラスミド、ファージ粒子、または可能性のあるゲノム挿入物であり得る。さらに明細書で用いられる場合、用語「作動可能に連結された」は、二つのＤＮＡ領域間の機能上の関係を記述する。本発明における使用に適切な発現ベクターは、本発明のペプチドをコードする核酸分子に作動可能に連結された少なくとも一つの発現調節エレメント（例えば、オペレーター、プロモーター、ｌａｃシステム、リーダー配列、終結コドン、および／またはポリアデニル化シグナル）を含む。一つの実施形態において、その発現ベクターは、真核細胞において機能する真核細胞の発現ベクター（例えば、レトロウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、または鶏痘ウイルスベクター）である。
【００６９】
いったん本発明の核酸分子に作動可能に連結されると、その発現ベクターは、核酸の移入に適切な任意のインビボまたはエキソビボの方法により、受容者細胞中に導入され得る。それらの方法としては、エレクトロポレーション、ＤＥＡＥデキストラントランスフェクション、リン酸カルシウムトランスフェクション、リポフェクション、モノカチオンリポソーム融合、ポリカチオンリポソーム融合、プロトプラスト融合、インビボ電場の形成、ＤＮＡ被覆微粒子銃、複製欠損組み換えウイルスの注入、相同組み換え、ウイルスベクター、むき出しのＤＮＡの移入、またはそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されるわけではない。核酸の移入に適切な組み換えウイルスベクターとしては、ウイルス（例えば、レトロウイルス、ＨＳＶ、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、セムリキ森林ウイルス（Ｓｅｍｉｌｉｋｉ Ｆｏｒｅｓｔ ｖｉｒｕｓ）、サイトメガロウイルス、およびワクシニアウイルス）のゲノム由来のベクターが挙げられるが、これらに限定されるわけではない。
【００７０】
本発明はさらに、本発明の組み換え核酸構築物を含む少なくとも一つの宿主細胞を提供する。本発明の宿主細胞は、明細書に記述された核酸構築物で形質転換される。宿主細胞は、真核細胞（例えば、動物細胞、植物細胞、昆虫細胞、または酵母細胞）でも原核細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）でもよい。
【００７１】
加えて、本発明は、表１のアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを生産するための方法を提供する。その方法は次の工程を包含する：（ａ）そのペプチドの発現を許容する条件下で、明細書で記述されたとおりの組み換え核酸構築物を含む少なくとも一つの宿主細胞を培養すること；および（ｂ）少なくとも一つの宿主細胞から、またはその培養培地からそのペプチドを回収すること。その組み換えペプチドは、粗溶解産物として回収されうる；その組み換えペプチドはまた、当該分野で公知の標準的なタンパク質精製手順（アフィニティクロマトグラフィーおよび免疫アフィニティクロマトグラフィー、ディファレンシャル沈澱、ゲル電気泳動、イオン交換クロマトグラフィー、等電点電気泳動、サイズ排除クロマトグラフィーなどが挙げられるが、それらに限定されるわけではない）により精製され得る。
【００７２】
（薬学的組成物）
本発明はさらに、表１のアミノ酸配列、または配列番号１、配列番号３〜１６、もしくは配列番号１８〜６０のアミノ酸配列を含むペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体（前述のいずれかの薬学的に受け入れられる塩、酸付加塩、もしくはエステルが挙げられる）を含むペプチドを、少なくとも一つの薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤、または賦形剤との組み合わせで含む薬学的な組成物を提供する。薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤または賦形剤は、組成物の他の成分と適合し、そしてその受容者に有害ではないという意味で「受け入れられる」でなければならない。受け入れられる薬学的キャリア、希釈剤、および賦形剤の例は、数ある中で、カルボキシメチルセルロース、結晶セルロース、グリセリン、アラビアゴム、ラクトース、ステアリン酸マグネシウム、メチルセルロース、粉剤、生理食塩水、アルギン酸ナトリウム、スクロース、でんぷん、タルク、および水が挙げられるが、それに限定されるものではい。明細書に記述されるように、本発明の薬学的な組成物の調合物は、単位投薬量で都合よく与えられ得る。
【００７３】
（使用）
本発明のペプチドは、先天免疫の増強において治療上の有用性があることが示された。先天免疫の増強は、抗微生物活性の欠損（実施例２）ならびにインビボモデルにおける抗感染防御（実施例３および実施例４）により、そしてまた実施例５のＤＰＰＩＶアッセイにより示される。従って、本発明はまた、被験体において感染を処置および／または予防するための方法を提供する。明細書で用いられる場合、「被験体」は、鳥類（例えば、ニワトリ、七面鳥等）または哺乳動物（例えば、ウシ、イヌ、ヒト、サル、マウス、ブタ、ラット等）である。一つの実施形態において、被験体はヒトである。被験体は、感染していてもよく、または感染のリスクを持っていてもよい。例として、感染は、微生物感染でありうる。本発明の方法により処置され得る微生物感染としては、細菌による感染、真菌による感染、寄生体による感染、およびウイルスによる感染が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【００７４】
ほとんどの細菌性病原体は、一般的な環境中に、または宿主の正常な細菌叢中に存在する。細菌は、コロニーを形成し、宿主の組織中に広まり、そして宿主の組織を侵略することを可能にする、異なる機構（毒性因子と呼ばれる）を獲得することによって、ひどい疾患をひきおこす能力を進化させた。これらの病原性因子が抑制される場合、細菌は、宿主組織中でもはやそれ自体を維持できず、そしてそれゆえ、疾患をひきおこすことができない。本発明の方法により処置され得る典型的な細菌としては、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．（例えば、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．、およびバンコマイシン耐性腸球菌が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【００７５】
Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａは、どこにでもいるグラム陰性細菌であり、環境の融通性、感受性のある個体において疾患をひきおこす能力、および抗生物質に対する耐性のために注目される。Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａは、融通のきく生物であり、土壌、沼地、および海岸に近い海の生息環境、ならびに植物上および動物組織中で増殖する。嚢胞性線維症の最も重大な合併症は、Ｐ． ａｅｒｕｇｉｎｏｓａによる、気道感染である。免疫系欠損症を持つ特定の他の個体がかかるのと同様に、癌患者および熱傷患者もまた普通にこの生物体によるひどい感染にかかる。多くの環境中の細菌とは異なり、Ｐ． ａｅｒｕｇｉｎｏｓａは、感受性の宿主において疾患をひきおこす顕著な能力を持つ。
【００７６】
Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓは、直径約１マイクロメートルのグラム陽性の球状の細菌であり、微視的な群で増殖する。Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、ヒトの最も重要な病原体の一つであり、心内膜炎から肺炎までの範囲の、市中感染および院内感染の両方をひきおこす。Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、一般的に細胞外病原体として分類されるが、最近のデータは、多様な型の宿主細胞（例えば、プロフェッショナル食細胞（ｐｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌ ｐｈａｇｏｃｙｔｅ）および非食細胞（内皮細胞、線維芽細胞等が挙げられる）の両方）にＳ．ａｕｒｅｕｓが感染する能力を示した。この侵入は、細胞表面へのＳ．ａｕｒｅｕｓの付着によって開始され、それはブドウ球菌のフィブロネクチン結合タンパク質が重要な役割をはたすプロセスである。貪食されたＳ．ａｕｒｅｕｓは、宿主細胞のアポトーシスを誘導するか、または細胞質中で数日間生存することが可能であり、このことは抗ブドウ球菌エフェクター機構の欠損によると考えられる。
【００７７】
Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、鼻の通路、皮膚表面、粘膜、ならびに口、生殖器および直腸の周りの領域にコロニーを形成する。Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、表面の皮膚病巣（例えば、腫脹、麦粒腫、およびフルンケル）をひきおこし得る。よりひどい感染としては、肺炎、乳腺炎、静脈炎、髄膜炎、および尿路感染が挙げられ、根深い感染としては、骨髄炎および心内膜炎が挙げられる。
【００７８】
本発明の方法により処置されうる典型的な真菌としては、糸状菌、酵母、および高等真菌が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。全ての真菌は、真核細胞であり、そしてその細胞膜にステロールを持つが、ペプチドグリカンを持たない。真菌の感染、すなわち真菌症は、組織の関与の程度および宿主中への侵入の様式により分類される。免疫無防備状態の宿主において、多様な非病原性真菌、または通常は軽度の真菌が、致死的な可能性をもつ感染をひきおこし得る。
【００７９】
寄生体は、他の生体（宿主として知られる）から、食物および保護を得ている生物である。寄生体は、動物からヒトへ、ヒトからヒトへ、またはヒトから動物へと伝えられ得る。いくつかの寄生体は、食品伝染疾患および水系感染性疾患の重要な原因として現れた。それらは、汚染された食物および水の消費により、または感染したヒトもしくは動物の便（糞便）と接触した物質の経口摂取により、宿主から宿主へと伝えられ得る。寄生体は、感染したヒトおよび動物宿主の組織および臓器中で生存および繁殖し、そしてしばしば糞便中に排出される。大きさにおいて異なる型（小さい単細胞の微視的な生物体（原生動物）から、顕微鏡を用いずに見ることができる、より大きな多細胞の蠕虫（腸内寄生虫）までの範囲にわたる）の寄生体がある。本発明の方法により処置され得る一般的な寄生体の例としては、Ｇｉａｒｄｉａ ｄｕｏｄｅｎａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ
ｐａｒｖｕｍ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ ｃａｙｅｔａｎｅｎｓｉｓ、およびＴｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉが挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【００８０】
真菌および細菌と異なり、ウイルスは、自由生活細胞の多くの特性を欠いている。一つのウイルス粒子は、固定的な構造であり、きわめて安定で、そしてその一部を変化させたりまたは置き換えたりすることができない。細胞と会合した場合にのみ、ウイルスは、複製し、そして生命のある系の特性のいくつかを獲得することができるようになる。ウイルスは、多数の疾患（例えば、感冒および咽頭炎（咽喉炎）のような上気道感染（ＵＲＴＩ）が挙げられる）をひきおこす。本発明の方法により処置され得るウイルスの他の例としては、ＡＩＤＳ、鳥インフルエンザ、水痘、単純疱疹、感冒、胃腸炎（特に子供の）、伝染性単核球症、インフルエンザ、麻疹、ムンプス、咽頭炎、肺炎、風疹、ＳＡＲＳ、および下気道感染（例えば、ＲＳウイルス、すなわちＲＳＶ）に関係するウイルスが挙げられるが、それらに限定されるものではない。
【００８１】
本発明者達は、表１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１、配列番号３〜１６、配列番号１８〜６０のアミノ酸配列を含むペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド、またはそれらの明白な化学的同等物を含むペプチドが、感染の予防および／または処置において有効であることを、明細書で示した。従って、被験体における感染を処置および／または予防する本方法は、表１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１、配列番号３〜１６、配列番号１８〜６０のアミノ酸配列を含むペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド、またはそれらの明白な化学的同等物を含むペプチドを、被験体に投与することを含む。本発明のペプチドを、感染の処置および／もしくは予防の有効性を増大させるため、ならびに／またはターゲティングの有効性を増大させるために、別の因子と結合させ得ること、または抗生物質（例えば、ペニシリン、メチシリン、またはバンコマイシン）のような別の因子との組み合わせで投与し得ることは、本発明の範囲にある。
【００８２】
本発明の一つの実施形態において、本発明のペプチドは、表１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１、配列番号３〜１６、配列番号１８〜６０のアミノ酸配列のペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド、またはそれらの明白な化学的同等物を含むペプチドを含む。別の実施形態において、本発明のペプチドは、被験体の先天免疫を調節し、それゆえ、被験体における感染を処置および／または予防する。先天免疫応答は、病原体との遭遇に対する最前線の反応である。先天免疫応答は、感染性疾患の発症を予防する多数の機構を含む。そのような機構の一つは、免疫エフェクター細胞のプライミングおよび動員を含む。
【００８３】
一つの実施形態において、本発明のペプチドは、炎症を抑制すると同時に、先天免疫または先天免疫応答を増強しうる。
【００８４】
別の実施形態において、本発明のペプチドが、ＤＰＰＩＶ活性の調節因子であることが示された。本発明のペプチドは、ＤＰＰＩＶ活性を減少させることが示された。それゆえ、本発明のペプチドは特定の免疫学的状態を処置するペプチドの投与から利益を得られうる被験体のスクリーニングにおいて有用である。そのスクリーニングは、ＤＰＰＩＶ関連状態を有することが疑われるか、または知られている被験体からサンプルを採取し、このサンプルを本発明のペプチドおよびＤＰＰＩＶの基質とともにインキュベートし、そしてＤＰＰＩＶ活性の減少に対するそのペプチドの効果を、対照との比較においてモニターすることを含む。ここで、活性の減少は、ＤＰＰＩＶ関連状態を処置するための被験体へのペプチドの投与の可能性のある利益を示す。別の実施形態において、対照と比較しての、そのペプチドの存在下でのＤＰＰＩＶ活性の調節が、ＤＰＰＩＶ関連状態を示し得る。それゆえ、本発明のペプチドを、ＤＰＰＩＶ関連状態の診断において用いうる。別の局面において、本発明のペプチドは、ＤＰＰＩＶ関連障害（例えば、ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、グレーヴズ病、癌（例えば、肺癌および大腸癌）、糖尿病、および自己免疫障害（例えば、関節リウマチおよび多発性硬化症））のような多くの免疫学的障害の処置において有用である。
【００８５】
（投与）
本発明の方法に従って、明細書に記述されたとおりの本発明のペプチドは、被験体において感染を処置および／または予防するのに、ならびに、あるいはＤＰＰＩＶ関連状態を処置または予防するのに有効な量（例えば、治療上の有効量）で、被験体に直接投与され得る。同様に、明細書で記述されたペプチドは、被験体におけるそのペプチドの発現を許容する方法で、そして感染を処置および／または予防するのに有効な量で、そのペプチドをコードする核酸配列を被験体に投与することによって、被験体に間接的に投与され得る。
【００８６】
さらに、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸分子が、被験体において感染を処置するのに有効な量で、被験体に投与され得る。明細書で用いられる場合、「感染を処置するのに有効な」の語句は、感染（細菌、真菌、寄生体、ウイルス等による）の結果生じる臨床的な障害または症状を、改善または最小化するのに有効であることを意味する。例えば、被験体が、微生物に感染した場合、微生物感染の処置に有効なペプチド（またはこれをコードする核酸）の量は、微生物感染の症状（例えば、頭痛、項硬直、食欲不振、悪心、嘔吐、下痢、腹部不快感、急性腎不全、複数の臓器への虚血性ダメージの症状発現の変化、発熱および血小板減少を含むが、それらに制限されるものではない）を改善または最小化し得る量である。被験体において、感染を処置するのに有効なペプチド（またはこれをコードする核酸）の量は、それぞれの症例の特定の要因（被験体の体重および被験体の状態の重大さを含む）に依存して変化する。ペプチド（またはこれをコードする核酸）の適切な量は、当業者により容易に決定され得る。同様に、ＤＰＰＩＶ関連状態の処置に有効な量は、当業者に知られた多くの類似の要因に依存して変化し得る。
【００８７】
同様に、本発明の方法において、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸分子はまた、被験体における感染を予防するのに有効な量で、感染を発症するリスクのある被験体に投与され得る。明細書で用いられる場合、「感染を予防するのに有効な」の語句は、感染（細菌、真菌、寄生体、ウイルス等による）に由来する臨床的な障害または症状の発症または症状発現を、妨げるかまたは予防するのに有効なものを包含する。被験体において感染を予防するのに有効な、ペプチド（またはこれをコードする核酸）の量は、個々の症例の特定の因子（被験体の性別、体重、および被験体の状態の重大さ、状態の性質、感染部位、および投与の方法が挙げられる）に依存して変化する。ペプチド（またはこれをコードする核酸）の適切な量は、当業者により容易に決定され得る。
【００８８】
明細書で開示されるとおりの本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸配列は、、ヒトまたは動物の被験体に、公知の手順により投与され得、その手順は経口投与、非経口投与（例えば、筋膜上投与、包内投与、皮内投与、皮膚の内側への投与、筋内投与、眼窩内投与、腹腔内投与、脊椎内投与、胸骨内投与、脈管内投与、静脈内投与、実質投与、または皮下投与）、経皮投与、鼻腔内投与、肺への投与（例えば、気管内投与により）、および浸透圧ポンプによる投与が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。一つの実施形態において、投与の方法は、静脈内注射または皮下注射による非経口投与である。
【００８９】
経口投与に関して、そのペプチド（またはこれをコードする核酸）の処方物は、カプセル、錠剤、粉末、顆粒、または懸濁剤もしくは液体として提供され得る。その処方物は、従来の添加剤（例えば、ラクトース、マンニトール、トウモロコシでんぷん、またはジャガイモでんぷん）を含み得る。その処方物はまた、結合剤（例えば、結晶セルロース、セルロース誘導体、アラビアゴム、トウモロコシでんぷん、またはゼラチン）を与えられ得る。加えて、その処方物は、崩壊剤（例えば、トウモロコシでんぷん、ジャガイモでんぷん、またはカルボキシメチルセルロースナトリウム）を与えられ得る。その処方物はさらに、二塩基性無水リン酸水素カルシウムまたはでんぷんグリコール酸ナトリウムを与えられ得る。最後に、その処方物は、滑沢剤（例えば、タルクまたはステアリン酸マグネシウム）を与えられ得る。
【００９０】
非経口投与に関して、そのペプチド（または、これをコードする核酸）は、好ましくは被験体の血液と等張の滅菌水性溶液と組み合わせられ得る。そのような処方物は、固体の活性成分を水（この水は生理的に適合性のある物質（例えば、塩化ナトリウム、グリシンなど）を含み、かつ生理的条件に適合する緩衝されたｐＨを持っている）中に溶解して水性溶液を得て、その後、この溶液を滅菌することによって調製され得る。その処方物は、一個でまたは複数投与量の容器（例えば、密封されたアンプルまたは小瓶）で提供され得る。その処方物はまた、明細書で記述されたもの任意のものを含め、任意の注入方法により送達され得る。
【００９１】
経皮投与に関して、そのペプチド（またはこれをコードする核酸）は、皮膚浸透エンハンサー（例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、イソプロパノール、エタノール、オレイン酸、Ｎ−メチルピロリドンなど）と組み合わされ得る。皮膚浸透エンハンサーはペプチドまたは核酸に対する皮膚の透過性を増大させ、そしてペプチドまたは核酸が皮膚をとおって浸透して血流中へ入り込むのを許容する。エンハンサーおよびペプチドまたは核酸の組成物はまた、高分子の物質（例えば、エチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、エチレン／酢酸ビニル、ポリビニルピロリドンなど）とさらに組み合わせてゲル状の組成物を提供することが可能であり、これは、塩化メチレンのような溶媒に溶解され、望ましい粘度まで蒸発、そしてその後裏張り材料に適用されてパッチが提供されうる。そのペプチドまたは核酸は、感染が位置し得る被験体部位またはその近くに、経皮的に投与され得る。あるいは、そのペプチドまたは核酸は、全身性の投与を達成するために、感染領域とは別の部位に経皮的に投与され得る。
【００９２】
鼻腔内投与（例えば、鼻内噴霧）および／または肺への投与（吸入による投与）に関して、ペプチドまたは核酸の処方物（エアゾール処方物が挙げられる）は、当業者に周知の手順によって調製され得る。エアゾール処方物は、固体粒子または溶液（水性または非水性）のどちらをも含み得る。ネブライザ（例えば、ジェットネブライザ、超音波ネブライザ等）およびアトマイザが、溶液（例えば、エタノールのような溶媒を用いる）からエアゾールを作るのに用いられ得る。定量吸入器および乾燥粉末吸入器が、小粒子エアゾールを発生させるために用いられうる。エアゾール粒子の望ましい大きさは、当該分野で公知の多くの方法（ジェット−ミリング、噴霧乾燥、および臨界点凝縮が挙げられるが、それらに限定されるわけではない）の任意の一つを用いることにより獲得され得る。
【００９３】
鼻腔内投与のための薬学的な組成物は、固体処方物（例えば、粗い粉末）でよく、そして賦形剤（例えば、ラクトース）を含み得る。固体処方物は、鼻腔をとおしての迅速な吸入を用いて、鼻まで持ち上げられた粉末容器から投与され得る。鼻腔内投与のための組成物はまた、鼻内噴霧または点鼻薬の水性または油性の溶液を含み得る。噴霧器での使用については、そのペプチドまたは核酸の処方物は、水性溶液およびさらなる因子（例えば、賦形剤、緩衝剤、等浸透圧剤、保存剤、または界面活性剤が挙げられる）を含み得る。鼻内噴霧は、例えば、そのペプチドまたは核酸の懸濁物または溶液を、圧力下でノズルをとおして出すことにより作られ得る。
【００９４】
肺への投与のためのそのペプチドまたは核酸の処方物は、吸入デバイスによる送達のために適切な形態で提供されてもよく、そして肺または洞の下気道に到達するために有効な粒子の大きさを持ち得る。肺粘膜を含む粘膜表面をとおしての吸収に関しては、本発明の処方物は、エマルジョン（例えば、生物活性のあるペプチド、複数個のサブミクロンの粒子、粘膜付着性の巨大分子、および／または水性の連続した層を含む）を含み得る。粘膜表面をとおしての吸収は、そのエマルジョン粒子の粘膜付着をとおして達成され得る。
【００９５】
定量吸入器デバイスを用いる使用のための薬学的組成物は、非水性媒体中の懸濁物としてそのペプチドまたは核酸を含む細かく分割した粉末を含み得る。例えば、そのペプチドまたは核酸は、界面活性剤（例えば、トリオレイン酸ソルビタン、ダイズレシチン、またはオレイン酸）の助けでプロペラント中に懸濁され得る。定量吸入器は、典型的には、混合物（例えば、液化された圧縮ガスとして）として、容器（例えば、キャニスター）中に貯蔵されたプロペラントガス（例えば、クロロフルオロカーボン、ヒドロクロロフルオロカーボン、ヒドロフルオロカーボン、または炭化水素）を用いる。吸入器は、吸息中の作動を必要とする。例えば、定量バルブの作動が、その混合物をエアゾールとして放出させ得る。乾燥粉末吸入器は、混合粉末の吸息作動を用いる。
【００９６】
本発明のペプチドまたは核酸はまた、浸透圧ミニポンプまたは他の時限放出（ｔｉｍｅｄ−ｒｅｌｅａｓｅ）デバイスから放出または送達され得る。基本浸透圧ミニポンプからの放出速度は、放出開口部に配置された、微孔性の高速反応ゲル（ｆａｓｔ−ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｇｅｌ）で調節され得る。浸透圧ミニポンプは、そのペプチドまたは核酸の放出を調節するうえで、またはその送達を標的化するうえで有用である。
【００９７】
明細書で記述された方法に従って、本発明のペプチドは、被験体にペプチドそのものを導入することにより、またはそのペプチドをコードする核酸を、そのペプチドの発現を許容する方法で被験体に導入することにより、被験体に投与され得る。従って、本発明の一つの実施形態において、被験体における感染は、ある量の本発明のペプチドを被験体に投与することにより処置または予防され得る。本発明のさらなる実施形態において、被験体における感染は、被験体においてそのペプチドの発現を許容する方法で本発明のペプチドをコードする核酸配列を被験体に投与することにより、処置または予防され得る。
【００９８】
本発明のペプチドは、タンパク質および他の薬の導入に用いられる公知の方法（例えば、注射および輸液）により、被験体に投与または導入され得る。感染が、被験体の身体の特定の部分に限局されている場合、治療のためのペプチドをその領域に、注射またはなにか別の手段（例えば、そのペプチドを血液または別の体液中に導入することにより）により、直接導入することが望まれ得る。ペプチドの用いられる量は、先に定義したように、被験体において感染を処置および／または予防するのに有効な量であり、当業者によって容易に決定され得る。
