【課題】本発明の目的は、高いハイブリ効率かつ高スループットな単分子シークエンス法の提供に関する。
【解決手段】高いハイブリ効率かつ高スループットな単分子シークエンス法のためには、総プローブ数が一定であることと、光学分解能以上の距離に最低限の数の反応場がある必要がある。従って、本発明では、複数のプローブが固定された反応場を複数備えており、１個の標的核酸が反応場のプローブのいずれかにハイブリするようにする。ただし、各反応場間の距離は、単分子計測を行うために光学分解能以上離れている必要がある。標的核酸と反応場の比を１０倍以上にすることで、全ての標的核酸がプローブとハイブリした場合でも、９０％以上の標的核酸は反応場に１個だけハイブリし、複数の標的核酸が１つの反応場にハイブリする確率は１０％以下となる。 （もっと読む）

【課題】細胞核内における特定のタンパク質の存在量や局在等を指標として、ｉＰＳ細胞と正常な分化細胞と癌化した細胞とを識別する方法の提供。
【解決手段】誘導多能性幹細胞を識別する方法であって、ＳＰ１（Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）、カハールボディに含まれているタンパク質、核ラミナに含まれているタンパク質、傍核小体コンパートメントに含まれているタンパク質、及びＰＭＬボディに含まれているタンパク質から選択される１種以上のマーカータンパク質の細胞核内の存在量、前記マーカータンパク質を含む構造体の細胞核内における数量、又は前記マーカータンパク質を含む構造体の細胞核内における形状を識別用指標とし、１種又は２種類以上の前記識別用指標に基づいて、被検細胞が、誘導多能性幹細胞、正常な分化細胞、又は癌化した細胞のいずれであるかを識別することを特徴とする誘導多能性幹細胞の識別方法。 （もっと読む）

【課題】直接転写物を標的とすることのできるＲＮＡベースのレギュレーターの能力を、典型的にタンパク質ベースのレギュレーターと結合したアロステリック制御と結合すること。
【解決手段】（ｉ）外来の酵素活性に対する基質を形成することのできる基質配列、及び（ii）リガンドに結合するアプタマーを包含する核酸であって、リガンドの該アプタマーへの結合が、核酸のコンホメーション変化を引き起こし、それが、基質配列の、該基質を形成する能力を変え及び／又は外来酵素活性の基質のＫｍ及び／若しくはＫｃａｔを変える、当該核酸。 （もっと読む）

【課題】操作が簡便であり、短時間で高効率に核酸を濃縮し精製できる核酸電気泳動方法の提供。
【解決手段】
アニオン性官能基を有するインターカレーターを挿入した核酸を電気泳動させる手順を含む核酸電気泳動方法を提供する。インターカレーターの酸解離定数は、０より大きく３以下であってもよい。また、上記官能基は、スルホ基であってもよい。この核酸濃縮回収方法では、インターカレーターと結合した核酸の負電荷をより強めることで、核酸の電気泳動速度を速めることができる。 （もっと読む）

【課題】ＰＣＲ法によるＲＮＡ検出方法において、検出感度を向上させることのできるＲＮＡ検出用試薬、およびＲＮＡ検出方法を提供することを課題とする。
【解決手段】ＲＮＡ検出用試薬においては、ＲＮＡウイルスを含む試料から前記ＲＮＡウイルスのＲＮＡを抽出し、前記抽出されたＲＮＡをＰＣＲ法により増幅させて前記ＲＮＡを検出するために前記試料に添加されるＲＮＡ検出用試薬であって、ポリアクリル酸および／またはポリアクリル酸塩を含むことを特徴としている。 （もっと読む）

【課題】糞便検体を用い、免疫学的反応や遺伝子がハイブリダイズする特異性を利用して、該生体試料に含まれる種々の成分を測定する際に、正確に測定を行うために必要な糞便検体前処理液、並びにこの検体前処理液を用いた糞便に含まれる成分測定用キット及び成分測定方法を提供すること。
【解決手段】糞便に由来する検体の前処理方法であって、前記検体をｐＨが０．５〜２．９の範囲内に保たれた状態で懸濁する工程を含むことを特徴とする検体の前処理方法。 （もっと読む）

【課題】 植物の病害虫等による外的障害に対する色素反応に関わり、病原性糸状菌に対する感受性および抵抗性を支配する遺伝子を同定すること。
【解決手段】 病原性糸状菌に対する抵抗性品種と感受性品種とを交配させて得られたF3からF5の集団を対象として、3-デオキシアントシアニジンの合成を担い、ソルガムに当該感受性をもたらすtan遺伝子のマッピングを行った結果、当該遺伝子の同定に成功した。さらに、tan遺伝子がコードする蛋白質の機能喪失により、ソルガムに当該抵抗性が付与されることを見出した。 （もっと読む）

