閉鎖コンテナ中においてサンプルを処理するためのシステムおよび方法、並びに関連装置
核酸および他のサンプルの自動処理のためのシステムおよび方法は、トレーと柔軟性のあるバリアを含んでなる使い捨てコンテナを保有する。該バリアはトレーのトップエッジで密封するように形成され、密封されたトレー内に閉鎖無菌作業エリアを設ける。ピペットヘッドおよび／または他のサンプル操作デバイスがバリアの内側に取り付けられ、バリアはロボットアームまたは他のデバイスのためのインターフェースを保有できる。バリアがトレーに密封されている場合、バリアはロボットまたは他の操作デバイスからトレーの内容物を分離する。バリアは柔軟性があり、ロボットアームによりトレーの作業エリア中くまなくピペットヘッドを動かすことができる。核酸サンプルを処理するための全サンプル、試薬、ピペットチップ、および他のツールまたはデバイスが、処理に際してコンテナにより設けられた閉鎖区画内に留められてもよい。
【発明の詳細な説明】
【関連出願】
【０００１】
この出願は２００６年１月１８日付で出願された米国仮出願第６０／７６０，０８７号に対する優先権の利益を主張しており、その内容はここですべて記述されるとして、引用することにより本明細書の開示の一部とされる。
【発明の背景】
【０００２】
発明の分野
本発明は、サンプルおよび物質の自動処理に関し、閉鎖環境において核酸を処理するために特に適している。
【０００３】
背景技術
核酸ベース増幅反応は、試験サンプルで病気の診断および／または病原生物の特定を補助するために、研究所および臨床検査室において広く用いられている。このような増幅反応は、例えば、患者自身の腫瘍細胞に由来する自己ワクチンを含めた、ワクチンの開発にも用いられる。腫瘍組織から単離された核酸の増幅によれば、小さな腫瘍からでも自己ワクチン生産を行え、したがって最小の全身腫瘍組織量(tumor burden)の患者も治療しうる機会を得られる。
【０００４】
一般的には、現在知られている増幅スキームは、変性温度、プライマーアニーリング温度、およびアンプリコン（核酸の酵素増幅の産物）合成温度間の温度の連続サイクリングにより酵素増幅反応が行なわれるか否か、または温度が酵素増幅工程（等温増幅）を通して一定に保たれるか否かに基づいて、概して二つのクラスに分類される。典型的なサイクリング核酸増幅技術（サーマルサイクリング）は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）およびリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）である。このような反応の具体的プロトコールは、例えばShort Protocols in Molecular Biology,2nd Edition,A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology,(Eds.Ausubel et al.,John Wiley & Sons,New York,1992)chapter 15において記載されている。等温反応としては、転写媒介増幅（ＴＭＡ）、核酸配列ベース増幅（ＮＡＳＢＡ）、および鎖置換増幅（ＳＤＡ）がある。
【０００５】
核酸増幅は、例えば米国特許第４，６８３，１９５号、第４，６８３，２０２号、第５，１３０，２３８号、第４，８７６，１８７号、第５，０３０，５５７号、第５，３９９，４９１号、第５，４０９，８１８号、第５，４８５，１８４号、第５，４０９，８１８号、第５，５５４，５１７号、第５，４３７，９９０号、および第５，５５４，５１６号において記載されている。これらの特許において記載された方法がクローニングを要することなく核酸の増幅および検出を行なえ、核酸配列の高感度アッセイに寄与していることは周知である。しかしながら、核酸増幅で可能な検出の感度とともに、極少量の望ましくない外来核酸配列による汚染の危険が極めて大きいことも、同様によく認識されている。増幅反応の有用性は、望ましくない外来核酸および他の汚染物の導入を制御する方法により高められる。
【０００６】
特に、例えば自家療法用のワクチンのような治療剤の生産を含めた、生物サンプルの処理のために、現行の適正製造基準（ＧＭＰ）は典型的には無菌環境で製造を要する。
【０００７】
したがって、核酸および他のサンプルを処理するための自動システムおよび方法を提供する必要性が当業界に存在する。
【発明の概要】
【０００８】
本発明の態様は、一以上のサンプルの自動処理のためのシステム、装置、および方法に関する。該システムは閉鎖環境において物品を操作するために用いられ、医学、診断、バイオテクノロジー、エレクトロニクス、およびナノテクノロジーの分野で特に有用である。本発明の態様は、組織、血液、血液製品、核酸（例えば、ＲＮＡ、ＤＮＡ）、タンパク質、細胞培養物などに限定されないが、それらを含めた生物サンプルの処理と特に関連している。
【０００９】
本発明の態様は、閉鎖コンテナにおいて一以上の物品を操作するための装置を提供する。ここでは“隔離コンテナ”とも称される該コンテナは、扱われるいくつかの物品を保持しうるように形成された内部チャンバーを形成するトレーと、内部エリアをカバーしてコンテナトレーで密封するように形成および寸法化された柔軟性のあるバリアとを含んでなる。内部エリア内において物品を操作するためのツールが、柔軟性のあるバリアに取り付けられているか、またはそれとともにもしくはその中に組み込まれる。
【００１０】
該ツールは、ロボットデバイスに取り付けられるよう構成された、バリアの外側から接近可能な第一インターフェースを有しうる。柔軟性のあるバリアがコンテナで密封された場合内部エリア内に配置されるように、該ツールはバリアの反対側から伸びる第二インターフェースも保有できる。ロボットデバイスが第一インターフェースに取り付けられた場合、該ツールはコンテナ内で物品を操作しうるように形成できる。一部の態様において、閉鎖コンテナ中、一以上の物品としては、例えば、核酸、他のサンプル、試薬、洗浄液、ピペットチップ、容器、他の消耗品、および／またはそれらの組合せがある。他のツールまたはデバイス、例えばコンテナ内においてサンプルまたは他の物品を処理、操作、測定、分析、サンプリング、および／または貯蔵するためのツールもしくはデバイスも、コンテナ内に配置してよい。
【００１１】
一部の態様において、核酸および他のサンプルの自動処理のためのシステムおよび方法は、トレーと、該トレーで密封するように形成された柔軟性のあるバリアとの一回用使い捨て隔離コンテナアセンブリーを保有し、それにより密封されたトレー内に閉鎖作業エリアを設ける。閉鎖作業エリアは無菌でもよい。
【００１２】
ピペットヘッドおよび／または他のサンプル操作デバイスが、バリアの内側に取り付けられ、そしてバリアは密封された作業エリア内で物品を操作するために用いられるロボットアームまたは他のデバイスのためのインターフェースを保有できる。バリアがトレーに密封されている場合、該バリアはロボットまたは他の操作デバイスからトレーの内容物を分離している。バリアは柔軟性があり、ロボットアームによりトレーの作業エリア中くまなくピペットヘッドまたは他のサンプル操作デバイスを動かせる。核酸サンプルを処理するための全サンプル、試薬、ピペットチップ、および他の消耗品、ツールもしくはデバイスが、処理に際して隔離コンテナにより設けられた閉鎖区画内に留められてもよい。
