ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の治療的又は診断的用途
【課題】がんの診断および／または治療に有効な新規薬剤等の提供。
【解決手段】プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子であるがん治療剤。さらに、（ａ）上記遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸、（ｂ）上記遺伝子の転写産物またはその一部に対するアンチセンス核酸、および（ｃ）上記遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸、からなる群から選択される物質を含むがん治療剤。
【解決手段】プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子であるがん治療剤。さらに、（ａ）上記遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸、（ｂ）上記遺伝子の転写産物またはその一部に対するアンチセンス核酸、および（ｃ）上記遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸、からなる群から選択される物質を含むがん治療剤。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、がんにおいて特異的に増幅しているプロテオソーム関連遺伝子、その治療的又は診断的用途などに関する。より具体的には、本発明は、大腸がんにおいて特異的に増幅している遺伝子であるＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子、その治療的又は診断的用途などに関する。
【背景技術】
【０００２】
悪性腫瘍（がん）の特徴として、増殖・浸潤・転移を経て全身化することによる致死があげられる。外科的な切除または放射線治療のような局所療法では、転移性再発がんに対して十分な対処はできず、全身療法である薬物療法の発展が、今後のがん治療成績の向上に期待されている。
【０００３】
がん薬物療法の現在の中心である化学療法は、直接がん細胞のＤＮＡおよび／またはＲＮＡに作用し、細胞を死に至らせる殺細胞薬剤を用いる場合が多いが、がん細胞以外の、例えば、骨髄細胞、生殖細胞、毛母細胞、消化管上皮細胞など分裂がさかんな正常細胞に対しても作用し、強い副作用をもたらしていた。一方、近年の分子細胞生物学の進歩により、がん細胞の浸潤・増殖・転移などにかかわるメカニズムが解明され、そのがん細胞の特定メカニズムに特異的に作用する分子標的薬の開発が注目されている。代表例として、非小細胞肺がんの治療に効果のある、ＥＧＦＲ（上皮成長因子 受容体）チロシンキナーゼ阻害剤であるイレッサ（一般名：ゲフィチニブ）（特許文献１：ＷＯ９６／３３９８０）、乳がんの治療に効果のある、ＨＥＲ−２（ヒト上皮成長因子受容体２）のヒト化モノクローナル抗体のハーセプチン（一般名：トラスツズマブ）（特許文献２：ＷＯ９４／００１３６）などがあげられる。しかしながら、現状では未だ有効な分子標的薬は少なく、今後更なる各がん種に対する有効な分子標的薬の開発が望まれている。
【０００４】
日本人の大腸がんは年々増加の傾向にあり、死亡数は、肺がん、胃がんに次いで３位になっている。年齢別では６０歳代が一番多く、次いで５０歳代、７０歳代の順である。大腸がんの増加の原因には、遺伝的要因、環境的要因などが考えられるが、食生活の西欧化、特に動物性脂肪の取りすぎが原因ではないかと指摘されている。大腸がんの有効な分子標的薬の開発が待たれている。また、診断に用いられている腫瘍マーカー（ＣＥＡ，ＣＡ１９−９）は、進行大腸がんであっても約半数が陽性を示すのみで、臓器特異性も無く、より高性能な診断薬の開発が望まれている。
【特許文献１】ＷＯ９６／３３９８０
【特許文献２】ＷＯ９４／００１３６
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
このような状況下、がんの診断および／または治療に有効な薬剤の開発が望まれている。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、鋭意研究を重ねた結果、がん（特に、大腸がん）において、高頻度に増幅している２つのプロテアソームに関連する遺伝子、ＰＯＭＰ、ＰＳＭＡ７を見出した。本発明者らはさらに、大腸がん細胞株においてＰＯＭＰおよび／またはＰＳＭＡ７の発現を阻害することによって、がん細胞の増殖を抑制し得ることを見出し、本発明を完成するに至った。すなわち、本発明は、以下に記載するがん治療剤、がん抑制作用を有する候補物質のスクリーニング方法、がん診断剤、がん診断用キット、がんの診断方法などを提供する。
【０００７】
［１］プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん治療剤。
［２］上記プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質が、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸、
（ｂ）ＰＯＭＰ遺伝子もしくはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物またはその一部に対するアンチセンス核酸、
および
（ｃ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸、
からなる群から選択される物質を含む、［１］に記載のがん治療剤。
［３］プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である、がん治療剤。
［４］上記プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質が、
該ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体、
を含む、［３］に記載のがん治療剤。
［５］上記がんが大腸がんである、［１］〜［４］のいずれかに記載のがん治療剤。
【０００８】
［６］プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子を発現する細胞に、被検化合物を接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子の発現レベルを測定する工程、および
（ｃ）被検化合物を接触させない場合と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
［７］プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物とを接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物との結合活性を測定する工程、および
（ｃ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と結合する化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
［８］大腸がんの治療剤の候補化合物をスクリーニングするためのものである、［６］または［７］に記載の方法。
【０００９】
［９］ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体。
［１０］［９］に記載の抗体を含有するがん治療剤。
［１１］放射性同位元素、治療タンパク質、低分子の薬剤、または治療遺伝子を担持したベクターをさらに含有する、［１０］に記載のがん治療剤。
［１２］上記がんが大腸がんである、［１０］または［１１］に記載のがん治療剤。
［１３］［９］に記載の抗体を含有するがん診断剤。
［１４］プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列を含有するがん診断剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断剤。
［１５］上記がんが大腸がんである、［１３］または［１４］に記載のがん診断剤。
【００１０】
［１６］［９］に記載の抗体を含有するがん診断用キット。
［１７］プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するがん診断用キットであって、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断用キット。
［１８］上記がんが大腸がんである、［１６］または［１７］に記載のがん診断用キット。
【００１１】
［１９］被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連タンパク質またはプロテアソーム関連遺伝子をがんマーカーとして検出および／または定量する方法であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質であり、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、方法。
［２０］上記生体試料が、全血、血清、または血漿である、［１９］に記載の方法。
［２１］質量分析装置を用いて、上記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、［１９］または［２０］に記載の方法。
［２２］抗プロテアソーム関連抗体を用いて、上記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、［１９］〜［２１］のいずれかに記載の方法。
［２３］（ａ）被験者由来の生体試料と、上記プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体とを接触させる工程、および
（ｂ）上記試料中での上記抗体と、上記プロテアソーム関連タンパク質との結合を検出および／または定量する工程、
を包含する、［２２］に記載の方法。
［２４］（ａ）被験者由来の生体試料と、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドとを接触させる工程、および
（ｂ）上記試料中での上記ポリヌクレオチドと、該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片とのハイブリダイゼーションを検出および／または定量する工程、
を包含する、［１９］または［２０］に記載の方法。
［２５］がんの診断に用いるための［１９］〜［２４］のいずれかに記載の方法。
［２６］上記がんが、大腸がんである、［２５］に記載の方法。
【００１２】
［２７］配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有する、ポリヌクレオチド。
［２８］ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有するポリヌクレオチドを含有する、がん治療剤。
【発明の効果】
【００１３】
本発明により、がん（例えば、大腸がん）の治療および／または診断に有用な新規な薬剤、キットおよび方法、ならびにがん抑制作用を有する候補化合物のスクリーニング方法が提供される。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】ＰＯＭＰ、ＰＳＭＡ７遺伝子の大腸がん患者由来の２００検体における遺伝子増幅度に対する頻度を示すヒストグラムである。
【図２】大腸がん患者由の５つの検体組織（Ａ，Ｂ，Ｃ，Ｄ，Ｅ）のＰＯＭＰ遺伝子領域に対するプローブを用いたＦＩＳＨ光学顕微鏡写真である。ＤＡＰＩ染色された核内に、検体組織では６細胞すべてにおいてシグナルが３以上認められた。
【図３】大腸がん患者由の５つの検体組織（Ａ，Ｂ，Ｃ，Ｄ，Ｆ）のＰＳＭＡ７遺伝子領域に対するプローブを用いたＦＩＳＨ光学顕微鏡写真である。ＤＡＰＩ染色された核内に、検体組織では６細胞すべてにおいてシグナルが３以上認められた。
【図４】定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析により、大腸正常13検体とがん２０検体におけるＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のＴＢＰ遺伝子に対するｍＲＮＡ相対発現量を求め、プロットしたグラフである。
【図５】定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析により測定した、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の遺伝子ノックダウン率を示すグラフである。ＮＣはネガティブコントロールを、ＮＴは未処理を表す。
【図６】ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入後、４８時間と７２時間における内在性のＰＳＭＡ７タンパク質を検出した、イムノブロット解析の結果である。ＰＳＭＡ７タンパク質と思われるバンドを矢印で示した（上のパネル）。アスタリスクは非特異的なバンドを示す。内在性コントロール遺伝子としてＰＰＩＢタンパク質を検出した(下のパネル)。ＮＴは未処理を表す。トランスフェクション後４８時間のＰＳＭＡ７タンパク質はＮＴに対しておよそ３０%にまで減少しており、７２時間後も同程度の減少量であった。
【図７】ＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、２４時間ごとの経時変化を示した微分干渉像である。Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）はＲＮＡｉ解析９６時間目の細胞に対して生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値を求めることで算出した。
【図８】ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、２４時間ごとの経時変化を示した微分干渉像である。Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）はＲＮＡｉ解析９６時間目の細胞に対して生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値を求めることで算出した。
【図９】ＲＫＯ細胞におけるＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析後の生細胞数と死細胞数の経時変化を示したグラフである。
【図１０】大腸がん細胞５種と大腸正常細胞ＣＣＤ１８Ｃｏに対するＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【図１１】大腸がん細胞５種と大腸正常細胞ＣＣＤ１８Ｃｏに対するＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【図１２】肺がん細胞２種と肺正常細胞ＩＭＲ−９０および乳がん細胞２種と乳正常細胞Ｈｓ６１７．Ｍｇに対するＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【図１３】肺がん細胞２種と肺正常細胞ＩＭＲ−９０および乳がん細胞２種と乳正常細胞Ｈｓ６１７．Ｍｇに対するＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１５】
本発明者らは、大腸がん患者由来の検体を用いてアレイＣＧＨ法による増幅遺伝子の検証を行い、大腸がん特異的な遺伝子増幅領域を特定した。検体において高頻度に増幅が起きている領域のうち、ヒトＰＯＭＰ（Proteasome maturation protein）遺伝子およびヒトＰＳＭＡ７（Proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 7）遺伝子が大腸がん患者由来の検体において高頻度であることを見出した。
【００１６】
POMPは、分子シャペロンとしてプロテアソーム形成にかかわるタンパク質分子であり、ハーフプロテアソームを重合させ、２０Ｓプロテアソームの形成を促進することが知られている（特開２００７−１１９３８２号公報）。
【００１７】
PSMA7は、プロテアソームを構成するαタイプサブユニットの１つである。このタンパク質分子はC末端に核局在化シグナルを有しており、プロテアソームを核内に移行させ、機能させるのに重要な役割を担っている（Ogiso, Y., Tomida, A., Tsuruo, T. (2002) Cancer Res. 62, 5008-5012. Nuclear Localization of Proteasomes Participates in Stress-inducible Resistance of Solid Tumor Cells to Topoisomerase II-directed Drugs）。
【００１８】
プロテアソームは、ユビキチンで修飾されたタンパク質を分解する細胞内タンパク質分解装置である。活性型の26Sプロテアソームはタンパク質分解実行ユニットである20Sプロテアソームの両端に、それを制御する19S 複合体が会合した巨大な分子複合体である。
【００１９】
20Sプロテアソームは、リング状に集まった７種類のサブユニット（α１〜α７）から構成されるαリングと、同様にリング状に集まった７種類のサブユニット（β１〜β７） から構成されるβリングが、αββαの順に積み重なった筒状構造をしている。空洞になった部分はタンパク質分解の場となっており、β1、β2、β5がその触媒活性を発揮する。なお、αリングとβリングが一つずつ会合した状態（２０Ｓプロテアソームの半分の状態）を、ハーフプロテアソームという。
【００２０】
ユビキチン−プロテアソームシステムは細胞内における主要なタンパク質分解系として知られている。ユビキチンは、分解するタンパク質に結合し、ポリユビキチン鎖を形成し（ポリユビキチン化修飾）、プロテアソームは、そのポリユビキチン化修飾されたタンパク質を特異的に分解する。
【００２１】
このシステムは、細胞内における選択的なタンパク質分解を通じて、細胞周期・アポトーシス・代謝調節・免疫応答・シグナル伝達・転写制御・ストレス応答・ＤＮＡ修復など、生命科学のあらゆる領域において、中心的な役割を果たしていることが明らかになりつつある(Adams J. (2004) Nat Rev Cancer. 4, 349-360. The proteasome: a suitable antineoplastic target. ； Hershko, A. (2005) Cell Death Differ. 12, 1191-1197. The ubiquitin system for protein degradation and some of its roles in the control of the cell division cycle)。
【００２２】
近年、プロテアソーム阻害剤ががん治療に有用である可能性があることが示された（Kisselev, A. F., Goldgerg, A. L. (2001) Chem. & Biol. 8, 739-758. : Proteasome inhibitors: from research tools to drug candidates.； Elliott, P. J., Ross, J. S., (2001) Am. J. Clin. Pathol. 116, 637-646. The Proteasome: A New Target for Novel Drug Therapies. ）。ベルケード（Bortezomib） は、多発性骨髄腫に高い有効性を持つ抗ガン剤として2003年に欧米で認可された（WO/2003/039545 ）、プロテアソームを標的としたはじめての分子標的薬である。また、多発性骨髄腫以外のがんに対するプロテアソーム阻害剤の有効性についても検討されている（Adams J. (2004) Nat Rev Cancer. 4, 349-360. The proteasome: a suitable antineoplastic target）。
【００２３】
プロテアソーム阻害剤は、プロテアソームの触媒活性を持つβサブユニットを阻害する。特に、Bortezomibはβ5の活性中心に結合して、プロテアソームを特異的かつ可逆的に阻害する（Kisselev, A. F., Goldgerg, A. L. (2001) Chem. & Biol. 8, 739-758. : Proteasome inhibitors: from research tools to drug candidates； Lightcap, E. S., McCormack, T. A., Pien, C. S., Chau, V., Adams, J., and Elliott, P. J. (2000) Clin. Chem. 46, 673-683. Proteasome Inhibition Measurements: Clinical Application）。
【００２４】
しかしながら、ＰＯＭＰまたはＰＳＭＡ７とがんとの直接的な関連については、報告されていない。
【００２５】
本発明者らは、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子（これらは、プロテオソームの形成、機能等に関わるタンパク質をコードする遺伝子である）の発現をＲＮＡｉ（ＲＮＡ干渉）によって抑制することによってがん細胞の増殖を抑制できることを確認した。したがって、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現を抑制することによって、がんを治療することが可能となる。また、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現量を測定することによってがんの診断を行うことも可能となる。
【００２６】
以下、本発明のがん治療剤、スクリーニング方法、診断剤などについて詳細に説明する。
【００２７】
１．がん抑制作用を有する薬剤
本発明は、プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。
【００２８】
より具体的には、本発明は、（１）ＰＯＭＰ遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤、及び（２）ＰＯＭＰタンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。
【００２９】
本発明はまた、（１）ＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤、及び（２）ＰＳＭＡ７タンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。
【００３０】
本明細書中、「プロテアソーム関連遺伝子」という場合、プロテアソームの形成、機能等に関わるタンパク質（以下、「プロテアソーム関連タンパク質」と呼ぶ。）をコードする遺伝子を意味し、より具体的には、ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子などを指す。
【００３１】
本明細書中、「ＰＯＭＰ遺伝子」という場合、ＮＣＢＩヌクレオチドデータベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿０１５９３２で登録されている１３４７塩基対（ｂｐ）からなるヒトＰＯＭＰ遺伝子（配列番号１）を意味するが、これに限定されず、例えば、当該遺伝子の塩基配列において１つ以上（例えば、１〜５０個、１〜４０個、１〜３０個、１〜２５個、１〜２０個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個（１〜数個）、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、１個）の塩基の置換、欠失、付加、または挿入などを有することによって変化している変異体のような、当該遺伝子の塩基配列またはその相補配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドからなる遺伝子も本明細書中で使用する「ＰＯＭＰ遺伝子」に含まれるものとする。
【００３２】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７遺伝子」という場合、ＮＣＢＩヌクレオチドデータベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿００２７９２で登録されている９８４塩基対（ｂｐ）からなるヒトＰＳＭＡ７遺伝子（配列番号３）を意味するが、これに限定されず、例えば、当該遺伝子の塩基配列において１つ以上（例えば、１〜５０個、１〜４０個、１〜３０個、１〜２５個、１〜２０個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個（１〜数個）、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、１個）の塩基の置換、欠失、付加、または挿入などを有することによって変化している変異体のような、当該遺伝子の塩基配列またはその相補配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドからなる遺伝子も本明細書中で使用する「ＰＳＭＡ７遺伝子」に含まれるものとする。
【００３３】
ハイブリダイゼーションは、公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えば、モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｔｈｉｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｊ．Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂ． Ｐｒｅｓｓ． ２００１）に記載の方法などに従って行うことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行うことができる。ここで、「ストリンジェントな条件」は、低ストリンジェントな条件、中ストリンジェントな条件及び高ストリンジェントな条件のいずれでもよい。「低ストリンジェントな条件」は、例えば、５×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ＳＤＳ、５０％ホルムアミド、３２℃の条件である。また、「中ストリンジェントな条件」は、例えば、５×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ＳＤＳ、５０％ホルムアミド、４２℃の条件である。「高ストリンジェントな条件」は、例えば、５×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ＳＤＳ、５０％ホルムアミド、５０℃の条件である。これらの条件において、温度を上げるほど高い相同性を有するＤＮＡが効率的に得られることが期待できる。ただし、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーに影響する要素としては温度、プローブ濃度、プローブの長さ、イオン強度、時間、塩濃度など複数の要素が考えられ、当業者であればこれら要素を適宜選択することで同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。
【００３４】
ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとしては、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴなどの相同性検索ソフトウェアにより、デフォルトのパラメーターを用いて計算したときに、配列番号１の塩基配列と、例えば、７０％以上、７５％以上、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９１％以上、９２％以上、９３％以上、９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、９９％以上の同一性を有するポリヌクレオチドをあげることができる。
【００３５】
本明細書中、「遺伝子の発現阻害」とは、遺伝子からタンパク質生成までの一連の事象（例えば、転写（ｍＲＮＡの生成）、翻訳（タンパク質の生成）を含む）のうちのいずれかの事象を阻害することによってその遺伝子によってコードされるタンパク質の生成を阻害することを意味するものとする。
【００３６】
本明細書中、「ＰＯＭＰタンパク質」という場合、ＮＣＢＩタンパク質データベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＰ＿０５７０１６で登録されている１４１アミノ酸残基（ａａ）からなるヒトＰＯＭＰタンパク質（配列番号２）およびこのタンパク質と実質的に同質の活性（例えば、プロテアソームの形成促進活性）から選択される一種以上の活性）を保持し、このタンパク質のアミノ酸配列に対して１〜複数個のアミノ酸残基の欠失、置換、挿入、及び／または付加が生じたアミノ酸配列からなる変異タンパク質をいう。
【００３７】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７タンパク質」という場合、ＮＣＢＩタンパク質データベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＰ＿００２７８３で登録されている２４８アミノ酸残基（ａａ）からなるヒトＰＳＭＡ７タンパク質（配列番号４）およびこのタンパク質と実質的に同質の機能（例えば、プロテアソームの形成およびプロテアソームの活性発現に必須な構成因子としての機能）から選択される一種以上の機能）を保持し、このタンパク質のアミノ酸配列に対して１〜複数個のアミノ酸残基の欠失、置換、挿入、及び／または付加が生じたアミノ酸配列からなる変異タンパク質をいう。
【００３８】
上記変異タンパク質における、アミノ酸の変異部位および個数は、変異タンパク質が元のタンパク質と実質的に同質の活性を保持している限り特に制限はないが、変異個数は、例えば、１〜５０個、１〜４０個、１〜３０個、１〜２５個、１〜２０個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個（１〜数個）、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、１個である。変異個数は一般的に少ない程好ましい。また、このような変異タンパク質は、配列番号２のアミノ酸配列と約７０％以上、７５％以上、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９１％以上、９２％以上、９３％以上、９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、９９％以上の同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつ元のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質を含む。上記相同性の数値は一般的に大きい程好ましい。
【００３９】
上記ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質には、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の「部分ペプチド」もそれぞれ含まれる。
【００４０】
ＰＯＭＰタンパク質の部分ペプチドとしては、ＰＯＭＰタンパク質のアミノ酸配列（配列番号２）の一部の連続するアミノ酸の配列からなる部分ペプチドであって、好ましくは、前述のＰＯＭＰタンパク質の活性と同様の活性を有するものであればいずれのものでも良い。例えば、配列番号２で表されるアミノ酸配列において、少なくとも２０個、好ましくは少なくとも５０個、さらに好ましくは少なくとも７０個、より好ましくは少なくとも１００個、最も好ましくは少なくとも１３０個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列を有するポリペプチドなどが挙げられる。
【００４１】
ＰＳＭＡ７タンパク質の部分ペプチドとしては、ＰＳＭＡ７タンパク質のアミノ酸配列（配列番号４）の一部の連続するアミノ酸の配列からなる部分ペプチドであって、好ましくは、前述のＰＳＭＡ７タンパク質の活性と同様の活性を有するものであればいずれのものでも良い。例えば、配列番号４で表されるアミノ酸配列において、少なくとも２０個、好ましくは少なくとも５０個、さらに好ましくは少なくとも７０個、より好ましくは少なくとも１００個、最も好ましくは少なくとも２００個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列を有するポリペプチドなどが挙げられる。
【００４２】
好ましくは、これらのポリペプチドは、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の活性に関与する部分に対応するアミノ酸配列を含有する。また、本発明で使用される部分ペプチドは、上記のポリペプチドにおいて、そのアミノ酸配列中の１または複数個（例えば、１〜２０個程度、より好ましくは１〜１０個程度、さらにより好ましくは１〜５個程度）のアミノ酸残基が欠失、付加、置換、または挿入により変更されているものでもよい。
【００４３】
本発明で用いるＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質は、そのタンパク質を発現している細胞や組織から調製することができる。また、これらのタンパク質は、公知のペプチド合成機によっても合成できるし、原核生物あるいは真核生物から選択される適当な宿主細胞を用いた組換え方法によっても調製することができる。本発明で用いるＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質は、いずれの種由来のものでもよいが、好ましくはヒト由来である。
【００４４】
「実質的に同質の活性」とは、それらの活性が性質的に同等であることを示す。したがって、活性（ＰＯＭＰの場合、例えば、プロテアソームの形成促進活性など。ＰＳＭＡ７の場合、例えば、機能（例えば、プロテアソームの形成およびプロテアソームの活性発現に必須な構成因子としての機能など。）が同等（例えば、約０．０１〜１００倍、好ましくは約０．５〜２０倍、より好ましくは約０．５〜２倍）であることが好ましいが、これらの活性の程度やタンパク質の分子量などの量的要素は異なっていてもよい。これらの活性の測定は、それぞれ、Hirano Y, Hayashi H, Iemura S, Hendil KB, Niwa S, Kishimoto T, Kasahara M, Natsume T, Tanaka K, Murata S. (2006) Mol. Cell. 24, 977-84. : Cooperation of multiple chaperones required for the assembly of mammalian 20S proteasomes. 、Liu, X., Huang, W., Li, C., Li, P., Yuan, J., Li, X., Qiu, X. B., Ma, Q., Cao, C. (2006) Mol. Cell. 22, 317-27.: Interaction between c-Abl and Arg tyrosine kinases and proteasome subunit PSMA7 regulates proteasome degradation.などの文献に記載の公知の方法に準じて行うことができるが、例えば、後に記載するスクリーニング方法に従って測定することができる。
