説明

株式会社メイズにより出願された特許

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【課題】 簡便且つ高い信頼性を保持した遺伝子同定方法および発現解析方法、並びにそこで使用される網羅的フラグメント解析のためのデータベース構築方法を提供する。
【解決手段】 試料に含まれるゲノムDNAまたは転写産物から得られたcDNAを断片化し、識別可能な指標配列を付与してフラグメントDNA混合液を得る段階、前記フラグメントDNA混合液の一部分を高速DNAシーケンシングし、そこに含まれる全フラグメントDNAについてリード配列データを取得する段階、前記の全リード配列データについて前記指標配列部分の有無を検査し、前記指標配列を有するリード配列データを抽出する段階、前記抽出された全リード配列データについて、配列類似性と配列長のパラメータにより配列のクラスタリング・アッセンブリング処理を行い、複数のクラスタを形成し、前記クラスタについて、当該クラスタの構成配列数、コンセンサス配列およびコンセンサス配列長、並びにアライメント情報を取得する段階を具備するデータベース構築方法。 (もっと読む)


【課題】本発明の目的は、注釈情報を含めた照合処理を行い、データベースの中から高精度かつ高効率に一の配列情報を特定することができるデータベース検索装置および方法を提供することにある。
【解決手段】本発明は、第一の配列情報の入力手段と、配列情報を格納した第一のデータベースと、第一の配列情報を第一のデータベースと照合し、第一のデータベースの中から第一の配列情報に類似する第二の配列情報を表示する手段と、第二の配列情報についての注釈情報の入力手段と、前記注釈情報に基づいて第二のデータベースを作成する手段と、第一の配列情報を第二のデータベースと照合し、第二のデータベースの中から第一の配列情報に類似する第三の配列情報を表示する手段とを備える、データベース検索装置を提供する。 (もっと読む)


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