水晶体落屑症候群および緑内障の診断、予後診断および治療における使用のためのマーカーとしての染色体１５Ｑ２４上の遺伝的変異
本発明は、緑内障および水晶体落屑症候群を含む眼疾患に対する感受性を診断する方法に関する。本発明は、水晶体落屑症候群および緑内障に対する増加したまたは減少した感受性を診断する方法、ならびにリスクアセスメント、治療および予後診断のための方法を提供する。本発明は、さらに、本発明の方法の使用のためのキットに関する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの眼症状に対する感受性を判定する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程であって、前記少なくとも１つの多型マーカーの異なる対立遺伝子は、ヒトにおける少なくとも１つの症状に対する異なる感受性と関連する工程と、
前記核酸配列データから水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの症状に対する感受性を判定する工程と、を含む方法。
【請求項２】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも２つの多型マーカーについての核酸配列データを入手する工程を含む請求項１記載の方法。
【請求項３】
感受性の判定は、前記核酸配列データを、前記ヒトＬＯＸＬ１遺伝子の多型マーカーと前記少なくとも１つの症状に対する感受性との間の相関データを含むデータベースと比較する工程を含む請求項１または請求項２記載の方法。
【請求項４】
前記データベースは、前記ＬＯＸＬ１遺伝子の多型マーカーについての前記少なくとも１つの症状に対する感受性の少なくとも１つのリスク基準を含む請求項３記載の方法。
【請求項５】
前記データベースは、前記多型マーカーについての前記少なくとも１つの症状の少なくとも１つのリスク基準を含む参照表を含む請求項３記載の方法。
【請求項６】
核酸配列データを入手する工程は、前記ヒト個体から生物学的試料を入手する工程と、前記試料中の核酸における前記少なくとも１つの多型マーカーの配列を分析する工程と、を含む請求項１〜５いずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つの多型マーカーの配列を分析する工程は、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項８】
前記核酸配列データを入手する工程は、既存の記録から得た核酸配列情報を入手する工程を含む請求項１〜５いずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記個体、前記個体の保護者、遺伝医療提供者、医師、医療機関、および医療保険会社からなる群から選択される少なくとも１つの実体に対して前記感受性を報告する工程をさらに含む請求項１〜８いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６に記載されたマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１〜９いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１〜１０いずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項１０または請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される請求項１〜１２いずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）である請求項１〜１３いずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの眼症状に対する感受性を判定する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも２つの多型マーカーの両方の対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程と、
前記配列データに基づいた少なくとも１つのハプロタイプの同一性を判定する工程と、
前記ハプロタイプのデータから水晶体落屑症候群および緑内障から選択された少なくとも１つの症状に対する感受性を判定する工程と、を含む方法。
【請求項１６】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプは、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する増加した感受性を示す請求項１〜１５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１７】
前記増加した感受性は、少なくとも１．５（少なくとも２．０、少なくとも２．５、少なくとも３．０、少なくとも３．５、および少なくとも４．０を含む）の相対リスクまたはオッズ比によって特徴付けられる請求項１６記載の方法。
【請求項１８】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ２１６５２４１ 対立遺伝子Ｔ、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇまたはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇである請求項１６または請求項１７記載の方法。
【請求項１９】
（ａ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに／または
（ｂ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
の存在は、水晶体落屑症候群または緑内障の増加した感受性を示す請求項１５または請求項１６記載の方法。
【請求項２０】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する減少した感受性を示す請求項１〜１５いずれか１項に記載の方法。
【請求項２１】
ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｔおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ａの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項１７記載の方法。
【請求項２２】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ａの存在によって特徴付けられるハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群または緑内障の発症についての減少した感受性を示す請求項１５記載の方法。
【請求項２３】
前記減少した感受性は、０．７未満（０．６未満、０．５未満、０．４未満、０．３５未満、０．３未満、および０．２５未満を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項１７〜１９いずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を診断する方法であって、前記方法は、
前記個体から得られた核酸試料、または前記個体から得た遺伝子型データセットにおける少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連し、かつ、前記少なくとも１つの対立遺伝子の存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示す方法。
【請求項２５】
前記少なくとも１つの多型マーカーの両方の対立遺伝子を判定する工程を含む請求項２１記載の方法。
【請求項２６】
前記個体における少なくとも１つのハプロタイプの同一性を評価する工程をさらに含み、前記少なくとも１つのハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示す請求項２２記載の方法。
【請求項２７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６に記載されたマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項２１〜２３いずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項２１〜２４いずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項２１〜２５いずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される、請求項２１〜２６いずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）である請求項２１〜２７いずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
前記ハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、または
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、の存在によって特徴付けられる請求項２３記載の方法。
【請求項３３】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する増加した感受性を示す請求項２１〜２９いずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
前記増加した感受性は、少なくとも１．５（少なくとも２．０、少なくとも２．５、少なくとも３．０、少なくとも３．５、および少なくとも４．０を含む）の相対リスクまたはオッズ比によって特徴付けられる請求項３０記載の方法。
【請求項３５】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ２１６５２４１ 対立遺伝子Ｔ、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇまたはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇである請求項３０または請求項３１記載の方法。
【請求項３６】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに／または
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、の存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症についての増加した感受性を示す請求項３０〜３２いずれか１項に記載の方法。
【請求項３７】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項２１〜２８いずれか１項に記載の方法。
【請求項３８】
ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｔおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ａの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項３４記載の方法。
【請求項３９】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ａの存在によって特徴付けられるハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症に対する減少した感受性を示す請求項３４記載の方法。
【請求項４０】
前記減少した感受性は、０．７未満（０．６未満、０．５未満、０．４未満、０．３５未満、０．３未満、および０．２５未満を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項３４〜３６いずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、水晶体落屑症候群および／または緑内障の臨床診断によってさらに特徴付けられる請求項２１〜３７いずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する前記症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少、のうち少なくとも１つの存在によって特徴付けられる請求項２１〜３８いずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少、の少なくとも１つによって特徴付けられる請求項３９記載の方法。
【請求項４４】
前記ヒト個体は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子をさらに有し、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項１〜４０いずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
前記緑内障は、落屑緑内障である請求項１〜４１いずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの眼症状に対する感受性を診断する方法であって、前記方法は、
ヒト個体の少なくとも１つのコードされたＬＯＸＬ１タンパク質についてのＬＯＸＬ１アミノ酸配列データを入手する工程と、
前記ＬＯＸＬ１アミノ酸配列に関連する少なくとも１つの多型部位を同定する工程であって、前記少なくとも１つの多型部位の異なるアミノ酸は、ヒトにおける少なくとも１つの症状に対する異なる感受性と関連する工程と、
前記アミノ酸配列データから得た水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの症状に対する感受性を診断する工程と、を含む方法。
【請求項４７】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のアルギニンおよび／または位置１５３のグリシンの存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する増加した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項４８】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のアルギニンおよび位置１５３のグリシンの存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する増加した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項４９】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のロイシンおよび／または位置１５３のアスパラギン酸の存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する減少した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項５０】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のロイシンおよび位置１５３のアスパラギン酸の存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する減少した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項５１】
個体における水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状の感受性を診断する方法であって、前記方法は、
前記個体から入手した核酸試料中の少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つのマーカーは、ＬＯＸＬ１ ＬＤブロック内に位置するマーカー群から選択され、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状の感受性は、前記少なくとも１つの対立遺伝子の同一性と相関する方法。
【請求項５２】
前記少なくとも１つの多型マーカーの両方の対立遺伝子の判定を含む請求項４８記載の方法。
【請求項５３】
