【課題】コンピュータによって実行される以下の方法。生物リスト中の一種類以上の生物に関連する標的配列のリストを提供すること。それらの標的配列の一つ以上にハイブリダイズすると推定される候補プロトタイプ配列のリストを提供すること。各候補プロトタイプ配列に対応するプローブのコレクションであって、各プローブコレクションが、対応する候補プロトタイプ配列の所定の一定のサブ配列長を有するすべてのサブ配列に対するプローブのセットを有するコレクションを作製すること。
【解決手段】これらのセットは、対応するサブ配列と、対応するサブ配列の中心にあるヌクレオチドを変えることによって形成された、対応するサブ配列のあらゆる変異とからなる。各標的配列に対応する断片のセットであって、各断片セットが、対応する標的配列の所定の一定の断片長を有するすべての断片を有するセットを作製すること。各断片が、その断片の相補配列と結合する自由エネルギーを計算すること。いずれの結合自由エネルギーが上記所定の一定の閾値を超える場合には、その断片を一度に一塩基ずつ延長して、結合自由エネルギーが閾値を下回るか、断片がプローブと同じ長さになるまで、延長断片のセットを作製すること。どの延長断片が、プローブのいずれかに完全に一致するかを決定すること。各候補プロトタイプ配列に対応するベースコール配列を集める。このベースコール配列は、いずれかの延長断片に完全に一致する対応するプロトタイプ配列の各プローブの中央にあるヌクレオチドに対応するベースコールを有するが、完全に一致するプローブを含むプローブのセットの残りメンバーは、いずれの延長断片とも完全には一致せず、別の状況ではベースコールしない。 （もっと読む）

本発明により、以下を含む検出システムが提供される：試料中の蛍光体を励起するのに十分な波長を有する励起光を生成する光源；励起光の経路に沿った第一の線に沿って配置される励起フィルターであって、光源からの励起光を透過する励起フィルター；第一の線に沿って配置されるビームスプリッターであって、励起フィルターによって透過された励起光を、ビームスプリッターの一つの側面上に配置されるミラーへ向けて第二の線に沿って反射し、かつ第二の線に沿って反射された発光を通過させるビームスプリッター；ビームスプリッターからの励起光を、第一および第二の線の双方に対して垂直である第三の線に沿って、試料中の蛍光体へと反射するように配置されるミラーであって、第三の線に沿って発せられた発光を、ビームスプリッターへ向けて第二の線に沿ってさらに反射するミラー；ビームスプリッターの第二の側面上に、第二の線に沿って配置される発光フィルター；ならびに発光フィルターによって透過された発光を検出する検出器。

（もっと読む）

【課題】コンタミネーション（細菌感染や汚濁）の可能性を低減すること。
【解決手段】ディッシュ１１に保持された培養液中の試料細胞に向けて、当該試料細胞に作用する物質を含む液体を吐出する液滴吐出装置１０を、上記試料細胞に作用する物質を含む液体を保持するとともに、当該液体を吐出する吐出口を有する吐出ヘッド１２と、印加される電圧に応じて、上記吐出ヘッド１２の吐出口から当該液体を吐出させる圧電素子３４と、上記吐出ヘッド１２の吐出口が上記培養液に非接触の位置にあるときに、上記圧電素子３４に所定の電圧を印加する制御用・画像表示用ＰＣ１７と、から構成する。 （もっと読む）

【課題】反応以外での待機時間が長くなることに伴う検体と試薬の劣化を防ぐとともに、装置の稼働効率の向上を図る。
【解決手段】少なくとも２つが独立して検体をそれぞれ反応させる複数の反応部と、検体の反応以外での待機時間の上限値、および検体の反応時間を入力するための入出力ターミナル１５と、入出力ターミナル１５で入力された反応以外での待機時間の上限値、および反応時間に基づいて、検体の投入時刻、および検体を処理するために使用する反応部、および検体の反応以外での待機時間のいずれか一つ以上を決定するスケジュール管理部４４と、スケジュール管理部４４による決定に基づいて複数の反応部で検体を処理するように制御する全体制御部４０とを備える。 （もっと読む）

