本発明は、炎症性疾患および／または癌と関連する抗原の存在によって特徴付けられる障害を処置および診断する組成物および方法に関連する。一局面において、本発明は、一般に免疫関連疾患（哺乳動物（ヒトを含む）における炎症性疾患を含む）の診断および処置に有用な組成物および方法に関する。本発明は、一部、哺乳動物における免疫応答に関与する化合物（ポリペプチドおよび抗体が挙げられる）の同定に基づいている。一局面において、本発明は、哺乳動物の炎症性障害を処置する方法に関し、ネイティブの配列ＳＴＩｇＭＡポリペプチド、ＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチドまたはＰＲＯ２４５ポリペプチドのアンタゴニストの治療的に有効量を、哺乳動物に投与する工程を包含する。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物における炎症性障害を処置する方法であって、該方法は、該哺乳動物にネイティブの配列ＳＴＩｇＭＡポリペプチド、ＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチドまたはＰＲＯ２４５ポリペプチドのアンタゴニストの治療的に有効量を投与する工程を包含する、方法。
【請求項２】
（１）前記ネイティブの配列ＳＴＩｇＭＡポリペプチドは、配列番号２、配列番号３２、配列番号３３および配列番号３４のポリペプチドからなる群より選択されるか、（２）前記ＰＲＯ３０１ポリペプチドは、配列番号１の配列を含むか、（３）前記ＰＲＯ３６２ポリペプチドは、配列番号２の配列を含むか、または（４）前記ＰＲＯ２４５ポリペプチドは、配列番号９の配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記アンタゴニストが抗体である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記抗体が非ヒト相補性決定領域（ＣＤＲ）残基を有し、かつ、ヒトフレームワーク領域（ＦＲ）残基を含む、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記抗体が、薬学的に受容可能なキャリアもしくは賦形剤との混合物中の組成である、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記アンタゴニストがイムノアドヘシンである、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記イムノアドヘシンが、免疫グロブリン定常領域配列に融合したＳＴＩｇＭＡポリペプチド、ＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチドまたはＰＲＯ２４５ポリペプチドの細胞外領域配列を含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記細胞外領域配列が本質的に膜貫通ドメイン配列を含まない、請求項５〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記免疫グロブリンがＩｇＧである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記ＩｇＧがＩｇＧ１またはＩｇＧ３である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記炎症性障害が、炎症性腸疾患；全身性エリテマトーデス；慢性関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身性硬化症、例えば、強皮症；特発性炎症性筋障害、例えば、皮膚筋炎、多発性筋炎；シェーグレン症候群；全身性脈管炎；サルコイドーシス、自己免疫性溶血性貧血、例えば、免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症；自己免疫性血小板減少症、例えば、特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症；甲状腺炎、例えば、グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎；糖尿病、免疫媒介性腎疾患、例えば、糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎；中枢神経系および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症）、特発性多発神経障害；肝胆道疾患（例えば、Ａ型肝炎、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、Ｄ型肝炎、Ｅ型肝炎および非肝親和性ウイルスなどの感染性肝炎；自己免疫性慢性活動性肝炎；原発性胆汁性肝硬変；肉芽腫性肝炎；および硬化性胆管炎；炎症性肺疾患および線維性肺疾患（例えば、嚢胞性線維症）；グルテン過敏性腸疾患；ホウィップル病；自己免疫性または免疫媒介性皮膚疾患（水疱性皮膚疾患、多形性紅斑および接触皮膚炎、乾癬が挙げられる）；肺のアレルギー性疾患（好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）、移植関連疾患（移植片拒絶および移植片対宿主病）からなる群より選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記炎症性疾患が慢性関節リウマチである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記哺乳動物がヒトである、請求項１２または請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
