ＰＵＦＡポリケチドシンターゼ系およびそれらの使用方法
【課題】非細菌生物から単離または誘導された高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系、それらの相同体、このようなPUFA PKS系の生物活性ドメインをコードしている単離核酸分子および組換え核酸分子、対象とする生物活性分子を生成するためのこのような系の作成および使用法、並びにこのようなPUFA PKS系を有する新規の細菌および非細菌微生物を同定する新規方法を提供する。
【解決手段】スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列、該組換え核酸分子でトランスフェクションされた組換え微生物と組換え植物とその選択方法、および、それら微生物を用いた高度不飽和脂肪酸の製造方法。
【解決手段】スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列、該組換え核酸分子でトランスフェクションされた組換え微生物と組換え植物とその選択方法、および、それら微生物を用いた高度不飽和脂肪酸の製造方法。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
(a) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(c) 前記(a)のアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；
(d) 前記(b)のアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物学的活性を有する核酸配列；ならびに
(e) 前記(a)、(b)、(c)または(d)の核酸配列に完全に相補的である核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、単離核酸分子。
【請求項２】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項３】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項４】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項５】
核酸配列が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項６】
核酸分子が、配列番号：1、配列番号：3、配列番号：5、配列番号：7、配列番号：9、配列番号：12、配列番号：17、配列番号：19、配列番号：21、配列番号：23、配列番号：25、配列番号：27、配列番号：29、および配列番号：31からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項７】
少なくとも1個の転写制御配列に機能的に連結した、請求項1記載の核酸分子を含む組換え核酸分子。
【請求項８】
請求項7記載の組換え核酸分子でトランスフェクションされた組換え細胞。
【請求項９】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を発現する、遺伝的に改変された微生物であって、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが、下記の(a)〜(f)からなる群より選択される核酸配列によりコードされ：
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；
該PKS系の活性に影響を及ぼすように遺伝的に改変された微生物。
【請求項１０】
PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインを含むPKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列内にある、請求項9記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１１】
遺伝的改変が、マロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)、β-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)、ケトレダクターゼ(KR)、アシルトランスフェラーゼ(AT)、FabA-様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)、ホスホパンテテイントランスフェラーゼ、鎖伸長因子(CLF)、アシルキャリヤータンパク質(ACP)、エノイルACP-レダクターゼ(ER)、トランス-2-デセノイル-ACPの合成を触媒する酵素、トランス-2-デセノイル-ACPのシス-3-デセノイル-ACPへの可逆的異性化を触媒する酵素、およびシス-3-デセノイル-ACPのシス-バクセン酸への伸長を触媒する酵素であるタンパク質の少なくとも1種の生物活性を有するドメインをコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１２】
遺伝的改変が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１３】
遺伝的改変が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１４】
遺伝的改変が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１５】
遺伝的改変が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１６】
スラウストキトリドである、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１７】
スラウストキトリドが、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項16記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１８】
細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする少なくとも1個の核酸分子を組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１９】
I型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２０】
II型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２１】
モジュラーPKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２２】
PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPUFA PKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、第二のPKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする組換え核酸分子、および該PUFA PKS系の活性に影響を及ぼすタンパク質をコードする組換え核酸分子からなる群より選択される組換え核酸分子の発現を含む、請求項9記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２３】
組換え核酸分子が
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 前記(a)のアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 前記(b)のアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２４】
前記(a)のスラウストキトリド微生物が、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群から選択される属に由来する、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２５】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２６】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２７】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２８】
組換え核酸分子が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２９】
組換え核酸分子が、ホスホパンテテイントランスフェラーゼをコードする、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３０】
組換え核酸分子が、細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３１】
組換え核酸分子が、I型PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３２】
