【課題】本発明は、新規の免疫原性ＨＩＶポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供することを課題とする。
【解決手段】本発明は、新規の免疫原性ＨＩＶポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供する。免疫、パッケージング細胞株の産生、およびＨＩＶポリペプチドの産生を含む適用におけるポリヌクレオチドの使用もまた、提供される。抗原性ＨＩＶポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが提供され、これらのポリヌクレオチドおよびそれら由来のポリペプチド産物の使用（免疫原性組成物の処方およびそれらの使用を含む）も提供される。特定の実施形態において、本発明は、ＨＩＶポリペプチドをコードする、合成ポリヌクレオチドおよび／または発現カセットに関する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
発現カセットを含む核酸であって、該発現カセットは、以下：
（ａ）ＨＩＶ Ｇａｇポリペプチドであって、該Ｇａｇポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、および、配列番号１６からなる群より選択される配列の全長に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｇａｇポリペプチド；
（ｂ）ＨＩＶ Ｇａｇポリペプチドであって、該Ｇａｇポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、および、配列番号５５からなる群より選択される配列の全長に対して少なくとも９８％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｇａｇポリペプチド；
（ｃ）ＨＩＶ Ｇａｇポリペプチドであって、該Ｇａｇポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号１７の全長に対して少なくとも９５％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｇａｇポリペプチド；
（ｄ）ＨＩＶ Ｎｅｆポリペプチドであって、該Ｎｅｆポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号３３、および、配列番号３４からなる群より選択される配列の全長に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｎｅｆポリペプチド；
（ｅ）ＨＩＶ Ｐｒｏｔポリペプチドであって、該Ｐｒｏｔポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号３９の全長に対して少なくとも９８％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｐｒｏｔポリペプチド；
（ｆ）ＨＩＶ Ｔａｔポリペプチドであって、該Ｔａｔポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号４２、配列番号４３、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５６、および、配列番号５７からなる群より選択される配列の全長に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｔａｔポリペプチド；
（ｇ）ＨＩＶ Ｒｅｖポリペプチドであって、該Ｒｅｖポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号４５または配列番号４５の全長に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｒｅｖポリペプチド；
（ｈ）ＨＩＶ Ｖｉｆポリペプチドであって、該Ｖｉｆポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号５８の少なくとも３０個の連続する塩基対に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｖｉｆポリペプチド；
（ｉ）ＨＩＶ Ｖｐｒポリペプチドであって、該Ｖｐｒポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号５９の少なくとも２０個の連続する塩基対に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｖｐｒポリペプチド；
（ｊ）ＨＩＶ Ｖｐｕポリペプチドであって、該Ｖｐｕポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号６０の少なくとも２０個の連続する塩基対に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｖｐｕポリペプチド；ならびに、
（ｋ）ＨＩＶ Ｅｎｖポリペプチドであって、該Ｅｎｖポリペプチドをコードする該ポリヌクレオチド配列が、配列番号６１、配列番号６２、配列番号６３、および、配列番号６４からなる群より選択される配列の全長に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する配列を含む、ＨＩＶ Ｅｎｖポリペプチド；
からなる群から選択されるポリペプチドを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む、核酸。
【請求項２】
選択された宿主細胞における使用のための組換え発現系である請求項１に記載の核酸であって、ここで、該組換え発現系は、請求項１に記載の発現カセットを含み、ここで、前記ポリヌクレオチド配列が、該選択された宿主細胞における該ポリヌクレオチドの発現と適合する制御エレメントに作動可能に連結されている、核酸。
【請求項３】
請求項２に記載の組換え発現系であって、前記制御エレメントが、転写プロモーター、転写エンハンサーエレメント、転写終結シグナル、ポリアデニル化配列、翻訳の開始の最適化のための配列、および翻訳終結配列からなる群より選択される、組換え発現系。
【請求項４】
請求項２に記載の組換え発現系であって、前記転写プロモーターが、ＣＭＶ、ＣＭＶおよびイントロンＡ、ＳＶ４０、ＲＳＶ、ＨＩＶ−Ｌｔｒ、ＭＭＬＶ−ｌｔｒ、ならびに、メタロチオネインからなる群より選択される、組換え発現系。
【請求項５】
請求項１に記載の発現カセットを含む単離された細胞であって、前記ポリヌクレオチド配列が、前記選択された細胞における発現に適合する制御エレメントに作動可能に連結されている、細胞。
【請求項６】
哺乳動物細胞、昆虫細胞、細菌細胞、酵母細胞、植物細胞、抗原提示細胞、始原細胞、不死化細胞、および、腫瘍由来細胞からなる群から選択される、請求項５に記載の単離された細胞。
【請求項７】
ＨＩＶポリペプチド配列を含むポリペプチドを産生するための方法であって、該方法が、請求項５に記載の単離された細胞を、該ポリペプチドを産生するための条件下でインキュベートする工程を包含する、方法。
【請求項８】
哺乳動物被験体での免疫応答惹起における使用のためのベクターである請求項１に記載の核酸であって、該ベクターが、請求項１に記載の発現カセットを含み、そして前記ポリヌクレオチド配列が、該被験体における該ポリヌクレオチドの発現と適合する制御エレメントに作動可能に連結されている、核酸。
【請求項９】
被験体のＤＮＡ免疫化のための組成物であって、該被験体における前記発現カセットの発現と適合する条件下で該被験体に導入されるベクターであることを特徴とする請求項８に記載のベクターを含む、組成物。
【請求項１０】
前記ベクターが：
（ａ）非ウイルスベクターであるか；
（ｂ）リポソーム調製物にカプセル化されているか；または、
（ｃ）ウイルスベクターである、
請求項９に記載の組成物。
【請求項１１】
前記ベクターが特定のキャリアーを使用して送達される、請求項９に記載の組成物。
【請求項１２】
請求項１１に記載の組成物であって、前記ベクターが、金またはタングステンの粒子上にコーティングされ、そして該コーティングされた粒子が、遺伝子銃を使用して前記被験体に送達される、組成物。
【請求項１３】
前記ベクターがウイルスベクターであり、該ウイルスベクターが、レトロウイルスベクター、アルファウイルスベクター、および、レンチウイルスベクターからなる群から選択される、請求項９に記載の組成物。
【請求項１４】
前記被験体が、哺乳動物である、請求項９に記載の組成物。
【請求項１５】
前記哺乳動物が、ヒトである、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
前記該被験体の細胞に、請求項１０に記載のベクターを、前記ポリヌクレオチドの発現および前記ポリペプチドの産生を可能にする条件下で、トランスフェクトし、それによって、該ポリペプチドに対する免疫学的応答を誘発することを特徴とする、請求項９に記載の組成物。
【請求項１７】
前記トランスフェクションが、エキソビボで行われ、そして前記トランスフェクトされた細胞が、前記被験体に再導入される、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１８】
前記トランスフェクションが、前記被験体においてインビボで行われる、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１９】
前記免疫応答が、体液性免疫応答である、請求項１６に記載の組成物。
【請求項２０】
前記免疫応答が、細胞性免疫応答である、請求項１６に記載の組成物。
【請求項２１】
請求項１６に記載の組成物であって、前記ベクターが、筋肉内、粘膜内、鼻腔内、皮下、皮内、経皮、膣内、直腸内、経口、または静脈内で投与されることを特徴とする、組成物。

