癌及び感染症の免疫療法のための組成物及び方法
本発明は、対象における免疫応答を刺激するための、及びインターロイキン１２（ＩＬ−１２）治療の代替として使用するための、原発性腫瘍疾患、転移性腫瘍疾患及び感染症の予防及び治療のための組成物及び方法を提供する。詳細には本発明は、免疫刺激活性を有することから、癌及び感染症の治療及び予防並びに免疫変調に用途を有するアピコンプレックス関連タンパク質（ＡＲＰ）を提供する。ＡＲＰを含む組成物が提供される。インターロイキン１２（ＩＬ−１２）治療の代替として使用するための、及び対象における免疫応答を誘発するための、癌及び／又は感染症を予防及び／又は治療するためのＡＲＰの使用方法も提供される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
動物における疾患を治療又は予防する方法であって、前記動物にタンパク質を供給する薬学的有効量の医薬組成物を前記動物に投与することを含み、前記タンパク質が、デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０からなる群から選択されるタンパク質のいずれか１つと少なくとも２５％の同一性を有し、前記タンパク質が免疫刺激活性を有する方法。
【請求項２】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、タンパク質、前記タンパク質をコードする核酸、又は前記タンパク質をコードする核酸をトランスフェクトされている細胞として供給する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
疾患を治療する、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
疾患を予防する、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号１を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号２を含む単離されたタンパク質、
（ｃ）配列番号２８を含む単離されたタンパク質、
（ｄ）配列番号３０を含む単離されたタンパク質、
（ｅ）配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質、
（ｆ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｇ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給する、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
医薬組成物が、配列番号１を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
医薬組成物が、配列番号２を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
医薬組成物が、配列番号２８を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項９】
医薬組成物が、配列番号３０を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項１０】
医薬組成物が、配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項１１】
医薬組成物が、動物に前記タンパク質を、
（ａ）（１）アイメリアに感染している組織又は細胞の細胞抽出物を作製する段階、
（２）上清を作製するために前記細胞抽出物を遠心分離する段階、
（３）タンパク質を沈殿させてペレットにするために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画し、且つ前記ペレットを溶液に再懸濁する段階、
（４）ＨＩＣカラムに前記溶液を適用する段階、
（５）溶出した物質を作製するために前記ＨＩＣカラムに結合した物質を溶出させる段階、
（６）ＤＥＡＥカラムに負荷するための試料を作製するために、前記溶出した物質を透析する段階、
（７）ＤＥＡＥカラムに前記試料を適用する段階、
（８）溶出した画分を作製するために緩衝液で前記ＤＥＡＥカラムに結合した物質を溶出させ、且つ前記溶出した画分を濃縮する段階、
（９）サイズ排除カラムに前記濃縮され溶出した画分を適用する段階、
（１０）前記サイズ排除カラムから溶出した画分を収集及びプールする段階、
（１１）カルシウム結合タンパクを除去するためにＨＩＣカラムに前記プールされた画分を適用する段階、
（１２）ＨＰＬＣ ＨＩＣカラムに前記ＨＩＣカラムから溶出した画分を適用し、且つ活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（１３）前記活性画分を透析する段階、並びに
（１４）ＨＰＬＣ ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用し、且つ１つ若しくは複数の活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質、
（ｂ）組換え発現されたタンパク質、
（ｃ）前記（ａ）をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｄ）前記（ａ）をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給する、請求項３に記載の方法。
【請求項１２】
単離されたタンパク質が、
（１５）逆相ＨＰＬＣカラムに段階（１４）において収集された活性画分を適用する段階、及び
（１６）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
をさらに含む工程の生成物である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
単離されたタンパク質が、段階（１６）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
細胞抽出物が、アイメリアに感染している組織から作製され、前記組織がウシ小腸組織である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
医薬組成物が、
（ａ）精製されたアピコンプレックス門生物の、又はアピコンプレックス門生物に感染している細胞のホモジネートを作製する段階、
（ｂ）ペレットを得るために前記ホモジネートを遠心分離する段階、
（ｃ）ホスホリパーゼを含む溶液で前記ペレットを処理する段階、
（ｄ）上清を得るために前記溶液を遠心分離する段階、
（ｅ）逆相ＨＰＬＣカラムに前記上清を適用する段階、及び
（ｆ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項３に記載の方法。
【請求項１６】
医薬組成物が、段階（ｆ）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
医薬組成物が、組換え発現された単離されたタンパク質である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給する、請求項５又は１１に記載の方法。
【請求項１９】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項５又は１１に記載の方法。
【請求項２０】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している請求項５又は１１に記載の方法。
【請求項２１】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｃ）配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｄ）ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質、
（ｅ）低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｆ）高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｇ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、
（ｈ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給し、前記医薬組成物が樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである、請求項３に記載の方法。
【請求項２２】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質として供給する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を含む単離されたタンパク質として供給する請求項１０から１５又は２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２６】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質として供給する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２７】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる単離されたタンパク質として供給し、前記タンパク質が免疫刺激活性を有する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる単離されたタンパク質として供給し、前記タンパク質が免疫刺激活性を有する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２９】