哺乳動物における炎症性障害を診断する方法であって、該方法は、（ａ）該哺乳動物から入手した細胞の試験サンプル中、および（ｂ）同一細胞型の既知の正常細胞のコントロールサンプル中のＳＴＩｇＭＡポリペプチド、ＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチドまたはＰＲＯ２４５ポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルを決定する工程を包含し、ここで、該コントロールサンプルと比較して、該試験サンプル中のより高いレベルの該遺伝子の発現は、該試験組織細胞が入手された該哺乳動物における免疫関連障害の存在を示す、方法。
【請求項１６】
（１）前記ＳＴＩｇＭＡポリペプチドが、配列番号２、配列番号３２、配列番号３３および配列番号３４のポリペプチドからなる群より選択されるか、（２）前記ＰＲＯ３０１ポリペプチドが配列番号１の配列を含むか、（３）前記ＰＲＯ３６２ポリペプチドが配列番号２の配列を含むか、または（４）前記ＰＲＯ２４５ポリペプチドが配列番号９の配列を含む、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
哺乳動物における免疫性障害を診断する方法であって、該方法は、（ａ）抗ＳＴＩｇＭＡ抗体、抗ＰＲＯ３０１抗体、抗ＰＲＯ３６２抗体または抗ＰＲＯ２４５抗体を該哺乳動物から入手した細胞の試験サンプルと接触させる工程、および（ｂ）該試験サンプル中の該抗体とＳＴＩｇＭＡポリペプチド、ＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチドまたはＰＲＯ２４５ポリペプチドとの間の複合体の形成を検出する工程を包含し、該複合体の形成が、該哺乳動物における炎症性障害の存在を示す、方法。
【請求項１８】
哺乳動物において腫瘍の存在を検出する方法であって、該方法は、（ａ）該哺乳動物から採取した細胞の試験サンプル中のＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチド、ＰＲＯ２４５ポリペプチドまたはＰＲＯ１８６８ポリペプチドをコードする遺伝子の発現のレベルと（ｂ）同一細胞型の既知の正常細胞のコントロールサンプル中のＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチド、ＰＲＯ２４５ポリペプチドまたはＰＲＯ１８６８ポリペプチドをコードする遺伝子の発現のレベルとを比較する工程を包含し、ここで、該コントロールサンプルと比較して、該試験サンプル中の該ポリペプチドのより高い発現レベルは、該哺乳動物の腫瘍における存在を示す、方法。
【請求項１９】
哺乳動物における腫瘍を診断する方法であって、該方法は、（ａ）抗ＰＲＯ３０１抗体、抗ＰＲＯ３６２抗体、抗ＰＲＯ２４５抗体および抗ＰＲＯ１８６８抗体からなる群より選択される抗体を、該哺乳動物から入手した細胞の試験サンプルと接触させる工程、および（ｂ）該試験サンプル中の抗ＰＲＯ３０１抗体、抗ＰＲＯ３６２抗体、抗ＰＲＯ２４５抗体または抗ＰＲＯ１８６８抗体それぞれと、ＰＲＯ３０１ペプチド、ＰＲＯ３６２ペプチド、ＰＲＯ２４５ペプチドまたはＰＲＯ１８６８ペプチドそれぞれとの間の複合体の形成を検出する工程であって、該複合体の形成が、該哺乳動物における腫瘍の存在を示す、方法。
【請求項２０】
前記試験サンプルが、新生物の細胞成長または細胞増殖を有することが疑われる哺乳動物から入手される、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記哺乳動物が、結腸癌、精巣癌、肺癌および乳癌からなる群より選択される疾患および障害に関する新生物の細胞成長または細胞増殖を有することが疑われる、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記哺乳動物に、治療的に有効量のＰＲＯ１８６８アゴニストを投与する工程を包含する、哺乳動物の骨および／または軟骨関連障害を処置する方法。
【請求項２３】
ＳＴＩｇＭＡポリペプチド、ＰＲＯ３０１ポリペプチド、ＰＲＯ３６２ポリペプチド、ＰＲＯ２４５ポリペプチドまたはＰＲＯ１８６８ポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項２４】
請求項２３に記載の抗体であって、該抗体は、（１）該ＳＴＩｇＭＡポリペプチドが配列番号２、配列番号３２、配列番号３３および配列番号３４のポリペプチドからなる群より選択されるか、（２）該ＰＲＯ３０１ポリペプチドが配列番号１の配列を含むか、（３）該ＰＲＯ３６２ポリペプチドが配列番号２の配列を含むか、または、（４）該ＰＲＯ２４５ポリペプチドが配列番号９の配列を含む、抗体。
【請求項２５】
モノクローナル抗体である、請求項２３または請求項２４に記載の抗体。
【請求項２６】
非ヒト相補性決定領域（ＣＤＲ）残基およびヒトフレームワーク領域（ＦＲ）残基を含む、請求項２５に記載の抗体。
【請求項２７】
標識される、請求項２６に記載の抗体。
【請求項２８】
固体支持体上に固定される、請求項２７に記載の抗体。
【請求項２９】
抗体フラグメント、単鎖抗体、または抗イディオタイプ抗体である、請求項２３または請求項２４に記載の抗体。
【請求項３０】
請求項２９に記載の抗体を、薬学的に受容可能なキャリアと混合して含有する組成物。
【請求項３１】
二次抗体または細胞毒性剤または化学療法剤を、さらに含有する、請求項３０に記載の組成物。
【請求項３２】
単離された核酸分子であって、該核酸分子は、配列番号３２のアミノ酸２１〜２７６、配列番号３３のアミノ酸２１〜１８２、配列番号３４のアミノ酸２１〜１８０、または配列番号３１のアミノ酸１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約８０％の同一性を有するポリペプチドをコードする核酸配列を含む、核酸分子。
