新規虚血マーカー及びこれを用いた虚血状態の検出方法
【課題】
本発明は、虚血−再灌流時に虚血組織から特異的に放出され、虚血状態を感度良く識別可能なマーカータンパク質及びこれを用いた虚血状態の検出方法を提供することを目的とする。
【解決手段】
上記課題の解決のため、本発明は、虚血−再灌流刺激特異的に発現が亢進するタンパク質群、好適にはアポトーシス誘導因子（ＡＩＦ）、骨形成タンパク質−１（ＢＭＰ−１）、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ（ＴｎＣ）、アグリンのうち少なくとも１つからなる虚血マーカータンパク質、及び前記マーカータンパク質の発現レベルを測定することを特徴とする虚血状態の検出方法を提供する。
本発明は、虚血−再灌流時に虚血組織から特異的に放出され、虚血状態を感度良く識別可能なマーカータンパク質及びこれを用いた虚血状態の検出方法を提供することを目的とする。
【解決手段】
上記課題の解決のため、本発明は、虚血−再灌流刺激特異的に発現が亢進するタンパク質群、好適にはアポトーシス誘導因子（ＡＩＦ）、骨形成タンパク質−１（ＢＭＰ−１）、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ（ＴｎＣ）、アグリンのうち少なくとも１つからなる虚血マーカータンパク質、及び前記マーカータンパク質の発現レベルを測定することを特徴とする虚血状態の検出方法を提供する。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、哺乳動物組織における虚血状態を効果的に検出可能なマーカーに関し、より詳しくは、虚血−再灌流時に特異的に放出され、特異的なマーカーとして利用可能なタンパク質及びこれを用いた虚血状態の検出方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
虚血−再灌流（Ischemic hypoxia and reoxygenation；ＩＨ／Ｒ）は、例えば心筋梗塞や心臓バイパス手術、心臓移植などで発生する心臓の主要な疾患状態である。心臓冠動脈の虚血−再灌流が発生した場合、心臓は肥大したり、虚血周囲で細胞死が観察されたり、また、心筋の繊維化が見られる。これらの現象はリモデリングと呼ばれており、これは虚血にさらされた心筋細胞ばかりでなく虚血周囲の組織においてもよく観察されている。幾つかのケースでは、虚血にさらされた心筋細胞に対する隣接する血管からの血管新生が観察されている。これらのことは、虚血−再灌流時に何らかのシグナルを伝達するための様々な因子が放出されていることを示唆している（非特許文献１，２）。
【０００３】
実際、心臓は全身に血液を送るポンプの役割ばかりでなく、ホルモン性因子を放出する内分泌系の組織として働いていることもよく知られている。一酸化窒素やプロスタグランジン、アデノシンといった低分子物質が心臓から放出され、心臓血管系の制御に関与している。これらの低分子に加え、骨形成因子（Bone morphogenetic protein；ＢＭＰ）の刺激により心筋細胞から放出されるトランスフォーミング成長因子−β（Transforming growth factor-β）が線維芽細胞から心筋繊維細胞への転換を促している。一方、心臓虚血時には、炎症性サイトカインもまた心臓から放出されている（非特許文献６−８）。腫瘍壊死因子は虚血心筋において産生され、リアナジン受容体阻害を介して心臓の収縮抑制に関与している。炎症性サイトカインであるインターロイキン１β（ＩＬ−１β）やインターロイキン６（ＩＬ−６）も虚血後の心臓から放出されている。ＩＬ−１βは心筋の直接的な阻害に加え、カルシウムを制御する遺伝子のダウンレギュレーションを介して心臓の収縮を抑制している。ＩＬ−６は、Ｌ型タイプのカルシウムチャネルを阻害することによってカルシウムの細胞内流入や心臓収縮の抑制に働いている。線維芽細胞成長因子（Fibroblast growth factor；ＦＧＦ）やヘパリン結合性成長因子（Heparin-binding growth factor；ＨＢＧＦ）は心筋虚血時に放出され防護因子として働くことも報告されている（非特許文献９−１５）。この様に虚血−再灌流時には様々なシグナル伝達機構が機能を果たしていることが明らかになってきており、これらのペプチド性因子を心臓虚血を捕捉するためのマーカーとして利用する動きも広がってきている。
【０００４】
ペプチド性の虚血マーカー、特に心臓虚血のマーカーとしては、これまでにＰＥＰ−１９，ＩｇＡ結合性アルカリ性ホスファターゼ、心房性／脳性ナトリウム利尿ペプチド、虚血変成アルブミン、酸素調節タンパク質、トロポニン、カルシトニン、ウロテンシン、ミオグロビン、ミオシン、アネキシン、マトリックスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、リポタンパク質やクレアチンキナーゼ、エノラーゼ、乳酸デヒドロゲナーゼなどの酵素などが開示されている（特許文献１−１８）。しかしながら、従来の虚血マーカーは、虚血状態にありながらも簡便な検出可能な程度には十分に放出されないものや、逆に虚血状態とは無関係な要因により放出されるケースなどがあり、更に従来のマーカーでは検出が困難な虚血の症例も見出されている。一方で、虚血が複数の複雑な反応の集積であることが明らかにされ、単独のマーカーだけではなく複数のマーカーを組み合わせることによって虚血状態の判定がなされてきたというこれまでの経緯からも、虚血−再灌流イベントと生理的・機能的に結びついた、特異性や再現性の高い新規な虚血マーカーの開発が待たれていた。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】特開２００７−０５６００８ ｍ−カルパインおよび／またはμ−カルパインによるＰＥＰ−１９の分解を阻害することを特徴とする虚血性脳疾患の治療方法
【特許文献２】特開２００６−１３２９４６ ＩｇＡ結合性アルカリ性ホスファターゼ６の測定方法およびそれに用いるキット
【特許文献３】特開２００４−０３７４５５ マーカーの組み合わせを用いた心臓疾患症例の予後判定
【特許文献４】特開２００３−２７０２５０ 血液中の心不全マーカー定量方法
【特許文献５】特表２００７−５０５７２６ 心臓由来が疑われる胸部痛を有する患者のリスク階層化のための装置および方法
【特許文献６】特表２００７−５１０１４６ マーカーの組合せによる急性心筋虚血性疾患の診断
【特許文献７】特表２００６−５０７５１０ 組織低酸素症の体液マーカー
【特許文献８】特表２００６−５２６１４０ 鑑別診断のためのマーカーおよびその使用方法
【特許文献９】特表２００５−５２２６６９ 卒中および脳損傷の診断マーカーおよびその使用方法
【特許文献１０】特表２００４−５２０５９８ 急性冠状動脈症候群の診断マーカーおよびその使用方法
【特許文献１１】特表２００４−５２９３５１ 急性心筋梗塞および他の臨床的状態の診断への改良
【特許文献１２】特表２００３−５３２６８５ アテローム性動脈硬化症の治療および／または予防のためのＩＬ−１８阻害剤の用途
【特許文献１３】特表２００２−５３８４６３ 脳卒中を診断しそして区別するための方法
【特許文献１４】特表平１０−５０４０９７ 臓器拒絶反応のマーカー
【特許文献１５】特表平１０−５１１１８５ 胸痛の発症初期に診断し鑑別するための方法ならびに装置
【特許文献１６】再公表０４−０６５９６１ 酸化度の定量法
【特許文献１７】特許第３８６０６０５号 補体活性化をブロックするキメラタンパク質
【特許文献１８】特許第３６６６８６６号 神経保護治療をモニターする方法
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】Sutton M.G. & Sharpe N. 2000. Circulation 101:2981-2988.
【非特許文献２】Eefting F. et al. 2004. Cardiovasc.Res. 61:414-426.
【非特許文献３】Sabbah H.N. 2000. Cardiovasc.Res. 45:704-712.
【非特許文献４】Kang P.M. & Izumo S. 2000. Circ.Res. 86:1107-1113.
【非特許文献５】Lijnen P.Petrov V. 2000. J.Mol.Cell Cardiol. 32:865-879.
【非特許文献６】Fragogiannis N.G. et al. 2002. Cardiovasc.Res. 53:31-47.
【非特許文献７】Thaik C.M. et al. 1995. J.Clin.Invest. 96:1093-1099.
【非特許文献８】Neumann F.J. et al. 1995. Circulation 92:748-755.
【非特許文献９】Li Y. et al. 2003. Circulation 107:2499-2506.
【非特許文献１０】Jayasankar V. et al. 2003. Circulation 108 Suppl. 1:II230-236.
【非特許文献１１】Jiang Z.S. et al. 2002. Am.J.Physiol.Heart.Circ.Physiol. 282:H1071-1080.
【非特許文献１２】House S.L. et al. 2003. Circulation 108:3140-3148.
【非特許文献１３】Tanaka N. et al. 2002. Biochem.Biophys.Res.Commun. 297:375-381.
【非特許文献１４】Detillieux K.A. et al. 2003. Cardiovasc.Res. 57:8-19.
【非特許文献１５】Zisch et al. 2003. Cardiovasc.Pathol. 12:295-310.
【非特許文献１６】Mizukami Y. et al. 2000. J.Biol.Chem. 275:19921-19927.