【００１３】
他の態様において、核酸（例えば、ＲＮＡおよび／またはＤＮＡ）を処理する方法は、例えばオペレーター、他の対象者、または外部環境から、対象物質を望ましくない生物物質において汚染の危険を減らすために、使い捨て（一回用）隔離コンテナを利用する。一部の態様において、隔離コンテナは、次のもの：腫瘍組織、血液、血液製品、細胞、病原体などのうち一種以上に限定されないが、それらを含めた生物サンプルからのＲＮＡ単離用に設計されている。具体的な態様において、生物サンプルは腫瘍ホモゲネートを含んでなり、システムは清澄化された腫瘍ホモゲネートをインビトロ転写（ＩＶＴ）ＲＮＡへ変換するためのすべての特徴および機能性を発揮する。
【００１４】
典型的には、隔離コンテナの内側のみが対象物質に暴露され、それにより処理システムで生じうる汚染を防ぎ、システムにより処理される連続対象サンプル間における洗浄の必要性を減らす。一部の態様において、処理システムは一つの隔離コンテナにおいて諸サンプルを一度に処理する。他の態様において、該システムは二以上の隔離コンテナにおいて諸サンプルを実質上同時に処理しうるように形成できる。
【００１５】
一部の態様において、本発明は、隔壁(diaphragm)によりサンプルデバイスから分離された、作業液および作業液ポンプを含んでなる、流体の移動用の装置を提供する。使用時、隔壁越しに伝えられる圧力の変化により、例えば作業液ポンプが作業液の圧力を変えた場合における隔壁の動きにより、サンプルまたは他の流体がサンプルデバイス中へ吸引またはそこから排出される。一つの態様において、サンプルデバイスは、流体サンプルを取込、分配、および／または混合するための、および／またはサンプル、試薬または他の流体をある箇所から他の箇所へ移動するためのピペットチップまたは他の管である。ピペットチップまたは管はいかなる適切な形状および大きさでもよい。
【００１６】
更に他の態様において、本発明は、少なくとも一つの光源またはエミッターと少なくとも一つのレシーバー（キュベットが流体を含有しているかまたは空であるかに応じてレシーバーが光路における変化を検出しうる光路で形成されたキュベット）およびキュベットから取り出された流体の容量を調べられるようにレシーバーと連絡した流体移動デバイスを含んでなる、流体の容量を測定するための装置を提供する。
【００１７】
他の態様は、生物サンプル処理コンテナに関する。該コンテナは、第一ワークステーションがサーマルブロック（例えば、シングル管、マルチウェルプレートまたはストリップ、ＰＣＲプレートなど）でインキュベート用の容器を保持するように形成され、第二ワークステーションが試薬を保持するように形成され、および第三ワークステーションがピペットを保持するように形成された、実質的に硬質のボディを有する一回用使い捨てトレーを含む。
【００１８】
一部の態様は、トレーに密封して、密封された閉鎖内部チャンバーを形成するように形状化された外部エッジ部分を有する、柔軟性のあるバリアに関する。該柔軟性のあるバリアはエラストマーを含有し、バリアの中央部分でロボットアームインターフェースに密封可能に取り付けられる。
【００１９】
更に他の態様は、自動ピペットチップ取外しシステムに関する。該システムは：（ａ）側壁を有するトレー、および（ｂ）トレー側壁と接触し、それにより該側壁との接触でレバーをピボットへ押しやり、操作ツールにより保持された各使用済みピペットチップを解放するように形成された、外方へ伸びるレバーを有する操作ツールと一体化したロボットアームを保有する。一部の態様において、トレーは操作ツールレバーと接触する傾斜側壁を有する。
【００２０】
一部の態様は、液体を処理するためのシステムに関する。該システムは：（ａ）ロボットアーム、および（ｂ）ロボットアームと協同する操作ツール（該ツールは、ピペットチップを解放可能に係合し、カバーの付いた穴あきオープニングの一つを介して容器から流体を取り出す前に、自動的に並進して異なる間隔の箇所で複数回にわたり容器のカバーを穴あけするように形成される）を含む。
【００２１】
他の態様は溶出トレーに関する。該トレーは、上方へ伸びるバリアの第一側面に複数およびバリアの反対側面に複数の、間隔をあけた複数の容器を有する無菌生体適合性溶出トレーである。該容器は、その各側面に伸びて主管状部分の方向で下方へテーパー化する、チャンネルを有する。
【００２２】
更に他の態様は、自動処理システムにおいて使用されるキットに関する。該キットは：（ａ）トレーとそれに密封可能に取り付けられるよう構成された柔軟性のあるバリアを含んでなる一回用使い捨てコンテナ、（ｂ）第一ワークステーションでコンテナに存在するように形成された一回用使い捨て試薬ラック、（ｃ）コンテナに存在するように形成された一回用使い捨て結合カラムマニホールド(manifold)、および（ｄ）コンテナに存在するように形成された一回用使い捨てピペットラックを保有する。
【００２３】
一部の態様は、液体を移動する方法に関する。該方法は：（ａ）ピペットチップを解放可能に保持するインターフェースツールを動かすために、ロボットアームをプログラムで指示し、（ｂ）ピペットチップを用いて複数回にわたり標的液体を保持する容器のシーリング材を自動的に穴あけし、次いで（ｃ）ピペットチップを用いて穴あきシーリング材付き容器から液体を自動的に取り出す、ことを含む。
【００２４】
一部の態様は、ピペットから液体を放出させる方法に関する。該方法は：（ａ）ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かし、閉鎖コンテナにおいて受容表面付近に先端を置いて下方角度方向にピペットを向けさせるために、ロボットアームをプログラムで指示し、（ｂ）次いで下方向き角度のピペットを平面に沿い実質上直線的に自動で動かしながら、ピペットから流動性物質を放出させる、ことを含む
【００２５】
更に他の態様は、液体をピペットに吸引する方法に関する。該方法は：（ａ）ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かして、閉鎖コンテナで標的流体を保持する容器を係合するために、ロボットアームをプログラムで指示し、次いで（ｂ）容器の内側でピペットを自動的に動かして容器において液体を混ぜ、次いで（ｃ）混ぜられた液体をピペットへ吸引する、ことを含む。
一部の態様において、該方法は液体を混ぜるために液体を吸引および分配することもできる（一回または多数回）。
【００２６】
更に他の態様は、閉鎖システムでサンプルを処理する自動化方法に関する。該方法は：（ａ）柔軟性のあるバリアを有する密封可能閉鎖コンテナにサンプルを用意し、および（ｂ）サンプルを処理するため閉鎖コンテナが密封されたままで、柔軟性のあるバリアと協同して、一連の作動により閉鎖コンテナの内側においてインターフェースツールを動かすために、ロボットアームをプログラムで指示する、ことを含む。
