【課題】分子量を基に、原子の結合に矛盾のない分子式を構築することのできる分子式構築装置を実現する。
【解決手段】原子団組成取得部６は、記憶部２に記憶された、原子団とその質量数とを対応付けた情報である質量数情報を基に、含まれる全ての原子団の質量数の合計が、与えられた分子量を満たすような原子団組成を求める。結合矛盾判定部７は、原子団組成取得部６により得られた原子団組成について、当該原子団組成に含まれる全ての原子団の結合次数を、記憶部２に記憶された原子団とその結合次数とを対応付けた情報である結合次数情報から取得し、取得した結合次数を基に、当該原子団組成に含まれる全ての原子団における結合に矛盾が有るか否かを判定する。そして、分子式構築部８は、結合矛盾判定部７により結合に矛盾が無いと判断された原子団組成から分子式を構築する。 （もっと読む）

調製された生物試料から関心対象の一部分または特性を抽出する画像処理システムである。この画像処理システムの１つの適切な用途はバイオマーカーを見つけ出すことである。しかし他の多くの適切な用途もあり得る。本システムのいくつかの構成要素は画像の前処理（データの補間、保持時間の調整、画像ノイズのフィルタ処理、バックグラウンドの推定、および合成画像の形成）；画像特徴の抽出（ピーク、同位体群、および荷電群）；および特徴特性と発現統計値、差異のある発現、および差異のない発現の計算を含む。本システムの出力はさらなる発見を補助するための関心対象の一部または特性の候補一覧表を含む。
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【課題】第１のアミノ基の保護と陽イオン交換クロマトグラフィーとを組み合わせた、ペプチド混合物を単純化する方法を提供する。
【解決手段】１タンパク質あたり平均４つの多重荷電ペプチド（ＲＨペプチド）の選択的分離と、分析されるプロテオームにおける９０％のタンパク質の研究とを可能にする。この方法は、二次元電気泳動を使用しない定量的プロテオミクス研究に適しており、どのタイプの同位体標識とも適合し、単一の実験で異なった同位体標識を用いる場合には、複数の状態（３〜６通りの状態）に存在するタンパク質の差次的発現を測定するのに非常に有用である。使用されるクロマトグラフィーシステムでは、ＲＨペプチドの分別分画も可能であり、それによって、より多数のタンパク質の同定が実現される。 （もっと読む）

【課題】 記憶されている複数の測定データの管理が容易である分析装置を提供する。
【解決手段】 測定データを取得する装置と、画面３２を備えた表示装置とを有する分析装置である。測定データは座標Ｇｃ，Ｇｄと共に画面３２上に画像として表示される。移動子３０及び３１を移動させると座標Ｇｃ，Ｇｄ上の測定データの表示内容が更新される。座標Ｇｃ，Ｇｄの画像を矢印Ａ，Ｂのようにウインドウ４２へドラッグすると、測定データがビットマップイメージＭと関連してメモリ内に記憶され、ビットマップイメージＭはウインドウ４２内に表示される。表示されているビットマップイメージＭをダブルクリックすると、記憶した測定データをいつでも再表示できる。ビットマップイメージＭは座標Ｇｃ，Ｇｄの画像そのものとすることができるので、分析者はビットマップイメージＭによって測定データの内容を容易に判別できる。 （もっと読む）

【課題】非常に多くの成分や化学ノイズを含むサンプルを分析する場合、検出成分全てのタンデム質量分析スペクトルを効率よく得ることは困難である。
【解決手段】分析対象とするイオンの質量情報（質量ｍ、電荷数ｚ）、LC保持時間、及び、タンデム質量分析スペクトル情報（解離イオンのm/zや強度など）を登録する内部データベースを有する質量分析システムを用いる。質量分析スペクトルが取得した後に、内部データベースを検索し、タンデム質量分析における前駆イオン候補数等に応じて、前駆イオン群を幾つかのグループに分類し、グループ毎に纏めてタンデム質量分析を実施する分析シーケンスを実時間で決定し、質量を分析する。 （もっと読む）