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
上記の現状に鑑み、本発明は、虚血−再灌流時に虚血組織から特異的に放出され、虚血状態を感度良く識別可能なマーカータンパク質及びこれを用いた虚血状態の検出方法を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
前記課題の解決のため、特に、これまでに知られていない新規な虚血マーカーを見出すために、本発明者は、細胞・組織がある状態に置かれたときに特異的に発現するタンパク質を網羅的に解析するというプロテオーム解析の手法に着目した。すなわち培養心筋細胞の系を用いてここに虚血−再灌流刺激を与え、培養液中に放出されるタンパク質を網羅的に解析した。具体的には、虚血刺激なしで培養液中に放出されるタンパク質と虚血刺激により放出されるタンパク質のプロファイルを比較し（Subtractive Proteomics）、虚血−再灌流刺激によって特異的に放出されるタンパク質を同定して、刺激時に発現が亢進（Up-regulated）及び減少（Down-regulated）するマーカー候補となるタンパク質群を明らかにし、このうち発現が大幅に亢進するタンパク質数種については人工心肺による心臓手術を受ける患者さん（一時的に心臓本体は虚血状態になる）の血液中における発現の検証を行って、これらのマーカー候補が確かに虚血−再灌流時に特異的に発現亢進していることを確証し、本発明を完成させた。
【０００９】
本発明は、哺乳動物細胞における虚血状態を検出する方法であって、前記哺乳動物細胞から採取した試料中に含まれる下記の虚血マーカー、
Ａｒｐｃ３，Ｐｆｎ２，Ｓｇｃｅ，Ａｃｔｒ３，Ｈ３ｆ３ｂ，Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｍ，Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｐ，Ｈｉｓｔ１ｈ３ａ，Ｈｉｓｔ２ｈ２ａａ１，Ｐｏｓｔｎ，Ｆｂｌｎ５，Ｃｏｌ１８ａ１，Ｌａｍｂ１−１，Ｌａｍｃ１，Ｐｒｏｓ１，Ｃｏｌ６ａ２，Ｃｔｎｎｂ１，Ｄｃｂｌｄ２，Ｉｔｇａ３，Ｃｏｐｂ２，Ｃｏｐａ，Ｃｏｐｓ３，Ｉｔｍ２ｂ，Ａｉｆｍ１，Ｔｒａｐ１，Ａｎｘａ４，Ａｎｘａ６，Ｐｌａ２ｇ７，Ａｓｐｎ，Ｌｏｘ，Ｃｒｋ，Ｆｂｌｎ１，Ｇｐｒ５２，Ｐｐｐ２ｃａ，Ｐｐｐ２ｒ２ｂ，Ｌｐｈｎ３，Ｐｔｐｒｆ，Ｒｂｂｐ９，Ｐｒｒｃ１，Ｃｒｅｇ１，Ｎｐｍ１，Ｒｐｓ４ｘ，Ｐｌｒｇ１，Ｒｎａｓｅ４，Ｕｇｐ２，Ｙａｒｓ，Ｇａｌｎｔ１０，Ｎｕｄｔ２１，Ｕｂｅ２ｌ３，Ｕｆｄ１ｌ，Ｓｅｒｐｉｎｅ１，Ｕｂａ５２，Ｕｂｅ２ｖ２，Ｐｓｍａ２，Ｐｓｍｂ１，Ｐｓｍｂ４，Ｐｓｍｂ６，Ｐｓｍｂ７，Ｔｒｙ１０，Ｃｃｔ４，Ｆｋｂｐ４，Ｂｍｐ１，Ｈｅｘｂ，Ｇｌｂ１，Ａｌｄｈ３ａ１，Ｍａｎ２ｂ２，Ｎｇｌｙ１，Ｆｕｃａ１，Ｏｘｃｔ１，Ｎｉｔ２，Ｌｏｘｌ１，Ｍａｎ１ｃ１，Ｃｒａｂｐ２，Ｃｔｂｓ，Ｇｓｔａ４，Ｇｓｔｍ２，Ｈｄｈｄ２，Ｓｇｓｈ，Ｈｙｉ，Ｖａｓｎ，Ｔｆｒｃ，Ｌｃｎ２，Ａｐ１ｍ１，Ｃ１ｑｔｎｆ６，Ｖｐｓ２６ｂ，Ｓｅｃ２４ｄ，Ｓｌｃ４４ａ２，Ｃｄ１４，Ａｎｐｅｐ（ＣＤ１３），Ｆｋｂｐ９，Ａｌｃａｍ，Ｃ３，ＴｎＣ，Ｎｕｄｃ，Ｓｅｍａ４ｂ，Ａｇｒｉｎ，Ｐｌｘｎｂ２，１１１０００７Ｌ １５Ｒｉｋ，２７０００８５Ｅ ０５Ｒｉｋ，３１１０００３Ａ １７Ｒｉｋ，４９３１４０６Ｃ ０７Ｒｉｋ，６５３０４０１Ｎ ０４Ｒｉｋ，ＥＧ５４５０９
のうち少なくとも１つより選択されるタンパク質の発現レベルを測定することを特徴とする、虚血状態の検出方法を提供する。
【００１０】
なかでも、本発明の態様は、哺乳動物組織における虚血状態を検出する方法であって、前記哺乳動物から採取した試料中に含まれるテネイシンＣ（ＴｎＣ）タンパク質の発現レベルを測定することを特徴とする、虚血状態の検出方法を提供する。
【００１１】
本発明は、試料がヒト血清である、前記態様に記載の虚血状態検出方法を提供する。
【００１２】
本発明は、マーカータンパク質の発現レベルの測定が、抗原抗体反応を用いた測定である、前記態様のうちいずれか１つに記載の虚血状態検出方法を提供する。
【００１３】
本発明は、マーカータンパク質の発現レベルの測定が、予め測定された非虚血状態の試料中に含まれる前記マーカータンパク質の発現レベルとの比較工程を含む、前記態様に記載の虚血状態検出方法を提供する。
【００１４】
本発明は、虚血が心臓虚血である、前記態様のうちいずれか１つに記載の虚血状態検出方法を提供する。
【発明の効果】
【００１５】
本発明の提供する虚血マーカー並びに同虚血マーカーを利用した虚血状態の検出方法を利用することにより、組織の虚血状態、特に心臓組織の虚血−再灌流状態を迅速かつ効果的に検出することが可能となる。また本発明に係るマーカーはその発現亢進または減少を指標とした虚血治療のための創薬のターゲットとしても利用可能であり、更にこれらマーカー自体も機能的に虚血からの回復に関連したものは虚血治療薬となりうるなど、今後新たなマーカーや治療薬を開発するための優れた基礎を提供するものである。
【図面の簡単な説明】
【００１６】
【図１】培養心筋細胞において、虚血−再灌流刺激によって特異的に発現するタンパク質群を、その機能により分類・模式化して示す。
【図２】本発明における、虚血−再灌流刺激特異的に発現するタンパク質群の網羅的な解析手法を模式化して示す。
【図３】虚血−再灌流刺激を与えた培養心筋細胞における、ＡＩＦ、ＢＭＰ−１（発現亢進）、ＨＳＰ９０（発現変化無し）、及びα−エノラーゼ（発現減少）の刺激前後における発現量の経時変化を比較して示す。
【図４】人工心肺を用いた開胸手術時における血液中の各マーカータンパク質の発現量の経時変化を、手術前（ＢＳ）、手術中（ＤＳ）及び手術後（０，３，２４，４８，７２時間後）のそれぞれの時点で比較して示す。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
本発明は、虚血後の再潅流時に、特異的かつ再現性よく放出される酵素等のタンパク質をマーカーとして、これを検出することを提案するものである。これらのマーカー物質は、例えば、ヒトを含む哺乳動物の心筋梗塞、脳梗塞、心臓手術、外傷時の止血等の後の再潅流時に、これらの虚血状態におかれた細胞またはその周辺細胞から放出されるものであると考えられる。そこで、本発明の態様は、哺乳動物細胞における虚血状態を検出する方法であって、前記哺乳動物細胞から採取した試料中に含まれる下記の虚血マーカー（略称で示す；括弧内が正式名）、
Ａｒｐｃ３（actin related protein 2/3 complex,subunit 3），Ｐｆｎ２（profilin 2），Ｓｇｃｅ（sarcoglycan, epsilon），Ａｃｔｒ３（ARP3 actin-related protein 3 homolog），Ｈ３ｆ３ｂ（H3 histone, family 3B），Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｍ（histone cluster 1，Ｈ２ｂｍ），Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｐ（histone cluster 1，Ｈ２ｂｐ），Ｈｉｓｔ１ｈ３ａ（histone cluster 1，Ｈ３ａ），Ｈｉｓｔ２ｈ２ａａ１（histone cluster 2，Ｈ２ａａ１），Ｐｏｓｔｎ（periostin,osteoblast specific factor），Ｆｂｌｎ５（fibulin 5），Ｃｏｌ１８ａ１（procollagen,type XVIII，alpha 1），Ｌａｍｂ１−１（laminin B1 subunit 1），Ｌａｍｃ１（laminin,gamma 1），Ｐｒｏｓ１（protein S alpha），Ｃｏｌ６ａ２（procollagen,typeVI，alpha 2），Ｃｔｎｎｂ１（catenin[cadherin associated protein],beta 1），Ｄｃｂｌｄ２（discoidin,CUB and LCCL domain containing 2），Ｉｔｇａ３（integrin alpha 3），Ｃｏｐｂ２（coatomer protein complex,subunit beta 2［beta prime］），Ｃｏｐａ（coatomer protein complex subunit alpha），Ｃｏｐｓ３（ＣＯＰ９［constitutive photomorphogenic］homolog,subunit 3），Ｉｔｍ２ｂ（integral membrane protein 2B），Ａｉｆｍ１（apoptosis-inducing factor,mitochondrion-associated 1），Ｔｒａｐ１（ＴＮＦ receptor- associated protein 1），Ａｎｘａ４（annexin A4），Ａｎｘａ６（annexin A6），Ｐｌａ２ｇ７（phospholipase A2,group VII［platelet-activating factor acetylhydrolase,plasma］），Ａｓｐｎ（asporin），Ｌｏｘ（lysyl oxidase），Ｃｒｋ（v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog［avian］），Ｆｂｌｎ１（fibulin 1），Ｇｐｒ５２（G protein-coupled receptor 52），Ｐｐｐ２ｃａ（protein phosphatase 2［formerly 2A］，catalytic subunit,alpha isoform），Ｐｐｐ２ｒ２ｂ（protein phosphatase 2［formerly 2A］，regulatory subunit B［PR52］，beta isoform），Ｌｐｈｎ３（latrophilin 3），Ｐｔｐｒｆ（protein tyrosine phosphatase,receptor type,F），Ｒｂｂｐ９（retinoblastoma binding protein 9），Ｐｒｒｃ１（proline-rich coiled-coil 1），Ｃｒｅｇ１（cellular repressor of E1A stimulated genes 1），Ｎｐｍ１（nucleophosmin 1），Ｒｐｓ４ｘ（ribosomal protein S4,X-linked），Ｐｌｒｇ１（pleiotropic regulator 1,PRL1 homolog［Arabidopsis］），Ｒｎａｓｅ４（ribonuclease,RNase A family 4），Ｕｇｐ２（UDP-glucose pyrophosphorylase 2），Ｙａｒｓ（tyrosyl-tRNA synthetase），Ｇａｌｎｔ１０（UDP-N-acetyl-alpha-Dgalactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyl transferase 10），Ｎｕｄｔ２１（nudix［nucleoside diphosphate linked moiety X］-type motif 21），Ｕｂｅ２ｌ３（ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3），Ｕｆｄ１ｌ（ubiquitin fusion degradation 1 like），Ｓｅｒｐｉｎｅ１（serine［or cysteine］peptidase inhibitor,clade E,member 1［plasminogen activator inhibitor-1］），Ｕｂａ５２（ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1），Ｕｂｅ２ｖ２（ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2），Ｐｓｍａ２（proteasome［prosome,macropain］subunit,alpha type 2），Ｐｓｍｂ１（proteasome［prosome,macropain］Subunit，beta type 1），Ｐｓｍｂ４（proteasome［prosome,macropain］Subunit，beta type 4），Ｐｓｍｂ６（proteasome［prosome,macropain］Subunit,beta type 6），Ｐｓｍｂ７（proteasome［prosome,macropain］Subunit,beta type 