【００４５】
なお、アミノ酸配列や塩基配列の同一性は、カーリンおよびアルチュールによるアルゴリズムＢＬＡＳＴ（ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７２２６４−２２６８，１９９０； ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ ９０： ５８７３， １９９３）を用いて決定できる。ＢＬＡＳＴのアルゴリズムに基づいたＢＬＡＳＴＮやＢＬＡＳＴＸと呼ばれるプログラムが開発されている（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ＳＦ， ｅｔ ａｌ： Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２１５： ４０３，１９９０）。ＢＬＡＳＴＮを用いて塩基配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばｓｃｏｒｅ＝１００、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝１２とする。また、ＢＬＡＳＴＸを用いてアミノ酸配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばｓｃｏｒｅ＝５０、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝３とする。ＢＬＡＳＴとＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを用いる場合は、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。
【００４６】
本明細書中、「がん治療剤」という用語は、抗癌剤、癌転移阻害剤、癌細胞のアポトーシス誘導剤、癌細胞の増殖抑制剤、癌細胞の浸潤抑制剤、がん予防剤等を含む意味で使用される。なお、本願明細書中、用語「癌（または、がん）」と「腫瘍」とは同じ意味を有する用語として使用される。
【００４７】
１．１ プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を含有するがん治療剤
本発明は、１つの実施形態において、プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。典型的には、上記プロテアソーム関連遺伝子は、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である。
【００４８】
本明細書中、「プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質」は、プロテアソーム関連遺伝子の発現を阻害するものであれば制限はないが、典型的には、ＰＯＭＰ遺伝子の発現阻害物質またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質である。
【００４９】
本明細書中、「ＰＯＭＰ遺伝子の発現阻害物質」には、ＰＯＭＰ遺伝子の発現を阻害するものであれば制限はないが、例えば、（ｉ）ＰＯＭＰ遺伝子からＰＯＭＰ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質、および（ｉｉ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡからＰＯＭＰタンパク質への翻訳を阻害する物質が含まれる。
【００５０】
ＰＯＭＰ遺伝子からＰＯＭＰ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質の例としては、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはその一部に対するアンチセンス核酸、
（ｂ）ＰＯＭＰ遺伝子またはその一部に対するデコイ核酸、
（ｃ）ＰＯＭＰ遺伝子またはその一部に対してドミナントネガティブに作用するＰＯＭＰ遺伝子変異体、あるいは
（ｄ）その他の転写阻害化合物
などが含まれる。
【００５１】
また、ＰＯＭＰ ｍＲＮＡからＰＯＭＰタンパク質への翻訳を阻害する物質の例としては、
（ｅ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡまたはその一部に対してＲＮＡｉ作用を有するポリヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）、
（ｆ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡまたはその一部に対するアンチセンスポリヌクレオチド、
（ｇ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡまたはその一部に対してリボザイム活性を有するポリヌクレオチド、あるいは
（ｈ）その他の翻訳阻害化合物
などが含まれる。
【００５２】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質」には、ＰＳＭＡ７遺伝子の発現を阻害するものであれば制限はないが、例えば、（ｉ）ＰＳＭＡ７遺伝子からＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質、および（ｉｉ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡからＰＳＭＡ７タンパク質への翻訳を阻害する物質が含まれる。
【００５３】
ＰＳＭＡ７遺伝子からＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質の例としては、
（ａ）ＰＳＭＡ７遺伝子またはその一部に対するアンチセンス核酸、
（ｂ）ＰＳＭＡ７遺伝子またはその一部に対するデコイ核酸、
（ｃ）ＰＳＭＡ７遺伝子またはその一部に対してドミナントネガティブに作用するＰＳＭＡ７遺伝子変異体、あるいは
（ｄ）その他の転写阻害化合物
などが含まれる。
【００５４】
また、ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡからＰＳＭＡ７タンパク質への翻訳を阻害する物質の例としては、
（ｅ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡまたはその一部に対してＲＮＡｉ作用を有するポリヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）、
（ｆ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡまたはその一部に対するアンチセンスポリヌクレオチド、
（ｇ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡまたはその一部に対してリボザイム活性を有するポリヌクレオチド、あるいは
（ｈ）その他の翻訳阻害化合物
などが含まれる。
【００５５】
本明細書中、「核酸」とはＲＮＡまたはＤＮＡを意味する。ここでいう「核酸」は、プリンおよびピリミジン塩基を含有するのみでなく、修飾されたその他の複素環型塩基をもつようなものを含んでいてもよい。こうした修飾物は、メチル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、あるいはその他の複素環を含むものであって良い。修飾されたヌクレオシドおよび修飾されたヌクレオチドはまた、糖部分が修飾されていて良く、例えば、１個以上の水酸基がハロゲンとか、脂肪族基などで置換されているか、あるいはエーテル、アミンなどの官能基に変換されていてよい。
【００５６】
本発明のがん治療剤においては、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸を有効成分として用いることができる。ＲＮＡｉとは、標的遺伝子配列と同一もしくは類似した配列を有する二重鎖ＲＮＡを細胞内に導入すると、導入した外来遺伝子および標的内在性遺伝子の発現がいずれも阻害される現象のことをいう。ここで用いられるＲＮＡとしては、例えば、１９〜３０塩基長のＲＮＡ干渉を生ずる二重鎖ＲＮＡ、例えば、ｄｓＲＮＡ（ｄｏｕｂｌｅ ｓｔｒａｎｄ ＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ（ｓｍａｌｌ ｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇ ＲＮＡ）又はｓｈＲＮＡ（ｓｈｏｒｔ ｈａｉｒｐｉｎ ＲＮＡ）が挙げられる。このようなＲＮＡは、リポソームなどの送達システムにより所望の部位に局所送達させることも可能であり、また上記二重鎖ＲＮＡが生成されるようなベクターを用いてこれを局所発現させることができる。このような二重鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ、ｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡ）の調製方法、使用方法などは、多くの文献から公知である（特表２００２−５１６０６２号； 米国公開許第２００２／０８６３５６Ａ号； Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ， ２４（２）， Ｆｅｂ．， １８０−１８３； Ｇｅｎｅｓｉｓ， ２６（４）， Ａｐｒｉｌ， ２４０−２４４； Ｎａｔｕｒｅ，Ｓｐｅ．２１，４０７：６８０２，３１９−２０； Ｇｅｎｅｓ ＆ Ｄｅｖ．， Ｖｏｌ．１６，（８）， Ａｐｒ．１６，９４８−９５８； Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．， ９９（８），１６ Ａｐｒ．， ５５１５−５５２０； Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２９６（５５６７）， １９ Ａｐｒ．， ５５０−５５３； Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ， Ａｐｒ．３０，９９：９， ６０４７−６０５２； Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ．２０ （５）， Ｍａｙ，４９７−５００； Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ． ２０（５）， Ｍａｙ，５００−５０８； Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， Ｍａｙ １５など）。
【００５７】
本発明で用いられるＲＮＡｉ効果を奏する二重鎖ＲＮＡの長さは、通常、１９〜３０塩基、好ましくは２０〜２７塩基、より好ましくは２１〜２５塩基、最も好ましくは２１〜２３塩基である。本発明においては、具体的には、下記ｓｉＲＮＡ（実施例４、５で使用）を用いることができる。
【表１】
【表２】
【００５８】
本明細書中、「アンチセンス核酸」、または「アンチセンスポリヌクレオチド」とは、ある対象となるＤＮＡ領域の少なくとも一部に相補的なポリヌクレオチドを有し、そのポリヌクレオチドが当該領域の少なくとも一部とハイブリダイズすることができる核酸のことをいう。本発明のアンチセンス核酸またはアンチセンスポリヌクレオチドは、ＲＮＡ、ＤＮＡ、あるいは修飾された核酸（ＲＮＡ、ＤＮＡ）である。それらは二本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、さらにＤＮＡ：ＲＮＡハイブリッドであってもよい。修飾された核酸の具体例としては、核酸の硫黄誘導体やチオホスフェート誘導体、さらにはポリヌクレオチドアミドやオリゴヌクレオチドアミドの分解に抵抗性を有するものなどが挙げられるが、それらに限定されるものではない。
【００５９】
使用されるアンチセンス核酸は、適当なプロモーターの下流に連結され、好ましくは３’側に転写終結シグナルを含む配列が連結される。このようにして調製された核酸は、公知の方法を用いることで、所望の動物へ形質転換できる。アンチセンス核酸の配列は、形質転換される動物が持つ内在性遺伝子またはその一部と相補的な配列であることが好ましいが、遺伝子の発現を有効に抑制できる限りにおいて、完全に相補的でなくてもよい。
【００６０】
例えば、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子のｍＲＮＡの５’端近傍の非翻訳領域に相補的なアンチセンス配列を設計すれば、遺伝子の翻訳阻害に効果的である。コード領域もしくは３’側の非翻訳領域に相補的な配列も使用することができる。遺伝子の翻訳阻害に効果的なアンチセンス核酸は、標的遺伝子の転写産物に対して約７０％以上、好ましくは約８０％以上、より好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の相補性を有する。
【００６１】
アンチセンス核酸を用いて標的遺伝子の発現を効果的に抑制するには、アンチセンス核酸の長さは少なくとも約１０塩基以上（例えば、１０〜４０個程度）、好ましくは約１５塩基以上であり、より好ましくは約１００塩基以上であり、さらに好ましくは約５００塩基以上である。アンチセンス核酸は公知の文献を参照して設計することができる（例えば、平島および井上、新生化学実験講座２ 核酸ＩＶ遺伝子の複製と発現、日本生化学会編、東京化学同人、１９９３、ｐ．３１９−３４７）、Ｊ．Ｋａｗａｋａｍｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｈａｒｍ Ｔｅｃｈ Ｊａｐａｎ． Ｖｏｌ．８，ｐ．２４７，１９９２；Ｖｏｌ．８，ｐ．３９５，１９９２；Ｓ．Ｔ． Ｃｒｏｏｋｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ， １９９３など参照）。
【００６２】
また、本発明のがん治療剤においては、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸を有効成分として用いることができる。ここでいう「リボザイム活性」とは、ターゲットとする遺伝子の転写産物であるｍＲＮＡを部位特異的に切断する核酸のことをいう。リボザイムには、グループＩイントロン型やＲＮａｓｅＰに含まれるＭ１ ＲＮＡのように４００ヌクレオチド以上の大きさのものもあるが、ハンマーヘッド型やヘアピン型と呼ばれる４０ヌクレオチド程度の活性ドメインを有するものもある（タンパク質核酸酵素、１９９０、３５、ｐ．２１９１）。ハンマーヘッド型リボザイムについては、例えば、ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ，１９８８，２２８，ｐ．２２８；ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ，１９８８，２３９，ｐ．２８５；タンパク質核酸酵素，１９９０，３５，ｐ．２１９１；Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ，１９８９，１７，ｐ．７０５９などを参照することができる。また、ヘアピン型リボザイムについては、例えば、Ｎａｔｕｒｅ，１９８６，３２３，ｐ．３４９；Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ，１９９１，１９，ｐ．６７５１；菊池洋，化学と生物，１９９２，３０，ｐ．１１２などを参照することができる。このようなリボザイムを用いて本発明におけるＰＯＭＰおよび／またはＰＳＭＡ７遺伝子遺伝子の転写産物を特異的に切断することで、該遺伝子の発現を阻害することができる。
【００６３】
さらに、本発明は、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写活性を阻害する核酸以外の化合物を有効成分として用いることができる。そのような化合物は、例えば、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現・転写に関与する因子に結合する化合物である。このような化合物は、天然物でも合成化合物でもよい。このような化合物は、後述のスクリーニング方法によって、取得することが可能である。
【００６４】
１．２ プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を含有するがん治療剤
本発明はまた、別の実施形態において、プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を含有するがん治療剤を提供する。典型的には、上記プロテアソーム関連タンパク質は、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である。
【００６５】
本明細書中、「プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質」は、プロテアソーム関連タンパク質の活性を阻害するものであれば制限はないが、例えば、ＰＯＭＰタンパク質の活性阻害物質、ＰＳＭＡ７タンパク質の活性阻害物質が含まれる。
【００６６】
本明細書中、「ＰＯＭＰタンパク質の活性阻害物質」には、例えば、
【００６７】
（ａ）ＰＯＭＰタンパク質に結合する抗体、
【００６８】
（ｂ）ＰＯＭＰタンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＯＭＰタンパク質変異体、あるいは
【００６９】
（ｃ）ＰＯＭＰタンパク質に結合する化合物（上記抗体および変異体を除く）
などが含まれる。
【００７０】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７タンパク質の活性阻害物質」には、例えば、
【００７１】
（ａ）ＰＳＭＡ７タンパク質に結合する抗体、
【００７２】
（ｂ）ＰＳＭＡ７タンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＳＭＡ７タンパク質変異体、あるいは
【００７３】
（ｃ）ＰＳＭＡ７タンパク質に結合する化合物（上記抗体および変異体を除く）
などが含まれる。
【００７４】
本明細書における「抗体」とはタンパク質の全長又は断片に反応する抗体を意味する。本発明の抗体の形態には、特に制限はなく、本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）に結合する限り、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体のほかに、ヒト抗体、遺伝子組み換えによるヒト型化抗体、さらにその抗体断片や抗体修飾物も含まれる。プロテアソーム関連タンパク質に結合する抗体（例：ＰＯＭＰタンパク質に結合する抗体（抗ＰＯＭＰ抗体）、ＰＳＭＡ７タンパク質に結合する抗体（抗ＰＳＭＡ７抗体））は、当業者に公知の方法により調製することが可能である。なお、抗ＰＯＭＰ抗体または抗ＰＳＭＡ７抗体の詳細については後述する。
【００７５】
本明細書における「ＰＯＭＰタンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＯＭＰタンパク質変異体」または「ＰＳＭＡ７タンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＳＭＡ７タンパク質変異体」とは、それぞれ、それをコードする遺伝子を発現させることによって、内在性の野生型ＰＯＭＰタンパク質または内在性の野生型ＰＳＭＡ７タンパク質の活性を消失または低下させる機能を有するタンパク質を指す（土田邦博著、遺伝子の活性阻害実験法 多比良和誠編、羊土社（２００１） ２６−３２など参照）。
【００７６】
さらに、本発明においては、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の活性を阻害し得る物質として、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質にそれぞれ結合する、上記抗体または変異体以外の化合物を有効成分として用いることができる。そのような化合物は、例えば、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に結合し、その活性を阻害する化合物である。このような化合物は、天然物でも合成化合物でもよい。このような化合物は、後述のスクリーニング方法によって、取得することが可能である。
【００７７】
上記した本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）の活性を阻害し得る物質は、がん（特に、大腸がん）の治療剤として使用することができる。
【００７８】
２．プロテアソーム関連遺伝子の発現またはプロテアソーム関連タンパク質の活性を阻害する物質のスクリーニング方法
【００７９】
本発明は、がん抑制作用を有する候補化合物のスクリーニング方法をも提供する。
【００８０】
一つの態様としては、プロテアソーム関連タンパク質と被検化合物との結合を指標とする方法がある。典型的には、上記プロテアソーム関連タンパク質は、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である。
【００８１】
通常、プロテアソーム関連タンパク質と結合する化合物は、プロテアソーム関連タンパク質の活性を阻害する効果を有することが期待される。ここで、該化合物は、プロテアソーム関連タンパク質の活性部位に結合することが好ましい。例えば、本方法においては、まず、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物とを接触させる。ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質は、被検化合物との結合を検出するための指標に応じて、例えば、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の精製された形態、細胞内または細胞外に発現した形態、あるいはアフィニティーカラムに結合した形態であり得る。この方法に用いる被検化合物は必要に応じて適宜標識して用いることができる。標識としては、例えば、放射標識、蛍光標識等を挙げることができる。
【００８２】
次いで、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物との結合を検出する。
【００８３】
本方法に用いる被検化合物としては、特に制限はない。例えば、天然化合物、有機化合物、無機化合物、タンパク質、ペプチドなどの単一化合物、並びに、化合物ライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物等が挙げられるが、これらに限定されない。
【００８４】
プロテアソーム関連タンパク質と被検化合物との結合は、例えば、プロテアソーム関連タンパク質に結合した被検化合物に付された標識によって検出することができる。また、細胞内または細胞外に発現しているプロテアソーム関連タンパク質への被検化合物の結合により生じるプロテアソーム関連タンパク質の活性の変化を指標として検出することもできる。タンパク質と被検化合物との結合活性は、公知の手法によって測定することができる（例えば、プロテアソーム形成促進活性の測定（Hirano Y, Hayashi H, Iemura S, Hendil KB, Niwa S, Kishimoto T, Kasahara M, Natsume T, Tanaka K, Murata S. (2006) Mol. Cell. 24, 977-84. : Cooperation of multiple chaperones required for the assembly of mammalian 20S proteasomes. ）。
【００８５】
本方法においては、次いで、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質）と結合し、その活性を阻害する被検化合物を選択する。
【００８６】
本方法により単離される化合物は、がん抑制作用を有することが期待され、がん治療剤として有用である。
【００８７】
本発明のスクリーニング方法の他の態様は、プロテアソーム関連遺伝子の発現を指標とする方法である。典型的には、上記プロテアソーム関連遺伝子は、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である。
【００８８】
本方法においては、まず、プロテアソーム関連遺伝子（例えば、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞に、被検化合物を接触させる。用いられる「細胞」の由来としては、ヒト、マウス、ネコ、イヌ、ウシ、ヒツジ、トリなど、ペット、家畜等に由来する細胞が挙げられるが、これら由来に制限されない。「プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞」としては、内因性のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現している細胞、または外因性のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）が導入され、該遺伝子が発現している細胞を利用することができる。外因性のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）が発現した細胞は、通常、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）が挿入された発現ベクターを宿主細胞へ導入することにより作製することができる。該発現ベクターは、一般的な遺伝子工学技術によって作製することができる。
【００８９】
本方法に用いる被検化合物としては、特に制限はないが、例えば、天然化合物、有機化合物、無機化合物、タンパク質、ペプチドなどの単一化合物、並びに、化合物ライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物等が用いられる。
【００９０】
プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞への被検化合物の「接触」は、通常、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞の培養液に被検化合物を添加することによって行うが、この方法に限定されない。被検化合物がタンパク質等の場合には、該タンパク質を発現するＤＮＡベクターを、該細胞へ導入することにより、「接触」を行うことができる。
【００９１】
本方法においては、次いで、該プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子等）の発現レベルを測定する。ここで「遺伝子の発現」には、転写および翻訳の双方が含まれる。遺伝子の発現レベルの測定は、当業者に公知の方法によって行うことができる。例えば、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞からｍＲＮＡを常法に従って抽出し、このｍＲＮＡを鋳型としたノーザンハイブリダイゼーション法またはＲＴ−ＰＣＲ法を実施することによって該遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。あるいは、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）のプロモーター領域を常法に従って単離し、その下流に標識遺伝子（例えば、ルシフェラーゼ、ＧＦＰ、ガラクトシダーゼ等の発光、蛍光、発色などを指標に検出可能な遺伝子が挙げられるが、これらに限定されない）をつなげ、その標識遺伝子の活性を見ることによっても該遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。また、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞からタンパク質画分を回収し、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）の発現をＳＤＳ−ＰＡＧＥ等の電気泳動法で検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うこともできる。さらに、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）に対する抗体を用いて、ウエスタンブロッティング法を実施することにより該タンパク質の発現を検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うことも可能である。プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）の検出に用いる抗体としては、検出可能な抗体であれば、特に制限はないが、例えばモノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体の両方を利用することができる。
【００９２】
本方法においては、次いで、被検化合物を接触させない場合（コントロール）と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する。このようにして選択された化合物は、がん治療剤のための候補化合物となる。
【００９３】
３．プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体及びこの抗体を含有する治療剤、複合体および組成物
【００９４】
本発明はまた、プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体、この抗体を含有するがん治療剤などを提供する。典型的には、上記プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体は、抗ＰＯＭＰ抗体または抗ＰＳＭＡ７抗体である。本発明の１つの好ましい態様では、上記がん治療剤は、がんの標的化療法または標的化薬物送達のために使用される。
【００９５】
３．１ プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体
【００９６】
本明細書中、「プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体」または「抗プロテアソーム関連タンパク質抗体」としては、プロテアソーム関連タンパク質に特異的に結合または認識する抗体であれば制限はないが、典型的には、抗ＰＯＭＰ抗体および抗ＰＭＳＡ７抗体が含まれる。
【００９７】
本明細書中、「抗ＰＯＭＰ抗体」には、ＰＯＭＰタンパク質（その断片（部分ペプチド）もしくはその塩を含む）に特異的に結合する抗体が含まれる。また、「抗ＰＭＳＡ７抗体」には、ＰＳＭＡ７タンパク質（その断片（部分ペプチド）もしくはその塩を含む）に特異的に結合する抗体が含まれる。
【００９８】
本発明において使用する抗ＰＯＭＰ抗体または抗ＰＳＭＡ７抗体は、ポリクローナル抗体であってもよいし、モノクローナル抗体であってもよい。抗体のクラスは、特に限定されず、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、またはＩｇＥ等のいずれのアイソタイプを有する抗体をも包含する。好ましくは、ＩｇＧまたはＩｇＭであり、精製の容易性等を考慮すると、より好ましくはＩｇＧである。また、ここでいう「抗体」という用語は、任意の抗体断片または誘導体を含む意味で用いられ、例えば、Ｆａｂ、Ｆａｂ’2、ＣＤＲ、ヒト化抗体、多機能抗体、単鎖抗体（ＳｃＦｖ）などを含む。本発明の抗体は、公知の方法で製造することができる。このような抗体の製造法は当該分野で周知である（例えばＨａｒｌｏｗ Ｅ． ＆ Ｌａｎｅ Ｄ．， Ａｎｔｉｂｏｄｙ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９８８）を参照）。
【００９９】
（１）抗原の調製
本発明において、感作抗原として使用されるタンパク質は、通常、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）またはその塩である。上記プロテアソーム関連タンパク質には、その部分ペプチドも含まれ、これは、限定されることはないが、例えば、配列番号２または配列番号４のアミノ酸配列の断片であって、例えば、２０個以上、４０個以上、６０個以上、８０個以上、１００個以上の、連続するアミノ酸配列部分を有する部分ペプチドである。これらの断片として、例えば、アミノ（Ｎ）末端断片やカルボキシ（Ｃ）末端断片が用いられる。本発明で用いられる部分ペプチドは、上記アミノ酸配列中の１または２個以上（好ましくは、１〜１０個程度、さらに好ましくは数個（１〜６個））のアミノ酸残基が欠失、置換、挿入及び／又は付加されたものであってもよい。ここで用いられるＰＯＭＰタンパク質もしくはＰＳＭＡ７タンパク質またはその部分ペプチドの塩としては、例えば、無機酸（例えば、塩酸、硫酸）との塩、あるいは有機酸（例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸）との塩などが用いられる。抗体取得の感作抗原として使用される本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）は、その由来となる動物種に制限されないが哺乳動物、例えばマウス、ヒト由来のタンパク質が好ましく、特にヒト由来のタンパク質が好ましい。
【０１００】
（２）プロテアソーム関連タンパク質に対するモノクローナル抗体の作製
（ｉ）抗体産生細胞の採取
上記のようなプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）、その部分ペプチド又はその塩（本明細書中、抗体に関する説明では、これらをまとめて、「プロテアソーム関連タンパク質」（または、それぞれ「ＰＯＭＰタンパク質」、「ＰＳＭＡ７タンパク質」）という。）を抗原として、哺乳動物、例えばラット、マウス、ウサギなどに投与する。抗原の動物１匹当たりの投与量は、アジュバントを用いないときは０．１〜１００ｍｇであり、アジュバントを用いるときは１〜１００μｇである。アジュバントとしては、フロイント完全アジュバント（ＦＣＡ）、フロイント不完全アジュバント（ＦＩＡ）、水酸化アルミニウムアジュバント等が挙げられる。免疫は、主として静脈内、皮下又は腹腔内等に注入することにより行われる。また、免疫の間隔は特に限定されず、数日から数週間間隔、好ましくは２〜５週間間隔で、１〜１０回、好ましくは２〜５回免疫を行う。そして、最終の免疫日から１〜６０日後、好ましくは１〜１４日後に抗体産生細胞を採集する。抗体産生細胞としては、脾臓細胞、リンパ節細胞、末梢血細胞等が挙げられるが、脾臓細胞又は局所リンパ節細胞が好ましい。
【０１０１】
（ｉｉ）細胞融合
ハイブリドーマを得るため、抗体産生細胞とミエローマ細胞との細胞融合を行う。抗体産生細胞と融合させるミエローマ細胞として、マウスなどの動物の一般に入手可能な株化細胞を使用することができる。使用する細胞株としては、薬剤選択性を有し、未融合の状態ではＨＡＴ選択培地（ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジンを含む）で生存できず、抗体産生細胞と融合した状態でのみ生存できる性質を有するものが好ましい。ミエローマ細胞としては、例えば Ｘ６３Ａｇ．８．６５３、ＮＳＩ／１−Ａｇ４−１、ＮＳ０／１などのマウスミエローマ細胞株、ＹＢ ２／０などのラットミエローマ細胞株が挙げられる。
