説明

病態を識別するための体液試料中に含まれるポリペプチドおよびマーカーの定量的評価のための装置および方法

病態を識別するための、体液の試料中に含まれるポリペプチドおよびマーカーの、定量的評価のための装置および方法が記載される。
該ポリペプチドはデータベースに保存された参照値と比較される。これらの参照値は、症状に関係するポリペプチドのデータ記録として保存され、その記録はそれぞれ健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する少なくとも一部の情報を含む。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、病態を識別するための、体液の試料中に含まれるポリペプチドおよびマーカーの、定量的評価およびデータベースに保存された参照値との比較のための装置および方法に関する。
【背景技術】
【0002】
独国特許第100 21 737 C2号明細書から、液体試料のタンパク質および/またはポリペプチドパターンの定性的および/または定量的測定のための方法および装置が知られている。液体試料のタンパク質および/またはポリペプチドはキャピラリー電気泳動によって分離され、次いで直接にイオン化され、およびインターフェイスを通して検出用のオンライン連結された質量分析装置へ輸送される。
【0003】
長期にわたって人体または動物体の状態を監視するために、この状態を表す参照値および試料値、およびそこから得られる偏差および一致が自動的にデータベースに保存され、およびタンパク質および/またはペプチドパターンが再び測定される際、最適な一致について検索が自動的に実施される。
【0004】
人体または動物体の状態についての非常に信頼性の高い説明が、現在までに得られたポリペプチドパターンを用いて既に可能であることが見出されている。それらは以前の普通の実験および診断法を補完または代替しうる。特に糖尿病および糖尿病性腎症に関しては、ポリペプチドパターンの測定のための多数の参照値および試料値がこれまでに得られている。
【0005】
糖尿病はしばしば糖尿病性腎症の前兆であり、糖尿病性腎症は何年何十年にわたって進行しうる。糖尿病性腎症はいくつかの段階を経て進行する。糖尿病性腎症の早期診断は、現在利用可能な手段ではほとんど不可能であり、および、多大な費用をかけてようやく可能であり、および相対的に遅い時期にしかできない。
【0006】
顕在性の腎症の十分に早期の診断および持続的な治療は、不可避的な透析を防ぐかまたは遅らせるだけでなく、糖尿病患者における高い心臓血管リスクを低下させる。
【0007】
液体試料たとえば尿のポリペプチドパターンは、本発明の疾患の早期段階での診断を可能にすることが既に見出されている。さらなる検討は、上述の糖尿病および糖尿病性腎症以外の疾患の診断もまた、ポリペプチドパターンによって可能であることを示す。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【0008】
本発明の目的は、装置でのコンピューターを使用した保存および評価に適したポリペプチドの定義、および体液の試料中に含まれるポリペプチドの定量的評価およびデータベースに保存された参照値との比較のための方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【0009】
この目的は、参照値が症状に関係するポリペプチドのデータ記録として保存され、その記録はそれぞれ健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する少なくとも一部の情報を含むことを特徴とする、体液の試料中に含まれるポリペプチドの定量的評価およびデータベースに保存された参照値との比較のための装置において、および、健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する少なくとも一つの参照値と体液の試料中のポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する値とを比較することによる症状に関係するポリペプチドのデータ記録として比較のために参照値が用いられることを特徴とする、体液の試料中に含まれるポリペプチドの定量的評価およびデータベースに保存された参照値との比較のための方法で達成される。
【0010】
本発明の別の目的は、保存および評価に適した含まれるポリペプチドの定義を通じて、病態を識別するためのマーカーを提供することである。
【0011】
この目的は、健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する一個の情報にそれぞれ関連する症状に関係する複数のポリペプチドによって特徴づけられる、病態を識別するためのマーカーを用いて達成される。