【００９９】
本発明の方法において、そのペプチドはまた、そのペプチドの発現を許容する方法で、そのペプチドをコードする核酸を被験体の十分な数の細胞に導入することにより、被験体に投与または導入され得る。治療のためのペプチドをコードする核酸の量は、先に定義したように、被験体において感染を処置および／または予防するのに有効な量のペプチドを生産する量である。この量は、当業者によって容易に決定され得る。
【０１００】
本発明のペプチドをコードする核酸は、当該分野で公知の従来の手順（エレクトロポレーション、ＤＥＡＥデキストラントランスフェクション、リン酸カルシウムトランスフェクション、リポフェクション、モノカチオンリポソーム融合、ポリカチオンリポソーム融合、プロトプラスト融合、インビボ電場の形成、ＤＮＡ被覆微粒子銃、複製欠損組み換えウイルスの注入、相同組み換え、インビボ遺伝子治療、エキソビボ遺伝子治療、ウイルスベクター、むき出しのＤＮＡの移入、またはそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、それらに限定されるわけではない）を用いて、被験体に導入され得る。遺伝子治療に適切な組み換えウイルスベクターは、ウイルス（例えば、レトロウイルス、ＨＳＶ、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、セムリキ森林ウイルス（Ｓｅｍｉｌｉｋｉ Ｆｏｒｅｓｔ
ｖｉｒｕｓ）、サイトメガロウイルス、およびワクシニアウイルス）のゲノム由来のベクターが挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【０１０１】
本発明のペプチドをコードする核酸が、細胞における治療のためのペプチドの発現を成し遂げるために、従来の手順を用いて、適切な細胞にインビトロで導入され得ることもまた、本発明の範囲の中にある。そのペプチドを発現している細胞は、その後、インビボで感染を処置および／または予防するために被験体中に導入され得る。そのような、エキソビボ遺伝子治療の取り組みにおいて、その細胞は好ましくは被験体から取り出され、治療のためのペプチドをコードする核酸を組み込むＤＮＡ技術の対象とされ、そしてその後、被験体中に再導入される。
【０１０２】
本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸を含む処方物が、薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤、または賦形剤と、さらに混在させてもよく、したがって、薬学的な組成物を構成することもまた本発明の範囲の中にある。本発明の薬学的な組成物ならびに典型的なキャリア、希釈剤、および賦形剤は、先に記述される。
【０１０３】
本発明の処方物は、薬学分野で周知の方法により調製され得る。例えば、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸は、懸濁物または溶液として、キャリア、希釈剤、または賦形剤と混在させられ得る。一つまたはそれより多い補助成分（例えば、緩衝剤、矯味矯臭剤、界面活性剤など）もまた、随意に、加えられ得る。キャリアの選択は、投与の経路に依存する。感染を処置および／または予防するため、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸分子を被験体に投与するうえで、その薬学的な組成物は有用である。そのペプチドまたは核酸は、薬学的な組成物が投与される被験体において、感染を処置および／または予防するのに有効な量で提供される。この量は、先に記述されたように、当業者により容易に決定され得る。
【０１０４】
（診断およびスクリーニングアッセイ）
本発明は、先天免疫状態、またはＤＰＰＩＶ関連状態を有することが疑われる被験体を診断するための方法、被験体が本発明のペプチド（例えば、表１に列挙されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体）による処置に反応するか否かを予想するための方法、および本発明のペプチドの免疫学的な影響を調節（例えば、増強、阻害または模倣）する因子についてスクリーニングするための方法を提供する。別の実施形態において、本発明は、本発明のペプチドの免疫学的に活性な類似物、誘導体および変異体、または表１に列挙されたペプチドまたは免疫学的に活性なそれらの改変物についてスクリーニングするための方法を提供する。
【０１０５】
一つの実施形態において、免疫学的な障害（例えば先天免疫関連状態）を持つ患者が、本発明のペプチドによる処置に反応するか予想するための方法は、被験体から生物学的サンプルを獲得すること、本発明のペプチドをこのサンプルに投与すること、ならびに、その状態を示す、予め決定されたマーカー（例えば、ＤＰＰＩＶ関連状態に関してはＤＰＰＩＶ、感染に関しては炎症バイオマーカー、細胞生存率または細菌量）のレベルを、正の対照および／または負の対照との比較においてモニターすることを含む。その正の対照は、公知の免疫学的状態の被験体由来のサンプルでもよい。負の対照は、そのペプチドを投与されていない同じ被験体由来のサンプルでもよい。もしそのペプチドが、対照と比べて、その活性、マーカーのレベル、または細胞生存率を調節するなら、その被験体はそのような免疫学的な障害を持つ可能性があり、そしてそのペプチドでの処置から利益をうけ得る。
【０１０６】
さらにとりわけ、本発明の一つの局面において、もし被験体がＤＰＰＩＶ関連状態を有するか、またはその疑いがあるならば、その状態についてのマーカーとしてＤＰＰＩＶ活性をモニターすることは適切である。一つの局面において、対照と比較してのＤＰＰＩＶ活性の減少は、その被験体が、そのペプチドでの処置に反応することを示す。あるいは、仮に被験体が感染を有するかまたは感染を有する疑いがある場合、その患者からサンプルを獲得し、そのペプチドの投与後に患者からのサンプルと比較して病原体量または細胞生存率についてそのサンプルをモニターする（ここで、そのペプチドの投与後の患者において病原体量がより低いか、または細胞生存率がより高いことは、その被験体が、ペプチド処置から利益を得るか、あるいは免疫学的な障害を持っていることを示す）。
【０１０７】
別の実施形態において、ペプチドまたは表１のペプチドの改変物または他の因子が、本発明のペプチドと同じ免疫学的な活性を持つか知りたい場合、サンプル（因子に感染したマウスまたは既知のＤＰＰＩＶ関連状態に感染したマウスのいずれか由来）に対して公知の調節作用をもつ参照ペプチドと比較したＤＰＰＩＶ活性へのそのペプチドの影響をモニターしてもよく、あるいは、予防をモニターしたい場合は、サンプルにそのペプチドまたは因子を投与し、この感染またはＤＰＰＩＶ関連状態をこのサンプル中で誘導し、そしてその後、この感染もしくはＤＰＰＩＶ関連状態の発症、または免疫応答を、そのペプチドが調節または阻害するかモニターしうる。このサンプルは動物モデルでよく、ＤＰＰＩＶ関連状態または感染の誘導は、倫理指針に従って、認められた動物モデルにおいて実施され、そしてその後、その動物またはその動物の適切な生物学的サンプルが、そのペプチドの影響についてスクリーニングされる。
【０１０８】
本発明はさらに、被験体が、微生物感染に対する処置に反応するか否かを予想するための方法を提供し、その処置は、表１のアミノ酸配列を含むペプチドまたはその類似物、誘導体もしくは変異体を含むペプチドを被験体へ投与することを含む。その方法は、一つまたはそれより多い数のバイオマーカー（例えば、炎症バイオマーカー）について、被験体の診断サンプルをアッセイすることを含み、少なくとも一つのバイオマーカー（例えば、炎症バイオマーカー）の存在は、その被験体がその処置に対して反応することを示す。
【０１０９】
明細書で用いられる場合、「バイオマーカー」または「マーカー」は、その状態（例えば、免疫状態、感染、炎症状態、ＤＰＰＩＶ関連状態、先天免疫状態）に関係することが知られているか、または認識されている任意の適切なバイオマーカーであり、そして遺伝子から得られる任意の分子（例えば、遺伝子の転写物）、遺伝子から得られたセンス（コーディング）プローブ配列もしくはアンチセンス（ノンコーディング）プローブ配列、または遺伝子の部分長もしくは完全長の翻訳産物、またはそれらに対する抗体を含み、それらは、免疫応答、先天免疫応答、炎症および／またはＤＰＰＩＶ関連状態と関連する状態、障害、または疾患をモニターするために用いられうる。
【０１１０】
本発明の方法により、被験体の診断サンプルがインビトロまたはインビボでアッセイされ得る。そのアッセイが、インビトロで実行される場合、被験体由来の診断サンプルは、標準的な手順により取り出され得る。診断サンプルは、組織（任意の筋肉組織、皮膚組織、または軟組織が挙げられる）であってよく、それらは標準的なバイオプシーにより取り出され得る。加えて、診断サンプルは、体液であってよく、血液、唾液、血清、または尿が挙げられる。被験体または患者は、微生物感染もしくは他の免疫学的な障害（例えば、ＤＰＰＩＶ関連状態）を有することが知られていてもよく、微生物感染もしくは他の免疫学的な状態（例えば、先天免疫状態もしくはＤＰＰＩＶ関連状態）が疑われていてもよく、または微生物感染もしくは他の免疫学的な状態（例えば、先天免疫状態もしくはＤＰＰＩＶ関連状態）ではないと信じられていてもよい。
【０１１１】
本発明の方法に従って、被験体の診断サンプルは、一つまたはそれより多い望ましいマーカーの発現についてアッセイされ得る。明細書で用いられる場合、「発現」は、炎症マーカー遺伝子の少なくとも一つのｍＲＮＡ転写物への転写、または少なくとも一つのｍＲＮＡのマーカータンパク質への翻訳を意味する。従って、診断サンプルは、マーカータンパク質、マーカーｃＤＮＡ、またはマーカーｍＲＮＡについてアッセイすることにより、マーカー発現に関してアッセイされ得る。マーカーの適切な形は、明細書で討議した特定の技術に基づき明白である。
【０１１２】
アッセイされるタンパク質は、被験体または患者の診断サンプルから、当該分野で公知の標準的な方法を用いて単離および精製され得る。その方法は、組織からの抽出（例えば、タンパク質を可溶化する洗浄剤を用いる）（必要な場合、カラムでのアフィニティー精製、クロマトグラフィー（例えば、ＦＰＬＣおよびＨＰＬＣ）、免疫沈降（目的の炎症マーカーに対する抗体を用いる）、および沈殿（例えば、イソプロパノールおよびＴｒｉｚｏｌのような試薬を用いる）が後に続く）が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。そのタンパク質の単離と精製には、電気泳動（例えば、ＳＤＳポリアクリルアミドゲルでの）があとに続き得る。診断サンプルは、いずれかの形または全ての形のマーカータンパク質（前駆体、末端タンパク質分解でプロセシングされた形、および翻訳後修飾の結果として得られる他の形が挙げられる）の発現についてアッセイされ得ると考えられる。核酸は、診断サンプルから、当業者に公知の標準的な技術を用いて単離され得る。
【０１１３】
本発明の方法に従って、当該分野から容易に決定されるアッセイおよび検出方法（例えば、免疫学的な技術、ハイブリダイゼーション分析、蛍光イメージング技術、および／または放射線検出）、ならびに明細書で開示された任意のアッセイおよび検出方法（例えば、免疫沈降、ウエスタンブロット分析等）を用いて、被験体の診断サンプルはマーカーの発現についてアッセイされ得、そしてマーカーの発現は診断サンプル中で検出され得る。例えば、被験体の診断サンプルは、炎症マーカーと反応性のある因子を用いて、マーカーの発現についてアッセイされ得る。明細書で用いられる場合、「反応性の」は、その因子が、そのマーカーに親和性をもつ、そのマーカーに結合する、またはそのマーカーを指向することを意味する。さらに、明細書で用いられる場合、「因子」は、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡが挙げられる）、抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、分子、化合物、抗生物質、薬物、およびそれらの任意の組み合わせを包含するものとする。好ましくは、本発明のその因子は、明細書に記述された技術に従って、検出可能なマーカーまたは標識で標識される。本発明の一つの実施形態において、マーカーと反応性のある因子は抗体である。
【０１１４】
本発明のその因子が、望ましいマーカーと反応性のある抗体である場合、被験体から取り出される診断サンプルは、アフィニティーカラムを通すことにより精製され得るが、そのカラムは、そのマーカーに対する抗体を含み、その抗体はリガンドとして固体支持体（例えば、ビーズ、ゲル、またはプレートの形態における不溶性有機ポリマー）に取り付けられている。固体支持体に取り付けられたその抗体は、カラムの形態において用いられ得る。適切な固体支持体の例は、アガロース、セルロース、デキストラン、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、セファロース、および他の不溶性有機ポリマーが挙げられるが、それらに限定されるわけではない。そのマーカーに対する抗体はさらに、望まれるなら、スペーサー分子を介して、固体支持体に取り付けられ得る。その因子およびその抗体の結合を保障するための適切な結合条件（例えば、温度、ｐＨ、および塩濃度）は、当業者により容易に決定され得る。好ましい実施形態において、そのマーカーに対するその抗体は、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ ４Ｂのようなセファロースカラムに取り付けられる。
【０１１５】
加えて、その因子が抗体であるとき、被験体の診断サンプルは、標準的な免疫学的検出技術に沿って、そのマーカーと反応性のある一つまたはそれより多い抗体を利用する結合調査を用い、免疫学的なマーカーの発現についてアッセイされ得る。例えば、アフィニティーカラムから溶出されたそのマーカータンパク質は、ＥＬＩＳＡアッセイ、ウエスタンブロット分析、フローサイトメトリー、または抗原抗体相互作用を用いる任意の他の免疫染色法に供され得る。好ましくは、その診断サンプルは、ウエスタンブロッティングを用いてマーカーの発現についてアッセイされる。
【０１１６】
あるいは、被験体の診断サンプルは、被験体から取り出した診断サンプルより抽出された核酸のハイブリダイゼーション分析を用いて、マーカーの発現についてアッセイされ得る。本発明のこの方法に従って、そのハイブリダイゼーション分析は、ｍＲＮＡのノーザンブロット分析を用いて行われ得る。この方法は、そのマーカーをコードする核酸にハイブリダイズする、一つまたはそれより多い核酸プローブを用いてのＤＮＡのサザンブロット分析を行うことによってもまた行われ得る。その核酸プローブは、当業者に公知の多様な技術により調製され得、この技術としては以下が挙げられるが、それらに限定されるものではない：マーカー核酸の制限酵素消化；およびＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｍｏｄｅｌ ３９２ ＤＮＡ／ＲＮＡ 合成装置のような商業的に入手可能なオリゴヌクレオチド合成装置を用いる、マーカー核酸のヌクレオチド配列の選択された部分に対応する配列をもつオリゴヌクレオチドの自動化された合成。
【０１１７】
本発明において用いられる核酸プローブは、ＤＮＡでもＲＮＡでもよく、そして、長さは約８ヌクレオチドから炎症マーカー核酸の全長まで変化し得る。加えて、本発明の核酸プローブは、一つまたはそれより多い数の検出可能なマーカーまたは標識で標識され得る。核酸プローブの標識は、明細書で記述された方法の任意のものを含め、当該分野で知られた多くの方法のうちの一つを用いて達成され得る。マーカー核酸の異なる領域または重なり合う領域に対応する、二つまたはそれより多い核酸プローブ（またはプライマー）の組み合わせもまた、マーカー発現についての診断サンプルのアッセイ（例えばＰＣＲまたはＲＴ−ＰＣＲを用いる）に用いられ得る。
【０１１８】
本発明の方法におけるマーカー発現の検出には、被験体の診断サンプル中のマーカー発現の程度を測定または定量するアッセイが続き得る。そのようなアッセイは、当業者には周知であり、そして、免疫組織化学／免疫細胞化学、フローサイトメトリー、質量分析、ウエスタンブロット分析、またはマーカータンパク質の量を測定するためのＥＬＩＳＡを含み得る。例えば、免疫組織化学アッセイを用いるには、組織の組織学的（パラフィン包埋）切片が、スライド上に載せられ、そしてその後、マーカーに対する抗体とともにインキュベートされ得る。そのスライドは、それから、（一次抗体に対する）二次抗体、（これは色素または熱量測定系（例えば、蛍光色素、放射活性因子、または高電子走査容量をもつ因子）で標識されている）とともにインキュベートされて、その切片中に存在するそのマーカーが可視化されうる。
【０１１９】
本発明は、以下の実施例において詳述され、それらの実施例は本発明の理解を助けるために示されており、そしてその後に続く請求の範囲において定義される本発明の範囲をいずれにせよ制限するとは解釈されるべきではない。
【実施例】
【０１２０】
（実施例１−ペプチド合成）
表１におけるペプチドを、固相ペプチド合成技術を用いて合成した。
【０１２１】
Ｆｍｏｃで保護された、全ての必要とされたアミノ酸を、１ミリモルの望ましいペプチドに対して３倍のモル過剰量の重さで量りとった。そのアミノ酸を、次に、ジメチルホルムアミド（Ｄｉｍｅｔｈｙｌｆｏｒｍａｉｄｅ）（ＤＭＦ）（７．５ｍｌ）に溶解し、３ｍＭの溶液を作製した。適切な量のリンクアミドＭＢＨＡレジン（Ｒｉｎｋ ａｍｉｄｅ
ＭＢＨＡ ｒｅｓｉｎ）を、そのレジンの置換を考慮した重さで量りとった。そのレジンを、次に、自動合成装置の反応容器中に移し、そして、ジクロロメタン（ＤＣＭ）で１５分間、前浸漬した。
【０１２２】
そのレジンを、ＤＭＦ（３０ｍｌ）中の２５％ピペリジンをそのレジンに加え、そして２０分間混合することにより、脱保護した。そのレジンの脱保護後、その３ｍＭのアミノ酸溶液を４ｍＭの２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート（２−（１Ｈ−ｂｅｎｚｉｔｒｉａｚｏｌｅ−１−ｙｌ）−１，１，３，３−ｔｅｔｒａｍｅｔｈｙｌｕｒｏｎｉｕｍ ｈｅｘａｆｌｕｏｒｏｐｈｏｓｐｈａｔｅ）（ＨＢＴＵ）および８ｍＭのＮ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＰＡ）と混合することにより、最初の連結を生じさせた。その溶液を、そのレジンに加える前に５分間にわたって前活性化させた。そのアミノ酸を、４５分間にわたって連結させた。
【０１２３】
連結後、そのレジンを、ＤＭＦおよびジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）で入念にリンスした。その取り付けられた、Ｆｍｏｃで保護されたアミノ酸を、前述した同じ方法で脱保護し、そして、次のアミノ酸を、同じ連結のスキームＡＡ：ＨＢＴＵ：ＤＩＥＰＡを用いて取り付けた。
【０１２４】
その合成の完了後、そのペプチドを、９７．５％のトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）および２．５％の水を含有する切断用カクテルを使用することで、そのレジンから切り離した。そのレジンを、その切断用カクテル中に１と２分の１時間にわたって懸濁した。その溶液を、次に、ブーフナー漏斗を用いて重力により濾過し、そして、その濾過液を、５０ｍｌの遠心分離用チューブに集めた。そのペプチドを、冷却したジエチルエーテルで沈殿させることにより単離した。遠心分離およびジエチルエーテルのデカンテーション後、その粗精製ペプチドを、ジエチルエーテルでもう一度洗浄した後、吸引乾燥機中で２時間乾燥させた。そのペプチドを、次に、脱イオン水（１０ｍｌ）中に溶解し、−８０℃で凍結させ、そして凍結乾燥した。その乾燥ペプチドは、ＨＰＬＣ精製に用いることができた。
【０１２５】
これらのペプチドの親水性の性質によって、ジエチルエーテルによるペプチドの単離は機能しなかった。それゆえに、クロロホルム抽出を必要とした。そのＴＦＡを蒸発させ、そして、得られたペプチド残基を、１０％酢酸（１５ｍｌ）中に溶解した。不純物およびスカベンジャーを、その酢酸ペプチド溶液から、その溶液をクロロホルム（３０ｍｌ）で二回洗浄することにより、除去した。その水性ペプチド溶液を、次に、−８０℃で凍結させ、そして、凍結乾燥させることで、ＨＰＬＣ精製の準備ができた、粉末にしたペプチドを結果として得た。
【０１２６】
配列番号３３および配列番号３４のペプチドは、それぞれが一つのＮ−メチルアミノ酸を含有した。そのＮ−メチルアミノ酸、ＰｙＢｒｏｐ、およびＮ−ヒドロキシベンゾトリアゾール＊Ｈ２Ｏ（ＨＯＢｔ）、ならびにＤＩＥＰＡ溶液を、そのレジンを含有する、そのＲＶ中で一緒に合わせることにより、この連結を実行した。４５分間連結させた後、そのＮ−メチルアミノ酸を次に、もう一度連結させて、完全な連結を確実にした。Ｎ−メチルアミノ酸に続く連結が、十分に完全ではないことが観察された。それゆえに、この連結を、Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチル−Ｏ−（７−アザベンゾトリアゾール−１−イル）ウロニウムヘキサフルオロホスフェート（ＨＡＴＵ）をＨＢＴＵの代わりに用いて、実行した。これによって、なお、合計で全純度の３０〜４０％になる二つの不純物を典型的に含有する、粗精製ペプチドを生じた。そのペプチドを、改変したＨＰＬＣ条件下で精製し、接近して溶出する不純物から離れた、純粋なペプチドのピークを単離した。
【０１２７】
（実施例２−非抗微生物活性）
細菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ ２５９２３）を、ペプチド（２００μＭ）、ベヒクル（トリス（Ｔｒｉｓ））、または抗生物質（エリスロマイシン；１２０μｇ／ｍｌ）を含有するウエル中に播種した。その細菌を、２時間増殖させた。その後、細菌の生存率を、ＷＳＴ−１比色生存率試験（カタログ番号１６４４８０７；Ｒｏｃｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ）を利用して決定した。ＤＭＥＭおよびＤＭＥＭ＋ＷＳＴ−１を、バックグラウンドの対照として含めた。図１Ａおよび図１Ｂに示したように、配列番号５および配列番号４７のペプチドが、抗生物質の対照と比較して、活性の欠如を明白に示した。
【０１２８】
（実施例３−生体内での防御）
マウスを、腹腔内（ＩＰ）注射によりＳ．ａｕｒｅｕｓ ２５９２３で感染させた。四時間後、配列番号１、４、５、６、４５、および４７のペプチドを、配列番号１に関しては１２ｍｇ／ｋｇおよび２４ｍｇ／ｋｇで（図２Ａおよび図２Ｂ）、配列番号５に関しては９．６ｍｇ／ｋｇで（図２Ｃ）、配列番号４７に関しては１３ｍｇ／ｋｇで（図２Ｄ）、配列番号４に関しては１２ｍｇ／ｋｇで（図２Ｅ）、配列番号６に関しては９ｍｇ／ｋｇで（図２Ｆ）、そして、配列番号４５に関しては１３ｍｇ／ｋｇで（図２Ｇ）、ＩＰ注射により投与した。感染の２４時間後、生存している動物を殺し、そして、腹腔内洗浄液をプレートにまき、ペプチド処置の有無における残存細菌数（１ｍｌ当たりのコロニー形成ユニット数（ＣＦＵ／ｍｌ））を決定した。
【０１２９】
死亡動物は、本研究におけるあらゆる動物において最も高い細菌数が割り当てられた。配列番号１、４、５、６、４５、および４７のペプチドは、図２Ａ〜２Ｇに示したように、対照と比較して、防御をあきらかに示した。
【０１３０】
（実施例４−予防的な生体内での防御）
感染２４時間前に、ペプチドを、１２ｍｇ／ｋｇ（配列番号１、図３Ａ）および１１．５ｍｇ／ｋｇ（配列番号５、図３Ｂ）で、ＩＰ注射により、投与した。マウスを、その後、ＩＰ注射によりＳ．ａｕｒｅｕｓ ２５９２３に感染させた。感染の２４時間後、生存している動物を殺し、そして、腹腔内洗浄液をプレートにまき、ペプチド処置の有無における残存細菌数（１ｍｌ当たりのコロニー形成ユニット数（ＣＦＵ／ｍｌ））を決定した。
【０１３１】
死亡動物は、本研究におけるあらゆる動物において最も高い細菌数が割り当てられた。配列番号１および配列番号５のペプチドが、防御をあきらかに示した（死亡マウス２匹（対照）に対して、死亡マウス０匹（ペプチド処置））。図３Ａおよび図３Ｂを参照のこと。
【０１３２】
以下に述べるのは、実施例１〜４の実験に関して発明者らにより得られた結果である：
発明者らは、表１で示したペプチドのアミノ酸配列を持つか、あるいは本発明の一部としてここに述べたとおりのペプチドが先天免疫を増強し得ることを示した。特に、配列番号１、４、５、６、４５、および４７のペプチドは、生体内のモデル（図２および実施例３；図３および実施例４）において示したように、感染を予防する能力および防御する能力を有していた。しかしながら、配列番号５および配列番号４７のペプチドは、実施例１および図１において示したように、抗微生物活性を欠いていた。それゆえに、配列番号５および／または配列番号４７のペプチドによる先天免疫の調節は、これらのペプチドが感染性疾患の処置のための治療剤として用いられ得ることを示す。
【０１３３】
（実施例５−マウス血液を用いた血漿ＤＰＰＩＶ活性アッセイ）
マウス血液を、心臓穿刺によりＩＣＲマウスより得、そして、ヘパリン処理した採血管中に集めた。数匹のマウスからの血液をプールして、そして、３００μＬの等量に分けた。そのペプチドを、ｐＨ５．５の酢酸緩衝食塩水中に９ｍＭの濃度になるように溶解した。この貯蔵溶液のうち３０μＬを、３００μＬの血液に加え、そして再懸濁により混合した（血液中の濃度は０．８２ｍＭ）。対照として、３０μＬのブランク酢酸緩衝食塩水を、３００μＬの血液に加えた。それぞれのペプチド群を、３回反復実験で調製し、一方、対照は６回反復実験で調製した。そのサンプルを、密閉したマイクロチューブ中で２時間にわたって３７℃でインキュベートした。インキュベーション後、血漿を、４０００ｒｃｆの遠心分離により、そのサンプルから単離した。その血漿を、ＤＰＰＩＶアッセイのため、９６ウエルアッセイプレートに移した。そのアッセイを、ＤＰＰＩＶの基質のｇｌｙ−ｐｒｏ−ｐ−ニトロアニリド（脱イオン水中で１６ｍＭ）５μＬを９５μＬの血漿（血漿中の濃度は０．８ｍＭ）に加えることにより開始し、そして、ＵＶ吸光度（４０５ｎｍ）における増大を、２０分間にわたってモニターした。ｇｌｙ−ｐｒｏ−ｐ−ニトロアニリドの酵素的切断によるｐ−ニトロアニリンの産生の速度を、ＤＰＰＩＶの活性とした（Ｄｕｒｉｎｘ Ｃ ｅｔ ａｌ．，（２００１）「血漿ジペプチジルペプチダーゼＩＶ活性のための参照値および、それらの、他の実験パラメーターとの関係」．Ｃｌｉｎ Ｃｈｅｍ Ｌａｂ Ｍｅｄ．３９（２）：１５５−９）。
