補体活性化を阻害する修飾プロテアーゼ
補体系を調節するための方法および化合物が提供される。特に、補体活性化を阻害する化合物が提供され、また補体活性化を促進する化合物が提供される。こうした化合物は、補体系に対して作用するので治療用物質となる。したがって、補体活性化を阻害する化合物は、心筋梗塞および発作を含む虚血再灌流障害、セプシス、自己免疫疾患、炎症性疾患、ならびにアルツハイマー病および他の神経変性障害を含む、炎症成分を有する疾患の処置のために使用することができる。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
補体活性化を調節する方法であって、非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させ、それにより標的基質タンパク質が切断されて、前記標的基質を含む経路の補体活性化が変更されることを含む方法。
【請求項２】
前記非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させることがｉｎ ｖｉｔｒｏで起こる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させることがｉｎ ｖｉｖｏで起こる、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させることがｅｘ ｖｉｖｏで起こる、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
補体活性化が阻害される、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
補体活性化が増加する、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記補体経路が、補体の古典経路、代替経路、およびレクチン経路のうちの１つまたは複数の中から選択される、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
前記標的基質が、Ｃ１ｑ、Ｃ２、Ｃ３、ｉＣ３、Ｃ４、ｉＣ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９、ＭＢＬ、Ｂ因子、Ｄ因子、Ｐ因子、ＭＡＳＰ−１、ＭＡＳＰ−２、Ｃ１ｒ、Ｃ１ｓ、Ｃ４ｂ、Ｃ４ａ、Ｃ２ｂ、Ｃ２ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ３ａ、Ｂａ、およびＢｂのうちの１つまたは複数である、請求項１から７のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
前記標的基質が、配列番号２９８、２９９、３００、３０２、３０４、３０５、３０６、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、３１７、３１８、３１９、３２０、３２１、３２２、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３５、３３８、３４０、および３４４のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を含む、または補体活性を呈するその断片を含む、請求項１から８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記標的基質がフィコリンである、請求項１から７のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記標的基質が、配列番号６６０〜６６２のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記非補体プロテアーゼが、無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼと比較して、１つまたは複数のアミノ酸残基での修飾を含み、前記修飾アミノ酸残基は、標的基質についての特異性または標的基質への活性の一方または両方を増加させる、請求項１から１１のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼが、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、またはメタロプロテアーゼのいずれか１つである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記スカフォールドプロテアーゼが、グランザイムＢ、グランザイムＡ、グランザイムＭ、カテプシンＧ、ＭＴ−ＳＰ１、好中球エラスターゼ、キマーゼ、アルファ−トリプターゼ、ベータ−トリプターゼＩまたはＩＩ、キモトリプシン、コラーゲナーゼ、第ＸＩＩ因子、第ＸＩ因子、ＣＩＩ因子、第Ｘ因子、トロンビン、プロテインＣ、ｕ−プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）、ｔ−プラスミノーゲン活性化因子（ｔ−ＰＡ）、プラスミン、血漿カリクレイン、キモトリプシン、トリプシン、カテプシン、パパイン、クルザイン、金属プロテアーゼ、ならびにその対立遺伝子変形物、アイソフォーム、および触媒活性部分の中から選択される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記スカフォールドプロテアーゼが、配列番号２、４、８、７７、７９、８３、８５、８７、８９、９３、９９、１１７、１１９、１２１、１２３、１３２、１３４、１３８、１４２、１４４、１４６、１４８、１６２、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２３８、２４８、２５０、２６０、２６２、２８０、２８２、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、５４７、５４９、および５５１のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列ならびにそれらの触媒活性部分を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記スカフォールドプロテアーゼが、ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、配列番号２または１０に記載されるアミノ酸の配列を含む、またはその対立遺伝子もしくは種変異体である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項１６または１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４および／または位置１４６における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４および／または位置１４６における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２２】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２３】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたI41T/Y146D/G151L/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、およびI41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/G151L/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される修飾を有するプロテアーゼに対応する、請求項２１または２２に記載の方法。
【請求項２４】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、拡張された基質特異性または相互作用の二次的部位に寄与する１つまたは複数のアミノ酸にある、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項２５】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸位置９７、１４６、１９２、および２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸Ｆ９７、Ｙ１４６、Ｑ１９２、およびＫ２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｆ９７Ｄ、Ｆ９７Ｅ、Ｆ９７Ａ、Ｆ９７Ｗ、Ｙ１４６Ｎ、Ｙ１４６Ｄ、Ｙ１４６Ｅ、Ｙ１４６Ａ、Ｙ１４６Ｗ、Ｙ１４６Ｒ、Ｑ１９２Ｒ、Ｑ１９２Ｖ、Ｋ２２４Ａ、およびＫ２２４Ｆのうちの１つまたは複数から選択される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０〜６９、４０４〜４１８、４１９〜４４７、５２４〜５３３、５５２〜６５９、または６６３〜７１０のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項２９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｙ１４６Ｄ／Ｋ２２４ＦまたはＹ１４６Ｅである、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号５９６または６５０に記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたF97N、F97D、F97E、F99Y、F99V、F99W、D217A、D217V、F97A、F97W、F99A、Y146N、Y146D、Y146E、Y146A、Y146W、Y146R、W215F、W215Y、Q192V、Q192R、Q192F、K224A、K224F、M180E、Y146D/K224F、D96A、Y146E/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224R、I41T/Y146D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224N、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224L、Y146E/ Q221aE/K224F、I41T/ Y146E/ G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224N、Q221aD、Y146E/K224R、Y146E/ Q175D/ K224N、Y146D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224F、Y146E/Q175D/K224R、Y146E/L224L、G147E、Y146D/Q175D/K224R、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175W/K224L、Y146D/K224L、Y146E/Q221aE/K224R、Y146E/ K224A、Y146D/Q175H/K224L、Y146D/Q175Y/K224L、Y146E/K224Y、Y146D/Q175F/K224L、Y146D/Q175F/K225L、Y146D/Q221aL/K224S、I41E/Y146D/K224L、Y146D/D217F/K224L、Y146D/D217F/K224L、H143V/Y146D/K224F、Y146E/K224F、Y146A/K224F、Y146E/K224T、I41T/Y146E/K224L、I41F/Y146D/K224F、I41L/Y146D/K224F、I41T/Y146D/G151L/K224F、I41A/Y146D/K224F、I41E/Y146D/K224F、I41D/Y146D/K224L、I41D/Y146D/K224F、Y146N/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224F、Q192F/K224F、Y146D/Q192A/K224F、Q192V/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224L、I41T/Y146D/Q175D/K224R、I41T/Y146D/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175R/K224N、Y146D/Q175K/K224N、Y146D/Q175H/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項３２】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼが基質認識部位で標的基質を切断する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記標的基質がＣ２であり、前記基質認識部位が、ＳＬＧＲのアミノ酸の配列（配列番号３９２）を含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記非補体プロテアーゼが、標的基質の基質認識部位を切断する、請求項１から２４のいずれかに記載の方法。
