本明細書記載の本発明は、プロテオミクス質量分析(MS)データを解析して糖タンパク質を同定および特徴づけるために開発されたツールに関する。本ツールは、4つの主要な課題を独立してまたは必要に応じて行うように設計されている：MS/MSのための糖ペプチドの選択を至適化する、MS/MSデータから糖ペプチドスペクトルを同定する、同定された糖ペプチドスペクトルの糖成分を特徴づける、およびグリコシル化前駆体をその親タンパク質に一致させる。これらの成分のそれぞれに関する設計および実行について、本特許出願においてさらに詳細に説明する。
（もっと読む）

本発明は、質量分析（ＭＳ）を用いて変異体ペプチドをスクリーニングするための方法に関する。本発明は、当該方法を実施するためのシステム及びキットにも関する。 （もっと読む）

以下の工程：ａ）試料の調製、ｂ）場合により行われる、調製された試料希釈、ｃ）場合により希釈された試料の高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）／タンデム質量分析（ＭＳ／ＭＳ）による直接的な分析を含む、試料の５ｍｇ／ｋｇ以下の量で存在する１つ又はそれ以上の殺虫性化合物を分析するための方法。 （もっと読む）

多くの障害、特に癌及びポリープのような腫瘍性障害は、過剰増殖性細胞又は分化障害を有する細胞の結果である。これらのタイプの障害に対しては、早期の検出が極めて重要であり、結腸直腸癌のようなよく見られるタイプの癌のための信頼できる及び早期のバイオマーカーはまだ得られていない。それ故、新規マーカー及びこうした新規マーカーを同定するための方法が必要とされている。本発明は、癌のような障害、好ましくは、ポリープのような結腸直腸癌性又は関連する障害のためのマーカー及び療法剤として適した、転写中間因子−１ベータ（ＴＩＦ１−ベータ）に由来するペプチド及びタンパク質及びそれらの誘導体を提供する。
（もっと読む）

【課題】 微量タンパク質に対しても適用でき、かつ確度の高い内部配列情報取得技術の確立。
【解決手段】 解析対象とするタンパク質を、所定のアミノ酸の位置において限定的に分解して、複数のペプチド断片混合物を調製し、前記ペプチド断片混合物から、１又は複数のペプチド断片を分離・精製し、前記分離・精製されたペプチド断片のＣ末端アミノ酸を、化学反応により逐次的に分解して、得られる一連の生成物を含む混合物を調製し、前記逐次的分解の反応産物、及び前記逐次的分解反応を施していない未反応のペプチド断片のそれぞれの質量分析を行い、そして、前記質量分析の結果を解析し、解析対象とするタンパク質の化学構造情報を取得する。
なし （もっと読む）

本発明は、質量分析装置を用いてタンパク質やペプチドの同定を行う場合に、より高速且つ高確度に同定を行うことが可能な質量分析方法および装置を提供する。具体的には、試料をイオン化し、質量分析装置を用いてタンパク質の分析を行う質量分析方法において、タンパク質やペプチドの情報が格納されたデータベースより、所定の情報を選出し、当該選出された成分の質量を推測し、質量ごとの頻度情報を算出し、試料を質量分析装置によって分析してマススペクトルを得、当該得られたマススペクトルと前記頻度情報に基づいて同定に用いるべき質量を選出し、当該選出された質量のマススペクトルを前駆イオンとして質量分析し、得られたマススペクトルを用いて同定処理を行う。これにより、分析の目的に合致した頻度情報を用いて同定処理に必要なＭＳ／ＭＳスペクトルを得るための前駆イオンを効率良く選択することができる。
（もっと読む）

本発明は、患者において前立腺癌状態を測定するのに有用であるタンパク質に基づいたバイオマーカーである、ApoA-IIアイソフォームを提供する。特に、本発明のバイオマーカーは、生体試料を前立腺癌または非前立腺癌として分類するために有用である。正常な前立腺特異的抗原(PSA)を有する患者において疾患を検出するApoA-IIの能力により、本発明のバイオマーカーは無痛性疾患を同定するのに有用となる。バイオマーカーは、SELDI質量分析、HPLC、PAGE、およびウェスタンブロッティングにより検出することができる。 （もっと読む）

