説明

TIAM2(T細胞のリンパ腫の侵襲および転移2)ヌクレオチド交換因子

【課題】TIAM2(T細胞のリンパ腫の侵襲および転移2)タンパク質をコードする核酸配列を提供すること。
【解決手段】本発明は、TIAM2タンパク質をコードする核酸配列を提供する。本発明はまた、診断アッセイ、発現ベクター、アンチセンス分子、リボザイム、およびこの核酸配列によりコードされるポリペプチドを発現するための宿主細胞を包含する。本発明はまた、この核酸配列によりコードされるポリペプチド配列に対する特許請求を包含する。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
(発明の分野)
本発明は、分子生物学の分野に存在する。より詳細には、本発明は、ポリヌクレオチド配列および対応するTIAM2タンパク質に関する。
【背景技術】
【0002】
(発明の背景)
TIAM1遺伝子およびコードされるタンパク質の特徴づけは、Habetsら、Cell 77:537−549(1994)[非特許文献1];Hart,M.J.ら、J.Biol.Chem.269:62−65(1994)[非特許文献2];Haslamら、Nature 363:309−310(1993)[非特許文献3];およびMayer,B.J.ら、Cell 73:629−630(1993)[非特許文献4]において議論される。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【0003】
【非特許文献1】Habetsら、Cell 77:537−549(1994)
【非特許文献2】Hart,M.J.ら、J.Biol.Chem.269:62−65(1994)
【非特許文献3】Haslamら、Nature 363:309−310(1993)
【非特許文献4】Mayer,B.J.ら、Cell 73:629−630(1993)
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0004】
本発明は、例えば、以下の項目を提供する:
(項目1)以下:
(a)配列番号11のアミノ酸約1〜約626をコードするポリヌクレオチド;
(b)配列番号11のアミノ酸約2〜約626をコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号12のアミノ酸約1〜約626をコードするポリヌクレオチド;
(d)配列番号12のアミノ酸約2〜約626をコードするポリヌクレオチド;
(e)配列番号13のアミノ酸約1〜約626をコードするポリヌクレオチド;
(f)配列番号13のアミノ酸約2〜約626をコードするポリヌクレオチド;
(g)(a)、(b)、(c)、(d)、(e)または(f)のポリヌクレオチドに少なくとも80%同一のポリヌクレオチド;および
(h)(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)のポリヌクレオチドのポリヌクレオチド相補体、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
(項目2)配列番号8、配列番号9または配列番号10のコード領域由来の10個連続したヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
(項目3)配列番号8、配列番号9または配列番号10のコード領域由来の20個連続したヌクレオチドを含む、項目2に記載の単離された核酸分子。
(項目4)配列番号8、配列番号9または配列番号10のコード領域由来の50個連続したヌクレオチドを含む、項目3に記載の単離された核酸分子。
(項目5)ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで少なくとも1つの保存アミノ酸置換を除いて、該ポリペプチドが以下:
(a)配列番号11の約1〜約626のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
(b)配列番号11の約2〜約626のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号12の約1〜約626のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
(d)配列番号12の約2〜約626のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
(e)配列番号13の約1〜約626のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;および
(f)配列番号13の約2〜約626のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、単離された核酸分子。
(項目6)項目1に記載の核酸分子をプロモーターへ作動可能な連結でベクター中に挿入する工程を包含する、組換えベクターを作成する方法。
(項目7)項目6に記載の方法により生成される組換えベクター。
(項目8)項目7の組換えベクターを宿主細胞中に導入する工程を包含する、組換え宿主細胞を作製する方法。
(項目9)項目8に記載の方法により生成される、組換え宿主細胞。
(項目10)ポリペプチドを産生する組換え方法であって、該ポリペプチドが発現されるような条件下で、項目9に記載の組換え宿主細胞を培養する工程および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
(項目11)以下:
(a)配列番号11の約1〜626のアミノ酸;
(b)配列番号11の約2〜626のアミノ酸;
(c)配列番号12の約1〜626のアミノ酸;
(d)配列番号12の約2〜626のアミノ酸;
(e)配列番号13の約1〜626のアミノ酸;および
(f)配列番号13の約2〜626のアミノ酸、
からなる群から選択されるアミノ酸に対して少なくとも90%同一なアミノ酸を含む、単離されたポリペプチド。
(項目12)単離されたポリペプチドであって、少なくとも1つの保存アミノ酸置換を除いて、該ポリペプチドが、以下:
(a)配列番号11の約1〜626のアミノ酸;
(b)配列番号11の約2〜626のアミノ酸;
(c)配列番号12の約1〜626のアミノ酸;
(d)配列番号12の約2〜626のアミノ酸;
(e)配列番号13の約1〜626のアミノ酸;および
(f)配列番号13の約2〜626のアミノ酸、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、単離されたポリペプチド。
(項目13)以下:
(a)配列番号11の約1〜626のアミノ酸;
(b)配列番号11の約2〜626のアミノ酸;
(c)配列番号12の約1〜626のアミノ酸;
(d)配列番号12の約2〜626のアミノ酸;
(e)配列番号13の約1〜626のアミノ酸;および
(f)配列番号13の約2〜626のアミノ酸、
からなる群から選択されるアミノ酸を含む、単離されたポリペプチド。
(項目14)配列番号11、配列番号12または配列番号13のポリペプチドのエピトープ保有部分。
(項目15)配列番号11、配列番号12または配列番号13の10個連続したアミノ酸を含む、項目14に記載のエピトープ保有部分。
(項目16)配列番号11、配列番号12または配列番号13の20個連続したアミノ酸を含む、項目15に記載のエピトープ保有部分。
(項目17)項目11に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
(項目18)項目12に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
(項目19)項目13に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
(項目20)(i)配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る配列を含むアンチセンスポリヌクレオチドであって、ここで該ポリヌクレオチドは、ネイティブなヒトTIAM2のmRNAにハイブリダイズし得る、アンチセンスポリヌクレオチド;および(ii)該アンチセンスポリヌクレオチドの転写を開始し得る配列を含むポリヌクレオチド、を含むアンチセンスベクター。
(項目21)転写を開始するための前記配列がレトロウイルス、アデノウイルスまたはアデノ随伴ウイルス由来である、項目20に記載のアンチセンスベクター。
(項目22)さらに複製起点を含む、項目21に記載のアンチセンスベクター。
(項目23)以下:
(a)配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸配列を含むアンチセンスポリヌクレオチドであって、そして、ネイティブなヒトTIAM2のmRNAにハイブリダイズし得るアンチセンスポリヌクレオチドを提供する工程;および
(b)該アンチセンスポリヌクレオチドを該TIAM2と接触させる工程、
を包含する、TIAM2の発現を阻害する方法。
(項目24)サンプル中の過剰増殖細胞を検出するための方法であって、以下:
(a)配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る配列を含むプローブポリヌクレオチドを提供する工程;
(b)ポリヌクレオチドハイブリッドを形成させる条件下でサンプル細胞のポリヌクレオチドと該プローブとを接触させる工程;および
(c)ハイブリッドを検出する工程、
を包含する、方法。
(項目25)サンプル中のTIAM2ポリペプチドを検出する方法であって、以下:
(a)TIAM2ポリペプチドの特異的に結合する抗体であって、ここで該TIAM2ポリペプチドは、配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにハイブリダイズし得る配列を含むポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、抗体を提供する工程;
(b)該抗体を抗体/抗原複合体を形成させる条件下で該サンプルに接触する工程;および
(c)複合体を検出する工程、
を包含する、方法。
(項目26)細胞の複製を阻害する方法であって、以下:
(a)TIAM2ポリペプチドに特異的に結合する抗体であって、ここで該TIAM2ポリペプチドは、配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにハイブリダイズし得る配列を含むポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、抗体を提供する工程;
(b)該抗体を抗体/抗原複合体を形成させる条件下でサンプルに接触する工程、
を包含する、方法。
(要旨)
本発明は、配列番号8のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドに関する。
本発明はまた、配列番号8によりコードされるポリペプチドに関する。
【0005】
本発明はさらに、配列番号8に少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0006】
本発明はなおさらに、配列番号8に少なくとも85%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0007】
本発明はまた、配列番号8に少なくとも90%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0008】
本発明はさらに、配列番号8に少なくとも95%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0009】
本発明は、配列番号9のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドに関する。
【0010】
本発明はまた、配列番号9によりコードされるポリペプチドに関する。
【0011】
本発明はさらに、配列番号9に少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0012】
本発明はなおさらに、配列番号9に少なくとも85%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0013】
本発明はまた、配列番号9に少なくとも90%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0014】
本発明はさらに、配列番号9に少なくとも95%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0015】
本発明は、配列番号10のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドに関する。
【0016】
本発明はまた、配列番号10によりコードされるポリペプチドに関する。
【0017】
本発明はさらに、配列番号10に少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0018】
本発明はなおさらに、配列番号10に少なくとも85%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0019】
本発明はまた、配列番号10に少なくとも90%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0020】
本発明はさらに、配列番号10に少なくとも95%配列同一性を有するポリヌクレオチドに関する。
【0021】
本発明は、配列番号11、配列番号12または配列番号13のアミノ酸配列に少なくとも80%配列同一性を有するポリペプチドに関する。
【0022】
本発明はまた、配列番号11、配列番号12または配列番号13のアミノ酸配列に少なくとも85%配列同一性を有するポリペプチドに関する。
【0023】
本発明はさらに、配列番号11、配列番号12または配列番号13のアミノ酸配列に少なくとも90%配列同一性を有するポリペプチドに関する。
【0024】
本発明はなおさらに、配列番号11、配列番号12または配列番号13のアミノ酸配列に少なくとも95%配列同一性を有するポリペプチドに関する。
【0025】
本発明はさらに、配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10により、または配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10に対して少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドに特異的に結合し得る抗体に関する。
【0026】
本発明はさらに、配列番号11、配列番号12または配列番号13のアミノ酸配列を有するポリペプチドに特異的に結合し得る抗体に関する。
【0027】
本発明はまた、生物学的サンプル中のTIMA2発現産物の発現の検出の方法に関し、この方法は、生物学的サンプルからポリペプチドを得る工程、TIAM2に特異的に結合し得る抗体とこのポリペプチドを接触させる工程、および抗体−ポリペプチド複合体の存在または非存在を検出する工程の方法に関する。
【0028】
本発明はまた、配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10に対して少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドを発現する工程を包含する、TIAM2ポリペプチドを得る方法に関する。
【0029】
本発明はさらに、配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10に少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドを含むベクターに関する。
【0030】
本発明はなおさらに、配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10および少なくとも1つの調節領域に対して少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドを含むベクターに関する。
【0031】
本発明はまた、配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10に少なくとも80%配列同一性を有するポリヌクレオチドを含む宿主細胞に関する。
本発明はさらに、配列番号8、配列番号9もしくは配列番号10のポリヌクレオチド配列と癌性である恐れのある卵巣組織サンプルの染色体6q25の領域のポリペプチド配列とを比較する工程、および組織サンプルのポリヌクレオチド中の配列の存在または不存在を検出する工程を包含する、卵巣癌における染色体6q25の領域の欠失を検出する方法に関する。
【図面の簡単な説明】
【0032】
【図1】2μg/レーンのポリ(A)-mRNAを含む、ヒト脳(A)ブロットおよび組織特異的(B)ブロットは、TIAM2の長い形態(TIAML)および短い形態(TIAMS)の両方を認識するTIAM特異的プローブとハイブリダイズされた。脳特異的ノーザンに際して、4.4−Kbメッセージの5’末端由来のプローブは、長い形態のみにハイブリダイズした(C)が、一方、3’特異的プローブは、長い形態および短い形態の両方にハイブリダイズした(D)。
【図2】図2は、マウス脳中のTIAM2およびmRNAの発現を示す。(A)E13.5胎仔脳の全量。TIAM2転写物は、発生している終脳(T)にわたり発現される。(B)TIAM2 mRNAが軟膜(P)表面の近くの細胞に配置されることを実証する、E13.5終脳を通る傍矢状断面;標識化は、脳室表面(V)付近には見られなかった。(C)成体マウス前脳を通る冠状切断。TIAM2転写物は、上皮(小さい矢印)および灰白層(矢印)において強度の標識化で、大脳皮質(Ctx)および尾状被殻(CP)に局在化される。(D)脳梁(CC)の下の側脳室(LV)を裏打ちする上皮(矢じり)における標識化のより高い拡大の表示。(E)嗅球、糸球体層(矢じり)、僧帽状細胞層(矢印)におけるTIAM2転写。(F)視床(矢じり)および灰白小束(矢印)における標識化を実証する冠状切断。(G)歯状回(DG)の顆粒細胞およびCA2の錐体細胞における発現を示すTIAM2の海馬の発現。
【図3】図3は、TIAM2Lのアミノ酸配列とTIAM1タンパク質のカルボキシ末端のアミノ酸配列(アミノ酸576〜1591)との比較を示す。EXドメイン、代替的スプライス領域、DHRドメイン、DHドメインおよびPHドメインが、下線され、そしてTIAM2S(アミノ酸452)の開始メチオニンは太字であり、そして矢印で示される。
【図4】図4は、GDP−GTP交換アッセイの結果を示す。不完全に精製したHis−TIAM2Sタンパク質は、免疫沈降したRac(A)タンパク質またはRas(B)タンパク質でGDP−GTP交換活性を刺激する能力についてアッセイされた。(A)Racが、His−TIAM2S(◇)、SOS(○)、または緩衝液単独(□)の存在下で[32P]GTPとインキュベートされた、3つの別々の反応の平均。(B)Rasが、TIAM2S(●)、SOS(▲)または緩衝液単独(×)の存在下で[32P]GTPとインキュベートされた代表的な実験。
【図5】図5は、腫瘍組織および正常な組織中のTIAM2 mRNAの発現を示す。
【発明を実施するための形態】
【0033】
(発明の詳細な説明)
TIAM2(DP−75)(T細胞リンパ腫の侵襲および転移2について)は、TIAM1といくらかの配列相同性を有する新規のDNAおよびアミノ酸配列に関する。(Habetsら、Cell 77:537−749(1994)、およびHabetsら、Oncogene 10:1371−1376(1995))。全長のまたは短縮された形態のTIAM1の過剰発現は、マウス中でのリンパ腫の細胞の転移の可能性を増大する。TIAM1は、Rho様およびRac様のGTPaseを活性化するタンパク質である、ファミリーGDP解離刺激因子(GDS)のメンバーである。GDS、ならびにRhoおよびRacは、腫瘍形成性の能力を有する。
【0034】
本発明に従うと、TIAM1に対して高い相同性を有する新規のタンパク質であるTIAM2が同定されている。TIAM2は、約4.4kbおよび約3.3kbのメッセージとして発現され、これは、TIAM2タンパク質の長い形態(TIAM2L)および短い形態(TIAM2S)をコードする。TIAM2Lは、TIAM1のコイルドコイル(coiled−coil)領域に対して同一性を有する領域中で開始し、そしてTIAM1中に見出されるEXおよびPDZドメインの両方を含む。TIAM2LおよびTIAM2Sの両方が、TIAM1のDHおよびカルボキシ末端のPHドメインに対して同一の領域を含む。さらなるレベルの複雑度が、約4.4kbのメッセージの選択的スプライシングによって加わり、この選択的スプライシングは、EXドメインとDHRドメインとの間に24アミノ酸の挿入を導く。
【0035】
約4.4kbのメッセージの分析によって、翻訳のための良好な状況にある51位のヌクレオチドでのATGが同定され、一方、さらなる分析によって、ORFがATGの5’から最初の51ヌクレオチドへと延長され得ることが明らかになった。この延長されたORFは、TIAMLを延長するさらなる5’配列が存在することを示し得る。開始は、おそらく、ヌクレオチド51位で開始する、なぜなら、cDNAクローンの大きさ(4586nt)は、小脳のメッセージ(約4.4kb)の概算される大きさに等しいかまたはそれよりも大きいからであり、そしてなぜなら、多数の試みにもかかわらず、さらなる5’配列が同定されなかったからである。
【0036】
TIAM2SのHisタグをつけたバージョンが、TIAM2の発現に好ましい系であるバキュロウイルス系中で発現され、そしてニッケルカラム上で精製された。His−TIAM2Sは、SOSと比較され、そしてRASよりもRACを好むGEF活性を有することが示された。
【0037】
TIAM1およびTIAM2タンパク質のコード配列間での高い類似性、発現パターン、およびGEF活性は、TIAM1と同様に(Habetsら、Cell 77:537−549、1994;Hordijkら、Science 278:1464−1466、1997;Ehlerら、Mol.Cell.Neurosci.9:1−12、1997;van Leeuwenら、J.Cell Biol.、139:797−807、1997)、TIAM2が神経の発達において役割を果たし得ることを示唆する。E13.5終脳の全体にわたる高レベルのTIAM2の発現は、TIAM2が前脳の発達において重要な役割を果たし得ることを示唆する。E13.5では、有糸分裂後のニューロンが、産生される;これらの細胞は、発達しつつある脳内でのそれらの正確な位置に移動し、そしてそれらの正確な標的との接触を確立するために増殖性垂体(growth cone)を放たなければならない。これらのプロセスの全てが、環境的な合図でアクチンに基づく細胞骨格の再配列を調整することを必要とする。Rac/cdc42 GTPaseが、神経系中での軸索の形成および標的の認識において重要な役割を果たすことの強力な証拠が存在する(Albertinazziら、J.Cell.biol.142:815−825,1998;Hingら、Cell 97:853−863、1999;van Leewenら、前出、1997)。マウスの胚形成の間のTIAM2の発現のさらなる分析は、特定の形態形成の事象との相関関係、または特定のGTP−aseファミリーのメンバー、調節因子、もしくはエフェクターとの相関関係を明らかにし得る。神経の発達の間に特異的に確立されるいくつかは、TIAM1、RAC3、およびTIAM2のようなGTPaseのシグナル伝達経路の成分の細胞型特異的発現に起因するようである。
【0038】
TIAM1とは異なり、TIAM2は、成体の前脳において高レベルで発現され続ける。成体での高発現の領域は、成体中のシナプス形成性の領域(皮質、海馬)、または神経形成性(歯状回、上衣/上衣下)である(Gouldら、Trends Cogn.Sci.3:186−192、1999;Temple,Curr.Biol.9:R397−399,1999;LowensteinおよびParent.Science 283:1126−1127,1999)。
【0039】
TIAM2は、転移または腫瘍の抑制において役割を果たし得る。TIAM2の照射ハイブリッドマッピングは、それを卵巣癌において頻繁に欠失される染色体6q25の4−cM領域に配置する(Colittiら、Oncogene 16:555−559、1998)。卵巣癌のほとんどが、天然において上皮性であり、そしてTIAM1(21q22.1;ChenおよびAntonarakis、Genomics 30:123−127、1995)が上皮細胞において腫瘍のサプレッサーとして作用し得ることが示唆されているので、これは、卵巣癌におけるTIAM2の役割を示唆し得る。
【0040】
TIAM2の別の形態の発現は、TIAM2LおよびTIAM2Sの異なる役割を示唆する。TIAM2L中で見出されたEXドメインおよびPDZドメインの両方が、タンパク質−タンパク質相互作用、およびタンパク質の細胞内局在化において役割を果たすことが示唆されている。TIAM2sは、TIAM2LのEXドメインおよびPDZドメインの両方を欠失しているので、2つの形態が、細胞の異なる領域に局在化され得る。TIAM2の別の形態を理解することは、GEFのこの新生のファミリーの複雑さの知見を拡大し、そして侵襲のプロモーターおよび腫瘍サプレッサーの両方としてのTIAM1の多様な役割についての洞察を最終的に生じ得る。
【0041】
GDSは、種々の癌に関与し、そして本明細書中での議論に基づくと、TIAM2は、癌性細胞を診断するために有用であり得る。多くの技術が、組織サンプルがTIAM2を含有している腫瘍細胞を保有しているかどうかを診断するために使用され得る。例えば、TIAM2 mRNA配列の存在を同定するための、腫瘍サンプルのRNAの逆転写およびPCR増幅(Sambrookら、Molecular Cloning;A Laboratory Manual、第2版1989)、第14章、またはGauglerら、J.Exp.Med 179:921−930(1994)を参照のこと)。また、免疫組織化学的技術またはELISAアッセイが、TIAM−2を発現する腫瘍を同定するために使用され得る。例えば、TIAM2タンパク質が組換えによって発現され得、そしてモノクローナル抗体が当該分野で公知の方法に従って調製され得る。例えば、EP 174,204号、KohlerおよびMilstein、Nature 256:495−497(1975)、Fongら、J.Immun.Meth.70:83−90(1984)、GB 2,086,937号、同第2,113,715号、EP 57,107号、同第62,409号、EP 118,893号、EP 124,301号、およびEP 131,878号に示されている方法が、本発明について適切である。抗TIAM2モノクローナル抗体は、次いで、上記に記載される標準的なアッセイ、またはそうでなければ当該分野で公知であるこれらのアッセイにおいて使用され得る。
【0042】
モノクローナル抗体はまた、治療的に使用され得る。抗TIAM2モノクローナル抗体は、当該分野で公知の手段によって投与され得る。好ましくは、抗体は、非経口的に、または皮下で投与され、より好ましくはこれらは、静脈内で投与される。モノクローナル抗体は、抗体の活性を促進するように設計された他の薬剤と組合せて、またはTIAM2を発現する細胞に関連する根本的な状態を処置するために、投与され得る。
