【課題】構成が簡単で、小型化及び複合装置での具現が容易で、高温安定性を持たないDNAポリメラーゼも使用できる、熱対流を利用した核酸配列増幅装置及び方法を提供する。
【解決手段】試料内の複数の特定領域に対して熱を供給しまたは熱を奪う複数の熱源を試料と熱的に結合させる工程であって、前記試料内の複数の特定領域のうち相対的に高い温度に保持される領域が相対的に低い温度に保持される領域よりも低く位置するように配置され、それによって、ポリメラーゼ連鎖反応が効率よく起こり得る特定の空間的温度分布を試料内に保持させる前記工程を含む、熱対流を利用した核酸配列増幅装置及び方法。 （もっと読む）

【課題】Ｚａｒｌｉｎｇ法の不十分さを克服する改善されたリコンビナーゼ依存性のＤＮＡ増幅方法を提供すること。
【解決手段】ＲＰＡと称されるＤＮＡ増幅方法。ネスティドＲＰＡ増幅のプロセス。二本鎖標的分子のＤＮＡ増幅のＲＰＡプロセス。ＲＰＡを使用して遺伝子型を検出する方法。これらの方法は、ｄｓＤＮＡの指数関数的増幅を達成するために設計されている。これらの方法は、動的なＲｅｃＡ／ＤＮＡフィラメントの存在下で、標的核酸中の標的化可能配列の迅速な再生を可能にすることによって、これを達成する。さらに、１つ以上の方法は、リーディング鎖およびラギング鎖の合成を組み合わせて、同時に２つの二本鎖産物を生成することによって、標的核酸の両端からの、同調した複製の開始についての要件を排除する。 （もっと読む）

本発明は、生体物質を保持する固相コーティング担体を製造する方法に関する。さらに、本発明は、生体物質を結合させる固相コーティング担体および医薬品の調製のための固相コーティング担体の使用に関する。さらに、本発明は、患者の血液、リンパ、または脳脊髄液を接触させ、濾過し、または清浄化するための方法、疾患の診断のための方法、および診断組成物、を提供する。 （もっと読む）

本発明はカテゴリー変数について分析されるべき試料をプールする方法に関し、ここで該分析は分析物の定量的測定を含み、該試料をプールする方法は、ｎ個の試料のプールを用意することを含み、ここで該プール内の個々の試料の量は、該試料中の該分析物がＸ^０：Ｘ^１：Ｘ^２：Ｘ^{（ｎ−１）}のモル比で存在するものであり且つ、ｘは、カテゴリー変数のクラスの数を表す２以上の整数である。 （もっと読む）

【課題】本発明は、ＰＣＲ法をはじめとする核酸合成法において、核酸合成効率を向上させることができる化合物を含む組成物、および当該組成物を用いた核酸の変性方法、核酸の合成方法、並びに当該化合物の効率的な製造方法に関する。
【解決手段】本発明にかかる組成物は、分子内に少なくとも１組以上のカチオンとアニオンとの双性イオンを有するベタインであって、(a)カチオンとアニオンと間のスペーサー長が少なくともＣ₃以上である、および／または（b）アンモニウム基の置換基がＣ₂以上であるベタインを含む。本発明にかかる組成物によれば、高いＧＣ含量のＤＮＡ領域の融解温度を低下させることによって、これまで困難であった当該ＤＮＡ領域の合成を容易にする。 （もっと読む）

【課題】ゲノム配列における大量のデータの解析が簡単に行え、回文構造の解析結果が、視覚的に部位が判別可能に得られるゲノム配列における回文構造検出装置を提供する。
【解決手段】本発明の回文構造検出システムは、ゲノム配列にて塩基対を形成する塩基各々に同一の数字を宛がい、それぞれに極性の異なる符号を付し、回文構造を検出するものであり、ゲノム配列における各塩基を、対応する符号の付された数字に置き換える塩基／数字変換部と、解析範囲内の両端から中央方向に塩基を一つずつずらし、解析範囲内の各両端からｎ個ずつの塩基を両端からの位置に対応して組合せて、設定された数の塩基対を生成する塩基対生成部と、この塩基対各々の塩基に対応する数字を独立して加算するｎ個の第１の加算部と、第１の加算部毎に設けられ、加算結果の絶対値を算出する絶対値部と、解析範囲内の上記絶対値を加算する第２の加算部とを有する回文演算部とからなる。 （もっと読む）