【請求項３６】
前記非補体プロテアーゼが、第Ｉ因子基質認識部位を切断する、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
補体媒介性障害を有する対象を処置するための方法であって、非補体プロテアーゼを投与し、それにより前記非補体プロテアーゼが補体経路の１つまたは複数の標的基質を切断して、前記標的基質を含む経路の補体活性化が変更されることを含む方法。
【請求項３８】
補体活性化が阻害される、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
補体活性化の阻害が、炎症性障害、神経変性障害、および心血管障害の中から選択される補体媒介性障害に関連する炎症性症状の低下につながる、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記補体媒介性障害が、セプシス、関節リウマチ（ＲＡ）、膜性増殖性糸球体腎炎（ＭＰＧＮ）、多発性硬化症（ＭＳ）、重症筋無力症（ＭＧ）、喘息、炎症性腸疾患、免疫複合体（ＩＣ）媒介性急性炎症性組織傷害、アルツハイマー病（ＡＤ）、および虚血再灌流傷害の中から選択される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記補体媒介性障害が、ギラン−バレー症候群である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４２】
前記虚血再灌流傷害が、心筋梗塞症（ＭＩ）、発作、血管形成術、冠動脈バイパス術、心肺バイパス（ＣＰＢ）、および血液透析の中から選択される事象または処置により引き起こされる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
前記補体媒介性障害が、対象の処置に起因する、請求項３７から４２のいずれかに記載の方法。
【請求項４４】
非補体プロテアーゼを投与することが対象の処置の前に実行される、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
非補体プロテアーゼを投与することが、ｉｎ ｖｉｔｒｏ、ｅｘ ｖｉｖｏ、またはｉｎ ｖｉｖｏにおいて体液または組織試料を非補体プロテアーゼと接触させることにより実行される、請求項３７から４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記処置が、補体媒介性虚血再灌流傷害をもたらす、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
前記処置が、血管形成術または冠動脈バイパス術である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
前記補体経路が、古典経路、代替経路、およびレクチン経路のうちの１つまたは複数である、請求項３７から４７のいずれかに記載の方法。
【請求項４９】
前記標的基質が、Ｃ１ｑ、Ｃ２、Ｃ３、ｉＣ３、Ｃ４、ｉＣ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９、ＭＢＬ、Ｂ因子、Ｄ因子、Ｐ因子、ＭＡＳＰ−１、ＭＡＳＰ−２、Ｃ１ｒ、Ｃ１ｓ、Ｃ４ｂ、Ｃ４ａ、Ｃ２ｂ、Ｃ２ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ３ａ、Ｂａ、およびＢｂのうちの１つまたは複数である、請求項３７から４８のいずれかに記載の方法。
【請求項５０】
前記標的基質が、配列番号２９８、２９９、３００、３０２、３０４、３０５、３０６、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、３１７、３１８、３１９、３２０、３２１、３２２、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３５、３３８、３４０、もしくは３４４のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を含む、または補体活性を呈するその断片を含む、請求項３７から４９のいずれかに記載の方法。
【請求項５１】
前記標的基質が、フィコリンである、請求項３７から４８のいずれかに記載の方法。
【請求項５２】
前記非補体プロテアーゼが、無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼと比較して、１つまたは複数のアミノ酸残基での修飾を含み、前記修飾アミノ酸残基は、標的基質についての特異性もしくは標的基質への活性の一方または両方を増加させる、請求項４９に記載の方法。
【請求項５３】
前記無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼが、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、またはメタロプロテアーゼのいずれか１つである、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
前記スカフォールドプロテアーゼが、グランザイムＢ、グランザイムＡ、グランザイムＭ、カテプシンＧ、ＭＴ−ＳＰ１、好中球エラスターゼ、キマーゼ、アルファ−トリプターゼ、ベータ−トリプターゼＩまたはＩＩ、キモトリプシン、コラーゲナーゼ、第ＸＩＩ因子、第ＸＩ因子、ＣＩＩ因子、第Ｘ因子、トロンビン、プロテインＣ、ｕ−プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）、ｔ−プラスミノーゲン活性化因子（ｔ−ＰＡ）、プラスミン、血漿カリクレイン、キモトリプシン、トリプシン、カテプシン、パパイン、クルザイン、金属プロテアーゼ、ならびにその対立遺伝子変形物、アイソフォーム、および触媒活性部分の中から選択される、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
前記スカフォールドプロテアーゼが、配列番号２、４、８、７７、７９、８３、８５、８７、８９、９３、９９、１１７、１１９、１２１、１２３、１３２、１３４、１３８、１４２、１４４、１４６、１４８、１６２、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２３８、２４８、２５０、２６０、２６２、２８０、２８２、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、５４７、５４９、および５５１のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列ならびにその触媒活性部分を含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
前記スカフォールドプロテアーゼがＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼである、請求項５４に記載の方法。
【請求項５７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、配列番号２もしくは１０に記載されるアミノ酸の配列を含む、またはその対立遺伝子もしくは種変異体である、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記標的基質が、Ｃ２またはＣ３である、請求項５６または５７のいずれかに記載の方法。
【請求項５９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４における修飾を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項６０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４における修飾を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項６２】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６３】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたは触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたI41T/Y146D/G151L/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、およびI41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/G151L/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項６１または６２に記載の方法。
【請求項６４】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、拡張された基質特異性または相互作用の二次的部位に寄与する１つまたは複数のアミノ酸にある、請求項５６または５７に記載の方法。
【請求項６５】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸位置９７、１４６、１９２、および２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸Ｆ９７、Ｙ１４６、Ｑ１９２、およびＫ２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｆ９７Ｄ、Ｆ９７Ｅ、Ｆ９７Ａ、Ｆ９７Ｗ、Ｙ１４６Ｎ、Ｙ１４６Ｄ、Ｙ１４６Ｅ、Ｙ１４６Ａ、Ｙ１４６Ｗ、Ｙ１４６Ｒ、Ｑ１９２Ｒ、Ｑ１９２Ｖ、Ｋ２２４Ａ、およびＫ２２４Ｆのうちの１つまたは複数から選択される、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０〜６９、４０４〜４１８、４１９〜４４７、５２４〜５３３、５５２〜６５９、または６６３〜７１０のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項５６または５７に記載の方法。
【請求項６９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｙ１４６Ｄ／Ｋ２２４ＦまたはＹ１４６Ｅである、請求項６７に記載の方法。
【請求項７０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号５９６または６５０に記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項６８に記載の方法。
