脳腫瘍マーカーおよびその用途
【課題】脳腫瘍に対する新たな治療法、診断学の開発のために悪性脳腫瘍の指標となる脳腫瘍マーカーおよびその用途を提供する。
【解決手段】本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子は、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする。また、脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍の予後を予測することを特徴とする。
【解決手段】本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子は、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする。また、脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍の予後を予測することを特徴とする。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、脳腫瘍の悪性度の指標となりうる脳腫瘍マーカーおよびその用途に関する。
【背景技術】
【０００２】
神経膠腫は原発性脳腫瘍の中で最も頻度の多い腫瘍であり、また悪性神経膠腫は最も予後不良な悪性腫瘍の一つである。最も悪性度の高い神経膠芽腫では生存期間中央値は９〜１２ヶ月にすぎない（非特許文献１及び２）。近年の腫瘍生物学や手術、放射線化学療法の進歩にも拘わらず、生存期間の延長は殆ど認められていない（非特許文献３）。それゆえ新たな診断、治療法に結びつくような新しい分子標的の発見等、腫瘍生物学的な解析が望まれていた。
【０００３】
ＨＥＣＴ２，ＯＳＴはグアニンヌクレオチド交換因子である。グアニンヌクレオチド交換因子は、Ｒｈｏ，Ｒａｃ−１，Ｃｄｃ４２などの低分子量ＧＴＰ結合たんぱく質のレギュレーターであり細胞の増殖、分化、運動などのさまざまな機能を調節する。Ｈｅｃｔ２はMikiら（非特許文献４）により単離された癌遺伝子であり、細胞周期をコントロールし細胞質分裂を調節する（非特許文献5）。一方、Ｏｓｔは Horiiらにより単離された癌遺伝子であり、脳での発現が高く、正常状態では軸索輸送に関与すると考えられている（非特許文献６−８）。
【非特許文献１】Karpeh MS, Kelsen DP, Tepper JE :Cancer of the Stomach. In: Cancer, principles & practice of oncology. 6th ed. Devita VT Jr (ed) Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia,pp 1092-1121, 2001.
【非特許文献２】Stewart LA: Chemotherapy in adult high-grade glioma: a systematic review and meta-analysis of individual patient data from 12 randomized trials. Lancet 359:1011-1018,2002.
【非特許文献３】Maher EA, Furnari FB, Bachoo RM, Rowitch DH, Louis DN, Cavenee WK, DePinho RA: Malignant glioma: genetics and biology of a grave matter. Genes Dev 15:1311-1333, 2001.
【非特許文献４】Miki T, Smith CL, Long JE, Eva A, Fleming TP : Oncogene ect2 is related to regulators of small GTP-binding proteins. Nature 362(6419):462-465, 1993.
【非特許文献５】Tatsumoto T, Xie X, Blumenthal R, Okamoto I, Miki T : Human ECT2 is an exchange factor for Rho GTPases, phosphorylated in G2/M phases, and involved in cytokinesis. J Cell Biol. 147(5):921-928, 1999.
【非特許文献６】Horii Y, Beeler JF, Sakaguchi K, Tachibana M, Miki T: A novel oncogene, ost, encodes a guanine nucleotide exchange factor that potentially links Rho and Rac signaling pathways. EMBO J. 13(20):4776-4786,1994.
【非特許文献７】Lorenzi MV, Castagnino P, Chen Q, Hori Y, Miki T : Distinct expression patterns and transforming properties of multiple isoforms of Ost, an exchange factor for RhoA and Cdc42. Oncogene 18(33):4742-4755,1999
【非特許文献８】Yamanaka R, Blumenthal R, Lorenzi MV, Tatsumoto T, Miki T : Ostip2, a novel oncoprotein that associates with the Rho exchange factor Ost. DNA Cell Biol. 20(7):383-390,2001
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
各癌種に対しては、治療標的遺伝子、マーカー遺伝子の選択は試みられている。しかしながら、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴに関しては、実際の腫瘍サンプルを用いた解析から、治療標的遺伝子、マーカー遺伝子であると述べた報告はない。さらに脳腫瘍は未だ治療法が確立されておらず、新たな診断、治療法に結びつくような新しい分子標的の発見等、腫瘍生物学的な解析が期待されている。
【０００５】
本発明は、以上の事情に鑑みてなされたものであって、脳腫瘍に対する新たな治療法、診断学の開発のために悪性脳腫瘍の指標となる脳腫瘍マーカーおよびその用途を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
上記課題に鑑みて鋭意検討した結果、悪性度の高い神経膠腫において、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴのｍＲＮＡレベルおよびタンパク質レベルの発現の亢進がみられることに着目し、その後細胞生物学的解析によりＨＥＣＴ２，ＯＳＴの発現と悪性神経膠腫細胞の増殖能及び浸潤能との関連が示されたことにより、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴが神経膠腫の悪性化へ関与していることを見出し、本発明を完成するに至った。
【０００７】
本発明の請求項１の発明は、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカーであって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする脳腫瘍マーカーである。
【０００８】
本発明の請求項２の発明は、脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカーであって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍患者の予後を予測することを特徴とする脳腫瘍マーカーである。
【０００９】
本発明の請求項３の発明は、前記ＨＥＣＴ２又はＯＳＴの発現量が、そのｍＲＮＡ又はタンパク質の少なくとも一方の量により測定されることを特徴とする請求項１又は２に記載の脳腫瘍マーカーである。
【００１０】
本発明の請求項４の発明は、請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのｍＲＮＡマーカーであって、ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ又はＯＳＴｍＲＮＡを含むことを特徴とするｍＲＮＡマーカー。
【００１１】
本発明の請求項５の発明は、請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのタンパク質マーカーであって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含むことを特徴とするタンパク質マーカー。
【００１２】
本発明の請求項６の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるオリゴヌクレオチドであって、前記ｍＲＮＡの塩基配列またはその相補塩基配列の一部からなり、前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部分特異的塩基対を形成することを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【００１３】
本発明の請求項７の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプライマーであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプライマー。
【００１４】
本発明の請求項８の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプローブであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプローブ。
【００１５】
本発明の請求項９の発明は、請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するための抗体であって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を認識することを特徴とする抗体。
【００１６】