前記個体における少なくとも１つのハプロタイプの同一性の評価をさらに含み、前記少なくとも１つのハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示す請求項４９記載の方法。
【請求項５４】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表４に記載されたマーカー群、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカー群から選択される請求項４８〜５０いずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項４８〜５１いずれか１項に記載の方法。
【請求項５６】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項５１または請求項５２記載の方法。
【請求項５７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される請求項４８〜５３いずれか１項に記載の方法。
【請求項５８】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）である請求項４８〜５４いずれか１項に記載の方法。
【請求項５９】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する増加した感受性を示す請求項４８〜５５いずれか１項に記載の方法。
【請求項６０】
前記増加した感受性は、少なくとも１．２（少なくとも１．５、少なくとも２．０、少なくとも２．５、少なくとも３．０、少なくとも３．５、および少なくとも４．０を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項５６記載の方法。
【請求項６１】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇもしくはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇ、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカー対立遺伝子である請求項５６または請求項５７記載の方法。
【請求項６２】
（ａ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに／または
（ｂ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
の存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症の増加した感受性を示す請求項５６〜５８いずれか１項に記載の方法。
【請求項６３】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項４８〜５５いずれか１項に記載の方法。
【請求項６４】
ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｔおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ａの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項６０記載の方法。
【請求項６５】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ａの存在によって特徴付けられるハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症の減少した感受性を示す、請求項６０記載の方法。
【請求項６６】
前記減少した感受性は、０．７未満（０．６未満、０．５未満、０．４未満、０．３５未満、０．３未満、および０．２５未満を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項６０〜６２いずれか１項に記載の方法。
【請求項６７】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、水晶体落屑症候群および／または緑内障の臨床診断によってさらに特徴付けられる請求項４８〜６３いずれか１項に記載の方法。
【請求項６８】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少、の少なくとも１つの存在によって特徴付けられる、請求項４８〜６４いずれか１項に記載の方法。
【請求項６９】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少、の少なくとも１つによって特徴付けられる請求項６５記載の方法。
【請求項７０】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子をさらに有し、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項４８〜６６いずれか１項に記載の方法。
【請求項７１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性の評価における使用のためのマーカーを同定する方法であって、前記方法は、
（ｃ）ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型を同定する工程と、
（ｄ）水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された、またはこれらに対する感受性を有する個体の試料、ならびに対照試料の遺伝子型の状態を判定する工程と、を含み、
前記対照試料における少なくとも１つの対立遺伝子の頻度と比較した、水晶体落屑症候群と診断された、またはこれに対する感受性を有する個体における、少なくとも１つの多型の前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度の有意差は、前記少なくとも１つの多型が水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性の評価に有用であることを示す方法。
【請求項７２】
前記少なくとも１つの多型は、連鎖不平衡にあり、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）に対して０．２超のｒ２値によって特徴付けられる請求項６８記載の方法。
【請求項７３】
前記対照試料における前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度と比較した、水晶体落屑症候群と診断された、またはこれに対する感受性を有する個体の前記少なくとも１つの多型の少なくとも１つの対立遺伝子の頻度の増加は、前記少なくとも１つの多型が水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する増加した感受性の評価に有用であることを示す、請求項６８または請求項６９記載の方法。
【請求項７４】
前記対照試料における前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度と比較した、水晶体落屑症候群と診断された、またはこれに対する感受性を有する個体の前記少なくとも１つの多型の前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度の減少は、前記少なくとも１つの多型は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する減少した感受性、またはこれらに対する保護の評価に有用であることを示す請求項６８または請求項６９記載の方法。
【請求項７５】
水晶体落屑症候群および／または緑内障のリスクを有する、または水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断されたヒト個体から入手した核酸試料の遺伝子型を同定する方法であって、前記試料における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性を判定する工程を含み、前記マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択され、かつ、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性を示す方法。
【請求項７６】
前記マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）から選択される請求項７２記載の方法。
【請求項７７】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のマーカー間のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって判定される請求項７２または請求項７３記載の方法。
【請求項７８】
前記試料は、血液試料または頬スワブである請求項７２〜７４いずれか１項に記載の方法。
【請求項７９】
遺伝子型の同定は、前記少なくとも１つの多型マーカーに隣接するヌクレオチドプライマー対を使用し、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって前記核酸試料を増幅する工程を含む請求項７２〜７５いずれか１項に記載の方法。
【請求項８０】
遺伝子型の同定は、対立遺伝子特異的なプローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的なプライマー伸張、対立遺伝子特異的な増幅、核酸配列判定、５’−エキソヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖ＤＮＡ高次構造解析から選択される工程を使用して行われる請求項７２〜７６いずれか１項に記載の方法。
【請求項８１】
前記工程は、対立遺伝子特異的なプローブハイブリダイゼーションを含む請求項７７記載の方法。
【請求項８２】
前記工程は、核酸配列判定を含む請求項７７記載の方法。
【請求項８３】
前記核酸配列判定は、ＤＮＡ配列判定である請求項７７記載の方法。
【請求項８４】
（ａ）オリゴヌクレオチドプローブと前記核酸の特異的なハイブリダイゼーションのための条件下で、前記核酸のコピーを、検出オリゴヌクレオチドプローブおよびエンハンサーオリゴヌクレオチドプローブと接触させる工程であって、
（ｂ）前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、長さが５〜１００ヌクレオチドであり、ヌクレオチド配列が少なくとも１つの多型部位を含む配列番号８４によって与えられる、前記核酸の第１の分節に、（ストリンジェントな条件下で）特異的にハイブリダイズし、
（ｃ）前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、その３’末端に検出可能な標識、およびその５’末端に消光部分を含み、
（ｄ）前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、長さが５〜１００ヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドプローブに対して５’の前記ヌクレオチド配列の第２の分節と相補的であり、そのため前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、両方のオリゴヌクレオチドが前記核酸にハイブリダイズされると、前記検出オリゴヌクレオチドプローブに対して３’に位置し、
（ｅ）１つの塩基間隙が、前記第１の分節と前記第２の分節との間に存在し、そのため、前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記エンハンサーオリゴヌクレオチドプローブが両方前記核酸にハイブリダイズされた場合、１つの塩基間隙が前記オリゴヌクレオチド間に存在する工程と、
（ｆ）前記核酸を、前記検出プローブが前記核酸にハイブリダイズされた場合、前記検出可能な標識を、前記検出プローブの３’末端から切断し、フリーの検出可能な標識を放出するエンドヌクレアーゼで処理する工程と、
（ｇ）フリーの検出可能な標識を測定する工程であって、前記フリーの検出可能な標識の存在は、前記検出プローブが前記核酸の前記第１の分節に特異的にハイブリダイズすることを示し、かつ、前記多型部位の配列は前記検出プローブの補完物であることを示す工程と、を含む請求項７２〜８０いずれか１項に記載の方法。
【請求項８５】
前記核酸のコピーは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）による増幅によって与えられる請求項８１記載の方法。
【請求項８６】
前記感受性は、増加した感受性である請求項７２〜８２いずれか１項に記載の方法。
【請求項８７】
前記感受性は、減少した感受性である請求項７２〜８２いずれか１項に記載の方法。
【請求項８８】
前記個体から得た試料中の少なくとも１つのバイオマーカーを評価する工程をさらに含む請求項１〜８４いずれか１項に記載の方法。
【請求項８９】
前記試料は血液試料である請求項８５記載の方法。
【請求項９０】
前記試料は、涙液である請求項８５記載の方法。
【請求項９１】
前記バイオマーカーは、ＬＯＸＬ１タンパク質である請求項８５〜８７いずれか１項に記載の方法。
【請求項９２】
前記個体の全体のリスクアセスメント、診断、または予後診断を行うための非遺伝的情報を分析する工程をさらに含む請求項１〜８８いずれか１項記載の方法。
【請求項９３】
前記非遺伝的情報は、年齢、性別、民族性、社会経済的な状態、以前の疾病診断、被験者の病歴、水晶体落屑症候群および／または緑内障の家族歴、生化学的測定結果、および臨床的測定結果から選択される請求項８９記載の方法。
【請求項９４】
前記個体から得た試料におけるＬＯＸＬ１の発現レベルを分析する工程をさらに含む請求項１〜９０いずれか１項に記載の方法。
【請求項９５】
前記試料は血液試料である請求項９１記載の方法。
【請求項９６】
前記試料は核酸試料である請求項９１記載の方法。
【請求項９７】
前記試料は、ｍＲＮＡを含む請求項９３記載の方法。
【請求項９８】
発現は、前記試料におけるＬＯＸＬ１タンパク質レベルを測定することによって決定される請求項９１または請求項９２記載の方法。
【請求項９９】
発現は、前記試料におけるＬＯＸＬ１ ｍＲＮＡレベルを測定することによって決定される請求項９１〜９４いずれか１項に記載の方法。
【請求項１００】
ＬＯＸＬ１の減少した発現レベルは、水晶体落屑症候群または緑内障に対する増加した感受性を示す請求項９１〜９６いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状を予防および／または寛解するための治療薬に対する反応の可能性について個体を評価する方法であって、
前記個体から入手した核酸試料における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、前記ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する多型マーカーから選択され、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性は、前記治療薬に対する陽性反応の可能性を示す方法。
【請求項１０２】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、またはこれらと連鎖不平衡にあるマーカーである請求項９８記載の方法。
【請求項１０３】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少、のうち少なくとも１つの存在によって特徴付けられる請求項９８または請求項９９記載の方法。
【請求項１０４】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少、のうち少なくとも１つによって特徴付けられる請求項１００記載の方法。
【請求項１０５】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子を有することによって特徴付けられ、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項９８〜１０１いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０６】
前記治療薬は、プロスタグランジン類似体、プロスタミド、α２ アドレナリン作動薬、炭酸脱水酵素阻害薬、β−遮断薬、コリン作動薬から選択される請求項９８〜１０２いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０７】