【請求項７１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたF97N、F97D、F97E、F99Y、F99V、F99W、D217A、D217V、F97A、F97W、F99A、Y146N、Y146D、Y146E、Y146A、Y146W、Y146R、W215F、W215Y、Q192V、Q192R、Q192F、K224A、K224F、M180E、Y146D/K224F、D96A、Y146E/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224R、I41T/Y146D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224N、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224L、Y146E/ Q221aE/K224F、I41T/ Y146E/ G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224N、Q221aD、Y146E/K224R、Y146E/ Q175D/ K224N、Y146D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224F、Y146E/Q175D/K224R、Y146E/L224L、G147E、Y146D/Q175D/K224R、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175W/K224L、Y146D/K224L、Y146E/Q221aE/K224R、Y146E/ K224A、Y146D/Q175H/K224L、Y146D/Q175Y/K224L、Y146E/K224Y、Y146D/Q175F/K224L、Y146D/Q175F/K225L、Y146D/Q221aL/K224S、I41E/Y146D/K224L、Y146D/D217F/K224L、Y146D/D217F/K224L、H143V/Y146D/K224F、Y146E/K224F、Y146A/K224F、Y146E/K224T、I41T/Y146E/K224L、I41F/Y146D/K224F、I41L/Y146D/K224F、I41T/Y146D/G151L/K224F、I41A/Y146D/K224F、I41E/Y146D/K224F、I41D/Y146D/K224L、I41D/Y146D/K224F、Y146N/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224F、Q192F/K224F、Y146D/Q192A/K224F、Q192V/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224L、I41T/Y146D/Q175D/K224R、I41T/Y146D/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175R/K224N、Y146D/Q175K/K224N、Y146D/Q175H/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項５６または５７に記載の方法。
【請求項７２】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼが、前記標的基質の基質認識部位を切断する、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
前記標的基質がＣ２であり、前記基質認識部位が、ＳＬＧＲのアミノ酸の配列（配列番号３９２）を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
前記非補体プロテアーゼが、前記標的基質の基質認識部位を切断する、請求項３７から７４のいずれかに記載の方法。
【請求項７６】
前記非補体プロテアーゼが、第Ｉ因子基質認識部位を切断する、請求項７５に記載の方法。
【請求項７７】
前記非補体プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、補体媒介性障害を処置するための第２の作用物質と組み合わせて投与される、請求項３７から７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記第２の作用物質が、抗炎症剤または抗凝固薬である、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
前記第２の作用物質が、ＮＳＡＩＤ、代謝拮抗物質、コルチコステロイド、鎮痛薬、細胞毒性薬、炎症促進性サイトカイン阻害剤、抗炎症性サイトカイン、Ｂ細胞標的作用物質、Ｔ抗原を標的にする化合物、接着分子遮断薬、ケモカイン受容体拮抗薬、キナーゼ阻害剤、ＰＰＡＲ−γリガンド、補体阻害剤、ヘパリン、ワルファリン、アセノクマロール、フェニンジオン、ＥＤＴＡ、クエン酸塩、シュウ酸塩、アルガトロバン、レピルジン、ビバリルジン、およびキシメラガトランのうちの１つまたは複数の中から選択される、請求項７８に記載の方法。
【請求項８０】
（ａ）補体経路の１つまたは複数の補体標的基質を切断して、前記標的基質を含む経路の補体活性化を変更させる非補体プロテアーゼと、
（ｂ）補体媒介性障害を処置するための１つまたは複数の第２の作用物質とを含む組合せ。
【請求項８１】
１つまたは複数の前記第２の作用物質が、抗炎症剤または抗凝固薬である、請求項８０に記載の組合せ。
【請求項８２】
前記抗炎症剤が、ＮＳＡＩＤ、代謝拮抗物質、コルチコステロイド、鎮痛薬、細胞毒性薬、炎症促進性サイトカイン阻害剤、抗炎症性サイトカイン、Ｂ細胞標的作用物質、Ｔ抗原を標的にする化合物、接着分子遮断薬、ケモカイン受容体拮抗薬、キナーゼ阻害剤、ＰＰＡＲ−γリガンド、補体阻害剤、ヘパリン、ワルファリン、アセノクマロール、フェニンジオン、ＥＤＴＡ、クエン酸塩、シュウ酸塩、アルガトロバン、レピルジン、ビバリルジン、およびキシメラガトランのうちの１つまたは複数の中から選択される、請求項８１に記載の組合せ。
【請求項８３】
補体活性化が阻害される、請求項８０から８２のいずれか一項に記載の組合せ。
【請求項８４】
スカフォールドプロテアーゼの１つまたは複数のアミノ酸において修飾を含み、
前記修飾アミノ酸残基が、標的基質についての特異性もしくは標的基質への活性の一方または両方を増加させ、前記標的基質が補体タンパク質である、修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８５】
前記標的基質が、Ｃ１ｑ、Ｃ２、Ｃ３、ｉＣ３、Ｃ４、ｉＣ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９、ＭＢＬ、Ｂ因子、Ｄ因子、Ｐ因子、ＭＡＳＰ−１、ＭＡＳＰ−２、Ｃ１ｒ、Ｃ１ｓ、Ｃ４ｂ、Ｃ４ａ、Ｃ２ｂ、Ｃ２ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ３ａ、Ｂａ、またはＢｂのうちの１つまたは複数である、請求項８４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８６】
前記標的基質が、配列番号２９８、２９９、３００、３０２、３０４、３０５、３０６、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、３１７、３１８、３１９、３２０、３２１、３２２、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３５、３３８、３４０、および３４４のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を含む、または補体活性を呈するその断片を含む、請求項８４または８５に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８７】
前記標的基質がフィコリンである、請求項８４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８８】
前記標的基質が、配列番号６６０〜６６２のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を含む、請求項８７に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８９】
前記スカフォールドプロテアーゼが、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、およびメタロプロテアーゼの中から選択される、請求項８４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９０】
前記スカフォールドプロテアーゼが、グランザイムＢ、グランザイムＡ、グランザイムＭ、カテプシンＧ、ＭＴ−ＳＰ１、好中球エラスターゼ、キマーゼ、アルファ−トリプターゼ、ベータ−トリプターゼＩまたはＩＩ、キモトリプシン、コラーゲナーゼ、第ＸＩＩ因子、第ＸＩ因子、ＣＩＩ因子、第Ｘ因子、トロンビン、プロテインＣ、ｕ−プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）、ｔ−プラスミノーゲン活性化因子（ｔ−ＰＡ）、プラスミン、血漿カリクレイン、キモトリプシン、トリプシン、カテプシン、パパイン、クルザイン、金属プロテアーゼ、ならびにその対立遺伝子変形物、アイソフォーム、および触媒活性部分の中から選択される、請求項８９に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９１】
前記スカフォールドプロテアーゼが、配列番号２、４、８、７７、７９、８３、８５、８７、８９、９３、９９、１１７、１１９、１２１、１２３、１３２、１３４、１３８、１４２、１４４、１４６、１４８、１６２、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４，１７６、１７８、１８０、１８２、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２３８、２４８、２５０、２６０、２６２、２８０、２８２、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、５４７、５４９、および５５１のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列ならびにそれらの触媒活性部分を含む、請求項９０に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９２】
前記スカフォールドプロテアーゼが、ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼである、請求項９０に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９３】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、配列番号２または１０に記載されるアミノ酸の配列を含む、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９４】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項９２または９３に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９５】
少なくとも２つ以上の修飾を含み、キモトリプシン番号付けに基づいて、一方の修飾は位置１４６にあり、他方の修飾は位置２２４にあり、ただし、
（ｉ）プロテアーゼが２つの修飾のみを含む場合、プロテアーゼは、前記２つの修飾としてＹ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆを含まず、
（ｉｉ）プロテアーゼが３つの修飾を含有する場合、プロテアーゼは、Ｙ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆと共に、Ｆ９９ＶまたはＩまたはＬまたはＴを含まない、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９６】
少なくとも２つ以上の修飾を含み、キモトリプシン番号付けに基づいて、一方の修飾は位置１４６にあり、他方の修飾は位置２２４にあり、ただし、
（ｉ）プロテアーゼが２つの修飾のみを含む場合、プロテアーゼは、前記２つの修飾としてＹ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆを含まず、
（ｉｉ）プロテアーゼが３つの修飾を含有する場合、プロテアーゼは、Ｙ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆと共に、Ｆ９９ＶまたはＩまたはＬまたはＴを含まない、請求項９４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９７】
少なくとも１つの修飾をキモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１に含む、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９８】
少なくとも１つの修飾をキモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１に含む、請求項９４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９９】
ＭＴ−ＳＰ１または触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたI41T/Y146D/G151L/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、およびI41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/G151L/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項９７または９８に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１００】