アイメリアの核酸が、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項３０】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項２１に記載の方法。
【請求項３１】
形質転換細胞が、前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞を含み、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している、請求項２１に記載の方法。
【請求項３２】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号１を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号２を含む単離されたタンパク質、
（ｃ）配列番号２８を含む単離されたタンパク質、
（ｄ）配列番号３０を含む単離されたタンパク質、
（ｅ）配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質、
（ｆ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｇ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給する、請求項４に記載の方法。
【請求項３３】
医薬組成物が、配列番号１を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
医薬組成物が、配列番号２を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３５】
医薬組成物が、配列番号２８を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３６】
医薬組成物が、配列番号３０を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３７】
医薬組成物が、配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）（１）アイメリアに感染している組織又は細胞の細胞抽出物を作製する段階、
（２）上清を作製するために前記細胞抽出物を遠心分離する段階、
（３）タンパク質を沈殿させてペレットにするために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画し、且つ前記ペレットを溶液に再懸濁する段階、
（４）前記溶液をＨＩＣカラムに適用する段階、
（５）溶出した物質を作製するために前記ＨＩＣカラムに結合した物質を溶出させる段階 、
（６）ＤＥＡＥカラムに負荷するための試料を作製するために前記溶出した物質を透析する段階、
（７）ＤＥＡＥカラムに前記試料を適用する段階、
（８）溶出した画分を作製するために緩衝液で前記ＤＥＡＥカラムに結合した物質を溶出させ、且つ前記溶出した画分を濃縮する段階、
（９）サイズ排除カラムに前記濃縮され溶出した画分を適用する段階、
（１０）前記サイズ排除カラムから溶出した画分を収集及びプールする段階、
（１１）カルシウム結合タンパクを除去するためにＨＩＣカラムに前記プールされた画分を適用する段階、
（１２）ＨＰＬＣ ＨＩＣカラムに前記ＨＩＣカラムから溶出した画分を適用し、且つ活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（１３）前記活性画分を透析する段階、並びに
（１４）ＨＰＬＣ ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用し、且つ１つ若しくは複数の活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質、
（ｂ）組換え発現されたタンパク質、
（ｃ）前記（ａ）をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｄ）前記（ａ）をコードし、プロモーターに作動可能に連結しているヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞
として供給する、請求項４に記載の方法。
【請求項３９】
単離されたタンパク質が、
（１５）前記段階（１４）において収集された活性画分を逆相ＨＰＬＣカラムに適用する段階、及び
（１６）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階
をさらに含む工程の生成物であり、前記タンパク質が樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞が前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
単離されたタンパク質が、前記段階（１６）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
細胞抽出物が、アイメリアに感染している組織から作製され、前記組織がウシ小腸組織である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４２】
医薬組成物が、
（ａ）精製されたアピコンプレックス門生物の、又はアピコンプレックス門生物に感染している細胞のホモジネートを作製する段階、
（ｂ）ペレットを得るために前記ホモジネートを遠心分離する段階、
（ｃ）ホスホリパーゼを含む溶液で前記ペレットを処理する段階、
（ｄ）上清を得るために前記溶液を遠心分離する段階、
（ｅ）逆相ＨＰＬＣカラムに前記上清を適用する段階、及び
（ｆ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項４に記載の方法。
【請求項４３】
医薬組成物が、段階（ｆ）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
医薬組成物が、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として動物に前記タンパク質を供給する、請求項３２又は３８に記載の方法。
【請求項４５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項３２又は３８に記載の方法。
【請求項４６】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している、請求項３２又は３８に記載の方法。
【請求項４７】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｃ）配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｄ）ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質、
（ｅ）低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｆ）高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｇ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、
（ｈ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として提供し、前記医薬組成物が樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞が前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである、請求項４に記載の方法。
【請求項４８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を含む単離されたタンパク質として供給する、請求項３７から４２又は４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５２】
医薬組成物が、ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質として動物に前記タンパク質を供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５３】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５４】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５６】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項４７に記載の方法。
【請求項５７】
形質転換細胞が、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞を含み、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している、請求項４７に記載の方法。
【請求項５８】
動物における疾患を治療又は予防する方法であって、そのような治療又は予防が望ましい前記動物に治療又は予防有効量の精製されたアピコンプレックス門生物又は精製されたアピコンプレックス門生物のタンパク質含有膜画分を投与することを含む方法。
【請求項５９】
精製及び不活性化されたアピコンプレックス門生物を投与することを含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