7），Ｔｒｙ１０（trypsin 10），Ｃｃｔ４（chaperonin subunit 4［delta］），Ｆｋｂｐ４（FK506 binding protein 4），Ｂｍｐ１（bone morphogenetic protein 1），Ｈｅｘｂ（hexosaminidase B），Ｇｌｂ１（Galactosidase,beta 1），Ａｌｄｈ３ａ１（aldehyde dehydrogenase family 3,subfamily A1），Ｍａｎ２ｂ２（mannosidase 2,alpha B2），Ｎｇｌｙ１（N-glycanase 1），Ｆｕｃａ１（fucosidase,alpha-L-1,tissue），Ｏｘｃｔ１（3-oxoacid CoA transferase 1），Ｎｉｔ２（nitrilase family,member 2），Ｌｏｘｌ１（lysyl oxidase-like 1），Ｍａｎ１ｃ１（mannosidase,alpha,class 1C,member 1），Ｃｒａｂｐ２（cellular retinoic acid binding protein II），Ｃｔｂｓ（chitobiase,di-N-acetyl-），Ｇｓｔａ４（glutathione S-transferase,alpha 4），Ｇｓｔｍ２（glutathione S-transferase,mu 2），Ｈｄｈｄ２（haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 2），Ｓｇｓｈ（N-sulfoglucosamine sulfohydrolase［sulfamidase］），Ｈｙｉ（hydroxypyruvate isomerase homolog［E.coli］），Ｖａｓｎ（vasorin），Ｔｆｒｃ（transferrin receptor），Ｌｃｎ２（lipocalin 2），Ａｐ１ｍ１（adaptor-related protein complex AP-1,mu subunit 1），Ｃ１ｑｔｎｆ６（C1q and tumor necrosis factor related protein 6），Ｖｐｓ２６ｂ（vacuolar protein sorting 26 homolog B［yeast］），Ｓｅｃ２４ｄ（SEC24 related gene family,member D［S.cerevisiae］），Ｓｌｃ４４ａ２（solute carrier family 44,member 2），Ｃｄ１４（CD14 antigen），Ａｎｐｅｐ（alanyl［membrane］aminopeptidase；ＣＤ１３），Ｆｋｂｐ９（FK506 binding protein 9），Ａｌｃａｍ（activated leukocyte cell adhesion molecule)，Ｃ３（complement component 3），ＴｎＣ（tenascin C），Ｎｕｄｃ（nuclear distribution gene C homolog［Aspergillus］），Ｓｅｍａ４ｂ（sema domain,immunoglobulin domain［Ｉｇ］,transmembrane domain［ＴＭ］and short cytoplasmic domain，［semaphorin］4B），Ａｇｒｉｎ，Ｐｌｘｎｂ２（plexin B2），１１１０００７Ｌ １５Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 1110007L15 gene），２７０００８５Ｅ ０５Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 2700085E05 gene），３１１０００３Ａ １７Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 3110003A17 gene），４９３１４０６Ｃ ０７Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 4931406C07 gene），６５３０４０１Ｎ ０４Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 6530401N04 gene），ＥＧ５４５０９（predicted gene，EG545091）
のうち少なくとも１つより選択されるタンパク質の発現レベル、好ましくはアポトーシス誘導因子（ＡＩＦ）の、骨形成タンパク質−１（ＢＭＰ−１）、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ（ＴｎＣ）、アグリンのうち少なくとも１つ、中でもＴｎＣからなる虚血マーカータンパク質のタンパク質量を測定することを特徴とする、虚血状態の検出方法を提供する。組織が虚血−再灌流刺激を受けた際、それに対する応答としてこれまでに知られていなかった種々のタンパク質が細胞外・組織外に放出されることが、本発明者による培養心筋細胞での虚血／非虚血時発現タンパク質の網羅的解析から明らかとなった（図１）。これらのタンパク質を既存のデータベースと比較したところ、これまでに虚血マーカーとして報告のあるタンパク質とは異なり、アポトーシス、炎症反応、血管新生、細胞増殖、細胞接着や神経細胞再生などに関連する様々な機能を持ったタンパク質が特異的に発現していることが明らかとなった。虚血と結びついたそれぞれの反応において特異的に組織外に放出されるこれらのタンパク質の発現レベル、好ましくはこれらのタンパク質の試料中に含まれる量を測定することにより、虚血マーカーとして利用可能である。上記のマーカーは、これまでに機能が明らかにされてきたものの虚血との関連については明らかではないが、虚血後の再潅流時に放出されるものである。哺乳動物組織から採集される試料の種類、その採集方法、マーカータンパク質の検出方法などは当該分野で利用されるもののうちから適宜選択すればよいが、一般に再灌流後の血液を試料として採取するのが好ましい。また検出方法は何ら本発明を限定するものではないが、例えばヒト血液試料を採取し、血清中に含まれるタンパク質に対して上記マーカーに対する特異的抗体を用いたイムノアッセイ（簡便には蛍光イムノアッセイなど）やウェスタンブロッティングを行い、マーカータンパク質の存在を検出するといった方法があげられる。
【００１８】
上記マーカーのうち、従来アポトーシス誘導に係るタンパク質として知られていたＡＩＦは、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＡＩＦ（またはProgrammed cell death 8）には、ＡＩＦそのものの他、そのプリカーサーまたはアイソフォームといった、ＡＩＦとアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であってもアポトーシス誘導という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００１９】
上記マーカーのうち、従来骨細胞増殖に係るタンパク質として知られていたＢＭＰ−１は、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＢＭＰ−１（またはProcollagen C proteinase）には、そのプリカーサーまたはアイソフォーム、ＢＭＰ、ＢＭＰ１−５、ＢＭＰ１−６、Ｔｏｌｌｏｉｄ−ｌｉｋｅタンパク質、そのプリカーサーまたはアイソフォーム、Ｔｏｌｌｏｉｄ−ｌｉｋｅ１、Ｔｏｌｌｏｉｄ−ｌｉｋｅ２などといった、ＢＭＰ−１とアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても骨細胞増殖という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。従来技術欄でも述べた通り、ＢＭＰ−１は心筋細胞に対するホルモン様作用が知られていたが、虚血時に虚血組織から放出されるという現象はまったく知られておらず、虚血マーカーとしてのＢＭＰ−１は新規なマーカーである。
【００２０】
上記マーカーのうち、血管新生に係るタンパク質として知られていたＣＤ１３は、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＣＤ１３（またはAmino peptidase N）には、そのプリカーサーまたはアイソフォーム、Amino peptidase A、Laeverin、ＴＲＨ−ＤＥ（Thyrotropin-releasing hormone degrading enzyme）などといった、ＣＤ１３とアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても血管新生という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２１】
上記マーカーのうち、炎症反応に係るタンパク質として知られていたＣＤ１４は、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＣＤ１４には、そのプリカーサーまたはアイソフォームなどといった、ＣＤ１４とアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても炎症反応という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２２】
上記マーカーのうち、細胞増殖に係るタンパク質として知られていたテネイシンＣは、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうテネイシンＣには、テネイシン、そのプリカーサー、サイトタクチン（Cytotactin）及びそのプリカーサー、テネイシンＸＢ、テネイシンＸ及びそのプリカーサー、テネイシンＲ、テネイシンＮなど、テネイシンＣとアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても細胞増殖という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２３】
上記マーカーのうち、神経細胞再生に係るタンパク質として知られていたアグリンは、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうアグリンとは、アグリンのプリカーサーまたはアイソフォーム、Ｐｅｒｌｅｃａｎ（Heparan sulfate proteoglycan）１、２、またはそのアイソフォームなど、アグリンとアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても細胞増殖という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２４】
本発明の虚血状態検出方法を適用する試料としては、虚血が疑われる組織から放出されるマーカーを含む体液であればどの様なものでも良く、その種類が本発明を限定するものではないが、採集の容易さや既存のマーカーとの比較に供することの容易性の観点、及び疾患の早期発見のため臨床現場で用いられることが想定されることから、ヒト血液、特に血球成分を予め除いたヒト血清が好ましい。試料の採集方法や保存方法などについては、タンパク質である上記マーカーが分解されない条件を満たせば、臨床の現場等で用いられている手法を適宜応用すれば良く、これらが本発明を限定するものではない。
【００２５】
本発明におけるマーカータンパク質の発現レベルの測定手法に関しては、タンパク質の定性／定量的測定方法として用いられている手法を適宜応用すれば良く、本発明を限定するものではないが、プロトコルが確立され、また検出感度にすぐれた抗原抗体反応、すなわち前記マーカータンパク質に対する特異的抗体を用いた検出方法が好適である。前記の特異的抗体を１次抗体として例えばメンブレン転写やフローインジェクション法を用いて試料中のタンパク質に反応させ、これの検出系としては１次抗体を直接標識する方法の他、２次抗体や抗体と反応する試薬を用いた発光、発色による検出などを適宜利用すればよい。
【００２６】
