癌（ＭＵＣ１）の診断および治療のための技術および組成物
本発明は細胞増殖、特に癌の診断および／または治療に基本的に関与する一連の組成物、方法、キット、物品および種を提供する。ＭＵＣ１の異常な発現に関与する細胞増殖に特に焦点が当てられる。ＭＵＣ１細胞増殖に関与する機構が議論される。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＭＧＦＲに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２】
前記抗体またはその抗原結合断片が２価である、請求項１に記載される抗体またはその抗原断片。
【請求項３】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項４】
前記抗体またはその抗原結合断片がＰＳＭＧＦＲに特異的に結合する、請求項１に記載される抗体またはその抗原断片。
【請求項５】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片に特異的に結合する、請求項４に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項６】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいは１０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片に特異的に結合する、請求項５に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項７】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいは５個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片に特異的に結合する、請求項６に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項８】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する、請求項７に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項９】
前記抗体またはその抗原結合断片がヒト、ヒト化、異種間、またはキメラヒト−非ヒト抗体またはその抗原結合断片である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１０】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理抗体である、先の請求項のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１１】
前記抗原結合断片が１本鎖Ｆｖ断片、Ｆａｂ'断片、Ｆａｂ断片、またはＦｄ断片を含む、請求項３に記載される抗原結合断片。
【請求項１２】
前記抗原結合断片がＦ（ａｂ'）２断片を含む、請求項２記載に記載される抗原結合断片。
【請求項１３】
先の請求項のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片を含む組成物。
【請求項１４】
薬学的組成物であって、さらに、薬学的に許容される担体を含む、請求項１３に記載される組成物。
【請求項１５】
前記抗体またはその抗原結合断片がポリクローナル抗体である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１６】
前記抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１７】
請求項１〜１２のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片を含むキット。
【請求項１８】
さらに、表面を有する物品を含む、請求項１７に記載されるキット。
【請求項１９】
前記抗体またはその抗原結合断片が物品の表面に固定されるか、あるいは固定されるように適用される、請求項１８に記載されるキット。
【請求項２０】
前記物品が粒子を含む、請求項１９に記載されるキット。
【請求項２１】
前記物品が粒子を含む、請求項１８に記載されるキット。
【請求項２２】
さらに、第２粒子、および細胞表面受容体の鎖間結合領域の分断後、細胞表面に付着して残存する細胞表面受容体の一部分を含むペプチド配列であって、細胞から脱着されるか、第２粒子に固定されるかあるいは固定されるように適用されるペプチド配列を含む、請求項２０に記載されるキット。
【請求項２３】
さらに、受容体開裂後に細胞表面に付着して残存する細胞表面受容体の一部分を含み、細胞から脱着されるか、粒子に固定されるかあるいは固定されるように適用されるペプチド配列を含む、請求項２１に記載されるキット。
【請求項２４】
さらに、前記第２粒子、および受容体開裂後に細胞表面に付着して残存する細胞表面受容体の一部分を含み、細胞から脱着されるか、粒子に固定されるかあるいは固定されるように適用されるペプチド配列を含む、請求項２３に記載されるキット。
【請求項２５】
さらに、前記抗体またはその抗原結合断片の存在下に、ペプチド配列が他の同一ペプチド配列および／または前記抗体またはその抗原結合断片に結合する能力に影響を与える候補薬剤を含む、請求項２２または２４に記載されるキット。
【請求項２６】
前記ペプチド配列がＭＧＦＲを含む、請求項２５に記載されるキット。
【請求項２７】
成長因子などの活性化リガンドと相互作用して、細胞増殖を促進する細胞表面受容体の一部分であって、活性化リガンドと該一部分に相互作用する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含むペプチドを準備し、そして、該ペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を生成することを含む方法。
【請求項２８】
前記抗体またはその抗原結合断片は２価である、請求項２７に記載される方法。
【請求項２９】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項２７に記載される方法。
【請求項３０】
請求項２７に記載される方法によって産生された抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３１】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理抗体である、請求項３０に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３２】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１を含む、請求項２７に記載される方法。
【請求項３３】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項３２に記載される方法。
【請求項３４】
前記ペプチドが配列番号３６に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項２７に記載される方法。
【請求項３５】
前記ペプチド配列が配列番号７に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項２７に記載される方法。
【請求項３６】
癌を寛解するのに有効な量の抗体またはその抗原結合断片を被検者に投与することを含む、ＭＵＣ１の異常な発現を特徴とする癌を患う患者を治療する方法。
【請求項３７】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項３６に記載される方法。
【請求項３８】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理の１本鎖抗体である、請求項３７に記載される方法。
【請求項３９】
前記投与工程で前記抗体またはその抗原結合断片が腫瘍の成長を低下させるのに有効な量で投与される、請求項３６に記載される方法。
【請求項４０】
前記抗体またはその抗原結合断片がＭＧＦＲに特異的に結合する、請求項３６に記載される方法。
【請求項４１】
前記方法は、ＭＵＣ１受容体の開裂後に細胞表面に付着して残存するＭＵＣ１受容体の一部分と天然リガンドとの相互作用を遮断するのに有効な量の前記抗体またはその抗原結合断片を被検者に投与することを含む、請求項３７に記載される方法。
【請求項４２】
ＭＵＣ１受容体の鎖間結合領域の分断を低下させるに有効な量の前記抗体またはその抗原結合断片を被検者に投与することを含む、請求項３６に記載される方法。
【請求項４３】
前記癌は乳癌、前立腺癌、肺癌、卵巣癌、結腸直腸癌、膵臓癌および脳癌のうちの少なくとも１つを含む、請求項３６に記載される方法。
【請求項４４】
成長因子などの活性化リガンドと相互作用して、細胞増殖を促進する細胞表面受容体の一部分であって、活性化リガンドと相互作用する細胞表面受容体を十分に含む一部分を含むペプチドと特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を被検者を投与することを含む、癌を患うか、あるいは癌を発症する危険性を有する被検者を治療する方法。
【請求項４５】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項４４に記載される方法。
【請求項４６】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理１本鎖抗体である、請求項４５に記載される方法。
【請求項４７】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１である、請求項４４に記載される方法。
【請求項４８】
前記ペプチドがＭＧＦＲである、請求項４７に記載される方法。
【請求項４９】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項４８に記載される方法。
【請求項５０】
前記ペプチドはＮ−末端に配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項４８に記載される方法。
【請求項５１】
前記ペプチドはＰＳＭＧＦＲからなる、請求項４９に記載される方法。
【請求項５２】
前記ペプチドは配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項５１に記載される方法。
【請求項５３】