【図２ａ】

【図２ｂ】

【図２ｃ】

【図４】

【図５】

【図６ａ】

【図６ｂ】

【図７ａ】

【図７ｂ】

【図８ａ】

【図８ｂ】

【図９ａ】

【図９ｂ】

【図１０ａ】

【図１０ｂ】

【図１１ａ】

【図１１ｂ】

【図１２ａ】

【図１２ｂ】

【図１３ａ】

【図１３ｂ】

【図１４ａ】

【図１４ｂ】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１ａ】

【図３１ｂ】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８】

【図３９】

【図４０】

【図４１】

【図４２】

【図４３】

【図４４】

【図４５】

【図４６】

【図４７】

【図４８】

【図４９】

【図５０】

【図５１ａ】

【図５１ｂ】

【図５２ａ】

【図５２ｂ】

【図５３】

【図５４】

【図５５】

【図５６】

【図５７】

【図５８】

【図５９】

【図６０】

【図６１】

【図６２】

【図６３】

【図６４】

【図６５】

【図６６】

【図６７】

【図６８】

【図１ａ】

【図１ｂ】

【図１ｃ】

【図１ｄ】

【図３】

【公開番号】特開２００９−２５４３８３（Ｐ２００９−２５４３８３Ａ）
【公開日】平成２１年１１月５日（２００９．１１．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−１８１００１（Ｐ２００９−１８１００１）
【出願日】平成２１年８月３日（２００９．８．３）
【分割の表示】特願２００３−５２５５８０（Ｐ２００３−５２５５８０）の分割
【原出願日】平成１４年７月５日（２００２．７．５）
【出願人】（５９１０７６８１１）ノバルティス　バクシンズ　アンド　ダイアグノスティックス，インコーポレーテッド (265)
【Ｆターム（参考）】