本発明は、タンパク分子の同位体／同重体標識化及びその後の親和性選択及び解析のためのキット及び方法に関する。特に、本発明は、タンパク分子の標識化のための、組み合わせによる複数の標識化試薬を含むキットオブパーツであって、各標識化試薬は、同重体標識成分、同位体標識成分及びタンパク分子と反応することができる反応基を含み、同位体標識成分が親和性タグでもある、キットに関する。本発明は更に、タンパク分子の解析のための対応する方法であって、ここに規定されるキットオブパーツを用いることによって存在するタンパク分子の少なくとも１のサブセットを標識化し、その後、標識に含まれる親和性タグを介して親和性精製によって標識化された分子を分離することを含む方法に関する。最後に、本発明は、タンパク質発現プロファイリング又はプロテオーム解析のためのこのような方法の使用に関する。
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複合混合物の化学成分の組成を決定するためのシステム、方法、及びコンピュータ読み取り可能な媒体が開示される。一の態様によれば、複合混合物の化学成分の組成の決定方法は、分離技術及び質量分析装置を用い、サンプルの分離及び質量分析データを生成し、ここで分離データはピーク情報を含み、かつ質量分析データは１次及び２次質量分析データを含む。生成された分離及び質量分析データを含む解析結果は収集及び格納される。解析結果を化学物質の特性を示す情報のライブラリと比較することにより、サンプルの化学成分が決定され、比較は分離及び質量分析データに基づいている。情報のライブラリは分離技術及び質量分析装置によって生成されるデータを含み、さらに同定され又は同定されていない化学物質の分離及び質量分析データを含む。サンプルの化学成分の表示は、人間がアクセス可能な形で利用できるようになされる。
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【課題】バイオマス資源から製造したグリコール化合物と化石資源から製造したグリコール化合物と外観上同じものであり、一見区別がつかない。このため、化石資源から製造したグリコール化合物を、バイオマス資源から製造したグリコールと間違って使用する可能性がある。
【解決手段】本発明は、バイオマス資源から製造したグリコールの判別方法であって、グリコール中の^１４Ｃの濃度比がmodern reference standardに対して５０．０ｐＭＣ以上であることを特徴とするグリコールの判別方法であり、当該方法によって上記課題を解決する事ができる。 （もっと読む）

【課題】バイオマス資源から製造した芳香族化合物と化石資源から製造した芳香族化合物と外観上同じものであり、一見区別がつかない。このため、化石資源から製造した芳香族化合物を、バイオマス資源から製造した芳香族化合物と間違って使用する可能性がある。
【解決手段】本発明は、バイオマス資源から製造した芳香族化合物の判別方法であって、芳香族化合物中の^１４Ｃの濃度比がmodern reference standardに対して５０．０ｐＭＣ以上であることを特徴とする芳香族化合物の判別方法であり、当該方法によって上記課題を解決する事が出来る。 （もっと読む）

本発明は、対象における障害の診断を補助する方法であって、前記対象に由来する、血液を含む試料を供給するステップと、前記試料の少なくとも２つの特徴をアッセイするステップであり、前記特徴が、前記試料に含まれるポリペプチドの構造組成、前記試料に含まれる代謝産物、及び前記試料に含まれる触媒活性から選択され、前記少なくとも２つの特徴のそれぞれが同一試料の多重分析から決定されるステップを含む方法に関する。本発明は、一定の組成物にも関する。 （もっと読む）

本発明は、サンプル中の複数の分析物を定量分析するための方法を提供する。また、こうした分析に有用な一般的および特定内部標準も記載する。特定の実施形態において、これらの標準は、本明細書に記載もされる液体クロマトグラフィ／質量分析システムに有用であると記載される。さらに、特定の実施形態において、本発明の定量方法は、未知分析物に対して同時に検出され、比較される既知の分析物誘導体を用いて単一のサンプル混合物中に含有される分析物に関する複数の分析物定量についての精密度および／または正確度を増大させるのに有用である。 （もっと読む）