【請求項３３】
前記配列同一性が少なくとも約８５％である、請求項３２に記載の単離された核酸分子。
【請求項３４】
（ａ）図２２（配列番号３１）のアミノ酸残基１〜３１０の配列を含むＰＲＯ１８６８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、または（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の相補体に対して少なくとも８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含む、単離された核酸。
【請求項３５】
図２２（配列番号３１）のアミノ酸残基１〜３１０を有するＰＲＯ１８６８ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む、請求項３４に記載の単離された核酸。
【請求項３６】
ＡＴＣＣ受託番号２０３５５３の下で寄託されたｃＤＮＡの全長コード配列に対して、少なくとも８０％の核酸配列同一性を有する、単離された核酸。
【請求項３７】
配列番号３２のアミノ酸２１〜３９９、配列番号３３のアミノ酸２１〜３０５、および配列番号３４のアミノ酸２１〜２８０からなる群より選択されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
【請求項３８】
請求項３２〜請求項３７のいずれか１項に記載の核酸を含む、ベクター。
【請求項３９】
前記ベクターを用いて形質転換された宿主細胞によって識別される制御配列に、作動可能に結合した、請求項３８に記載のベクター。
【請求項４０】
請求項３８または請求項３９に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項４１】
前記宿主細胞が、ＣＨＯ細胞、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母細胞およびバキュロウイルス感染昆虫細胞からなる群より選択される、請求項４０に記載の宿主細胞。
【請求項４２】
ＰＲＯ１８６８ポリペプチドの発現に適した条件下で、請求項４１に記載の宿主細胞を培養する工程、および該培養物から該ポリペプチドを回収する工程を包含する、ＰＲＯ１８６８ポリペプチドを産生するためのプロセス。
【請求項４３】
配列番号３２のアミノ酸２１〜２７６、配列番号３３のアミノ酸２１〜１８２、配列番号３４のアミノ酸２１〜１８０、配列番号３１のアミノ酸１〜３１０、および配列番号アミノ酸１〜Ｘからなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドであって、ここで、Ｘは、アミノ酸２３７〜２４７のいずれか一つである、ポリペプチド。
【請求項４４】
ＡＴＣＣ受託番号２０３５５３の下で寄託されたｃＤＮＡの全長コード配列によってコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、単離されたポリペプチド。
【請求項４５】
異種アミノ酸配列に融合した、請求項４３または請求項４４に記載のポリペプチドを含む、キメラ分子。
【請求項４６】
前記異種アミノ酸配列が、エピトープタグまたは免疫グロブリンのＦｃ領域である、請求項４５に記載のキメラ分子。
【請求項４７】
免疫グロブリンの定常領域配列に融合した、配列番号３２のアミノ酸１もしくは約２１〜約２７６、または配列番号３３のアミノ酸１または約２１〜約１８２、配列番号３４のアミノ酸１または約２１〜約１８０を含む、イムノアドヘシン。
【請求項４８】
前記定常領域配列が、免疫グロブリン重鎖定常領域の配列である、請求項４７に記載のイムノアドヘシン。
【請求項４９】
請求項４３または４４に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項５０】
前記抗体が、任意の他のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープに実質的に結合することなく、前記ポリペプチドに特異的に結合するか、または該ポリペプチド上のエピトープに特異的に結合する、請求項４９に記載の抗体。
【請求項５１】
モノクローナル抗体、ヒト化抗体または単鎖抗体である、請求項５０に記載の単離された抗体。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
図２２（配列番号３１）のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項２】
図２２（配列番号３１）のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３】
図２２（配列番号３１）のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項４】
図２２（配列番号３１）のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項５】
図２２（配列番号３１）に示されるアミノ酸残基３１〜３１０を含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項６】
図２２（配列番号３１）に示されるアミノ酸残基３１〜２４１を含む、請求項１に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項７】
配列番号３１のアミノ酸１〜Ｘを含む単離されたポリペプチドであって、Ｘが、アミノ酸２３７〜２４７のいずれか一つである、ポリペプチド。
【請求項８】
異種アミノ酸配列に融合した、請求項１〜７のいずれか１項に記載のポリペプチドを含む、キメラ分子。
【請求項９】
前記異種アミノ酸配列が、エピトープタグまたは免疫グロブリンのＦｃ領域である、請求項８に記載のキメラ分子。
