標的ポリヌクレオチド中のタンデムリピートの数を決定するための方法であって、(a)標的ポリヌクレオチド中のタンデムリピートの1個または複数が一本鎖形態である標的ポリヌクレオチドを含有する試料を提供するステップ、(b)標識プローブオリゴヌクレオチドを標的ポリヌクレオチドの一本鎖部分にハイブリダイズするステップであって、標的ポリヌクレオチドの一本鎖部分中について、プローブオリゴヌクレオチドが前記タンデムリピートの少なくとも1個に相補的であり、かつプローブオリゴヌクレオチドの少なくとも5個のヌクレオチドが前記タンデムリピートに相補的であるステップ、および(c)プローブオリゴヌクレオチドの標的ポリヌクレオチドの一本鎖部分へのハイブリダイゼーションに基づいて標的ポリヌクレオチド中のタンデムリピートの数を決定するステップを含む方法。
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二次構造を実質的に有さず、ヌクレオチド残基から形成され、2つ以上の内部ヌクレオチド残基が結合するクエンチャーなしに蛍光体で標識されている一本鎖オリゴヌクレオチド。典型的には蛍光体で標識されたヌクレオチド残基の少なくとも2つは少なくとも2つの未標識ヌクレオチド残基で分離されている。このオリゴヌクレオチドは、標的ポリヌクレオチド配列の研究に有用である。
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