【課題】サイズに基づいた目的の分子の分離が必要とされる広範な種々のリガンド対反応に利用され得る組成物および方法を提供すること。
【解決手段】本発明により、次式の化合物：Ｔ^ms−Ｌ−Ｘ（ここで、Ｔ^msは、質量分析によって検出可能な有機基であり、これは炭素、少なくとも一つの水素およびフッ化物、ならびに酸素、窒素、硫黄、リンおよびヨウ素から選択される任意の原子を含む；Ｌは、独特のＴ^ms含有部分が、化合物の残部から切断されることを可能にする有機基であり、ここで、Ｔ^ms含有部分は化合物が質量分析を受けるときに単一イオン化荷電状態を補助する官能基を含み、これは三級アミン、四級アミンまたは有機酸である；そしてＸは、ホスホルアミダイトおよびＨ−ホスホネートから選択された官能基である）が提供される。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
核酸標的中の単一ヌクレオチド多型の存在を決定する方法であって、該方法が、以下の工程：
（ａ）単一ヌクレオチド多型を含む核酸標的の配列を増幅する工程；
（ｂ）該標的の一本鎖形態を生成する工程；
（ｃ）相補的な増幅され選択された標的核酸分子に、タグ化核酸プローブをハイブリダイゼーションさせるために十分な時間および条件下で、該タグ化核酸プローブを、該増幅された標的核酸分子と合わせる工程であって、ここで、該タグは、特定の単一ヌクレオチド多型と相関し、そして分光測定または電位差測定により検出可能である；
（ｄ）ハイブリダイズしていないタグ化プローブを、ハイブリダイズしたタグ化プローブから、サイジング方法論により分離する工程；
（ｅ）該タグを該プローブから切断する工程；および
（ｆ）分光測定または電位差測定により該タグを検出し、そして該単一ヌクレオチド多型の存在を決定する工程、
を含む、方法。
【請求項２】
明細書に記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１４Ｃ】

【図１４Ｄ】

【図１４Ｅ】

【図１４Ｆ】

【図１４Ｇ】

【図１４Ｈ】

【図１４Ｉ】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９Ａ】

【図１９Ｂ】

【図２０Ａ】

【図２０Ｂ】

【図２１】

【図２２Ａ】

【図２２Ｂ】

【図２２Ｃ】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【公開番号】特開２００９−１５９９８５（Ｐ２００９−１５９９８５Ａ）
【公開日】平成２１年７月２３日（２００９．７．２３）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−９８４８３（Ｐ２００９−９８４８３）
【出願日】平成２１年４月１４日（２００９．４．１４）
【分割の表示】特願２０００−５０４２８６（Ｐ２０００−５０４２８６）の分割
【原出願日】平成１０年７月２２日（１９９８．７．２２）
【出願人】（３９８０７３９７２）キアジェン　ジェノミックス，インコーポレイテッド (4)
【Ｆターム（参考）】