説明

肺がんへの傾向についてのスクリーニングのための方法およびマーカー組合せ

【課題】肺がんを患っていることが疑われる被験者中の肺がんの検出において補助するための、迅速で感度のよい方法を提供する。
【解決手段】被験者より試験試料を得る段階、試験試料中、パネル中の1つ以上のバイオマーカーの量を定量する段階、バイオマーカーに対して、所定のカットオフと、パネル中の各バイオマーカーの量を比較し、比較に基づいた各バイオマーカーに対するスコアを割り当てる段階、前段階において決定された各バイオマーカーに対する割り当てられたスコアを比較して、被験者に関する総スコアを見つけ出す段階、前段階にて決定された総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、および被験者が総スコアに基づく肺がんの危険性を有するかどうか決定する段階、を含む。


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【特許請求の範囲】
【請求項1】
肺がんの疑いのある被験者の診断を補助する方法であり、
a.被験者より試験試料を得る段階、
b.試験試料において、パネル中の1つ以上のバイオマーカーの量を定量する段階、
c.パネル中の各バイオマーカーの量を前記バイオマーカーに対する所定のカットオフと比較し、および前記比較に基づいて各バイオマーカーに対するスコアを割り当てる段階、
d.段階cにおいて決定された各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に関する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dにて決定された総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんの危険性を有するかどうか決定する段階、
を含む、方法。
【請求項2】
1つ又はそれ以上のバイオマーカーが、抗体、抗原および関心領域の群から選択される、請求項1の方法。
【請求項3】
被験者から少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを得ることをさらに含む、請求項1の方法。
【請求項4】
少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターが、被験者の喫煙歴に基づく、請求項3の方法。
【請求項5】
少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを、前記バイオメトリックパラメーターのそれぞれに対する所定のカットオフと比較し、および前記比較に基づき各バイオメトリックパラメーターに対してスコアを割り当てる段階をさらに含み、各バイオメトリックパラメーターに対して割り当てられたスコアを、段階cにて定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアと統合して、段階dでの前記被験者に対する総スコアを見つけ出し、段階eで総スコアを所定の総スコアと比較し、および段階fにおいて総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんの危険性を有するかどうかを決定する、請求項3の方法。
【請求項6】
定量されるバイオマーカーが、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3、免疫反応性Cycllin E2に対する少なくとも1つの抗体、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA15−3、SCC、proGRP、CA19−9、血清アミロイドA、アルファ−1−抗−トリプシン、アポリポタンパク質CIII、Acn6399、Acn9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、Pub2951、Pub2433、Pub17338、TFA6453およびHIC3959の1つ以上である、請求項1の方法。
【請求項7】
肺がんに関連するバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項1の方法。
【請求項8】
肺がんの疑いのある被験者の診断を補助する方法であり、
a.被験者から少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを得る段階、
b.少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを、前記各バイオメトリックパラメーターに対して先に決定したカットオフと比較し、および前記比較に基づいて各バイオメトリックパラメーターに対してスコアを割り当てる段階、
c.被験者から試験試料を得る段階、
d.試験試料において、パネル内の2つ以上のバイオマーカーの量を定量(パネルは、少なくとも1つの抗体および少なくとも1つの抗原を含む。)する段階、
e.パネル中の定量された各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフに対して比較し、および前記比較に基づいて各バイオマーカーに対してスコアを割り当てる段階、
f.段階bにて決定した各バイオメトリックパラメーターに対して割り当てられたスコアを、段階eにて定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアと統合して、前記被験者の総スコアを見つけ出す段階、
g.段階fで決定された総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
h.段階fで決定した総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんの危険性を有するかどうかを決定する段階、
を含む、方法。
【請求項9】
パネルが、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3および免疫反応性サイクリンE2に対する少なくとも1つの抗体からなる群より選択される少なくとも1つの抗体を含む、請求項8の方法。
【請求項10】
パネルが、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA15−3、SCC、proGRP、CA19−9、血清アミロイドA、α−1−抗−トリプシンおよびアポリポタンパク質CIIIからなる群から選択される少なくとも1つの抗原を含む、請求項8の方法。
【請求項11】
パネルがさらに、Acn6399、Acn9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、Pub2951、Pub2433、Pub17338、TFA6453およびHIC3959からなる群より選択される、少なくとも1つの関心領域を含む、請求項8の方法。
【請求項12】
肺がんに関連したバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項8の方法。
【請求項13】