アピコンプレックス門生物の胞子形成オーシストを投与することを含み、対象が、前記アピコンプレックス門生物の自然宿主ではない、請求項５８に記載の方法。
【請求項６１】
アピコンプレックス門生物がアイメリア種である、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
アピコンプレックス門生物又はタンパク質含有膜画分が経口投与される、請求項５８に記載の方法。
【請求項６３】
医薬組成物が、金属キレート剤と共に投与される、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６４】
疾患が癌である、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
対象に癌に対する二次療法を施すことをさらに含む、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
二次療法が、手術、放射線療法、化学療法、又はその組合せである、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
二次療法が、対象にＣＤ４０リガンド、インターフェロンγ、インターロイキン４、インターロイキン１８、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、別のサイトカイン、抗ＣＤ４０抗体、又はその組合せを投与することを含む、請求項６５に記載の方法。
【請求項６８】
癌が卵巣癌である、請求項６４に記載の方法。
【請求項６９】
疾患が感染症であり、前記感染症がヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）又はアイメリア属生物への感染によって引き起こされるものではない、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項７０】
感染症が細菌によって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
感染症がウイルスによって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７２】
ウイルスがインフルエンザウイルスである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
感染症がヒトにおけるものであり、医薬組成物が単離されたタンパク質を含み、前記単離されたタンパク質の用量が約２．８ｍｇから約２８０ｍｇである、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
用量が約５ｍｇから約１００ｍｇである、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
用量が約１０ｍｇから約５０ｍｇである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
感染症が原生動物によって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７７】
感染症が寄生虫によって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７８】
動物が鳥類種ではなく、且つヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染しておらず、医薬組成物の投与が免疫応答を刺激する、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項７９】
動物がヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染しておらず、医薬組成物の投与が前記動物におけるインターロイキン１２（ＩＬ−１２）の全身レベルの上昇を刺激する、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項８０】
動物がヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染していない、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項８１】
医薬組成物が生物のゲノムによってコードされるタンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８２】
生物がアピコンプレックス門生物である、請求項８１に記載の方法。
【請求項８３】
アピコンプレックス門生物がアイメリア種である、請求項８２に記載の方法。
【請求項８４】
医薬組成物が精製された分子を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８５】
医薬組成物が単離されたタンパク質を含み、前記単離されたタンパク質がジスルフィド結合を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８６】
ジスルフィド結合が還元型である、請求項８５に記載の方法。
【請求項８７】
ジスルフィド結合が酸化型である、請求項８５に記載の方法。
【請求項８８】
医薬組成物がグリコシル化タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８９】
医薬組成物が非グリコシル化タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９０】
医薬組成物がグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）連結タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９１】
医薬組成物がグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）連結ではないタンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９２】
医薬組成物が天然タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９３】
医薬組成物が組換え発現されたタンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９４】
治療又は予防することがアイメリア属タンパク質を含む前記医薬組成物を用いるものである、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９５】
動物がヒトである、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項９６】
動物がヒトではない、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項９７】
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含む精製されたポリペプチド、
（ｂ）配列番号３、４、５、６及び７を含む精製されたポリペプチド、
（ｃ）デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号２９と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む精製されたポリペプチド、並びに
（ｄ）配列番号３、４、５、６及び７を含むアミノ酸配列の変異体を含む精製されたポリペプチド（前記変異体は、それぞれ配列番号３、４、５、６及び７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）
からなる群から選択される精製されたポリペプチド。
【請求項９８】
ポリペプチドが配列番号３、４、６又は７を含み、前記ポリペプチドがドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を有する、請求項９７に記載の精製されたポリペプチド。
【請求項９９】
ポリペプチドが配列番号３、４、５、６及び７を含み、前記ポリペプチドがドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を有する、請求項９７に記載の精製されたポリペプチド。
【請求項１００】
（ａ）アイメリアに感染している組織又は細胞の細胞抽出物を作製すること、
（ｂ）上清を作製するために前記細胞抽出物を遠心分離すること、
（ｃ）タンパク質を沈殿させてペレットにするために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画すること、及び前記ペレットを溶液に再懸濁すること、
（ｄ）前記溶液をＨＩＣカラムに適用すること、
（ｅ）溶出した物質を作製するために前記ＨＩＣカラムに結合した物質を溶出させること、
（ｆ）ＤＥＡＥカラムに負荷するための試料を作製するために、前記溶出した物質を透析すること、
（ｇ）ＤＥＡＥカラムに前記試料を適用すること、
（ｈ）溶出した画分を作製するために緩衝液で前記ＤＥＡＥカラムに結合した物質を溶出させること、及び前記溶出した画分を濃縮すること、
（ｉ）サイズ排除カラムに前記濃縮され溶出した画分を適用すること、
（ｊ）前記サイズ排除カラムから溶出した画分を収集及びプールすること、
（ｋ）カルシウム結合タンパクを除去するためにＨＩＣカラムに前記プールされた画分を適用すること、
（ｌ）ＨＰＬＣ ＨＩＣカラムに前記ＨＩＣカラムから溶出した画分を適用すること、及び活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（ｍ）前記活性画分を透析すること、