本発明におけるマーカータンパク質の発現レベルを解析するに際し、より正確な虚血状態の検出のためには非虚血状態の試料、好適には非虚血状態のヒト血清中に含まれる前記マーカータンパク質の発現レベルを予め測定しておき、これと虚血が疑われる状態の試料中での同マーカータンパク質の発現レベルとを比較することが有効である。この際には、例えば多人数より採取した試料中における非虚血状態のヒトマーカー発現量を測定しこの平均値を標準としておき、これに対して虚血が疑われる試料中のマーカータンパク量を比較等すれば良い。比較工程においては、例えばマーカーの発現量を示す発色・発光を目視にて定性的に比較する他、画像処理技術などを用いて定量的・半定量的に両者の発現量を比較する方法など、分子生物学分野で採用されている比較手法を適宜用いれば良く、比較方法そのものが本発明を限定するものではない。
【００２７】
本発明の虚血マーカー及びこれを用いた虚血状態の検出方法は、哺乳動物組織における虚血状態を検出する方法として広く利用可能であると考えられるが、臨床的な必要性の高い心臓虚血が主たる対象疾患である。以下に本発明の実施例を示すが、本発明は実施例にのみ限定されるものではない。
【実施例】
【００２８】
（心筋細胞の培養）本実施例に係る心筋細胞の培養、及び虚血−再灌流刺激の与え方については、非特許文献１６に記載の方法に従った。具体的には、ラット胎児心臓由来の培養細胞株であるＨ９ｃ２細胞を１００−ｍｍ培養プレートに５×１０４細胞の密度で蒔き、１０％ウシ胎児血清を含むDulbecco’s modified Eagle medium（ＤＭＥＭ）で７２時間培養した。その後細胞を無血清ＤＭＥＭ培地に移し、６０−７２時間培養した。虚血刺激を与えるために、細胞をSlightly hypotonic Hank’s balanced saline solution（１．３ｍＭ ＣａＣｌ２，５ｍＭ ＫＣｌ，０．３ｍＭ ＫＨ２ＰＯ４，０．５ｍＭ ＭｇＣｌ２，０．４ｍＭ ＭｇＳＯ４，６９ｍＭ ＮａＣｌ，４ｍＭ ＮａＨＣＯ３，０．３ｍＭ Ｎａ２ＨＰＯ４，glucose or serum free）中で２時間、３７℃にてインキュベートした。インキュベーター中の酸素を窒素で置き換えることで虚血状態とし、このときの酸素濃度は１％であった。虚血刺激後、細胞を無血清ＤＭＥＭ培地に移し、酸素濃度２０％、二酸化炭素濃度５％の通常の培養条件に戻して、３７℃にてインキュベートし再灌流状態とした。
【００２９】
（ＩＨ／Ｒ刺激により分泌されるタンパク質の精製）２時間の虚血刺激を与えたＨ９ｃ２細胞を２４時間再灌流し、細胞培養液の上清１Ｌ（リットル）を試料としてプロテオーム解析用に供した。試料を５ｍｌ ＨｉＴｒａｐ陰イオン交換カラム（GE HealthCare，ＵＳＡ）にかけ、カラムにトラップされたタンパク質を５００ｍＭ ＮａＣｌで１ｍｌ／分の流速にて溶出させた。溶出した分画を、遠心フィルターカラム（MILLIPORE，ＵＳＡ）を通して脱塩及び濃縮した。
【００３０】
（トリプシンによるタンパク質のゲル中分解）濃縮した試料をＳＤＳ−ＰＡＧＥにかけ、泳動後のゲルをＣＢＢで染色した。ＩＨ／Ｒ試料と対照試料を泳動したレーンをそれぞれゲルから切り出し、各レーンを均等にスライスして２４個の断片とした。更にこの断片を細かく刻み、２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３を含む３０％アセトニトリルで脱染色した。脱染色したゲル細断片を１００％アセトニトリルで脱水し、その後室温にて３０分間乾燥させた。ゲル中に含まれるタンパク質を、１０ｍＭジチオトレイトール／２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３を用い５６℃で１時間還元処理し、その後５５ｍＭ ヨードアセトアミド／２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３を用い室温・暗黒条件下でアルキル化した。処理後のゲルを５０％アセトニトリル／２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３２５ｍＭで３０分間×２回、１００％アセトニトリルで５分間×１回の計３回、脱水した。脱水したゲルを室温にて３０分間乾燥させ、トリプシン溶液（PROMEGA，１０ｎｇ／ｍｌ ｉｎ２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３）で３０分間、氷上にて再膨潤させた。ゲル外の溶液を取り除き、ゲル中に含まれるタンパク質を３７℃に一晩おいて分解した。分解産物であるペプチドを５０％アセトニトリル／０．１％ トリフルオロ酢酸で３０分×２回、抽出し、抽出物を吸引乾燥して質量分析用に０．１％ギ酸に溶解させた。図２に、培養心筋細胞を用い虚血（ＩＨ／Ｒ）／非虚血（Control）時に放出されるタンパク質を質量分析にかけるまでの上記手順を模式化して示した。
【００３１】
（ペプチド断片の質量分析）トリプシン処理によって得られたペプチド断片を、Ｑ−Ｔｏｆ２（MICROMASS，ＵＫ）を用いその用法に従ってＬＣ−ＭＳ／ＭＳを用いた質量分析に供した。ＬＣカラムはＰｅｐＭａｐ Ｃ１８カラム（LC PACKINGS，HOL）を用い、ＭＳ／ＭＳ分析にはMassLynx，ProteinLynx（MICROMASS）の各ソフトウェアを用いて解析を行った。ペプチド断片の配列データをＮＣＢＩデータベースのデータと比較し、タンパク質を同定するため、Ｍａｓｃｏｔ ＭＳ／ＭＳ Ions Search（MATRIX SCIENCE）を用いた。こうして得られたペプチド断片から推定される発現タンパク質のプロファイルを、虚血−再灌流刺激あり、刺激無しのそれぞれについて比較した。表１はその結果から一部分を抜粋したものであり、表中ＮＣＢＩ ＩＤはペプチド断片の配列から推測されるタンパク質のＮＣＢＩデータベースでの対応物を、Ｇｅｎｅは遺伝子名を、Control Scoreは対照サンプル中の同遺伝子産物のＭａｓｃｏｔ ＭＳ／ＭＳ Ions Searchによる“確からしさ”の指標（値が大きいほど確からしく、同時に発現量の大小も反映している）を、ＩＨ／Ｒ scoreは虚血−再灌流刺激を与えたサンプル中での同遺伝子産物のスコアをそれぞれ表している。更に、個々のタンパク質はその発現量がそれぞれ異なっていることを考慮して、Control scoreとＩＨ／Ｒ scoreの比をRatio欄で示した。表１のうち、Ｎｏ．１−５の様に対照では発現が見られず虚血−再灌流刺激時にのみ特異的に現れるもの、Ｎｏ．６−１０の様に虚血−再灌流刺激時に発現量が増大するもの、Ｎｏ．１１−１５の様に刺激前後で発現量に変化が見られないもの、Ｎｏ．１６−２０の様に虚血−再灌流刺激時に発現量が減少するものがそれぞれ確認された。虚血−再灌流刺激時に特異的に発現するタンパク質のうちには、過去に虚血マーカーとして報告のあるミオシン等が含まれており、今回の発現解析が有効であることが示された。
【００３２】
【表１】
【００３３】
上記結果のうち、虚血マーカーとしては虚血−再灌流刺激時に特異的に発現するものが最も望ましいと考えられた。網羅的な比較分析の結果、１０９種類のＩＨ／Ｒ特異的発現タンパク質が同定された（表２）。表中ＮＣＢＩ ＩＤはペプチド断片の配列から推測されるタンパク質のＮＣＢＩデータベースでの対応物を、ＭＷは分子量を、Official symbolは正式略称を、Official nameは遺伝子産物の正式名を、Scoreは虚血−再潅流時のＭａｓｃｏｔスコアを、Localizationはこれまでに報告のあるそれぞれのタンパク質の細胞内での局在を、Functionはこれまでに報告のあるそれぞれのタンパク質の機能を表している。すなわち表２に記載されたタンパク質のうち、これまでに虚血マーカーとして報告のあるものを除いたタンパク質群は、虚血マーカー、好ましくは心臓虚血のマーカーとして利用可能なタンパク質である。この中には、アポトーシス関連タンパク質群、シグナル伝達系タンパク質群、成長因子及びその関連タンパク質群、プロテアーゼ、細胞接着因子、シャペロン、代謝酵素、リンパ細胞シグナルタンパク質群、神経細胞成長関連タンパク質群、トランスポーター、細胞骨格タンパク質、転写制御因子、コートマータンパク質などが含まれていた。下記表７に、それらのうち代表的なものを示す。
【００３４】
【表２】
【００３５】
【表３】
【００３６】
【表４】
【００３７】
【表５】
【００３８】
【表６】
【００３９】
【表７】
【００４０】
（イムノブロッティング）データベースとの比較から同定された１０９種類のタンパク質のうち、アポトーシス、炎症反応、細胞接着、細胞増殖、神経細胞成長、血管新生、とそれぞれ異なった機能を有するタンパク質であると推測された６種類のタンパク質、すなわちＡＩＦ、ＢＭＰ−１、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ、アグリンについて、培養細胞系における虚血−再灌流刺激前後のタンパク質発現量の比較、及び人工心肺による心臓手術を受ける患者さん（一時的に心臓本体は虚血状態になる）の血液中における発現の検証として、培養細胞上清及び血液からの試料調整とその試料を用いた電気泳動、並びにイムノブロッティングを行った。培養細胞系における虚血−再灌流刺激前後のタンパク質発現量の比較には、発現亢進がみられたＡＩＦとＢＭＰ−１の他、表１にあげたタンパク質のうち刺激前後で発現量が同等と推測されたストレス応答タンパク質の一種ＨＳＰ９０、及び刺激後に発現量が減少すると推測されたα−エノラーゼについても、検出の有効性を確認するために検証した。血液試料の採取は山口大学病院にて人工心肺を用いた開胸手術を受ける５４−７５歳の患者さん６名につき、インフォームドコンセント及び関連法令・規則に則って、血清中のＡＩＦ、ＢＭＰ−１、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ、アグリンの発現量を手術前後で比較した。採取した試料（血清）はLysis buffer［１％ ＴｒｉｔｏｎＸ−１００，２０ｍＭ Ｔｒｉｓ（ｐＨ７．５），１５０ｍＭ ＮａＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ，２．５ｍＭ ピロリン酸Ｎａ，１ｍＭ β−グリセロールリン酸，１ｍＭ オルソバナジウム酸Ｎａ，１μｇ／ｍｌ ロイペプチン，１ｍＭ フェニルメタンスルホニルフルオライド］で溶解し、溶液を１０％ポリアクリルアミドゲル電気泳動にかけ、泳動物をニトロセルロース膜に転写した。転写後に膜を５％脱脂粉乳または１０％ＢＳＡ（Bovine serum albumin）／０．０５％（ｗ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０含有ＴＢＳ bufferでブロッキングし、上記の各タンパク質に対する特異的抗体を反応させ、結合しなかった抗体を洗い流した後に蛍光試薬で標的タンパク質の存在を定量的に可視化した。抗アグリン抗体、抗テネイシンＣ抗体、抗ＢＭＰ−１抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＡＩＦ抗体及び抗ＨＳＰ９０抗体、抗α−エノラーゼ抗体はそれぞれSANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY（ＵＳＡ）から購入したものを用い、抗原抗体反応は用法に従って行った。
【００４１】
培養細胞系における虚血−再灌流刺激前後のタンパク質発現量の比較を目的としたイムノブロッティングの結果を、図３に示す。図３ＡはＡＩＦ、ＢはＢＭＰ−１、ＣはＨＳＰ９０、Ｄはα−エノラーゼの結果を示し、ＩＨ／Ｒ ０，２，・・・の数字はそれぞれ虚血−再灌流刺激後の経過時間（０は刺激無し）を表している。ＡＩＦ（Ａ）の発現量は、虚血刺激を与える前にはほとんどみられないのに対して、刺激を与えた２時間後には急激に増加し、２４時間後にもこの増加は継続、４８時間後にはやや減少するという傾向が見られた。ＢＭＰ−１（Ｂ）についても、刺激前には発現がみられず、刺激後２時間後にもそれほど増加はみられないが、２４時間後には明瞭な発現の亢進が観察された。ＨＳＰ９０（Ｃ）については、虚血刺激前に一定量の発現があり、刺激後２時間では一時的に発現量が減少するものの２４時間後には刺激前と同程度にまで発現量が回復しており、０時間と２４時間後の比較では発現量が同等という先の推測が裏付けられた。反対にα−エノラーゼ（Ｄ）では、刺激前に発現が観察されたが刺激後２時間でその発現が消失し、２４−４８時間後にわずかな回復がみられるもののその発現量は刺激前に比べてはるかに減少しており、こちらも上記の推測を裏付ける結果となった。虚血−再灌流刺激後に発現の亢進するタンパク質、同等なタンパク質、減少するタンパク質それぞれについて、網羅的なリストアップと個々のタンパク質に対するイムノブロットの結果が一致したことから、本発明の網羅的解析で得られたマーカー候補となるタンパク質の情報が有効であることが確認された。
【００４２】