ＭＴ−ＳＰ１または触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＩ４１Ｔ／Ｉ４６Ｄ／Ｇ１５１Ｌ／Ｋ２２４Ｆの修飾に対応する、請求項９９に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＤ９６Ａ、Ｄ９６Ｖ、Ｄ９６Ｆ、Ｄ９６Ｆ、Ｄ９６Ｓ、Ｄ９６Ｔ、Ｆ９９Ｓ、Ｆ９９Ｇ、Ｑ１７４Ｈ、Ｑ１７４Ａ、Ｑ１７４Ｖ、Ｑ１７４Ｆ、Ｑ１７４Ｒ、Ｑ１７４Ｋ、Ｑ１７４Ｌ、Ｑ１７４Ｙ、Ｑ１９２Ｌ、Ｑ１９２Ｉ、Ｑ１９２Ｅ、Ｑ１９２Ｋ、Ｑ１９２Ｙ、Ｄ２１７Ｑ、Ｄ２１７Ｎ、Ｄ２１７Ｈ、Ｋ２２４Ａのうちの１つまたは複数から選択される、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０２】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたY146E/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224R、I41T/Y146D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224N、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224L、Y146E/ Q221aE/K224F、I41T/ Y146E/ G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224N、Q221aD、Y146E/K224R、Y146E/ Q175D/ K224N、Y146D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224F、Y146E/Q175D/K224R、Y146E/L224L、G147E、Y146D/Q175D/K224R、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175W/K224L、Y146D/K224L、Y146E/Q221aE/K224R、Y146E/ K224A、Y146D/Q175H/K224L、Y146D/Q175Y/K224L、Y146E/K224Y、Y146D/Q175F/K224L、Y146D/Q175F/K225L、Y146D/Q221aL/K224S、I41E/Y146D/K224L、Y146D/D217F/K224L、Y146D/D217F/K224L、H143V/Y146D/K224F、Y146E/K224F、Y146A/K224F、Y146E/K224T、I41T/Y146E/K224L、I41F/Y146D/K224F、I41L/Y146D/K224F、I41T/Y146D/G151L/K224F、I41A/Y146D/K224F、I41E/Y146D/K224F、I41D/Y146D/K224L、I41D/Y146D/K224F、Y146N/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224F、Q192F/K224F、Y146D/Q192A/K224F、Q192V/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224L、I41T/Y146D/Q175D/K224R、I41T/Y146D/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224F、およびI41T/Y146E/Q175D/K224L、、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175R/K224N、Y146D/Q175K/K224N、Y146D/Q175H/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０３】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号４１〜５１、５６、５７、６０〜６４、６７、６９、４１９〜４２９、４３１、４３４、４３５、４３８〜４４２、４４５、５２４、５２５、５２７〜５３０、５３２、５３３、５５２〜６５９、または６６３〜７１０のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０４】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号５９６または６５０のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０５】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼが、前記標的基質の基質認識部位を切断する、請求項１０３に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０６】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項１０５に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０７】
前記標的基質がＣ２であり、前記基質認識部位が、ＳＬＧＲのアミノ酸の配列（配列番号３９２）を含む、請求項１０６に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０８】
請求項８４〜１０７、１３１、および１３０のいずれかの修飾非補体プロテアーゼを含む医薬組成物。
【請求項１０９】
（ａ）請求項１０８に記載の医薬組成物と、
（ｂ）補体媒介性障害を処置するための１つまたは複数の第２の作用物質とを含む組合せ。
【請求項１１０】
薬学的に許容し得る賦形剤をさらに含む、請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１１】
全身、経口、経鼻、経肺、局所、または局部投与のために製剤される、請求項１１０に記載の医薬組成物。
【請求項１１２】
請求項１０８または１０９のいずれか一項に記載の医薬組成物と、前記組成物の投与のためのデバイスとを含み、投与のための使用説明書を含んでいてもよいキット。
【請求項１１３】
請求項８４から１０７に記載の修飾非補体プロテアーゼのいずれか１つをコードするヌクレオチドの配列を含む核酸分子。
【請求項１１４】
請求項１１３に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項１１５】
請求項１１４に記載のベクターを含む細胞。
【請求項１１６】
対象に、請求項１１３に記載の核酸分子を投与することを含む処置の方法。
【請求項１１７】
前記核酸分子が、ベクターの中に投与のために導入される、請求項１１６に記載の処置の方法。
【請求項１１８】
前記ベクターが発現ベクターである、請求項１１７に記載の処置の方法。
【請求項１１９】
前記ベクターがエピソーム性である、請求項１１８に記載の処置の方法。
【請求項１２０】
前記発現ベクターが、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、ＥＢＶ、ＳＶ４０、サイトメガロウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、または人工染色体の中から選択される、請求項１１７または１１８に記載の処置の方法。
【請求項１２１】
前記核酸が、ｉｎ ｖｉｖｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで投与される、請求項１１７から１２０のいずれかに記載の処置の方法。
【請求項１２２】
ｅｘ ｖｉｖｏ処置が、ｉｎ ｖｉｔｒｏにおいて細胞中に前記核酸を投与し、続いて前記細胞を前記対象に投与することを含む、請求項１２１に記載の処置の方法。
【請求項１２３】
前記細胞が、適合するドナーまたは処置される前記対象からのものである、請求項１２２に記載の処置の方法。
【請求項１２４】
前記対象がヒトである、請求項１１６から１２３に記載の処置の方法。
【請求項１２５】
非プロテアーゼポリペプチドに融合される、請求項８４から１０７、１３１、および１３０のいずれかに記載のプロテアーゼの触媒活性部分を含む融合タンパク質。
【請求項１２６】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項１２７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項１２８】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項１２９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項１３０】
キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１で少なくとも１つの修飾を含む、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１３１】
キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１で少なくとも１つの修飾を含む、請求項９４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１３２】
補体媒介性疾患または障害の処置用の薬剤の製剤のための、請求項８４から１０７、１３１、および１３０のいずれかに記載の非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３３】
補体媒介性疾患または障害の処置のための、請求項８４から１０７、１３１、および１３０のいずれかに記載の非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３４】
補体媒介性疾患または障害の処置用の薬剤の製剤のための非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３５】
補体媒介性疾患または障害の処置のための非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３６】
前記非補体プロテアーゼが、補体経路の１つまたは複数の標的基質を切断して、前記標的基質を含む経路の補体活性化を変更させる、請求項１３２から１３５のいずれかに記載の使用。
【請求項１３７】
補体活性化が阻害される、請求項１３６に記載の使用。
【請求項１３８】
補体活性化の阻害が、炎症性障害、神経変性障害、および心血管障害の中から選択される補体媒介性障害に関連する炎症性症状の低下につながる、請求項１３７に記載の使用。
【請求項１３９】
前記補体媒介性障害が、セプシス、関節リウマチ（ＲＡ）、膜性増殖性糸球体腎炎（ＭＰＧＮ）、多発性硬化症（ＭＳ）、重症筋無力症（ＭＧ）、喘息、炎症性腸疾患、免疫複合体（ＩＣ）媒介性急性炎症性組織傷害、アルツハイマー病（ＡＤ）、および虚血再灌流傷害の中から選択される、請求項１３８に記載の使用。
【請求項１４０】
前記補体媒介性障害がギラン−バレー症候群である、請求項１３８に記載の使用。
【請求項１４１】
前記虚血再灌流傷害が、心筋梗塞症（ＭＩ）、発作、血管形成術、冠動脈バイパス術、心肺バイパス（ＣＰＢ）、および血液透析の中から選択される事象または処置により引き起こされる、請求項１３９に記載の使用。
【請求項１４２】
前記補体媒介性障害が、対象の処置に起因する、請求項１３２から１４１のいずれかに記載の使用。
【請求項１４３】
前記処置が、補体媒介性虚血再灌流傷害をもたらす、請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４４】
前記処置が、血管形成術または冠動脈バイパス術である、請求項１４３に記載の方法。
【請求項１】
補体活性化を調節する方法であって、非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させ、それにより標的基質タンパク質が切断されて、前記標的基質を含む経路の補体活性化が変更されることを含む方法。
【請求項２】
前記非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させることがｉｎ ｖｉｔｒｏで起こる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させることがｉｎ ｖｉｖｏで起こる、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記非補体プロテアーゼを補体経路の１つまたは複数の標的基質と接触させることがｅｘ ｖｉｖｏで起こる、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