【0012】
さらなる展開および有益な実施形態はそれぞれの従属請求項に見ることができる。
【0013】
本発明では、体液中の濃度が正常な状態と比較して病理的状態において明らかに変化するポリペプチドについてのデータが評価される。予備試験では、多数の被験者を用いてそのようなポリペプチドを規定しうる。
【0014】
各ポリペプチドは、病態について健常者および患者における存在確率 および/または濃度に関する情報を含む情報と関連している。
【0015】
液体試料に由来するポリペプチドを対照値と比較する際、液体試料の比較される各ポリペプチドについてその存在および/または濃度が健常状態または疾患状態を表すかどうかに関して値の割り当てが見出される。多数のポリペプチドを比較することによって、典型的な存在確率および濃度からの少数の個別の偏差による全体の結果の偏りを低減または回避することができる。
【0016】
別の一実施形態によると、ポリペプチドはまた、キャピラリー電気泳動における関連する質量および関連する保持時間を示すことによって定義されうる。
【0017】
したがって、キャピラリー電気泳動および質量分析のデータを直接に採用することができる。これらのデータはすべてのポリペプチドについて異なるが、しかし明瞭であり、そのためそのデータは定義に十分である。たとえば、キャピラリー電気泳動における保持時間は、長さ90cmおよび内径(ID)75μmおよび外径(OD)360μmのガラスキャピラリーを用いる電圧30kVでのキャピラリー電気泳動によって、30%メタノール、0.5%ギ酸を含む水を試料用溶媒として用いて測定できる。
【0018】
「糖尿病」および「腎臓損傷」の診断については、その症状に関連するポリペプチドの特別のデータ記録が、多数の被験者に由来する尿試料を用いることによって確立されおよび確認されたデータベースに要約されている。個別のポリペプチド、ポリペプチドの組み合わせ、またはすべてのポリペプチドを比較できる。
【0019】
健常状態および病理的状態についての多数のポリペプチドの代表性は重複しているため、最も単純な場合には、これらのポリペプチドのうち一つだけの比較が十分でありうる。しかし、統計的不確実性または個別の偏差に由来する誤差を消去するために、状態に関連するポリペプチドの組み合わせの比較を追求すべきである。列記されたすべてのポリペプチドが比較される場合、最適の結果が達成される。
【0020】
マーカーとして作用するこれらのポリペプチドはまた、潜在的に治療標的となりうる。したがって、これらのポリペプチドが基礎または標的構造である治療剤を開発することが可能である。このように、そのポリペプチドの存在および/または濃度は、調べられる体液中のその濃度が正常値を取るように、補充および/または体内の抗体によってそれぞれ変化させられる。
【0021】
本発明の実施例では、尿中の多数のポリペプチドの存在および濃度が分析される。現在、これはキャピラリー電気泳動と連結した質量分析装置(CE-MS)を用いることによって行われるが、他の方法によって選択的に実施することもできる。
【実施例】
【0022】
図1a中のグラフによって記号化されるCE-MS測定の結果は、x軸上に保持時間、y軸上に質量、およびz軸上にシグナル振幅をプロットすることによる三次元表示を作製後、典型的には500〜1500ポリペプチドのポリペプチドパターンに繋がる。図1bは「生データ」の表示を示し、ここから図cで「認められたシグナル」と呼ばれる関係するシグナルがまずフィルタリングおよび評価ソフトウェアによってフィルタリング除去され、次いで図1dで「ポリペプチドパターン」と呼ばれるポリペプチドパターンを計算する。ポリペプチドはCEにおいて質量および保持時間によって付注され/同定される。ポリペプチドの濃度はシグナルの振幅によって計算される。
【0023】
ポリペプチドパターンを形成するデータはデータベースに保存される。明瞭な同定に必要な個々の情報は、該当の各ポリペプチドについての別個のデータ記録に保存される。図1eはいくつかのデータ記録の画面表示を記号的に示す。
【0024】
必須なポリペプチドを識別するために、確定診断された糖尿病性腎症を有するおよび有しない、または確定診断された糖尿病を有するおよび有しない患者に由来する尿をCE-MSによって検査した。
【0025】
50個を超える測定値についてのデータベース比較から、健康な腎臓を有する被験者の典型的なポリペプチドパターンを規定することができた。同じ方法を用いてI型およびII型糖尿病の200名を超える患者に由来する尿試料を測定した。これらの患者は、全く病的でない段階から尿中タンパク質3G/日を超える値までの、腎疾患のさまざまな段階の集団に相当する。
【0026】
データを分析するために、患者を下記の表に示す通りの四つの群に分けた。