本発明の請求項１０の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記ｍＲＮＡのｃＤＮＡを定量可能なように増幅するために請求項７記載のプライマーと、検出のため前記増幅産物に対合させる請求項８記載のプローブとを含むことを特徴とするキット。
【００１７】
本発明の請求項１１の発明は、請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、請求項９記載の抗体及び／又はその標識化抗体を含むことを特徴とするキット。
【００１８】
本発明の請求項１２の発明は、以下の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法である：（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドにおける、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００１９】
本発明の請求項１３の発明は、以下の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法である：（ａ）被験者の生体試料から調製されたタンパク質における、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００２０】
本発明の請求項１４の発明は、以下の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含むことを特徴とするＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法である：（ａ）被験物質と、前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーを発現している細胞とを接触させる工程、（ｂ）被験物質を接触させた細胞における前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を測定し、被験物質を接触させない対照細胞における上記に対応する脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量と比較する工程、（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を減少させる被験物質を選択する工程。
【発明の効果】
【００２１】
本発明によれば、悪性脳腫瘍の指標となる脳腫瘍マーカーが提供される。特に、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子、又は、脳腫瘍患者の予後（生存期間）を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子が提供される。また、この脳腫瘍マーカー遺伝子やタンパク質マーカーを使用することによって、腫瘍マーカーとしての診断応用の他に、新規抗癌剤など創薬への応用が可能となる。さらに、脳腫瘍マーカー遺伝子に対するプローブ等を作製することにより、脳腫瘍マーカー遺伝子を検出し、脳腫瘍の診断を広範囲にかつ確実に行うことができる。また、脳腫瘍を抑制する物質のスクリーニングを行い、新規抗癌剤の開発を進展させることができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２２】
以下、本発明について詳細に説明する。
【００２３】
本発明の「脳腫瘍」は、頭蓋内に発生するすべての腫瘍をいう。このような脳腫瘍の中でも、発生頻度の高い代表的なものが神経膠腫であり、これはさらに、星状細胞腫、神経膠芽腫等を含む。脳腫瘍には、この他、下垂体腺腫、神経鞘腫などがある。
【００２４】
本発明におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴはグアニンヌクレオチド交換因子である。グアニンヌクレオチド交換因子は、Ｒｈｏ，Ｒａｃ−１，Ｃｄｃ４２などの低分子量ＧＴＰ結合たんぱく質のレギュレーターであり細胞の増殖、分化、運動などのさまざまな機能を調節する。Ｈｅｃｔ２は癌遺伝子であり、細胞周期をコントロールし細胞質分裂を調節する。一方、Ｏｓｔも癌遺伝子であり、脳での発現が高く、正常状態では軸索輸送に関与すると考えられている。
【００２５】
本発明で使用することができるＨＥＣＴ２，ＯＳＴの起源は特に限定されず、任意の生物に由来する任意の遺伝子を使用することができる。本発明は、任意の起源に由来するＨＥＣＴ２，ＯＳＴを包含する。例えば、哺乳動物から入手できるＨＥＣＴ２，ＯＳＴを使用してもよい。用語「哺乳動物」とは、哺乳類の任意の個体を意味し、大型動物（牛、羊、馬など）、運動動物（犬及び猫を含む）、及び霊長類（旧世界ザル、新世界ザル、類人猿、ヒトなどを含む）などを含む。例えば、ヒトＨＥＣＴ２，ＯＳＴが使用される。本発明で使用するＨＥＣＴ２，ＯＳＴは、例えばＰＣＲなどの当業者に公知の技術を用いて哺乳動物培養細胞などから得たｃＤＮＡでもよい。
【００２６】
本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子は、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする。
【００２７】
また、本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子は、脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍患者の予後を予測することを特徴とする。
【００２８】
本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子を用いて脳腫瘍の判定において、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴの発現量を測定する場合、そのｍＲＮＡを定量してもよく、そのタンパク質を定量してもよい。したがって、ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ又はＯＳＴｍＲＮＡは、本発明の脳腫瘍の遺伝子マーカーを定量するためのｍＲＮＡマーカーとすることができ、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質は、本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのタンパク質マーカーとすることができる。
【００２９】
本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するための前記ｍＲＮＡマーカーを定量する方法としては、細胞内の特定ｍＲＮＡ量を定量できる方法であれば、特に制限されず、例えば、前記ｍＲＮＡマーカーのｍＲＮＡもしくはそのｃＤＮＡの塩基配列またはそれらの相補塩基配列の一部からなるオリゴヌクレオチドであって、前記ｍＲＮＡマーカーのｍＲＮＡまたはｃＤＮＡに部位特異的に結合するオリゴヌクレオチドを含むプライマーやプローブを用いた方法があげられる。前記プライマーやプローブは、前記オリゴヌクレオチドが前記マーカーｍＲＮＡのｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成するものであれば、前記ｍＲＮＡを検出・定量するための様々な修飾がされたものであってよい。さらに、本発明のプローブを固定化させたＤＮＡチップを作製することも可能である。ＤＮＡチップの作製方法は、当業者には公知である。ＤＮＡチップを用いることにより、本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子の発現レベルを検出、測定することができる。
【００３０】
本発明の抗体は、前記のタンパク質マーカーを定量するための抗体であって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を認識することを特徴とする。本発明の抗体はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質に特異的に結合する性質を有することから、前記抗体を利用することによって、被験者の組織内に発現したＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を特異的に検出することができる。
【００３１】
抗体の製造方法は公知であり、本発明の抗体も常法に従って製造することができる。具体的には、本発明の抗体がポリクローナル抗体の場合には、常法に従って大腸菌等で発現し精製したＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を用いて、あるいは常法に従ってこれらＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質の部分アミノ酸配列を有するオリゴペプチドを合成して、家兎等の非ヒト動物に免疫し、該免疫動物の血清から常法に従って得ることが可能である。一方、モノクローナル抗体の場合には、常法に従って大腸菌等で発現し精製したＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質またはこれらタンパク質の部分アミノ酸配列を有するオリゴペプチドをマウス等の非ヒト動物に免疫し、得られた脾臓細胞と骨髄腫細胞とを細胞融合させて調製したハイブリドーマ細胞の中から得ることができる。該抗体は、適当な標識によりラベル（例えば、酵素標識、放射性標識、蛍光標識等）されていてもよいし、ビオチン等により適当に修飾されていてもよい。それゆえ、該抗体には、標識物質によって標識化された抗体も含まれる。
【００３２】
本発明のキットは、前記のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記ｍＲＮＡのｃＤＮＡを定量可能なように増幅するために前記のプライマーと、検出のため前記増幅産物に対合させる前記のプローブとを含むことを特徴とする。
【００３３】
さらに、本発明のキットは、前記のタンパク質マーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記の抗体及び／又はその標識化抗体を含むことを特徴とする。この診断キットは、抗体や標識化抗体を液相中に含むものであってもよく、あるいは抗体や標識化抗体を固相担体に結合したものであってもよい。さらにこの診断キットは、例えば標識化抗体の標識が酵素の場合にはその基質を含むものであってもよく、固相担体を含むものの場合には、固相への非結合分子を洗浄除去するための溶液を含むものであってもよい。このようなキットは、被検成分の種類に応じて各種のものが市販されており、この発明の診断キットも、この発明によって提供される抗体及び／又は標識化抗体を用いることを除き、公知公用のキットに用いられている各要素によって構成することができる。