補体活性化が阻害される、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
補体活性化が増加する、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記補体経路が、補体の古典経路、代替経路、およびレクチン経路のうちの１つまたは複数の中から選択される、請求項１から６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
前記標的基質が、Ｃ１ｑ、Ｃ２、Ｃ３、ｉＣ３、Ｃ４、ｉＣ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９、ＭＢＬ、Ｂ因子、Ｄ因子、Ｐ因子、ＭＡＳＰ−１、ＭＡＳＰ−２、Ｃ１ｒ、Ｃ１ｓ、Ｃ４ｂ、Ｃ４ａ、Ｃ２ｂ、Ｃ２ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ３ａ、Ｂａ、およびＢｂのうちの１つまたは複数である、請求項１から７のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
前記標的基質が、配列番号２９８、２９９、３００、３０２、３０４、３０５、３０６、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、３１７、３１８、３１９、３２０、３２１、３２２、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３５、３３８、３４０、および３４４のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を含む、または補体活性を呈するその断片を含む、請求項１から８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記標的基質がフィコリンである、請求項１から７のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記標的基質が、配列番号６６０〜６６２のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記非補体プロテアーゼが、無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼと比較して、１つまたは複数のアミノ酸残基での修飾を含み、前記修飾アミノ酸残基は、標的基質についての特異性または標的基質への活性の一方または両方を増加させる、請求項１から１１のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼが、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、またはメタロプロテアーゼのいずれか１つである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記スカフォールドプロテアーゼが、グランザイムＢ、グランザイムＡ、グランザイムＭ、カテプシンＧ、ＭＴ−ＳＰ１、好中球エラスターゼ、キマーゼ、アルファ−トリプターゼ、ベータ−トリプターゼＩまたはＩＩ、キモトリプシン、コラーゲナーゼ、第ＸＩＩ因子、第ＸＩ因子、ＣＩＩ因子、第Ｘ因子、トロンビン、プロテインＣ、ｕ−プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）、ｔ−プラスミノーゲン活性化因子（ｔ−ＰＡ）、プラスミン、血漿カリクレイン、キモトリプシン、トリプシン、カテプシン、パパイン、クルザイン、金属プロテアーゼ、ならびにその対立遺伝子変形物、アイソフォーム、および触媒活性部分の中から選択される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記スカフォールドプロテアーゼが、配列番号２、４、８、７７、７９、８３、８５、８７、８９、９３、９９、１１７、１１９、１２１、１２３、１３２、１３４、１３８、１４２、１４４、１４６、１４８、１６２、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２３８、２４８、２５０、２６０、２６２、２８０、２８２、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、５４７、５４９、および５５１のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列ならびにそれらの触媒活性部分を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記スカフォールドプロテアーゼが、ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、配列番号２または１０に記載されるアミノ酸の配列を含む、またはその対立遺伝子もしくは種変異体である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項１６または１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４および／または位置１４６における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４および／または位置１４６における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２２】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２３】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたI41T/Y146D/G151L/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、およびI41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/G151L/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される修飾を有するプロテアーゼに対応する、請求項２１または２２に記載の方法。
【請求項２４】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、拡張された基質特異性または相互作用の二次的部位に寄与する１つまたは複数のアミノ酸にある、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項２５】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸位置９７、１４６、１９２、および２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸Ｆ９７、Ｙ１４６、Ｑ１９２、およびＫ２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｆ９７Ｄ、Ｆ９７Ｅ、Ｆ９７Ａ、Ｆ９７Ｗ、Ｙ１４６Ｎ、Ｙ１４６Ｄ、Ｙ１４６Ｅ、Ｙ１４６Ａ、Ｙ１４６Ｗ、Ｙ１４６Ｒ、Ｑ１９２Ｒ、Ｑ１９２Ｖ、Ｋ２２４Ａ、およびＫ２２４Ｆのうちの１つまたは複数から選択される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０〜６９、４０４〜４１８、４１９〜４４７、５２４〜５３３、５５２〜６５９、または６６３〜７１０のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項２９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｙ１４６Ｄ／Ｋ２２４ＦまたはＹ１４６Ｅである、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号５９６または６５０に記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたF97N、F97D、F97E、F99Y、F99V、F99W、D217A、D217V、F97A、F97W、F99A、Y146N、Y146D、Y146E、Y146A、Y146W、Y146R、W215F、W215Y、Q192V、Q192R、Q192F、K224A、K224F、M180E、Y146D/K224F、D96A、Y146E/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224R、I41T/Y146D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224N、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224L、Y146E/ Q221aE/K224F、I41T/ Y146E/ G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224N、Q221aD、Y146E/K224R、Y146E/ Q175D/ K224N、Y146D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224F、Y146E/Q175D/K224R、Y146E/L224L、G147E、Y146D/Q175D/K224R、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175W/K224L、Y146D/K224L、Y146E/Q221aE/K224R、Y146E/ K224A、Y146D/Q175H/K224L、Y146D/Q175Y/K224L、Y146E/K224Y、Y146D/Q175F/K224L、Y146D/Q175F/K225L、Y146D/Q221aL/K224S、I41E/Y146D/K224L、Y146D/D217F/K224L、Y146D/D217F/K224L、H143V/Y146D/K224F、Y146E/K224F、Y146A/K224F、Y146E/K224T、I41T/Y146E/K224L、I41F/Y146D/K224F、I41L/Y146D/K224F、I41T/Y146D/G151L/K224F、I41A/Y146D/K224F、I41E/Y146D/K224F、I41D/Y146D/K224L、I41D/Y146D/K224F、Y146N/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224F、Q192F/K224F、Y146D/Q192A/K224F、Q192V/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224L、I41T/Y146D/Q175D/K224R、I41T/Y146D/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175R/K224N、Y146D/Q175K/K224N、Y146D/Q175H/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項１６または１７に記載の方法。
【請求項３２】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼが基質認識部位で標的基質を切断する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記標的基質がＣ２であり、前記基質認識部位が、ＳＬＧＲのアミノ酸の配列（配列番号３９２）を含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記非補体プロテアーゼが、標的基質の基質認識部位を切断する、請求項１から２４のいずれかに記載の方法。
【請求項３６】
前記非補体プロテアーゼが、第Ｉ因子基質認識部位を切断する、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
補体媒介性障害を有する対象を処置するための方法であって、非補体プロテアーゼを投与し、それにより前記非補体プロテアーゼが補体経路の１つまたは複数の標的基質を切断して、前記標的基質を含む経路の補体活性化が変更されることを含む方法。
【請求項３８】
補体活性化が阻害される、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
