本発明は、データ・ベース上の公知タンパク質をコードする遺伝子の塩基配列、ならびに、推断される完全長アミノ酸配列を参照し、解析対象タンパク質を部位特異的酵素消化したペプチド断片複数の質量分析結果に基づき、該対象タンパク質と同じゲノム遺伝子に由来する公知タンパク質、ないしは公知タンパク質変異体を高い確度で特定する手法を提供する。
本発明の手法においては、部位特異的なタンパク質分解処理によるペプチド断片化を利用した、該対象タンパク質由来のペプチド断片分子量実測値と、公知タンパク質の推断完全長アミノ酸配列に基づき、推定されるペプチド断片分子量推定値とを対比し、一致する断片数の多寡、ならびに、公知タンパク質の一致断片アミノ酸配列の連続性、更には、不一致断片における変異推定を含む対比により、同定候補となる公知タンパク質を高い確度で特定する。 （もっと読む）

本発明の実施形態は、クワイエットゾーンにおける質量スペクトルデータの分析に関する。いくつかの実施形態において、本発明は、質量スペクトル中のクワイエットゾーンにおいて、標識および／または標識された分析物の分析に有用である、方法、システム、および／または組成物に関する。上記分析を、クワイエットゾーンに向けることより、上記分析のダイナミックレンジを極大化することが可能である。これは、分析物の定性的分析および／または定量的分析に有用であり得る。 （もっと読む）

メモリを有するコンピュータが、データを受け取るための命令を記憶している。このデータは、ある1つの種の試験生物内または前記種の生物の試験生体標本内で測定された複数の細胞成分のうちのそれぞれの細胞成分の1つまたは複数の特性を含む。このメモリはさらに、複数のモデルのうちのある1つのモデルを演算するための命令を記憶しており、このモデルは、前記試験生物内または前記試験生体標本内の生物学的特徴の存在の有無を表すモデルスコアによって特性づけられる。このモデルの演算は、前記複数の細胞成分のうちの1つまたは複数の細胞成分の1つまたは複数の特性を使用して前記モデルスコアを決定することを含む。このメモリはさらに、演算するための前記命令を1回または数回繰り返すための命令を記憶しており、それによって前記複数のモデルが演算される。このメモリはさらに、演算されたモデルスコアを通信するための命令を記憶している。
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本発明は、ポリヌクレオチド配列上の反復的酵素的オリゴヌクレオチド合成事象を介して複数の検出可能なオリゴヌクレオチドを産出し、前記産物を検出することによって、目的とする分子の存在を検出するための方法を提供する。本発明はまた、多重不完全転写の方法を提供する。さらなる態様では、本発明は、不完全プロモーターカセットを含有するデンドリマーの使用を提供する。一態様では、本発明は、本発明で使用するのに適した不完全プロモーターカセットを提供する。一態様では、不完全転写の産物は、質量分析を用いて検出される。別の態様では、本発明は、質量分析によるものを含めて検出される不完全転写によって、複数の検出可能なＲＮＡオリゴリボヌクレオチドを産出することによって、標的タンパク質、ＤＮＡ、またはＲＮＡを検出するための方法を提供する。
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分析対象の物質を含む溶液が極微量であっても、当該溶液をロスすることなくハイスループットに解析を行う。 分離流路からの溶出時間が早い物質を含む第１溶液と、当該分離流路からの溶出時間が遅い物質を含む第２溶液とを、前記第１溶液の少なくとも一部を前記第２溶液の少なくとも一部よりも後に分離流路に導入する工程と、上記分離流路から溶出する物質に関するクロマトグラムを検出する工程とを含む。 （もっと読む）

本発明は、（ａ）特定のプローブ／ターゲット結合によって複合体混合物中に含まれている特定の分子ターゲットを保持する固定された分子プローブを各マイクロカラム2が備えているマイクロカラムのマトリックスと、（ｂ）本発明の装置中に導入された複合体混合物を（ａ）において規定されたマトリックスの各マイクロカラムに向って循環させる第１の毛管ネットワーク3と、（ｃ）溶離の後、マイクロカラム上に保持された分子ターゲットを、その再生および、または解析を行うセンサ5に向って循環させる第２の毛管ネットワーク4と、および（ｄ）必要な場合に、種々の異なる分子ターゲットの再生および、または解析を行う質量分光計の形態であることが好ましいセンサ5とを備えていることを特徴とする複合体混合物中に溶解された複数の分子ターゲットを分離し、解析する装置に関する。 （もっと読む）