【0043】
さらに、分岐したDNA試験が、米国特許第5,124,246号、および同第4,868,105号(それらの全体において参考として本明細書中で援用される)に示されているようなTIAM2のDNAについてアッセイするために行われ得る。分岐したDNA試験のためのTIAM2核酸プローブ分子は、好ましくは、10〜50塩基の長さであり、より好ましくは15〜40塩基の長さであり、最も好ましくは、20〜30塩基の長さである。
【0044】
リボザイムは、配列番号1、配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10、またはそれらのフラグメント中で同定されるTIAM2配列に対して作用するように設計され得る。(Kashani−CabetおよびScanlon、Cancer Gene Therapy、2:213−223(1995)、その全体において参照として本明細書中で援用される)。細胞性の発現を得るために、リボザイム遺伝子が利用可能なベクター中にクローン化され、そして選択された細胞中にトランスフェクトされる。異なるベクターが、感染された標的細胞に基づいて選択され得る。例えば、呼吸性細胞が、アデノウイルスまたはアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターによって標的化され得る。適切なプロモーターが、調節可能な発現を確実にするために、これらのベクター中に挿入され得る。(Kashani−Cabet、216頁)。
【0045】
アンチセンス分子が、配列番号1、配列番号6、配列番号8、配列番号9、または配列番号10に示されるTIAM2配列に基づいて開発され得る。例えば、米国特許第5,491,133号、および同第5,271,941号を参照のこと。これらは、それらの全体において本明細書中で参照として援用されている。
【0046】
アンチセンスRNA配列は、原核生物(Mizuno,T.、Chou,M−.Y.、およびInouye.M.(1984)、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81.(1966−1970))および真核生物(Heywood,S.M.、Nucleic Acids Res.,14、6771−6772(1986))の両方における、遺伝子発現の天然に存在する生物学的なインヒビターとして記載されており、そしてこれらの配列は、相補的なmRNA配列に対してハイブリダイズすることによって機能し、それによって翻訳のハイブリダイゼーションによる阻止を生じる(Paterson.B.M.,Roberts.B.E.およびKuff.E.L.(1977)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 74、4370−4374)。
【0047】
アンチセンスオリゴデオキシヌクレオチドは、特定の遺伝子またはRNAメッセージに対して相補的であるように形成された短い合成ヌクレオチド配列である。これらのオリゴマーの標的DNA配列または標的mRNA配列に対する結合を通じて、遺伝子の転写または翻訳が、選択的にブロックされ得、そしてその遺伝子によって生成される疾患のプロセスが停止させられ得る。mRNAの細胞質性の配置は、細胞に侵入するアンチセンスオリゴヌクレオチドに対して容易に接近可能であると考えられる標的を提供する;従って、この分野での多くの作業が、標的としてRNAに対して焦点をあてている。
【0048】
アンチセンス治療は、細胞内に配置された標的ポリヌクレオチドに結合するオリゴヌクレオチドの投与である。これらのオリゴヌクレオチドは、通常は外因性であるが、これらは内因的に発現され得る。用語「アンチセンス」は、このようなオリゴヌクレオチドがそれらの細胞内の標的(例えば、TIAM2)に対して相補的であるという事実をいう。例えば、Jack Cohen、Oligonucleotides.Antisense Inhibitors of Gene Expression、CRC Press、1989;およびSynthesis 1:1−5(1988)を参照のこと。
【0049】
本発明のTIAM2のアンチセンスオリゴヌクレオチドとしては、増強された癌細胞の増殖阻害作用を示す、S−オリゴヌクレオチド(ホスホロチオエート誘導体、またはS−オリゴ、Jack Cohen、前出を参照のこと)のような誘導体が挙げられる。本発明のTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAまたはDNAであり得る。このRNAまたはDNAは、TIAM2ゲノムまたは対応するmRNAに対して相補的であり、かつそれらと安定にハイブリダイズする。この領域に対して相補的なオリゴヌクレオチドの使用は、TIAM2 mRNAに対する選択的なハイブリダイゼーションを可能にし、そして他のmRNAに対するハイブリダイゼーションは可能にはしない。
【0050】
好ましくは、本発明のTIAM2のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、TIAM2 mRNAに対してハイブリダイズする、アンチセンスDNA分子の15〜40マーのフラグメントである。あるいは、好ましいTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、RIAM2中の領域に対してハイブリダイズする、20から30マーのオリゴヌクレオチドである。有効量の少なくとも1つの本発明のTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドを、薬学的に受容可能なキャリアと組合せて含有している薬学的組成物が、本発明に含まれる。1つの実施形態においては、単一のTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドが利用される。別の実施形態においては、2つのTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドが利用され、これらは、TIAM2のゲノムの隣接する領域に対して相補的である。
【0051】
2つのTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチド(これらは、TIAM2のゲノムの隣接する領域、または対応するmRNAに対して相補的である)の投与は、TIAM2のゲノムの転写またはmRNAの翻訳のより効率的な阻害を可能にし得、これによって癌細胞の増殖のより効果的な阻害を生じる。好ましくは、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞によるアンチセンス分子の取りこみを増強する薬剤とともに、同時に投与される。例えば、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、リポソームの形態であり得る親油性のカチオン性化合物と組み合わされ得る。
【0052】
細胞中にヌクレオチドを導入するためのリポソームの使用は、例えば、米国特許第4,897,355号、および同第4,394,448号に教示される。これらの開示は、それらの全体において本明細書中で参考として援用されている。また、生物学的な材料を含有しているリポソームを調製するための一般的な方法については、米国特許第4,235,871号、同第4,231,877号、同第4,224,179号、同第4,753,788号、同第4,673,567号、同第4,247,411号、同第4,814,270号を参照のこと。
【0053】
あるいは、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、コレステロール、コール酸塩、およびデオキシコール酸を含む、多数のステロールうちのいずれか1つのような、親油性のキャリアと組み合わされ得る。好ましいステロールは、コレステロールである。さらに、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞によって摂取されるペプチドに対して結合され得る。有用なペプチドの例としては、ペプチドホルモン、抗原、または抗体、およびペプチド毒素が挙げられる。腫瘍性細胞によって選択的に取り込まれるペプチドを選択することによって、アンチセンス薬剤の特異的な送達がもたらされ得る。
【0054】
TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、活性化されたアミノアルキル誘導体の形成によって5’のH基を通じて共有結合され得る。次いで、選択されたペプチドが、ヘテロ二官能性試薬と反応するアミノおよびスルフヒドリルを介して、活性化されたTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドに対して共有結合され得る。後者は、ペプチド中に存在するシステイン残基に対して結合される。ペプチドに結合されたTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドに対する細胞の暴露の際に、ペプチジルアンチセンス薬剤が、エンドサイトーシスされ、そしてTIAM2アンチセンスオリゴヌクレチドが、標的TIAM2 mRNAに対して結合して、翻訳を阻害する。PCT出願公開番号PCT/US89/02363.1を参照のこと。
【0055】
本発明のTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび薬学的組成物は、それらの意図された目的を達成するための任意の手段によって投与され得る。例えば、本発明のアンチセンス化合物または他の化合物の投与は、非経口経路、皮下経路、静脈内経路、筋肉内経路、腹膜内経路、または経皮経路によって行われ得る。
【0056】
投与される投与量は、レシピエントの年齢、健康、および体重、平行して行われている処置の種類、必要である場合には、処置の頻度、および所望される効果の性質に依存する。本発明の範囲内の組成物としては、全ての組成物が挙げられ、ここでは、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、被験体の癌細胞の増殖の阻害を達成する、および/または分化を刺激するために有効である量で含まれる。
【0057】
個体は変更を必要とするが、それぞれの組成物の有効量の最適な範囲の決定は、当業者の範囲内である。代表的には、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、哺乳動物(例えば、ヒト)に対して、0.005〜1mg/kg/日の用量で、または処置される哺乳動物の体重の1日あたりの等価な量の、それらの薬学的に受容可能な塩で、投与され得る。
【0058】
溶液中にて生の化学薬品としてTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドを投与することに加えて、TIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドは、薬学的に使用され得る調製物へのTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドのプロセシングを促進する賦形剤および添加剤を含有している、適切な薬学的に受容可能なキャリアを含有している薬学的調製物の一部として投与され得る。用語薬学的に受容可能は、過度の毒性を伴わずに哺乳動物に対して投与され得る化合物および組成物をいう。例示的な薬学的に受容可能な塩としては、塩酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩などのような、無機酸塩;および酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩などのような、有機酸塩が挙げられる。
【0059】
非経口的な投与に適切な処方物としては、水溶性の形態でのTIAM2アンチセンスオリゴヌクレオチドの水溶液、例えば、水溶性の塩が挙げられる。さらに、適切な油状の注射懸濁物として活性な化合物の懸濁物が、投与され得る。適切な親油性の溶媒またはビヒクルとしては、例えば、ゴマ油のような脂肪油、または例えば、オレイン酸エチルもしくはトリグリセリドのような合成脂肪酸エステルが挙げられる。水性の注射懸濁物は、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、および/またはデキストランを含む物質を含み得る。必要に応じて、懸濁物はまた、安定化剤を含み得る。
【0060】
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、当業者に周知の任意の方法に従って調製され得る。好ましくは、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、固相合成によって調製される。オリゴヌクレオチドの化学合成の概説については、Goodchild,J.Bioconjugate Chemistry、1:165−167(1990)を参照のこと。あるいは、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドのカスタム合成を専門に扱う多数の会社から入手することができる。
【0061】
TIAM2ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体は、経口的、局所的、または皮下および筋肉内注射を含む非経口的な手段、徐放デポー製剤の移植、静脈内注射、鼻腔内投与などによって投与され得る。腫瘍を処置するために使用される場合は、TIAM2ポリペプチドまたは抗体を、例えば、腫瘍の塊を除去するための外科手術の間に、部位に対して直接適用することが有利であり得る。従って、TIAM2ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体は、薬学的に受容可能な賦形剤を含有している薬学的組成物として投与され得る。このような組成物は、水溶液、乳濁物、クリーム剤、軟膏、懸濁剤、ゲル、リポソーム懸濁剤などであり得る。適切な賦形剤としては、水、生理食塩水、リンゲル液、デキストロース溶液、ならびに、エタノール、グルコース、スクロース、デキストラン、マンノース、マンニトール、ソルビトール、ポリエチレングリコール(PEG)、リン酸塩、酢酸塩、ゼラチン、コラーゲン、Carbopol(登録商標)、植物油の溶液などが挙げられる。1つは、さらに、適切な保存剤、安定化剤、抗酸化剤、抗菌剤、および緩衝化剤(例えば、BHA、BHT、クエン酸、アスコルビン酸、テトラサイクリンなど)を含み得る。処方物中で有用なクリーム剤または軟膏の基剤としては、ラノリン、Silvadene(登録商標)(Marion)、Aquaphor(登録商標)(Duke Laboratories)などが挙げられる。他の局所的な処方物としては、エアゾール、バンドエイド、および他の創傷の包帯剤が挙げられる。
【0062】
あるいは、1つは、適切なポリマーマトリックスまたはメンブレン中にTIAM2ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体を取りこみ得るかまたはカプセル化し得、これによって、局所的に処置される部位の近くでの移植に適切な徐放送達デバイスを提供する。他のデバイスとしては、Alzet(登録商標)ミニポンプのような、内在するカテーテルおよびデバイスが挙げられる。眼科用調製物が、Sorbi−care(登録商標)(Allergan)、Neodecadron(登録商標)(Merck,Sharp & Dohme)、Lacrilube(登録商標)などのような市販のビヒクルを使用して処方され得るか、または本明細書中で参考として援用されている米国特許第5,124,155号に記載されている調製物のような局所的な調製物を使用し得る。さらに、1つは、TIAM2ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体を固体の形態で、特に凍結乾燥された粉末として提供し得る。凍結乾燥された処方物は、代表的には、安定化剤および増量剤(例えば、ヒト血清アルブミン、スクロース、マンニトールなど)を含有する。薬学的に受容可能な賦形剤の徹底的な議論は、Remington’s Pharmaceutical Science(Marck Pub.Co)において入手可能である。
【0063】
任意の特定の障害の処置のために必要とされるTIAM2ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体の量は、もちろん、障害の性質および重篤度、被験体の年齢および状態、ならびに当業者によって容易に決定される他の因子に依存して変化する。適切な投与量は、当業者によって決定され得る。
【0064】
遺伝子治療法においては、上記の核酸分子(すなわち、リボザイムまたはアンチセンス分子)を投与することが有用であり得る。従って、以下に記載されるベクターおよび技術が有用である。以下の発現系は、上記のポリヌクレオチドの送達のための遺伝子治療の適用に有用である、ベクター、プロモーター、および調節エレメントを記載する。
【0065】
本発明に有用なベクターおよび発現系としては、ウイルス系および非ウイルス系が挙げられる。例示的なウイルス性の送達系としては、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、シンドビスおよびヘルパーウイルスが挙げられる。本発明の1つの局面においては、ウイルスベクターは、上記の核酸配列を、長期間の発現のために宿主細胞のゲノム中に組み込むことができる。
【0066】
1つの好ましいレトロウイルスは、マウスの白血病ウイルスである。しかし、宿主細胞のゲノム中への組込みを回避することが好まれ得る。非ウイルス性のベクターとしては、裸のDNA、およびカチオン性脂質またはリポソームを用いて処方されたDNAが挙げられる。使用され得る非ウイルス系は、T7/T7系である。
【0067】
さらに、例えば、インヒビターについて試験するためのアッセイにおいて、またはモノクローナル抗体の調製に使用される、本明細書中で開示される核酸配列からTIAM2タンパク質を産生することが有用である。TIAM2は、ネイティブなまたは改変されたTIAM2核酸配列で形質転換されているバキュロウイルスによって発現され得る。本発明において有用なTIAM2核酸配列は、ネイティブなTIAM2のアミノ酸配列に対して実質的に同一であるアミノ酸配列を有するタンパク質をコードする。
【0068】
好ましくは、TIAM2核酸またはタンパク質配列は、以下に列挙される部分的な配列に対して相同である。好ましくは、上記の配列は、配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10、またはそれらのフラグメントに対して80%を超えて相同であり、より好ましくは、これは、85%を超えて相同であり、より好ましくは、90%を超えて相同であり、なおより好ましくは、91%、92%、93%、94%、または95%を超えて相同である。最も好ましくは、これは、96%、97%、98%、または99%を超えて相同である。実質的に同一は、配列が同一であるか、またはタンパク質の活性に有害な影響を与えない1つ以上の変更(欠失、付加、置換)によって異なることを意味する。タンパク質配列が上記の同じ割合で相同であることが好ましい。パーセント同一性または相同性は、当該分野で公知の方法およびアルゴリズムを使用して計算され得る。適切であるが限定的ではない方法は、以下の検索パラメーターを用いて姻戚(affine)ギャップ検索を使用するMPSRCHプログラム(Oxford Biomolecular)において実行されるような、Smith−Watermanの相同性検索アルゴリズムである:12のギャップオープンペナルティー、および1のギャップ伸張ペナルティー。
【0069】
TIAM2配列の正確な化学的な構造は、多数の因子に依存し得る。イオン化されたアミノ基およびカルボキシル基が分子中に存在する場合は、特定のタンパク質が、酸性の塩もしくは塩基性の塩として、または天然の形態で得られ得る。全てのこのような調製物(これらは、適切な環境条件下に配置された場合に、それらの活性を保持している)が、本明細書中のタンパク質の定義に含まれる。さらに、タンパク質の一次アミノ酸配列が、糖部分を使用する誘導体化によって、または脂質、リン酸塩、アセチル基などのような他の追加の分子によって、増大させられ得る。このような増大の特定の局面は、産生宿主の翻訳後プロセシング系を通じて達成される;他のこのような改変はインビトロで導入され得る。任意の事象においては、このような改変は、タンパク質の活性が破壊されない限りは、本明細書中のタンパク質の定義に含まれる。このような改変が、種々のアッセイにおいてタンパク質の活性を増強するかまたは低下させるかのいずれかによって、活性に定量的または定性的に影響を与え得ることが予想される。さらに、鎖中の個々のアミノ酸残基は、酸化、還元、誘導体化によって改変され得、そしてタンパク質は、活性を保持しているフラグメントを得るために切断され得る。活性を破壊しないこのような変更は、本明細書中のTIAM2の定義からタンパク質配列を除去しない。
【0070】
翻訳の間に配列中に取り込まれるアミノ酸の欠失、付加、または変更による一次配列自体に対する改変は、タンパク質の活性を崩壊させることなく行われ得る。例えば、部位特異的変異誘発は、ポリペプチド構造中の変更をもたらす、DNA構造中での特定の変更が可能であり得る。Markら、米国特許第4,959,314号、およびSambrookら、前出、第2巻、第15章(これらは、その全体において本明細書中で参考として援用されている)を参照のこと)。
【0071】
TIAM2タンパク質としては、変異体、フラグメント、融合物、および配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10、またはそれらのフラグメント中に列挙される配列によってコードされるタンパク質が挙げられる。ネイティブTIAM2タンパク質は、天然に存在するタンパク質である。ネイティブポリペプチドのアミノ酸配列は、わずかに(代表的には、配列番号1、配列番号6、配列番号8、配列番号9、または配列番号10によってコードされる10〜20個未満のアミノ酸)変化する配列を含む。
【0072】
用語「ポリヌクレオチド」または「核酸配列」は、本明細書中で使用される場合は、任意の長さのヌクレオチドのポリマー(好ましくは、デオキシリボヌクレオチド)をいい、そして用語「オリゴヌクレオチド」および「オリゴマー」と本明細書中で互換的に使用される。この用語は、分子の一次構造のみをいう。従って、この用語は、二本鎖および一本鎖のDNA、ならびにアンチセンスポリヌクレオチドを含む。以下のような既知の型の改変もまた、含まれる:例えば、当該分野で公知である標識の存在、メチル化、末端「キャップ」、1つ以上の天然に存在するヌクレオチドのアナログでの置換、ヌクレオチド間での改変(例えば、特定の型の荷電していない結合(例えば、メチルホスホネート、ホスホロトリエステル、ホスホロアミデート、カルバメートなど)または荷電した結合(例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど)での置換など)、ペンダント部分(例えば、タンパク質(ヌクレアーゼ、毒素、抗体、シグナルペプチド、ポリ−L−リジンなど)、挿入剤(例えば、アクリジン、ソラレンなど)、キレート化剤(例えば、金属の放射活性種、ホウ素、酸化剤部分など)、アルキル化剤(例えば、αアノマー核酸など)の導入。
【0073】
ネイティブTIAM2タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列は、TIAM2タンパク質の他のクラスをコードするように容易に改変され得る。TIAM2ポリペプチドのいくつかのアミノ酸配列が、タンパク質の構造または機能に対する有意な効果を伴わずに変更され得ることが、当該分野で認識される。配列中でのこのような変更が意図される場合には、活性を決定するタンパク質上の重要な領域が存在することが思い出されるはずである。一般的には、同様の機能を実行する残基が使用される限りにおいては、4次構造を形成する残基を置換することが可能である。他の例においては、この型の残基は、タンパク質の重要ではない領域で変更が生じた場合に、完全にささいなことであり得る。アミノ酸の置換はまた、細胞表面レセプターに対する結合の選択性を変更し得る。Ostadeら、Nature 361:266−268(1993)は、2つの既知の型のTNFレセプターの1つのみに対するTNF−αの選択的な結合を生じる特定の変異を記載している。従って、本発明のポリペプチドは、天然の変異またはヒトの操作のいずれかによる、1つ以上のアミノ酸の置換、欠失、または付加を含み得る。
【0074】
従って、本発明はさらに、実質的なTIAM2ポリペプチド活性を示すか、または以下に議論されるタンパク質部分のようなTIAM2タンパク質の領域を含む、TIAM2ポリペプチドのバリエーションを含む。このような変異体は、欠失、挿入、転換、反復、および型の置換を含む。上記に示すように、アミノ酸の変更が、おそらく表現形的にはサイレントであるということに関する指針は、Bowie,J.U.ら、「Deciphering the Message in Protein Sequences:Tolerance to Amino Acid Substitutions」、Science 247:1306−1310(1990)において見出される。
【0075】
特定の目的は、別の荷電したアミノ酸での、および中性の、または負に荷電したアミノ酸での、荷電したアミノ酸の置換である。後者は、TIAM2タンパク質の特徴を改善するために、減少した正の電荷を有するタンパク質を生じる。凝集を防ぐことが非常に望まれる。タンパク質の凝集は、活性の損失を生じるだけではなく、それらが免疫原性であり得るために、薬学的処方物を調製する場合にも問題となり得る。(Pinckardら、Clin Exp.Immunol.2:331−340(1967);Robbinsら、Diabetes 36:838−845(1987);Clelandら、Crit.Rev.Therappeutic Drug Carrier Systems 10:307−377(1993))。
【0076】
機能に必須である本発明のポリペプチド中のアミノ酸は、部位特異的変異誘発またはアラニンスキャン変異誘発(CunninghamおよびWells、Science 244:1081−1085(1989))のような、当該分野で公知の方法によって同定され得る。後者の手順は、分子中のそれぞれの残基に単一のアラニン変異を導入する。得られた変異体分子は、次いで、レセプター結合またはインビトロで、すなわち、インビトロ増殖アッセイのような、生物学的な活性について試験される。リガンド−レセプターの結合に重要な部位はまた、結晶化、核磁気共鳴、または光親和標識のような構造的な分析によっても決定され得る(Smithら、J.Mol.Biol.244:899−904(1992)およびde Vosら、Science 255:306−312(1992))。
【0077】
例えば、変異体は、保存的なアミノ酸の置換を作成することによって構築され得る。以下は、保存的な置換の例である:
【0078】
【化1】

