参照発現データでポピュレートされたデータベース（１１２）を含む、生物学的試験サンプルを分類するためのシステム（１００）。参照発現データは、複数の参照サンプル内の、１組のマーカー分子を含む複数の分子（ポリヌクレオチドまたはポリペプチド）の発現レベルを含む。各参照サンプルは、１つまたは複数の臨床的に有意な変数のそれぞれについて事前に割り当てられた値を有する。このシステムは、少なくとも１個のプロセッサ（１１０）と、前記プロセッサ（１１０）が実行するためのプログラム命令を含む少なくとも１つの記憶媒体とを含む。そのプログラム命令は、プロセッサに、生物学的試験サンプル内のマーカー分子の発現レベルの試験ベクトルを含む入力発現データを受け入れさせ（１２２）、入力発現データを１つまたは複数の解析プログラム（１３０ａ、１３０ｂ、３５）に通過させる。この解析プログラムは、前記臨床的に有意な変数の少なくとも１つの値を試験サンプルに割り当てるための、少なくとも１つの統計的分類プログラム（１３５）を含む。
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