前記ペプチドは配列番号３６に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項５２に記載される方法。
【請求項５４】
前記抗体またはその抗原結合断片は配列番号７に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する、請求項５２に記載される方法。
【請求項５５】
前記癌は乳癌、前立腺癌、肺癌、卵巣癌、結腸直腸癌、膵臓癌および脳癌のうちの少なくとも１つを含む、請求項４４に記載される方法。
【請求項５６】
前記癌はＭＵＣ１の異常な発現を特徴とする、請求項４７に記載される方法。
【請求項５７】
癌を患うか、あるいは癌を疑う被検者から得た試料を細胞表面に発現したペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片と接触させ、そして、試料に特異的に結合した抗体またはその抗原結合断片の量を測定することを含む癌の病原力および／または転移可能性を決定する方法。
【請求項５８】
前記試料は被検者の細胞および／またはその可溶化液を含む、請求項５７に記載される方法。
【請求項５９】
前記ペプチドは成長因子などの活性化リガンドと相互作用して、細胞増殖を促進する細胞表面受容体の一部分であって、活性化リガンドと相互作用する細胞表面受容体を十分に有する部分を含む、請求項５７に記載される方法。
【請求項６０】
前記抗体またはその抗原結合断片はシグナル伝達物質に対して固定化されているか、あるいは固定化されるように適用される、請求項５７に記載される方法。
【請求項６１】
前記抗体またはその抗原結合断片は２価である、請求項６０に記載される方法。
【請求項６２】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６３】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項５２に記載される方法。
【請求項６４】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＭＳＧＦＲを含む、請求項５３に記載される方法。
【請求項６５】
前記癌は乳癌、前立腺癌、肺癌、卵巣癌、結腸直腸癌、膵臓癌および脳癌のうちの少なくとも１つを含む、請求項５７に記載される方法。
【請求項６６】
前記癌はＭＵＣ１の異常な発現を特徴とする、請求項６２に記載される方法。
【請求項６７】
ＰＳＭＧＦＲＴＣをコードする単離核酸分子、およびその縮重体、相補体、および固有断片。
【請求項６８】
配列番号３７に記載されるアミノ酸配列をコードする単離核酸分子、およびその縮重体、相補体、および固有断片。
【請求項６９】
プロモーターと実施可能に連結した請求項６７または６８に記載される単離核酸を含む発現ベクター。
【請求項７０】
請求項６７または６８に記載される核酸分子を含む発現ベクターで形質移入または形質転換された宿主細胞。
【請求項７１】
高ストリンジェントな条件下に配列番号４２に記載される核酸配列、その縮重体、相補体、および固有断片とハイブリダイズする単離核酸分子。
【請求項７２】
プロモーターと実施可能に連結した配列番号６６に記載される単離核酸分子、その縮重体、または相補体を含む発現ベクター。
【請求項７３】
請求項６６に記載される核酸分子またはその縮重体または相補体を含む発現ベクターで形質移入または形質転換された縮主細胞。
【請求項７４】
細胞表面受容体の一部分であって、成長因子などの活性化リガンドと相互作用し、細胞増殖を促進する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含み、該部分間の自発的結合を阻止するために必要な範囲まで、細胞表面受容体の鎖間結合領域を有していない細胞表面ペプチドを含むアミノ酸配列をコードする発現ベクターで宿主細胞を形質移入または形質転換し、該細胞によってペプチドの発現を促進して、細胞がその表面にペプチドを表示することを含む方法。
【請求項７５】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１を含む、請求項７４に記載される方法。
【請求項７６】
前記細胞表面ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項７５に記載される方法。
【請求項７７】
前記細胞表面ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項７６に記載される方法。
【請求項７８】
さらに、その表面にペプチドを表示する細胞を、該ペプチドと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤、および活性リガンドと接触させ、そして、ペプチドと活性化リガンドの相互作用を阻止する候補薬剤の能力を測定することを含む、請求項７５に記載される方法。
【請求項７９】
その表面にペプチドを表示する複数の細胞を、該ペプチドと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤および活性化リガンドと接触工程で接触させることを含む、請求項７８に記載される方法。
【請求項８０】
測定工程で細胞増殖速度および／または細胞の生存度を測定することを含む、請求項７９に記載される方法。
【請求項８１】
前記活性化リガンドとペプチドとの相互作用中にリン酸化される細胞内タンパクがリン酸化されるか否かを測定することを含む、請求項７８に記載される方法。
【請求項８２】
前記細胞内タンパクがＥＲＫ−２である、請求項８１に記載される方法。
【請求項８３】
前記活性化リガンドと候補薬剤の少なくとも１つは補助シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項７８に記載される方法。
【請求項８４】
前記補助シグナル伝達物質がコロイド粒子である、請求項８３に記載される方法。
【請求項８５】
前記補助シグナル伝達物質がコロイド粒子でない、請求項８３に記載される方法。
【請求項８６】
前記活性化リガンドと候補薬剤の少なくとも１つはコロイド粒子に付着されている補助シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項８３に記載される方法。
【請求項８７】
前記活性化リガンドは２価であり、前記細胞表面ペプチドのうちの２つに特異的に結合することが可能である、請求項７５に記載される方法。
【請求項８８】
前記活性化リガンドはＭＧＦＲに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項８７に記載される方法。
【請求項８９】
細胞表面受容体の一部分であって、成長因子などの活性化リガンドと相互作用し、細胞増殖を促進する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含み、該一部分間の自発的結合を阻止するために必要な範囲まで、細胞表面受容体の鎖間結合領域を有していないペプチドを準備し、そして、該ペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターを発現させることを含む方法。
【請求項９０】
請求項８９に記載される方法によって産生される発現ベクター。
【請求項９１】
前記細胞表面受容体はＭＵＣ１を含む、請求項８９に記載される方法。
【請求項９２】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項９１に記載される方法。
【請求項９３】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項９２に記載される方法。
【請求項９４】
細胞表面受容体の一部分であって、成長因子などの活性リガンドと相互作用し、細胞増殖を促進する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含み、該一部分間の自発的結合を阻止するために必要な範囲まで、細胞表面受容体の鎖間結合領域を有していない部分を含むペプチドをその表面に発現する細胞を準備し、該細胞を該ペプチドと相互作用する活性リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤および活性リガンドと接触させ、そして、ペプチドと活性化リガンドの相互作用時にリン酸化される細胞内タンパクがリン酸化されるか否かを測定することを含む方法。
【請求項９５】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１である、請求項９４に記載される方法。
【請求項９６】
前記細胞がＭＵＣ１陽性腫瘍細胞である、請求項９５に記載される方法。
【請求項９７】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項９５に記載される方法。
【請求項９８】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項９７に記載される方法。
【請求項９９】
前記細胞内タンパクがＥＲＫ−２を含む、請求項９４に記載される方法。
【請求項１００】
その表面にペプチドを表示する複数の細胞を、ペプチドと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤および活性化リガンドと接触工程で接触させることを含む、請求項９４に記載される方法。
【請求項１０１】
さらに、接触工程後に細胞を可溶化するか、あるいは透過させることを含む、請求項１００に記載される方法。
【請求項１０２】
さらに、ゲルを使用する分子サイズに基づく可溶化または透過工程で得られる細胞内物質に含まれるタンパクを分離することを含む、請求項１０１に記載される方法。
【請求項１０３】
分離工程で分離されたタンパクを、細胞内タンパクのリン酸化体と特異的に結合するが、リン酸化されないとき、細胞内タンパクと結合しない生物学的分子と接触させることを含む、請求項１０２に記載される方法。
【請求項１０４】
前記生物学的分子が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１０３に記載される方法。
【請求項１０５】
前記抗体またはその抗原結合断片は少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１０４に記載される方法。
【請求項１０６】
前記補助的シグナル伝達物質はコロイド粒子を含む、請求項１０５に記載される方法。
【請求項１０７】