前記治療薬は、ラタノプロスト、トラボプロスト、ウノプロストン、ビマトプロスト、ブリモニジン、アプラクロニジン、ドルゾラミド、ブリンゾラミド、アセタゾラミド、メタゾラミド、ベタキソロール、カルテオロール、レボブノロール、メチプラノロール、チモロール、ピロカルピン、カルバコール、エコチオパートおよびエピネフリンから選択される請求項９８〜１０３いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０８】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状を経験している個体、または水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された個体の予後診断を予測する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程であって、前記少なくとも１つの多型マーカーの異なる対立遺伝子は、ヒトにおける前記少なくとも１つの症状に対する異なる感受性と関連する工程と、
前記核酸配列データから前記個体の予後診断を予測する工程と、を含む方法。
【請求項１０９】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも２つの多型マーカーについての核酸配列データを入手する工程を含む請求項１０５記載の方法。
【請求項１１０】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６に記載されたマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１０５または請求項１０６記載の方法。
【請求項１１１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１０５〜１０７いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１２】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少のうち少なくとも１つの存在によって特徴付けられる請求項１０５〜１０８いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１３】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少のうち少なくとも１つによって特徴付けられる請求項１０９記載の方法。
【請求項１１４】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子を有することによって特徴付けられ、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項１０５〜１１０いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１５】
水晶体落屑症候群および／または緑内障についての治療を経験している個体の治療成績を予測する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程であって、前記少なくとも１つの多型マーカーの異なる対立遺伝子は、ヒトにおける前記少なくとも１つの症状に対する異なる感受性に関連する工程と、
前記核酸配列データから前記個体の治療成績を予測する工程と、を含む方法。
【請求項１１６】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子と関連する少なくとも２つの多型マーカーについての核酸配列データを入手する工程を含む請求項１１２記載の方法。
【請求項１１７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６記載のマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項ｌｌ２または請求項１１３記載の方法。
【請求項１１８】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１１２〜１１４いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１９】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子を有することによって特徴付けられ、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項１１２〜１１５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１２０】
ヒト個体の水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を評価するキットであって、
前記キットは、前記個体のゲノムにおける少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を選択的に検出するための試薬を含み、
前記多型マーカーは、表４、表６および表６ａに記載された多型マーカー、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択され、かつ、前記少なくとも１つの対立遺伝子の存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示すキット。
【請求項１２１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１１７記載のキット。
【請求項１２２】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項１１７または請求項１１８記載のキット。
【請求項１２３】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０６）である請求項１１７〜１１９いずれか１項に記載のキット。
【請求項１２４】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇからなる群から選択される請求項１１７〜１２０いずれか１項記載のキット。
【請求項１２５】
前記試薬は、前記少なくとも１つの多型マーカーを含む前記個体のゲノム断片にハイブリダイズする少なくとも１つの近接するオリゴヌクレオチド、バッファー、および検出可能な標識を含む請求項１１７〜１２１いずれか１項記載のキット。
【請求項１２６】
前記試薬は、前記被験者から入手したゲノムの核酸分節の逆ストランドにハイブリダイズする少なくとも１つの対のオリゴヌクレオチドを含み、各オリゴヌクレオチドプライマー対は、１つの多型マーカーを含む前記個体のゲノムの断片を選択的に増幅するように設計され、かつ、前記断片は、大きさが少なくとも３０塩基対である請求項１１７〜１２２いずれか１項に記載のキット。
【請求項１２７】
前記少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、前記個体のゲノムと完全に相補的である請求項１２２または請求項１２３記載のキット。
【請求項１２８】
前記オリゴヌクレオチドは、長さが約１８〜約５０ヌクレオチドである請求項１２２〜１２４いずれか１項に記載のキット。
【請求項１２９】
前記オリゴヌクレオチドは長さが２０〜３０ヌクレオチドである請求項１２２〜１２５いずれか１項に記載のキット。
【請求項１３０】
前記キットは、
（ａ）長さが５〜１００ヌクレオチドである検出オリゴヌクレオチドプローブ、
（ｂ）長さが５〜１００ヌクレオチドであるエンハンサーオリゴヌクレオチドプローブ、および、
（ｃ）エンドヌクレアーゼ酵素、を含み、
前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、ヌクレオチド配列が少なくとも１つの多型部位を含む配列番号８４によって与えられる核酸の第１の分節に特異的にハイブリダイズし、かつ、
前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、その３’末端に検出可能な標識、およびその５’末端に消光部分を含み、かつ
前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、長さが５〜１００ヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドプローブに対して５’のヌクレオチド配列の第２の分節に相補的であり、そのため前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、両方のオリゴヌクレオチドが前記核酸にハイブリダイズされると、前記検出オリゴヌクレオチドプローブに対して３’に位置し、かつ、
１つの塩基間隙が前記第１の分節と前記第２の分節との間に存在し、そのため、前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記エンハンサーオリゴヌクレオチドプローブが両方前記核酸にハイブリダイズされた場合、１つの塩基間隙が前記オリゴヌクレオチド間に存在し、かつ、
前記エンドヌクレアーゼによる前記核酸の処理は、前記検出プローブが前記核酸にハイブリダイズされた場合、前記検出プローブの３’末端から前記検出可能な標識を切断して、フリーの検出可能な標識を放出する、請求項１１７〜１２６いずれか１項に記載のキット。
【請求項１３１】
水晶体落屑症候群または緑内障に対する感受性を診断および／または評価するための診断薬の製造におけるオリゴヌクレオチドプローブの使用であって、前記プローブは、ヌクレオチド配列が少なくとも１つの多型部位を含む配列番号８４によって与えられる核酸の分節にハイブリダイズし、前記分節は長さが１５〜５００ヌクレオチドである使用。
【請求項１３２】
前記多型部位は、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にある多型から選択される請求項１２８記載の使用。
【請求項１３３】
前記多型部位は、ｒｓ１０４８６６１またはｒｓ３８２５９４２である請求項１２８または請求項１２９記載の使用。
【請求項１３４】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性を判定するためのコンピューターが実行可能な命令を有するコンピューター可読媒体であって、
前記コンピューター可読媒体は、少なくとも１つの多型マーカーを示すデータと、
前記コンピューター可読媒体上に保存され、かつ、前記少なくとも１つの多型マーカーについて水晶体落屑症候群および／または緑内障を発症するリスクを判定するためにプロセッサによって実行されるように適合されたルーチンと、を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ＬＯＸＬ１遺伝子に関連するコンピューター可読媒体。
【請求項１３５】
前記コンピューター可読媒体は、少なくとも２つの多型マーカーを示すデータを含む請求項１３１記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３６】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１３１または請求項１３２記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１３１〜１３３いずれか１項に記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３８】
２以上の多型マーカーを含む少なくとも１つのハプロタイプを示すデータをさらに含む請求項１３１〜１３４いずれか１項に記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３９】
ヒト個体における水晶体落屑症候群または緑内障の遺伝的指標を判定する装置であって、
プロセッサと、
ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーについて、少なくとも１人のヒト個体についてマーカーおよび／またはハプロタイプの情報を分析し、前記マーカーまたはハプロタイプの情報に基づいた結果を生じるために前記プロセッサで実行されるように適合されたコンピューターが実行可能な命令を有するコンピューター可読メモリと、を含み、かつ、
前記結果は、前記少なくとも１つのマーカーまたはハプロタイプのリスク基準を、前記ヒト個体の水晶体落屑症候群または緑内障の遺伝的指標として含む装置。
【請求項１４０】
前記コンピューター可読メモリは、
水晶体落屑症候群または緑内障と診断された、またはこれらに関連する症状を呈する複数の個体における、少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータと、
複数の参照個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータをさらに含み、かつ、
リスク基準は、前記ヒト個体の前記少なくとも１つのマーカーおよび／またはハプロタイプの状態と、水晶体落屑症候群または緑内障と診断された前記複数の個体の前記少なくとも１つのマーカーの頻度および／またはハプロタイプの情報を示すデータとの比較に基づく請求項１３６記載の装置。
【請求項１４１】
前記コンピューター可読メモリは、少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプに関連する水晶体落屑症候群および／または緑内障の発症のリスクを示すデータと、をさらに含み、かつ、
前記ヒト個体のリスク基準は、前記ヒト個体の前記少なくとも１つのマーカーおよび／またはハプロタイプの状態と、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または前記少なくとも１つのハプロタイプに関連するリスクとの比較に基づく請求項１３６記載の装置。
【請求項１４２】
前記コンピューター可読メモリは、水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された、またはこれらに関連する症状を呈する複数の個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータと、
複数の参照個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータと、をさらに含み、かつ、
水晶体落屑症候群および／または緑内障の発症のリスクは、水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された、またはこれらに関連する症状を呈する個体および参照個体の、前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの頻度の比較に基づく請求項１３８記載の装置。
【請求項１４３】
前記少なくとも１つのマーカーまたはハプロタイプは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択されるマーカーを含み、かつ、前記マーカーまたはハプロタイプの情報に基づく結果を生じ、前記結果は、前記少なくとも１つのマーカーまたはハプロタイプのリスク基準を、前記ヒト個体の水晶体落屑症候群または緑内障の遺伝的指標として含む請求項１３７〜１３９いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４４】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１３７〜１４０いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４５】
前記少なくとも１つのハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプおよび、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
から選択される請求項１３７〜１４１いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４６】
前記リスク基準は、オッズ比（ＯＲ）または相対リスク（ＲＲ）によって特徴付けられる請求項１３７〜１４２いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４７】
ヒト ＬＯＸＬ１遺伝子またはその断片によってコードされるポリペプチド、ならびに薬理学的に許容できる担体および／または賦形剤を含む、治療を必要とする個体における緑内障または水晶体落屑症候群に関連する症状の治療のための医薬組成物。
【請求項１４８】
前記ポリペプチドは、配列番号８５の位置１４１におけるロイシンの存在によって特徴付けられる請求項１４４記載の医薬組成物。