バイオメトリックパラメーターが、被験者の喫煙歴、年齢、発がん物質への暴露および性別からなる群より選択される、請求項8の方法。
【請求項14】
バイオメトリックパラメーターが、喫煙のパックイヤーである、請求項13の方法。
【請求項15】
段階bが、各バイオメトリックパラメーターの量を、前記バイオメトリックパラメーターに対する所定のカットオフの数に対して比較し、および前記比較に基づいて、各前記バイオメトリックパラメーターに対して可能性あるいくつかのスコアの1つを割り当てることを含み、段階eが、パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフの数に対して比較し、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てることを含み、段階fが、段階bでのバイオメトリックパラメーターに対する割り当てられたスコアを、段階eで定量された各バイオマーカーに対する割り当てられたスコアと統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出すことを含み、段階gが、段階fで決定した総スコアを、先に決定したいくつかの総スコアと比較することを含み、段階gが、段階gで決定した総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定することを含む、請求項8の方法。
【請求項16】
肺がんの疑いのある被験者の診断を補助する方法であり、
a.被験者から試験試料を得る段階、
b.試験試料において、パネル中の2つ以上のバイオマーカーの量を定量(パネルは、少なくとも1つの抗体と少なくとも1つの抗原を含む。)する段階、
c.パネル中で定量された各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフと比較し、および前記比較に基づいて各バイオマーカーに対してスコアを割り当てる段階、
d.段階cにおいて定量された各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dにて決定された総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.段階eにて決定された総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんの危険性を有するかどうかを決定する段階、
を含む、方法。
【請求項17】
パネルが、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3および免疫反応性サイクリンE2に対する少なくとも1つの抗体からなる群より選択される少なくとも1つの抗体を含む、請求項16の方法。
【請求項18】
パネルが、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA19−9、CA15−3、SCC、proGRP、血清アミロイドA、α−1−抗−トリプシンおよびアポリポタンパク質CIIIからなる群から選択される少なくとも1つの抗原を含む、請求項16の方法。
【請求項19】
パネルがさらに、Acn6399、Acn9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、Pub2951、Pub2433、Pub17338、TFA6453およびHIC3959からなる群より選択される、少なくとも1つの関心領域を含む、請求項16の方法。
【請求項20】
肺がんに関連したバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項16の方法。
【請求項21】
段階cが、パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフの数と比較し、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てることを含み、段階dが、段階cにて定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出すことを含み、段階eが、段階dで決定した総スコアを、所定の総スコアの数と比較することを含み、ならびに段階fが、段階eで決定した総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定することを含む、請求項16の方法。
【請求項22】
肺がんの疑いのある被験者の診断を補助する方法であり、
a.被験者から試験試料を得る段階、
b.試験試料においてパネル中の少なくとも1つのバイオマーカーの量を定量する(パネルが、免疫反応性サイクリンE2に対する少なくとも1つの抗体を含む。)段階、
c.パネル中の定量した各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフに対して比較し、および前記比較に基づいて各バイオマーカーに対してスコアを割り当てる段階、
d.段階cにて定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dにて決定した総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.段階eで決定した総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうか決定する段階、
を含む、方法。
【請求項23】
肺がんに関連したバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項22の方法。
【請求項24】
段階cが、パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフの数に対して比較し、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てることを含み、段階dが、段階cにて定量した各バイオマーカーに対する割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出すことを含み、段階eが、段階dで決定した総スコアを、所定の総スコアの数と比較することを含み、ならびに段階fが、段階eで決定された総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定することを含む、請求項22の方法。
【請求項25】
方法がさらに、被験者の少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを得ること、および少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを、各前記バイオメトリックパラメーターに対する所定のカットオフに対して比較すること、および前記比較に基づいて、各バイオメトリックパラメーターに対してスコアを割り当てること、を含む、請求項22の方法。
【請求項26】
さらに、試験試料中の少なくとも1つの抗原を定量すること、試験試料中の少なくとも1つの抗体を定量すること、または試験試料中の少なくとも1つの抗原および少なくとも1つの抗体の組合せを定量することを含む請求項22の方法。