。ムテインと呼ばれる変異体のサブセットは、中性のアミノ酸(一般的には、セリン)で置換された非ジスルフィド結合に関与するシステインを有するポリペプチドの基である。これらの変異体は、ネイティブTIAM2タンパク質よりも広い範囲の温度にわたって安定である。示されるように、変更は、好ましくは、主要ではない性質(例えば、タンパク質の折り畳みまたは活性に有意には影響を与えない保存的なアミノ酸置換)である。もちろん、当業者によって作成されるアミノ酸置換の数は、上記の因子を含む多くの因子に依存する。一般的に言うと、任意の所定のTIAM2ポリペプチドについての置換の数は、50、40、30、25、20、15、10、5、または3を超えない。変異体のコード配列は、ネイティブTIAM2ポリペプチドをコードする配列のインビトロでの変異誘発によって構築され得る。
【0079】
本明細書中で使用される場合は、用語「タンパク質」または「ポリペプチド」は、アミノ酸のポリマーをいい、そして生成物の特定の長さをいわない;従って、ペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチド、タンパク質、およびポリタンパク質、ならびにこれらのフラグメントは、この定義に含まれる。この用語はまた、タンパク質の発現後の改変(例えば、グリコシル化、アセチル化、リン酸化など)については言及しないか、またはこれらを排除する。例えば、1つ以上のアミノ酸のアナログ(例えば、非天然アミノ酸などを含む)を含有しているタンパク質、置換された結合を有するタンパク質、ならびに他の当該分野で公知の他の改変(天然に存在するもの、および天然には存在しないものの両方)が、この定義に含まれる。
【0080】
指定された核酸配列「に由来する」またはそれによって「コードされる(coded by)」またはそれによって「コードされる(encoded by)」ポリペプチドまたはタンパク質またはアミノ酸配列は、配列中にコードされるポリペプチドのアミノ酸配列、または一部が、少なくとも3〜5個の連続しているアミノ酸、およびより好ましくは少なくとも8〜10個のアミノ酸、そしてなおより好ましくは少なくとも11〜15個のアミノ酸から構成されるその一部に対して同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドをいうか、または配列中にコードされるポリペプチドを用いて免疫学的に同定が可能であるポリペプチドをいう。この用語はまた、指定された核酸配列から発現されるポリペプチドを含む。
【0081】
「精製された」および「単離された」は、ポリペプチドまたはヌクレオチド配列をいう場合には、同じ型の他の生物学的なマクロ分子の実質的な非存在下に、示された分子が存在することを意味する。用語「精製された」は、本明細書中で使用される場合には、存在する同じ型の生物学的なマクロ分子の、少なくとも75重量%、より好ましくは少なくとも85重量%、より好ましくはなお少なくとも95重量%、そして最も好ましくは少なくとも98重量%を意味する(しかし、水、緩衝液、および他の低分子(特に、1000未満の分子量を有する分子)が存在し得る)。
【0082】
本明細書中で開示されるTIAM2ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドのフラグメントもまた、本発明の範囲に含まれる。このようなフラグメントは、タンパク質の抗原性領域、または本明細書中に記載されるタンパク質の生物学的に機能性である領域をコードし得る。このようなフラグメントはまた、本明細書中に開示される融合タンパク質のポリペプチド成分をコードする。フラグメントはまた、配列番号8、9、および/または10とハイブリダイズし得るポリヌクレオチドを同定するためのプローブとしての使用に適切である。フラグメントは、約10塩基対から、配列番号8については3344塩基対であり、配列番号9については4590塩基対であり、そして配列番号10については4514塩基対である全長のポリヌクレオチドまでの長さの範囲であり得る。好ましいフラグメントは、配列番号8、9、または10については、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、200、250、300、350、400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、2100、2200、2300、2400、2500、2600、2700、2800、2900、3000、3100、3200、または3300塩基対;配列番号9または10については、3400、3500、3600、3700、3800、4000、4100、4200、4300、4400、4500、または4510塩基対;そして配列番号10については、4520、4550、4575、または4580塩基対である。特に好ましいフラグメントは、配列番号8のヌクレオチド1〜104を含む。
【0083】
ポリペプチドフラグメントは、変異体またはネイティブのT1AM2タンパク質のアミノ末端および/またはカルボキシル末端のアミノ酸欠失である。短縮されるアミノ酸の数は、このポリペプチドフラグメントが、所望の配列相同性、免疫学的活性または生物学的活性を示す限りは、重要ではない。好ましいフラグメントは、配列番号7、11、12、または13の10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、250、300、350、400、450、500、550、600または625アミノ酸;配列番号12または13の650、675、750、800、825、900、950、1000、1025、または1050アミノ酸;ならびに配列番号13の1060、1065、1070または1075アミノ酸である。免疫学的に重要なポリペプチドフラグメントは、例えば、ネイティブTIAM2タンパク質により共有される少なくとも1つのエピトープを含む。このようなTIAM2タンパク質は、5〜15アミノ酸長のみであり得る。フラグメントのアミノ酸配列の例としては、以下を含む:配列番号7、11、12、または13のアミノ酸番号1〜8(aa1〜aa8);配列番号7、11、12、または13のaa2〜aa9;配列番号7、11、12、または13のaa3〜aa10;配列番号7、11、12、または13のaa4〜aa11;配列番号7、11、12、または13のaa5〜aa12;配列番号7、11、12、または13のaa6〜aa13;配列番号7、11、12、または13のaa7〜aa14;配列番号7、11、12、または13のaa8〜aa15;配列番号7、11、12、または13のaa9〜aa16;配列番号7、11、12、または13のaa10〜aa17;配列番号7、11、12、または13のaa11〜aa18;配列番号7、11、12、または13のaa12〜aa19;配列番号7、11、12、または13のaa13〜aa20;配列番号7、11、12、または13のaa14〜aa21;配列番号7、11、12、または13のaa15〜aa22;配列番号7、11、12、または13のaa16〜aa23;配列番号7、11、12、または13のaa17〜aa24;配列番号7、11、12、または13のaa18〜aa25;配列番号7、11、12、または13のaa19〜aa26;配列番号7、11、12、または13のaa20〜aa27;配列番号7、11、12、または13のaa21〜aa28;配列番号7、11、12、または13のaa22〜aa29;配列番号7、11、12、または13のaa23〜aa30;配列番号7、11、12、または13のaa24〜aa31;配列番号7、11、12、または13のaa25〜aa32;配列番号7、11、12、または13のaa26〜aa33;配列番号7、11、12、または13のaa27〜aa34;配列番号7、11、12、または13のaa28〜aa35;配列番号7、11、12、または13のaa29〜aa36;配列番号7、11、12、または13のaa30〜aa37;配列番号7、11、12、または13のaa31〜aa38;配列番号7、11、12、または13のaa32〜aa39;配列番号7、11、12、または13のaa33〜aa40;配列番号7、11、12、または13のaa34〜aa41;配列番号7、11、12、または13のaa35〜aa42;配列番号7、11、12、または13のaa36〜aa43;配列番号7、11、12、または13のaa37〜aa44;配列番号7、11、12、または13のaa38〜aa45;配列番号7、11、12、または13のaa39〜aa46;配列番号7、11、12、または13のaa40〜aa47;配列番号7、11、12、または13のaa41〜aa48;配列番号7、11、12、または13のaa42〜aa49;配列番号7、11、12、または13のaa43〜aa50;配列番号7、11、12、または13のaa44〜aa51;配列番号7、11、12、または13のaa45〜aa52;配列番号7、11、12、または13のaa46〜aa53;配列番号7、11、12、または13のaa47〜aa54;配列番号7、11、12、または13のaa48〜aa55;配列番号7、11、12、または13のaa49〜aa56;配列番号7、11、12、または13のaa50〜aa57;配列番号7、11、12、または13のaa51〜aa58;配列番号7、11、12、または13のaa52〜aa59;配列番号7、11、12、または13のaa53〜aa60;配列番号7、11、12、または13のaa54〜aa61;配列番号7、11、12、または13のaa55〜aa62;配列番号7、11、12、または13のaa56〜aa63;配列番号7、11、12、または13のaa57〜aa64;配列番号7、11、12、または13のaa58〜aa65;配列番号7、11、12、または13のaa59〜aa66;配列番号7、11、12、または13のaa60〜aa67;配列番号7、11、12、または13のaa61〜aa68;配列番号7、11、12、または13のaa62〜aa69;配列番号7、11、12、または13のaa63〜aa70;配列番号7、11、12、または13のaa64〜aa71;配列番号7、11、12、または13のaa65〜aa72;配列番号7、11、12、または13のaa66〜aa73;配列番号7、11、12、または13のaa67〜aa74;配列番号7、11、12、または13のaa68〜aa75;配列番号7、11、12、または13のaa69〜aa76;配列番号7、11、12、または13のaa70〜aa77;配列番号7、11、12、または13のaa71〜aa78;配列番号7、11、12、または13のaa72〜aa79;配列番号7、11、12、または13のaa73〜aa80;配列番号7、11、12、または13のaa74〜aa81;配列番号7、11、12、または13のaa75〜aa82;配列番号7、11、12、または13のaa76〜aa83;配列番号7、11、12、または13のaa77〜aa84;配列番号7、11、12、または13のaa78〜aa84;配列番号7、11、12、または13のaa79〜aa86;配列番号7、11、12、または13のaa80〜aa87;配列番号7、11、12、または13のaa81〜aa88;配列番号7、11、12、または13のaa82〜aa89;配列番号7、11、12、または13のaa83〜aa90;配列番号7、11、12、または13のaa84〜aa91;配列番号7、11、12、または13のaa85〜aa92;配列番号7、11、12、または13のaa86〜aa93;配列番号7、11、12、または13のaa87〜aa94;配列番号7、11、12、または13のaa88〜aa95;配列番号7、11、12、または13のaa89〜aa96;配列番号7、11、12、または13のaa90〜aa97;配列番号7、11、12、または13のaa91〜aa98;配列番号7、11、12、または13のaa92〜aa99;配列番号7、11、12、または13のaa93〜aa100;配列番号7、11、12、または13のaa94〜aa101;配列番号7、11、12、または13のaa95〜aa102;配列番号7、11、12、または13のaa96〜aa103;配列番号7、11、12、または13のaa97〜aa104;配列番号7、11、12、または13のaa98〜aa105;配列番号7、11、12、または13のaa99〜aa106;配列番号7、11、または13のaa100〜aa107;配列番号7、11、12、または13のaa101〜aa108;配列番号7、11、12、または13のaa102〜aa109;配列番号7、11、12、または13のaa103〜aa110;配列番号7、11、12、または13のaa104〜aa111;配列番号7、11、12、または13のaa105〜aa112;配列番号7、11、12、または13のaa106〜aa113;配列番号7、11、12、または13のaa107〜aa114;配列番号7、11、12、または13のaa108〜aa115;配列番号7、11、12、または13のaa109〜aa116;配列番号7、11、12、または13のaa110〜aa117;配列番号7、11、12、または13のaa111〜aa118;配列番号7、11、12、または13のaa112〜aa119;配列番号7、11、12、または13のaa113〜aa120;配列番号7、11、12、または13のaa114〜aa121;配列番号7、11、12、または13のaa115〜aa122;配列番号7、11、12、または13のaa116〜aa123;配列番号7、11、12、または13のaa117〜aa124;配列番号7、11、12、または13のaa118〜aa125;配列番号7、11、12、または13のaa119〜aa126;配列番号7、11、12、または13のaa120〜aa127;配列番号7、11、12、または13のaa121〜aa128;配列番号7、11、12、または13のaa122〜aa129;配列番号7、11、12、または13のaa123〜aa130;配列番号7、11、12、または13のaa124〜aa131;配列番号7、11、12、または13のaa125〜aa132;配列番号7、11、12、または13のaa126〜aa133;配列番号7、11、12、または13のaa127〜aa134;配列番号7、11、12、または13のaa128〜aa135;配列番号7、11、12、または13のaa129〜aa136;配列番号7、11、12、または13のaa130〜aa137;配列番号7、11、12、または13のaa131〜aa138;配列番号7、11、12、または13のaa132〜aa139;配列番号7、11、12、または13のaa133〜aa140;配列番号7、11、12、または13のaa134〜aa141;配列番号7、11、12、または13のaa135〜aa142;配列番号7、11、12、または13のaa136〜aa143;配列番号7、11、12、または13のaa137〜aa144;配列番号7、11、12、または13のaa138〜aa145;配列番号7、11、12、または13のaa139〜aa146;配列番号7、11、12、または13のaa140〜aa147;配列番号7、11、12、または13のaa141〜aa148;配列番号7、11、12、または13のaa142〜aa149;配列番号7、11、12、または13のaa143〜aa150;配列番号7、11、12、または13のaa144〜aa151;配列番号7、11、12、または13のaa145〜aa152;配列番号7、11、12、または13のaa146〜aa153;配列番号7、11、12、または13のaa147〜aa154;配列番号7、11、12、または13のaa148〜aa155;配列番号7、11、12、または13のaa149〜aa156;配列番号7、11、12、または13のaa150〜aa157;配列番号7、11、12、または13のaa151〜aa158;配列番号7、11、12、または13のaa152〜aa159;配列番号7、11、12、または13のaa153〜aa160;配列番号7、11、12、または13のaa154〜aa161;配列番号7、11、12、または13のaa155〜aa162;配列番号7、11、12、または13のaa156〜aa163;配列番号7、11、12、または13のaa157〜aa164;配列番号7、11、12、または13のaa158〜aa165;配列番号7、11、12、または13のaa159〜aa166;配列番号7、11、12、または13のaa160〜aa167;配列番号7