【課題】従来の技術に固有の制限を克服するｐｒｏｔｅｏｍｅ分析において使用され得る方法および試薬を提供する。
【解決手段】自動化ＬＣ／ＭＳ／ＭＳシステムであって、以下： （ａ）キャピラリーＨＰＬＣと流体接続するオートサンプラー （ｂ）該キャピラリーＨＰＬＣと流体接続するエレクトロスプレーイオン化三連四重極ＭＳ／ＭＳ装置；および （ｃ）該オートサンプラー、キャピラリーＨＰＬＣおよびＭＳ／ＭＳ装置と電気接続する装置制御およびデータ分析システムを備える、システム。 （もっと読む）

転写因子が結合し得るエレメント配列を含む少なくとも１つのポリヌクレオチドが基板上に固定化されてなるトランスクリプションチップ。
（もっと読む）

【課題】蛋白質の酵素による消化分解物など、複雑で分離の難しい混合物に対しても、含まれている成分毎にマススペクトルを分離して得る。
【解決手段】質量分析計により取得されたトータル・イオン・クロマトグラムの中から、所望のピークトップ近傍の積算マススペクトルを表示させ、表示された積算マススペクトルの中から所望のマスピークを選択し、選択されたマスピークのマスクロマトグラムと溶出開始時間、最大溶出時間、溶出終了時間が一致する他のマスクロマトグラムを抽出し、マスピークとして選び出すことにより、単一成分のマススペクトルを再構成するものであって、クロマトグラフ装置からの溶出開始時間、最大溶出時間、溶出終了時間の決定は、マスクロマトグラムの時間的変化に高次関数曲線またはガウス関数曲線をフィットさせることによって行なう。 （もっと読む）

【課題】 多数の試料を迅速に分析する手段を提供し、核酸およびタンパク質等の生体分子の分析を迅速に実施する方法を提供する。また、高分子量の生体分子を分析する方法を提供する。
【解決手段】 生体分子を分析する方法であって、試料中の生体分子を固体支持体上に固定化すること、固体支持体上の生体分子を酵素で分解すること、および得られた分解物を質量分析することを含む前記方法。 （もっと読む）

本発明は、ヒトおよび動物由来の生物学的サンプル中の病原体を同定する方法、ヒトおよび動物から得られるサンプル中に存在する複数の病原体を分析する方法、病原体についての詳細な遺伝情報または病原体を決定する方法、そして環境的サンプル、臨床的サンプルまたはその他のサンプル由来の生体物質を迅速に検出および同定する方法を提供する。 （もっと読む）

【課題】計算処理の効率化を図り、精度の高いアミノ酸配列同定方法を提供する。
【解決手段】 マススペクトルを入力する入力手段と、プレカーサーの質量より考えられるアミノ酸組合せを算出し、アミノ酸の理論質量値と、上記入力手段から入力したマススペクトルのうち特定のマススペクトルの質量電荷比から算出される実測質量値との差を算出し、算出した差のなかで所定の範囲内にあるものを同定し、同定した差を算出するのに使用したN個のアミノ酸をd+1〜d+N番目のアミノ酸の候補アミノ酸とする候補アミノ酸検索手段と、アミノ酸の組合せに従いながらアミノ酸同定候補を絞り込み、各候補アミノ酸に関してイオン強度より算出した正規化相対イオン強度とアミノ酸巻の切れやすさの確率を評価関数に用いてそれぞれ評価値を演算する評価値演算手段と、評価値を用いてペプチド断片におけるアミノ酸配列を同定する同定手段とを備えるアミノ酸配列同定装置。 （もっと読む）

特定の典型的な実施形態は、ＦＴＭＳを使用して反復定量分析を実行するための方法を提供する。本方法は、複数の潜在的アクティビティを含んでいてよく、それらの一部は自動的に、繰り返して、および／または枝分かれさせて実施することができ、そしてそれらの一部は引き続いて発生する。少なくとも１つの所定試料源から試料を入手してＦＴＭＳへ提供できる。ＦＴＭＳのための少なくとも１つの変数は最適化できる。ＦＴＭＳから複数の出力を入手できる。試料の少なくとも１つの主要なイオン成分の同一性を確定できる。少なくとも１つの主要なイオン成分の量を決定できる。
（もっと読む）