前記補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１０５に記載される方法。
【請求項１０８】
さらに、分離工程で分離されたタンパクを、分子内タンパクのリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、細胞内分子に結合しない第１生物学的分子に接触させ、そして、第１生物学的分子に特異的に結合する第２生物学的分子に接触させることを含む、請求項１０３に記載される方法。
【請求項１０９】
前記第２生物学的分子が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１０８に記載される方法。
【請求項１１０】
前記抗体またはその抗原結合断片が少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１０９に記載される方法。
【請求項１１１】
前記補助的シグナル伝達物質がコロイド粒子を含む、請求項１１０に記載される方法。
【請求項１１２】
前記補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１１０に記載される方法。
【請求項１１３】
さらに、可溶化あるいは透過化工程において得られる細胞内物質に含まれるタンパクを複数のコロイド粒子に接触させることを含む、請求項１０１に記載される方法。
【請求項１１４】
前記コロイド粒子の第１サブセットは細胞内タンパクのリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、細胞内タンパクに結合しない第１生物学的分子に対して固定化され、そして前記コロイド粒子の第２サブセットは第１生物学的分子が特異的に結合するエピトープとは異なるエピトープにて、細胞内タンパクのリン酸化体に特異的に結合する第２生物学的分子に対して固定化されている、請求項１１３に記載される方法。
【請求項１１５】
前記測定工程は細胞内タンパクのリン酸化体の存在を示すコロイド粒子の凝集を表示する色変化が生じたか否かを検出することを含む、請求項１１４に記載される方法。
【請求項１１６】
前記第１生物学的分子は抗体またはその抗原結合断片であり、かつ、第２生物学的分子は細胞内タンパクのリン酸化体、およびリン酸化されていないとき、細胞内タンパクの両方に結合する抗体またはその抗原結合断片である、請求項１１４に記載される方法。
【請求項１１７】
前記細胞内タンパクはＥＲＫ−２である、請求項１１６に記載される方法。
【請求項１１８】
その表面上にＭＧＦＲを含むペプチドを発現する細胞を用意し、該細胞を、ＭＧＦＲと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与える候補薬剤および活性化リガンドと接触させ、そして、細胞内でＥＲＫ−２タンパクがリン酸化されるか否かを測定することを含む方法。
【請求項１１９】
前記細胞がＭＵＣ１陽性腫瘍細胞である、請求項１１８に記載される方法。
【請求項１２０】
前記ペプチドはそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項１１８に記載される方法。
【請求項１２１】
その表面上にペプチドを表示する複数の細胞を、ＭＧＦＲと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与える候補薬剤および活性リガンドと接触工程で接触させることを含む、請求項１１８に記載される方法。
【請求項１２２】
さらに、接触工程後に細胞を可溶化または透過化することを含む、請求項１２１に記載される方法。
【請求項１２３】
さらに、ゲルを使用する分子サイズに基づく可溶化または透過化工程で得られる細胞内物質に含まれるタンパクを分離することを含む、請求項１２２に記載される方法。
【請求項１２４】
分離工程で分離されるタンパクを、ＥＲＫ−２のリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、ＥＲＫ−２に結合しない生物学的分子に接触させることを含む、請求項１２３に記載される方法。
【請求項１２５】
前記生物学的分子が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１２４に記載される方法。
【請求項１２６】
前記抗体またはその抗原結合断片は少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１２５に記載される方法。
【請求項１２７】
前記補助的シグナル伝達物質はコロイド粒子を含む、請求項１２６に記載される方法。
【請求項１２８】
補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１２６に記載される方法。
【請求項１２９】
さらに、分離工程で分離されるタンパクを、細胞内タンパクのリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、細胞内タンパクに結合しない第１生物学的分子および第１生物学的分子に特異的に結合する第２生物学的分子に接触させることを含む、請求項１２３に記載される方法。
【請求項１３０】
前記第２生物学的分子は抗体またはその抗原結合断片である、請求項１２９に記載される方法。
【請求項１３１】
前記抗体またはその抗原結合断片は少なくとも１つのシグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１３０に記載される方法。
【請求項１３２】
前記補助的シグナル伝達物質はコロイド粒子を含む、請求項１３１に記載される方法。
【請求項１３３】
前記補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１３１に記載される方法。
【請求項１３４】
さらに、可溶化または透過化工程で得られる細胞内物質に含まれるタンパクを複数のコロイド粒子に接触させることを含む、請求項１２２に記載される方法。
【請求項１３５】
前記コロイド粒子の第１サブセットは、ＥＲＫ−２のリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、ＥＲＫ−２に特異的に結合しない第１生物学的分子に対して固定化されていて、そして、コロイド粒子の第２サブセットは、第１生物学的分子が特異的に結合するエピトープと異なるエピトープでＥＲＫ−２のリン酸化体に特異的に結合する第２生物学的分子に対して固定化されている、請求項１３４に記載される方法。
【請求項１３６】
前記測定工程はＥＲＫ−２リン酸化体の存在を示すコロイド粒子の凝集を表示する色変化が生じたか否かを検出することを含む、請求項１３５に記載される方法。
【請求項１３７】
前記第１生物学的分子は抗体またはその抗原結合断片であり、かつ、第２生物学的分子はＥＲＫ−２リン酸化体、およびリン酸化されていないとき、ＥＲＫ−２の両方に結合する抗体またはその抗原結合断片である、請求項１３５に記載される方法。
【請求項１３８】
細胞表面受容体と活性リガンドの結合を干渉する能力を有すると推測される候補薬剤が細胞表面受容体と活性リガンドの結合を干渉し、かつ、該薬剤候補が細胞表面受容体またはリガンドと相互作用するか否かを同時に測定することを含む方法。
【請求項１３９】
生物学的分子は第２変性状態にあるときよりも第１変性状態にて異なった範囲で生物学的分子に近接するとき、生物学的分子に対して固定化されるように作られたコロイド粒子を準備し、そして、生物学的分子に対するコロイド粒子の固定化を検出することを含む生物学的分子の変性状態を測定する方法。
【請求項１４０】
前記生物学的分子がタンパクである、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４１】
前記生物学的分子がＥＲＫ−２である、請求項１４０に記載される方法。
【請求項１４２】
前記第２変性状態が未変性状態を含む、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４３】
前記第１変性状態で生物学的分子はリン酸化、グリコシル化またはアセチル化されている、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４４】
生物学的分子は準備工程および測定工程の少なくとも１つの工程中にゲル中または膜上に存在する、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４５】
複数の生物学的分子を、変性の第１状態にあるとき生物学的分子に特異的に結合するが、変性の第２状態にあるとき生物学的分子に結合しない物質に接触させることを含む、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４６】
前記物質が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１４５に記載される方法。
【請求項１４７】
前記抗体またはその抗原結合断片が少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１４６に記載される方法。
【請求項１４８】
前記補助的シグナル伝達物質がコロイド粒子を含む、請求項１４７に記載される方法。
【請求項１４９】
前記補助的シグナル伝達物質がさらに染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１４８に記載される方法。
【請求項１５０】
さらに、複数の生物学的分子を、変性の第１状態にあるとき、生物学的分子に特異的に結合するが、変性の第２状態にあるとき、生物学的分子に結合しない第１物質、および第１物質に特異的に結合する第２物質に接触させることを含む、請求項１４５に記載される方法。
【請求項１５１】
前記第２物質が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１５０に記載される方法。
【請求項１５２】
抗体またはその抗原結合断片が少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１５１に記載される方法。
【請求項１５３】
前記補助的シグナル伝達物質がコロイド粒子を含む、請求項１５２に記載される方法。
【請求項１５４】
前記補助的シグナル伝達物質がさらに染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１５３に記載される方法。
【請求項１５５】
さらに、複数の生物学的分子を複数のコロイド粒子に接触させる、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１５６】
