【課題】ＭＨＣクラスＩに対して高親和性を有し、かつ標的特異的プロテアソームにより産生されるエピトープで、免疫学的試薬の生成に有用である核酸、ポリペプチドを提供する。
【解決手段】腫瘍関連抗原ＰＲＡＭＥの１つ以上のセグメント配列をコードし、それぞれのセグメントがエピトープクラスターを有し、前記クラスターは同じＭＨＣ受容体ペプチド結合間隙と既知のまたは予測親和性を有する少なくとも２つのアミノ酸配列を有するかまたはコードし、前記配列を含むリーディングフレームは、プロモーターとその制御下で連結する、単離された核酸。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１の配列を含むリーディングフレームを有する単離された核酸であって、
前記第１の配列は腫瘍関連抗原ＰＲＡＭＥ（配列番号：７７）の１つ以上のセグメントをコードし、
前記第１の配列は完全なＰＲＡＭＥ抗原をコードせず、それぞれのセグメントがエピトープクラスターを有し、前記クラスターは、同じＭＨＣ受容体ペプチド結合間隙と既知のまたは予測親和性を有する少なくとも２つのアミノ酸配列を有するか、またはコードし、
前記リーディングフレームは、プロモーターとその制御下で連結することを特徴とする単離された核酸。
【請求項２】
前記エピトープクラスターは次のアミノ酸からなるグループから選択されることを特徴とする、請求項１に記載の核酸；
配列番号４に記載のＰＲＡＭＥの１８−５９、３３−４７、７１−８１、７８−１１５、９９−１０８、１２６−１３５、２２２−２３８、２２４−２４６、２９０−３０３、３０５−３２４、３４３−３６３、３６４−４４７、３９４−４０９、４２２−４４３及び４５９−４８７塩基。
【請求項３】
前記１つ以上のセグメントが前記エピトープクラスターからなることを特徴とする、請求項１又は２に記載の核酸。
【請求項４】
前記第１の配列がＰＲＡＭＥのフラグメントをコードすることを特徴とする、請求項１〜３のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項５】
前記コードされたフラグメントが、ＰＲＡＭＥの長さの９０％以下長さのポリペプチドからなることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項６】
前記コードされたフラグメントが、ＰＲＡＭＥの長さの８０％以下長さのポリペプチドからなることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項７】
前記コードされたフラグメントが、ＰＲＡＭＥの長さの６０％以下長さのポリペプチドからなることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項８】
前記コードされたフラグメントが、ＰＲＡＭＥの長さの５０％以下長さのポリペプチドからなることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項９】
前記コードされたフラグメントが、ＰＲＡＭＥの長さの２５％以下長さのポリペプチドからなることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項１０】
前記コードされたフラグメントが、ＰＲＡＭＥの長さの１０％以下長さのポリペプチドからなることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項１１】
前記コードされたフラグメントが、基本的に、ＰＲＡＭＥの１８、３３、７１、７８、９９、１２６、２２２、２２４、２９０、３０５、３４３、３６４、３９４、４２２及び４５９からなる群から選択されるアミノ酸の一つから始まり、ＰＲＡＭＥの４７、５９、８１、１０８、１１５、１３５、２３８、２４６、３０３、３２４、３６３、４０９、４４３、４４７及び４８７からなる群から選択されるアミノ酸の一つで終わるアミノ酸配列からなるフラグメントをコードすることを特徴とする、請求項４に記載の核酸。
【請求項１２】
前記コードされたフラグメントが、基本的に、ＰＲＡＭＥの１８−４７、１８−５９、
１８−８１、１８−１０８、１８−１１５、１８−１３５、１８−２３８、１８−２４６、１８−３０３、１８−３２４、１８−３６３、１８−４０９、１８−４４３、１８−４４７、１８−４８７、３３−４７、３３−５９、３３−８１、３３−１０８、３３−１１５、３３−１３５、３３−２３８、３３−２４６、３３−３０３、３３−３２４、３３−３６３、３３−４０９、３３−４４３、３３−４４７、３３−４８７、７１−８１、７１−１０８、７１−１１５、７１−１３５、７１−２３８、７１−２４６、７１−３０３、７１−３２４、７１−３６３、７１−４０９、７１−４４３、７１−４４７、７１−４８７、７８−１０８、７８−１１５、７８−１３５、７８−２３８、７８−２４６、７８−３０３、７８−３２４、７８−３６３、７８−４０９、７８−４４３、７８−４４７、７８−４８７、９９−１０８、９９−１１５、９９−１３５、９９−２３８、９９−２４６、９９−３０３、９９−３２４、９９−３６３、９９−４０９、９９−４４３、９９−４４７、９９−４８７、１２６−１３５、１２６−２３８、１２６−２４６、１２６−３０３、１２６−３２４、１２６−３６３、１２６−４０９、１２６−４４３、１２６−４４７、１２６−４８７、２２２−２３８、２２２−２４６、２２２−３０３、２２２−３２４、２２