、11、12、または13のaa161〜aa168;配列番号7、11、12、または13のaa162〜aa169;配列番号7、11、12、または13のaa163〜aa170;配列番号7、11、12、または13のaa164〜aa171;配列番号7、11、12、または13のaa165〜aa172;配列番号7、11、12、または13のaa166〜aa173;配列番号7、11、12、または13のaa167〜aa174;配列番号7、11、12、または13のaa168〜aa175;配列番号7、11、12、または13のaa169〜aa176;配列番号7、11、12、または13のaa170〜aa177;配列番号7、11、12、または13のaa171〜aa178;配列番号7、11、12、または13のaa172〜aa179;配列番号7、11、12、または13のaa173〜aa180;配列番号7、11、12、または13のaa174〜aa181;配列番号7、11、12、または13のaa175〜aa182;配列番号7、11、12、または13のaa176〜aa183;配列番号7、11、12、または13のaa177〜aa184;配列番号7、11、12、または13のaa178〜aa185;配列番号7、11、12、または13のaa179〜aa186;配列番号7、11、12、または13のaa180〜aa187;配列番号7、11、12、または13のaa181〜aa188;配列番号7、11、12、または13のaa182〜aa189;配列番号7、11、12、または13のaa183〜aa190;配列番号7、11、12、または13のaa184〜aa191;配列番号7、11、12、または13のaa185〜aa192;配列番号7、11、12、または13のaa186〜aa193;配列番号7、11、12、または13のaa187〜aa194;配列番号7、11、12、または13のaa188〜aa195;配列番号7、11、12、または13のaa189〜aa196;配列番号7、11、12、または13のaa190〜aa197;配列番号7、11、12、または13のaa191〜aa198;配列番号7、11、12、または13のaa192〜aa199;配列番号7、11、12、または13のaa193〜aa200;配列番号7、11、12、または13のaa194〜aa201;配列番号7、11、12、または13のaa195〜aa202;配列番号7、11、12、または13のaa196〜aa203;配列番号7、11、12、または13のaa197〜aa204;配列番号7、11、12、または13のaa198〜aa205;配列番号7、11、12、または13のaa199〜aa206;配列番号7、11、12、または13のaa200〜aa207;配列番号7、11、12、または13のaa201〜aa208;配列番号7、11、12、または13のaa202〜aa209;配列番号7、11、12、または13のaa203〜aa210;配列番号7、11、12、または13のaa204〜aa211;配列番号7、11、12、または13のaa205〜aa212;配列番号7、11、12、または13のaa206〜aa213;配列番号7、11、12、または13のaa207〜aa214;配列番号7、11、12、または13のaa208〜aa215;配列番号7、11、12、または13のaa209〜aa216;配列番号7、11、12、または13のaa210〜aa217;配列番号7、11、12、または13のaa211〜aa218;配列番号7、11、12、または13のaa212〜aa219;配列番号7、11、12、または13のaa213〜aa220;配列番号7、11、12、または13のaa214〜aa221;配列番号7、11、12、または13のaa215〜aa222;配列番号7、11、12、または13のaa216〜aa223;配列番号7、11、12、または13のaa217〜aa224;配列番号7、11、12、または13のaa218〜aa225;配列番号7、11、12、または13のaa219〜aa226;配列番号7、11、12、または13のaa220〜aa227;配列番号7、11、12、または13のaa221〜aa228;配列番号7、11、12、または13のaa222〜aa229;配列番号7、11、12、または13のaa223〜aa230;配列番号7、11、12、または13のaa224〜aa231;配列番号7、11、12、または13のaa225〜aa232;および配列番号7、11、12、または13のaa226〜aa233;配列番号7、11、12、または13のaa227〜aa234;配列番号7、11、12、または13のaa228〜aa235;配列番号7、11、12、または13のaa229〜aa236;配列番号7、11、12、または13のaa230〜aa237;配列番号7、11、12、または13のaa231〜aa238;配列番号7、11、12、または13のaa222〜aa239;配列番号7、11、12、または13のaa233〜aa240;配列番号7、11、12、または13のaa234〜aa41;配列番号7、11、12、または13のaa235〜aa242;配列番号7、11、12、または13のaa236〜aa243;配列番号7、11、12、または13のaa237〜aa244;配列番号7、11、12、または13のaa238〜aa245;配列番号7、11、12、または13のaa239〜aa246;配列番号7、11、12、または13のaa240〜aa247;配列番号7、11、12、または13のaa241〜aa248;配列番号7、11、12、または13のaa242〜aa249;配列番号7、11、12、または13のaa243〜aa250;配列番号7、11、12、または13のaa244〜aa251;配列番号7、11、12、または13のaa245〜aa252;配列番号7、11、12、または13のaa246〜aa253;配列番号7、11、12、または13のaa247〜aa254;配列番号7、11、12、または13のaa248〜aa255;配列番号7、11、12、または13のaa249〜aa256;配列番号7、11、12、または13のaa250〜aa257;配列番号7、11、12、または13のaa251〜aa258;配列番号7、11、12、または13のaa252〜aa259;配列番号7、11、12、または13のaa253〜aa260;配列番号7、11、12、または13のaa254〜aa261;配列番号7、11、12、または13のaa255〜aa262;配列番号7、11、12、または13のaa256〜aa263;配列番号7、11、12、または13のaa257〜aa264;配列番号7、11、12、または13のaa258〜aa265;配列番号7、11、121、または13のaa259〜aa266;配列番号7、11、12、または13のaa260〜aa267;配列番号7、11、12、または13のaa261〜aa268;配列番号7、11、12、または13のaa262〜aa269;配列番号7、11、12、または13のaa263〜aa270;配列番号7、11、12、または13のaa264〜aa271;配列番号7、11、12、または13のaa265〜aa272;配列番号7、11、12、または13のaa266〜aa273;配列番号7、11、12、または13のaa267〜aa274;配列番号7、11、12、または13のaa268〜aa275;配列番号7、11、12、または13のaa269〜aa276;配列番号7、11、12、または13のaa270〜aa277;配列番号7、11、12、または13のaa271〜aa278;配列番号7、11、12、または13のaa272〜aa279;配列番号7、11、12、または13のaa273〜aa280;配列番号7、11、12、または13のaa274〜aa281;配列番号7、11、12、または13のaa275〜aa282;配列番号7、11、12、または13のaa276〜aa283;配列番号7、11、12、または13のaa277〜aa284;配列番号7、11、12、または13のaa278〜aa284;配列番号7、11、12、または13のaa279〜aa286;配列番号7、11、12、または13のaa280〜aa287;配列番号7、11、12、または13のaa281〜aa288;配列番号7、11、12、または13のaa282〜aa289;配列番号7、11、12、または13;aa283〜aa290;配列番号7、11、12、または13のaa284〜aa291;配列番号7、11、12、または13のaa285〜aa292;配列番号7、11、12、または13のaa286〜aa293;配列番号7、11、12または13;aa287〜aa294;配列番号7、11、12、または13のaa288〜aa295;配列番号7、11、12、または13のaa289〜aa296;配列番号7、11、12、または13のaa290〜aa297;配列番号7、11、12、または13のaa291〜aa298;配列番号7、11、12、または13のaa292〜aa299;配列番号7、11、12、または13のaa293〜aa300;配列番号7、11、12、または13のaa294〜aa101;配列番号7、11、12、または13のaa295〜aa102;配列番号7、11、12、または13のaa296〜aa103;配列番号7、11、12、または13のaa297〜aa104;配列番号7、11、12、または13のaa298〜aa105;配列番号7、11、12、または13のaa299〜aa106;配列番号7、11、12、または13のaa300〜aa307;配列番号7、11、12、または13のaa301〜aa308;配列番号7、11、12、または13のaa302〜aa309;配列番号7、11、12、または13のaa303〜aa310;配列番号7のaa304〜aa311;配列番号7、11、12、または13のaa305〜aa312;配列番号7、11、12、または13のaa306〜aa313;配列番号7、11、12、または13のaa307〜aa314;配列番号7、11、12、または13のaa308〜aa315;配列番号7、11、12、または13のaa309〜aa316;配列番号7、11、12、または13のaa310〜aa317;配列番号7、11、12、または13のaa311〜aa318;配列番号7、11、12、または13のaa312〜aa319;配列番号7、11、12、または13のaa313〜aa320;配列番号7、11、12、または13のaa314〜aa321;配列番号7、11、12、または13のaa315〜aa322;配列番号7、11、12、または13のaa316〜aa323;配列番号7、11、12、または13のaa317〜aa324;配列番号7、11、12、または13のaa318〜aa325;配列番号7、11、12、または13のaa319〜aa326;配列番号7、11、12、または13;aa320〜aa327;配列番号7、11、12、または13のaa321〜aa328;配列番号7、11、12、または13のaa322〜aa329;配列番号7、11、12、または13のaa323〜aa330;配列番号7、11、12、または13のaa324〜aa331;配列番号7、11、12、または13のaa325〜aa332;配列番号7、11、12、または13の;aa326〜aa333;配列番号7、11、12、または13のaa327〜aa334;配列番号7、11、12、または13のaa328〜aa335;配列番号7、11、12、または13の;aa329〜aa336;配列番号7、11、12、または13のaa330〜aa337;配列番号7、11、12、または13のaa331〜aa338;配列番号