（ｎ）ＨＰＬＣ ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用すること、及び１つ又は複数の活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む、ポリペプチドの製造方法。
【請求項１０１】
（ｏ）逆相ＨＰＬＣカラムに段階（ｎ）で収集された活性画分を適用する段階、及び
（ｐ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
をさらに含む、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０２】
段階（ｐ）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１０３】
細胞抽出物が、アイメリアに感染しているウシ小腸組織から作製される、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０４】
請求項１００に記載の工程の生成物である、精製されたポリペプチド。
【請求項１０５】
（ａ）精製されたアピコンプレックス門生物の、又はアピコンプレックス門生物に感染している細胞のホモジネートを作製すること、
（ｂ）ペレットを得るために前記ホモジネートを遠心分離すること、
（ｃ）ホスホリパーゼを含む溶液で前記ペレットを処理すること、
（ｄ）上清を得るために前記溶液を遠心分離すること、
（ｅ）逆相ＨＰＬＣカラムに前記上清を適用すること、及び
（ｆ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させること（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む、ポリペプチドの製造方法。
【請求項１０６】
作製された抽出物がウシに自然に感染する精製されたアピコンプレックス門生物のものである、請求項１０５に記載の方法。
【請求項１０７】
請求項１０５に記載の工程の生成物である、精製されたポリペプチド。
【請求項１０８】
請求項９７、１０４又は１０７に記載の治療有効量のポリペプチド及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
【請求項１０９】
第１タンパク質に結合する抗体であって、前記第１タンパク質のアミノ酸配列が配列番号２６からなり、前記抗体が第２タンパク質に結合せず、前記第２タンパク質のアミノ酸配列が配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０からなる抗体。
【請求項１１０】
モノクローナル抗体である請求項１０９に記載の抗体。
【請求項１１１】
請求項１１０に記載の抗体のフラグメントを含む分子であって、前記フラグメントが前記第１タンパク質と結合できる分子。
【請求項１１２】
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、
（ｂ）配列番号３、４、５、６及び７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、並びに
（ｃ）デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号２９と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子
からなる群から選択される単離された核酸。
【請求項１１３】
精製されている、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１４】
ベクターである、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１５】
ポリペプチドをコードする核酸配列に作動可能に連結しているプロモーターをさらに含む、請求項１１４に記載のベクター。
【請求項１１６】
発現ベクターを含む宿主細胞であって、前記発現ベクターがヌクレオチド配列に作動可能に連結しているプロモーターを含み、前記プロモーターが前記ヌクレオチド配列に関して非天然であり、前記ヌクレオチド配列が、
（ａ）配列番号３、４、６若しくは７を含むポリペプチド、
（ｂ）配列番号３、４、５、６及び７を含むポリペプチド、又は
（ｃ）デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号２９と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド
をコードする宿主細胞。
【請求項１１７】
哺乳動物宿主細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１１８】
酵母細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１１９】
昆虫細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１２０】
細菌細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１２１】
大腸菌である、請求項１２０に記載の宿主細胞。
【請求項１２２】
コードされているポリペプチドが請求項１１６に記載の細胞によって発現されるように前記細胞を増殖させること、及び発現した前記ポリペプチドを回収することを含むポリペプチドの製造方法。
【請求項１２３】
発現したポリペプチドを回収することが、
（ａ）宿主細胞の抽出物を作製すること、
（ｂ）上清を作製するために前記宿主細胞の抽出物を遠心分離すること、
（ｃ）タンパク質を沈殿させるために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画すること、
（ｄ）ペレットを得るために前記沈殿を遠心分離すること、
（ｅ）前記ペレットを溶液に再懸濁すること、
（ｆ）低圧疎水性相互作用カラムに前記溶液を適用すること、
（ｇ）前記低圧疎水性相互作用カラムから溶出した活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（ｈ）前記低圧疎水性相互作用カラムから前記溶出した活性画分を透析すること、
（ｉ）低圧ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用すること、
（ｊ）前記低圧ＤＥＡＥカラムから溶出した１つ又は複数の活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（ｋ）サイズ排除カラムに前記低圧ＤＥＡＥカラムから溶出した前記活性画分を適用すること、及び
（ｌ）前記サイズ排除カラムから前記活性画分を溶出させること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む、請求項１２２に記載の方法。
【請求項１２４】
医薬組成物が血清アルブミンをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１２５】
血清アルブミンがヒト血清アルブミンである、請求項１２４に記載の方法。
【請求項１２６】
ヒト血清アルブミンが前記組成物の重量に対して約１重量％から約１０重量％の濃度で存在する、請求項１２５に記載の方法。
【請求項１２７】
ヒト血清アルブミンが前記組成物の重量に対して約２重量％から約４重量％の濃度で存在する、請求項１２６に記載の方法。
【請求項１】
動物における疾患を治療又は予防する方法であって、前記動物にタンパク質を供給する薬学的有効量の医薬組成物を前記動物に投与することを含み、前記タンパク質が、デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０からなる群から選択されるタンパク質のいずれか１つと少なくとも２５％の同一性を有し、前記タンパク質が免疫刺激活性を有する方法。
【請求項２】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、タンパク質、前記タンパク質をコードする核酸、又は前記タンパク質をコードする核酸をトランスフェクトされている細胞として供給する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
疾患を治療する、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
疾患を予防する、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号１を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号２を含む単離されたタンパク質、
（ｃ）配列番号２８を含む単離されたタンパク質、
（ｄ）配列番号３０を含む単離されたタンパク質、
（ｅ）配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質、
（ｆ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｇ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給する、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
医薬組成物が、配列番号１を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
医薬組成物が、配列番号２を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
医薬組成物が、配列番号２８を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項９】
医薬組成物が、配列番号３０を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項１０】