【請求項１４９】
前記ポリペプチドは、配列番号８５の位置１５３のアスパラギン酸の存在によって特徴付けられる請求項１４４記載の医薬組成物。
【請求項１５０】
前記ポリペプチドは、配列番号８５の位置１４１のロイシンおよび配列番号８５の位置１５３のアスパラギン酸の存在によって特徴付けられる請求項１４４記載の医薬組成物。
【請求項１５１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状の予防または寛解のための、化合物のスクリーニング用のアッセイであって、
（ｖ）水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状を有する動物、またはそれらから単離された細胞集団に試料化合物を投与する工程と、
（ｖｉ）前記動物から得た試料またはそれらから単離した前記細胞集団におけるＬＯＸＬ１の遺伝子発現レベルを測定する工程と、
（ｖｉｉ）水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状を有さない少なくとも１つの対照動物、またはそれらから単離された細胞集団から得た試料におけるＬＯＸＬ１の遺伝子発現レベルを、前記化合物の不存在下で測定する工程と、
（ｖｉｉｉ）（ｉｉ）および（ｉｉｉ）で得られた発現レベルを比較する工程と、を含み、
治療された動物および前記少なくとも１つの対照動物で似ている発現レベルを与える試料化合物は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の予防または寛解のための薬物の候補として同定されるアッセイ。
【請求項１５２】
前記動物はヒト個体である請求項１４８記載の方法。
【請求項１５３】
前記試料化合物の投与前に、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、またはこれらと連鎖不平衡にあるマーカーについて前記ヒト個体の遺伝子型を判定する工程をさらに含み、
前記ヒト個体の遺伝子型の状態は、前記動物が前記試料化合物のスクリーニングに適しているかどうかの判定に使用される請求項１４９記載の方法。
【請求項１５４】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）についての前記ヒト個体の遺伝子型が判定され、かつ、
マーカー ｒｓ１０４８６６１の対立遺伝子Ｇおよび／またはマーカー ｒｓ３８２５９４２の対立遺伝子Ｇの存在は、前記試料化合物のスクリーニングに適している前記ヒト個体の基準である請求項１５０記載の方法。
【請求項１５５】
水晶体落屑症候群および緑内障から選択される眼症状に関連する症状についてヒト個体を治療する方法であって、請求項１４８〜１５１いずれか１項に記載の方法によって同定された化合物を投与する工程を含む方法。
【請求項１５６】
水晶体落屑症候群および緑内障から選択される眼症状に関連する症状についてヒト個体を治療する方法であって、ｉｎ ｖｉｖｏで、前記症状を治療するのに十分な量のヒト ＬＯＸＬ１遺伝子を発現させる工程を含む方法。
【請求項１５７】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子は、少なくとも１つの多型部位を含む、配列番号８４に記載されるヌクレオチド配列を有する請求項１５３記載の方法。
【請求項１５８】
前記ヌクレオチド配列は、配列番号８４の位置７１４２におけるＴの存在によって特徴付けられる請求項１５４記載の方法。
【請求項１５９】
前記ヌクレオチド配列は、配列番号８４の位置７１７８におけるＡの存在によって特徴付けられる請求項１５５記載の方法。
【請求項１６０】
前記ヌクレオチド配列は、配列番号８４の位置７１４２におけるＴおよび位置７１７８におけるＡの存在によって特徴付けられる請求項１５４記載の方法。
【請求項１６１】
（ａ）ヒト ＬＯＸＬ１遺伝子を含むベクターを前記ヒト個体に投与する工程と、
（ｂ）水晶体落屑症候群または緑内障に関連する前記症状を治療するのに十分な量のＬＯＸＬ１タンパク質を発現させる工程と、を含む請求項１５３〜１５５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１６２】
前記ベクターは、アデノウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターから選択される請求項１５８記載の方法。
【請求項１６３】
前記ベクターは、複製欠損ウイルスベクターである請求項１５８記載の方法。
【請求項１６４】
前記ベクターは、局所投与、眼内投与、非経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、気管支内投与および皮下投与から選択される方法によって投与される請求項１５８〜１６０いずれか１項に記載の方法。
【請求項１６５】
ＬＯＸＬ１遺伝子またはそれがコードしているＲＮＡもしくはタンパク質の、発現、活性または物理的状態を制御する薬剤を投与する工程を含む、水晶体落屑症候群および緑内障から選択される眼症状を治療する方法。
【請求項１６６】
前記薬剤は、小分子化合物、オリゴヌクレオチド、ペプチドおよび抗体から選択される請求項１６２記載の方法。
【請求項１６７】
前記薬剤は、アンチセンス分子または干渉ＲＮＡである請求項１６２記載の方法。
【請求項１６８】
前記薬剤は、発現修飾因子である請求項１６２記載の方法。
【請求項１６９】
前記薬剤は、活性化剤である請求項１６５記載の方法。
【請求項１７０】
前記薬剤は、抑圧物質である請求項１６５記載の方法。
【請求項１７１】
緑内障または水晶体落屑症候群の治療のためのヒト ＬＯＸＬ１ポリペプチド。
【請求項１７２】
配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８記載のポリペプチド。
【請求項１７３】
位置１４１にロイシンを有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８または請求項１６９記載のポリペプチド。
【請求項１７４】
位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８または請求項１６９記載のポリペプチド。
【請求項１７５】
位置１４１にロイシン、および位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８または請求項１６９記載のポリペプチド。
【請求項１７６】
治療有効量のＬＯＸＬ１ポリペプチドを含む組成物を、緑内障または水晶体落屑症候群に関連する症状の予防または寛解を必要とする個体に投与する工程を含む、緑内障または水晶体落屑症候群に関連する症状を予防または寛解する方法。
【請求項１７７】
前記ＬＯＸＬ１ポリペプチドは、配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７３記載の方法。
【請求項１７８】
前記ポリペプチドは、位置１４１にロイシンを有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７４記載の方法。
【請求項１７９】
前記ポリペプチドは、位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７４記載の方法。
【請求項１８０】
前記ポリペプチドは、位置１４１にロイシン、および位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７４記載の方法。
【請求項１８１】
前記ＬＯＸＬ１ポリペプチドは、局所投与、眼内投与、非経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、気管支内投与および皮下投与から選択される方法によって投与される請求項１７３〜１７７いずれか１項に記載の方法。
【請求項１８２】
前記ＬＯＸＬ１ポリペプチドは、眼内投与によって投与される請求項１７３〜１７８いずれか１項に記載の方法。
【請求項１８３】
ヒト個体が、糖質コルチコイド治療薬で治療される合併症として上昇した眼圧、水晶体落屑症候群および／または緑内障を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法であって、前記方法は、
前記個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連し、かつ、前記少なくとも１つの対立遺伝子の存在の判定は、糖質コルチコイド治療薬で治療される合併症として上昇した眼圧および／または緑内障を発症する増加したリスクを示す方法。
【請求項１８４】
前記個体における少なくとも２つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含む請求項１８０記載の方法。
【請求項１８５】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ２１６５２４１ 対立遺伝子Ｔ、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよびｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇ、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１８０または請求項１８１記載の方法。
【請求項１８６】
前記個体の少なくとも１つのハプロタイプの同一性を判定する工程をさらに含む請求項１８１または請求項１８２記載の方法。
【請求項１８７】
前記ハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、または、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、の存在によって特徴付けられる請求項１８３記載の方法。
【請求項１８８】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項１８２記載の方法。
【請求項１８９】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される請求項１８０〜１９５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９０】
前記糖質コルチコイド治療薬は、薬剤表ＩＩに記載される薬剤から選択される請求項１８０〜１８６いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９１】
緑内障および水晶体落屑症候群から選択される眼症状を予防治療する方法であって、
緑内障および水晶体落屑症候群から選択される眼症状のリスクを有するヒト被験者を選択する工程と、
緑内障、上昇した眼圧または水晶体落屑症候群の治療薬を含む、治療有効量の組成物を前記被験者に投与する工程と、を含み、
前記選択する工程は、前記ヒト被験者のＬＯＸＬ１変異体を判定する工程と、前記眼症状の増加したリスクと相関するＬＯＸＬ１変異体を有するヒト被験者を予防治療のために選択する工程を含む方法。
【請求項１９２】
前記選択する工程は、前記眼症状の増加したリスクと相関する前記ＬＯＸＬ１遺伝子の遺伝子型またはハプロタイプの存在または不存在を判定する工程を含む請求項１８８記載の方法。
【請求項１９３】
前記遺伝子型は、ｒｓ１０４８６６１およびマーカー ｒｓ３８２５９４２、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される少なくとも１つのマーカーを含む請求項１８９記載の方法。
【請求項１９４】
前記選択する工程は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇを含む遺伝子型を有するヒト被験者の選択を含む請求項１８９または請求項１９０記載の方法。
【請求項１９５】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、および
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
から選択されるハプロタイプの判定は、前記個体の眼症状の増加したリスクを示す請求項１８９記載の方法。
【請求項１９６】
前記選択する工程は、前記配列番号８５に記載される配列における位置１４１のアルギニンおよび／または位置１５３のグリシンを有する前記ヒト被験者のＬＯＸＬ１タンパク質の存在の判定を含む請求項１８８記載の方法。
【請求項１９７】
前記治療薬は、薬剤表Ｉに記載される薬剤から選択される請求項１８８〜１９２いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９８】
前記ヒト個体は、前記眼症状の前駆症状を有する請求項１８８〜１９３いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９９】
緑内障、上昇した眼圧および水晶体落屑症候群から選択される眼症状用の、眼症状の増加したリスクと相関するＬＯＸＬ１変異体を有するヒト被験者を治療するための治療薬。
【請求項２００】
緑内障、上昇した眼圧および水晶体落屑症候群から選択される眼症状のための、前記眼症状の増加したリスクと相関するＬＯＸＬ１変異体を有するヒト被験者の眼症状を治療するための薬物の製造用の治療薬の使用。
【請求項２０１】
前記ヒト被験者は、前記眼症状の増加したリスクと相関する前記ＬＯＸＬ１遺伝子における少なくとも１つの遺伝子型またはハプロタイプを有する請求項１９５または請求項１９６記載の使用または薬剤。
【請求項２０２】
前記遺伝子型は、ｒｓ１０４８６６１およびマーカー ｒｓ３８２５９４２、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される少なくとも１つのマーカーを含む請求項１９７記載の使用または薬剤。
【請求項２０３】
前記ヒト被験者は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇを含む遺伝子型を有する請求項１９７または請求項１９８記載の使用または薬剤。
【請求項２０４】
前記ハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇ、およびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔ、およびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
から選択される請求項１９７記載の使用または薬剤。
【請求項２０５】
前記ＬＯＸＬ１変異体は、配列番号８５に記載される配列において、位置１４１にアルギニン、および／または位置１５３にグリシンを有するＬＯＸＬ１タンパク質を含む請求項１９５または請求項１９６記載の使用または薬剤。
【請求項２０６】
前記治療薬は、薬剤表Ｉに記載される薬剤から選択される請求項１９５〜２０１いずれか１項に記載の使用または薬剤。
【請求項２０７】
前記ヒト個体は、前記眼症状についての前駆症状を有する請求項１９５〜２０２いずれか１項に記載の使用または薬剤。
【請求項１】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの眼症状に対する感受性を判定する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程であって、前記少なくとも１つの多型マーカーの異なる対立遺伝子は、ヒトにおける少なくとも１つの症状に対する異なる感受性と関連する工程と、
前記核酸配列データから水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの症状に対する感受性を判定する工程と、を含む方法。
【請求項２】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも２つの多型マーカーについての核酸配列データを入手する工程を含む請求項１記載の方法。
【請求項３】
感受性の判定は、前記核酸配列データを、前記ヒトＬＯＸＬ１遺伝子の多型マーカーと前記少なくとも１つの症状に対する感受性との間の相関データを含むデータベースと比較する工程を含む請求項１または請求項２記載の方法。
【請求項４】
前記データベースは、前記ＬＯＸＬ１遺伝子の多型マーカーについての前記少なくとも１つの症状に対する感受性の少なくとも１つのリスク基準を含む請求項３記載の方法。
【請求項５】
前記データベースは、前記多型マーカーについての前記少なくとも１つの症状の少なくとも１つのリスク基準を含む参照表を含む請求項３記載の方法。
【請求項６】