【０１３４】
その結果を、表１において見ることができる。ＤＰＰＩＶの活性に対するそのペプチドの影響が観察された。結果を、食塩水の対照（１００％とする）に関して、正規化され、平均化された活性％として示す。１００％より少ないいずれもが、ＤＰＰＩＶの活性における減少を示す。
【０１３５】
本発明の一つの局面において、おおよそ２５％のＤＰＰＩＶ活性の減少、または一つの実施形態において、少なくとも２５％（言い換えると、約７５％まで）のＤＰＰＩＶ活性の減少が、活性であるとみなされた。望まれる活性の水準が、そのペプチドの用途に依存して変化し得るということを、当業者は認める。
【０１３６】
（論考）
ＣＤ２６あるいはアデノシンデアミナーゼ結合タンパク質としても知られている、ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰＩＶ）は、免疫機能を含む多様な生理的過程の主要な調節因子である。ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶは、１１０ｋＤの細胞表面の糖タンパク質であり、成熟胸腺細胞、活性化Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、マクロファージ、および上皮細胞上で主として発現している。ＤＰＰＩＶは、少なくとも二つの機能（シグナル伝達機能および蛋白分解機能）を持つ（Ｍｏｒｉｍｏｔｏ Ｃ，Ｓｃｈｌｏｓｓｍａｎ ＳＦ．Ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｏｆ ＣＤ２６ ｉｎ．−． Ｔｈｅ Ｔ−ｃｅｌｌ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ．
Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖｉｅｗ．１９９８，１６１：５５−７０）。ＤＰＰＩＶの、細胞での役割のうちの１つは、ケモカインのＮ末端からジペプチドを切断することによる、ケモカイン活性の調節を含む。ケモカインのＮＨ２末端の調節は、それらのレセプターへの結合およびその後の反応のためだけではなく、そのプロセシングされたケモカインのレセプター特異性を変えるうえでも、非常に重要である。さらに、可溶性ｒＣＤ２６は、単球の遊走反応を減少させるのに対して、Ｔ細胞の経内皮移動を増強することが実証された［Ｏｒａｖｅｃｚ， Ｔ． ｅｔ． ａｌ．，（１９９７）Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ
ｔｈｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ａｎｄ ｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ＲＡＮＴＥＳ（ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｎ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ， ｎｏｒｍａｌ Ｔ ｃｅｌｌ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ａｎｄ ｓｅｃｒｅｔｅｄ） ｂｙ ｄｉｐｅｐｔｙｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ （ＣＤ２６）−ｍｅｄｉａｔｅｄ ｃｌｅａｖａｇｅ． Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８６：１８６５〜１８７２；Ｉｗａｔａ， Ｓ．， ｅｔ． ａｌ．，（１９９９）ＣＤ２６／ｄｉｐｅｐｔｉｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｒｅｇｕｌａｔｅｓ ｔｈｅ ｃｈｅｍｏｔａｘｉｓ ｏｆ Ｔ ｃｅｌｌｓ ａｎｄ ｍｏｎｏｃｙｔｅｓ ｔｏｗａｒｄ ＲＡＮＴＥＳ： ｐｏｓｓｉｂｌｅ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｆｏｒ
ｔｈｅ ｓｗｉｔｃｈ ｆｒｏｍ ｉｎｎａｔｅ ｔｏ ａｃｑｕｉｒｅｄ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ． Ｉｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１：４１７〜４２６］。これらの結果は、ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶがＴ細胞および単球の走化性反応を差別的に調節し、そして、先天免疫応答から獲得免疫応答への切替えに関係することを、示した。それゆえ、ＤＰＰＩＶの活性の減少は、それから、逆の効果を持ち、先天免疫応答およびマクロファージ遊走反応を促進する。ＤＰＰＩＶ酵素活性の薬理学的な阻害が、ＲＡの実験ラットモデルにおいて、関節炎の進行を減じうることもまた報告されており（Ｔａｎａｋａ Ｓ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉ−ａｒｔｈｒｉｔｉｃ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｔｈｅ ｎｏｖｅｌ ｄｉｐｅｐｔｉｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ＴＭＣ−２Ａ ａｎｄ ＴＳＬ−２２５． Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ １９９８，４０：２１−２６；Ｔａｎａｋａ Ｓ，ｅｔ ａｌ．，：Ｓｕｐｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ａｒｔｈｒｉｔｉｓ ｂｙ ｔｈｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ ｄｉｐｅｐｔｉｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ． Ｉｎｔ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｌ
１９９７，１９：１５−２４）、ＤＰＰＩＶ活性の減少が、ある状況下では炎症を緩和し得ることを示唆している。抗炎症の役割、および、そのケモカイン活性のその調節を合わせて考えると、ＤＰＰＩＶを、これらの活性に関係する新規化合物のスクリーニングのための良好な分子ということになる。
【０１３７】
ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶは、多様な疾患（例えば、ＡＩＤＳおよびＨＩＶという疾患の進行（Ｂｌａｚｑｕｅｚ ｅｔ ａｌ．１９９２；Ｖａｎｈａｍ ｅｔ ａｌ．１９９３；Ｓｃｈｏｌｓ ｅｔ ａｌ．１９９８ Ｏｒａｖｅｃｚ ｅｔ ａｌ．１９９５）、グレーヴズ病（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．１９８９；Ｎｉｓｈｉｋａｗａ ｅｔ ａｌ．１９９５）、および癌（Ｓｔｅｃｃａ ｅｔ ａｌ．１９９７）、ならびに糖尿病（Ｈｉｎｋｅ ｅｔ ａｌ．２０００；Ｍａｒｇｕｅｔ ｅｔ ａｌ．２０００））の病理に関係している。
【０１３８】
さらに、Ｔ細胞活性のインジケーターとしてのＣＤ２６は、関節リウマチ（Ｎａｋａｏ
ｅｔ ａｌ．，１９８９）および自己免疫性甲状腺炎（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．，１９８９）のようないくつかの自己免疫疾患と並行して変動することが示されている。ＣＤ２６は、これらの疾患の活性のレベルとよく相関するマーカーとして記述された。ＣＤ２６は、さらに、慢性進行性多発性硬化症における疾患進行のインジケーターとして研究された（Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｅｓｃｕ ｅｔ ａｌ．，１９９５）。
【０１３９】
本発明のペプチドがＤＰＰＩＶ活性を減じ得ることが示された。それゆえ、それらは、ＤＰＰＩＶに関係した状態またはＤＰＰＩＶに関連した状態のような、特定の免疫状態の処置において用いられ得、そして、一つの局面において、先天免疫、および敗血症に至る炎症のような炎症を調節し得る。
【０１４０】
前述の発明が、明快さおよび理解の目的のために、いくらか詳細に記述されたとはいえ、本開示を読むことにより、付加された特許請求の範囲におけるその発明の真の範囲から、はずれることなく、形式および詳細における多様な変更がされ得ることを、当業者は認めるものである。
【０１４１】
【表１−１】
【０１４２】
【表１−２】
【０１４３】
（表１続き）
表１のノート１：
Ｘ１は、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、またはＮ末端で置換された塩基性官能基をもつグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択される。
【０１４４】
Ｘ２は、配列番号５５のアミノ酸配列を含む、１０アミノ酸までの単離されたペプチドを含め、Ｖ、Ｉ、Ｋ、Ｐ、およびＨからなる群より選択される。
【０１４５】
表１のノート２：
Ｘ１は、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、またはＮ末端で置換された塩基性官能基をもつグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択され、そしてＸ２は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ｋ、Ｐ、Ｇ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｏ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ａｂｕ、Ｎｖａ、Ｎｌｅからなる群より選択され、そしてＸ２は、Ｎ−メチル化され得、そしてＸ３は、Ｉ、Ｖ、Ｐからなる群より選択され、一つの実施形態において、Ｘ３は、Ｎ−メチル化されていない。一つの実施形態において、その単離されたペプチドは、１０アミノ酸までのアミノ酸配列であり得るが、配列番号２でも配列番号１７でもない。
【０１４６】
表１のノート３：
Ｘ１、Ｘ２およびＸ３は、配列番号５６においてのとおりに定義され、そして「ａ」は、Ｓ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、Ｃ、Ｔ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｃ、Ｍ、およびＦからなる群より選択されるかまたは上記配列を含む１０アミノ酸までの単離されたペプチドである。
【０１４７】
表１のノート４：
Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐは、配列番号５６において定義されるとおりであり、そして「ｂ」はＡ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｆ、Ｋ、Ｃ、Ｉ、Ｖ、Ｔ、Ｙ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、およびＭからなる群より選択されるが、一つの実施形態においてＰではない。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５８を含むが配列番号１７は含まない、１０アミノ酸までのペプチドである。
【０１４８】
表１のノート５：
Ｘ１、Ｘ２およびＸ３は、配列番号５６において定義されるとおりであり、そして「ａ１」は、Ｋ、Ｉ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、およびＧからなる群より選択され、そして「ａ２」は、Ｓ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｈ、Ｋ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｓ、およびＩからなる群より選択される。一つの実施形態において、「ａ１」は、アセチル化されていないか、またはａ１がＫであるとき、Ｋはアセチル化されていないか、または配列番号２ではない。一つの実施形態において、その単離されたペプチドは、配列番号５９を含む１０アミノ酸までを含む。
【０１４９】
表１のノート６：
Ｘ１、Ｘ２およびＸ３は、配列番号５６において定義されるとおりであり、そして、「ａ」は、Ｓ、Ｒ、Ｋ、Ｈ、Ｏ、Ｔ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ａ、およびＧからなる群より選択され、そして、「ｂ」はＡ、Ｖ、Ｉ、Ｌ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｓ、Ｔ、およびＦからなる群より選択されるか、または配列番号６０を含む１０アミノ酸までのペプチドである。
【０１５０】
（引用された参考文献）
【０１５１】
【表２】
【０１５２】
【表３】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願）
本出願は、２００５年１０月４日に出願された米国仮特許出願６０／７２２，９６２号；同第６０／７２２，９５８号；および同第６０／７２２，９５９号（全て「Ｎｏｖｅｌ
Ｐｅｐｔｉｄｅｓ Ｆｏｒ Ｔｒｅａｔｉｎｇ Ａｎｄ Ｐｒｅｖｅｎｔｉｎｇ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ Ｂｙ Ｍｏｄｕｌａｔｉｎｇ Ｉｎｎａｔｅ Ｉｍｍｕｎｉｔｙ」と題し、そして、本明細書により、その全体が参考として援用される）に対する優先権を主張する。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、先天免疫を調節することによる感染の処置および予防を含む、免疫関連障害の処置および予防において用いるためのペプチドに関する。一つの局面において、本発明は、先天免疫を調節するための組成物およびその使用に関する。別の局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ活性を減少させるうえで効果がある新規ペプチドおよびその使用を提供する。
【背景技術】
【０００３】
（発明の背景）
ウイルス、細菌、真菌、および寄生体を含めた多様な微生物が、疾患をひきおこし得る。微生物の細胞は、動物および植物の細胞と異なり、それらは、自然界では単独では生存できず、多細胞生物の一部分としてのみ存在する。微生物の細胞は、その微生物およびその宿主の状態に一部分依存して、病原性または非病原性であり得る。例えば、普通は無害な細菌が、免疫無防備状態の宿主において病原体となり得る。宿主細胞への侵入は、細胞内環境において複製する細菌性の病原体の生存にとって重要である。細胞外の部位で複製する生物に関しては、宿主細胞への細菌の侵入のその重要性はよくわかっていない。
【０００４】
薬剤耐性は、感染と戦う進行中の努力において、障害として残っている。例えば、ペニシリンは、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓの処置において、その細菌が耐性となるまでは、有効であった。２０世紀の後半をとおして、新しい抗生物質（例えば、バンコマイシンおよびメチシリン）が、開発された；これらは、成功裡に、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染を治療した。しかしながら、Ｓ．ａｕｒｅｕｓのメチシリン耐性株が、１９７０年代に進化し、そしてそれ以来ずっと世界中の病院を悩ませている。より最近、Ｓ．ａｕｒｅｕｓのバンコマイシン耐性株が表面化した。
【０００５】
抗微生物薬への耐性の、増大する脅威および新しい感染性疾患の出現にともない、新しい治療用化合物の、継続的な必要性が存在する。病原体にではなく、宿主に作用する治療薬が、望ましい。なぜならば、それらは病原体の耐性を助長しないからである。特に、先天免疫系を介して宿主に作用する薬剤は、治療薬の将来有望な供給源を提供する。
【０００６】
微生物に対する宿主の防御は、宿主の体の上皮のバリアおよび先天免疫系で開始され、そして適応免疫応答の誘導に達する。その宿主の先天免疫応答は、微生物の感染を認識し迎え撃つ、ひとそろいの、高度に保存された機構を含む。先天免疫の要素は、低いレベルで連続的に維持されており、そして刺激を受けたとき非常に迅速に活性化される。その先天免疫応答は、微生物病原体に曝された直後に起こる事象で始まる。免疫グロブリンレセプター遺伝子の再配列のような、適応免疫に関連する事象は、その先天性の反応の一部とは考えられない。
【０００７】
先天性の反応が、大抵の感染症の調節において助けになり、そしてまた、炎症反応の一因となることを示す証拠がある。感染によって引き起こされる炎症反応は、疾患の病因の中心となる構成要素であることが知られている。その先天免疫応答におけるＴｏｌｌ様レセプター（ＴＬＲ）の重要性もまた、特性がよくわかっている。ＴＬＲの哺乳動物ファミリーは保存された分子を認識し、その多くは、微生物病原体の表面で見られるか、または微生物病原体によって放出される。宿主の先天性の防御を開始する、および／または先天性の防御に寄与する、特性がよくわかっていない多くの他の機構がある。
【０００８】
その先天免疫系は、上皮のバリア機能ならびにサイトカインおよびケモカインの分泌を含む、ある範囲の防御メカニズムを提供する。現在までのところ、四つのファミリーのケモカインが、保存されたＮ末端のシステインモチーフ（Ｃ、ＣＣ、ＣＸＣ、およびＣＸ３Ｃであり、Ｘは非保存アミノ酸残基である）の数により、類別されている。ＣＸＣケモカインは、ＣＸＣＲ３レセプターを持つ細胞（単球、活性化Ｔ細胞（Ｔｈ１）およびＮＫ細胞が挙げられる）に関して走化性があることが知られている。ヒト気道上皮初代細胞、および１６−ＨＢＥ細胞株は、ＣＸＣＲ３レセプターおよびそのリガンドであるＩＰ−１０、Ｉ−ＴＡＣ、およびＭＩＧを構成的に発現している（例えば、非特許文献１を参照のこと）。さらに、ＣＸＣＲ３リガンドは、走化性応答およびアクチンの再構成を、１６−ＨＢＥ細胞において誘導する（例えば、非特許文献１を参照のこと）。
【０００９】
さらに、ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰＩＶ）は、ＣＤ２６またはアデノシンデアミナーゼ結合タンパク質としても知られており、免疫機能を含めた多様な生理的過程の主要な調節因子である。ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶは、１１０ｋＤの細胞表面の糖タンパク質であり、成熟胸腺細胞、活性化Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、マクロファージ、および上皮細胞上で主として発現している。ＤＰＰＩＶは、少なくとも二つの機能（シグナル伝達機能および蛋白分解機能）を持つ（例えば、非特許文献２を参照のこと）。ＤＰＰＩＶの、細胞での役割のうちの１つとしては、ケモカインのＮ末端からジペプチドを切断することによる、ケモカイン活性の調節が挙げられる。ケモカインのＮＨ２末端の調節は、それらのレセプターへの結合およびその後の反応のためだけではなく、そのプロセシングされたケモカインのレセプター特異性を変えるうえでも、非常に重要である。ＤＰＰＩＶ活性は、多くの、免疫関連状態と関連付けられる。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【００１０】
【非特許文献１】Ｋｅｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｈｅ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ＣＸＣＲ３ ａｎｄ ｉｔｓ ｓｐｌｉｃｅ ｖａｒｉａｎｔ ａｒｅ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｉｎ ｈｕｍａｎ ａｉｒｗａｙ ｅｐｉｔｈｅｌｉａｌ ｃｅｌｌｓ， Ａｍ． Ｊ． Ｐｈｙｓｉｏｌ． Ｌｕｎｇ Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ． Ｐｈｙｓｉｏｌ．，２８７：Ｌ５８４，２００４
【非特許文献２】Ｍｏｒｉｍｏｔｏ Ｃ，Ｓｃｈｌｏｓｓｍａｎ ＳＦ．Ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｏｆ ＣＤ２６ ｉｎ ｔｈｅ Ｔ−ｃｅｌｌ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ． Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖｉｅｗ．１９９８，１６１：５５−７０．
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１１】
（発明の要旨）
本発明者たちは、表１で列挙され記述されたペプチドのうちの一つのアミノ酸配列を持つペプチド、またはそれの類似物、誘導体、または変異体が、宿主の先天免疫を増強し得ることを、発見した。一つの局面において、本発明のその免疫調節性ペプチドが、抗微生物活性を欠くが、一方で、感染した宿主の生存を改善する能力を示すことが見いだされた。別の局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ活性を調節するペプチドを提供する。一つの局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ活性を減少させるペプチドを提供する。さらに別の局面において、本発明は、免疫学的障害（例えば、ＤＰＰＩＶ活性および／または先天免疫と関連したもの）の診断、処置または予防において用いられ得るペプチドを提供する。
【００１２】
それゆえに、一つの局面において、本発明は、表１のどれか一つのアミノ酸配列またはそのアミノ酸配列の類似物、誘導体、もしくは変異体を含む単離されたペプチドを提供するか、またはそれらの明白な化学的な同等物を提供するか、または上記ペプチドを含むペプチドを提供する。一つの実施形態において、そのペプチドは、上記ペプチドを含めて１０アミノ酸以下である。例として、その単離されたペプチドは、改変されたＣ末端（例えば、アミド化されたＣ末端）および／または改変されたＮ末端を持ち得る。本発明のその単離されたペプチドは、Ｄアミノ酸の少なくとも一つの置換により改変された表１のそのアミノ酸配列を、さらに含み得る。その単離されたペプチドは、例として、改変された骨格をさらに含み得、それはそのＮ末端がアミドからＮ−メチルに改変されている。一つの局面において、親ペプチドの免疫学的な活性を保持する、それらの改変されたペプチド、および上記活性を保持する、それらのペプチドの明白な化学的な同等物は、本発明の範囲に含まれる。
【００１３】
別の局面において、本発明はさらに、表１のアミノ酸配列を含む単離されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含む単離されたペプチドと反応性のある因子を提供する。一つの実施形態において、その因子は、天然に存在しない抗体（例えば、ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体）である。一つの実施形態において、その抗体は、ＭＡＰＳ抗原を用いて作製され、そのＭＡＰＳ抗原は本発明のペプチドにそのペプチドのＣ末端に挿入された二つのグリシン残基を介して取り付けられている。その構築物は、そして、動物（例えば、ウサギ）に投与され得、そしてその抗体は当該分野で周知の手順により採取される。一つの局面において、そのような因子は、標識され得るか、または本発明のペプチドを標識するために用いられ得る。別の局面において、そのような因子は、診断方法およびスクリーニング方法において、ペプチドの活性を調整し得る因子をモニターするか、またはそのペプチドの量を定量するために使用され得る。
【００１４】
さらに別の局面において、本発明は、単離された核酸分子を提供し、その核酸分子は、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含む単離されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含む単離されたペプチドをコードする。そしてまた提供されるものは、組み換え核酸構築物であり、この組み換え核酸構築物は、発現ベクターに作動可能に連結された核酸分子を含む。
【００１５】
さらなる局面において、本発明は、少なくとも一つの宿主細胞を提供し、その細胞は、本発明の組み換え核酸構築物を含有する。そしてまた提供されるものは、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含むペプチドを生産するための方法であり、この方法は、（ａ）そのペプチドの発現を許容する条件下で、少なくとも一つの宿主細胞を培養すること；そして（ｂ）そのペプチドを、少なくとも一つの宿主細胞またはその培養培地から取り出すことによる。
【００１６】
さらに別の局面において、本発明は、薬学的組成物を提供し、その組成物は、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含む単離されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体（薬学的に受け入れられる塩、付加塩、または上記のいずれかのエステルもしくは多形体を包含する）を持つかもしくは含む単離されたペプチドを、薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤、または賦形剤との組み合わせで、含む。
【００１７】