補体活性化の阻害が、炎症性障害、神経変性障害、および心血管障害の中から選択される補体媒介性障害に関連する炎症性症状の低下につながる、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記補体媒介性障害が、セプシス、関節リウマチ（ＲＡ）、膜性増殖性糸球体腎炎（ＭＰＧＮ）、多発性硬化症（ＭＳ）、重症筋無力症（ＭＧ）、喘息、炎症性腸疾患、免疫複合体（ＩＣ）媒介性急性炎症性組織傷害、アルツハイマー病（ＡＤ）、および虚血再灌流傷害の中から選択される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記補体媒介性障害が、ギラン−バレー症候群である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４２】
前記虚血再灌流傷害が、心筋梗塞症（ＭＩ）、発作、血管形成術、冠動脈バイパス術、心肺バイパス（ＣＰＢ）、および血液透析の中から選択される事象または処置により引き起こされる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
前記補体媒介性障害が、対象の処置に起因する、請求項３７から４２のいずれかに記載の方法。
【請求項４４】
非補体プロテアーゼを投与することが対象の処置の前に実行される、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
非補体プロテアーゼを投与することが、ｉｎ ｖｉｔｒｏ、ｅｘ ｖｉｖｏ、またはｉｎ ｖｉｖｏにおいて体液または組織試料を非補体プロテアーゼと接触させることにより実行される、請求項３７から４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記処置が、補体媒介性虚血再灌流傷害をもたらす、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
前記処置が、血管形成術または冠動脈バイパス術である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
前記補体経路が、古典経路、代替経路、およびレクチン経路のうちの１つまたは複数である、請求項３７から４７のいずれかに記載の方法。
【請求項４９】
前記標的基質が、Ｃ１ｑ、Ｃ２、Ｃ３、ｉＣ３、Ｃ４、ｉＣ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９、ＭＢＬ、Ｂ因子、Ｄ因子、Ｐ因子、ＭＡＳＰ−１、ＭＡＳＰ−２、Ｃ１ｒ、Ｃ１ｓ、Ｃ４ｂ、Ｃ４ａ、Ｃ２ｂ、Ｃ２ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ３ａ、Ｂａ、およびＢｂのうちの１つまたは複数である、請求項３７から４８のいずれかに記載の方法。
【請求項５０】
前記標的基質が、配列番号２９８、２９９、３００、３０２、３０４、３０５、３０６、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、３１７、３１８、３１９、３２０、３２１、３２２、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３５、３３８、３４０、もしくは３４４のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を含む、または補体活性を呈するその断片を含む、請求項３７から４９のいずれかに記載の方法。
【請求項５１】
前記標的基質が、フィコリンである、請求項３７から４８のいずれかに記載の方法。
【請求項５２】
前記非補体プロテアーゼが、無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼと比較して、１つまたは複数のアミノ酸残基での修飾を含み、前記修飾アミノ酸残基は、標的基質についての特異性もしくは標的基質への活性の一方または両方を増加させる、請求項４９に記載の方法。
【請求項５３】
前記無修飾プロテアーゼまたはスカフォールドプロテアーゼが、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、またはメタロプロテアーゼのいずれか１つである、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
前記スカフォールドプロテアーゼが、グランザイムＢ、グランザイムＡ、グランザイムＭ、カテプシンＧ、ＭＴ−ＳＰ１、好中球エラスターゼ、キマーゼ、アルファ−トリプターゼ、ベータ−トリプターゼＩまたはＩＩ、キモトリプシン、コラーゲナーゼ、第ＸＩＩ因子、第ＸＩ因子、ＣＩＩ因子、第Ｘ因子、トロンビン、プロテインＣ、ｕ−プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）、ｔ−プラスミノーゲン活性化因子（ｔ−ＰＡ）、プラスミン、血漿カリクレイン、キモトリプシン、トリプシン、カテプシン、パパイン、クルザイン、金属プロテアーゼ、ならびにその対立遺伝子変形物、アイソフォーム、および触媒活性部分の中から選択される、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
前記スカフォールドプロテアーゼが、配列番号２、４、８、７７、７９、８３、８５、８７、８９、９３、９９、１１７、１１９、１２１、１２３、１３２、１３４、１３８、１４２、１４４、１４６、１４８、１６２、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２３８、２４８、２５０、２６０、２６２、２８０、２８２、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、５４７、５４９、および５５１のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列ならびにその触媒活性部分を含む、請求項５４に記載の方法。
【請求項５６】
前記スカフォールドプロテアーゼがＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼである、請求項５４に記載の方法。
【請求項５７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、配列番号２もしくは１０に記載されるアミノ酸の配列を含む、またはその対立遺伝子もしくは種変異体である、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】
前記標的基質が、Ｃ２またはＣ３である、請求項５６または５７のいずれかに記載の方法。
【請求項５９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４における修飾を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項６０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置２２４における修飾を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項６２】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１における修飾を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項６３】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたは触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたI41T/Y146D/G151L/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、およびI41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/G151L/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項６１または６２に記載の方法。
【請求項６４】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、拡張された基質特異性または相互作用の二次的部位に寄与する１つまたは複数のアミノ酸にある、請求項５６または５７に記載の方法。
【請求項６５】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸位置９７、１４６、１９２、および２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼのアミノ酸Ｆ９７、Ｙ１４６、Ｑ１９２、およびＫ２２４のうちの１つまたは複数に対応する、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｆ９７Ｄ、Ｆ９７Ｅ、Ｆ９７Ａ、Ｆ９７Ｗ、Ｙ１４６Ｎ、Ｙ１４６Ｄ、Ｙ１４６Ｅ、Ｙ１４６Ａ、Ｙ１４６Ｗ、Ｙ１４６Ｒ、Ｑ１９２Ｒ、Ｑ１９２Ｖ、Ｋ２２４Ａ、およびＫ２２４Ｆのうちの１つまたは複数から選択される、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０〜６９、４０４〜４１８、４１９〜４４７、５２４〜５３３、５５２〜６５９、または６６３〜７１０のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項５６または５７に記載の方法。
【請求項６９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、Ｙ１４６Ｄ／Ｋ２２４ＦまたはＹ１４６Ｅである、請求項６７に記載の方法。
【請求項７０】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号５９６または６５０に記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項６８に記載の方法。
【請求項７１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたF97N、F97D、F97E、F99Y、F99V、F99W、D217A、D217V、F97A、F97W、F99A、Y146N、Y146D、Y146E、Y146A、Y146W、Y146R、W215F、W215Y、Q192V、Q192R、Q192F、K224A、K224F、M180E、Y146D/K224F、D96A、Y146E/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224R、I41T/Y146D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224N、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224L、Y146E/ Q221aE/K224F、I41T/ Y146E/ G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224N、Q221aD、Y146E/K224R、Y146E/ Q175D/ K224N、Y146D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224F、Y146E/Q175D/K224R、Y146E/L224L、G147E、Y146D/Q175D/K224R、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175W/K224L、Y146D/K224L、Y146E/Q221aE/K224R、Y146E/ K224A、Y146D/Q175H/K224L、Y146D/Q175Y/K224L、Y146E/K224Y、Y146D/Q175F/K224L、Y146D/Q175F/K225L、Y146D/Q221aL/K224S、I41E/Y146D/K224L、Y146D/D217F/K224L、Y146D/D217F/K224L、H143V/Y146D/K224F、Y146E/K224F、Y146A/K224F、Y146E/K224T、I41T/Y146E/K224L、I41F/Y146D/K224F、I41L/Y146D/K224F、I41T/Y146D/G151L/K224F、I41A/Y146D/K224F、I41E/Y146D/K224F、I41D/Y146D/K224L、I41D/Y146D/K224F、Y146N/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224F、Q192F/K224F、Y146D/Q192A/K224F、Q192V/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224L、I41T/Y146D/Q175D/K224R、I41T/Y146D/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175R/K224N、Y146D/Q175K/K224N、Y146D/Q175H/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項５６または５７に記載の方法。