【００２７】
該方法は、場合により次のうち一以上を含んでもよい：（ｃ）増幅中に複数の時間でサンプルの容量および濃度を電子的かつ自動的に測定する、（ｄ）使用前、使用後、および／または使用中に閉鎖コンテナの密封の完全性を電子的かつ自動的に測定する、および（ｅ）閉鎖システムの密封された状態を毀損することなくアリコート容器で少なくとも一つの増幅ＲＮＡサンプルを捕捉する。
【００２８】
本発明の更に他の態様は、閉鎖コンテナで物品を操作するための装置に関する。該装置は：（ａ）操作対象となる複数の物品を保持しうるように形成された内部区域を有するコンテナ、および（ｂ）閉鎖ループでコンテナの内部区域内に密封された空気を循環させるように形成された再循環真空システム、を含む。
【００２９】
本発明の方法の態様に関して、ここでは一部の態様が記載されているが、本発明はシステムおよびコンピュータープログラム製品としても具体化できることが理解されるであろう。しかも、システム、装置、方法、またはコンピュータープログラムの請求項の一つの種類に関して請求項で記載されるいずれの特徴も、請求項で記載される作動または特徴のいずれか他の種類として請求項で記載または実施しうる、ことが注記される。
【００３０】
本発明の態様による他のシステム、方法、システム構成部品、および／またはコンピュータープログラム製品は、下記の図面および詳細な記載のレビューから当業者に明らかであるまたは明らかとなる。すべてのこのような追加のシステム、方法、および／またはコンピュータープログラム製品がこの記載の範囲内に含まれ、本発明の範囲内にあり、添付の請求項により保護される。
【発明の具体的説明】
【００３１】
本発明は修正および代替形態により実施してもよいが、その具体的な態様が図面において例示として示され、詳細に記載されている。しかしながら、本発明を開示された具体的な態様に限定されるものではなく、逆に本発明は本発明の精神および範囲内に属するすべての修正物、相当物、および代替物に及ぶと理解されるべきである。同一の参照番号は、図面の記載を通して、同一要素を表す。
【００３２】
図面において、ある線の太さ、層、構成部品、要素、または特徴は、明確化のために誇張されることがある。別記されない限り、破線は、任意の特徴、作動、または隠れた構成部品を表す。請求項において、記載された方法は、そこでそのように述べられていない限り、示された工程の順序に限定されない。
【００３３】
ここで用いられる技術は具体的な態様を記載する目的のためだけに用いられ、本発明を限定するものではない。ここで用いられているような単数形“ａ”、“ａｎ”、および“ｔｈｅ”は、内容が明らかにそれ以外を示すのでない限り、複数形も含む意味である。用語“含んでなる”は、この明細書で用いられている場合、記載された特徴、整数、工程、作動、要素、および／または構成部品の存在を表すが、一以上の他の特徴、整数、工程、作動、要素、構成部品、および／またはそのグループの存在または付加を除外するものではないことが、更に理解されるであろう。ここで用いられているような用語“および／または”は、関連掲載物品のいずれかおよびその一以上のすべての組合せを含む。ここで用いられている“Ｘ〜Ｙ”および“約Ｘ〜Ｙ”のような語句は、ＸおよびＹを含むと解釈されるべきである。ここで用いられている“約Ｘ〜Ｙ”および“約Ｘ〜約Ｙ”のような語句は、“約Ｘ〜約Ｙ”を意味する。ここで用いられている“約ＸからＹまで”のような語句は、“約Ｘから約Ｙまで”を意味する。
【００３４】
別に定義されていない限り、ここで用いられているすべての用語（専門および科学用語を含む）は、本発明が属する当業者により通常、理解されるものと同様の意味を有する。常用される辞書において定義されている用語は、明細書および関連業界の関係でそれらの意味と一致した意味を有するとして解釈されるべきであり、ここで明らかにそのように定義されていない限り、理想化されたまたは過度に形式的な意味で解釈されるべきでないことが、更に理解されるであろう。周知の機能または構成は、簡略化および／または明確化のため詳細に記載されないこともある。
【００３５】
第一、第二などの用語が様々な要素、構成部品、区域、層、および／または項目を記載するためにここで用いられているが、これらの要素、構成部品、区域、層、および／または項目はこれらの用語により限定されるべきでないことが理解されるであろう。これらの用語は、ある要素、構成部品、区域、層、または項目を他の区域、層、または項目から区別するためだけに用いられる。このように、以下で記載される第一の要素、構成部品、区域、層、または項目は、本発明の開示から逸脱することなく、第二の要素、構成部品、区域、層、または項目と称することもできる。作動（または工程）の順番は、特に他で示されない限り、請求項または図面において呈示された順序に限定されない。
【００３６】
“閉鎖システム”または“閉鎖コンテナ”という用語は、処理に際してシステムまたはコンテナ中へ（またはから）の外在または外部物質の導入を阻止または防止するために、完全でなければ、実質上閉鎖的に密封されて作動する、各々システムおよびコンテナに関する。閉鎖システムは汚染を阻止または防止するように形成される。一部の態様において、閉鎖システムまたはコンテナの構成部品は製造現場で使用前に前滅菌され、使用箇所で滅菌され、および／または各閉鎖システムが使用前に組立て、および閉鎖された後で滅菌される。閉鎖システムまたはコンテナは、ある大気条件下でわずかな目標または既定漏れ率まで圧力‐または真空気密(vacuum-tight)である。漏れ率は、真空もしくは圧力センサー試験を用いる内部および／または外部センサー、または他の漏れチェックシステムなどにより調べられてもよい。典型的な大気条件は、海面からそれ以上の標高まで、装置の所在位置により変化してもよい。しかしながら、本発明の態様で考えられる閉鎖システムは海洋（水面下、深海）、飛行、および／または宇宙環境でも用いられてもよく、密封性はその大気条件で目標漏れ率を実質的に十分に維持しうる。閉鎖システムまたはコンテナは、閉鎖システムの完全性の毀損なしに、それらの各所定目的のために利用することができる。閉鎖システムまたはコンテナは無菌性を維持しながら標的流体サンプルの流体移動に適合化でき、および／または閉鎖システムの完全性を維持しながら他の閉鎖システムに接続可能である。工程に際して大気または他の構成部品に開いた流路で、フィルターが場合により用いられる。フィルターは、所望のクリーンレベルまたはクラスまで濾過して、クラス１００，０００、クラス１０，０００、クラス１０００フィルター、または更にはクラス１００フィルターのような閉鎖状態をとれるように形成されてもよい。
【００３７】
“隔離コンテナ”という用語は、内部構成部品を保持、格納、および／または隔離し、外部病原体、微生物など、および／または外部環境において存在しうる他の物質から隔離して、そこに保持された一以上の物品またはサンプルを処理しうるように形成された、コンテナに関する。隔離コンテナは一回用使い捨てコンテナでもよい。一部の態様において、隔離コンテナ中のサンプルは、例えば組織（例えば、清澄化された腫瘍ホモゲネート）中の核酸をＩＶＴ ＲＮＡへ処理するための、核酸であるか、またはそれを含んでなる。