核酸配列データを入手する工程は、前記ヒト個体から生物学的試料を入手する工程と、前記試料中の核酸における前記少なくとも１つの多型マーカーの配列を分析する工程と、を含む請求項１〜５いずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１つの多型マーカーの配列を分析する工程は、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含む請求項６記載の方法。
【請求項８】
前記核酸配列データを入手する工程は、既存の記録から得た核酸配列情報を入手する工程を含む請求項１〜５いずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記個体、前記個体の保護者、遺伝医療提供者、医師、医療機関、および医療保険会社からなる群から選択される少なくとも１つの実体に対して前記感受性を報告する工程をさらに含む請求項１〜８いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６に記載されたマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１〜９いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１〜１０いずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項１０または請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される請求項１〜１２いずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）である請求項１〜１３いずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの眼症状に対する感受性を判定する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも２つの多型マーカーの両方の対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程と、
前記配列データに基づいた少なくとも１つのハプロタイプの同一性を判定する工程と、
前記ハプロタイプのデータから水晶体落屑症候群および緑内障から選択された少なくとも１つの症状に対する感受性を判定する工程と、を含む方法。
【請求項１６】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプは、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する増加した感受性を示す請求項１〜１５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１７】
前記増加した感受性は、少なくとも１．５（少なくとも２．０、少なくとも２．５、少なくとも３．０、少なくとも３．５、および少なくとも４．０を含む）の相対リスクまたはオッズ比によって特徴付けられる請求項１６記載の方法。
【請求項１８】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ２１６５２４１ 対立遺伝子Ｔ、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇまたはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇである請求項１６または請求項１７記載の方法。
【請求項１９】
（ａ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに／または
（ｂ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
の存在は、水晶体落屑症候群または緑内障の増加した感受性を示す請求項１５または請求項１６記載の方法。
【請求項２０】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する減少した感受性を示す請求項１〜１５いずれか１項に記載の方法。
【請求項２１】
ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｔおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ａの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項１７記載の方法。
【請求項２２】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ａの存在によって特徴付けられるハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群または緑内障の発症についての減少した感受性を示す請求項１５記載の方法。
【請求項２３】
前記減少した感受性は、０．７未満（０．６未満、０．５未満、０．４未満、０．３５未満、０．３未満、および０．２５未満を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項１７〜１９いずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を診断する方法であって、前記方法は、
前記個体から得られた核酸試料、または前記個体から得た遺伝子型データセットにおける少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連し、かつ、前記少なくとも１つの対立遺伝子の存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示す方法。
【請求項２５】
前記少なくとも１つの多型マーカーの両方の対立遺伝子を判定する工程を含む請求項２１記載の方法。
【請求項２６】
前記個体における少なくとも１つのハプロタイプの同一性を評価する工程をさらに含み、前記少なくとも１つのハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示す請求項２２記載の方法。
【請求項２７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６に記載されたマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項２１〜２３いずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項２１〜２４いずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項２１〜２５いずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される、請求項２１〜２６いずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）である請求項２１〜２７いずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
前記ハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、または
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、の存在によって特徴付けられる請求項２３記載の方法。
【請求項３３】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する増加した感受性を示す請求項２１〜２９いずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
前記増加した感受性は、少なくとも１．５（少なくとも２．０、少なくとも２．５、少なくとも３．０、少なくとも３．５、および少なくとも４．０を含む）の相対リスクまたはオッズ比によって特徴付けられる請求項３０記載の方法。
【請求項３５】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ２１６５２４１ 対立遺伝子Ｔ、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇまたはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇである請求項３０または請求項３１記載の方法。
【請求項３６】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに／または
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、の存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症についての増加した感受性を示す請求項３０〜３２いずれか１項に記載の方法。
【請求項３７】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項２１〜２８いずれか１項に記載の方法。
【請求項３８】
ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｔおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ａの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項３４記載の方法。
【請求項３９】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ａの存在によって特徴付けられるハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症に対する減少した感受性を示す請求項３４記載の方法。
【請求項４０】
前記減少した感受性は、０．７未満（０．６未満、０．５未満、０．４未満、０．３５未満、０．３未満、および０．２５未満を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項３４〜３６いずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、水晶体落屑症候群および／または緑内障の臨床診断によってさらに特徴付けられる請求項２１〜３７いずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する前記症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少、のうち少なくとも１つの存在によって特徴付けられる請求項２１〜３８いずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少、の少なくとも１つによって特徴付けられる請求項３９記載の方法。
【請求項４４】
前記ヒト個体は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子をさらに有し、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項１〜４０いずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
前記緑内障は、落屑緑内障である請求項１〜４１いずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
ヒト個体における水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの眼症状に対する感受性を診断する方法であって、前記方法は、
ヒト個体の少なくとも１つのコードされたＬＯＸＬ１タンパク質についてのＬＯＸＬ１アミノ酸配列データを入手する工程と、
前記ＬＯＸＬ１アミノ酸配列に関連する少なくとも１つの多型部位を同定する工程であって、前記少なくとも１つの多型部位の異なるアミノ酸は、ヒトにおける少なくとも１つの症状に対する異なる感受性と関連する工程と、
前記アミノ酸配列データから得た水晶体落屑症候群および緑内障から選択される少なくとも１つの症状に対する感受性を診断する工程と、を含む方法。
【請求項４７】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のアルギニンおよび／または位置１５３のグリシンの存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する増加した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項４８】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のアルギニンおよび位置１５３のグリシンの存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する増加した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項４９】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のロイシンおよび／または位置１５３のアスパラギン酸の存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する減少した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項５０】
配列番号８５に記載されるＬＯＸＬ１タンパク質の位置１４１のロイシンおよび位置１５３のアスパラギン酸の存在の判定は、前記少なくとも１つの症状に対する減少した感受性を示す請求項４３記載の方法。
【請求項５１】
個体における水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状の感受性を診断する方法であって、前記方法は、
前記個体から入手した核酸試料中の少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つのマーカーは、ＬＯＸＬ１ ＬＤブロック内に位置するマーカー群から選択され、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状の感受性は、前記少なくとも１つの対立遺伝子の同一性と相関する方法。
【請求項５２】
前記少なくとも１つの多型マーカーの両方の対立遺伝子の判定を含む請求項４８記載の方法。
【請求項５３】
前記個体における少なくとも１つのハプロタイプの同一性の評価をさらに含み、前記少なくとも１つのハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示す請求項４９記載の方法。
【請求項５４】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表４に記載されたマーカー群、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカー群から選択される請求項４８〜５０いずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項４８〜５１いずれか１項に記載の方法。
【請求項５６】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項５１または請求項５２記載の方法。
【請求項５７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される請求項４８〜５３いずれか１項に記載の方法。
【請求項５８】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）である請求項４８〜５４いずれか１項に記載の方法。
【請求項５９】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する増加した感受性を示す請求項４８〜５５いずれか１項に記載の方法。
【請求項６０】
前記増加した感受性は、少なくとも１．２（少なくとも１．５、少なくとも２．０、少なくとも２．５、少なくとも３．０、少なくとも３．５、および少なくとも４．０を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項５６記載の方法。
【請求項６１】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇもしくはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇ、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカー対立遺伝子である請求項５６または請求項５７記載の方法。