別の局面において、本発明は、被験体における感染（例えば、微生物感染）を処置および／または予防するための方法を提供し、その方法は表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含むペプチド、またはそれらの明白な化学的な同等物を被験体に投与することによる。例として、その被験体は、感染していてもよく、または感染のリスクを持っていてもよい。一つの実施形態において、そのペプチドは、その被験体において先天免疫を調節し、それにより、被験体における感染を処置および／または予防する。本発明は、さらに、本発明のペプチドで処置し得る微生物感染を同定するための方法を提供する。別の局面において、本発明は、ＤＰＰＩＶ関連状態またはＤＰＰＩＶ関連障害を、処置または予防するための方法を提供する。
【００１８】
本発明の方法により処置および／または予防され得る典型的な感染は、細菌（例えば、グラム陽性細菌またはグラム陰性細菌）による感染、真菌による感染、寄生体による感染、およびウイルスによる感染を包含する。本発明の一つの実施形態において、その感染は、細菌感染（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．、またはバンコマイシン耐性腸球菌による感染）である。別の実施形態において、その感染は真菌感染（例えば、糸状菌、酵母、または高等真菌による感染）である。さらに別の実施形態において、その感染は寄生体感染（例えば、Ｇｉａｒｄｉａ ｄｕｏｄｅｎａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ ｃａｙｅｔａｎｅｎｓｉｓ、およびＴｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉを包含する、単細胞寄生体または多細胞寄生体による感染）である。さらに別の実施形態において、その感染は、ウイルス感染（例えば、ＡＩＤＳ、鳥インフルエンザ、水痘、単純疱疹、感冒、胃腸炎、伝染性単核球症、インフルエンザ、麻疹、ムンプス、咽頭炎、肺炎、風疹、ＳＡＲＳ、および下気道感染または上気道感染に関係するウイルス（例えば、ＲＳウイルス）による感染）である。
【００１９】
本発明の方法に従って、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含むペプチドが、被験体に直接的に（すなわち、そのペプチドそのものを投与することにより）、または間接的に（例えば、被験体においてそのペプチドの発現を許容する方法で、そのペプチドをコードする核酸配列を被験体に投与することにより）、投与され得る。本発明のそのペプチド（またそれをコードする核酸）は、被験体に、経口的に、非経口的に（例えば、皮内に、筋内に、腹腔内に、静脈内に、または皮下に）、経皮的に、鼻腔内に、肺への投与により（例えば、気管内投与により）、および／または浸透圧ポンプにより投与され得る。
【００２０】
さらに別の局面において、本発明は、被験体の診断サンプルのＤＰＰＩＶ活性を測定することにより、被験体が、表１のアミノ酸配列を含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを用いる処置に反応するか予測するための方法を提供し、ここで、ＤＰＰＩＶ活性の減少のような調節は、その被験体がそのペプチドによる処置に反応することを示す。一つの局面において、被験体は、ＤＰＰＩＶ関連状態またはＤＰＰＩＶ関連障害を持っているか、または持つ疑がいがある。
【００２１】
本発明のさらなる局面および利点は、以下に続くその説明を考慮すれば明らかである。詳細な説明およびその特定の例は、しかしながら、本発明の好ましい実施形態を示しているとはいえ、例示のためにのみ与えられることが理解されるべきである。なぜならば、本発明の意図および範囲における多様な変化および改変は、この詳細な説明から当業者には明白となるからである。
例えば、本願発明は以下の項目を提供する。
（項目１）
表１のアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体もしくは変異体を含む、単離されたペプチド。
（項目２）
項目１に記載の単離されたペプチドであって、改変されたＣ末端および／または改変されたＮ末端を持つ、ペプチド。
（項目３）
項目２に記載の単離されたペプチドであって、改変されたＣ末端を持つ、ペプチド。
（項目４）
項目３に記載の単離されたペプチドであって、アミド化されたＣ末端を持つ、ペプチド。
（項目５）
項目１に記載の単離されたペプチドであって、Ｄアミノ酸の少なくとも一つの置換により改変された表１のアミノ酸配列を含む、ペプチド。
（項目６）
項目１に記載のペプチドと反応性のある、因子。
（項目７）
項目６に記載の因子であって、抗体である、因子。
（項目８）
項目７に記載の因子であって、モノクローナル抗体である、因子。
（項目９）
項目１に記載のペプチドをコードする、単離された核酸分子。
（項目１０）
発現ベクターに作動可能に連結された項目９に記載の核酸分子を含む、組み換え核酸構築物。
（項目１１）
項目１０に記載の組み換え核酸構築物を含む、少なくとも一つの宿主細胞。
（項目１２）
表１に列挙されたアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを生産するための方法であって、該方法は、以下の工程：
（ａ）該ペプチドの発現を許容する条件下で項目１１に記載の少なくとも一つの細胞を培養する工程；および
（ｂ）該少なくとも一つの宿主細胞またはその培養培地から該ペプチドを回収する工程を包含する、方法。
（項目１３）
項目１に記載のペプチド、および薬学的に受け入れられる、キャリア、希釈剤、または賦形剤を含む、薬学的組成物。
（項目１４）
被験体における感染を処置および／または予防するための方法であって、表１に列挙されたアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを、該被験体に投与する工程を包含する、方法。
（項目１５）
項目１４に記載の方法であって、前記ペプチドが配列番号１、３〜１６、１８〜６０のアミノ酸配列を持つ、方法。
（項目１６）
項目１４に記載の方法であって、前記被験体における先天免疫を前記ペプチドが調節し、その結果、該被験体において、前記感染が処置および／または予防される、方法。
（項目１７）
項目１４に記載の方法であって、前記感染は微生物感染である、方法。
（項目１８）
項目１７に記載の方法であって、前記感染は、細菌による感染、真菌による感染、寄生体による感染、およびウイルスによる感染からなる群より選択される、方法。
（項目１９）
項目１８に記載の方法であって、前記細菌は、グラム陽性細菌またはグラム陰性細菌である、方法。
（項目２０）
項目１９に記載の方法であって、前記細菌は、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ
ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．、またはバンコマイシン耐性腸球菌からなる群より選択される、方法。
（項目２１）
項目１８に記載の方法であって、前記真菌は、糸状菌、酵母、または高等真菌からなる群より選択される、方法。
（項目２２）
項目１８に記載の方法であって、前記寄生体は、単細胞寄生体または多細胞寄生体である、方法。
（項目２３）
項目２２に記載の方法であって、前記寄生体は、Ｇｉａｒｄｉａ ｄｕｏｄｅｎａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ ｃａｙｅｔａｎｅｎｓｉｓ、およびＴｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉからなる群より選択される、方法。
（項目２４）
項目１８に記載の方法であって、前記ウイルスは、ＡＩＤＳ、鳥インフルエンザ、水痘、単純疱疹、感冒、胃腸炎、伝染性単核球症、インフルエンザ、下気道感染、麻疹、ムンプス、咽頭炎、肺炎、風疹、ＳＡＲＳ、および上気道感染に関係するウイルスからなる群より選択される状態に関連している、方法。
（項目２５）
項目２４に記載の方法であって、前記ウイルスは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）である、方法。
（項目２６）
項目１４に記載の方法であって、前記被験体は、感染しているか、または感染のリスクを持っている、方法。
（項目２７）
項目２６に記載の方法であって、前記ペプチドは、経口的に、非経口的に、経皮的に、鼻腔内に、肺への投与により、または浸透圧ポンプにより投与される、方法。
（項目２８）
被験体が、微生物感染または免疫関連障害のための処置に反応するか否かを予想するための方法であって、該処置は、表１のアミノ酸配列またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドの該被験体への投与を含み、該方法は、ＤＰＰＩＶ基質の存在下で、ＤＰＰＩＶが該基質と反応することを許容する条件下で、本発明のペプチドを該被験体の診断サンプルに投与することにより該被験体の診断サンプルをＤＰＰＩＶ活性に関してアッセイする工程を包含し、ここで、該ペプチドなしでの対照と比較してのＤＰＰＩＶ活性の減少は、該被験体が該処置に対して反応性であることを示す、方法。
（項目２９）
配列番号１〜６０からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたペプチド。
（項目３０）
項目２９に記載の単離されたペプチドであって、前記アミノ酸配列が、配列番号１、３〜１６、１８〜６０からなる群より選択される、単離されたペプチド。
（項目３１）
項目３０に記載の単離されたペプチドであって、前記アミノ酸配列が、配列番号１、３〜１６、１８〜５４からなる群より選択される、単離されたペプチド。
（項目３２）
項目２９または項目３０のいずれか一項に記載の単離されたペプチドであって、免疫学的活性を持つ、単離されたペプチド。
（項目３３）
項目３２に記載の単離されたペプチドであって、１０までのアミノ酸からなる、単離されたペプチド。
（項目３４）
ＤＰＰＩＶ関連状態の処置における、項目３２または項目３３のいずれか一項に記載の単離されたペプチドの使用。
（項目３５）
感染の処置または先天免疫関連状態の処置のための、項目３２または項目３３のいずれか一項に記載のペプチドの使用。
【図面の簡単な説明】
【００２２】
本発明が、ここで図面に関して記述される。
【図１Ａ】図１Ａは、実施例２において記述された実験の結果を描く。生存率％＝ベヒクル対照（トリス）に対する細菌の増殖の量であり、対照の細菌生存率を１００％として、配列番号５のペプチドとともに示す；Ｅｒｙｔｈｒ．＝エリスロマイシン。
【図１Ｂ】図１Ｂは、実施例２において記述された実験の結果を描く。生存率％＝ベヒクル対照（トリス）に対する細菌の増殖の量であり、対照の細菌生存率を１００％として、配列番号４７のペプチドとともに示す；Ｅｒｙｔｈｒ．＝エリスロマイシン。
【図２Ａ】図２Ａは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号１＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｂ】図２Ｂは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号１＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｃ】図２Ｃは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号５＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｄ】図２Ｄは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号４７＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｅ】図２Ｅは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号４＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｆ】図２Ｆは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号６＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図２Ｇ】図２Ｇは、実施例３において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号４５＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図３Ａ】図３Ａは、実施例４において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に、１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号１＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【図３Ｂ】図３Ｂは、実施例４において記述された実験の結果を描く。そのグラフは、Ｙ軸上に、１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ／ｍｌ）を、そしてＸ軸上に処置群（対照＝ペプチド無し；配列番号５＝そのアミノ酸配列を持つペプチドで処置）を示す。個々のマウスの細菌数を示す。
【発明を実施するための形態】
【００２３】
（発明の詳細な説明）
（定義）
本明細書で用いられる場合、「ＤＰＰＩＶ関連障害」または「ＤＰＰＩＶ関連状態」または「ＤＰＰＩＶに関連した状態」とは、ＤＰＰＩＶ活性と相互に関連付けられている任意の医学的な状態を意味しており、そして上記活性の調節は上記状態を処置および／または予防または診断するために用いられ得る。そのような状態の例としては、ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、自己免疫状態（例えば、関節リウマチ）、多発性硬化症、癌（例えば、大腸癌および肺癌）、糖尿病、およびグレーヴズ病が挙げられるが、それらに限定されない。
【００２４】
「免疫関連障害」は、免疫系の活性化または阻害のどちらかによって、被験体の免疫系と関連した状態、あるいは、被験体における免疫応答（例えば、先天免疫応答）の特定の構成要素を標的とすることによって、処置、予防または診断され得る状態である。
【００２５】
本明細書で用いられる場合、「免疫学的に活性」は、先天免疫活性（例えば、被験体において、先天免疫応答またはその構成要素を調節する能力）またはＤＰＰＩＶ活性を調節する能力を指す。
【００２６】
本明細書で用いられる場合、「調節する」または「調節」（例えば、ＤＰＰＩＶ活性の調節または特定の反応の調節のような）は、特定の条件下での対照または正常もしくは基準線のレベルの活性もしくは反応に対する、活性もしくは反応の増大もしくは減少を包含する。それはまた、そのペプチドの活性のレベルを通常は増大もしくは減少させる条件下での活性もしくは反応のレベルの維持を包含しうる。
【００２７】
「薬学的に受け入れられる塩」は、製薬産業で一般的に用いられる非毒性のアルカリ金属塩、アルカリ土類金属塩、およびアンモニウム塩を指しており、ナトリウム、カリウム、リチウム、カルシウム、マグネシウム、バリウム、アンモニウムおよびプロタミン亜鉛の塩を包含し、それらは、当該分野で周知の方法により調製される。その用語はまた、本発明の化合物を適切な有機酸または無機酸と反応させることにより一般的に調製される、非毒性の酸付加塩を包含する。代表的な塩としては、塩酸塩、臭化水素酸塩、硫酸塩、重硫酸塩、酢酸塩、シュウ酸塩、吉草酸塩、オレイン酸塩、ラウリン酸塩、ホウ酸塩、安息香酸塩、乳酸塩、リン酸塩、トシラート、クエン酸塩、マレイン酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、ナプシラート（ｎａｐｓｙｌａｔｅ）、トリフルオロ酢酸塩などが挙げられる。
【００２８】
「薬学的に受け入れられる酸付加塩」は、遊離塩基の生物学的な効果および特性を保持し、かつ生物学的にも他の点でも望ましくないわけではない塩を指しており、それらは、無機酸（例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸など）ならびに有機酸（例えば、トリフルオロ酢酸、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、リンゴ酸、マロン酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、桂皮酸、マンデル酸、メンタンスルホン酸（ｍｅｎｔｈａｎｅｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ）、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸など）より形成される。プロドラッグとしての薬学的に受け入れられる酸付加塩の詳細に関しては、Ｂｕｎｄｇａａｒｄ， Ｈ．，ｅｄ．，（１９８５）Ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｐｒｏｄｒｕｇｓ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ， Ａｍｓｔｅｒｄａｍを参照のこと。
【００２９】
「薬学的に受け入れられるエステル」は、エステル結合が加水分解されたときに、カルボン酸またはアルコールの生物学的な効果および特性を保持し、かつ生物学的にも他の点でも望ましくないわけではないエステルを指す。プロドラッグとしての薬学的に受け入れられるエステルの詳細に関しては、上記のＢｕｎｄｇａａｒｄ，Ｈ．を参照のこと。これらのエステルは、対応するカルボン酸およびアルコールから典型的には形成される。一般的に、エステル形成は、従来の合成技術を介して達成され得る（例えば、Ｍａｒｃｈ， Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， ３ｒｄ Ｅｄ．， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８５）ｐ．１１５７、およびその中で援用された参考文献、ならびにＭａｒｋ ｅｔ ａｌ．， Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆
Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８０）を参照のこと）。そのエステルのアルコール構成要素は、（ｉ）一つまたはそれより多くのの二重結合を持っていても持っていなくてもよく、そして分岐した炭素鎖を持っていても持っていなくてもよい、Ｃ．２〜Ｃ．１２脂肪族アルコール、または（ｉｉ）Ｃ．７〜Ｃ．１２芳香族またはヘテロ芳香族アルコールを、一般に含む。本発明は、ここで記述されるエステルであると同時に、薬学的に受け入れられるそれらの酸付加塩でもある組成物の使用もまた企図する。
【００３０】
「薬学的に受け入れられるアミド」は、アミド結合が加水分解されたときにカルボン酸またはアミンの生物学的な効果および特性を保持し、かつ生物学的にも他の点でも望ましくないわけではないアミドを指す。プロドラッグとして薬学的に受け入れられるアミドの詳細については、上記のＢｕｎｄｇａａｒｄ，Ｈ．，ｅｄ．を参照のこと。これらのアミドは、対応するカルボン酸およびアミンから、典型的に形成される。一般的に、アミド形成は、従来の合成技術を用いて達成されうる（例えば、Ｍａｒｃｈ， Ａｄｖａｎｃｅｄ
Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， ３ｒｄ Ｅｄ．， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８５）ｐ．１１５２およびＭａｒｋ ｅｔ ａｌ．， Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，
Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８０））。本発明はまた、ここに記述したアミドであると同時に、薬学的に受け入れられるその酸付加塩でもある組成物の使用を企図する。
【００３１】
「薬学的または治療上で受け入れられるキャリア」は、活性な成分の生物学的な活性の効果に干渉せず、かつ宿主にも患者にも毒性ではないキャリア媒体を指す。
【００３２】
「立体異性体」は、別のものと同じ分子量、化学的組成および構造を持つが、原子が異なってグループ分けされている化学的化合物を指す。すなわち、特定の同一の化学的部分は、空間において異なる配向にあり、それゆえ、純粋な場合、偏光面を回転させる能力がある。しかしながら、いくつかの純粋な立体異性体は、非常にわずかであるゆえに現在の計測装置では検出できない光学回転を持ちうる。本発明の化合物は、一つまたはそれより多くの不斉炭素原子を持ってよく、そしてそれゆえ、多様な立体異性体を包含しうる。全ての免疫的に活性な立体異性体が、本発明の範囲に含まれる。
【００３３】
本発明の組成物に適用される場合、「治療上または薬学的に効果的な量」は、望ましい生物学的結果を誘導するのに十分な組成物の量を指す。その結果は、徴候、症状、もしくは疾患の原因の軽減、または生物学的システムにおけるほかの任意の望ましい変化であり得る。例えば、本発明では、その結果は、先天免疫応答の増強、ＤＰＰＩＶ活性の減少、および／または感染もしくは組織の傷害に対する炎症反応の調節（例えば、阻害または減少または非刺激）を典型的には包含する。
【００３４】
ペプチドにおけるアミノ酸残基は、以下のように略記される：フェニルアラニンはＰｈｅまたはＦであり；ロイシンはＬｅｕまたはＬであり；イソロイシンはＩｌｅまたはＩであり；メチオニンはＭｅｔまたはＭであり；バリンはＶａｌまたはＶであり；セリンはＳｅｒまたはＳであり；プロリンはＰｒｏまたはＰであり；スレオニンはＴｈｒまたはＴであり；アラニンはＡｌａまたはＡであり；チロシンはＴｙｒまたはＹであり；ヒスチジンはＨｉｓまたはＨであり；グルタミンはＧｌｎまたはＱであり；アスパラギンはＡｓｎまたはＮであり；リジンはＬｙｓまたはＫであり；アスパラギン酸はＡｓｐまたはＤであり；グルタミン酸はＧｌｕまたはＥであり；システインはＣｙｓまたはＣであり；トリプトファンはＴｒｐまたはＷであり；アルギニンはＡｒｇまたはＲであり；そしてグリシンはＧｌｙまたはＧである。加えて、略語Ｎａｌは１−ナフチルアラニンを示すのに用い；オルニチンはＯｒｎまたはＯであり、Ｃｉｔはシトルリンであり、Ｈｃｉはメチレン基をもう一つ持つシトルリンであり、そしてＶｘまたはバリンｘ、ここで、「ｘ」は、アミノ酸の骨格における変化を指し、アミノ酸結合はもはやアミド結合ではないが、しかしメチル化されたアミンであり、このことは「ｘ」の表示をもつ他のアミノ酸に同様に適用される。また、２，４−ジアミノ酪酸はＤａｂであり；２，３−ジアミノプロピオン酸はＤｐｒまたはＤａｐａであり；Ｎ−（４−アミノブチル）−グリシンはＮｌｙｓであり；ｈＳｅｒはホモセリンであり；Ｈｙｐはヒドロキシプロリンであり；Ｖａｌ（ｂｅｔａＯＨ）はヒドロキシバリンであり；Ｄ−Ｐｒｏは３，４−デヒドロプロリンであり；Ｐｙｒはピログルタミン（環中にＣ＝Ｏをもつプロリン）；その環にフッ素置換をもつプロリン；１，３−チアゾリジン−４−カルボン酸（環中にＳをもつプロリン）であり；Ｔｈｉはベータ−（２チエニル）−アラニンであり；Ａｂｕは２−アミノ酪酸であり；Ｎｖａはノルバリンであり；Ｎｌｅはノルロイシンであり；Ｈｏｌはホモロイシンであり；そしてＡｉｂはアルファ−アミノイソ酪酸である。
【００３５】
天然に存在するアミノ酸のみからなるペプチドに加えて、ペプチド模倣薬またはペプチド類似物もまた提供される。ペプチド類似物は、鋳型ペプチドの特性に類似の特性を持った非ペプチド薬として、製薬産業において、一般的に用いられる。これらのタイプの非ペプチド化合物は、「ペプチド模倣物（ｐｅｐｔｉｄｅ ｍｉｍｅｔｉｃｓ）」または「ペプチド模倣薬」（Ｆａｕｃｈｅｒｅ，Ｊ．，Ａｄｖ． Ｄｒｕｇ Ｒｅｓ．１５：２９（１９８６）；Ｖｅｂｅｒ ａｎｄ Ｆｒｅｉｄｉｎｇｅｒ， ＴＩＮＳ ｐ．３９２（１９８５）；およびＥｖａｎｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ．３０：１２２９（１９８７）、これらは本明細書により参考として援用される）と呼ばれる。治療上で役に立つペプチドに構造的に類似しているペプチド模倣物が、等しいかもしくは増強された、治療上もしくは予防上の効果を生じるために用いられ得る。一般的に、ペプチド模倣薬は、模範ペプチド（すなわち、生物学的または薬理学的活性を持つペプチド（例えば、天然に存在するレセプター結合ペプチド））に構造的に類似するが、しかし、以下からなる群より選択された結合によって必要に応じて置き換えられる一つまたはそれより多くのペプチド結合をもつ：−−ＣＨ２ＮＨ−−、−−ＣＨ２．Ｓ−−、−−ＣＨ２＝ＣＨ２−−、−−ＣＨ＝ＣＨ−−（シスおよびトランス）、−−ＣＯＣＨ２−−、−−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２−−および−−ＣＨ２ＳＯ−−。その置き換えは当該分野で既知の方法、および以下の参考文献にさらに記述された方法により行われる：Ｓｐａｔｏｌａ， Ａ． Ｆ．，ｉｎ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ｏｆ Ａｍｉｎｏ Ａｃｉｄｓ， Ｐｅｐｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ， Ｂ． Ｗｅｉｎｓｔｅｉｎ， ｅｄｓ．， Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ｐ．２６７（１９８３）；Ｓｐａｔｏｌａ， Ａ． Ｆ．， Ｖｅｇａ Ｄａｔａ（Ｍａｒｃｈ １９８３）， Ｖｏｌ．１， Ｉｓｓｕｅ ３， ＰＥＰＴＩＤＥ ＢＡＣＫＢＯＮＥ ＭＯＤＩＦＩＣＡＴＩＯＮＳ（ｇｅｎｅｒａｌ ｒｅｖｉｅｗ）；Ｍｏｒｌｅｙ， Ｔｒｅｎｄｓ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ（１９８０） ｐｐ．４６３ ４６８（ｇｅｎｅｒａｌ ｒｅｖｉｅｗ）；Ｈｕｄｓｏｎ， Ｄ． ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｔ Ｊ Ｐｅｐｔ Ｐｒｏｔ