組換え核酸分子が、II型PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３３】
組換え核酸分子が、モジュラーPKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３４】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする組換え核酸分子によるトランスフェクションにより遺伝的に改変されている、請求項9記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３５】
組換え核酸分子が
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 前記(a)のアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 前記(b)のアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３６】
前記(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３７】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３８】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３９】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４０】
組換え核酸分子が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４１】
細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする少なくとも1個の核酸分子を組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４２】
I型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４３】
II型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４４】
モジュラーPKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４５】
植物が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を組換え的に発現するように遺伝的に改変されており、該ドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる、遺伝的に改変された植物。
【請求項４６】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項４７】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列からなる群より選択される、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項４８】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項４９】
核酸配列が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５０】
前記(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５１】
植物が、細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする少なくとも1個の核酸分子を組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５２】
植物が、I型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５３】
植物が、II型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５４】
植物が、モジュレーターPKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５５】
下記の工程を含む、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を有する微生物を同定する方法であり：
(a) 少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(b) 発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する、工程(a)の微生物を同定する工程であり；
少なくとも1種のPUFAを生成しかつ飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する微生物が、PUFA PKS系を含む候補として同定される方法。
【請求項５６】
工程(b)が、飽和の約2％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する(a)由来の微生物を同定する工程を含む、請求項55記載の方法。
【請求項５７】
工程(b)が、飽和の約1％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する(a)由来の微生物を同定する工程を含む、請求項55記載の方法。
【請求項５８】
工程(b)が、飽和の約0％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する(a)由来の微生物を同定する工程を含む、請求項55記載の方法。
【請求項５９】
工程(a)から選択された微生物が、食作用により細菌を消費する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６０】
工程(a)から選択された微生物が、単純な脂肪酸プロファイルを有する、請求項55記載の方法。
【請求項６１】
工程(a)から選択された微生物が、非細菌性微生物である、請求項55記載の方法。
【請求項６２】
工程(a)から選択された微生物が、真核生物である、請求項55記載の方法。
【請求項６３】
工程(a)から選択された微生物が、ヤブレツボカビ目のメンバーである、請求項55記載の方法。
【請求項６４】
工程(a)から選択された微生物が、約15℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６５】
工程(a)から選択された微生物が、約20℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６６】
工程(a)から選択された微生物が、約25℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６７】
工程(a)から選択された微生物が、約30℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６８】
工程(a)から選択された微生物が、生物の乾燥質量の約5％よりも多い対象とする生物活性化合物を生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６９】
工程(a)から選択された微生物が、生物の乾燥質量の約10％よりも多い対象とする生物活性化合物を生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項７０】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約30％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、3個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７１】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約40％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、3個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７２】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約30％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、4個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７３】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約30％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、5個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７４】
(a) 生物がPUFA PKS系を含むかどうかを検出する工程をさらに含む、請求項55記載の方法。
【請求項７５】
検出工程が、スラウストキトリドPUFA PKS系由来のアミノ酸配列をコードする核酸配列とストリンジェント条件下でハイブリダイズする微生物中の核酸配列を検出する工程を含む、請求項74記載の方法。
