【課題】下面発酵酵母のゲノム配列情報を用いて、蛋白質と遺伝子との対応および全ての遺伝子の機能を解明する。
【解決手段】(ａ)酵母を所定の培養条件下で培養する工程、(ｂ)該酵母の培養物から蛋白質試料を抽出する工程、(ｃ)該蛋白質試料を蛋白質分離手段により分離し、標的ピークまたはスポットを選択し、該ピークまたはスポットに含まれる標的蛋白質またはその断片を回収する工程、(ｄ)該標的蛋白質の全部または一部のアミノ酸配列を決定する工程、(ｅ)工程(ｄ)において決定されたアミノ酸配列と、下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部に基づいて、予め決定しておいたアミノ酸配列とを比較する工程、(ｆ)該比較結果に基づいて、該標的蛋白質および該標的蛋白質をコードする遺伝子を同定する工程、および(ｇ)該同定された遺伝子の機能解析を行うことによって該遺伝子が酵母に付与する特性を同定する工程を包含する、方法。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
目的とする酵母のタンパク質またはそれをコードする遺伝子を同定する方法であって、
(a)酵母を所定の培養条件下で培養する工程、
(b)該酵母の培養物からタンパク質試料を抽出する工程、
(c)該タンパク質試料をタンパク質分離手段により分離し、標的ピークまたはスポットを選択し、該ピークまたはスポットに含まれる標的タンパク質またはその断片を回収する工程、
(d)該標的タンパク質の全部または一部のアミノ酸配列を決定する工程、
(e)工程(d)において決定されたアミノ酸配列と、下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部に基づいて、予め決定しておいたアミノ酸配列とを比較する工程、
(f)該比較結果に基づいて、該標的タンパク質および該標的タンパク質をコードする遺伝子を同定する工程、および
(g)該同定された遺伝子の機能解析を行うことによって該遺伝子が酵母に付与する特性を同定する工程
を包含する方法。
【請求項２】
前記下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部が、
配列番号３３〜６２３６、
配列番号７５３３７〜８２７８４、
配列番号１６６１５４〜１６６１８１、
配列番号１６６４９０〜１６７０４２、および
配列番号１７３１２５〜１７４６０３の塩基配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部が、
配列番号３３〜６２３６、
配列番号７５３３７〜８２７８４、
配列番号１６６１５４〜１６６１８１、
配列番号１６６４９０〜１６７０４２、および
配列番号１７３１２５〜１７４６０３から選ばれる２以上の塩基配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部が、
配列番号３３〜６２３６の塩基配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部が、
配列番号３３〜６２３６から選ばれる２以上の塩基配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部が、
配列番号１６６１５４〜１６６１８１の塩基配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記下面発酵酵母のゲノム配列情報の全部または一部が、
配列番号１６６１５４〜１６６１８１から選ばれる２以上の塩基配列を含む、請求項１に記載の方法。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【公開番号】特開２００７−２２８９５６（Ｐ２００７−２２８９５６Ａ）
【公開日】平成１９年９月１３日（２００７．９．１３）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００６−１１７１９８（Ｐ２００６−１１７１９８）
【出願日】平成１８年２月２８日（２００６．２．２８）
【出願人】（０００００１９０４）サントリー株式会社 (319)
【Ｆターム（参考）】