医薬組成物が、配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質を含む、請求項５に記載の方法。
【請求項１１】
医薬組成物が、動物に前記タンパク質を、
（ａ）（１）アイメリアに感染している組織又は細胞の細胞抽出物を作製する段階、
（２）上清を作製するために前記細胞抽出物を遠心分離する段階、
（３）タンパク質を沈殿させてペレットにするために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画し、且つ前記ペレットを溶液に再懸濁する段階、
（４）ＨＩＣカラムに前記溶液を適用する段階、
（５）溶出した物質を作製するために前記ＨＩＣカラムに結合した物質を溶出させる段階、
（６）ＤＥＡＥカラムに負荷するための試料を作製するために、前記溶出した物質を透析する段階、
（７）ＤＥＡＥカラムに前記試料を適用する段階、
（８）溶出した画分を作製するために緩衝液で前記ＤＥＡＥカラムに結合した物質を溶出させ、且つ前記溶出した画分を濃縮する段階、
（９）サイズ排除カラムに前記濃縮され溶出した画分を適用する段階、
（１０）前記サイズ排除カラムから溶出した画分を収集及びプールする段階、
（１１）カルシウム結合タンパクを除去するためにＨＩＣカラムに前記プールされた画分を適用する段階、
（１２）ＨＰＬＣ ＨＩＣカラムに前記ＨＩＣカラムから溶出した画分を適用し、且つ活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（１３）前記活性画分を透析する段階、並びに
（１４）ＨＰＬＣ ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用し、且つ１つ若しくは複数の活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質、
（ｂ）組換え発現されたタンパク質、
（ｃ）前記（ａ）をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｄ）前記（ａ）をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給する、請求項３に記載の方法。
【請求項１２】
単離されたタンパク質が、
（１５）逆相ＨＰＬＣカラムに段階（１４）において収集された活性画分を適用する段階、及び
（１６）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
をさらに含む工程の生成物である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
単離されたタンパク質が、段階（１６）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
細胞抽出物が、アイメリアに感染している組織から作製され、前記組織がウシ小腸組織である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
医薬組成物が、
（ａ）精製されたアピコンプレックス門生物の、又はアピコンプレックス門生物に感染している細胞のホモジネートを作製する段階、
（ｂ）ペレットを得るために前記ホモジネートを遠心分離する段階、
（ｃ）ホスホリパーゼを含む溶液で前記ペレットを処理する段階、
（ｄ）上清を得るために前記溶液を遠心分離する段階、
（ｅ）逆相ＨＰＬＣカラムに前記上清を適用する段階、及び
（ｆ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項３に記載の方法。
【請求項１６】
医薬組成物が、段階（ｆ）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
医薬組成物が、組換え発現された単離されたタンパク質である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給する、請求項５又は１１に記載の方法。
【請求項１９】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項５又は１１に記載の方法。
【請求項２０】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している請求項５又は１１に記載の方法。
【請求項２１】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｃ）配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｄ）ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質、
（ｅ）低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｆ）高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｇ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、
（ｈ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給し、前記医薬組成物が樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである、請求項３に記載の方法。
【請求項２２】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質として供給する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を含む単離されたタンパク質として供給する請求項１０から１５又は２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２６】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質として供給する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２７】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる単離されたタンパク質として供給し、前記タンパク質が免疫刺激活性を有する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる単離されたタンパク質として供給し、前記タンパク質が免疫刺激活性を有する、請求項２１に記載の方法。
【請求項２９】
アイメリアの核酸が、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項３０】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項２１に記載の方法。
【請求項３１】
形質転換細胞が、前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞を含み、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している、請求項２１に記載の方法。
【請求項３２】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号１を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号２を含む単離されたタンパク質、
（ｃ）配列番号２８を含む単離されたタンパク質、
（ｄ）配列番号３０を含む単離されたタンパク質、
（ｅ）配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質、
（ｆ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｇ）前記（ａ）〜（ｅ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として供給する、請求項４に記載の方法。
【請求項３３】
医薬組成物が、配列番号１を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
医薬組成物が、配列番号２を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３５】
医薬組成物が、配列番号２８を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３６】
医薬組成物が、配列番号３０を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３７】
医薬組成物が、配列番号３、４、５、６及び７を含む単離されたタンパク質を含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）（１）アイメリアに感染している組織又は細胞の細胞抽出物を作製する段階、
（２）上清を作製するために前記細胞抽出物を遠心分離する段階、
（３）タンパク質を沈殿させてペレットにするために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画し、且つ前記ペレットを溶液に再懸濁する段階、
（４）前記溶液をＨＩＣカラムに適用する段階、
（５）溶出した物質を作製するために前記ＨＩＣカラムに結合した物質を溶出させる段階 、
（６）ＤＥＡＥカラムに負荷するための試料を作製するために前記溶出した物質を透析する段階、
（７）ＤＥＡＥカラムに前記試料を適用する段階、
（８）溶出した画分を作製するために緩衝液で前記ＤＥＡＥカラムに結合した物質を溶出させ、且つ前記溶出した画分を濃縮する段階、
