本発明は、タンパク質の凝集を予測し、さらに凝集阻害物質を設計する方法を提供する。潜在的なタンパク質凝集阻害ペプチド配列を予測するそのような方法の１つは以下の工程を含む：a）標的タンパク質において凝集領域の少なくとも一部を形成するペプチド配列を同定する工程；b）前記ペプチド配列がβ-シートの一部を構成するか否かを試験する工程；c）工程b）で陽性結果が得られた場合、当該シートの隣接する鎖を抜き出す工程；d）前記隣接する鎖内の残基であって、前記ペプチド配列と相互作用する残基を同定する工程であって、前記残基が潜在的なタンパク質凝集阻害ペプチド配列を構成する、前記工程。本発明はまた、上記方法で同定された残基を用いて化合物を設計する方法、上記方法によって製造される化合物、及び上記方法を実行するコンピュータプログラムを提供する。
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