【０１０２】
次に、上記ミエローマ細胞と抗体産生細胞とを細胞融合させる。細胞融合は、血清を含まないＤＭＥＭ、ＲＰＭＩ−１６４０培地などの動物細胞培養用培地中で、１×１０6〜１×１０7個／ｍｌの抗体産生細胞と２×１０5〜２×１０6個／ｍｌのミエローマ細胞とを混合し（抗体産生細胞とミエローマ細胞との細胞比２：１〜３：１が好ましい）、細胞融合促進剤存在のもとで融合反応を行う。細胞融合促進剤として、平均分子量１０００〜６０００ダルトンのポリエチレングリコール等を使用することができる。また、電気刺激（例えばエレクトロポレーション）を利用した市販の細胞融合装置を用いて抗体産生細胞とミエローマ細胞とを融合させることもできる。
【０１０３】
（ｉｉｉ）ハイブリドーマの選別及びクローニング
細胞融合処理後の細胞から目的とするハイブリドーマを選別する。その方法として、細胞懸濁液を例えばウシ胎児血清含有ＲＰＭＩ−１６４０培地などで適当に希釈後、マイクロタイタープレート上に３×１０5個／ｗｅｌｌ程度まき、各ウエルに選択培地を加え、以後適当に選択培地を交換して培養を行う。その結果、選択培地で培養開始後、１４日前後から生育してくる細胞をハイブリドーマとして得ることができる。
【０１０４】
次に、増殖してきたハイブリドーマの培養上清中に、プロテアソーム関連タンパク質に反応する抗体が存在するか否かをスクリーニングする。ハイブリドーマのスクリーニングは、通常の方法に従えばよく、特に限定されるものではない。例えば、ハイブリドーマとして生育したウエルに含まれる培養上清の一部を採集し、酵素免疫測定法、放射性免疫測定法等によってスクリーニングすることができる。融合細胞のクローニングは、限界希釈法等により行う。そして、最終的に、プロテアソーム関連タンパク質と反応するモノクローナル抗体を産生する細胞であるハイブリドーマを樹立する。
【０１０５】
（ｉｖ）モノクローナル抗体の採取
上記のようにして得たハイブリドーマからモノクローナル抗体を採取する方法として、通常の細胞培養法又は腹水形成法等を採用することができる。細胞培養法においては、ハイブリドーマを１０％ウシ胎児血清含有ＲＰＭＩ−１６４０培地、ＭＥＭ培地又は無血清培地等の動物細胞培養培地中で、通常の培養条件（例えば３７℃、５％ ＣＯ2濃度）で７〜１４日間培養し、その培養上清から抗体を取得する。腹水形成法の場合は、ミエローマ細胞由来の哺乳動物と同種系動物の腹腔内にハイブリドーマを約１×１０7個投与し、ハイブリドーマを大量に増殖させる。そして、１〜２週間後に腹水を採取する。上記抗体の採取方法において抗体の精製が必要とされる場合は、硫安塩析法、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過、アフィニティークロマトグラフィーなどの公知の方法を適宜選択して、又はこれらを組み合わせることにより精製することができる。
【０１０６】
（３）プロテアソーム関連タンパク質に対するポリクローナル抗体の作製
まず、上記した抗原を哺乳動物、例えばラット、マウス、ウサギなどに投与する。抗原の動物１匹当たりの投与量は、アジュバントを用いないときは０．１〜１００ｍｇであり、アジュバントを用いるときは１０〜１０００μｇである。アジュバントとしては、フロイント完全アジュバント（ＦＣＡ）、フロイント不完全アジュバント（ＦＩＡ）、水酸化アルミニウムアジュバント等が挙げられる。免疫は、主として静脈内、皮下又は腹腔内等に注入することにより行われる。また、免疫の間隔は特に限定されず、数日から数週間間隔、好ましくは２〜５週間間隔で、１〜１０回、好ましくは２〜５回免疫を行う。そして、最終の免疫日から６〜６０日後に、酵素免疫測定法（ＥＬＩＳＡ（ｅｎｚｕｍｅ−ｌｉｎｋｅｄ ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ ａｓｓｙ）又は ＥＩＡ（ｅｎｚｙｍｅ ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ））、放射性免疫測定法（ＲＩＡ；ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏ ａｓｓａｙ）等で抗体価を測定し、最大の抗体価を示した日に採血し、抗血清を得る。
【０１０７】
次いで、例えば、抗血清中のポリクローナル抗体を、プロテアソーム関連タンパク質で固定されたアフィニティーカラムにかけてプロテアソーム関連タンパク質と反応する抗体（カラム吸着画分）を採取する。プロテアソーム関連タンパク質に対する抗血清中のポリクローナル抗体の反応性は、ＥＬＩＳＡ法などで測定することができる。
【０１０８】
（４）抗体の断片など
ＦａｂまたはＦａｂ’2断片は、従来の方法によるプロテアーゼ（例えば、ペプシンまたはパパイン）を用いた消化により作製することができる。ヒト化抗体は、例えばＲｉｅｃｈｍａｎｎら（Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． Ｏｃｔ ５；２０３（３）：８２５−８，１９８８）、およびＪｏｎｅｓら（Ｊｏｎｅｓら Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２−５２５，１９８６）に記載のような方法の１つにより調製することができる。
【０１０９】
また、キメラ抗体は、例えば、「実験医学（臨時増刊号）、Ｖｏｌ．１．６，Ｎｏ．１０，１９８８」、特公平３−７３２８０号公報等を、ヒト化抗体は、例えば、「Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．１５，ｐ．１４６−１５６，１９９７」、「Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．７，ｐ．１３−２１，１９９４」、特表平４−５０４３６５号公報、国際出願公開ＷＯ９４・２５５８５号公報等、「日経サイエンス、６月号、第４０〜第５０頁、１９９５年」、「Ｎａｔｕｒｅ，Ｖｏｌ．３６８，ｐ．８５６−８５９，１９９４」、特表平６−５００２３３号公報等を参考にそれぞれ製造することができる。本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例えば、ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）に結合する抗体は、例えば、癌細胞の増殖もしくは転移の抑制等を目的とした使用が考えられる。得られた抗体を人体に投与する目的（抗体治療）で使用する場合には、免疫原性を低下させるため、ヒト抗体やヒト型抗体が好ましい。
【０１１０】
抗体は、診断剤として用いる場合は、モニタリング等のための標識物質（例えば、放射性同位元素、蛍光物質など）で標識されていてもよい。必要に応じて、放射性物質、蛍光化合物などにより標識することができる。最も慣用の蛍光標識化合物の中には、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリンおよびフルオレスカミンがある。同様に、生体発光性化合物を用いて、プロテアソーム関連タンパク質（例えば、ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）に対する抗体を標識することもできる。生体発光性タンパク質の存在は、蛍光の存在を検出することによって測定される。この標識目的に重要な生体発光性化合物は、ルシフェリン、ルシフェラーゼおよびイエクオリンである。
【０１１１】
なお、本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在するプロテアソーム関連タンパク質（例えば、ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）を特異的に検出するために使用することができる。また、プロテアソーム関連タンパク質を精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中のプロテアソーム関連タンパク質の検出、被検細胞内におけるプロテアソーム関連タンパク質の挙動の分析などのために使用することができる。
【０１１２】
３．２ プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を含有する複合体など
また、本発明において使用する抗プロテアソーム関連タンパク質抗体（例：抗ＰＯＭＰ抗体、抗ＰＳＭＡ７抗体）は、本発明の治療剤または診断剤において、それ自体が、抗原の活性を減弱させるような中和活性を有する薬剤（ａｇｅｎｔ）であり得るが、必要に応じて、治療効果を奏するための他の薬剤と組み合わせて用いることができる。したがって、本発明は、もう一つの態様において、がん（例えば、大腸がん）の標的化療法または標的化イメージング等に使用するための、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と他の薬剤との複合体、そのような複合体を含有する組成物などをも提供する。このような態様によれば、本発明において使用する抗プロテアソーム関連タンパク質抗体を用いて、治療効果を奏する他の薬剤または診断のための標識剤などを、プロテアソーム関連タンパク質を高発現する標的部位へ送達することができる。
【０１１３】
本発明において用いられる「その他の薬剤」としては、例えば、放射性同位元素、治療タンパク質、または低分子の薬剤など、標的への遺伝子導入のためのウイルスベクターもしくは非ウイルスベクターなどが例示される。
【０１１４】
本発明において、「放射性同位元素」の例としては、フッ素−１８、ヨウ素−１２５（125Ｉ）、およびヨウ素−１３１などの放射性ハロゲン元素が挙げられる。これらの放射性ハロゲン元素も上述の放射性金属元素と同様に抗体やペプチドに標識して、放射性治治療剤あるいは放射性診断剤として広く利用し得る。例えば、125Ｉまたは131Ｉでのヨード化は、クロラミンＴ法等の公知の方法により、抗体または抗体断片に結合させることができる。さらに、診断用としてはテクネチウム−９９ｍ、インジウム−１１１およびガリウム−６７（67Ｇａ）など、また治療用としてはイットリウム−９０（90Ｙ）、レニウム−１８６（186Ｒｅ）またはレニウム−１８８（188Ｒｅ）などが使用され得る。放射性同位元素を用いて抗体に標識する場合には、通常、金属キレート剤が用いられる。金属キレート剤としては、ＥＤＴＡ、ＤＴＰＡ、ジアミノジチオ化合物、サイクラム、およびＤＯＴＡなどが知られている。これらのキレート剤は抗体に予め結合しておき、その後放射性金属で標識する場合と、放射性金属キレートを形成後、抗体に結合して標識する方法がある。
【０１１５】
本発明において、「治療タンパク質」の例としては、免疫を担う細胞を活性化するサイトカインが好適であり、例えば、ヒトインターロイキン２、ヒト顆粒球−マクロファージ−コロニー刺激因子、ヒトマクロファージコロニー刺激因子、ヒトインターロイキン１２等が挙げられる。また、大腸がん細胞を直接殺傷するため、リシンやジフテリア毒素などの毒素を用いることができる。例えば、治療タンパク質との融合抗体については、抗体または抗体断片をコードするｃＤＮＡに治療タンパク質をコードするｃＤＮＡを連結させ、融合抗体をコードするＤＮＡを構築し、このＤＮＡを原核生物または真核生物用の発現ベクターに挿入し、この発現ベクターを原核生物または真核生物へ導入することにより発現させ、融合抗体を製造することができる。
【０１１６】
「低分子の薬剤」は、本明細書中で「放射性同位元素」や「治療タンパク質」等以外の診断または治療用化合物を意味するものとして用いられる。「低分子の薬剤」の例としては、ナイトロジェン・マスタード、サイクロファスファミドなどのアルキル化剤、５−フルオロウラシル、メソトレキセートなどの代謝拮抗剤、ダウノマイシン、ブレオマイシン、マイトマイシンＣ，ダウノルビシン、ドキソルビシンなどの抗生物質、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシンのような植物アルカロイド、タモキシフェン、デキサメタソンなどのホルモン剤等の抗癌剤（臨床腫瘍学（日本臨床腫瘍研究会編 １９９６年 癌と化学療法社））、またはハイドロコーチゾン、プレドニゾンなどのステロイド剤、アスピリン、インドメタシンなどの非ステロイド剤、金チオマレート、ペニシラミンなどの免疫調節剤、サイクロフォスファミド、アザチオプリンなどの免疫抑制剤、マレイン酸クロルフェニラミン、クレマシチンのような抗ヒスタミン剤等の抗炎症剤（炎症と抗炎症療法 昭和５７年 医歯薬出版株式会社）などがあげられる。例えば、ダウノマイシンと抗体を結合させる方法としては、グルタールアルデヒドを介してダウノマイシンと抗体のアミノ基間を結合させる方法、水溶性カルボジイミドを介してダウノマイシンのアミノ基と抗体のカルボキシル基を結合させる方法等があげられる。
【０１１７】
「ウイルスベクター」の例としては、本発明の抗プロテアソーム関連タンパク質抗体に結合し得るように改変されたウイルスベクターが使用し得る（例えば、アデノウイルスベクター（Ｗａｎｇ， Ｐ．， ｅｔ ａｌ．（１９９５） Ｓｏｍａｔｉｃ Ｃｅｌｌ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃ． Ｇｅｎｅｔ． ２１， ４２９−４４１）、レトロウイルスベクター（Ｎａｖｉａｕｘ Ｒ．Ｋ．， ｅｔ ａｌ．（１９９６） Ｊ． Ｖｉｒｏｌ ７０， ５７０１−５７０５）、レンチウイルスベクター（Ｎａｌｄｉｎｉ， Ｌ． （１９９８） Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ． Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． ９， ４５７−４６３）などが挙げられる）。このようなウイルスベクターには、細胞増殖関連遺伝子、アポトーシス関連遺伝子、免疫制御遺伝子等の、標的部位（例えば、大腸がん）において、例えば、癌細胞のアポトーシスを誘導するなどの治療効果を奏する遺伝子（治療遺伝子）が組み込まれる。抗プロテアソーム関連タンパク質抗体に結合するウイルスベクターは、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と共に遺伝子治療を必要とする患者に投与された場合、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体が認識する抗原（すなわち、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質））が存在する部位に標的化することができる。
【０１１８】
抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と上記他の薬剤とは、化学的または遺伝子工学的に結合され得る。ここで、「化学的な結合」には、イオン結合、水素結合、共有結合、分子間力による結合、疎水性相互作用による結合などが含まれるものとし、「遺伝子工学的な結合」には、例えば、抗体と治療タンパク質とからなる融合タンパク質を遺伝子組換えなどの技術を用いて作製した場合の、抗体と治療タンパク質との間の結合様式などが含まれるものとする。
【０１１９】
４．製剤化および製剤の投与方法
本発明のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子等）の発現阻害物質を含有するがん治療剤、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）の活性阻害物質を含有するがん治療剤、本発明の抗プロテアソーム関連タンパク質抗体を含有する治療剤、または本発明において使用する抗プロテアソーム関連タンパク質抗体が、放射性同位元素、治療タンパク質、低分子の薬剤、および治療遺伝子を担持したウイルスベクターもしくは非ウイルスベクターのうちのいずれか、またはこれらの任意の組み合わせと化学的または遺伝子工学的に結合されている治療剤は、公知の手法に基づいて製剤化することができる。
【０１２０】
本発明の治療剤の製剤化にあたっては、常法に従い、必要に応じて薬学的に許容される担体を添加することができる。例えば、界面活性剤、賦形剤、着色料、着香料、保存料、安定剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、流動性促進剤、矯味剤等が挙げられるが、これらに制限されず、その他常用の担体を適宜使用することができる。具体的には、軽質無水ケイ酸、乳糖、結晶セルロース、マンニトール、デンプン、カルメロースカルシウム、カルメロースナトリウム、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリビニルアセタールジエチルアミノアセテート、ポリビニルピロリドン、ゼラチン、中鎖脂肪酸トリグリセライド、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油６０、白糖、カルボキシメチルセルロース、コーンスターチ、無機塩類等を挙げることができる。
【０１２１】
本発明の治療剤の剤型の種類としては、例えば、経口剤として錠剤、粉末剤、丸剤、散剤、顆粒剤、細粒剤、軟・硬カプセル剤、フィルムコーティング剤、ペレット剤、舌下剤、ペースト剤等、非経口剤として注射剤、坐剤、経皮剤、軟膏剤、硬膏剤、外用液剤等が挙げられ、当業者においては投与経路や投与対象等に応じた最適の剤型を選ぶことができる。有効成分としてのプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡタンパク質等）の活性の阻害物質またはプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子等）の発現の阻害物質は、製剤中０．１から９９．９重量％含有することができる。
【０１２２】
本発明の薬剤の有効成分の投与量は、投与対象、対象臓器、症状、投与方法などにより差はあるが、経口投与の場合、一般的に例えば、患者（６０ｋｇとして）に対して一日につき約０．１ｍｇ〜１，０００ｍｇ、好ましくは約１．０〜１００ｍｇ、より好ましくは約１．０〜５０ｍｇである。非経口的に投与する場合は、その一回投与量は投与対象、対象臓器、症状、投与方法などによっても異なるが、例えば、注射剤の形では通常例えば、患者（６０ｋｇに対して）、一日につき約０．０１から３０ｍｇ程度、好ましくは約０．１から２０ｍｇ程度、より好ましくは約０．１〜１０ｍｇ程度を静脈注射により投与するのが好都合である。しかしながら、最終的には、剤型の種類、投与方法、患者の年齢や体重、患者の症状等を考慮して、医師または獣医師の判断により適宜決定することができる。
【０１２３】
このようにして得られる製剤は、例えば、ヒトやその他の哺乳動物（例えば、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど）に対して投与することができる。ヒト以外の動物の場合も、上記の６０ｋｇ当たりに換算した量を投与することができる。
【０１２４】
本発明の治療剤は、がん（例えば、大腸がん、胃がん、肺がん、乳がん、前立腺がん、食道がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん（例：子宮頸がん、子宮体がん）、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、卵巣がん、脳腫瘍、血液腫瘍など）の予防・治療、好ましくは、大腸がんの予防・治療に用いられる。
【０１２５】
本発明の薬剤は、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）の活性阻害物質またはプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の発現阻害物質を有効成分として含有しているため、抗癌剤、癌転移阻害剤、癌細胞のアポトーシス誘導剤等として使用し得る。対象となる細胞、組織、臓器、または癌の種類は特定のものに限定されない。また、本発明の薬剤は、プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質およびプロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質の両方を含んでいても良い。
【０１２６】
本発明の治療剤において、アンチセンス核酸を用いる場合、該アンチセンス核酸を単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、公知の手段に従って投与することができる。アンチセンス核酸は、単独で、あるいは生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与することができる。
【０１２７】
また、本発明において組換えアデノウイルス粒子のようなウイルスベクターと本発明のプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体との組み合わせを癌治療のために使用する場合は、これら単独で使用してもよいが、一般には製薬的に許容できる担体と共に使用される。そのような担体としては、既に上記したような担体、ならびに水、生理食塩水、グルコース、ヒトアルブミン等の水性等張溶液が好ましい。更に、製薬的に通常使用される添加剤、保存剤、防腐剤、衡量等を添加することもできる。そのように調製した医薬組成物は、治療すべき疾病に依存して適切な投与形態、投与経路によって投与することができる。投与形態としては、例えば、乳剤、シロップ剤、カプセル、錠剤、顆粒剤、注射剤、軟膏等が挙げられる。本発明の抗プロテアソーム関連タンパク質抗体−ウイルスベクター粒子またはこれを含む医薬組成物を治療のために投与する場合は、通常成人一人当たり１回に１０3〜１０15個のウイルス粒子を投与するのが好ましいが、疾病の状態や標的細胞・組織の性質によって変更してよい。投与回数は、１日１回〜数回でよく、投与期間は１日〜数ヶ月以上にわたってもよく、１〜数回の投入を１セットとして、長期にわたって断続的に多数セットを投与してもよい。また、本発明において使用されるウイルスベクター粒子またはウイルスベクター核酸分子は、特定の細胞および／または組織の検出、または疾病状態の診断に使用することができる。例えば、ウイルスベクターの核酸分子に検出可能なマーカー遺伝子を組込み、これを適切な宿主細胞にトランスフェクションして得られたウイルスベクター粒子は、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と組み合わせて腫瘍細胞を検出診断するために使用することができる。あるいは、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体に検出可能な標識を結合させて腫瘍細胞を検出診断するために使用することができる。
【０１２８】
５．がんの診断剤及び診断方法
本発明はまた、がんの診断剤を提供する。１つの好ましい態様において、本発明のがんの診断剤は、（ａ）プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体、又は（ｂ）プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有する。
【０１２９】
５．１ プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を用いる診断剤及び診断方法
プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体（例：抗ＰＯＭＰ抗体、抗ＰＳＭＡ７抗体等）は、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）を特異的に認識することができるので、被検液中のプロテアソーム関連タンパク質を定量することができる。具体的には、本発明のプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を用いる診断方法は、例えば、（ａ）被験者由来の生体試料と、プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体とを接触させる工程、および（ｂ）前記試料中での前記抗体と、プロテアソーム関連タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩との結合を検出および／または定量する工程を包含する。好ましくは、上記検出および／または定量する工程において、標識されたプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を用いて、プロテアソーム関連タンパク質またはその断片とプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体との結合が検出および／または定量される。
【０１３０】
本明細書中、「被験者由来の生体試料」は、被験者由来の組織、細胞、または体液（例えば、血液（全血、血漿、血清等を含む）、尿、リンパ液、唾液、汗、精液等）を含む。また、「被験者」は、通常、がん検診を受ける、または受けることが望まれるヒト被験体であり、がんに罹患しているか、または罹患していると疑われるヒト被験体等が含まれる。このようながんの例としては、大腸がん、胃がん、肺がん、乳がん、前立腺がん、食道がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん（例：子宮頸がん、子宮体がん）、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、卵巣がん、脳腫瘍、血液腫瘍などが含まれるが、とりわけ、大腸がんが好ましい。
【０１３１】
被験者由来の生体試料におけるプロテアソーム関連遺伝子の発現を検出するための免疫測定は、がん（例えば、大腸がん）を有すると疑われるか、がんの危険性を有する被験体から採取した生体試料を、特異的抗原−抗体結合を生じさせる条件下でプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体と接触させ、次いで、抗体による免疫特異的結合量を測定することを包含する。このような抗体の結合を使用して、プロテアソーム関連タンパク質の存在および／または増大した発現が検出される。この場合、増大したプロテアソーム関連タンパク質の発現の検出が疾病状態の指標となる。必要に応じて、生体試料中のプロテアソーム関連タンパク質のレベルを、がんを有しない健常者のレベルと比較してもよい。
【０１３２】
上記免疫測定法の１つの態様では、例えば、血清試料などの生体試料を、試料中に存在する全部のタンパク質を固定する目的で、ニトロセルロースなどの固相支持体または担体と接触させる。次いで、この支持体を緩衝液で洗浄し、続いて検出可能に標識したプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体により処理する。次いで、この固相支持体を緩衝液で２回洗浄し、未結合抗体を除去する。固相支持体上の結合した抗体の量を、周知の方法に従って測定する。各測定に適する検出条件は、慣用的な試験方法を使用して当業者により適宜決定され得る。
【０１３３】
プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を検出可能に標識する方法の１つにおいて、当該抗体を、酵素、例えば、酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）に使用されるもののような酵素に結合させる［Ｖｏｉｌｅｒ，Ａ．による「酵素標識した免疫吸着アッセイ」（“Ｔｈｅ Ｅｎｚｙｍｅ Ｌｉｎｋｅｄ Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ Ａｓｓａｙ）（ＥＬＩＳＡ），１９７８，Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ Ｈｏｒｉｚｏｎｓ，２：１〜７，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ Ｑｕａｒｔｅｒｌｙ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ．ＭＤ； Ｖｏｉｌｅｒ，Ａ．によるＪ．Ｃｌｉｎ．Ｐａｔｈｏｌ．，３１：５０７〜５２０，１９７８：Ｂｕｔｉｅｒ，Ｊ．Ｅ．によるＭｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．，７３：４８２〜５２３，１９８１］。抗体に結合する酵素を、例えば分光光度測定により、可視手段による蛍光測定により検出することができる化学分子が生成されるような方法で、適当な基質、好ましくは色素原性基質と反応させる。抗体に検出可能な標識を付けるために使用することができる酵素は、ペルオキシダーゼおよびアルカリ性ホスファターゼを包含するが、これらに限定されない。この検出はまた、酵素に対する色素原性基質を用いる比色法により達成することができる。
【０１３４】
その他の本発明において使用し得る方法としては、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、サンドイッチ免疫測定法、イムノメトリック法、ネフロメトリー、蛍光免疫測定法（ＦＩＡ）、時間分解蛍光免疫測定法（ＴＲＦＩＡ）、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、発光免疫測定法（ＬＩＡ）、電気化学発光免疫測定法（ＥＣＬＩＡ）、ラテックス凝集法、免疫沈降アッセイ、沈降素反応法、ゲル拡散沈降素反応法、免疫拡散検定法、凝集素検定法、補体結合検定法、免疫放射分析検定法、蛍光免疫検定法、およびプロテインＡ免疫検定法からなる群から選択される免疫測定法などが挙げられる（ＷＯ００／１４２２７号公報第３９頁第２５行〜第４２頁第８行、ＥＰ１１１１０４７Ａ２号公報段落［０１１５］第１９頁第３５行〜第２０頁第４７行など参照）。
【０１３５】
以上のように、本発明の抗体を用いる、生体内でのプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）の定量法を利用することにより、プロテアソーム関連タンパク質の機能不全に関連する各種疾患の診断をすることができる。例えば、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の濃度増加が検出された場合は、例えば、ＰＯＭＰまたはＰＳＭＡ７の過剰発現に起因する疾患（例えば、がん（例：大腸がん））である可能性が高いまたは将来罹患する可能性が高いと診断することができる。
【０１３６】
なお、本発明のプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体は、ｉｎ ｖｉｖｏでの診断に用いることもできる。ここで使用し得る抗体調製物の調製および使用方法は当該分野でよく知られている。例えば、抗体−キレート剤について、Ｎｕｃｌ． Ｍｅｄ． Ｂｉｏｌ． １９９０ １７：２４７−２５４に記載されている。また、磁気共鳴イメージングで用いる標識としての常磁性イオンを有する抗体については、例えば、Ｍａｇｎｅｔｉｃ Ｒｅｓｏｎａｎｃｅ ｉｎ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ １９９１ ２２：３３９−３４２に記載されている。
【０１３７】
５．２ ポリヌクレオチド（例えば、ＤＮＡ）プローブを用いる診断剤及び診断方法
本発明の診断方法においては、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の塩基配列に基づいて設計されるプローブ又はプライマーを用いることができる。具体的には、そのような診断方法は、例えば、（ａ）被験者由来の生体試料と、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチド（プローブ）とを接触させる工程、および（ｂ）前記試料中での前記ポリヌクレオチドと、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片とのハイブリダイゼーションを検出および／または定量する工程を包含する。
【０１３８】
上記本発明の方法では、被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）のＤＮＡ（またはその遺伝子断片）を、上記プローブを使用して検出および／または定量する。プローブとして用いる塩基配列の長さは、例えば、１２塩基以上、１５塩基以上、１８塩基以上、２１塩基以上、２４塩基以上、２７塩基以上、３０塩基以上、またはさらに長い長さのポリヌクレオチド断片であり得る。ハイブリダイゼーションには、上記した低、中又は高ストリンジェントな条件を使用し得る。なお、本明細書中、「プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列」には、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片の塩基配列に相補的な塩基配列（アンチセンスポリヌクレオチド）も含まれるものとする。プローブおよび核酸のハイブリダイゼーションの方法は当業者に知られており、例えば国際公開公報第８９／０６６９８号、ＥＰ−Ａ０２００３６２、米国特許第２，９１５，０８２号、ＥＰ−Ａ００６３８７９、ＥＰ−Ａ０１７３２５１、ＥＰ−Ａ０１２８０１８に記載されている。
【０１３９】
本発明の診断方法においては、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）に対する特異的ポリヌクレオチドプローブまたはプライマーを用いて、公知の手法を用いて標的配列を検出または定量することができる。そのような公知の手法として、例えば、サザンハイブリダイゼーション、ノーザンハイブリダイゼーション、ＲＴ−ＰＣＲ法、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法（Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，第５巻，８７４〜８７９頁（１９８９年））、Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａ，第８６巻，２７６６〜２７７０頁（１９８９年））、ＦＩＳＨ法、ＤＮＡチップあるいはアレイＣＧＨ（Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）法などを用いることができる。定量的な検出は、定量ＲＴ−ＰＣＲによって実施可能である。
【０１４０】
アレイＣＧＨ法は、染色体ＣＧＨ法（Ｋａｌｌｉｏｎｉｅｍｉ， Ａ． ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５８， ８１８−８２１）を応用した方法で、スライド上に染色体領域をカバーするゲノムＤＮＡ断片（ＢＡＣ，ＰＡＣ，ＹＡＣなど）を高密度にスポットしたＤＮＡチップを用いて、別々の色素で標識したがん由来ＤＮＡと正常ＤＮＡを、スライド上のゲノムＤＮＡ断片に対して同時にハイブリダイゼーションを行い、その結合状態を検出することにより、がんにおけるＤＮＡコピー数異常を高解像度に検出する方法である（Ｐｉｎｋｅｌ，Ｄ． ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．２０， ２０７−２１１）。
【０１４１】
なお、本発明においては、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の発現が上方制御されるか否かを検出するために、細胞のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）のｍＲＮＡレベルを標準遺伝子（ハウスキーピング遺伝子（例えば、Ｓｈａｐｅｒ， Ｎ．Ｌ．ら、Ｊ． Ｍａｍｍａｒｙ Ｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌ． Ｎｅｏｐｌａｓｉａ ３（１９９８）３１５−３２４；Ｗｕ， Ｙ．Ｙ．およびＲｅｅｓ， Ｊ．Ｌ．、Ａｃｔａ Ｄｅｒｍ． Ｖｅｎｅｒｅｏｌ． ８０（２０００）２−３）のｍＲＮＡレベルと、好ましくはＲＴ−ＰＣＲによって比較することもできる。
