核酸マイクロアレイの作製用設計配列を作る方法が記載される。本方法は、組織試料又は罹患状態の転写産物のハイスループット３’シークエンシングを使用して核酸マイクロアレイ用のプローブを設計する。また、組織中の転写産物の最３’側末端を標的とするプローブを有する核酸マイクロアレイも記載される。こうしたマイクロアレイは、好ましくは、転写産物が由来する組織に特異的な選択的ポリアデニル化配列を表す。また、組織における遺伝子発現について、偽陽性及び偽陰性結果を低減して評価するための、転写産物の最３’側末端を標的とするマイクロアレイの使用方法も記載される。 （もっと読む）

患部組織のトランスクリプトームを有するアレイならびにそのアレイを疾患の診断、予後、スクリーニング、および同定に使用する方法が本明細書に提供される。患部組織由来のトランスクリプトームアレイは、疾患状態に特異的な組織試料の遺伝子プロファイルの分析による疾患の診断に有用である。次に、この遺伝子プロファイルを、特異的治療剤の有効性に関するデータと相関させる。治療剤の有効性に対して発現プロファイルを相関させることは、それらの治療剤に反応すると予測されるさらなる患者をスクリーニングおよび選択する方法を提供することによって、無効の治療法に不必要にさらすことを最小にする。 （もっと読む）