（９）サイズ排除カラムに前記濃縮され溶出した画分を適用する段階、
（１０）前記サイズ排除カラムから溶出した画分を収集及びプールする段階、
（１１）カルシウム結合タンパクを除去するためにＨＩＣカラムに前記プールされた画分を適用する段階、
（１２）ＨＰＬＣ ＨＩＣカラムに前記ＨＩＣカラムから溶出した画分を適用し、且つ活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（１３）前記活性画分を透析する段階、並びに
（１４）ＨＰＬＣ ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用し、且つ１つ若しくは複数の活性画分を収集する段階（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質、
（ｂ）組換え発現されたタンパク質、
（ｃ）前記（ａ）をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、又は
（ｄ）前記（ａ）をコードし、プロモーターに作動可能に連結しているヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞
として供給する、請求項４に記載の方法。
【請求項３９】
単離されたタンパク質が、
（１５）前記段階（１４）において収集された活性画分を逆相ＨＰＬＣカラムに適用する段階、及び
（１６）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階
をさらに含む工程の生成物であり、前記タンパク質が樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞が前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
単離されたタンパク質が、前記段階（１６）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
細胞抽出物が、アイメリアに感染している組織から作製され、前記組織がウシ小腸組織である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４２】
医薬組成物が、
（ａ）精製されたアピコンプレックス門生物の、又はアピコンプレックス門生物に感染している細胞のホモジネートを作製する段階、
（ｂ）ペレットを得るために前記ホモジネートを遠心分離する段階、
（ｃ）ホスホリパーゼを含む溶液で前記ペレットを処理する段階、
（ｄ）上清を得るために前記溶液を遠心分離する段階、
（ｅ）逆相ＨＰＬＣカラムに前記上清を適用する段階、及び
（ｆ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項４に記載の方法。
【請求項４３】
医薬組成物が、段階（ｆ）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む工程の生成物である単離されたタンパク質である、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
医薬組成物が、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として動物に前記タンパク質を供給する、請求項３２又は３８に記載の方法。
【請求項４５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項３２又は３８に記載の方法。
【請求項４６】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸として供給し、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している、請求項３２又は３８に記載の方法。
【請求項４７】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質、
（ｂ）配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｃ）配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質（前記変異体は、それぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）、
（ｄ）ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質、
（ｅ）低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｆ）高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされるアミノ酸配列を含む、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質、
（ｇ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、
（ｈ）前記（ａ）〜（ｆ）のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞（前記ヌクレオチド配列はプロモーターに作動可能に連結している）
として提供し、前記医薬組成物が樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞が前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである、請求項４に記載の方法。
【請求項４８】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７を含む単離されたタンパク質として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を含む単離されたタンパク質として供給する、請求項３７から４２又は４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０のいずれか１つの変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、配列番号３、４、６又は７の変異体を含む単離されたタンパク質として供給し、前記変異体がそれぞれ配列番号３、４、６又は７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５２】
医薬組成物が、ＰＲＯＦ（プロフィリン）ドメインを含む単離されたタンパク質として動物に前記タンパク質を供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５３】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、低ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５４】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、高ストリンジェンシー条件下で配列番号１５、１６、１７、１８、１９、２０若しくは２７、又は前記配列番号のいずれかの相補体にハイブリダイズ可能なヌクレオチド配列からなる核酸によってコードされる、免疫刺激活性を有する単離されたタンパク質として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５５】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列として供給する、請求項４７に記載の方法。
【請求項５６】
医薬組成物が、動物にタンパク質を、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列として供給し、前記ヌクレオチド配列が前記動物において作動可能なプロモーターに連結している、請求項４７に記載の方法。
【請求項５７】
形質転換細胞が、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で形質転換された細胞を含み、前記ヌクレオチド配列がプロモーターに作動可能に連結している、請求項４７に記載の方法。
【請求項５８】
動物における疾患を治療又は予防する方法であって、そのような治療又は予防が望ましい前記動物に治療又は予防有効量の精製されたアピコンプレックス門生物又は精製されたアピコンプレックス門生物のタンパク質含有膜画分を投与することを含む方法。
【請求項５９】
精製及び不活性化されたアピコンプレックス門生物を投与することを含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６０】
アピコンプレックス門生物の胞子形成オーシストを投与することを含み、対象が、前記アピコンプレックス門生物の自然宿主ではない、請求項５８に記載の方法。
【請求項６１】
アピコンプレックス門生物がアイメリア種である、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
アピコンプレックス門生物又はタンパク質含有膜画分が経口投与される、請求項５８に記載の方法。
【請求項６３】
医薬組成物が、金属キレート剤と共に投与される、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６４】
疾患が癌である、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
対象に癌に対する二次療法を施すことをさらに含む、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
二次療法が、手術、放射線療法、化学療法、又はその組合せである、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