【課題】高価な蛍光標識した核酸プローブを、標的核酸ごとに調製する必要のない核酸プローブを提供すること。
【解決手段】蛍光物質で標識されたヌクレオチド（ａ）を含むオリゴヌクレオチドからなる蛍光プローブ（Ａ）と、該蛍光プローブ（Ａ）がハイブリダイズする蛍光プローブ結合領域（ｂ１）と、標的核酸（Ｃ）とハイブリダイズする標的核酸結合領域（ｂ２）とを有するオリゴヌクレオチドからなるバインディングプローブ（Ｂ）とからなり、蛍光プローブ（Ａ）が、蛍光プローブ結合領域（ｂ１）にハイブリダイズし、かつ標的核酸（Ｃ）が標的核酸結合領域（ｂ２）にハイブリダイズしたときに、標的核酸（Ｃ）中のグアニンが、ヌクレオチド（ａ）に標識された蛍光物質（ｄ）と相互作用して蛍光物質（ｄ）の蛍光キャラクターが変化するように設計されている核酸プローブセット。 （もっと読む）

【課題】核酸を切断および修飾するための新規の切断因子およびポリメラーゼを提供する。
【解決手段】酵素を含む組成物であって、該酵素が異種性の機能ドメインを有し、該異種性機能ドメインが、核酸切断アッセイ法において改変された機能性を提供する組成物。これらの切断因子およびポリメラーゼは、例えば、核酸配列および核酸配列の変異を検出し、特徴を調べる上で有用である。いくつかの態様においては、多様な酵素の5'ヌクレアーゼ活性を用いて、標的依存的な切断構造を切断し、それによって、特異的な核酸配列、または特異的な核酸配列変異が存在することが示される。 （もっと読む）

【課題】分子進化工学（例えば、酵素進化法）におけるスクリーニングの効率を向上させることを、本発明の課題とする。
【解決手段】上記課題は、核酸分解酵素によって処理された一枚膜リポソームであって、以下：
（ａ）プロモーター配列、翻訳開始配列、および、ポリペプチドコード配列を含むＤＮＡ；
（ｂ）ＲＮＡポリメラーゼ；
（ｃ）リボヌクレオチド；ならびに、
（ｄ）無細胞蛋白質合成系、
を含む、一枚膜リポソーム、あるいは、核酸分解酵素によって処理された一枚膜リポソームであって、以下：
（ａ）翻訳開始配列、および、ポリペプチドコード配列を含むＲＮＡ；ならびに、
（ｄ）無細胞蛋白質合成系、
を含む、一枚膜リポソームを提供することによって解決された。 （もっと読む）

【課題】錠型プライマーが、長いかもしくは環状のターゲット核酸にハイブリダイズすると、錠型プライマーのローリングサークル複製を行う方法を提供する。
【解決手段】錠型プローブとハイブリダイズする部位の近傍もしくは好ましくはその部位でターゲット核酸を切断し、これにより切断されたターゲット核酸の３’端が、錠型プローブのローリングサークル複製のためのプライマーとして機能する、それぞれがオリゴヌクレオチド標識を有する二つのアフィニティープローブおよび二つのアフィニティープローブと結合したローリングサークル複製のための錠型プローブを利用することにより、ポリエピトープ・ターゲットをアッセイする方法。 （もっと読む）

【課題】ＰＣＲを必要とせず、かつ短時間でテロメラーゼ活性を測定できる方法を提供する。
【解決手段】テロメラーゼの活性を測定する方法であって、（１）テロメラーゼと、テロメラーゼの基質となる一本鎖ＤＮＡを同一溶液中に置き、テロメラーゼ反応を行わせる工程
（２）前記テロメラーゼ反応に供せられた前記基質一本鎖ＤＮＡと、テロメアＤＮＡの配列と相補的に結合できる配列からなり、かつ蛍光を発する官能基とこの蛍光を消光する官能基が修飾された一本鎖ＲＮＡと、ＲＮａｓｅＨ活性を有する酵素を、同一溶液中に置き、ＲＮａｓｅＨ反応を行わせる工程、（３）前記ＲＮａｓｅＨ反応中あるいは反応後に、前記蛍光を測定する工程を含む。 （もっと読む）