【0027】
試験群の回収されたポリペプチドパターンから、群特異的なポリペプチドパターンが明らかになった。こうして得られたポリペプチドパターンは、正常試料からの典型的な偏差、すなわち、個別のポリペプチドにおける変化を示す。説明のために、表に記載の群特異的ポリペプチドパターンを図2に示す。
【0028】
群K0、P0、P1およびP2のポリペプチドパターンをそれぞれ図2a、2b、2cおよび2dに示す。群K0、P0、P1およびP2のポリペプチドパターンから、合成全体図を組み立て、これが次いで図2eに記載のポリペプチドパターンをマーカープロファイルとして規定するのに用いられる。
【0029】
該当するマーカーについて検索するためには、少なくとも1つの群において適切な数に、この場合には40%より大に見出されうるポリペプチドだけが繰り返される。その後、これらのポリペプチドは、どれが「健常」および「疾患」分類の間の区別を可能にしたか考察される。各群にわたって一貫した発生があるように配慮された。
【0030】
ポリペプチドパターンにおける変化は部分的には基礎疾患の糖尿病のためであり、およびしたがってすべての糖尿病患者において一様に見出すことができ、および部分的には腎症の発症/進行のためであり、またはその原因でさえある。したがって、これらのポリペプチドは、糖尿病または糖尿病性腎症の診断のためのマーカーとして用いることができる。
【0031】
そこに存在するポリペプチドは以降、検査された患者試料中で検索され、その際にその存在または不在が、図2fに示す通り、診断を行うために用いられる。
【0032】
下記の表は、糖尿病性腎症の識別の範囲で見出される、特に関係するマーカーポリペプチドを要約する。ここで言及されるポリペプチドは本疾患の初期段階での識別に役立ち、および単独で、部分集合で、または完全な組み合わせで用いることができる。
【0033】
一覧は質量およびキャピラリー電気泳動における保持時間によって定義された380種類のポリペプチドを含む。1から157までの連番は「糖尿病」の診断に用いられるマーカーペプチドを表す。158から380までの連番は、「腎臓損傷」の診断に用いられるマーカーペプチドを含む。これらの二つの群の中で、ポリペプチドはまず、「陽性」ポリペプチド、すなわち疾患の場合に増加するポリペプチド、または「陰性」ポリペプチドであるかどうかの判定基準によって分類される。その後、ポリペプチドは質量によって昇順に並べられる。
【0034】
下記の表で、各列は下記の意味を有する:











【発明を実施するための最良の形態】
【0035】
本発明の好ましい一実施形態では、本発明に記載の装置または本発明に記載の方法は、キャピラリー電気泳動と連結した質量分析装置で規定できるような、キャピラリー電気泳動における関連する質量および関連する保持時間を示すことによってポリペプチドが定義される点でさらに特徴づけられる。別の好ましい一実施形態では、「糖尿病」の診断のためのデータベースは、上記の表のポリペプチド1番〜157番のデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてを含む。さらに別の好ましい一実施形態では、「腎臓損傷」の診断のためのデータベースは、上記の表のポリペプチド158番〜380番のデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてを含む
【0036】
本発明の好ましい一実施形態では、本発明に記載のマーカーは、キャピラリー電気泳動と連結した質量分析装置で規定できるような、キャピラリー電気泳動における関連する質量および関連する保持時間を示すことによってポリペプチドが定義される点でさらに特徴づけられる。特に、マーカーは、上記の表のポリペプチド1番〜157番の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてが「糖尿病」の診断に含まれおよび上記の表のポリペプチド158番〜380番の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてが「腎臓損傷」の診断に含まれる点で特徴づけられる。
【0037】
本発明の特に好ましい一実施形態では、特に好ましいポリペプチドの組み合わせを、装置、方法 またはマーカーに用いることができる。
【0038】
糖尿病「陽性」ポリペプチドとしては、ポリペプチド番号32(A)、1(B)、48(C)、2(D)、44(E)、22(F)、9(G)、23(H)および20(I)およびその組み合わせ、特に下記のものが好ましい。
【0039】
糖尿病「陰性」ポリペプチドとしては、ポリペプチド番号123(A)、153(B)、155(C)、105(D)、150(E)、121(F)、157(G)、92(H)および69(I)およびその組み合わせ、特に下記のものが好ましい。
【0040】
腎症「陽性」ポリペプチドとしては、ポリペプチド番号225(A)、208(B)、164(C)、166(D)、171(E)、204(F)、206(G)、182(H)および210(I)およびその組み合わせ、特に下記のものが好ましい。
【0041】
腎症「陰性」ポリペプチドとしては、ポリペプチド番号262(A)、260(B)、306(C)、358(D)、279(E)、318(F)、305(G)、261(H)および278(I)およびその組み合わせ、特に下記のものが好ましい。
【0042】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち2つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−AおよびB、AおよびC、AおよびD、AおよびE、AおよびF、AおよびG、AおよびH、AおよびI、
−BおよびC、BおよびD、BおよびE、BおよびF、BおよびG、BおよびH、BおよびI、
−CおよびD、CおよびE、CおよびF、CおよびG、CおよびH、CおよびI、
−DおよびE、DおよびF、DおよびG、DおよびH、DおよびI、
−EおよびF、EおよびG、EおよびH、EおよびI、
−FおよびG、FおよびH、FおよびI、
−GおよびH、GおよびIもしくは、
−HおよびIである。
【0043】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち3つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−リペプチドAおよびBがポリペプチドC、D、E、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドAおよびCがポリペプチドD、E、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドAおよびDがポリペプチドC、D、E、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドAおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドAおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドAおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせであるか、
−ポリペプチドAおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドBおよびCがポリペプチドD、E、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドBおよびDがポリペプチドE、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドBおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドBおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドBおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせであるか、
−ポリペプチドBおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドCおよびDがポリペプチドE、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドCおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドCおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドCおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドCおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドDおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドDおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドDおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドDおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドEおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドEおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドEおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドFおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドFおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、もしくは、
−ポペプチドGおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ。
【0044】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち4つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−ポリペプチドA、BおよびCがポリペプチドD、E、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、BおよびDがポリペプチドE、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、BおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、BおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、BおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、BおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、CおよびDがポリペプチドE、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、CおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、CおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、CおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、CおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、DおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、GおよびHがポリペプチドIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、CおよびDがポリペプチドE、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、CおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、CおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、CおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、CおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、DおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、DおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせであり、
−ポリペプチドC、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせであり、
−ポリペプチドD、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドE、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドE、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドE、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、もしくは、
−ポリペプチドF、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ。
【0045】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち5つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−ポリペプチドA、B、C およびDがポリペプチドE、F、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、CおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、CおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、CおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、CおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、DおよびがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、B、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、B、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、B、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、C、DおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、C、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、C、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、C、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、D、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、DおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、E、Gおよび HがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドD、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、もしくは、
−ポリペプチドE、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ。
【0046】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち6つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−ポリペプチドA、B、C、DおよびEがポリペプチドF、G、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、DおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、DおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、DおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、EおよびがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ
−ポリペプチドA、B、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、EよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、D、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドC、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
もしくは、
−ポリペプチドD、E、F、GおよびHがポリペプチド Iとの組み合わせ。
【0047】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち7つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−ポリペプチドA、B、C、D、EおよびFがポリペプチドG、HまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、D、EおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、D、EおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、D、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、D、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、D、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、C、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、D、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、B、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、D、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、C、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドA、D、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、E、FおよびGがポリペプチドHまたはIのいずれか1つとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、E、FおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、E、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、D、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、C、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
−ポリペプチドB、D、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ、
もしくは、
−ポリペプチドC、D、E、F、GおよびHがポリペプチドIとの組み合わせ。
【0048】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち8つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−A、B、C、D、E、F、GおよびH、
−A、B、C、D、E、F、GおよびI、
−A、B、C、D、E、F、HおよびI、
−A、B、C、D、E、G、HおよびI、
−A、B、C、D、F、G、HおよびI、
−A、B、C、E、F、G、HおよびI、
−A、B、D、E、F、G、HおよびI、
−A、C、D、E、F、G、HおよびI、もしくは、
−B、C、D、E、F、G、HおよびI。
【0049】
本発明のさらに別の好ましい一実施形態では、上述の好ましいポリペプチドA、B、C、D、E、F、G、HおよびIのうち9つずつが、糖尿病「陰性」として、糖尿病「陽性」として、腎症「陰性」としてまたは腎症「陽性」ポリペプチドとして用いられる。特に、これらがポリペプチドの組み合わせである:
−A、B、C、D、E、F、G、HおよびI。
【図面の簡単な説明】
【0050】
下記で、本発明は以下の図面によって図解される:
【図1】図1は、ポリペプチドパターンを定義するためのデータ取り込みにおける個々の中間段階の図式的説明である。
【図2】図2は、ポリペプチドパターンおよびその相互関係の図式的説明である。
【図1a】