【０１４２】
上記のような手法によって標的配列（ＤＮＡ、ｍＲＮＡなど）を検出・定量し、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の発現過多が確認された場合は、例えば、ＰＯＭＰまたはＰＳＭＡ７の過剰発現に起因する疾患（例えば、がん（例：大腸がん））である可能性が高い、あるいは将来罹患する可能性が高いと診断することができる。
【０１４３】
５．３ 質量分析装置を用いる診断方法
本発明の診断方法の別の実施形態では、被検試料中の標的タンパク質またはその断片の存在を、質量分析装置（ＭＳ）を用いて同定することができる。すなわち、質量分析装置を用いることによって、標的タンパク質またはその断片のアミノ酸配列の決定を行うことができ、被験者由来の生体試料中にプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）が存在するか否かを判定することができる。質量分析法は、ＭＳを用いてタンパク質やペプチドのような試料をイオン化し、得られた質量／電荷（ｍ／ｚ）に従って分離し、その強度を測定することにより、試料の質量を決定する方法である。その質量分析の結果から、タンパク質やペプチドのアミノ酸配列を構成する個々のアミノ酸を同定することができる。
【０１４４】
イオン化には、マトリクスアシステッドレーザーデソープションイオン化法（ＭＡＬＤＩ）、エレクトロスプレーイオン化法（ＥＳＩ）、気相法（ＥＩ，ＣＩ）、電界脱離（ＦＤ）法など種々の方法が使用され得る。イオン分離には、イオン化法と相性のよいイオン分離法が用いられ、例えば、ＭＡＬＤＩの場合には、飛行時間型（ｔｉｍｅ ｏｆ ｆｌｉｇｈｔ：ＴＯＦ）質量分析計、ＥＳＩの場合には、四重極型（ＱＭＳ）、イオントラップ型、磁場型などの質量分析計がそれぞれ用いられる。質量分析装置は、タンデムで用いられることもある。例えば、ＬＣ−ＥＳＩ ＭＳ／ＭＳ、Ｑ−ＴＯＦ ＭＳ、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ ＭＳ等が挙げられる。なお、その他のアミノ酸配列決定法、例えば、シークエンサー（例：気相シークエンサー）によるアミノ酸配列決定法が利用されてもよい。
【０１４５】
５．４ 診断用キット
本発明はまた、プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体（例：抗ＰＯＭＰ抗体、抗ＰＳＭＡ７抗体）を含有する、被験者の体液試料中のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）またはその断片をがんマーカーとして検出および／または定量するためのキットを提供する。さらに、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列を含有する、被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片をがんマーカーとして検出および／または定量するためのキットをも提供する。これらのキットは、上述の免疫学的手法またはハイブリダイゼーション法等により、がんマーカーを検出するために用いられる。このようながんとしては、例えば、大腸がん、胃がん、肺がん、乳がん、前立腺がん、食道がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん（例：子宮頸がん、子宮体がん）、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、卵巣がん、脳腫瘍、血液腫瘍などが含まれるが、とりわけ、大腸がんが好ましい。
【０１４６】
本明細書中、「がんマーカー」とは、被験者の体液（例えば、血液、尿、リンパ液、唾液、汗、精液等）または細胞もしくは組織中における、正常組織に由来していないか、あるいはがん細胞または組織において選択的に発現の亢進している分子のことをいい、被験者の体液または細胞もしくは組織中における当該分子の存在ががんの存在を示すかまたは示唆するものをいう。
【０１４７】
上記第一の態様のキットは、被験者からの体液試料中の抗原〔プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）およびその部分ペプチドを含む〕を検出および／または定量する成分を含有する。例えば、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）がＥＬＩＳＡで検出および／または定量される場合、このような成分は、例えば、組織切片、または血液や尿のような体液試料中のプロテオソーム関連遺伝子またはタンパク質のレベルを検出および／または定量するために使用され得る。このような抗体は放射能、蛍光、比色、または酵素標識で標識されていてもよい。本発明のキットは、標識された二次抗体を含有していてもよい。
【０１４８】
上記第二の態様のキットは、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有する。例えば、本発明のキットは、ＤＮＡチップ上に固定された上記ポリヌクレオチドを含有し得る。
【０１４９】
本発明のキットは、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）に対する抗体、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列等の他に、容器およびラベルを含んでいてもよい。容器上のまたは容器に伴うラベルには、薬剤が大腸がんマーカーの検出に使用されることが示されていてもよい。また、他のアイテム、例えば、使用説明書等がさらに含まれていてもよい。
【０１５０】
以下、実施例を用いて本発明をより具体的に説明するが、本発明の範囲は、これらの実施例によって限定されない。
【実施例】
【０１５１】
実施例１：アレイＣＧＨ法による大腸がん特異的増幅遺伝子の同定
本実施例では、大腸がん特異的な遺伝子増幅領域を特定するために、大腸がん検体２００症例のサンプル調製およびアレイＣＧＨ法に基づく検証を実施した。
【０１５２】
その結果、大腸がん検体において高頻度に増幅が起きている領域の内、公共ＤＢでの遺伝子情報（ＮＣＢＩ：ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）を利用し、精査した結果、使用したＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−９７Ｅ２３に位置している、ＰＯＭＰ（Proteasome maturation protein）（ＮＣＢＩ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿０１５９３２）および、ＲＰ１１−１０８３Ｇ１８に位置している、ＰＳＭＡ７（Proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 7）（ＮＣＢＩ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿００２７９２）遺伝子が大腸がん患者において高頻度で高値であることを見出した（図１，表３）。図１は、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の大腸がん患者２００検体での増幅度に対する頻度を示すヒストグラムである。G/R値が１．２以上の検体では、ＰＯＭＰ遺伝子はＧ／Ｒ値が１．３〜１．５を中心とした分布を示し、ＰＳＭＡ７遺伝子はＧ／Ｒ値が１．５〜２を中心とした分布を示した。
また、下記の表３は、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の大腸がん患者２００検体での増幅度（Ｇ／Ｒ値）および頻度を示す。平均値は、Ｇ／Ｒ値が１．２以上の検体での平均値を示している。表３に示されるように、ＰＯＭＰ遺伝子は、２００検体の大腸がん患者の３９．０％において増幅が認められ、その増幅度の平均値は、１．３であった。最大値は５．３であり、非常に高頻度で顕著な増幅が起こっていた。またＰＳＭＡ７遺伝子は、２００検体の大腸がん患者の６９．５％において増幅が認められ、その増幅度の平均値は、１．５であった。最大値は２．８であり、ＰＯＭＰ遺伝子と同様に、非常に高頻度で顕著な増幅が起こっていた。
【表３】
【０１５３】
実施例２：遺伝子増幅の評価
アレイＣＧＨ法により得られた結果を検証するために、検体組織のがん細胞におけるＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子領域の遺伝子増幅を、当該技術分野で公知のＦＩＳＨ法により評価した。
【０１５４】
アレイＣＧＨ法により、遺伝子増幅度（Ｇ／Ｒ）が１．２以上であった大腸がん患者由来の検体組織を用いて、ＰＯＭＰ遺伝子が位置するＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−９７Ｅ２３とＰＳＭＡ７遺伝子が位置するＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−１０８３Ｇ１のＤＮＡ Ｐｒｏｂｅでハイブリダイゼーションを実施した。
【０１５５】
結果
図２は、ＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−９７Ｅ２３（ＰＯＭＰ遺伝子領域に相当）をＤＮＡ Ｐｒｏｂｅとして行ったＦＩＳＨ解析の結果である。図は、使用した５つの検体組織（Ａ〜Ｅ）とそれらのＧ／Ｒ値、および、各検体におけるＤＡＰＩ染色された核(６細胞分)の蛍光顕微鏡写真を示す。図３は、ＲＰ１１−１０８３Ｇ１（ＰＳＭＡ７遺伝子領域に相当）をＤＮＡ Ｐｒｏｂｅとして行ったＦＩＳＨ解析の結果である。図は、５つの検体組織（Ａ〜ＤおよびＦ。検体Ａ〜ＤはＰＯＭＰ遺伝子のＦＩＳＨ解析に使用した検体と共通の検体）に対してＤＡＰＩにより染色された核(６細胞分)の蛍光顕微鏡写真を示す。
ＰＯＭＰ遺伝子領域のシグナルは、正常部の核では２スポットであったが、がん細胞の核では最も多いもので８スポット観察された（図２，検体Ｅ−５）。ＰＳＭＡ７遺伝子領域のシグナルは、正常部の核では２スポットであったが、がん細胞の核では最も多いもので９スポット観察された（図３，検体Ｆ−２）。いずれの遺伝子領域においても、がん細胞の核においては3スポット以上のシグナルが観察された。以上のことは、検体組織に対して行ったＦＩＳＨ解析によって、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の遺伝子増幅が確認されたことを示しており、併せて、アレイＣＧＨ法により得られた結果がＦＩＳＨ法によって検証されたことを示している。またこのことは、これらの遺伝子領域が、がん治療薬の分子標的としてだけでなく、ＦＩＳＨ法によるがん診断に応用できることを示している。
【０１５６】
実施例３：大腸がん検体における遺伝子発現量亢進の検証
ゲノムＤＮＡのある遺伝子領域の増幅は、その遺伝子の発現量亢進が引き起こされることが想像される。そこで本実施例では、遺伝子領域の増幅が見出されたＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のがん特異的なｍＲＮＡの発現量亢進を検証するために、大腸正常１３検体、がん２０検体におけるＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子の定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析を実施した。
【０１５７】
大腸がん検体由来の全ＲＮＡはサイトミクス社より購入し、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ ＩＩＩ Ｆｉｒｓｔ−Ｓｔｒａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｙｓｔｅｍ ｆｏｒ ＲＴ−ＰＣＲ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用して、添付のプロトコールに従ってｃＤＮＡを合成した。このｃＤＮＡを鋳型にして、定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析を実施した。定量的ＰＣＲは、ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ ＲＴ−ＰＣＲ Ｒｅａｇｅｎｔｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して、添付のプロトコールに従って７５００ Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて実施した。ｍＲＮＡの相対発現量を算出するための内部標準遺伝子として、ＴＡＴＡ ｂｏｘ ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ（ＴＢＰ）を用いた。プライマーは、以下の配列を合成し（ＯＰＥＲＯＮに合成委託）使用した。
【０１５８】
ＰＯＭＰプライマー配列：
５’−ATCTGAGCTAAAGGACAGTATTCCAGTTAC−３’（配列番号１３）
５’−AAACCTTTCCGAAGAAGATCATGAC−３’（配列番号１４）
ＰＳＭＡ７プライマー配列：
５’−CAAGTGGAGTACGCGCAGGA−３’（配列番号１５）
５’−CTGCAGTTTGGCCACTGACTTC−３’（配列番号１６）
ＴＢＰプライマー配列：
５’−CTTGACCTAAAGACCATTGCACTTC−３’（配列番号１７）
５’−GTGGCTCTCTTATCCTCATGATTACC−３’（配列番号１８）。
【０１５９】
結果
市販されている大腸がん組織および正常組織由来の全ＲＮＡを用いて、定量的ＲＴ−ＰＣＲを実施した。
【０１６０】
図４に、大腸正常１３検体および大腸がん２０検体におけるＰＯＭＰ遺伝子のＴＢＰ遺伝子に対するｍＲＮＡ相対発現量（以降単に、ＰＯＭＰ遺伝子相対発現量と表記する）とＰＳＭＡ７遺伝子のＴＢＰ遺伝子に対するｍＲＮＡ相対発現量（以降単に、ＰＳＭＡ７遺伝子相対発現量と表記する）をプロットしたグラフを示す。図４に示されるように、ＰＯＭＰ遺伝子相対発現量およびＰＳＭＡ７遺伝子相対発現量は、大腸正常検体に比べてともに高い値を示した（ｐ＜０．０１のｔ検定において有意）。
表４に、ＰＯＭＰ遺伝子相対発現量およびＰＳＭＡ７遺伝子相対発現量における、正常１３検体の平均値およびがん２０検体の平均値を示した。またさらに、それぞれの遺伝子相対発現量おいて、正常１３検体の平均値に対するがん２０検体での平均値の割合を発現亢進度として求め、併せて表に示した。表４に示すように、ＰＯＭＰ遺伝子では２．６倍、ＰＳＭＡ７遺伝子では２．８倍の発現亢進度を示した。これらのことから、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子は、ともにがん特異的にｍＲＮＡの発現亢進が起こっていることが示された。
【表４】
【０１６１】
実施例４：大腸がん細胞株を用いたＲＮＡｉ解析による機能解析
本実施例では、大腸がん患者２００検体において高頻度に増幅が認められたＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子について、がん細胞における遺伝子機能を調査するために、培養細胞を用いたＲＮＡｉ解析を行った。遺伝子ノックダウン率については、定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析あるいはイムノブロッティング解析により評価した。遺伝子ノックダウンによる細胞の表現型に対する影響を評価するために、大腸がん細胞株であるＲＫＯ細胞へｓｉＲＮＡを導入し、時系列に従い顕微鏡下で微分干渉像を撮影し、細胞の動態を詳細に観察した。またｓｉＲＮＡの導入後、９６時間目に生細胞数測定解析を行い、細胞の生存率を求めた。
【０１６２】
＜ＲＮＡｉ解析＞
細胞株はＡＴＣＣより購入し、添付のプロトコールに従い培養を行った。ｓｉＲＮＡは４種のｓｉＲＮＡが混合されたＯＮ−ＴＡＲＧＥＴ ｐｌｕｓ ＳＭＡＲＴｐｏｏｌをＤｈａｒｍａｃｏｎより購入した。
【０１６３】
ｓｉＲＮＡの培養細胞内への導入は、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用し、１０ｎＭのｓｉＲＮＡを添付のプロトコールに従い細胞に導入した。対照にはＯＮ−ＴＡＲＧＥＴ ｐｌｕｓ Ｎｏｎ−Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｐｏｏｌ（Ｄｈａｒｍａｃｏｎ）を使用した。
【０１６４】
＜定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析＞
遺伝子ノックダウン率について評価するために、ｓｉＲＮＡの効果をｍＲＮＡレベルで検証した。ｓｉＲＮＡ導入後２４時間の細胞から、ＳＶ９６ Ｔｏｔａｌ ＲＮＡ Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を使用して、添付のプロトコールに従い、全ＲＮＡを抽出した。その後、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ ＩＩＩ Ｆｉｒｓｔ−Ｓｔｒａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｙｓｔｅｍ ｆｏｒ ＲＴ−ＰＣＲ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用して、添付のプロトコールに従い、ｃＤＮＡを合成した。
【０１６５】
このｃＤＮＡを鋳型にして、定量的ＲＴ−ＰＣＲを実施した。定量的ＰＣＲは、Ｐｏｗｅｒ ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して、添付のプロトコールに従い、７５００ Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて実施した。
【０１６６】
＜イムノブロッティング解析＞
遺伝子ノックダウン率について評価するために、ｓｉＲＮＡの効果をタンパク質レベルで検証した。ｓｉＲＮＡ導入後４８時間および７２時間の細胞を回収し、１％ＳＤＳを含むＰＢＳ中で超音波破砕を行い、細胞溶解液を調製した。その細胞溶解液についてＳＤＳ−ＰＡＧＥ（ドデシル硫酸−ポリアクリルアミドゲル電気泳動）を行った後、抗ＰＳＭＡ７抗体を用いてイムノブロッティングを行った。内在性コントロールとして、ｐｅｐｔｉｄｙｌｐｒｏｌｙｌ ｉｓｏｍｅｒａｓｅ Ｂ（ＰＰＩＢ）を用いた。
【０１６７】
＜生細胞数測定解析＞
ｓｉＲＮＡ導入後の生細胞数をＡｌａｍａｒ Ｂｌｕｅ（Ｂｉｏｓｏｕｒｃｅ）を用いて、添付のプロトコールに従い、Ｗａｌｌａｃ １４２０ Ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ／Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｃｅ Ｃｏｕｎｔｅｒ ＡＲＶＯ（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ）により測定した。
【０１６８】
結果
図５に、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入後、２４時間に回収したＯＵＭＳ−２３細胞を用いて行った定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析の結果を示す。内在性コントロールとしてＴＢＰの相対比を用いて、ＮＣに対する相対量を示した。ＮＣはＯＮ−ＴＡＲＧＥＴ ｐｌｕｓ Ｎｏｎ−Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｐｏｏｌ（Ｄｈａｒｍａｃｏｎ）を使用した。ＮＴはＮｏｎ−Ｔｒｅａｔｅｄ（未処理）を表す。図５に示されるように、ｍＲＮＡレベルでのＲＮＡｉ効果を定量的ＲＴ−ＰＣＲで確認した結果、いずれの遺伝子においても遺伝子発現量は、ＮＣに対して１０% 以下にまで減少していることが認められた。
【０１６９】
図６に、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入後、４８時間および７２時間に回収したＨｅＬａ細胞を用いて行ったイムノブロッティング解析の結果を示す。図６に示されるように、タンパク質レベルでのＲＮＡｉ効果をイムノブロッティングで確認した結果、ＰＰＩＢタンパク質はサンプル間で一定であったが、ＰＳＭＡ７タンパク質は、ｓｉＲＮＡを導入したサンプル特異的に、およそ３０%程度にまで減少していた。このＰＳＭＡ７タンパク質の減少はトランスフェクション後７２時間においても同様に認められた。
【０１７０】
図７に、ＲＫＯ細胞に対してＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、経時的に微分干渉観察を行った結果を示した。また、トランスフェクション後９６時間に生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値をＶｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）として算出した。図７に示されるように、ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡを細胞内に導入することで、４８時間目以降における細胞増殖の抑制および細胞死の誘導が確認された。また、トランスフェクション９６時間後の生存率は８．９%と著しく減少していた。
【０１７１】
図８に、ＲＫＯ細胞に対してＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、経時的に微分干渉観察を行った結果を示した。また、トランスフェクション後９６時間に生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値をＶｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）として算出した。図７に示されるように、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを細胞内に導入することで、４８時間目以降における細胞増殖の抑制および細胞死の誘導が確認された。また、トランスフェクション９６時間後の生存率は１１．１%と著しく減少していた。
【０１７２】
図９は、観察した微分干渉像の視野内における、生細胞数と死細胞数の経時的な推移を示したグラフである。ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを細胞内に導入すした結果、ともにトランスフェクション４８時間以降で生細胞数の減少および死細胞数の増加が確認された。
【０１７３】
ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡの細胞内へ導入は、それぞれの遺伝子のｍＲＮＡとタンパク質の減少を引き起こすことが確認された（図５，図６）。また、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡの細胞内へ導入は、細胞の増殖を抑制し、細胞死を誘導した（図７，８，９）。これらのことから、大腸がん細胞株であるＲＫＯ細胞において、ＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子の発現抑制は、細胞増殖の抑制をもたらすことが見出された。
【０１７４】
実施例５：大腸由来の種々の細胞株でのＲＮＡｉ効果の評価
本実施例では、大腸由来の種々の細胞株でのＲＮＡｉ効果の評価するために、大腸がん細胞株であるＲＫＯ細胞、ＬＳ１２３細胞、ＲＫＯ−Ｅ６細胞、ＯＵＭＳ−２３細胞、Ｃａｃｏ−２細胞、さらに大腸正常細胞株であるＣＣＤ１８Ｃｏ細胞を用いてＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、時系列に従い顕微鏡下で微分干渉像を撮影し、細胞の動態を詳細に観察した。またｓｉＲＮＡの導入後、９６時間目に生細胞数測定解析を行い、細胞の生存率を求めた。
【０１７５】
＜ＲＮＡｉ解析＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１７６】
＜生細胞数の測定＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１７７】
結果
図１０に、ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡのトランスフェクション９６時間後の微分干渉像および生存率を示す。使用されたすべての大腸がん培養細胞株に対して、ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡ導入は、細胞死を誘導することが認められた。また、ＬＳ１２３細胞においては、細胞死の誘導は弱いものの、細胞周期長の延長が認められた。
【０１７８】
図１１にＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡのトランスフェクション９６時間後の微分干渉像および生存率を示す。使用された細胞のうち半数以上の大腸がん培養細胞株に対して、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡ導入は、細胞死を誘導することが認められた。また、ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果はＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果に比べて僅かに弱いことが確認された。
【０１７９】
これらのことから、ＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子の遺伝子発現の抑制は、種々の大腸がん培養細胞に対して、細胞増殖抑制効果をもたらすことが認められた。
【０１８０】
実施例６：肺および乳由来細胞株でのＲＮＡｉ効果の評価
大腸がん細胞株では、ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子ともにＲＮＡｉにより、増殖抑制効果が認められた。そこでさらに、他の臓器（肺および乳）由来の細胞株においてどのような効果が認められるのか、前述のＲＮＡｉ解析法により評価した。肺由来の培養細胞は、がん細胞株であるＮＣＩ−Ｈ８３８細胞とＡＢＣ−１細胞および正常細胞株であるＩＭＲ−９０細胞を用いた。また、乳由来の培養細胞は、がん細胞であるＭＣＦ７細胞とＨＣＣ１８０６細胞および正常細胞株であるＨｓ６１７．Ｍｇ細胞を用いた。
【０１８１】
＜ＲＮＡｉ解析＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１８２】
＜生細胞数の測定＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１８３】
結果
図１２は、肺および乳由来の細胞株にＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡを導入した９６時間目の微分干渉像および生存率を示す。ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡの導入は、ＡＢＣ−１細胞（生存率４３％）、ＩＭＲ−９０細胞（生存率９％）、ＨＣＣ１８６０細胞（生存率３％）では細胞死を誘導するが、比較的生存率の高いＭＣＦ７細胞（生存率６５％）、Ｈｓ６１７．Ｍｇ細胞（生存率６１％）に対する細胞増殖抑制効果はわずかであった。ＮＣＩ−Ｈ８３８細胞（生存率１０８％）においては、ＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果は見られなかった。
【０１８４】
図１３は、肺および乳由来の細胞株にＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入した９６時間目の微分干渉像および生存率を示す。ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡの導入は、ＡＢＣ−１細胞（生存率３８％）、ＩＭＲ−９０細胞（生存率４３％）、ＨＣＣ１８６０細胞（生存率２４％）では細胞死を誘導するが、比較的生存率の高いＭＣＦ７細胞（生存率８３％）に対する細胞増殖抑制効果はわずかであった。また、ＩＭＲ−９０細胞においては、細胞死の誘導と合わせて形態変化（細胞伸張）が認められた。ＮＣＩ−Ｈ８３８細胞（生存率１０４％）とＨｓ６１７．Ｍｇ細胞（生存率９９％）においては、ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果は認められなかった。また大腸がん細胞株と同様に、ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果はＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果に比べて僅かに弱いことが確認された。
【０１８５】
これらの結果から、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の機能阻害は、大腸がんだけでなく、肺がんまたは乳がんにおいても抗腫瘍性効果を示すことが示唆された。
【産業上の利用可能性】
【０１８６】
本発明により、がん（例えば、大腸がん）の治療および／または診断に有用な新規な薬剤、キットおよび方法、ならびにがん抑制作用を有する候補化合物のスクリーニング方法が提供される。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、がんにおいて特異的に増幅しているプロテオソーム関連遺伝子、その治療的又は診断的用途などに関する。より具体的には、本発明は、大腸がんにおいて特異的に増幅している遺伝子であるＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子、その治療的又は診断的用途などに関する。
【背景技術】
【０００２】
悪性腫瘍（がん）の特徴として、増殖・浸潤・転移を経て全身化することによる致死があげられる。外科的な切除または放射線治療のような局所療法では、転移性再発がんに対して十分な対処はできず、全身療法である薬物療法の発展が、今後のがん治療成績の向上に期待されている。
【０００３】
がん薬物療法の現在の中心である化学療法は、直接がん細胞のＤＮＡおよび／またはＲＮＡに作用し、細胞を死に至らせる殺細胞薬剤を用いる場合が多いが、がん細胞以外の、例えば、骨髄細胞、生殖細胞、毛母細胞、消化管上皮細胞など分裂がさかんな正常細胞に対しても作用し、強い副作用をもたらしていた。一方、近年の分子細胞生物学の進歩により、がん細胞の浸潤・増殖・転移などにかかわるメカニズムが解明され、そのがん細胞の特定メカニズムに特異的に作用する分子標的薬の開発が注目されている。代表例として、非小細胞肺がんの治療に効果のある、ＥＧＦＲ（上皮成長因子 受容体）チロシンキナーゼ阻害剤であるイレッサ（一般名：ゲフィチニブ）（特許文献１：ＷＯ９６／３３９８０）、乳がんの治療に効果のある、ＨＥＲ−２（ヒト上皮成長因子受容体２）のヒト化モノクローナル抗体のハーセプチン（一般名：トラスツズマブ）（特許文献２：ＷＯ９４／００１３６）などがあげられる。しかしながら、現状では未だ有効な分子標的薬は少なく、今後更なる各がん種に対する有効な分子標的薬の開発が望まれている。
【０００４】
日本人の大腸がんは年々増加の傾向にあり、死亡数は、肺がん、胃がんに次いで３位になっている。年齢別では６０歳代が一番多く、次いで５０歳代、７０歳代の順である。大腸がんの増加の原因には、遺伝的要因、環境的要因などが考えられるが、食生活の西欧化、特に動物性脂肪の取りすぎが原因ではないかと指摘されている。大腸がんの有効な分子標的薬の開発が待たれている。また、診断に用いられている腫瘍マーカー（ＣＥＡ，ＣＡ１９−９）は、進行大腸がんであっても約半数が陽性を示すのみで、臓器特異性も無く、より高性能な診断薬の開発が望まれている。
【特許文献１】ＷＯ９６／３３９８０
【特許文献２】ＷＯ９４／００１３６
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
このような状況下、がんの診断および／または治療に有効な薬剤の開発が望まれている。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、鋭意研究を重ねた結果、がん（特に、大腸がん）において、高頻度に増幅している２つのプロテアソームに関連する遺伝子、ＰＯＭＰ、ＰＳＭＡ７を見出した。本発明者らはさらに、大腸がん細胞株においてＰＯＭＰおよび／またはＰＳＭＡ７の発現を阻害することによって、がん細胞の増殖を抑制し得ることを見出し、本発明を完成するに至った。すなわち、本発明は、以下に記載するがん治療剤、がん抑制作用を有する候補物質のスクリーニング方法、がん診断剤、がん診断用キット、がんの診断方法などを提供する。
【０００７】
［１］プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん治療剤。
［２］上記プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質が、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸、
（ｂ）ＰＯＭＰ遺伝子もしくはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物またはその一部に対するアンチセンス核酸、
および
（ｃ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸、
からなる群から選択される物質を含む、［１］に記載のがん治療剤。
［３］プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である、がん治療剤。
［４］上記プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質が、
該ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体、
を含む、［３］に記載のがん治療剤。
［５］上記がんが大腸がんである、［１］〜［４］のいずれかに記載のがん治療剤。
【０００８】
［６］プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子を発現する細胞に、被検化合物を接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子の発現レベルを測定する工程、および
（ｃ）被検化合物を接触させない場合と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
［７］プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物とを接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物との結合活性を測定する工程、および
（ｃ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と結合する化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