【請求項７６】
検出工程が、スラウストキトリドPUFA PKS系由来の核酸配列からのオリゴヌクレオチドプライマーにより増幅される微生物中の核酸配列を検出する工程を含む、請求項74記載の方法。
【請求項７７】
請求項55記載の方法により同定され、かつPUFA PKS系による分子の生成を調節するように遺伝的に改変されている、微生物。
【請求項７８】
ポリケチドシンターゼ系により生成される生物活性分子を生成する方法であって、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を発現する遺伝的に改変された生物を、該生物活性分子を生成するのに有効な条件下で培養する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされ；
該生物が該PKS系の活性に影響するように遺伝的に改変されている方法。
【請求項７９】
工程(a)のスラウストキトリドが、スラウストキトリウムおよびシゾキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項78記載の方法。
【請求項８０】
工程(a)のスラウストキトリドが、スラウストキトリウム種23B(ATCC 20892)である、請求項78記載の方法。
【請求項８１】
工程(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウム種SR21である、請求項78記載の方法。
【請求項８２】
工程(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウム株ATCC 20888である、請求項78記載の方法。
【請求項８３】
工程(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウム・リマシウム(IFO 32693)である、請求項78記載の方法。
【請求項８４】
工程(a)のスラウストキトリドが、ウルケニア(BP-5601)である、請求項78記載の方法。
【請求項８５】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項８６】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項８７】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項８８】
核酸配列が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項78記載の方法。
【請求項８９】
生物が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインを含むPKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列内である、請求項78記載の方法。
【請求項９０】
遺伝的改変が、野生型生物と比べ、内因性PKS系により生成された少なくとも1個の生成物を変更する、請求項89記載の方法。
【請求項９１】
生物が、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、第二のPKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする組換え核酸分子および該PUFA PKS系の活性に影響するタンパク質をコードする組換え核酸分子からなる群より選択される組換え核酸分子による該生物のトランスフェクションを含む、請求項78記載の方法。
【請求項９２】
遺伝的改変が、野生型生物と比べ、内因性PKS系により生成された少なくとも1種の生成物を変更する、請求項91記載の方法。
【請求項９３】
生物が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする組換え核酸分子によるトランスフェクションにより遺伝的に改変された、請求項78記載の方法。
【請求項９４】
生物が、遺伝的改変を伴わない天然の生物とは異なる高度不飽和脂肪酸(PUFA)プロファイルを作成する、請求項78記載の方法。
【請求項９５】
生物が、非細菌のPUFA PKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、該非細菌のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列から異なるPKS系由来のドメインへの置換を含む、請求項78記載の方法。
【請求項９６】
生物が、PUFA PKS系により生成された脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質をコードする組換え核酸分子による該生物のトランスフェクションにより改変されている非細菌のPUFA PKS系を内因性に発現している、請求項78記載の方法。
【請求項９７】
脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質をコードする組換え核酸分子が、非細菌のPUFA PKS系における鎖長をコードする核酸配列を交換する、請求項96記載の方法。
【請求項９８】
PUFA PKS系により生成された脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質は、鎖伸長因子である、請求項96記載の方法。
【請求項９９】
PUFA PKS系により生成された脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質は、C20ユニットの合成を誘導する鎖伸長因子である、請求項96記載の方法。
【請求項１００】
生物が、FabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドロゲナーゼ(DH)ドメインをコードするドメインおよびβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)をコードするドメインからなる群より選択されるドメインにおける遺伝的改変を含む非細菌のPUFA PKS系を発現し、改変により、該改変の存在しないものと比較して、該PUFA PKS系により生成された長鎖脂肪酸の割合が変更される、請求項96記載の方法。
【請求項１０１】
改変が、非細菌のPUFA PKS系におけるFabA様β-ヒドロキシアシルACPデヒドロゲナーゼ(DH)から異性化活性を有さないDHドメインへの置換を含む、請求項100記載の方法。
【請求項１０２】
改変が、ドメインの全てまたは一部の欠失、該ドメインから異なる生物由来の相同ドメインへの置換、および該ドメインの突然変異からなる群より選択される、請求項100記載の方法。
【請求項１０３】
生物が、非PUFA PKS系を発現し、遺伝的改変が、異性化活性を有さないDHドメインからPUFA PKS系由来のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメインへの置換を含む、請求項96記載の方法。
【請求項１０４】
生物が、エノイル-ACPレダクターゼ(ER)ドメインにおける改変を含む非細菌のPUFA PKS系を発現し、改変により、該改変の非存在下と比べて異なる化合物が生成される、請求項78記載の方法。
【請求項１０５】
改変が、ERドメインの全てまたは一部の欠失、該ERドメインから異なる生物由来のERドメインへの置換、および該ERドメインの突然変異からなる群より選択される、請求項104記載の方法。
【請求項１０６】
生物活性分子が、抗炎症製剤、化学療法剤、活性賦形剤、骨粗鬆症治療薬、抗鬱薬、抗痙攣薬、抗ヘリコバクター・ピロリ薬、神経変性疾患の治療用薬物、変性肝疾患の治療用薬物、抗生物質、およびコレステロール低下製剤からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項１０７】
生物活性分子が抗生物質である、請求項78記載の方法。
【請求項１０８】
生物活性分子が高度不飽和脂肪酸(PUFA)である、請求項78記載の方法。
【請求項１０９】
生物活性分子が、シス配置において炭素-炭素二重結合を含む分子である、請求項78記載の方法。
【請求項１１０】
生物活性分子が、3個目の炭素毎に二重結合を含む分子である、請求項78記載の方法。
【請求項１１１】
生物が微生物である、請求項78記載の方法。
【請求項１１２】
生物が植物である、請求項78記載の方法。
【請求項１１３】
天然の植物とは異なる高度不飽和脂肪酸(PUFA)プロファイルを有する植物を作出する方法であって、該植物の細胞を遺伝的改変し、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子を含むPKS系を発現する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１１４】
少なくとも1種の脂肪酸を含む最終生成物を改変する方法であって、該最終生成物に、PUFA PKS系の少なくとも1種の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子を発現する組換え宿主細胞により生成された油を添加する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１１５】
