流体排出機構を備えた生物反応装置
【課題】生物反応装置の反応室内の流体を自動的に迅速に交換することを可能にし、オペレータの熟練の程度にかかわらず生物反応ないしは化学反応を適切に制御することを可能する手段を提供する。
【解決手段】分離型のカバーと、サンプル領域に配置されたサンプルとを有する少なくとも１つの基材を受け入れるための生物反応装置（１０）であって、サンプル領域の上方において、カバーと基材との間に反応室が形成されている。該装置（１０）は、基材を配置するための配置手段と、カバーを基材に対して配置するとともに移動させるためのカバー配置手段と、流体を反応室内に分配するための流体分配手段と、流体排出機構とを含んでいる。ここで、流体排出機構はウィッキング手段を含んでいる。
【解決手段】分離型のカバーと、サンプル領域に配置されたサンプルとを有する少なくとも１つの基材を受け入れるための生物反応装置（１０）であって、サンプル領域の上方において、カバーと基材との間に反応室が形成されている。該装置（１０）は、基材を配置するための配置手段と、カバーを基材に対して配置するとともに移動させるためのカバー配置手段と、流体を反応室内に分配するための流体分配手段と、流体排出機構とを含んでいる。ここで、流体排出機構はウィッキング手段を含んでいる。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、化学反応のための反応室を設けるための方法及び装置に関するものである。本発明はまた、反応室に流体を充填する方法及びこの目的のために用いられる流体に関するものでもある。
【背景技術】
【０００２】
サンプル上で化学反応を開始させるのが望ましい応用例（application）は多数存在する。一般に、サンプルは、顕微鏡スライドの上に配置される。典型的な反応には、細胞物質の免疫組織化学反応（immuno-histochemical reaction）や、ＤＮＡ又はＲＮＡの原位置交配（in situ-hybridisation）が含まれる。他の形態においては、ＤＮＡ、ＲＮＡ、タンパク質又は小さい化学化合物を含んでいる数千の小さい材料サンプルのマイクロアレー（micro array）が顕微鏡スライドに取り付けられる。この場合、スライド上の材料と他の薬品又は流体との間での化学反応を促進するのが望ましい。これらの反応は、制御された反応時間、温度及び薬品濃度をはじめとする制御された条件を必要とする。スライドにおける反応が均一であり、またスライドからスライドへの反応が一貫している（consistent）ことが重要である。蒸発及び流体の総消費量を最小にすることもまた重要である。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００３】
従来、スライド上で起こる化学反応は、熟練者が試薬を加えて混合することにより制御されている。これは、試薬の量及び時間を、スライドごとに制御することを可能にする。しかしながら、この手法では、時間がかかり、非常に熟練したオペレータを必要とし、かつ、スライドからスライドへの一貫した結果を得ることができない。
【課題を解決するための手段】
【０００４】
ある１つの形態においては、本発明は、サンプル領域に位置決めされたサンプルを有する少なくとも１つの基材（substrate）と、分離型のカバーとを受け入れるための生物反応装置であって、サンプル領域の上方において、カバーと基材との間に反応室が形成され、基材を位置決めする（locate）ための位置決め手段と、カバーを基材に対して位置決めするとともに移動させるためのカバー位置決め手段と、反応室内に流体を分配する（dispense）ための流体分配手段と、流体排出機構（draining mechanism）を含んでいて、流体排出機構がウィッキング手段（wicking means：流体除去手段）を含んでいる生物反応装置である。
【０００５】
好ましい態様では、ウィッキング手段は、基材から流体を排出するための流体通路を形成する基材上の当接点（points of contact）を含んでいる。
【０００６】
好ましい態様では、基材は、該装置内で下側から担持（support）されている。基材を下側から担持することは、基材の周縁部付近からウィッキング通路（wicking path）を除去する。
【０００７】
もう１つの態様では、本発明は、反応室の充填を行うための充填流体であって、基材上の先行する流体に比べて、より高い粘度を有している充填流体を提供する。
【０００８】
好ましい態様では、充填流体は水に対して混和性を有する（miscible）ものである。
【０００９】
好ましい態様では、充填流体は水に比べて、より高い沸点を有するものである。
【００１０】
好ましい態様では、充填流体は上記基材又はサンプルに残留物（residue）を残さないものである。
【００１１】
好ましい態様では、充填流体は生物試薬及びサンプルに対して不活性である。
【００１２】
好ましい態様では、充填流体はグリセロール（glycerol）を含む溶液である。
【００１３】
ある１つの態様では、充填流体はグリセロールと水と緩衝物（buffer）とを含んでいる。緩衝物はトリス緩衝食塩水（tris buffered saline）であってもよい。
【００１４】
好ましい態様では、充填流体は、体積で２％から８０％までの間のグリセロールを含んでいる。
【００１５】
より好ましい態様では、充填流体は、体積で１０％から６０％までの間のグリセロールを含んでいる。
【００１６】
より好ましい態様では、充填流体は、２０％から３０％までの間のグリセロールを含んでいる。
【００１７】
ある１つの態様では、充填流体は、充填サイクル中に上記反応室内に形成される泡の放出を促進する界面活性剤を含んでいる。
【００１８】
より好ましい態様では、界面活性剤はツイーン（Tween）である。
【００１９】
もう１つの態様では、本発明は、基材及びカバーを位置決めするようになっている受け入れ手段（receiving means）を有する基材のためのレセプタクル（receptacle）に関する。
【００２０】
好ましい態様では、受け入れ手段は、基材を配置して担持するためのステーションを含み、カバーが基材上で担持されている。
【００２１】
好ましい態様では、受け入れステーションは、基材を、該基材の周縁部付近で担持している。
【００２２】
好ましい態様では、受け入れ手段は、基材を担持するための周縁出っ張り部（peripheral ledges）を有するそれぞれの開口部によって形成されている。
【００２３】
好ましい態様では、開口部が、反応装置から支持プラットホームを受け入れるようになっていて、反応装置内にロード（load：搭載）されたときにプラットホームが上記基材を担持するようになっている。
【００２４】
好ましい態様では、受け入れ手段が、基材からカバーを持ち上げるための持ち上げ手段を有している。
【００２５】
より好ましい態様では、持ち上げ手段は、カバー上の突起部と係合するようになっている傾斜面である。
【００２６】
好ましい態様では、受け入れ手段は、カバーが該レセプタクル及びスライドに対して移動させられることを可能にするガイド部を有している。
【００２７】
もう１つの態様では、本発明は、流体導管と、流体導管に接続されたポンプと、流体導管を、流体源から分配領域に移動させるための位置決め手段とを含んでいる反応装置のためのディスペンサ（dispenser）に関する。
【００２８】
好ましい態様では、ディスペンサは、流体源及び基材のタイプを検出するためのバーコードセンサを含んでいる。
【００２９】
好ましい態様では、ディスペンサは、流体源内に残っている流体の体積（volume）を決定するための手段を含んでいる。
【００３０】
より好ましい態様では、流体源内の流体の体積を決定するための手段は、流体コンテナ内の流体のレベル（level）を計測するようになっているセンサを含んでいる。
【００３１】
より好ましい態様では、センサは、上記流体導管のキャパシタンス（電気容量）の変化を測定して、流体コンテナ内への流体の注入を検出するようになっている。
【００３２】
もう１つの態様では、本発明は、流体を基材に分配する方法であって、少なくとも１つの流体コンテナを備えた試薬レセプタクルをロードするステップと、試薬レセプタクルを反応装置に取り付けるステップと、試薬レセプタクルを検出するステップと、試薬レセプタクルが検出された後、センサを起動して、少なくとも１つの流体コンテナ内の流体のタイプを検出するステップと、流体のタイプについての情報を格納し、要求があったときに流体が基材上に分配されるのを可能にするステップとを含んでいる方法に関する。
【００３３】
好ましい態様では、センサはバーコードを検出する。
【００３４】
もう１つの態様では、本発明は、スライドのための支持突起部と、分配手段と、流体除去手段とを有している反応装置であって、支持突起部が下側からスライドを担持するとともに、ウィッキング手段が上記スライドの周縁部と接触し、ウィッキング手段が、スライドの上表面から流体を除去するためのウィッキングキング通路（wicking path：流体除去通路）を形成している反応装置に関する。
【００３５】
好ましい態様では、支持突起部は、水平方向に対して０ないし１０度傾斜し、流体除去領域を備えたマウント部（mount）を形成している。
【００３６】
好ましい態様では、ウィッキング手段がウィッキングポスト（wicking post：流体除去柱）である。
【００３７】
好ましい態様では、ウィッキングポストは流体除去領域に配置されている。
【００３８】
ある態様では、ウィッキング手段は、スライドの幅の大部分を横切って伸びるようになっている。
【００３９】
もう１つの態様では、本発明は、サンプルを含んでいる表面を有する基材と、サンプルを含んでいる表面とで反応室を形成する表面を有するカバーとを位置決めするようになっている反応装置であって、反応室の体積を変化させるようになっているカバー係合手段を含んでいる反応装置に関する。これは、反応室内における流体の混合を促進する。
【００４０】
ある態様では、カバー係合手段は、カバーを基材にクランプする（clamp：固定する）ようになっているクランプ機構（clamping mechanism：固定機構）である。
【００４１】
もう１つの態様では、本発明は、複数の基材及びカバーを保持するようになっている分離型の基材トレーと、基材トレーを受け入れるための少なくとも１つの受け入れステーションと、基材トレー内の基材の上に流体を分配するための分配手段とを有する反応装置であって、基材とカバーとの間に反応室が形成され、上記基材の上に分配された流体が上記反応室に入るようになっている反応装置に関する。
【００４２】
好ましい態様では、反応装置は、それぞれ基材トレーを受け入れるようになっている複数の受け入れステーションを含んでいる。
【００４３】
好ましい態様では、反応装置は、他のどの基材トレーとも独立して１つの基材トレーの上の基材の上に上記流体が分配されるのを可能にするコントローラ（制御器）を有している。
【００４４】
もう１つの態様では、サンプル領域内に位置決めされたサンプルを有する基材と、該基材から流体を排出するためのウィッキング手段を含んでいる流体排出機構とを受け入れるための反応装置が提供される。
【００４５】
もう１つの態様では、反応装置内のスライドの上に反応室を形成する方法であって、空洞部（cavity）を有するカバーをスライドの上に配置して、反応室を形成する過程と、カバー及びスライドをトレーのレセプタクル内に位置決めする過程と、トレー内の各レセプタクルのためのマウント部を有する反応装置内に、受け入れ部を設ける過程と、トレーを、反応装置の受け入れ部内にロードし、上記反応装置の受け入れ部が上記トレーを位置決めする過程と、カバーをスライドに取り外し可能に保持する過程と、スライド及びカバーからトレーを取り外す過程とを含む方法が提供される。
【００４６】
もう１つの態様では、複数のスライド及びカバーをロードするための装置であって、スライド及びカバーのための複数のレセプタクルを有するトレーと、トレーを受け入れるための受け入れ部と、受け入れ部内に位置決めされた各レセプタクルのためのマウント部と、各マウント部のためのクランプとを含んでいて、スライド及びカバーを有するトレーが受け入れ部内にロードされたときに、各クランプが、カバーをスライド上に保持してスライドを位置決めし、かつ、トレーがスライドから落ちて、各スライドがマウント部によって担持されるようになっている装置が提供される。
【００４７】
もう１つの態様では、複数のステップを含んでいる、スライドの上のサンプルの上で反応を起こさせる方法であって、少なくとも１つのスライドを有する第１のホルダを反応装置内にロードする過程と、スライドを走査して、スライド上で起こる反応における複数のステップを決定する過程と、他のホルダが反応装置内にロードされているかどうかを決定する過程と、第１のホルダに関連する少なくとも１つのスライドで要求される複数のステップを起こさせる過程と、第２のホルダが検出されたときに、第１のホルダ内の少なくとも１つのスライドに関連する反応におけるステップを継続し、この後、第２のホルダに関連するスライドに関連する少なくとも１つのステップを起こさせる過程とを含む方法が提供される。
【００４８】
もう１つの態様では、スライド上で反応を行わせるための装置であって、スライド及び関連するカバーを担持するとともに位置決めするようになっている複数のレセプタクルを有するトレーと、トレーの各レセプタクルと関連するマウント部を有する、トレーのための受け入れポートと、カバー及びスライドを所定の位置にクランプするためのクランプ機構と、カバーとスライドとの間に形成された反応室から流体を排出するための流体排出手段と、少なくとも１つの流体が該装置に配置されるのを可能にするための流体レセプタクルと、流体をスライドの上に分配するための流体分配手段とを含んでいて、トレーがロードされてから、スライド及びカバーがクランプされるとともにトレーが移動させられ、これにより、スライド及びカバーがマウント部上に担持され、流体が、分配手段によってスライド上に分配されることができ、かつ流体排出手段によって排出されるようになっている装置が提供される。
【００４９】
もう１つの態様では、試薬をサンプルスライドに供給するための装置であって、スライドを受け入れるための複数のポートと、スライドの各々についての識別情報を読み取るための読取器と、スライド上に堆積されるべき試薬を運ぶ試薬コンテナを受け入れるための試薬ラック（reagent rack）とを含んでいて、スライドが、関連するポート（port）に受け入れられたトレーに供給され、各トレーが個別のバッチのスライドに相当し、該装置の動作時におけるバッチ処理に対して、個別のトレーの追加及び除去を可能にするようになっている装置が提供される。
【図面の簡単な説明】
【００５０】
【図１】反応装置の一例を示す図である。
【図２】図１に示す反応装置とともに用いられるトレーの一例を示す図である。
【図３】図１に示す反応装置の受け入れポート内に部分的にロードされた、図２に示すトレーを示す図である。
【図４】反応装置のラック受け入れゾーン及び試薬容器ラックの一例を示す図である。
【図５】図１に示す反応装置の分散機構及びロボットアームを示す図である。
【図６】図１に示す反応装置のステーションにロードされたスライド及びカバーを示す図である。
【図７】図２に示すトレー内にロードされたカバーを示す図である。
【図８】（ａ）〜（ｃ）は、スライドに対する３つの位置におけるカバーを示す図である。
【図９】図１に示す反応装置の受け入れポート内のカバーのための係合手段の第１の図である。
【図１０】カバーとスライドとの間に形成された反応装置の模式的な断面図である。
【図１１】反応装置の洗浄ステーションを示す図である。
【図１２】トレー受け入れポート及びウィッキング手段のステーションを示す図である。
【図１３】スライド上に取り付けられたカバーの切り取られた断面部を示す図である。
【図１４】図１に示す反応装置のトレー受け入れポートの上面図である。
【図１５】ステーションのマウント上のスライド及びカバーの断面図である。
【図１６】図１５に示すマウント、スライド及びカバーの切り取られた断面を示す断面図である。
【図１７】混合ステーションの斜視図である。
【発明を実施するための形態】
【００５１】
以下、添付の図面を参照しつつ、非制限的な単なる具体例として本発明を説明する。
図１は、バルク試薬コンテナ受け入れゾーン１２（bulk reagent container receiving zone）と、基材トレー受け入れポート１４（substrate tray receiving ports）と、ロボットアーム１６と、試薬ラック受け入れゾーン１８（reagent rack receiving zone）とを有する自動化された反応装置１０を示している。
【００５２】
バルク試薬コンテナ受け入れゾーン１２は、多数のバルク試薬コンテナ２０を保持するようになっている。これらのコンテナ２０は、典型的には、トリス緩衝食塩水（tris buffered saline）、ＰＢＳ、クエン酸塩（Citrate）、ＥＤＴＡ、有機溶媒、廃試薬（waste reagent）、脱イオン水、脱ロウ溶液（dewaxing solution）などの流体を保持している。反応装置１０のバルク試薬コンテナ２０は、１ないし４リットルの流体を保持している。
【００５３】
ロボットアーム１６は、ガイド部２４（guide）に沿って移動することができ、モータ（図示せず）によって駆動され、コンピュータなどのコントローラ（図示せず）によって制御される。図５に示すように、ロボットアーム１６には、分配手段２６（dispensing means）が移動可能に取り付けられている。分配手段２６は、流体を分配する（dispense）ためのピペット２８などの流体導管（fluid conduit）を含んでいる。ピペット２８は、管路２９（tubing）によってポンプ（図示せず）に接続されている。この具体例では、ポンプは、正確な体積の流体を引き抜き、保持し及び供給することができるモータ付きのシリンジポンプ（motorised syringe pump）である。ピペット２８は、流体を引き抜き又は分布させるときには下降させることができ、反応装置１０を横切って移動するときには上昇させることができる。ロボットアーム１６には、バーコードを読み取るためのセンサ３３も設けられている。
【００５４】
図４に最も明瞭に示されているように、試薬ラック受け入れゾーン１８は、４つのラックマウント３０（rack mount）と、ラック配置クリップ３１（rack locating clip）と、各試薬ラック３４の取り付けを検出するためのセンサ３５とを含んでいる。各試薬ラック３４は、それぞれ試薬コンテナ３９を受け入れるようになっている９つのレセプタクル３６（receptacle：容器）を含んでいる。試薬ラック３４は、コンテナ３９を除去し、補充し（refill）又は交換する（change）ことが必要なときには、ラック受け入れゾーン１８から除去することができる。
【００５５】
図１及び図３においては、それぞれ単一のスライドトレー１５を保持するようになっている３つのスライドトレー受け入れポート１４（slide tray receiving port）が存在する。
【００５６】
スライドトレー１５（図２に示されている）は、担持手段３８（support means）を有する開口部（aperture）の形態の１０個のスライド受け入れ手段３７を含んでいる。図３に示すように、スライド１の形態の１つ又はこれより多い基材はスライドトレー１５内に配置することができる。かくして、スライド１は、中央部ではなく周縁部付近で担持される。図７に示すように、スライド１の上にカバー２が配置されている。図６に示すとともに、以下でより詳しく説明するように、スライドトレー１５がトレー受け入れポート１４内に配置されたときに、各スライド受け入れ手段３７は、反応装置１０内のスライドステーション３５ａに対応する（correspond）。トレー受入ポート１４内の一連のブロック４０（block）は、スライドトレー１５がレール３９ａに沿って反応装置１０内に完全に挿入されたときにスライド１を担持するようになっている。スライドトレー１５は、受入ポート１４内に完全に挿入されたときには、スライド１がブロック４０に当接して該ブロック４０によって担持されるように、下降させることができる。この後、スライドトレー１５はスライド１とは当接せず、スライド１はブロック４０によって下側から担持された状態となる。図３に示すスライドトレー１５では、２つのスライド１とカバー２とがロード（load：搭載）されているだけであるが、スライドトレー１５に収容されている受け入れ手段３７の数までは、任意の数のスライド及びカバーが存在することができる。
【００５７】
図１２に示すように、典型的には金属であり、制御可能に（controllably）加熱又は冷却されることができるブロック４０は、ウィッキングポスト４２（wicking post）の形態のウィッキング手段４１（wicking means）と関連しているスライド１を担持する。ブロック４０の上面は、反応装置１０の動作時にスライド１に沿って流体が流れるのを促進するために、水平方向に対して小さい角度で（典型的には５度）傾斜させられている。