【００３４】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする：（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドにおける、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００３５】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法において、「被験者」は、例えばＭＲＩ検査等によって脳腫瘍の疑いがあると診察された患者であり、その「生体試料」とは患者脳からの切除組織あるいは血液等である。評価対象の生体試料は、遺伝子マーカーを含む任意の試料であり得る。患者脳からの切除組織あるいは血液等から常法に従って、生体試料からＲＮＡを調製することができる。また、患者脳からの切除組織あるいは血液等から常法に従って、該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドを調製することができる。例えば、被験者の細胞から単離したｍＲＮＡを鋳型として、ｃＤＮＡを合成し、ＰＣＲ増幅する。その際に、標識ｄＮＴＰを取り込ませて標識ｃＤＮＡとすることができる。
【００３６】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、前記生体試料における脳腫瘍マーカー遺伝子の発現レベルを検出し、測定することによって実施される。本発明の診断方法により、脳腫瘍の悪性度の判定、或いは、脳腫瘍患者の生存期間の予後予測を行うことが可能である。健常者の生体試料におけるＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を基準とし、被験者の生体試料における前記脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量が前記基準より高いと悪性脳腫瘍とする。具体的には、本発明の検出方法は、ＲＴ−ＰＣＲ法、ノーザンブロット法、ＤＮＡマイクロアレイ解析法、ｉｎ ｓｉｔｕ ハイブリダイゼーション解析法などの公知の方法により前記脳腫瘍の遺伝子マーカーの発現量を測定する。このとき、本発明のプローブやプライマーを適宜用いることができる。
【００３７】
さらに、本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする：（ａ）被験者の生体試料から調整されるタンパク質における、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００３８】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、前記生体試料における脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現レベルを検出し、測定することによって実施される。本発明の診断方法により、脳腫瘍の悪性度の判定、或いは、脳腫瘍患者の生存期間の予後予測を行うことが可能である。健常者の生体試料におけるＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を基準とし、被験者の生体試料における前記脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量が前記基準より高いと悪性脳腫瘍とする。具体的には、公知の方法に基づいて、患者の組織の一部を採取し、そこから常法に従ってタンパク質を調製する。その後、例えば、ウェスタンブロット法、ＥＬＩＳＡ法、蛍光抗体法など公知の検出方法に基づいて、脳腫瘍マーカーの発現量を検出することができる。このとき、後述する抗体を適宜用いることができる。
【００３９】
本発明のＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法は、以下の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含むことを特徴とする：（ａ）被験物質と、前記脳腫瘍マーカーを発現している細胞とを接触させる工程、（ｂ）被験物質を接触させた細胞における前記脳腫瘍マーカーの発現量を測定し、被験物質を接触させない対照細胞における上記に対応する脳腫瘍マーカーの発現量と比較する工程、（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、脳腫瘍マーカーの発現量を減少させる被験物質を選択する工程。
【００４０】
本発明のＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法は、前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を低下させる物質を探索することによって、悪性脳腫瘍を抑制する候補物質を提供するものである。
【００４１】
本発明のスクリーニングに用いられる細胞としては、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーを発現する培養細胞全般を挙げることができる。培養細胞においてこれら脳腫瘍マーカーが発現しているか否かは、公知のウェスタンブロット法などにて検出することにより、容易に確認することができる。培養細胞としては、具体的には、例えば癌患者より単離、調製した生体組織や血球由来の細胞、または本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子のいずれかを導入した細胞等を挙げることができる。
【００４２】
また、本発明のスクリーニング方法に際して、被験物質と細胞とを接触させる条件は、特に制限されないが、該細胞が死滅せず且つ本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーを発現できる培養条件（温度、ｐＨ、培地組成など）を選択するのが好ましい。
【００４３】
以下に本発明の実施例によって、本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例により何ら制限されるものではない。なお、以下の実施例１〜３において使用される細胞培養、実験方法等は次の通りである。
【００４４】
（細胞培養）
神経膠腫細胞株（Ｕ２５１、Ｔ９８Ｇ、ＯＮ１２、ＮＰ３、ＧＩ−１）を、１０％非働化ウシ胎児血清を添加したイーグル最小必須培地（ＭＥＭ）（Nissui Pharmacoceutical Inc.，Tokyo, Japan）を用いて、３７℃、５％ＣＯ２インキュベーターで培養した。
【００４５】
（対象症例）
新潟大学脳研究所脳神経外科にて手術摘出された神経膠腫４７例（ＷＨＯ グレードII：９例、III：１１例、ＩＶ：２７例、平均年齢４４歳）を対象とした（表１）。高悪性度のものは術後、放射線治療（腫瘍局所４０Ｇｙ、全脳照射２０Ｇｙ）並びにニトロソウレアを中心とした化学療法を施行した。生存期間は診断確定日より患者の死亡日もしくは最終受診日とした。組織診断はＷＨＯ脳腫瘍組織分類（Kleihues P, Louis DN, Scheithauer BW, Rorke LB, Reifenberger G, Burger PC, Cavenee WK: The WHO classification of tumors of the nervous system. J Neuropathol Exp Neurol 61:215-225, 2002）に基づいて行った。なお、本明細書に記載の実験は、新潟大学倫理委員会の規則に則り、全ての対象者からインフォームドコンセントを得ている。
【００４６】
（免疫組織化学染色）
５ミクロン切片を作成し、脱パラフィン化の後に１０ｍＭクエン酸ナトリウム（ｐＨ６．０）中にて１２１℃、１０分間加温した。０．３％Ｈ２Ｏ２にて内因性ペルオキシダーゼ活性の阻害を行った。１０％ヤギ血清にてブロッキング後、抗ＨＥＣＴ２ウサギポリクローナル抗体，抗ＯＳＴウサギポリクローナル抗体（１：５０；Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA）と４℃で12時間反応させた。洗浄後、アビジン-ビオチン-ペルオキシダーゼシステム（Vectasin elite ABC kit, Vector Labs, Burlingame, CA）を反応させ、０．０１％３，３−ジアミノベンジジン（ＤＡＢ）（Sigma）とＰＢＳ０．０１％過酸化水素水にて発色させた。
【００４７】
（ＲＮＡ分離と定量ＰＣＲ）
試料４７例全例でＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ，ＯＳＴｍＲＮＡの発現を検討した。ＲＮＡは凍結組織よりＩｓｏｇｅｎ（Nippongene, Toyama, Japan）を用いて抽出した。第１鎖ｃＤＮＡは試料から得られたｍＲＮＡから、オリゴ（ｄＴ）プライマー、逆転写酵素（Super Script II RNase H, Life Technologies, Grand Island, NY）を用いて作成した。定量ＰＣＲはライトサイクラー（Idaho Technology, Salt Lake City, UT）によるリアルタイムＰＣＲで行った。ＰＣＲ試薬の組成は１×ライトサイクラーＤＮＡマスターＳＹＢＲグリーンＩ（Rosche Moleculer Biochemicals, Mannheim, Germany）、各プライマー０．５μＭ、３ｍＭ ＭｇＣｌ２、２μｌ ｃＤＮＡテンプレートにて行った。ＰＣＲは９５℃１０分間で変性後、９５℃１５分、５５℃５分、７２℃１０分の各サイクルを４０サイクル行った。反応産物はＰＣＲの融解サイクルを経て各サイクルで蛍光強度を測定した。標準化曲線はＨＥＣＴ２プラスミドＤＮＡ，ＯＳＴ プラスミドＤＮＡ（Dr．Toru MIKI，NIHから供与）から得られたＨＥＣＴ２ｃＤＮＡ，ＯＳＴｃＤＮＡの一連の段階的１０倍希釈溶液により作成した。ＰＣＲ増幅のためのプライマーの塩基配列は以下の通りである。ＨＥＣＴ２センス鎖：5'-CAAATGGATGCCCGAGCTG-3';ＨＥＣＴ２アンチセンス鎖：5'-GGTGGAAATGGTGACACGTCTG-3'；ＯＳＴセンス鎖：5'-GCCTCACAACCTGTGGACAA-3';ＯＳＴアンチセンス鎖：5'-ATCTTGGTTGAGGATGGATTCG-3'。