Ｒｅｓ １４：１７７ １８５（１９７９）：（−−ＣＨ２ＮＨ−−、ＣＨ２ＣＨ２−−）；Ｓｐａｔｏｌａ ｅｔ ａｌ．， Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ３８：１２４３ １２４９（１９８６）：（−−ＣＨ２−−Ｓ）；Ｈａｎｎ Ｊ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ． Ｐｅｒｋｉｎ Ｔｒａｎｓ．Ｉ３０７ ３１４（１９８２）：（−−ＣＨ−−ＣＨ、シスおよびトランス）；Ａｌｍｑｕｉｓｔ ｅｔ ａｌ．， Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ２３：１３９２ １３９８（１９８０）：（−−ＣＯＣＨ２−−）；Ｊｅｎｎｉｎｇｓ−Ｗｈｉｔｅ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ２３：２５３３（１９８２）：（−−ＣＯＣＨ２−−）：Ｓｚｅｌｋｅ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ．ＥＰ４５６６５ ＣＡ：９７：３９４０５（１９８２）（−−ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２．）；Ｈｏｌｌａｄａｙ ｅｔ ａｌ．， Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ ２４：４４０１ ４４０４（１９８３）：（−−Ｃ（ＯＨ）ＣＨ２−−）；およびＨｒｕｂｙ
Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ３１：１８９ １９９（１９８２）：（−−ＣＨ２−−Ｓ−−）であり；そのそれぞれが参考として援用される。一つの局面において、非ペプチド結合は、−−ＣＨ２ＮＨ−−である。そのようなペプチド擬似物は、ポリペプチドの実施形態を超える顕著な利点（例えば、より経済的な生産、より高い化学的安定性、増強された薬理学的特性（半減期、吸収、効力、効能、その他）、改変された特異性（例えば、広いスペクトルの生物学的活性）、低減された抗原性などが挙げられる）を持ち得る。ペプチド模倣薬の標識は、定量的な構造活性データおよび／または分子モデリングにより予想されるペプチド模倣薬上の非干渉位置への、直接あるいはスペーサー（例えば、アミド基）を介した、一つまたはそれより多くの標識の共有結合による付加を通常は含む。そのような非干渉位置は一般的に、ペプチド模倣薬が結合して治療上の効果を生じる高分子（例えば、免疫グロブリンスーパーファミリー分子）と直接の接触を形成しない位置である。ペプチド模倣薬の誘導体化（例えば、標識）は、そのペプチド模倣薬の望ましい生物学的な活性または薬理学的な活性を、実質上妨げるべきではない。一般的に、レセプター結合タンパクのペプチド模倣薬は、そのレセプターに高い親和性で結合し、かつ検出可能な生物学的活性をもつ（すなわち、レセプターにより媒介される一つまたはそれより多くの表現型の変化に対して、アゴニストまたはアンタゴニストとして作用する）。
【００３６】
コンセンサス配列の一つまたはそれより多くのアミノ酸の、同じ型のＤ−アミノ酸（例えば、Ｌ−リジンの代わりのＤ−リジン）による系統的な置換が、より安定なペプチドを生じるために用いられうる。そのペプチドの免疫学的な活性が保持されるＤ−アミノ酸置換が望まれることは理解される。
【００３７】
（説明）
ここに記述するように、本発明者達は、表１に示されたアミノ酸配列を持ち、かつ／もしくは含む新規ペプチド、または表１に開示されたアミノ酸配列の類似物、誘導体、もしくは変異体を持ち、かつ／もしくは含む新規ペプチドを同定した。本発明者達はまた、表１のアミノ酸配列のうちの一つおよびアミド化されたＣ末端を持つかもしくは含むペプチドが、先天免疫の増強において、治療上の有用性を持つことを明らかにした。特に、本発明者達は、表１のアミノ酸配列を含むペプチドが、Ｓ．ａｕｒｅｕｓに対する抗微生物効力を欠くが、Ｓ．ａｕｒｅｕｓを感染させたマウスにおいて生体内での防御をなお提供することを示した。そのペプチドは、感染に対する宿主の反応を増強し、結果として、細菌除去および宿主の生存を改善した。したがって、記述されたその新規ペプチドは、感染症の処置のための治療剤として使用されうる。別の実施形態において、本発明のペプチドが、ＤＰＰＩＶ活性を減少させることが示されており、ＤＰＰＩＶ活性は多くの免疫関連障害（例えば、ＡＩＤＳの進行およびＨＩＶ病の進行（Ｂｌａｚｑｕｅｚ ｅｔ ａｌ．１９９２；Ｖａｎｈａｍ ｅｔ ａｌ．１９９３；Ｓｃｈｏｌｓ ｅｔ ａｌ．１９９８ Ｏｒａｖｅｃｚ ｅｔ ａｌ．１９９５）、グレーヴズ病（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．１９８９；Ｎｉｓｈｉｋａｗａ ｅｔ ａｌ．１９９５）、ならびに癌（Ｓｔｅｃｃａ ｅｔ ａｌ．１９９７）（例えば、肺癌および大腸癌）、ならびに糖尿病（Ｈｉｎｋｅ ｅｔ ａｌ．２０００；Ｍａｒｇｕｅｔ ｅｔ ａｌ．２０００）に関与することが示されている。さらに、Ｔ細胞活性化のインジケーターとしてＤＰＰＩＶは、関節リウマチ（Ｎａｋａｏ ｅｔ ａｌ．，１９８９）および自己免疫性甲状腺炎（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ
ａｌ．，１９８９）のようないくつかの自己免疫疾患と並行して変動することが示されている。ＤＰＰＩＶは、これらの疾患の活性のレベルとよく相関するマーカーとして記述されている。さらに、ＤＰＰＩＶは慢性進行性多発性硬化症における疾患進行のインジケーターとして研究されている（Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｅｓｃｕ ｅｔ ａｌ．，１９９５）。本発明のペプチドは、そのような状態の処置において使用され得る。
【００３８】
（本発明のペプチド）
したがって、本発明は、表１のアミノ酸配列を持つかもしくは含む単離されたペプチド、または免疫学的に活性である、その類似物、誘導体、もしくは変異体を持つかもしくは含む単離されたペプチドを提供する。また提供されるものは、本発明のペプチド、そのペプチドの類似物、誘導体、および変異体であるペプチドの薬学的に受け入れられる塩、酸付加塩、およびエステルであり、本明細書に記述されたもの（例えば、本明細書に記述された、保存性の置換、ならびにＮ末端およびＣ末端の改変、ならびに骨格の改変である）を包含する。本明細書で用いられる場合、本発明の「単離された」ペプチドは、天然に存在する対応物を持たないか、またはそれに天然に付随する成分から分離もしくは精製されたペプチドである。本発明の単離されたペプチドは、例えば、そのペプチドをコードする組み換え核酸の発現により、または化学的な合成により得られうる。化学的に合成されたペプチドは、本来、それに天然に付随する成分から隔てられているため、その合成ペプチドは「単離」されている。
【００３９】
一つの局面において、本発明の単離されたペプチドは式「Ｘ１Ｘ２Ｐ」（配列番号５５）を持つアミノ酸配列を含み、ここでＸ１は、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、Ｎ末端において塩基性官能基で置換されたグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｒ、Ｓ、Ｏ、およびＣｉｔからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｒ、およびＳからなる群より選択されるかもしくはＲであり、またここでＸ２はＶ、Ｉ、Ｋ、Ｐ、およびＨからなる群より選択される。一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、配列番号５５である。別の局面において、本発明の単離されたペプチドは、配列番号５５のアミノ酸配列を含む１０アミノ酸までのペプチドである。一つの実施形態において、配列番号５５の単離されたペプチドは、配列番号８、９、２６、３９、４０、４１および４５〜５３であるか、または、上記配列を含む１０アミノ酸までの単離されたペプチドである。別の実施形態において、配列番号５５を含む単離されたペプチドは、配列番号４４であり、それは１３アミノ酸までである。
【００４０】
別の実施形態において、本発明は、式「Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐ」（配列番号５６）を含む単離されたペプチドを提供し、ここでＸ１はＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、またはＮ末端において塩基性官能基で置換されたグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、およびＯからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、およびＴからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＫ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、およびＯからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＲ、Ｈ、Ｋ、およびＳからなる群より選択される。ここでＸ２は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ｋ、Ｐ、Ｇ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｏ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ａｂｕ、Ｎｖａ、およびＮｌｅからなる群より選択され、Ｘ２はＮ−メチル化されてもよく、あるいは別の実施形態においては、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ｋ、Ｐ、Ｇ、Ｈ、およびＲからなる群より選択され、ここでＮ−メチル化されてもよく、ここでＸ３はＩ、Ｖ、およびＰからなる群より選択され、ここで一つの実施形態においてＸ３はＮ−メチル化されていない。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号１、３〜７、１０〜１６、１８、２１〜２５、２７、２８、３１〜３９、４２、４３、または４７を含め、配列番号５６を含む１０アミノ酸までのアミノ酸配列でも、または配列番号５４を含む１１アミノ酸までの単離されたペプチドでもよい。しかしながら、一つの実施形態において、配列番号５６が六量体である場合、それは配列番号２ではなく、あるいは一つの実施形態における場合、配列番号５６が五量体である場合、それは配列番号１７ではない。一つの実施形態において、本発明で単離されたペプチドは、配列番号２または配列番号１７を含むペプチドを含まない。
【００４１】
別の実施形態において、本発明は、配列番号５６の式を含むペプチドを含む単離されたペプチドを五量体または六量体において提供する。一つの実施形態において、上記ペプチドは、免疫学的に活性である。
【００４２】
一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、式「ａＸ１Ｘ２Ｘ３Ｐ」（配列番号５７）のペプチドを含み、ここでＸ１、Ｘ２、およびＸ３は配列番号５６について定義されたとおりであり、かつ「ａ」はＳ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、Ｃ、Ｔ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｃ、Ｍ、およびＦからなる群より選択されるか、または別の実施形態においては、Ｓ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、Ｃ、Ｔ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｃ、およびＭからなる群より選択されるか、または別の実施形態においては、Ｓ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、およびＣからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＳである。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５７を含むか、または上記配列を含む１０アミノ酸までのペプチドである。別の実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号４、４７であるか、または単離されたペプチドが六量体の場合は、配列番号３９であるか、または上記配列を含む１０アミノ酸までの単離されたペプチドである。
【００４３】
別の実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、式「Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐｂ」（配列番号５８）のペプチドを含み、ここでＸ１Ｘ２Ｘ３は配列番号５６で定義されたとおりであり、かつ「ｂ」は、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｆ、Ｋ、Ｃ、Ｉ、Ｖ、Ｔ、Ｙ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、およびＭからなる群より選択されるが、しかし一つの実施形態においてはＰではなく、あるいは別の実施形態においては、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｆ、およびＫからなる群より選択され、あるいは別の実施形態においては、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｋ、およびＣからなる群より選択され、あるいは一つの実施形態においては、Ａ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、およびＫからなる群より選択される。ここでＡ＊は、アラニンのＤアミノ酸を表す。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５８を含む１０アミノ酸までのアミノ酸である。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５〜８、１０、１１、１３〜１６、２１〜２５、２７、２８、３１、３３〜３８および４２〜４３であるか、またはそれらを含む。別の実施形態において、そのペプチドは、配列番号５８のペプチドであり、ここで「ｂ」はＰでもＹでもないか、またはＲＩＶＰＰ（配列番号１７）ではないか、あるいはここでＸ３はＧではないか、またはＲＩＧＰＡではなく、あるいはＸ３は、ＶｘではなくまたはＸ３はＲＩＶｘＰＡではない。
【００４４】
一つの実施形態において、配列番号５８に類似のペプチドであるか、あるいはそれを含むペプチドであるが、しかしここでＸ１は、かわりに、Ｇ、ＧＧ、またはＣｉｔからなる群より選択されるか、あるいはここで「ｂ」はＡであり、Ｘ２はＩであり、Ｘ３はＶであり、Ｘ１はＧ、ＧＧ、もしくはＣｉｔであるが、あるいはそのペプチドは配列番号１９、２０、および３６である。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号３１を含む。別の実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５８の逆の配列を含むかまたは配列番号３０を含む。
【００４５】
一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、配列番号２９のアミノ酸配列を持つペプチドであるか、あるいはそのペプチドを含むペプチドである。
【００４６】
本発明のペプチドはまた、式「ａ１ａ２Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐ」（配列番号５９）を含む単離されたペプチドを提供し、ここでＸ１、Ｘ２、およびＸ３は配列番号５６で定義されたとおりであり、かつａ１は、Ｋ、Ｉ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、およびＧからなる群より選択されるか、または一つの実施形態においては、ＫおよびＩからなる群より選択されるか、または一つの実施形態においてＫであり、かつａ２はＳ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｈ、Ｋ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｓ、およびＩからなる群より選択され、または一つの実施形態において、Ｓ、Ｐ、およびＲからなる群より選択されるか、または別の実施形態において、ＳおよびＰからなる群より選択されるか、または別の実施形態においてはＰである。一つの実施形態において、ａ１はアセチル化されておらず、あるいはａ１がＫの場合、Ｋはアセチル化されておらず、また配列番号２でもない。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号１および４７であるか、または配列番号５９を含む１０アミノ酸までのペプチドであるか、あるいはそれらを含むペプチドである。
【００４７】
別の実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、式「ａＸ１Ｘ２Ｘ３Ｐｂ」（配列番号６０）のペプチドであるか、あるいはそのペプチドを含むペプチドであり、ここでＸ１、Ｘ２、およびＸ３は配列番号５６で定義されたとおりであり、かつここで「ａ」はＳ、Ｒ、Ｋ、Ｈ、Ｏ、Ｔ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇからなる群より選択されるか、あるいは別の実施形態において、Ｓ、Ｒ、およびＩからなる群より選択されるか、あるいは別の実施形態において、ＳおよびＲからなる群より選択され、かつここで「ｂ」はＡ、Ｖ、Ｉ、Ｌ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｓ、Ｔ、Ｆからなる群より選択されるか、あるいは別の実施形態においてはＡである。別の実施形態において、配列番号６０のペプチドは、配列番号３、１２、および３９であるか、あるいは配列番号６０または配列番号３、１２もしくは３９を含む１０アミノ酸までのペプチドである。
【００４８】
本明細書で用いられる場合、「表１の配列のアミノ酸配列を含むペプチド」または「表１の配列のアミノ酸配列を含むペプチド」は、そのペプチドそのもの、そのペプチドの明白な化学的同等物、そのペプチドの異性体（例えば、それらの異性体、立体異性体、レトロ異性体、レトロインベルソ異性体、全ての−［Ｄ］異性体、全ての−［Ｌ］異性体、または混合された［Ｌ］異性体および［Ｄ］異性体）、そのペプチドの保存性の置換物、そのペプチドの前駆体形、そのペプチドのタンパク分子内プロセシング形（例えば、Ｎ末端もしくはＣ末端からの一つのアミノ酸の切断物または本発明のペプチドの免疫学的に活性な代謝産物）、そのペプチドの薬学的に受け入れられる塩およびエステル、および翻訳後修飾の結果生じる他の形であるペプチドを包含する。また包含されるものは、長さが１０、９、８、７、６、５、および４アミノ酸まで、およびそれを含む、（環状化した、または直線状の、または中心となる親配列から分岐した）任意の親配列であり、そのうち指定された配列は部分配列である。表中におけるペプチドは三量体であるが、それが１０、９、８、７、６、５、および４マーの部分配列であり得ることを、一方、もし表１に記載されたペプチドが六量体でも、それが１０、９、８、および７マーの部分配列であり得るが、５マーでも４マーでもないことを、当業者は認める。加えて、本発明は、１０マーより大きい配列（配列番号４４および配列番号５４）を含む。本発明のペプチドの免疫学的活性を保持する改変されたペプチドは、本発明の範囲内に含まれる。
【００４９】
明細書でさらに用いられる場合、本発明のペプチドの「明白な化学的同等物」は、明細書で記述されたペプチドと同じ望ましい活性（例えば、明細書で記述されたペプチドと同じ免疫学的活性）を持ち、かつささいな化学的相違を示す分子であるか、あるいはマイルドな条件下で本発明のペプチドに転換される分子（例えば、本発明のペプチドのエステル、エーテル、還元産物、および複合体）である。
【００５０】
加えて、明細書で用いられる場合、「保存性の置換」は、類似した極性または立体的配置を持つか、または置換された残基と同じクラス（例えば、疎水性、酸性、または塩基性）に属するかのどちらかであることにより、置換されたアミノ酸残基と機能上同等であるアミノ酸置換である。明細書で定義された用語「保存性の置換」は、本発明のペプチドの先天免疫増強能力への取るに足らない影響を持つ置換を包含する。保存性の置換の例は、極性（親水性）残基による別の残基の置換（例えば、アルギニン／リジン、グルタミン／アスパラギン、またはスレオニン／セリン）、非極性（疎水性）残基（例えば、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、またはバリン）による別の残基の置換、酸性残基（例えば、アスパラギン酸またはグルタミン酸）による別の残基の置換、または塩基性残基（例えば、アルギニン、ヒスチジン、リジンまたはオルニチン）による別の残基の置換を含む。
【００５１】
明細書で用いられる場合、用語「類似物」は、明細書で記述される配列に実質上同一のアミノ酸配列を持つ任意のペプチドであって、その少なくとも一つの残基が機能上類似の残基によって保存性の置換がされているペプチドを包含する。「類似物」は、６０％またはそれより大きい（好ましくは、７０％またはそれより大きい、８０％またはそれより大きい、８５％またはそれより大きい、９０％またはそれより大きい、９５％またはそれより大きい、または９９％の）アミノ酸配列のホモロジーが、表１のアミノ酸配列とあり、そして表１のアミノ酸配列の機能上の変異体である。さらに明細書で用いられる場合、用語「機能上の変異体」は、明細書で記述されるように先天免疫を増強するか、またはＤＰＰＩＶ活性を減少させる能力を示すペプチドの活性を指す。「類似物」は、表１のアミノ酸と類似した三次元の立体配座を持つ、表１のアミノ酸の変異体を包含する。「類似物」は、明細書に記述されるとおりの類似物の任意の薬学的に受け入れられる塩をさらに含包含する。「変異体」は、明細書に記述されるとおりの変異体の任意の薬学的に受け入れられる塩をさらに包含する。
【００５２】
「誘導体」は、明細書で用いられる場合、官能性の側基の反応により化学的に誘導された一つあるいはより多くのアミノ酸を持つ本発明のペプチドを指す。模範的な誘導された分子としては、遊離アミノ基が、アセチル基、アミン塩酸塩、カルボベンゾイル基、クロロアセチル基、ホルミル基、ｐ−トルエンスルホニル基、またはｔ−ブチルオキシカルボニル基を付加することにより、塩またはアミドを形成するように誘導されたペプチド分子が挙げられるがこれらに限定されない。遊離ヒドロキシル基は、Ｏ−アシル誘導体またはＯ−アルキル誘導体を形成するように誘導され得る。さらに、遊離カルボキシル基は、塩、エステル（例えば、メチルエステルおよびエチルエステル）、またはヒドラジドを形成するように誘導され得る。従って、「誘導体」は、さらに、明細書に記述されるとおりの誘導体の薬学的に受け入れられる任意の塩を包含する。
【００５３】
本発明の一つの実施形態において、本発明の単離されたペプチドは、改変されたＣ末端および／または改変されたＮ末端を持つ。例えば、単離されたペプチドは、アミド化されたＣ末端を持ち得る。例えば、アミノ末端は、アセチル化（Ａｃ）され得るし、あるいはカルボキシ末端はアミド化（ＮＨ２）され得る。しかしながら、本発明の一つの実施形態において、仮にそのような改変が、望ましい免疫学的活性の消失を結果として生じる場合は、本発明のペプチドは、好ましくはアセチル化されない。アミノ末端の改変としては、メチル化（すなわち、−−ＮＨＣＨ３または−−ＮＨ（ＣＨ３）２）、アセチル化、カルボベンゾイル基（ｃａｒｂｏｂｅｎｚｏｙｌ ｇｒｏｕｐ）の付加、またはカルボキシレートの官能性を持つ（ＲＣＯＯ−−で定義され、ここでＲはナフチル基、アクリジニル基、ステロイジル基、および類似の基からなる群より選択される）任意のブロッキング基でアミノ末端をブロックすることが挙げられる。カルボキシ末端の改変としては、遊離酸をカルボキサミド基で置き換えること、または構造的な制約を導入するためにカルボキシ末端で環状ラクタムを形成することが挙げられる。
【００５４】
一つの実施形態において、骨格の置換（例えば、ＮＣＨ３へのＮＨの置換）がされうる。単離されたペプチドはまた、表１のアミノ酸配列のペプチドの改変物（例えば、１挿入もしくは１欠失のような点変異、または先端の切断）でも、または表１のアミノ酸配列を含む改変物（例えば、挿入もしくは欠失のような点変異、または先端の切断）でもよい。例として、そのペプチドは、望ましい免疫学的活性が保持されさえすれば、Ｄアミノ酸の少なくとも一つの点挿入により改変される表１のアミノ酸配列を含み得る。特に、プロリン残基の環の大きさが５員から４員、６員、または７員に変えられたプロリン類似物が用いられうる。環状基は、飽和でも非飽和でもよく、そして非飽和の場合、芳香性でも非芳香性でもよい。
【００５５】
２０種類の遺伝的にコードされたアミノ酸（またはＤアミノ酸）の天然に存在する側鎖を、類似の特性を持つ他の側鎖（例えば、アルキル、低級アルキル、環状４員アルキル、環状５員アルキル、環状６員アルキル、環状７員アルキル、アミド、アミド低級アルキル、アミドジ（低級アルキル）、低級アルコキシ、ヒドロキシ、カルボキシ、およびそれらの低級エステル誘導体）で、ならびに４員複素環、５員複素環、６員複素環、７員複素環で置き換えることができる。
【００５６】