【請求項６２】
（ａ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに／または
（ｂ）マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
の存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症の増加した感受性を示す請求項５６〜５８いずれか１項に記載の方法。
【請求項６３】
前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項４８〜５５いずれか１項に記載の方法。
【請求項６４】
ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｔおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ａの存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する減少した感受性を示す請求項６０記載の方法。
【請求項６５】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ａの存在によって特徴付けられるハプロタイプの存在は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の発症の減少した感受性を示す、請求項６０記載の方法。
【請求項６６】
前記減少した感受性は、０．７未満（０．６未満、０．５未満、０．４未満、０．３５未満、０．３未満、および０．２５未満を含む）のオッズ比または相対リスクによって特徴付けられる請求項６０〜６２いずれか１項に記載の方法。
【請求項６７】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、水晶体落屑症候群および／または緑内障の臨床診断によってさらに特徴付けられる請求項４８〜６３いずれか１項に記載の方法。
【請求項６８】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少、の少なくとも１つの存在によって特徴付けられる、請求項４８〜６４いずれか１項に記載の方法。
【請求項６９】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少、の少なくとも１つによって特徴付けられる請求項６５記載の方法。
【請求項７０】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子をさらに有し、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項４８〜６６いずれか１項に記載の方法。
【請求項７１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性の評価における使用のためのマーカーを同定する方法であって、前記方法は、
（ｃ）ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型を同定する工程と、
（ｄ）水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された、またはこれらに対する感受性を有する個体の試料、ならびに対照試料の遺伝子型の状態を判定する工程と、を含み、
前記対照試料における少なくとも１つの対立遺伝子の頻度と比較した、水晶体落屑症候群と診断された、またはこれに対する感受性を有する個体における、少なくとも１つの多型の前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度の有意差は、前記少なくとも１つの多型が水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性の評価に有用であることを示す方法。
【請求項７２】
前記少なくとも１つの多型は、連鎖不平衡にあり、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）に対して０．２超のｒ２値によって特徴付けられる請求項６８記載の方法。
【請求項７３】
前記対照試料における前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度と比較した、水晶体落屑症候群と診断された、またはこれに対する感受性を有する個体の前記少なくとも１つの多型の少なくとも１つの対立遺伝子の頻度の増加は、前記少なくとも１つの多型が水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する増加した感受性の評価に有用であることを示す、請求項６８または請求項６９記載の方法。
【請求項７４】
前記対照試料における前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度と比較した、水晶体落屑症候群と診断された、またはこれに対する感受性を有する個体の前記少なくとも１つの多型の前記少なくとも１つの対立遺伝子の頻度の減少は、前記少なくとも１つの多型は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する減少した感受性、またはこれらに対する保護の評価に有用であることを示す請求項６８または請求項６９記載の方法。
【請求項７５】
水晶体落屑症候群および／または緑内障のリスクを有する、または水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断されたヒト個体から入手した核酸試料の遺伝子型を同定する方法であって、前記試料における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性を判定する工程を含み、前記マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択され、かつ、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性を示す方法。
【請求項７６】
前記マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）から選択される請求項７２記載の方法。
【請求項７７】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のマーカー間のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって判定される請求項７２または請求項７３記載の方法。
【請求項７８】
前記試料は、血液試料または頬スワブである請求項７２〜７４いずれか１項に記載の方法。
【請求項７９】
遺伝子型の同定は、前記少なくとも１つの多型マーカーに隣接するヌクレオチドプライマー対を使用し、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって前記核酸試料を増幅する工程を含む請求項７２〜７５いずれか１項に記載の方法。
【請求項８０】
遺伝子型の同定は、対立遺伝子特異的なプローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的なプライマー伸張、対立遺伝子特異的な増幅、核酸配列判定、５’−エキソヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖ＤＮＡ高次構造解析から選択される工程を使用して行われる請求項７２〜７６いずれか１項に記載の方法。
【請求項８１】
前記工程は、対立遺伝子特異的なプローブハイブリダイゼーションを含む請求項７７記載の方法。
【請求項８２】
前記工程は、核酸配列判定を含む請求項７７記載の方法。
【請求項８３】
前記核酸配列判定は、ＤＮＡ配列判定である請求項７７記載の方法。
【請求項８４】
（ａ）オリゴヌクレオチドプローブと前記核酸の特異的なハイブリダイゼーションのための条件下で、前記核酸のコピーを、検出オリゴヌクレオチドプローブおよびエンハンサーオリゴヌクレオチドプローブと接触させる工程であって、
（ｂ）前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、長さが５〜１００ヌクレオチドであり、ヌクレオチド配列が少なくとも１つの多型部位を含む配列番号８４によって与えられる、前記核酸の第１の分節に、（ストリンジェントな条件下で）特異的にハイブリダイズし、
（ｃ）前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、その３’末端に検出可能な標識、およびその５’末端に消光部分を含み、
（ｄ）前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、長さが５〜１００ヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドプローブに対して５’の前記ヌクレオチド配列の第２の分節と相補的であり、そのため前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、両方のオリゴヌクレオチドが前記核酸にハイブリダイズされると、前記検出オリゴヌクレオチドプローブに対して３’に位置し、
（ｅ）１つの塩基間隙が、前記第１の分節と前記第２の分節との間に存在し、そのため、前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記エンハンサーオリゴヌクレオチドプローブが両方前記核酸にハイブリダイズされた場合、１つの塩基間隙が前記オリゴヌクレオチド間に存在する工程と、
（ｆ）前記核酸を、前記検出プローブが前記核酸にハイブリダイズされた場合、前記検出可能な標識を、前記検出プローブの３’末端から切断し、フリーの検出可能な標識を放出するエンドヌクレアーゼで処理する工程と、
（ｇ）フリーの検出可能な標識を測定する工程であって、前記フリーの検出可能な標識の存在は、前記検出プローブが前記核酸の前記第１の分節に特異的にハイブリダイズすることを示し、かつ、前記多型部位の配列は前記検出プローブの補完物であることを示す工程と、を含む請求項７２〜８０いずれか１項に記載の方法。
【請求項８５】
前記核酸のコピーは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）による増幅によって与えられる請求項８１記載の方法。
【請求項８６】
前記感受性は、増加した感受性である請求項７２〜８２いずれか１項に記載の方法。
【請求項８７】
前記感受性は、減少した感受性である請求項７２〜８２いずれか１項に記載の方法。
【請求項８８】
前記個体から得た試料中の少なくとも１つのバイオマーカーを評価する工程をさらに含む請求項１〜８４いずれか１項に記載の方法。
【請求項８９】
前記試料は血液試料である請求項８５記載の方法。
【請求項９０】
前記試料は、涙液である請求項８５記載の方法。
【請求項９１】
前記バイオマーカーは、ＬＯＸＬ１タンパク質である請求項８５〜８７いずれか１項に記載の方法。
【請求項９２】
前記個体の全体のリスクアセスメント、診断、または予後診断を行うための非遺伝的情報を分析する工程をさらに含む請求項１〜８８いずれか１項記載の方法。
【請求項９３】
前記非遺伝的情報は、年齢、性別、民族性、社会経済的な状態、以前の疾病診断、被験者の病歴、水晶体落屑症候群および／または緑内障の家族歴、生化学的測定結果、および臨床的測定結果から選択される請求項８９記載の方法。
【請求項９４】
前記個体から得た試料におけるＬＯＸＬ１の発現レベルを分析する工程をさらに含む請求項１〜９０いずれか１項に記載の方法。
【請求項９５】
前記試料は血液試料である請求項９１記載の方法。
【請求項９６】
前記試料は核酸試料である請求項９１記載の方法。
【請求項９７】
前記試料は、ｍＲＮＡを含む請求項９３記載の方法。
【請求項９８】
発現は、前記試料におけるＬＯＸＬ１タンパク質レベルを測定することによって決定される請求項９１または請求項９２記載の方法。
【請求項９９】
発現は、前記試料におけるＬＯＸＬ１ ｍＲＮＡレベルを測定することによって決定される請求項９１〜９４いずれか１項に記載の方法。
【請求項１００】
ＬＯＸＬ１の減少した発現レベルは、水晶体落屑症候群または緑内障に対する増加した感受性を示す請求項９１〜９６いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状を予防および／または寛解するための治療薬に対する反応の可能性について個体を評価する方法であって、
前記個体から入手した核酸試料における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、前記ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する多型マーカーから選択され、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の同一性は、前記治療薬に対する陽性反応の可能性を示す方法。
【請求項１０２】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、またはこれらと連鎖不平衡にあるマーカーである請求項９８記載の方法。
【請求項１０３】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少、のうち少なくとも１つの存在によって特徴付けられる請求項９８または請求項９９記載の方法。
【請求項１０４】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少、のうち少なくとも１つによって特徴付けられる請求項１００記載の方法。
【請求項１０５】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子を有することによって特徴付けられ、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項９８〜１０１いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０６】
前記治療薬は、プロスタグランジン類似体、プロスタミド、α２ アドレナリン作動薬、炭酸脱水酵素阻害薬、β−遮断薬、コリン作動薬から選択される請求項９８〜１０２いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０７】
前記治療薬は、ラタノプロスト、トラボプロスト、ウノプロストン、ビマトプロスト、ブリモニジン、アプラクロニジン、ドルゾラミド、ブリンゾラミド、アセタゾラミド、メタゾラミド、ベタキソロール、カルテオロール、レボブノロール、メチプラノロール、チモロール、ピロカルピン、カルバコール、エコチオパートおよびエピネフリンから選択される請求項９８〜１０３いずれか１項に記載の方法。
【請求項１０８】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状を経験している個体、または水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された個体の予後診断を予測する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程であって、前記少なくとも１つの多型マーカーの異なる対立遺伝子は、ヒトにおける前記少なくとも１つの症状に対する異なる感受性と関連する工程と、
前記核酸配列データから前記個体の予後診断を予測する工程と、を含む方法。
【請求項１０９】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも２つの多型マーカーについての核酸配列データを入手する工程を含む請求項１０５記載の方法。
【請求項１１０】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６に記載されたマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１０５または請求項１０６記載の方法。
【請求項１１１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１０５〜１０７いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１２】
前記水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状は、網膜神経節細胞の変性、上昇した眼圧、視神経乳頭の変化および周辺視野の減少のうち少なくとも１つの存在によって特徴付けられる請求項１０５〜１０８いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１３】
