【課題】読取りデータの再アセンブリはアセンブリにおける配列誤りを含み得る。なぜならセグメントを正確な元の順序に戻すことは難しいことがあるからである。
【解決手段】遺伝子配列アセンブリの誤りを検出するための方法は、遺伝子データの配列のアセンブリ（Ａ）を規定するステップと、読取りデータを読取りのライブラリ（Ｌ）に集めるステップと、読取りのサイズ対サイズ当りの読取り数のヒストグラムをプロットするステップと、分布（Ｄ）を被覆度Ｃで正規化することによって、平均（μ）および標準偏差（σ）を有するＤ’を得て、Ｄ’を得るために用いられない位置（ｉ）を保留するステップと、ＡおよびＤ’を用いて読取りの部分集合（Ｓ_ｉ⊂Ｌ）を集めるステップと、Ｓ_ｉを用いて平均（μ_ｉ）および標準偏差（√ｃ_ｉ・σ_ｉ）を計算するステップと、ユーザに対してディスプレイ上に結果を出力するステップとを含む。 （もっと読む）

【課題】容器内の液体に混入して懸濁している磁性粒子を、磁気手段を移動させることにより任意の位置に集合させ、磁性粒子と液体の分離及び分散を高効率に行うようにする装置の提供。
【解決手段】容器1内に収容された液体10に磁性粒子11を混入して分散させ、前記容器1の外部から磁気手段4を用いて前記磁性粒子11を前記容器1内の所定位置に移動させることにより、吸引手段2を用いて前記液体10の吸引を少なくとも行うことができるようにし、前記磁気手段4を前記容器1に対して移動手段を介して移動させ、前記容器1内の任意の位置に前記磁性粒子11を集合させるようにした液体中の磁性粒子の集合/分散装置。 （もっと読む）

【課題】ＤＮＡシーケンサにおいて、試料ステージの高速化に伴う振動を抑制して、観察試料と試薬の反応状態の画像を安定して取得可能とすることで、装置スループットを向上する。
【解決手段】送りねじと、この送りねじに螺合されるナットと、ナットに取り付けられる被送り部材と、送りねじを回転させる回転駆動手段と、回転駆動手段と送りねじを連結するねじり剛性可変機構付き継手と、回転駆動手段およびねじり剛性可変機構付き継手を制御する手段を備えることを特徴とするステージ機構を用いたＤＮＡシーケンサを提供する。 （もっと読む）

【課題】フローチップのように高い流路抵抗を持つ狭流路構造に対し、液体を漏れなく気泡なく注入し、またそれを漏らすことなく吸引し得る、手動または自動の定量ピペット類の使用を想定した、分注チップを提供することを目的とする。
【解決手段】本発明の分注チップ１０１は、狭流路構造に液体または気体を漏れなく注入し、またはそれを漏らすことなく吸引するため、狭流路構造の開口部と接する流出入口１０６と、この周囲をシールする平面部を備えている。 （もっと読む）

【課題】本発明の目的は、予め解析対象となる生体分子を表面に固定しておいた担体の濃度に、微細流路中で勾配を生じさせ、支持基体表面に高濃度の担体を供給しすることで、担体の固定化効率を向上させた核酸分析装置に関する。
【解決手段】本発明は、担体を固定する基板と、基板上に流路を形成する反応チャンバーを備え、微細流路中において解析対象分子を保持した担体の濃度に、慣性力・電磁気力等を用いて勾配を生じさせる構造を有する、核酸分析装置に関する。本発明により、担体の固定化反応を起こす基板の表面における担体濃度を高め、効率の良い固定化反応を行うことができ、結果、固定化反応時間の短縮と使用サンプル量の低減を図ることができる。 （もっと読む）

【課題】ＤＮＡマイクロアレイに相当する再使用が容易なプローブセットを容易に設計・変更可能とする核酸情報の処理技術を提供する。
【解決手段】核酸情報処理装置であって、複数の塩基配列の情報を記憶する記憶部１３０と、類似度の閾値を特定する情報を受け付ける入力処理部１１１と、入力処理部１１１等で指定を受け付けたクラスタリングの対象となるターゲットフラグメントの塩基配列データ全てを、ＢＬＡＳＴソフトウェアにて取り扱い可能な形式のデータへ変換するクラスター制御部１１８等、とを備える。 （もっと読む）

【課題】層分離した複数の層のうち下層のみを簡便な構成および操作で回収する。
【解決手段】容器２内において層分離した上層と下層のうち該下層を吸引管により吸引する際に用いられ、両端に開口する貫通孔１１ａを有し、容器２内に一端側から挿入可能であるとともに貫通孔１１ａ内に吸引管を挿入可能な筒状の胴部１１と、該胴部１１の一端の開口を密閉し吸引管の先端により貫通可能な封止部材１２と、胴部１１の外周面に外側に突出して設けられ、胴部１１が容器２内に挿入されたときに該容器２の上面に突き当てられる肩部１３とを備える溶液回収補助具１を提供する。 （もっと読む）