【００３８】
“一回用使い捨て”という用語は、再使用されない構成部品に関する。換言すれば、その意図した使用、即ち標的サンプルの処理または調製を終えた後、それは捨てられる。標的産品の処理／調製後にその内容物のいかなる不注意な外部放出または暴露も阻止するために、隔離コンテナがその内部構成部品をそこに保持して閉鎖の密封された状態で捨てられる閉鎖システムを保持するために、隔離コンテナは一回用使い捨てでよい（そのようにラベルしてもよい）。
【００３９】
“アリコート”という用語は、標的流体の所望量に関する、流体の量は既定および／または特定範囲内にある。“アリコート管”という用語は、コンテナから流体アリコートの取出しを行なえる管に関する。典型的には、“アリコート管”という用語は、隔離コンテナの閉鎖状態または密封された完全性を毀損することなく、少なくとも一つ（典型的には複数）の流体アリコートを入れられるように、隔離コンテナの内部と連絡した管に関する。アリコート管は柔軟性があり、かつ無菌でもよく、ＰＶＣのようなエラストマーを含んでなる。
【００４０】
“キュベット”という用語は、容器内に含まれる物質、典型的には流体の機械的、電気的、または光学的測定、典型的には濃度または容量測定を行なえるように形成された容器に関する。キュベットは、典型的には約０．００１ｍＬ〜約５．０ｍＬの範囲内で、比較的少量の流体を保持するようにサイズ化される。
【００４１】
“ピペットチップ”という用語は、流体、典型的には液体を少量、典型的には約０．１μＬ〜約１０００μＬの量で取込および／または放出しうる、両端で開く管に関する。該管は、典型的にはヘッドから下方先端にかけてテーパー化(tapering)した、不規則もしくは一定の周囲形状または大きさを有する。“ピペット”は複数のかみ合い可能な(matable)構成部品により形成される。即ち、ピペットはチップ部分およびヘッド部分を有する。ヘッド部分は、処理に際して異なるピペットチップと解放可能に取り付けられる、ロボットデバイスへ（間接的に）取り付けられた操作ツールに形成される。異なる容量の大きさのピペットも単一コンテナ／処理システムにおいて用いてもよい。
【００４２】
“Human Machine Interface（ＨＭＩ）”との用語は当業者に周知であり、オペレーターに機械へ入力、指示させ、それと相互作用させるインターフェースに関し、プログラムで情報を提供してオペレーターからの制御指令を受け取る“Graphic User Interface（ＧＵＩ）”付きの電子ディスプレーを典型的には含む。
【００４３】
“無菌”という用語は、コンテナの内部処理空間において外部病原微生物および／または望ましくない外来物質による標的サンプルの汚染を阻止または防止する、および／またはコンテナの内容物による近位外部環境の汚染を阻止または防止する、処理状態に関する。
【００４４】
“結合カラム”という用語は、サンプルまたはその誘導体の諸成分を分離するために用いられる、濾過／溶出カラムに関する。一部の態様において、結合カラムは核酸（例えば、ＤＮＡおよび／またはＲＮＡ）単離または精製に用いることができる。一部の態様において、結合カラムはシリカ膜を保有してもよい。
【００４５】
“トレー”という用語は、一以上の構成部品を保持するために十分な剛性を有した支持体に関する。トレーは実質的に平坦でも、またはボウル様形状を有してもよい。トレーは他の形状および形態を有してもよい。トレーは一体ウェルまたは保持区域を形成するように形成しても、またはデバイスもしくはコンテナ、典型的には少なくとも一つの処理ワークステーションと関連したそれらの構成部品と密封可能にかみ合う、および／またはそれらを保持するように形成されてもよい。
【００４６】
“ユーザー”という用語は、オペレーター、プログラマー、および／またはメンテナーに関する一般名である。
【００４７】
“ロボット”という用語は、規定された処理工程または作動を行なうよう望ましい方向へ翻訳することがプログラムにより指示される、自動デバイスに関する。“ロボット”という用語は広く用いられ、多軸並進の固定設置ロボットアーム、並びに全可動ロボットおよび他の適切なロボットデバイスを含む。
【００４８】
本発明はシステム、方法および／またはコンピュータープログラム製品として具体化されてもよい。したがって、本発明はハードウェアおよび／またはソフトウェア（ファームウェア、レジデントソフトウェア、マイクロコードなどを含む）で具体化されてもよい。更に、本発明は、指令遂行システムによるまたはそれと連携した使用のためにコンピューター使用可能またはコンピューター読取可能プログラムコードを媒体で具体化させたコンピューター使用可能またはコンピューター読取可能蓄積媒体において、コンピュータープログラム製品の形態をとってもよい。本明細書に照らして、コンピューター使用可能またはコンピューター読取可能媒体は、指令遂行システム、装置もしくはデバイスによるまたはそれと連携した使用のために、プログラムを保有、蓄積、伝達、伝播、または輸送しうる、いかなる媒体であってもよい。
【００４９】
コンピューター使用可能またはコンピューター読取可能媒体は、例えば電子、磁気、光、電磁気、赤外線または半導体システム、装置、デバイスまたは伝播媒体であってもよく、それらに限定されない。コンピューター読取可能媒体の更に具体的な例（非包括的リスト）としては次のものがある：一以上のワイヤ、ポータブルコンピューターディスケット、ランダムアクセスメモリー（ＲＡＭ）、読み出し専用メモリー（ＲＯＭ）、消去可能なプログラム可能読み出し専用メモリー（ＥＰＲＯＭまたはフラッシュメモリー）、光ファーバー、およびポータブルコンパクトディスク読み出し専用メモリー（ＣＤ‐ＲＯＭ）を有する電気コネクション。コンピューター使用可能またはコンピューター読取可能媒体は、紙もしくは他の適切な媒体でもよく、そこにプログラムがプリントされ、プログラムが例えば紙または他の媒体の光学式走査で電子的に捕捉されると、必要であれば適切に編集、解釈、または処理され、次いでコンピューター（電子）メモリーに蓄積されることに留意する。
【００５０】
閉鎖環境において、自動処理のための装置および方法が以下で記載されている。該システムは、例えば閉鎖環境で何かを処理、作製、組立て、または操作するために用いられ、医学、犯罪科学、治療、診断、バイオテクノロジー、エレクトロニクス、およびナノテクノロジーの分野で特に有用である。記載の便宜上、本発明の様々な態様および特徴が、核酸処理のためのシステムの関係において、ここでは記載されている。しかしながら、以下の記載は本発明の単なる説明にすぎず、限定されるものではない、と当業者であれば理解するであろう。例えば閉鎖コンテナで何らかの物品を作製、組立て、処理、または操作するためのシステムおよび方法を含めて、様々な他の適用も本発明の範囲内とみなされる。
【００５１】
例示の自動システムの概観