7、11、12、または13のaa332〜aa339;配列番号7、11、12、または13のaa333〜aa340;配列番号7、11、12、または13のaa334〜aa341;配列番号7、11、12、または13のaa335〜aa342;配列番号7、11、12、または13のaa336〜aa343;配列番号7、11、12、または13のaa337〜aa344;配列番号7、11、12、または13のaa338〜aa345;配列番号7、11、12、または13のaa339〜aa346;配列番号7、11、12、または13のaa340〜aa347;配列番号7、11、12、または13のaa341〜aa348;配列番号7、11、12、または13のaa342〜aa349;配列番号7、11、12、または13のaa343〜aa350;配列番号7、11、12、または13のaa344〜aa351;配列番号7、11、12、または13のaa345〜aa352;配列番号7、11、12、または13のaa346〜aa353;配列番号7、11、12、または13のaa347〜aa354;配列番号7、11、12、または13のaa348〜aa355;配列番号7、11、12、または13のaa349〜aa356;配列番号7、11、12、または13のaa350〜aa357;配列番号7、11、12、または13のaa351〜aa358;配列番号7、11、12、または13のaa352〜aa359;配列番号7、11、12、または13のaa353〜aa360;配列番号7、11、12、または13のaa354〜aa361;配列番号7、11、12、または13のaa355〜aa362;配列番号7、11、12、または13のaa356〜aa363;配列番号7、11、12、または13のaa357〜aa364;配列番号7、11、12、または13のaa358〜aa365;配列番号7、11、12、または13のaa359〜aa366;配列番号7、11、12、または13のaa360〜aa367;配列番号7、11、12、または13のaa361〜aa368;配列番号7、11、12、または13のaa362〜aa369;配列番号7、11、12、または13のaa363〜aa370;配列番号7、11、12、または13のaa364〜aa371;配列番号7、11、12、または13のaa365〜aa372;配列番号7、11、12、または13のaa366〜aa373;配列番号7、11、12、または13のaa367〜aa374;配列番号7、11、12、または13のaa368〜aa375;配列番号7、11、12、または13のaa369〜aa376;配列番号7、11、12、または13のaa370〜aa377;配列番号7、11、12、または13のaa371〜aa378;配列番号7、11、12、または13のaa372〜aa379;配列番号7、11、12、または13のaa373〜aa380;配列番号7、11、12、または13のaa374〜aa381;配列番号7、11、12、または13のaa375〜aa382;配列番号7、11、12、または13のaa376〜aa383;配列番号7、11、12、または13のaa377〜aa384;配列番号7、11、12、または13のaa378〜aa385;配列番号7、11、12、または13のaa379〜aa386;配列番号7、11、12、または13のaa380〜aa387;配列番号7、11、12、または13のaa381〜aa388;配列番号7、11、12、または13のaa382〜aa389;配列番号7、11、12、または13のaa383〜aa390;配列番号7、11、12、または13のaa384〜aa391;配列番号7、11、12、または13のaa385〜aa392;配列番号7、11、12、または13のaa386〜aa393;配列番号7、11、12、または13のaa387〜aa394;配列番号7、11、12、または13のaa388〜aa395;配列番号7、11、12、または13のaa389〜aa396;配列番号7、11、12、または13のaa390〜aa397;配列番号7、11、12、または13のaa391〜aa398;配列番号7、11、12、または13のaa392〜aa399;配列番号7、11、12、または13のaa393〜aa400;配列番号7、11、12、または13のaa394〜aa401;配列番号7、11、12、または13のaa395〜aa402;配列番号7、11、12、または13のaa396〜aa403;配列番号7、11、12、または13のaa397〜aa404;配列番号7、11、12、または13;aa398〜aa405;配列番号7、11、12、または13のaa399〜aa406;配列番号7、11、12、または13のaa400〜aa407;配列番号7、11、12、または13のaa401〜aa408;配列番号7、11、12、または13のaa402〜aa409;配列番号7、11、12、または13;aa403〜aa410;配列番号7、11、12、または13のaa404〜aa411;配列番号7、11、12、または13のaa405〜aa412;配列番号7、11、12、または13のaa406〜aa413;配列番号7、11、12、または13のaa407〜aa414;配列番号7、11、12、または13のaa408〜aa415;配列番号7、11、12、または13のaa409〜aa416;配列番号7、11、12、または13のaa410〜aa417;配列番号7、11、12、または13の、aa411〜aa418;配列番号7、11、12、または13のaa412〜aa419;配列番号7、11、12、または13のaa413〜aa420;配列番号7、11、12、または13のaa414〜aa421;配列番号7、11、12、または13のaa415〜aa422;配列番号7、11、12、または13のaa416〜aa423;配列番号7、11、12、または13のaa417〜aa424;配列番号7、11、12、または13のaa418〜aa425;配列番号7、11、12、または13のaa419〜aa426;配列番号7、11、12、または13のaa420〜aa427;配列番号7、11、12、または13;aa421〜aa428;配列番号7、11、12、または13のaa422〜aa429;配列番号7、11、12、または13のaa423〜aa430;配列番号7、11、12、または13のaa424〜aa431;配列番号7、11、12、または13のaa425〜aa432;配列番号7、11、12、または13のaa426〜aa433;配列番号7、11、12、または13のaa427〜aa434;配列番号7、11、12、または13のaa428〜aa435;配列番号7、11、12、または13のaa429〜aa436;配列番号7、11、12、または13のaa430〜aa437;配列番号7、11、12、または13のaa431〜aa438;配列番号7、11、12、または13のaa432〜aa439;配列番号7、11、12、または13のaa433〜aa440;配列番号7、11、12、または13のaa434〜aa441;配列番号7、11、12、または13のaa435〜aa442;配列番号7、11、12、または13のaa436〜aa443;配列番号7、11、12、または13のaa437〜aa444;配列番号7、11、12、または13のaa438〜aa445;配列番号7、11、12、または13のaa439〜aa446;配列番号7、11、12、または13のaa440〜aa447;配列番号7、11、12、または13のaa441〜aa448;配列番号7、11、12、または13のaa442〜aa449;配列番号7、11、12、または13のaa443〜aa450;配列番号7、11、12、または13のaa444〜aa451;配列番号7、11、12、または13のaa445〜aa452;配列番号7、11、12、または13のaa446〜aa453;配列番号7、11、12、または13のaa447〜aa454;配列番号7、11、12、または13のaa448〜aa455;配列番号7、11、12、または13のaa449〜aa456;配列番号7、11、12、または13のaa450〜aa457;配列番号7、11、12、または13のaa451〜aa458;配列番号7、11、12、または13のaa452〜aa459;配列番号7、11、12、または13のaa453〜aa460;配列番号7、11、12、または13のaa454〜aa461;配列番号7、11、12、または13のaa455〜aa462;配列番号7、11、12、または13のaa456〜aa463;配列番号7、11、12、または13のaa457〜aa464;配列番号7、11、12、または13のaa458〜aa465;配列番号7、11、12、または13のaa459〜aa466;配列番号7、11、12、または13のaa460〜aa467;配列番号7、11、12、または13のaa461〜aa468;配列番号7、11、12、または13のaa462〜aa469;配列番号7、11、12、または13のaa463〜aa470;配列番号7、11、12、または13のaa464〜aa471;配列番号7、11、12、または13のaa465〜aa472;配列番号7、11、12、または13のaa466〜aa473;配列番号7、11、12、または13のaa467〜aa474;配列番号7、11、12、または13のaa468〜aa475;配列番号7、11、12、または13のaa469〜aa476;配列番号7、11、12、または13のaa470〜aa477;配列番号7、11、12、または13のaa471〜aa478;配列番号7、11、12、または13のaa472〜aa479;配列番号7、11、12、または13のaa473〜aa480;配列番号7、11、12、または13のaa474〜aa481;配列番号7、11、17、または13のaa475〜aa482;配列番号7、11、12、または13のaa476〜aa483;配列番号7、11、12、または13のaa477〜aa484;配列番号7、11、12、または13のaa478〜aa484;配列番号7、11、12、または13のaa479〜aa486;配列番号7、11、12、または13のaa480〜aa487;配列番号7、11、12、または13のaa481〜aa488;配列番号7、11、12または13のaa482〜aa489;配列番号7、11、12、または13のaa483〜aa490;配列番号7、11、12、または13のaa484〜aa491;配列番号7、11、12、または13のaa485〜aa492;配列番号7、11、12、または13のaa486〜aa493;配列番号7、11、12、または13のaa487〜aa494;配列番号7、11、12、または13のaa488〜aa495;配列番号7、11、12、または13のaa489〜aa496;配列番号7、11、12、または13のaa490〜aa497;配列番号7、11、12、または13のaa491〜aa498;配列番号7、11、12、または13のaa492〜aa499;配列番号7、11、12、または13のaa493〜aa500;配列番号7、11、12、または13のaa494〜aa501;配列番号7、11、12、または13のaa495〜aa502;配列番号7、11、12、または13のaa496〜aa503;配列番号7、11、12、または13のaa497〜aa504;配列番号7、11、12、または13のaa498〜aa505;配列番号7、11、12、または13のaa499〜aa506;配列番号7、11、12、または13のaa500〜aa507;配列番号7、11、12、または13のaa501〜aa508;配列番号7、11、12、または13のaa502〜a

a509;配列番号7、11、12、または13のaa503〜aa510;配列番号7、11、12、または13のaa504〜aa511;配列番号7、11、12、または13のaa505〜aa512;配列番号7、11、12、または13のaa506〜aa513;配列番号7、11、12、または13のaa507〜aa514;配列番号7、11、12、または13のaa508〜aa515;配列番号7、11、12、または13のaa509〜aa516;配列番号7、11、12、または13のaa510〜aa517;配列番号7、11、12、または13のaa511〜aa518;配列番号7、11、12、または13のaa512〜aa519;配列番号7、11、12、または13のaa513〜aa520;配列番号7、11、12、または13のaa514〜aa521;配列番号7、11、12、または13のaa515〜aa522;配列番号7、11、12、または13のaa516〜aa523;配列番号7、11、12、または13のaa517〜aa524;配列番号7、11、12、または13のaa518〜aa525;配列番号7、11、12、または13のaa519〜aa526;配列番号7、11、12、または13のaa520〜aa527;配列番号7、11、12、または13のaa521〜aa528;配列番号7、11、12、または13のaa522〜aa529;配列番号7、11、12、または13のaa523〜aa530;配列番号7、11、12、または13のaa524〜aa531;配列番号7、11、12、または13のaa525〜aa532;配列番号7、11、12、または13のaa526〜aa533;配列番号7、11、12、または13のaa527〜aa534;配列番号7、11、12、または13のaa528〜aa535;配列番号7、11、12、または13のaa529〜aa536;配列番号7、11、12、または13のaa530〜aa537;配列番号7、11、12、または13のaa531〜aa538;配列番号7、11、12、または13のaa532〜aa539;配列番号7、11、12、または13のaa533〜aa540;配列番号7、11、12、または13の;aa534〜aa541;配列番号7、11、12、または13の;aa535〜aa542;配列番号7、11、12、または13のaa536〜aa543;配列番号7、11、12、または13のaa537〜aa544;配列番号7、11、12、または13のaa538〜aa545;配列番号7、11、12、または13のaa539〜aa546;配列番号7、11、12、または13のaa540〜aa547;配列番号7、11、12、または13のaa541〜aa548;配列番号7、11、12、または13のaa542〜aa549;配列番号7、11、12、または13のaa543〜aa550;配列番号7、11、12、または13のaa544〜aa551;配列番号7、11、12、または13のaa545〜aa552;配列番号7、11、12、または13のaa546〜aa553;配列番号7、11、12、または13のaa547〜aa554;配列番号7、11、12、または13のaa548〜aa555;配列番号7、11、12、または13のaa549〜aa556;配列番号7、11、12、または13のaa550〜aa557;配列番号7、11、12、または13のaa551〜aa558;配列番号7、11、12、または13のaa552〜aa559;配列番号7、11、12、または13のaa553〜aa560;配列番号7、11、12、または13のaa554〜aa561;配列番号7、11、12、または13のaa555〜aa562;配列番号7、11、12、または13のaa556〜aa563;配列番号7、11、12、または13のaa557〜aa564;配列番号7、11、12、または13のaa558〜aa565;配列番号7、11、12、または13のaa559〜aa566;配列番号7、11、12、または13のaa560〜aa567;配列番号7、11、12、または13のaa561〜aa568;配列番号7、11、12、または13のaa562〜aa569;配列番号7、11、12、または13のaa563〜aa570;配列番号7、11、12、または13のaa564〜aa571;配列番号7、11、12、または13のaa565〜aa572;配列番号7、11、12、または13のaa566〜aa573;配列番号7、11、12、または13のaa567〜aa574;配列番号7、11、12、または13のaa568〜aa575;配列番号7、11、12、または13のaa569〜aa576;配列番号7、11、12、または13のaa570〜aa577;配列番号7、11、12、または13のaa571〜aa578;配列番号7、11、12、または13のaa572〜aa579;配列番号7、11、12、または13のaa573〜aa580;配列番号7、11、12、または13の;aa574〜aa581;配列番号7、11、12、または13のaa575〜aa582;配列番号7、11、12、または13のaa576〜aa583;配列番号7、11、12、または13のaa577〜aa584;配列番号7、11、12、または13のaa578〜aa585;配列番号7、11、12、または13のaa579〜aa586;配列番号7、11、12、または13のaa580〜aa587;配列番号7、11、12、または13のaa581〜aa588;配列番号7、11、12、または13のaa582〜aa589;配列番号7、11、12、または13のaa583〜aa590;配列番号7、11、12、または13のaa584〜aa591;配列番号7、11、12、または13のaa585〜aa592;配列番号7、11、12、または13のaa586〜aa593;配列番号7、11、12、または13のaa587〜aa594;配列番号7、11、12、または13のaa588〜aa595;配列番号7、11、12、または13のaa589〜aa596;配列番号7、11、12、または13のaa590〜aa597;配列番号7、11、12、または13のaa591〜aa598;配列番号7、11、12、または13のaa592〜aa599;配列番号7、11、12、または13のaa593〜aa600;配列番号7、11、12、または13のaa594〜aa601;配列番号7、11、12、または13のaa595〜aa602;配列番号7、11、12、または13のaa596〜aa603;配列番号7、11、12、または13のaa597〜aa604;配列番号7、11、12、または13のaa598〜aa605;配列番号7、11、12、または13の;aa599〜aa606;配列番号7、11、12、または13のaa600〜aa607;配列番号7、11、12、または13のaa601〜aa608;配列番号7、11、12、または13のaa602〜aa609;配列番号7、11、12、または13のaa603〜aa610;配列番号7、11、12、または13のaa604〜aa611;配列番号7、11、12、または13のaa605〜aa612;配列番号7、11、12、または13のaa606〜aa613;配列番号7、11、12、または13のaa607〜aa614;配列番号7、11、12、または13のaa608〜aa615;配列番号7、11、12、または13のaa609〜aa616;配列番号7、11、12、または13のaa610〜aa617;配列番号7、11、12、または13のaa611〜aa618;配列番号7、11、12、または13のaa612〜aa619;配列番号7、11、12、または13のaa613〜aa620;配列番号7、11、12、または13のaa614〜aa621;配列番号7、11、12、または13のaa615〜aa622;配列番号7、11、12、または13のaa616〜aa623;配列番号7、11、12、または13のaa617〜aa624;配列番号7、11、12、または13のaa618〜aa625;配列番号7、11、12、または13のaa619〜aa626;配列番号12または13のaa620〜aa627;配列番号12または13のaa621〜aa628;配列番号12または13のaa622〜aa629;配列番号12または13のaa623〜aa630;配列番号12または13のaa624〜aa631;配列番号12または13のaa625〜aa632;配列番号12または13のaa626〜aa633;配列番号12または13のaa627〜aa634;配列番号12または13のaa628〜aa635;配列番号12または13のaa629〜aa636;配列番号12または13のaa630〜aa637;配列番号12または13のaa631〜aa638;配列番号12または13のaa632〜aa639;配列番号12または13のaa633〜aa640;配列番号12または13のaa634〜aa641;配列番号12または13のaa635〜aa642;配列番号12または13のaa636〜aa643;配列番号12または13のaa637〜aa644;配列番号12または13のaa638〜aa645;配列番号12または13のaa639〜aa646;配列番号12または13のaa640〜aa647;配列番号12または13のaa641〜aa648;配列番号12または13のaa642〜aa649;配列番号12または13のaa643〜aa650;配列番号12または13のaa644〜aa651;配列番号12または13のaa645〜aa652;配列番号12または13のaa646〜aa653;配列番号12または13のaa647〜aa654;配列番号12または13のaa648〜aa655;配列番号12または13のaa649〜aa656;配列番号12または13のaa650〜aa657;配列番号12または13のaa651〜aa658;配列番号12または13のaa652〜aa659;配列番号12または13のaa653〜aa660;配列番号12または13のaa654〜aa661;配列番号12または13のaa655〜aa662;配列番号12または13のaa656〜aa663;配列番号12または13のaa657〜aa664;配列番号12または13のaa658〜aa665;配列番号12または13のaa659〜aa666;配列番号12または13のaa660〜aa667;配列番号12または13のaa661〜aa668;配列番号12または13のaa662〜aa669;配列番号12または13のaa663〜aa670;配列番号12または13のaa664〜aa671;配列番号12または13のaa665〜aa672;配列番号12または13のaa666〜aa673;配列番号12または13のaa667〜aa674;配列番号12または13のaa668〜aa675;配列番号12または13のaa669〜aa676;配列番号12または13のaa670〜aa677;配列番号12または13のaa671〜aa678;配列番号12または13のaa672〜aa679;配列番号12または13のaa673〜aa680;配列番号12または13のaa674〜aa681;配列番号12または13のaa675〜aa682;配列番号12または13のaa676〜aa683;配列番号12または13のaa677〜aa684;配列番号12または13のaa678〜aa684;配列番号12または13のaa679〜aa686;配列番号12または13のaa680〜aa687;配列番号12または13のaa681〜aa688;配列番号12または13のaa682〜aa689;配列番号12または13のaa683〜aa690;配列番号12または13のaa684〜aa691;配列番号12または13のaa685〜aa692;配列番号12または13のaa686〜

