本発明は、遺伝子発現及び／又は活性の調節に応答した形質、疾患及び症状の研究、診断及び治療のための化合物、組成物及び方法に関する。本発明は、かかる形質、疾患及び症状の持続又は発生を媒介する遺伝子発現経路又は他の細胞プロセスに関与する遺伝子の発現及び／又は活性の調節に応答する形質、疾患及び症状に関係した化合物、組成物及び方法も対象とする。具体的には、本発明は、小核酸分子のカクテル、及び小核酸分子の脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）調合物を含めて、遺伝子発現に対するＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を媒介し得る、低分子干渉核酸（ｓｉＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、ミクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）分子などの小核酸分子を含めた、二本鎖核酸分子に関する。本発明は、ｓｉＮＡ、ｓｉＲＮＡなどの小核酸分子にも関し、内因性ＲＮＡ又は内因性ＲＮＡと結合したタンパク質（例えば、ＲＩＳＣ）の調節機能を妨害することによって遺伝子発現を調節するために、内因性ミクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）の機能を阻害し得る小核酸分子（例えば、ｍｉＲＮＡ阻害剤）、内因性低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）の機能を阻害し得る小核酸分子（例えば、ｓｉＲＮＡ阻害剤）などの内因性ＲＮＡ分子の機能を阻害し得る小核酸分子、ＲＩＳＣの機能を阻害し得る小核酸分子（例えば、ＲＩＳＣ阻害剤）にも関し、かかる小核酸分子のカクテル及びかかる小核酸分子の脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）調合物にも関する。かかる小核酸分子は、例えば、対象又は生物体における遺伝子発現又は活性に関連した疾患、形質及び症状を予防、阻害又は抑制する組成物を提供するのに有用である。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
センス鎖とアンチセンス鎖を含む構造ＳＩＸを有する二本鎖核酸分子
【化１】

（ここで、二本鎖核酸分子の上側の鎖はセンス鎖であり、下側の鎖はアンチセンス鎖であり、前記アンチセンス鎖は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）ＲＮＡに相補的である配列を含み、各Ｎは独立にヌクレオチドであり、各Ｂは存在しても、しなくてもよい末端キャップ部分であり、（Ｎ）は、無修飾でも、化学修飾されていてもよい、非塩基対形成ヌクレオチド又はオーバーハングヌクレオチドであり、［Ｎ］はリボヌクレオチドであるヌクレオチド位置であり、Ｘ１及びＸ２は独立に約０から約４の整数であり、Ｘ３は約９から約３０の整数であり、Ｘ４は約１１から約３０の整数であって、ただしＸ４とＸ５の合計は約１７−３６であり、Ｘ５は約１から約６の整数であり、
（ａ）アンチセンス鎖中に存在する任意のピリドミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、［Ｎ］ヌクレオチド位置のプリンヌクレオチド以外のアンチセンス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは独立に、２’−Ｏ−メチルヌクレオチド、２’−デオキシリボヌクレオチド、又は２’−デオキシリボヌクレオチドと２’−Ｏ−メチルヌクレオチドの組合せであり、
（ｂ）センス鎖中に存在する任意のピリミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、センス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは独立に、２’−デオキシリボヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルヌクレオチド、又は２’−デオキシリボヌクレオチドと２’−Ｏ−メチルヌクレオチドの組合せであり、および
（ｃ）任意の（Ｎ）ヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ又はデオキシリボヌクレオチドであってもよい。）。
【請求項２】
センス鎖とアンチセンス鎖を含む構造ＳＸを有する二本鎖核酸分子
【化２】

（ここで、二本鎖核酸分子の上側の鎖はセンス鎖であり、下側の鎖はアンチセンス鎖であり、前記アンチセンス鎖は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）ＲＮＡに相補的である配列を含み、各Ｎは独立にヌクレオチドであり、各Ｂは存在しても、しなくてもよい末端キャップ部分であり、（Ｎ）は、無修飾でも、化学修飾されていてもよい、非塩基対形成ヌクレオチド又はオーバーハングヌクレオチドであり、［Ｎ］はリボヌクレオチドであるヌクレオチド位置であり、Ｘ１及びＸ２は独立に約０から約４の整数であり、Ｘ３は約９から約３０の整数であり、Ｘ４は約１１から約３０の整数であって、ただしＸ４とＸ５の合計は約１７−３６であり、Ｘ５は約１から約６の整数であり、ならびに
（ａ）アンチセンス鎖中に存在する任意のピリドミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、［Ｎ］ヌクレオチド位置のプリンヌクレオチド以外のアンチセンス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは２’−Ｏ−メチルヌクレオチドであり、
（ｂ）センス鎖中に存在する任意のピリミジンヌクレオチドはリボヌクレオチドであり、センス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドはリボヌクレオチドであり、および
（ｃ）任意の（Ｎ）ヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ又はデオキシリボヌクレオチドであってもよい。）。
【請求項３】
センス鎖とアンチセンス鎖を含む構造ＳＸＩを有する二本鎖核酸分子
【化３】