【請求項27】
定量される少なくとも1つの抗原が、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA15−3、SCC、CA19−9、proGRP、血清アミロイドA、α−1−抗−トリプシンおよびアポリポタンパク質CIIIからなる群から選択される、請求項26の方法。
【請求項28】
定量される少なくとも1つの抗体が、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3からなる群より選択される、請求項26の方法。
【請求項29】
試験試料中、Acn6399、Acn9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、Pub2951、Pub2433、Pub17338、TFA6453およびHIC3959からなる群より選択される、少なくとも1つの関心領域を定量する段階をさらに含む、請求項22の方法。
【請求項30】
肺がんの疑いのある被験者の診断において補助する方法であり、
a.被験者から試験試料を得る段階、
b.試験試料において、パネル中の少なくとも1つのバイオマーカーを定量(パネルには、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA15−3、SCC、CA19−9、proGRP、血清アミロイドA、α−1−抗−トリプシンおよびアポリポタンパク質CIIIからなる群より選択される少なくとも1つのバイオマーカーを含む。)する段階、
c.パネル中の定量した各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフと比較する段階、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てる段階、
d.段階cにて定量した各バイオマーカーに対して割り当てたスコアを統合し、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dにて定量した総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうか決定する段階、
を含む、方法。
【請求項31】
方法が、少なくとも1つの被験者のバイオメトリックパラメーターを得ること、および少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを各前記バイオメトリックパラメーターに対する所定のカットオフに対して比較し、および前記比較に基づいて、各バイオメトリックパラメーターに対してスコアを割り当てることをさらに含む、請求項30の方法。
【請求項32】
パネルがさらに、試験試料中の少なくとも1つの抗体を、試験試料中で定量する段階を含む、請求項30の方法。
【請求項33】
少なくとも1つの抗体が、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3からなる群より選択される、請求項31の方法。
【請求項34】
パネルがさらに、Acn6399、Acn9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、Pub2951、Pub2433、Pub17338、TFA6453およびHIC3959からなる群より選択される、少なくとも1つの関心領域を含む、請求項30の方法。
【請求項35】
肺がんに関連したバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項30の方法。
【請求項36】
段階cが、パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフの数に対して比較すること、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てることを含み、段階dが、段階cにて定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出すことを含み、段階eが、段階dにて決定された総スコアを、所定の総スコアの数と比較することを含み、ならびに段階fが、段階eにて決定した総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定することを含む、請求項30の方法。
【請求項37】
肺がんの疑いのある被験者の診断において補助する方法であり、
a.被験者から試験試料を得る段階、
b.試験試料においてパネル中の少なくとも1つのバイオマーカーを(パネルは、少なくとも1つのバイオマーカーを含み段階で、バイオマーカーは、Acn6399、Acn9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、Pub2951、Pub2433、Pub17338、TFA6453およびHIC3959からなる群より選択される、関心領域である。)定量する段階、
c.パネル中の定量した各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフと比較し、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てる段階、
d.段階cで定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dにて定量した総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.段階eにて決定した総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定する段階、
を含む、方法。
【請求項38】
方法がさらに、被験者の少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを得ること、および少なくとも1つのバイオメトリックパラメーターを、各前記バイオメトリックパラメーターに対する所定のカットオフに対して比較し、および前記比較に基づいて、各バイオメトリックパラメーターに対してスコアを割り当てること、を含む、請求項37の方法。
【請求項39】
パネルがさらに、少なくとも1つの抗原、少なくとも1つの抗体、または少なくとも1つの抗原と少なくとも1つの抗体の組合せを含む、請求項37の方法。
【請求項40】
少なくとも1つの抗原は、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA15−3、SCC、CA19−9、proGRP、血清アミロイドA、α−1−抗−トリプシンおよびアポリポタンパク質CIIIからなる群から選択される、請求項39の方法。
【請求項41】
少なくとも1つの抗体が、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3からなる群より選択される、請求項39の方法。
【請求項42】
肺がんに関連したバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項37の方法。
【請求項43】