人工心肺による心臓手術時（一時的虚血状態）の血液中における各マーカータンパク質の発現の比較結果を、図４に示す。図４ＡはＡＩＦ、ＢはＢＭＰ−１、ＣはＣＤ１３、ＤはＣＤ１４、ＥはテネイシンＣ、Ｆはアグリンの発現量を、蛍光の強度（結合した抗体量＝標的のタンパク質量を反映）でそれぞれ表したものであり、またＢＳ（Before Surgery）は手術前に採集した試料、ＤＳ（During Surgery）は手術中に採集した試料、０，３，・・・は手術後の各時間における試料をそれぞれ表している。Ａ−Ｆは代表的なもの１例を挙げたが、６例いずれも同様の傾向を示した。ＡＩＦ、ＢＭＰ−１、ＣＤ１３、テネイシンＣ及びアグリンでは、手術前にはほとんど発現がみられないのと比較して、手術後２４−４８時間で血清中に含まれる各タンパク質量が増加することがイムノブロッティングの結果より示された（図中▼で示す）。ＣＤ１４については、手術前・手術中の血清に既に放出されていたが、手術後にその発現量が増大することが示された。培養細胞系での結果と臨床検体での結果に良い一致が見られたことから、本発明におけるマーカータンパク質は、虚血マーカー、好ましくは心臓虚血マーカーとしてきわめて有効であることが示された。
【産業上の利用可能性】
【００４３】
本発明は、虚血マーカー、虚血の検査の分野などに好適に利用することができる。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、哺乳動物組織における虚血状態を効果的に検出可能なマーカーに関し、より詳しくは、虚血−再灌流時に特異的に放出され、特異的なマーカーとして利用可能なタンパク質及びこれを用いた虚血状態の検出方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
虚血−再灌流（Ischemic hypoxia and reoxygenation；ＩＨ／Ｒ）は、例えば心筋梗塞や心臓バイパス手術、心臓移植などで発生する心臓の主要な疾患状態である。心臓冠動脈の虚血−再灌流が発生した場合、心臓は肥大したり、虚血周囲で細胞死が観察されたり、また、心筋の繊維化が見られる。これらの現象はリモデリングと呼ばれており、これは虚血にさらされた心筋細胞ばかりでなく虚血周囲の組織においてもよく観察されている。幾つかのケースでは、虚血にさらされた心筋細胞に対する隣接する血管からの血管新生が観察されている。これらのことは、虚血−再灌流時に何らかのシグナルを伝達するための様々な因子が放出されていることを示唆している（非特許文献１，２）。
【０００３】
実際、心臓は全身に血液を送るポンプの役割ばかりでなく、ホルモン性因子を放出する内分泌系の組織として働いていることもよく知られている。一酸化窒素やプロスタグランジン、アデノシンといった低分子物質が心臓から放出され、心臓血管系の制御に関与している。これらの低分子に加え、骨形成因子（Bone morphogenetic protein；ＢＭＰ）の刺激により心筋細胞から放出されるトランスフォーミング成長因子−β（Transforming growth factor-β）が線維芽細胞から心筋繊維細胞への転換を促している。一方、心臓虚血時には、炎症性サイトカインもまた心臓から放出されている（非特許文献６−８）。腫瘍壊死因子は虚血心筋において産生され、リアナジン受容体阻害を介して心臓の収縮抑制に関与している。炎症性サイトカインであるインターロイキン１β（ＩＬ−１β）やインターロイキン６（ＩＬ−６）も虚血後の心臓から放出されている。ＩＬ−１βは心筋の直接的な阻害に加え、カルシウムを制御する遺伝子のダウンレギュレーションを介して心臓の収縮を抑制している。ＩＬ−６は、Ｌ型タイプのカルシウムチャネルを阻害することによってカルシウムの細胞内流入や心臓収縮の抑制に働いている。線維芽細胞成長因子（Fibroblast growth factor；ＦＧＦ）やヘパリン結合性成長因子（Heparin-binding growth factor；ＨＢＧＦ）は心筋虚血時に放出され防護因子として働くことも報告されている（非特許文献９−１５）。この様に虚血−再灌流時には様々なシグナル伝達機構が機能を果たしていることが明らかになってきており、これらのペプチド性因子を心臓虚血を捕捉するためのマーカーとして利用する動きも広がってきている。
【０００４】
ペプチド性の虚血マーカー、特に心臓虚血のマーカーとしては、これまでにＰＥＰ−１９，ＩｇＡ結合性アルカリ性ホスファターゼ、心房性／脳性ナトリウム利尿ペプチド、虚血変成アルブミン、酸素調節タンパク質、トロポニン、カルシトニン、ウロテンシン、ミオグロビン、ミオシン、アネキシン、マトリックスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、リポタンパク質やクレアチンキナーゼ、エノラーゼ、乳酸デヒドロゲナーゼなどの酵素などが開示されている（特許文献１−１８）。しかしながら、従来の虚血マーカーは、虚血状態にありながらも簡便な検出可能な程度には十分に放出されないものや、逆に虚血状態とは無関係な要因により放出されるケースなどがあり、更に従来のマーカーでは検出が困難な虚血の症例も見出されている。一方で、虚血が複数の複雑な反応の集積であることが明らかにされ、単独のマーカーだけではなく複数のマーカーを組み合わせることによって虚血状態の判定がなされてきたというこれまでの経緯からも、虚血−再灌流イベントと生理的・機能的に結びついた、特異性や再現性の高い新規な虚血マーカーの開発が待たれていた。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】特開２００７−０５６００８ ｍ−カルパインおよび／またはμ−カルパインによるＰＥＰ−１９の分解を阻害することを特徴とする虚血性脳疾患の治療方法
【特許文献２】特開２００６−１３２９４６ ＩｇＡ結合性アルカリ性ホスファターゼ６の測定方法およびそれに用いるキット
【特許文献３】特開２００４−０３７４５５ マーカーの組み合わせを用いた心臓疾患症例の予後判定
【特許文献４】特開２００３−２７０２５０ 血液中の心不全マーカー定量方法
【特許文献５】特表２００７−５０５７２６ 心臓由来が疑われる胸部痛を有する患者のリスク階層化のための装置および方法
【特許文献６】特表２００７−５１０１４６ マーカーの組合せによる急性心筋虚血性疾患の診断
【特許文献７】特表２００６−５０７５１０ 組織低酸素症の体液マーカー
【特許文献８】特表２００６−５２６１４０ 鑑別診断のためのマーカーおよびその使用方法
【特許文献９】特表２００５−５２２６６９ 卒中および脳損傷の診断マーカーおよびその使用方法
【特許文献１０】特表２００４−５２０５９８ 急性冠状動脈症候群の診断マーカーおよびその使用方法
【特許文献１１】特表２００４−５２９３５１ 急性心筋梗塞および他の臨床的状態の診断への改良
【特許文献１２】特表２００３−５３２６８５ アテローム性動脈硬化症の治療および／または予防のためのＩＬ−１８阻害剤の用途
【特許文献１３】特表２００２−５３８４６３ 脳卒中を診断しそして区別するための方法
【特許文献１４】特表平１０−５０４０９７ 臓器拒絶反応のマーカー
【特許文献１５】特表平１０−５１１１８５ 胸痛の発症初期に診断し鑑別するための方法ならびに装置
【特許文献１６】再公表０４−０６５９６１ 酸化度の定量法
【特許文献１７】特許第３８６０６０５号 補体活性化をブロックするキメラタンパク質
【特許文献１８】特許第３６６６８６６号 神経保護治療をモニターする方法
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】Sutton M.G. & Sharpe N. 2000. Circulation 101:2981-2988.
【非特許文献２】Eefting F. et al. 2004. Cardiovasc.Res. 61:414-426.
【非特許文献３】Sabbah H.N. 2000. Cardiovasc.Res. 45:704-712.
【非特許文献４】Kang P.M. & Izumo S. 2000. Circ.Res. 86:1107-1113.
【非特許文献５】Lijnen P.Petrov V. 2000. J.Mol.Cell Cardiol. 32:865-879.
【非特許文献６】Fragogiannis N.G. et al. 2002. Cardiovasc.Res. 53:31-47.
【非特許文献７】Thaik C.M. et al. 1995. J.Clin.Invest. 96:1093-1099.
【非特許文献８】Neumann F.J. et al. 1995. Circulation 92:748-755.
【非特許文献９】Li Y. et al. 2003. Circulation 107:2499-2506.
【非特許文献１０】Jayasankar V. et al. 2003. Circulation 108 Suppl. 1:II230-236.
【非特許文献１１】Jiang Z.S. et al. 2002. Am.J.Physiol.Heart.Circ.Physiol. 282:H1071-1080.
【非特許文献１２】House S.L. et al. 2003. Circulation 108:3140-3148.
【非特許文献１３】Tanaka N. et al. 2002. Biochem.Biophys.Res.Commun. 297:375-381.
【非特許文献１４】Detillieux K.A. et al. 2003. Cardiovasc.Res. 57:8-19.
【非特許文献１５】Zisch et al. 2003. Cardiovasc.Pathol. 12:295-310.
【非特許文献１６】Mizukami Y. et al. 2000. J.Biol.Chem. 275:19921-19927.
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
上記の現状に鑑み、本発明は、虚血−再灌流時に虚血組織から特異的に放出され、虚血状態を感度良く識別可能なマーカータンパク質及びこれを用いた虚血状態の検出方法を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
前記課題の解決のため、特に、これまでに知られていない新規な虚血マーカーを見出すために、本発明者は、細胞・組織がある状態に置かれたときに特異的に発現するタンパク質を網羅的に解析するというプロテオーム解析の手法に着目した。すなわち培養心筋細胞の系を用いてここに虚血−再灌流刺激を与え、培養液中に放出されるタンパク質を網羅的に解析した。具体的には、虚血刺激なしで培養液中に放出されるタンパク質と虚血刺激により放出されるタンパク質のプロファイルを比較し（Subtractive Proteomics）、虚血−再灌流刺激によって特異的に放出されるタンパク質を同定して、刺激時に発現が亢進（Up-regulated）及び減少（Down-regulated）するマーカー候補となるタンパク質群を明らかにし、このうち発現が大幅に亢進するタンパク質数種については人工心肺による心臓手術を受ける患者さん（一時的に心臓本体は虚血状態になる）の血液中における発現の検証を行って、これらのマーカー候補が確かに虚血−再灌流時に特異的に発現亢進していることを確証し、本発明を完成させた。
【０００９】
本発明は、哺乳動物細胞における虚血状態を検出する方法であって、前記哺乳動物細胞から採取した試料中に含まれる下記の虚血マーカー、
Ａｒｐｃ３，Ｐｆｎ２，Ｓｇｃｅ，Ａｃｔｒ３，Ｈ３ｆ３ｂ，Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｍ，Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｐ，Ｈｉｓｔ１ｈ３ａ，Ｈｉｓｔ２ｈ２ａａ１，Ｐｏｓｔｎ，Ｆｂｌｎ５，Ｃｏｌ１８ａ１，Ｌａｍｂ１−１，Ｌａｍｃ１，Ｐｒｏｓ１，Ｃｏｌ６ａ２，Ｃｔｎｎｂ１，Ｄｃｂｌｄ２，Ｉｔｇａ３，Ｃｏｐｂ２，Ｃｏｐａ，Ｃｏｐｓ３，Ｉｔｍ２ｂ，Ａｉｆｍ１，Ｔｒａｐ１，Ａｎｘａ４，Ａｎｘａ６，Ｐｌａ２ｇ７，Ａｓｐｎ，Ｌｏｘ，Ｃｒｋ，Ｆｂｌｎ１，Ｇｐｒ５２，Ｐｐｐ２ｃａ，Ｐｐｐ２ｒ２ｂ，Ｌｐｈｎ３，Ｐｔｐｒｆ，Ｒｂｂｐ９，Ｐｒｒｃ１，Ｃｒｅｇ１，Ｎｐｍ１，Ｒｐｓ４ｘ，Ｐｌｒｇ１，Ｒｎａｓｅ４，Ｕｇｐ２，Ｙａｒｓ，Ｇａｌｎｔ１０，Ｎｕｄｔ２１，Ｕｂｅ２ｌ３，Ｕｆｄ１ｌ，Ｓｅｒｐｉｎｅ１，Ｕｂａ５２，Ｕｂｅ２ｖ２，Ｐｓｍａ２，Ｐｓｍｂ１，Ｐｓｍｂ４，Ｐｓｍｂ６，Ｐｓｍｂ７，Ｔｒｙ１０，Ｃｃｔ４，Ｆｋｂｐ４，Ｂｍｐ１，Ｈｅｘｂ，Ｇｌｂ１，Ａｌｄｈ３ａ１，Ｍａｎ２ｂ２，Ｎｇｌｙ１，Ｆｕｃａ１，Ｏｘｃｔ１，Ｎｉｔ２，Ｌｏｘｌ１，Ｍａｎ１ｃ１，Ｃｒａｂｐ２，Ｃｔｂｓ，Ｇｓｔａ４，Ｇｓｔｍ２，Ｈｄｈｄ２，Ｓｇｓｈ，Ｈｙｉ，Ｖａｓｎ，Ｔｆｒｃ，Ｌｃｎ２，Ａｐ１ｍ１，Ｃ１ｑｔｎｆ６，Ｖｐｓ２６ｂ，Ｓｅｃ２４ｄ，Ｓｌｃ４４ａ２，Ｃｄ１４，Ａｎｐｅｐ（ＣＤ１３），Ｆｋｂｐ９，Ａｌｃａｍ，Ｃ３，ＴｎＣ，Ｎｕｄｃ，Ｓｅｍａ４ｂ，Ａｇｒｉｎ，Ｐｌｘｎｂ２，１１１０００７Ｌ １５Ｒｉｋ，２７０００８５Ｅ ０５Ｒｉｋ，３１１０００３Ａ １７Ｒｉｋ，４９３１４０６Ｃ ０７Ｒｉｋ，６５３０４０１Ｎ ０４Ｒｉｋ，ＥＧ５４５０９