【００５８】
カバー２（図８及び図１３に最も明確に示されている）は、ここに参照のために組み入れられた、本願出願人に係る「スライド用のカバー」との名称がつけられた同時継続の国際特許出願に記載されている多数の可能な変形例又はその他の変形例のうちの１つである。カバー２は、透明なプラスチック材料でつくられ、これが取り付けられるべきスライド１と実質的に同一幅のものである。図１０に模式的に示すように、サンプルと対向しているカバー２の側部に空洞部５１（cavity）が配設されている。この空洞部５１は、スライド１のサンプル保持面５３及びランド部５２（land）と連携して反応室３２を形成している。ここで、ｚ軸方向は、明瞭化のために誇張されている。図１０は、スライド１上のカバー２の断面図であり、反応室３２と、サンプル５と、ランド部５２と、スライド表面５３とを示している。典型的には、スライド１は、幅が２５ｍｍであり、長さが７６ｍｍであり、空洞部５１の高さは１００マイクロメータである。図１３に示すように、ランド部５２は、当接面５４に沿って、スライド表面５３に極めて接近し、又は当接し、それゆえ、反応室３２の外側に反応室３２から流体が漏れるのを制限（禁止）する。毛管力は、反応室３２内に流体を保持するのを促進する。
【００５９】
図９に示すように、ロケータアーム３（locator arm）は、カバー２がロケータ係合手段４３（locator engaging means）によってスライド１に沿って移動させられるのを可能にする。各ロケータアーム３は、ブラケット４４と係合している。図８には、スライド１に対するカバー２の位置の範囲が示されている。すなわち、図８（ａ）では完全に開かれ、図８（ｂ）では部分的に開かれ、図８（ｃ）では完全に閉じられている。カバー２が閉じられ又は部分的に開かれた位置にあるときには、スライド１上のサンプル５の上方において、カバー２とスライド１との間に反応室３２が形成される。カバー２は、流体が分配されることができる流体容器１９を含んでいる。前記の同時継続出願に記載されているように、いくつかの形態の流体容器が存在する。カバー及びスライドは、カバーがスライドに当接しているときには、流体容器１９内に流体を保持することができる。
【００６０】
カバー２が、図８（ａ）に示す開かれた位置から、図８（ｃ）に示す閉じられた位置までスライド１上を移動するのに伴って、流体容器内の流体は、カバー２の空洞部５１内に引き込まれる。流体容器１９は、カバー２が閉じられた位置にあるときにもなお容器内に流体を存在させるのに十分な体積を保持している。これは、反応時間が延長され又は高温が持続しているときに、流体容器の流体補給（fluid top ups）の必要性を低減させる結果となる。毛管力を含む多数の因子によって、流体が空洞部内に引き込まれるものと確信される。
【００６１】
図７に示すように、カバー２は、該カバー２から突出している翼部５０（wing）を含み、該翼部はスライドトレー１５上の斜面部５２（ramp）と係合するようになっている。カバー２の翼部５０が斜面部５２の形態の持ち上げ手段と係合するときに、これらの翼部５０は、スライド１からカバー２を離間させて持ち上げる。カバー２を、サンプルは覆われていないがカバー２がガイド部５６に沿ってスライドと当接したままである位置に移動させることが可能である。斜面部５２及び翼部５０の形態（configuration）に依存するが、カバー２がスライド１との当接を解除する前に、反応室を完全に開くことは必要ではない。
【００６２】
ロケータアーム３は、位置決め部材４５と制御可能に係合するカム機構（図示せず）などのアクチュエータによって移動させられる。その結果、カバー２を、図８に示すｘ軸に沿う方向に、スライド１に対して正確に位置決めすることができる。図９は、全てのカバーを一度に移動させるものを示しているが、反応装置の他の例では、ロケータアームを個別に移動させることにより、カバーを個別に制御することが可能である。
【００６３】
図６においては、バーコード６を有するスライド１が、それぞれのブロック４０の上に示されている。この図においては、その明瞭化を目的として、スライドトレー１５及び係合手段４３は省略されている。処理工程中において、スライド１上の所定の位置にカバー２を確実に保持するためにクランプ６０（clamp：固定部）が用いられている。クランプ６０は、複数の脚部６２（leg）を含んでいる。これらの脚部６２は、スライド１の周縁部付近に配置され、カバー２の周縁部付近の力を均等にするために、ばねと類似（同様）の物性を有している。クランプ６０は、プラスチック材料でつくることができる。ただし、他の例（図示せず）では、脚部は、金属でつくられたばね（板ばね又はコイルばね）の形態のものである。脚部又はクランプの他の形態として、圧縮可能な発泡体又は空気式クランプなどを用いることも可能である。
【００６４】
各カバー２のためのクランプ６０は、カバー２を移動させるべきときに上昇させることができ、又は、流体分配動作中にカバー２と係合させるために降下させることができる。この具体例では、特定の受け入れポート１４内の全てのクランプ６０及びカバー２が一緒に移動させられる。個々の受け入れポート１４は、互いに独立して動作してもよい。
【００６５】
使用時においては、バルク試薬コンテナ２０のバルク試薬（bulk reagents）が反応装置１０にロードされる。試薬コンテナ３９を有する試薬ラック３４は、ラックマウント３０にロードされる。センサ３５はそれらの存在を検出し、バーコードセンサ３３は各試薬コンテナ３９のバーコードを読み取り、試薬ラック３４内におけるその位置に対する各試薬コンテナ３９の内容を識別する。スライド１上のサンプルに対するスライド１のバーコード６に関する情報、及び、それらの各内容に関する試薬コンテナ３９のバーコード６に関する情報がコントローラ（図示せず）に入力される。このコントローラは、典型的には、適切なソフトウエアインターフェース及びドライバ（driver）を有するコンピュータワークステーションである。少なくとも１つ、ただし１０以下のスライド１を収容しているスライドトレー１５は受け入れポート１４内に配置される。ここで、センサ（図示せず）は、スライドトレー１５を検出し、ステーション３５ａの走査（scan）を開始させる。走査時には、ロボットアーム１６のバーコードセンサ３３は各ステーション３５ａに移動し、バーコード６を読み取ろうと試みる。もしバーコード６を伴ったスライド１が存在すれば、コントローラは、バーコード６を、ユーザによって入力された情報及び既知のスライドのリストと比較し、個々のスライド１にどのプロトコルを適用するかを決定する。あるいは、バーコードが走査された後、ユーザは、スライドを処理するために反応装置に必要とされる情報を入力する。各スライドは、異なるプロトコルを有していてもよい。コントローラは、プロトコルによって指示された反応を実行するのに必要な試薬を、試薬ラック３４内のコンテナ３９内に配置された試薬と比較する。どのような不一致も、ユーザに送られるべきエラーメッセージを生じさせるであろう。もしコンテナ３９が見つからなければ、試薬ラック３４が除去され、正しいコンテナ３９を試薬ラック３４内に配置することができる。ここで、試薬ラック３４が検出され、試薬コンテナ３９のもう１つの走査が実行される。
【００６６】
もしエラーがなければ、ロボットアーム１６は、分配手段２６のピペット２８を適切な試薬コンテナ３９のところに移動させ、必要とされる量の流体を引き抜く。このとき、分配手段２６は、ピペット２８のキャパシタンス（capacitance）をチェックする。このキャパシタンスは、ピペット２８が試薬コンテナ３９の流体表面に接触したときに変化する。このようにして、試薬コンテナ３９内に残留している流体の体積（容量）を決定することができ、ユーザは、必要に応じて試薬コンテナ３９を取り換えることができる。この後、ロボットアーム１６は、ピペット２８を、第１のスライド１のところに移動させ（コントローラによって決定される）、流体をスライド１の表面に分配する。スライド１上のサンプル５に対するピペット２８及びカバー２の配置については、いくつかのオプション形態（option）が存在するが、これらは以下でさらに詳しく説明されるであろう。
【００６７】
第１のスライド１に対する分配動作が実行された後、さらなるスライドに対してこのプロセスが繰り返される。各スライド１においては、各ステップで同一の流体を充填する（fill）ことは必要ではなく、スライド１に任意の適切な順序で流体を充填することができる。図１１に示すように、洗浄ステーション１２０は、試薬ラック３４の近傍に配置され、異なる試薬の引き抜きに先立ってピペット２８を清浄にするのに用いることができる。洗浄ステーション１２０は、ピペット２８を受け入れるためのレセプタクル１２１を含む。ここで、１つのバルク試薬コンテナ２０からの洗浄流体は、ピペット２８の外側にポンプ輸送され（pumped）、先行する流体の痕跡（trace）を除去する。洗浄流体は、ピペット２８の内側表面を洗浄するために、管路（tubing）を経由して、バルク試薬コンテナ２０からポンプ輸送してもよい。
【００６８】
試薬は、バルク試薬コンテナ２０から、配管（piping）及びバルブ（図示せず）を通して、ピペット２８にポンプ輸送することができる。バルク試薬コンテナ２０からのバルク試薬はまた、洗浄ステーション１２０にもポンプ輸送することができる。
【００６９】
反応装置１０の本体部１２（body）に含まれている、バルク試薬コンテナ２０などのその他の試薬コンテナは、スライド上に分配することができるタイプの試薬に付加することができる。いくつかのバルク試薬コンテナ２０は、通常、サンプルの洗浄及び水和（hydrating）に必要とされる流体を収容している。
【００７０】
試薬ラック３４は、検出キット（detection kit）を収容するために用いることができる。検出キットは、１つ又はこれより多いサンプルに特定の試験を実施するために用いられる分離された試薬コンテナ３９内の複数の試薬からなる。このような検出キットは、単一の試験を実行するための９つの試薬コンテナ３９を含むことができ、これはその他のスライドに用いることができる試薬コンテナ３９の数を２７にまで低減する。
【００７１】
スライド上のサンプルに添加される典型的な試薬は、ノボカストラ・ラボラトリ社（Novocastra Laboratory Ltd）によって販売されている一次抗体（primary antibody）を含んでいる。これらの試薬は、通常、典型的には７ｍｌから３０ｍｌまでの間の体積の試薬コンテナ３９に供給される。緩衝液及び脱イオン水などのその他の試薬及び流体は、典型的には１〜４リットルの間の体積を有するバルク貯蔵コンテナ２０内に保持することができる。
【００７２】
サンプルへの添加（application）のために準備された、いくつかの試薬の貯蔵寿命は比較的短い。それゆえ、試薬は、いつでも使用できる処方（ready-to-use formulation）に予混合されて供給され、この場合、それは発注から短期間内に用いなければならない。あるいは、試薬は、使用に先立って研究スタッフによって準備され、適切な試薬コンテナ内に配置されてもよい。３’，３−ジアミノベンジジン（ＤＡＢ：3',3-diamino benzidene）などのいくつかの試薬は、最終的な形態にあるときには、準備後すぐに劣化し始め、最初の準備の後２４時間を超えると使用不可能となるであろう。これは、毎日新たにバッチ（batch）を準備することを必要とし、古いバッチは使用後に確実に廃棄することになる。さらに、プロテアーゼ（protease）などの酵素を、組織の型（tissue type）や、添加されるべきその他の試薬などの因子に依存して濃度を変化させるのに添加することが必要であろう。これは、サンプルへの添加の前に多数のバッチの試薬を準備することを必要とする結果となるであろう。この場合、正確な添加、有効期限、正確な混合、追跡及び追跡可能性などといった関連する問題を伴うであろう。
【００７３】
濃縮された一次抗体はまた、使用前に準備することが必要であり、サンプルへの添加前に希釈することが必要であろう。一次抗体は、濃縮された形態、又は予め希釈されたいつでも使用できる形態のいずれかで供給することができる。しかしながら、単一の反応装置１０で、同一の抗体に、いくつかの異なる希釈を行うことが必要であろう。そうでなければ、これは、試薬ラック３４内にいくつかの場所を占めるであろう。それゆえ、抗体について単一の試薬コンテナ３９を用いるのが有利であろう。ここで、抗体試薬の希釈は、試薬をサンプルに添加する前に行うことができる。一次抗体は、ビジョン・バイオシステムズ社（Vision BioSystems Ltd）によって販売されているＡＢＤＩＬ９３５２などの一次抗体希釈剤によって希釈することができる。
【００７４】
図１１に示すように、この実施の形態に係る反応装置１０では、混合ステーション１２２が設けられている。図１７に示すように、混合ステーション１２２は、複数の混合バイアル瓶１３２（vial）を有する挿入部材１３０（insert）を含んでいる。挿入部材１３０は、６つのバイアル瓶１３２を有し、各バイアル瓶１３２は異なる試薬を保持することができる。図示されたバイアル瓶１３２は、全て同一の体積であるが、必要に応じて体積を変えてもよい。典型的な体積は、１つのバイアル瓶１３２につき７ｍｌである。
【００７５】
また、挿入部材１３０には、タブ１３４（tab）も取り付けられている。タブ１３４は、バーコードなどにより挿入部材１３０を識別（特定）するのに用いられる。挿入部材１３０は使い捨てであると予想されるが、反応装置１０のいくつかの運転（run）にわたって、複数の異なる試薬を収容することができる。
【００７６】
挿入部材１３０のバーコードは、挿入部材１３０を識別するのに用いることができる。これにより、コントローラは、挿入部材１３０をいつ破棄すべきかを知り、新たな挿入部材を混合ステーション１２２にロードすることを要求する。これは、ある一連の期間又は使用の後に予め設定することができる。
【００７７】
挿入部材１３０には、任意のバイアル瓶１３２から溢流（オーバーフロー）する余剰の流体を該挿入部材から排出するのを可能にする溢流開口部１３５（overflow aperture）も設けられている。
【００７８】
使用時には、スライドのバーコードの情報はコントローラ内のデータベースと照合され、どのシリーズの試薬を各スライドに添加すべきかを定めることができる。この後、反応装置１０は、要求された試薬を、現在ロードされている試薬と比較する。もしある試薬があるサンプルに対して添加すべき最終的な形態ではないと識別されれば、準備ステップが、反応装置１０で実行すべき作業の指示計画に組み入れられる（計画される）。
【００７９】
ある具体例においては、それぞれＤＡＢの成分Ａ、Ｂ及びＣを有する３つの試薬コンテナ（試薬ラック３４内に配置された試薬コンテナ３９と同一）を、反応装置１０に配置することができる。この具体例においては、ＤＡＢを、Ａが１部であり、Ｂが２５部であり、Ｃが１部である比率で混合するであろう。使える状態である１バッチのＤＡＢを混合するために、ロボットアーム１６は、まず、成分Ａを収容している試薬コンテナのところに移動し、設定された体積の成分Ａの試薬を抜き出す。この後、ロボットアーム１６は、混合ステーション１２２で１つのバイアル瓶１３２のところに移動し、１つのバイアル瓶１３２内に上記体積の試薬を落とす。この後、ピペット２８は、混合ステーション１２２の次に配置されている洗浄ステーション１２０に移動させられ、ここでピペット２８の外側及び内側が洗浄処理される（rinse）。清浄化の後、ロボットアーム１６は、ピペット２８を、成分Ｂの試薬を収容している試薬コンテナのところに移動させる。ピペット２８は、試薬（成分Ａの体積の２５倍）を引き抜き、成分Ａを収容しているバイアル瓶のところへ移動する。試薬をバイアル瓶内に落とした後、ピペット２８は、成分Ｃの試薬を保持している試薬コンテナのところへの移動の前に、洗浄ステーションのところに移動し、再び洗浄される。成分Ａを保持しているコンテナから除去されたのと同一の体積（volume）が除去され、そしてピペット２８は元のバイアル瓶のところに移動し、該試薬をその他の試薬とともに落とす。最初に試薬を混合バイアル瓶内へ落とす（deposit）ことにより、いくらかの混合が生じるが、試薬の一部又は全部をバイアル瓶１３２からピペット２８内に引き抜き、この後試薬をバイアル瓶１３２内に再び落とすことにより、さらなる混合を実現することができる。ピペット２８は、試薬を落とすときに、その先端部が流体レベルの上方に位置することを確実化して混合プロセスを促進するために、上下方向に移動することができる。再度落とすことによるエネルギは、試薬をより容易に混合させる結果となる。この混合プロセスは、所望の回数実行することができる。試薬が十分に混合された後、もしサンプルに添加すべき次の試薬がＤＡＢでなければ、ピペット２８を洗浄ステーション１２０に進めることができる。バイアル瓶のこの体積及びピペット２８によって引き抜かれた量は、サンプルに対する多くの添加（application）に対して十分な量のＤＡＢを供給する。ＤＡＢが必要なときはいつでも、ロボットアーム１６は、ピペット２８を特定の試薬の混合がコントローラによって記録されるバイアル瓶である、ＤＡＢが混合されたところのバイアル瓶に移動させる。準備の時間もまた記録され、これにより、予め設定された期間の後、混合された試薬を廃棄することができる。これは、準備された試薬が使用期限後に用いられるのを防止する。
【００８０】
その日の試験の完了後、又はＤＡＢの使用期限が到来したときに、ＤＡＢ（又は、使用期限が到来したその他の試薬）を収容しているバイアル瓶１３２を、以下で説明するように清浄化することができる。
【００８１】
１バッチにおける混合計画の作成手法に関して、２００３年２月２４日に本願出願人によって出願され、その内容が参照のためにここに編入されている、「計画作成方法（Method of Scheduling）」と題されたオーストラリア仮特許出願に、特定の詳細な計画作成手法が開示されている。
【００８２】
上記プロセスは自動化されているが、用いられる手段（resources）、すなわちロボットアーム１６及びピペット２８は、サンプルへの一般的な試薬の添加におけるかなりの期間にわたって利用されることができる。それゆえ、１日に数バッチの試薬を準備する必要をなくす（低減する）のが望ましいであろう。この理由により、反応装置１０は、該反応装置１０内にロードされたサンプルが存在しないとき、又は通常の処理時に試薬を準備するようプログラムを組むことができ、体積及び濃度は、ユーザインターフェース（図示せず）により、ユーザが決定することができる。
【００８３】
上記の具体例においては、各バイアル瓶１３２内の各試薬の準備の時間及び濃度は、反応装置１０のコントローラのメモリ内に記憶される。このため、古い又は不正に混合された試薬がサンプルに添加される機会がなくなり、オペレータのミスを低減することができる。
【００８４】
ピペット２８による混合は、準備された試薬が、サンプルへの添加の前に十分に混合されることを確実にする。これにより、例えば試薬の成分をサンプルに直接添加してサンプル上で混合するよりも、より均一な混合を行うことができる。
【００８５】
反応装置１０での混合によって恩恵を受ける試薬のその他の例は、多数の濃度で添加することが必要とされるプロテアーゼである。上記の具体例では、プロテアーゼについては１つの試薬コンテナだけが必要とされ、プロテアーゼのいくつかの濃度は、試薬コンテナ３９又はバルク試薬コンテナ２０に貯留されている希釈剤を用いて反応装置１０によって準備することができる。これらの異なる濃度のものは、後の使用のために異なるバイアル瓶１３２内に配置されてもよい。
【００８６】
上記の具体例では、混合作業（mixing task）を、サンプルへの試薬添加ステップに組み入れさせることが可能である。例えば、ロボットアームに必要な作業が存在しない場合、スライドの試験中にしばしば時間が存在する。これらの時間は、空き時間（open time）と称されるが、これは典型的には、次のステップを実行する前にスライドに添加される流体が反応時間を必要とするときに起こる。もし空き時間が十分に長ければ、混合ステップに計画を組み入れることが可能であろう。これは、サンプルへの流体の添加を完了するのに必要な時間を最小にする一方、オペレータを試薬の準備から解放する。
【００８７】
試薬が準備されてサンプルに添加された後、残っているか又は使用期限が切れた準備試薬（prepared reagent）は、アスピレータ（aspirator）により吸い上げられて消耗される。この後、バイアル瓶１３２が清浄化される。清浄化は、必要とされる準備試薬が分配された後、残っている準備試薬を排出することにより実施される。流体の排出はピペット２８で行われ、排出された流体は、内部でポンプ輸送されバルク廃棄コンテナに送られる。実質的に空になれば、すすぎサイクルが実施される。すすぎサイクルでは、例えばバイアル瓶１３２内に分配されたＩＭＳなどのアルコールを含むことも可能である洗浄液を用いることができる。この後、洗浄液は、ピペット２８を経由して排出される。複数のすすぎサイクルを実施してもよい。最後のすすぎについて洗浄液を除去した後、残っている洗浄液を蒸発させて、バイアル瓶を完全に空にすることが可能である。