【請求項７２】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼが、前記標的基質の基質認識部位を切断する、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
前記標的基質がＣ２であり、前記基質認識部位が、ＳＬＧＲのアミノ酸の配列（配列番号３９２）を含む、請求項７３に記載の方法。
【請求項７５】
前記非補体プロテアーゼが、前記標的基質の基質認識部位を切断する、請求項３７から７４のいずれかに記載の方法。
【請求項７６】
前記非補体プロテアーゼが、第Ｉ因子基質認識部位を切断する、請求項７５に記載の方法。
【請求項７７】
前記非補体プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、補体媒介性障害を処置するための第２の作用物質と組み合わせて投与される、請求項３７から７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記第２の作用物質が、抗炎症剤または抗凝固薬である、請求項７７に記載の方法。
【請求項７９】
前記第２の作用物質が、ＮＳＡＩＤ、代謝拮抗物質、コルチコステロイド、鎮痛薬、細胞毒性薬、炎症促進性サイトカイン阻害剤、抗炎症性サイトカイン、Ｂ細胞標的作用物質、Ｔ抗原を標的にする化合物、接着分子遮断薬、ケモカイン受容体拮抗薬、キナーゼ阻害剤、ＰＰＡＲ−γリガンド、補体阻害剤、ヘパリン、ワルファリン、アセノクマロール、フェニンジオン、ＥＤＴＡ、クエン酸塩、シュウ酸塩、アルガトロバン、レピルジン、ビバリルジン、およびキシメラガトランのうちの１つまたは複数の中から選択される、請求項７８に記載の方法。
【請求項８０】
（ａ）補体経路の１つまたは複数の補体標的基質を切断して、前記標的基質を含む経路の補体活性化を変更させる非補体プロテアーゼと、
（ｂ）補体媒介性障害を処置するための１つまたは複数の第２の作用物質とを含む組合せ。
【請求項８１】
１つまたは複数の前記第２の作用物質が、抗炎症剤または抗凝固薬である、請求項８０に記載の組合せ。
【請求項８２】
前記抗炎症剤が、ＮＳＡＩＤ、代謝拮抗物質、コルチコステロイド、鎮痛薬、細胞毒性薬、炎症促進性サイトカイン阻害剤、抗炎症性サイトカイン、Ｂ細胞標的作用物質、Ｔ抗原を標的にする化合物、接着分子遮断薬、ケモカイン受容体拮抗薬、キナーゼ阻害剤、ＰＰＡＲ−γリガンド、補体阻害剤、ヘパリン、ワルファリン、アセノクマロール、フェニンジオン、ＥＤＴＡ、クエン酸塩、シュウ酸塩、アルガトロバン、レピルジン、ビバリルジン、およびキシメラガトランのうちの１つまたは複数の中から選択される、請求項８１に記載の組合せ。
【請求項８３】
補体活性化が阻害される、請求項８０から８２のいずれか一項に記載の組合せ。
【請求項８４】
スカフォールドプロテアーゼの１つまたは複数のアミノ酸において修飾を含み、
前記修飾アミノ酸残基が、標的基質についての特異性もしくは標的基質への活性の一方または両方を増加させ、前記標的基質が補体タンパク質である、修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８５】
前記標的基質が、Ｃ１ｑ、Ｃ２、Ｃ３、ｉＣ３、Ｃ４、ｉＣ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９、ＭＢＬ、Ｂ因子、Ｄ因子、Ｐ因子、ＭＡＳＰ−１、ＭＡＳＰ−２、Ｃ１ｒ、Ｃ１ｓ、Ｃ４ｂ、Ｃ４ａ、Ｃ２ｂ、Ｃ２ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ３ａ、Ｂａ、またはＢｂのうちの１つまたは複数である、請求項８４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８６】
前記標的基質が、配列番号２９８、２９９、３００、３０２、３０４、３０５、３０６、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、３１７、３１８、３１９、３２０、３２１、３２２、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３５、３３８、３４０、および３４４のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を含む、または補体活性を呈するその断片を含む、請求項８４または８５に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８７】
前記標的基質がフィコリンである、請求項８４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８８】
前記標的基質が、配列番号６６０〜６６２のいずれかに記載されるアミノ酸の配列を含む、請求項８７に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項８９】
前記スカフォールドプロテアーゼが、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、トレオニンプロテアーゼ、およびメタロプロテアーゼの中から選択される、請求項８４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９０】
前記スカフォールドプロテアーゼが、グランザイムＢ、グランザイムＡ、グランザイムＭ、カテプシンＧ、ＭＴ−ＳＰ１、好中球エラスターゼ、キマーゼ、アルファ−トリプターゼ、ベータ−トリプターゼＩまたはＩＩ、キモトリプシン、コラーゲナーゼ、第ＸＩＩ因子、第ＸＩ因子、ＣＩＩ因子、第Ｘ因子、トロンビン、プロテインＣ、ｕ−プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）、ｔ−プラスミノーゲン活性化因子（ｔ−ＰＡ）、プラスミン、血漿カリクレイン、キモトリプシン、トリプシン、カテプシン、パパイン、クルザイン、金属プロテアーゼ、ならびにその対立遺伝子変形物、アイソフォーム、および触媒活性部分の中から選択される、請求項８９に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９１】
前記スカフォールドプロテアーゼが、配列番号２、４、８、７７、７９、８３、８５、８７、８９、９３、９９、１１７、１１９、１２１、１２３、１３２、１３４、１３８、１４２、１４４、１４６、１４８、１６２、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４，１７６、１７８、１８０、１８２、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２３８、２４８、２５０、２６０、２６２、２８０、２８２、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、５４７、５４９、および５５１のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列ならびにそれらの触媒活性部分を含む、請求項９０に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９２】
前記スカフォールドプロテアーゼが、ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼである、請求項９０に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９３】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分が、配列番号２または１０に記載されるアミノ酸の配列を含む、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９４】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項９２または９３に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９５】
少なくとも２つ以上の修飾を含み、キモトリプシン番号付けに基づいて、一方の修飾は位置１４６にあり、他方の修飾は位置２２４にあり、ただし、
（ｉ）プロテアーゼが２つの修飾のみを含む場合、プロテアーゼは、前記２つの修飾としてＹ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆを含まず、
（ｉｉ）プロテアーゼが３つの修飾を含有する場合、プロテアーゼは、Ｙ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆと共に、Ｆ９９ＶまたはＩまたはＬまたはＴを含まない、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９６】
少なくとも２つ以上の修飾を含み、キモトリプシン番号付けに基づいて、一方の修飾は位置１４６にあり、他方の修飾は位置２２４にあり、ただし、
（ｉ）プロテアーゼが２つの修飾のみを含む場合、プロテアーゼは、前記２つの修飾としてＹ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆを含まず、
（ｉｉ）プロテアーゼが３つの修飾を含有する場合、プロテアーゼは、Ｙ１４６ＤおよびＫ２２４Ｆと共に、Ｆ９９ＶまたはＩまたはＬまたはＴを含まない、請求項９４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９７】
少なくとも１つの修飾をキモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１に含む、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９８】
少なくとも１つの修飾をキモトリプシン番号付けに基づいた位置１５１に含む、請求項９４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項９９】
ＭＴ−ＳＰ１または触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたI41T/Y146D/G151L/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、およびI41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/G151L/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項９７または９８に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１００】