本発明は、アイソトープ標識水を１以上の組織又は個体に投与し、異なる化学クラスの生体分子を含む２以上の生体分子の分子流速を比較することによる、種々の生体分子の相対分子流速を測定及び比較するための技術に関する。本方法は、疾患、障害又は症状の診断、予後診断又はモニター、種々の疾患モデルにおける治療効果についての化学物質及び生物学的因子のｉｎ ｖｉｖｏハイスループットスクリーニング、並びに毒性作用についての化学物質及び生物学的因子のｉｎ ｖｉｖｏハイスループットスクリーニングを含む、複数の用途において使用しうる。
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本発明は、化学分析装置及び方法に関し、特に、分子、例えばペプチド、及び/又は短悪質などの生物分子を、溶液中の分子の混合体から抽出し、そして分析装置に提示する前に抽出された分子にサンプル処理を行うための特異的な装置に関する。試料の分析方法は、複合試料処理及び試料保持装置を使用する。当該装置は、各アレイ位置に位置するコンパートメントの各々に繋がれた１の側に試料を受け入れるための入口を有するプレートを含み、ここで当該コンパートメントの各々は、プレートを通して液体が流れることを可能にする出口と繋がっている。当該方法は、外部容器にサンプルを供給し；場合により当該サンプルを、外部容器内で第一処理にかけ、当該複合試料処理及び試料保持装置に移し、そして当該試料を装置を通した液体の流れを利用して、第二処理にかけ（ここで媒質が装置内に保持される）工程を含む。
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様々な組成物の高エネルギー脱離／イオン化のための物品および方法が開示される。本発明の方法が、任意に１つ以上の表面コーティングと充填剤と共に多孔性基材を利用し、分析物の向上された脱離を提供する。かかる向上された脱離が、質量分析などの分析の分野において特に有用である。この向上された脱離が、様々な有用性を有する。例えば、前記多孔性基材の使用が、化学マトリックスを使用せずに脱離を行なうことを可能にする場合がある。
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所定の DNA配列において DNA突然変異、一塩基多型および挿入・欠失を検出するための方法であり、a)遺伝子工学処理されたポリメラーゼによって、４種類の天然 DNA塩基のうちの少なくとも１種類の一部または全部が非天然塩基で置換された、前記所定の DNA配列の複製物を作製する工程；b)前記非天然塩基を使用して、工程a)で得られた複製物を開裂させ、配列特異的断片を表す DNA生成物を作製する工程；c)工程b)で得られた前記配列特異的断片を質量分析法で分析して、配列特異的断片のパターンを得る工程；およびd)工程c)で得られた配列特異的断片パターンを用いて、前記所定の DNA配列に関して配列の変化を同定する工程を含む方法。 DNA変異、一塩基多型および挿入・欠失の検出のためのキット。 （もっと読む）

本発明は、既存の方法と比較して効率的で費用効果的であるエレクトロスプレー質量分析法による後の分析のための、核酸の迅速な溶液捕獲精製法を提供する。精製された試料がエレクトロスプレー質量分析法による分析に良好な状態になるように、本発明は、核酸の迅速な溶液捕獲を実践するために有効なキットも提供する。

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本発明は新規ナノファイバー増大表面積基板と前記基板を含む構造、及び前記基板の方法と使用を提供する。 （もっと読む）

生スペクトル・データを処理することによって、較正済み連続スペクトル・データを得ること、較正済みライブラリ・データを形成するために処理されたライブラリ・スペクトル・データを得ること、および、生スペクトル・データを生成した試料内の成分の濃度を決定するために、較正済み連続スペクトル・データと較正済みライブラリ・データとの間で、好ましくは行列演算（式１）を使用して、最小二乗フィットを実行することを含む、質量分析計からのデータを分析する方法。この方法に従って動作する質量分析計システム（図１）、変換された質量スペクトルのデータ・ライブラリ、およびこのデータ・ライブラリを作る方法。 （もっと読む）