本発明は、狭窄に関連する遺伝子多型の発見に基づく。特に、本発明は、多型を含む核酸分子、このような核酸分子によってコードされる改変タンパク質、多型核酸分子およびタンパク質を検出するための試薬、ならびに核酸分子およびタンパク質を用いる方法、ならびにこれらの検出のための試薬の使用方法に関する。特に、本発明は、ヒトゲノムにおける特定の一塩基多型（ＳＮＰ）、ならびに狭窄および関係する病理とのそれらの関連に関する。正常個体に対しての、狭窄患者集団における対立遺伝子頻度の違いに基づいて、本明細書において開示される天然に存在するＳＮＰは、診断試薬の設計および治療剤の開発のため、ならびに疾患関連分析および連鎖分析のための標的として、使用され得る。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
狭窄を発生させる変更された危険性を有する個体を同定するための方法であって、該方法が、該個体の核酸において、配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列のいずれか一つに一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する工程を包含し、ここで、該ＳＮＰの存在が、該個体における狭窄の変更された危険性と関連する、方法。
【請求項２】
前記変更された危険性が、上昇した危険性である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記個体が、狭窄を有する、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記変更された危険性が、減少した危険性である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記ＳＮＰが、表６および７に記載のＳＮＰからなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
請求項１に記載の方法であって、以下：対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖立体配座多型からなる群より選択されるプロセスにより検出が実施される、方法。
【請求項７】
少なくとも８個の連続したヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで、該ヌクレオチドの一つが、配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列、またはその相補体のいずれか一つより選択される一塩基多型（ＳＮＰ）である、核酸分子。
【請求項８】
前記ＳＮＰが、表３および４に記載のＳＮＰからなる群より選択される、請求項７に記載の単離された核酸分子。
【請求項９】
配列番号２８５〜５６８のアミノ酸配列のいずれか一つをコードする、単離された核酸分子。
【請求項１０】
配列番号２８５〜５６８からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１１】
請求項１０に記載のポリペプチド、もしくはその抗原結合フラグメントに特異的に結合する、抗体。
【請求項１２】
前記抗体が、モノクローナル抗体である、請求項１１に記載の抗体。
【請求項１３】
増幅されたポリヌクレオチドであって、該増幅されたポリヌクレオチドが、配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列またはその相補体のいずれか一つより選択される一塩基多型（ＳＮＰ）を含み、ここで、該増幅されたポリヌクレオチドが、約１６ヌクレオチドと約１，０００ヌクレオチドとの間の長さである、ポリヌクレオチド。
【請求項１４】
請求項１３に記載の増幅されたポリヌクレオチドであって、ここで、前記ヌクレオチド配列が、配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列のいずれか一つを含む、ポリヌクレオチド。
【請求項１５】
配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列のいずれか一つの一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子に、特異的にハイブリダイズする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１６】
８〜７０ヌクレオチドの長さである、請求項１５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１７】
対立遺伝子特異的プローブである、請求項１５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８】
対立遺伝子特異的プライマーである、請求項１５に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９】
請求項１５に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドが、表５（配列番号２６，１３１〜２６，４１５）に記載のプライマー配列からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド。
【請求項２０】
核酸中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するためのキットであって、該キットが、請求項１５のポリヌクレオチド、緩衝剤、および酵素を備える、キット。
【請求項２１】
核酸分子中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するための方法であって、該方法が、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列のいずれか一つにおいてＳＮＰに特異的にハイブリダイズする試薬と、試験サンプルとを接触させる工程；ならびにハイブリダイズした二重鎖の形成を検出する工程を包含する、方法。
【請求項２２】
請求項２１に記載の方法であって、以下：対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖立体配座多型からなる群より選択されるプロセスにより検出が実施される、方法。
【請求項２３】
改変ポリペプチドを検出するための方法であって、該方法が、試験サンプル中の配列番号１〜２８４および５６９〜２６，１３０のヌクレオチド配列のいずれか一つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）によりコードされる改変ポリペプチドと、試薬とを接触させる工程、および該試薬の該ポリペプチドへの結合を検出する工程を包含する、方法。
【請求項２４】
狭窄を治療的もしくは予防的に処置するのに有用な薬剤を同定するための方法であって、該方法が、候補薬剤に請求項１０に記載のポリペプチドを、該ポリペプチドと該候補薬剤との間に結合複合体を形成させるために適切な条件下で接触させる工程、ならびに該結合複合体の形成を検出する工程を包含し、ここで、該複合体の存在が、該薬剤を同定する、方法。

【図１】

【公表番号】特表２００９−５１９００１（Ｐ２００９−５１９００１Ａ）
【公表日】平成２１年５月１４日（２００９．５．１４）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００５−５１００４８（Ｐ２００５−５１００４８）
【出願日】平成１５年１２月２２日（２００３．１２．２２）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０４０９７７
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０５８９９０
【国際公開日】平成１６年７月１５日（２００４．７．１５）
【出願人】（５０３３０６４７８）アプレラ　コーポレイション (4)
【Ｆターム（参考）】