【課題】ヒラメラブドウイルス（HIRRV）の感染を予防及び治療することのできる医薬及び方法、HIRRVを特定水域から除去する装置及び方法、並びにHIRRVを簡便かつ高感度に検出するための方法及びキットを提供する。
【解決手段】HIRRV及び／又は該ウイルスで発現するポリペプチドに結合し、宿主のHIRRV感染活性を抑制する活性を有するHIRRV結合性核酸アプタマー。また、前記HIRRV結合性核酸アプタマーを用いてHIRRV及び／又は該ウイルスで発現するポリペプチドを検出する方法。 （もっと読む）

【課題】新たな遺伝子セットを用いた生体毒性の検出・予測方法、そのキット、生体毒性の処置方法及び生体毒性の候補薬剤確認方法の提供。
【解決手段】血液学的手法または病理学的手法による肝臓毒性の検出は指標（マーカー）が限られているため、その評価が困難であるのに対して、外部環境の変化による生体内の遺伝子発現変化は鋭敏である。この、生体毒性を判別するための遺伝子セットを同定することによる、生体毒性の処置方法及び生体毒性の候補薬剤確認方法。 （もっと読む）

【課題】核酸アプタマーと特異的に結合する標的分子を検出し定量する方法を提供する。
【解決手段】標的分子に結合しない核酸アプタマー、および、標的分子に特異的に結合する核酸アプタマーに標的分子を含むサンプルを加えた後、両者の核酸アプタマーを一緒にヌクレアーゼで処理し、両者の核酸アプタマーの量比を調べることにより、標的分子の定量を行うことを含む、標的分子の定量方法。 （もっと読む）

【課題】特定の細胞に特徴的な細胞表面の標的タンパク質に特異的に結合する核酸鎖を容易に得る方法の提供。
【解決手段】特定の細胞表面の標的タンパク質に特異的に結合する核酸鎖候補を精製回収するために、細胞表面のタンパク質等に核酸鎖候補を結合させたのち、膜表面タンパク質等を分解するプロテアーゼ等のタンパク質分解酵素を作用させて、膜たんぱく質を分解することで回収することができる。 （もっと読む）

【課題】１本鎖フラグメントレベルでポリヌクレオチドの配列を決定するための改良された方法の提供。
【解決手段】ポリヌクレオチドの配列を決定するための方法であって、該方法は、ポリヌクレオチドと相互作用し、ポリヌクレオチドに沿って進行する酵素における立体配座の変化を検出することに貢献する。立体配座の変化に関する検出は、酵素に結合する蛍光団における変化を測定して行った。本発明の一つの態様によれば、ポリヌクレオチドの配列を決定するための方法は、酵素活性を誘導するのに十分な条件下で、標的ポリヌクレオチドを、該ポリヌクレオチドと相互作用し、かつポリヌクレオチドに沿って進行し得る酵素と、反応せしめ、酵素がポリヌクレオチドに沿って進行する時に、酵素における立体配座の変化を検出することを含む。 （もっと読む）

【課題】カスガマイシン耐性に関与する新規な遺伝子を単離し、カスガマイシン耐性菌を迅速に、かつ高精度に検出しうる手段を提供する。
【解決手段】下記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのＤＮＡからなる遺伝子：（ａ）特定な配列の塩基配列からなるＤＮＡ、（ｂ）（ａ）の塩基配列と８０％以上の同一性を有し、かつカスガマイシンアセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ、（ｃ）（ａ）の塩基配列において、１又は数個の塩基が欠失、置換、挿入及び／又は付加された塩基配列からなるＤＮＡであって、カスガマイシンアセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ、（ｄ）（ａ）の塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡであって、カスガマイシンアセチルトランスフェラーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。 （もっと読む）

【課題】試料中のL-トリプトファンを、これまでの方法に比べ安価で簡易的に定量可能である酵素的定量法を提供する。この酵素的定量法を実施する際に利用できる測定用のキット及び酵素センサーを提供する。
【解決手段】検体に、L-トリプトファン脱水素酵素を作用させ、生じたNADHを定量することを含む、前記試料に含有されるL-トリプトファンの測定方法。トリプトファン脱水素酵素を用いることを特徴とする酵素センサー。以下の(1)及び（２）の試薬を含むL-トリプトファンの測定用キット。
（１）L-トリプトファン脱水素酵素
（２）NAD⁺ （もっと読む）

【課題】アマノリ類の鉄欠乏状態の検出方法を提供する。
【解決手段】ＦＴＲ１遺伝子を分子マーカーとして使用する、アマノリ類の鉄欠乏状態の検出方法。 （もっと読む）