２−３６３、２２２−４０９、２２２−４４３、２２２−４４７、２２２−４８７、２２４−２３８、２２４−２４６、２２４−３０３、２２４−３２４、２２４−３６３、２２４−４０９、２２４−４４３、２２４−４４７、２２４−４８７、２９０−３０３、２９０−３２４、２９０−３６３、２９０−４０９、２９０−４４３、２９０−４４７、２９０−４８７、３０５−３２４、３０５−３６３、３０５−４０９、３０５−４４３、３０５−４４７、３０５−４８７、３４３−３６３、３４３−４０９、３４３−４４３、３４３−４４７、３４３−４８７、３６４−４０９、３６４−４４３、３６４−４４７、３６４−４８７、３９４−４０９、３９４−４４３、３９４−４４７、３９４−４８７、４２２−４４３、４２２−４４７、４２２−４８７又は４５９−４８７からなることを特徴とする請求項１１に記載の核酸。
【請求項１３】
更に第２の配列を含むことを特徴とする請求項１〜１０のいずれか１項に記載の核酸であって、前記第２の配列が、成熟したエピトープ、または１〜数個の更なるアミノ酸が隣接し、ハウスキーピングエピトープが免疫プロテアソームプロセッシングにより直接的にまたはＮ−末端トリミングとの組み合わせ若しくは外因性の酵素活性との組み合わせにより遊離するハウスキーピングエピトープをコードする核酸。
【請求項１４】
前記第１及び第２の配列が単一のリーディングフレームを構成することを特徴とする、請求項１３に記載の核酸。
【請求項１５】
前記リーディングフレームがプロモーターとその制御下で連結することを特徴とする、請求項１４に記載の核酸。
【請求項１６】
請求項１４または１５に記載の前記リーディングフレームにおいてコードされるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１３〜１５のいずれか１項に記載の核酸を含む免疫原性組成物。
【請求項１８】
請求項１６に記載のポリペプチドを含む免疫原性組成物。
【請求項１９】
前記リーディングフレームが更に、エピトープまたはエピトープ配列から本質的になるポリペプチド配列をコードする第２の配列を有することを特徴とする、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項２０】
少なくとも１つのＰＲＡＭＥエピトープクラスターを有するアミノ酸配列をコードする手段にプロモーターの制御下で連結されたプロモーターを有する発現ベクターであって、
前記手段が完全なＰＲＡＭＥ抗原をコードしないものである発現ベクター。
【請求項２１】
前記ハウスキーピングエピトープが配列番号１〜５９９のいずれかで表されるポリペプチドであることを特徴とする、請求項１３〜１５のいずれか１項に記載の核酸。
【請求項２２】
ＭＨＣエピトープであり、ハウスキーピングプロテアソームが優勢に活性である細胞上に提示されるエピトープをコードする、設計されたまたは操作された核酸配列を更に有する請求項１〜１０のいずれか１項に記載の核酸であって、前記エピトープが、ｐＡＰＣにおけるプロセッシングによりエピトープが遊離し得る状態を提供するより大きな配列に組み込まれていることを特徴とする核酸。
【請求項２３】
前記エピトープが配列番号１〜５９９のいずれかで表されるポリペプチドであることを特徴とする、請求項２２に記載の核酸。
【請求項２４】
第１の配列を含むリーディングフレームを有する単離された核酸であって、
前記第１の配列は、腫瘍関連抗原ｇｐ１００（配列番号７０）の１つ以上のセグメントをコードし、
前記第１の配列は完全なｇｐ１００抗原をコードぜず、それぞれのセグメントがエピトープクラスターを有し、前記クラスターは、同じＭＨＣ受容体ペプチド結合間隙と既知のまたは予測親和性を有する少なくとも２つのアミノ酸配列を有するか、またはコードし、
前記リーディングフレームは、プロモーターとその制御下で連結することを特徴とする単離された核酸。
【請求項２５】
第１の配列を含むリーディングフレームを有する単離された核酸であって、
前記第１の配列は、腫瘍関連抗原ＰＳＡ（配列番号７８）の１つ以上のセグメントをコードし、
前記第１の配列は完全なＰＳＡ抗原をコードぜず、それぞれのセグメントがエピトープクラスターを有し、前記クラスターは、同じＭＨＣ受容体ペプチド結合間隙と既知のまたは予測親和性を有する少なくとも２つのアミノ酸配列を有するか、またはコードし、
前記リーディングフレームは、プロモーターとその制御下で連結することを特徴とする単離された核酸。

【図１Ａ】

【図１Ｂ】

【図１Ｃ】

【図２】

【図３Ａ】

【図３Ｂ】

【図３Ｃ】

【図４】

【図５】

【図６】

【図７Ａ】

【図７Ｂ】

【図７Ｃ】

【図８】

【図９】

【図１０】

【図１１】

【図１２】

【図１３】

【図１４】

【図１５】

【図１６】

【図１７】

【公開番号】特開２００９−６０９１０（Ｐ２００９−６０９１０Ａ）
【公開日】平成２１年３月２６日（２００９．３．２６）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−２５１４８２（Ｐ２００８−２５１４８２）
【出願日】平成２０年９月２９日（２００８．９．２９）
【分割の表示】特願２００２−５８００１０（Ｐ２００２−５８００１０）の分割
【原出願日】平成１４年４月４日（２００２．４．４）
【出願人】（５０３２０８５５２）マンカインド　コーポレイション (50)
【Ｆターム（参考）】