前記コロイド粒子の第１サブセットは変性の第１状態にあるとき、生物学的分子に特異的に結合し、変性の第２状態にあるとき、生物的分子に特異的に結合しない第１物質に対して固定化されていて、そしてコロイド粒子の第２サブセットは第１物質が特異的に結合するエピトープと異なったエピトープで変性の第１状態にあるとき、生物学的分子に特異的に結合する第２物質に対して固定化されている、請求項１５５に記載される方法。
【請求項１５７】
前記検出工程は変性の第１状態にあるとき、生物学的分子の存在を表示するコロイド粒子の凝集の表示である色変化が生じたか否かを検出することを含む、請求項１５６に記載される方法。
【請求項１５８】
前記第１物質は抗体またはその抗原結合断片であり、そして、第２物質は変性の第１状態および変性の第２状態にあるとき、生物学的分子に結合する抗体またはその抗原結合断片である、請求項１５６に記載される方法。
【請求項１５９】
さらに、検出工程で得られた情報から、細胞表面受容体への活性リガンドの結合時に、複数の細胞内シグナル伝達経路のいずれが活性化されるかを決定することを含む、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１６０】
配列番号１、２、３、６または７に記載されるアミノ酸配列のいずれかを含まない、Ｎ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６１】
Ｎ−末端に配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項１６０に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６２】
Ｎ−末端に配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは１０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項１６０に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６３】
Ｎ−末端に配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは５個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項１６２に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６４】
Ｎ−末端に配列番号３６に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項１６３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６５】
Ｎ−末端に配列番号６３に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項１６３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６６】
配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項１６０に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６７】
配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは１０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項１６６に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６８】
配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは５個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項１６７に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６９】
配列番号３６に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１６８に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７０】
配列番号６３に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１６８に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７１】
Ｎ−末端に配列番号７に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７２】
配列番号７に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７１に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７３】
Ｎ−末端に配列番号６４に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７４】
配列番号６４に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７５】
配列番号１、２または３に記載されるアミノ酸配列のいずれも含まないＨｉｓ−ＰＳＭＧＦＲを含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７６】
前記ＰＳＭＧＦＲがタンパクまたはペプチドのＮ−末端にあり、ポリヒスチジンがタンパクまたはペプチドのＣ−末端にある、請求項１７５に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７７】
配列番号２に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７８】
配列番号６０に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７９】
配列番号２に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７７に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８０】
配列番号６０に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７８に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８１】
配列番号７に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８２】
配列番号７に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１８１に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８３】
配列番号６４に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８４】
配列番号６４に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１８３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８５】
配列番号８に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８６】
配列番号６５に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８７】
配列番号３９に記載される配列の固有領域に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８８】
配列番号３９に記載されるアミノ酸配列のＮ−末端とアミノ酸番号１０４を架橋する領域に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８９】
請求項１〜１６および１８５〜１８８のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片を試料に作用させ、抗体またはその抗原結合断片と試料との相互作用を観察し、そして、観察行為中に観察された情報の少なくとも一部に基づいて癌の存否または癌の病原力を診断する行為を含む方法。
【請求項１９０】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＭＵＣ１受容体またはその一部分の量を測定することを含む、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９１】
患者から得た組織検体、体液または細胞を接触させ、そして、ＭＵＣ１受容体またはその一部分のクラスターパターンの損失を測定することを含む、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９２】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＰＳＭＧＦＲの量を測定することを含む、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９３】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＰＳＩＢＲの量を測定する、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９４】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＴＰＳＩＢＲの量を測定する、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９５】
さらに、観察行為中に観察された情報の少なくとも一部に基づいて癌治療のプロトコールを設計することを含む、請求項１８９〜１９４に記載される方法。
【請求項１】
ＭＧＦＲに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項２】
前記抗体またはその抗原結合断片が２価である、請求項１に記載される抗体またはその抗原断片。
【請求項３】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項４】