【００８８】
最初の準備から予め設定された時間が経過した後、混合バイアル瓶に戻って（revisit）試薬を再混合することも可能である。これは、準備試薬の一部をピペット２８内に引き抜いて、同一のバイアル瓶１３２に分配することにより行うことができる。これは、準備試薬の成分が時間後も滞留し、又は時間後に混合された状態で滞留しないときには重要であろう。最初の混合に伴って、ロボットアーム及びアスピレータの非動作時に、再混合ステップを組み入れてもよい。
【００８９】
スライドトレー１５が反応装置１０にロードされたときには、各ブラケット４４は、スライドトレー１５内の各カバー２のロケータアーム３（locator arm）と係合している。開かれた充填（open fill）が必要な場合、すなわち、カバー２がスライド１から実質的に又は十分に引き出されている場合、ロケータ係合手段４３は、スライドから離れているスライドトレー１５上の全てのカバー２を、図８（ａ）中のカバー２で示されている位置に移動させる。この開かれたカバー２の位置はサンプル５を露出させ、この場合、ピペット２８を、種々の位置に位置決めすることができる。図８に示すように、ピペット２８の位置は、流体をピペット２８に直接分配するためのサンプル５の上方の位置、あるいは、流体を流体容器１９に戻すためのカバー２の前部に隣り合う位置を含む。各位置についての理由は、以下で説明される。
【００９０】
開かれた充填位置においては、流体が全てのスライドに分配されると、ロケータ係合手段４３が、スライド上のサンプルの上方の反応室３２の位置に移動する。スライド１の表面の上方のカバー２の移動及び毛管作用は、分配された流体に、カバー２とスライド１との間の領域内への流れを生じさせる。クランプ６０は、カバー２を所定の位置に保持するのに用いることができ、カバー２とスライド１との間の液体の膜上にカバー２が浮遊する（浮かぶ）のを防止することができる。
【００９１】
図１４及び図１５に示すように、スライド１は、ブロック４０の上にあるときには、ウィッキングポスト４２と当接することができる。スライド長が変わる（vary）ので、ブロック４０上でのスライド１の移動が可能である。そして、スライドの上方のカバー２の移動は、スライド１を移動させることができる。通常、この移動は、１〜２ｍｍのオーダーにすぎない。もう１つの具体例（図示せず）では、アクチュエータを用い、スライドをウィッキングポストから遠ざかるように移動させて反応室からの流体のウィッキング（漏出）を低減することが可能である。
【００９２】
図１５は、スライド１及びその上のカバー２を示し、両者ともブロック４０の上に配置されている。ウィッキングポスト４２はスライドと当接し、したがって流体のためのウィッキング通路を形成する。反応室は、スライドとカバーとの間に位置するが、図１５がほぼ縮尺どおりであるので、この図では明確にはみることができない。流体容器１９に入った流体は反応室内に流入し、反応室からウィッキングポスト４２につながる排出部５５（drain）に流下することができる。ファン（図示せず）などのポンプにより排出部５５から空気を引き抜くことにより、ウィッキングポストのまわりの空気圧を低下させて流体の除去を助勢することができる。これは、もし必要であれば、反応室を通って排出部５５外への流体の流れを促進するであろう。スライドからカバーを引き出すこともまた、排出部５５への流体の流下を促進するであろう。
【００９３】
ウィッキングポストからの流体圧力が存在する場合、又は該領域の空気圧が低下している場合、流体のメニスカス（meniscus）がウィッキングポスト近傍のスライドのエッジ（edge）から伸びているので、ウィッキングポストがスライドに当接していなくても、ウィッキングポストは流体をウィックする（除去する）であろう。
【００９４】
しかしながら、培養時（incubation period）などにおいてもし必要であれば、ロケータアーム３を操作することによりウィッキング作用を中断することができる。これにより、カバー２を、ウィッキングポスト４２から離れる方向に、反応室からの流体のさらなる排出を防止するのに十分な距離だけ移動させることができる。
【００９５】
分配された流体が反応室３２を充填したときに、反応室内の流体とウィッキングポスト４２との間に流体接触が生じるであろう。ブロック４０の上面は、水平方向に対してほぼ５度の角度で傾斜している。ここで、ウィッキングポストと隣り合うスライド端部は、スライドのバーコード端より低い位置にある。この角度は、ウィッキングポスト４２に向かう流体の流れを促進し、これはブロック４０から離れてスライド１との接触だけを生じさせる。ウィッキングポスト４２がスライド１の上面又はその近傍でスライド１と当接するので、スライド上面の最も低い端部では、流体はウィッキングポスト４２と隣り合うスライドの上の反応室内の領域からウィックする（wick）傾向があるが、それ以外にはウィッキングポイント（wicking point）は存在しないのでその他の領域からウィックする傾向はないであろう。
【００９６】
ディスペンサ２６（dispenser）を制御し、流体を種々の位置でスライド上に分配することが可能である。流体は、スライドのバーコード端に向かって、又はカバーが開かれた位置にある場合はスライドのウィッキングポスト側の端部に向かって、分配することができる。ディスペンサを、流体がスライド上で複数の位置に分配される「ねじれた滝（staggered waterfall）」の形態（arrangement）で分配することも可能である。カバーを、ディスペンサがスライドを上向きに移動するのに伴って閉じてもよい。
【００９７】
流体は、制御された体積でスライド１上に分配される。現在の配置構造（arrangement）においては、次の２つの条件のうちの１つが満足されない限り、流体は、反応室３２からウィッキングポスト４２に下向きにウィック（流出、漏出）しないということが見出された。第１に、容器１９内の流体は、反応室３２を通して流体を押圧することが必要である。追加の流体は、先行する流体を移動させてこれを反応室から除去する。先行する流体は、ウィッキングポストを経由して反応室から除去される。かくして、流体を流体容器内に配置することにより、反応室内の流体を交換することが可能である。第２に、ポンプは、ウィッキングポストのまわりに低減された大気圧を生成して、反応室から流体を引き出す圧力差を惹起することができる。反応室の流体はまた、ウィッキングポストのまわりの空気圧を低減することにより排出することができる。
【００９８】
反応室に新たな流体が加えられることになっていない場合、反応室を開くことにより、反応室から流体を排出することが可能である。これは、サンプルが覆われなくなるまでスライド１に沿ってカバーを滑動させること（sliding）により実現される。反応室内の流体は、サンプルから離れたカバーに追従する傾向があり、これにより流体がウィッキングポストを経由して排出されるであろう。あるいは、ファンを動作させて反応室から流体を引き出すことが可能である。この場合、カバーは、閉じられた位置のままでいることができる。上記の組み合わせも可能である。
【００９９】
供給されている流体又は反応室内の流体がとくに粘度が高い場合などにおいては、ポンプを利用して流体を容器に供給し、反応室を通しての流体流れを生じさせることが必要であろう。このようにして、流体を制御された方法で切り替える（change over）ことが可能である。
【０１００】
カバー２及びスライド１は、反応が完了したときに反応装置１０から除去され、それゆえ、反応室３２は各反応に対して固有（unique）である。これは、他の反応装置で必要とされる固定的な（static）反応室を完全に清浄化する必要性をなくす。さらに、反応室は、環境に対して実質的にシールされ、蒸発を低減するとともにサンプルの乾燥（drying out）の可能性を低減する。
【０１０１】
反応室が、スライドと、交換可能なカバーとで形成されているので、反応室の形成は比較的安価であり、各反応に対して新しく清浄な反応室が形成され、清浄化に要するコスト及び時間が低減されるとともに、先行する反応又は洗浄流体による汚染の可能性が除去される。
【０１０２】
カバーの引き出しを伴った最初の充填（開放充填）は、反応室内での空洞（void）又は泡の生成を最小にしつつ反応室に流体を充填する方法をもたらす。反応室がほぼ１００ミクロンの深さを有するものであるので、反応室を形成しているスライドの上方にカバーが存在する場合、反応室から泡又は空洞を流し出す（flush）ことは困難である。反応に用いられるいくつかの流体は、極端に高価であったり、有害であったりするかもしれず、それゆえそれらの消費を最小限にとどめるのが望ましい。
【０１０３】
適切な最初の充填流体は、２５ないし３０％のグリセロールを含む、水とグリセロールの混合物であるということが見出された。少量のグリセロールは、大量のグリセロールと同様に、泡の形成・発生の低減を助勢する。しかしながら、ある環境では、体積で２５％のグリセロールが良好に作用するということが見出された。表面張力を低減するために、洗浄剤（例えば、ツイーン（Tween））などの添加物（additive）が含まれていてもよく、かかる添加物はまた、ある環境では空洞を除去するのに有益であるということも証明された。
【０１０４】
グリセロールの使用は、流体が外部のウィッキング通路を経由してスライド表面からウィックする傾向を低減する。これは、最初の充填時に生成する大きな泡の数を低減する。
【０１０５】
最初の充填の後に反応室内に存在するかもしれない空洞の除去を助勢するために、表面張力及び粘度が低く水と混和する（miscible）、イソプロパノールのようなアルコールなどの流体が洗い流し流体（flushing fluid）として有用であるということが見出された。
【０１０６】
典型的には、洗い流し（flushing）は加熱段階（heating phase）の後に起こり、反応室内の温度の上昇に伴って泡又は空洞の形成が生じるであろう。イソプロパノールなどの低粘度の流体の使用は、泡又は空洞の移動を促進する。
【０１０７】
反応室に流体が充填された（満たされた）後、追加の空気を閉じ込める（entrap）ことなく、さらなる流体を加えることが可能である。かくして、場合によっては、単に流体容器を満たすこと（topping up）により、流体を変えてウィッキングポスト近傍の空気圧を低減することが可能である。このように形成された反応室は、新たな流体が交換している流体と混合する傾向はないであろうといった望ましい流れ特性を呈する。反応室の毛管特性は、さほど乱流混合を生じさせず、それゆえ、反応室又はスライド表面の洗い流しをさほど必要とせず、流体の変化を正確に決める（time）ことが可能である。これは、反応の開始及び終了を、流体及び反応のある範囲にわたって十分な正確さでもって決定することを可能にする。
【０１０８】
圧力の低下及びカバー移動の速度は、背後に残っている残留流体の体積に影響を及ぼす（effect）であろう。
【０１０９】
サンプル上の反応室内での反応を促進するために、クランプ６０の負荷（load）を調節することにより、カバーをスライド上で上下方向に（図８に示すｚ軸方向）移動させることが可能である。この上下方向の移動は、上下方向の流体の混合に加えて、スライドの長手方向ではなく、スライドと交差する方向（ｙ軸方向）の流体の混合を促進する。反応室に対する流体の充填（注入）及び排出は、流体をスライドの長手方向（ｘ軸方向）に沿って移動させ、これは、アーム４４を移動させることにより、カバーをスライドのｘ軸に沿って移動させることにより、促進することができる。ブロック４０は、反応を促進するために加熱してもよい。
【０１１０】
例えば原位置交配（in situ-hybridisation）、エピトープリトリーバル（epitope retrieval）、脱ロウ（dewaxing）をはじめとする多くの反応においては、反応室内の流体をセ氏１００度に近い温度まで加熱するのが望ましい。この場合、気泡を生成することが知られているが、かかる気泡は、移動させるのは困難であろう。泡がサンプル上で生じた場合、それらはサンプルにさらされる流体の量を低減し、それゆえサンプル内に加えて、異なるスライド上のサンプル間にも、結果の一致を生じさせることができる。この場合、１つ又はこれより多いコーティング（coating）を有するカバーを用いることが泡の形成・発生を低減するということが見出された。
【０１１１】
反応装置１０のもう１つの特徴は、反応室の寸法を変えることができることである。典型的には、閉じられた位置と称されている、カバーが完全にスライドの上方にある状態では、反応室の体積は１５０マイクロリットルである。しかしながら、カバーが完全に閉じられていない場合、カバーとスライドとの間に形成された反応室の体積は低減されたものとなるであろう。図８（ｂ）においては、カバーは部分的に閉じられた位置で示され、この場合、反応室の体積はかなり低減され、例えば８０マイクロリットルまで低減されるであろう。この具体例は、サンプルが小さい場合、あるいはサンプルがスライド端部に向かって置かれている場合に有用であり、カバーが、サンプルを覆いつつ、より小さい反応室を形成することを可能にする。より小さい反応室は、より小さい体積の流体しか必要とせず、これは、用いられる流体が高価な場合、又は入手が困難な場合に有利である。反応室のこれらの具体例は、流体をスライド上に分配するときに、カバーの位置を参照することを可能にする。それゆえ、カバーが開かれた位置にあるときには、流体を、組織サンプルの頂部、又は組織サンプルとカバーとの間のいずれかに分配することが可能である。これにより、閉じられた位置に向かうカバーの移動が、反応室に流体を充填しつつサンプルを横切って流体を押圧する。流体をスライドに沿う方向の複数の位置に分配し、又は、流体をカバーの前側エッジ又はその近傍に分配することも可能である。
【０１１２】
以下、上記反応装置のセットアップ（set up）及び使用について説明を行う。
１． スライドのロード
ガラスのスライドの上に取り付けられたパラフィン包埋組織（paraffin-embedded tissue）の切片（サンプル５）を、カバー２を伴ったスライドトレー１５内にロードし、反応装置１０の受け入れゾーン１４に挿入する。ユーザは、所望のプロトコルと実行タイプ［すなわち、１００μＬ（エコノミタイプ、スライドの２／３）又は１５０μＬ（標準タイプ、全スライド）］）とを選択し、必要な試薬コンテナ３９を収容している試薬トレー３４が反応装置１０にロードされるのを確実にする。
【０１１３】
２． 脱ロウ
染色処理（staining procedures）の実施に先立って、切片化（sectioning）に続いて組織の切片（section）からのロウ（wax）の除去を行うことが必要である。機器（instrument）で脱ロウを行うために、カバーを閉じられた位置にとどめる一方、脱ロウ溶液（dewaxing solution）を分配手段２６によりスライド上に分配し、このスライドを取り付けブロック４０により７０°Ｃまで予熱する。スライドを、ポンプ（図示せず）によって惹起されたウィッキングポストまわりの低減された空気圧により、過剰の脱ロウ溶液の除去に先立って、７０°Ｃで４分間培養する（incubate）。さらに４分間の７０°Ｃでの培養のために、スライド上に新しい脱ロウ溶液を分配する。典型的には、このプロセスを、脱ロウを必要とするトレー内の全てのスライドに対してもう１回繰り返す。スライドを周囲温度まで冷却し、残りの溶解しているロウを含んでいる過剰の脱ロウ溶液を除去するために、カバーを開閉する。全てのスライドを、残留している脱ロウ溶液を除去するために、１つずつ、分配手段によって供給されたイソプロパノールで洗浄し、この後、全てのスライドに対して、分配手段によって分配された蒸留水で再び水分補給を行う。
【０１１４】
３． エピトープリトリーバル（抗原性賦活化）
ＩＨＣ処理及びＩＳＨ処理を行う前に、固定処理（fixation process）中に隠されてしまう（hidden）かもしれない組織内のエピトープ（タンパク質、ＤＮＡ、ＲＮＡ）を露出させることが必要である。この機器では、２つのプロトコルを備えることができる。
【０１１５】
ａ． 熱誘発型エピトープリトリーバル（HIER、heat-induced epitope retrieval）
脱ロウに続いて、全てのスライドは、カバーが開かれた位置でリトリーバルバッファ（最初の充填流体）（１０ｍＭ、クエン酸ナトリウム／３０％、グリセロール／０．０５％、ツイーン）の最初の充填を受け入れ、スライドへの溶液の下降移動を促進して、泡の形成を低減する。カバーを閉じ、取り付けブロック４０によりスライドを、必要なリトリーバル時間だけ１００°Ｃに加熱する。リトリーバルが終了した後、スライドを、分配手段により、リトリーバルバッファでの個々の洗い流しで冷却する。
【０１１６】
ｂ． 酵素誘発型エピトープリトリーバル（EIER、enzyme-induced epitope retrieval）
プロテアーゼ溶液（すなわち、プロテイナーゼＫ（proteinase K）、ペプシン（pepsin）、及びトリプシン（trypsin））を、分配手段により各スライド上に分配し、所望のリトリーバル温度（例えば、周囲温度〜５０°Ｃ、又は、室温）で１０〜３０分間培養する。リトリーバルが完了した後、各スライドを、分配手段によって分配された蒸留水で洗浄する。
【０１１７】
４． 免疫ヒソケミストリ（IHC、immunohisochemistry）
ＩＨＣは、組織の生体検査（biopsies）及び標本（specimens）における、抗原（タンパク質）に対する抗体（タンパク質）の特異結合（specific binding）に基づいている。エピトープリトリーバル段階に続いて、各スライドは、分配手段から、ツイーン−２０を含んでいるバッファを受け入れる。各スライドを、過酸化水素でもって、周囲温度で８分間処理して組織切片内の内生ペルオキシダーゼ活性（endogenous peroxidase activity）をブロックする（block）し、ツイーン−２０を含んでいるＴＷＢバッファで洗浄し、再び分配手段により分配する。特定のターゲットのタンパク質に向けられた一次抗体を、分配手段により組織サンプルに供給し、１５〜６０分間培養する。この後に続いて、第２のビオチン標識抗体（secondary biotin-labelled antibody）の培養を行う。結合抗体（bound antibody）を、各スライド上に、ストレプタビジン―又はアルカリ性ホスファターゼ―共役ペルオキシダーゼ（streptavidin-or alkaline phosphatase-conjugated peroxidase）を分配することにより検出する。これらを、すべて分配手段よって分配された色原体（chromogen）、すなわちＤＡＢ、ＢＣＩＰ／ＮＢＴの添加により可視化する。切片を、分配手段によって分配されたヘマトキシリン（hematoxylin）で対比染色する（counterstained）。
【０１１８】
５． 原位置交配（ＩＳＨ）
ＩＳＨは、細胞内における特定の核酸配列の検出を可能にする。ＥＩＥＲ段階に続いて、組織切片を、イソプロパノールを各スライドの反応室内に分配することにより脱水し、カバーを開かれた位置に移動させて組織を乾燥させる。蛍光色素又はビオチン標識核酸のプローブ（probe）をスライドに供給し、カバーを緩慢に閉じてプローブを、該組織と交差する方向に均一となるように分布させる。このプローブを、組織切片中のその相補的ＤＮＡ／ＲＮＡターゲットと、３７〜５５°Ｃで１．５〜２時間交配させることが可能である。ターゲットがＤＮＡである場合、組織切片及びプローブを、まず、交配に先立って５〜１０分間、高温で（すなわち、９５°Ｃ）変性させる（denature）。スライドを、ねじれた滝のすすぎを用いて、分配手段からのＴＷＢを分配することにより洗浄し、非結合プローブを穏やかに除去する。洗浄に続いて、カバーを、残りの処理のために、閉じられた位置に移動させる。結合プローブを、分配手段から分配されたアンチフルオレセイン又はアンチビオチンの共役抗体をアルカリ性ホスフォターゼに供給することにより検出する。これを、分配手段から分配された酵素基質（ＢＣＩＰ／ＮＢＴ）の添加により可視化する。
【０１１９】
６． 除去
特定のスライドトレーに対してプロトコルが完了した後、このスライドトレーを、他のスライドトレーの状態にかかわりなく除去することができる。このスライドトレーは、それぞれ、利用される異なるプロトコルを有しているスライドを収容することができるので、このスライドトレーは、この特定のスライドトレーに対するすべてのプロトコルが完了するまで、反応装置内に残さなければならない。光などの表示手段（indicator）は、スライドトレー上のスライドに適用されるべきすべてのプロトコルが完了したときに、これをユーザに報知する。
【０１２０】