【００４８】
（ＲＮＡサイレンシングによる細胞増殖アッセイ）
ヒトＨＥＣＴ２，ＯＳＴに対する特異的なｓｉＲＮＡはＡＭＢＩＯＮ（Tokyo,japan）より購入した。ＨＥＣＴ２（ＡＭＢＩＯＮ，＃２６０７０），ＯＳＴ（ＡＭＢＩＯＮ，＃３２０９８），ＡＲＫ５（ＡＭＢＩＯＮ，＃９６４），非サイレンシングコントロールおよびＭＡＰＫ１（ＱＩＡＧＥＮ）を含めたこれらトランスフェクションにはＲＮＡｉ ヒト／マウスコントロールキット （Qiagen, Tokyo)を用い、プロトコールに従って実験を行った。細胞株を９６ウェルプレート（１００μｌ／ｗｅｌｌ）に培養し８０％コンフレントに達した時点で培地を交換（７５μｌ／ｗｅｌｌ）し、ＳｉＲＮＡ１００ｎＭ／２５μｌを混和、トランスフェクションさせた。４８時間の培養後、テトラカラーワン（Seikagaku CO.,Tokyo）を用いて発色し、ＭＴＴアッセイにより生存度を評価した。これらの値は非サイレンシングｓｉＲＮＡによるネガティブコントロールと比較検討した。全て増殖試験は３回以上行い、結果は平均±標準偏差で示した。
【００４９】
（マトリゲルによる細胞浸潤アッセイ）
細胞浸潤アッセイにはマトリゲル（Matrigel）（Becton-Dickinson, Tokyo）を購入し、プロトコールに従って実験を行った。神経膠腫細胞株（Ｕ２５１、Ｔ９８Ｇ）は前述のごとくコントロールを含めてｓｉＲＮＡトランスフェクションを行い24時間後、細胞解離溶液 (Sigma)に浮遊させ、洗浄後使用した。ＭＥＭ１０％ＦＢＳを満たしたウェル（２４ウェルプレート）にマトリゲルチャンバー（底面がマトリゲルで被膜された８μｍ多孔膜よりなる）を静置して充分水和させた後、チャンバーに細胞を播き、２４時間培養した。マトリゲルチャンバー内の細胞を払拭除去し、浸潤して多孔膜裏面に浸潤付着した細胞をギムザ染色液にて染色し、光顕２００倍で１０視野の細胞数を評価した。結果はコントロールとの比率で表し、平均±標準偏差で示した。
【００５０】
（統計学的解析）
神経膠腫の各グループ間におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴの発現はＭａｎｎ−ＷｈｉｔｎｅｙのＵ検定にて評価し、ｐ＜０．０５を統計学的に有意と判定した。生存曲線はＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ法にて表現し、２群間の検定にはＬｏｇ−ｒａｎｋ検定で評価した。
【実施例１】
【００５１】
（神経膠腫組織におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴ発現の免疫組織化学的検討）
神経膠腫組織におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴの局在を調べる為に免疫組織染色を行った。図１に示すように、ＨＥＣＴ２（Ａ）及び ＯＳＴ（Ｂ）のいずれにおいてもＨＥＣＴ２，ＯＳＴは全ての細胞質あるいは核で症例によって様々な程度に染色された。次いで、任意の３視野での各タンパク質の発現強度を０−３、および発現面積を０，０．２５，０．５，０．７５，１．０と表示し、それらの積の平均値を求め発現レベルとした。発現レベルからポジティブとネガティブの２群に分け、各群の生存曲線を描き、Logrank 検定にて２群間の有意差を検討した。染色強度の高いものほど生存期間が短く、２群間に有意差を認めた(Ａ：ＨＥＣＴ２，Ｐ＝０．０２８， Ｂ：ＯＳＴ，Ｐ＜０．０５ Logrank検定 図２)。
【実施例２】
【００５２】
（神経膠腫におけるＨＥＣＴ２遺伝子，ＯＳＴ遺伝子発現と予後の相関）
神経膠腫組織中のＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ，ＯＳＴｍＲＮＡの発現を定量リアルタイムＰＣＲにて測定した。ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ，ＯＳＴｍＲＮＡの発現によって症例を 高発現群、低発現群に分けて生存曲線で比較したところ、高発現群において生存期間が短いことが認められた（Ａ：ＨＥＣＴ２，Ｐ＜０．００１， Ｂ：ＯＳＴ，Ｐ＝０．０１５ Logrank検定 図３）。
【実施例３】
【００５３】
（ＨＥＣＴ２，ＯＳＴによる神経膠腫細胞株(Ｕ２５１)の増殖能と浸潤能の抑制）
ＨＥＣＴ２，ＯＳＴの過剰発現はこれまでの検討から神経膠腫の生物学的悪性度を反映していたと考えられる。そこで内因性のＨＥＣＴ２，ＯＳＴを抑制することにより神経膠腫細胞株の増殖能や浸潤能を抑制することができるかどうか確かめるため、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴに特異的なｓｉＲＮＡを導入し、ｍＲＮＡを下方制御することでＨＥＣＴ２タンパク質，ＯＳＴタンパク質の発現を押さえて細胞増殖能と浸潤能について検討した。ＨＥＣＴ２（Ｅ０５３１，２６０７０），ＯＳＴ（Ｍ４７７）に特異的なｓｉＲＮＡを導入し、ｍＲＮＡが下方制御されることが確認された(Ｐ＜０．０１，図４Ａ)。ｓｉＲＮＡ導入によるＵ２５１細胞株の細胞増殖試験ではＨＥＣＴ２（Ｅ０５３）ｓｉＲＮＡ，ＯＳＴ（Ｍ４７７）ｓｉＲＮＡを導入することで増殖抑制効果が見られた(Ｐ＜０．０１，図４Ｂ)。
【００５４】
また、Ｕ２５１において抗−ＨＥＣＴ２ｓｉＲＮＡ，抗−ＯＳＴｓｉＲＮＡを導入し、マトリゲルマトリックスに対する細胞浸潤能を検討したところ、コントロールｓｉＲＮＡでは全く影響がなかったが、ＨＥＣＴ２（２６０７０，Ｅ０５３）ｓｉＲＮＡ，ＯＳＴ（Ｍ４７７）ｓｉＲＮＡ導入では著しい浸潤抑制効果が認められた（Ｐ＜０．０１，図４Ｃ）。
【図面の簡単な説明】
【００５５】
【図１】ＨＥＣＴ２（Ａ），ＯＳＴ（Ｂ）の免疫組織化学染色の結果を示す顕微鏡写真である（拡大率×200）。
【図２】免疫組織化学染色によるＨＥＣＴ２タンパク質（Ａ），ＯＳＴタンパク質（Ｂ）の発現強度と生存期間の相関を示すグラフである。
【図３】ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ（Ａ），ＯＳＴｍＲＮＡ（Ｂ）発現量と生命予後の相関を示す図である。
【図４】（Ａ）抗−ＨＥＣＴ２ｓｉＲＮＡ,抗−ＯＳＴｓｉＲＮＡによるＵ２５１神経膠腫細胞株におけるＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ,ＯＳＴｍＲＮＡの発現抑制を示す図である。
【００５６】
（Ｂ）ＨＥＣＴ２，ＯＳＴ遺伝子サイレンシング下における細胞増殖能試験の結果を示す図である。
【００５７】
（Ｃ）ＨＥＣＴ２，ＯＳＴ遺伝子サイレンシング下におけるマトリゲルマトリックスに対する細胞湿潤能試験の結果を示す図である。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、脳腫瘍の悪性度の指標となりうる脳腫瘍マーカーおよびその用途に関する。
【背景技術】
【０００２】
神経膠腫は原発性脳腫瘍の中で最も頻度の多い腫瘍であり、また悪性神経膠腫は最も予後不良な悪性腫瘍の一つである。最も悪性度の高い神経膠芽腫では生存期間中央値は９〜１２ヶ月にすぎない（非特許文献１及び２）。近年の腫瘍生物学や手術、放射線化学療法の進歩にも拘わらず、生存期間の延長は殆ど認められていない（非特許文献３）。それゆえ新たな診断、治療法に結びつくような新しい分子標的の発見等、腫瘍生物学的な解析が望まれていた。
【０００３】
ＨＥＣＴ２，ＯＳＴはグアニンヌクレオチド交換因子である。グアニンヌクレオチド交換因子は、Ｒｈｏ，Ｒａｃ−１，Ｃｄｃ４２などの低分子量ＧＴＰ結合たんぱく質のレギュレーターであり細胞の増殖、分化、運動などのさまざまな機能を調節する。Ｈｅｃｔ２はMikiら（非特許文献４）により単離された癌遺伝子であり、細胞周期をコントロールし細胞質分裂を調節する（非特許文献5）。一方、Ｏｓｔは Horiiらにより単離された癌遺伝子であり、脳での発現が高く、正常状態では軸索輸送に関与すると考えられている（非特許文献６−８）。
【非特許文献１】Karpeh MS, Kelsen DP, Tepper JE :Cancer of the Stomach. In: Cancer, principles & practice of oncology. 6th ed. Devita VT Jr (ed) Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia,pp 1092-1121, 2001.
【非特許文献２】Stewart LA: Chemotherapy in adult high-grade glioma: a systematic review and meta-analysis of individual patient data from 12 randomized trials. Lancet 359:1011-1018,2002.
【非特許文献３】Maher EA, Furnari FB, Bachoo RM, Rowitch DH, Louis DN, Cavenee WK, DePinho RA: Malignant glioma: genetics and biology of a grave matter. Genes Dev 15:1311-1333, 2001.
【非特許文献４】Miki T, Smith CL, Long JE, Eva A, Fleming TP : Oncogene ect2 is related to regulators of small GTP-binding proteins. Nature 362(6419):462-465, 1993.
【非特許文献５】Tatsumoto T, Xie X, Blumenthal R, Okamoto I, Miki T : Human ECT2 is an exchange factor for Rho GTPases, phosphorylated in G2/M phases, and involved in cytokinesis. J Cell Biol. 147(5):921-928, 1999.
【非特許文献６】Horii Y, Beeler JF, Sakaguchi K, Tachibana M, Miki T: A novel oncogene, ost, encodes a guanine nucleotide exchange factor that potentially links Rho and Rac signaling pathways. EMBO J. 13(20):4776-4786,1994.