前記抗体またはその抗原結合断片がＰＳＭＧＦＲに特異的に結合する、請求項１に記載される抗体またはその抗原断片。
【請求項５】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片に特異的に結合する、請求項４に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項６】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいは１０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片に特異的に結合する、請求項５に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項７】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいは５個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片に特異的に結合する、請求項６に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項８】
前記抗体またはその抗原結合断片が配列番号３６に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する、請求項７に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項９】
前記抗体またはその抗原結合断片がヒト、ヒト化、異種間、またはキメラヒト−非ヒト抗体またはその抗原結合断片である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１０】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理抗体である、先の請求項のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１１】
前記抗原結合断片が１本鎖Ｆｖ断片、Ｆａｂ'断片、Ｆａｂ断片、またはＦｄ断片を含む、請求項３に記載される抗原結合断片。
【請求項１２】
前記抗原結合断片がＦ（ａｂ'）２断片を含む、請求項２記載に記載される抗原結合断片。
【請求項１３】
先の請求項のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片を含む組成物。
【請求項１４】
薬学的組成物であって、さらに、薬学的に許容される担体を含む、請求項１３に記載される組成物。
【請求項１５】
前記抗体またはその抗原結合断片がポリクローナル抗体である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１６】
前記抗体またはその抗原結合断片がモノクローナル抗体である、請求項１に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１７】
請求項１〜１２のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片を含むキット。
【請求項１８】
さらに、表面を有する物品を含む、請求項１７に記載されるキット。
【請求項１９】
前記抗体またはその抗原結合断片が物品の表面に固定されるか、あるいは固定されるように適用される、請求項１８に記載されるキット。
【請求項２０】
前記物品が粒子を含む、請求項１９に記載されるキット。
【請求項２１】
前記物品が粒子を含む、請求項１８に記載されるキット。
【請求項２２】
さらに、第２粒子、および細胞表面受容体の鎖間結合領域の分断後、細胞表面に付着して残存する細胞表面受容体の一部分を含むペプチド配列であって、細胞から脱着されるか、第２粒子に固定されるかあるいは固定されるように適用されるペプチド配列を含む、請求項２０に記載されるキット。
【請求項２３】
さらに、受容体開裂後に細胞表面に付着して残存する細胞表面受容体の一部分を含み、細胞から脱着されるか、粒子に固定されるかあるいは固定されるように適用されるペプチド配列を含む、請求項２１に記載されるキット。
【請求項２４】
さらに、前記第２粒子、および受容体開裂後に細胞表面に付着して残存する細胞表面受容体の一部分を含み、細胞から脱着されるか、粒子に固定されるかあるいは固定されるように適用されるペプチド配列を含む、請求項２３に記載されるキット。
【請求項２５】
さらに、前記抗体またはその抗原結合断片の存在下に、ペプチド配列が他の同一ペプチド配列および／または前記抗体またはその抗原結合断片に結合する能力に影響を与える候補薬剤を含む、請求項２２または２４に記載されるキット。
【請求項２６】
前記ペプチド配列がＭＧＦＲを含む、請求項２５に記載されるキット。
【請求項２７】
成長因子などの活性化リガンドと相互作用して、細胞増殖を促進する細胞表面受容体の一部分であって、活性化リガンドと該一部分に相互作用する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含むペプチドを準備し、そして、該ペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を生成することを含む方法。
【請求項２８】
前記抗体またはその抗原結合断片は２価である、請求項２７に記載される方法。
【請求項２９】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項２７に記載される方法。
【請求項３０】
請求項２７に記載される方法によって産生された抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３１】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理抗体である、請求項３０に記載される抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３２】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１を含む、請求項２７に記載される方法。
【請求項３３】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項３２に記載される方法。
【請求項３４】
前記ペプチドが配列番号３６に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項２７に記載される方法。
【請求項３５】
前記ペプチド配列が配列番号７に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項２７に記載される方法。
【請求項３６】
癌を寛解するのに有効な量の抗体またはその抗原結合断片を被検者に投与することを含む、ＭＵＣ１の異常な発現を特徴とする癌を患う患者を治療する方法。
【請求項３７】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項３６に記載される方法。
【請求項３８】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理の１本鎖抗体である、請求項３７に記載される方法。
【請求項３９】
前記投与工程で前記抗体またはその抗原結合断片が腫瘍の成長を低下させるのに有効な量で投与される、請求項３６に記載される方法。
【請求項４０】
前記抗体またはその抗原結合断片がＭＧＦＲに特異的に結合する、請求項３６に記載される方法。
【請求項４１】
前記方法は、ＭＵＣ１受容体の開裂後に細胞表面に付着して残存するＭＵＣ１受容体の一部分と天然リガンドとの相互作用を遮断するのに有効な量の前記抗体またはその抗原結合断片を被検者に投与することを含む、請求項３７に記載される方法。
【請求項４２】
ＭＵＣ１受容体の鎖間結合領域の分断を低下させるに有効な量の前記抗体またはその抗原結合断片を被検者に投与することを含む、請求項３６に記載される方法。
【請求項４３】
前記癌は乳癌、前立腺癌、肺癌、卵巣癌、結腸直腸癌、膵臓癌および脳癌のうちの少なくとも１つを含む、請求項３６に記載される方法。
【請求項４４】
成長因子などの活性化リガンドと相互作用して、細胞増殖を促進する細胞表面受容体の一部分であって、活性化リガンドと相互作用する細胞表面受容体を十分に含む一部分を含むペプチドと特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を被検者を投与することを含む、癌を患うか、あるいは癌を発症する危険性を有する被検者を治療する方法。
【請求項４５】
前記抗体またはその抗原結合断片が１価である、請求項４４に記載される方法。
【請求項４６】
前記抗体またはその抗原結合断片が未処理１本鎖抗体である、請求項４５に記載される方法。
【請求項４７】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１である、請求項４４に記載される方法。
【請求項４８】
前記ペプチドがＭＧＦＲである、請求項４７に記載される方法。
【請求項４９】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項４８に記載される方法。
【請求項５０】
前記ペプチドはＮ−末端に配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項４８に記載される方法。
【請求項５１】
前記ペプチドはＰＳＭＧＦＲからなる、請求項４９に記載される方法。
【請求項５２】
前記ペプチドは配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項５１に記載される方法。
【請求項５３】
前記ペプチドは配列番号３６に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項５２に記載される方法。
【請求項５４】
前記抗体またはその抗原結合断片は配列番号７に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する、請求項５２に記載される方法。
【請求項５５】
前記癌は乳癌、前立腺癌、肺癌、卵巣癌、結腸直腸癌、膵臓癌および脳癌のうちの少なくとも１つを含む、請求項４４に記載される方法。
【請求項５６】
前記癌はＭＵＣ１の異常な発現を特徴とする、請求項４７に記載される方法。
【請求項５７】