【請求項１０】
単離された核酸分子であって、該核酸分子は、配列番号３１のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約８０％の配列同一性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項１１】
請求項１０に記載の単離された核酸分子であって、該核酸分子は、配列番号３１のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約８５％の配列同一性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項１２】
請求項１０に記載の単離された核酸分子であって、該核酸分子は、配列番号３１のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約９０％の配列同一性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項１３】
請求項１０に記載の単離された核酸分子であって、該核酸分子は、配列番号３１のアミノ酸残基１〜３１０のアミノ酸配列と少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項１４】
配列番号３１のアミノ酸残基１〜３１０をコードするヌクレオチド配列を含む、請求項１０に記載の単離された核酸分子。
【請求項１５】
（ａ）図１１のアミノ酸残基１〜３１０の配列を含むＰＲＯ１８６８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、または（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の相補体に対して少なくとも８０％の配列同一性を有するＤＮＡを含む、単離された核酸。
【請求項１６】
請求項１０〜１５のいずれか１項に記載の核酸を含む、ベクター。
【請求項１７】
前記核酸が、前記ベクターを用いて形質転換された宿主細胞によって識別される制御配列に、作動可能に結合した、請求項１６に記載のベクター。
【請求項１８】
請求項１７に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項１９】
前記宿主細胞が、ＣＨＯ細胞、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞、酵母細胞またはバキュロウイルス感染昆虫細胞である、請求項１８に記載の宿主細胞。
【請求項２０】
ＰＲＯ１８６８ポリペプチドの発現に適した条件下で、請求項１８または１９に記載の宿主細胞を培養する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、ＰＲＯ１８６８ポリペプチドを産生するためのプロセス。
【請求項２１】
図２２（配列番号３１）に示されるポリペプチド配列のアミノ酸残基３１〜２４１に特異的に結合する、抗体。
【請求項２２】
モノクローナル抗体である、請求項２１に記載の抗体。
【請求項２３】
非ヒト相補性決定領域（ＣＤＲ）残基およびヒトフレームワーク領域（ＦＲ）残基を含む、請求項２２に記載の抗体。
【請求項２４】
標識される、請求項２２に記載の抗体。
【請求項２５】
固体支持体上に固定される、請求項２４に記載の抗体。
【請求項２６】
抗体フラグメント、単鎖抗体、または抗イディオタイプ抗体である、請求項２１〜２５のいずれか１項に記載の抗体。
【請求項２７】
請求項２１〜２６のいずれか１項に記載の抗体を、薬学的に受容可能なキャリアと混合して含有する組成物。
【請求項２８】
哺乳動物における腫瘍を診断するための方法であって、該方法は、（ａ）配列番号３１のポリペプチドのアミノ酸残基３１〜２４１に特異的に結合する抗体を、該哺乳動物から入手した細胞の試験サンプルと接触させる工程、および（ｂ）該試験サンプル中の該抗体と該ポリペプチドとの間の複合体の形成を検出する工程であって、該複合体の形成が、該哺乳動物中の腫瘍の存在を示す、工程を包含する、方法。
【請求項２９】
前記試験サンプルが、新生物の細胞成長または細胞増殖を有することが疑われる哺乳動物から入手される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記哺乳動物が、結腸癌、精巣癌、肺癌および乳癌からなる群より選択される疾患または障害に関する新生物の細胞成長または細胞増殖を有することが疑われる、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
腫瘍を処置するための方法であって、該方法は、配列番号３１のポリペプチドを過剰発現する腫瘍を有すると診断された患者に、該ポリペプチドに特異的に結合する抗体を投与する工程を包含する、方法。
【請求項３２】
前記哺乳動物に、治療的に有効量の配列番号３１のポリペプチドまたはそのアゴニストを投与する工程を包含する、哺乳動物の骨および／または軟骨関連障害を処置する方法。
【請求項３３】
十分に分化したマクロファージが組織中の内皮細胞に付着するのを阻害するための方法であって、該方法は、該組織を、配列番号２のポリペプチド、配列番号３２のポリペプチドおよび配列番号３３のポリペプチドからなる群より選択されるポリペプチドの細胞外ドメインを含むイムノアドヘシンと接触させる工程を包含する、方法。
【請求項３４】
哺乳動物における慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を処置するための方法であって、該方法は、該哺乳動物に、配列番号２のポリペプチド、配列番号３２のポリペプチドおよび配列番号３３のポリペプチドからなる群より選択されるポリペプチドの細胞外ドメインを含むイムノアドヘシンの有効量を投与する工程を包含する、方法。