最終生成物が、栄養補助食品、食品、医薬製剤、母乳化した動物乳、および乳幼児用調合乳からなる群より選択される、請求項114記載の方法。
【請求項１１６】
医薬製剤が、抗炎症製剤、化学療法剤、活性賦形剤、骨粗鬆症治療薬、抗鬱薬、抗痙攣薬、抗ヘリコバクター・ピロリ薬、神経変性疾患の治療用薬物、変性肝疾患の治療用薬物、抗生物質、およびコレステロール低下製剤からなる群より選択される、請求項115記載の方法。
【請求項１１７】
最終生成物が、慢性炎症、急性炎症、胃腸障害、癌、悪液質、心臓再狭窄、神経変性疾患、肝の変性疾患、血中脂質障害、骨粗鬆症、骨関節炎、自己免疫疾患、子癇前症、早産、年齢に関連した黄斑症、肺疾患、およびペルオキシソーム疾患からなる群より選択される状態を治療するために使用される、請求項114記載の方法。
【請求項１１８】
母乳化した動物乳の製造法であって、乳汁分泌動物の乳汁-産生細胞を、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子で遺伝的改変する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１１９】
組換え微生物を作出する方法であって、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子を発現するために、微生物細胞を遺伝的改変する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１２０】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を発現するように改変されており、該PKSが、反復性および非反復性の両方の酵素反応を触媒し、かつ該PUFA PKS系が
(a) 少なくとも2個のエノイルACP-レダクターゼ(ER)ドメイン；
(b) 少なくとも6個のアシルキャリヤータンパク質(ACP)ドメイン；
(c) 少なくとも2個のβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)ドメイン；
(d) 少なくとも1個のアシルトランスフェラーゼ(AT)ドメイン；
(e) 少なくとも1個のケトレダクターゼ(KR)ドメイン；
(f) 少なくとも2個のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメイン；
(g) 少なくとも1個の鎖伸長因子(CLF)ドメイン；および
(h) 少なくとも1個のマロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)ドメインを含む、組換え宿主細胞。
【請求項１２１】
PUFA PKS系が、真核生物PUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２２】
PUFA PKS系が、藻類のPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２３】
PUFA PKS系が、スラウストキトリアレスPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２４】
PUFA PKS系が、シゾキトリウムPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２５】
PUFA PKS系が、スラウストキトリウムPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２６】
PUFA PKS系が、原核宿主細胞において発現可能である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２７】
PUFA PKS系が、真核宿主細胞において発現可能である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２８】
宿主細胞が植物細胞である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２９】
少なくとも1種のPUFAを含む生成物の製造法であって、該生成物を生成するのに有効な条件下で請求項128記載の植物細胞を含む植物を生育する工程を含む方法。
【請求項１３０】
宿主細胞が微生物細胞である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１３１】
少なくとも1種のPUFAを含む生成物の製造法であって、該生成物を製造するのに有効な条件下で請求項130記載の該微生物細胞を含む培養物を培養する工程を含む方法。
【請求項１３２】
PKS系がトリグリセリドの直接生成を触媒する、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１３３】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を含む遺伝的に改変された微生物であって、該PKSが、反復性および非反復性の両方の酵素反応を触媒し、かつ該PUFA PKS系が
(a) 少なくとも2個のエノイルACP-レダクターゼ(ER)ドメイン；
(b) 少なくとも6個のアシルキャリヤータンパク質(ACP)ドメイン；
(c) 少なくとも2個のβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)ドメイン；
(d) 少なくとも1個のアシルトランスフェラーゼ(AT)ドメイン；
(e) 少なくとも1個のケトレダクターゼ(KR)ドメイン；
(f) 少なくとも2個のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメイン；
(g) 少なくとも1個の鎖伸長因子(CLF)ドメイン；および
(h) 少なくとも1個のマロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)ドメインを含み、
この遺伝的改変が、該PUFA PKS系の活性に影響を及ぼす、微生物。
【請求項１３４】
真核微生物である、請求項133記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１３５】
非細菌性の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を発現するように改変されている組換え宿主細胞であって、該非細菌性PUFA PKSが、反復性および非反復性の両方の酵素反応を触媒し、かつ該非細菌性PUFA PKS系が
(a) 少なくとも1個のエノイルACP-レダクターゼ(ER)ドメイン；
(b) 複数のアシルキャリヤータンパク質(ACP)ドメイン；
(c) 少なくとも2個のβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)ドメイン；
(d) 少なくとも1個のアシルトランスフェラーゼ(AT)ドメイン；
(e) 少なくとも1個のケトレダクターゼ(KR)ドメイン；
(f) 少なくとも2個のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメイン；
(g) 少なくとも1個の鎖伸長因子(CLF)ドメイン；および
(h) 少なくとも1個のマロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)ドメインを含む細胞。
【請求項１】
(a) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(c) 前記(a)のアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；
(d) 前記(b)のアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物学的活性を有する核酸配列；ならびに
(e) 前記(a)、(b)、(c)または(d)の核酸配列に完全に相補的である核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、単離核酸分子。
【請求項２】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項３】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項４】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項５】
核酸配列が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項６】
核酸分子が、配列番号：1、配列番号：3、配列番号：5、配列番号：7、配列番号：9、配列番号：12、配列番号：17、配列番号：19、配列番号：21、配列番号：23、配列番号：25、配列番号：27、配列番号：29、および配列番号：31からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項1記載の単離核酸分子。
【請求項７】
少なくとも1個の転写制御配列に機能的に連結した、請求項1記載の核酸分子を含む組換え核酸分子。
【請求項８】
請求項7記載の組換え核酸分子でトランスフェクションされた組換え細胞。