［８］大腸がんの治療剤の候補化合物をスクリーニングするためのものである、［６］または［７］に記載の方法。
【０００９】
［９］ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体。
［１０］［９］に記載の抗体を含有するがん治療剤。
［１１］放射性同位元素、治療タンパク質、低分子の薬剤、または治療遺伝子を担持したベクターをさらに含有する、［１０］に記載のがん治療剤。
［１２］上記がんが大腸がんである、［１０］または［１１］に記載のがん治療剤。
［１３］［９］に記載の抗体を含有するがん診断剤。
［１４］プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列を含有するがん診断剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断剤。
［１５］上記がんが大腸がんである、［１３］または［１４］に記載のがん診断剤。
【００１０】
［１６］［９］に記載の抗体を含有するがん診断用キット。
［１７］プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するがん診断用キットであって、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断用キット。
［１８］上記がんが大腸がんである、［１６］または［１７］に記載のがん診断用キット。
【００１１】
［１９］被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連タンパク質またはプロテアソーム関連遺伝子をがんマーカーとして検出および／または定量する方法であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質であり、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、方法。
［２０］上記生体試料が、全血、血清、または血漿である、［１９］に記載の方法。
［２１］質量分析装置を用いて、上記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、［１９］または［２０］に記載の方法。
［２２］抗プロテアソーム関連抗体を用いて、上記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、［１９］〜［２１］のいずれかに記載の方法。
［２３］（ａ）被験者由来の生体試料と、上記プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体とを接触させる工程、および
（ｂ）上記試料中での上記抗体と、上記プロテアソーム関連タンパク質との結合を検出および／または定量する工程、
を包含する、［２２］に記載の方法。
［２４］（ａ）被験者由来の生体試料と、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドとを接触させる工程、および
（ｂ）上記試料中での上記ポリヌクレオチドと、該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片とのハイブリダイゼーションを検出および／または定量する工程、
を包含する、［１９］または［２０］に記載の方法。
［２５］がんの診断に用いるための［１９］〜［２４］のいずれかに記載の方法。
［２６］上記がんが、大腸がんである、［２５］に記載の方法。
【００１２】
［２７］配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有する、ポリヌクレオチド。
［２８］ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有するポリヌクレオチドを含有する、がん治療剤。
【発明の効果】
【００１３】
本発明により、がん（例えば、大腸がん）の治療および／または診断に有用な新規な薬剤、キットおよび方法、ならびにがん抑制作用を有する候補化合物のスクリーニング方法が提供される。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】ＰＯＭＰ、ＰＳＭＡ７遺伝子の大腸がん患者由来の２００検体における遺伝子増幅度に対する頻度を示すヒストグラムである。
【図２】大腸がん患者由の５つの検体組織（Ａ，Ｂ，Ｃ，Ｄ，Ｅ）のＰＯＭＰ遺伝子領域に対するプローブを用いたＦＩＳＨ光学顕微鏡写真である。ＤＡＰＩ染色された核内に、検体組織では６細胞すべてにおいてシグナルが３以上認められた。
【図３】大腸がん患者由の５つの検体組織（Ａ，Ｂ，Ｃ，Ｄ，Ｆ）のＰＳＭＡ７遺伝子領域に対するプローブを用いたＦＩＳＨ光学顕微鏡写真である。ＤＡＰＩ染色された核内に、検体組織では６細胞すべてにおいてシグナルが３以上認められた。
【図４】定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析により、大腸正常13検体とがん２０検体におけるＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のＴＢＰ遺伝子に対するｍＲＮＡ相対発現量を求め、プロットしたグラフである。
【図５】定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析により測定した、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の遺伝子ノックダウン率を示すグラフである。ＮＣはネガティブコントロールを、ＮＴは未処理を表す。
【図６】ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入後、４８時間と７２時間における内在性のＰＳＭＡ７タンパク質を検出した、イムノブロット解析の結果である。ＰＳＭＡ７タンパク質と思われるバンドを矢印で示した（上のパネル）。アスタリスクは非特異的なバンドを示す。内在性コントロール遺伝子としてＰＰＩＢタンパク質を検出した(下のパネル)。ＮＴは未処理を表す。トランスフェクション後４８時間のＰＳＭＡ７タンパク質はＮＴに対しておよそ３０%にまで減少しており、７２時間後も同程度の減少量であった。
【図７】ＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、２４時間ごとの経時変化を示した微分干渉像である。Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）はＲＮＡｉ解析９６時間目の細胞に対して生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値を求めることで算出した。
【図８】ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、２４時間ごとの経時変化を示した微分干渉像である。Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）はＲＮＡｉ解析９６時間目の細胞に対して生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値を求めることで算出した。
【図９】ＲＫＯ細胞におけるＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析後の生細胞数と死細胞数の経時変化を示したグラフである。
【図１０】大腸がん細胞５種と大腸正常細胞ＣＣＤ１８Ｃｏに対するＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【図１１】大腸がん細胞５種と大腸正常細胞ＣＣＤ１８Ｃｏに対するＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【図１２】肺がん細胞２種と肺正常細胞ＩＭＲ−９０および乳がん細胞２種と乳正常細胞Ｈｓ６１７．Ｍｇに対するＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【図１３】肺がん細胞２種と肺正常細胞ＩＭＲ−９０および乳がん細胞２種と乳正常細胞Ｈｓ６１７．Ｍｇに対するＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果を示す微分干渉像である。生存率および定性評価を合わせて示す。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１５】
本発明者らは、大腸がん患者由来の検体を用いてアレイＣＧＨ法による増幅遺伝子の検証を行い、大腸がん特異的な遺伝子増幅領域を特定した。検体において高頻度に増幅が起きている領域のうち、ヒトＰＯＭＰ（Proteasome maturation protein）遺伝子およびヒトＰＳＭＡ７（Proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 7）遺伝子が大腸がん患者由来の検体において高頻度であることを見出した。
【００１６】
POMPは、分子シャペロンとしてプロテアソーム形成にかかわるタンパク質分子であり、ハーフプロテアソームを重合させ、２０Ｓプロテアソームの形成を促進することが知られている（特開２００７−１１９３８２号公報）。
【００１７】
PSMA7は、プロテアソームを構成するαタイプサブユニットの１つである。このタンパク質分子はC末端に核局在化シグナルを有しており、プロテアソームを核内に移行させ、機能させるのに重要な役割を担っている（Ogiso, Y., Tomida, A., Tsuruo, T. (2002) Cancer Res. 62, 5008-5012. Nuclear Localization of Proteasomes Participates in Stress-inducible Resistance of Solid Tumor Cells to Topoisomerase II-directed Drugs）。
【００１８】
プロテアソームは、ユビキチンで修飾されたタンパク質を分解する細胞内タンパク質分解装置である。活性型の26Sプロテアソームはタンパク質分解実行ユニットである20Sプロテアソームの両端に、それを制御する19S 複合体が会合した巨大な分子複合体である。
【００１９】
20Sプロテアソームは、リング状に集まった７種類のサブユニット（α１〜α７）から構成されるαリングと、同様にリング状に集まった７種類のサブユニット（β１〜β７） から構成されるβリングが、αββαの順に積み重なった筒状構造をしている。空洞になった部分はタンパク質分解の場となっており、β1、β2、β5がその触媒活性を発揮する。なお、αリングとβリングが一つずつ会合した状態（２０Ｓプロテアソームの半分の状態）を、ハーフプロテアソームという。
【００２０】
ユビキチン−プロテアソームシステムは細胞内における主要なタンパク質分解系として知られている。ユビキチンは、分解するタンパク質に結合し、ポリユビキチン鎖を形成し（ポリユビキチン化修飾）、プロテアソームは、そのポリユビキチン化修飾されたタンパク質を特異的に分解する。
【００２１】
このシステムは、細胞内における選択的なタンパク質分解を通じて、細胞周期・アポトーシス・代謝調節・免疫応答・シグナル伝達・転写制御・ストレス応答・ＤＮＡ修復など、生命科学のあらゆる領域において、中心的な役割を果たしていることが明らかになりつつある(Adams J. (2004) Nat Rev Cancer. 4, 349-360. The proteasome: a suitable antineoplastic target. ； Hershko, A. (2005) Cell Death Differ. 12, 1191-1197. The ubiquitin system for protein degradation and some of its roles in the control of the cell division cycle)。
【００２２】
近年、プロテアソーム阻害剤ががん治療に有用である可能性があることが示された（Kisselev, A. F., Goldgerg, A. L. (2001) Chem. & Biol. 8, 739-758. : Proteasome inhibitors: from research tools to drug candidates.； Elliott, P. J., Ross, J. S., (2001) Am. J. Clin. Pathol. 116, 637-646. The Proteasome: A New Target for Novel Drug Therapies. ）。ベルケード（Bortezomib） は、多発性骨髄腫に高い有効性を持つ抗ガン剤として2003年に欧米で認可された（WO/2003/039545 ）、プロテアソームを標的としたはじめての分子標的薬である。また、多発性骨髄腫以外のがんに対するプロテアソーム阻害剤の有効性についても検討されている（Adams J. (2004) Nat Rev Cancer. 4, 349-360. The proteasome: a suitable antineoplastic target）。
【００２３】
プロテアソーム阻害剤は、プロテアソームの触媒活性を持つβサブユニットを阻害する。特に、Bortezomibはβ5の活性中心に結合して、プロテアソームを特異的かつ可逆的に阻害する（Kisselev, A. F., Goldgerg, A. L. (2001) Chem. & Biol. 8, 739-758. : Proteasome inhibitors: from research tools to drug candidates； Lightcap, E. S., McCormack, T. A., Pien, C. S., Chau, V., Adams, J., and Elliott, P. J. (2000) Clin. Chem. 46, 673-683. Proteasome Inhibition Measurements: Clinical Application）。
【００２４】
しかしながら、ＰＯＭＰまたはＰＳＭＡ７とがんとの直接的な関連については、報告されていない。
【００２５】
本発明者らは、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子（これらは、プロテオソームの形成、機能等に関わるタンパク質をコードする遺伝子である）の発現をＲＮＡｉ（ＲＮＡ干渉）によって抑制することによってがん細胞の増殖を抑制できることを確認した。したがって、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現を抑制することによって、がんを治療することが可能となる。また、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現量を測定することによってがんの診断を行うことも可能となる。
【００２６】
以下、本発明のがん治療剤、スクリーニング方法、診断剤などについて詳細に説明する。
【００２７】
１．がん抑制作用を有する薬剤
本発明は、プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。
【００２８】
より具体的には、本発明は、（１）ＰＯＭＰ遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤、及び（２）ＰＯＭＰタンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。
【００２９】
本発明はまた、（１）ＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤、及び（２）ＰＳＭＡ７タンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。
【００３０】
本明細書中、「プロテアソーム関連遺伝子」という場合、プロテアソームの形成、機能等に関わるタンパク質（以下、「プロテアソーム関連タンパク質」と呼ぶ。）をコードする遺伝子を意味し、より具体的には、ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子などを指す。
【００３１】
本明細書中、「ＰＯＭＰ遺伝子」という場合、ＮＣＢＩヌクレオチドデータベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿０１５９３２で登録されている１３４７塩基対（ｂｐ）からなるヒトＰＯＭＰ遺伝子（配列番号１）を意味するが、これに限定されず、例えば、当該遺伝子の塩基配列において１つ以上（例えば、１〜５０個、１〜４０個、１〜３０個、１〜２５個、１〜２０個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個（１〜数個）、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、１個）の塩基の置換、欠失、付加、または挿入などを有することによって変化している変異体のような、当該遺伝子の塩基配列またはその相補配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドからなる遺伝子も本明細書中で使用する「ＰＯＭＰ遺伝子」に含まれるものとする。
【００３２】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７遺伝子」という場合、ＮＣＢＩヌクレオチドデータベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿００２７９２で登録されている９８４塩基対（ｂｐ）からなるヒトＰＳＭＡ７遺伝子（配列番号３）を意味するが、これに限定されず、例えば、当該遺伝子の塩基配列において１つ以上（例えば、１〜５０個、１〜４０個、１〜３０個、１〜２５個、１〜２０個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個（１〜数個）、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、１個）の塩基の置換、欠失、付加、または挿入などを有することによって変化している変異体のような、当該遺伝子の塩基配列またはその相補配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドからなる遺伝子も本明細書中で使用する「ＰＳＭＡ７遺伝子」に含まれるものとする。
【００３３】
ハイブリダイゼーションは、公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えば、モレキュラー・クローニング（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｔｈｉｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｊ．Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂ． Ｐｒｅｓｓ． ２００１）に記載の方法などに従って行うことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行うことができる。ここで、「ストリンジェントな条件」は、低ストリンジェントな条件、中ストリンジェントな条件及び高ストリンジェントな条件のいずれでもよい。「低ストリンジェントな条件」は、例えば、５×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ＳＤＳ、５０％ホルムアミド、３２℃の条件である。また、「中ストリンジェントな条件」は、例えば、５×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ＳＤＳ、５０％ホルムアミド、４２℃の条件である。「高ストリンジェントな条件」は、例えば、５×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ＳＤＳ、５０％ホルムアミド、５０℃の条件である。これらの条件において、温度を上げるほど高い相同性を有するＤＮＡが効率的に得られることが期待できる。ただし、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーに影響する要素としては温度、プローブ濃度、プローブの長さ、イオン強度、時間、塩濃度など複数の要素が考えられ、当業者であればこれら要素を適宜選択することで同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。
【００３４】
ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとしては、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴなどの相同性検索ソフトウェアにより、デフォルトのパラメーターを用いて計算したときに、配列番号１の塩基配列と、例えば、７０％以上、７５％以上、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９１％以上、９２％以上、９３％以上、９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、９９％以上の同一性を有するポリヌクレオチドをあげることができる。
【００３５】
本明細書中、「遺伝子の発現阻害」とは、遺伝子からタンパク質生成までの一連の事象（例えば、転写（ｍＲＮＡの生成）、翻訳（タンパク質の生成）を含む）のうちのいずれかの事象を阻害することによってその遺伝子によってコードされるタンパク質の生成を阻害することを意味するものとする。
【００３６】
本明細書中、「ＰＯＭＰタンパク質」という場合、ＮＣＢＩタンパク質データベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＰ＿０５７０１６で登録されている１４１アミノ酸残基（ａａ）からなるヒトＰＯＭＰタンパク質（配列番号２）およびこのタンパク質と実質的に同質の活性（例えば、プロテアソームの形成促進活性）から選択される一種以上の活性）を保持し、このタンパク質のアミノ酸配列に対して１〜複数個のアミノ酸残基の欠失、置換、挿入、及び／または付加が生じたアミノ酸配列からなる変異タンパク質をいう。
【００３７】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７タンパク質」という場合、ＮＣＢＩタンパク質データベースにおいて、Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＰ＿００２７８３で登録されている２４８アミノ酸残基（ａａ）からなるヒトＰＳＭＡ７タンパク質（配列番号４）およびこのタンパク質と実質的に同質の機能（例えば、プロテアソームの形成およびプロテアソームの活性発現に必須な構成因子としての機能）から選択される一種以上の機能）を保持し、このタンパク質のアミノ酸配列に対して１〜複数個のアミノ酸残基の欠失、置換、挿入、及び／または付加が生じたアミノ酸配列からなる変異タンパク質をいう。
【００３８】
上記変異タンパク質における、アミノ酸の変異部位および個数は、変異タンパク質が元のタンパク質と実質的に同質の活性を保持している限り特に制限はないが、変異個数は、例えば、１〜５０個、１〜４０個、１〜３０個、１〜２５個、１〜２０個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個（１〜数個）、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、１個である。変異個数は一般的に少ない程好ましい。また、このような変異タンパク質は、配列番号２のアミノ酸配列と約７０％以上、７５％以上、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９１％以上、９２％以上、９３％以上、９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、９９％以上の同一性を有するアミノ酸配列を有し、かつ元のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質を含む。上記相同性の数値は一般的に大きい程好ましい。
【００３９】
上記ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質には、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の「部分ペプチド」もそれぞれ含まれる。
【００４０】
ＰＯＭＰタンパク質の部分ペプチドとしては、ＰＯＭＰタンパク質のアミノ酸配列（配列番号２）の一部の連続するアミノ酸の配列からなる部分ペプチドであって、好ましくは、前述のＰＯＭＰタンパク質の活性と同様の活性を有するものであればいずれのものでも良い。例えば、配列番号２で表されるアミノ酸配列において、少なくとも２０個、好ましくは少なくとも５０個、さらに好ましくは少なくとも７０個、より好ましくは少なくとも１００個、最も好ましくは少なくとも１３０個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列を有するポリペプチドなどが挙げられる。
【００４１】
ＰＳＭＡ７タンパク質の部分ペプチドとしては、ＰＳＭＡ７タンパク質のアミノ酸配列（配列番号４）の一部の連続するアミノ酸の配列からなる部分ペプチドであって、好ましくは、前述のＰＳＭＡ７タンパク質の活性と同様の活性を有するものであればいずれのものでも良い。例えば、配列番号４で表されるアミノ酸配列において、少なくとも２０個、好ましくは少なくとも５０個、さらに好ましくは少なくとも７０個、より好ましくは少なくとも１００個、最も好ましくは少なくとも２００個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列を有するポリペプチドなどが挙げられる。
【００４２】
好ましくは、これらのポリペプチドは、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の活性に関与する部分に対応するアミノ酸配列を含有する。また、本発明で使用される部分ペプチドは、上記のポリペプチドにおいて、そのアミノ酸配列中の１または複数個（例えば、１〜２０個程度、より好ましくは１〜１０個程度、さらにより好ましくは１〜５個程度）のアミノ酸残基が欠失、付加、置換、または挿入により変更されているものでもよい。
【００４３】
本発明で用いるＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質は、そのタンパク質を発現している細胞や組織から調製することができる。また、これらのタンパク質は、公知のペプチド合成機によっても合成できるし、原核生物あるいは真核生物から選択される適当な宿主細胞を用いた組換え方法によっても調製することができる。本発明で用いるＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質は、いずれの種由来のものでもよいが、好ましくはヒト由来である。
【００４４】
「実質的に同質の活性」とは、それらの活性が性質的に同等であることを示す。したがって、活性（ＰＯＭＰの場合、例えば、プロテアソームの形成促進活性など。ＰＳＭＡ７の場合、例えば、機能（例えば、プロテアソームの形成およびプロテアソームの活性発現に必須な構成因子としての機能など。）が同等（例えば、約０．０１〜１００倍、好ましくは約０．５〜２０倍、より好ましくは約０．５〜２倍）であることが好ましいが、これらの活性の程度やタンパク質の分子量などの量的要素は異なっていてもよい。これらの活性の測定は、それぞれ、Hirano Y, Hayashi H, Iemura S, Hendil KB, Niwa S, Kishimoto T, Kasahara M, Natsume T, Tanaka K, Murata S. (2006) Mol. Cell. 24, 977-84. : Cooperation of multiple chaperones required for the assembly of mammalian 20S proteasomes. 、Liu, X., Huang, W., Li, C., Li, P., Yuan, J., Li, X., Qiu, X. B., Ma, Q., Cao, C. (2006) Mol. Cell. 22, 317-27.: Interaction between c-Abl and Arg tyrosine kinases and proteasome subunit PSMA7 regulates proteasome degradation.などの文献に記載の公知の方法に準じて行うことができるが、例えば、後に記載するスクリーニング方法に従って測定することができる。
【００４５】
なお、アミノ酸配列や塩基配列の同一性は、カーリンおよびアルチュールによるアルゴリズムＢＬＡＳＴ（ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７２２６４−２２６８，１９９０； ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ ９０： ５８７３， １９９３）を用いて決定できる。ＢＬＡＳＴのアルゴリズムに基づいたＢＬＡＳＴＮやＢＬＡＳＴＸと呼ばれるプログラムが開発されている（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ＳＦ， ｅｔ ａｌ： Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２１５： ４０３，１９９０）。ＢＬＡＳＴＮを用いて塩基配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばｓｃｏｒｅ＝１００、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝１２とする。また、ＢＬＡＳＴＸを用いてアミノ酸配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばｓｃｏｒｅ＝５０、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝３とする。ＢＬＡＳＴとＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを用いる場合は、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。
【００４６】
本明細書中、「がん治療剤」という用語は、抗癌剤、癌転移阻害剤、癌細胞のアポトーシス誘導剤、癌細胞の増殖抑制剤、癌細胞の浸潤抑制剤、がん予防剤等を含む意味で使用される。なお、本願明細書中、用語「癌（または、がん）」と「腫瘍」とは同じ意味を有する用語として使用される。
【００４７】
１．１ プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を含有するがん治療剤
本発明は、１つの実施形態において、プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤を提供する。典型的には、上記プロテアソーム関連遺伝子は、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である。
【００４８】
本明細書中、「プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質」は、プロテアソーム関連遺伝子の発現を阻害するものであれば制限はないが、典型的には、ＰＯＭＰ遺伝子の発現阻害物質またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質である。
【００４９】
本明細書中、「ＰＯＭＰ遺伝子の発現阻害物質」には、ＰＯＭＰ遺伝子の発現を阻害するものであれば制限はないが、例えば、（ｉ）ＰＯＭＰ遺伝子からＰＯＭＰ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質、および（ｉｉ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡからＰＯＭＰタンパク質への翻訳を阻害する物質が含まれる。
【００５０】
ＰＯＭＰ遺伝子からＰＯＭＰ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質の例としては、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはその一部に対するアンチセンス核酸、
（ｂ）ＰＯＭＰ遺伝子またはその一部に対するデコイ核酸、
（ｃ）ＰＯＭＰ遺伝子またはその一部に対してドミナントネガティブに作用するＰＯＭＰ遺伝子変異体、あるいは
（ｄ）その他の転写阻害化合物
などが含まれる。
【００５１】
また、ＰＯＭＰ ｍＲＮＡからＰＯＭＰタンパク質への翻訳を阻害する物質の例としては、
（ｅ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡまたはその一部に対してＲＮＡｉ作用を有するポリヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）、
（ｆ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡまたはその一部に対するアンチセンスポリヌクレオチド、
（ｇ）ＰＯＭＰ ｍＲＮＡまたはその一部に対してリボザイム活性を有するポリヌクレオチド、あるいは
（ｈ）その他の翻訳阻害化合物
などが含まれる。
【００５２】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質」には、ＰＳＭＡ７遺伝子の発現を阻害するものであれば制限はないが、例えば、（ｉ）ＰＳＭＡ７遺伝子からＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質、および（ｉｉ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡからＰＳＭＡ７タンパク質への翻訳を阻害する物質が含まれる。
【００５３】
ＰＳＭＡ７遺伝子からＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡへの転写を阻害する物質の例としては、
（ａ）ＰＳＭＡ７遺伝子またはその一部に対するアンチセンス核酸、
（ｂ）ＰＳＭＡ７遺伝子またはその一部に対するデコイ核酸、
（ｃ）ＰＳＭＡ７遺伝子またはその一部に対してドミナントネガティブに作用するＰＳＭＡ７遺伝子変異体、あるいは
（ｄ）その他の転写阻害化合物
などが含まれる。
【００５４】
また、ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡからＰＳＭＡ７タンパク質への翻訳を阻害する物質の例としては、
（ｅ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡまたはその一部に対してＲＮＡｉ作用を有するポリヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）、
（ｆ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡまたはその一部に対するアンチセンスポリヌクレオチド、
（ｇ）ＰＳＭＡ７ ｍＲＮＡまたはその一部に対してリボザイム活性を有するポリヌクレオチド、あるいは
（ｈ）その他の翻訳阻害化合物
などが含まれる。