aa693;配列番号12または13のaa687〜aa694;配列番号12または13のaa688〜aa695;配列番号12または13のaa689〜aa696;配列番号12または13のaa690〜aa697;配列番号12または13のaa691〜aa698;配列番号12または13のaa692〜aa699;配列番号12または13のaa693〜aa700;配列番号12または13のaa694〜aa701;配列番号12または13のaa695〜aa702;配列番号12または13のaa696〜aa703;配列番号12または13のaa697〜aa704;配列番号12または13のaa698〜aa705;配列番号12または13のaa699〜aa706;配列番号12または13のaa700〜aa707;配列番号12または13のaa701〜aa708;配列番号12または13のaa702〜aa709;配列番号12または13のaa703〜aa710;配列番号12または13のaa704〜aa711;配列番号12または13のaa705〜aa712;配列番号12または13のaa76〜aa713;配列番号12または13のaa707〜aa714;配列番号12または13のaa708〜aa715;配列番号12または13のaa709〜aa716;配列番号12または13のaa710〜aa717;配列番号12または13のaa711〜aa718;配列番号12または13のaa712〜aa719;配列番号12または13のaa713〜aa720;配列番号12または13のaa714〜aa721;配列番号12または13のaa715〜aa722;配列番号12または13のaa716〜aa723;配列番号12または13のaa717〜aa724;配列番号12または13のaa718〜aa725;配列番号12または13のaa719〜aa726;配列番号12または13のaa720〜aa727;配列番号12または13のaa721〜aa728;配列番号12または13のaa722〜aa729;配列番号12または13のaa723〜aa730;配列番号12または13のaa724〜aa731;配列番号12または13のaa725〜aa732;配列番号12または13のaa726〜aa733;配列番号12または13のaa727〜aa734;配列番号12または13のaa728〜aa735;配列番号12または13のaa729〜aa736;配列番号12または13のaa730〜aa737;配列番号12または13のaa731〜aa738;配列番号12または13のaa732〜aa739;配列番号12または13のaa733〜aa740;配列番号12または13のaa734〜aa741;配列番号12または13のaa735〜aa742;配列番号12または13のaa736〜aa743;配列番号12または13のaa737〜aa744;配列番号12または13のaa738〜aa745;配列番号12または13のaa739〜aa746;配列番号12または13のaa740〜aa747;配列番号12または13のaa741〜aa748;配列番号12または13のaa742〜aa749;配列番号12または13のaa743〜aa750;配列番号12または13のaa744〜aa751;配列番号12または13のaa745〜aa752;配列番号12または13のaa746〜aa753;配列番号12または13のaa747〜aa754;配列番号12または13のaa748〜aa755;配列番号12または13のaa749〜aa756;配列番号12または13のaa750〜aa757;配列番号12または13のaa751〜aa758;配列番号12または13のaa752〜aa759;配列番号12または13のaa753〜aa760;配列番号12または13のaa754〜aa761;配列番号12または13のaa755〜aa762;配列番号12または13のaa756〜aa763;配列番号12または13のaa757〜aa764;配列番号12または13のaa758〜aa765;配列番号12または13のaa759〜aa766;配列番号12または13のaa760〜aa767;配列番号12または13のaa761〜aa768;配列番号12または13のaa762〜aa769;配列番号12または13のaa763〜aa770;配列番号12または13のaa764〜aa771;配列番号12または13のaa765〜aa772;配列番号12または13のaa766〜aa773;配列番号12または13のaa767〜aa774;配列番号12または13のaa768〜aa775;配列番号12または13のaa769〜aa776;配列番号12または13のaa770〜aa777;配列番号12または13のaa771〜aa778;配列番号12または13のaa772〜aa779;配列番号12または13のaa773〜aa780;配列番号12または13;an774〜aa781;配列番号12または13のaa775〜aa782;配列番号12または13のaa776〜aa783;配列番号12または13のaa777〜aa784;配列番号12または13のaa778〜aa784;配列番号12または13のaa779〜aa786;配列番号12または13のaa780〜aa787;配列番号12または13のaa781〜aa788;配列番号12または13のaa782〜aa789;配列番号12または13のaa783〜aa790;配列番号12または13のaa784〜aa791;配列番号12または13のaa785〜aa792;配列番号12または13のaa786〜aa793;配列番号12または13のaa787〜aa794;配列番号12または13のaa788〜aa795;配列番号12または13のaa789〜aa796;配列番号12または13のaa790〜aa797;配列番号12または13のaa791〜aa798;配列番号12または13のaa792〜aa799;配列番号12または13のaa793〜aa800;配列番号12または13のaa794〜aa801;配列番号12または13のaa795〜aa802;配列番号12または13のaa796〜aa803;配列番号12または13のaa797〜aa804;配列番号12または13のaa798〜aa805;配列番号12または13のaa799〜aa806;配列番号12または13のaa800〜aa807;配列番号12または13のaa801〜aa808;配列番号12または13のaa802〜aa809;配列番号12または13のaa803〜aa810;配列番号12または13のaa804〜aa811;配列番号12または13のaa805〜aa812;配列番号12または13のaa806〜aa813;配列番号12または13のaa807〜aa814;配列番号12または13のaa808〜aa815;配列番号12または13のaa809〜aa816;配列番号12または13のaa810〜aa817;配列番号12または13のaa811〜aa818;配列番号12または13のaa812〜aa819;配列番号12または13のaa813〜aa820;配列番号12または13のaa814〜aa821;配列番号12または13のaa815〜aa822;配列番号12または13のaa816〜aa823;配列番号12または13のaa817〜aa824;配列番号12または13のaa818〜aa825;配列番号12または13のaa819〜aa826;配列番号12または13のaa820〜aa827;配列番号12または13のaa821〜aa828;配列番号12または13のaa822〜aa829;配列番号12または13のaa823〜aa830;配列番号12または13のaa824〜aa831;配列番号12または13のaa825〜aa832;配列番号12または13のaa826〜aa833;配列番号12または13のaa827〜aa834;配列番号12または13のaa828〜aa835;配列番号12または13のaa829〜aa836;配列番号12または13のaa830〜aa837;配列番号12または13のaa831〜aa838;配列番号12または13のaa832〜aa839;配列番号12または13のaa833〜aa840;配列番号12または13のaa834〜aa841;配列番号12または13のaa835〜aa842;配列番号12または13のaa836〜aa843;配列番号12または13のaa837〜aa844;配列番号12または13のaa838〜aa845;配列番号12または13のaa839〜aa846;配列番号12または13のaa840〜aa847;配列番号12または13のaa841〜aa848;配列番号12または13のaa842〜aa849;配列番号12または13のaa843〜aa850;配列番号12または13のaa844〜aa851;配列番号12または13のaa845〜aa852;配列番号12または13のaa846〜aa853;配列番号12または13のaa847〜aa854;配列番号12または13のaa848〜aa855;配列番号12または13のaa849〜aa856;配列番号12または13のaa850〜aa857;配列番号12または13のaa851〜aa858;配列番号12または13のaa852〜aa859;配列番号12または13のaa853〜aa860;配列番号12または13のaa854〜aa861;配列番号12または13のan855〜aa862;配列番号12または13のaa856〜aa863;配列番号12または13のaa857〜aa864;配列番号12または13のaa858〜aa865;配列番号12または13のaa859〜aa866;配列番号12または13のaa860〜aa867;配列番号12または13のaa861〜aa868;配列番号12または13のaa862〜aa869;配列番号12または13のaa863〜aa870;配列番号12または13のaa864〜aa871;配列番号12または13のaa865〜aa872;配列番号12または13のaa866〜aa873;配列番号12または13のaa867〜aa874;配列番号12または13のaa868〜aa875;配列番号12または13のaa869〜aa876;配列番号12または13のaa870〜aa877;配列番号12または13のaa871〜aa878;配列番号12または13のaa872〜aa879;配列番号12または13のaa873〜aa880;配列番号12または13のaa874〜aa881;配列番号12または13のaa875〜aa882;配列番号12または13のaa876〜aa883;配列番号12または13のaa877〜aa884;配列番号12または13のaa878〜aa884;配列番号12または13のaa879〜aa886;配列番号12または13のaa880〜aa887;配列番号12または13のaa881〜aa888;配列番号12または13のaa882〜aa889;配列番号12または13のaa883〜aa890;配列番号12または13のaa884〜aa891;配列番号12または13のaa885〜aa892;配列番号12または13のaa886〜aa893;配列番号12または13のaa887〜aa894;配列番号12または13のaa888〜aa895;配列番号12または13のaa889〜aa896;配列番号12または13のaa890〜aa897;配列番号12または13のaa891〜aa898;配列番号12または13のaa892〜aa899;配列番号12または13のaa893〜aa900;配列番号12または13のaa894〜aa901;配列番号12または13のaa895〜aa902;配列番号12または13のaa896〜aa903;配列番号12または13のaa897〜aa904;配列番号12または13のaa898〜aa905;配列番号12または13のaa899〜aa906;配列番号