マイクロチップ（３５３）に形成された流路において予め試料を複数の成分に分離した後、分離方向に沿って流路にレーザー発信器（３６１）からレーザー光を照射し、流路で分離された各画分を順次イオン化する。イオン化されたフラグメントを質量分析部（３６３）にて検出し、分析結果解析部（３７１）にて解析する。解析結果は、駆動機構制御部（３６７）における位置情報、レーザー制御部（３７３）におけるレーザー光照射条件の情報と関連づけられて記憶部（３６９）に保存され、イメージ化部（３７５）にてイメージ化される。イメージ化された解析結果は、ディスプレイ（３７７）に表示される。
（もっと読む）

配列変化分析用の断片化をベースとした方法及びシステム、特に質量分析方法及びシステムを提供する。 （もっと読む）

細胞において微小管の重合もしくは脱重合を妨げる化学療法剤は、細胞の複製の強力なインヒビターである。このような薬剤の例としては、ヘミアスタリンアナログが挙げられる。ヘミアスタリンのアナログに対する特定の癌の感受性が特定のチューブリンのアイソタイプの発現または他の微小管結合タンパク質（例えば、ＭＡＰ−４およびスタスミン）の発現と相関することが、示されている。これらのような相関は、特定の化学療法剤を使用する処置に適した患者を同定するのに使用され得る。このようなシステムは、その癌に対する効果が最小限であるか、またはその効果がない細胞傷害性化合物による患者の処置を回避する。本発明はまた、異なる化合物および癌の型について、これらの相関を確立するシステムを提供する。そのシステムは、抗微小管薬剤と癌（例えば、肺癌、乳癌、および卵巣癌）との間の相関を確立するのに特に有用である。
（もっと読む）

【課題】構造未知の糖鎖についてＣＩＤ−ＭＳⁿ測定を行い、得られたデータをすでに取得されている参照データと比較することにより該糖鎖の構造解析を行う方法を提供する。
【解決手段】（ａ）目的糖鎖について特定のｍ／ｚのフラグメントイオンが得られるまでＣＩＤ−ＭＳⁿ測定を行い、（ｂ）該フラグメントイオンについてさらにＣＩＤ−ＭＳ／ＭＳ測定を行い、得られた特定のｍ／ｚの娘イオンの総イオンカウント数とＣＩＤエネルギーとの関係を示すＣＩＤエネルギー依存曲線を作成し、（ｃ）該ＣＩＤエネルギー依存曲線と、構造既知の参照糖鎖から得られた、上記フラグメントイオンと同一のｍ／ｚのフラグメントイオンをＣＩＤ−ＭＳ／ＭＳ測定することにより得られた、上記娘イオンと同一のｍ／ｚの娘イオンのＣＩＤエネルギー依存曲線とを比較する糖鎖構造解析方法が提供される。 （もっと読む）

本発明は、結腸直腸腺腫及び／又は結腸直腸癌腫を検出するための方法であって、ａ）個体から採取した単離供試材料を用意し、ｂ）単離した当該供試材料中のＣ３ａ又はその誘導体のレベルを定量し、ｃ）定量したＣ３ａ又はその誘導体のレベルを１以上の基準値と比較する、工程を含む方法に関する。本発明はさらに、結腸直腸腺腫と結腸直腸癌腫とを識別するための方法や、結腸直腸腺腫及び／若しくは結腸直腸癌腫の経過、並びに／又は結腸直腸腺腫及び／若しくは結腸直腸癌腫の処置をモニターするための方法に関する。さらに、本発明は、これらの方法において使用するための試験システム及びアレイに関する。さらには、本発明は、個体における結腸直腸腺腫及び／又は結腸直腸癌腫の検出のためのバイオマーカーとしての、Ｃ３ａの使用に関する。さらに本発明は、化合物が結腸直腸腺腫及び／又は結腸直腸癌腫の処置において有効かどうかを判定するための方法に関する。 （もっと読む）

本発明は、窓開き構造を同定するための原形質膜マーカーに関する。本発明はまた、原形質膜マーカー及び光学顕微鏡を用いて窓開き構造を視覚化する方法にも関する。本発明はまた、窓開き構造に対する原形質膜マーカーを同定する方法にも関する。特に、本発明は、窓開き構造多孔板の成分としてのモエシンの特徴付けに関する。とりわけ、本発明は、原形質膜マーカーとしてのモエシンの使用に関する。内皮細胞の窓又は透過性の同定のための原形質膜マーカーとしてモエシンを使用し得る。
（もっと読む）