【００５５】
本明細書中、「核酸」とはＲＮＡまたはＤＮＡを意味する。ここでいう「核酸」は、プリンおよびピリミジン塩基を含有するのみでなく、修飾されたその他の複素環型塩基をもつようなものを含んでいてもよい。こうした修飾物は、メチル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、あるいはその他の複素環を含むものであって良い。修飾されたヌクレオシドおよび修飾されたヌクレオチドはまた、糖部分が修飾されていて良く、例えば、１個以上の水酸基がハロゲンとか、脂肪族基などで置換されているか、あるいはエーテル、アミンなどの官能基に変換されていてよい。
【００５６】
本発明のがん治療剤においては、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸を有効成分として用いることができる。ＲＮＡｉとは、標的遺伝子配列と同一もしくは類似した配列を有する二重鎖ＲＮＡを細胞内に導入すると、導入した外来遺伝子および標的内在性遺伝子の発現がいずれも阻害される現象のことをいう。ここで用いられるＲＮＡとしては、例えば、１９〜３０塩基長のＲＮＡ干渉を生ずる二重鎖ＲＮＡ、例えば、ｄｓＲＮＡ（ｄｏｕｂｌｅ ｓｔｒａｎｄ ＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ（ｓｍａｌｌ ｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇ ＲＮＡ）又はｓｈＲＮＡ（ｓｈｏｒｔ ｈａｉｒｐｉｎ ＲＮＡ）が挙げられる。このようなＲＮＡは、リポソームなどの送達システムにより所望の部位に局所送達させることも可能であり、また上記二重鎖ＲＮＡが生成されるようなベクターを用いてこれを局所発現させることができる。このような二重鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ、ｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡ）の調製方法、使用方法などは、多くの文献から公知である（特表２００２−５１６０６２号； 米国公開許第２００２／０８６３５６Ａ号； Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ， ２４（２）， Ｆｅｂ．， １８０−１８３； Ｇｅｎｅｓｉｓ， ２６（４）， Ａｐｒｉｌ， ２４０−２４４； Ｎａｔｕｒｅ，Ｓｐｅ．２１，４０７：６８０２，３１９−２０； Ｇｅｎｅｓ ＆ Ｄｅｖ．， Ｖｏｌ．１６，（８）， Ａｐｒ．１６，９４８−９５８； Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．， ９９（８），１６ Ａｐｒ．， ５５１５−５５２０； Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２９６（５５６７）， １９ Ａｐｒ．， ５５０−５５３； Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ， Ａｐｒ．３０，９９：９， ６０４７−６０５２； Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ．２０ （５）， Ｍａｙ，４９７−５００； Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ． ２０（５）， Ｍａｙ，５００−５０８； Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， Ｍａｙ １５など）。
【００５７】
本発明で用いられるＲＮＡｉ効果を奏する二重鎖ＲＮＡの長さは、通常、１９〜３０塩基、好ましくは２０〜２７塩基、より好ましくは２１〜２５塩基、最も好ましくは２１〜２３塩基である。本発明においては、具体的には、下記ｓｉＲＮＡ（実施例４、５で使用）を用いることができる。
【表１】
【表２】
【００５８】
本明細書中、「アンチセンス核酸」、または「アンチセンスポリヌクレオチド」とは、ある対象となるＤＮＡ領域の少なくとも一部に相補的なポリヌクレオチドを有し、そのポリヌクレオチドが当該領域の少なくとも一部とハイブリダイズすることができる核酸のことをいう。本発明のアンチセンス核酸またはアンチセンスポリヌクレオチドは、ＲＮＡ、ＤＮＡ、あるいは修飾された核酸（ＲＮＡ、ＤＮＡ）である。それらは二本鎖ＤＮＡ、一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、さらにＤＮＡ：ＲＮＡハイブリッドであってもよい。修飾された核酸の具体例としては、核酸の硫黄誘導体やチオホスフェート誘導体、さらにはポリヌクレオチドアミドやオリゴヌクレオチドアミドの分解に抵抗性を有するものなどが挙げられるが、それらに限定されるものではない。
【００５９】
使用されるアンチセンス核酸は、適当なプロモーターの下流に連結され、好ましくは３’側に転写終結シグナルを含む配列が連結される。このようにして調製された核酸は、公知の方法を用いることで、所望の動物へ形質転換できる。アンチセンス核酸の配列は、形質転換される動物が持つ内在性遺伝子またはその一部と相補的な配列であることが好ましいが、遺伝子の発現を有効に抑制できる限りにおいて、完全に相補的でなくてもよい。
【００６０】
例えば、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子のｍＲＮＡの５’端近傍の非翻訳領域に相補的なアンチセンス配列を設計すれば、遺伝子の翻訳阻害に効果的である。コード領域もしくは３’側の非翻訳領域に相補的な配列も使用することができる。遺伝子の翻訳阻害に効果的なアンチセンス核酸は、標的遺伝子の転写産物に対して約７０％以上、好ましくは約８０％以上、より好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の相補性を有する。
【００６１】
アンチセンス核酸を用いて標的遺伝子の発現を効果的に抑制するには、アンチセンス核酸の長さは少なくとも約１０塩基以上（例えば、１０〜４０個程度）、好ましくは約１５塩基以上であり、より好ましくは約１００塩基以上であり、さらに好ましくは約５００塩基以上である。アンチセンス核酸は公知の文献を参照して設計することができる（例えば、平島および井上、新生化学実験講座２ 核酸ＩＶ遺伝子の複製と発現、日本生化学会編、東京化学同人、１９９３、ｐ．３１９−３４７）、Ｊ．Ｋａｗａｋａｍｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｈａｒｍ Ｔｅｃｈ Ｊａｐａｎ． Ｖｏｌ．８，ｐ．２４７，１９９２；Ｖｏｌ．８，ｐ．３９５，１９９２；Ｓ．Ｔ． Ｃｒｏｏｋｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ， １９９３など参照）。
【００６２】
また、本発明のがん治療剤においては、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸を有効成分として用いることができる。ここでいう「リボザイム活性」とは、ターゲットとする遺伝子の転写産物であるｍＲＮＡを部位特異的に切断する核酸のことをいう。リボザイムには、グループＩイントロン型やＲＮａｓｅＰに含まれるＭ１ ＲＮＡのように４００ヌクレオチド以上の大きさのものもあるが、ハンマーヘッド型やヘアピン型と呼ばれる４０ヌクレオチド程度の活性ドメインを有するものもある（タンパク質核酸酵素、１９９０、３５、ｐ．２１９１）。ハンマーヘッド型リボザイムについては、例えば、ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ，１９８８，２２８，ｐ．２２８；ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ，１９８８，２３９，ｐ．２８５；タンパク質核酸酵素，１９９０，３５，ｐ．２１９１；Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ，１９８９，１７，ｐ．７０５９などを参照することができる。また、ヘアピン型リボザイムについては、例えば、Ｎａｔｕｒｅ，１９８６，３２３，ｐ．３４９；Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ，１９９１，１９，ｐ．６７５１；菊池洋，化学と生物，１９９２，３０，ｐ．１１２などを参照することができる。このようなリボザイムを用いて本発明におけるＰＯＭＰおよび／またはＰＳＭＡ７遺伝子遺伝子の転写産物を特異的に切断することで、該遺伝子の発現を阻害することができる。
【００６３】
さらに、本発明は、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写活性を阻害する核酸以外の化合物を有効成分として用いることができる。そのような化合物は、例えば、ＰＯＭＰ遺伝子および／またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現・転写に関与する因子に結合する化合物である。このような化合物は、天然物でも合成化合物でもよい。このような化合物は、後述のスクリーニング方法によって、取得することが可能である。
【００６４】
１．２ プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を含有するがん治療剤
本発明はまた、別の実施形態において、プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を含有するがん治療剤を提供する。典型的には、上記プロテアソーム関連タンパク質は、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である。
【００６５】
本明細書中、「プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質」は、プロテアソーム関連タンパク質の活性を阻害するものであれば制限はないが、例えば、ＰＯＭＰタンパク質の活性阻害物質、ＰＳＭＡ７タンパク質の活性阻害物質が含まれる。
【００６６】
本明細書中、「ＰＯＭＰタンパク質の活性阻害物質」には、例えば、
【００６７】
（ａ）ＰＯＭＰタンパク質に結合する抗体、
【００６８】
（ｂ）ＰＯＭＰタンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＯＭＰタンパク質変異体、あるいは
【００６９】
（ｃ）ＰＯＭＰタンパク質に結合する化合物（上記抗体および変異体を除く）
などが含まれる。
【００７０】
本明細書中、「ＰＳＭＡ７タンパク質の活性阻害物質」には、例えば、
【００７１】
（ａ）ＰＳＭＡ７タンパク質に結合する抗体、
【００７２】
（ｂ）ＰＳＭＡ７タンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＳＭＡ７タンパク質変異体、あるいは
【００７３】
（ｃ）ＰＳＭＡ７タンパク質に結合する化合物（上記抗体および変異体を除く）
などが含まれる。
【００７４】
本明細書における「抗体」とはタンパク質の全長又は断片に反応する抗体を意味する。本発明の抗体の形態には、特に制限はなく、本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）に結合する限り、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体のほかに、ヒト抗体、遺伝子組み換えによるヒト型化抗体、さらにその抗体断片や抗体修飾物も含まれる。プロテアソーム関連タンパク質に結合する抗体（例：ＰＯＭＰタンパク質に結合する抗体（抗ＰＯＭＰ抗体）、ＰＳＭＡ７タンパク質に結合する抗体（抗ＰＳＭＡ７抗体））は、当業者に公知の方法により調製することが可能である。なお、抗ＰＯＭＰ抗体または抗ＰＳＭＡ７抗体の詳細については後述する。
【００７５】
本明細書における「ＰＯＭＰタンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＯＭＰタンパク質変異体」または「ＰＳＭＡ７タンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有するＰＳＭＡ７タンパク質変異体」とは、それぞれ、それをコードする遺伝子を発現させることによって、内在性の野生型ＰＯＭＰタンパク質または内在性の野生型ＰＳＭＡ７タンパク質の活性を消失または低下させる機能を有するタンパク質を指す（土田邦博著、遺伝子の活性阻害実験法 多比良和誠編、羊土社（２００１） ２６−３２など参照）。
【００７６】
さらに、本発明においては、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の活性を阻害し得る物質として、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質にそれぞれ結合する、上記抗体または変異体以外の化合物を有効成分として用いることができる。そのような化合物は、例えば、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に結合し、その活性を阻害する化合物である。このような化合物は、天然物でも合成化合物でもよい。このような化合物は、後述のスクリーニング方法によって、取得することが可能である。
【００７７】
上記した本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）の活性を阻害し得る物質は、がん（特に、大腸がん）の治療剤として使用することができる。
【００７８】
２．プロテアソーム関連遺伝子の発現またはプロテアソーム関連タンパク質の活性を阻害する物質のスクリーニング方法
【００７９】
本発明は、がん抑制作用を有する候補化合物のスクリーニング方法をも提供する。
【００８０】
一つの態様としては、プロテアソーム関連タンパク質と被検化合物との結合を指標とする方法がある。典型的には、上記プロテアソーム関連タンパク質は、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である。
【００８１】
通常、プロテアソーム関連タンパク質と結合する化合物は、プロテアソーム関連タンパク質の活性を阻害する効果を有することが期待される。ここで、該化合物は、プロテアソーム関連タンパク質の活性部位に結合することが好ましい。例えば、本方法においては、まず、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物とを接触させる。ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質は、被検化合物との結合を検出するための指標に応じて、例えば、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の精製された形態、細胞内または細胞外に発現した形態、あるいはアフィニティーカラムに結合した形態であり得る。この方法に用いる被検化合物は必要に応じて適宜標識して用いることができる。標識としては、例えば、放射標識、蛍光標識等を挙げることができる。
【００８２】
次いで、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物との結合を検出する。
【００８３】
本方法に用いる被検化合物としては、特に制限はない。例えば、天然化合物、有機化合物、無機化合物、タンパク質、ペプチドなどの単一化合物、並びに、化合物ライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物等が挙げられるが、これらに限定されない。
【００８４】
プロテアソーム関連タンパク質と被検化合物との結合は、例えば、プロテアソーム関連タンパク質に結合した被検化合物に付された標識によって検出することができる。また、細胞内または細胞外に発現しているプロテアソーム関連タンパク質への被検化合物の結合により生じるプロテアソーム関連タンパク質の活性の変化を指標として検出することもできる。タンパク質と被検化合物との結合活性は、公知の手法によって測定することができる（例えば、プロテアソーム形成促進活性の測定（Hirano Y, Hayashi H, Iemura S, Hendil KB, Niwa S, Kishimoto T, Kasahara M, Natsume T, Tanaka K, Murata S. (2006) Mol. Cell. 24, 977-84. : Cooperation of multiple chaperones required for the assembly of mammalian 20S proteasomes. ）。
【００８５】
本方法においては、次いで、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質）と結合し、その活性を阻害する被検化合物を選択する。
【００８６】
本方法により単離される化合物は、がん抑制作用を有することが期待され、がん治療剤として有用である。
【００８７】
本発明のスクリーニング方法の他の態様は、プロテアソーム関連遺伝子の発現を指標とする方法である。典型的には、上記プロテアソーム関連遺伝子は、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である。
【００８８】
本方法においては、まず、プロテアソーム関連遺伝子（例えば、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞に、被検化合物を接触させる。用いられる「細胞」の由来としては、ヒト、マウス、ネコ、イヌ、ウシ、ヒツジ、トリなど、ペット、家畜等に由来する細胞が挙げられるが、これら由来に制限されない。「プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞」としては、内因性のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現している細胞、または外因性のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）が導入され、該遺伝子が発現している細胞を利用することができる。外因性のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）が発現した細胞は、通常、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）が挿入された発現ベクターを宿主細胞へ導入することにより作製することができる。該発現ベクターは、一般的な遺伝子工学技術によって作製することができる。
【００８９】
本方法に用いる被検化合物としては、特に制限はないが、例えば、天然化合物、有機化合物、無機化合物、タンパク質、ペプチドなどの単一化合物、並びに、化合物ライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物等が用いられる。
【００９０】
プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞への被検化合物の「接触」は、通常、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞の培養液に被検化合物を添加することによって行うが、この方法に限定されない。被検化合物がタンパク質等の場合には、該タンパク質を発現するＤＮＡベクターを、該細胞へ導入することにより、「接触」を行うことができる。
【００９１】
本方法においては、次いで、該プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子等）の発現レベルを測定する。ここで「遺伝子の発現」には、転写および翻訳の双方が含まれる。遺伝子の発現レベルの測定は、当業者に公知の方法によって行うことができる。例えば、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞からｍＲＮＡを常法に従って抽出し、このｍＲＮＡを鋳型としたノーザンハイブリダイゼーション法またはＲＴ−ＰＣＲ法を実施することによって該遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。あるいは、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）のプロモーター領域を常法に従って単離し、その下流に標識遺伝子（例えば、ルシフェラーゼ、ＧＦＰ、ガラクトシダーゼ等の発光、蛍光、発色などを指標に検出可能な遺伝子が挙げられるが、これらに限定されない）をつなげ、その標識遺伝子の活性を見ることによっても該遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。また、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）を発現する細胞からタンパク質画分を回収し、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）の発現をＳＤＳ−ＰＡＧＥ等の電気泳動法で検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うこともできる。さらに、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）に対する抗体を用いて、ウエスタンブロッティング法を実施することにより該タンパク質の発現を検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うことも可能である。プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子）の検出に用いる抗体としては、検出可能な抗体であれば、特に制限はないが、例えばモノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体の両方を利用することができる。
【００９２】
本方法においては、次いで、被検化合物を接触させない場合（コントロール）と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する。このようにして選択された化合物は、がん治療剤のための候補化合物となる。
【００９３】
３．プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体及びこの抗体を含有する治療剤、複合体および組成物
【００９４】
本発明はまた、プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体、この抗体を含有するがん治療剤などを提供する。典型的には、上記プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体は、抗ＰＯＭＰ抗体または抗ＰＳＭＡ７抗体である。本発明の１つの好ましい態様では、上記がん治療剤は、がんの標的化療法または標的化薬物送達のために使用される。
【００９５】
３．１ プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体
【００９６】
本明細書中、「プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体」または「抗プロテアソーム関連タンパク質抗体」としては、プロテアソーム関連タンパク質に特異的に結合または認識する抗体であれば制限はないが、典型的には、抗ＰＯＭＰ抗体および抗ＰＭＳＡ７抗体が含まれる。
【００９７】
本明細書中、「抗ＰＯＭＰ抗体」には、ＰＯＭＰタンパク質（その断片（部分ペプチド）もしくはその塩を含む）に特異的に結合する抗体が含まれる。また、「抗ＰＭＳＡ７抗体」には、ＰＳＭＡ７タンパク質（その断片（部分ペプチド）もしくはその塩を含む）に特異的に結合する抗体が含まれる。
【００９８】
本発明において使用する抗ＰＯＭＰ抗体または抗ＰＳＭＡ７抗体は、ポリクローナル抗体であってもよいし、モノクローナル抗体であってもよい。抗体のクラスは、特に限定されず、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、またはＩｇＥ等のいずれのアイソタイプを有する抗体をも包含する。好ましくは、ＩｇＧまたはＩｇＭであり、精製の容易性等を考慮すると、より好ましくはＩｇＧである。また、ここでいう「抗体」という用語は、任意の抗体断片または誘導体を含む意味で用いられ、例えば、Ｆａｂ、Ｆａｂ’2、ＣＤＲ、ヒト化抗体、多機能抗体、単鎖抗体（ＳｃＦｖ）などを含む。本発明の抗体は、公知の方法で製造することができる。このような抗体の製造法は当該分野で周知である（例えばＨａｒｌｏｗ Ｅ． ＆ Ｌａｎｅ Ｄ．， Ａｎｔｉｂｏｄｙ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９８８）を参照）。
【００９９】
（１）抗原の調製
本発明において、感作抗原として使用されるタンパク質は、通常、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）またはその塩である。上記プロテアソーム関連タンパク質には、その部分ペプチドも含まれ、これは、限定されることはないが、例えば、配列番号２または配列番号４のアミノ酸配列の断片であって、例えば、２０個以上、４０個以上、６０個以上、８０個以上、１００個以上の、連続するアミノ酸配列部分を有する部分ペプチドである。これらの断片として、例えば、アミノ（Ｎ）末端断片やカルボキシ（Ｃ）末端断片が用いられる。本発明で用いられる部分ペプチドは、上記アミノ酸配列中の１または２個以上（好ましくは、１〜１０個程度、さらに好ましくは数個（１〜６個））のアミノ酸残基が欠失、置換、挿入及び／又は付加されたものであってもよい。ここで用いられるＰＯＭＰタンパク質もしくはＰＳＭＡ７タンパク質またはその部分ペプチドの塩としては、例えば、無機酸（例えば、塩酸、硫酸）との塩、あるいは有機酸（例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸）との塩などが用いられる。抗体取得の感作抗原として使用される本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）は、その由来となる動物種に制限されないが哺乳動物、例えばマウス、ヒト由来のタンパク質が好ましく、特にヒト由来のタンパク質が好ましい。
【０１００】
（２）プロテアソーム関連タンパク質に対するモノクローナル抗体の作製
（ｉ）抗体産生細胞の採取
上記のようなプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）、その部分ペプチド又はその塩（本明細書中、抗体に関する説明では、これらをまとめて、「プロテアソーム関連タンパク質」（または、それぞれ「ＰＯＭＰタンパク質」、「ＰＳＭＡ７タンパク質」）という。）を抗原として、哺乳動物、例えばラット、マウス、ウサギなどに投与する。抗原の動物１匹当たりの投与量は、アジュバントを用いないときは０．１〜１００ｍｇであり、アジュバントを用いるときは１〜１００μｇである。アジュバントとしては、フロイント完全アジュバント（ＦＣＡ）、フロイント不完全アジュバント（ＦＩＡ）、水酸化アルミニウムアジュバント等が挙げられる。免疫は、主として静脈内、皮下又は腹腔内等に注入することにより行われる。また、免疫の間隔は特に限定されず、数日から数週間間隔、好ましくは２〜５週間間隔で、１〜１０回、好ましくは２〜５回免疫を行う。そして、最終の免疫日から１〜６０日後、好ましくは１〜１４日後に抗体産生細胞を採集する。抗体産生細胞としては、脾臓細胞、リンパ節細胞、末梢血細胞等が挙げられるが、脾臓細胞又は局所リンパ節細胞が好ましい。
【０１０１】
（ｉｉ）細胞融合
ハイブリドーマを得るため、抗体産生細胞とミエローマ細胞との細胞融合を行う。抗体産生細胞と融合させるミエローマ細胞として、マウスなどの動物の一般に入手可能な株化細胞を使用することができる。使用する細胞株としては、薬剤選択性を有し、未融合の状態ではＨＡＴ選択培地（ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジンを含む）で生存できず、抗体産生細胞と融合した状態でのみ生存できる性質を有するものが好ましい。ミエローマ細胞としては、例えば Ｘ６３Ａｇ．８．６５３、ＮＳＩ／１−Ａｇ４−１、ＮＳ０／１などのマウスミエローマ細胞株、ＹＢ ２／０などのラットミエローマ細胞株が挙げられる。
【０１０２】
次に、上記ミエローマ細胞と抗体産生細胞とを細胞融合させる。細胞融合は、血清を含まないＤＭＥＭ、ＲＰＭＩ−１６４０培地などの動物細胞培養用培地中で、１×１０6〜１×１０7個／ｍｌの抗体産生細胞と２×１０5〜２×１０6個／ｍｌのミエローマ細胞とを混合し（抗体産生細胞とミエローマ細胞との細胞比２：１〜３：１が好ましい）、細胞融合促進剤存在のもとで融合反応を行う。細胞融合促進剤として、平均分子量１０００〜６０００ダルトンのポリエチレングリコール等を使用することができる。また、電気刺激（例えばエレクトロポレーション）を利用した市販の細胞融合装置を用いて抗体産生細胞とミエローマ細胞とを融合させることもできる。
【０１０３】
（ｉｉｉ）ハイブリドーマの選別及びクローニング
細胞融合処理後の細胞から目的とするハイブリドーマを選別する。その方法として、細胞懸濁液を例えばウシ胎児血清含有ＲＰＭＩ−１６４０培地などで適当に希釈後、マイクロタイタープレート上に３×１０5個／ｗｅｌｌ程度まき、各ウエルに選択培地を加え、以後適当に選択培地を交換して培養を行う。その結果、選択培地で培養開始後、１４日前後から生育してくる細胞をハイブリドーマとして得ることができる。
【０１０４】
次に、増殖してきたハイブリドーマの培養上清中に、プロテアソーム関連タンパク質に反応する抗体が存在するか否かをスクリーニングする。ハイブリドーマのスクリーニングは、通常の方法に従えばよく、特に限定されるものではない。例えば、ハイブリドーマとして生育したウエルに含まれる培養上清の一部を採集し、酵素免疫測定法、放射性免疫測定法等によってスクリーニングすることができる。融合細胞のクローニングは、限界希釈法等により行う。そして、最終的に、プロテアソーム関連タンパク質と反応するモノクローナル抗体を産生する細胞であるハイブリドーマを樹立する。
【０１０５】
（ｉｖ）モノクローナル抗体の採取
上記のようにして得たハイブリドーマからモノクローナル抗体を採取する方法として、通常の細胞培養法又は腹水形成法等を採用することができる。細胞培養法においては、ハイブリドーマを１０％ウシ胎児血清含有ＲＰＭＩ−１６４０培地、ＭＥＭ培地又は無血清培地等の動物細胞培養培地中で、通常の培養条件（例えば３７℃、５％ ＣＯ2濃度）で７〜１４日間培養し、その培養上清から抗体を取得する。腹水形成法の場合は、ミエローマ細胞由来の哺乳動物と同種系動物の腹腔内にハイブリドーマを約１×１０7個投与し、ハイブリドーマを大量に増殖させる。そして、１〜２週間後に腹水を採取する。上記抗体の採取方法において抗体の精製が必要とされる場合は、硫安塩析法、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過、アフィニティークロマトグラフィーなどの公知の方法を適宜選択して、又はこれらを組み合わせることにより精製することができる。
【０１０６】
（３）プロテアソーム関連タンパク質に対するポリクローナル抗体の作製
まず、上記した抗原を哺乳動物、例えばラット、マウス、ウサギなどに投与する。抗原の動物１匹当たりの投与量は、アジュバントを用いないときは０．１〜１００ｍｇであり、アジュバントを用いるときは１０〜１０００μｇである。アジュバントとしては、フロイント完全アジュバント（ＦＣＡ）、フロイント不完全アジュバント（ＦＩＡ）、水酸化アルミニウムアジュバント等が挙げられる。免疫は、主として静脈内、皮下又は腹腔内等に注入することにより行われる。また、免疫の間隔は特に限定されず、数日から数週間間隔、好ましくは２〜５週間間隔で、１〜１０回、好ましくは２〜５回免疫を行う。そして、最終の免疫日から６〜６０日後に、酵素免疫測定法（ＥＬＩＳＡ（ｅｎｚｕｍｅ−ｌｉｎｋｅｄ ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ ａｓｓｙ）又は ＥＩＡ（ｅｎｚｙｍｅ ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ））、放射性免疫測定法（ＲＩＡ；ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏ ａｓｓａｙ）等で抗体価を測定し、最大の抗体価を示した日に採血し、抗血清を得る。
【０１０７】
次いで、例えば、抗血清中のポリクローナル抗体を、プロテアソーム関連タンパク質で固定されたアフィニティーカラムにかけてプロテアソーム関連タンパク質と反応する抗体（カラム吸着画分）を採取する。プロテアソーム関連タンパク質に対する抗血清中のポリクローナル抗体の反応性は、ＥＬＩＳＡ法などで測定することができる。
【０１０８】
（４）抗体の断片など
ＦａｂまたはＦａｂ’2断片は、従来の方法によるプロテアーゼ（例えば、ペプシンまたはパパイン）を用いた消化により作製することができる。ヒト化抗体は、例えばＲｉｅｃｈｍａｎｎら（Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． Ｏｃｔ ５；２０３（３）：８２５−８，１９８８）、およびＪｏｎｅｓら（Ｊｏｎｅｓら Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２−５２５，１９８６）に記載のような方法の１つにより調製することができる。
【０１０９】
また、キメラ抗体は、例えば、「実験医学（臨時増刊号）、Ｖｏｌ．１．６，Ｎｏ．１０，１９８８」、特公平３−７３２８０号公報等を、ヒト化抗体は、例えば、「Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．１５，ｐ．１４６−１５６，１９９７」、「Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．７，ｐ．１３−２１，１９９４」、特表平４−５０４３６５号公報、国際出願公開ＷＯ９４・２５５８５号公報等、「日経サイエンス、６月号、第４０〜第５０頁、１９９５年」、「Ｎａｔｕｒｅ，Ｖｏｌ．３６８，ｐ．８５６−８５９，１９９４」、特表平６−５００２３３号公報等を参考にそれぞれ製造することができる。本発明のプロテアソーム関連タンパク質（例えば、ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）に結合する抗体は、例えば、癌細胞の増殖もしくは転移の抑制等を目的とした使用が考えられる。得られた抗体を人体に投与する目的（抗体治療）で使用する場合には、免疫原性を低下させるため、ヒト抗体やヒト型抗体が好ましい。
【０１１０】
抗体は、診断剤として用いる場合は、モニタリング等のための標識物質（例えば、放射性同位元素、蛍光物質など）で標識されていてもよい。必要に応じて、放射性物質、蛍光化合物などにより標識することができる。最も慣用の蛍光標識化合物の中には、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリンおよびフルオレスカミンがある。同様に、生体発光性化合物を用いて、プロテアソーム関連タンパク質（例えば、ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）に対する抗体を標識することもできる。生体発光性タンパク質の存在は、蛍光の存在を検出することによって測定される。この標識目的に重要な生体発光性化合物は、ルシフェリン、ルシフェラーゼおよびイエクオリンである。