反応室に流体を充填した後、サンプルを、ある延長された期間、バッファ内に保持することが可能である。反応室内の流体は、例えば、あるいくつかのスライドの反応は完了されているが、スライドトレー上の他のスライドはさらなる処理を必要とする場合に、補充する（top up）ことができる。３つのスライドトレーを有するので、時間集中処理（time intensive processing）を必要とするサンプルが１つのスライドトレー内に配置される一方、より速い処理が個別のスライドトレーで実施される場合に、ある程度の柔軟性（a certain amount of flexibility）がある。追加のスライドトレーを導入する一方、１つ又はこれより多いスライドトレーで処理を開始することができる。そして、終了したスライドトレーを除去する一方、他のスライドトレーを処理することが可能である。試薬ラック３４を、例えばコンテナが空になった場合には、処理の実行中に除去することができる。試薬ラック３４を交換した後、バーコードセンサ３３で、再び試薬コンテナ上のバーコードを走査し、正しい試薬のみの供給を確実にする。
【０１２１】
分配機構は、試薬コンテナ内の流体のレベルを検出するためのセンサを用いている。それゆえ、コンテナの中身が残り少なくなっているときには、ユーザに警告を発する。試薬が適切に貯留されていない場合、有効期間が短くかつ試薬が高価であるときには、消費の低減はかなり有利であるので、これは重要である。
【０１２２】
センサは、ピペットが試薬コンテナ内の流体の表面に到達したときにこれを検出するために、ピペットに取り付けてもよい。これは、コンテナの体積を決定し、流体レベルが予め設定されたレベルまで低下したときに、オペレータに警報を送ることを可能にする。この後、試薬ラックを反応装置から除去し、コンテナを交換することができる。ここで、スキャナは、試薬コンテナ上のバーコードを読み取ることにより、正しい試薬に交換されたかどうかを決定するであろう。このようにして、オペレータのミスが低減される。
【０１２３】
以上で説明されたように多数の変形例が存在するが、反応装置は、流体の供給、反応時間及び温度に対して柔軟な取り組みが可能となるような仕様となっている。それゆえ、反応装置は、流体の供給、カバーの位置及び移動についての変形例である、可能な手法の中の特定の例に限定することを意図しているのではない。
【０１２４】
利用することができるプロトコルを変えることができ、単一のラック内のスライドの上の各サンプルに対して、異なるプロトコルを適用することが可能である。さらに、反応装置は、新たなスライドのトレーをロードし、又は完了したスライドのトレー除去する一方、他のスライドのトレーを処理することが可能である。
【０１２５】
前記の説明に制限されることなく、本発明のいくつかの特定の態様が、いくつかの利点の簡単な説明とともに、以下に記載されている。
【０１２６】
反応装置内のスライドの上に反応室を形成する方法であって、
空洞部を有するカバーをスライドの上に配置し、反応室を形成する過程と、
カバー及びスライドをトレーのレセプタクル内に配置する過程と、
トレー内の各レセプタクルのためのマウントを有する反応装置内に、受け入れ部を設ける過程と、
トレーを、反応装置の受け入れ部内にロードし、反応装置の受け入れ部がトレーを配置する過程と、
カバーをスライドに取り外し可能に保持する過程と、
スライド及びカバーからトレーを取り外す過程とを含む方法。
【０１２７】
上記方法は、スライド及びカバーがトレー内のレセプタクルに容易に配置されることを可能にする。このトレーは、ここに開示された実施の形態の図面中に示されているように、複数のレセプタクル、例えば１トレー当たり１０のレセプタクルを有していてもよい。この後、トレーは、反応装置の受け入れ部内にロードされることができ、これにより、例えば、スライド及びカバーで形成された１０までの反応室が、反応装置内に配置されることができる。トレーはロードに際して反応装置によって配置され、そしてスライド及びカバーはトレーによって配置されるので、１０までの反応室の正確な位置は反応装置内で容易に決定されることができる。スライドの寸法が製造上の不正確さに起因して変化するとすれば、カバーはスライドの側部に当接せず（外部のウィッキングポイントをなくすために）、かくしてカバーは、他の手段によって拘束されなければスライドの頂部上で自由に移動することができ、一度に１０の反応室を配置することは困難となるであろう。
【０１２８】
トレーがロードされ、かつスライド及びカバーがクランプによって所定の位置に固定された後、トレーは除去されることができる。この例においては、トレーは下へ落とされ、これによりマウントはスライド及びカバーを担持する。これは、ウィッキングポストを別にすれば、スライドのエッジのまわりのすべての当接（接触）を除去する。かくして、この配置構造でもって、複数（多数）のスライド及びカバーを、スライドの側部と何ら当接させることなく、容易にかつ迅速に配置することが可能である。カバーは能動的なシール構造（positive sealing arrangement）を備えず、かつ反応室は一般に流体で満たされるので、この配置構造は、流体の損失を招くことなく、複数のスライドをロードすることを助勢し、これにより反応室内での泡の形成を最小化する。
【０１２９】
複数の（multiple）スライド及びカバーをロードするための装置であって、
スライド及びカバーのための複数のレセプタクルを有するトレーと、
トレーを受け入れるための受け入れ部と、
受け入れ部内に配置された各レセプタクルのためのマウントと、
各マウントのためのクランプ（clamp：固定具）とを含んでいて、
スライド及びカバーを有するトレーが受け入れ部内にロードされたときに、各クランプが、カバーをスライド上に保持してスライドを配置し、かつ、トレーがスライドから落ちて、各スライドがマウントによって担持されるようになっている装置。
【０１３０】
好ましい態様では、流体排出手段が設けられる。
好ましい態様では、流体排出手段がウィッキング手段を含む。
上記装置は、スライド及びカバーが、必要があればバッチ単位で、オペレータによって容易にロードされるのを可能にする。
【０１３１】
複数のステップを含んでいるスライド上のサンプルでの反応を行わせる方法であって、
少なくとも１つのスライドを有する第１のホルダを反応装置内にロードする過程と、
スライドを走査して、スライド上で起こる反応における複数のステップを決定する過程と、
他のホルダが反応装置内にロードされているかどうかを決定する過程と、
第１のホルダに関連する少なくとも１つのスライドで要求される複数のステップを行わせる過程と、
第２のバッチが検出されたときに、第１のホルダ内の少なくとも１つのスライドに関連する反応におけるステップを継続し、この後、第２のホルダに関連するスライドに関連する少なくとも１つのステップを行わせる過程とを含む方法。
【０１３２】
これは、反応を開始もしくは停止させ、又はその他の作業（ピペットのロボットアームへの取り付けなど）を行わせるのに用いられる装置が常時利用されるわけではないギャップが一般に存在するといった状況で可能である。
【０１３３】
もし装置が常時用いられるのであれば、第２のホルダと関連する少なくとも１つのスライドの上で起こる反応のステップは、第１のバッチ（bath）が終了するまで始まらないであろう。
【０１３４】
スライド上で反応を実施するための装置であって、
スライド及び関連するカバーを担持するとともに配置するようになっている複数のレセプタクルを有するトレーと、
トレーの各レセプタクルと関連するマウントを有する、トレーのための受け入れポートと、
カバー及びスライドを所定の位置に固定するための固定機構と、
カバーとスライドとの間に形成された反応室から流体を排出するための流体排出手段と、
少なくとも１つの流体が該装置に配置されるのを可能にするための流体レセプタクルと、
流体を上記スライド上に分配するための流体分配手段とを含んでいて、
トレーがロードされた後、スライド及びカバーが固定されるとともにトレーが移動させられ、
これにより、スライド及びカバーがマウント上で担持され、流体が、分配手段によってスライド上に分配されることができ、かつ排出手段によって排出されるようになっている装置。
【０１３５】
好ましい態様では、該装置が、スライドに対してカバーを配置するとともに移動させるための配置手段を含んでいる。
好ましい態様では、トレー内の各レセプタクルに関連する配置手段が存在する。
好ましい態様では、１つの特定のトレーと関連する全ての配置手段がすべて同時に移動して、スライドに関連するカバーを移動させ、トレー上の全てのスライドの流体の分配又は排出を促進するようになっている。
【０１３６】
試薬をサンプルスライドに供給するための装置であって、
スライドを受け入れるための複数のポートと、
スライドの各々についての識別情報を読み取るための読取器と、
スライド上に落とされるべき試薬を運ぶ試薬コンテナを受け入れるための試薬ラックとを含んでいて、
スライドが、関連するポートに受け入れられたトレーに供給され、各トレーが個別の１バッチのスライドに相当し、該装置の動作時におけるバッチ処理に対して、個別のトレーの追加及び除去を可能にするようになっている装置。
【０１３７】
バッチのロードは、再び、検査及び計画が関係する範囲において、オペレータに対して実質的な柔軟性を与える。
【符号の説明】
【０１３８】
１０ 反応装置、１２ バルク試薬容器受け入れゾーン、１４ 基材トレー受け入れポート、１５ スライドトレー、１６ ロボットアーム、１８ 試薬ラック受け入れゾーン、２０ バルク試薬容器、２４ ガイド、２６ 分散手段、２８ ピペット、３０ ラックマウント、３１ ラック配置クリップ、３３ センサ、３４ 試薬ラック、３５ センサ、３７ 受け入れ手段、３８ 支持手段、３９ 試薬容器。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、化学反応のための反応室を設けるための方法及び装置に関するものである。本発明はまた、反応室に流体を充填する方法及びこの目的のために用いられる流体に関するものでもある。
【背景技術】
【０００２】
サンプル上で化学反応を開始させるのが望ましい応用例（application）は多数存在する。一般に、サンプルは、顕微鏡スライドの上に配置される。典型的な反応には、細胞物質の免疫組織化学反応（immuno-histochemical reaction）や、ＤＮＡ又はＲＮＡの原位置交配（in situ-hybridisation）が含まれる。他の形態においては、ＤＮＡ、ＲＮＡ、タンパク質又は小さい化学化合物を含んでいる数千の小さい材料サンプルのマイクロアレー（micro array）が顕微鏡スライドに取り付けられる。この場合、スライド上の材料と他の薬品又は流体との間での化学反応を促進するのが望ましい。これらの反応は、制御された反応時間、温度及び薬品濃度をはじめとする制御された条件を必要とする。スライドにおける反応が均一であり、またスライドからスライドへの反応が一貫している（consistent）ことが重要である。蒸発及び流体の総消費量を最小にすることもまた重要である。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００３】
従来、スライド上で起こる化学反応は、熟練者が試薬を加えて混合することにより制御されている。これは、試薬の量及び時間を、スライドごとに制御することを可能にする。しかしながら、この手法では、時間がかかり、非常に熟練したオペレータを必要とし、かつ、スライドからスライドへの一貫した結果を得ることができない。
【課題を解決するための手段】
【０００４】
ある１つの形態においては、本発明は、サンプル領域に位置決めされたサンプルを有する少なくとも１つの基材（substrate）と、分離型のカバーとを受け入れるための生物反応装置であって、サンプル領域の上方において、カバーと基材との間に反応室が形成され、基材を位置決めする（locate）ための位置決め手段と、カバーを基材に対して位置決めするとともに移動させるためのカバー位置決め手段と、反応室内に流体を分配する（dispense）ための流体分配手段と、流体排出機構（draining mechanism）を含んでいて、流体排出機構がウィッキング手段（wicking means：流体除去手段）を含んでいる生物反応装置である。
【０００５】
好ましい態様では、ウィッキング手段は、基材から流体を排出するための流体通路を形成する基材上の当接点（points of contact）を含んでいる。
【０００６】
好ましい態様では、基材は、該装置内で下側から担持（support）されている。基材を下側から担持することは、基材の周縁部付近からウィッキング通路（wicking path）を除去する。
【０００７】
もう１つの態様では、本発明は、反応室の充填を行うための充填流体であって、基材上の先行する流体に比べて、より高い粘度を有している充填流体を提供する。
【０００８】
好ましい態様では、充填流体は水に対して混和性を有する（miscible）ものである。
【０００９】
好ましい態様では、充填流体は水に比べて、より高い沸点を有するものである。
【００１０】
好ましい態様では、充填流体は上記基材又はサンプルに残留物（residue）を残さないものである。
【００１１】
好ましい態様では、充填流体は生物試薬及びサンプルに対して不活性である。
【００１２】
好ましい態様では、充填流体はグリセロール（glycerol）を含む溶液である。
【００１３】
ある１つの態様では、充填流体はグリセロールと水と緩衝物（buffer）とを含んでいる。緩衝物はトリス緩衝食塩水（tris buffered saline）であってもよい。
【００１４】
好ましい態様では、充填流体は、体積で２％から８０％までの間のグリセロールを含んでいる。
【００１５】
より好ましい態様では、充填流体は、体積で１０％から６０％までの間のグリセロールを含んでいる。
【００１６】
より好ましい態様では、充填流体は、２０％から３０％までの間のグリセロールを含んでいる。
【００１７】
ある１つの態様では、充填流体は、充填サイクル中に上記反応室内に形成される泡の放出を促進する界面活性剤を含んでいる。
【００１８】
より好ましい態様では、界面活性剤はツイーン（Tween）である。
【００１９】
もう１つの態様では、本発明は、基材及びカバーを位置決めするようになっている受け入れ手段（receiving means）を有する基材のためのレセプタクル（receptacle）に関する。
【００２０】
好ましい態様では、受け入れ手段は、基材を配置して担持するためのステーションを含み、カバーが基材上で担持されている。
【００２１】
好ましい態様では、受け入れステーションは、基材を、該基材の周縁部付近で担持している。
【００２２】
好ましい態様では、受け入れ手段は、基材を担持するための周縁出っ張り部（peripheral ledges）を有するそれぞれの開口部によって形成されている。
【００２３】
好ましい態様では、開口部が、反応装置から支持プラットホームを受け入れるようになっていて、反応装置内にロード（load：搭載）されたときにプラットホームが上記基材を担持するようになっている。
【００２４】
好ましい態様では、受け入れ手段が、基材からカバーを持ち上げるための持ち上げ手段を有している。
【００２５】
より好ましい態様では、持ち上げ手段は、カバー上の突起部と係合するようになっている傾斜面である。
【００２６】
好ましい態様では、受け入れ手段は、カバーが該レセプタクル及びスライドに対して移動させられることを可能にするガイド部を有している。
【００２７】
もう１つの態様では、本発明は、流体導管と、流体導管に接続されたポンプと、流体導管を、流体源から分配領域に移動させるための位置決め手段とを含んでいる反応装置のためのディスペンサ（dispenser）に関する。
【００２８】
好ましい態様では、ディスペンサは、流体源及び基材のタイプを検出するためのバーコードセンサを含んでいる。
【００２９】
好ましい態様では、ディスペンサは、流体源内に残っている流体の体積（volume）を決定するための手段を含んでいる。
【００３０】
より好ましい態様では、流体源内の流体の体積を決定するための手段は、流体コンテナ内の流体のレベル（level）を計測するようになっているセンサを含んでいる。
【００３１】
より好ましい態様では、センサは、上記流体導管のキャパシタンス（電気容量）の変化を測定して、流体コンテナ内への流体の注入を検出するようになっている。
【００３２】
もう１つの態様では、本発明は、流体を基材に分配する方法であって、少なくとも１つの流体コンテナを備えた試薬レセプタクルをロードするステップと、試薬レセプタクルを反応装置に取り付けるステップと、試薬レセプタクルを検出するステップと、試薬レセプタクルが検出された後、センサを起動して、少なくとも１つの流体コンテナ内の流体のタイプを検出するステップと、流体のタイプについての情報を格納し、要求があったときに流体が基材上に分配されるのを可能にするステップとを含んでいる方法に関する。
【００３３】
好ましい態様では、センサはバーコードを検出する。
【００３４】
もう１つの態様では、本発明は、スライドのための支持突起部と、分配手段と、流体除去手段とを有している反応装置であって、支持突起部が下側からスライドを担持するとともに、ウィッキング手段が上記スライドの周縁部と接触し、ウィッキング手段が、スライドの上表面から流体を除去するためのウィッキングキング通路（wicking path：流体除去通路）を形成している反応装置に関する。
【００３５】
好ましい態様では、支持突起部は、水平方向に対して０ないし１０度傾斜し、流体除去領域を備えたマウント部（mount）を形成している。
【００３６】
好ましい態様では、ウィッキング手段がウィッキングポスト（wicking post：流体除去柱）である。
【００３７】
好ましい態様では、ウィッキングポストは流体除去領域に配置されている。
【００３８】
ある態様では、ウィッキング手段は、スライドの幅の大部分を横切って伸びるようになっている。
【００３９】
もう１つの態様では、本発明は、サンプルを含んでいる表面を有する基材と、サンプルを含んでいる表面とで反応室を形成する表面を有するカバーとを位置決めするようになっている反応装置であって、反応室の体積を変化させるようになっているカバー係合手段を含んでいる反応装置に関する。これは、反応室内における流体の混合を促進する。
【００４０】
ある態様では、カバー係合手段は、カバーを基材にクランプする（clamp：固定する）ようになっているクランプ機構（clamping mechanism：固定機構）である。
【００４１】
もう１つの態様では、本発明は、複数の基材及びカバーを保持するようになっている分離型の基材トレーと、基材トレーを受け入れるための少なくとも１つの受け入れステーションと、基材トレー内の基材の上に流体を分配するための分配手段とを有する反応装置であって、基材とカバーとの間に反応室が形成され、上記基材の上に分配された流体が上記反応室に入るようになっている反応装置に関する。
【００４２】
好ましい態様では、反応装置は、それぞれ基材トレーを受け入れるようになっている複数の受け入れステーションを含んでいる。
【００４３】
好ましい態様では、反応装置は、他のどの基材トレーとも独立して１つの基材トレーの上の基材の上に上記流体が分配されるのを可能にするコントローラ（制御器）を有している。
【００４４】
もう１つの態様では、サンプル領域内に位置決めされたサンプルを有する基材と、該基材から流体を排出するためのウィッキング手段を含んでいる流体排出機構とを受け入れるための反応装置が提供される。
【００４５】
もう１つの態様では、反応装置内のスライドの上に反応室を形成する方法であって、空洞部（cavity）を有するカバーをスライドの上に配置して、反応室を形成する過程と、カバー及びスライドをトレーのレセプタクル内に位置決めする過程と、トレー内の各レセプタクルのためのマウント部を有する反応装置内に、受け入れ部を設ける過程と、トレーを、反応装置の受け入れ部内にロードし、上記反応装置の受け入れ部が上記トレーを位置決めする過程と、カバーをスライドに取り外し可能に保持する過程と、スライド及びカバーからトレーを取り外す過程とを含む方法が提供される。
【００４６】
もう１つの態様では、複数のスライド及びカバーをロードするための装置であって、スライド及びカバーのための複数のレセプタクルを有するトレーと、トレーを受け入れるための受け入れ部と、受け入れ部内に位置決めされた各レセプタクルのためのマウント部と、各マウント部のためのクランプとを含んでいて、スライド及びカバーを有するトレーが受け入れ部内にロードされたときに、各クランプが、カバーをスライド上に保持してスライドを位置決めし、かつ、トレーがスライドから落ちて、各スライドがマウント部によって担持されるようになっている装置が提供される。
【００４７】
もう１つの態様では、複数のステップを含んでいる、スライドの上のサンプルの上で反応を起こさせる方法であって、少なくとも１つのスライドを有する第１のホルダを反応装置内にロードする過程と、スライドを走査して、スライド上で起こる反応における複数のステップを決定する過程と、他のホルダが反応装置内にロードされているかどうかを決定する過程と、第１のホルダに関連する少なくとも１つのスライドで要求される複数のステップを起こさせる過程と、第２のホルダが検出されたときに、第１のホルダ内の少なくとも１つのスライドに関連する反応におけるステップを継続し、この後、第２のホルダに関連するスライドに関連する少なくとも１つのステップを起こさせる過程とを含む方法が提供される。