のうち少なくとも１つより選択されるタンパク質の発現レベルを測定することを特徴とする、虚血状態の検出方法を提供する。
【００１０】
なかでも、本発明の態様は、哺乳動物組織における虚血状態を検出する方法であって、前記哺乳動物から採取した試料中に含まれるテネイシンＣ（ＴｎＣ）タンパク質の発現レベルを測定することを特徴とする、虚血状態の検出方法を提供する。
【００１１】
本発明は、試料がヒト血清である、前記態様に記載の虚血状態検出方法を提供する。
【００１２】
本発明は、マーカータンパク質の発現レベルの測定が、抗原抗体反応を用いた測定である、前記態様のうちいずれか１つに記載の虚血状態検出方法を提供する。
【００１３】
本発明は、マーカータンパク質の発現レベルの測定が、予め測定された非虚血状態の試料中に含まれる前記マーカータンパク質の発現レベルとの比較工程を含む、前記態様に記載の虚血状態検出方法を提供する。
【００１４】
本発明は、虚血が心臓虚血である、前記態様のうちいずれか１つに記載の虚血状態検出方法を提供する。
【発明の効果】
【００１５】
本発明の提供する虚血マーカー並びに同虚血マーカーを利用した虚血状態の検出方法を利用することにより、組織の虚血状態、特に心臓組織の虚血−再灌流状態を迅速かつ効果的に検出することが可能となる。また本発明に係るマーカーはその発現亢進または減少を指標とした虚血治療のための創薬のターゲットとしても利用可能であり、更にこれらマーカー自体も機能的に虚血からの回復に関連したものは虚血治療薬となりうるなど、今後新たなマーカーや治療薬を開発するための優れた基礎を提供するものである。
【図面の簡単な説明】
【００１６】
【図１】培養心筋細胞において、虚血−再灌流刺激によって特異的に発現するタンパク質群を、その機能により分類・模式化して示す。
【図２】本発明における、虚血−再灌流刺激特異的に発現するタンパク質群の網羅的な解析手法を模式化して示す。
【図３】虚血−再灌流刺激を与えた培養心筋細胞における、ＡＩＦ、ＢＭＰ−１（発現亢進）、ＨＳＰ９０（発現変化無し）、及びα−エノラーゼ（発現減少）の刺激前後における発現量の経時変化を比較して示す。
【図４】人工心肺を用いた開胸手術時における血液中の各マーカータンパク質の発現量の経時変化を、手術前（ＢＳ）、手術中（ＤＳ）及び手術後（０，３，２４，４８，７２時間後）のそれぞれの時点で比較して示す。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
本発明は、虚血後の再潅流時に、特異的かつ再現性よく放出される酵素等のタンパク質をマーカーとして、これを検出することを提案するものである。これらのマーカー物質は、例えば、ヒトを含む哺乳動物の心筋梗塞、脳梗塞、心臓手術、外傷時の止血等の後の再潅流時に、これらの虚血状態におかれた細胞またはその周辺細胞から放出されるものであると考えられる。そこで、本発明の態様は、哺乳動物細胞における虚血状態を検出する方法であって、前記哺乳動物細胞から採取した試料中に含まれる下記の虚血マーカー（略称で示す；括弧内が正式名）、
Ａｒｐｃ３（actin related protein 2/3 complex,subunit 3），Ｐｆｎ２（profilin 2），Ｓｇｃｅ（sarcoglycan, epsilon），Ａｃｔｒ３（ARP3 actin-related protein 3 homolog），Ｈ３ｆ３ｂ（H3 histone, family 3B），Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｍ（histone cluster 1，Ｈ２ｂｍ），Ｈｉｓｔ１ｈ２ｂｐ（histone cluster 1，Ｈ２ｂｐ），Ｈｉｓｔ１ｈ３ａ（histone cluster 1，Ｈ３ａ），Ｈｉｓｔ２ｈ２ａａ１（histone cluster 2，Ｈ２ａａ１），Ｐｏｓｔｎ（periostin,osteoblast specific factor），Ｆｂｌｎ５（fibulin 5），Ｃｏｌ１８ａ１（procollagen,type XVIII，alpha 1），Ｌａｍｂ１−１（laminin B1 subunit 1），Ｌａｍｃ１（laminin,gamma 1），Ｐｒｏｓ１（protein S alpha），Ｃｏｌ６ａ２（procollagen,typeVI，alpha 2），Ｃｔｎｎｂ１（catenin[cadherin associated protein],beta 1），Ｄｃｂｌｄ２（discoidin,CUB and LCCL domain containing 2），Ｉｔｇａ３（integrin alpha 3），Ｃｏｐｂ２（coatomer protein complex,subunit beta 2［beta prime］），Ｃｏｐａ（coatomer protein complex subunit alpha），Ｃｏｐｓ３（ＣＯＰ９［constitutive photomorphogenic］homolog,subunit 3），Ｉｔｍ２ｂ（integral membrane protein 2B），Ａｉｆｍ１（apoptosis-inducing factor,mitochondrion-associated 1），Ｔｒａｐ１（ＴＮＦ receptor- associated protein 1），Ａｎｘａ４（annexin A4），Ａｎｘａ６（annexin A6），Ｐｌａ２ｇ７（phospholipase A2,group VII［platelet-activating factor acetylhydrolase,plasma］），Ａｓｐｎ（asporin），Ｌｏｘ（lysyl oxidase），Ｃｒｋ（v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog［avian］），Ｆｂｌｎ１（fibulin 1），Ｇｐｒ５２（G protein-coupled receptor 52），Ｐｐｐ２ｃａ（protein phosphatase 2［formerly 2A］，catalytic subunit,alpha isoform），Ｐｐｐ２ｒ２ｂ（protein phosphatase 2［formerly 2A］，regulatory subunit B［PR52］，beta isoform），Ｌｐｈｎ３（latrophilin 3），Ｐｔｐｒｆ（protein tyrosine phosphatase,receptor type,F），Ｒｂｂｐ９（retinoblastoma binding protein 9），Ｐｒｒｃ１（proline-rich coiled-coil 1），Ｃｒｅｇ１（cellular repressor of E1A stimulated genes 1），Ｎｐｍ１（nucleophosmin 1），Ｒｐｓ４ｘ（ribosomal protein S4,X-linked），Ｐｌｒｇ１（pleiotropic regulator 1,PRL1 homolog［Arabidopsis］），Ｒｎａｓｅ４（ribonuclease,RNase A family 4），Ｕｇｐ２（UDP-glucose pyrophosphorylase 2），Ｙａｒｓ（tyrosyl-tRNA synthetase），Ｇａｌｎｔ１０（UDP-N-acetyl-alpha-Dgalactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyl transferase 10），Ｎｕｄｔ２１（nudix［nucleoside diphosphate linked moiety X］-type motif 21），Ｕｂｅ２ｌ３（ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3），Ｕｆｄ１ｌ（ubiquitin fusion degradation 1 like），Ｓｅｒｐｉｎｅ１（serine［or cysteine］peptidase inhibitor,clade E,member 1［plasminogen activator inhibitor-1］），Ｕｂａ５２（ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1），Ｕｂｅ２ｖ２（ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2），Ｐｓｍａ２（proteasome［prosome,macropain］subunit,alpha type 2），Ｐｓｍｂ１（proteasome［prosome,macropain］Subunit，beta type 1），Ｐｓｍｂ４（proteasome［prosome,macropain］Subunit，beta type 4），Ｐｓｍｂ６（proteasome［prosome,macropain］Subunit,beta type 6），Ｐｓｍｂ７（proteasome［prosome,macropain］Subunit,beta type 7），Ｔｒｙ１０（trypsin 10），Ｃｃｔ４（chaperonin subunit 4［delta］），Ｆｋｂｐ４（FK506 binding protein 4），Ｂｍｐ１（bone morphogenetic protein 1），Ｈｅｘｂ（hexosaminidase B），Ｇｌｂ１（Galactosidase,beta 1），Ａｌｄｈ３ａ１（aldehyde dehydrogenase family 3,subfamily A1），Ｍａｎ２ｂ２（mannosidase 2,alpha B2），Ｎｇｌｙ１（N-glycanase 1），Ｆｕｃａ１（fucosidase,alpha-L-1,tissue），Ｏｘｃｔ１（3-oxoacid CoA transferase 1），Ｎｉｔ２（nitrilase family,member 2），Ｌｏｘｌ１（lysyl oxidase-like 1），Ｍａｎ１ｃ１（mannosidase,alpha,class 1C,member 1），Ｃｒａｂｐ２（cellular retinoic acid binding protein II），Ｃｔｂｓ（chitobiase,di-N-acetyl-），Ｇｓｔａ４（glutathione S-transferase,alpha 4），Ｇｓｔｍ２（glutathione S-transferase,mu 2），Ｈｄｈｄ２（haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 2），Ｓｇｓｈ（N-sulfoglucosamine sulfohydrolase［sulfamidase］），Ｈｙｉ（hydroxypyruvate isomerase homolog［E.coli］），Ｖａｓｎ（vasorin），Ｔｆｒｃ（transferrin receptor），Ｌｃｎ２（lipocalin 2），Ａｐ１ｍ１（adaptor-related protein complex AP-1,mu subunit 1），Ｃ１ｑｔｎｆ６（C1q and tumor necrosis factor related protein 6），Ｖｐｓ２６ｂ（vacuolar protein sorting 26 homolog B［yeast］），Ｓｅｃ２４ｄ（SEC24 related gene family,member D［S.cerevisiae］），Ｓｌｃ４４ａ２（solute carrier family 44,member 2），Ｃｄ１４（CD14 antigen），Ａｎｐｅｐ（alanyl［membrane］aminopeptidase；ＣＤ１３），Ｆｋｂｐ９（FK506 binding protein 9），Ａｌｃａｍ（activated leukocyte cell adhesion molecule)，Ｃ３（complement component 3），ＴｎＣ（tenascin C），Ｎｕｄｃ（nuclear distribution gene C homolog［Aspergillus］），Ｓｅｍａ４ｂ（sema domain,immunoglobulin domain［Ｉｇ］,transmembrane domain［ＴＭ］and short cytoplasmic domain，［semaphorin］4B），Ａｇｒｉｎ，Ｐｌｘｎｂ２（plexin B2），１１１０００７Ｌ １５Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 1110007L15 gene），２７０００８５Ｅ ０５Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 2700085E05 gene），３１１０００３Ａ １７Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 3110003A17 gene），４９３１４０６Ｃ ０７Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 4931406C07 gene），６５３０４０１Ｎ ０４Ｒｉｋ（RIKEN cDNA 6530401N04 gene），ＥＧ５４５０９（predicted gene，EG545091）