癌を患うか、あるいは癌を疑う被検者から得た試料を細胞表面に発現したペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片と接触させ、そして、試料に特異的に結合した抗体またはその抗原結合断片の量を測定することを含む癌の病原力および／または転移可能性を決定する方法。
【請求項５８】
前記試料は被検者の細胞および／またはその可溶化液を含む、請求項５７に記載される方法。
【請求項５９】
前記ペプチドは成長因子などの活性化リガンドと相互作用して、細胞増殖を促進する細胞表面受容体の一部分であって、活性化リガンドと相互作用する細胞表面受容体を十分に有する部分を含む、請求項５７に記載される方法。
【請求項６０】
前記抗体またはその抗原結合断片はシグナル伝達物質に対して固定化されているか、あるいは固定化されるように適用される、請求項５７に記載される方法。
【請求項６１】
前記抗体またはその抗原結合断片は２価である、請求項６０に記載される方法。
【請求項６２】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６３】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項５２に記載される方法。
【請求項６４】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＭＳＧＦＲを含む、請求項５３に記載される方法。
【請求項６５】
前記癌は乳癌、前立腺癌、肺癌、卵巣癌、結腸直腸癌、膵臓癌および脳癌のうちの少なくとも１つを含む、請求項５７に記載される方法。
【請求項６６】
前記癌はＭＵＣ１の異常な発現を特徴とする、請求項６２に記載される方法。
【請求項６７】
ＰＳＭＧＦＲＴＣをコードする単離核酸分子、およびその縮重体、相補体、および固有断片。
【請求項６８】
配列番号３７に記載されるアミノ酸配列をコードする単離核酸分子、およびその縮重体、相補体、および固有断片。
【請求項６９】
プロモーターと実施可能に連結した請求項６７または６８に記載される単離核酸を含む発現ベクター。
【請求項７０】
請求項６７または６８に記載される核酸分子を含む発現ベクターで形質移入または形質転換された宿主細胞。
【請求項７１】
高ストリンジェントな条件下に配列番号４２に記載される核酸配列、その縮重体、相補体、および固有断片とハイブリダイズする単離核酸分子。
【請求項７２】
プロモーターと実施可能に連結した配列番号６６に記載される単離核酸分子、その縮重体、または相補体を含む発現ベクター。
【請求項７３】
請求項６６に記載される核酸分子またはその縮重体または相補体を含む発現ベクターで形質移入または形質転換された縮主細胞。
【請求項７４】
細胞表面受容体の一部分であって、成長因子などの活性化リガンドと相互作用し、細胞増殖を促進する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含み、該部分間の自発的結合を阻止するために必要な範囲まで、細胞表面受容体の鎖間結合領域を有していない細胞表面ペプチドを含むアミノ酸配列をコードする発現ベクターで宿主細胞を形質移入または形質転換し、該細胞によってペプチドの発現を促進して、細胞がその表面にペプチドを表示することを含む方法。
【請求項７５】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１を含む、請求項７４に記載される方法。
【請求項７６】
前記細胞表面ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項７５に記載される方法。
【請求項７７】
前記細胞表面ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項７６に記載される方法。
【請求項７８】
さらに、その表面にペプチドを表示する細胞を、該ペプチドと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤、および活性リガンドと接触させ、そして、ペプチドと活性化リガンドの相互作用を阻止する候補薬剤の能力を測定することを含む、請求項７５に記載される方法。
【請求項７９】
その表面にペプチドを表示する複数の細胞を、該ペプチドと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤および活性化リガンドと接触工程で接触させることを含む、請求項７８に記載される方法。
【請求項８０】
測定工程で細胞増殖速度および／または細胞の生存度を測定することを含む、請求項７９に記載される方法。
【請求項８１】
前記活性化リガンドとペプチドとの相互作用中にリン酸化される細胞内タンパクがリン酸化されるか否かを測定することを含む、請求項７８に記載される方法。
【請求項８２】
前記細胞内タンパクがＥＲＫ−２である、請求項８１に記載される方法。
【請求項８３】
前記活性化リガンドと候補薬剤の少なくとも１つは補助シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項７８に記載される方法。
【請求項８４】
前記補助シグナル伝達物質がコロイド粒子である、請求項８３に記載される方法。
【請求項８５】
前記補助シグナル伝達物質がコロイド粒子でない、請求項８３に記載される方法。
【請求項８６】
前記活性化リガンドと候補薬剤の少なくとも１つはコロイド粒子に付着されている補助シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項８３に記載される方法。
【請求項８７】
前記活性化リガンドは２価であり、前記細胞表面ペプチドのうちの２つに特異的に結合することが可能である、請求項７５に記載される方法。
【請求項８８】
前記活性化リガンドはＭＧＦＲに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項８７に記載される方法。
【請求項８９】
細胞表面受容体の一部分であって、成長因子などの活性化リガンドと相互作用し、細胞増殖を促進する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含み、該一部分間の自発的結合を阻止するために必要な範囲まで、細胞表面受容体の鎖間結合領域を有していないペプチドを準備し、そして、該ペプチドをコードする核酸分子を含む発現ベクターを発現させることを含む方法。
【請求項９０】
請求項８９に記載される方法によって産生される発現ベクター。
【請求項９１】
前記細胞表面受容体はＭＵＣ１を含む、請求項８９に記載される方法。
【請求項９２】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項９１に記載される方法。
【請求項９３】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項９２に記載される方法。
【請求項９４】
細胞表面受容体の一部分であって、成長因子などの活性リガンドと相互作用し、細胞増殖を促進する細胞表面受容体を十分に有する一部分を含み、該一部分間の自発的結合を阻止するために必要な範囲まで、細胞表面受容体の鎖間結合領域を有していない部分を含むペプチドをその表面に発現する細胞を準備し、該細胞を該ペプチドと相互作用する活性リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤および活性リガンドと接触させ、そして、ペプチドと活性化リガンドの相互作用時にリン酸化される細胞内タンパクがリン酸化されるか否かを測定することを含む方法。
【請求項９５】
前記細胞表面受容体がＭＵＣ１である、請求項９４に記載される方法。
【請求項９６】
前記細胞がＭＵＣ１陽性腫瘍細胞である、請求項９５に記載される方法。
【請求項９７】
前記ペプチドがＭＧＦＲを含む、請求項９５に記載される方法。
【請求項９８】
前記ペプチドがそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項９７に記載される方法。
【請求項９９】
前記細胞内タンパクがＥＲＫ−２を含む、請求項９４に記載される方法。
【請求項１００】
その表面にペプチドを表示する複数の細胞を、ペプチドと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与えるための候補薬剤および活性化リガンドと接触工程で接触させることを含む、請求項９４に記載される方法。
【請求項１０１】
さらに、接触工程後に細胞を可溶化するか、あるいは透過させることを含む、請求項１００に記載される方法。
【請求項１０２】
さらに、ゲルを使用する分子サイズに基づく可溶化または透過工程で得られる細胞内物質に含まれるタンパクを分離することを含む、請求項１０１に記載される方法。
【請求項１０３】
分離工程で分離されたタンパクを、細胞内タンパクのリン酸化体と特異的に結合するが、リン酸化されないとき、細胞内タンパクと結合しない生物学的分子と接触させることを含む、請求項１０２に記載される方法。
【請求項１０４】
前記生物学的分子が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１０３に記載される方法。
【請求項１０５】
前記抗体またはその抗原結合断片は少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１０４に記載される方法。
【請求項１０６】
前記補助的シグナル伝達物質はコロイド粒子を含む、請求項１０５に記載される方法。
【請求項１０７】
前記補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１０５に記載される方法。
【請求項１０８】
さらに、分離工程で分離されたタンパクを、分子内タンパクのリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、細胞内分子に結合しない第１生物学的分子に接触させ、そして、第１生物学的分子に特異的に結合する第２生物学的分子に接触させることを含む、請求項１０３に記載される方法。
【請求項１０９】
前記第２生物学的分子が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１０８に記載される方法。
【請求項１１０】
前記抗体またはその抗原結合断片が少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１０９に記載される方法。
【請求項１１１】
前記補助的シグナル伝達物質がコロイド粒子を含む、請求項１１０に記載される方法。
【請求項１１２】