【請求項９】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を発現する、遺伝的に改変された微生物であって、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが、下記の(a)〜(f)からなる群より選択される核酸配列によりコードされ：
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；
該PKS系の活性に影響を及ぼすように遺伝的に改変された微生物。
【請求項１０】
PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインを含むPKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列内にある、請求項9記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１１】
遺伝的改変が、マロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)、β-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)、ケトレダクターゼ(KR)、アシルトランスフェラーゼ(AT)、FabA-様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)、ホスホパンテテイントランスフェラーゼ、鎖伸長因子(CLF)、アシルキャリヤータンパク質(ACP)、エノイルACP-レダクターゼ(ER)、トランス-2-デセノイル-ACPの合成を触媒する酵素、トランス-2-デセノイル-ACPのシス-3-デセノイル-ACPへの可逆的異性化を触媒する酵素、およびシス-3-デセノイル-ACPのシス-バクセン酸への伸長を触媒する酵素であるタンパク質の少なくとも1種の生物活性を有するドメインをコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１２】
遺伝的改変が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１３】
遺伝的改変が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１４】
遺伝的改変が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列であって、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有するアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１５】
遺伝的改変が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列内にある、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１６】
スラウストキトリドである、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１７】
スラウストキトリドが、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項16記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１８】
細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする少なくとも1個の核酸分子を組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１９】
I型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２０】
II型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２１】
モジュラーPKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項10記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２２】
PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPUFA PKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、第二のPKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする組換え核酸分子、および該PUFA PKS系の活性に影響を及ぼすタンパク質をコードする組換え核酸分子からなる群より選択される組換え核酸分子の発現を含む、請求項9記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２３】
組換え核酸分子が
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 前記(a)のアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 前記(b)のアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２４】
前記(a)のスラウストキトリド微生物が、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群から選択される属に由来する、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２５】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２６】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２７】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２８】
組換え核酸分子が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項23記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項２９】
組換え核酸分子が、ホスホパンテテイントランスフェラーゼをコードする、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３０】
組換え核酸分子が、細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３１】
組換え核酸分子が、I型PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３２】
組換え核酸分子が、II型PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３３】
組換え核酸分子が、モジュラーPKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む、請求項22記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３４】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする組換え核酸分子によるトランスフェクションにより遺伝的に改変されている、請求項9記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３５】
組換え核酸分子が
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 前記(a)のアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 前記(b)のアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３６】
前記(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３７】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３８】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項３９】
組換え核酸分子が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４０】
組換え核酸分子が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項35記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４１】
細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする少なくとも1個の核酸分子を組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４２】
I型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４３】
II型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４４】
モジュラーPKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項34記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項４５】
植物が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を組換え的に発現するように遺伝的に改変されており、該ドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記の方法で同定された、微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる、遺伝的に改変された植物。
【請求項４６】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項４７】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列からなる群より選択される、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項４８】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項４９】
核酸配列が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５０】
前記(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウムおよびスラウストキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５１】
植物が、細菌のPUFA PKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする少なくとも1個の核酸分子を組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５２】
植物が、I型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５３】
植物が、II型PKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５４】
植物が、モジュレーターPKS系由来のPKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを組換え的に発現するように遺伝的にさらに改変されている、請求項45記載の遺伝的に改変された植物。
【請求項５５】
下記の工程を含む、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を有する微生物を同定する方法であり：
(a) 少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(b) 発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する、工程(a)の微生物を同定する工程であり；
少なくとも1種のPUFAを生成しかつ飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する微生物が、PUFA PKS系を含む候補として同定される方法。
【請求項５６】
工程(b)が、飽和の約2％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する(a)由来の微生物を同定する工程を含む、請求項55記載の方法。
【請求項５７】
工程(b)が、飽和の約1％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する(a)由来の微生物を同定する工程を含む、請求項55記載の方法。
【請求項５８】
工程(b)が、飽和の約0％未満の溶存酸素条件下で増大したPUFAを生成する能力を有する(a)由来の微生物を同定する工程を含む、請求項55記載の方法。
【請求項５９】
工程(a)から選択された微生物が、食作用により細菌を消費する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６０】
工程(a)から選択された微生物が、単純な脂肪酸プロファイルを有する、請求項55記載の方法。
【請求項６１】
工程(a)から選択された微生物が、非細菌性微生物である、請求項55記載の方法。
【請求項６２】
工程(a)から選択された微生物が、真核生物である、請求項55記載の方法。
【請求項６３】
工程(a)から選択された微生物が、ヤブレツボカビ目のメンバーである、請求項55記載の方法。
【請求項６４】
工程(a)から選択された微生物が、約15℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６５】
工程(a)から選択された微生物が、約20℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６６】
工程(a)から選択された微生物が、約25℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６７】
工程(a)から選択された微生物が、約30℃よりも高い温度でPUFAを生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６８】
工程(a)から選択された微生物が、生物の乾燥質量の約5％よりも多い対象とする生物活性化合物を生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項６９】
工程(a)から選択された微生物が、生物の乾燥質量の約10％よりも多い対象とする生物活性化合物を生成する能力を有する、請求項55記載の方法。
【請求項７０】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約30％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、3個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７１】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約40％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、3個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７２】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約30％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、4個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７３】
工程(a)から選択された微生物が、総脂肪酸の約30％よりも多くをC14:0、C16:0およびC16:1として含むと同時に、5個またはそれ以上の不飽和結合を有する少なくとも1種の長鎖脂肪酸を生成する、請求項55記載の方法。
【請求項７４】
(a) 生物がPUFA PKS系を含むかどうかを検出する工程をさらに含む、請求項55記載の方法。
【請求項７５】
検出工程が、スラウストキトリドPUFA PKS系由来のアミノ酸配列をコードする核酸配列とストリンジェント条件下でハイブリダイズする微生物中の核酸配列を検出する工程を含む、請求項74記載の方法。
【請求項７６】
検出工程が、スラウストキトリドPUFA PKS系由来の核酸配列からのオリゴヌクレオチドプライマーにより増幅される微生物中の核酸配列を検出する工程を含む、請求項74記載の方法。
【請求項７７】
請求項55記載の方法により同定され、かつPUFA PKS系による分子の生成を調節するように遺伝的に改変されている、微生物。
【請求項７８】
ポリケチドシンターゼ系により生成される生物活性分子を生成する方法であって、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を発現する遺伝的に改変された生物を、該生物活性分子を生成するのに有効な条件下で培養する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされ；
該生物が該PKS系の活性に影響するように遺伝的に改変されている方法。
【請求項７９】
工程(a)のスラウストキトリドが、スラウストキトリウムおよびシゾキトリウムからなる群より選択される属に由来する、請求項78記載の方法。
【請求項８０】
工程(a)のスラウストキトリドが、スラウストキトリウム種23B(ATCC 20892)である、請求項78記載の方法。
【請求項８１】
工程(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウム種SR21である、請求項78記載の方法。
【請求項８２】
工程(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウム株ATCC 20888である、請求項78記載の方法。
【請求項８３】
工程(a)のスラウストキトリドが、シゾキトリウム・リマシウム(IFO 32693)である、請求項78記載の方法。
【請求項８４】
工程(a)のスラウストキトリドが、ウルケニア(BP-5601)である、請求項78記載の方法。