【非特許文献７】Lorenzi MV, Castagnino P, Chen Q, Hori Y, Miki T : Distinct expression patterns and transforming properties of multiple isoforms of Ost, an exchange factor for RhoA and Cdc42. Oncogene 18(33):4742-4755,1999
【非特許文献８】Yamanaka R, Blumenthal R, Lorenzi MV, Tatsumoto T, Miki T : Ostip2, a novel oncoprotein that associates with the Rho exchange factor Ost. DNA Cell Biol. 20(7):383-390,2001
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
各癌種に対しては、治療標的遺伝子、マーカー遺伝子の選択は試みられている。しかしながら、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴに関しては、実際の腫瘍サンプルを用いた解析から、治療標的遺伝子、マーカー遺伝子であると述べた報告はない。さらに脳腫瘍は未だ治療法が確立されておらず、新たな診断、治療法に結びつくような新しい分子標的の発見等、腫瘍生物学的な解析が期待されている。
【０００５】
本発明は、以上の事情に鑑みてなされたものであって、脳腫瘍に対する新たな治療法、診断学の開発のために悪性脳腫瘍の指標となる脳腫瘍マーカーおよびその用途を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
上記課題に鑑みて鋭意検討した結果、悪性度の高い神経膠腫において、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴのｍＲＮＡレベルおよびタンパク質レベルの発現の亢進がみられることに着目し、その後細胞生物学的解析によりＨＥＣＴ２，ＯＳＴの発現と悪性神経膠腫細胞の増殖能及び浸潤能との関連が示されたことにより、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴが神経膠腫の悪性化へ関与していることを見出し、本発明を完成するに至った。
【０００７】
本発明の請求項１の発明は、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカーであって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする脳腫瘍マーカーである。
【０００８】
本発明の請求項２の発明は、脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカーであって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍患者の予後を予測することを特徴とする脳腫瘍マーカーである。
【０００９】
本発明の請求項３の発明は、前記ＨＥＣＴ２又はＯＳＴの発現量が、そのｍＲＮＡ又はタンパク質の少なくとも一方の量により測定されることを特徴とする請求項１又は２に記載の脳腫瘍マーカーである。
【００１０】
本発明の請求項４の発明は、請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのｍＲＮＡマーカーであって、ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ又はＯＳＴｍＲＮＡを含むことを特徴とするｍＲＮＡマーカー。
【００１１】
本発明の請求項５の発明は、請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのタンパク質マーカーであって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含むことを特徴とするタンパク質マーカー。
【００１２】
本発明の請求項６の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるオリゴヌクレオチドであって、前記ｍＲＮＡの塩基配列またはその相補塩基配列の一部からなり、前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部分特異的塩基対を形成することを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【００１３】
本発明の請求項７の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプライマーであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプライマー。
【００１４】
本発明の請求項８の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプローブであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプローブ。
【００１５】
本発明の請求項９の発明は、請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するための抗体であって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を認識することを特徴とする抗体。
【００１６】
本発明の請求項１０の発明は、請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記ｍＲＮＡのｃＤＮＡを定量可能なように増幅するために請求項７記載のプライマーと、検出のため前記増幅産物に対合させる請求項８記載のプローブとを含むことを特徴とするキット。
【００１７】
本発明の請求項１１の発明は、請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、請求項９記載の抗体及び／又はその標識化抗体を含むことを特徴とするキット。
【００１８】
本発明の請求項１２の発明は、以下の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法である：（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドにおける、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００１９】
本発明の請求項１３の発明は、以下の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法である：（ａ）被験者の生体試料から調製されたタンパク質における、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００２０】
本発明の請求項１４の発明は、以下の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含むことを特徴とするＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法である：（ａ）被験物質と、前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーを発現している細胞とを接触させる工程、（ｂ）被験物質を接触させた細胞における前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を測定し、被験物質を接触させない対照細胞における上記に対応する脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量と比較する工程、（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を減少させる被験物質を選択する工程。
【発明の効果】
【００２１】
本発明によれば、悪性脳腫瘍の指標となる脳腫瘍マーカーが提供される。特に、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子、又は、脳腫瘍患者の予後（生存期間）を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子が提供される。また、この脳腫瘍マーカー遺伝子やタンパク質マーカーを使用することによって、腫瘍マーカーとしての診断応用の他に、新規抗癌剤など創薬への応用が可能となる。さらに、脳腫瘍マーカー遺伝子に対するプローブ等を作製することにより、脳腫瘍マーカー遺伝子を検出し、脳腫瘍の診断を広範囲にかつ確実に行うことができる。また、脳腫瘍を抑制する物質のスクリーニングを行い、新規抗癌剤の開発を進展させることができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２２】
以下、本発明について詳細に説明する。
【００２３】
本発明の「脳腫瘍」は、頭蓋内に発生するすべての腫瘍をいう。このような脳腫瘍の中でも、発生頻度の高い代表的なものが神経膠腫であり、これはさらに、星状細胞腫、神経膠芽腫等を含む。脳腫瘍には、この他、下垂体腺腫、神経鞘腫などがある。
【００２４】
本発明におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴはグアニンヌクレオチド交換因子である。グアニンヌクレオチド交換因子は、Ｒｈｏ，Ｒａｃ−１，Ｃｄｃ４２などの低分子量ＧＴＰ結合たんぱく質のレギュレーターであり細胞の増殖、分化、運動などのさまざまな機能を調節する。Ｈｅｃｔ２は癌遺伝子であり、細胞周期をコントロールし細胞質分裂を調節する。一方、Ｏｓｔも癌遺伝子であり、脳での発現が高く、正常状態では軸索輸送に関与すると考えられている。
【００２５】
本発明で使用することができるＨＥＣＴ２，ＯＳＴの起源は特に限定されず、任意の生物に由来する任意の遺伝子を使用することができる。本発明は、任意の起源に由来するＨＥＣＴ２，ＯＳＴを包含する。例えば、哺乳動物から入手できるＨＥＣＴ２，ＯＳＴを使用してもよい。用語「哺乳動物」とは、哺乳類の任意の個体を意味し、大型動物（牛、羊、馬など）、運動動物（犬及び猫を含む）、及び霊長類（旧世界ザル、新世界ザル、類人猿、ヒトなどを含む）などを含む。例えば、ヒトＨＥＣＴ２，ＯＳＴが使用される。本発明で使用するＨＥＣＴ２，ＯＳＴは、例えばＰＣＲなどの当業者に公知の技術を用いて哺乳動物培養細胞などから得たｃＤＮＡでもよい。
【００２６】
本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子は、脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする。
【００２７】
また、本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子は、脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍患者の予後を予測することを特徴とする。