（ここで、二本鎖核酸分子の上側の鎖はセンス鎖であり、下側の鎖はアンチセンス鎖であり、前記アンチセンス鎖は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）ＲＮＡに相補的である配列を含み、各Ｎは独立にヌクレオチドであり、各Ｂは存在しても、しなくてもよい末端キャップ部分であり、（Ｎ）は、無修飾でも、化学修飾されていてもよい、非塩基対形成ヌクレオチド又はオーバーハングヌクレオチドであり、［Ｎ］はリボヌクレオチドであるヌクレオチド位置であり、Ｘ１及びＸ２は独立に約０から約４の整数であり、Ｘ３は約９から約３０の整数であり、Ｘ４は約１１から約３０の整数であって、ただしＸ４とＸ５の合計は約１７−３６であり、Ｘ５は約１から約６の整数であり、ならびに
（ａ）アンチセンス鎖中に存在する任意のピリドミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、［Ｎ］ヌクレオチド位置のプリンヌクレオチド以外のアンチセンス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは２’−Ｏ−メチルヌクレオチドであり、および
（ｂ）センス鎖中に存在する任意のピリミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、センス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドはリボヌクレオチドであり、
（ｃ）任意の（Ｎ）ヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ又はデオキシリボヌクレオチドであってもよい。）。
【請求項４】
センス鎖とアンチセンス鎖を含む構造ＳＸＩＩを有する二本鎖核酸分子
【化４】

（ここで、二本鎖核酸分子の上側の鎖はセンス鎖であり、下側の鎖はアンチセンス鎖であり、前記アンチセンス鎖は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）ＲＮＡに相補的である配列を含み、各Ｎは独立にヌクレオチドであり、各Ｂは存在しても、しなくてもよい末端キャップ部分であり、（Ｎ）は、無修飾でも、化学修飾されていてもよい、非塩基対形成ヌクレオチド又はオーバーハングヌクレオチドであり、［Ｎ］はリボヌクレオチドであるヌクレオチド位置であり、Ｘ１及びＸ２は独立に約０から約４の整数であり、Ｘ３は約９から約３０の整数であり、Ｘ４は約１１から約３０の整数であって、ただしＸ４とＸ５の合計は約１７−３６であり、Ｘ５は約１から約６の整数であり、ならびに
（ａ）アンチセンス鎖中に存在する任意のピリドミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、［Ｎ］ヌクレオチド位置のプリンヌクレオチド以外のアンチセンス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは２’−Ｏ−メチルヌクレオチドであり、および
（ｂ）センス鎖中に存在する任意のピリミジンヌクレオチドは２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドであり、センス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドはデオキシリボヌクレオチドであり、
（ｃ）任意の（Ｎ）ヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ又はデオキシリボヌクレオチドであってもよい。）。
【請求項５】
センス鎖とアンチセンス鎖を含む構造ＳＸＩＩＩを有する二本鎖核酸分子
【化５】