【請求項８５】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約70％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項８６】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約80％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項８７】
核酸配列が
(a) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(b) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約90％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項８８】
核酸配列が、配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項78記載の方法。
【請求項８９】
生物が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインを含むPKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列内である、請求項78記載の方法。
【請求項９０】
遺伝的改変が、野生型生物と比べ、内因性PKS系により生成された少なくとも1個の生成物を変更する、請求項89記載の方法。
【請求項９１】
生物が、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインを含むPKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、第二のPKS系由来の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする組換え核酸分子および該PUFA PKS系の活性に影響するタンパク質をコードする組換え核酸分子からなる群より選択される組換え核酸分子による該生物のトランスフェクションを含む、請求項78記載の方法。
【請求項９２】
遺伝的改変が、野生型生物と比べ、内因性PKS系により生成された少なくとも1種の生成物を変更する、請求項91記載の方法。
【請求項９３】
生物が、高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする組換え核酸分子によるトランスフェクションにより遺伝的に改変された、請求項78記載の方法。
【請求項９４】
生物が、遺伝的改変を伴わない天然の生物とは異なる高度不飽和脂肪酸(PUFA)プロファイルを作成する、請求項78記載の方法。
【請求項９５】
生物が、非細菌のPUFA PKS系を内因性に発現し、遺伝的改変が、該非細菌のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列から異なるPKS系由来のドメインへの置換を含む、請求項78記載の方法。
【請求項９６】
生物が、PUFA PKS系により生成された脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質をコードする組換え核酸分子による該生物のトランスフェクションにより改変されている非細菌のPUFA PKS系を内因性に発現している、請求項78記載の方法。
【請求項９７】
脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質をコードする組換え核酸分子が、非細菌のPUFA PKS系における鎖長をコードする核酸配列を交換する、請求項96記載の方法。
【請求項９８】
PUFA PKS系により生成された脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質は、鎖伸長因子である、請求項96記載の方法。
【請求項９９】
PUFA PKS系により生成された脂肪酸の鎖長を調節するタンパク質は、C20ユニットの合成を誘導する鎖伸長因子である、請求項96記載の方法。
【請求項１００】
生物が、FabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドロゲナーゼ(DH)ドメインをコードするドメインおよびβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)をコードするドメインからなる群より選択されるドメインにおける遺伝的改変を含む非細菌のPUFA PKS系を発現し、改変により、該改変の存在しないものと比較して、該PUFA PKS系により生成された長鎖脂肪酸の割合が変更される、請求項96記載の方法。
【請求項１０１】
改変が、非細菌のPUFA PKS系におけるFabA様β-ヒドロキシアシルACPデヒドロゲナーゼ(DH)から異性化活性を有さないDHドメインへの置換を含む、請求項100記載の方法。
【請求項１０２】
改変が、ドメインの全てまたは一部の欠失、該ドメインから異なる生物由来の相同ドメインへの置換、および該ドメインの突然変異からなる群より選択される、請求項100記載の方法。
【請求項１０３】
生物が、非PUFA PKS系を発現し、遺伝的改変が、異性化活性を有さないDHドメインからPUFA PKS系由来のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメインへの置換を含む、請求項96記載の方法。
【請求項１０４】
生物が、エノイル-ACPレダクターゼ(ER)ドメインにおける改変を含む非細菌のPUFA PKS系を発現し、改変により、該改変の非存在下と比べて異なる化合物が生成される、請求項78記載の方法。
【請求項１０５】
改変が、ERドメインの全てまたは一部の欠失、該ERドメインから異なる生物由来のERドメインへの置換、および該ERドメインの突然変異からなる群より選択される、請求項104記載の方法。
【請求項１０６】
生物活性分子が、抗炎症製剤、化学療法剤、活性賦形剤、骨粗鬆症治療薬、抗鬱薬、抗痙攣薬、抗ヘリコバクター・ピロリ薬、神経変性疾患の治療用薬物、変性肝疾患の治療用薬物、抗生物質、およびコレステロール低下製剤からなる群より選択される、請求項78記載の方法。
【請求項１０７】
生物活性分子が抗生物質である、請求項78記載の方法。
【請求項１０８】
生物活性分子が高度不飽和脂肪酸(PUFA)である、請求項78記載の方法。
【請求項１０９】
生物活性分子が、シス配置において炭素-炭素二重結合を含む分子である、請求項78記載の方法。
【請求項１１０】
生物活性分子が、3個目の炭素毎に二重結合を含む分子である、請求項78記載の方法。
【請求項１１１】
生物が微生物である、請求項78記載の方法。
【請求項１１２】
生物が植物である、請求項78記載の方法。
【請求項１１３】
天然の植物とは異なる高度不飽和脂肪酸(PUFA)プロファイルを有する植物を作出する方法であって、該植物の細胞を遺伝的改変し、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子を含むPKS系を発現する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べ、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１１４】
少なくとも1種の脂肪酸を含む最終生成物を改変する方法であって、該最終生成物に、PUFA PKS系の少なくとも1種の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子を発現する組換え宿主細胞により生成された油を添加する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１１５】
最終生成物が、栄養補助食品、食品、医薬製剤、母乳化した動物乳、および乳幼児用調合乳からなる群より選択される、請求項114記載の方法。
【請求項１１６】
医薬製剤が、抗炎症製剤、化学療法剤、活性賦形剤、骨粗鬆症治療薬、抗鬱薬、抗痙攣薬、抗ヘリコバクター・ピロリ薬、神経変性疾患の治療用薬物、変性肝疾患の治療用薬物、抗生物質、およびコレステロール低下製剤からなる群より選択される、請求項115記載の方法。
【請求項１１７】
最終生成物が、慢性炎症、急性炎症、胃腸障害、癌、悪液質、心臓再狭窄、神経変性疾患、肝の変性疾患、血中脂質障害、骨粗鬆症、骨関節炎、自己免疫疾患、子癇前症、早産、年齢に関連した黄斑症、肺疾患、およびペルオキシソーム疾患からなる群より選択される状態を治療するために使用される、請求項114記載の方法。
【請求項１１８】
母乳化した動物乳の製造法であって、乳汁分泌動物の乳汁-産生細胞を、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子で遺伝的改変する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１１９】
組換え微生物を作出する方法であって、PUFA PKS系の少なくとも1個の生物活性ドメインをコードする核酸配列を含む少なくとも1個の組換え核酸分子を発現するために、微生物細胞を遺伝的改変する工程を含み、該PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインが
(a) スラウストキトリド微生物由来の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列；
(b) 下記方法により同定された微生物由来のPUFA PKS系の少なくとも1個のドメインをコードする核酸配列：
(i)少なくとも1種のPUFAを生成する微生物を選択する工程；および
(ii)発酵培地内で飽和を約5％上回る溶存酸素条件下での該微生物によるPUFAの生成と比べて、発酵培地内で飽和の約5％未満の溶存酸素条件下で、増大したPUFAを生成する能力を有する(i)由来の微生物を同定する工程；
(c) 配列番号：2、配列番号：4、配列番号：6、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(d) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、配列番号：32、およびそれらの生物活性断片からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする核酸配列；
(e) 配列番号：2、配列番号：4、および配列番号：6からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも500個の連続したアミノ酸と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系の少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列；ならびに
(f) 配列番号：8、配列番号：10、配列番号：13、配列番号：18、配列番号：20、配列番号：22、配列番号：24、配列番号：26、配列番号：28、配列番号：30、および配列番号：32からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも約60％同一であるアミノ酸配列をコードする核酸配列であって、該アミノ酸配列が、PUFA PKS系少なくとも1個のドメインの生物活性を有する核酸配列
からなる群より選択される核酸配列によりコードされる方法。
【請求項１２０】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を発現するように改変されており、該PKSが、反復性および非反復性の両方の酵素反応を触媒し、かつ該PUFA PKS系が
(a) 少なくとも2個のエノイルACP-レダクターゼ(ER)ドメイン；
(b) 少なくとも6個のアシルキャリヤータンパク質(ACP)ドメイン；
(c) 少なくとも2個のβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)ドメイン；
(d) 少なくとも1個のアシルトランスフェラーゼ(AT)ドメイン；
(e) 少なくとも1個のケトレダクターゼ(KR)ドメイン；
(f) 少なくとも2個のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメイン；
(g) 少なくとも1個の鎖伸長因子(CLF)ドメイン；および
(h) 少なくとも1個のマロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)ドメインを含む、組換え宿主細胞。
【請求項１２１】
PUFA PKS系が、真核生物PUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２２】
PUFA PKS系が、藻類のPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２３】
PUFA PKS系が、スラウストキトリアレスPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２４】
PUFA PKS系が、シゾキトリウムPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２５】
PUFA PKS系が、スラウストキトリウムPUFA PKS系である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２６】
PUFA PKS系が、原核宿主細胞において発現可能である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２７】
PUFA PKS系が、真核宿主細胞において発現可能である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２８】
宿主細胞が植物細胞である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１２９】
少なくとも1種のPUFAを含む生成物の製造法であって、該生成物を生成するのに有効な条件下で請求項128記載の植物細胞を含む植物を生育する工程を含む方法。
【請求項１３０】
宿主細胞が微生物細胞である、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１３１】
少なくとも1種のPUFAを含む生成物の製造法であって、該生成物を製造するのに有効な条件下で請求項130記載の該微生物細胞を含む培養物を培養する工程を含む方法。
【請求項１３２】
PKS系がトリグリセリドの直接生成を触媒する、請求項120記載の組換え宿主細胞。
【請求項１３３】
高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を含む遺伝的に改変された微生物であって、該PKSが、反復性および非反復性の両方の酵素反応を触媒し、かつ該PUFA PKS系が
(a) 少なくとも2個のエノイルACP-レダクターゼ(ER)ドメイン；
(b) 少なくとも6個のアシルキャリヤータンパク質(ACP)ドメイン；
(c) 少なくとも2個のβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)ドメイン；
(d) 少なくとも1個のアシルトランスフェラーゼ(AT)ドメイン；
(e) 少なくとも1個のケトレダクターゼ(KR)ドメイン；
(f) 少なくとも2個のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメイン；
(g) 少なくとも1個の鎖伸長因子(CLF)ドメイン；および
(h) 少なくとも1個のマロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)ドメインを含み、
この遺伝的改変が、該PUFA PKS系の活性に影響を及ぼす、微生物。
【請求項１３４】
真核微生物である、請求項133記載の遺伝的に改変された微生物。
【請求項１３５】
非細菌性の高度不飽和脂肪酸(PUFA)ポリケチドシンターゼ(PKS)系を発現するように改変されている組換え宿主細胞であって、該非細菌性PUFA PKSが、反復性および非反復性の両方の酵素反応を触媒し、かつ該非細菌性PUFA PKS系が
(a) 少なくとも1個のエノイルACP-レダクターゼ(ER)ドメイン；
(b) 複数のアシルキャリヤータンパク質(ACP)ドメイン；
(c) 少なくとも2個のβ-ケトアシル-ACPシンターゼ(KS)ドメイン；
(d) 少なくとも1個のアシルトランスフェラーゼ(AT)ドメイン；
(e) 少なくとも1個のケトレダクターゼ(KR)ドメイン；
(f) 少なくとも2個のFabA様β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ(DH)ドメイン；
(g) 少なくとも1個の鎖伸長因子(CLF)ドメイン；および
(h) 少なくとも1個のマロニル-CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(MAT)ドメインを含む細胞。
【図１】
【図２】
【図３】
【図２】
【図３】
【公開番号】特開２００９−５７００（Ｐ２００９−５７００Ａ）
【公開日】平成２１年１月１５日（２００９．１．１５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−１５６６６６（Ｐ２００８−１５６６６６）
【出願日】平成２０年６月１６日（２００８．６．１６）
【分割の表示】特願２００２−５８２２０９（Ｐ２００２−５８２２０９）の分割
【原出願日】平成１４年４月１６日（２００２．４．１６）
【出願人】（５９５１６９７８０）マーテック バイオサイエンシズ ボールダー コーポレーション (2)
【氏名又は名称原語表記】ＭＡＲＴＥＫ ＢＩＯＳＣＩＥＮＣＥＳ ＢＯＵＬＤＥＲ ＣＯＲＰＯＲＡＴＩＯＮ
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２１年１月１５日（２００９．１．１５）
【国際特許分類】
【出願日】平成２０年６月１６日（２００８．６．１６）
【分割の表示】特願２００２−５８２２０９（Ｐ２００２−５８２２０９）の分割
【原出願日】平成１４年４月１６日（２００２．４．１６）
【出願人】（５９５１６９７８０）マーテック バイオサイエンシズ ボールダー コーポレーション (2)
【氏名又は名称原語表記】ＭＡＲＴＥＫ ＢＩＯＳＣＩＥＮＣＥＳ ＢＯＵＬＤＥＲ ＣＯＲＰＯＲＡＴＩＯＮ
【Ｆターム（参考）】
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