【課題】本発明の課題は、所与の糖分子の分子構造から、MSⁿスペクトルを予測することができるスペクトル予測方法を提供することである。
【解決手段】上記課題を解決するために、本発明に係るスペクトル予測方法は、入力ファイルを読み込む読み込みステップと、前記読み込みステップにより読み込まれた前記入力ファイルに含まれる情報に基づいて、糖分子に含まれる化学結合の切断と前記糖分子のイオン化をシミュレートするシミュレーションステップと、前記シミュレーションステップにより生成がシミュレートされた前記糖分子のフラグメントの情報を記録する記録ステップと、前記フラグメントの情報に基づいて、前記糖分子のMSⁿスペクトルを予測する予測ステップとを備えたことを特徴する。 （もっと読む）

イオン移動度の予測で使用するために分子の断面積を推定する方法が、構造的に関連する異性体の分離および特徴付けを提供するために、気相相互作用半径決定および断面アルゴリズム計算を与える。より詳細には、本発明は、所定の抗癌剤の抗癌作用の差と分子構造の差を相関させる方法を、そのような薬物の分子の断面積を推定するための新アルゴリズムを利用することにより提供する。
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本発明は、イオン移動度分光計システムを構成する方法、特に、標的アナライトを検出するためのイオン移動度分光計システムを構成する方法に関する。本方法は、標的アナライトの換算した移動度定数値Ｋ_０を概算するための量子化学的手法を用いることを含む、検出アルゴリズムに基づくイオン移動度分光計システムを構成する。
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【課題】高極性成分を、イオンペア試薬を使用しない逆相液体クロマトグラフィーで分離し、質量分析する。
【解決手段】
〔1〕逆相液体クロマトグラフィーおよび質量分析装置を使用し、当該逆相液体クロマトグラフィーが（１）多官能固定相、および（２）揮発性の塩基および／または塩を含むｐＨ８〜ｐＨ１１の移動相を用いる、高極性内因性代謝物の分析方法の提供および、前記分析方法によって得られた液体クロマトグラフィー保持時間、質量分析ピーク値、および／または質量分析ピーク強度を利用し、統計解析処理を行う。 （もっと読む）

【課題】
質量分析装置を用いて、タンパク質やペプチドの立体構造の形成に重要な所定結合部位を予測し、立体構造情報の取得を実現する。
【解決手段】
質量分析の前処理法として、タンパク質またはペプチド試料に対して、立体構造の形成に重要な所定結合を切断する切断剤を添加して前処理を行い測定試料とする場合と、切断剤を添加せずに前処理を行い測定試料とする場合の２通りを行い、この２通りで処理した測定試料を質量分析装置で測定し、得られた測定データを比較解析することで、所定結合の部位を予測する。 （もっと読む）

【課題】解離して質量分析すべき親イオンの種類を減らし、リアルタイムに分析の可能な質量分析装置および質量分析方法を提供する。
【解決手段】試料１０中に含まれる物質を分離しイオン化したイオン種中から選択した親イオンを解離した解離イオンの質量分析を行う質量分析部１３と、質量分析部１３で取得されるイオン種の質量対電荷比と前処理系で取得され複数のイオン種を識別可能な特性データとを記憶するデータベース７とを有し、質量分析部１３では、解離イオンをイオン種に替えて親イオンの選択と解離イオンの質量分析を繰り返しながら、データベース７に基づいて識別できるイオン種でない親イオンを選択する質量分析装置１において、データベース７では、試薬により標識される物質がイオン化したイオン種の質量対電荷比と特性データとを複製し、複製された質量対電荷比を、試薬により物質が標識された場合の質量数の増減に基づいて書き換える。 （もっと読む）

【課題】 複数安定同位体で標識した生体試料などの２試料の混合液を液体クロマトグラフ−タンデム質量分析計で比較定量解析すると、多種類の成分が同時にイオン化するため、２次質量分析に必要な時間を十分にとれず、未分析なイオンが生じてしまう。
【解決手段】 ２次質量分析を行い、その分析データからアミノ酸配列解析を行う。アミノ酸配列解析により安定同位体で標識された特定アミノ酸の有無を判断可能になり、特定アミノ酸が含まれる場合は、ＭＳスペクトル中の同位体標識ペアのｍ／ｚを計算し、算出したｍ／ｚ情報を用いて２次質量分析対象外情報を作成する。その結果、同じペプチド由来の重複した２次質量分析が避けられ、２次質量分析を効率よく行える。 （もっと読む）

