本発明は、コード化反応およびデコード反応を使用して少なくとも１つのサンプルにおける標的ポリヌクレオチド配列の存在または非存在を検出（または定量）するための方法、試薬およびキットに関する。特定の標的ポリヌクレオチドがサンプルに存在するとき、アドレス可能なプライマー部分を含む反応生成物がコード化反応において形成される。少なくとも１つの標識および少なくとも１つのアドレスプライマーがデコード増幅反応において用いられ、それにより、配列が存在するか、または非存在であるかに依存して、検出可能なシグナル値を提供する。いくつかの実施形態において、ユニバーサルな塩基と、プローブの縮小されたライブラリーとを、標的ポリヌクレオチドの非常に多重化された分析のために用いることができる。
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本発明は、親和性定数および速度定数を測定する工程を包含する、タンパク質およびタンパク質の他の分子との相互作用を検出するための組成物および方法に関する。本方法は、例えば、互いに識別可能であるフルオロフォアのような検出可能な標識で標識した二つ以上のタンパク質特異的プローブを使用する。そのプローブの標識タンパク質への結合は、同時シグナルとして検出され、従って複数のプローブの単一の標的タンパク質への結合は、サンプル中にそのタンパク質が存在することを示唆する。
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金属イオンリン酸リガンドの特異的結合及び蛍光性ポリマースーパークエンチングを用いた、キナーゼ、ホスファターゼ及びプロテアーゼ酵素活性のための試薬及びアッセイについて説明する。本アッセイは、ペプチド及びタンパク質基質を用いて、キナーゼ、ホスファターゼ及びプロテアーゼ酵素活性を測定するための一般的なプラットホームを提供する。ＤＮＡハイブリダイゼーションをベースとした試薬及びアッセイ、並びにアプタマー、抗体及び他のリガンドを用いたタンパク質用の試薬及びアッセイについても説明する。
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転移性心血管環境または転移性胎盤環境を模倣する細胞接着マトリックスシステムを使用して、疾患を単離し、そして診断するための方法およびデバイスが開示される。この細胞接着マトリックスは、疾患（例えば、癌、心血管疾患、および胎児性疾患）に罹患した患者の処置における診断用途および治療用途のため、ならびに、転移性疾患、心血管疾患、および胎児性疾患の分子分析における研究用途のための、血液のような流体サンプル由来の標的細胞（例えば、転移性腫瘍細胞、胎児細胞、および内皮前駆細胞）の濃縮を促進する。多重分子分析を用いた、循環性の腫瘍細胞および内皮細胞の濃縮と検出とのための血液試験のプロトタイプおよび方法が、本明細書において記載される。
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本発明は、ビルトインサンプル調製能力を組み込む統合された生物分析システムに関連する。本発明の一つの観点において、生物分析装置には、PCRに基づく(又はサーマルサイクルブロック/モジュール)に基づくビルトインサンプル調製デバイスが提供されている。本発明の１つの実施態様において、サンプル調製デバイス中のペルチェユニットが、マルチウェルトレーにおいて支持されたサンプルのサーマルサイクルを提供し、それはサーマルサイクル型に基づくサンプル調製装置(生物分子反応)を含んで成りうる。本発明の他の観点において、PCR装置にはビルイトン分析装置、例えばCE装置をPCR(生物分子反応)方法の結果を評価するために含んで成る。
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肝細胞癌（HCC）を検出、診断、治療、および予防する客観的な方法を本明細書において記述する。特に、本発明は、正常細胞と比較してHCC細胞においてアップレギュレートされている、本明細書においてMGC47816およびHES6と呼ばれる二つの遺伝子に関する。一つの態様において、診断方法は、肝細胞癌細胞と正常細胞との間で異なるMGC47816またはHES6の発現レベルを決定する段階を含む。本発明はさらに、HCCの治療において有用である治療物質のスクリーニング方法、HCCを治療する方法、およびHCCに対して対象をワクチン接種する方法を提供する。
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生物医学研究の多くの領域は、個々の遺伝子または転写産物におけるまれな変異の分析に依存している。ここで、本発明者らは、これまで達成できなかった規模および容易さでそのような変異を定量することができる方法を記載する。そのような分子のコレクションにおける各DNA分子は、配列においてオリジナルと同一であるDNAの何千個というコピーが結合している単一粒子へ変換される。そしてこのビーズの集団は、出発DNA分子の1対1の表示に対応する。DNA分子のオリジナルの集団内の変異はその後、フローサイトメトリーにより蛍光標識された粒子を数えることにより簡単に評価されうる。何百万個という個々のDNA分子が標準的実験装置でこの様式で評価されうる。さらに、特定の変異体がフローソーティングにより単離され、さらなる実験のために用いられうる。このアプローチは、まれな突然変異の同定および定量のために、加えて特定の集団または組織における遺伝子配列または転写産物における変異を研究するために用いられうる。 （もっと読む）

本発明は、癌患者における予後診断決定のための非侵襲性定量試験を提供する。この試験は、特定のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）の腫瘍レベルの測定値に依存する。これらのｍＲＮＡレベルは、再発リスクを示す数値的再発スコアを得る多項式（アルゴリズム）に代入される。具体的には、本発明は、癌再発の可能性および／または患者が治療法によく応答する可能性を決定するための、アルゴリズムに基づく予後試験を提供する。特定の局面において、本発明は、浸潤乳癌を有する患者における乳癌の再発および／または処置に対する患者応答の可能性を決定するためのアルゴリズムおよび予後試験を提供する。
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本発明は、標的依存性環状化及び標的核酸分子とのトポロジー的結合能力を有するアロステリックに調節可能なポリヌクレオチドを提供する。本発明のポリヌクレオチドは、標的結合配列及び調節エレメント（標的結合が存在しないときは環状化を妨げる）を含む。ポリヌクレオチドは触媒ドメインを含むことができ、前記は、ポリヌクレオチドの標的結合配列が標的と結合しているときは、触媒による環状化を進行させる。トポロジー的に結合したポリヌクレオチドは、標的分子の検出、又は標的の転写若しくは翻訳の阻害に用いることができる。 （もっと読む）

本発明は昆虫の機能的エクジソン受容体の構造研究に関する。より具体的には、本発明は、コナジラミ、特にタバココナジラミ(Bernisia tabaci)のエクジソン受容体リガンド結合ドメインの結晶構造、およびその結晶の用途および該受容体と相互作用する化合物を選択しスクリーニングするための関連構造情報に関する。
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アッセイ方法及び装置。本発明は、（ａ）流体流入口と、流体排出口を有する少なくとも１個の第１の容器と、（ｂ）多孔質膜と、（ｃ）少なくとも１種の検体特異的結合剤とを備えたアッセイで使用するための装置であって、前記少なくとも１種の検体特異的結合剤が、流体流入口に対して前記多孔質膜の下面に固定されていることを特徴とする装置及び前記アッセイの実施方法に関する。
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【課題】 ウシClaudin-16欠損症の診断法を提供する。
【解決手段】 ウシClaudin-16欠損症の原因がClaudin-16遺伝子の一部を含む約30 kbに及ぶDNA欠損に起因することを見出し、かかる欠損により、該遺伝子を含む領域が特定のPCRプライマーの使用により増幅できたり、できなかったりすることなどを利用して、該疾患を遺伝子診断する。具体的には対象遺伝子の周辺の領域を特異的に増幅せしめ、当該欠損を検知することにより、診断を行う。ウシのClaudin-16欠損症及びそのキャリアーを簡便かつ迅速に検出し、診断することが可能である。 （もっと読む）