二次療法が、対象にＣＤ４０リガンド、インターフェロンγ、インターロイキン４、インターロイキン１８、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、別のサイトカイン、抗ＣＤ４０抗体、又はその組合せを投与することを含む、請求項６５に記載の方法。
【請求項６８】
癌が卵巣癌である、請求項６４に記載の方法。
【請求項６９】
疾患が感染症であり、前記感染症がヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）又はアイメリア属生物への感染によって引き起こされるものではない、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項７０】
感染症が細菌によって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７１】
感染症がウイルスによって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７２】
ウイルスがインフルエンザウイルスである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
感染症がヒトにおけるものであり、医薬組成物が単離されたタンパク質を含み、前記単離されたタンパク質の用量が約２．８ｍｇから約２８０ｍｇである、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
用量が約５ｍｇから約１００ｍｇである、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
用量が約１０ｍｇから約５０ｍｇである、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
感染症が原生動物によって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７７】
感染症が寄生虫によって引き起こされる、請求項６９に記載の方法。
【請求項７８】
動物が鳥類種ではなく、且つヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染しておらず、医薬組成物の投与が免疫応答を刺激する、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項７９】
動物がヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染しておらず、医薬組成物の投与が前記動物におけるインターロイキン１２（ＩＬ−１２）の全身レベルの上昇を刺激する、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項８０】
動物がヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染していない、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項８１】
医薬組成物が生物のゲノムによってコードされるタンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８２】
生物がアピコンプレックス門生物である、請求項８１に記載の方法。
【請求項８３】
アピコンプレックス門生物がアイメリア種である、請求項８２に記載の方法。
【請求項８４】
医薬組成物が精製された分子を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８５】
医薬組成物が単離されたタンパク質を含み、前記単離されたタンパク質がジスルフィド結合を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８６】
ジスルフィド結合が還元型である、請求項８５に記載の方法。
【請求項８７】
ジスルフィド結合が酸化型である、請求項８５に記載の方法。
【請求項８８】
医薬組成物がグリコシル化タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項８９】
医薬組成物が非グリコシル化タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９０】
医薬組成物がグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）連結タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９１】
医薬組成物がグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）連結ではないタンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９２】
医薬組成物が天然タンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９３】
医薬組成物が組換え発現されたタンパク質を含む、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９４】
治療又は予防することがアイメリア属タンパク質を含む前記医薬組成物を用いるものである、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２又は４７に記載の方法。
【請求項９５】
動物がヒトである、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項９６】
動物がヒトではない、請求項５、１１、１５、２１、３２、３８、４２、４７又は５８に記載の方法。
【請求項９７】
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含む精製されたポリペプチド、
（ｂ）配列番号３、４、５、６及び７を含む精製されたポリペプチド、
（ｃ）デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号２９と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含む精製されたポリペプチド、並びに
（ｄ）配列番号３、４、５、６及び７を含むアミノ酸配列の変異体を含む精製されたポリペプチド（前記変異体は、それぞれ配列番号３、４、５、６及び７に対して保存的アミノ酸置換のみを有する）
からなる群から選択される精製されたポリペプチド。
【請求項９８】
ポリペプチドが配列番号３、４、６又は７を含み、前記ポリペプチドがドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を有する、請求項９７に記載の精製されたポリペプチド。
【請求項９９】
ポリペプチドが配列番号３、４、５、６及び７を含み、前記ポリペプチドがドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってアッセイされる分子量１８〜２５ｋＤ及び４．０と４．７との間の等電点（ｐＩ）を有する、請求項９７に記載の精製されたポリペプチド。
【請求項１００】
（ａ）アイメリアに感染している組織又は細胞の細胞抽出物を作製すること、
（ｂ）上清を作製するために前記細胞抽出物を遠心分離すること、
（ｃ）タンパク質を沈殿させてペレットにするために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画すること、及び前記ペレットを溶液に再懸濁すること、
（ｄ）前記溶液をＨＩＣカラムに適用すること、
（ｅ）溶出した物質を作製するために前記ＨＩＣカラムに結合した物質を溶出させること、
（ｆ）ＤＥＡＥカラムに負荷するための試料を作製するために、前記溶出した物質を透析すること、
（ｇ）ＤＥＡＥカラムに前記試料を適用すること、
（ｈ）溶出した画分を作製するために緩衝液で前記ＤＥＡＥカラムに結合した物質を溶出させること、及び前記溶出した画分を濃縮すること、
（ｉ）サイズ排除カラムに前記濃縮され溶出した画分を適用すること、
（ｊ）前記サイズ排除カラムから溶出した画分を収集及びプールすること、
（ｋ）カルシウム結合タンパクを除去するためにＨＩＣカラムに前記プールされた画分を適用すること、
（ｌ）ＨＰＬＣ ＨＩＣカラムに前記ＨＩＣカラムから溶出した画分を適用すること、及び活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（ｍ）前記活性画分を透析すること、
（ｎ）ＨＰＬＣ ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用すること、及び１つ又は複数の活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む、ポリペプチドの製造方法。
【請求項１０１】
（ｏ）逆相ＨＰＬＣカラムに段階（ｎ）で収集された活性画分を適用する段階、及び
（ｐ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させる段階（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
をさらに含む、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０２】
段階（ｐ）の溶出したタンパク質を再生する段階をさらに含む、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１０３】
細胞抽出物が、アイメリアに感染しているウシ小腸組織から作製される、請求項１００に記載の方法。
【請求項１０４】