12または13のaa900〜aa907;配列番号12または13のaa901〜aa908;配列番号12または13のaa902〜aa909;配列番号12または13のaa903〜aa910;配列番号12または13のaa904〜aa911;配列番号12または13のaa905〜aa912;配列番号12または13のaa906〜aa913;配列番号12または13のaa907〜aa914;配列番号12または13のaa908〜aa915;配列番号12または13のaa909〜aa916;配列番号12または13のaa910〜aa917;配列番号12または13のaa911〜aa918;配列番号12または13のaa912〜aa919;配列番号12または13のaa913〜aa920;配列番号12または13のaa914〜aa921;配列番号12または13のaa915〜aa922;配列番号12または13のaa916〜aa923;配列番号12または13のaa917〜aa924;配列番号12または13のaa918〜aa925;配列番号12または13のaa919〜aa926;配列番号12または13のaa920〜aa927;配列番号12または13のaa921〜aa928;配列番号12または13のaa922〜aa929;配列番号12または13のaa923〜aa930;配列番号12または13のaa924〜aa931;配列番号12または13のaa925〜aa932;配列番号12または13のaa926〜aa933;配列番号12または13のaa927〜aa934;配列番号12または13のaa928〜aa935;配列番号12または13のaa929〜aa936;配列番号12または13のaa930〜aa937;配列番号12または13のaa931〜aa938;配列番号12または13のaa932〜aa939;配列番号12または13のaa933〜aa940;配列番号12または13のaa934〜aa941;配列番号12または13のaa935〜aa942;配列番号12または13のaa936〜aa943;配列番号12または13のaa937〜aa944;配列番号12または13のaa938〜aa945;配列番号12または13のaa939〜aa946;配列番号12または13のaa940〜aa947;配列番号12または13のaa941〜aa948;配列番号12または13のaa942〜aa949;配列番号12または13のaa943〜aa950;配列番号12または13のaa944〜aa951;配列番号12または13のaa945〜aa952;配列番号12または13のaa946〜aa953;配列番号12または13のaa947〜aa954;配列番号12または13のaa948〜aa955;配列番号12または13のaa949〜aa956;配列番号12または13のaa950〜aa957;配列番号12または13のaa951〜aa958;配列番号12または13のaa952〜aa959;配列番号12または13のaa953〜aa960;配列番号12または13のaa954〜aa961;配列番号12または13のaa955〜aa962;配列番号12または13のaa956〜aa963;配列番号12または13のaa957〜aa964;配列番号12または13のaa958〜aa965;配列番号12または13のaa959〜aa966;配列番号12または13のaa960〜aa967;配列番号12または13のaa961〜aa968;配列番号12または13のaa962〜aa969;配列番号12または13のaa963〜aa970;配列番号12または13のaa964〜aa971;配列番号12または13のaa965〜aa972;配列番号12または13のaa966〜aa973;配列番号12または13のaa967〜aa974;配列番号12または13のaa968〜aa975;配列番号12または13のaa969〜aa976;配列番号12または13のaa970〜aa977;配列番号12または13のaa971〜aa978;配列番号12または13のaa972〜aa979;配列番号12または13のaa973〜aa980;配列番号12または13のaa974〜aa981;配列番号12または13のaa975〜aa982;配列番号12または13のaa976〜aa983;配列番号12または13のaa977〜aa984;配列番号12または13のaa978〜aa984;配列番号12または13のaa979〜aa986;配列番号12または13のaa980〜aa987;配列番号12または13のaa981〜aa988;配列番号12または13のaa982〜aa989;配列番号12または13のaa983〜aa990;配列番号12または13のaa984〜aa991;配列番号12または13のaa985〜aa992;配列番号12または13のaa986〜aa993;配列番号12または13のaa987〜aa994;配列番号12または13のaa988〜aa995;配列番号12または13のaa989〜aa996;配列番号12または13のaa990〜aa997;配列番号12または13のaa991〜aa998;配列番号12または13のaa992〜aa999;配列番号12または13のaa993〜aa1000;配列番号12または13のaa994〜aa1001;配列番号12または13のaa995〜aa1002;配列番号12または13のaa996〜aa1003;配列番号12または13のaa997〜aa1004;配列番号12または13のaa998〜aa1005;配列番号12または13のaa999〜aa1006;配列番号12または13のaa1000〜aa1007;配列番号12または13のaa1001〜aa1008;配列番号12または13のaa1002〜aa1009;配列番号12または13のaa1003〜aa1010;配列番号12または13のaa1004〜aa1011;配列番号12または13のaa1005〜aa1012;配列番号12または13のaa1006〜aa1013;配列番号12または13のaa1007〜aa1014;配列番号12または13のaa1008〜aa1015;配列番号12または13のaa1009〜aa1016;配列番号12または13のaa1010〜aa1017;配列番号12または13のaa1011〜aa1018;配列番号12または13のaa1012〜aa1019;配列番号12または13のaa1013〜aa1020;配列番号12または13のaa1014〜aa1021;配列番号12または13のaa1015〜aa1022;配列番号12または13のaa1016〜aa1023;配列番号12または13のaa1017〜aa1024;配列番号12または13のaa1018〜aa1025;配列番号12または13のaa1019〜aa1026;配列番号12または13のaa1020〜aa1027;配列番号12または13のaa1021〜aa1028;配列番号12または13のaa1022〜aa1029;配列番号12または13のaa1023〜aa1030;配列番号12または13のaa1024〜aa1031;配列番号12または13のaa1025〜aa1032;配列番号12または13のaa1026〜aa1033;配列番号12または13のaa1027〜aa1034;配列番号12または13のaa1028〜aa1035;配列番号12または13のaa1029〜aa1036;配列番号12または13のaa1030〜aa1037;配列番号12または13のaa1031〜aa1038;配列番号12または13のaa1032〜aa1039;配列番号12または13のaa1033〜aa1040;配列番号12または13のaa1034〜aa1041;配列番号12または13のaa1035〜aa1042;配列番号12または13のaa1036〜aa1043;配列番号12または13のaa1037〜aa1044;配列番号12または13のaa1038〜aa1045;配列番号12または13のaa1039〜aa1046;配列番号12または13のaa1040〜aa1047;配列番号12または13のaa1041〜aa1048;配列番号12または13のaa1042〜aa1049;配列番号12または13のaa1043〜aa1050;配列番号12または13のaa1044〜aa1051;配列番号12または13のaa1045〜aa1052;配列番号12または13のaa1046〜aa1053;配列番号12または13のaa1047〜aa1054;配列番号13のaa1048〜aa1055;配列番号13のaa1049〜aa1056;配列番号13のaa1050〜aa1057;配列番号13のaa1051〜aa1058;配列番号13のaa1052〜aa1059;配列番号13のaa1053〜aa1060;配列番号13のaa1054〜aa1061;配列番号13のaa1055〜aa1062;配列番号13のaa1056〜aa1063;配列番号13のaa1057〜aa1064;配列番号13のaa1058〜aa1065;配列番号13のaa1059〜aa1066;配列番号13のaa1060〜aa1067;配列番号13のaa1061〜aa1068;配列番号13のaa1062〜aa1069;配列番号13のaa1063〜aa1070;配列番号13のaa1064〜aa1071;配列番号13のaa1065〜aa1072;配列番号13のaa1066〜aa1073;配列番号13のaa1067〜aa1074;配列番号13のaa1068〜aa1075;配列番号13のaa1069〜aa1076;配列番号13のaa1070〜aa1077;ならびに配列番号13のaa1071〜aa1078。フラグメントのコード配列は、変異体またはネイティブのTIAM2タンパク質コード配列由来の不必要なヌクレオチドを切断することにより構築され得る。
【0084】
融合物は、末端のいずれか、または両方でさらなるアミノ酸を有する、フラグメント、変異体、またはネイティブTIAM2タンパク質である。さらなるアミノ酸配列は、一般的には、ネイティブTIAM2ポリペプチド中に見出される配列と相同ではない。さらなるアミノ酸残基は、例えば、ポリペプチドの発現、検出、または活性を促進し得る。さらなるアミノ酸配列はまた、TIAM2タンパク質の多量体を構築するためのリンカーとして使用され得る。全ての融合ポリペプチドは、所望される配列相同性、免疫学的活性、または生物学的活性を示す。組換えTIAM2融合タンパク質が、好ましい細胞系であるバキュロウイルスを使用して産生され得る。
【0085】
移入ベクター中にTIAM2 DNA配列を挿入した後、ベクターおよび野生型のウイルスのゲノムが、昆虫宿主細胞中にトランスフェクトされる。ここで、ベクターおよびウイルスゲノムが、組換えされる。パッケージされた組換えウイルスが発現され、そして組換えプラークが同定されそして精製される。バキュロウイルス/昆虫細胞の発現系についての材料および方法は、とりわけ、Invitrogen、San Diego CA(「MaxBac」キット)から、キット形態で市販されている。これらの技術は、一般的には、当業者に公知であり、そしてSummersおよびSmith、Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No.1555(1987)に十分に記載されている。
【0086】
バキュロウイルスのゲノム中へのタンパク質をコードするDNA配列の挿入の前に、プロモーター、リーダー(所望される場合)、目的のコード配列、および転写終結配列を含有している上記の成分が、通常は、中間体構築物(移入ベクター)に組み立てられる。
【0087】
AcNPV中に外来遺伝子を導入するために現在、最も一般的に使用される移入ベクターは、pAc373である。多くの他のベクター(当該分野で公知である)もまた、設計されている。これらとしては、例えば、pVL985が挙げられる。これは、ポリヘドリン開始コドンがATGからATTに変更され、そしてATTの32塩基対下流にBamHIクローニング部位が導入されている;LuckowおよびSummers、Virology 17:31(1989)を参照のこと。
【0088】
プラスミドはまた、通常は、ポリへドロンポリアデニル化シグナル(Millerら、Ann.Rev.Microbiol.,42:177(1988))、および原核生物のアンピシリン耐性(amp)遺伝子、およびE.coli中での選択および増殖のための複製起点を含む。
【0089】
バキュロウイルス移入ベクターは、通常は、バキュロウイルスプロモーターを含む。プロモーターは、通常は、コード配列の5’末端の近位に配置される、転写開始領域を有する。この転写開始領域は、通常は、RNAポリメラーゼ結合部位および転写開始部位を含む。バキュロウイルス移入ベクターはまた、エンハンサーと呼ばれる第2のドメインを有し得る。これは、存在する場合には、通常は、構造遺伝子に対して遠位である。発現は、調節され得るかまたは構成的であるかのいずれかであり得る。
【0090】
ウイルスの感染のサイクルにおいて後期に豊富に転写される構造遺伝子は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、ウイルスのポリへドロンタンパク質をコードする遺伝子(Friesenら(1986)「The Regulation of Baculovirus Gene Expression」:The Molecular Biology of Baculovirus(Walter Doerfler編);EPO公開第127839号および同第155476号);ならびに、p10タンパク質をコードする遺伝子(Vlakら、J.Gen.Virol.69:765(1988))に由来する配列が挙げられる。
【0091】
適切なシグナル配列をコードするDNAは、分泌される昆虫またはバキュロウイルスのタンパク質(例えば、バキュロウイルスのポリヘドリン遺伝子(Carbonellら、Gene、73:409(1988))の遺伝子に由来し得る。あるいは、哺乳動物細胞の翻訳後の改変(例えば、シグナルペプチドの切断、タンパク質分解的切断、およびリン酸化)は、昆虫細胞によって認識されるようであり、そして分泌のために必要とされるシグナルおよび核の蓄積はまた、無脊椎動物細胞および脊椎動物細胞間で保存されているようである。昆虫以外の起源のリーダー(例えば、ヒトのα−インターフェロンをコードする遺伝子に由来するもの、Maedaら、Nature 315:592(1985));ヒトのガストリン放出ペプチドをコードする遺伝子に由来するもの、Lebacq−Verheydenら、Molec.Cell.Biol.8:3129(1988);ヒトIL−2、Smithら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:8404(1985);マウスのIL−3をコードする遺伝子に由来するもの(Miyajimaら、Gene 58:273(1987);およびヒトグルコセレブロシダーゼ(glucocerebrosidase)をコードする遺伝子に由来するもの、Martinら、DNA 7:99(1988))もまた、昆虫での分泌を提供するように使用され得る。
【0092】
タンパク質の発現産物前駆体をコードするDNA配列および/または遺伝子の挿入後、昆虫細胞宿主が、移入ベクターの異種DNAおよび野生型バキュロウイルスのゲノムDNAを用いて、通用は、同時トランスフェクションによって同時形質転換される。バキュロウイルスの所望される部位に異種DNAを導入するための方法は、当該分野で公知である(SummersおよびSmith;Juら(1987);Smithら、Mol.Cell.Biol.3:2156(1983);およびLuckowおよびSummers(1989)を参照のこと)。例えば、挿入は、相同二重交差組換えによって、ポリヘドリン遺伝子のような遺伝子中であり得る;挿入はまた、所望されるバキュロウイルス遺伝子中に操作された制限酵素部位中であり得る。Millerら、Bioessays 4:91(1989)。
【0093】
新たに形成されたバキュロウイルス発現ベクターは、その後、感染性の組換えバキュロウイルス中にパッケージされる。組換えウイルスを同定するための方法は、「Current Protocols in Microbiology」第2巻(Ausubelら編)、16.8(補遣10、1990);SummersおよびSmith;Millerら(1989)に記載されている。
【0094】
組換えバキュロウイルス発現ベクターが、いくつかの昆虫細胞中への感染のために開発されている。例えば、組換えバキュロウイルスは、とりわけ、以下について開発されている:Aedes aegypti、Autographa californica、Bombyx mori、Drosophila melanogaster、Spodoptera frugiperda、およびTrichoplusia ni(PCT国際公開番号WO89/046699;Carbonellら、J.Virol.56:153(1985);Wright Nature 321:718(1986);Smithら、Mol.Cell.Biol.3:2156(1983);および一般的には、Fraserら、In Vitro Cell Dev.Biol.25:225(1989)を参照のこと)。
【0095】
TIAM2タンパク質は、インヒビターについてのアッセイにおいて、およびTIAM2に対して指向された抗体を調製するために、使用され得る。TIAM2タンパク質はまた、培養物中の癌細胞の増殖を促進する因子として有用であり得る。TIAM2タンパク質は、TIAM2アンチセンス分子を用いる使用についての上記の薬学的に受容可能なキャリアと組み合わされ得る。
【0096】
本発明は、特に有利な実施形態を示す以下の実施例を参照して本明細書中で説明される。しかし、以下の実施例は、これらの実施形態が説明され、そしていかなる様式にも本発明を制限するようには解釈されないことが留意されるべきである。
【実施例】
【0097】
(実施例)
(実施例1)
(TIAM2遺伝子の同定)
新規の遺伝子の縮重PCRに基づくスクリーニングにおいて、単一の377ヌクレオチドのクローン(DP−75)を同定した。これは、マウスおよびヒトのTIAM1遺伝子に対して高い相同性を有した。TIAM1に対するその類似性に起因して、この新規の遺伝子およびその推定されるタンパク質産物を、T細胞リンパ腫侵襲および転移2(TIAM2)と命名した。
【0098】
DP−75プローブでのノーザン分析は、大脳皮質、大脳後頭極、前頭葉、および側頭葉中での約3.3kbの転写物、ならびに精巣および小脳中の約4.4kbの転写物を明らかにした(図1Aおよび1B)。cDNAライブラリーのスクリーニングおよびRACEクローニングによって、重複しているクローンを単離し、そしてそれぞれ約4.4kbおよび約3.3kbのメッセージを示す全長配列に従った。ノーザン分析を行うために、Human Multiple Tissue Nothern Blots(Clontech)を、SpeedHyb溶液(BIOS lab)中でDP75プローブと65℃でハイブリダイズさせた。ブロットを、0.5×SSC、0.5%のSDSを用いて、10分間、室温で2回洗浄し、そして0.1×SSC、0.5%のSDSにおいて65℃で1時間、1回洗浄した。
【0099】
約4.4kbのメッセージに従うcDNAは、4586ヌクレオチドの長さであり、ポリアデニル化を伴わず、そしてTIAM2タンパク質の1077アミノ酸の長い形態(TIAM2L)をコードすると推定される。最初のATGは、ヌクレオチド51位であり、そして翻訳に良好な状況にある。TIAM1に対する推定されるタンパク質のアラインメント(図3)は、TIAM2の最初のメチオニンおよびTIAM2の576位のメチオニンで開始する有意な同一性を示し、この領域は、TIAM1のコイルドコイルドメイン(aa548−590)の最後の14アミノ酸に対応する。この同一性は、ヒトのTIAM1のアミノ酸599からアミノ酸691に伸びるEXドメインにまで続く。TIAM1/TIAM2LのEXドメインの比較は、全体的に62%の同一性を示すが、60aaのサブドメインにおいては85%の同一性を有する。EXドメインに続く、72ヌクレオチドのミニエキソンの選択的スプライシングは、TIAM1またはSIF配列に対して有意な同一性を有さない、24アミノ酸配列の存在または非存在を導く。選択的にスプライシングされた領域の後ろはTIAM1に対して弱い同一性(18%)を有する配列であるが、これは、PDZドメインまたはDHRドメインの保存された残基を含む(Michielsら、Nature 375:338−340、1995)。残りの配列は、DH触媒領域に対する同一性を含み(70%)、そしてカルボキシ末端のPHドメインに対する同一性(54%)を含む。
【0100】
約3.3kbのメッセージに従う配列は、3344ヌクレオチドの長さであり、そしてTIAM2(TIAMS)の短い形態(626aa)をコードすると推定される。約3.3kbのメッセージは、最初の104ヌクレオチドが独特である点で、約4.4kbのメッセージとは異なる。このことは、約3.3kbのメッセージが、約4.4kbのメッセージのプロモーターとは異なるプロモーターでの開始によって生じることを示唆する。162位での開始メチオニンは、4.4kbのTIAM2推定タンパク質のアミノ酸428でのメチオニンと一致し、そしてタンパク質の残りは、TIAM2Lと完全な同一性を示す。TIAM1遺伝子(Habetsら、Cell 77:537−549、1994)で見られるものと同様に、約3.3kbのメッセージ中に2つの上流のATGが存在し、これらが長いオープンリーディングフレーム(ヌクレオチド162)の前にあり、ヌクレオチド162位の開始コドンのみが、翻訳に良好な状況にある。TIAMとの比較は、TIAM2SがDHドメインのすぐ上流(24aa)で開始することを示す。
【0101】
約4.4kbのメッセージの5’末端から単離したプローブを用いるノーザン分析によって、長いTIAM2転写物のみを同定し(図1C)、一方、TIAM2の3’末端から単離したプローブによって両方の転写物を同定した(図1D)。
【0102】
照射ハイブリッドマッピング実験を、以下のように行った。TIAM2特異的オリゴAGTCCTACCTCATCAAGCCG(配列番号(SEQ ID NO)14)およびTTAGTGCTTCCGTCAGGTGG(配列番号15)を合成し、そして製造業者の説明書に従ってG3パネル(Research Genetics)とともに使用した。得られたPCR産物をゲル電気泳動によって分析し、そして得られたデータを、StewartおよびCox、「Genome Mapping:A Practical Approach」(P.Dearら編)73〜93頁、Oxford Univ.Press.Oxford,1997の方法に従って分析した。2点最大可能性(two−point maximum−likelihood)分析は、マーカーが、100のロッドスコアでD6S1556(6q25)に関連することを示した。
【0103】
(実施例2)
(インサイチュハイブリダイゼーション)
ヒトの3.3kbのTIAM2 cDNAのヌクレオチド566−586(AGTACAGAAGGTTCTGGAGCG)から、およびヌクレオチド1348−1367(TACCAGGCGATCCTTACACG)から設計したオリゴを、マウスの脳のcDNA(Clonetech)に対してPCRを行うために使用した。40℃のアニーリング温度を用いて行った30回のサイクルのPCRによって、予測された長さ(802nt)の生成物(MDP75)の産生を導いた。クローニングおよび配列決定によって、MDP75が、クローンの長さ全体にわたってヒトのTIAM2に対して90%同一であることを確認した。マウスの胚(CD−1)を、ホールマウント(whole−mount)RNAのインサイチュハイブリダイゼーションのために、Nietoら、「Methods in Avian Embryology」(M.Bronner−Fraser編)、Academic Press.San Diego(1995)のプロトコールに従って処理した。成体の脳の切片を、記載されるように、凍結切片についてのプロトコールを使用して処理した(Schaeren−WiemersおよびGerfin−Moser、Histochemistry 100:431−440(1993))。
【0104】
胚13.5日(E13.5)および成体のマウス脳でのTIAM2 mRNAの発現を、ジゴキシゲニンで標識したリボプローブを用いるインサイチュハイブリダイゼーションによって試験した。離散性および再現可能な標識を、アンチセンスプローブを用いて両方の年齢で観察した;センスプローブでは標識は検出されなかった。E13.5および成体の脳の両方におけるTIAM2転写物の細胞性の局在は、グリア細胞よりもむしろニューロン細胞中でのTIAM2の発現と一致する。E13.5では、TIAM2転写物は、終脳全体にわたって存在する(図2A)。終脳全体にわたる側副平面の切片により、発現は初期に生じた有糸分裂後のニューロンが局在化される軟膜表面に局在化されることが実証される(図2B)。TIAM2は、脳室に沿う増殖性神経前駆細胞中では発現されない。
【0105】
成体のマウスの脳においては、TIAM2は、終脳に由来する領域において主に発現され続ける(図2C〜2G、表1)。強力な発現の領域としては、嗅球、大脳皮質、尾状の被殻、および海馬が挙げられる。海馬での発現は、歯状回、およびそれに由来する領域、灰白鞘、ならびに灰白帯の細胞において高度に特異的である;そしてCA領域(CA2)の1つの部分領域のピラミッド型細胞(pyramidal cell)は、非常に強く標識されるが、一方、CA1およびCA3は非常にわずかな発現を示す。TIAM2はまた、側脳室の側方表面の上衣細胞中で強く発現される(図2D)。この領域は、ニューロンが成体の寿命を通じて生成される胚の領域である。この領域で発生したニューロンの大部分は、嗅球に移動すると考えられる。
【0106】
【表1】