そのような置換は、以下のものを含み得るが必ずしもそれに限定はされない。（１）正に荷電した非標準アミノ酸（例えば、オルニチン、Ｄａｂ（２，４−ジアミノ酪酸（それはオルニチンからメチレン基を一つ除いたようなもの（またはリジンからメチレン基を二つ除いたようなもの）である）、ＤｐｒまたはＤａｐａ（２，３−ジアミノプロピオン酸（それはオルニチンからメチレン基を二つ除いたようなもの（またはリジンからメチレン基を三つ除いたようなもの、またはヒドロキシルのかわりにアミノ基を持つセリンのようなもの）である））、Ｎｌｙｓ（（Ｎ−（４−アミノブチル）−グリシンであり「Ｎ末端」に取り付けられたリジン側鎖およびグリシンのアミノ基に取り付けられたアミノプロピル基またはアミノエチル基を持つ化合物を持つ））（２）電荷を持たない、アルガニン様の非天然のアミノ酸。例えば、Ｃｉｔ（シトルリン）およびＨｃｉ（メチレン基をもう一つ持つシトルリン）。（３）ＯＨをもつ（例えば、セリンのように）、非標準の天然には存在しないアミノ酸（例えば、ｈＳｅｒ（ホモセリン（メチレン基をもう一つ持つ））、Ｈｙｐ（ヒドロキシプロリン）、Ｖａｌ（ベータＯＨ）（ヒドロキシバリン）、Ｐｅｎ（ペニシラミン）（Ｖａｌ（ベータＳＨ））。（４）プロリン誘導体（例えば、Ｄ−Ｐｒｏ。例えば、３，４−デヒドロプロリン、Ｐｙｒ（ピログルタミン、環中にＣ＝Ｏを持つプロリン）、環上にフッ素置換を持つプロリン、１，３−チアゾリジン−４−カルボン酸（環中にＳを持つプロリン））。（５）ヒスチジン誘導体（例えば、Ｔｈｉ（ベータ−（２チエニル）−アラニン））。または（６）アルキル誘導体（例えば、Ａｂｕ（２−アミノ酪酸（Ｃアルファ上にエチル基））、Ｎｖａ（ノルバリン（Ｃアルファ上にプロピル基））、Ｎｌｅ（ノルロイシン（Ｃアルファ上にブチル基））、Ｈｏｌ（ホモロイシン（Ｃアルファ上にプロピル基））、Ａｉｂ（アルファ−アミノイソ酪酸（メチレン基を持たないバリン））。それらの置換が親ペプチド／配列の免疫学的な活性を保持することを当業者は認める。
【００５７】
別の代わりになる実施形態において、Ｃ末端カルボキシル基またはＣ末端エステルが、それぞれ、カルボキシル基の−−ＯＨまたはカルボキシルエステルのエステル（−−ＯＲ）のＮ末端アミノ基による内部置換により環化して環状ペプチドを形成するよう誘導され得る。例えば、ペプチド酸を与える合成と切断後、遊離酸は、（例えば、塩化メチレン（ＣＨ２Ｃｌ２）、ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）混合物中の）とけたジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）のような適切なカルボキシル基のアクチベーターにより、活性化されたエステルに変えられる。環状ペプチドが、その後、活性化されたエステルのＮ末端アミンによる内部置換により形成される。重合と対照的に、内部環化は、非常に希薄な溶液の使用により増進されうる。そのような方法は、当該分野で周知である。
【００５８】
末端アミノ基または末端カルボキシル基が存在しないように、本発明のペプチドを環化するか、またはペプチド末端へデスアミノ残基を組み込むか、もしくはペプチド末端へデスカルボキシ残基を組み込むことによって、そのペプチドのプロテアーゼに対する感受性を減少させるか、またはそのペプチドの立体配座を制限することもまた可能である。本発明の化合物のＣ末端官能基としては、アミド、アミド低級アルキル、アミドジ（低級アルキル）、低級アルコキシ、ヒドロキシ、およびカルボキシ、ならびにそれらの低級エステル誘導体、ならびに薬学的に受け入れられるそれらの塩が挙げられる。
【００５９】
また、Ｎ末端システインおよび／またはＣ末端システインを付加し、そしてジスルフィド結合または他の側鎖の相互作用を介してそのペプチドを環化することによってそのペプチドを環化し得る。
【００６０】
末端アミノ基または末端カルボキシル基が存在しないように、デスアミノ残基またはデスカルボキシ残基をペプチドの末端に組み込んで、そのペプチドのプロテアーゼに対する感受性を減少させるかまたはそのペプチドの立体配座を制限することも可能である。
【００６１】
（ペプチドの製造方法）
本発明は、ペプチドの類似物、誘導体、および変異体を含むペプチドであって、合成により生産されたか、組み換えにより生じたか、または天然の細胞から単離されたペプチドを企図する。本発明のペプチドは、当業者に周知の方法により合成され得る（例えば、Ｍｏｄｅｒｎ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ｏｆ Ｐｅｐｔｉｄｅ ａｎｄ Ａｍｉｎｏ Ａｃｉｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，１９８１）、およびＢｏｄａｎｓｋｙ， Ｍ．，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ Ｎ．Ｙ．，Ｉｎｃ．，１９８４）に記述されたとおり）。本発明のペプチドの合成において用いられ得る方法の例は、固相ペプチド合成、溶液または液体法ペプチド合成、および任意の商業的に入手できるペプチド合成装置を用いた合成を含むが、しかしそれに限定はされない。一つの実施形態において、本発明のペプチドはインビトロで合成される（例えば、化学的な方法またはｍＲＮＡのインビトロトランスレーションにより）。別の実施形態において、本発明のペプチドは、従来技術およびペプチドをコードするｃＤＮＡを用いて、組み換えにより生産される。本発明のアミノ酸配列は、ペプチド配列の合成において用いられる当業者に周知のカップリング剤および保護基をさらに含み得る。
【００６２】
本発明のペプチド類似物、誘導体、および変異体は、当業者に周知の、広い種類の異なる変異誘発技法により作られ得る。これらの技法は、任意の分子生物学実験室マニュアル（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ−Ａ
Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ ｅｄ．（Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ，ＮＹ：Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，１９８９）、またはＡｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．， Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ）が挙げられる）において見いだされ得る。変異キットはまた、多くの商業的な分子生物学の供給者から入手できる。初めのアミノ酸配列において部位特異的変異誘発、領域特異的変異誘発、またはランダム変異誘発を行なう方法が入手できる。類似物、誘導体、および変異体が生産された後、それらは、明細書に記述されたように、先天免疫を増強する望ましい能力に関してスクリーニングされ得る。
【００６３】
（ペプチドと反応性のある因子）
本発明は、表１のアミノ酸配列を含むペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドと反応性のある因子をさらに提供する。明細書で用いられる場合、「反応性の」は、本発明のペプチドに親和性があるか、結合するか、または指向する因子を意味する。さらに、明細書で用いられる場合、「因子」は、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡが挙げられる）、天然には存在しない抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、分子、化合物、抗生物質、薬物、およびそれらの任意の組み合わせを包含するものとする。Ｆａｂ断片は、抗体の一価の抗原結合断片であり、パパイン消化により産生される。Ｆ（ａｂ’）２断片は、抗体の二価の抗原結合断片であり、ペプシン消化により産生される。好ましくは、本発明の因子は、検出可能なマーカーまたは標識で標識される。天然に存在しない抗体は、二つのＣ末端グリシン残基およびＭＡＰＳのような、別の化合物と結合したペプチドを用いて生成される抗体を意味する。ＭＡＰＳ抗原は、本発明のペプチドに、そのペプチドのＣ末端に挿入された２個のグリシン残基を介して取り付けられる。その構築物はその後、ウサギのような動物に投与され得、そして、抗体は、当該分野で周知の手順を用いて収集され得る。
【００６４】
本発明の一つの実施形態において、本発明のペプチドと反応性のある因子は、抗体である。明細書で用いられる場合、本発明の抗体は、ポリクローナルでもモノクローナルでもよい。加えて、本発明の抗体は、当業者には周知の技術により生産され得る。例えば、ポリクローナル抗体は、マウス、ウサギ、またはラットを本発明の精製されたペプチドで免疫することにより生産され得る。次に、モノクローナル抗体は、免疫した動物から脾臓を取り出し、脾臓細胞を骨髄腫細胞と融合させ、培養して増殖させた場合、モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを形成させることにより生産されうる。例えば、Ｊ．Ｇ．Ｒ．Ｈｕｒｒｅｌ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ｈｙｂｒｉｄｏｍａ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ （Ｂｏｃｏ Ｒａｔｏｎ， ＦＬ：ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ Ｉｎｃ．，１９８２）を参照のこと。
【００６５】
本発明の抗体は、検出可能なマーカーまたは標識で標識され得る。抗体の標識は、ペルオキシダーゼ標識、当該分野で公知の化学発光標識、および当該分野で公知の放射性標識を含めた多様な標識技術のうちの一つを用いて実行され得る。本発明の検出可能なマーカーまたは標識は、例えば、非放射性マーカーまたは蛍光マーカー（例えば、ビオチン、フルオレセイン（ＦＩＴＣ）、アクリジン、コレステロール、またはカルボキシ−Ｘ−ローダミン）であり得、それらは当該分野で容易に知られる蛍光イメージング技術または他のイメージング技術を用いて検出され得る。あるいは、検出可能なマーカーまたは標識は、例えば放射性同位体を含め、放射性マーカーでもよい。放射性同位体は、検出可能な放射線を放射する任意の同位体（例えば、３５Ｓ、３２Ｐ、１２５Ｉ、３Ｈ、または１４Ｃ）でありうる。放射性同位体により放射される放射能は、当該分野で周知の技術により検出され得る。例えば、放射性同位体からのガンマ放射は、ガンマイメージング技術、特にシンチグラフィーイメージングを用いて検出され得る。好ましくは、本発明の因子は、検出可能なマーカーまたは標識で標識された高親和性抗体である。
【００６６】
（単離された核酸分子）
加えて、本発明は、表１のアミノ酸配列を含むペプチドをコードする単離された核酸分子を、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド（結合ペプチド（例えば、キャリアペプチド構築物）を含む）をコードする単離された核酸分子を、または他のペプチドをコードする単離された核酸分子を、または免疫学的に活性な表１のペプチドへと代謝される、または切り離されるプロペプチドをコードする単離された核酸分子を提供する。遺伝コードの縮重により、本発明の核酸分子は、本発明のペプチドをまたコードする多数の核酸置換物を含む。本発明はさらに、表１のアミノ酸配列またはその類似物、誘導体、もしくは変異体をコードする単離された核酸分子にハイブリダイズする核酸を提供する。
【００６７】
本発明の核酸分子は、ＤＮＡまたはＲＮＡであり得る。それらは、当業者に公知の多様な技術により調製され得、それらの方法としては、商業的に入手可能なオリゴヌクレオチド合成装置（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｍｏｄｅｌ ３９２ ＤＮＡ／ＲＮＡ 合成装置）を用いたオリゴヌクレオチドの自動化された合成が挙げられるが、これに限定されるわけではない。加えて、本発明の核酸分子は、一つまたはそれより多い検出可能なマーカーまたは標識で標識され得る。核酸分子の標識は、当該分野で公知の多くの方法のうちの一つ（例えば、ニックトランスレーション、末端標識、フィルイン末端標識、ポリヌクレオチドキナーゼ変換反応、ランダムプライミング、または（リボプローブ（ｒｉｂｏｐｒｏｂｅ）調製のための）ＳＰ６ポリメラーゼ）を、多様な標識（例えば、３５Ｓ、３２Ｐ、もしくは３Ｈのような放射性標識、またはビオチン、フルオレセイン（ＦＩＴＣ）、アクリジン、コレステロール、もしくはカルボキシ−Ｘ−ローダミン（ＲＯＸ）のような非放射性標識）のうちの一つとともに用いて実行され得る。
【００６８】
本発明はまた、発現ベクターに作動可能に連結された本発明の核酸分子を含む組み換え核酸構築物を提供する。明細書で用いられる場合、「発現ベクター」は、適切な宿主においてそのＤＮＡの発現をもたらす能力のある適切な調節配列に作動可能に連結されたＤＮＡ配列を含むＤＮＡ構築物である。例えば、ベクターは、プラスミド、ファージ粒子、または可能性のあるゲノム挿入物であり得る。さらに明細書で用いられる場合、用語「作動可能に連結された」は、二つのＤＮＡ領域間の機能上の関係を記述する。本発明における使用に適切な発現ベクターは、本発明のペプチドをコードする核酸分子に作動可能に連結された少なくとも一つの発現調節エレメント（例えば、オペレーター、プロモーター、ｌａｃシステム、リーダー配列、終結コドン、および／またはポリアデニル化シグナル）を含む。一つの実施形態において、その発現ベクターは、真核細胞において機能する真核細胞の発現ベクター（例えば、レトロウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、または鶏痘ウイルスベクター）である。
【００６９】
いったん本発明の核酸分子に作動可能に連結されると、その発現ベクターは、核酸の移入に適切な任意のインビボまたはエキソビボの方法により、受容者細胞中に導入され得る。それらの方法としては、エレクトロポレーション、ＤＥＡＥデキストラントランスフェクション、リン酸カルシウムトランスフェクション、リポフェクション、モノカチオンリポソーム融合、ポリカチオンリポソーム融合、プロトプラスト融合、インビボ電場の形成、ＤＮＡ被覆微粒子銃、複製欠損組み換えウイルスの注入、相同組み換え、ウイルスベクター、むき出しのＤＮＡの移入、またはそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されるわけではない。核酸の移入に適切な組み換えウイルスベクターとしては、ウイルス（例えば、レトロウイルス、ＨＳＶ、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、セムリキ森林ウイルス（Ｓｅｍｉｌｉｋｉ Ｆｏｒｅｓｔ ｖｉｒｕｓ）、サイトメガロウイルス、およびワクシニアウイルス）のゲノム由来のベクターが挙げられるが、これらに限定されるわけではない。
【００７０】
本発明はさらに、本発明の組み換え核酸構築物を含む少なくとも一つの宿主細胞を提供する。本発明の宿主細胞は、明細書に記述された核酸構築物で形質転換される。宿主細胞は、真核細胞（例えば、動物細胞、植物細胞、昆虫細胞、または酵母細胞）でも原核細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）でもよい。
【００７１】
加えて、本発明は、表１のアミノ酸配列、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチドを生産するための方法を提供する。その方法は次の工程を包含する：（ａ）そのペプチドの発現を許容する条件下で、明細書で記述されたとおりの組み換え核酸構築物を含む少なくとも一つの宿主細胞を培養すること；および（ｂ）少なくとも一つの宿主細胞から、またはその培養培地からそのペプチドを回収すること。その組み換えペプチドは、粗溶解産物として回収されうる；その組み換えペプチドはまた、当該分野で公知の標準的なタンパク質精製手順（アフィニティクロマトグラフィーおよび免疫アフィニティクロマトグラフィー、ディファレンシャル沈澱、ゲル電気泳動、イオン交換クロマトグラフィー、等電点電気泳動、サイズ排除クロマトグラフィーなどが挙げられるが、それらに限定されるわけではない）により精製され得る。
【００７２】
（薬学的組成物）
本発明はさらに、表１のアミノ酸配列、または配列番号１、配列番号３〜１６、もしくは配列番号１８〜６０のアミノ酸配列を含むペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体（前述のいずれかの薬学的に受け入れられる塩、酸付加塩、もしくはエステルが挙げられる）を含むペプチドを、少なくとも一つの薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤、または賦形剤との組み合わせで含む薬学的な組成物を提供する。薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤または賦形剤は、組成物の他の成分と適合し、そしてその受容者に有害ではないという意味で「受け入れられる」でなければならない。受け入れられる薬学的キャリア、希釈剤、および賦形剤の例は、数ある中で、カルボキシメチルセルロース、結晶セルロース、グリセリン、アラビアゴム、ラクトース、ステアリン酸マグネシウム、メチルセルロース、粉剤、生理食塩水、アルギン酸ナトリウム、スクロース、でんぷん、タルク、および水が挙げられるが、それに限定されるものではい。明細書に記述されるように、本発明の薬学的な組成物の調合物は、単位投薬量で都合よく与えられ得る。
【００７３】
（使用）
本発明のペプチドは、先天免疫の増強において治療上の有用性があることが示された。先天免疫の増強は、抗微生物活性の欠損（実施例２）ならびにインビボモデルにおける抗感染防御（実施例３および実施例４）により、そしてまた実施例５のＤＰＰＩＶアッセイにより示される。従って、本発明はまた、被験体において感染を処置および／または予防するための方法を提供する。明細書で用いられる場合、「被験体」は、鳥類（例えば、ニワトリ、七面鳥等）または哺乳動物（例えば、ウシ、イヌ、ヒト、サル、マウス、ブタ、ラット等）である。一つの実施形態において、被験体はヒトである。被験体は、感染していてもよく、または感染のリスクを持っていてもよい。例として、感染は、微生物感染でありうる。本発明の方法により処置され得る微生物感染としては、細菌による感染、真菌による感染、寄生体による感染、およびウイルスによる感染が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【００７４】
ほとんどの細菌性病原体は、一般的な環境中に、または宿主の正常な細菌叢中に存在する。細菌は、コロニーを形成し、宿主の組織中に広まり、そして宿主の組織を侵略することを可能にする、異なる機構（毒性因子と呼ばれる）を獲得することによって、ひどい疾患をひきおこす能力を進化させた。これらの病原性因子が抑制される場合、細菌は、宿主組織中でもはやそれ自体を維持できず、そしてそれゆえ、疾患をひきおこすことができない。本発明の方法により処置され得る典型的な細菌としては、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．（例えば、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．、およびバンコマイシン耐性腸球菌が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【００７５】
Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａは、どこにでもいるグラム陰性細菌であり、環境の融通性、感受性のある個体において疾患をひきおこす能力、および抗生物質に対する耐性のために注目される。Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａは、融通のきく生物であり、土壌、沼地、および海岸に近い海の生息環境、ならびに植物上および動物組織中で増殖する。嚢胞性線維症の最も重大な合併症は、Ｐ． ａｅｒｕｇｉｎｏｓａによる、気道感染である。免疫系欠損症を持つ特定の他の個体がかかるのと同様に、癌患者および熱傷患者もまた普通にこの生物体によるひどい感染にかかる。多くの環境中の細菌とは異なり、Ｐ． ａｅｒｕｇｉｎｏｓａは、感受性の宿主において疾患をひきおこす顕著な能力を持つ。
【００７６】
Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓは、直径約１マイクロメートルのグラム陽性の球状の細菌であり、微視的な群で増殖する。Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、ヒトの最も重要な病原体の一つであり、心内膜炎から肺炎までの範囲の、市中感染および院内感染の両方をひきおこす。Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、一般的に細胞外病原体として分類されるが、最近のデータは、多様な型の宿主細胞（例えば、プロフェッショナル食細胞（ｐｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌ ｐｈａｇｏｃｙｔｅ）および非食細胞（内皮細胞、線維芽細胞等が挙げられる）の両方）にＳ．ａｕｒｅｕｓが感染する能力を示した。この侵入は、細胞表面へのＳ．ａｕｒｅｕｓの付着によって開始され、それはブドウ球菌のフィブロネクチン結合タンパク質が重要な役割をはたすプロセスである。貪食されたＳ．ａｕｒｅｕｓは、宿主細胞のアポトーシスを誘導するか、または細胞質中で数日間生存することが可能であり、このことは抗ブドウ球菌エフェクター機構の欠損によると考えられる。
【００７７】
Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、鼻の通路、皮膚表面、粘膜、ならびに口、生殖器および直腸の周りの領域にコロニーを形成する。Ｓ．ａｕｒｅｕｓは、表面の皮膚病巣（例えば、腫脹、麦粒腫、およびフルンケル）をひきおこし得る。よりひどい感染としては、肺炎、乳腺炎、静脈炎、髄膜炎、および尿路感染が挙げられ、根深い感染としては、骨髄炎および心内膜炎が挙げられる。
【００７８】
本発明の方法により処置されうる典型的な真菌としては、糸状菌、酵母、および高等真菌が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。全ての真菌は、真核細胞であり、そしてその細胞膜にステロールを持つが、ペプチドグリカンを持たない。真菌の感染、すなわち真菌症は、組織の関与の程度および宿主中への侵入の様式により分類される。免疫無防備状態の宿主において、多様な非病原性真菌、または通常は軽度の真菌が、致死的な可能性をもつ感染をひきおこし得る。
【００７９】
寄生体は、他の生体（宿主として知られる）から、食物および保護を得ている生物である。寄生体は、動物からヒトへ、ヒトからヒトへ、またはヒトから動物へと伝えられ得る。いくつかの寄生体は、食品伝染疾患および水系感染性疾患の重要な原因として現れた。それらは、汚染された食物および水の消費により、または感染したヒトもしくは動物の便（糞便）と接触した物質の経口摂取により、宿主から宿主へと伝えられ得る。寄生体は、感染したヒトおよび動物宿主の組織および臓器中で生存および繁殖し、そしてしばしば糞便中に排出される。大きさにおいて異なる型（小さい単細胞の微視的な生物体（原生動物）から、顕微鏡を用いずに見ることができる、より大きな多細胞の蠕虫（腸内寄生虫）までの範囲にわたる）の寄生体がある。本発明の方法により処置され得る一般的な寄生体の例としては、Ｇｉａｒｄｉａ ｄｕｏｄｅｎａｌｉｓ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ
ｐａｒｖｕｍ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ ｃａｙｅｔａｎｅｎｓｉｓ、およびＴｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉが挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【００８０】
真菌および細菌と異なり、ウイルスは、自由生活細胞の多くの特性を欠いている。一つのウイルス粒子は、固定的な構造であり、きわめて安定で、そしてその一部を変化させたりまたは置き換えたりすることができない。細胞と会合した場合にのみ、ウイルスは、複製し、そして生命のある系の特性のいくつかを獲得することができるようになる。ウイルスは、多数の疾患（例えば、感冒および咽頭炎（咽喉炎）のような上気道感染（ＵＲＴＩ）が挙げられる）をひきおこす。本発明の方法により処置され得るウイルスの他の例としては、ＡＩＤＳ、鳥インフルエンザ、水痘、単純疱疹、感冒、胃腸炎（特に子供の）、伝染性単核球症、インフルエンザ、麻疹、ムンプス、咽頭炎、肺炎、風疹、ＳＡＲＳ、および下気道感染（例えば、ＲＳウイルス、すなわちＲＳＶ）に関係するウイルスが挙げられるが、それらに限定されるものではない。
【００８１】
本発明者達は、表１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１、配列番号３〜１６、配列番号１８〜６０のアミノ酸配列を含むペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド、またはそれらの明白な化学的同等物を含むペプチドが、感染の予防および／または処置において有効であることを、明細書で示した。従って、被験体における感染を処置および／または予防する本方法は、表１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１、配列番号３〜１６、配列番号１８〜６０のアミノ酸配列を含むペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド、またはそれらの明白な化学的同等物を含むペプチドを、被験体に投与することを含む。本発明のペプチドを、感染の処置および／もしくは予防の有効性を増大させるため、ならびに／またはターゲティングの有効性を増大させるために、別の因子と結合させ得ること、または抗生物質（例えば、ペニシリン、メチシリン、またはバンコマイシン）のような別の因子との組み合わせで投与し得ることは、本発明の範囲にある。
【００８２】
本発明の一つの実施形態において、本発明のペプチドは、表１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１、配列番号３〜１６、配列番号１８〜６０のアミノ酸配列のペプチド、またはそれらの類似物、誘導体、もしくは変異体を含むペプチド、またはそれらの明白な化学的同等物を含むペプチドを含む。別の実施形態において、本発明のペプチドは、被験体の先天免疫を調節し、それゆえ、被験体における感染を処置および／または予防する。先天免疫応答は、病原体との遭遇に対する最前線の反応である。先天免疫応答は、感染性疾患の発症を予防する多数の機構を含む。そのような機構の一つは、免疫エフェクター細胞のプライミングおよび動員を含む。