本発明は、データベースとそれに連結した演算装置とによって編集された代謝物データの視覚的表示を生成する。特に本発明は、サンプル群の三次元スペクトル分析データを自動的に受け取るためのデータベースを提供する。本発明はまた、複数の選択した代謝物に対応する複数の固有プロットと直接比較できるプロットを生成するためのデータセットを処理する演算装置を提供する。さらに、上記演算装置は、上記サンプル群に渡って上記選択した代謝物が存在することを示す視覚的表示を生成することができる。それゆえ、本発明のユーザは、上記サンプル群に渡って上記選択した代謝物が存在することを示す視覚的表示をもって、一連の複雑なデータセットを解析することができる。さらに、本発明の実施形態によって生成される上記視覚的表示によって、迅速にスペクトル分析データセットの主観的な解析ができる。
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本発明は少なくとも1つのサンプルを分析する方法に関し、その方法では、該供試サンプルは少なくとも1種の化合物を含んでなり、該方法は次のステップを含んでなる：a) 少なくとも1種の化合物を含んでなる少なくとも1つのサンプルを提供し；b)該供試サンプル中の該少なくとも1種の化合物を決定し、それによって生の結果が作成され；およびc)ステップb)で得られた生の結果を分析し、その該少なくとも1つの供試サンプルの分析には少なくとも1つの参照サンプルの分析を伴い；その分析では供試サンプルおよび参照サンプルがその方法の各ステップにおいて同一の順序で分析される。さらに、本発明は該方法を行うためのシステムを包含し、そのシステムは機能しうる形でお互いに連結された次のものを含んでなる：(a) 化合物を測定する手段；(b) プロセスのパラメーターをモニターする手段；(c) (a)の手段から得られた生の結果を分析する手段であって、生の結果を分析するための該手段は次のものを含んでなる：(i) 化合物を測定する該手段から受け取った生の結果を含んでなる第1のデータベース；(ii) モニターされたプロセスパラメーターを含んでなる第2のデータベース；(iii) その生の結果をヴァリデートするためのルールを含んでなる第3のデータベース；(iv) 同定された化合物のアロケートされた結果を含んでなる第4のデータベース；このシステムでは少なくとも第2、第3、および第4のデータベースは機能しうる形で第1のデータベースと連結されている。 （もっと読む）

【解決手段】レーザー監視装置を提供する。本発明の別の態様では、装置は、レーザーと、パルス整形器と、検出装置とを含む。本発明の別の態様は、フェムト秒レーザーと二位相パルス整形（ＢＰＳ）とを採用する。本発明のさらに別の態様は、レーザービームパルスと、パルス整形器と、ＳＨＧ結晶とを使用する。本発明のさらに別の態様では、多光子パルス内干渉位相走査（ＭＩＩＰＳ）法を、フェムト秒レーザーパルスのスペクトル位相の特性を分析し、補正するために使用する。本発明の装置のさらなる態様は、毒素、爆発物質、病原物質を含む化学・生物物質を監視するために使用する。
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特定のタンパク質のペプチドに対して実測されるＮ個の最高のイオン化強度の和または平均を較正標準と比較することにより試料中のタンパク質の絶対定量がもたらされる。この較正標準は、１つ以上の所定のタンパク質を用いて行われる先行のタンパク質ペプチド分析により生成されるテーブルの形のものであることができる。この比較は、イオン化強度の実測された和または平均に基づいてタンパク質の対応する絶対量を求めるのに使用される。単純な変換係数を較正標準値に適用して、試料中のタンパク質の絶対量を求めることができる。 （もっと読む）

【課題】
本発明の課題は、生体内における代謝物の網羅的な定量方法を見出すことにある。
【解決手段】
代謝的に同位体標識された第一の代謝物群を調製し、サンプルと混合して質量分析装置で測定することにより、サンプル（例えば、組織、生体液、細胞など）中の複数の代謝物を精度よく定量することが可能となった。また、代謝的に同位体標識された第一の代謝物群中の代謝物を定量しておくことにより、代謝物の網羅的な絶対定量が可能となった。
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化学物質を分析する方法（１００）は、混成サンプルを、各々が様々の濃度比ではあるが２つのポリペプチドの部分を含む少なくとも２つのサンプル部分に分画し、消化し、およびサンプル部分（１１０）の各々でＬＣ／ＭＳを行い、およびＬＣ／ＭＳを介して観察される前駆体イオンを、ＬＣ／ＭＳで提供される強度データに応じてこれらの対応のポリペプチドと関連させる（１７０）ことを含む。両方のサンプル部分で実質的に類似の強度比を有する前駆体イオンの集合が、同じポリペプチドと関連していることが決定される。
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物質の質量分析のデータを取得するための方法およびシステム。方法は、物質をクロマトグラフィプロセスまたはその他の分離プロセスの対象にすることと、その出力をイオン化することと、イオン化された出力を再帰的な質量解析の対象にすることと、反復的な解析の間に取得されたデータに関する改良された処理および解析を提供することとを含んでいる。本発明の一局面にしたがうシステムは、イオン源と、選択された質量のイオンの解析が可能な質量分析器と、質量分析器から、複数の質量分析を表すデータを表している信号を受信し、上記信号を保持するように構成されている。
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【課題】微量なタンパク質由来のペプチドなどを、ユーザの欲するタンデム質量分析ターゲットとして計測の無駄なく自動的に判定処理する。
【解決手段】測定対象物質をイオン化し、生成した種々のイオン種を質量分析し、生成した種々のイオン種の中から特定の質量対電荷比を持つイオン種を選択して解離させ、イオンの質量分析測定をｎ段階（ｎ＝１，２，…）繰り返すタンデム型の分析システムである。ｎ段階目の質量分析であるＭＳⁿ結果で、イオンの質量対電荷比に対するピークで表されたイオン強度に基づき、ＭＳⁿの次の分析の制御内容を分析対象イオン毎に判定するデータ処理する。イオン化検出部１４は試料から計測されイオン化されたデータを高精度に照合、同位体ピーク判定する。データ処理部１５は、ある一定期間に測定した、例えば親イオンペプチドのＭＳ^１のカウント数をＩとするとき、ペプチドのＭＳ^２の積算回数又は分析時間を１／Ｉに比例させる。 （もっと読む）