視神経乳頭の変化は、（ａ）増加した陥凹乳頭比（薄い神経網膜周縁部）、（ｂ）進行性視神経乳頭陥凹、（ｃ）非対称性視神経乳頭陥凹（０．２超の相違）、（ｄ）前記視神経の後天性の小窩、（ｅ）視神経周囲網脈絡膜の網膜神経線維束の減少のうち少なくとも１つによって特徴付けられる請求項１０９記載の方法。
【請求項１１４】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子を有することによって特徴付けられ、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項１０５〜１１０いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１５】
水晶体落屑症候群および／または緑内障についての治療を経験している個体の治療成績を予測する方法であって、前記方法は、
ヒトＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を同定するヒト個体についての核酸配列データを入手する工程であって、前記少なくとも１つの多型マーカーの異なる対立遺伝子は、ヒトにおける前記少なくとも１つの症状に対する異なる感受性に関連する工程と、
前記核酸配列データから前記個体の治療成績を予測する工程と、を含む方法。
【請求項１１６】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子と関連する少なくとも２つの多型マーカーについての核酸配列データを入手する工程を含む請求項１１２記載の方法。
【請求項１１７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、表１６記載のマーカー、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項ｌｌ２または請求項１１３記載の方法。
【請求項１１８】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、およびこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１１２〜１１４いずれか１項に記載の方法。
【請求項１１９】
前記ヒト被験者は、水晶体落屑症候群および／または緑内障についての少なくとも１つの危険因子を有することによって特徴付けられ、前記危険因子は、増加した眼圧、高年齢、アフリカ系アメリカ人種、視野異常、近視、緑内障の家族歴、薄い角膜、全身性高血圧、循環器疾患、片頭痛および末梢血管攣縮から選択される請求項１１２〜１１５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１２０】
ヒト個体の水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を評価するキットであって、
前記キットは、前記個体のゲノムにおける少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子を選択的に検出するための試薬を含み、
前記多型マーカーは、表４、表６および表６ａに記載された多型マーカー、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択され、かつ、前記少なくとも１つの対立遺伝子の存在は、水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状に対する感受性を示すキット。
【請求項１２１】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群から選択される請求項１１７記載のキット。
【請求項１２２】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項１１７または請求項１１８記載のキット。
【請求項１２３】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０６）である請求項１１７〜１１９いずれか１項に記載のキット。
【請求項１２４】
前記少なくとも１つの対立遺伝子は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇからなる群から選択される請求項１１７〜１２０いずれか１項記載のキット。
【請求項１２５】
前記試薬は、前記少なくとも１つの多型マーカーを含む前記個体のゲノム断片にハイブリダイズする少なくとも１つの近接するオリゴヌクレオチド、バッファー、および検出可能な標識を含む請求項１１７〜１２１いずれか１項記載のキット。
【請求項１２６】
前記試薬は、前記被験者から入手したゲノムの核酸分節の逆ストランドにハイブリダイズする少なくとも１つの対のオリゴヌクレオチドを含み、各オリゴヌクレオチドプライマー対は、１つの多型マーカーを含む前記個体のゲノムの断片を選択的に増幅するように設計され、かつ、前記断片は、大きさが少なくとも３０塩基対である請求項１１７〜１２２いずれか１項に記載のキット。
【請求項１２７】
前記少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、前記個体のゲノムと完全に相補的である請求項１２２または請求項１２３記載のキット。
【請求項１２８】
前記オリゴヌクレオチドは、長さが約１８〜約５０ヌクレオチドである請求項１２２〜１２４いずれか１項に記載のキット。
【請求項１２９】
前記オリゴヌクレオチドは長さが２０〜３０ヌクレオチドである請求項１２２〜１２５いずれか１項に記載のキット。
【請求項１３０】
前記キットは、
（ａ）長さが５〜１００ヌクレオチドである検出オリゴヌクレオチドプローブ、
（ｂ）長さが５〜１００ヌクレオチドであるエンハンサーオリゴヌクレオチドプローブ、および、
（ｃ）エンドヌクレアーゼ酵素、を含み、
前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、ヌクレオチド配列が少なくとも１つの多型部位を含む配列番号８４によって与えられる核酸の第１の分節に特異的にハイブリダイズし、かつ、
前記検出オリゴヌクレオチドプローブは、その３’末端に検出可能な標識、およびその５’末端に消光部分を含み、かつ
前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、長さが５〜１００ヌクレオチドであり、前記オリゴヌクレオチドプローブに対して５’のヌクレオチド配列の第２の分節に相補的であり、そのため前記エンハンサーオリゴヌクレオチドは、両方のオリゴヌクレオチドが前記核酸にハイブリダイズされると、前記検出オリゴヌクレオチドプローブに対して３’に位置し、かつ、
１つの塩基間隙が前記第１の分節と前記第２の分節との間に存在し、そのため、前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記エンハンサーオリゴヌクレオチドプローブが両方前記核酸にハイブリダイズされた場合、１つの塩基間隙が前記オリゴヌクレオチド間に存在し、かつ、
前記エンドヌクレアーゼによる前記核酸の処理は、前記検出プローブが前記核酸にハイブリダイズされた場合、前記検出プローブの３’末端から前記検出可能な標識を切断して、フリーの検出可能な標識を放出する、請求項１１７〜１２６いずれか１項に記載のキット。
【請求項１３１】
水晶体落屑症候群または緑内障に対する感受性を診断および／または評価するための診断薬の製造におけるオリゴヌクレオチドプローブの使用であって、前記プローブは、ヌクレオチド配列が少なくとも１つの多型部位を含む配列番号８４によって与えられる核酸の分節にハイブリダイズし、前記分節は長さが１５〜５００ヌクレオチドである使用。
【請求項１３２】
前記多型部位は、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にある多型から選択される請求項１２８記載の使用。
【請求項１３３】
前記多型部位は、ｒｓ１０４８６６１またはｒｓ３８２５９４２である請求項１２８または請求項１２９記載の使用。
【請求項１３４】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に対する感受性を判定するためのコンピューターが実行可能な命令を有するコンピューター可読媒体であって、
前記コンピューター可読媒体は、少なくとも１つの多型マーカーを示すデータと、
前記コンピューター可読媒体上に保存され、かつ、前記少なくとも１つの多型マーカーについて水晶体落屑症候群および／または緑内障を発症するリスクを判定するためにプロセッサによって実行されるように適合されたルーチンと、を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ＬＯＸＬ１遺伝子に関連するコンピューター可読媒体。
【請求項１３５】
前記コンピューター可読媒体は、少なくとも２つの多型マーカーを示すデータを含む請求項１３１記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３６】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１３１または請求項１３２記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３７】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１３１〜１３３いずれか１項に記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３８】
２以上の多型マーカーを含む少なくとも１つのハプロタイプを示すデータをさらに含む請求項１３１〜１３４いずれか１項に記載のコンピューター可読媒体。
【請求項１３９】
ヒト個体における水晶体落屑症候群または緑内障の遺伝的指標を判定する装置であって、
プロセッサと、
ＬＯＸＬ１遺伝子に関連する少なくとも１つの多型マーカーについて、少なくとも１人のヒト個体についてマーカーおよび／またはハプロタイプの情報を分析し、前記マーカーまたはハプロタイプの情報に基づいた結果を生じるために前記プロセッサで実行されるように適合されたコンピューターが実行可能な命令を有するコンピューター可読メモリと、を含み、かつ、
前記結果は、前記少なくとも１つのマーカーまたはハプロタイプのリスク基準を、前記ヒト個体の水晶体落屑症候群または緑内障の遺伝的指標として含む装置。
【請求項１４０】
前記コンピューター可読メモリは、
水晶体落屑症候群または緑内障と診断された、またはこれらに関連する症状を呈する複数の個体における、少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータと、
複数の参照個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータをさらに含み、かつ、
リスク基準は、前記ヒト個体の前記少なくとも１つのマーカーおよび／またはハプロタイプの状態と、水晶体落屑症候群または緑内障と診断された前記複数の個体の前記少なくとも１つのマーカーの頻度および／またはハプロタイプの情報を示すデータとの比較に基づく請求項１３６記載の装置。
【請求項１４１】
前記コンピューター可読メモリは、少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプに関連する水晶体落屑症候群および／または緑内障の発症のリスクを示すデータと、をさらに含み、かつ、
前記ヒト個体のリスク基準は、前記ヒト個体の前記少なくとも１つのマーカーおよび／またはハプロタイプの状態と、前記少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または前記少なくとも１つのハプロタイプに関連するリスクとの比較に基づく請求項１３６記載の装置。
【請求項１４２】
前記コンピューター可読メモリは、水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された、またはこれらに関連する症状を呈する複数の個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータと、
複数の参照個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子または少なくとも１つのハプロタイプの頻度を示すデータと、をさらに含み、かつ、
水晶体落屑症候群および／または緑内障の発症のリスクは、水晶体落屑症候群および／または緑内障と診断された、またはこれらに関連する症状を呈する個体および参照個体の、前記少なくとも１つの対立遺伝子またはハプロタイプの頻度の比較に基づく請求項１３８記載の装置。
【請求項１４３】
前記少なくとも１つのマーカーまたはハプロタイプは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択されるマーカーを含み、かつ、前記マーカーまたはハプロタイプの情報に基づく結果を生じ、前記結果は、前記少なくとも１つのマーカーまたはハプロタイプのリスク基準を、前記ヒト個体の水晶体落屑症候群または緑内障の遺伝的指標として含む請求項１３７〜１３９いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４４】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１３７〜１４０いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４５】
前記少なくとも１つのハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプおよび、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
から選択される請求項１３７〜１４１いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４６】
前記リスク基準は、オッズ比（ＯＲ）または相対リスク（ＲＲ）によって特徴付けられる請求項１３７〜１４２いずれか１項に記載の装置。
【請求項１４７】
ヒト ＬＯＸＬ１遺伝子またはその断片によってコードされるポリペプチド、ならびに薬理学的に許容できる担体および／または賦形剤を含む、治療を必要とする個体における緑内障または水晶体落屑症候群に関連する症状の治療のための医薬組成物。
【請求項１４８】
前記ポリペプチドは、配列番号８５の位置１４１におけるロイシンの存在によって特徴付けられる請求項１４４記載の医薬組成物。
【請求項１４９】
前記ポリペプチドは、配列番号８５の位置１５３のアスパラギン酸の存在によって特徴付けられる請求項１４４記載の医薬組成物。
【請求項１５０】
前記ポリペプチドは、配列番号８５の位置１４１のロイシンおよび配列番号８５の位置１５３のアスパラギン酸の存在によって特徴付けられる請求項１４４記載の医薬組成物。
【請求項１５１】
水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状の予防または寛解のための、化合物のスクリーニング用のアッセイであって、
（ｖ）水晶体落屑症候群および／または緑内障に関連する症状を有する動物、またはそれらから単離された細胞集団に試料化合物を投与する工程と、
（ｖｉ）前記動物から得た試料またはそれらから単離した前記細胞集団におけるＬＯＸＬ１の遺伝子発現レベルを測定する工程と、
（ｖｉｉ）水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状を有さない少なくとも１つの対照動物、またはそれらから単離された細胞集団から得た試料におけるＬＯＸＬ１の遺伝子発現レベルを、前記化合物の不存在下で測定する工程と、
（ｖｉｉｉ）（ｉｉ）および（ｉｉｉ）で得られた発現レベルを比較する工程と、を含み、
治療された動物および前記少なくとも１つの対照動物で似ている発現レベルを与える試料化合物は、水晶体落屑症候群または緑内障に関連する症状の予防または寛解のための薬物の候補として同定されるアッセイ。
【請求項１５２】
前記動物はヒト個体である請求項１４８記載の方法。
【請求項１５３】
前記試料化合物の投与前に、マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）もしくはｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）、またはこれらと連鎖不平衡にあるマーカーについて前記ヒト個体の遺伝子型を判定する工程をさらに含み、
前記ヒト個体の遺伝子型の状態は、前記動物が前記試料化合物のスクリーニングに適しているかどうかの判定に使用される請求項１４９記載の方法。