ＭＴ−ＳＰ１または触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＩ４１Ｔ／Ｉ４６Ｄ／Ｇ１５１Ｌ／Ｋ２２４Ｆの修飾に対応する、請求項９９に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０１】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたＤ９６Ａ、Ｄ９６Ｖ、Ｄ９６Ｆ、Ｄ９６Ｆ、Ｄ９６Ｓ、Ｄ９６Ｔ、Ｆ９９Ｓ、Ｆ９９Ｇ、Ｑ１７４Ｈ、Ｑ１７４Ａ、Ｑ１７４Ｖ、Ｑ１７４Ｆ、Ｑ１７４Ｒ、Ｑ１７４Ｋ、Ｑ１７４Ｌ、Ｑ１７４Ｙ、Ｑ１９２Ｌ、Ｑ１９２Ｉ、Ｑ１９２Ｅ、Ｑ１９２Ｋ、Ｑ１９２Ｙ、Ｄ２１７Ｑ、Ｄ２１７Ｎ、Ｄ２１７Ｈ、Ｋ２２４Ａのうちの１つまたは複数から選択される、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０２】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいたY146E/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224R、I41T/Y146D/K224F、I41T/Y146E/Q175D/K224N、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224L、Y146E/ Q221aE/K224F、I41T/ Y146E/ G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224N、Q221aD、Y146E/K224R、Y146E/ Q175D/ K224N、Y146D/K224R、I41T/Y146E/G151L/Q175D/K224F、Y146E/Q175D/K224R、Y146E/L224L、G147E、Y146D/Q175D/K224R、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175L/K224L、Y146D/Q175W/K224L、Y146D/K224L、Y146E/Q221aE/K224R、Y146E/ K224A、Y146D/Q175H/K224L、Y146D/Q175Y/K224L、Y146E/K224Y、Y146D/Q175F/K224L、Y146D/Q175F/K225L、Y146D/Q221aL/K224S、I41E/Y146D/K224L、Y146D/D217F/K224L、Y146D/D217F/K224L、H143V/Y146D/K224F、Y146E/K224F、Y146A/K224F、Y146E/K224T、I41T/Y146E/K224L、I41F/Y146D/K224F、I41L/Y146D/K224F、I41T/Y146D/G151L/K224F、I41A/Y146D/K224F、I41E/Y146D/K224F、I41D/Y146D/K224L、I41D/Y146D/K224F、Y146N/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224F、Q192F/K224F、Y146D/Q192A/K224F、Q192V/K224F、I41T/Y146D/Q175D/K224L、I41T/Y146D/Q175D/K224R、I41T/Y146D/Q175D/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224L、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224R、I41T/Y146D/G151L/Q175D/K224N、I41T/Y146E/Q175D/K224F、およびI41T/Y146E/Q175D/K224L、、I41T/Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/Q175D/K224N、Y146D/G151L/K224N、Y146D/Q175R/K224N、Y146D/Q175K/K224N、Y146D/Q175H/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224F、I41T/Y146D/G151L/Q175K/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175R/K224N、I41T/Y146D/G151L/Q175H/K224N、およびI41T/Y146D/G151L/Q175Y/K224Nの中から選択される、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０３】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号４１〜５１、５６、５７、６０〜６４、６７、６９、４１９〜４２９、４３１、４３４、４３５、４３８〜４４２、４４５、５２４、５２５、５２７〜５３０、５３２、５３３、５５２〜６５９、または６６３〜７１０のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０４】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、配列番号５９６または６５０のいずれか１つに記載されるアミノ酸の配列を有する修飾ＭＴ−ＳＰ１ポリペプチドに対応する、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０５】
前記ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼが、前記標的基質の基質認識部位を切断する、請求項１０３に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０６】
前記標的基質がＣ２またはＣ３である、請求項１０５に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０７】
前記標的基質がＣ２であり、前記基質認識部位が、ＳＬＧＲのアミノ酸の配列（配列番号３９２）を含む、請求項１０６に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１０８】
請求項８４〜１０７、１３１、および１３０のいずれかの修飾非補体プロテアーゼを含む医薬組成物。
【請求項１０９】
（ａ）請求項１０８に記載の医薬組成物と、
（ｂ）補体媒介性障害を処置するための１つまたは複数の第２の作用物質とを含む組合せ。
【請求項１１０】
薬学的に許容し得る賦形剤をさらに含む、請求項１０８に記載の医薬組成物。
【請求項１１１】
全身、経口、経鼻、経肺、局所、または局部投与のために製剤される、請求項１１０に記載の医薬組成物。
【請求項１１２】
請求項１０８または１０９のいずれか一項に記載の医薬組成物と、前記組成物の投与のためのデバイスとを含み、投与のための使用説明書を含んでいてもよいキット。
【請求項１１３】
請求項８４から１０７に記載の修飾非補体プロテアーゼのいずれか１つをコードするヌクレオチドの配列を含む核酸分子。
【請求項１１４】
請求項１１３に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項１１５】
請求項１１４に記載のベクターを含む細胞。
【請求項１１６】
対象に、請求項１１３に記載の核酸分子を投与することを含む処置の方法。
【請求項１１７】
前記核酸分子が、ベクターの中に投与のために導入される、請求項１１６に記載の処置の方法。
【請求項１１８】
前記ベクターが発現ベクターである、請求項１１７に記載の処置の方法。
【請求項１１９】
前記ベクターがエピソーム性である、請求項１１８に記載の処置の方法。
【請求項１２０】
前記発現ベクターが、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、ＥＢＶ、ＳＶ４０、サイトメガロウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、または人工染色体の中から選択される、請求項１１７または１１８に記載の処置の方法。
【請求項１２１】
前記核酸が、ｉｎ ｖｉｖｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで投与される、請求項１１７から１２０のいずれかに記載の処置の方法。
【請求項１２２】
ｅｘ ｖｉｖｏ処置が、ｉｎ ｖｉｔｒｏにおいて細胞中に前記核酸を投与し、続いて前記細胞を前記対象に投与することを含む、請求項１２１に記載の処置の方法。
【請求項１２３】
前記細胞が、適合するドナーまたは処置される前記対象からのものである、請求項１２２に記載の処置の方法。
【請求項１２４】
前記対象がヒトである、請求項１１６から１２３に記載の処置の方法。
【請求項１２５】
非プロテアーゼポリペプチドに融合される、請求項８４から１０７、１３１、および１３０のいずれかに記載のプロテアーゼの触媒活性部分を含む融合タンパク質。
【請求項１２６】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項１２７】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を有するプロテアーゼから選択される、請求項１８に記載の方法。
【請求項１２８】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を含む、請求項５６に記載の方法。
【請求項１２９】
ＭＴ−ＳＰ１プロテアーゼまたはその触媒活性部分における前記修飾が、キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１における修飾を含む、請求項５８に記載の方法。
【請求項１３０】
キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１で少なくとも１つの修飾を含む、請求項９２に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１３１】
キモトリプシン番号付けに基づいた位置４１で少なくとも１つの修飾を含む、請求項９４に記載の修飾非補体プロテアーゼ。
【請求項１３２】
補体媒介性疾患または障害の処置用の薬剤の製剤のための、請求項８４から１０７、１３１、および１３０のいずれかに記載の非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３３】
補体媒介性疾患または障害の処置のための、請求項８４から１０７、１３１、および１３０のいずれかに記載の非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３４】
補体媒介性疾患または障害の処置用の薬剤の製剤のための非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３５】
補体媒介性疾患または障害の処置のための非補体プロテアーゼの使用。
【請求項１３６】
前記非補体プロテアーゼが、補体経路の１つまたは複数の標的基質を切断して、前記標的基質を含む経路の補体活性化を変更させる、請求項１３２から１３５のいずれかに記載の使用。
【請求項１３７】
補体活性化が阻害される、請求項１３６に記載の使用。
【請求項１３８】
補体活性化の阻害が、炎症性障害、神経変性障害、および心血管障害の中から選択される補体媒介性障害に関連する炎症性症状の低下につながる、請求項１３７に記載の使用。
【請求項１３９】
前記補体媒介性障害が、セプシス、関節リウマチ（ＲＡ）、膜性増殖性糸球体腎炎（ＭＰＧＮ）、多発性硬化症（ＭＳ）、重症筋無力症（ＭＧ）、喘息、炎症性腸疾患、免疫複合体（ＩＣ）媒介性急性炎症性組織傷害、アルツハイマー病（ＡＤ）、および虚血再灌流傷害の中から選択される、請求項１３８に記載の使用。
【請求項１４０】
前記補体媒介性障害がギラン−バレー症候群である、請求項１３８に記載の使用。
【請求項１４１】
前記虚血再灌流傷害が、心筋梗塞症（ＭＩ）、発作、血管形成術、冠動脈バイパス術、心肺バイパス（ＣＰＢ）、および血液透析の中から選択される事象または処置により引き起こされる、請求項１３９に記載の使用。
【請求項１４２】
前記補体媒介性障害が、対象の処置に起因する、請求項１３２から１４１のいずれかに記載の使用。
【請求項１４３】
前記処置が、補体媒介性虚血再灌流傷害をもたらす、請求項１４２に記載の方法。
【請求項１４４】
前記処置が、血管形成術または冠動脈バイパス術である、請求項１４３に記載の方法。
【図１】
【公表番号】特表２００９−５１２４５１（Ｐ２００９−５１２４５１Ａ）
【公表日】平成２１年３月２６日（２００９．３．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５３６８４７（Ｐ２００８−５３６８４７）
【出願日】平成１８年１０月２０日（２００６．１０．２０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４１１６５
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０４７９９５
【国際公開日】平成１９年４月２６日（２００７．４．２６）
【出願人】（５０８１２１５９９）カタリスト・バイオサイエンシーズ・インコーポレイテッド (7)
【氏名又は名称原語表記】ＣＡＴＡＬＹＳＴ ＢＩＯＳＣＩＥＮＣＥＳ， ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年３月２６日（２００９．３．２６）
【国際特許分類】
【出願日】平成１８年１０月２０日（２００６．１０．２０）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０４１１６５
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０４７９９５
【国際公開日】平成１９年４月２６日（２００７．４．２６）
【出願人】（５０８１２１５９９）カタリスト・バイオサイエンシーズ・インコーポレイテッド (7)
【氏名又は名称原語表記】ＣＡＴＡＬＹＳＴ ＢＩＯＳＣＩＥＮＣＥＳ， ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】
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