【０１１１】
なお、本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在するプロテアソーム関連タンパク質（例えば、ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）を特異的に検出するために使用することができる。また、プロテアソーム関連タンパク質を精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中のプロテアソーム関連タンパク質の検出、被検細胞内におけるプロテアソーム関連タンパク質の挙動の分析などのために使用することができる。
【０１１２】
３．２ プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を含有する複合体など
また、本発明において使用する抗プロテアソーム関連タンパク質抗体（例：抗ＰＯＭＰ抗体、抗ＰＳＭＡ７抗体）は、本発明の治療剤または診断剤において、それ自体が、抗原の活性を減弱させるような中和活性を有する薬剤（ａｇｅｎｔ）であり得るが、必要に応じて、治療効果を奏するための他の薬剤と組み合わせて用いることができる。したがって、本発明は、もう一つの態様において、がん（例えば、大腸がん）の標的化療法または標的化イメージング等に使用するための、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と他の薬剤との複合体、そのような複合体を含有する組成物などをも提供する。このような態様によれば、本発明において使用する抗プロテアソーム関連タンパク質抗体を用いて、治療効果を奏する他の薬剤または診断のための標識剤などを、プロテアソーム関連タンパク質を高発現する標的部位へ送達することができる。
【０１１３】
本発明において用いられる「その他の薬剤」としては、例えば、放射性同位元素、治療タンパク質、または低分子の薬剤など、標的への遺伝子導入のためのウイルスベクターもしくは非ウイルスベクターなどが例示される。
【０１１４】
本発明において、「放射性同位元素」の例としては、フッ素−１８、ヨウ素−１２５（125Ｉ）、およびヨウ素−１３１などの放射性ハロゲン元素が挙げられる。これらの放射性ハロゲン元素も上述の放射性金属元素と同様に抗体やペプチドに標識して、放射性治治療剤あるいは放射性診断剤として広く利用し得る。例えば、125Ｉまたは131Ｉでのヨード化は、クロラミンＴ法等の公知の方法により、抗体または抗体断片に結合させることができる。さらに、診断用としてはテクネチウム−９９ｍ、インジウム−１１１およびガリウム−６７（67Ｇａ）など、また治療用としてはイットリウム−９０（90Ｙ）、レニウム−１８６（186Ｒｅ）またはレニウム−１８８（188Ｒｅ）などが使用され得る。放射性同位元素を用いて抗体に標識する場合には、通常、金属キレート剤が用いられる。金属キレート剤としては、ＥＤＴＡ、ＤＴＰＡ、ジアミノジチオ化合物、サイクラム、およびＤＯＴＡなどが知られている。これらのキレート剤は抗体に予め結合しておき、その後放射性金属で標識する場合と、放射性金属キレートを形成後、抗体に結合して標識する方法がある。
【０１１５】
本発明において、「治療タンパク質」の例としては、免疫を担う細胞を活性化するサイトカインが好適であり、例えば、ヒトインターロイキン２、ヒト顆粒球−マクロファージ−コロニー刺激因子、ヒトマクロファージコロニー刺激因子、ヒトインターロイキン１２等が挙げられる。また、大腸がん細胞を直接殺傷するため、リシンやジフテリア毒素などの毒素を用いることができる。例えば、治療タンパク質との融合抗体については、抗体または抗体断片をコードするｃＤＮＡに治療タンパク質をコードするｃＤＮＡを連結させ、融合抗体をコードするＤＮＡを構築し、このＤＮＡを原核生物または真核生物用の発現ベクターに挿入し、この発現ベクターを原核生物または真核生物へ導入することにより発現させ、融合抗体を製造することができる。
【０１１６】
「低分子の薬剤」は、本明細書中で「放射性同位元素」や「治療タンパク質」等以外の診断または治療用化合物を意味するものとして用いられる。「低分子の薬剤」の例としては、ナイトロジェン・マスタード、サイクロファスファミドなどのアルキル化剤、５−フルオロウラシル、メソトレキセートなどの代謝拮抗剤、ダウノマイシン、ブレオマイシン、マイトマイシンＣ，ダウノルビシン、ドキソルビシンなどの抗生物質、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシンのような植物アルカロイド、タモキシフェン、デキサメタソンなどのホルモン剤等の抗癌剤（臨床腫瘍学（日本臨床腫瘍研究会編 １９９６年 癌と化学療法社））、またはハイドロコーチゾン、プレドニゾンなどのステロイド剤、アスピリン、インドメタシンなどの非ステロイド剤、金チオマレート、ペニシラミンなどの免疫調節剤、サイクロフォスファミド、アザチオプリンなどの免疫抑制剤、マレイン酸クロルフェニラミン、クレマシチンのような抗ヒスタミン剤等の抗炎症剤（炎症と抗炎症療法 昭和５７年 医歯薬出版株式会社）などがあげられる。例えば、ダウノマイシンと抗体を結合させる方法としては、グルタールアルデヒドを介してダウノマイシンと抗体のアミノ基間を結合させる方法、水溶性カルボジイミドを介してダウノマイシンのアミノ基と抗体のカルボキシル基を結合させる方法等があげられる。
【０１１７】
「ウイルスベクター」の例としては、本発明の抗プロテアソーム関連タンパク質抗体に結合し得るように改変されたウイルスベクターが使用し得る（例えば、アデノウイルスベクター（Ｗａｎｇ， Ｐ．， ｅｔ ａｌ．（１９９５） Ｓｏｍａｔｉｃ Ｃｅｌｌ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃ． Ｇｅｎｅｔ． ２１， ４２９−４４１）、レトロウイルスベクター（Ｎａｖｉａｕｘ Ｒ．Ｋ．， ｅｔ ａｌ．（１９９６） Ｊ． Ｖｉｒｏｌ ７０， ５７０１−５７０５）、レンチウイルスベクター（Ｎａｌｄｉｎｉ， Ｌ． （１９９８） Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ． Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． ９， ４５７−４６３）などが挙げられる）。このようなウイルスベクターには、細胞増殖関連遺伝子、アポトーシス関連遺伝子、免疫制御遺伝子等の、標的部位（例えば、大腸がん）において、例えば、癌細胞のアポトーシスを誘導するなどの治療効果を奏する遺伝子（治療遺伝子）が組み込まれる。抗プロテアソーム関連タンパク質抗体に結合するウイルスベクターは、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と共に遺伝子治療を必要とする患者に投与された場合、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体が認識する抗原（すなわち、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質））が存在する部位に標的化することができる。
【０１１８】
抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と上記他の薬剤とは、化学的または遺伝子工学的に結合され得る。ここで、「化学的な結合」には、イオン結合、水素結合、共有結合、分子間力による結合、疎水性相互作用による結合などが含まれるものとし、「遺伝子工学的な結合」には、例えば、抗体と治療タンパク質とからなる融合タンパク質を遺伝子組換えなどの技術を用いて作製した場合の、抗体と治療タンパク質との間の結合様式などが含まれるものとする。
【０１１９】
４．製剤化および製剤の投与方法
本発明のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子等）の発現阻害物質を含有するがん治療剤、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）の活性阻害物質を含有するがん治療剤、本発明の抗プロテアソーム関連タンパク質抗体を含有する治療剤、または本発明において使用する抗プロテアソーム関連タンパク質抗体が、放射性同位元素、治療タンパク質、低分子の薬剤、および治療遺伝子を担持したウイルスベクターもしくは非ウイルスベクターのうちのいずれか、またはこれらの任意の組み合わせと化学的または遺伝子工学的に結合されている治療剤は、公知の手法に基づいて製剤化することができる。
【０１２０】
本発明の治療剤の製剤化にあたっては、常法に従い、必要に応じて薬学的に許容される担体を添加することができる。例えば、界面活性剤、賦形剤、着色料、着香料、保存料、安定剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、流動性促進剤、矯味剤等が挙げられるが、これらに制限されず、その他常用の担体を適宜使用することができる。具体的には、軽質無水ケイ酸、乳糖、結晶セルロース、マンニトール、デンプン、カルメロースカルシウム、カルメロースナトリウム、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリビニルアセタールジエチルアミノアセテート、ポリビニルピロリドン、ゼラチン、中鎖脂肪酸トリグリセライド、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油６０、白糖、カルボキシメチルセルロース、コーンスターチ、無機塩類等を挙げることができる。
【０１２１】
本発明の治療剤の剤型の種類としては、例えば、経口剤として錠剤、粉末剤、丸剤、散剤、顆粒剤、細粒剤、軟・硬カプセル剤、フィルムコーティング剤、ペレット剤、舌下剤、ペースト剤等、非経口剤として注射剤、坐剤、経皮剤、軟膏剤、硬膏剤、外用液剤等が挙げられ、当業者においては投与経路や投与対象等に応じた最適の剤型を選ぶことができる。有効成分としてのプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡタンパク質等）の活性の阻害物質またはプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子等）の発現の阻害物質は、製剤中０．１から９９．９重量％含有することができる。
【０１２２】
本発明の薬剤の有効成分の投与量は、投与対象、対象臓器、症状、投与方法などにより差はあるが、経口投与の場合、一般的に例えば、患者（６０ｋｇとして）に対して一日につき約０．１ｍｇ〜１，０００ｍｇ、好ましくは約１．０〜１００ｍｇ、より好ましくは約１．０〜５０ｍｇである。非経口的に投与する場合は、その一回投与量は投与対象、対象臓器、症状、投与方法などによっても異なるが、例えば、注射剤の形では通常例えば、患者（６０ｋｇに対して）、一日につき約０．０１から３０ｍｇ程度、好ましくは約０．１から２０ｍｇ程度、より好ましくは約０．１〜１０ｍｇ程度を静脈注射により投与するのが好都合である。しかしながら、最終的には、剤型の種類、投与方法、患者の年齢や体重、患者の症状等を考慮して、医師または獣医師の判断により適宜決定することができる。
【０１２３】
このようにして得られる製剤は、例えば、ヒトやその他の哺乳動物（例えば、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど）に対して投与することができる。ヒト以外の動物の場合も、上記の６０ｋｇ当たりに換算した量を投与することができる。
【０１２４】
本発明の治療剤は、がん（例えば、大腸がん、胃がん、肺がん、乳がん、前立腺がん、食道がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん（例：子宮頸がん、子宮体がん）、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、卵巣がん、脳腫瘍、血液腫瘍など）の予防・治療、好ましくは、大腸がんの予防・治療に用いられる。
【０１２５】
本発明の薬剤は、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）の活性阻害物質またはプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の発現阻害物質を有効成分として含有しているため、抗癌剤、癌転移阻害剤、癌細胞のアポトーシス誘導剤等として使用し得る。対象となる細胞、組織、臓器、または癌の種類は特定のものに限定されない。また、本発明の薬剤は、プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質およびプロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質の両方を含んでいても良い。
【０１２６】
本発明の治療剤において、アンチセンス核酸を用いる場合、該アンチセンス核酸を単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、公知の手段に従って投与することができる。アンチセンス核酸は、単独で、あるいは生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与することができる。
【０１２７】
また、本発明において組換えアデノウイルス粒子のようなウイルスベクターと本発明のプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体との組み合わせを癌治療のために使用する場合は、これら単独で使用してもよいが、一般には製薬的に許容できる担体と共に使用される。そのような担体としては、既に上記したような担体、ならびに水、生理食塩水、グルコース、ヒトアルブミン等の水性等張溶液が好ましい。更に、製薬的に通常使用される添加剤、保存剤、防腐剤、衡量等を添加することもできる。そのように調製した医薬組成物は、治療すべき疾病に依存して適切な投与形態、投与経路によって投与することができる。投与形態としては、例えば、乳剤、シロップ剤、カプセル、錠剤、顆粒剤、注射剤、軟膏等が挙げられる。本発明の抗プロテアソーム関連タンパク質抗体−ウイルスベクター粒子またはこれを含む医薬組成物を治療のために投与する場合は、通常成人一人当たり１回に１０3〜１０15個のウイルス粒子を投与するのが好ましいが、疾病の状態や標的細胞・組織の性質によって変更してよい。投与回数は、１日１回〜数回でよく、投与期間は１日〜数ヶ月以上にわたってもよく、１〜数回の投入を１セットとして、長期にわたって断続的に多数セットを投与してもよい。また、本発明において使用されるウイルスベクター粒子またはウイルスベクター核酸分子は、特定の細胞および／または組織の検出、または疾病状態の診断に使用することができる。例えば、ウイルスベクターの核酸分子に検出可能なマーカー遺伝子を組込み、これを適切な宿主細胞にトランスフェクションして得られたウイルスベクター粒子は、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体と組み合わせて腫瘍細胞を検出診断するために使用することができる。あるいは、抗プロテアソーム関連タンパク質抗体に検出可能な標識を結合させて腫瘍細胞を検出診断するために使用することができる。
【０１２８】
５．がんの診断剤及び診断方法
本発明はまた、がんの診断剤を提供する。１つの好ましい態様において、本発明のがんの診断剤は、（ａ）プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体、又は（ｂ）プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有する。
【０１２９】
５．１ プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を用いる診断剤及び診断方法
プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体（例：抗ＰＯＭＰ抗体、抗ＰＳＭＡ７抗体等）は、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）を特異的に認識することができるので、被検液中のプロテアソーム関連タンパク質を定量することができる。具体的には、本発明のプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を用いる診断方法は、例えば、（ａ）被験者由来の生体試料と、プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体とを接触させる工程、および（ｂ）前記試料中での前記抗体と、プロテアソーム関連タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩との結合を検出および／または定量する工程を包含する。好ましくは、上記検出および／または定量する工程において、標識されたプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を用いて、プロテアソーム関連タンパク質またはその断片とプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体との結合が検出および／または定量される。
【０１３０】
本明細書中、「被験者由来の生体試料」は、被験者由来の組織、細胞、または体液（例えば、血液（全血、血漿、血清等を含む）、尿、リンパ液、唾液、汗、精液等）を含む。また、「被験者」は、通常、がん検診を受ける、または受けることが望まれるヒト被験体であり、がんに罹患しているか、または罹患していると疑われるヒト被験体等が含まれる。このようながんの例としては、大腸がん、胃がん、肺がん、乳がん、前立腺がん、食道がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん（例：子宮頸がん、子宮体がん）、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、卵巣がん、脳腫瘍、血液腫瘍などが含まれるが、とりわけ、大腸がんが好ましい。
【０１３１】
被験者由来の生体試料におけるプロテアソーム関連遺伝子の発現を検出するための免疫測定は、がん（例えば、大腸がん）を有すると疑われるか、がんの危険性を有する被験体から採取した生体試料を、特異的抗原−抗体結合を生じさせる条件下でプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体と接触させ、次いで、抗体による免疫特異的結合量を測定することを包含する。このような抗体の結合を使用して、プロテアソーム関連タンパク質の存在および／または増大した発現が検出される。この場合、増大したプロテアソーム関連タンパク質の発現の検出が疾病状態の指標となる。必要に応じて、生体試料中のプロテアソーム関連タンパク質のレベルを、がんを有しない健常者のレベルと比較してもよい。
【０１３２】
上記免疫測定法の１つの態様では、例えば、血清試料などの生体試料を、試料中に存在する全部のタンパク質を固定する目的で、ニトロセルロースなどの固相支持体または担体と接触させる。次いで、この支持体を緩衝液で洗浄し、続いて検出可能に標識したプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体により処理する。次いで、この固相支持体を緩衝液で２回洗浄し、未結合抗体を除去する。固相支持体上の結合した抗体の量を、周知の方法に従って測定する。各測定に適する検出条件は、慣用的な試験方法を使用して当業者により適宜決定され得る。
【０１３３】
プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体を検出可能に標識する方法の１つにおいて、当該抗体を、酵素、例えば、酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）に使用されるもののような酵素に結合させる［Ｖｏｉｌｅｒ，Ａ．による「酵素標識した免疫吸着アッセイ」（“Ｔｈｅ Ｅｎｚｙｍｅ Ｌｉｎｋｅｄ Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔ Ａｓｓａｙ）（ＥＬＩＳＡ），１９７８，Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ Ｈｏｒｉｚｏｎｓ，２：１〜７，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ Ｑｕａｒｔｅｒｌｙ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ．ＭＤ； Ｖｏｉｌｅｒ，Ａ．によるＪ．Ｃｌｉｎ．Ｐａｔｈｏｌ．，３１：５０７〜５２０，１９７８：Ｂｕｔｉｅｒ，Ｊ．Ｅ．によるＭｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．，７３：４８２〜５２３，１９８１］。抗体に結合する酵素を、例えば分光光度測定により、可視手段による蛍光測定により検出することができる化学分子が生成されるような方法で、適当な基質、好ましくは色素原性基質と反応させる。抗体に検出可能な標識を付けるために使用することができる酵素は、ペルオキシダーゼおよびアルカリ性ホスファターゼを包含するが、これらに限定されない。この検出はまた、酵素に対する色素原性基質を用いる比色法により達成することができる。
【０１３４】
その他の本発明において使用し得る方法としては、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、サンドイッチ免疫測定法、イムノメトリック法、ネフロメトリー、蛍光免疫測定法（ＦＩＡ）、時間分解蛍光免疫測定法（ＴＲＦＩＡ）、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、発光免疫測定法（ＬＩＡ）、電気化学発光免疫測定法（ＥＣＬＩＡ）、ラテックス凝集法、免疫沈降アッセイ、沈降素反応法、ゲル拡散沈降素反応法、免疫拡散検定法、凝集素検定法、補体結合検定法、免疫放射分析検定法、蛍光免疫検定法、およびプロテインＡ免疫検定法からなる群から選択される免疫測定法などが挙げられる（ＷＯ００／１４２２７号公報第３９頁第２５行〜第４２頁第８行、ＥＰ１１１１０４７Ａ２号公報段落［０１１５］第１９頁第３５行〜第２０頁第４７行など参照）。
【０１３５】
以上のように、本発明の抗体を用いる、生体内でのプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質等）の定量法を利用することにより、プロテアソーム関連タンパク質の機能不全に関連する各種疾患の診断をすることができる。例えば、ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質の濃度増加が検出された場合は、例えば、ＰＯＭＰまたはＰＳＭＡ７の過剰発現に起因する疾患（例えば、がん（例：大腸がん））である可能性が高いまたは将来罹患する可能性が高いと診断することができる。
【０１３６】
なお、本発明のプロテアソーム関連タンパク質に対する抗体は、ｉｎ ｖｉｖｏでの診断に用いることもできる。ここで使用し得る抗体調製物の調製および使用方法は当該分野でよく知られている。例えば、抗体−キレート剤について、Ｎｕｃｌ． Ｍｅｄ． Ｂｉｏｌ． １９９０ １７：２４７−２５４に記載されている。また、磁気共鳴イメージングで用いる標識としての常磁性イオンを有する抗体については、例えば、Ｍａｇｎｅｔｉｃ Ｒｅｓｏｎａｎｃｅ ｉｎ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ １９９１ ２２：３３９−３４２に記載されている。
【０１３７】
５．２ ポリヌクレオチド（例えば、ＤＮＡ）プローブを用いる診断剤及び診断方法
本発明の診断方法においては、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の塩基配列に基づいて設計されるプローブ又はプライマーを用いることができる。具体的には、そのような診断方法は、例えば、（ａ）被験者由来の生体試料と、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチド（プローブ）とを接触させる工程、および（ｂ）前記試料中での前記ポリヌクレオチドと、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片とのハイブリダイゼーションを検出および／または定量する工程を包含する。
【０１３８】
上記本発明の方法では、被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）のＤＮＡ（またはその遺伝子断片）を、上記プローブを使用して検出および／または定量する。プローブとして用いる塩基配列の長さは、例えば、１２塩基以上、１５塩基以上、１８塩基以上、２１塩基以上、２４塩基以上、２７塩基以上、３０塩基以上、またはさらに長い長さのポリヌクレオチド断片であり得る。ハイブリダイゼーションには、上記した低、中又は高ストリンジェントな条件を使用し得る。なお、本明細書中、「プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列」には、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片の塩基配列に相補的な塩基配列（アンチセンスポリヌクレオチド）も含まれるものとする。プローブおよび核酸のハイブリダイゼーションの方法は当業者に知られており、例えば国際公開公報第８９／０６６９８号、ＥＰ−Ａ０２００３６２、米国特許第２，９１５，０８２号、ＥＰ−Ａ００６３８７９、ＥＰ−Ａ０１７３２５１、ＥＰ−Ａ０１２８０１８に記載されている。
【０１３９】
本発明の診断方法においては、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）に対する特異的ポリヌクレオチドプローブまたはプライマーを用いて、公知の手法を用いて標的配列を検出または定量することができる。そのような公知の手法として、例えば、サザンハイブリダイゼーション、ノーザンハイブリダイゼーション、ＲＴ−ＰＣＲ法、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法（Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，第５巻，８７４〜８７９頁（１９８９年））、Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａ，第８６巻，２７６６〜２７７０頁（１９８９年））、ＦＩＳＨ法、ＤＮＡチップあるいはアレイＣＧＨ（Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）法などを用いることができる。定量的な検出は、定量ＲＴ−ＰＣＲによって実施可能である。
【０１４０】
アレイＣＧＨ法は、染色体ＣＧＨ法（Ｋａｌｌｉｏｎｉｅｍｉ， Ａ． ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５８， ８１８−８２１）を応用した方法で、スライド上に染色体領域をカバーするゲノムＤＮＡ断片（ＢＡＣ，ＰＡＣ，ＹＡＣなど）を高密度にスポットしたＤＮＡチップを用いて、別々の色素で標識したがん由来ＤＮＡと正常ＤＮＡを、スライド上のゲノムＤＮＡ断片に対して同時にハイブリダイゼーションを行い、その結合状態を検出することにより、がんにおけるＤＮＡコピー数異常を高解像度に検出する方法である（Ｐｉｎｋｅｌ，Ｄ． ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．２０， ２０７−２１１）。
【０１４１】
なお、本発明においては、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の発現が上方制御されるか否かを検出するために、細胞のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）のｍＲＮＡレベルを標準遺伝子（ハウスキーピング遺伝子（例えば、Ｓｈａｐｅｒ， Ｎ．Ｌ．ら、Ｊ． Ｍａｍｍａｒｙ Ｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌ． Ｎｅｏｐｌａｓｉａ ３（１９９８）３１５−３２４；Ｗｕ， Ｙ．Ｙ．およびＲｅｅｓ， Ｊ．Ｌ．、Ａｃｔａ Ｄｅｒｍ． Ｖｅｎｅｒｅｏｌ． ８０（２０００）２−３）のｍＲＮＡレベルと、好ましくはＲＴ−ＰＣＲによって比較することもできる。
【０１４２】
上記のような手法によって標的配列（ＤＮＡ、ｍＲＮＡなど）を検出・定量し、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）の発現過多が確認された場合は、例えば、ＰＯＭＰまたはＰＳＭＡ７の過剰発現に起因する疾患（例えば、がん（例：大腸がん））である可能性が高い、あるいは将来罹患する可能性が高いと診断することができる。
【０１４３】
５．３ 質量分析装置を用いる診断方法
本発明の診断方法の別の実施形態では、被検試料中の標的タンパク質またはその断片の存在を、質量分析装置（ＭＳ）を用いて同定することができる。すなわち、質量分析装置を用いることによって、標的タンパク質またはその断片のアミノ酸配列の決定を行うことができ、被験者由来の生体試料中にプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）が存在するか否かを判定することができる。質量分析法は、ＭＳを用いてタンパク質やペプチドのような試料をイオン化し、得られた質量／電荷（ｍ／ｚ）に従って分離し、その強度を測定することにより、試料の質量を決定する方法である。その質量分析の結果から、タンパク質やペプチドのアミノ酸配列を構成する個々のアミノ酸を同定することができる。
【０１４４】
イオン化には、マトリクスアシステッドレーザーデソープションイオン化法（ＭＡＬＤＩ）、エレクトロスプレーイオン化法（ＥＳＩ）、気相法（ＥＩ，ＣＩ）、電界脱離（ＦＤ）法など種々の方法が使用され得る。イオン分離には、イオン化法と相性のよいイオン分離法が用いられ、例えば、ＭＡＬＤＩの場合には、飛行時間型（ｔｉｍｅ ｏｆ ｆｌｉｇｈｔ：ＴＯＦ）質量分析計、ＥＳＩの場合には、四重極型（ＱＭＳ）、イオントラップ型、磁場型などの質量分析計がそれぞれ用いられる。質量分析装置は、タンデムで用いられることもある。例えば、ＬＣ−ＥＳＩ ＭＳ／ＭＳ、Ｑ−ＴＯＦ ＭＳ、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ ＭＳ等が挙げられる。なお、その他のアミノ酸配列決定法、例えば、シークエンサー（例：気相シークエンサー）によるアミノ酸配列決定法が利用されてもよい。
【０１４５】
５．４ 診断用キット
本発明はまた、プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体（例：抗ＰＯＭＰ抗体、抗ＰＳＭＡ７抗体）を含有する、被験者の体液試料中のプロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）またはその断片をがんマーカーとして検出および／または定量するためのキットを提供する。さらに、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列を含有する、被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその断片をがんマーカーとして検出および／または定量するためのキットをも提供する。これらのキットは、上述の免疫学的手法またはハイブリダイゼーション法等により、がんマーカーを検出するために用いられる。このようながんとしては、例えば、大腸がん、胃がん、肺がん、乳がん、前立腺がん、食道がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん（例：子宮頸がん、子宮体がん）、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、卵巣がん、脳腫瘍、血液腫瘍などが含まれるが、とりわけ、大腸がんが好ましい。
【０１４６】
本明細書中、「がんマーカー」とは、被験者の体液（例えば、血液、尿、リンパ液、唾液、汗、精液等）または細胞もしくは組織中における、正常組織に由来していないか、あるいはがん細胞または組織において選択的に発現の亢進している分子のことをいい、被験者の体液または細胞もしくは組織中における当該分子の存在ががんの存在を示すかまたは示唆するものをいう。
【０１４７】
上記第一の態様のキットは、被験者からの体液試料中の抗原〔プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）およびその部分ペプチドを含む〕を検出および／または定量する成分を含有する。例えば、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）がＥＬＩＳＡで検出および／または定量される場合、このような成分は、例えば、組織切片、または血液や尿のような体液試料中のプロテオソーム関連遺伝子またはタンパク質のレベルを検出および／または定量するために使用され得る。このような抗体は放射能、蛍光、比色、または酵素標識で標識されていてもよい。本発明のキットは、標識された二次抗体を含有していてもよい。
【０１４８】
上記第二の態様のキットは、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有する。例えば、本発明のキットは、ＤＮＡチップ上に固定された上記ポリヌクレオチドを含有し得る。
【０１４９】
本発明のキットは、プロテアソーム関連タンパク質（例：ＰＯＭＰタンパク質、ＰＳＭＡ７タンパク質）に対する抗体、プロテアソーム関連遺伝子（例：ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子）またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列等の他に、容器およびラベルを含んでいてもよい。容器上のまたは容器に伴うラベルには、薬剤が大腸がんマーカーの検出に使用されることが示されていてもよい。また、他のアイテム、例えば、使用説明書等がさらに含まれていてもよい。
【０１５０】
以下、実施例を用いて本発明をより具体的に説明するが、本発明の範囲は、これらの実施例によって限定されない。
【実施例】
【０１５１】
実施例１：アレイＣＧＨ法による大腸がん特異的増幅遺伝子の同定
本実施例では、大腸がん特異的な遺伝子増幅領域を特定するために、大腸がん検体２００症例のサンプル調製およびアレイＣＧＨ法に基づく検証を実施した。
【０１５２】
その結果、大腸がん検体において高頻度に増幅が起きている領域の内、公共ＤＢでの遺伝子情報（ＮＣＢＩ：ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）を利用し、精査した結果、使用したＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−９７Ｅ２３に位置している、ＰＯＭＰ（Proteasome maturation protein）（ＮＣＢＩ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿０１５９３２）および、ＲＰ１１−１０８３Ｇ１８に位置している、ＰＳＭＡ７（Proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 7）（ＮＣＢＩ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．：ＮＭ＿００２７９２）遺伝子が大腸がん患者において高頻度で高値であることを見出した（図１，表３）。図１は、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の大腸がん患者２００検体での増幅度に対する頻度を示すヒストグラムである。G/R値が１．２以上の検体では、ＰＯＭＰ遺伝子はＧ／Ｒ値が１．３〜１．５を中心とした分布を示し、ＰＳＭＡ７遺伝子はＧ／Ｒ値が１．５〜２を中心とした分布を示した。
