本発明は、癌を有する患者が長期または短期生存期間を示すと予想されるかどうかを判定するために使用できる予測マーカーの同定を対象とする。特に、本発明は、予測マーカーの発現が予想される短期または長期生存と相関する、特定の個別予測マーカーおよび／または予測マーカーの組合せの使用を対象とする。それ故、個別予測マーカーおよび／またはマーカーセットを含む予測マーカーの発現レベルを検査することにより、予測される患者の生存期間を判定することが可能である。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
癌を有する患者が、治療レジメンで治療されたとき短期生存または長期生存すると予測されるかどうかを判定するための方法であって、
ａ）患者の試料において予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを測定すること；
ｂ）該予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルが情報的発現レベルであるかどうかを判定するために、該予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを対照発現レベルと比較すること；および
ｃ）該予測マーカーまたは複数のマーカーが、表１および／または表２において同定される予測マーカーから選択され；および情報的発現レベルが、該患者が治療レジメンで治療されたとき短期生存者または長期生存者のいずれかであると予測されることを指示する、患者が短期生存者または長期生存者であると予測されるかどうかを判定すること
を含む、方法。
【請求項２】
前記患者の試料が腫瘍由来の細胞を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記腫瘍が、骨髄腫、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、ワルデンストレーム症候群、慢性リンパ性白血病および他の白血病から成る群より選択される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記治療レジメンが、プロテアソーム阻害治療またはグルココルチコイド治療である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記プロテアソーム阻害治療がボルテゾミブ治療である、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルがｍＲＮＡの検出によって測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルがタンパク質の検出によって測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記複数のマーカーが、表１および／または表２からの少なくとも５つの予測マーカーである、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記複数のマーカーが、表１および／または表２からの少なくとも２０の予測マーカーである、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記複数のマーカーが、表２からの少なくとも９５の予測マーカーである、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記情報的発現レベルが前記複数のマーカーの少なくとも５０％から組み合わされる、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
表１からの予測マーカーまたは複数のマーカーが各々、短期生存マーカーについては少なくとも１．３のハザード比、または長期生存マーカーについては０．８０以下のハザード比を有する、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
表２からの予測マーカーまたは複数のマーカーが各々、短期生存マーカーについては少なくとも２．２のＳｕｐｅｒＰＣスコア、または長期生存マーカーについては−２．３５以下のＳｕｐｅｒＰＣスコアを有する、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
表１および／または表２からの予測マーカーまたは複数のマーカーが生物学的カテゴリーに分類される、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
患者をプロテアソーム阻害剤で治療するかどうかを判定するための方法であって、該方法は、
ａ）患者の試料において予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを測定すること；
ｂ）該予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルが情報的発現レベルであるかどうかを判定するために、該予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを対照発現レベルと比較すること；
ｃ）該患者が、治療レジメンで治療されたとき短期生存者または長期生存者であると予測されるかどうかを判定すること；および
ｄ）該患者が長期生存者であると予測される場合、該患者をプロテアソーム阻害剤で治療することを決定すること
を含み、該予測マーカーまたは複数のマーカーが、表１および／または表２において同定される予測マーカーから選択され；および該情報的発現レベルが、該患者が短期生存者または長期生存者のいずれかであると予測されることを指示する、方法。
【請求項１６】
治療レジメンで治療されたときの患者の短期または長期生存を予測するための予測マーカーまたは予測マーカーセットを同定するための方法であって、
ａ）試料中で、表１および／または表２において同定される予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを測定すること；
ｂ）応答性または非応答性に関連する特徴を選択するために、各マーカーの発現レベルに統計解析を適用すること；および
ｃ）選択した特徴を含むマーカーまたはマーカーセットを同定すること
を含む、方法。
【請求項１７】
請求項１６において同定されるマーカーを検出するための試薬を含むキット。
【請求項１８】
患者において癌の治療を継続するかどうかを決定するための方法であって、該方法は、
ａ）治療の前に患者の試料において予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを測定すること；
ｂ）治療中の患者の試料において予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを測定すること；
ｃ）ａ）とｂ）の予測マーカーまたは複数のマーカーの発現のレベルを比較すること；および
ｄ）該比較が長期生存を予測する場合は治療を継続すること、または該比較が短期生存を予測する場合は治療を中止することを決定すること
を含み、該予測マーカーまたは複数のマーカーが、表１および／または表２において同定される予測マーカーから選択される、方法。
【請求項１９】
前記治療がボルテゾミブ治療である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
表１および／または表２からの少なくとも５つの予測マーカーを含む分類器。
【請求項２１】
請求項２０の分類器において予測マーカーの発現を評価するための試薬、および使用のための指示書を含むキット。
【請求項２２】
癌の治療のための代金を支払うかどうかを決定する方法であって、
ａ）該患者が、治療レジメンで治療されたとき短期生存または長期生存すると予測されるかどうかを請求項１の方法によって判定すること；および
ｄ）該患者が、該治療レジメンで治療されたとき長期生存者であると予測される場合に支払いを許可すること
を含む、方法。

【図１Ａ】

【図１Ｂ】

【図２Ａ】

【図２Ｂ】

【図３−１】

【図３−２】

【公表番号】特表２０１０−５００５６５（Ｐ２０１０−５００５６５Ａ）
【公表日】平成２２年１月７日（２０１０．１．７）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００９−５２３８４４（Ｐ２００９−５２３８４４）
【出願日】平成１９年８月９日（２００７．８．９）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００７／０１７７１６
【国際公開番号】ＷＯ２００８／０２１１８３
【国際公開日】平成２０年２月２１日（２００８．２．２１）
【出願人】（５００２８７６３９）ミレニアム・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド (98)
【氏名又は名称原語表記】ＭＩＬＬＥＮＮＩＵＭ　ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ，　ＩＮＣ．
【Ｆターム（参考）】