前記補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１１０に記載される方法。
【請求項１１３】
さらに、可溶化あるいは透過化工程において得られる細胞内物質に含まれるタンパクを複数のコロイド粒子に接触させることを含む、請求項１０１に記載される方法。
【請求項１１４】
前記コロイド粒子の第１サブセットは細胞内タンパクのリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、細胞内タンパクに結合しない第１生物学的分子に対して固定化され、そして前記コロイド粒子の第２サブセットは第１生物学的分子が特異的に結合するエピトープとは異なるエピトープにて、細胞内タンパクのリン酸化体に特異的に結合する第２生物学的分子に対して固定化されている、請求項１１３に記載される方法。
【請求項１１５】
前記測定工程は細胞内タンパクのリン酸化体の存在を示すコロイド粒子の凝集を表示する色変化が生じたか否かを検出することを含む、請求項１１４に記載される方法。
【請求項１１６】
前記第１生物学的分子は抗体またはその抗原結合断片であり、かつ、第２生物学的分子は細胞内タンパクのリン酸化体、およびリン酸化されていないとき、細胞内タンパクの両方に結合する抗体またはその抗原結合断片である、請求項１１４に記載される方法。
【請求項１１７】
前記細胞内タンパクはＥＲＫ−２である、請求項１１６に記載される方法。
【請求項１１８】
その表面上にＭＧＦＲを含むペプチドを発現する細胞を用意し、該細胞を、ＭＧＦＲと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与える候補薬剤および活性化リガンドと接触させ、そして、細胞内でＥＲＫ−２タンパクがリン酸化されるか否かを測定することを含む方法。
【請求項１１９】
前記細胞がＭＵＣ１陽性腫瘍細胞である、請求項１１８に記載される方法。
【請求項１２０】
前記ペプチドはそのＮ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む、請求項１１８に記載される方法。
【請求項１２１】
その表面上にペプチドを表示する複数の細胞を、ＭＧＦＲと相互作用する活性化リガンドの能力に影響を与える候補薬剤および活性リガンドと接触工程で接触させることを含む、請求項１１８に記載される方法。
【請求項１２２】
さらに、接触工程後に細胞を可溶化または透過化することを含む、請求項１２１に記載される方法。
【請求項１２３】
さらに、ゲルを使用する分子サイズに基づく可溶化または透過化工程で得られる細胞内物質に含まれるタンパクを分離することを含む、請求項１２２に記載される方法。
【請求項１２４】
分離工程で分離されるタンパクを、ＥＲＫ−２のリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、ＥＲＫ−２に結合しない生物学的分子に接触させることを含む、請求項１２３に記載される方法。
【請求項１２５】
前記生物学的分子が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１２４に記載される方法。
【請求項１２６】
前記抗体またはその抗原結合断片は少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１２５に記載される方法。
【請求項１２７】
前記補助的シグナル伝達物質はコロイド粒子を含む、請求項１２６に記載される方法。
【請求項１２８】
補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１２６に記載される方法。
【請求項１２９】
さらに、分離工程で分離されるタンパクを、細胞内タンパクのリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、細胞内タンパクに結合しない第１生物学的分子および第１生物学的分子に特異的に結合する第２生物学的分子に接触させることを含む、請求項１２３に記載される方法。
【請求項１３０】
前記第２生物学的分子は抗体またはその抗原結合断片である、請求項１２９に記載される方法。
【請求項１３１】
前記抗体またはその抗原結合断片は少なくとも１つのシグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１３０に記載される方法。
【請求項１３２】
前記補助的シグナル伝達物質はコロイド粒子を含む、請求項１３１に記載される方法。
【請求項１３３】
前記補助的シグナル伝達物質は染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１３１に記載される方法。
【請求項１３４】
さらに、可溶化または透過化工程で得られる細胞内物質に含まれるタンパクを複数のコロイド粒子に接触させることを含む、請求項１２２に記載される方法。
【請求項１３５】
前記コロイド粒子の第１サブセットは、ＥＲＫ−２のリン酸化体に特異的に結合するが、リン酸化されていないとき、ＥＲＫ−２に特異的に結合しない第１生物学的分子に対して固定化されていて、そして、コロイド粒子の第２サブセットは、第１生物学的分子が特異的に結合するエピトープと異なるエピトープでＥＲＫ−２のリン酸化体に特異的に結合する第２生物学的分子に対して固定化されている、請求項１３４に記載される方法。
【請求項１３６】
前記測定工程はＥＲＫ−２リン酸化体の存在を示すコロイド粒子の凝集を表示する色変化が生じたか否かを検出することを含む、請求項１３５に記載される方法。
【請求項１３７】
前記第１生物学的分子は抗体またはその抗原結合断片であり、かつ、第２生物学的分子はＥＲＫ−２リン酸化体、およびリン酸化されていないとき、ＥＲＫ−２の両方に結合する抗体またはその抗原結合断片である、請求項１３５に記載される方法。
【請求項１３８】
細胞表面受容体と活性リガンドの結合を干渉する能力を有すると推測される候補薬剤が細胞表面受容体と活性リガンドの結合を干渉し、かつ、該薬剤候補が細胞表面受容体またはリガンドと相互作用するか否かを同時に測定することを含む方法。
【請求項１３９】
生物学的分子は第２変性状態にあるときよりも第１変性状態にて異なった範囲で生物学的分子に近接するとき、生物学的分子に対して固定化されるように作られたコロイド粒子を準備し、そして、生物学的分子に対するコロイド粒子の固定化を検出することを含む生物学的分子の変性状態を測定する方法。
【請求項１４０】
前記生物学的分子がタンパクである、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４１】
前記生物学的分子がＥＲＫ−２である、請求項１４０に記載される方法。
【請求項１４２】
前記第２変性状態が未変性状態を含む、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４３】
前記第１変性状態で生物学的分子はリン酸化、グリコシル化またはアセチル化されている、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４４】
生物学的分子は準備工程および測定工程の少なくとも１つの工程中にゲル中または膜上に存在する、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４５】
複数の生物学的分子を、変性の第１状態にあるとき生物学的分子に特異的に結合するが、変性の第２状態にあるとき生物学的分子に結合しない物質に接触させることを含む、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１４６】
前記物質が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１４５に記載される方法。
【請求項１４７】
前記抗体またはその抗原結合断片が少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１４６に記載される方法。
【請求項１４８】
前記補助的シグナル伝達物質がコロイド粒子を含む、請求項１４７に記載される方法。
【請求項１４９】
前記補助的シグナル伝達物質がさらに染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１４８に記載される方法。
【請求項１５０】
さらに、複数の生物学的分子を、変性の第１状態にあるとき、生物学的分子に特異的に結合するが、変性の第２状態にあるとき、生物学的分子に結合しない第１物質、および第１物質に特異的に結合する第２物質に接触させることを含む、請求項１４５に記載される方法。
【請求項１５１】
前記第２物質が抗体またはその抗原結合断片である、請求項１５０に記載される方法。
【請求項１５２】
抗体またはその抗原結合断片が少なくとも１つの補助的シグナル伝達物質に対して固定化されている、請求項１５１に記載される方法。
【請求項１５３】
前記補助的シグナル伝達物質がコロイド粒子を含む、請求項１５２に記載される方法。
【請求項１５４】
前記補助的シグナル伝達物質がさらに染料、顔料、電気的活性分子、化学発光分子、電気化学発光分子、蛍光性分子、上流制御リン、および西洋ワサビパーオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素連結シグナル伝達分子のうち、少なくとも１つを含む、請求項１５３に記載される方法。
【請求項１５５】
さらに、複数の生物学的分子を複数のコロイド粒子に接触させる、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１５６】
前記コロイド粒子の第１サブセットは変性の第１状態にあるとき、生物学的分子に特異的に結合し、変性の第２状態にあるとき、生物的分子に特異的に結合しない第１物質に対して固定化されていて、そしてコロイド粒子の第２サブセットは第１物質が特異的に結合するエピトープと異なったエピトープで変性の第１状態にあるとき、生物学的分子に特異的に結合する第２物質に対して固定化されている、請求項１５５に記載される方法。
【請求項１５７】
前記検出工程は変性の第１状態にあるとき、生物学的分子の存在を表示するコロイド粒子の凝集の表示である色変化が生じたか否かを検出することを含む、請求項１５６に記載される方法。
【請求項１５８】
前記第１物質は抗体またはその抗原結合断片であり、そして、第２物質は変性の第１状態および変性の第２状態にあるとき、生物学的分子に結合する抗体またはその抗原結合断片である、請求項１５６に記載される方法。
【請求項１５９】