【請求項１５４】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）またはｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）についての前記ヒト個体の遺伝子型が判定され、かつ、
マーカー ｒｓ１０４８６６１の対立遺伝子Ｇおよび／またはマーカー ｒｓ３８２５９４２の対立遺伝子Ｇの存在は、前記試料化合物のスクリーニングに適している前記ヒト個体の基準である請求項１５０記載の方法。
【請求項１５５】
水晶体落屑症候群および緑内障から選択される眼症状に関連する症状についてヒト個体を治療する方法であって、請求項１４８〜１５１いずれか１項に記載の方法によって同定された化合物を投与する工程を含む方法。
【請求項１５６】
水晶体落屑症候群および緑内障から選択される眼症状に関連する症状についてヒト個体を治療する方法であって、ｉｎ ｖｉｖｏで、前記症状を治療するのに十分な量のヒト ＬＯＸＬ１遺伝子を発現させる工程を含む方法。
【請求項１５７】
前記ＬＯＸＬ１遺伝子は、少なくとも１つの多型部位を含む、配列番号８４に記載されるヌクレオチド配列を有する請求項１５３記載の方法。
【請求項１５８】
前記ヌクレオチド配列は、配列番号８４の位置７１４２におけるＴの存在によって特徴付けられる請求項１５４記載の方法。
【請求項１５９】
前記ヌクレオチド配列は、配列番号８４の位置７１７８におけるＡの存在によって特徴付けられる請求項１５５記載の方法。
【請求項１６０】
前記ヌクレオチド配列は、配列番号８４の位置７１４２におけるＴおよび位置７１７８におけるＡの存在によって特徴付けられる請求項１５４記載の方法。
【請求項１６１】
（ａ）ヒト ＬＯＸＬ１遺伝子を含むベクターを前記ヒト個体に投与する工程と、
（ｂ）水晶体落屑症候群または緑内障に関連する前記症状を治療するのに十分な量のＬＯＸＬ１タンパク質を発現させる工程と、を含む請求項１５３〜１５５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１６２】
前記ベクターは、アデノウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターから選択される請求項１５８記載の方法。
【請求項１６３】
前記ベクターは、複製欠損ウイルスベクターである請求項１５８記載の方法。
【請求項１６４】
前記ベクターは、局所投与、眼内投与、非経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、気管支内投与および皮下投与から選択される方法によって投与される請求項１５８〜１６０いずれか１項に記載の方法。
【請求項１６５】
ＬＯＸＬ１遺伝子またはそれがコードしているＲＮＡもしくはタンパク質の、発現、活性または物理的状態を制御する薬剤を投与する工程を含む、水晶体落屑症候群および緑内障から選択される眼症状を治療する方法。
【請求項１６６】
前記薬剤は、小分子化合物、オリゴヌクレオチド、ペプチドおよび抗体から選択される請求項１６２記載の方法。
【請求項１６７】
前記薬剤は、アンチセンス分子または干渉ＲＮＡである請求項１６２記載の方法。
【請求項１６８】
前記薬剤は、発現修飾因子である請求項１６２記載の方法。
【請求項１６９】
前記薬剤は、活性化剤である請求項１６５記載の方法。
【請求項１７０】
前記薬剤は、抑圧物質である請求項１６５記載の方法。
【請求項１７１】
緑内障または水晶体落屑症候群の治療のためのヒト ＬＯＸＬ１ポリペプチド。
【請求項１７２】
配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８記載のポリペプチド。
【請求項１７３】
位置１４１にロイシンを有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８または請求項１６９記載のポリペプチド。
【請求項１７４】
位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８または請求項１６９記載のポリペプチド。
【請求項１７５】
位置１４１にロイシン、および位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１６８または請求項１６９記載のポリペプチド。
【請求項１７６】
治療有効量のＬＯＸＬ１ポリペプチドを含む組成物を、緑内障または水晶体落屑症候群に関連する症状の予防または寛解を必要とする個体に投与する工程を含む、緑内障または水晶体落屑症候群に関連する症状を予防または寛解する方法。
【請求項１７７】
前記ＬＯＸＬ１ポリペプチドは、配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７３記載の方法。
【請求項１７８】
前記ポリペプチドは、位置１４１にロイシンを有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７４記載の方法。
【請求項１７９】
前記ポリペプチドは、位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７４記載の方法。
【請求項１８０】
前記ポリペプチドは、位置１４１にロイシン、および位置１５３にアスパラギン酸を有する配列番号８５に記載されるアミノ酸配列によって特徴付けられる請求項１７４記載の方法。
【請求項１８１】
前記ＬＯＸＬ１ポリペプチドは、局所投与、眼内投与、非経口投与、鼻腔内投与、気管内投与、気管支内投与および皮下投与から選択される方法によって投与される請求項１７３〜１７７いずれか１項に記載の方法。
【請求項１８２】
前記ＬＯＸＬ１ポリペプチドは、眼内投与によって投与される請求項１７３〜１７８いずれか１項に記載の方法。
【請求項１８３】
ヒト個体が、糖質コルチコイド治療薬で治療される合併症として上昇した眼圧、水晶体落屑症候群および／または緑内障を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法であって、前記方法は、
前記個体における少なくとも１つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含み、
前記少なくとも１つの多型マーカーは、前記ＬＯＸＬ１遺伝子に関連し、かつ、前記少なくとも１つの対立遺伝子の存在の判定は、糖質コルチコイド治療薬で治療される合併症として上昇した眼圧および／または緑内障を発症する増加したリスクを示す方法。
【請求項１８４】
前記個体における少なくとも２つの多型マーカーの少なくとも１つの対立遺伝子の存在または不存在を判定する工程を含む請求項１８０記載の方法。
【請求項１８５】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、マーカー ｒｓ２１６５２４１ 対立遺伝子Ｔ、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよびｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇ、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される請求項１８０または請求項１８１記載の方法。
【請求項１８６】
前記個体の少なくとも１つのハプロタイプの同一性を判定する工程をさらに含む請求項１８１または請求項１８２記載の方法。
【請求項１８７】
前記ハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、または、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇ、の存在によって特徴付けられる請求項１８３記載の方法。
【請求項１８８】
連鎖不平衡は、少なくとも０．２のｒ２の数値および／または少なくとも０．８の｜Ｄ’｜値によって定められる請求項１８２記載の方法。
【請求項１８９】
前記少なくとも１つの多型マーカーは、ｒｓ４８８６７２５（配列番号８６）、ｒｓ１２９１５９５６（配列番号８７）、ｒｓ８９６５９０（配列番号８８）、ｒｓ１２４３８８７２（配列番号８９）、ｒｓ４２６１４８２（配列番号４２）、ｒｓ２１６５２４１（配列番号１５）、ｒｓ１９９２３１４（配列番号４４）、ｒｓ４８８６７７６（配列番号４５）、ｒｓ２０２８３８６（配列番号４６）、ｒｓ４３３７２５２（配列番号４７）、ｒｓ２０２８３８７（配列番号４８）、ｒｓ４０７７２８４（配列番号４９）、ｒｓ８９３８１６（配列番号５０）、ｒｓ４８８６７８２（配列番号５１）、ｒｓ８９３８１７（配列番号１７）、ｒｓ８９３８１８（配列番号５２）、ｒｓ８９３８２０（配列番号５３）、ｒｓ１２４４０６６７（配列番号５４）、ｒｓ１５３０１６９（配列番号１９）、ｒｓ８９３８２１（配列番号９０）、ｒｓ７５０４６０（配列番号５５）、ｒｓ４２４３０４２（配列番号５６）、ｒｓ２３０４７２２（配列番号９１）、ｒｓ４８８６６２３（配列番号９２）、ｒｓ２１６７６４８（配列番号９３）、ｒｓ１５８４７３８（配列番号９４）、ｒｓ１９０１５７０（配列番号９５）、ｒｓ８０２６５９３（配列番号６）、ｒｓ４８８６６６０（配列番号９６）、ｒｓ４８８６４２１（配列番号９７）、ｒｓ４８８６６６３（配列番号９８）、ｒｓ４８８６６６４（配列番号９９）、ｒｓ４１４５８７３（配列番号１００）、ｒｓ４１４５８７４（配列番号１０１）、ｒｓ１４５２３８９（配列番号１０２）、ｒｓ１０７８９６７（配列番号１０３）、ｒｓ８０４１６４２（配列番号１０４）、ｒｓ８０４１６８５（配列番号１６）、ｒｓ８０４２０３９（配列番号１０５）、ｒｓ２３０４７１９（配列番号１８）、ｒｓ１２４３７４６５（配列番号５７）、ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）、およびｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）からなる群から選択される請求項１８０〜１９５いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９０】
前記糖質コルチコイド治療薬は、薬剤表ＩＩに記載される薬剤から選択される請求項１８０〜１８６いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９１】
緑内障および水晶体落屑症候群から選択される眼症状を予防治療する方法であって、
緑内障および水晶体落屑症候群から選択される眼症状のリスクを有するヒト被験者を選択する工程と、
緑内障、上昇した眼圧または水晶体落屑症候群の治療薬を含む、治療有効量の組成物を前記被験者に投与する工程と、を含み、
前記選択する工程は、前記ヒト被験者のＬＯＸＬ１変異体を判定する工程と、前記眼症状の増加したリスクと相関するＬＯＸＬ１変異体を有するヒト被験者を予防治療のために選択する工程を含む方法。
【請求項１９２】
前記選択する工程は、前記眼症状の増加したリスクと相関する前記ＬＯＸＬ１遺伝子の遺伝子型またはハプロタイプの存在または不存在を判定する工程を含む請求項１８８記載の方法。
【請求項１９３】
前記遺伝子型は、ｒｓ１０４８６６１およびマーカー ｒｓ３８２５９４２、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される少なくとも１つのマーカーを含む請求項１８９記載の方法。
【請求項１９４】
前記選択する工程は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇを含む遺伝子型を有するヒト被験者の選択を含む請求項１８９または請求項１９０記載の方法。
【請求項１９５】
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、および
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔおよびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
から選択されるハプロタイプの判定は、前記個体の眼症状の増加したリスクを示す請求項１８９記載の方法。
【請求項１９６】
前記選択する工程は、前記配列番号８５に記載される配列における位置１４１のアルギニンおよび／または位置１５３のグリシンを有する前記ヒト被験者のＬＯＸＬ１タンパク質の存在の判定を含む請求項１８８記載の方法。
【請求項１９７】
前記治療薬は、薬剤表Ｉに記載される薬剤から選択される請求項１８８〜１９２いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９８】
前記ヒト個体は、前記眼症状の前駆症状を有する請求項１８８〜１９３いずれか１項に記載の方法。
【請求項１９９】
緑内障、上昇した眼圧および水晶体落屑症候群から選択される眼症状用の、眼症状の増加したリスクと相関するＬＯＸＬ１変異体を有するヒト被験者を治療するための治療薬。
【請求項２００】
緑内障、上昇した眼圧および水晶体落屑症候群から選択される眼症状のための、前記眼症状の増加したリスクと相関するＬＯＸＬ１変異体を有するヒト被験者の眼症状を治療するための薬物の製造用の治療薬の使用。
【請求項２０１】
前記ヒト被験者は、前記眼症状の増加したリスクと相関する前記ＬＯＸＬ１遺伝子における少なくとも１つの遺伝子型またはハプロタイプを有する請求項１９５または請求項１９６記載の使用または薬剤。
【請求項２０２】
前記遺伝子型は、ｒｓ１０４８６６１およびマーカー ｒｓ３８２５９４２、ならびにこれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択される少なくとも１つのマーカーを含む請求項１９７記載の使用または薬剤。
【請求項２０３】
前記ヒト被験者は、ｒｓ１０４８６６１ 対立遺伝子Ｇおよび／またはｒｓ３８２５９４２ 対立遺伝子Ｇを含む遺伝子型を有する請求項１９７または請求項１９８記載の使用または薬剤。
【請求項２０４】
前記ハプロタイプは、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｇ、およびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、ならびに、
マーカー ｒｓ１０４８６６１（配列番号１０６）における対立遺伝子Ｔ、およびマーカー ｒｓ３８２５９４２（配列番号１０７）における対立遺伝子Ｇの存在によって特徴付けられるハプロタイプ、
から選択される請求項１９７記載の使用または薬剤。
【請求項２０５】
前記ＬＯＸＬ１変異体は、配列番号８５に記載される配列において、位置１４１にアルギニン、および／または位置１５３にグリシンを有するＬＯＸＬ１タンパク質を含む請求項１９５または請求項１９６記載の使用または薬剤。
【請求項２０６】
前記治療薬は、薬剤表Ｉに記載される薬剤から選択される請求項１９５〜２０１いずれか１項に記載の使用または薬剤。
【請求項２０７】
前記ヒト個体は、前記眼症状についての前駆症状を有する請求項１９５〜２０２いずれか１項に記載の使用または薬剤。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【公表番号】特表２０１０−５３３４７７（Ｐ２０１０−５３３４７７Ａ）
【公表日】平成２２年１０月２８日（２０１０．１０．２８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１０−５１１７８５（Ｐ２０１０−５１１７８５）
【出願日】平成２０年６月１３日（２００８．６．１３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＩＳ２００８／００００１４
【国際公開番号】ＷＯ２００８／１５２６５６
【国際公開日】平成２０年１２月１８日（２００８．１２．１８）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．レーザーディスク
【出願人】（５０９２６８２３３）
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２２年１０月２８日（２０１０．１０．２８）
【国際特許分類】
【出願日】平成２０年６月１３日（２００８．６．１３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＩＳ２００８／００００１４
【国際公開番号】ＷＯ２００８／１５２６５６
【国際公開日】平成２０年１２月１８日（２００８．１２．１８）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．レーザーディスク
【出願人】（５０９２６８２３３）
【Ｆターム（参考）】
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