単一試料の多重分析、ならびにタンパク質リン酸化状態の分析を提供するように開発された、４Ｅ／４Ｅレギュロン経路タンパク質のための高感度ハイスループット質量分析に基づく定量アッセイが提供される。これは、４Ｅ／４Ｅレギュロン生物学的経路の初の単一試料分析方法としての使用に適合させることができる。一つの実施形態において、少なくとも１つの標的タンパク質の単一試料の多重分析、ならびに特定の実施形態においては少なくとも１つの標的タンパク質のリン酸化状態の同時分析を提供する、高感度ハイスループット質量分析に基づく定量アッセイが提供される。
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【課題】前処理・分析期間を大幅に短縮して且つ高分解能ＧＣ−ＭＳを使用しなくても信頼性を有する（確からしい）結果が得られ、環境基準のスクリーニング等に好適な新規な構成のダイオキシン類の簡易測定方法を提供すること。
【解決手段】被検体から採取した実試料を有機溶剤による抽出工程後、クリーンアップ工程（夾雑物除去工程）を経た抽出液を定容してガスクロマト質量分析計を用いてダイオキシン類を定量分析するダイオキシン類の簡易測定方法。有機溶剤抽出を、高速溶媒抽出装置で行い、また、質量分析器におけるイオン化として負化学イオン化（ＮＣＩ）を選択し選択イオン検出（ＳＩＭ）により測定をする。 （もっと読む）

【課題】（１）選択した生体内物質について、被爆のおそれや取扱時間の制約がある放射性同位体原子ではなく、安定同位体原子を用いて標識化合物を製造すること、（２）その標識化合物は、選択した生体内物質の自然界に存在する安定同位体原子の置換化合物と分離して感度良く測定可能であること。
【解決手段】生体内物質コリンについて、４級アンモニウム基の窒素原子及び該窒素原子に結合したメチル基の炭素原子の全てをそれぞれの同位体¹⁵Ｎ及び¹³Ｃに置換して標識し、診断薬として用いる。 （もっと読む）

本発明は、細胞又は組織のプロテオーム中に含まれる標的タンパク等の被検体中に含まれる標的成分に対する小分子又は他の化合物の結合親和性の評価及び／又は定量化のための方法に関する。 （もっと読む）

生物間の表現型の類似性又は非類似性を検定するための方法を開示する。この方法では、混合した第１及び第２サンプルの複合サンプルを準備する。第１標準サンプルは平均濃度の、生物種中に存在する約1000AMU未満の分子量の化合物を含む。第２検定サンプルは、表現型を検定すべき生物中に存在する同様の分子量を有する化合物を含む。両サンプルの成分は、（ｉ）液状媒体中にあり、かつ（ii）サンプルの各化合物は、同一の第１及び第２のそれぞれの量の、第１原子の第１及び第２安定同位体を有する。複合サンプルを被分析物について質量分光法により分析し、各被分析物について第１同位体の第２同位体に対する比を、複合サンプルの比メジアンと共に決定する。各被分析物の比をメジアンと比較する。範囲外の比は非類似性を示す。 （もっと読む）

本発明は、試験サンプル内の、ＡＭＳ同位体で標識化した検体の量を測定する方法に用いる較正方法を提供する。前記較正方法は、
（ｉ）複数の較正サンプルを提供するために、前記検体にも標識化していない対照検体にも汚染されていない複数のサンプルを、既知量の前記対照検体および、量Ｃの検体へ接触させるステップにおいて、前記較正サンプルが、既知量でかつ量Ｃとは異なる量の対照検体含むことを特徴とするステップと、
（ｉｉ）複数のサンプルへそれぞれ加えた検体の量Ｃを、ＡＭＳにより測定するステップと、
（ｉｉｉ）複数の精製サンプルを提供するために、複数のサンプル内で、検体および対照検体を、他の化学種から分離するステップと、
（ｉｖ）前記精製サンプル内の検体の量Ａを、ＡＭＳにより測定するステップと、
（ｖ）前記精製サンプル内の対照検体の量Ｂを、ＡＭＳにより測定するステップとを
含むことを特徴とする。 （もっと読む）