【００８３】
一つの実施形態において、本発明のペプチドは、炎症を抑制すると同時に、先天免疫または先天免疫応答を増強しうる。
【００８４】
別の実施形態において、本発明のペプチドが、ＤＰＰＩＶ活性の調節因子であることが示された。本発明のペプチドは、ＤＰＰＩＶ活性を減少させることが示された。それゆえ、本発明のペプチドは特定の免疫学的状態を処置するペプチドの投与から利益を得られうる被験体のスクリーニングにおいて有用である。そのスクリーニングは、ＤＰＰＩＶ関連状態を有することが疑われるか、または知られている被験体からサンプルを採取し、このサンプルを本発明のペプチドおよびＤＰＰＩＶの基質とともにインキュベートし、そしてＤＰＰＩＶ活性の減少に対するそのペプチドの効果を、対照との比較においてモニターすることを含む。ここで、活性の減少は、ＤＰＰＩＶ関連状態を処置するための被験体へのペプチドの投与の可能性のある利益を示す。別の実施形態において、対照と比較しての、そのペプチドの存在下でのＤＰＰＩＶ活性の調節が、ＤＰＰＩＶ関連状態を示し得る。それゆえ、本発明のペプチドを、ＤＰＰＩＶ関連状態の診断において用いうる。別の局面において、本発明のペプチドは、ＤＰＰＩＶ関連障害（例えば、ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、グレーヴズ病、癌（例えば、肺癌および大腸癌）、糖尿病、および自己免疫障害（例えば、関節リウマチおよび多発性硬化症））のような多くの免疫学的障害の処置において有用である。
【００８５】
（投与）
本発明の方法に従って、明細書に記述されたとおりの本発明のペプチドは、被験体において感染を処置および／または予防するのに、ならびに、あるいはＤＰＰＩＶ関連状態を処置または予防するのに有効な量（例えば、治療上の有効量）で、被験体に直接投与され得る。同様に、明細書で記述されたペプチドは、被験体におけるそのペプチドの発現を許容する方法で、そして感染を処置および／または予防するのに有効な量で、そのペプチドをコードする核酸配列を被験体に投与することによって、被験体に間接的に投与され得る。
【００８６】
さらに、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸分子が、被験体において感染を処置するのに有効な量で、被験体に投与され得る。明細書で用いられる場合、「感染を処置するのに有効な」の語句は、感染（細菌、真菌、寄生体、ウイルス等による）の結果生じる臨床的な障害または症状を、改善または最小化するのに有効であることを意味する。例えば、被験体が、微生物に感染した場合、微生物感染の処置に有効なペプチド（またはこれをコードする核酸）の量は、微生物感染の症状（例えば、頭痛、項硬直、食欲不振、悪心、嘔吐、下痢、腹部不快感、急性腎不全、複数の臓器への虚血性ダメージの症状発現の変化、発熱および血小板減少を含むが、それらに制限されるものではない）を改善または最小化し得る量である。被験体において、感染を処置するのに有効なペプチド（またはこれをコードする核酸）の量は、それぞれの症例の特定の要因（被験体の体重および被験体の状態の重大さを含む）に依存して変化する。ペプチド（またはこれをコードする核酸）の適切な量は、当業者により容易に決定され得る。同様に、ＤＰＰＩＶ関連状態の処置に有効な量は、当業者に知られた多くの類似の要因に依存して変化し得る。
【００８７】
同様に、本発明の方法において、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸分子はまた、被験体における感染を予防するのに有効な量で、感染を発症するリスクのある被験体に投与され得る。明細書で用いられる場合、「感染を予防するのに有効な」の語句は、感染（細菌、真菌、寄生体、ウイルス等による）に由来する臨床的な障害または症状の発症または症状発現を、妨げるかまたは予防するのに有効なものを包含する。被験体において感染を予防するのに有効な、ペプチド（またはこれをコードする核酸）の量は、個々の症例の特定の因子（被験体の性別、体重、および被験体の状態の重大さ、状態の性質、感染部位、および投与の方法が挙げられる）に依存して変化する。ペプチド（またはこれをコードする核酸）の適切な量は、当業者により容易に決定され得る。
【００８８】
明細書で開示されるとおりの本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸配列は、、ヒトまたは動物の被験体に、公知の手順により投与され得、その手順は経口投与、非経口投与（例えば、筋膜上投与、包内投与、皮内投与、皮膚の内側への投与、筋内投与、眼窩内投与、腹腔内投与、脊椎内投与、胸骨内投与、脈管内投与、静脈内投与、実質投与、または皮下投与）、経皮投与、鼻腔内投与、肺への投与（例えば、気管内投与により）、および浸透圧ポンプによる投与が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。一つの実施形態において、投与の方法は、静脈内注射または皮下注射による非経口投与である。
【００８９】
経口投与に関して、そのペプチド（またはこれをコードする核酸）の処方物は、カプセル、錠剤、粉末、顆粒、または懸濁剤もしくは液体として提供され得る。その処方物は、従来の添加剤（例えば、ラクトース、マンニトール、トウモロコシでんぷん、またはジャガイモでんぷん）を含み得る。その処方物はまた、結合剤（例えば、結晶セルロース、セルロース誘導体、アラビアゴム、トウモロコシでんぷん、またはゼラチン）を与えられ得る。加えて、その処方物は、崩壊剤（例えば、トウモロコシでんぷん、ジャガイモでんぷん、またはカルボキシメチルセルロースナトリウム）を与えられ得る。その処方物はさらに、二塩基性無水リン酸水素カルシウムまたはでんぷんグリコール酸ナトリウムを与えられ得る。最後に、その処方物は、滑沢剤（例えば、タルクまたはステアリン酸マグネシウム）を与えられ得る。
【００９０】
非経口投与に関して、そのペプチド（または、これをコードする核酸）は、好ましくは被験体の血液と等張の滅菌水性溶液と組み合わせられ得る。そのような処方物は、固体の活性成分を水（この水は生理的に適合性のある物質（例えば、塩化ナトリウム、グリシンなど）を含み、かつ生理的条件に適合する緩衝されたｐＨを持っている）中に溶解して水性溶液を得て、その後、この溶液を滅菌することによって調製され得る。その処方物は、一個でまたは複数投与量の容器（例えば、密封されたアンプルまたは小瓶）で提供され得る。その処方物はまた、明細書で記述されたもの任意のものを含め、任意の注入方法により送達され得る。
【００９１】
経皮投与に関して、そのペプチド（またはこれをコードする核酸）は、皮膚浸透エンハンサー（例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、イソプロパノール、エタノール、オレイン酸、Ｎ−メチルピロリドンなど）と組み合わされ得る。皮膚浸透エンハンサーはペプチドまたは核酸に対する皮膚の透過性を増大させ、そしてペプチドまたは核酸が皮膚をとおって浸透して血流中へ入り込むのを許容する。エンハンサーおよびペプチドまたは核酸の組成物はまた、高分子の物質（例えば、エチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、エチレン／酢酸ビニル、ポリビニルピロリドンなど）とさらに組み合わせてゲル状の組成物を提供することが可能であり、これは、塩化メチレンのような溶媒に溶解され、望ましい粘度まで蒸発、そしてその後裏張り材料に適用されてパッチが提供されうる。そのペプチドまたは核酸は、感染が位置し得る被験体部位またはその近くに、経皮的に投与され得る。あるいは、そのペプチドまたは核酸は、全身性の投与を達成するために、感染領域とは別の部位に経皮的に投与され得る。
【００９２】
鼻腔内投与（例えば、鼻内噴霧）および／または肺への投与（吸入による投与）に関して、ペプチドまたは核酸の処方物（エアゾール処方物が挙げられる）は、当業者に周知の手順によって調製され得る。エアゾール処方物は、固体粒子または溶液（水性または非水性）のどちらをも含み得る。ネブライザ（例えば、ジェットネブライザ、超音波ネブライザ等）およびアトマイザが、溶液（例えば、エタノールのような溶媒を用いる）からエアゾールを作るのに用いられ得る。定量吸入器および乾燥粉末吸入器が、小粒子エアゾールを発生させるために用いられうる。エアゾール粒子の望ましい大きさは、当該分野で公知の多くの方法（ジェット−ミリング、噴霧乾燥、および臨界点凝縮が挙げられるが、それらに限定されるわけではない）の任意の一つを用いることにより獲得され得る。
【００９３】
鼻腔内投与のための薬学的な組成物は、固体処方物（例えば、粗い粉末）でよく、そして賦形剤（例えば、ラクトース）を含み得る。固体処方物は、鼻腔をとおしての迅速な吸入を用いて、鼻まで持ち上げられた粉末容器から投与され得る。鼻腔内投与のための組成物はまた、鼻内噴霧または点鼻薬の水性または油性の溶液を含み得る。噴霧器での使用については、そのペプチドまたは核酸の処方物は、水性溶液およびさらなる因子（例えば、賦形剤、緩衝剤、等浸透圧剤、保存剤、または界面活性剤が挙げられる）を含み得る。鼻内噴霧は、例えば、そのペプチドまたは核酸の懸濁物または溶液を、圧力下でノズルをとおして出すことにより作られ得る。
【００９４】
肺への投与のためのそのペプチドまたは核酸の処方物は、吸入デバイスによる送達のために適切な形態で提供されてもよく、そして肺または洞の下気道に到達するために有効な粒子の大きさを持ち得る。肺粘膜を含む粘膜表面をとおしての吸収に関しては、本発明の処方物は、エマルジョン（例えば、生物活性のあるペプチド、複数個のサブミクロンの粒子、粘膜付着性の巨大分子、および／または水性の連続した層を含む）を含み得る。粘膜表面をとおしての吸収は、そのエマルジョン粒子の粘膜付着をとおして達成され得る。
【００９５】
定量吸入器デバイスを用いる使用のための薬学的組成物は、非水性媒体中の懸濁物としてそのペプチドまたは核酸を含む細かく分割した粉末を含み得る。例えば、そのペプチドまたは核酸は、界面活性剤（例えば、トリオレイン酸ソルビタン、ダイズレシチン、またはオレイン酸）の助けでプロペラント中に懸濁され得る。定量吸入器は、典型的には、混合物（例えば、液化された圧縮ガスとして）として、容器（例えば、キャニスター）中に貯蔵されたプロペラントガス（例えば、クロロフルオロカーボン、ヒドロクロロフルオロカーボン、ヒドロフルオロカーボン、または炭化水素）を用いる。吸入器は、吸息中の作動を必要とする。例えば、定量バルブの作動が、その混合物をエアゾールとして放出させ得る。乾燥粉末吸入器は、混合粉末の吸息作動を用いる。
【００９６】
本発明のペプチドまたは核酸はまた、浸透圧ミニポンプまたは他の時限放出（ｔｉｍｅｄ−ｒｅｌｅａｓｅ）デバイスから放出または送達され得る。基本浸透圧ミニポンプからの放出速度は、放出開口部に配置された、微孔性の高速反応ゲル（ｆａｓｔ−ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｇｅｌ）で調節され得る。浸透圧ミニポンプは、そのペプチドまたは核酸の放出を調節するうえで、またはその送達を標的化するうえで有用である。
【００９７】
明細書で記述された方法に従って、本発明のペプチドは、被験体にペプチドそのものを導入することにより、またはそのペプチドをコードする核酸を、そのペプチドの発現を許容する方法で被験体に導入することにより、被験体に投与され得る。従って、本発明の一つの実施形態において、被験体における感染は、ある量の本発明のペプチドを被験体に投与することにより処置または予防され得る。本発明のさらなる実施形態において、被験体における感染は、被験体においてそのペプチドの発現を許容する方法で本発明のペプチドをコードする核酸配列を被験体に投与することにより、処置または予防され得る。
【００９８】
本発明のペプチドは、タンパク質および他の薬の導入に用いられる公知の方法（例えば、注射および輸液）により、被験体に投与または導入され得る。感染が、被験体の身体の特定の部分に限局されている場合、治療のためのペプチドをその領域に、注射またはなにか別の手段（例えば、そのペプチドを血液または別の体液中に導入することにより）により、直接導入することが望まれ得る。ペプチドの用いられる量は、先に定義したように、被験体において感染を処置および／または予防するのに有効な量であり、当業者によって容易に決定され得る。
【００９９】
本発明の方法において、そのペプチドはまた、そのペプチドの発現を許容する方法で、そのペプチドをコードする核酸を被験体の十分な数の細胞に導入することにより、被験体に投与または導入され得る。治療のためのペプチドをコードする核酸の量は、先に定義したように、被験体において感染を処置および／または予防するのに有効な量のペプチドを生産する量である。この量は、当業者によって容易に決定され得る。
【０１００】
本発明のペプチドをコードする核酸は、当該分野で公知の従来の手順（エレクトロポレーション、ＤＥＡＥデキストラントランスフェクション、リン酸カルシウムトランスフェクション、リポフェクション、モノカチオンリポソーム融合、ポリカチオンリポソーム融合、プロトプラスト融合、インビボ電場の形成、ＤＮＡ被覆微粒子銃、複製欠損組み換えウイルスの注入、相同組み換え、インビボ遺伝子治療、エキソビボ遺伝子治療、ウイルスベクター、むき出しのＤＮＡの移入、またはそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、それらに限定されるわけではない）を用いて、被験体に導入され得る。遺伝子治療に適切な組み換えウイルスベクターは、ウイルス（例えば、レトロウイルス、ＨＳＶ、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、セムリキ森林ウイルス（Ｓｅｍｉｌｉｋｉ Ｆｏｒｅｓｔ
ｖｉｒｕｓ）、サイトメガロウイルス、およびワクシニアウイルス）のゲノム由来のベクターが挙げられるが、それらに限定されるわけではない。
【０１０１】
本発明のペプチドをコードする核酸が、細胞における治療のためのペプチドの発現を成し遂げるために、従来の手順を用いて、適切な細胞にインビトロで導入され得ることもまた、本発明の範囲の中にある。そのペプチドを発現している細胞は、その後、インビボで感染を処置および／または予防するために被験体中に導入され得る。そのような、エキソビボ遺伝子治療の取り組みにおいて、その細胞は好ましくは被験体から取り出され、治療のためのペプチドをコードする核酸を組み込むＤＮＡ技術の対象とされ、そしてその後、被験体中に再導入される。
【０１０２】
本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸を含む処方物が、薬学的に受け入れられるキャリア、希釈剤、または賦形剤と、さらに混在させてもよく、したがって、薬学的な組成物を構成することもまた本発明の範囲の中にある。本発明の薬学的な組成物ならびに典型的なキャリア、希釈剤、および賦形剤は、先に記述される。
【０１０３】
本発明の処方物は、薬学分野で周知の方法により調製され得る。例えば、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸は、懸濁物または溶液として、キャリア、希釈剤、または賦形剤と混在させられ得る。一つまたはそれより多い補助成分（例えば、緩衝剤、矯味矯臭剤、界面活性剤など）もまた、随意に、加えられ得る。キャリアの選択は、投与の経路に依存する。感染を処置および／または予防するため、本発明のペプチド、またはこれをコードする核酸分子を被験体に投与するうえで、その薬学的な組成物は有用である。そのペプチドまたは核酸は、薬学的な組成物が投与される被験体において、感染を処置および／または予防するのに有効な量で提供される。この量は、先に記述されたように、当業者により容易に決定され得る。
【０１０４】
（診断およびスクリーニングアッセイ）
本発明は、先天免疫状態、またはＤＰＰＩＶ関連状態を有することが疑われる被験体を診断するための方法、被験体が本発明のペプチド（例えば、表１に列挙されたペプチド、またはその類似物、誘導体、もしくは変異体）による処置に反応するか否かを予想するための方法、および本発明のペプチドの免疫学的な影響を調節（例えば、増強、阻害または模倣）する因子についてスクリーニングするための方法を提供する。別の実施形態において、本発明は、本発明のペプチドの免疫学的に活性な類似物、誘導体および変異体、または表１に列挙されたペプチドまたは免疫学的に活性なそれらの改変物についてスクリーニングするための方法を提供する。
【０１０５】
一つの実施形態において、免疫学的な障害（例えば先天免疫関連状態）を持つ患者が、本発明のペプチドによる処置に反応するか予想するための方法は、被験体から生物学的サンプルを獲得すること、本発明のペプチドをこのサンプルに投与すること、ならびに、その状態を示す、予め決定されたマーカー（例えば、ＤＰＰＩＶ関連状態に関してはＤＰＰＩＶ、感染に関しては炎症バイオマーカー、細胞生存率または細菌量）のレベルを、正の対照および／または負の対照との比較においてモニターすることを含む。その正の対照は、公知の免疫学的状態の被験体由来のサンプルでもよい。負の対照は、そのペプチドを投与されていない同じ被験体由来のサンプルでもよい。もしそのペプチドが、対照と比べて、その活性、マーカーのレベル、または細胞生存率を調節するなら、その被験体はそのような免疫学的な障害を持つ可能性があり、そしてそのペプチドでの処置から利益をうけ得る。
【０１０６】
さらにとりわけ、本発明の一つの局面において、もし被験体がＤＰＰＩＶ関連状態を有するか、またはその疑いがあるならば、その状態についてのマーカーとしてＤＰＰＩＶ活性をモニターすることは適切である。一つの局面において、対照と比較してのＤＰＰＩＶ活性の減少は、その被験体が、そのペプチドでの処置に反応することを示す。あるいは、仮に被験体が感染を有するかまたは感染を有する疑いがある場合、その患者からサンプルを獲得し、そのペプチドの投与後に患者からのサンプルと比較して病原体量または細胞生存率についてそのサンプルをモニターする（ここで、そのペプチドの投与後の患者において病原体量がより低いか、または細胞生存率がより高いことは、その被験体が、ペプチド処置から利益を得るか、あるいは免疫学的な障害を持っていることを示す）。
【０１０７】
別の実施形態において、ペプチドまたは表１のペプチドの改変物または他の因子が、本発明のペプチドと同じ免疫学的な活性を持つか知りたい場合、サンプル（因子に感染したマウスまたは既知のＤＰＰＩＶ関連状態に感染したマウスのいずれか由来）に対して公知の調節作用をもつ参照ペプチドと比較したＤＰＰＩＶ活性へのそのペプチドの影響をモニターしてもよく、あるいは、予防をモニターしたい場合は、サンプルにそのペプチドまたは因子を投与し、この感染またはＤＰＰＩＶ関連状態をこのサンプル中で誘導し、そしてその後、この感染もしくはＤＰＰＩＶ関連状態の発症、または免疫応答を、そのペプチドが調節または阻害するかモニターしうる。このサンプルは動物モデルでよく、ＤＰＰＩＶ関連状態または感染の誘導は、倫理指針に従って、認められた動物モデルにおいて実施され、そしてその後、その動物またはその動物の適切な生物学的サンプルが、そのペプチドの影響についてスクリーニングされる。
【０１０８】
本発明はさらに、被験体が、微生物感染に対する処置に反応するか否かを予想するための方法を提供し、その処置は、表１のアミノ酸配列を含むペプチドまたはその類似物、誘導体もしくは変異体を含むペプチドを被験体へ投与することを含む。その方法は、一つまたはそれより多い数のバイオマーカー（例えば、炎症バイオマーカー）について、被験体の診断サンプルをアッセイすることを含み、少なくとも一つのバイオマーカー（例えば、炎症バイオマーカー）の存在は、その被験体がその処置に対して反応することを示す。
【０１０９】
明細書で用いられる場合、「バイオマーカー」または「マーカー」は、その状態（例えば、免疫状態、感染、炎症状態、ＤＰＰＩＶ関連状態、先天免疫状態）に関係することが知られているか、または認識されている任意の適切なバイオマーカーであり、そして遺伝子から得られる任意の分子（例えば、遺伝子の転写物）、遺伝子から得られたセンス（コーディング）プローブ配列もしくはアンチセンス（ノンコーディング）プローブ配列、または遺伝子の部分長もしくは完全長の翻訳産物、またはそれらに対する抗体を含み、それらは、免疫応答、先天免疫応答、炎症および／またはＤＰＰＩＶ関連状態と関連する状態、障害、または疾患をモニターするために用いられうる。
【０１１０】
本発明の方法により、被験体の診断サンプルがインビトロまたはインビボでアッセイされ得る。そのアッセイが、インビトロで実行される場合、被験体由来の診断サンプルは、標準的な手順により取り出され得る。診断サンプルは、組織（任意の筋肉組織、皮膚組織、または軟組織が挙げられる）であってよく、それらは標準的なバイオプシーにより取り出され得る。加えて、診断サンプルは、体液であってよく、血液、唾液、血清、または尿が挙げられる。被験体または患者は、微生物感染もしくは他の免疫学的な障害（例えば、ＤＰＰＩＶ関連状態）を有することが知られていてもよく、微生物感染もしくは他の免疫学的な状態（例えば、先天免疫状態もしくはＤＰＰＩＶ関連状態）が疑われていてもよく、または微生物感染もしくは他の免疫学的な状態（例えば、先天免疫状態もしくはＤＰＰＩＶ関連状態）ではないと信じられていてもよい。
【０１１１】
本発明の方法に従って、被験体の診断サンプルは、一つまたはそれより多い望ましいマーカーの発現についてアッセイされ得る。明細書で用いられる場合、「発現」は、炎症マーカー遺伝子の少なくとも一つのｍＲＮＡ転写物への転写、または少なくとも一つのｍＲＮＡのマーカータンパク質への翻訳を意味する。従って、診断サンプルは、マーカータンパク質、マーカーｃＤＮＡ、またはマーカーｍＲＮＡについてアッセイすることにより、マーカー発現に関してアッセイされ得る。マーカーの適切な形は、明細書で討議した特定の技術に基づき明白である。
【０１１２】
アッセイされるタンパク質は、被験体または患者の診断サンプルから、当該分野で公知の標準的な方法を用いて単離および精製され得る。その方法は、組織からの抽出（例えば、タンパク質を可溶化する洗浄剤を用いる）（必要な場合、カラムでのアフィニティー精製、クロマトグラフィー（例えば、ＦＰＬＣおよびＨＰＬＣ）、免疫沈降（目的の炎症マーカーに対する抗体を用いる）、および沈殿（例えば、イソプロパノールおよびＴｒｉｚｏｌのような試薬を用いる）が後に続く）が挙げられるが、それらに限定されるわけではない。そのタンパク質の単離と精製には、電気泳動（例えば、ＳＤＳポリアクリルアミドゲルでの）があとに続き得る。診断サンプルは、いずれかの形または全ての形のマーカータンパク質（前駆体、末端タンパク質分解でプロセシングされた形、および翻訳後修飾の結果として得られる他の形が挙げられる）の発現についてアッセイされ得ると考えられる。核酸は、診断サンプルから、当業者に公知の標準的な技術を用いて単離され得る。
【０１１３】
本発明の方法に従って、当該分野から容易に決定されるアッセイおよび検出方法（例えば、免疫学的な技術、ハイブリダイゼーション分析、蛍光イメージング技術、および／または放射線検出）、ならびに明細書で開示された任意のアッセイおよび検出方法（例えば、免疫沈降、ウエスタンブロット分析等）を用いて、被験体の診断サンプルはマーカーの発現についてアッセイされ得、そしてマーカーの発現は診断サンプル中で検出され得る。例えば、被験体の診断サンプルは、炎症マーカーと反応性のある因子を用いて、マーカーの発現についてアッセイされ得る。明細書で用いられる場合、「反応性の」は、その因子が、そのマーカーに親和性をもつ、そのマーカーに結合する、またはそのマーカーを指向することを意味する。さらに、明細書で用いられる場合、「因子」は、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡが挙げられる）、抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、分子、化合物、抗生物質、薬物、およびそれらの任意の組み合わせを包含するものとする。好ましくは、本発明のその因子は、明細書に記述された技術に従って、検出可能なマーカーまたは標識で標識される。本発明の一つの実施形態において、マーカーと反応性のある因子は抗体である。
【０１１４】
本発明のその因子が、望ましいマーカーと反応性のある抗体である場合、被験体から取り出される診断サンプルは、アフィニティーカラムを通すことにより精製され得るが、そのカラムは、そのマーカーに対する抗体を含み、その抗体はリガンドとして固体支持体（例えば、ビーズ、ゲル、またはプレートの形態における不溶性有機ポリマー）に取り付けられている。固体支持体に取り付けられたその抗体は、カラムの形態において用いられ得る。適切な固体支持体の例は、アガロース、セルロース、デキストラン、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、セファロース、および他の不溶性有機ポリマーが挙げられるが、それらに限定されるわけではない。そのマーカーに対する抗体はさらに、望まれるなら、スペーサー分子を介して、固体支持体に取り付けられ得る。その因子およびその抗体の結合を保障するための適切な結合条件（例えば、温度、ｐＨ、および塩濃度）は、当業者により容易に決定され得る。好ましい実施形態において、そのマーカーに対するその抗体は、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ ４Ｂのようなセファロースカラムに取り付けられる。
【０１１５】
加えて、その因子が抗体であるとき、被験体の診断サンプルは、標準的な免疫学的検出技術に沿って、そのマーカーと反応性のある一つまたはそれより多い抗体を利用する結合調査を用い、免疫学的なマーカーの発現についてアッセイされ得る。例えば、アフィニティーカラムから溶出されたそのマーカータンパク質は、ＥＬＩＳＡアッセイ、ウエスタンブロット分析、フローサイトメトリー、または抗原抗体相互作用を用いる任意の他の免疫染色法に供され得る。好ましくは、その診断サンプルは、ウエスタンブロッティングを用いてマーカーの発現についてアッセイされる。
【０１１６】