（ここで、二本鎖核酸分子の上側の鎖はセンス鎖であり、下側の鎖はアンチセンス鎖であり、前記アンチセンス鎖は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）ＲＮＡに相補的である配列を含み、各Ｎは独立にヌクレオチドであり、各Ｂは存在しても、しなくてもよい末端キャップ部分であり、（Ｎ）は、無修飾でも、化学修飾されていてもよい、非塩基対形成ヌクレオチド又はオーバーハングヌクレオチドであり、［Ｎ］はリボヌクレオチドであるヌクレオチドであり、Ｘ１及びＸ２は独立に約０から約４の整数であり、Ｘ３は約９から約３０の整数であり、Ｘ４は約１１から約３０の整数であって、ただしＸ４とＸ５の合計は約１７−３６であり、Ｘ５は約１から約６の整数であり、ならびに
（ａ）アンチセンス鎖中に存在する任意のピリドミジンヌクレオチドは、リボ様、ノーザン又はＡ型ヘリックス配置を有するヌクレオチドであり、［Ｎ］ヌクレオチド位置のプリンヌクレオチド以外のアンチセンス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは２’−Ｏ−メチルヌクレオチドであり、
（ｂ）センス鎖中に存在する任意のピリミジンヌクレオチドはリボ様、ノーザン又はＡ型ヘリックス配置を有するヌクレオチドであり、センス鎖中に存在する任意のプリンヌクレオチドは２’−Ｏ−メチルヌクレオチドであり、および
（ｃ）任意の（Ｎ）ヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ又はデオキシリボヌクレオチドであってもよい。）。
【請求項６】
Ｘ５＝１、２又は３；各Ｘ１及びＸ２＝１又は２；Ｘ３＝１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０、並びにＸ４＝１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０である、請求項１の二本鎖核酸分子。
【請求項７】
Ｘ５＝１、２又は３；各Ｘ１及びＸ２＝１又は２；Ｘ３＝１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０、並びにＸ４＝１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０である、請求項２の二本鎖核酸分子。
【請求項８】
Ｘ５＝１、２又は３；各Ｘ１及びＸ２＝１又は２；Ｘ３＝１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０、並びにＸ４＝１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０である、請求項３の二本鎖核酸分子。
【請求項９】
Ｘ５＝１、２又は３；各Ｘ１及びＸ２＝１又は２；Ｘ３＝１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０、並びにＸ４＝１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０である、請求項４の二本鎖核酸分子。
【請求項１０】
Ｘ５＝１、２又は３；各Ｘ１及びＸ２＝１又は２；Ｘ３＝１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０、並びにＸ４＝１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０である、請求項５の二本鎖核酸分子。
【請求項１１】
Ｂが、センス鎖の３’及び５’末端ならびにアンチセンス鎖の３’末端に存在する、請求項１の二本鎖核酸分子。
【請求項１２】
Ｂが、センス鎖の３’及び５’末端ならびにアンチセンス鎖の３’末端に存在する、請求項２の二本鎖核酸分子。
【請求項１３】
Ｂが、センス鎖の３’及び５’末端ならびにアンチセンス鎖の３’末端に存在する、請求項３の二本鎖核酸分子。
【請求項１４】
Ｂが、センス鎖の３’及び５’末端ならびにアンチセンス鎖の３’末端に存在する、請求項４の二本鎖核酸分子。
【請求項１５】
Ｂが、センス鎖の３’及び５’末端ならびにアンチセンス鎖の３’末端に存在する、請求項５の二本鎖核酸分子。
【請求項１６】
ｓｉＮＡ分子のセンス鎖、アンチセンス鎖又はセンス鎖とアンチセンス鎖の両方の３’末端上の第１の末端（Ｎ）における１個以上のホスホロチオアートヌクレオチド間結合を含む、請求項１の二本鎖核酸分子。
【請求項１７】
ｓｉＮＡ分子のセンス鎖、アンチセンス鎖又はセンス鎖とアンチセンス鎖の両方の３’末端上の第１の末端（Ｎ）における１個以上のホスホロチオアートヌクレオチド間結合を含む、請求項２の二本鎖核酸分子。
【請求項１８】
ｓｉＮＡ分子のセンス鎖、アンチセンス鎖又はセンス鎖とアンチセンス鎖の両方の３’末端上の第１の末端（Ｎ）における１個以上のホスホロチオアートヌクレオチド間結合を含む、請求項３の二本鎖核酸分子。
【請求項１９】
ｓｉＮＡ分子のセンス鎖、アンチセンス鎖又はセンス鎖とアンチセンス鎖の両方の３’末端上の第１の末端（Ｎ）における１個以上のホスホロチオアートヌクレオチド間結合を含む、請求項４の二本鎖核酸分子。
【請求項２０】
ｓｉＮＡ分子のセンス鎖、アンチセンス鎖又はセンス鎖とアンチセンス鎖の両方の３’末端上の第１の末端（Ｎ）における１個以上のホスホロチオアートヌクレオチド間結合を含む、請求項５の二本鎖核酸分子。
【請求項２１】
薬剤として許容される担体又は希釈剤中に請求項１の二本鎖核酸分子を含む、組成物。

【図１】

【図２】

【図３】

【図４】

【図５】

【図６Ａ】

【図６Ｂ】

【図６Ｃ】

【図７】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４Ａ】

【図１４Ｂ】

【図１４Ｃ】

【図１４Ｄ】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【図１８】

【図１９】

【図２０】

【図２１】

【図２２】

【図２３】

【図２４】

【図２５】

【図２６】

【図２７】

【図２８】

【図２９】

【図３０】

【図３１】

【図３２】

【図３３】

【図３４】

【図３５】

【図３６】

【図３７】

【図３８Ａ】

【図３８Ｂ】

【図３９】

【図４０】

【図４１】

【図４２】

【図４３】

【公表番号】特表２００９−５０４１９０（Ｐ２００９−５０４１９０Ａ）
【公表日】平成２１年２月５日（２００９．２．５）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５２７１３９（Ｐ２００８−５２７１３９）
【出願日】平成１８年８月１７日（２００６．８．１７）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００６／０３２１６８
【国際公開番号】ＷＯ２００７／０２２３６９
【国際公開日】平成１９年２月２２日（２００７．２．２２）
【出願人】（５００２０３６８４）サーナ・セラピューティクス・インコーポレイテッド (28)
【氏名又は名称原語表記】Ｓｉｒｎａ　Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．
【Ｆターム（参考）】