概観として、図１に関し、システム１０は、内部チャンバー（内部作業エリアまたは区域としても記載され、“エリア”という用語が広く用いられているが、二次元数理的ではない）付き閉鎖コンテナアセンブリー１２内で一以上の物品を操作する、ロボットアーム２０で形成しうる。一部の態様において、コンテナアセンブリー１２は、処理されるおよび／またはそれ以外で操作対象となる複数の物品を保持するように形成された、内部区域１８を有する。柔軟性のあるバリア１６は、コンテナトレー１４の内部をカバーし、それで密封するように、形成および寸法取りされる。チャンバー内で物品を操作するためのツールが柔軟性のあるバリア１６へ取り付けられまたはその中に組み込まれ、バリア１６がトレー１４へ取り付けられた場合に、内部区域中へ伸びる。バリアがコンテナトレーで密封されまたはそれへ取り付けられた場合に、ツールがコンテナの外側からロボットデバイスにより操作されるように、該ツールはバリアの外側から接近可能なアダプターまたは他のインターフェースを有しうる。トレー１４は、閉鎖コンテナで一以上の物品または工程構成部品または流体を保持するための、一以上の作業スペース、エリア、ステーション、ラック、ホルダー、容器、ウェル、または他のデバイスを保有するように形成される。他のツールまたはデバイスがコンテナ内に配置されてもまたはそこから接近可能でもよく、例えばサンプルまたは他の物品を処理、操作、測定、分析、サンプリング、および／または貯蔵するためのツールもしくはデバイスがコンテナのチャンバー内に存在してもよい。
【００５２】
ここで図面に戻ると、図１は例示の自動核酸処理システム１０を示す。システム１０はコンテナアセンブリー１２を保有してもよい。コンテナアセンブリー１２は隔離コンテナ１２でもよい。システム１０は、コンテナアセンブリー１２内でおよび／またはそれと関連して物品を操作するための、ロボット２０（典型的にはロボットアーム）または他の自動もしくは手動指示可能デバイスも保有する。コンテナアセンブリー１２はトレー１４と柔軟性のあるバリア１６を含んでなる。バリア１６はトレー１４で密封またはそれと取り付けられるよう構成される。バリア１６の最外周端部分１６ｐはコンテナトレー１４を密封可能に係合でき、コンテナアセンブリー１２内に閉鎖無菌作業エリア１８を設ける。一部の態様において、コンテナアセンブリー１２またはそのいずれか一部は一回用使い捨てである。具体的な態様において、サンプルは密封されたコンテナを開けることなくコンテナの外部で排出、収集、または捕捉され、密封されたコンテナ１２は残留内容物と共に“そのまま”捨てられる。
【００５３】
トレー１４は実質的に硬質であって、成形されたボディでもよい。一部の態様において、トレー１４は医療グレード（ＵＳＰクラスVIまたは他の適切なグレード）の成形ポリマーを含んでなる。トレー１４のボディは、内部目視性を呈する視覚性のために、一以上の実質的にクリアな半透明または透明の光沢区域を含んでなる。トレー１４は、バイオバーデンおよび微粒子を阻止および／または最少化するために、クリーンルームモールドおよびクリーンルーム成形施設で成形される。トレー１４は、例えばＶＨＰ（蒸気過酸化水素）、ガンマ線照射、またはエチレンオキシド蒸気過酸化水素による表面汚染除去のような、一般的滅菌技術を用いることにより、柔軟性のあるバリア１６を密封する前にまたはその後に滅菌される。輸送のために、トレー１４は密封された二重プラスチック包装／袋詰めのように二重エラストマー無菌包装物質で梱包される。
【００５４】
バリア１６は、コンテナアセンブリー１２の密封された完全性を毀損することなく、垂直に約４〜２４インチおよび水平にトレー１４の少なくともほぼ幅と長さで、密封されたコンテナアセンブリー１２の作業エリア１８内でロボット２０にツールを動かせるように形成される。一部の態様において、ロボット２０は、密封の密封された完全性を毀損することなく、密封されたコンテナアセンブリー１２で６〜１２インチの垂直運動を有するよう、内部インターフェースに命令しうる。バリア１６は、コンテナ１２の内部容量を過度に圧縮または減損することなく、ロボット２０の望ましい運動範囲を確保する上で十分な空気容量をもたらすよう、トレー１４との相関でサイズ化され、そして形成される。
【００５５】
一部の態様において、システム１０は、組織、血液、血液製品、核酸、タンパク質、細胞培養物などに限定されないが、それらを含めた生物サンプルをコンテナアセンブリー１２内において処理するために用いられる。このような態様において、コンテナ１２は、例えば生物サンプル、試薬、洗浄液、ピペット、ピペットチップ、容器、他の消耗品、またはそれらいずれかの組合せのような物品を含んでもよい。
【００５６】
示されたように、システム１０は自立式、自給式ユニットであってもよい。システム１０は、自動システム１０の隔離コンテナアセンブリー１２および他の構成部品、例えばロボット２０、サーマルブロック３０（例えば、ヒートブロックおよび／または冷却ブロックなど）、アリコート・リトリーバル・アセンブリー４０および処理されたサンプルを集めるための関連機構、ユーザーインターフェース６０、および以下の項目において記載されているような様々な他の構成部品および機構を支持するためのハウジングまたはシャシ７０を保有する。サーマルブロック３０は、例えば、図１０、１１において示されるように、サーマルブロックアセンブリー１０００と協同してもよい。
【００５７】
処理システム１０の一部の態様において、オペレーターまたはメンテナーは通常作動のためにシステム１０のフロントへ接近することのみを要してもよい。図１において示されるように、一以上のアクセスドア１１０が、隔離コンテナ１２を取り付けるまたは取り外す際に、接近性をもたらすため、例えば実質上垂直に持ち上げるか、または側面もしくは他の方向に開けることで開いてもよい。
【００５８】
一部の態様において、システム１０の自動性により、ドア１１０は作動時にオペレーターがシステムの各パートを動かさないように防いでもよい。システム１０は、システムが作動している際にドア１１０を開けないようオペレーターを阻止または防止するため、電子的に制御されたインターロックまたは他の機構を組み込んでもよい。インターロックされたガードを開くための補助手動装置も装備でき、このような補助手動装置は例えば電力が得られない場合に用いられてもよい。ＨＭＩ（Human Machine Interface）とも称されるユーザーインターフェース６０は、オペレーターに処理作動を開始させまたはシステム１０を制御させうるように形成でき、アクセスドア１１０に隣接するシャシ７０のフロントに設置しうる。ある態様では、ＨＭＩのディスプレースクリーン６１および制御（タッチスクリーン、キーパッド、または他のインプット）も、立ちながらユーザーにそれらを視認および作動させるように置いてもよい。一部の態様において、システム１０の背面および側面はオペレーターにより日常的に接近される必要はない。結果的に、システムは壁または他のシステムを背にして置ける。
【００５９】