請求項１００に記載の工程の生成物である、精製されたポリペプチド。
【請求項１０５】
（ａ）精製されたアピコンプレックス門生物の、又はアピコンプレックス門生物に感染している細胞のホモジネートを作製すること、
（ｂ）ペレットを得るために前記ホモジネートを遠心分離すること、
（ｃ）ホスホリパーゼを含む溶液で前記ペレットを処理すること、
（ｄ）上清を得るために前記溶液を遠心分離すること、
（ｅ）逆相ＨＰＬＣカラムに前記上清を適用すること、及び
（ｆ）溶出したタンパク質を作製するために前記逆相ＨＰＬＣカラムから結合したタンパク質を溶出させること（前記タンパク質は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する活性を有し、前記樹状細胞は前記活性をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む、ポリペプチドの製造方法。
【請求項１０６】
作製された抽出物がウシに自然に感染する精製されたアピコンプレックス門生物のものである、請求項１０５に記載の方法。
【請求項１０７】
請求項１０５に記載の工程の生成物である、精製されたポリペプチド。
【請求項１０８】
請求項９７、１０４又は１０７に記載の治療有効量のポリペプチド及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
【請求項１０９】
第１タンパク質に結合する抗体であって、前記第１タンパク質のアミノ酸配列が配列番号２６からなり、前記抗体が第２タンパク質に結合せず、前記第２タンパク質のアミノ酸配列が配列番号１、配列番号２、配列番号２８又は配列番号３０からなる抗体。
【請求項１１０】
モノクローナル抗体である請求項１０９に記載の抗体。
【請求項１１１】
請求項１１０に記載の抗体のフラグメントを含む分子であって、前記フラグメントが前記第１タンパク質と結合できる分子。
【請求項１１２】
（ａ）配列番号３、４、６又は７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、
（ｂ）配列番号３、４、５、６及び７を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸、並びに
（ｃ）デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号２９と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子
からなる群から選択される単離された核酸。
【請求項１１３】
精製されている、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１４】
ベクターである、請求項１１２に記載の核酸。
【請求項１１５】
ポリペプチドをコードする核酸配列に作動可能に連結しているプロモーターをさらに含む、請求項１１４に記載のベクター。
【請求項１１６】
発現ベクターを含む宿主細胞であって、前記発現ベクターがヌクレオチド配列に作動可能に連結しているプロモーターを含み、前記プロモーターが前記ヌクレオチド配列に関して非天然であり、前記ヌクレオチド配列が、
（ａ）配列番号３、４、６若しくは７を含むポリペプチド、
（ｂ）配列番号３、４、５、６及び７を含むポリペプチド、又は
（ｃ）デフォルトパラメータに調整したBLAST 2.0アルゴリズムによって決定される配列番号２９と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド
をコードする宿主細胞。
【請求項１１７】
哺乳動物宿主細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１１８】
酵母細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１１９】
昆虫細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１２０】
細菌細胞である、請求項１１６に記載の宿主細胞。
【請求項１２１】
大腸菌である、請求項１２０に記載の宿主細胞。
【請求項１２２】
コードされているポリペプチドが請求項１１６に記載の細胞によって発現されるように前記細胞を増殖させること、及び発現した前記ポリペプチドを回収することを含むポリペプチドの製造方法。
【請求項１２３】
発現したポリペプチドを回収することが、
（ａ）宿主細胞の抽出物を作製すること、
（ｂ）上清を作製するために前記宿主細胞の抽出物を遠心分離すること、
（ｃ）タンパク質を沈殿させるために硫酸アンモニウムによって前記上清を分画すること、
（ｄ）ペレットを得るために前記沈殿を遠心分離すること、
（ｅ）前記ペレットを溶液に再懸濁すること、
（ｆ）低圧疎水性相互作用カラムに前記溶液を適用すること、
（ｇ）前記低圧疎水性相互作用カラムから溶出した活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（ｈ）前記低圧疎水性相互作用カラムから前記溶出した活性画分を透析すること、
（ｉ）低圧ＤＥＡＥカラムに前記透析された活性画分を適用すること、
（ｊ）前記低圧ＤＥＡＥカラムから溶出した１つ又は複数の活性画分を収集すること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）、
（ｋ）サイズ排除カラムに前記低圧ＤＥＡＥカラムから溶出した前記活性画分を適用すること、及び
（ｌ）前記サイズ排除カラムから前記活性画分を溶出させること（前記活性画分は樹状細胞からのインターロイキン１２の放出を刺激する能力を有し、前記樹状細胞は前記能力をアッセイする１０時間以内に哺乳動物から単離されたものである）
を含む、請求項１２２に記載の方法。
【請求項１２４】
医薬組成物が血清アルブミンをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１２５】
血清アルブミンがヒト血清アルブミンである、請求項１２４に記載の方法。
【請求項１２６】
ヒト血清アルブミンが前記組成物の重量に対して約１重量％から約１０重量％の濃度で存在する、請求項１２５に記載の方法。
【請求項１２７】
ヒト血清アルブミンが前記組成物の重量に対して約２重量％から約４重量％の濃度で存在する、請求項１２６に記載の方法。
【図１】
【図２（Ａ）】
【図２（Ｂ）】
【図３（Ａ）】
【図３（Ｂ）】
【図３（Ｃ）】
【図３（Ｄ）】
【図４】
【図５（Ａ）】
【図５（Ｂ）】
【図６】
【図７（Ａ）】
【図７（Ｂ）】
【図７（Ｃ）】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３（Ａ）】
【図１３（Ｂ）】
【図１４】
【図１５】
【図１６（Ａ）】
【図１６（Ｂ）】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図１９−１】
【図２０】
【図２０−１】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２（Ａ）】
【図２（Ｂ）】
【図３（Ａ）】
【図３（Ｂ）】
【図３（Ｃ）】
【図３（Ｄ）】
【図４】
【図５（Ａ）】
【図５（Ｂ）】
【図６】
【図７（Ａ）】
【図７（Ｂ）】
【図７（Ｃ）】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３（Ａ）】
【図１３（Ｂ）】
【図１４】
【図１５】
【図１６（Ａ）】
【図１６（Ｂ）】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図１９−１】
【図２０】
【図２０−１】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【公表番号】特表２００８−５００００５（Ｐ２００８−５００００５Ａ）
【公表日】平成２０年１月１０日（２００８．１．１０）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５２０４０２（Ｐ２００６−５２０４０２）
【出願日】平成１６年７月１５日（２００４．７．１５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２３１１３
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１００４０
【国際公開日】平成１７年２月３日（２００５．２．３）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．テフロン
【出願人】（５０６０１６３７０）バロス リサーチ インスティテュート (1)
【出願人】（５０６０１６４７３）ミシガン ステート ユニヴァーシティー (1)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２０年１月１０日（２００８．１．１０）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年７月１５日（２００４．７．１５）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２３１１３
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１００４０
【国際公開日】平成１７年２月３日（２００５．２．３）
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．テフロン
【出願人】（５０６０１６３７０）バロス リサーチ インスティテュート (1)
【出願人】（５０６０１６４７３）ミシガン ステート ユニヴァーシティー (1)
【Ｆターム（参考）】
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