(実施例3:GDP−GTP交換活性)
アミノ末端HISタグ化したバージョンの3.3kbTIAMsタンパク質(His−TIAM2)を、バキュロウイルスの系において発現した。推分子量(75.661Da)のタンパク質を、ニッケルカラムで部分精製し、そしてそのタンパク質の同一性をアミノ末端配列決定および質量分析によって確認した。Hisタグ化したTIAM2s発現構築物を生成するために、リンカー−アダプターを生成して、TIAM2s配列の最初の29bpの5’末端にEcoRI部位を付加した(GAATTCATGGAAGGACCGCGGGA−GAATCAGGATCC)。BamHI部位(TIAM2配列の塩基23〜29)で終結するこのリン酸化したリンカー/アダプターを、TIAM2sの全コード領域を含む、BamHIフラグメントによって直鎖状化されたcDNAクローンDP−75#1と連結した。その後のSalI消化は、TIAM2sの全コード領域を含む、約2000bpのEcoRI−SalIフラグメントを遊離した。このフラグメントを単離、精製し、そしてEcoRI−SalI消化したpBlueBacHis2Bベクター(Invitrogen)中に連結した。生じるクローン(pHIS−TIAM2s)を配列分析によって確認した。
【0107】
pHIS−TIAM2sを、SF9細胞に導入し、そして高レベルのpHIS−TIAM2sを発現するクローンをウェスタンブロットによって同定した。クローンの増殖後、pHIS−TIAM2s発現細胞を濃縮し、溶解し、そしてニッケルカラム(Invitrogen)にアプライした。pHIS−TIAM2sタンパク質を、50mMのイミダゾール洗浄後にタンパク質を直接500mMのイミダゾール中で直接溶出した以外は、製造業者の推奨によってカラムから精製した。pHIS−TIAM2sを含有する画分を、Centricon(Amicon)30カラムにおいて、5000gで30分間遠心することによって濃縮した。
【0108】
His−TIAM2sを、RacまたはRasタンパク質を用いるGDP−GTP交換活性を刺激するその能力について試験し、そしてSOS(公知のRas GEF(Jeffersonら、Oncogene 16:2303−2310、1998))の活性と比較した。これらの実験において(図4)、免疫沈降したRacまたはRasタンパク質に予めGDPをロードしておき、そして[32P]GTP含有緩衝液単独中か、またはHis−TIAM2sまたは精製SOSのいずれかを含む緩衝液中でインキュベートした。複数の実験において、His−TIAM2sは、緩衝液単独と比べて、30分の時点で、およそ5倍のRac交換活性の刺激を示したが、SOSは、せいぜい穏やかな刺激(×1.6)を示した(図4A)。逆に、His−TIAM2sおよびSOSをRASとインキュベートした場合、SOSは、4〜5倍の交換活性の刺激を示したが、His−TIAM2sは、ほとんど効果を有さなかったか、または全く効果を有さなかった(図4B)。
【0109】
(実施例4:癌の診断のためのポリヌクレオチドの使用)
ドットブロット分析において、TIAM2を、癌組織および正常組織の両方由来のRNAとハイブリダイズした。癌組織の供給源としては、腎臓、甲状腺、胸部、結腸、尿管、肺、鼻、胃、食道、肝臓、リンパ腫、子宮、膀胱、直腸および脳が挙げられる。
【0110】
ブロットは、BioChain Institute,Inc.,San Leandro,California,USAからであった。ExpressHybTMハイブリダイゼーション緩衝液(Clontech,Palo Alto,California,USA)を、1×106cpm/mlで2時間、TIAM2(配列番号1)とともに、68℃でブロッティングするために使用した。
【0111】
図5において示すように、4つの甲状腺サンプル中の4サンプルにおいて、配列番号1のmRNAレベルが、正常組織よりも癌組織において高かった。4つの結腸サンプルのうちの2つにおいて、配列番号1のmRNAレベルが正常組織よりも癌組織において高かった。2つの尿管サンプルのうちの1つにおいて、配列番号1(TIAM2)のmRNAレベルが正常組織よりも癌組織において高かった。4つの胸部サンプルのうちの1つにおいて、配列番号1のmRNAレベルが正常組織よりも癌組織において高かった。4つの腎臓サンプルのうちの1つにおいて、配列番号1のmRNAレベルが正常組織よりも癌組織において高かった。他の全ての試験した組織型において、配列番号1のmRNAレベルは、癌サンプルよりも正常サンプルにおいて、同一であるか、または高かった。
【0112】
【化2】

(実施例5:配列番号6の単離)
配列番号6を、ファージベクター(Stratagene、La Jolla、California、USA)を使用する前頭皮質ライブラリーより単離した。このライブラリーを、約1×106cpm/mlの最終放射活性カウントを用いるランダムプライム標識によって生成した配列番号1によってプローブした。このプローブをRediPrimeTM DNAラベリングキット(Amersham、Arlington Heights、Illinois、USA)を用いて製造業者の指示に従って、標識した。
【0113】
ファージライブラリーを増殖して、製造業者の指示に従って、3.0〜5.0×105プラーク/プレートで20枚のプレートにプレーティングした。プラークをニトロセルロースメンブレンに移した。各メンブレンを、Clontech(Palo Alto,California,USA)より購入した2時間65℃、ExpressHybTMハイブリダイゼーション溶液中で、配列番号1プローブとともに、インキュベートした。このフィルターをClontechの指示に従って、洗浄した。フィルムをメンブレンに曝露して、所望のTIAM2ポリヌクレオチドを含む推定陽性プラークを同定した。
【0114】
2回目のプレーティングおよびハイブリダイゼーションを実行して、単一の陽性プラークを同定した。1回目の陽性プラークを増殖して、そしてStratageneによって提供される指示に従う寒天培地上にプレーティングした。プラークをフィルターに移した。これらのフィルターを配列番号1プローブとともにインキュベートした。プローブおよびハイブリダイゼーション条件は、上記と同一であった。陽性プラークを同定し、そして増殖した。
【0115】
製造業者の指示に従って、BlueScriptプラスミドをファージベクターから回収した。プラスミド由来のEcoRI挿入物を配列決定した。ポリヌクレオチド配列を、配列番号6に示す。
【0116】
本発明を、特定の実施形態を参照して記載した。しかし、この適用は、添付の特許請求の範囲の趣旨および範囲を逸脱することなく当業者によってなされ得る変化および置換を含むことが、意図される。
【0117】
(寄託の情報)
以下の材料は、American Type Culture Collectionに寄託された。
【0118】
【表2】

上記の材料は、American Type Culture Collection(Manassas、Virginia)に、示された受託番号のもとで寄託された。この寄託は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブタペスト条約のもとで維持される。この寄託は、本特許の発行後30年間、または本特許の有効な期間のいずれかより長い期間、維持される。特許の発行に際して、この寄託は、ATCCから制限されることなく公衆に利用可能となる。
【0119】
これらの寄託は、単に、当業者の確認のために提供されるのであって、寄託が35U.S.C.112条のもとで必要とされることを承認するものではない。寄託された材料に含まれるポリヌクレオチド配列、ならびにそのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、参考として本明細書に取り込まれ、そして本明細書において記載される配列とのいかなる不一致の場合においても、優先する。寄託された物質の、生産、使用、または販売のためには、ランセンスが必要とされるかもしれないが、そのようなラインセスは、本明細書によって与えられるものではない。
【0120】
【表3】



















【特許請求の範囲】
【請求項1】
以下:
(a)配列番号9のヌクレオチド1〜1346、配列番号9のヌクレオチド51〜1346、配列番号10のヌクレオチド1〜1274および配列番号10のヌクレオチド51〜1274からなる群の少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸配列を含みかつ、TIAM2のmRNAにハイブリダイズし得るポリヌクレオチドプローブを提供する工程;ならびに
(b)該ポリヌクレオチドプローブをTIAM2のmRNAと接触させる工程、
を包含し、ここで該TIAM2のmRNAは、
a)配列番号9に示されるポリヌクレオチド;
b)配列番号10に示されるポリヌクレオチド;および
c)a)またはb)によってコードされるポリペプチドから20個未満のアミノ酸が欠失、付加または置換によって変化するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであって、該c)によってコードされるポリペプチドは、GDP−GTP交換活性を有する、ポリヌクレオチド
からなる群から選択される、サンプル中のTIAM2のmRNAの発現を検出する方法。
【請求項2】
サンプル中の過剰増殖細胞を検出するための方法であって、以下:
(a)配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る配列を含むプローブポリヌクレオチドを提供する工程;
(b)ポリヌクレオチドハイブリッドを形成させる条件下でサンプル細胞のポリヌクレオチドと該プローブとを接触させる工程;および
(c)該ハイブリッドを検出する工程、
を包含する、方法。
【請求項3】
サンプル中のTIAM2ポリペプチドを検出する方法であって、以下:
(a)TIAM2ポリペプチドに特異的に結合する抗体を提供するであって、ここで該TIAM2ポリペプチドは、配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにハイブリダイズし得る配列を含むポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、工程;
(b)該抗体を抗体/抗原複合体を形成させる条件下で該サンプルに接触させる工程;および
(c)該複合体を検出する工程、
を包含する、方法。
【請求項4】
以下:
(a)配列番号11約626位のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
(b)配列番号11約626位のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;
)(a)または(b)ポリヌクレオチドに対して少なくとも80%同一なポリヌクレオチド;および
)(a)または(b)ポリヌクレオチドのポリヌクレオチド相補体、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項5】
配列番号のコード領域由来の10個連続したヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
【請求項6】
配列番号コード領域由来の20個連続したヌクレオチドを含む、請求項5に記載の単離された核酸分子。
【請求項7】
配列番号コード領域由来の50個連続したヌクレオチドを含む、請求項6に記載の単離された核酸分子。
【請求項8】
ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで少なくとも1個の保存的アミノ酸除いて、該ポリペプチドが以下:
(a)配列番号111位〜約626位のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド;および
(b)配列番号112位〜約626位のアミノ酸をコードするポリヌクレオチド
らなる群から選択される核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を有する、単離された核酸分子。
【請求項9】
請求項に記載の核酸分子をプロモーターへ作動可能な連結でベクター中に挿入する工程を包含する、組換えベクターを作成する方法。
【請求項10】
請求項に記載の方法により生成される組換えベクター。
【請求項11】
請求項10の組換えベクターを宿主細胞中に導入する工程を包含する、組換え宿主細胞を作製する方法。
【請求項12】
請求項11に記載の方法により生成される、組換え宿主細胞。
【請求項13】
ポリペプチドを産生する組換え方法であって、該ポリペプチドが発現されるような条件下で、請求項12に記載の組換え宿主細胞を培養する工程および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。
【請求項14】
以下:
(a)配列番号111位〜約626位のアミノ酸;および
(b)配列番号112位〜約626位のアミノ酸
らなる群から選択されるアミノ酸に対して少なくとも90%同一なアミノ酸を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項15】
単離されたポリペプチドであって、少なくとも1個の保存的アミノ酸除いて、該ポリペプチドが、以下:
(a)配列番号111位〜約626位のアミノ酸;および
(b)配列番号112位〜約626位のアミノ酸
らなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、単離されたポリペプチド。
【請求項16】
以下:
(a)配列番号111位〜約626位のアミノ酸;および
(b)配列番号112位〜約626位のアミノ酸
らなる群から選択されるアミノ酸を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項17】
配列番号11、配列番号12または配列番号13のポリペプチドのエピトープ保有部分。
【請求項18】
配列番号11、配列番号12または配列番号13の10個連続したアミノ酸を含む、請求項17に記載のエピトープ保有部分。
【請求項19】
配列番号11、配列番号12または配列番号13の20個連続したアミノ酸を含む、請求項18に記載のエピトープ保有部分。
【請求項20】
請求項14に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項21】
請求項15に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項22】
請求項16に記載のポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
【請求項23】
(i)配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る配列を含むアンチセンスポリヌクレオチドであって、ここで該ポリヌクレオチドは、ネイティブなヒトTIAM2のmRNAにハイブリダイズし得る、アンチセンスポリヌクレオチド;および(ii)該アンチセンスポリヌクレオチドの転写を開始し得る配列を含むポリヌクレオチド、を含むアンチセンスベクター。
【請求項24】
転写を開始するための前記配列がレトロウイルス、アデノウイルスまたはアデノ随伴ウイルス由来である、請求項23に記載のアンチセンスベクター。
【請求項25】
さらに複製起点を含む、請求項24に記載のアンチセンスベクター。
【請求項26】
TIAM2の発現を阻害する方法であって、以下:
(a)配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸配列を含み、かつ、ネイティブなヒトTIAM2のmRNAにハイブリダイズし得るアンチセンスポリヌクレオチドを提供する工程;および
(b)該アンチセンスポリヌクレオチドを該TIAM2と接触させる工程、
を包含する、方法。
【請求項27】
細胞の複製を阻害する方法であって、以下:
(a)TIAM2ポリペプチドに特異的に結合する抗体を提供する工程であって、ここで該TIAM2ポリペプチドは、配列番号6、配列番号8、配列番号9、配列番号10またはそのフラグメントの少なくとも1つにハイブリダイズし得る配列を含むポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列を含む、工程;および
(b)該抗体を、抗体/抗原複合体を形成させる条件下でサンプルに接触させる工程、
を包含する、方法。

【図1】
image rotate

【図3】
image rotate

【図4】
image rotate

【図5】
image rotate

【図2】
image rotate


【公開番号】特開2011−83295(P2011−83295A)
【公開日】平成23年4月28日(2011.4.28)
【国際特許分類】
【外国語出願】
【出願番号】特願2011−20242(P2011−20242)
【出願日】平成23年2月1日(2011.2.1)
【分割の表示】特願2000−592315(P2000−592315)の分割
【原出願日】平成12年1月6日(2000.1.6)
【出願人】(591076811)ノバルティス バクシンズ アンド ダイアグノスティックス,インコーポレーテッド (265)
【Fターム(参考)】