また、下記の表３は、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の大腸がん患者２００検体での増幅度（Ｇ／Ｒ値）および頻度を示す。平均値は、Ｇ／Ｒ値が１．２以上の検体での平均値を示している。表３に示されるように、ＰＯＭＰ遺伝子は、２００検体の大腸がん患者の３９．０％において増幅が認められ、その増幅度の平均値は、１．３であった。最大値は５．３であり、非常に高頻度で顕著な増幅が起こっていた。またＰＳＭＡ７遺伝子は、２００検体の大腸がん患者の６９．５％において増幅が認められ、その増幅度の平均値は、１．５であった。最大値は２．８であり、ＰＯＭＰ遺伝子と同様に、非常に高頻度で顕著な増幅が起こっていた。
【表３】
【０１５３】
実施例２：遺伝子増幅の評価
アレイＣＧＨ法により得られた結果を検証するために、検体組織のがん細胞におけるＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子領域の遺伝子増幅を、当該技術分野で公知のＦＩＳＨ法により評価した。
【０１５４】
アレイＣＧＨ法により、遺伝子増幅度（Ｇ／Ｒ）が１．２以上であった大腸がん患者由来の検体組織を用いて、ＰＯＭＰ遺伝子が位置するＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−９７Ｅ２３とＰＳＭＡ７遺伝子が位置するＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−１０８３Ｇ１のＤＮＡ Ｐｒｏｂｅでハイブリダイゼーションを実施した。
【０１５５】
結果
図２は、ＢＡＣ Ｃｌｏｎｅ ＲＰ１１−９７Ｅ２３（ＰＯＭＰ遺伝子領域に相当）をＤＮＡ Ｐｒｏｂｅとして行ったＦＩＳＨ解析の結果である。図は、使用した５つの検体組織（Ａ〜Ｅ）とそれらのＧ／Ｒ値、および、各検体におけるＤＡＰＩ染色された核(６細胞分)の蛍光顕微鏡写真を示す。図３は、ＲＰ１１−１０８３Ｇ１（ＰＳＭＡ７遺伝子領域に相当）をＤＮＡ Ｐｒｏｂｅとして行ったＦＩＳＨ解析の結果である。図は、５つの検体組織（Ａ〜ＤおよびＦ。検体Ａ〜ＤはＰＯＭＰ遺伝子のＦＩＳＨ解析に使用した検体と共通の検体）に対してＤＡＰＩにより染色された核(６細胞分)の蛍光顕微鏡写真を示す。
ＰＯＭＰ遺伝子領域のシグナルは、正常部の核では２スポットであったが、がん細胞の核では最も多いもので８スポット観察された（図２，検体Ｅ−５）。ＰＳＭＡ７遺伝子領域のシグナルは、正常部の核では２スポットであったが、がん細胞の核では最も多いもので９スポット観察された（図３，検体Ｆ−２）。いずれの遺伝子領域においても、がん細胞の核においては3スポット以上のシグナルが観察された。以上のことは、検体組織に対して行ったＦＩＳＨ解析によって、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の遺伝子増幅が確認されたことを示しており、併せて、アレイＣＧＨ法により得られた結果がＦＩＳＨ法によって検証されたことを示している。またこのことは、これらの遺伝子領域が、がん治療薬の分子標的としてだけでなく、ＦＩＳＨ法によるがん診断に応用できることを示している。
【０１５６】
実施例３：大腸がん検体における遺伝子発現量亢進の検証
ゲノムＤＮＡのある遺伝子領域の増幅は、その遺伝子の発現量亢進が引き起こされることが想像される。そこで本実施例では、遺伝子領域の増幅が見出されたＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のがん特異的なｍＲＮＡの発現量亢進を検証するために、大腸正常１３検体、がん２０検体におけるＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子の定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析を実施した。
【０１５７】
大腸がん検体由来の全ＲＮＡはサイトミクス社より購入し、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ ＩＩＩ Ｆｉｒｓｔ−Ｓｔｒａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｙｓｔｅｍ ｆｏｒ ＲＴ−ＰＣＲ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用して、添付のプロトコールに従ってｃＤＮＡを合成した。このｃＤＮＡを鋳型にして、定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析を実施した。定量的ＰＣＲは、ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ ＲＴ−ＰＣＲ Ｒｅａｇｅｎｔｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して、添付のプロトコールに従って７５００ Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて実施した。ｍＲＮＡの相対発現量を算出するための内部標準遺伝子として、ＴＡＴＡ ｂｏｘ ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ（ＴＢＰ）を用いた。プライマーは、以下の配列を合成し（ＯＰＥＲＯＮに合成委託）使用した。
【０１５８】
ＰＯＭＰプライマー配列：
５’−ATCTGAGCTAAAGGACAGTATTCCAGTTAC−３’（配列番号１３）
５’−AAACCTTTCCGAAGAAGATCATGAC−３’（配列番号１４）
ＰＳＭＡ７プライマー配列：
５’−CAAGTGGAGTACGCGCAGGA−３’（配列番号１５）
５’−CTGCAGTTTGGCCACTGACTTC−３’（配列番号１６）
ＴＢＰプライマー配列：
５’−CTTGACCTAAAGACCATTGCACTTC−３’（配列番号１７）
５’−GTGGCTCTCTTATCCTCATGATTACC−３’（配列番号１８）。
【０１５９】
結果
市販されている大腸がん組織および正常組織由来の全ＲＮＡを用いて、定量的ＲＴ−ＰＣＲを実施した。
【０１６０】
図４に、大腸正常１３検体および大腸がん２０検体におけるＰＯＭＰ遺伝子のＴＢＰ遺伝子に対するｍＲＮＡ相対発現量（以降単に、ＰＯＭＰ遺伝子相対発現量と表記する）とＰＳＭＡ７遺伝子のＴＢＰ遺伝子に対するｍＲＮＡ相対発現量（以降単に、ＰＳＭＡ７遺伝子相対発現量と表記する）をプロットしたグラフを示す。図４に示されるように、ＰＯＭＰ遺伝子相対発現量およびＰＳＭＡ７遺伝子相対発現量は、大腸正常検体に比べてともに高い値を示した（ｐ＜０．０１のｔ検定において有意）。
表４に、ＰＯＭＰ遺伝子相対発現量およびＰＳＭＡ７遺伝子相対発現量における、正常１３検体の平均値およびがん２０検体の平均値を示した。またさらに、それぞれの遺伝子相対発現量おいて、正常１３検体の平均値に対するがん２０検体での平均値の割合を発現亢進度として求め、併せて表に示した。表４に示すように、ＰＯＭＰ遺伝子では２．６倍、ＰＳＭＡ７遺伝子では２．８倍の発現亢進度を示した。これらのことから、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子は、ともにがん特異的にｍＲＮＡの発現亢進が起こっていることが示された。
【表４】
【０１６１】
実施例４：大腸がん細胞株を用いたＲＮＡｉ解析による機能解析
本実施例では、大腸がん患者２００検体において高頻度に増幅が認められたＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子について、がん細胞における遺伝子機能を調査するために、培養細胞を用いたＲＮＡｉ解析を行った。遺伝子ノックダウン率については、定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析あるいはイムノブロッティング解析により評価した。遺伝子ノックダウンによる細胞の表現型に対する影響を評価するために、大腸がん細胞株であるＲＫＯ細胞へｓｉＲＮＡを導入し、時系列に従い顕微鏡下で微分干渉像を撮影し、細胞の動態を詳細に観察した。またｓｉＲＮＡの導入後、９６時間目に生細胞数測定解析を行い、細胞の生存率を求めた。
【０１６２】
＜ＲＮＡｉ解析＞
細胞株はＡＴＣＣより購入し、添付のプロトコールに従い培養を行った。ｓｉＲＮＡは４種のｓｉＲＮＡが混合されたＯＮ−ＴＡＲＧＥＴ ｐｌｕｓ ＳＭＡＲＴｐｏｏｌをＤｈａｒｍａｃｏｎより購入した。
【０１６３】
ｓｉＲＮＡの培養細胞内への導入は、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用し、１０ｎＭのｓｉＲＮＡを添付のプロトコールに従い細胞に導入した。対照にはＯＮ−ＴＡＲＧＥＴ ｐｌｕｓ Ｎｏｎ−Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｐｏｏｌ（Ｄｈａｒｍａｃｏｎ）を使用した。
【０１６４】
＜定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析＞
遺伝子ノックダウン率について評価するために、ｓｉＲＮＡの効果をｍＲＮＡレベルで検証した。ｓｉＲＮＡ導入後２４時間の細胞から、ＳＶ９６ Ｔｏｔａｌ ＲＮＡ Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を使用して、添付のプロトコールに従い、全ＲＮＡを抽出した。その後、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ ＩＩＩ Ｆｉｒｓｔ−Ｓｔｒａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｙｓｔｅｍ ｆｏｒ ＲＴ−ＰＣＲ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用して、添付のプロトコールに従い、ｃＤＮＡを合成した。
【０１６５】
このｃＤＮＡを鋳型にして、定量的ＲＴ−ＰＣＲを実施した。定量的ＰＣＲは、Ｐｏｗｅｒ ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して、添付のプロトコールに従い、７５００ Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて実施した。
【０１６６】
＜イムノブロッティング解析＞
遺伝子ノックダウン率について評価するために、ｓｉＲＮＡの効果をタンパク質レベルで検証した。ｓｉＲＮＡ導入後４８時間および７２時間の細胞を回収し、１％ＳＤＳを含むＰＢＳ中で超音波破砕を行い、細胞溶解液を調製した。その細胞溶解液についてＳＤＳ−ＰＡＧＥ（ドデシル硫酸−ポリアクリルアミドゲル電気泳動）を行った後、抗ＰＳＭＡ７抗体を用いてイムノブロッティングを行った。内在性コントロールとして、ｐｅｐｔｉｄｙｌｐｒｏｌｙｌ ｉｓｏｍｅｒａｓｅ Ｂ（ＰＰＩＢ）を用いた。
【０１６７】
＜生細胞数測定解析＞
ｓｉＲＮＡ導入後の生細胞数をＡｌａｍａｒ Ｂｌｕｅ（Ｂｉｏｓｏｕｒｃｅ）を用いて、添付のプロトコールに従い、Ｗａｌｌａｃ １４２０ Ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ／Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｃｅ Ｃｏｕｎｔｅｒ ＡＲＶＯ（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ）により測定した。
【０１６８】
結果
図５に、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入後、２４時間に回収したＯＵＭＳ−２３細胞を用いて行った定量的ＲＴ−ＰＣＲ解析の結果を示す。内在性コントロールとしてＴＢＰの相対比を用いて、ＮＣに対する相対量を示した。ＮＣはＯＮ−ＴＡＲＧＥＴ ｐｌｕｓ Ｎｏｎ−Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｐｏｏｌ（Ｄｈａｒｍａｃｏｎ）を使用した。ＮＴはＮｏｎ−Ｔｒｅａｔｅｄ（未処理）を表す。図５に示されるように、ｍＲＮＡレベルでのＲＮＡｉ効果を定量的ＲＴ−ＰＣＲで確認した結果、いずれの遺伝子においても遺伝子発現量は、ＮＣに対して１０% 以下にまで減少していることが認められた。
【０１６９】
図６に、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入後、４８時間および７２時間に回収したＨｅＬａ細胞を用いて行ったイムノブロッティング解析の結果を示す。図６に示されるように、タンパク質レベルでのＲＮＡｉ効果をイムノブロッティングで確認した結果、ＰＰＩＢタンパク質はサンプル間で一定であったが、ＰＳＭＡ７タンパク質は、ｓｉＲＮＡを導入したサンプル特異的に、およそ３０%程度にまで減少していた。このＰＳＭＡ７タンパク質の減少はトランスフェクション後７２時間においても同様に認められた。
【０１７０】
図７に、ＲＫＯ細胞に対してＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、経時的に微分干渉観察を行った結果を示した。また、トランスフェクション後９６時間に生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値をＶｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）として算出した。図７に示されるように、ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡを細胞内に導入することで、４８時間目以降における細胞増殖の抑制および細胞死の誘導が確認された。また、トランスフェクション９６時間後の生存率は８．９%と著しく減少していた。
【０１７１】
図８に、ＲＫＯ細胞に対してＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、経時的に微分干渉観察を行った結果を示した。また、トランスフェクション後９６時間に生細胞数測定解析を行い、ＮＣに対する相対値をＶｉａｂｉｌｉｔｙ（生存率）として算出した。図７に示されるように、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを細胞内に導入することで、４８時間目以降における細胞増殖の抑制および細胞死の誘導が確認された。また、トランスフェクション９６時間後の生存率は１１．１%と著しく減少していた。
【０１７２】
図９は、観察した微分干渉像の視野内における、生細胞数と死細胞数の経時的な推移を示したグラフである。ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを細胞内に導入すした結果、ともにトランスフェクション４８時間以降で生細胞数の減少および死細胞数の増加が確認された。
【０１７３】
ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡの細胞内へ導入は、それぞれの遺伝子のｍＲＮＡとタンパク質の減少を引き起こすことが確認された（図５，図６）。また、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡの細胞内へ導入は、細胞の増殖を抑制し、細胞死を誘導した（図７，８，９）。これらのことから、大腸がん細胞株であるＲＫＯ細胞において、ＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子の発現抑制は、細胞増殖の抑制をもたらすことが見出された。
【０１７４】
実施例５：大腸由来の種々の細胞株でのＲＮＡｉ効果の評価
本実施例では、大腸由来の種々の細胞株でのＲＮＡｉ効果の評価するために、大腸がん細胞株であるＲＫＯ細胞、ＬＳ１２３細胞、ＲＫＯ−Ｅ６細胞、ＯＵＭＳ−２３細胞、Ｃａｃｏ−２細胞、さらに大腸正常細胞株であるＣＣＤ１８Ｃｏ細胞を用いてＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ解析を行い、時系列に従い顕微鏡下で微分干渉像を撮影し、細胞の動態を詳細に観察した。またｓｉＲＮＡの導入後、９６時間目に生細胞数測定解析を行い、細胞の生存率を求めた。
【０１７５】
＜ＲＮＡｉ解析＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１７６】
＜生細胞数の測定＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１７７】
結果
図１０に、ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡのトランスフェクション９６時間後の微分干渉像および生存率を示す。使用されたすべての大腸がん培養細胞株に対して、ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡ導入は、細胞死を誘導することが認められた。また、ＬＳ１２３細胞においては、細胞死の誘導は弱いものの、細胞周期長の延長が認められた。
【０１７８】
図１１にＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡのトランスフェクション９６時間後の微分干渉像および生存率を示す。使用された細胞のうち半数以上の大腸がん培養細胞株に対して、ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡ導入は、細胞死を誘導することが認められた。また、ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果はＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果に比べて僅かに弱いことが確認された。
【０１７９】
これらのことから、ＰＯＭＰ遺伝子とＰＳＭＡ７遺伝子の遺伝子発現の抑制は、種々の大腸がん培養細胞に対して、細胞増殖抑制効果をもたらすことが認められた。
【０１８０】
実施例６：肺および乳由来細胞株でのＲＮＡｉ効果の評価
大腸がん細胞株では、ＰＯＭＰ遺伝子、ＰＳＭＡ７遺伝子ともにＲＮＡｉにより、増殖抑制効果が認められた。そこでさらに、他の臓器（肺および乳）由来の細胞株においてどのような効果が認められるのか、前述のＲＮＡｉ解析法により評価した。肺由来の培養細胞は、がん細胞株であるＮＣＩ−Ｈ８３８細胞とＡＢＣ−１細胞および正常細胞株であるＩＭＲ−９０細胞を用いた。また、乳由来の培養細胞は、がん細胞であるＭＣＦ７細胞とＨＣＣ１８０６細胞および正常細胞株であるＨｓ６１７．Ｍｇ細胞を用いた。
【０１８１】
＜ＲＮＡｉ解析＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１８２】
＜生細胞数の測定＞
実施例４の記載方法と同様に実施する。
【０１８３】
結果
図１２は、肺および乳由来の細胞株にＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡを導入した９６時間目の微分干渉像および生存率を示す。ＰＯＭＰ遺伝子のｓｉＲＮＡの導入は、ＡＢＣ−１細胞（生存率４３％）、ＩＭＲ−９０細胞（生存率９％）、ＨＣＣ１８６０細胞（生存率３％）では細胞死を誘導するが、比較的生存率の高いＭＣＦ７細胞（生存率６５％）、Ｈｓ６１７．Ｍｇ細胞（生存率６１％）に対する細胞増殖抑制効果はわずかであった。ＮＣＩ−Ｈ８３８細胞（生存率１０８％）においては、ＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果は見られなかった。
【０１８４】
図１３は、肺および乳由来の細胞株にＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡを導入した９６時間目の微分干渉像および生存率を示す。ＰＳＭＡ７遺伝子のｓｉＲＮＡの導入は、ＡＢＣ−１細胞（生存率３８％）、ＩＭＲ−９０細胞（生存率４３％）、ＨＣＣ１８６０細胞（生存率２４％）では細胞死を誘導するが、比較的生存率の高いＭＣＦ７細胞（生存率８３％）に対する細胞増殖抑制効果はわずかであった。また、ＩＭＲ−９０細胞においては、細胞死の誘導と合わせて形態変化（細胞伸張）が認められた。ＮＣＩ−Ｈ８３８細胞（生存率１０４％）とＨｓ６１７．Ｍｇ細胞（生存率９９％）においては、ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果は認められなかった。また大腸がん細胞株と同様に、ＰＳＭＡ７遺伝子のＲＮＡｉ効果はＰＯＭＰ遺伝子のＲＮＡｉ効果に比べて僅かに弱いことが確認された。
【０１８５】
これらの結果から、ＰＯＭＰ遺伝子およびＰＳＭＡ７遺伝子の機能阻害は、大腸がんだけでなく、肺がんまたは乳がんにおいても抗腫瘍性効果を示すことが示唆された。
【産業上の利用可能性】
【０１８６】
本発明により、がん（例えば、大腸がん）の治療および／または診断に有用な新規な薬剤、キットおよび方法、ならびにがん抑制作用を有する候補化合物のスクリーニング方法が提供される。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん治療剤。
【請求項２】
前記プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質が、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸、
（ｂ）ＰＯＭＰ遺伝子もしくはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物またはその一部に対するアンチセンス核酸、
および
（ｃ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸、
からなる群から選択される物質を含む、請求項１に記載のがん治療剤。
【請求項３】
プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である、がん治療剤。
【請求項４】
前記プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質が、
該ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体、
を含む、請求項３に記載のがん治療剤。
【請求項５】
前記がんが大腸がんである、請求項１〜４のいずれかに記載のがん治療剤。
【請求項６】
プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子を発現する細胞に、被検化合物を接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子の発現レベルを測定する工程、および
（ｃ）被検化合物を接触させない場合と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
【請求項７】
プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物とを接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物との結合活性を測定する工程、および
（ｃ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と結合する化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
【請求項８】
大腸がんの治療剤の候補化合物をスクリーニングするためのものである、請求項６または７に記載の方法。
【請求項９】
ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体。
【請求項１０】
請求項９に記載の抗体を含有するがん治療剤。
【請求項１１】
放射性同位元素、治療タンパク質、低分子の薬剤、または治療遺伝子を担持したベクターをさらに含有する、請求項１０に記載のがん治療剤。
【請求項１２】
前記がんが大腸がんである、請求項１０または１１に記載のがん治療剤。
【請求項１３】
請求項９に記載の抗体を含有するがん診断剤。
【請求項１４】
プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列を含有するがん診断剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断剤。
【請求項１５】
前記がんが大腸がんである、請求項１３または１４に記載のがん診断剤。
【請求項１６】
請求項９に記載の抗体を含有するがん診断用キット。
【請求項１７】
プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するがん診断用キットであって、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断用キット。
【請求項１８】
前記がんが大腸がんである、請求項１６または１７に記載のがん診断用キット。
【請求項１９】
被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連タンパク質またはプロテアソーム関連遺伝子をがんマーカーとして検出および／または定量する方法であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質であり、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、方法。
【請求項２０】
前記生体試料が、全血、血清、または血漿である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
質量分析装置を用いて、前記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、請求項１９または２０に記載の方法。
【請求項２２】
抗プロテアソーム関連抗体を用いて、前記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、請求項１９〜２１のいずれかに記載の方法。
【請求項２３】
（ａ）被験者由来の生体試料と、前記プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体とを接触させる工程、および
（ｂ）前記試料中での前記抗体と、前記プロテアソーム関連タンパク質との結合を検出および／または定量する工程、
を包含する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
（ａ）被験者由来の生体試料と、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドとを接触させる工程、および
（ｂ）前記試料中での前記ポリヌクレオチドと、該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片とのハイブリダイゼーションを検出および／または定量する工程、
を包含する、請求項１９または２０に記載の方法。
【請求項２５】
がんの診断に用いるための請求項１９〜２４のいずれかに記載の方法。
【請求項２６】
前記がんが、大腸がんである、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有する、ポリヌクレオチド。
【請求項２８】
ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有するポリヌクレオチドを含有する、がん治療剤。
【請求項１】
プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん治療剤。
【請求項２】
前記プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質が、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現をＲＮＡｉ効果により阻害する作用を有する核酸、
（ｂ）ＰＯＭＰ遺伝子もしくはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物またはその一部に対するアンチセンス核酸、
および
（ｃ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を有する核酸、
からなる群から選択される物質を含む、請求項１に記載のがん治療剤。
【請求項３】
プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質である、がん治療剤。
【請求項４】
前記プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質が、
該ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体、
を含む、請求項３に記載のがん治療剤。
【請求項５】
前記がんが大腸がんである、請求項１〜４のいずれかに記載のがん治療剤。
【請求項６】
プロテアソーム関連遺伝子の発現阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子を発現する細胞に、被検化合物を接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子の発現レベルを測定する工程、および
（ｃ）被検化合物を接触させない場合と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
【請求項７】
プロテアソーム関連タンパク質の活性阻害物質をスクリーニングする方法であって、
（ａ）ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物とを接触させる工程、
（ｂ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と被検化合物との結合活性を測定する工程、および
（ｃ）該ＰＯＭＰタンパク質または該ＰＳＭＡ７タンパク質と結合する化合物を選択する工程を包含する、スクリーニング方法。
【請求項８】
大腸がんの治療剤の候補化合物をスクリーニングするためのものである、請求項６または７に記載の方法。
【請求項９】
ＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質に対する抗体。
【請求項１０】
請求項９に記載の抗体を含有するがん治療剤。
【請求項１１】
放射性同位元素、治療タンパク質、低分子の薬剤、または治療遺伝子を担持したベクターをさらに含有する、請求項１０に記載のがん治療剤。
【請求項１２】
前記がんが大腸がんである、請求項１０または１１に記載のがん治療剤。
【請求項１３】
請求項９に記載の抗体を含有するがん診断剤。
【請求項１４】
プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列を含有するがん診断剤であって、該プロテアソーム関連遺伝子が、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断剤。
【請求項１５】
前記がんが大腸がんである、請求項１３または１４に記載のがん診断剤。
【請求項１６】
請求項９に記載の抗体を含有するがん診断用キット。
【請求項１７】
プロテアソーム関連遺伝子またはその一部の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するがん診断用キットであって、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、がん診断用キット。
【請求項１８】
前記がんが大腸がんである、請求項１６または１７に記載のがん診断用キット。
【請求項１９】
被験者由来の生体試料中のプロテアソーム関連タンパク質またはプロテアソーム関連遺伝子をがんマーカーとして検出および／または定量する方法であって、該プロテアソーム関連タンパク質がＰＯＭＰタンパク質またはＰＳＭＡ７タンパク質であり、該プロテアソーム関連遺伝子がＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子である、方法。
【請求項２０】
前記生体試料が、全血、血清、または血漿である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
質量分析装置を用いて、前記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、請求項１９または２０に記載の方法。
【請求項２２】
抗プロテアソーム関連抗体を用いて、前記プロテアソーム関連タンパク質を検出および／または定量する、請求項１９〜２１のいずれかに記載の方法。
【請求項２３】
（ａ）被験者由来の生体試料と、前記プロテアソーム関連タンパク質に対する抗体とを接触させる工程、および
（ｂ）前記試料中での前記抗体と、前記プロテアソーム関連タンパク質との結合を検出および／または定量する工程、
を包含する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
（ａ）被験者由来の生体試料と、ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片の塩基配列にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズ可能な塩基配列からなるポリヌクレオチドとを接触させる工程、および
（ｂ）前記試料中での前記ポリヌクレオチドと、該ＰＯＭＰ遺伝子または該ＰＳＭＡ７遺伝子またはその断片とのハイブリダイゼーションを検出および／または定量する工程、
を包含する、請求項１９または２０に記載の方法。
【請求項２５】
がんの診断に用いるための請求項１９〜２４のいずれかに記載の方法。
【請求項２６】
前記がんが、大腸がんである、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有する、ポリヌクレオチド。
【請求項２８】
ＰＯＭＰ遺伝子またはＰＳＭＡ７遺伝子の発現阻害物質を有効成分として含有するがん治療剤であって、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１または配列番号１２の塩基配列を有するポリヌクレオチドを含有する、がん治療剤。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【公開番号】特開２０１０−１６６８７３（Ｐ２０１０−１６６８７３Ａ）
【公開日】平成２２年８月５日（２０１０．８．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−１３７８９（Ｐ２００９−１３７８９）
【出願日】平成２１年１月２６日（２００９．１．２６）
【出願人】（５０２０１９９３３）リンク・ジェノミクス株式会社 (11)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２２年８月５日（２０１０．８．５）
【国際特許分類】
【出願日】平成２１年１月２６日（２００９．１．２６）
【出願人】（５０２０１９９３３）リンク・ジェノミクス株式会社 (11)
【Ｆターム（参考）】
[ Back to top ]