【００４８】
もう１つの態様では、スライド上で反応を行わせるための装置であって、スライド及び関連するカバーを担持するとともに位置決めするようになっている複数のレセプタクルを有するトレーと、トレーの各レセプタクルと関連するマウント部を有する、トレーのための受け入れポートと、カバー及びスライドを所定の位置にクランプするためのクランプ機構と、カバーとスライドとの間に形成された反応室から流体を排出するための流体排出手段と、少なくとも１つの流体が該装置に配置されるのを可能にするための流体レセプタクルと、流体をスライドの上に分配するための流体分配手段とを含んでいて、トレーがロードされてから、スライド及びカバーがクランプされるとともにトレーが移動させられ、これにより、スライド及びカバーがマウント部上に担持され、流体が、分配手段によってスライド上に分配されることができ、かつ流体排出手段によって排出されるようになっている装置が提供される。
【００４９】
もう１つの態様では、試薬をサンプルスライドに供給するための装置であって、スライドを受け入れるための複数のポートと、スライドの各々についての識別情報を読み取るための読取器と、スライド上に堆積されるべき試薬を運ぶ試薬コンテナを受け入れるための試薬ラック（reagent rack）とを含んでいて、スライドが、関連するポート（port）に受け入れられたトレーに供給され、各トレーが個別のバッチのスライドに相当し、該装置の動作時におけるバッチ処理に対して、個別のトレーの追加及び除去を可能にするようになっている装置が提供される。
【図面の簡単な説明】
【００５０】
【図１】反応装置の一例を示す図である。
【図２】図１に示す反応装置とともに用いられるトレーの一例を示す図である。
【図３】図１に示す反応装置の受け入れポート内に部分的にロードされた、図２に示すトレーを示す図である。
【図４】反応装置のラック受け入れゾーン及び試薬容器ラックの一例を示す図である。
【図５】図１に示す反応装置の分散機構及びロボットアームを示す図である。
【図６】図１に示す反応装置のステーションにロードされたスライド及びカバーを示す図である。
【図７】図２に示すトレー内にロードされたカバーを示す図である。
【図８】（ａ）〜（ｃ）は、スライドに対する３つの位置におけるカバーを示す図である。
【図９】図１に示す反応装置の受け入れポート内のカバーのための係合手段の第１の図である。
【図１０】カバーとスライドとの間に形成された反応装置の模式的な断面図である。
【図１１】反応装置の洗浄ステーションを示す図である。
【図１２】トレー受け入れポート及びウィッキング手段のステーションを示す図である。
【図１３】スライド上に取り付けられたカバーの切り取られた断面部を示す図である。
【図１４】図１に示す反応装置のトレー受け入れポートの上面図である。
【図１５】ステーションのマウント上のスライド及びカバーの断面図である。
【図１６】図１５に示すマウント、スライド及びカバーの切り取られた断面を示す断面図である。
【図１７】混合ステーションの斜視図である。
【発明を実施するための形態】
【００５１】
以下、添付の図面を参照しつつ、非制限的な単なる具体例として本発明を説明する。
図１は、バルク試薬コンテナ受け入れゾーン１２（bulk reagent container receiving zone）と、基材トレー受け入れポート１４（substrate tray receiving ports）と、ロボットアーム１６と、試薬ラック受け入れゾーン１８（reagent rack receiving zone）とを有する自動化された反応装置１０を示している。
【００５２】
バルク試薬コンテナ受け入れゾーン１２は、多数のバルク試薬コンテナ２０を保持するようになっている。これらのコンテナ２０は、典型的には、トリス緩衝食塩水（tris buffered saline）、ＰＢＳ、クエン酸塩（Citrate）、ＥＤＴＡ、有機溶媒、廃試薬（waste reagent）、脱イオン水、脱ロウ溶液（dewaxing solution）などの流体を保持している。反応装置１０のバルク試薬コンテナ２０は、１ないし４リットルの流体を保持している。
【００５３】
ロボットアーム１６は、ガイド部２４（guide）に沿って移動することができ、モータ（図示せず）によって駆動され、コンピュータなどのコントローラ（図示せず）によって制御される。図５に示すように、ロボットアーム１６には、分配手段２６（dispensing means）が移動可能に取り付けられている。分配手段２６は、流体を分配する（dispense）ためのピペット２８などの流体導管（fluid conduit）を含んでいる。ピペット２８は、管路２９（tubing）によってポンプ（図示せず）に接続されている。この具体例では、ポンプは、正確な体積の流体を引き抜き、保持し及び供給することができるモータ付きのシリンジポンプ（motorised syringe pump）である。ピペット２８は、流体を引き抜き又は分布させるときには下降させることができ、反応装置１０を横切って移動するときには上昇させることができる。ロボットアーム１６には、バーコードを読み取るためのセンサ３３も設けられている。
【００５４】
図４に最も明瞭に示されているように、試薬ラック受け入れゾーン１８は、４つのラックマウント３０（rack mount）と、ラック配置クリップ３１（rack locating clip）と、各試薬ラック３４の取り付けを検出するためのセンサ３５とを含んでいる。各試薬ラック３４は、それぞれ試薬コンテナ３９を受け入れるようになっている９つのレセプタクル３６（receptacle：容器）を含んでいる。試薬ラック３４は、コンテナ３９を除去し、補充し（refill）又は交換する（change）ことが必要なときには、ラック受け入れゾーン１８から除去することができる。
【００５５】
図１及び図３においては、それぞれ単一のスライドトレー１５を保持するようになっている３つのスライドトレー受け入れポート１４（slide tray receiving port）が存在する。
【００５６】
スライドトレー１５（図２に示されている）は、担持手段３８（support means）を有する開口部（aperture）の形態の１０個のスライド受け入れ手段３７を含んでいる。図３に示すように、スライド１の形態の１つ又はこれより多い基材はスライドトレー１５内に配置することができる。かくして、スライド１は、中央部ではなく周縁部付近で担持される。図７に示すように、スライド１の上にカバー２が配置されている。図６に示すとともに、以下でより詳しく説明するように、スライドトレー１５がトレー受け入れポート１４内に配置されたときに、各スライド受け入れ手段３７は、反応装置１０内のスライドステーション３５ａに対応する（correspond）。トレー受入ポート１４内の一連のブロック４０（block）は、スライドトレー１５がレール３９ａに沿って反応装置１０内に完全に挿入されたときにスライド１を担持するようになっている。スライドトレー１５は、受入ポート１４内に完全に挿入されたときには、スライド１がブロック４０に当接して該ブロック４０によって担持されるように、下降させることができる。この後、スライドトレー１５はスライド１とは当接せず、スライド１はブロック４０によって下側から担持された状態となる。図３に示すスライドトレー１５では、２つのスライド１とカバー２とがロード（load：搭載）されているだけであるが、スライドトレー１５に収容されている受け入れ手段３７の数までは、任意の数のスライド及びカバーが存在することができる。
【００５７】
図１２に示すように、典型的には金属であり、制御可能に（controllably）加熱又は冷却されることができるブロック４０は、ウィッキングポスト４２（wicking post）の形態のウィッキング手段４１（wicking means）と関連しているスライド１を担持する。ブロック４０の上面は、反応装置１０の動作時にスライド１に沿って流体が流れるのを促進するために、水平方向に対して小さい角度で（典型的には５度）傾斜させられている。
【００５８】
カバー２（図８及び図１３に最も明確に示されている）は、ここに参照のために組み入れられた、本願出願人に係る「スライド用のカバー」との名称がつけられた同時継続の国際特許出願に記載されている多数の可能な変形例又はその他の変形例のうちの１つである。カバー２は、透明なプラスチック材料でつくられ、これが取り付けられるべきスライド１と実質的に同一幅のものである。図１０に模式的に示すように、サンプルと対向しているカバー２の側部に空洞部５１（cavity）が配設されている。この空洞部５１は、スライド１のサンプル保持面５３及びランド部５２（land）と連携して反応室３２を形成している。ここで、ｚ軸方向は、明瞭化のために誇張されている。図１０は、スライド１上のカバー２の断面図であり、反応室３２と、サンプル５と、ランド部５２と、スライド表面５３とを示している。典型的には、スライド１は、幅が２５ｍｍであり、長さが７６ｍｍであり、空洞部５１の高さは１００マイクロメータである。図１３に示すように、ランド部５２は、当接面５４に沿って、スライド表面５３に極めて接近し、又は当接し、それゆえ、反応室３２の外側に反応室３２から流体が漏れるのを制限（禁止）する。毛管力は、反応室３２内に流体を保持するのを促進する。
【００５９】
図９に示すように、ロケータアーム３（locator arm）は、カバー２がロケータ係合手段４３（locator engaging means）によってスライド１に沿って移動させられるのを可能にする。各ロケータアーム３は、ブラケット４４と係合している。図８には、スライド１に対するカバー２の位置の範囲が示されている。すなわち、図８（ａ）では完全に開かれ、図８（ｂ）では部分的に開かれ、図８（ｃ）では完全に閉じられている。カバー２が閉じられ又は部分的に開かれた位置にあるときには、スライド１上のサンプル５の上方において、カバー２とスライド１との間に反応室３２が形成される。カバー２は、流体が分配されることができる流体容器１９を含んでいる。前記の同時継続出願に記載されているように、いくつかの形態の流体容器が存在する。カバー及びスライドは、カバーがスライドに当接しているときには、流体容器１９内に流体を保持することができる。
【００６０】
カバー２が、図８（ａ）に示す開かれた位置から、図８（ｃ）に示す閉じられた位置までスライド１上を移動するのに伴って、流体容器内の流体は、カバー２の空洞部５１内に引き込まれる。流体容器１９は、カバー２が閉じられた位置にあるときにもなお容器内に流体を存在させるのに十分な体積を保持している。これは、反応時間が延長され又は高温が持続しているときに、流体容器の流体補給（fluid top ups）の必要性を低減させる結果となる。毛管力を含む多数の因子によって、流体が空洞部内に引き込まれるものと確信される。
【００６１】
図７に示すように、カバー２は、該カバー２から突出している翼部５０（wing）を含み、該翼部はスライドトレー１５上の斜面部５２（ramp）と係合するようになっている。カバー２の翼部５０が斜面部５２の形態の持ち上げ手段と係合するときに、これらの翼部５０は、スライド１からカバー２を離間させて持ち上げる。カバー２を、サンプルは覆われていないがカバー２がガイド部５６に沿ってスライドと当接したままである位置に移動させることが可能である。斜面部５２及び翼部５０の形態（configuration）に依存するが、カバー２がスライド１との当接を解除する前に、反応室を完全に開くことは必要ではない。
【００６２】
ロケータアーム３は、位置決め部材４５と制御可能に係合するカム機構（図示せず）などのアクチュエータによって移動させられる。その結果、カバー２を、図８に示すｘ軸に沿う方向に、スライド１に対して正確に位置決めすることができる。図９は、全てのカバーを一度に移動させるものを示しているが、反応装置の他の例では、ロケータアームを個別に移動させることにより、カバーを個別に制御することが可能である。
【００６３】
図６においては、バーコード６を有するスライド１が、それぞれのブロック４０の上に示されている。この図においては、その明瞭化を目的として、スライドトレー１５及び係合手段４３は省略されている。処理工程中において、スライド１上の所定の位置にカバー２を確実に保持するためにクランプ６０（clamp：固定部）が用いられている。クランプ６０は、複数の脚部６２（leg）を含んでいる。これらの脚部６２は、スライド１の周縁部付近に配置され、カバー２の周縁部付近の力を均等にするために、ばねと類似（同様）の物性を有している。クランプ６０は、プラスチック材料でつくることができる。ただし、他の例（図示せず）では、脚部は、金属でつくられたばね（板ばね又はコイルばね）の形態のものである。脚部又はクランプの他の形態として、圧縮可能な発泡体又は空気式クランプなどを用いることも可能である。
【００６４】
各カバー２のためのクランプ６０は、カバー２を移動させるべきときに上昇させることができ、又は、流体分配動作中にカバー２と係合させるために降下させることができる。この具体例では、特定の受け入れポート１４内の全てのクランプ６０及びカバー２が一緒に移動させられる。個々の受け入れポート１４は、互いに独立して動作してもよい。
【００６５】
使用時においては、バルク試薬コンテナ２０のバルク試薬（bulk reagents）が反応装置１０にロードされる。試薬コンテナ３９を有する試薬ラック３４は、ラックマウント３０にロードされる。センサ３５はそれらの存在を検出し、バーコードセンサ３３は各試薬コンテナ３９のバーコードを読み取り、試薬ラック３４内におけるその位置に対する各試薬コンテナ３９の内容を識別する。スライド１上のサンプルに対するスライド１のバーコード６に関する情報、及び、それらの各内容に関する試薬コンテナ３９のバーコード６に関する情報がコントローラ（図示せず）に入力される。このコントローラは、典型的には、適切なソフトウエアインターフェース及びドライバ（driver）を有するコンピュータワークステーションである。少なくとも１つ、ただし１０以下のスライド１を収容しているスライドトレー１５は受け入れポート１４内に配置される。ここで、センサ（図示せず）は、スライドトレー１５を検出し、ステーション３５ａの走査（scan）を開始させる。走査時には、ロボットアーム１６のバーコードセンサ３３は各ステーション３５ａに移動し、バーコード６を読み取ろうと試みる。もしバーコード６を伴ったスライド１が存在すれば、コントローラは、バーコード６を、ユーザによって入力された情報及び既知のスライドのリストと比較し、個々のスライド１にどのプロトコルを適用するかを決定する。あるいは、バーコードが走査された後、ユーザは、スライドを処理するために反応装置に必要とされる情報を入力する。各スライドは、異なるプロトコルを有していてもよい。コントローラは、プロトコルによって指示された反応を実行するのに必要な試薬を、試薬ラック３４内のコンテナ３９内に配置された試薬と比較する。どのような不一致も、ユーザに送られるべきエラーメッセージを生じさせるであろう。もしコンテナ３９が見つからなければ、試薬ラック３４が除去され、正しいコンテナ３９を試薬ラック３４内に配置することができる。ここで、試薬ラック３４が検出され、試薬コンテナ３９のもう１つの走査が実行される。
【００６６】
もしエラーがなければ、ロボットアーム１６は、分配手段２６のピペット２８を適切な試薬コンテナ３９のところに移動させ、必要とされる量の流体を引き抜く。このとき、分配手段２６は、ピペット２８のキャパシタンス（capacitance）をチェックする。このキャパシタンスは、ピペット２８が試薬コンテナ３９の流体表面に接触したときに変化する。このようにして、試薬コンテナ３９内に残留している流体の体積（容量）を決定することができ、ユーザは、必要に応じて試薬コンテナ３９を取り換えることができる。この後、ロボットアーム１６は、ピペット２８を、第１のスライド１のところに移動させ（コントローラによって決定される）、流体をスライド１の表面に分配する。スライド１上のサンプル５に対するピペット２８及びカバー２の配置については、いくつかのオプション形態（option）が存在するが、これらは以下でさらに詳しく説明されるであろう。
【００６７】
第１のスライド１に対する分配動作が実行された後、さらなるスライドに対してこのプロセスが繰り返される。各スライド１においては、各ステップで同一の流体を充填する（fill）ことは必要ではなく、スライド１に任意の適切な順序で流体を充填することができる。図１１に示すように、洗浄ステーション１２０は、試薬ラック３４の近傍に配置され、異なる試薬の引き抜きに先立ってピペット２８を清浄にするのに用いることができる。洗浄ステーション１２０は、ピペット２８を受け入れるためのレセプタクル１２１を含む。ここで、１つのバルク試薬コンテナ２０からの洗浄流体は、ピペット２８の外側にポンプ輸送され（pumped）、先行する流体の痕跡（trace）を除去する。洗浄流体は、ピペット２８の内側表面を洗浄するために、管路（tubing）を経由して、バルク試薬コンテナ２０からポンプ輸送してもよい。
【００６８】
試薬は、バルク試薬コンテナ２０から、配管（piping）及びバルブ（図示せず）を通して、ピペット２８にポンプ輸送することができる。バルク試薬コンテナ２０からのバルク試薬はまた、洗浄ステーション１２０にもポンプ輸送することができる。
【００６９】
反応装置１０の本体部１２（body）に含まれている、バルク試薬コンテナ２０などのその他の試薬コンテナは、スライド上に分配することができるタイプの試薬に付加することができる。いくつかのバルク試薬コンテナ２０は、通常、サンプルの洗浄及び水和（hydrating）に必要とされる流体を収容している。
【００７０】
試薬ラック３４は、検出キット（detection kit）を収容するために用いることができる。検出キットは、１つ又はこれより多いサンプルに特定の試験を実施するために用いられる分離された試薬コンテナ３９内の複数の試薬からなる。このような検出キットは、単一の試験を実行するための９つの試薬コンテナ３９を含むことができ、これはその他のスライドに用いることができる試薬コンテナ３９の数を２７にまで低減する。
【００７１】
スライド上のサンプルに添加される典型的な試薬は、ノボカストラ・ラボラトリ社（Novocastra Laboratory Ltd）によって販売されている一次抗体（primary antibody）を含んでいる。これらの試薬は、通常、典型的には７ｍｌから３０ｍｌまでの間の体積の試薬コンテナ３９に供給される。緩衝液及び脱イオン水などのその他の試薬及び流体は、典型的には１〜４リットルの間の体積を有するバルク貯蔵コンテナ２０内に保持することができる。
【００７２】
サンプルへの添加（application）のために準備された、いくつかの試薬の貯蔵寿命は比較的短い。それゆえ、試薬は、いつでも使用できる処方（ready-to-use formulation）に予混合されて供給され、この場合、それは発注から短期間内に用いなければならない。あるいは、試薬は、使用に先立って研究スタッフによって準備され、適切な試薬コンテナ内に配置されてもよい。３’，３−ジアミノベンジジン（ＤＡＢ：3',3-diamino benzidene）などのいくつかの試薬は、最終的な形態にあるときには、準備後すぐに劣化し始め、最初の準備の後２４時間を超えると使用不可能となるであろう。これは、毎日新たにバッチ（batch）を準備することを必要とし、古いバッチは使用後に確実に廃棄することになる。さらに、プロテアーゼ（protease）などの酵素を、組織の型（tissue type）や、添加されるべきその他の試薬などの因子に依存して濃度を変化させるのに添加することが必要であろう。これは、サンプルへの添加の前に多数のバッチの試薬を準備することを必要とする結果となるであろう。この場合、正確な添加、有効期限、正確な混合、追跡及び追跡可能性などといった関連する問題を伴うであろう。
【００７３】
濃縮された一次抗体はまた、使用前に準備することが必要であり、サンプルへの添加前に希釈することが必要であろう。一次抗体は、濃縮された形態、又は予め希釈されたいつでも使用できる形態のいずれかで供給することができる。しかしながら、単一の反応装置１０で、同一の抗体に、いくつかの異なる希釈を行うことが必要であろう。そうでなければ、これは、試薬ラック３４内にいくつかの場所を占めるであろう。それゆえ、抗体について単一の試薬コンテナ３９を用いるのが有利であろう。ここで、抗体試薬の希釈は、試薬をサンプルに添加する前に行うことができる。一次抗体は、ビジョン・バイオシステムズ社（Vision BioSystems Ltd）によって販売されているＡＢＤＩＬ９３５２などの一次抗体希釈剤によって希釈することができる。
【００７４】