のうち少なくとも１つより選択されるタンパク質の発現レベル、好ましくはアポトーシス誘導因子（ＡＩＦ）の、骨形成タンパク質−１（ＢＭＰ−１）、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ（ＴｎＣ）、アグリンのうち少なくとも１つ、中でもＴｎＣからなる虚血マーカータンパク質のタンパク質量を測定することを特徴とする、虚血状態の検出方法を提供する。組織が虚血−再灌流刺激を受けた際、それに対する応答としてこれまでに知られていなかった種々のタンパク質が細胞外・組織外に放出されることが、本発明者による培養心筋細胞での虚血／非虚血時発現タンパク質の網羅的解析から明らかとなった（図１）。これらのタンパク質を既存のデータベースと比較したところ、これまでに虚血マーカーとして報告のあるタンパク質とは異なり、アポトーシス、炎症反応、血管新生、細胞増殖、細胞接着や神経細胞再生などに関連する様々な機能を持ったタンパク質が特異的に発現していることが明らかとなった。虚血と結びついたそれぞれの反応において特異的に組織外に放出されるこれらのタンパク質の発現レベル、好ましくはこれらのタンパク質の試料中に含まれる量を測定することにより、虚血マーカーとして利用可能である。上記のマーカーは、これまでに機能が明らかにされてきたものの虚血との関連については明らかではないが、虚血後の再潅流時に放出されるものである。哺乳動物組織から採集される試料の種類、その採集方法、マーカータンパク質の検出方法などは当該分野で利用されるもののうちから適宜選択すればよいが、一般に再灌流後の血液を試料として採取するのが好ましい。また検出方法は何ら本発明を限定するものではないが、例えばヒト血液試料を採取し、血清中に含まれるタンパク質に対して上記マーカーに対する特異的抗体を用いたイムノアッセイ（簡便には蛍光イムノアッセイなど）やウェスタンブロッティングを行い、マーカータンパク質の存在を検出するといった方法があげられる。
【００１８】
上記マーカーのうち、従来アポトーシス誘導に係るタンパク質として知られていたＡＩＦは、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＡＩＦ（またはProgrammed cell death 8）には、ＡＩＦそのものの他、そのプリカーサーまたはアイソフォームといった、ＡＩＦとアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であってもアポトーシス誘導という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００１９】
上記マーカーのうち、従来骨細胞増殖に係るタンパク質として知られていたＢＭＰ−１は、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＢＭＰ−１（またはProcollagen C proteinase）には、そのプリカーサーまたはアイソフォーム、ＢＭＰ、ＢＭＰ１−５、ＢＭＰ１−６、Ｔｏｌｌｏｉｄ−ｌｉｋｅタンパク質、そのプリカーサーまたはアイソフォーム、Ｔｏｌｌｏｉｄ−ｌｉｋｅ１、Ｔｏｌｌｏｉｄ−ｌｉｋｅ２などといった、ＢＭＰ−１とアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても骨細胞増殖という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。従来技術欄でも述べた通り、ＢＭＰ−１は心筋細胞に対するホルモン様作用が知られていたが、虚血時に虚血組織から放出されるという現象はまったく知られておらず、虚血マーカーとしてのＢＭＰ−１は新規なマーカーである。
【００２０】
上記マーカーのうち、血管新生に係るタンパク質として知られていたＣＤ１３は、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＣＤ１３（またはAmino peptidase N）には、そのプリカーサーまたはアイソフォーム、Amino peptidase A、Laeverin、ＴＲＨ−ＤＥ（Thyrotropin-releasing hormone degrading enzyme）などといった、ＣＤ１３とアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても血管新生という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２１】
上記マーカーのうち、炎症反応に係るタンパク質として知られていたＣＤ１４は、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうＣＤ１４には、そのプリカーサーまたはアイソフォームなどといった、ＣＤ１４とアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても炎症反応という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２２】
上記マーカーのうち、細胞増殖に係るタンパク質として知られていたテネイシンＣは、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうテネイシンＣには、テネイシン、そのプリカーサー、サイトタクチン（Cytotactin）及びそのプリカーサー、テネイシンＸＢ、テネイシンＸ及びそのプリカーサー、テネイシンＲ、テネイシンＮなど、テネイシンＣとアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても細胞増殖という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２３】
上記マーカーのうち、神経細胞再生に係るタンパク質として知られていたアグリンは、新規な虚血マーカーとして特に適している。ここでいうアグリンとは、アグリンのプリカーサーまたはアイソフォーム、Ｐｅｒｌｅｃａｎ（Heparan sulfate proteoglycan）１、２、またはそのアイソフォームなど、アグリンとアミノ酸配列の相同性が高いタンパク質、好ましくは８０％以上の相同性を持つタンパク質や、また８０％以下の相同性であっても細胞増殖という機能的な相同性を持ちかつ５０％程度の相同性を持つ哺乳動物のタンパク質群、更に好ましくはヒトでその存在が確認されているタンパク質群を含んでも良い。
【００２４】
本発明の虚血状態検出方法を適用する試料としては、虚血が疑われる組織から放出されるマーカーを含む体液であればどの様なものでも良く、その種類が本発明を限定するものではないが、採集の容易さや既存のマーカーとの比較に供することの容易性の観点、及び疾患の早期発見のため臨床現場で用いられることが想定されることから、ヒト血液、特に血球成分を予め除いたヒト血清が好ましい。試料の採集方法や保存方法などについては、タンパク質である上記マーカーが分解されない条件を満たせば、臨床の現場等で用いられている手法を適宜応用すれば良く、これらが本発明を限定するものではない。
【００２５】
本発明におけるマーカータンパク質の発現レベルの測定手法に関しては、タンパク質の定性／定量的測定方法として用いられている手法を適宜応用すれば良く、本発明を限定するものではないが、プロトコルが確立され、また検出感度にすぐれた抗原抗体反応、すなわち前記マーカータンパク質に対する特異的抗体を用いた検出方法が好適である。前記の特異的抗体を１次抗体として例えばメンブレン転写やフローインジェクション法を用いて試料中のタンパク質に反応させ、これの検出系としては１次抗体を直接標識する方法の他、２次抗体や抗体と反応する試薬を用いた発光、発色による検出などを適宜利用すればよい。
【００２６】
本発明におけるマーカータンパク質の発現レベルを解析するに際し、より正確な虚血状態の検出のためには非虚血状態の試料、好適には非虚血状態のヒト血清中に含まれる前記マーカータンパク質の発現レベルを予め測定しておき、これと虚血が疑われる状態の試料中での同マーカータンパク質の発現レベルとを比較することが有効である。この際には、例えば多人数より採取した試料中における非虚血状態のヒトマーカー発現量を測定しこの平均値を標準としておき、これに対して虚血が疑われる試料中のマーカータンパク量を比較等すれば良い。比較工程においては、例えばマーカーの発現量を示す発色・発光を目視にて定性的に比較する他、画像処理技術などを用いて定量的・半定量的に両者の発現量を比較する方法など、分子生物学分野で採用されている比較手法を適宜用いれば良く、比較方法そのものが本発明を限定するものではない。
【００２７】
本発明の虚血マーカー及びこれを用いた虚血状態の検出方法は、哺乳動物組織における虚血状態を検出する方法として広く利用可能であると考えられるが、臨床的な必要性の高い心臓虚血が主たる対象疾患である。以下に本発明の実施例を示すが、本発明は実施例にのみ限定されるものではない。
【実施例】
【００２８】
（心筋細胞の培養）本実施例に係る心筋細胞の培養、及び虚血−再灌流刺激の与え方については、非特許文献１６に記載の方法に従った。具体的には、ラット胎児心臓由来の培養細胞株であるＨ９ｃ２細胞を１００−ｍｍ培養プレートに５×１０４細胞の密度で蒔き、１０％ウシ胎児血清を含むDulbecco’s modified Eagle medium（ＤＭＥＭ）で７２時間培養した。その後細胞を無血清ＤＭＥＭ培地に移し、６０−７２時間培養した。虚血刺激を与えるために、細胞をSlightly hypotonic Hank’s balanced saline solution（１．３ｍＭ ＣａＣｌ２，５ｍＭ ＫＣｌ，０．３ｍＭ ＫＨ２ＰＯ４，０．５ｍＭ ＭｇＣｌ２，０．４ｍＭ ＭｇＳＯ４，６９ｍＭ ＮａＣｌ，４ｍＭ ＮａＨＣＯ３，０．３ｍＭ Ｎａ２ＨＰＯ４，glucose or serum free）中で２時間、３７℃にてインキュベートした。インキュベーター中の酸素を窒素で置き換えることで虚血状態とし、このときの酸素濃度は１％であった。虚血刺激後、細胞を無血清ＤＭＥＭ培地に移し、酸素濃度２０％、二酸化炭素濃度５％の通常の培養条件に戻して、３７℃にてインキュベートし再灌流状態とした。
【００２９】
（ＩＨ／Ｒ刺激により分泌されるタンパク質の精製）２時間の虚血刺激を与えたＨ９ｃ２細胞を２４時間再灌流し、細胞培養液の上清１Ｌ（リットル）を試料としてプロテオーム解析用に供した。試料を５ｍｌ ＨｉＴｒａｐ陰イオン交換カラム（GE HealthCare，ＵＳＡ）にかけ、カラムにトラップされたタンパク質を５００ｍＭ ＮａＣｌで１ｍｌ／分の流速にて溶出させた。溶出した分画を、遠心フィルターカラム（MILLIPORE，ＵＳＡ）を通して脱塩及び濃縮した。
【００３０】