【課題】RNAの分解度を測定し、RNAの品質を検査する方法およびその方法に用いるデバイスの提供。
【解決手段】RNA試料から短鎖分画を抽出し、分解指標核酸プローブを搭載した核酸アレイを用いて、短鎖分画に含まれる核酸の中から分解指標核酸由来の核酸断片を検出する。 （もっと読む）

本願発明は、生体分子の酵素過程を観察するための方法及び装置を提供する。酵素過程とは、とりわけ、核酸の増幅（例えばＰＣＲ）におけるポリメラーゼ活性である。センサーの表面に付着した磁性粒子の量を測定することを、酵素過程の最中に少なくとも１回行うことによって、この観察を行う。本願発明の実施例による方法及び装置を使って、酵素過程を時間の関数として観察してもよい。
（もっと読む）

【課題】液残りや逆流を解消でき、確実に送液することのできる生物化学反応用装置及び生物化学反応方法を提供する。
【解決手段】生物化学反応用装置１００は、基板１と、基板１に重ねて設けられた弾性体２との間に、溶液Ｘ，Ｙが収容される複数の室２１〜２４及び複数の室２１〜２４を連結する流路２５を有するカートリッジ３と、弾性体２の表面に接触しながら回転移動することにより、弾性体２に外力を加えて流路２５又は室２１〜２４あるいは両者を部分的に変形させ、流路２又は室２１〜２４にある溶液Ｘ，Ｙを移動させるローラ４とを備える。ローラ４のローラ軸４１に直交する断面形状が、少なくとも三つ以上の角部４３１〜４３４を有し、各角部４３１〜４３４同士の間の各辺の長さｎがともに等しい形状である。 （もっと読む）

【課題】感染源となる病原体や有害な検査標本などを完全に遮断した状態で検査処理を行うことができ、また、検査処理の自動化及び装置の小型化を図ることによって迅速かつ容易に検査することのできるカートリッジ用検査装置を提供する。
【解決手段】カートリッジ用検査装置１００は、基板１と、基板１を重ねて設けられた弾性体２との間に、溶液Ｘ，Ｙが収容される複数の室２１〜２５及び流路２６，２６，２７，２７を有するカートリッジ３と、弾性体２に外力を加えて流路２６，２６，２７，２７又は室２１〜２５にある溶液Ｘ，Ｙを移動させることによって検査処理を自動的に行う送液装置４とが配された筐体５を備え、筐体５は、外気に対して密閉され、筐体５内から外部に通じる排気路に除菌フィルタ６３が設けられた安全キャビネットである。 （もっと読む）

ディップ・ペン・ナノリソグラフィを含むリソグラフィによって作製されるナノアレイテンプレート上で、TMVなどのウイルス粒子のサイト分離および配向を制御するための、新規な配位化学または金属イオン結合アプローチである。多くのウイルスに固有の表面の化学的性質を用いることによって、金属イオンに基づく化学または無機の配位化学を用いて、個々のウイルス粒子を、遺伝子改変を必要とすることなく固定化した。単一粒子の制御によって、ウイルス構築物とアレイを構成する装備との間のサイズの不一致によりマイクロアレイが不可能であったウイルスを含む広範な研究が可能となる。これらには以下が含まれる：単一粒子、単一細胞感染性の研究、材料合成および分子電子工学におけるテンプレートのような構造物の探索、ならびに表面の提示がその生物活性にいかに影響しうるかの理解を目的とした研究。これは、単一粒子レベルでのそのような制御の先駆的な例であり、従って、生物学的システムにおけるナノアレイの商業的な使用である。

（もっと読む）

【課題】被検体との接触・反応後のプローブ担持粒子の粒子液と、分離液とが効果的に分散し、液体中のプローブ担持粒子が凝集されてしまうことなく攪拌することができるとともに、確実に被検体中の標的物質を分離することのできる分離装置および分離装置を用いた自動攪拌システム、また分離装置を用いた分離方法および分離装置を用いた自動攪拌方法を提供する。
【解決手段】プローブを担持した粒子と被検体中の標的物質とを反応させ、被検体中から標的物質を分離するために用いられる分離装置であって、前記分離装置は、被検体との接触後の前記粒子および分離液を収容するとともに、粒子含有液から液体のみ選択的に通過させるフィルターが底部に配設された液体収容部と、前記液体収容部に収容された粒子含有液を振動させる振動部と、を少なくとも有する。 （もっと読む）