【課題】 質量分析データを用いた糖鎖構造の予測方法及びプログラムを提供すること。
【解決手段】 ＭＳ/ＭＳデータの所定ピークを基準として、質量が小さい側の所定範囲中のピークを選択する第１ステップ（Ｓ２）と、ピーク間の質量差を用いてデータベースを検索して得られた糖を接続して第１糖鎖を作成する第２ステップ（Ｓ２）と、複数種類の第１糖鎖の各々に関して、非還元末端糖を削除して第２糖鎖を生成する第３ステップ（Ｓ４）と、同じ非還元末端糖を複数含む第２糖鎖に関して、還元末端に最も近い非還元末端糖のみを残し、その他の非還元末端糖を削除して第３糖鎖を生成する第４ステップ（Ｓ４）と、第３糖鎖の各々において、非還元末端糖の非還元末端側に位置する糖を削除して第４糖鎖を生成する第５ステップ（Ｓ５）と、全ての第４糖鎖を対象として同じ順位に位置する同じ糖を１つのグループとする第６ステップ（Ｓ６）とを含む。 （もっと読む）

【課題】質量分析計で採取したデータのようなたたみ込みスペクトルを、逆たたみ込みするのに適した方法を提供する。
【解決手段】オーバーラップした同位体クラスターの群に対するたたみ込みスペクトルを受信する工程と、複数の主サマリー同位体ピークの各々について主サマリー同位体ピークを決定し、決定した各主サマリー同位体ピークに対して、少なくとも一つの下位質量同位体クラスター上側質量域サイドピークと、少なくとも一つの上位質量同位体クラスター下側質量域サイドピークとの既知強度寄与を、それぞれの主サマリー同位体ピークから差し引き、同位体クラスターの少なくとも一つの下側質量域サイドピーク及び少なくとも一つの上側質量域サイドピークの既知強度寄与をそれぞれの主サマリー同位体ピークに加えることによって、たたみ込みスペクトル中の各同位体クラスターに対する正規化ピーク強度を決定する工程を包含する方法。 （もっと読む）

【課題】複数のペプチドに由来する同位体ピーク群が重なり合っていて、しかもＭＳ／ＭＳマススペクトル上で同位体ピーク群を構成するピークの強度が小さい場合であっても、各ペプチドのアミノ酸配列を高い精度で同定する。
【解決手段】ペプチド混合物のＭＳ／ＭＳ分析で得られた同位体ピーク群をクラス分けする際に、まずプリカーサイオンの元素組成を推定した上で該プリカーサイオンに同位体が１個、２個、…含まれると仮定して（Ｓ１１）、ＭＳ／ＭＳ分析により得られるイオンの元素組成を推定し各ピークの強度比を計算する（Ｓ１３、Ｓ１４）。この理論計算による強度比と実測により得られたＭＳ／ＭＳマススペクトル上の同位体ピーク群に含まれるピークの強度比とが高い相関を有している場合に（Ｓ１９でＹＥＳ）、その同位体ピーク群をそのプリカーサイオンに含まれる同位体数のクラスに分類し（Ｓ２０）、ピークリストを作成する。 （もっと読む）

【課題】放電計算において、媒体の内部及び表面の形状や移動媒体による放電の変動を簡単に放電計算に組み込むことで、現象再現性を向上すること。
【解決手段】放電の開始判定工程と、放電による移動電荷量を算出する工程を備える放電解析方法において、乱数発生工程を有し、放電開始の判定基準又は放電による移動電荷量を乱数で与えることを特徴とする。又、放電の、開始判定工程と、放電による移動電荷量を算出する工程を備える放電解析装置において、乱数発生工程を有し、放電開始の判定基準又は放電による移動電荷量を乱数で与えることを特徴とする。 （もっと読む）

【課題】 導体の電気伝導、気中放電、物体の運動、トナー粒子の運動、トナー粒子への放電、転写媒体の変形といった転写特性に影響を与えるすべての因子を正確に考慮して、電子写真プロセスの解析を行うための技術を提供すること。
【解決手段】 力学モデルを作成した後、媒体受力計算部１９２がその力学モデルに作用する力を算出し、媒体変形計算部１９３が力学モデルと作用する力とから媒体の変形形状を計算し、電界計算モデル更新部１９４が、得られた媒体の変形結果を分割メッシュの媒体部分の分割に反映させる。 （もっと読む）

質量スペクトルにおける歪みは、式（Ｉ）で表されるｉ番目の時間ビンにおいて到着したイオンの数Ｑ_iを決定または推定することによって補正される質量分析の方法が開示される。


ｑ_iは、ｉ番目の時間ビン（ｔｉｍｅ ｂｉｎ）において記録されたイオン到着イベントの実際の総数であり、ｘは、推定された不感期間に対応する時間ビン数に対応する整数である。 （もっと読む）

質量分析データの分析に基づく癌スクリーニングモデルを用いて、上部気道消化管癌(肺癌および頭頚部癌を含む)を予測することができる。上部気道消化管癌患者から得られたスペクトルウエイト値と、このような癌のハイリスク患者から得られたスペクトルウエイト値とを比較することによって、モデルを作成することができる。予測変数または共変量の値によって、上部気道消化管癌に関連するスペクトルウエイト値が特定される。

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