一部の態様において、シャシ７０の下部は、オペレーター相互作用を要しない、電子制御システム、電源、および他の構成部品を保有しうる。これらの構成部品は、偶発的流体浸入から構成部品を保護し、生じうる電気ハザードからオペレーターを保護する、専用エンクロージャーに収納される。取り外し可能パネル１２０、１３０、１４０は、エンクロージャーの内側で電気構成部品および／または他の構成部品へ接近しうるように保有されてもよい。一部の態様において、訓練されたサービス員のみが、これらエンクロージャーの内側に近づくことを許されるか、または要求される。サービスアクセスパネルは、例えばパネルを取り外してシステムを作動継続させることを許諾または拒否するために、インターロックしてもまたはしなくてもよい。
【００６０】
図２は、作業表面２００に隔離コンテナ１２を保有した、システム１０の上部分の拡大側面図を示す。例えば、示されたようにバリアがトレー１４へ取り付けられた場合に、ピペットヘッド２２０の少なくとも一部分がコンテナ１２の内部作業エリア１８中へ伸びるように、ピペットヘッド２２０および／または他の操作デバイスがバリア１６へ取り付けられるか、またはそれとともにもしくはその中に組み込まれている。ピペットヘッド２２０は、ロボットデバイス２０のアーム２３０の端部で解放可能にアダプター２１０と接続するように形成されたインターフェースをバリア１６の反対側に保有する。一部の態様において、ピペットヘッド２２０または他の操作デバイスはバリア１６を物理的に通り抜けず、アダプターでロボットまたは他のデバイスと必ずしも連結していなくてよい。むしろ、このようなピペットヘッドはバリアの内側と取り付けまたは一体化し、例えばバリアの反対側に取り付けられたロボットアーム２３０を用いて、バリア１６の反対側から作動または操作される。他の態様において、（実質的に不透過性である）バリア１６と一体化されたピペットヘッドまたは他のサンプル操作デバイスは、バリア１６を介して操作デバイスを支持および／またはそれと連絡する磁石または他のデバイスにより作動してもよい。
【００６１】
バリア１６がトレー１４に密封されている場合、バリア１６はピペットヘッド２２０を操作するロボット２０または他のデバイスからトレー１４の内容物を分離する。バリア１６およびトレー１４間の密封は気密であり、それによりコンテナ１２内に閉鎖環境をもたらす。一部の態様において、バリア１６は柔軟性があり、ロボットアーム２３０によりトレー１４内の作業エリア１８中くまなくピペットヘッド２２０を動かせる。例えば、生物サンプル、試薬、ピペットチップ、または他の消耗品を含めた、核酸サンプルの処理に関与するすべての物品または物質と、サンプルを処理するための他のツールまたはデバイスとは、処理に際して閉鎖作業エリア１８内に留まれる。トレー１４は、このような物品を収納するために、トレー１４のベース２４０またはトレー１４の他の部分と成形、形成、取り付け、または一体化された、いくつかのフィーチャーまたはステーション２４２を含んでもよい。
【００６２】
示されたように、ロボットデバイス２０はシャシ７０の壁に取り付けられてもよい。他の態様において、ロボットデバイス２０は作業表面２００または他の支持構造体に取り付けられたアーム、ガントリー、またはリンケージシステムを含んでもよい。適切なロボットデバイスが当業界において知られている。以下の例には限定されないが、Staubli ＴＸ９０ロボット、Epson Ｅ２Ｌ Scaraロボット、Kawasaki Ｆ Seriesロボット、Yamaha ＹＫＬ Scaraロボット、ＳＴ Robotics Ｒ１７ロボットなどが含まれる。一部の態様において、ロボットデバイス２０は、FANUCLR MATE 200iB 5C、６軸ロボット、または他の適切な多軸ロボットデバイスであり、例えば、サンプルの処理に際しピペットチップを用い結合カラムマニホールドをスライドまたは持ち上げて、流体の吸引および移動のような望ましい操作を閉鎖コンテナ１２内部において自動的に行なうために用いられる。
【００６３】
多軸ロボットアームは、ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かし、いくつか異なる方向にピペットを向けて、吸引または分配時に液体の混合を助けるために用いられる。例えば、ピペットは閉鎖コンテナ中の受容容器で受容表面近くに先端がある状態で下方角度方向に向けられ、次いで自動的に下方向き角度のピペットが（マスタードの典型的な積層または分配に類似して）面に沿い実質上直線的に動かされ、その際にピペットから流動性物質を放出する。他の態様において、吸引前に容器において液体を混ぜ、次いで混ぜた液体をピペットへ吸引するように、ロボットアームが自動的にピペットを動かせる。一方または加えて、一部の態様において、液体は該液体を混ぜるために少なくとも一回吸引および分配される。一部の態様において、受容または分配容器はリップを有し、ロボットアームはピペットチップに指示してリップの周囲を動かせるように形成される。
【００６４】
図３において示されるように、フロントアクセスドア１１０の内側に置かれる水平作業表面２００は、例えば、隔離コンテナ１２と相互作用する様々な構成部品および機構を支持してもよい。作業表面２００は、処理に際して、アセンブリーサポートトロリー(trolley)３９９（図２７）に構成部品を係合してコンテナを並べさせるガイドスロット３９０ｓ、あるいは隔離コンテナ１２（例えば、図２のベース２４０）へ向けて解放可能に固定する他のロケーションフィーチャーを含めて、一以上のガイドスロット３９０ｓを保有しうる。
【００６５】
図２７において示されるように、システム１０とドッキングしうるトロリー３９９上にコンテナアセンブリー１２が作製される。トロリー３９９は、システム１０の支持表面上でガイド３９０により形成されるスロット３９０ｓと並ぶ、スロット３９９ｓを保有する。コンテナアセンブリー１２をシステム１０へ移動するために、オペレーターはシステム１０付近でトロリーを転がし、こうしてトロリー３９９がシステム１０のガイド３９０と並べられる。オペレーターがコンテナアセンブリー１２を持ち上げることなく、コンテナアセンブリー１２はシステム１０のスロット３９０ｓで適正な作動位置にスライドする。
【００６６】
図２８Ａおよび２８Ｂにおいて示されるように、作業表面２００は適所にある場合、コンテナ１２の下部分と接触するローラーガイド３８１、３８２を保有する。ローラーガイド３８２は、ワークステーション箇所の登録のためにロボットアームと望ましいアライメントにある最内部スロット壁３９０に対してぴったり適合するように、内側へコンテナ１２をバイアスさせるスプリング３８３と連絡しうる。
【００６７】
再び図３に戻ると、作業表面２００は、コンテナ内で区域、容器、または標的対象もしくは箇所を加熱および／または冷却するためのインキュベーションデバイスのような、温度制御デバイスを支持してもよい。このようなデバイスは当業者に知られている。ある態様において、システム１０は、例えば、ある核酸増幅反応または他の反応もしくは工程に際してＰＣＲプレート６１０（図６）または他の容器もしくは構成部品の温度を制御するためのサーマルサイクラー３０、およびこのような反応に際してサーマルサイクラー３０を選択的にカバーするためのサーマルサイクラーリッド機構３１０を保有する。ある態様にでは、真空ポンプアセンブリー３２０およびピンチバルブアセンブリー３３０が、処理に際して隔離コンテナ１２内において真空および空気の循環の制御をもたらす。真空ポンプアセンブリー３２０は、一回用使い捨て真空ヘッド１６０２、および関連管類(tubing)１６５０を解放可能に係合しうる（図２３Ｂ）。作業表面２００は、ここで更に記載のように、コンテナアセンブリー１２により保持される構成部品と分光光度計１９００ｓを連絡させうるように、コンテナアセンブリー１２も保持しうる。