本発明は、直接DNA配列決定、再配列決定またはSNPコーリングのようなさらなる分析のための、標的核酸、好ましくはゲノム試料の複雑性を減少させるための標的核酸の捕捉および増大のための新規方法およびシステムを提供する。特に、本発明は、溶液系形式における標的配列の増大を提供する。 （もっと読む）

伸長した形態で核酸分子をディスプレイする段階；分子を操作して核酸分子の長さに沿って、ポリメラーゼのアクセス可能な複数のプライミング部位を形成する段階；1つまたは複数のプライミング部位で伸張反応を開始する段階；伸張反応中に放出されるシグナルをモニターする段階；およびシグナルを分析して核酸分子の配列を決定する段階による、リアルタイムで単一核酸分子の順序づけられたセグメントのシーケンシングをするための新規の方法が開示される。

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本発明は、一般に、DNAまたはRNAもしくはタンパク質発現プロファイルにおける変化が腫瘍の発症、発症素因および/または進行を示すという点で、核酸分子に関するものである。特に、本発明は、DNAまたはRNAもしくはタンパク質発現プロファイルにおける変化が大腸腫瘍、例えば、腺腫もしくは腺癌の発症および/または進行を示すという点で、核酸分子に向けられる。本発明のDNAまたは発現プロファイルは、結腸直腸腫瘍、例えば、結腸直腸腺癌の診断および/またはモニタリングに関するものを含むがこれらに限定されない適用の範囲において有用である。したがって、関連する局面において、本発明は、1種もしくはそれ以上の核酸分子マーカーのDNAにおける修飾またはRNAもしくはタンパク質発現プロファイルについてスクリーニングすることにより、腫瘍の発症、発症素因および/または進行について対象をスクリーニングする方法に向けられる。 （もっと読む）

【課題】本発明は、リニアビーコンに関する方法、キットおよび組成物に関する。
【解決手段】標的配列の非存在下では、リニアビーコンは、プローブの反対の端に結合したドナーとアクセプター残基間の効率的なエネルギー移動を促進する。プローブが標的配列にハイブリダイズすると、プローブの少なくとも１つのドナーまたはアクセプター残基の少なくとも１つの性質の測定可能な変化があり、これは、試料中の標的配列を検出、同定または定量するのに使用することができる。 （もっと読む）

【課題】単一分子レベルで生体分子の高精度及び高感度検出が可能な生体分子検出素子を提供する。
【解決手段】表面に単一プローブ分子を固定した金属微粒子を製造するとともに，該金属微粒子を担体基板表面に固定した単一プローブ分子素子を製造する。 （もっと読む）

本発明は、試料中の分析物の検出に用いるための膜貫通タンパク質細孔に関する。細孔は、細孔と分析物との間の相互作用を助長する分子アダプターを含む。アダプターは、細孔を用いて分析物を検出することを可能にする向きで、細孔と共有結合している。

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生体サンプル反応を行なうための装置は、一般的な顕微鏡の並進ステージに据え付けられるように構成された複数のフローセルを備え、各フローセルは、生体サンプルを収容する少なくとも１つのサンプル・ホルダーを受け入れるように構成される。各フローセルは、少なくとも１つのサンプル・ホルダーを前記フローセル内に位置付ける開いた位置と、前記少なくとも１つのサンプル・ホルダー内に収容される生体サンプルを反応させる閉じた位置とに、選択的に設置されるように構成される。前記複数のフローセルは、前記開いた位置及び前記閉じた位置に互いに独立して選択的に設置されるように構成される。
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【課題】最終的に除外されてしまうような第２、第３読み枠に翻訳停止コドンが出現する塩基配列を予め除外した形で計算を行い、計算時間の大幅な短縮、計算機のメモリ使用量を大幅に短縮する多機能塩基配列の設計方法を提供すること。
【解決手段】ジペプチド配列がすでに第２、第３読み枠の翻訳産物の情報を内包していることに着目し、タンパク質を２０種のアミノ酸の連結産物として分析することなく、ジペプチド配列の重複連結産物として分析・計算する。例えば、“Leu-Ser”では第２、第３読み枠に終止コドンを含まない６×６−１０＝２６種として以後計算すればよい（図１）。また、“Leu-Ser-Arg”の配列は、２６種の“Leu-Ser”６-merコドンと、３２種の“Ser-Arg”６-merコドンを、セリンの同じコドンを用いる組み合わせを選び連結することで、２１８種のうち１４２種を以後計算すればよい。 （もっと読む）