段階cが、パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のいくつかのカットオフと比較し、および前記比較にもとづいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てることを含み、段階dが、段階cにて定量された各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出すことを含み、段階eが、段階dで決定された総スコアを、所定の総スコアの数を比較することを含み、段階fが、段階eにて決定された総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定することを含む、請求項37の方法。
【請求項44】
肺がんの疑いのある被験者の診断において補助する方法であり、
a.被験者から試験試料を得る段階、
b.パネル中の2つ又はそれ以上のバイオマーカーを試験試料中において、定量(パネルは、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CA19−9、CEA、CA15−3、CA125、SCC、proGRP、ACN9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Tfa6453およびHic3959の2つ以上を含む。)する段階、
c.パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフに対して比較し、および前記比較に基づいて、各バイオマーカーに対してスコアを割り当てる段階、
d.段階cにて決定された各バイオマーカーに対する割り当てられたスコアを統合し、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dで決定された総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.段階eにて決定された総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定する段階、
を含む、方法。
【請求項45】
肺がんに関連するバイオマーカーのDFIが、約0.4未満である、請求項44の方法。
【請求項46】
パネルが、サイトケラチン19、CEA、ACN9459、Pub11597、Pub4789およびTFA2759を含む、請求項44の方法。
【請求項47】
パネルが、サイトケラチン19、CEA、ACN9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759およびTFA9133を含む、請求項44の方法。
【請求項48】
パネルが、サイトケラチン19、CA19−9、CEA、CA15−3、CA125、SCC、サイトケラチン18およびProGRPを含む、請求項44の方法。
【請求項49】
パネルが、Pub11597、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Tfa6453およびHic3959を含む、請求項44の方法。
【請求項50】
パネルが、サイトケラチン19、CEA、CA125、SCC、サイトケラチン18、ProGRP、ACN9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133を含む、請求項44の方法。
【請求項51】
段階cが、パネル中の各バイオマーカーの量を、前記バイオマーカーに対する所定のカットオフの数と比較し、および前記比較に基づいて各バイオマーカーに対してスコアを割り当てることを含み、段階dが、段階cにて定量した各バイオマーカーに対する割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出すことを含み、段階eが、段階dにて決定した総スコアを、所定の総スコアの数と比較することを含むみ、ならびに段階fが、段階eにて決定された総スコアに基づいて、前記被験者が肺がんを有するかどうかを決定することを含む、請求項44の方法。
【請求項52】
配列番号1、配列番号3、配列番号4、配列番号5またはその組合せからなる群より選択されるペプチドを含むキット。
【請求項53】
免疫反応性サイクリンE2に対する少なくとも1つの抗体を含むキット。
【請求項54】
a.試験試料において1つ以上の抗原を定量するための、少なくとも1つの抗体を含む試薬(前記抗原は、サイトケラチン8、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CEA、CA125、CA15−3、SCC、CA19−9、proGRP、血清アミロイドA、α−1−抗−トリプシンおよびアポリポタンパク質CIIIである。)、
b.試験試料において、少なくとも1つの抗体を定量するための、1つまたははそれ以上の抗原を含む試薬(前記抗体は、抗−p53、抗−TMP21、抗−NPC1L1C−ドメイン、抗−TMOD1、抗−CAMK1、抗−RGS1、抗−PACSIN1、抗−RCV1、抗−MAPKAPK3、および免疫反応性サイクリンE2に対する少なくとも1つの抗体である。)、
c.ACN9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Tfa6453およびHic3959からなる群から選択される、1つ以上の関心領域を定量するための試薬、ならびに
d.試験試料において定量された、各抗原、抗体および関心領域の量を所定のカットオフに対して統合および比較するため、および前記比較に基づいて定量した、各抗原、抗体および関心領域に対してスコアを割り当てるため、定量した各抗原、抗体および関心領域に対して割り当てられたスコアを統合して総スコアを得るため、総スコアを所定の総スコアと比較するため、および被験者が肺がんを有するかどうか決定することにおける補助として、前記比較を用いるためのアルゴリズム、
を含むキット。
【請求項55】
a.試験試料において1つ以上の抗原を定量するための、少なくとも1つの抗体を含む試薬(前記抗原は、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CA19−9、CEA、CA15−3、CA125、SCC、およびproGRPである。)、
b.ACN9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Pub6453、およびHic3959からなる群から選択される、1つ以上の関心領域を定量するための試薬、ならびに
c.試験試料において定量された、各抗原および関心領域の量を所定のカットオフに対して統合および比較するため、および前記比較に基づいて定量した、各抗原および関心領域に対してスコアを割り当てるため、定量した各抗原および関心領域に対して割り当てられたスコアを統合して総スコアを得るため、総スコアを所定の総スコアと比較するため、および被験者が肺がんを有するかどうか決定することにおける補助として、前記比較を用いるための、1つ以上のアルゴリズム、
を含むキット。
【請求項56】
定量すべき抗原が、サイトケラチン19およびCEAであり、ならびに定量すべき関心領域が、Acn9459、Pub11597、Pub4789およびTfa2759からなる群より選択される、請求項55のキット。