さらに、検出工程で得られた情報から、細胞表面受容体への活性リガンドの結合時に、複数の細胞内シグナル伝達経路のいずれが活性化されるかを決定することを含む、請求項１３９に記載される方法。
【請求項１６０】
配列番号１、２、３、６または７に記載されるアミノ酸配列のいずれかを含まない、Ｎ−末端にＰＳＭＧＦＲを含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６１】
Ｎ−末端に配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項１６０に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６２】
Ｎ−末端に配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは１０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項１６０に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６３】
Ｎ−末端に配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは５個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片を含む、請求項１６２に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６４】
Ｎ−末端に配列番号３６に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項１６３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６５】
Ｎ−末端に配列番号６３に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項１６３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６６】
配列番号３６に記載されるアミノ酸配列あるいはＮ−末端に１５個以下のアミノ酸の付加または欠失を含み、かつ、２０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項１６０に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６７】
配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは１０個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項１６６に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６８】
配列番号３６または配列番号６３に記載されるアミノ酸配列あるいは５個以下のアミノ酸の置換を含む機能的変異体またはその断片からなる、請求項１６７に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１６９】
配列番号３６に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１６８に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７０】
配列番号６３に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１６８に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７１】
Ｎ−末端に配列番号７に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７２】
配列番号７に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７１に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７３】
Ｎ−末端に配列番号６４に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７４】
配列番号６４に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７５】
配列番号１、２または３に記載されるアミノ酸配列のいずれも含まないＨｉｓ−ＰＳＭＧＦＲを含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７６】
前記ＰＳＭＧＦＲがタンパクまたはペプチドのＮ−末端にあり、ポリヒスチジンがタンパクまたはペプチドのＣ−末端にある、請求項１７５に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７７】
配列番号２に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７８】
配列番号６０に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１７９】
配列番号２に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７７に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８０】
配列番号６０に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１７８に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８１】
配列番号７に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８２】
配列番号７に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１８１に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８３】
配列番号６４に記載されるアミノ酸配列を含む単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８４】
配列番号６４に記載されるアミノ酸配列からなる、請求項１８３に記載される単離タンパクまたはペプチド。
【請求項１８５】
配列番号８に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８６】
配列番号６５に記載されるアミノ酸配列に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８７】
配列番号３９に記載される配列の固有領域に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８８】
配列番号３９に記載されるアミノ酸配列のＮ−末端とアミノ酸番号１０４を架橋する領域に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１８９】
請求項１〜１６および１８５〜１８８のいずれか１つに記載される抗体またはその抗原結合断片を試料に作用させ、抗体またはその抗原結合断片と試料との相互作用を観察し、そして、観察行為中に観察された情報の少なくとも一部に基づいて癌の存否または癌の病原力を診断する行為を含む方法。
【請求項１９０】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＭＵＣ１受容体またはその一部分の量を測定することを含む、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９１】
患者から得た組織検体、体液または細胞を接触させ、そして、ＭＵＣ１受容体またはその一部分のクラスターパターンの損失を測定することを含む、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９２】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＰＳＭＧＦＲの量を測定することを含む、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９３】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＰＳＩＢＲの量を測定する、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９４】
患者から得た組織検体、体液または細胞を含む試料を接触させ、そして、試料中に存在するＴＰＳＩＢＲの量を測定する、請求項１８９に記載される方法。
【請求項１９５】
さらに、観察行為中に観察された情報の少なくとも一部に基づいて癌治療のプロトコールを設計することを含む、請求項１８９〜１９４に記載される方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【公表番号】特表２００７−５３１５０５（Ｐ２００７−５３１５０５Ａ）
【公表日】平成１９年１１月８日（２００７．１１．８）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−５２４８９６（Ｐ２００６−５２４８９６）
【出願日】平成１６年８月２６日（２００４．８．２６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２７９５４
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１９２６９
【国際公開日】平成１７年３月３日（２００５．３．３）
【出願人】（５０６０６５６５５）ミネルバ バイオオテクノロジーズ コーポレーション (2)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成１９年１１月８日（２００７．１１．８）
【国際特許分類】
【出願日】平成１６年８月２６日（２００４．８．２６）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００４／０２７９５４
【国際公開番号】ＷＯ２００５／０１９２６９
【国際公開日】平成１７年３月３日（２００５．３．３）
【出願人】（５０６０６５６５５）ミネルバ バイオオテクノロジーズ コーポレーション (2)
【Ｆターム（参考）】
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