【課題】所定の温度における液滴の滞在時間を制御することが容易な熱サイクル装置を提供すること。
【解決手段】本発明にかかる熱サイクル装置は、回転軸周りに回転する回転基盤と、回転基盤の回転軸から外れた位置に設けられ、液滴を内在する反応容器が装着される装着部と、前記装着部に設けられ、前記回転軸からの距離に応じた温度分布を前記反応容器が有するように温度制御する温度制御部と、回転基盤に設けられ、装着部の配置を変化させ、温度制御部の回転軸からの距離を変える変位機構と、を有する。 （もっと読む）

【課題】廃棄箱の一箇所に廃棄物が蓄積してしまい、デッドスペースを作ってしまうことや、チップ同士が連結し詰まってしまうことを解決する機構を提供する。
【解決手段】磁性金属を含有する蓋と、蓋により密栓される反応容器、もしくは、蓋と、蓋により密栓される磁性金属を含有する反応容器と、反応容器を廃棄する廃棄箱１と、密栓された反応容器を磁力により移動させる永久磁石５と、廃棄物の廃棄量をモニタリングするセンサ６〜９を配置した反応容器の運搬装置を備えることで、廃棄物が一箇所に集中して蓄積してデッドスペースを作ってしまうことや廃棄した分注チップが重なることを解決することができる。 （もっと読む）

【課題】プローブの変性を抑制したプローブの固定化方法を提供することを目的とするものである。
【解決手段】基板１１にプローブ１４を固定化するためのプローブ１４の固定化方法であって、ＤＮＡ１２が結合された基板１１と、ＤＮＡ結合タンパク質１３が結合したプローブ１４とを準備する工程と、基板１１のＤＮＡ１２を介してプローブ１４を固定化する工程とを含んでいる。このように基板１１にＤＮＡ１２を形成し、このＤＮＡ１２とプローブ１４に結合したＤＮＡ結合タンパク質１３の一部であるＤＮＡ結合ドメインとが結合することによって、プローブ１４を基板に吸着し固定できるため、化学反応におけるｐＨや温度の変化に伴ったプローブ１４の変性を抑制することが可能となる。 （もっと読む）

【課題】チップ上で液滴を移動させることにより、効率的な熱サイクルを当該液滴に施すことのできる熱サイクル装置を提供する。
【解決手段】本発明にかかる熱サイクル装置は、液滴を載置する載置面を有するチップを装着する装着部と、装着部を、所定方向に往復移動させる移動機構と、所定方向に温度分布を有するようにチップの載置面を温度制御する温度制御部と、を備え、移動機構は、装着部に印加される加速度および液滴の質量との積が、載置面に液滴が載置された際の静止摩擦力よりも大きくなるように、装着部を移動させる。 （もっと読む）

【課題】プローブの変性を抑制したプローブの固定化方法を提供することを目的とするものである。
【解決手段】基板１１にプローブ１３を固定化するためのプローブの固定化方法であって、基板表面が疎水性である基板と、末端に疎水部を有するプローブとを準備する工程と、少なくとも一部に油水界面を有する溶液の油水界面にプローブを並列させる工程と、前記プローブを並列させた溶液を基板表面が疎水性である基板に滴下することによりプローブを基板に固定化する工程とを含んでいる。これにより、プローブが固定化する際に、化学反応を伴うことがなくプローブを自然反応的に基板に吸着し固定することができるため、化学反応におけるｐＨや温度の変化に伴ったプローブの変性を抑制することが可能となる。 （もっと読む）

【課題】核酸断片の分子数の測定における定量性を向上させる。
【解決手段】核酸断片の完全一致および部分一致により結合する現象をシミュレーションする方程式に従い、核酸断片の部分結合に起因する誤差を補正するための係数を求め、試料中の核酸断片の濃度を塩基配列毎に定量する装置、方法ならびにプログラム。装置にあっては、各単鎖核酸の分子数と、該単鎖核酸を含む二重鎖核酸の離脱速度係数と、に基づき、二重鎖核酸の分子数をその組み合わせ毎に更新する二重鎖核酸分子数更新部２１と、更新された各二重鎖核酸の分子数と、外部より与えられた核酸断片の総分子数と、に基づいて、単鎖核酸の分子数を更新する単鎖核酸分子数更新部２２と、更新される前後の単鎖核酸の分子数の各差異に基づき、各単鎖核酸の分子数の推定結果が収束したか否かを判定する単鎖核酸収束判定部２３と、を有する。 （もっと読む）

【課題】吐出口から液滴を吐出した際、当該液滴に飛行曲りが生じるのが確実に防止されるマイクロ流路デバイスの製造方法およびマイクロ流路デバイスを提供すること。
【解決手段】マイクロ流路デバイスの製造方法は、長尺な板状をなし、その接合面３４に形成され、先端面３６に半円形状に開口する第３の溝３３を有する一対の板部材３ａおよび３ｂで構成され、板部材３ａと板部材３ｂとを接合してなるマイクロ流路デバイス１を製造する方法である。この製造方法は、板部材３ａおよび３ｂの接合面３４同士を重ねて接合して、第３の溝３３同士間で、先端側から見た開口形状が円形の吐出口２６を有する第３の流路２３を構成する第１の工程と、第３の流路２３に液体Ｗを供給して、液体Ｗを吐出口２６から吐出させつつ、板部材３ａの先端面３６を研削して、板部材３ａおよび３ｂの先端面３６同士を同じ位置に揃える第２の工程とを有する。 （もっと読む）