【００２８】
本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子を用いて脳腫瘍の判定において、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴの発現量を測定する場合、そのｍＲＮＡを定量してもよく、そのタンパク質を定量してもよい。したがって、ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ又はＯＳＴｍＲＮＡは、本発明の脳腫瘍の遺伝子マーカーを定量するためのｍＲＮＡマーカーとすることができ、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質は、本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのタンパク質マーカーとすることができる。
【００２９】
本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するための前記ｍＲＮＡマーカーを定量する方法としては、細胞内の特定ｍＲＮＡ量を定量できる方法であれば、特に制限されず、例えば、前記ｍＲＮＡマーカーのｍＲＮＡもしくはそのｃＤＮＡの塩基配列またはそれらの相補塩基配列の一部からなるオリゴヌクレオチドであって、前記ｍＲＮＡマーカーのｍＲＮＡまたはｃＤＮＡに部位特異的に結合するオリゴヌクレオチドを含むプライマーやプローブを用いた方法があげられる。前記プライマーやプローブは、前記オリゴヌクレオチドが前記マーカーｍＲＮＡのｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成するものであれば、前記ｍＲＮＡを検出・定量するための様々な修飾がされたものであってよい。さらに、本発明のプローブを固定化させたＤＮＡチップを作製することも可能である。ＤＮＡチップの作製方法は、当業者には公知である。ＤＮＡチップを用いることにより、本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子の発現レベルを検出、測定することができる。
【００３０】
本発明の抗体は、前記のタンパク質マーカーを定量するための抗体であって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を認識することを特徴とする。本発明の抗体はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質に特異的に結合する性質を有することから、前記抗体を利用することによって、被験者の組織内に発現したＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を特異的に検出することができる。
【００３１】
抗体の製造方法は公知であり、本発明の抗体も常法に従って製造することができる。具体的には、本発明の抗体がポリクローナル抗体の場合には、常法に従って大腸菌等で発現し精製したＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を用いて、あるいは常法に従ってこれらＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質の部分アミノ酸配列を有するオリゴペプチドを合成して、家兎等の非ヒト動物に免疫し、該免疫動物の血清から常法に従って得ることが可能である。一方、モノクローナル抗体の場合には、常法に従って大腸菌等で発現し精製したＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質またはこれらタンパク質の部分アミノ酸配列を有するオリゴペプチドをマウス等の非ヒト動物に免疫し、得られた脾臓細胞と骨髄腫細胞とを細胞融合させて調製したハイブリドーマ細胞の中から得ることができる。該抗体は、適当な標識によりラベル（例えば、酵素標識、放射性標識、蛍光標識等）されていてもよいし、ビオチン等により適当に修飾されていてもよい。それゆえ、該抗体には、標識物質によって標識化された抗体も含まれる。
【００３２】
本発明のキットは、前記のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記ｍＲＮＡのｃＤＮＡを定量可能なように増幅するために前記のプライマーと、検出のため前記増幅産物に対合させる前記のプローブとを含むことを特徴とする。
【００３３】
さらに、本発明のキットは、前記のタンパク質マーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記の抗体及び／又はその標識化抗体を含むことを特徴とする。この診断キットは、抗体や標識化抗体を液相中に含むものであってもよく、あるいは抗体や標識化抗体を固相担体に結合したものであってもよい。さらにこの診断キットは、例えば標識化抗体の標識が酵素の場合にはその基質を含むものであってもよく、固相担体を含むものの場合には、固相への非結合分子を洗浄除去するための溶液を含むものであってもよい。このようなキットは、被検成分の種類に応じて各種のものが市販されており、この発明の診断キットも、この発明によって提供される抗体及び／又は標識化抗体を用いることを除き、公知公用のキットに用いられている各要素によって構成することができる。
【００３４】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする：（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドにおける、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００３５】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法において、「被験者」は、例えばＭＲＩ検査等によって脳腫瘍の疑いがあると診察された患者であり、その「生体試料」とは患者脳からの切除組織あるいは血液等である。評価対象の生体試料は、遺伝子マーカーを含む任意の試料であり得る。患者脳からの切除組織あるいは血液等から常法に従って、生体試料からＲＮＡを調製することができる。また、患者脳からの切除組織あるいは血液等から常法に従って、該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドを調製することができる。例えば、被験者の細胞から単離したｍＲＮＡを鋳型として、ｃＤＮＡを合成し、ＰＣＲ増幅する。その際に、標識ｄＮＴＰを取り込ませて標識ｃＤＮＡとすることができる。
【００３６】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、前記生体試料における脳腫瘍マーカー遺伝子の発現レベルを検出し、測定することによって実施される。本発明の診断方法により、脳腫瘍の悪性度の判定、或いは、脳腫瘍患者の生存期間の予後予測を行うことが可能である。健常者の生体試料におけるＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を基準とし、被験者の生体試料における前記脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量が前記基準より高いと悪性脳腫瘍とする。具体的には、本発明の検出方法は、ＲＴ−ＰＣＲ法、ノーザンブロット法、ＤＮＡマイクロアレイ解析法、ｉｎ ｓｉｔｕ ハイブリダイゼーション解析法などの公知の方法により前記脳腫瘍の遺伝子マーカーの発現量を測定する。このとき、本発明のプローブやプライマーを適宜用いることができる。
【００３７】
さらに、本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする：（ａ）被験者の生体試料から調整されるタンパク質における、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を測定する工程、（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【００３８】
本発明の悪性脳腫瘍の診断方法は、前記生体試料における脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現レベルを検出し、測定することによって実施される。本発明の診断方法により、脳腫瘍の悪性度の判定、或いは、脳腫瘍患者の生存期間の予後予測を行うことが可能である。健常者の生体試料におけるＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を基準とし、被験者の生体試料における前記脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量が前記基準より高いと悪性脳腫瘍とする。具体的には、公知の方法に基づいて、患者の組織の一部を採取し、そこから常法に従ってタンパク質を調製する。その後、例えば、ウェスタンブロット法、ＥＬＩＳＡ法、蛍光抗体法など公知の検出方法に基づいて、脳腫瘍マーカーの発現量を検出することができる。このとき、後述する抗体を適宜用いることができる。
【００３９】
本発明のＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法は、以下の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含むことを特徴とする：（ａ）被験物質と、前記脳腫瘍マーカーを発現している細胞とを接触させる工程、（ｂ）被験物質を接触させた細胞における前記脳腫瘍マーカーの発現量を測定し、被験物質を接触させない対照細胞における上記に対応する脳腫瘍マーカーの発現量と比較する工程、（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、脳腫瘍マーカーの発現量を減少させる被験物質を選択する工程。
【００４０】
本発明のＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法は、前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を低下させる物質を探索することによって、悪性脳腫瘍を抑制する候補物質を提供するものである。
【００４１】
本発明のスクリーニングに用いられる細胞としては、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーを発現する培養細胞全般を挙げることができる。培養細胞においてこれら脳腫瘍マーカーが発現しているか否かは、公知のウェスタンブロット法などにて検出することにより、容易に確認することができる。培養細胞としては、具体的には、例えば癌患者より単離、調製した生体組織や血球由来の細胞、または本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子のいずれかを導入した細胞等を挙げることができる。
【００４２】
また、本発明のスクリーニング方法に際して、被験物質と細胞とを接触させる条件は、特に制限されないが、該細胞が死滅せず且つ本発明の脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーを発現できる培養条件（温度、ｐＨ、培地組成など）を選択するのが好ましい。