【００６８】
一以上のシリンジポンプ３５０（例えば、二つのポンプとして示される）は、ピペットヘッド２２０の吸引および分配作用を駆動させるために用いられる（図２）。一部の態様において、シリンジポンプ３５０は、ピペットヘッド２２０の作動のための真空および圧力をもたらす、図２において示されたピペットヘッドアダプター２１０を介して、例えばリザーバー３４０から作業液を送り出すために用いられてもよい。作業液は実質的に非圧縮性であってもよく、例えば約５０％エタノールの水溶液を含んでなる。他の流体、空気さえも用いてもよい。ポンプ機構およびピペットヘッド２２０の例示態様の追加詳細が、図７および８と関連して以下で更に詳細に記載されている。
【００６９】
図３に戻ると、キュベットホルダー３６０（図１９Ａにおいて分光光度計キュベットも参照）は、処理に際して望ましい作動で自動濃度測定を行なうために、シャシ７０の下部分で典型的に存在する分光光度計１９９０ｓと連結させうる。場合により、作業表面２００は一以上の冷却フィーチャー、例えば冷却機のような熱交換器を保有してもよく、ペルチェ（Peltier）冷却プレート３７０および３７２が隔離コンテナ１２のある部分を係合して密封されたコンテナ１２内で湿度および蒸気濃度の制御を助けるために置かれる。レバー３８０または他の機構もしくはデバイスも、作業表面２００において適所に隔離コンテナを固定するために用いられてもよい。
【００７０】
一部の態様において、ＲＮＡ処理システムは、大規模生産システムおよびデータ管理ツールまたはシステムから隔離されて、スタンドアローン式に作動してもよい。内部または外部コンピューターシステムがサブシステムの自動構成部品を制御および／または測定してもよい。ユーザーは、例えば、システムを作動させて状態を測定するために、インターフェース６０と相互作用してもよい。他の態様において、システム１０は他のシステムまたは監視ステーション（異なる部屋または異なる施設にあってもよい）と連絡しうる。
【００７１】
様々な構成部品およびアセンブリーの追加の詳細、および使用の例示方法が、以下の項目において記載されている。
【００７２】
例示の隔離コンテナ
隔離コンテナアセンブリー１２に関して、トレー１４および柔軟性のあるバリア１６が更に詳細に記載されている。トレー１４は、内部作業エリア１８を保有し、例えば、望ましいアッセイまたは工程用の容器、ピペットチップ、結合カラム、他の支持体、および／または他の消耗品またはデバイスを保持するための一以上のラック、マニホールド、または他のホルダーを含めて、コンテナ１２内に物品を保持するためのいくつかのインサート、空洞、ラックもしくはラック搭載フィーチャー、および／またはステーション２４２を含んでもよい。望ましい最終状態または産品へ物質を処理するために用いられるすべての物品がコンテナ内に保持され、即ちシステム用の消耗品は自給式であり、コンテナの内部を汚染する危険を最少化するためまたはサンプルに環境もしくはユーザーを汚染させないために、処理に際して密封される。バリア１６は、例えば図５において示されるようなトレー１４の環状エッジ４５２付近に、トレー１４で解放可能にまたは恒久的に密封するよう形成された最外周端部分１６ｐ（図５）を有する。バリア１６がトレー１４において密封されている場合、ピペットヘッド２２０および／または他のサンプル操作ツールもしくはデバイスの少なくとも一部はバリア１６から作業エリア１８中へ伸びている。
【００７３】
一部の態様において、バリア１６は硬質トップエッジ４５２に沿いトレー１４を係合している（図５）。バリア１６の最外周端部分１６ｐはトップエッジ４５２に接触して存在する（図５）。トップエッジ４５２は、バリア１６を締め付けてトレー１４に対してバリアを密封するＯ−リング（示さず）を入れる、ギャップスペース付き立上りリップとして形成されてもよい。
【００７４】
閉鎖システムまたは環境を作るために、隔離コンテナトレー１４およびバリア１６は、コンテナ１２内の物品と、コンテナで物品を処理するために用いられる外部デバイス、機構、および装置のピースとの間に、物理的バリアを形成するように形成されてもよい。例えば、柔軟性のあるサーマルサイクラーリッドシール４３０が、図４において示されるように、トレー１４の壁４５０内に組み込まれてもよい。このようなシール４３０はリッド１０１０を入れるスリーブまたは閉鎖チャンネルを包囲および形成し（図１１）、リッド機構３１０とコンテナ１２の内部エリア１８内の物品との間に物理的バリアを設けながら、サーマルサイクラーブロック３０による加熱時に、サーマルサイクラーリッド機構３１０によりトレー１４の側壁にある隙間１４ａ（図５）へリッドを伸ばし、サンプルをカバーさせるために用いられてもよい。
【００７５】
しかも、冷却プレート３７０、３７２は、隔離作業エリア内でどの物品とも接触することなく、コンテナ１２内の温度変化を知らせるように、トレー１４の外表面の各部分を係合してもよい。一部の態様において、冷却プレートは、隔離作業エリア／スペース内に保持された（試薬のような）物品の温度を制御しうるよう、トレー１４／コンテナ１２の外表面の各部分と係合してもよい。
【００７６】
同様に、図３において示されるように、キュベットホルダー３６０は濃度および／または容量の測定を行なえるようトレー１４のベース２４０から伸びるキュベット６６０（図６）を選択的に係合するが、ホルダー３６０はコンテナ１２内のどの物品とも接触しなくてもよい。そのため、一部の態様では、サンプルと直接接触するよう要求される試薬、消耗品、およびツールまたはデバイスのみが、隔離コンテナ内に保有される。このような形態はいくつかの利点を有する。例えば、サンプルはそれ自身の隔離環境において処理され、および／またはコンテナ外に存在する処理装置はサンプルと接触せず、そのため生じうる汚染から保護される。処理の終わりに、例えば収集サンプルまたは隔離コンテナの完全性を毀損することなく、以下で更に記載されているように、所望数のアリコートがアリコート管４４０（図４）に集められてもよく、コンテナ１２から取り出されてもよい。一部の態様において、例えば、密封された隔離コンテナ１２は、サンプル物質で汚染された構成部品とともに、処理サイクル後に捨てられる。
【００７７】
図５および６は、隔離トレー１４および柔軟性のあるバリア１６を含めた、例示の隔離コンテナ１２の一部構成部品の追加の詳細を示す。内部作業エリア１８は、例えばベース２４０と一以上の壁４５０で囲まれてもよく。バリア１６は、以下の別項目で更に詳細に記載されている、ピペットヘッド２２０または他のデバイスもしくはツールを保有しうる。バリア１６がトレー１４で密封された場合に、作業エリア１８が閉鎖された、典型的には気密な区画となるように、バリア１６は、例えばトレー１４の環状エッジ４５２に沿うシール５１０において、トレー１４でカバーおよび密封するように形成しうる。