【図1b】

【図1c】

【図1d】

【図1e】

【図2a】

【図2b】

【図2c】

【図2d】

【図2e】

【図2f】


【特許請求の範囲】
【請求項1】
体液の試料中に含まれるポリペプチドの定量的評価およびデータベースに保存された参照値との比較のための装置であって、前記参照値は症状に関係するポリペプチドのデータ記録として保存され、前記参照値はそれぞれ健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する少なくとも一部の情報を含むことを特徴とする、前記装置。
【請求項2】
キャピラリー電気泳動と連結した質量分析装置で規定できるような、キャピラリー電気泳動における関連する質量および関連する保持時間を示すことによってポリペプチドが定義される点で特徴づけられる、請求項1に記載の装置。
【請求項3】
「糖尿病」の診断のためのデータベースが、下記の表に記載のポリペプチドのデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてを含む点で特徴づけられる、請求項2に記載の装置。





【請求項4】
「腎臓損傷」の診断のためのデータベースが、下記の表に記載のポリペプチドのデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてを含む点で特徴づけられる、請求項2に記載の装置。







【請求項5】
体液の試料中に含まれるポリペプチドの定量的評価およびデータベースに保存された参照値との比較のための方法であって、健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する少なくとも一つの参照値と体液の試料中のポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する値とを比較することによる、症状に関係するポリペプチドのデータ記録として比較のために前記参照値が用いられることを特徴とする、前記方法。
【請求項6】
キャピラリー電気泳動と連結した質量分析装置で規定できるような、キャピラリー電気泳動における関連する質量および関連する保持時間を示すことによってポリペプチドが定義される点で特徴づけられる、請求項5に記載の方法。
【請求項7】
「糖尿病」の診断のために、下記の表に記載のポリペプチドのデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてが比較に用いられる点で特徴づけられる、請求項6に記載の方法。





【請求項8】
「腎臓損傷」の診断のために、下記の表に記載のポリペプチドのデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてが比較に用いられる点で特徴づけられる、請求項6に記載の方法。







【請求項9】
健常者および患者の標本における病態についてポリペプチドの存在確率および/または濃度に関する一個の情報にそれぞれ関連する症状に関係する複数のポリペプチドによって特徴づけられる、病態を識別するためのマーカー。
【請求項10】
キャピラリー電気泳動と連結した質量分析装置で規定できるような、キャピラリー電気泳動における関連する質量および関連する保持時間を示すことによってポリペプチドが定義される点で特徴づけられる、請求項9に記載のマーカー。
【請求項11】
「糖尿病」の診断のためのデータベースが、下記の表に記載のポリペプチドのデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてを含む点で特徴づけられる、請求項10に記載のマーカー。





【請求項12】
「腎臓損傷」の診断のためのデータベースが、下記の表に記載のポリペプチドのデータ記録の少なくとも一つ、部分集合、またはすべてを含む点で特徴づけられる、請求項10に記載のマーカー。








【公表番号】特表2007−504466(P2007−504466A)
【公表日】平成19年3月1日(2007.3.1)
【国際特許分類】
【出願番号】特願2006−525719(P2006−525719)
【出願日】平成16年9月3日(2004.9.3)
【国際出願番号】PCT/EP2004/009833
【国際公開番号】WO2005/024409
【国際公開日】平成17年3月17日(2005.3.17)
【出願人】(506074808)モザイクヴェス ディアグノシュティクス アンド テラポイティクス アクチェン ゲゼルシャフト (6)
【Fターム(参考)】