【００４３】
以下に本発明の実施例によって、本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例により何ら制限されるものではない。なお、以下の実施例１〜３において使用される細胞培養、実験方法等は次の通りである。
【００４４】
（細胞培養）
神経膠腫細胞株（Ｕ２５１、Ｔ９８Ｇ、ＯＮ１２、ＮＰ３、ＧＩ−１）を、１０％非働化ウシ胎児血清を添加したイーグル最小必須培地（ＭＥＭ）（Nissui Pharmacoceutical Inc.，Tokyo, Japan）を用いて、３７℃、５％ＣＯ２インキュベーターで培養した。
【００４５】
（対象症例）
新潟大学脳研究所脳神経外科にて手術摘出された神経膠腫４７例（ＷＨＯ グレードII：９例、III：１１例、ＩＶ：２７例、平均年齢４４歳）を対象とした（表１）。高悪性度のものは術後、放射線治療（腫瘍局所４０Ｇｙ、全脳照射２０Ｇｙ）並びにニトロソウレアを中心とした化学療法を施行した。生存期間は診断確定日より患者の死亡日もしくは最終受診日とした。組織診断はＷＨＯ脳腫瘍組織分類（Kleihues P, Louis DN, Scheithauer BW, Rorke LB, Reifenberger G, Burger PC, Cavenee WK: The WHO classification of tumors of the nervous system. J Neuropathol Exp Neurol 61:215-225, 2002）に基づいて行った。なお、本明細書に記載の実験は、新潟大学倫理委員会の規則に則り、全ての対象者からインフォームドコンセントを得ている。
【００４６】
（免疫組織化学染色）
５ミクロン切片を作成し、脱パラフィン化の後に１０ｍＭクエン酸ナトリウム（ｐＨ６．０）中にて１２１℃、１０分間加温した。０．３％Ｈ２Ｏ２にて内因性ペルオキシダーゼ活性の阻害を行った。１０％ヤギ血清にてブロッキング後、抗ＨＥＣＴ２ウサギポリクローナル抗体，抗ＯＳＴウサギポリクローナル抗体（１：５０；Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA）と４℃で12時間反応させた。洗浄後、アビジン-ビオチン-ペルオキシダーゼシステム（Vectasin elite ABC kit, Vector Labs, Burlingame, CA）を反応させ、０．０１％３，３−ジアミノベンジジン（ＤＡＢ）（Sigma）とＰＢＳ０．０１％過酸化水素水にて発色させた。
【００４７】
（ＲＮＡ分離と定量ＰＣＲ）
試料４７例全例でＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ，ＯＳＴｍＲＮＡの発現を検討した。ＲＮＡは凍結組織よりＩｓｏｇｅｎ（Nippongene, Toyama, Japan）を用いて抽出した。第１鎖ｃＤＮＡは試料から得られたｍＲＮＡから、オリゴ（ｄＴ）プライマー、逆転写酵素（Super Script II RNase H, Life Technologies, Grand Island, NY）を用いて作成した。定量ＰＣＲはライトサイクラー（Idaho Technology, Salt Lake City, UT）によるリアルタイムＰＣＲで行った。ＰＣＲ試薬の組成は１×ライトサイクラーＤＮＡマスターＳＹＢＲグリーンＩ（Rosche Moleculer Biochemicals, Mannheim, Germany）、各プライマー０．５μＭ、３ｍＭ ＭｇＣｌ２、２μｌ ｃＤＮＡテンプレートにて行った。ＰＣＲは９５℃１０分間で変性後、９５℃１５分、５５℃５分、７２℃１０分の各サイクルを４０サイクル行った。反応産物はＰＣＲの融解サイクルを経て各サイクルで蛍光強度を測定した。標準化曲線はＨＥＣＴ２プラスミドＤＮＡ，ＯＳＴ プラスミドＤＮＡ（Dr．Toru MIKI，NIHから供与）から得られたＨＥＣＴ２ｃＤＮＡ，ＯＳＴｃＤＮＡの一連の段階的１０倍希釈溶液により作成した。ＰＣＲ増幅のためのプライマーの塩基配列は以下の通りである。ＨＥＣＴ２センス鎖：5'-CAAATGGATGCCCGAGCTG-3';ＨＥＣＴ２アンチセンス鎖：5'-GGTGGAAATGGTGACACGTCTG-3'；ＯＳＴセンス鎖：5'-GCCTCACAACCTGTGGACAA-3';ＯＳＴアンチセンス鎖：5'-ATCTTGGTTGAGGATGGATTCG-3'。
【００４８】
（ＲＮＡサイレンシングによる細胞増殖アッセイ）
ヒトＨＥＣＴ２，ＯＳＴに対する特異的なｓｉＲＮＡはＡＭＢＩＯＮ（Tokyo,japan）より購入した。ＨＥＣＴ２（ＡＭＢＩＯＮ，＃２６０７０），ＯＳＴ（ＡＭＢＩＯＮ，＃３２０９８），ＡＲＫ５（ＡＭＢＩＯＮ，＃９６４），非サイレンシングコントロールおよびＭＡＰＫ１（ＱＩＡＧＥＮ）を含めたこれらトランスフェクションにはＲＮＡｉ ヒト／マウスコントロールキット （Qiagen, Tokyo)を用い、プロトコールに従って実験を行った。細胞株を９６ウェルプレート（１００μｌ／ｗｅｌｌ）に培養し８０％コンフレントに達した時点で培地を交換（７５μｌ／ｗｅｌｌ）し、ＳｉＲＮＡ１００ｎＭ／２５μｌを混和、トランスフェクションさせた。４８時間の培養後、テトラカラーワン（Seikagaku CO.,Tokyo）を用いて発色し、ＭＴＴアッセイにより生存度を評価した。これらの値は非サイレンシングｓｉＲＮＡによるネガティブコントロールと比較検討した。全て増殖試験は３回以上行い、結果は平均±標準偏差で示した。
【００４９】
（マトリゲルによる細胞浸潤アッセイ）
細胞浸潤アッセイにはマトリゲル（Matrigel）（Becton-Dickinson, Tokyo）を購入し、プロトコールに従って実験を行った。神経膠腫細胞株（Ｕ２５１、Ｔ９８Ｇ）は前述のごとくコントロールを含めてｓｉＲＮＡトランスフェクションを行い24時間後、細胞解離溶液 (Sigma)に浮遊させ、洗浄後使用した。ＭＥＭ１０％ＦＢＳを満たしたウェル（２４ウェルプレート）にマトリゲルチャンバー（底面がマトリゲルで被膜された８μｍ多孔膜よりなる）を静置して充分水和させた後、チャンバーに細胞を播き、２４時間培養した。マトリゲルチャンバー内の細胞を払拭除去し、浸潤して多孔膜裏面に浸潤付着した細胞をギムザ染色液にて染色し、光顕２００倍で１０視野の細胞数を評価した。結果はコントロールとの比率で表し、平均±標準偏差で示した。
【００５０】
（統計学的解析）
神経膠腫の各グループ間におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴの発現はＭａｎｎ−ＷｈｉｔｎｅｙのＵ検定にて評価し、ｐ＜０．０５を統計学的に有意と判定した。生存曲線はＫａｐｌａｎ−Ｍｅｉｅｒ法にて表現し、２群間の検定にはＬｏｇ−ｒａｎｋ検定で評価した。
【実施例１】
【００５１】
（神経膠腫組織におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴ発現の免疫組織化学的検討）
神経膠腫組織におけるＨＥＣＴ２，ＯＳＴの局在を調べる為に免疫組織染色を行った。図１に示すように、ＨＥＣＴ２（Ａ）及び ＯＳＴ（Ｂ）のいずれにおいてもＨＥＣＴ２，ＯＳＴは全ての細胞質あるいは核で症例によって様々な程度に染色された。次いで、任意の３視野での各タンパク質の発現強度を０−３、および発現面積を０，０．２５，０．５，０．７５，１．０と表示し、それらの積の平均値を求め発現レベルとした。発現レベルからポジティブとネガティブの２群に分け、各群の生存曲線を描き、Logrank 検定にて２群間の有意差を検討した。染色強度の高いものほど生存期間が短く、２群間に有意差を認めた(Ａ：ＨＥＣＴ２，Ｐ＝０．０２８， Ｂ：ＯＳＴ，Ｐ＜０．０５ Logrank検定 図２)。
【実施例２】
【００５２】
（神経膠腫におけるＨＥＣＴ２遺伝子，ＯＳＴ遺伝子発現と予後の相関）
神経膠腫組織中のＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ，ＯＳＴｍＲＮＡの発現を定量リアルタイムＰＣＲにて測定した。ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ，ＯＳＴｍＲＮＡの発現によって症例を 高発現群、低発現群に分けて生存曲線で比較したところ、高発現群において生存期間が短いことが認められた（Ａ：ＨＥＣＴ２，Ｐ＜０．００１， Ｂ：ＯＳＴ，Ｐ＝０．０１５ Logrank検定 図３）。
【実施例３】
【００５３】
（ＨＥＣＴ２，ＯＳＴによる神経膠腫細胞株(Ｕ２５１)の増殖能と浸潤能の抑制）
ＨＥＣＴ２，ＯＳＴの過剰発現はこれまでの検討から神経膠腫の生物学的悪性度を反映していたと考えられる。そこで内因性のＨＥＣＴ２，ＯＳＴを抑制することにより神経膠腫細胞株の増殖能や浸潤能を抑制することができるかどうか確かめるため、ＨＥＣＴ２，ＯＳＴに特異的なｓｉＲＮＡを導入し、ｍＲＮＡを下方制御することでＨＥＣＴ２タンパク質，ＯＳＴタンパク質の発現を押さえて細胞増殖能と浸潤能について検討した。ＨＥＣＴ２（Ｅ０５３１，２６０７０），ＯＳＴ（Ｍ４７７）に特異的なｓｉＲＮＡを導入し、ｍＲＮＡが下方制御されることが確認された(Ｐ＜０．０１，図４Ａ)。ｓｉＲＮＡ導入によるＵ２５１細胞株の細胞増殖試験ではＨＥＣＴ２（Ｅ０５３）ｓｉＲＮＡ，ＯＳＴ（Ｍ４７７）ｓｉＲＮＡを導入することで増殖抑制効果が見られた(Ｐ＜０．０１，図４Ｂ)。
【００５４】
また、Ｕ２５１において抗−ＨＥＣＴ２ｓｉＲＮＡ，抗−ＯＳＴｓｉＲＮＡを導入し、マトリゲルマトリックスに対する細胞浸潤能を検討したところ、コントロールｓｉＲＮＡでは全く影響がなかったが、ＨＥＣＴ２（２６０７０，Ｅ０５３）ｓｉＲＮＡ，ＯＳＴ（Ｍ４７７）ｓｉＲＮＡ導入では著しい浸潤抑制効果が認められた（Ｐ＜０．０１，図４Ｃ）。
【図面の簡単な説明】
【００５５】
【図１】ＨＥＣＴ２（Ａ），ＯＳＴ（Ｂ）の免疫組織化学染色の結果を示す顕微鏡写真である（拡大率×200）。
【図２】免疫組織化学染色によるＨＥＣＴ２タンパク質（Ａ），ＯＳＴタンパク質（Ｂ）の発現強度と生存期間の相関を示すグラフである。
【図３】ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ（Ａ），ＯＳＴｍＲＮＡ（Ｂ）発現量と生命予後の相関を示す図である。
【図４】（Ａ）抗−ＨＥＣＴ２ｓｉＲＮＡ,抗−ＯＳＴｓｉＲＮＡによるＵ２５１神経膠腫細胞株におけるＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ,ＯＳＴｍＲＮＡの発現抑制を示す図である。
【００５６】
（Ｂ）ＨＥＣＴ２，ＯＳＴ遺伝子サイレンシング下における細胞増殖能試験の結果を示す図である。
【００５７】
（Ｃ）ＨＥＣＴ２，ＯＳＴ遺伝子サイレンシング下におけるマトリゲルマトリックスに対する細胞湿潤能試験の結果を示す図である。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする脳腫瘍マーカー遺伝子。
【請求項２】
脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍患者の予後を予測することを特徴とする脳腫瘍マーカー遺伝子。