本発明は、血漿においてタンパク質を検出する方法を提供し、該方法は、該タンパク質を少なくとも１つの検出可能なフラグメントに消化する能力を有するプロテアーゼに血漿を接触させる工程、ならびに高速液体クロマトグラフィーおよび質量分析を使用して、少なくとも１つの検出可能なフラグメントを検出する工程を含む。 （もっと読む）

本発明は、ポリペプチドを絶対定量化するための方法に関する。 （もっと読む）

【課題】 複数安定同位体で標識した生体試料などの２試料の混合液を液体クロマトグラフ−タンデム質量分析計で比較定量解析すると、多種類の成分が同時にイオン化するため、２次質量分析に必要な時間を十分にとれず、未分析なイオンが生じてしまう。
【解決手段】 ２次質量分析を行い、その分析データからアミノ酸配列解析を行う。アミノ酸配列解析により安定同位体で標識された特定アミノ酸の有無を判断可能になり、特定アミノ酸が含まれる場合は、ＭＳスペクトル中の同位体標識ペアのｍ／ｚを計算し、算出したｍ／ｚ情報を用いて２次質量分析対象外情報を作成する。その結果、同じペプチド由来の重複した２次質量分析が避けられ、２次質量分析を効率よく行える。 （もっと読む）

イオントラップを有する質量分析計システムを操作する方法が提供される。本方法は、第１の群の前駆イオンおよび第１の複数のフラグメントのうちの少なくとも１つ内の選択された特徴を符号化することを備え、第１の複数のフラグメントイオンは、第１の選択された特徴を有し、他のイオンは、第１の選択された特徴を欠くように、符号化操作は、他のイオンには適用されずに、第１の群の前駆イオンおよび第１の複数のフラグメントのうちの少なくとも１つに適用される。 （もっと読む）

【解決手段】質量分析を行なう前に、固相及び／又はマイクロ波同位体比平衡及び測定を用いて、濃縮同位体種及び天然同位体種を平衡化する方法である。 （もっと読む）

【課題】同位体標識率が５０ａｔｏｍ％以下の低濃度に標識されたアミノ酸等の難揮発性物質の同位体濃度の決定に有効な安定同位体濃度の分析方法を提供する。
【解決手段】低濃度標識試料の同位体濃度を分析する際に、ＦＡＢ法のマトリックス溶液として、酸水溶液及びアルカリ金属イオン含有水溶液を添加したマトリックス溶液を使用し、このマトリックス溶液と試料とを混合して質量分析を行い、得られたマススペクトル中で、最も存在確率が高い分子にアルカリ金属が付加したアルカリ金属イオン付加分子イオンの第１のピークと、その次に存在確率が高いアルカリ金属イオン付加分子イオンのピークであって、かつ、前記第１のピークの１質量数だけ高質量数側に出現する第２のピークとの強度比から安定同位体濃度を算出する。 （もっと読む）

アナライトを分析する方法であって、（ａ）前記アナライトを含んでいてもよい試験サンプルと、各アリコートが既知の量のアナライトを含む少なくとも２の異なるアナライト含有アリコートを含むキャリブレーションサンプルとを混合する工程であって、前記試験サンプルと前記キャリブレーションサンプルの各アリコートとを質量分析法によって区別できるように、サンプル及び各アリコートを、質量分析上種類の異なる質量マーカー基をそれぞれ有する１以上の同重質量標識体を用いて相互に異なるように標識する工程と、（ｂ）質量分析法によって、前記試験サンプル中のアナライトの量及び前記キャリブレーションサンプルの各アリコート中のアナライトの量を測定し、前記キャリブレーションサンプルのアリコート中の既知の且つ測定されたアナライトの量に対して、前記試験サンプル中のアナライトの量を較正する工程とを含むことを特徴とする方法。 （もっと読む）

本発明は、セミカルバジド感受性アミンオキシダーゼ（ＳＳＡＯ）又はＳＳＡＯ活性を含有する生物学的サンプルの存在下でのメチレンアミン、メチレンアミン様化合物又はメチレンアミン部分を含有する化合物の安定性を決定するための方法を提供する。開示される方法は、ハイスループットスクリーニング適用についてのアッセイ形式に構成され得る。
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