イオン検出器からの電圧信号が分析される質量分析方法が開示される。各電圧信号の二階微分を取得し、観測された電圧ピークの開始及び終了時間を決定する。次いで、各電圧ピークの強度及び平均時間を決定し、その強度及び時間値を記憶する。次いで、複数回の実験実行から観測された各電圧ピークに関係する強度及び時間値を組み合わせることにより、中間の合成マススペクトルを形成する。次いで、時間及び強度データの種々のペアを積分して平滑な連続マススペクトルを生成する。次いで、連続マススペクトルは、連続マススペクトルの二階微分を決定することによってさらに処理し得る。連続マススペクトルにおいて観測される質量ピークの開始及び終了時間を決定し得る。次いで、連続マススペクトルにおいて観測される各質量ピークの強度及び質量電荷比を決定し得る。次いで、イオン種ごとの強度値及び質量電荷比だけを含む最終の離散マススペクトルを表示又は出力し得る。 （もっと読む）

本発明は、質量分光計の使用を通じて、物質を識別、および／または物質の識別を承認するためのシステム、方法、およびコンピュータプログラミングを提供する。既知の組成物の複数の検体が未知の組成物に加えられ、その組み合わせが分析される。分析の間に獲得されたデータは互いに比較される、および／または既知または見込みの参照データと比較される。未知の組成物から成る物質を識別するため、またはそのような物質の識別を承認するために、比較が使用される。
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【課題】 試料ガス中の共存物質の濃度が変動した場合でも化学剤の濃度を適切に定量可能なガスモニタリング装置を提供する。
【解決手段】 測定対象物質を含む試料ガスを導入する試料導入部３と、試料ガスに含まれ、測定対象物質と共存する所定の共存物質の濃度を測定する共存物質濃度測定手段４と、試料ガスをイオン化するイオン化部と、イオン化部で生成されたイオンの質量を分析する質量分析計と、質量分析計によって検出された信号を解析し、測定対象物質の濃度を算出するデータ処理部７と、データ処理部７によって解析された解析結果を表示する表示部８とを備えたガスモニタリング装置１であって、データ処理部７は、所定の共存物質の濃度に対応して、測定対象物質の濃度を補正する補正手段を備えたことを特徴とするガスモニタリング装置１である。 （もっと読む）

【課題】プロテオーム解析のための迅速で、効率的でかつ費用効率的な方法の提供。
【解決手段】ポリペプチドを同定する方法であって、以下：（ａ）ポリペプチドの集団由来の親ポリペプチドのサブセットの質量と該親ポリペプチドのサブセットのフラグメントの質量を同時に決定する工程；（ｂ）注釈されたポリペプチドインデックスと該決定された質量を比較する工程；および（ｃ）該決定された質量を有する該注釈されたポリペプチドインデックスの１つ以上のポリペプチドを同定する工程、を包含する方法など。 （もっと読む）

【課題】物質の構造に関する情報の取得効率を向上し、測定及び物質同定の時間を短縮し、同定精度を向上することのできる質量分析システムを提供する。
【解決手段】イオン化された試料を質量分析する工程、質量分析で観測されたイオンの中から第１のイオンを選択して断片化する第１の断片化工程、第１の断片化工程によって生じた複数の断片イオンを質量分析する工程、質量分析の結果を用いて、第１のイオンを再構成できる断片イオンの組み合わせを求める工程、断片イオンの組み合わせに含まれる断片イオンを断片化する第２の断片化工程、第２の断片化工程で生じた断片イオンを質量分析する工程を有する。 （もっと読む）

標的（例えば生体分子）をスクリーニングするための一般システムを説明する。
スクリーニングは、以降の生物学的試験で見られるように、標的の自然発生的な低活性または不活性状態に対して結合し、標的機能のインヒビターとして作用する化合物の発見に用いることがでる。本発明は、以降の生物学的試験で見られるように、標的の自然発生的な低活性または不活性状態に対して結合し、標的機能のインヒビターとして作用する化合物を発見するために、新規な様式で、標的（例えば生体分子）をスクリーニングするための一般システムに関する。 （もっと読む）

物質の質量スペクトログラム・データを得るための方法と装置である。この方法は、（ａ）物質にクロマトグラフィ・プロセスを行ってその出力をイオン化し、（ｂ）出力の現在の質量スペクトログラムを得、（ｃ）ステップ（ｂ）で得た現在の質量スペクトルと出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、（ｄ）同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録する。質量分析計装置は、クロマトグラフィ・カラムと、質量分析計であって、クロマトグラフィ・カラムの出力をイオン化するためのイオン源を含み、選択された質量のイオンを分離し、フラグメント化し、質量分析する機能を有する質量分析計と、質量分析計を動作させるようプログラムされたデータ依存のデータ収集コントローラであって、出力の現在の質量スペクトログラムを得て、現在の質量スペクトルと出力の１つ以上の前に収集した質量スペクトルとを比較して速く立ち上がる質量信号を有する少なくとも１つのイオンを同定し、前記同定されたイオンをフラグメント化して、得られる質量スペクトルを記録するコントローラと、を含む。
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