図１１に示すように、この実施の形態に係る反応装置１０では、混合ステーション１２２が設けられている。図１７に示すように、混合ステーション１２２は、複数の混合バイアル瓶１３２（vial）を有する挿入部材１３０（insert）を含んでいる。挿入部材１３０は、６つのバイアル瓶１３２を有し、各バイアル瓶１３２は異なる試薬を保持することができる。図示されたバイアル瓶１３２は、全て同一の体積であるが、必要に応じて体積を変えてもよい。典型的な体積は、１つのバイアル瓶１３２につき７ｍｌである。
【００７５】
また、挿入部材１３０には、タブ１３４（tab）も取り付けられている。タブ１３４は、バーコードなどにより挿入部材１３０を識別（特定）するのに用いられる。挿入部材１３０は使い捨てであると予想されるが、反応装置１０のいくつかの運転（run）にわたって、複数の異なる試薬を収容することができる。
【００７６】
挿入部材１３０のバーコードは、挿入部材１３０を識別するのに用いることができる。これにより、コントローラは、挿入部材１３０をいつ破棄すべきかを知り、新たな挿入部材を混合ステーション１２２にロードすることを要求する。これは、ある一連の期間又は使用の後に予め設定することができる。
【００７７】
挿入部材１３０には、任意のバイアル瓶１３２から溢流（オーバーフロー）する余剰の流体を該挿入部材から排出するのを可能にする溢流開口部１３５（overflow aperture）も設けられている。
【００７８】
使用時には、スライドのバーコードの情報はコントローラ内のデータベースと照合され、どのシリーズの試薬を各スライドに添加すべきかを定めることができる。この後、反応装置１０は、要求された試薬を、現在ロードされている試薬と比較する。もしある試薬があるサンプルに対して添加すべき最終的な形態ではないと識別されれば、準備ステップが、反応装置１０で実行すべき作業の指示計画に組み入れられる（計画される）。
【００７９】
ある具体例においては、それぞれＤＡＢの成分Ａ、Ｂ及びＣを有する３つの試薬コンテナ（試薬ラック３４内に配置された試薬コンテナ３９と同一）を、反応装置１０に配置することができる。この具体例においては、ＤＡＢを、Ａが１部であり、Ｂが２５部であり、Ｃが１部である比率で混合するであろう。使える状態である１バッチのＤＡＢを混合するために、ロボットアーム１６は、まず、成分Ａを収容している試薬コンテナのところに移動し、設定された体積の成分Ａの試薬を抜き出す。この後、ロボットアーム１６は、混合ステーション１２２で１つのバイアル瓶１３２のところに移動し、１つのバイアル瓶１３２内に上記体積の試薬を落とす。この後、ピペット２８は、混合ステーション１２２の次に配置されている洗浄ステーション１２０に移動させられ、ここでピペット２８の外側及び内側が洗浄処理される（rinse）。清浄化の後、ロボットアーム１６は、ピペット２８を、成分Ｂの試薬を収容している試薬コンテナのところに移動させる。ピペット２８は、試薬（成分Ａの体積の２５倍）を引き抜き、成分Ａを収容しているバイアル瓶のところへ移動する。試薬をバイアル瓶内に落とした後、ピペット２８は、成分Ｃの試薬を保持している試薬コンテナのところへの移動の前に、洗浄ステーションのところに移動し、再び洗浄される。成分Ａを保持しているコンテナから除去されたのと同一の体積（volume）が除去され、そしてピペット２８は元のバイアル瓶のところに移動し、該試薬をその他の試薬とともに落とす。最初に試薬を混合バイアル瓶内へ落とす（deposit）ことにより、いくらかの混合が生じるが、試薬の一部又は全部をバイアル瓶１３２からピペット２８内に引き抜き、この後試薬をバイアル瓶１３２内に再び落とすことにより、さらなる混合を実現することができる。ピペット２８は、試薬を落とすときに、その先端部が流体レベルの上方に位置することを確実化して混合プロセスを促進するために、上下方向に移動することができる。再度落とすことによるエネルギは、試薬をより容易に混合させる結果となる。この混合プロセスは、所望の回数実行することができる。試薬が十分に混合された後、もしサンプルに添加すべき次の試薬がＤＡＢでなければ、ピペット２８を洗浄ステーション１２０に進めることができる。バイアル瓶のこの体積及びピペット２８によって引き抜かれた量は、サンプルに対する多くの添加（application）に対して十分な量のＤＡＢを供給する。ＤＡＢが必要なときはいつでも、ロボットアーム１６は、ピペット２８を特定の試薬の混合がコントローラによって記録されるバイアル瓶である、ＤＡＢが混合されたところのバイアル瓶に移動させる。準備の時間もまた記録され、これにより、予め設定された期間の後、混合された試薬を廃棄することができる。これは、準備された試薬が使用期限後に用いられるのを防止する。
【００８０】
その日の試験の完了後、又はＤＡＢの使用期限が到来したときに、ＤＡＢ（又は、使用期限が到来したその他の試薬）を収容しているバイアル瓶１３２を、以下で説明するように清浄化することができる。
【００８１】
１バッチにおける混合計画の作成手法に関して、２００３年２月２４日に本願出願人によって出願され、その内容が参照のためにここに編入されている、「計画作成方法（Method of Scheduling）」と題されたオーストラリア仮特許出願に、特定の詳細な計画作成手法が開示されている。
【００８２】
上記プロセスは自動化されているが、用いられる手段（resources）、すなわちロボットアーム１６及びピペット２８は、サンプルへの一般的な試薬の添加におけるかなりの期間にわたって利用されることができる。それゆえ、１日に数バッチの試薬を準備する必要をなくす（低減する）のが望ましいであろう。この理由により、反応装置１０は、該反応装置１０内にロードされたサンプルが存在しないとき、又は通常の処理時に試薬を準備するようプログラムを組むことができ、体積及び濃度は、ユーザインターフェース（図示せず）により、ユーザが決定することができる。
【００８３】
上記の具体例においては、各バイアル瓶１３２内の各試薬の準備の時間及び濃度は、反応装置１０のコントローラのメモリ内に記憶される。このため、古い又は不正に混合された試薬がサンプルに添加される機会がなくなり、オペレータのミスを低減することができる。
【００８４】
ピペット２８による混合は、準備された試薬が、サンプルへの添加の前に十分に混合されることを確実にする。これにより、例えば試薬の成分をサンプルに直接添加してサンプル上で混合するよりも、より均一な混合を行うことができる。
【００８５】
反応装置１０での混合によって恩恵を受ける試薬のその他の例は、多数の濃度で添加することが必要とされるプロテアーゼである。上記の具体例では、プロテアーゼについては１つの試薬コンテナだけが必要とされ、プロテアーゼのいくつかの濃度は、試薬コンテナ３９又はバルク試薬コンテナ２０に貯留されている希釈剤を用いて反応装置１０によって準備することができる。これらの異なる濃度のものは、後の使用のために異なるバイアル瓶１３２内に配置されてもよい。
【００８６】
上記の具体例では、混合作業（mixing task）を、サンプルへの試薬添加ステップに組み入れさせることが可能である。例えば、ロボットアームに必要な作業が存在しない場合、スライドの試験中にしばしば時間が存在する。これらの時間は、空き時間（open time）と称されるが、これは典型的には、次のステップを実行する前にスライドに添加される流体が反応時間を必要とするときに起こる。もし空き時間が十分に長ければ、混合ステップに計画を組み入れることが可能であろう。これは、サンプルへの流体の添加を完了するのに必要な時間を最小にする一方、オペレータを試薬の準備から解放する。
【００８７】
試薬が準備されてサンプルに添加された後、残っているか又は使用期限が切れた準備試薬（prepared reagent）は、アスピレータ（aspirator）により吸い上げられて消耗される。この後、バイアル瓶１３２が清浄化される。清浄化は、必要とされる準備試薬が分配された後、残っている準備試薬を排出することにより実施される。流体の排出はピペット２８で行われ、排出された流体は、内部でポンプ輸送されバルク廃棄コンテナに送られる。実質的に空になれば、すすぎサイクルが実施される。すすぎサイクルでは、例えばバイアル瓶１３２内に分配されたＩＭＳなどのアルコールを含むことも可能である洗浄液を用いることができる。この後、洗浄液は、ピペット２８を経由して排出される。複数のすすぎサイクルを実施してもよい。最後のすすぎについて洗浄液を除去した後、残っている洗浄液を蒸発させて、バイアル瓶を完全に空にすることが可能である。
【００８８】
最初の準備から予め設定された時間が経過した後、混合バイアル瓶に戻って（revisit）試薬を再混合することも可能である。これは、準備試薬の一部をピペット２８内に引き抜いて、同一のバイアル瓶１３２に分配することにより行うことができる。これは、準備試薬の成分が時間後も滞留し、又は時間後に混合された状態で滞留しないときには重要であろう。最初の混合に伴って、ロボットアーム及びアスピレータの非動作時に、再混合ステップを組み入れてもよい。
【００８９】
スライドトレー１５が反応装置１０にロードされたときには、各ブラケット４４は、スライドトレー１５内の各カバー２のロケータアーム３（locator arm）と係合している。開かれた充填（open fill）が必要な場合、すなわち、カバー２がスライド１から実質的に又は十分に引き出されている場合、ロケータ係合手段４３は、スライドから離れているスライドトレー１５上の全てのカバー２を、図８（ａ）中のカバー２で示されている位置に移動させる。この開かれたカバー２の位置はサンプル５を露出させ、この場合、ピペット２８を、種々の位置に位置決めすることができる。図８に示すように、ピペット２８の位置は、流体をピペット２８に直接分配するためのサンプル５の上方の位置、あるいは、流体を流体容器１９に戻すためのカバー２の前部に隣り合う位置を含む。各位置についての理由は、以下で説明される。
【００９０】
開かれた充填位置においては、流体が全てのスライドに分配されると、ロケータ係合手段４３が、スライド上のサンプルの上方の反応室３２の位置に移動する。スライド１の表面の上方のカバー２の移動及び毛管作用は、分配された流体に、カバー２とスライド１との間の領域内への流れを生じさせる。クランプ６０は、カバー２を所定の位置に保持するのに用いることができ、カバー２とスライド１との間の液体の膜上にカバー２が浮遊する（浮かぶ）のを防止することができる。
【００９１】
図１４及び図１５に示すように、スライド１は、ブロック４０の上にあるときには、ウィッキングポスト４２と当接することができる。スライド長が変わる（vary）ので、ブロック４０上でのスライド１の移動が可能である。そして、スライドの上方のカバー２の移動は、スライド１を移動させることができる。通常、この移動は、１〜２ｍｍのオーダーにすぎない。もう１つの具体例（図示せず）では、アクチュエータを用い、スライドをウィッキングポストから遠ざかるように移動させて反応室からの流体のウィッキング（漏出）を低減することが可能である。
【００９２】
図１５は、スライド１及びその上のカバー２を示し、両者ともブロック４０の上に配置されている。ウィッキングポスト４２はスライドと当接し、したがって流体のためのウィッキング通路を形成する。反応室は、スライドとカバーとの間に位置するが、図１５がほぼ縮尺どおりであるので、この図では明確にはみることができない。流体容器１９に入った流体は反応室内に流入し、反応室からウィッキングポスト４２につながる排出部５５（drain）に流下することができる。ファン（図示せず）などのポンプにより排出部５５から空気を引き抜くことにより、ウィッキングポストのまわりの空気圧を低下させて流体の除去を助勢することができる。これは、もし必要であれば、反応室を通って排出部５５外への流体の流れを促進するであろう。スライドからカバーを引き出すこともまた、排出部５５への流体の流下を促進するであろう。
【００９３】
ウィッキングポストからの流体圧力が存在する場合、又は該領域の空気圧が低下している場合、流体のメニスカス（meniscus）がウィッキングポスト近傍のスライドのエッジ（edge）から伸びているので、ウィッキングポストがスライドに当接していなくても、ウィッキングポストは流体をウィックする（除去する）であろう。
【００９４】
しかしながら、培養時（incubation period）などにおいてもし必要であれば、ロケータアーム３を操作することによりウィッキング作用を中断することができる。これにより、カバー２を、ウィッキングポスト４２から離れる方向に、反応室からの流体のさらなる排出を防止するのに十分な距離だけ移動させることができる。
【００９５】
分配された流体が反応室３２を充填したときに、反応室内の流体とウィッキングポスト４２との間に流体接触が生じるであろう。ブロック４０の上面は、水平方向に対してほぼ５度の角度で傾斜している。ここで、ウィッキングポストと隣り合うスライド端部は、スライドのバーコード端より低い位置にある。この角度は、ウィッキングポスト４２に向かう流体の流れを促進し、これはブロック４０から離れてスライド１との接触だけを生じさせる。ウィッキングポスト４２がスライド１の上面又はその近傍でスライド１と当接するので、スライド上面の最も低い端部では、流体はウィッキングポスト４２と隣り合うスライドの上の反応室内の領域からウィックする（wick）傾向があるが、それ以外にはウィッキングポイント（wicking point）は存在しないのでその他の領域からウィックする傾向はないであろう。
【００９６】
ディスペンサ２６（dispenser）を制御し、流体を種々の位置でスライド上に分配することが可能である。流体は、スライドのバーコード端に向かって、又はカバーが開かれた位置にある場合はスライドのウィッキングポスト側の端部に向かって、分配することができる。ディスペンサを、流体がスライド上で複数の位置に分配される「ねじれた滝（staggered waterfall）」の形態（arrangement）で分配することも可能である。カバーを、ディスペンサがスライドを上向きに移動するのに伴って閉じてもよい。
【００９７】
流体は、制御された体積でスライド１上に分配される。現在の配置構造（arrangement）においては、次の２つの条件のうちの１つが満足されない限り、流体は、反応室３２からウィッキングポスト４２に下向きにウィック（流出、漏出）しないということが見出された。第１に、容器１９内の流体は、反応室３２を通して流体を押圧することが必要である。追加の流体は、先行する流体を移動させてこれを反応室から除去する。先行する流体は、ウィッキングポストを経由して反応室から除去される。かくして、流体を流体容器内に配置することにより、反応室内の流体を交換することが可能である。第２に、ポンプは、ウィッキングポストのまわりに低減された大気圧を生成して、反応室から流体を引き出す圧力差を惹起することができる。反応室の流体はまた、ウィッキングポストのまわりの空気圧を低減することにより排出することができる。
【００９８】
反応室に新たな流体が加えられることになっていない場合、反応室を開くことにより、反応室から流体を排出することが可能である。これは、サンプルが覆われなくなるまでスライド１に沿ってカバーを滑動させること（sliding）により実現される。反応室内の流体は、サンプルから離れたカバーに追従する傾向があり、これにより流体がウィッキングポストを経由して排出されるであろう。あるいは、ファンを動作させて反応室から流体を引き出すことが可能である。この場合、カバーは、閉じられた位置のままでいることができる。上記の組み合わせも可能である。
【００９９】
供給されている流体又は反応室内の流体がとくに粘度が高い場合などにおいては、ポンプを利用して流体を容器に供給し、反応室を通しての流体流れを生じさせることが必要であろう。このようにして、流体を制御された方法で切り替える（change over）ことが可能である。
【０１００】
カバー２及びスライド１は、反応が完了したときに反応装置１０から除去され、それゆえ、反応室３２は各反応に対して固有（unique）である。これは、他の反応装置で必要とされる固定的な（static）反応室を完全に清浄化する必要性をなくす。さらに、反応室は、環境に対して実質的にシールされ、蒸発を低減するとともにサンプルの乾燥（drying out）の可能性を低減する。
【０１０１】
反応室が、スライドと、交換可能なカバーとで形成されているので、反応室の形成は比較的安価であり、各反応に対して新しく清浄な反応室が形成され、清浄化に要するコスト及び時間が低減されるとともに、先行する反応又は洗浄流体による汚染の可能性が除去される。
【０１０２】
カバーの引き出しを伴った最初の充填（開放充填）は、反応室内での空洞（void）又は泡の生成を最小にしつつ反応室に流体を充填する方法をもたらす。反応室がほぼ１００ミクロンの深さを有するものであるので、反応室を形成しているスライドの上方にカバーが存在する場合、反応室から泡又は空洞を流し出す（flush）ことは困難である。反応に用いられるいくつかの流体は、極端に高価であったり、有害であったりするかもしれず、それゆえそれらの消費を最小限にとどめるのが望ましい。
【０１０３】
適切な最初の充填流体は、２５ないし３０％のグリセロールを含む、水とグリセロールの混合物であるということが見出された。少量のグリセロールは、大量のグリセロールと同様に、泡の形成・発生の低減を助勢する。しかしながら、ある環境では、体積で２５％のグリセロールが良好に作用するということが見出された。表面張力を低減するために、洗浄剤（例えば、ツイーン（Tween））などの添加物（additive）が含まれていてもよく、かかる添加物はまた、ある環境では空洞を除去するのに有益であるということも証明された。
【０１０４】
グリセロールの使用は、流体が外部のウィッキング通路を経由してスライド表面からウィックする傾向を低減する。これは、最初の充填時に生成する大きな泡の数を低減する。
【０１０５】
最初の充填の後に反応室内に存在するかもしれない空洞の除去を助勢するために、表面張力及び粘度が低く水と混和する（miscible）、イソプロパノールのようなアルコールなどの流体が洗い流し流体（flushing fluid）として有用であるということが見出された。
【０１０６】
典型的には、洗い流し（flushing）は加熱段階（heating phase）の後に起こり、反応室内の温度の上昇に伴って泡又は空洞の形成が生じるであろう。イソプロパノールなどの低粘度の流体の使用は、泡又は空洞の移動を促進する。
【０１０７】
反応室に流体が充填された（満たされた）後、追加の空気を閉じ込める（entrap）ことなく、さらなる流体を加えることが可能である。かくして、場合によっては、単に流体容器を満たすこと（topping up）により、流体を変えてウィッキングポスト近傍の空気圧を低減することが可能である。このように形成された反応室は、新たな流体が交換している流体と混合する傾向はないであろうといった望ましい流れ特性を呈する。反応室の毛管特性は、さほど乱流混合を生じさせず、それゆえ、反応室又はスライド表面の洗い流しをさほど必要とせず、流体の変化を正確に決める（time）ことが可能である。これは、反応の開始及び終了を、流体及び反応のある範囲にわたって十分な正確さでもって決定することを可能にする。
【０１０８】
圧力の低下及びカバー移動の速度は、背後に残っている残留流体の体積に影響を及ぼす（effect）であろう。
【０１０９】
サンプル上の反応室内での反応を促進するために、クランプ６０の負荷（load）を調節することにより、カバーをスライド上で上下方向に（図８に示すｚ軸方向）移動させることが可能である。この上下方向の移動は、上下方向の流体の混合に加えて、スライドの長手方向ではなく、スライドと交差する方向（ｙ軸方向）の流体の混合を促進する。反応室に対する流体の充填（注入）及び排出は、流体をスライドの長手方向（ｘ軸方向）に沿って移動させ、これは、アーム４４を移動させることにより、カバーをスライドのｘ軸に沿って移動させることにより、促進することができる。ブロック４０は、反応を促進するために加熱してもよい。
【０１１０】
例えば原位置交配（in situ-hybridisation）、エピトープリトリーバル（epitope retrieval）、脱ロウ（dewaxing）をはじめとする多くの反応においては、反応室内の流体をセ氏１００度に近い温度まで加熱するのが望ましい。この場合、気泡を生成することが知られているが、かかる気泡は、移動させるのは困難であろう。泡がサンプル上で生じた場合、それらはサンプルにさらされる流体の量を低減し、それゆえサンプル内に加えて、異なるスライド上のサンプル間にも、結果の一致を生じさせることができる。この場合、１つ又はこれより多いコーティング（coating）を有するカバーを用いることが泡の形成・発生を低減するということが見出された。
【０１１１】