【請求項57】
定量されるべき抗原が、サイトケラチン19およびCEAであり、ならびに定量すべき関心領域が、Acn9459、Pub11597、Pub4789、Tfa2759およびTfa9133からなる群より選択される、請求項55のキット。
【請求項58】
定量されるべき抗原が、サイトケラチン19、CEA、CA125、SCC、サイトケラチン18およびProGRPであり、ならびに定量すべき関心領域が、ACN9459、Pub4789およびTfa2759からなる群より選択される、請求項55のキット。
【請求項59】
a.試験試料において1つ以上の抗原を定量するための、少なくとも1つの抗体を含む試薬(前記抗原は、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CA19−9、CEA、CA15−3、CA125、SCC、およびproGRPである。)、ならびに
b.試験試料において定量された、各抗原の量を所定のカットオフに対して統合および比較するため、および前記比較に基づいて定量した各抗原に対してスコアを割り当てるため、定量した各抗原に対して割り当てられたスコアを統合して総スコアを得るため、総スコアを所定の総スコアと比較するため、および被験者が肺がんを有するかどうか決定することにおける補助として、前記比較を用いるための、1つ以上のアルゴリズム、
を含むキット。
【請求項60】
定量されるべき抗原が、サイトケラチン19、サイトケラチン18、CA19−9、CEA、CA15−3、CA125、SCC、およびproGRPである、請求項56のキット。
【請求項61】
a.1つ以上のバイオマーカーを定量するための試薬(前記バイオマーカーが、ACN9459、Pub11597、Pub4789、TFA2759、TFA9133、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Tfa6453、およびHic3959からなる群から選択される、関心領域である。)、
b.試験試料において定量された、各バイオマーカーの量を、所定のカットオフに対して統合および比較するため、および前記比較に基づいて定量した各バイオマーカーに対してスコアを割り当てるため、定量した各バイオマーカーに対して割り当てられたスコアを統合して総スコアを得るため、総スコアを所定の総スコアと比較するため、および被験者が肺がんを有するかどうか決定することにおける補助として、前記比較を用いるための、1つ以上のアルゴリズム、
を含むキット。
【請求項62】
定量されるべき関心領域が、Pub11597、Pub3743、Pub8606、Pub4487、Pub4861、Pub6798、Tfa6453およびHic3959からなる群から選択される、請求項61のキット。
【請求項63】
配列番号3および配列番号3のアミノ酸配列に対して60%相同性を有するポリペプチドからなる群より選択されるアミノ酸配列を有する単離ポリペプチド。
【請求項64】
配列番号4および配列番号4のアミノ酸配列に対して60%相同性を有するポリペプチドからなる群より選択されるアミノ酸配列を有する単離ポリペプチド。
【請求項65】
配列番号5および配列番号5のアミノ酸配列に対して60%相同性を有するポリペプチドからなる群より選択されるアミノ酸配列を有する単離ポリペプチド。
【請求項66】
a.被験者から少なくとも1つのマーカーを得る段階、
b.前記被験者からのマーカーの量を定量する段階、
c.定量した各マーカーの量を、前記マーカーに対する所定のカットオフの量に対して比較し、および前記比較に基づいて、各マーカーに対してスコアを割り当てる段階、および、
d.段階cにて定量した各マーカーに対する割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
を含む、被験者から得た1つ以上のマーカーをスコア化するための方法。
【請求項67】
マーカーが、バイオマーカー、バイオメトリックパラメーター、またはバイオマーカーとバイオメトリックパラメーターの組合せである、請求項66の方法。
【請求項68】
所定のカットオフが、ROC曲線に基づく、請求項66の方法。
【請求項69】
各マーカーに対するスコアが、マーカーの特異性に基づいて計算される、請求項66の方法。
【請求項70】
被験者の病状を発現させる危険性を決定するための方法であり、
a.被験者から少なくとも1つのマーカーを得る段階、
b.前記被験者からのマーカーの量を定量する段階、
c.定量した各マーカーの量を、前記マーカーに対する所定のいくつかのカットオフの量に対して比較し、および前記比較に基づいて、各マーカーに対してスコアを割り当てる段階、
d.段階cにて定量した各マーカーに対する割り当てられたスコアを統合して、前記被験者に対する総スコアを見つけ出す段階、
e.段階dにて決定された総スコアを、所定の総スコアと比較する段階、ならびに
f.段階eにて決定した総スコアに基づいて、病状を発現させる危険性を前記被験者が有するかどうかを決定する段階、
を含む、方法。
【請求項71】
マーカーが、バイオマーカー、バイオメトリックパラメーター、またはバイオマーカーとバイオメトリックパラメーターの組合せである、請求項70の方法。
【請求項72】
所定のカットオフが、ROC曲線に基づく、請求項70の方法。
【請求項73】
各マーカーに対するスコアが、マーカーの特異性に基づいて計算される、請求項70の方法。

【図1】
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【図2】
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【図3】
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【図4a】
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【図4b】
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【図4c】
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【図4d】
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【図5】
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【公開番号】特開2012−233902(P2012−233902A)
【公開日】平成24年11月29日(2012.11.29)
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願2012−131563(P2012−131563)
【出願日】平成24年6月11日(2012.6.11)
【分割の表示】特願2008−547772(P2008−547772)の分割
【原出願日】平成18年12月21日(2006.12.21)
【出願人】(391008788)アボット・ラボラトリーズ (650)
【氏名又は名称原語表記】ABBOTT LABORATORIES
【Fターム(参考)】