【課題】超並列シーケンサーにおける配列解読においては、様々なノイズ要因による読み取り精度の悪化が問題となる。
【解決手段】本発明は、難読DNA配列の配列上の特徴に基づいて配列を解読する。より具体的には、難読DNA配列をその配列の特徴に基づいて特徴グループに分類する処理と、各グループの特徴毎に既知のDNA配列データを用いて各サイクルにおける蛍光色の判定基準を学習する処理と、未知の実験DNA配列を解読する際に、その配列上の特徴グループについて学習した判定基準を適用し、配列を解読する処理とを実行する手法を提供する。 （もっと読む）

【課題】自動対立遺伝子割当用の一体化したソフトウエア環境内の自動分析、及びインタラクティブ再検討及び分析の改良をサポートする方法及びアルゴリズムを提供する。
【解決手段】誤りのある対立遺伝子割当を低減するのに用いる一連の閾値を確立するための方法であって、当該方法が：（ｉ）信号強度の信号強度パターンを生成するステップ；（ｉｉ）各々の信号強度Ｉから負の対照信号ＩＮＣを減算して、該結果を、補正した正の対照信号ＩＰＣ−ＩＮＣで除算して、標準化強度率：ｒ＝（Ｉ−ＩＮＣ）／（ＩＰＣ−ＩＮＣ）を得るステップと；（ｉｉｉ）標準化した信号強度が前記閾値より大きい場合に、前記プローブと該配列との間の正の相互作用として指定すべく、前記反応パターンと、前記集合における前記プローブとの該ターゲット集合の基準反応パターンとの間の類似性を最大化するように標準化信号強度に対する閾値を設定するステップと；を具える方法。 （もっと読む）

【課題】細胞の増殖速度または微生物のバイオマス産生等に基づく生産量と、複数の擾乱およびその生起確率を考慮した増殖抑制または生産量の低下等から計算される、当該生産量等がどの程度変動するかについての変動値と、を含むポートフォリオを、イールドリスク空間上にマップすることで、最適な細胞または微生物の組合せを選択することができる細胞選択装置、細胞選択方法、および、プログラムを提供することを課題とする。
【解決手段】本発明は、測定データに基づく細胞またはバイオマスの生産量、および、当該生産量がどの程度変動するかを示す変動値を細胞または条件ごとに設定し、設定された生産量および変動値に基づいて、複数の細胞または条件を組み合わせた場合の生産量および変動値の可変範囲を算出し、最適化手法を用いて、可変範囲における最適な組み合わせを算出する。 （もっと読む）