あるいは、被験体の診断サンプルは、被験体から取り出した診断サンプルより抽出された核酸のハイブリダイゼーション分析を用いて、マーカーの発現についてアッセイされ得る。本発明のこの方法に従って、そのハイブリダイゼーション分析は、ｍＲＮＡのノーザンブロット分析を用いて行われ得る。この方法は、そのマーカーをコードする核酸にハイブリダイズする、一つまたはそれより多い核酸プローブを用いてのＤＮＡのサザンブロット分析を行うことによってもまた行われ得る。その核酸プローブは、当業者に公知の多様な技術により調製され得、この技術としては以下が挙げられるが、それらに限定されるものではない：マーカー核酸の制限酵素消化；およびＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｍｏｄｅｌ ３９２ ＤＮＡ／ＲＮＡ 合成装置のような商業的に入手可能なオリゴヌクレオチド合成装置を用いる、マーカー核酸のヌクレオチド配列の選択された部分に対応する配列をもつオリゴヌクレオチドの自動化された合成。
【０１１７】
本発明において用いられる核酸プローブは、ＤＮＡでもＲＮＡでもよく、そして、長さは約８ヌクレオチドから炎症マーカー核酸の全長まで変化し得る。加えて、本発明の核酸プローブは、一つまたはそれより多い数の検出可能なマーカーまたは標識で標識され得る。核酸プローブの標識は、明細書で記述された方法の任意のものを含め、当該分野で知られた多くの方法のうちの一つを用いて達成され得る。マーカー核酸の異なる領域または重なり合う領域に対応する、二つまたはそれより多い核酸プローブ（またはプライマー）の組み合わせもまた、マーカー発現についての診断サンプルのアッセイ（例えばＰＣＲまたはＲＴ−ＰＣＲを用いる）に用いられ得る。
【０１１８】
本発明の方法におけるマーカー発現の検出には、被験体の診断サンプル中のマーカー発現の程度を測定または定量するアッセイが続き得る。そのようなアッセイは、当業者には周知であり、そして、免疫組織化学／免疫細胞化学、フローサイトメトリー、質量分析、ウエスタンブロット分析、またはマーカータンパク質の量を測定するためのＥＬＩＳＡを含み得る。例えば、免疫組織化学アッセイを用いるには、組織の組織学的（パラフィン包埋）切片が、スライド上に載せられ、そしてその後、マーカーに対する抗体とともにインキュベートされ得る。そのスライドは、それから、（一次抗体に対する）二次抗体、（これは色素または熱量測定系（例えば、蛍光色素、放射活性因子、または高電子走査容量をもつ因子）で標識されている）とともにインキュベートされて、その切片中に存在するそのマーカーが可視化されうる。
【０１１９】
本発明は、以下の実施例において詳述され、それらの実施例は本発明の理解を助けるために示されており、そしてその後に続く請求の範囲において定義される本発明の範囲をいずれにせよ制限するとは解釈されるべきではない。
【実施例】
【０１２０】
（実施例１−ペプチド合成）
表１におけるペプチドを、固相ペプチド合成技術を用いて合成した。
【０１２１】
Ｆｍｏｃで保護された、全ての必要とされたアミノ酸を、１ミリモルの望ましいペプチドに対して３倍のモル過剰量の重さで量りとった。そのアミノ酸を、次に、ジメチルホルムアミド（Ｄｉｍｅｔｈｙｌｆｏｒｍａｉｄｅ）（ＤＭＦ）（７．５ｍｌ）に溶解し、３ｍＭの溶液を作製した。適切な量のリンクアミドＭＢＨＡレジン（Ｒｉｎｋ ａｍｉｄｅ
ＭＢＨＡ ｒｅｓｉｎ）を、そのレジンの置換を考慮した重さで量りとった。そのレジンを、次に、自動合成装置の反応容器中に移し、そして、ジクロロメタン（ＤＣＭ）で１５分間、前浸漬した。
【０１２２】
そのレジンを、ＤＭＦ（３０ｍｌ）中の２５％ピペリジンをそのレジンに加え、そして２０分間混合することにより、脱保護した。そのレジンの脱保護後、その３ｍＭのアミノ酸溶液を４ｍＭの２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート（２−（１Ｈ−ｂｅｎｚｉｔｒｉａｚｏｌｅ−１−ｙｌ）−１，１，３，３−ｔｅｔｒａｍｅｔｈｙｌｕｒｏｎｉｕｍ ｈｅｘａｆｌｕｏｒｏｐｈｏｓｐｈａｔｅ）（ＨＢＴＵ）および８ｍＭのＮ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＰＡ）と混合することにより、最初の連結を生じさせた。その溶液を、そのレジンに加える前に５分間にわたって前活性化させた。そのアミノ酸を、４５分間にわたって連結させた。
【０１２３】
連結後、そのレジンを、ＤＭＦおよびジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）で入念にリンスした。その取り付けられた、Ｆｍｏｃで保護されたアミノ酸を、前述した同じ方法で脱保護し、そして、次のアミノ酸を、同じ連結のスキームＡＡ：ＨＢＴＵ：ＤＩＥＰＡを用いて取り付けた。
【０１２４】
その合成の完了後、そのペプチドを、９７．５％のトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）および２．５％の水を含有する切断用カクテルを使用することで、そのレジンから切り離した。そのレジンを、その切断用カクテル中に１と２分の１時間にわたって懸濁した。その溶液を、次に、ブーフナー漏斗を用いて重力により濾過し、そして、その濾過液を、５０ｍｌの遠心分離用チューブに集めた。そのペプチドを、冷却したジエチルエーテルで沈殿させることにより単離した。遠心分離およびジエチルエーテルのデカンテーション後、その粗精製ペプチドを、ジエチルエーテルでもう一度洗浄した後、吸引乾燥機中で２時間乾燥させた。そのペプチドを、次に、脱イオン水（１０ｍｌ）中に溶解し、−８０℃で凍結させ、そして凍結乾燥した。その乾燥ペプチドは、ＨＰＬＣ精製に用いることができた。
【０１２５】
これらのペプチドの親水性の性質によって、ジエチルエーテルによるペプチドの単離は機能しなかった。それゆえに、クロロホルム抽出を必要とした。そのＴＦＡを蒸発させ、そして、得られたペプチド残基を、１０％酢酸（１５ｍｌ）中に溶解した。不純物およびスカベンジャーを、その酢酸ペプチド溶液から、その溶液をクロロホルム（３０ｍｌ）で二回洗浄することにより、除去した。その水性ペプチド溶液を、次に、−８０℃で凍結させ、そして、凍結乾燥させることで、ＨＰＬＣ精製の準備ができた、粉末にしたペプチドを結果として得た。
【０１２６】
配列番号３３および配列番号３４のペプチドは、それぞれが一つのＮ−メチルアミノ酸を含有した。そのＮ−メチルアミノ酸、ＰｙＢｒｏｐ、およびＮ−ヒドロキシベンゾトリアゾール＊Ｈ２Ｏ（ＨＯＢｔ）、ならびにＤＩＥＰＡ溶液を、そのレジンを含有する、そのＲＶ中で一緒に合わせることにより、この連結を実行した。４５分間連結させた後、そのＮ−メチルアミノ酸を次に、もう一度連結させて、完全な連結を確実にした。Ｎ−メチルアミノ酸に続く連結が、十分に完全ではないことが観察された。それゆえに、この連結を、Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチル−Ｏ−（７−アザベンゾトリアゾール−１−イル）ウロニウムヘキサフルオロホスフェート（ＨＡＴＵ）をＨＢＴＵの代わりに用いて、実行した。これによって、なお、合計で全純度の３０〜４０％になる二つの不純物を典型的に含有する、粗精製ペプチドを生じた。そのペプチドを、改変したＨＰＬＣ条件下で精製し、接近して溶出する不純物から離れた、純粋なペプチドのピークを単離した。
【０１２７】
（実施例２−非抗微生物活性）
細菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ ２５９２３）を、ペプチド（２００μＭ）、ベヒクル（トリス（Ｔｒｉｓ））、または抗生物質（エリスロマイシン；１２０μｇ／ｍｌ）を含有するウエル中に播種した。その細菌を、２時間増殖させた。その後、細菌の生存率を、ＷＳＴ−１比色生存率試験（カタログ番号１６４４８０７；Ｒｏｃｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ）を利用して決定した。ＤＭＥＭおよびＤＭＥＭ＋ＷＳＴ−１を、バックグラウンドの対照として含めた。図１Ａおよび図１Ｂに示したように、配列番号５および配列番号４７のペプチドが、抗生物質の対照と比較して、活性の欠如を明白に示した。
【０１２８】
（実施例３−生体内での防御）
マウスを、腹腔内（ＩＰ）注射によりＳ．ａｕｒｅｕｓ ２５９２３で感染させた。四時間後、配列番号１、４、５、６、４５、および４７のペプチドを、配列番号１に関しては１２ｍｇ／ｋｇおよび２４ｍｇ／ｋｇで（図２Ａおよび図２Ｂ）、配列番号５に関しては９．６ｍｇ／ｋｇで（図２Ｃ）、配列番号４７に関しては１３ｍｇ／ｋｇで（図２Ｄ）、配列番号４に関しては１２ｍｇ／ｋｇで（図２Ｅ）、配列番号６に関しては９ｍｇ／ｋｇで（図２Ｆ）、そして、配列番号４５に関しては１３ｍｇ／ｋｇで（図２Ｇ）、ＩＰ注射により投与した。感染の２４時間後、生存している動物を殺し、そして、腹腔内洗浄液をプレートにまき、ペプチド処置の有無における残存細菌数（１ｍｌ当たりのコロニー形成ユニット数（ＣＦＵ／ｍｌ））を決定した。
【０１２９】
死亡動物は、本研究におけるあらゆる動物において最も高い細菌数が割り当てられた。配列番号１、４、５、６、４５、および４７のペプチドは、図２Ａ〜２Ｇに示したように、対照と比較して、防御をあきらかに示した。
【０１３０】
（実施例４−予防的な生体内での防御）
感染２４時間前に、ペプチドを、１２ｍｇ／ｋｇ（配列番号１、図３Ａ）および１１．５ｍｇ／ｋｇ（配列番号５、図３Ｂ）で、ＩＰ注射により、投与した。マウスを、その後、ＩＰ注射によりＳ．ａｕｒｅｕｓ ２５９２３に感染させた。感染の２４時間後、生存している動物を殺し、そして、腹腔内洗浄液をプレートにまき、ペプチド処置の有無における残存細菌数（１ｍｌ当たりのコロニー形成ユニット数（ＣＦＵ／ｍｌ））を決定した。
【０１３１】
死亡動物は、本研究におけるあらゆる動物において最も高い細菌数が割り当てられた。配列番号１および配列番号５のペプチドが、防御をあきらかに示した（死亡マウス２匹（対照）に対して、死亡マウス０匹（ペプチド処置））。図３Ａおよび図３Ｂを参照のこと。
【０１３２】
以下に述べるのは、実施例１〜４の実験に関して発明者らにより得られた結果である：
発明者らは、表１で示したペプチドのアミノ酸配列を持つか、あるいは本発明の一部としてここに述べたとおりのペプチドが先天免疫を増強し得ることを示した。特に、配列番号１、４、５、６、４５、および４７のペプチドは、生体内のモデル（図２および実施例３；図３および実施例４）において示したように、感染を予防する能力および防御する能力を有していた。しかしながら、配列番号５および配列番号４７のペプチドは、実施例１および図１において示したように、抗微生物活性を欠いていた。それゆえに、配列番号５および／または配列番号４７のペプチドによる先天免疫の調節は、これらのペプチドが感染性疾患の処置のための治療剤として用いられ得ることを示す。
【０１３３】
（実施例５−マウス血液を用いた血漿ＤＰＰＩＶ活性アッセイ）
マウス血液を、心臓穿刺によりＩＣＲマウスより得、そして、ヘパリン処理した採血管中に集めた。数匹のマウスからの血液をプールして、そして、３００μＬの等量に分けた。そのペプチドを、ｐＨ５．５の酢酸緩衝食塩水中に９ｍＭの濃度になるように溶解した。この貯蔵溶液のうち３０μＬを、３００μＬの血液に加え、そして再懸濁により混合した（血液中の濃度は０．８２ｍＭ）。対照として、３０μＬのブランク酢酸緩衝食塩水を、３００μＬの血液に加えた。それぞれのペプチド群を、３回反復実験で調製し、一方、対照は６回反復実験で調製した。そのサンプルを、密閉したマイクロチューブ中で２時間にわたって３７℃でインキュベートした。インキュベーション後、血漿を、４０００ｒｃｆの遠心分離により、そのサンプルから単離した。その血漿を、ＤＰＰＩＶアッセイのため、９６ウエルアッセイプレートに移した。そのアッセイを、ＤＰＰＩＶの基質のｇｌｙ−ｐｒｏ−ｐ−ニトロアニリド（脱イオン水中で１６ｍＭ）５μＬを９５μＬの血漿（血漿中の濃度は０．８ｍＭ）に加えることにより開始し、そして、ＵＶ吸光度（４０５ｎｍ）における増大を、２０分間にわたってモニターした。ｇｌｙ−ｐｒｏ−ｐ−ニトロアニリドの酵素的切断によるｐ−ニトロアニリンの産生の速度を、ＤＰＰＩＶの活性とした（Ｄｕｒｉｎｘ Ｃ ｅｔ ａｌ．，（２００１）「血漿ジペプチジルペプチダーゼＩＶ活性のための参照値および、それらの、他の実験パラメーターとの関係」．Ｃｌｉｎ Ｃｈｅｍ Ｌａｂ Ｍｅｄ．３９（２）：１５５−９）。
【０１３４】
その結果を、表１において見ることができる。ＤＰＰＩＶの活性に対するそのペプチドの影響が観察された。結果を、食塩水の対照（１００％とする）に関して、正規化され、平均化された活性％として示す。１００％より少ないいずれもが、ＤＰＰＩＶの活性における減少を示す。
【０１３５】
本発明の一つの局面において、おおよそ２５％のＤＰＰＩＶ活性の減少、または一つの実施形態において、少なくとも２５％（言い換えると、約７５％まで）のＤＰＰＩＶ活性の減少が、活性であるとみなされた。望まれる活性の水準が、そのペプチドの用途に依存して変化し得るということを、当業者は認める。
【０１３６】
（論考）
ＣＤ２６あるいはアデノシンデアミナーゼ結合タンパク質としても知られている、ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰＩＶ）は、免疫機能を含む多様な生理的過程の主要な調節因子である。ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶは、１１０ｋＤの細胞表面の糖タンパク質であり、成熟胸腺細胞、活性化Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、マクロファージ、および上皮細胞上で主として発現している。ＤＰＰＩＶは、少なくとも二つの機能（シグナル伝達機能および蛋白分解機能）を持つ（Ｍｏｒｉｍｏｔｏ Ｃ，Ｓｃｈｌｏｓｓｍａｎ ＳＦ．Ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｏｆ ＣＤ２６ ｉｎ．−． Ｔｈｅ Ｔ−ｃｅｌｌ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ．
Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖｉｅｗ．１９９８，１６１：５５−７０）。ＤＰＰＩＶの、細胞での役割のうちの１つは、ケモカインのＮ末端からジペプチドを切断することによる、ケモカイン活性の調節を含む。ケモカインのＮＨ２末端の調節は、それらのレセプターへの結合およびその後の反応のためだけではなく、そのプロセシングされたケモカインのレセプター特異性を変えるうえでも、非常に重要である。さらに、可溶性ｒＣＤ２６は、単球の遊走反応を減少させるのに対して、Ｔ細胞の経内皮移動を増強することが実証された［Ｏｒａｖｅｃｚ， Ｔ． ｅｔ． ａｌ．，（１９９７）Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ
ｔｈｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ａｎｄ ｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｅｍｏｋｉｎｅ ＲＡＮＴＥＳ（ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｎ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ， ｎｏｒｍａｌ Ｔ ｃｅｌｌ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ａｎｄ ｓｅｃｒｅｔｅｄ） ｂｙ ｄｉｐｅｐｔｙｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ （ＣＤ２６）−ｍｅｄｉａｔｅｄ ｃｌｅａｖａｇｅ． Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８６：１８６５〜１８７２；Ｉｗａｔａ， Ｓ．， ｅｔ． ａｌ．，（１９９９）ＣＤ２６／ｄｉｐｅｐｔｉｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｒｅｇｕｌａｔｅｓ ｔｈｅ ｃｈｅｍｏｔａｘｉｓ ｏｆ Ｔ ｃｅｌｌｓ ａｎｄ ｍｏｎｏｃｙｔｅｓ ｔｏｗａｒｄ ＲＡＮＴＥＳ： ｐｏｓｓｉｂｌｅ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｆｏｒ
ｔｈｅ ｓｗｉｔｃｈ ｆｒｏｍ ｉｎｎａｔｅ ｔｏ ａｃｑｕｉｒｅｄ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ． Ｉｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１：４１７〜４２６］。これらの結果は、ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶがＴ細胞および単球の走化性反応を差別的に調節し、そして、先天免疫応答から獲得免疫応答への切替えに関係することを、示した。それゆえ、ＤＰＰＩＶの活性の減少は、それから、逆の効果を持ち、先天免疫応答およびマクロファージ遊走反応を促進する。ＤＰＰＩＶ酵素活性の薬理学的な阻害が、ＲＡの実験ラットモデルにおいて、関節炎の進行を減じうることもまた報告されており（Ｔａｎａｋａ Ｓ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉ−ａｒｔｈｒｉｔｉｃ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｔｈｅ ｎｏｖｅｌ ｄｉｐｅｐｔｉｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ＴＭＣ−２Ａ ａｎｄ ＴＳＬ−２２５． Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ １９９８，４０：２１−２６；Ｔａｎａｋａ Ｓ，ｅｔ ａｌ．，：Ｓｕｐｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ａｒｔｈｒｉｔｉｓ ｂｙ ｔｈｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ ｄｉｐｅｐｔｉｄｙｌ ｐｅｐｔｉｄａｓｅ ＩＶ． Ｉｎｔ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｐｈａｒｍａｃｏｌ
１９９７，１９：１５−２４）、ＤＰＰＩＶ活性の減少が、ある状況下では炎症を緩和し得ることを示唆している。抗炎症の役割、および、そのケモカイン活性のその調節を合わせて考えると、ＤＰＰＩＶを、これらの活性に関係する新規化合物のスクリーニングのための良好な分子ということになる。
【０１３７】
ＣＤ２６／ＤＰＰＩＶは、多様な疾患（例えば、ＡＩＤＳおよびＨＩＶという疾患の進行（Ｂｌａｚｑｕｅｚ ｅｔ ａｌ．１９９２；Ｖａｎｈａｍ ｅｔ ａｌ．１９９３；Ｓｃｈｏｌｓ ｅｔ ａｌ．１９９８ Ｏｒａｖｅｃｚ ｅｔ ａｌ．１９９５）、グレーヴズ病（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．１９８９；Ｎｉｓｈｉｋａｗａ ｅｔ ａｌ．１９９５）、および癌（Ｓｔｅｃｃａ ｅｔ ａｌ．１９９７）、ならびに糖尿病（Ｈｉｎｋｅ ｅｔ ａｌ．２０００；Ｍａｒｇｕｅｔ ｅｔ ａｌ．２０００））の病理に関係している。
【０１３８】
さらに、Ｔ細胞活性のインジケーターとしてのＣＤ２６は、関節リウマチ（Ｎａｋａｏ
ｅｔ ａｌ．，１９８９）および自己免疫性甲状腺炎（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．，１９８９）のようないくつかの自己免疫疾患と並行して変動することが示されている。ＣＤ２６は、これらの疾患の活性のレベルとよく相関するマーカーとして記述された。ＣＤ２６は、さらに、慢性進行性多発性硬化症における疾患進行のインジケーターとして研究された（Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｅｓｃｕ ｅｔ ａｌ．，１９９５）。
【０１３９】
本発明のペプチドがＤＰＰＩＶ活性を減じ得ることが示された。それゆえ、それらは、ＤＰＰＩＶに関係した状態またはＤＰＰＩＶに関連した状態のような、特定の免疫状態の処置において用いられ得、そして、一つの局面において、先天免疫、および敗血症に至る炎症のような炎症を調節し得る。
【０１４０】
前述の発明が、明快さおよび理解の目的のために、いくらか詳細に記述されたとはいえ、本開示を読むことにより、付加された特許請求の範囲におけるその発明の真の範囲から、はずれることなく、形式および詳細における多様な変更がされ得ることを、当業者は認めるものである。
【０１４１】
【表１−１】
【０１４２】
【表１−２】
【０１４３】
（表１続き）
表１のノート１：
Ｘ１は、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、またはＮ末端で置換された塩基性官能基をもつグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択される。
【０１４４】
Ｘ２は、配列番号５５のアミノ酸配列を含む、１０アミノ酸までの単離されたペプチドを含め、Ｖ、Ｉ、Ｋ、Ｐ、およびＨからなる群より選択される。
【０１４５】
表１のノート２：
Ｘ１は、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｏ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、またはＮ末端で置換された塩基性官能基をもつグリシンを基本とする化合物（例えば、Ｎｌｙｓ）、ｈＳｅｒ、Ｖａｌ（ベータＯＨ）からなる群より選択され、そしてＸ２は、Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ｋ、Ｐ、Ｇ、Ｈ、Ｒ、Ｓ、Ｏ、Ｄａｂ、Ｄｐｒ、Ｃｉｔ、Ｈｃｉ、Ａｂｕ、Ｎｖａ、Ｎｌｅからなる群より選択され、そしてＸ２は、Ｎ−メチル化され得、そしてＸ３は、Ｉ、Ｖ、Ｐからなる群より選択され、一つの実施形態において、Ｘ３は、Ｎ−メチル化されていない。一つの実施形態において、その単離されたペプチドは、１０アミノ酸までのアミノ酸配列であり得るが、配列番号２でも配列番号１７でもない。
【０１４６】
表１のノート３：
Ｘ１、Ｘ２およびＸ３は、配列番号５６においてのとおりに定義され、そして「ａ」は、Ｓ、Ｐ、Ｉ、Ｒ、Ｃ、Ｔ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｃ、Ｍ、およびＦからなる群より選択されるかまたは上記配列を含む１０アミノ酸までの単離されたペプチドである。
【０１４７】
表１のノート４：
Ｘ１Ｘ２Ｘ３Ｐは、配列番号５６において定義されるとおりであり、そして「ｂ」はＡ、Ａ＊、Ｇ、Ｓ、Ｌ、Ｆ、Ｋ、Ｃ、Ｉ、Ｖ、Ｔ、Ｙ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、およびＭからなる群より選択されるが、一つの実施形態においてＰではない。一つの実施形態において、単離されたペプチドは、配列番号５８を含むが配列番号１７は含まない、１０アミノ酸までのペプチドである。
【０１４８】
表１のノート５：
Ｘ１、Ｘ２およびＸ３は、配列番号５６において定義されるとおりであり、そして「ａ１」は、Ｋ、Ｉ、Ｒ、Ｈ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、およびＧからなる群より選択され、そして「ａ２」は、Ｓ、Ｐ、Ｒ、Ｔ、Ｈ、Ｋ、Ｏ、Ｌ、Ｖ、Ａ、Ｇ、Ｓ、およびＩからなる群より選択される。一つの実施形態において、「ａ１」は、アセチル化されていないか、またはａ１がＫであるとき、Ｋはアセチル化されていないか、または配列番号２ではない。一つの実施形態において、その単離されたペプチドは、配列番号５９を含む１０アミノ酸までを含む。
【０１４９】
表１のノート６：
Ｘ１、Ｘ２およびＸ３は、配列番号５６において定義されるとおりであり、そして、「ａ」は、Ｓ、Ｒ、Ｋ、Ｈ、Ｏ、Ｔ、Ｉ、Ｌ、Ｖ、Ａ、およびＧからなる群より選択され、そして、「ｂ」はＡ、Ｖ、Ｉ、Ｌ、Ｇ、Ｋ、Ｈ、Ｒ、Ｏ、Ｓ、Ｔ、およびＦからなる群より選択されるか、または配列番号６０を含む１０アミノ酸までのペプチドである。
【０１５０】
（引用された参考文献）
【０１５１】
【表２】
【０１５２】
【表３】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
本願明細書に記載された発明。
【請求項１】
本願明細書に記載された発明。
【図１Ａ】
【図１Ｂ】
【図２Ａ】
【図２Ｂ】
【図２Ｃ】
【図２Ｄ】
【図２Ｅ】
【図２Ｆ】
【図２Ｇ】
【図３Ａ】
【図３Ｂ】
【図１Ｂ】
【図２Ａ】
【図２Ｂ】
【図２Ｃ】
【図２Ｄ】
【図２Ｅ】
【図２Ｆ】
【図２Ｇ】
【図３Ａ】
【図３Ｂ】
【公開番号】特開２０１２−２２３１９９（Ｐ２０１２−２２３１９９Ａ）
【公開日】平成２４年１１月１５日（２０１２．１１．１５）
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願２０１２−１７５９６１（Ｐ２０１２−１７５９６１）
【出願日】平成２４年８月８日（２０１２．８．８）
【分割の表示】特願２００８−５３３８３８（Ｐ２００８−５３３８３８）の分割
【原出願日】平成１８年１０月４日（２００６．１０．４）
【出願人】（５０８１０２３７０）イニメックス ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド (3)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２４年１１月１５日（２０１２．１１．１５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１２−１７５９６１（Ｐ２０１２−１７５９６１）
【出願日】平成２４年８月８日（２０１２．８．８）
【分割の表示】特願２００８−５３３８３８（Ｐ２００８−５３３８３８）の分割
【原出願日】平成１８年１０月４日（２００６．１０．４）
【出願人】（５０８１０２３７０）イニメックス ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド (3)
【Ｆターム（参考）】
[ Back to top ]