【請求項３】
前記ＨＥＣＴ２又はＯＳＴの発現量が、そのｍＲＮＡ又はタンパク質の少なくとも一方の量により測定されることを特徴とする請求項１又は２に記載の脳腫瘍マーカー遺伝子。
【請求項４】
請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのｍＲＮＡマーカーであって、ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ又はＯＳＴｍＲＮＡを含むことを特徴とするｍＲＮＡマーカー。
【請求項５】
請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのタンパク質マーカーであって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含むことを特徴とするタンパク質マーカー。
【請求項６】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるオリゴヌクレオチドであって、前記ｍＲＮＡの塩基配列またはその相補塩基配列の一部からなり、前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部分特異的塩基対を形成することを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【請求項７】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプライマーであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプライマー。
【請求項８】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプローブであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプローブ。
【請求項９】
請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するための抗体であって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を認識することを特徴とする抗体。
【請求項１０】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記ｍＲＮＡのｃＤＮＡを定量可能なように増幅するために請求項７記載のプライマーと、検出のため前記増幅産物に対合させる請求項８記載のプローブとを含むことを特徴とするキット。
【請求項１１】
請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、請求項９記載の抗体及び／又はその標識化抗体を含むことを特徴とするキット。
【請求項１２】
下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法：（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドにおける、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を測定する工程、
（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【請求項１３】
下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法：
（ａ）被験者の生体試料から調製されたタンパク質における、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を測定する工程、
（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【請求項１４】
下記の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含むことを特徴とするＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法：
（ａ）被験物質と、前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーを発現している細胞とを接触させる工程、
（ｂ）被験物質を接触させた細胞における前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を測定し、被験物質を接触させない対照細胞における上記に対応する脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量と比較する工程、
（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を減少させる被験物質を選択する工程。
【請求項１】
脳腫瘍の悪性度を判定するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量が高いほど、前記脳腫瘍の悪性度が高いと判定することを特徴とする脳腫瘍マーカー遺伝子。
【請求項２】
脳腫瘍患者の予後を予測するために使用する脳腫瘍マーカー遺伝子であって、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含み、前記遺伝子の発現量に基づいて脳腫瘍患者の予後を予測することを特徴とする脳腫瘍マーカー遺伝子。
【請求項３】
前記ＨＥＣＴ２又はＯＳＴの発現量が、そのｍＲＮＡ又はタンパク質の少なくとも一方の量により測定されることを特徴とする請求項１又は２に記載の脳腫瘍マーカー遺伝子。
【請求項４】
請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのｍＲＮＡマーカーであって、ＨＥＣＴ２ｍＲＮＡ又はＯＳＴｍＲＮＡを含むことを特徴とするｍＲＮＡマーカー。
【請求項５】
請求項１〜３のいずれかに記載の脳腫瘍マーカー遺伝子を定量するためのタンパク質マーカーであって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含むことを特徴とするタンパク質マーカー。
【請求項６】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるオリゴヌクレオチドであって、前記ｍＲＮＡの塩基配列またはその相補塩基配列の一部からなり、前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部分特異的塩基対を形成することを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【請求項７】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプライマーであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプライマー。
【請求項８】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用されるプローブであって、請求項６に記載のオリゴヌクレオチドを含み、前記オリゴヌクレオチドが前記ｍＲＮＡまたはそのｃＤＮＡと部位特異的塩基対を形成することを特徴とするプローブ。
【請求項９】
請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するための抗体であって、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を認識することを特徴とする抗体。
【請求項１０】
請求項４記載のｍＲＮＡマーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、前記ｍＲＮＡのｃＤＮＡを定量可能なように増幅するために請求項７記載のプライマーと、検出のため前記増幅産物に対合させる請求項８記載のプローブとを含むことを特徴とするキット。
【請求項１１】
請求項５記載のタンパク質マーカーを定量するために使用するキットであって、少なくとも、請求項９記載の抗体及び／又はその標識化抗体を含むことを特徴とするキット。
【請求項１２】
下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法：（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドにおける、ＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子の発現量を測定する工程、
（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【請求項１３】
下記の工程（ａ）及び（ｂ）を含むことを特徴とする悪性脳腫瘍の診断方法：
（ａ）被験者の生体試料から調製されたタンパク質における、ＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現量を測定する工程、
（ｂ）前記発現量が健常者のそれと比較して多い被験者を悪性脳腫瘍と診断する工程。
【請求項１４】
下記の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含むことを特徴とするＨＥＣＴ２又はＯＳＴを含む脳腫瘍マーカー遺伝子又はＨＥＣＴ２タンパク質又はＯＳＴタンパク質を含む脳腫瘍のタンパク質マーカーの発現を抑制する物質のスクリーニング方法：
（ａ）被験物質と、前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーを発現している細胞とを接触させる工程、
（ｂ）被験物質を接触させた細胞における前記脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を測定し、被験物質を接触させない対照細胞における上記に対応する脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量と比較する工程、
（ｃ）上記（ｂ）の比較結果に基づいて、脳腫瘍マーカー遺伝子又はタンパク質マーカーの発現量を減少させる被験物質を選択する工程。
【図２】
【図３】
【図４】
【図１】
【図３】
【図４】
【図１】
【公開番号】特開２００７−１７４９０７（Ｐ２００７−１７４９０７Ａ）
【公開日】平成１９年７月１２日（２００７．７．１２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００５−３７３８６１（Ｐ２００５−３７３８６１）
【出願日】平成１７年１２月２７日（２００５．１２．２７）
【出願人】（３０４０２７２７９）国立大学法人 新潟大学 (310)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成１９年７月１２日（２００７．７．１２）
【国際特許分類】
【出願日】平成１７年１２月２７日（２００５．１２．２７）
【出願人】（３０４０２７２７９）国立大学法人 新潟大学 (310)
【Ｆターム（参考）】
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