反応装置１０のもう１つの特徴は、反応室の寸法を変えることができることである。典型的には、閉じられた位置と称されている、カバーが完全にスライドの上方にある状態では、反応室の体積は１５０マイクロリットルである。しかしながら、カバーが完全に閉じられていない場合、カバーとスライドとの間に形成された反応室の体積は低減されたものとなるであろう。図８（ｂ）においては、カバーは部分的に閉じられた位置で示され、この場合、反応室の体積はかなり低減され、例えば８０マイクロリットルまで低減されるであろう。この具体例は、サンプルが小さい場合、あるいはサンプルがスライド端部に向かって置かれている場合に有用であり、カバーが、サンプルを覆いつつ、より小さい反応室を形成することを可能にする。より小さい反応室は、より小さい体積の流体しか必要とせず、これは、用いられる流体が高価な場合、又は入手が困難な場合に有利である。反応室のこれらの具体例は、流体をスライド上に分配するときに、カバーの位置を参照することを可能にする。それゆえ、カバーが開かれた位置にあるときには、流体を、組織サンプルの頂部、又は組織サンプルとカバーとの間のいずれかに分配することが可能である。これにより、閉じられた位置に向かうカバーの移動が、反応室に流体を充填しつつサンプルを横切って流体を押圧する。流体をスライドに沿う方向の複数の位置に分配し、又は、流体をカバーの前側エッジ又はその近傍に分配することも可能である。
【０１１２】
以下、上記反応装置のセットアップ（set up）及び使用について説明を行う。
１． スライドのロード
ガラスのスライドの上に取り付けられたパラフィン包埋組織（paraffin-embedded tissue）の切片（サンプル５）を、カバー２を伴ったスライドトレー１５内にロードし、反応装置１０の受け入れゾーン１４に挿入する。ユーザは、所望のプロトコルと実行タイプ［すなわち、１００μＬ（エコノミタイプ、スライドの２／３）又は１５０μＬ（標準タイプ、全スライド）］）とを選択し、必要な試薬コンテナ３９を収容している試薬トレー３４が反応装置１０にロードされるのを確実にする。
【０１１３】
２． 脱ロウ
染色処理（staining procedures）の実施に先立って、切片化（sectioning）に続いて組織の切片（section）からのロウ（wax）の除去を行うことが必要である。機器（instrument）で脱ロウを行うために、カバーを閉じられた位置にとどめる一方、脱ロウ溶液（dewaxing solution）を分配手段２６によりスライド上に分配し、このスライドを取り付けブロック４０により７０°Ｃまで予熱する。スライドを、ポンプ（図示せず）によって惹起されたウィッキングポストまわりの低減された空気圧により、過剰の脱ロウ溶液の除去に先立って、７０°Ｃで４分間培養する（incubate）。さらに４分間の７０°Ｃでの培養のために、スライド上に新しい脱ロウ溶液を分配する。典型的には、このプロセスを、脱ロウを必要とするトレー内の全てのスライドに対してもう１回繰り返す。スライドを周囲温度まで冷却し、残りの溶解しているロウを含んでいる過剰の脱ロウ溶液を除去するために、カバーを開閉する。全てのスライドを、残留している脱ロウ溶液を除去するために、１つずつ、分配手段によって供給されたイソプロパノールで洗浄し、この後、全てのスライドに対して、分配手段によって分配された蒸留水で再び水分補給を行う。
【０１１４】
３． エピトープリトリーバル（抗原性賦活化）
ＩＨＣ処理及びＩＳＨ処理を行う前に、固定処理（fixation process）中に隠されてしまう（hidden）かもしれない組織内のエピトープ（タンパク質、ＤＮＡ、ＲＮＡ）を露出させることが必要である。この機器では、２つのプロトコルを備えることができる。
【０１１５】
ａ． 熱誘発型エピトープリトリーバル（HIER、heat-induced epitope retrieval）
脱ロウに続いて、全てのスライドは、カバーが開かれた位置でリトリーバルバッファ（最初の充填流体）（１０ｍＭ、クエン酸ナトリウム／３０％、グリセロール／０．０５％、ツイーン）の最初の充填を受け入れ、スライドへの溶液の下降移動を促進して、泡の形成を低減する。カバーを閉じ、取り付けブロック４０によりスライドを、必要なリトリーバル時間だけ１００°Ｃに加熱する。リトリーバルが終了した後、スライドを、分配手段により、リトリーバルバッファでの個々の洗い流しで冷却する。
【０１１６】
ｂ． 酵素誘発型エピトープリトリーバル（EIER、enzyme-induced epitope retrieval）
プロテアーゼ溶液（すなわち、プロテイナーゼＫ（proteinase K）、ペプシン（pepsin）、及びトリプシン（trypsin））を、分配手段により各スライド上に分配し、所望のリトリーバル温度（例えば、周囲温度〜５０°Ｃ、又は、室温）で１０〜３０分間培養する。リトリーバルが完了した後、各スライドを、分配手段によって分配された蒸留水で洗浄する。
【０１１７】
４． 免疫ヒソケミストリ（IHC、immunohisochemistry）
ＩＨＣは、組織の生体検査（biopsies）及び標本（specimens）における、抗原（タンパク質）に対する抗体（タンパク質）の特異結合（specific binding）に基づいている。エピトープリトリーバル段階に続いて、各スライドは、分配手段から、ツイーン−２０を含んでいるバッファを受け入れる。各スライドを、過酸化水素でもって、周囲温度で８分間処理して組織切片内の内生ペルオキシダーゼ活性（endogenous peroxidase activity）をブロックする（block）し、ツイーン−２０を含んでいるＴＷＢバッファで洗浄し、再び分配手段により分配する。特定のターゲットのタンパク質に向けられた一次抗体を、分配手段により組織サンプルに供給し、１５〜６０分間培養する。この後に続いて、第２のビオチン標識抗体（secondary biotin-labelled antibody）の培養を行う。結合抗体（bound antibody）を、各スライド上に、ストレプタビジン―又はアルカリ性ホスファターゼ―共役ペルオキシダーゼ（streptavidin-or alkaline phosphatase-conjugated peroxidase）を分配することにより検出する。これらを、すべて分配手段よって分配された色原体（chromogen）、すなわちＤＡＢ、ＢＣＩＰ／ＮＢＴの添加により可視化する。切片を、分配手段によって分配されたヘマトキシリン（hematoxylin）で対比染色する（counterstained）。
【０１１８】
５． 原位置交配（ＩＳＨ）
ＩＳＨは、細胞内における特定の核酸配列の検出を可能にする。ＥＩＥＲ段階に続いて、組織切片を、イソプロパノールを各スライドの反応室内に分配することにより脱水し、カバーを開かれた位置に移動させて組織を乾燥させる。蛍光色素又はビオチン標識核酸のプローブ（probe）をスライドに供給し、カバーを緩慢に閉じてプローブを、該組織と交差する方向に均一となるように分布させる。このプローブを、組織切片中のその相補的ＤＮＡ／ＲＮＡターゲットと、３７〜５５°Ｃで１．５〜２時間交配させることが可能である。ターゲットがＤＮＡである場合、組織切片及びプローブを、まず、交配に先立って５〜１０分間、高温で（すなわち、９５°Ｃ）変性させる（denature）。スライドを、ねじれた滝のすすぎを用いて、分配手段からのＴＷＢを分配することにより洗浄し、非結合プローブを穏やかに除去する。洗浄に続いて、カバーを、残りの処理のために、閉じられた位置に移動させる。結合プローブを、分配手段から分配されたアンチフルオレセイン又はアンチビオチンの共役抗体をアルカリ性ホスフォターゼに供給することにより検出する。これを、分配手段から分配された酵素基質（ＢＣＩＰ／ＮＢＴ）の添加により可視化する。
【０１１９】
６． 除去
特定のスライドトレーに対してプロトコルが完了した後、このスライドトレーを、他のスライドトレーの状態にかかわりなく除去することができる。このスライドトレーは、それぞれ、利用される異なるプロトコルを有しているスライドを収容することができるので、このスライドトレーは、この特定のスライドトレーに対するすべてのプロトコルが完了するまで、反応装置内に残さなければならない。光などの表示手段（indicator）は、スライドトレー上のスライドに適用されるべきすべてのプロトコルが完了したときに、これをユーザに報知する。
【０１２０】
反応室に流体を充填した後、サンプルを、ある延長された期間、バッファ内に保持することが可能である。反応室内の流体は、例えば、あるいくつかのスライドの反応は完了されているが、スライドトレー上の他のスライドはさらなる処理を必要とする場合に、補充する（top up）ことができる。３つのスライドトレーを有するので、時間集中処理（time intensive processing）を必要とするサンプルが１つのスライドトレー内に配置される一方、より速い処理が個別のスライドトレーで実施される場合に、ある程度の柔軟性（a certain amount of flexibility）がある。追加のスライドトレーを導入する一方、１つ又はこれより多いスライドトレーで処理を開始することができる。そして、終了したスライドトレーを除去する一方、他のスライドトレーを処理することが可能である。試薬ラック３４を、例えばコンテナが空になった場合には、処理の実行中に除去することができる。試薬ラック３４を交換した後、バーコードセンサ３３で、再び試薬コンテナ上のバーコードを走査し、正しい試薬のみの供給を確実にする。
【０１２１】
分配機構は、試薬コンテナ内の流体のレベルを検出するためのセンサを用いている。それゆえ、コンテナの中身が残り少なくなっているときには、ユーザに警告を発する。試薬が適切に貯留されていない場合、有効期間が短くかつ試薬が高価であるときには、消費の低減はかなり有利であるので、これは重要である。
【０１２２】
センサは、ピペットが試薬コンテナ内の流体の表面に到達したときにこれを検出するために、ピペットに取り付けてもよい。これは、コンテナの体積を決定し、流体レベルが予め設定されたレベルまで低下したときに、オペレータに警報を送ることを可能にする。この後、試薬ラックを反応装置から除去し、コンテナを交換することができる。ここで、スキャナは、試薬コンテナ上のバーコードを読み取ることにより、正しい試薬に交換されたかどうかを決定するであろう。このようにして、オペレータのミスが低減される。
【０１２３】
以上で説明されたように多数の変形例が存在するが、反応装置は、流体の供給、反応時間及び温度に対して柔軟な取り組みが可能となるような仕様となっている。それゆえ、反応装置は、流体の供給、カバーの位置及び移動についての変形例である、可能な手法の中の特定の例に限定することを意図しているのではない。
【０１２４】
利用することができるプロトコルを変えることができ、単一のラック内のスライドの上の各サンプルに対して、異なるプロトコルを適用することが可能である。さらに、反応装置は、新たなスライドのトレーをロードし、又は完了したスライドのトレー除去する一方、他のスライドのトレーを処理することが可能である。
【０１２５】
前記の説明に制限されることなく、本発明のいくつかの特定の態様が、いくつかの利点の簡単な説明とともに、以下に記載されている。
【０１２６】
反応装置内のスライドの上に反応室を形成する方法であって、
空洞部を有するカバーをスライドの上に配置し、反応室を形成する過程と、
カバー及びスライドをトレーのレセプタクル内に配置する過程と、
トレー内の各レセプタクルのためのマウントを有する反応装置内に、受け入れ部を設ける過程と、
トレーを、反応装置の受け入れ部内にロードし、反応装置の受け入れ部がトレーを配置する過程と、
カバーをスライドに取り外し可能に保持する過程と、
スライド及びカバーからトレーを取り外す過程とを含む方法。
【０１２７】
上記方法は、スライド及びカバーがトレー内のレセプタクルに容易に配置されることを可能にする。このトレーは、ここに開示された実施の形態の図面中に示されているように、複数のレセプタクル、例えば１トレー当たり１０のレセプタクルを有していてもよい。この後、トレーは、反応装置の受け入れ部内にロードされることができ、これにより、例えば、スライド及びカバーで形成された１０までの反応室が、反応装置内に配置されることができる。トレーはロードに際して反応装置によって配置され、そしてスライド及びカバーはトレーによって配置されるので、１０までの反応室の正確な位置は反応装置内で容易に決定されることができる。スライドの寸法が製造上の不正確さに起因して変化するとすれば、カバーはスライドの側部に当接せず（外部のウィッキングポイントをなくすために）、かくしてカバーは、他の手段によって拘束されなければスライドの頂部上で自由に移動することができ、一度に１０の反応室を配置することは困難となるであろう。
【０１２８】
トレーがロードされ、かつスライド及びカバーがクランプによって所定の位置に固定された後、トレーは除去されることができる。この例においては、トレーは下へ落とされ、これによりマウントはスライド及びカバーを担持する。これは、ウィッキングポストを別にすれば、スライドのエッジのまわりのすべての当接（接触）を除去する。かくして、この配置構造でもって、複数（多数）のスライド及びカバーを、スライドの側部と何ら当接させることなく、容易にかつ迅速に配置することが可能である。カバーは能動的なシール構造（positive sealing arrangement）を備えず、かつ反応室は一般に流体で満たされるので、この配置構造は、流体の損失を招くことなく、複数のスライドをロードすることを助勢し、これにより反応室内での泡の形成を最小化する。
【０１２９】
複数の（multiple）スライド及びカバーをロードするための装置であって、
スライド及びカバーのための複数のレセプタクルを有するトレーと、
トレーを受け入れるための受け入れ部と、
受け入れ部内に配置された各レセプタクルのためのマウントと、
各マウントのためのクランプ（clamp：固定具）とを含んでいて、
スライド及びカバーを有するトレーが受け入れ部内にロードされたときに、各クランプが、カバーをスライド上に保持してスライドを配置し、かつ、トレーがスライドから落ちて、各スライドがマウントによって担持されるようになっている装置。
【０１３０】
好ましい態様では、流体排出手段が設けられる。
好ましい態様では、流体排出手段がウィッキング手段を含む。
上記装置は、スライド及びカバーが、必要があればバッチ単位で、オペレータによって容易にロードされるのを可能にする。
【０１３１】
複数のステップを含んでいるスライド上のサンプルでの反応を行わせる方法であって、
少なくとも１つのスライドを有する第１のホルダを反応装置内にロードする過程と、
スライドを走査して、スライド上で起こる反応における複数のステップを決定する過程と、
他のホルダが反応装置内にロードされているかどうかを決定する過程と、
第１のホルダに関連する少なくとも１つのスライドで要求される複数のステップを行わせる過程と、
第２のバッチが検出されたときに、第１のホルダ内の少なくとも１つのスライドに関連する反応におけるステップを継続し、この後、第２のホルダに関連するスライドに関連する少なくとも１つのステップを行わせる過程とを含む方法。
【０１３２】
これは、反応を開始もしくは停止させ、又はその他の作業（ピペットのロボットアームへの取り付けなど）を行わせるのに用いられる装置が常時利用されるわけではないギャップが一般に存在するといった状況で可能である。
【０１３３】
もし装置が常時用いられるのであれば、第２のホルダと関連する少なくとも１つのスライドの上で起こる反応のステップは、第１のバッチ（bath）が終了するまで始まらないであろう。
【０１３４】
スライド上で反応を実施するための装置であって、
スライド及び関連するカバーを担持するとともに配置するようになっている複数のレセプタクルを有するトレーと、
トレーの各レセプタクルと関連するマウントを有する、トレーのための受け入れポートと、
カバー及びスライドを所定の位置に固定するための固定機構と、
カバーとスライドとの間に形成された反応室から流体を排出するための流体排出手段と、
少なくとも１つの流体が該装置に配置されるのを可能にするための流体レセプタクルと、
流体を上記スライド上に分配するための流体分配手段とを含んでいて、
トレーがロードされた後、スライド及びカバーが固定されるとともにトレーが移動させられ、
これにより、スライド及びカバーがマウント上で担持され、流体が、分配手段によってスライド上に分配されることができ、かつ排出手段によって排出されるようになっている装置。
【０１３５】
好ましい態様では、該装置が、スライドに対してカバーを配置するとともに移動させるための配置手段を含んでいる。
好ましい態様では、トレー内の各レセプタクルに関連する配置手段が存在する。
好ましい態様では、１つの特定のトレーと関連する全ての配置手段がすべて同時に移動して、スライドに関連するカバーを移動させ、トレー上の全てのスライドの流体の分配又は排出を促進するようになっている。
【０１３６】
試薬をサンプルスライドに供給するための装置であって、
スライドを受け入れるための複数のポートと、
スライドの各々についての識別情報を読み取るための読取器と、
スライド上に落とされるべき試薬を運ぶ試薬コンテナを受け入れるための試薬ラックとを含んでいて、
スライドが、関連するポートに受け入れられたトレーに供給され、各トレーが個別の１バッチのスライドに相当し、該装置の動作時におけるバッチ処理に対して、個別のトレーの追加及び除去を可能にするようになっている装置。
【０１３７】
バッチのロードは、再び、検査及び計画が関係する範囲において、オペレータに対して実質的な柔軟性を与える。
【符号の説明】
【０１３８】
１０ 反応装置、１２ バルク試薬容器受け入れゾーン、１４ 基材トレー受け入れポート、１５ スライドトレー、１６ ロボットアーム、１８ 試薬ラック受け入れゾーン、２０ バルク試薬容器、２４ ガイド、２６ 分散手段、２８ ピペット、３０ ラックマウント、３１ ラック配置クリップ、３３ センサ、３４ 試薬ラック、３５ センサ、３７ 受け入れ手段、３８ 支持手段、３９ 試薬容器。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
サンプル領域に位置決めされたサンプルを有する少なくとも１つの基材と、分離型のカバーとを受け入れるための生物反応装置であって、
上記サンプル領域の上方において、上記カバーと上記基材との間に反応室が形成されていて、
上記基材を位置決めするための位置決め手段と、
上記カバーを上記基材に対して位置決めするとともに移動させるためのカバー位置決め手段と、
上記反応室内に流体を分配するための流体分配手段と、
流体排出機構とを備えていて、
上記流体排出機構が流体除去手段を有していることを特徴とする生物反応装置。
【請求項２】
上記流体除去手段が、上記基板から流体を排出するための流体通路を形成する上記基板上の当接点を有していることを特徴とする、請求項１に記載の生物反応装置。
【請求項３】
上記基材が、該生物反応装置内で下側から担持されていることを特徴とする、請求項１又は２に記載の生物反応装置。
【請求項４】
基材及びカバーを位置決めするようになっている受け入れ手段を有する基材のためのレセプタクル。
【請求項５】
上記受け入れ手段が、上記基材を配置して担持するためのステーションを含み、上記カバーが上記基材上で担持されている、請求項４に記載のレセプタクル。
【請求項６】
上記受け入れステーションが、上記基材を、該基材の周縁部付近で担持している請求項４又は５に記載のレセプタクル。
【請求項７】
上記受け入れ手段が、上記基材を担持するための周縁出っ張り部を有するそれぞれの開口部によって形成されている、請求項４〜６のいずれかに記載のレセプタクル。
【請求項８】
上記開口部が、反応装置から支持プラットホームを受け入れるようになっていて、反応装置内にロードされたときに上記プラットホームが上記基材を担持するようになっている、請求項７に記載のレセプタクル。
【請求項９】
上記受け入れ手段が、上記基材から上記カバーを持ち上げるための持ち上げ手段を有している、請求項４〜８のいずれかに記載のレセプタクル。
【請求項１０】
上記持ち上げ手段が、上記カバー上の突起部と係合するようになっている傾斜面である、請求項９に記載のレセプタクル。
【請求項１１】
上記受け入れ手段が、上記カバーが該レセプタクル及びスライドに対して移動させられることを可能にするガイド部を有している、請求項４〜１０のいずれかに記載のレセプタクル。
【請求項１２】
流体導管と、
上記流体導管に接続されたポンプと、
上記流体導管を、流体源から分配領域に移動させるための位置決め手段とを含んでいる反応装置のためのディスペンサ。
【請求項１３】
該ディスペンサが、流体源及び基材のタイプを検出するためのバーコードセンサを含んでいる、請求項１２に記載のディスペンサ。
【請求項１４】
該ディスペンサが、流体源内に残っている流体の体積を決定するための手段を含んでいる、請求項１２又は１３に記載のディスペンサ。
【請求項１５】
上記センサが、上記流体導管のキャパシタンスの変化を測定して、流体コンテナ内への流体の注入を検出するようになっている、請求項１２に記載のディスペンサ。
【請求項１６】
流体を基材に分配する方法であって、
少なくとも１つの流体コンテナを備えた試薬レセプタクルをロードするステップと、
上記試薬レセプタクルを反応装置に取り付けるステップと、
上記試薬レセプタクルを検出するステップと、