（トリプシンによるタンパク質のゲル中分解）濃縮した試料をＳＤＳ−ＰＡＧＥにかけ、泳動後のゲルをＣＢＢで染色した。ＩＨ／Ｒ試料と対照試料を泳動したレーンをそれぞれゲルから切り出し、各レーンを均等にスライスして２４個の断片とした。更にこの断片を細かく刻み、２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３を含む３０％アセトニトリルで脱染色した。脱染色したゲル細断片を１００％アセトニトリルで脱水し、その後室温にて３０分間乾燥させた。ゲル中に含まれるタンパク質を、１０ｍＭジチオトレイトール／２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３を用い５６℃で１時間還元処理し、その後５５ｍＭ ヨードアセトアミド／２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３を用い室温・暗黒条件下でアルキル化した。処理後のゲルを５０％アセトニトリル／２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３２５ｍＭで３０分間×２回、１００％アセトニトリルで５分間×１回の計３回、脱水した。脱水したゲルを室温にて３０分間乾燥させ、トリプシン溶液（PROMEGA，１０ｎｇ／ｍｌ ｉｎ２５ｍＭ（ＮＨ４）２ＣＯ３）で３０分間、氷上にて再膨潤させた。ゲル外の溶液を取り除き、ゲル中に含まれるタンパク質を３７℃に一晩おいて分解した。分解産物であるペプチドを５０％アセトニトリル／０．１％ トリフルオロ酢酸で３０分×２回、抽出し、抽出物を吸引乾燥して質量分析用に０．１％ギ酸に溶解させた。図２に、培養心筋細胞を用い虚血（ＩＨ／Ｒ）／非虚血（Control）時に放出されるタンパク質を質量分析にかけるまでの上記手順を模式化して示した。
【００３１】
（ペプチド断片の質量分析）トリプシン処理によって得られたペプチド断片を、Ｑ−Ｔｏｆ２（MICROMASS，ＵＫ）を用いその用法に従ってＬＣ−ＭＳ／ＭＳを用いた質量分析に供した。ＬＣカラムはＰｅｐＭａｐ Ｃ１８カラム（LC PACKINGS，HOL）を用い、ＭＳ／ＭＳ分析にはMassLynx，ProteinLynx（MICROMASS）の各ソフトウェアを用いて解析を行った。ペプチド断片の配列データをＮＣＢＩデータベースのデータと比較し、タンパク質を同定するため、Ｍａｓｃｏｔ ＭＳ／ＭＳ Ions Search（MATRIX SCIENCE）を用いた。こうして得られたペプチド断片から推定される発現タンパク質のプロファイルを、虚血−再灌流刺激あり、刺激無しのそれぞれについて比較した。表１はその結果から一部分を抜粋したものであり、表中ＮＣＢＩ ＩＤはペプチド断片の配列から推測されるタンパク質のＮＣＢＩデータベースでの対応物を、Ｇｅｎｅは遺伝子名を、Control Scoreは対照サンプル中の同遺伝子産物のＭａｓｃｏｔ ＭＳ／ＭＳ Ions Searchによる“確からしさ”の指標（値が大きいほど確からしく、同時に発現量の大小も反映している）を、ＩＨ／Ｒ scoreは虚血−再灌流刺激を与えたサンプル中での同遺伝子産物のスコアをそれぞれ表している。更に、個々のタンパク質はその発現量がそれぞれ異なっていることを考慮して、Control scoreとＩＨ／Ｒ scoreの比をRatio欄で示した。表１のうち、Ｎｏ．１−５の様に対照では発現が見られず虚血−再灌流刺激時にのみ特異的に現れるもの、Ｎｏ．６−１０の様に虚血−再灌流刺激時に発現量が増大するもの、Ｎｏ．１１−１５の様に刺激前後で発現量に変化が見られないもの、Ｎｏ．１６−２０の様に虚血−再灌流刺激時に発現量が減少するものがそれぞれ確認された。虚血−再灌流刺激時に特異的に発現するタンパク質のうちには、過去に虚血マーカーとして報告のあるミオシン等が含まれており、今回の発現解析が有効であることが示された。
【００３２】
【表１】
【００３３】
上記結果のうち、虚血マーカーとしては虚血−再灌流刺激時に特異的に発現するものが最も望ましいと考えられた。網羅的な比較分析の結果、１０９種類のＩＨ／Ｒ特異的発現タンパク質が同定された（表２）。表中ＮＣＢＩ ＩＤはペプチド断片の配列から推測されるタンパク質のＮＣＢＩデータベースでの対応物を、ＭＷは分子量を、Official symbolは正式略称を、Official nameは遺伝子産物の正式名を、Scoreは虚血−再潅流時のＭａｓｃｏｔスコアを、Localizationはこれまでに報告のあるそれぞれのタンパク質の細胞内での局在を、Functionはこれまでに報告のあるそれぞれのタンパク質の機能を表している。すなわち表２に記載されたタンパク質のうち、これまでに虚血マーカーとして報告のあるものを除いたタンパク質群は、虚血マーカー、好ましくは心臓虚血のマーカーとして利用可能なタンパク質である。この中には、アポトーシス関連タンパク質群、シグナル伝達系タンパク質群、成長因子及びその関連タンパク質群、プロテアーゼ、細胞接着因子、シャペロン、代謝酵素、リンパ細胞シグナルタンパク質群、神経細胞成長関連タンパク質群、トランスポーター、細胞骨格タンパク質、転写制御因子、コートマータンパク質などが含まれていた。下記表７に、それらのうち代表的なものを示す。
【００３４】
【表２】
【００３５】
【表３】
【００３６】
【表４】
【００３７】
【表５】
【００３８】
【表６】
【００３９】
【表７】
【００４０】
（イムノブロッティング）データベースとの比較から同定された１０９種類のタンパク質のうち、アポトーシス、炎症反応、細胞接着、細胞増殖、神経細胞成長、血管新生、とそれぞれ異なった機能を有するタンパク質であると推測された６種類のタンパク質、すなわちＡＩＦ、ＢＭＰ−１、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ、アグリンについて、培養細胞系における虚血−再灌流刺激前後のタンパク質発現量の比較、及び人工心肺による心臓手術を受ける患者さん（一時的に心臓本体は虚血状態になる）の血液中における発現の検証として、培養細胞上清及び血液からの試料調整とその試料を用いた電気泳動、並びにイムノブロッティングを行った。培養細胞系における虚血−再灌流刺激前後のタンパク質発現量の比較には、発現亢進がみられたＡＩＦとＢＭＰ−１の他、表１にあげたタンパク質のうち刺激前後で発現量が同等と推測されたストレス応答タンパク質の一種ＨＳＰ９０、及び刺激後に発現量が減少すると推測されたα−エノラーゼについても、検出の有効性を確認するために検証した。血液試料の採取は山口大学病院にて人工心肺を用いた開胸手術を受ける５４−７５歳の患者さん６名につき、インフォームドコンセント及び関連法令・規則に則って、血清中のＡＩＦ、ＢＭＰ−１、ＣＤ１３、ＣＤ１４、テネイシンＣ、アグリンの発現量を手術前後で比較した。採取した試料（血清）はLysis buffer［１％ ＴｒｉｔｏｎＸ−１００，２０ｍＭ Ｔｒｉｓ（ｐＨ７．５），１５０ｍＭ ＮａＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ，２．５ｍＭ ピロリン酸Ｎａ，１ｍＭ β−グリセロールリン酸，１ｍＭ オルソバナジウム酸Ｎａ，１μｇ／ｍｌ ロイペプチン，１ｍＭ フェニルメタンスルホニルフルオライド］で溶解し、溶液を１０％ポリアクリルアミドゲル電気泳動にかけ、泳動物をニトロセルロース膜に転写した。転写後に膜を５％脱脂粉乳または１０％ＢＳＡ（Bovine serum albumin）／０．０５％（ｗ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０含有ＴＢＳ bufferでブロッキングし、上記の各タンパク質に対する特異的抗体を反応させ、結合しなかった抗体を洗い流した後に蛍光試薬で標的タンパク質の存在を定量的に可視化した。抗アグリン抗体、抗テネイシンＣ抗体、抗ＢＭＰ−１抗体、抗ＣＤ１３抗体、抗ＣＤ１４抗体、抗ＡＩＦ抗体及び抗ＨＳＰ９０抗体、抗α−エノラーゼ抗体はそれぞれSANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY（ＵＳＡ）から購入したものを用い、抗原抗体反応は用法に従って行った。
【００４１】
培養細胞系における虚血−再灌流刺激前後のタンパク質発現量の比較を目的としたイムノブロッティングの結果を、図３に示す。図３ＡはＡＩＦ、ＢはＢＭＰ−１、ＣはＨＳＰ９０、Ｄはα−エノラーゼの結果を示し、ＩＨ／Ｒ ０，２，・・・の数字はそれぞれ虚血−再灌流刺激後の経過時間（０は刺激無し）を表している。ＡＩＦ（Ａ）の発現量は、虚血刺激を与える前にはほとんどみられないのに対して、刺激を与えた２時間後には急激に増加し、２４時間後にもこの増加は継続、４８時間後にはやや減少するという傾向が見られた。ＢＭＰ−１（Ｂ）についても、刺激前には発現がみられず、刺激後２時間後にもそれほど増加はみられないが、２４時間後には明瞭な発現の亢進が観察された。ＨＳＰ９０（Ｃ）については、虚血刺激前に一定量の発現があり、刺激後２時間では一時的に発現量が減少するものの２４時間後には刺激前と同程度にまで発現量が回復しており、０時間と２４時間後の比較では発現量が同等という先の推測が裏付けられた。反対にα−エノラーゼ（Ｄ）では、刺激前に発現が観察されたが刺激後２時間でその発現が消失し、２４−４８時間後にわずかな回復がみられるもののその発現量は刺激前に比べてはるかに減少しており、こちらも上記の推測を裏付ける結果となった。虚血−再灌流刺激後に発現の亢進するタンパク質、同等なタンパク質、減少するタンパク質それぞれについて、網羅的なリストアップと個々のタンパク質に対するイムノブロットの結果が一致したことから、本発明の網羅的解析で得られたマーカー候補となるタンパク質の情報が有効であることが確認された。
【００４２】
人工心肺による心臓手術時（一時的虚血状態）の血液中における各マーカータンパク質の発現の比較結果を、図４に示す。図４ＡはＡＩＦ、ＢはＢＭＰ−１、ＣはＣＤ１３、ＤはＣＤ１４、ＥはテネイシンＣ、Ｆはアグリンの発現量を、蛍光の強度（結合した抗体量＝標的のタンパク質量を反映）でそれぞれ表したものであり、またＢＳ（Before Surgery）は手術前に採集した試料、ＤＳ（During Surgery）は手術中に採集した試料、０，３，・・・は手術後の各時間における試料をそれぞれ表している。Ａ−Ｆは代表的なもの１例を挙げたが、６例いずれも同様の傾向を示した。ＡＩＦ、ＢＭＰ−１、ＣＤ１３、テネイシンＣ及びアグリンでは、手術前にはほとんど発現がみられないのと比較して、手術後２４−４８時間で血清中に含まれる各タンパク質量が増加することがイムノブロッティングの結果より示された（図中▼で示す）。ＣＤ１４については、手術前・手術中の血清に既に放出されていたが、手術後にその発現量が増大することが示された。培養細胞系での結果と臨床検体での結果に良い一致が見られたことから、本発明におけるマーカータンパク質は、虚血マーカー、好ましくは心臓虚血マーカーとしてきわめて有効であることが示された。
【産業上の利用可能性】
【００４３】
本発明は、虚血マーカー、虚血の検査の分野などに好適に利用することができる。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物から採取した試料中に含まれるテネイシンＣ（ＴｎＣ）のタンパク質量を測定することを特徴とする、哺乳動物組織における虚血状態の検出方法。
【請求項１】
哺乳動物から採取した試料中に含まれるテネイシンＣ（ＴｎＣ）のタンパク質量を測定することを特徴とする、哺乳動物組織における虚血状態の検出方法。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図２】
【図３】
【図４】
【公開番号】特開２０１１−２４２４０２（Ｐ２０１１−２４２４０２Ａ）
【公開日】平成２３年１２月１日（２０１１．１２．１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１１−１７０２３７（Ｐ２０１１−１７０２３７）
【出願日】平成２３年８月３日（２０１１．８．３）
【分割の表示】特願２００７−１６７７６１（Ｐ２００７−１６７７６１）の分割
【原出願日】平成１９年６月２６日（２００７．６．２６）
【出願人】（３０４０２０１７７）国立大学法人山口大学 (579)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２３年１２月１日（２０１１．１２．１）
【国際特許分類】
【出願日】平成２３年８月３日（２０１１．８．３）
【分割の表示】特願２００７−１６７７６１（Ｐ２００７−１６７７６１）の分割
【原出願日】平成１９年６月２６日（２００７．６．２６）
【出願人】（３０４０２０１７７）国立大学法人山口大学 (579)
【Ｆターム（参考）】
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