本発明は、血小板機能を診断する方法であって、
(a) 被験体から血小板含有サンプルを採取するステップ、および
(b) 好ましくは該サンプルを血漿凝固および/またはフィブリン形成を阻害し得る条件下で保持するステップ、
(c) 該血小板に由来する血小板機能マーカーまたはかかるマーカーの変異体を溶液化するステップ、
を含んでなり、ここで少なくともステップb)とc)は血液採取デバイス中で実施され、および/またはさらに該溶液中の該血小板機能マーカーのレベルが測定される、上記の方法を提供する。好ましくは、血小板機能マーカーは、in vitroで血小板を活性化させることにより、またはタンパク質分解によって溶液化される。血小板機能の好適なマーカーとしては、CD40L、sCD40L、P-セレクチン、可溶性P-セレクチン、GP-IV、可溶性GP-IV、GP-V、可溶性GP-V、GP-VI、可溶性GP-VI、CD63、血小板因子4(PF-4)、β-トロンボグロブリン(β-TG)、またはこれらの変異体が挙げられる。本発明の方法は、血小板機能低下または血小板機能亢進、心血管疾患、および血小板機能低下または血小板機能亢進に関連する任意の疾患の診断または測定を提供する。 （もっと読む）

【課題】核酸の迅速な増幅を都合よく可能にする、機器及び方法を提供する。
【解決手段】実質的に平らな温度センサー素子４、実質的に平らで硬い熱伝導基板５、実質的に平らな抵抗ヒーター、実質的に平らな絶縁層、及び冷却素子９を含んで成る、制御された方法において対象を加熱及び冷却するための機器１であり、機器の中の装置を加熱及び冷却することを含んで成り、核酸を含む液体の混合物を、機器中の装置中に供給し、温度サイクルにかけることを含んで成る、核酸の増幅のための方法。 （もっと読む）

【課題】微粒子封入時の操作性改善、封入微粒子の自由度向上。
【解決手段】基板とその一部に密着可能なカバーとを含むマイクロアレイであって、カバー表面に帯電防止加工が施されており、かつカバーがそれを貫通する少なくとも１つの孔を有していることを特徴とするマイクロアレイ。 （もっと読む）

【課題】効率的な疾患感受性遺伝子の探索方法及びその装置を提供する。
【解決手段】ホモ接合判定対象となる多型マーカーを選択する多型マーカー選択ステップと、二倍体以上である検体ＤＮＡの多型マーカーを構成している塩基が、ホモ接合であるかを判定するホモ接合判定ステップと、ホモ接合と判定された多型マーカーのみを選択して各検体に対してホモ接合型ハプロタイプ情報を得るホモ接合型ハプロタイプ情報取得ステップと、二以上の検体の前記ホモ接合型ハプロタイプ情報を比較し、共通ホモ接合領域情報を取得する共通ホモ接合領域情報取得ステップと、各共通ホモ接合領域情報ごとに所定の同祖判定条件を満たした場合に、その共通ホモ接合領域が各検体間で同祖領域であると判定する同祖領域判定ステップと、を有する同祖領域判定方法、該方法を用いた装置及び遺伝子スクリーニング方法を提供する。 （もっと読む）

【解決手段】 組織サンプルを解析するシステムであって、通常、１以上の細胞の複数のチャネルを含む１以上の画像を少なくとも一時的に記憶する記憶装置と、１以上の細胞内の領域から他の細胞内の領域に転位したバイオマーカーの範囲を決定し、転位の範囲と対応するスコアを生成することに適する処理装置とを含む。 （もっと読む）