【課題】修飾核酸合成用アミダイドを用いた修飾核酸合成方法を提供すること。
【解決手段】非プロトン性溶媒中で脱保護可能な保護基を有し、かつ、保護基が脱保護された際に、置換基中に水酸基が発現することを特徴とする下記一般式（Ｉ）で表される修飾核酸合成用アミダイド、及び前記修飾核酸合成用アミダイドを用いた修飾核酸合成方法である。


ただし、前記一般式（Ｉ）中、Ｘは塩基を表し、Ｙは置換基を表し、Ｚは前記置換基における水酸基を保護するための保護基を表し、Ｑは水素原子、水酸基、又は保護基で保護された水酸基を表す。 （もっと読む）

【課題】簡便、迅速、安価に、標的DNAを検出する方法を提供する。
【解決手段】キメラプローブ３０を標的DNA１０にハイブリダイズさせ、ハイブリッド鎖を形成させる工程と、前記ハイブリッド鎖をリボヌクレアーゼによって切断し、前記キメラプローブの断片を遊離させる工程とを含む第一の反応と、前記断片を一本鎖環状DNAにハイブリダイズさせる工程と、前記断片を鎖置換型DNAポリメラーゼによって伸張させる工程と、前記伸長した断片を検出する工程とを含む第二の反応とを具備する、標的DNA検出方法。 （もっと読む）

化学改変および高スループットDNAシークエンシングに好適なDNA鋳型を作製するための新規な方法および組成物が開示される。構成要素であるシトシンが5−メチルシトシンで置換され、結果として生じるアダプターを亜硫酸水素媒介性脱アミノ化に対して耐性にするDNAアダプター設計の方法もまた開示される。前記アダプターが二本鎖DNA鋳型上に連結されると、その後のDNA変性および亜硫酸水素処理は、鋳型DNAシトシンを差次的にウラシルに脱アミノ化させるが、連結アダプターの5−メチルシトシンは化学変換に抵抗するので、結果としてアダプター配列を未変化で残留させる。そこで亜硫酸水素処理されたDNAの両方の鎖は、未変化アダプター配列にハイブリダイズする単一プライマーセットを用いて増幅させることができる。さらに、亜硫酸水素反応のための条件を最適化するための規定のメチル化組成物のコントロール鋳型を作製するための方法もまた開示される。好ましい実施形態では、本発明は、DNAメチル化を試験するための従来型のSolexa（商標）、SOLiD（商標）又は454（商標）−型DNAシークエンシング・プラットフォームを使用して、全ゲノム亜硫酸水素−DNAシークエンシングに好適な鋳型を作製することができる。 （もっと読む）

本発明は，ｐＶＩＩに由来する新規な結合タンパク質を用いて，フィラメント状のファージ上にディスプレイされるペプチドの代替的な足場を提供する。フィラメント状のファージのライブラリーは，結合タンパク質から生成可能である。ファージディスプレイシステムは，ファージミドと，本発明の一部をなすヘルパーファージとを含む。本発明のある側面は，ファージディスプレイシステムを含むキットであり，該システムは，ファージミドと，ヘルパーファージとを含む。該ヘルパーファージは，本発明よる結合タンパク質をコードする核酸を含む。 （もっと読む）

支持体の求核性表面を改変する方法が記載される。本方法は、多機能性求電子性試薬を、該支持体の表面の求核性基と反応させる工程を含む。できた求電子性表面を、求核性官能基を有する粒子（例えばビーズ）の共有結合のために使用し得る。例えば、求核性（例えばアミン）基を有する核酸鋳型を、該粒子の表面に結合し得る。該核酸鋳型における求核性基を、次いで該支持体の改変された表面に該粒子を結合させるために使用し得る。できた支持体結合粒子を、該粒子上の核酸鋳型を分析する（例えば配列決定する）ために使用し得る。
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ヒトの癌を区別する方法であって、一つ又は複数の転写された超保存領域(T-UCR)発現プロファイルを用いることを含み、UCRのゲノム位置と分析された癌関連ゲノムエレメントとの間の関連が統計的に高度に有意であり、miRNAに関して報告されたものと比較しうるものである方法が本明細書で記載される。 （もっと読む）