【課題】液体の自動収集に使用するワークステーション、及びこのような自動ワークステーションと共に使用される収集装置を提供する。
【解決手段】プロセッサ、蠕動ポンプ２０、バルブアクチュエータ２２及びアルゴリズムを含む自動液体収集ワークステーション１０。蠕動ポンプ及びバルブアクチュエータは、プロセッサと電気通信する。バルブアクチュエータは、オフ位置と流出位置と収集位置との間で複数のバルブを動かす。アルゴリズムは、プロセッサに常駐し、サンプリングも流出も必要でないとき、全てのバルブをオフ位置に動かしてポンプをオフ状態し、流出が必要とされたとき、全てのバルブを流出位置に動かして、所定の流出時間の間ポンプをオン状態にし、収集が必要とされたとき、複数のバルブの１つを収集位置に動かして、この１つのバルブの上流側のバルブのいくつかを動かして、所定の収集時間の間ポンプをオン状態にする。 （もっと読む）

【課題】 ＤＮＡ等の微量物質の検出等を自動的に行うことのできる簡易且つ安価な構成による微量物質検出装置を提供すること。
【解決手段】 チューブと、チューブに設けられ被検出対象物質と磁気ビーズと標識物質を反応・結合させて試料溶液とする混合・反応部と、チューブに設けられ標識物質が結合された被検出対象物質を測定する測定部と、測定部に設置された一対の電極と、磁力により磁気ビーズと結合した被検出対象物質を混合・反応部や測定部で吸着・保持する磁気制御部と、チューブ内を吸引／加圧して試料溶液を移動させる吸引／加圧手段と、チューブの適所に設けられた複数個のバルブと、磁気制御部と吸引／加圧手段と複数個のバルブを制御する制御装置とを具備し、一対の電極の一方の表面にコーティングが施されるようにしたもの。 （もっと読む）

【課題】異なる対照がとられた増幅方法を提供する。
【解決手段】a.液体試料に内部対照核酸を添加する。b.固相支持体材料と前記液体試料を、槽中で、標的核酸および内部対照核酸を含む核酸が固相支持体材料に固定化させる。c.分離ステーション中で、液体試料中に存在する他の物質から固相支持体材料を分離する。d.前記分離ステーション中で核酸を精製し、固相支持体材料を洗浄バッファで1回以上洗浄する。e.精製された標的核酸および内部対照核酸を第一の槽内で、ならびに水性バッファ中の少なくとも1つの外部対照核酸を第二の槽内で、増幅試薬と接触させる。f.反応槽内で、精製された標的核酸、内部対照核酸および水性バッファ中の少なくとも1つの外部対照核酸を、前記1つ以上の増幅試薬と、標的核酸および対照核酸の存在または非存在を示す増幅反応が生じるのに充分な時間および条件下でインキュベートする工程が自動化される方法。 （もっと読む）

【課題】膀胱癌(BLC)を検出および診断する方法を提供する。
【解決手段】BLC細胞と正常細胞を識別するBLC関連遺伝子の発現レベルを決定する段階を含む。さらに、リンパ節転移を有する膀胱癌細胞において独特な発現パターン変化を有するBLC関連遺伝子を用いて、膀胱癌の治療において有用な治療薬をスクリーニングする方法、膀胱癌を治療する方法、および対象に膀胱癌のワクチン接種をする方法を提供する。特に、膀胱癌において発現が顕著に上昇する新規ヒト遺伝子C2093、B5860N、およびC6055を提供する。これらの遺伝子およびこれらの遺伝子によってコードされるポリペプチドは、例えば膀胱癌の診断において、疾患に対する薬物を開発するための標的分子として、および膀胱癌の細胞増殖を軽減するために使用することができる。 （もっと読む）

【課題】 生物学的検定において磁性粒子を処理するための構造体および方法。
【解決手段】 引き込み式のマグネット４およびプローブ３を備えた、生物学的サンプル内の磁性粒子を操作するための磁気ハンドリング構造体１ａ、ならびに生物学的サンプルの磁性粒子の処理方法。 （もっと読む）

【課題】シーケンス反応時にサンプル固定層からの核酸試料のはがれを防止する。解析可能な核酸試料数を増やすことで、高スループット解析を可能とする核酸分析用反応デバイスを提供する。
【解決手段】基板と、
該基板上のサンプル固定層と、
該サンプル固定層上に固定された核酸試料若しくは表面に核酸試料を有する担体と、
該核酸試料若しくは担体とサンプル固定層が結合する領域以外の領域を覆うブロッキング層とを備え、前記サンプル固定層が無機酸化物で形成されている核酸分析用反応デバイス。 （もっと読む）