【課題】高速に、しかもその場で高分子、例えば遺伝子の前処理や遺伝子診断を行なうことができる、マイクロ流路チップとこれを用いた生体高分子の処理方法を提供する。
【解決手段】マイクロ流路チップ１は、溶液導入口２Ａ，２Ｂと溶液排出口４Ａとを有するマイクロ流路２と、マイクロ流路２に設けられるマイクロピラー２Ｐと、マイクロピラー２Ｐと溶液排出口との間に設けられるハイドロゲルバルブ５とを備え、マイクロピラー５は、溶液導入口２Ａから導入される溶液のｐＨによりゼータ電位が変化する材料で被覆され、ハイドロゲルバルブ５は高分子材料からなり溶液のｐＨの変化により開閉する。 （もっと読む）

【課題】 化学発光分析方法およびその装置において、化学発光強度の時間変化を考慮して化学発光強度を精度高く補正して計測すること、測定項目間での発光強度の違いを正確に校正して比較することを課題とする。
【解決手段】 流路に配列しかつ表面に酵素が存在する複数の担体に、酵素の基質を含む溶液を流液させながら供給し、酵素と基質との化学発光反応を生じさせ、担体を含む領域について経時的に光学検出して化学発光検出を行い、検出結果から化学発光反応の発光減衰校正曲線を算出し、複数の担体の少なくとも一部についての光学検出の結果をこの発光減衰曲線に基づいて補正して化学発光分析を行う。 （もっと読む）

【課題】マイクロアレイ実験における遺伝子発現量の解析の精度を向上させる解析方法および解析装置を提供する。
【解決手段】マイクロアレイに、解析対象とするターゲットの塩基配列に対応した塩基配列を有する計測プローブと、解析対象とするターゲットの塩基配列に対応しない塩基配列を有するランダムプローブとを配置する。ランダムプローブの蛍光強度の測定値から、プローブに非特異的に結合するターゲット（バックグラウンドターゲット）の量（ｔ^ns）を求める（Ｓ３３）。バックグラウンドターゲットの量と各プローブの結合エネルギーとに基づき、計測プローブの蛍光強度の測定値におけるクロスハイブリダイゼーションの影響度（NS_i）を予測する。計測プローブの蛍光強度の測定値（Ｉ^m_i）からクロスハイブリダイゼーションの影響度を除外して、解析対象とするターゲットの量（ｔ^t_i）を求める（Ｓ３４）。 （もっと読む）

遮断シグナルを測定する電解検知システム１が、ＤＮＡ１８’等の流体チャネル１６、１６’を通じる分子１８の制御される転位を可能にする。ＤＣ電源２３が供給する実質的に一定の電界が流体チャネル１６、１６’にわたって印加され、システム１内の分子１８の転位を誘発する。ＡＣ電源２２、２２’が供給する振動電気パラメータ（例えば電流又は電圧）も遮断シグナルを測定する手段として流体チャネル１６、１６’にわたって印加される。実質的に一定の電界を変更して、分子１８のより詳細な制御を提供し、任意選択的に分子１８の選択された部分をチャネル１６、１６’に複数回通して多数のシグナル測定値を提供できる。温度制御ステージ１４がこのシステムを冷却し、分子転位のさらなる制御を提供する。変性又は非変性タンパク質孔３８を流体チャネル１６、１６’内で利用できる。本システムにより長いＤＮＡ１８１鎖を増幅を用いずに迅速にシークエンシング可能になる。
（もっと読む）

【課題】標的核酸配列増幅物を高速検査する。また、増幅産物の交錯汚染を防止し偽陽性を防ぐ。
【解決手段】本発明は完全密封標的核酸増幅物検査装置に関するものであり、核酸薄膜クロマトグラフィー（テスト・ストリップ）技術を完全密封した検査装置に利用した、標的核酸配列増幅物を高速検査する方法及び増幅産物の交錯汚染を防止し偽陽性を防ぐ技術に関するものである。また、本発明は完全密封の高速検査装置に関連するものであり、伝染病病原体の検査、食品工業、農業、牧畜、税関検疫、遺伝子突然変異及びＤＮＡ鑑定の分野での応用に関するものである。 （もっと読む）