【図１Ａ】


【図２】

【図３】

【図４Ａ−Ｂ】

【図４Ｃ】

【図５】

【図６Ａ】

【図６Ｂ】

【図７】

【図８】

【図９Ａ】

【図９Ｂ】

【図１０Ａ】

【図１０Ｂ】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８】

【図３９】

【図４０】

【図４１】

【図４２】

【図４３】

【図４４】

【図４５】

【図４６】

【図４７】

【図４８】

【図４９】

【図５０】

【図５１】

【図５２】

【図５３】

【図５４】

【図５５】

【図５６】

【図５７】

【図５８】

【図５９】

【図６０】

【図６１Ａ】

【図６１Ｂ】

【図６２】

【図６３】

【図６４】

【図６５】

【図６６】

【図６７】

【図６８】

【図６９】

【図７０】

【図７１】

【公表番号】特表２００６−５０１８６２（Ｐ２００６−５０１８６２Ａ）
【公表日】平成１８年１月１９日（２００６．１．１９）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００５−５００３５８（Ｐ２００５−５００３５８）
【出願日】平成１５年１０月１日（２００３．１０．１）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００３／０３１２０７
【国際公開番号】ＷＯ２００４／０３１１０５
【国際公開日】平成１６年４月１５日（２００４．４．１５）
【出願人】（５９６１６８３１７）ジェネンテック・インコーポレーテッド (372)
【氏名又は名称原語表記】ＧＥＮＥＮＴＥＣＨ，ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】