上記試薬レセプタクルが検出された後、センサを起動して、上記の少なくとも１つの流体コンテナ内の流体のタイプを検出するステップと、
流体のタイプについての情報を格納し、要求があったときに上記流体が基材上に分配されるのを可能にするステップとを含んでいる方法。
【請求項１７】
上記センサがバーコードを検出する、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
スライドのための支持突起部と、分配手段と、流体除去手段とを有している反応装置であって、
上記支持突起部が下側からスライドを担持するとともに、ウィッキング手段が上記スライドの周縁部と接触し、
上記ウィッキング手段が、上記スライドの上表面から流体を除去するためのウィッキングキング通路を形成している反応装置。
【請求項１９】
上記支持突起部が、水平方向に対して０ないし１０度傾斜し、流体除去領域を備えたマウント部を形成している、請求項１８に記載の反応装置。
【請求項２０】
上記ウィッキング手段がウィッキングポストである、請求項１８又は１９に記載の反応装置。
【請求項２１】
上記ウィッキングポストが上記流体除去領域に配置されている、請求項２０に記載の反応装置。
【請求項２２】
上記ウィッキング手段が、上記スライドの幅の大部分を横切って伸びるようになっている、請求項２０又は２１に記載の反応装置。
【請求項２３】
サンプルを含んでいる表面を有する基材と、サンプルを含んでいる上記表面とで反応室を形成する表面を有するカバーとを位置決めするようになっている反応装置であって、
上記反応室の体積を変化させるようになっているカバー係合手段を含んでいる反応装置。
【請求項２４】
上記カバー係合手段が、上記カバーを上記基材にクランプするようになっているクランプ機構である、請求項２３に記載の反応装置。
【請求項２５】
複数の基材及びカバーを保持するようになっている分離型の基材トレーと、
上記基材トレーを受け入れるための少なくとも１つの受け入れステーションと、
上記基材トレー内の基材の上に流体を分配するための分配手段とを有する反応装置であって、
上記基材とカバーとの間に反応室が形成され、上記基材の上に分配された流体が上記反応室に入るようになっている反応装置。
【請求項２６】
それぞれ基材トレーを受け入れるようになっている複数の受け入れステーションを含んでいる、請求項２５に記載の反応装置。
【請求項２７】
該反応装置が、他のどの基材トレーとも独立して１つの基材トレーの上の基材の上に上記流体が分配されるのを可能にするコントローラを有している、請求項２６に記載の反応装置。
【請求項２８】
サンプル領域内に位置決めされたサンプルを有する基材と、該基材から流体を排出するためのウィッキング手段を含んでいる流体排出機構とを受け入れるための反応装置。
【請求項２９】
反応装置内のスライドの上に反応室を形成する方法であって、
空洞部を有するカバーをスライドの上に配置して、反応室を形成する過程と、
上記カバー及びスライドをトレーのレセプタクル内に位置決めする過程と、
上記トレー内の各レセプタクルのためのマウント部を有する反応装置内に、受け入れ部を設ける過程と、
上記トレーを、上記反応装置の受け入れ部内にロードし、上記反応装置の受け入れ部が上記トレーを位置決めする過程と、
上記カバーを上記スライドに取り外し可能に保持する過程と、
上記スライド及びカバーから上記トレーを取り外す過程とを含む方法。
【請求項３０】
複数のスライド及びカバーをロードするための装置であって、
スライド及びカバーのための複数のレセプタクルを有するトレーと、
トレーを受け入れるための受け入れ部と、
上記受け入れ部内に位置決めされた各レセプタクルのためのマウント部と、
各マウント部のためのクランプとを含んでいて、
スライド及びカバーを有するトレーが上記受け入れ部内にロードされたときに、各クランプが、上記カバーを上記スライド上に保持して上記スライドを位置決めし、かつ、上記トレーが上記スライドから落ちて、各スライドが上記マウント部によって担持されるようになっている装置。
【請求項３１】
流体排出手段が設けられている、請求項３０に記載の装置。
【請求項３２】
上記流体排出手段がウィッキング手段を含んでいる、請求項３１に記載の装置。
【請求項３３】
複数のステップを含んでいる、スライドの上のサンプルの上で反応を起こさせる方法であって、
少なくとも１つのスライドを有する第１のホルダを反応装置内にロードする過程と、
上記スライドを走査して、上記スライド上で起こる反応における上記複数のステップを決定する過程と、
他のホルダが上記反応装置内にロードされているかどうかを決定する過程と、
上記第１のホルダに関連する上記少なくとも１つのスライドで要求される上記複数のステップを起こさせる過程と、
第２のホルダが検出されたときに、上記第１のホルダ内の上記少なくとも１つのスライドに関連する反応における上記ステップを継続し、この後、上記第２のホルダに関連するスライドに関連する上記少なくとも１つのステップを起こさせる過程とを含む方法。
【請求項３４】
上記第２のホルダに関連する上記少なくとも１つのスライドの反応の上記第１のステップが、上記第１のホルダに関連する上記少なくとも１つのスライドの反応の最後のステップが終了する前に開始される、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
スライド上で反応を行わせるための装置であって、
スライド及び関連するカバーを担持するとともに位置決めするようになっている複数のレセプタクルを有するトレーと、
上記トレーの各レセプタクルと関連するマウント部を有する、上記トレーのための受け入れポートと、
上記カバー及びスライドを所定の位置にクランプするためのクランプ機構と、
上記カバーと上記スライドとの間に形成された反応室から流体を排出するための流体排出手段と、
少なくとも１つの流体が該装置に配置されるのを可能にするための流体レセプタクルと、
流体を上記スライドの上に分配するための流体分配手段とを含んでいて、
上記トレーがロードされてから、上記スライド及びカバーがクランプされるとともに上記トレーが移動させられ、
これにより、上記スライド及びカバーが上記マウント部上に担持され、流体が、上記分配手段によって上記スライド上に分配されることができ、かつ上記流体排出手段によって排出されるようになっている装置。
【請求項３６】
該装置が、上記スライドに対して上記カバーを位置決めするとともに移動させるための位置決め手段を含んでいる、請求項３５に記載の装置。
【請求項３７】
トレー内の各レセプタクルに関連する位置決め手段が存在する、請求項３５に記載の装置。
【請求項３８】
１つの特定のトレーと関連する全ての位置決め手段がすべて同時に移動して、上記スライドに関連する上記カバーを移動させ、トレー上の全てのスライドの流体の分配又は排出を促進するようになっている、請求項３７に記載の装置。
【請求項３９】
試薬をサンプルスライドに供給するための装置であって、
上記スライドを受け入れるための複数のポートと、
上記スライドの各々についての識別情報を読み取るための読取器と、
上記スライド上に堆積されるべき試薬を運ぶ試薬コンテナを受け入れるための試薬ラックとを含んでいて、
上記スライドが、上記の関連するポートに受け入れられたトレーに供給され、各トレーが個別のバッチのスライドに相当し、該装置の動作時におけるバッチ処理に対して、個別のトレーの追加及び除去を可能にするようになっている装置。
【請求項４０】
サンプルスライドの上に試薬をのせるための装置であって、
複数の試薬コンテナを保持するための試薬ラックと、
上記コンテナから上記スライドに試薬を輸送するための流体導管と、
上記流体導管用いて、異なるコンテナからの試薬を組み合わせて混合させる混合ステーションとを含んでいる装置。
【請求項４１】
複数の試薬コンテナからの試薬を混合してサンプルスライドに供給する方法であって、
各コンテナからの試薬を、流体導管を用いて混合ステーションに輸送する過程と、
組み合わせられた試薬を流体導管内に引き戻すとともに、該試薬を上記混合ステーションに再びのせることにより上記混合ステーションで上記試薬を混合し、サンプルへの供給に先立って、上記試薬の攪拌混合を生じさせる過程とを含む方法。
【請求項１】
サンプル領域に位置決めされたサンプルを有する少なくとも１つの基材と、分離型のカバーとを受け入れるための生物反応装置であって、
上記サンプル領域の上方において、上記カバーと上記基材との間に反応室が形成されていて、
上記基材を位置決めするための位置決め手段と、
上記カバーを上記基材に対して位置決めするとともに移動させるためのカバー位置決め手段と、
上記反応室内に流体を分配するための流体分配手段と、
流体排出機構とを備えていて、
上記流体排出機構が流体除去手段を有していることを特徴とする生物反応装置。
【請求項２】
上記流体除去手段が、上記基板から流体を排出するための流体通路を形成する上記基板上の当接点を有していることを特徴とする、請求項１に記載の生物反応装置。
【請求項３】
上記基材が、該生物反応装置内で下側から担持されていることを特徴とする、請求項１又は２に記載の生物反応装置。
【請求項４】
基材及びカバーを位置決めするようになっている受け入れ手段を有する基材のためのレセプタクル。
【請求項５】
上記受け入れ手段が、上記基材を配置して担持するためのステーションを含み、上記カバーが上記基材上で担持されている、請求項４に記載のレセプタクル。
【請求項６】
上記受け入れステーションが、上記基材を、該基材の周縁部付近で担持している請求項４又は５に記載のレセプタクル。
【請求項７】
上記受け入れ手段が、上記基材を担持するための周縁出っ張り部を有するそれぞれの開口部によって形成されている、請求項４〜６のいずれかに記載のレセプタクル。
【請求項８】
上記開口部が、反応装置から支持プラットホームを受け入れるようになっていて、反応装置内にロードされたときに上記プラットホームが上記基材を担持するようになっている、請求項７に記載のレセプタクル。
【請求項９】
上記受け入れ手段が、上記基材から上記カバーを持ち上げるための持ち上げ手段を有している、請求項４〜８のいずれかに記載のレセプタクル。
【請求項１０】
上記持ち上げ手段が、上記カバー上の突起部と係合するようになっている傾斜面である、請求項９に記載のレセプタクル。
【請求項１１】
上記受け入れ手段が、上記カバーが該レセプタクル及びスライドに対して移動させられることを可能にするガイド部を有している、請求項４〜１０のいずれかに記載のレセプタクル。
【請求項１２】
流体導管と、
上記流体導管に接続されたポンプと、
上記流体導管を、流体源から分配領域に移動させるための位置決め手段とを含んでいる反応装置のためのディスペンサ。
【請求項１３】
該ディスペンサが、流体源及び基材のタイプを検出するためのバーコードセンサを含んでいる、請求項１２に記載のディスペンサ。
【請求項１４】
該ディスペンサが、流体源内に残っている流体の体積を決定するための手段を含んでいる、請求項１２又は１３に記載のディスペンサ。
【請求項１５】
上記センサが、上記流体導管のキャパシタンスの変化を測定して、流体コンテナ内への流体の注入を検出するようになっている、請求項１２に記載のディスペンサ。
【請求項１６】
流体を基材に分配する方法であって、
少なくとも１つの流体コンテナを備えた試薬レセプタクルをロードするステップと、
上記試薬レセプタクルを反応装置に取り付けるステップと、
上記試薬レセプタクルを検出するステップと、
上記試薬レセプタクルが検出された後、センサを起動して、上記の少なくとも１つの流体コンテナ内の流体のタイプを検出するステップと、
流体のタイプについての情報を格納し、要求があったときに上記流体が基材上に分配されるのを可能にするステップとを含んでいる方法。
【請求項１７】
上記センサがバーコードを検出する、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
スライドのための支持突起部と、分配手段と、流体除去手段とを有している反応装置であって、
上記支持突起部が下側からスライドを担持するとともに、ウィッキング手段が上記スライドの周縁部と接触し、
上記ウィッキング手段が、上記スライドの上表面から流体を除去するためのウィッキングキング通路を形成している反応装置。
【請求項１９】
上記支持突起部が、水平方向に対して０ないし１０度傾斜し、流体除去領域を備えたマウント部を形成している、請求項１８に記載の反応装置。
【請求項２０】
上記ウィッキング手段がウィッキングポストである、請求項１８又は１９に記載の反応装置。
【請求項２１】
上記ウィッキングポストが上記流体除去領域に配置されている、請求項２０に記載の反応装置。
【請求項２２】
上記ウィッキング手段が、上記スライドの幅の大部分を横切って伸びるようになっている、請求項２０又は２１に記載の反応装置。
【請求項２３】
サンプルを含んでいる表面を有する基材と、サンプルを含んでいる上記表面とで反応室を形成する表面を有するカバーとを位置決めするようになっている反応装置であって、
上記反応室の体積を変化させるようになっているカバー係合手段を含んでいる反応装置。
【請求項２４】
上記カバー係合手段が、上記カバーを上記基材にクランプするようになっているクランプ機構である、請求項２３に記載の反応装置。
【請求項２５】
複数の基材及びカバーを保持するようになっている分離型の基材トレーと、
上記基材トレーを受け入れるための少なくとも１つの受け入れステーションと、
上記基材トレー内の基材の上に流体を分配するための分配手段とを有する反応装置であって、
上記基材とカバーとの間に反応室が形成され、上記基材の上に分配された流体が上記反応室に入るようになっている反応装置。
【請求項２６】
それぞれ基材トレーを受け入れるようになっている複数の受け入れステーションを含んでいる、請求項２５に記載の反応装置。
【請求項２７】
該反応装置が、他のどの基材トレーとも独立して１つの基材トレーの上の基材の上に上記流体が分配されるのを可能にするコントローラを有している、請求項２６に記載の反応装置。
【請求項２８】
サンプル領域内に位置決めされたサンプルを有する基材と、該基材から流体を排出するためのウィッキング手段を含んでいる流体排出機構とを受け入れるための反応装置。
【請求項２９】
反応装置内のスライドの上に反応室を形成する方法であって、
空洞部を有するカバーをスライドの上に配置して、反応室を形成する過程と、
上記カバー及びスライドをトレーのレセプタクル内に位置決めする過程と、
上記トレー内の各レセプタクルのためのマウント部を有する反応装置内に、受け入れ部を設ける過程と、
上記トレーを、上記反応装置の受け入れ部内にロードし、上記反応装置の受け入れ部が上記トレーを位置決めする過程と、
上記カバーを上記スライドに取り外し可能に保持する過程と、
上記スライド及びカバーから上記トレーを取り外す過程とを含む方法。
【請求項３０】
複数のスライド及びカバーをロードするための装置であって、
スライド及びカバーのための複数のレセプタクルを有するトレーと、
トレーを受け入れるための受け入れ部と、
上記受け入れ部内に位置決めされた各レセプタクルのためのマウント部と、
各マウント部のためのクランプとを含んでいて、
スライド及びカバーを有するトレーが上記受け入れ部内にロードされたときに、各クランプが、上記カバーを上記スライド上に保持して上記スライドを位置決めし、かつ、上記トレーが上記スライドから落ちて、各スライドが上記マウント部によって担持されるようになっている装置。
【請求項３１】
流体排出手段が設けられている、請求項３０に記載の装置。
【請求項３２】
上記流体排出手段がウィッキング手段を含んでいる、請求項３１に記載の装置。
【請求項３３】
複数のステップを含んでいる、スライドの上のサンプルの上で反応を起こさせる方法であって、
少なくとも１つのスライドを有する第１のホルダを反応装置内にロードする過程と、
上記スライドを走査して、上記スライド上で起こる反応における上記複数のステップを決定する過程と、
他のホルダが上記反応装置内にロードされているかどうかを決定する過程と、
上記第１のホルダに関連する上記少なくとも１つのスライドで要求される上記複数のステップを起こさせる過程と、
第２のホルダが検出されたときに、上記第１のホルダ内の上記少なくとも１つのスライドに関連する反応における上記ステップを継続し、この後、上記第２のホルダに関連するスライドに関連する上記少なくとも１つのステップを起こさせる過程とを含む方法。
【請求項３４】
上記第２のホルダに関連する上記少なくとも１つのスライドの反応の上記第１のステップが、上記第１のホルダに関連する上記少なくとも１つのスライドの反応の最後のステップが終了する前に開始される、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
スライド上で反応を行わせるための装置であって、
スライド及び関連するカバーを担持するとともに位置決めするようになっている複数のレセプタクルを有するトレーと、
上記トレーの各レセプタクルと関連するマウント部を有する、上記トレーのための受け入れポートと、
上記カバー及びスライドを所定の位置にクランプするためのクランプ機構と、
上記カバーと上記スライドとの間に形成された反応室から流体を排出するための流体排出手段と、
少なくとも１つの流体が該装置に配置されるのを可能にするための流体レセプタクルと、
流体を上記スライドの上に分配するための流体分配手段とを含んでいて、
上記トレーがロードされてから、上記スライド及びカバーがクランプされるとともに上記トレーが移動させられ、
これにより、上記スライド及びカバーが上記マウント部上に担持され、流体が、上記分配手段によって上記スライド上に分配されることができ、かつ上記流体排出手段によって排出されるようになっている装置。
【請求項３６】
該装置が、上記スライドに対して上記カバーを位置決めするとともに移動させるための位置決め手段を含んでいる、請求項３５に記載の装置。
【請求項３７】
トレー内の各レセプタクルに関連する位置決め手段が存在する、請求項３５に記載の装置。
【請求項３８】
１つの特定のトレーと関連する全ての位置決め手段がすべて同時に移動して、上記スライドに関連する上記カバーを移動させ、トレー上の全てのスライドの流体の分配又は排出を促進するようになっている、請求項３７に記載の装置。
【請求項３９】
試薬をサンプルスライドに供給するための装置であって、
上記スライドを受け入れるための複数のポートと、
上記スライドの各々についての識別情報を読み取るための読取器と、
上記スライド上に堆積されるべき試薬を運ぶ試薬コンテナを受け入れるための試薬ラックとを含んでいて、
上記スライドが、上記の関連するポートに受け入れられたトレーに供給され、各トレーが個別のバッチのスライドに相当し、該装置の動作時におけるバッチ処理に対して、個別のトレーの追加及び除去を可能にするようになっている装置。
【請求項４０】
サンプルスライドの上に試薬をのせるための装置であって、
複数の試薬コンテナを保持するための試薬ラックと、
上記コンテナから上記スライドに試薬を輸送するための流体導管と、
上記流体導管用いて、異なるコンテナからの試薬を組み合わせて混合させる混合ステーションとを含んでいる装置。
【請求項４１】
複数の試薬コンテナからの試薬を混合してサンプルスライドに供給する方法であって、
各コンテナからの試薬を、流体導管を用いて混合ステーションに輸送する過程と、
組み合わせられた試薬を流体導管内に引き戻すとともに、該試薬を上記混合ステーションに再びのせることにより上記混合ステーションで上記試薬を混合し、サンプルへの供給に先立って、上記試薬の攪拌混合を生じさせる過程とを含む方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【公開番号】特開２０１１−１１７９７６（Ｐ２０１１−１１７９７６Ａ）
【公開日】平成２３年６月１６日（２０１１．６．１６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−４８７９９（Ｐ２０１１−４８７９９）
【出願日】平成２３年３月７日（２０１１．３．７）
【分割の表示】特願２００９−１２２４４（Ｐ２００９−１２２４４）の分割
【原出願日】平成１５年６月２０日（２００３．６．２０）
【出願人】（５０４４６６３７３）ビジョン・バイオシステムズ・リミテッド (4)
【氏名又は名称原語表記】ＶＩＳＩＯＮ ＢＩＯＳＹＳＴＥＭＳ ＬＩＭＩＴＥＤ
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２３年６月１６日（２０１１．６．１６）
【国際特許分類】
【出願日】平成２３年３月７日（２０１１．３．７）
【分割の表示】特願２００９−１２２４４（Ｐ２００９−１２２４４）の分割
【原出願日】平成１５年６月２０日（２００３．６．２０）
【出願人】（５０４４６６３７３）ビジョン・バイオシステムズ・リミテッド (4)
【氏名又は名称原語表記】ＶＩＳＩＯＮ ＢＩＯＳＹＳＴＥＭＳ ＬＩＭＩＴＥＤ
【Ｆターム（参考）】
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