【００７８】
トレー１４は実質的に硬質であり、収納するためにトレーで成形、形成され、それと取り付けまたは一体化された、いくつかのフィーチャーおよび／またはステーション２４２を保有しうる。下記構成部品の一部または全部は、トレー１４へ組み込まれるフィーチャーの例である：
・溶出６３０および廃棄６３２ステーション、
・真空入口および出口、
・分光光度計（濃度）キュベット６６０（図１９Ａ）、
・他の容器またはキュベット、例えば容量測定キュベット２０６０（図２０Ａ〜Ｅ）、
・温度制御デバイスで加熱および／または冷却されてもよいサーマルサイクラーＰＣＲプレート６１０および／または他の支持体または容器、
・ラック６２０における試薬容器６２２、
・ラック６５０におけるピペットチップ６５１、
・例えば、使用済みピペットチップ６５３のための、一以上の追加チップラック６５０または他の使い捨てコンテナ、
・例えば、核酸処理用の一以上の結合カラムを保有してもよい、結合カラムマニホールド５０、および
・アウトプット：例えば核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ、腫瘍全ＲＮＡ、および／または増幅腫瘍インビトロ転写ＲＮＡなど）、微生物、細胞、薬剤などを処理するための一以上のアリコート管４４０。
【００７９】
一部の態様において、柔軟性のあるバリア１６は、バリアの片側でロボットデバイス２０と連結し、バリア１６の内側で内部構成部品と連結する操作ツールで密封し、それを支持する。該ツールは、ピペットヘッド２２０および追加の操作フィーチャー、例えば内部構成部品を係合するためのハンドル５２０または他のフィーチャーもしくは機構、例えば廃棄および溶出ステーション６３２、６３０間にマニホールドを各々移動するための結合カラムマニホールド５０におけるハンドル５０ｈ（図５）を保有しうる。柔軟性のあるバリア１６は、トレー１４で収納されたすべての望ましい内部構成部品に接近しうるほど、十分にピペットヘッド２２０を動かせられる。ヘッド２２０は、廃棄６３２および溶出６３０ステーションへおよび／またはから結合カラムを移動できるように、結合カラムマニホールド５０も係合しうる。示されていないが、内部インターフェースは複数の連続的に取付け可能なインターフェースでもよい。即ち、ピペットヘッドまたは第一インターフェースは閉鎖コンテナ内で解放可能に保持され、他の操作ツールと交換されうる。操作ツールの選択は、トレー１４および／または内部操作ツールラック（示さず）により行なわれる。
【００８０】
ミキサーおよび／または遠心機も、例えば望まれる生物サンプルまたは他の物質のような液体またはサンプルを混合、ホモゲナイズ、分離、もしくは混合または処理するために、トレーと協同するか、またはそれに組み込んでよい（示さず）。他の態様においては、出発物質が予め混合され、次いでラック６２０または他の箇所に置かれる。ミキサーは、望ましい物質を混ぜられる回転ヘッドミキサー、磁気ミキサー、またはホモゲナイザーである。
【００８１】
例示のピペッティングシステム
図７ＡおよびＢに関して、ピペットヘッド２２０およびアダプター２１０アセンブリーを含んでなるピペッティングシステム７００が、隔離コンテナ１２内において流体移動を行なうために用いられてもよい。閉鎖隔離コンテナデザインと一致するように、ピペットヘッド２２０は、移動される流体とピペットポンプ機構とのバリアを維持するように形成される。フィルターおよび／または柔軟性のある隔壁７１０は、隔離コンテナ１２の内部と外部との物理的汚染抵抗バリアを設けられる。
【００８２】
一部の態様において、高い容量正確さをもたらすために、ピペッティングシステム７００は二本のポジティブ・ディスプレースメント・シリンジポンプ３５０‐１、３５０‐２、例えば一本は低容量移動（例えば、約１μＬ〜約５０μＬ）および一本は高容量（例えば、約５１μＬ〜約１０００μＬ）を用いてもよい。他の態様では、異なるリザーバー付きの単一ポンプチャンバーまたは作業液を計量する手段付きの単一リザーバーが用いられる。ポンプチャンバーは、（実質的に硬質の）管類および緩衝液（作業液）を介して、柔軟性のある隔壁７１０へ圧式で接続されてもよい。緩衝液は、ピペッティングシステム７００の弾性を減少または最少化しうる、実質的または全体的に非圧縮性の圧媒液である。ロボットアーム２３０は作業スペースで望ましい箇所にピペットヘッド２２０を置くために用いられる。ピペット移動中に試薬キャリーオーバーの可能性を減らすため、使い捨てチップ６５１が流体の取扱いに用いられてもよい。即ち、各移動後に、使用済みチップが“トラッシュ”容器、典型的には使用済みラックへ廃棄され、無菌ラックまたはサプライステーションから異なる新たな無菌チップが次の移動に用いられてもよい。ピペッティングシステム７００の例示態様の他の構成部品が図７Ａおよび７Ｂにおいて示される。
【００８３】
一部の態様において、ピペッティングシステム７００は初回使用前にピペットラインから液体を導入して空気を除去するように準備され、新たな閉鎖コンテナ１２の処理の開始時のような、異なるピペットヘッド２２０がピペットヘッドアダプター２１０へ接続される各時点の前に準備されてもよい。例えば、ブリードラインがソレノイドバルブ７４１を介してピペットヘッドのブリード口を作業液リザーバーへ接続する。空気をポンプ３５０から放出させ、流体ライン２２２、２２３（図８Ａ）、およびピペットヘッド２２０を経て、作業液リザーバー３４０へ戻すように、バルブ７４１が始動順序に際して開けられてもよい。ロボットアーム２３０は流体ラインをピペットヘッド２２０へ向けるように指示され、こうしてそれらは始動に際して曲げられる。システム７００が始動されると、ブリードバルブ７４１が閉じられてもよく、ピペットヘッド２２０は流体移動を行なう用意が整う。ＲＮＡ工程の完了時に、ブリードバルブ７４１が流体ライン２２２、２２３、およびピペットヘッド２２０を排液するために用いられる。流体ラインを空気で満たすと、ピペットヘッドの切離しに際する液こぼれの可能性を防げてもよい。
【００８４】
図８Ａおよび８Ｂは、圧力をピペットヘッド２２０からピペットチップ６５１、６５３へ伝えるための圧力伝達機構８００の作動の断面図を示す。一部の態様において、例えばリザーバー３４０からの圧媒作業液は柔軟性のある隔離隔壁７１０を作動させ（図８Ｃおよび８Ｄも参照）、作業液とピペットにより吸引される流体との物理的分離を維持しながらピペッティング作用を駆動させる。作業液のリザーバーは、他の側で作業空気から密封された隔壁７１０の片側に存在しうる。柔軟性のある隔壁７１０は、作業液３４０と内部ピペットチップアダプター２２０ａ（即ち、ピペットヘッド）および吸引された流体との間で、ヘッド２２０に存在する。図１５は隔壁および上部アセンブリーなしでアダプター２２０ａを示す。
【００８５】
図８Ａおよび８Ｂに関して、隔壁７１０の変位は隔壁７１０下でピペットチップアダプター２２０中の作業空気容量７００ａに影響を与え、それにより（典型的には配分）量の液体をピペットチップに取り込ませるかまたは放出させる。ピペッティングシステム７００の全体的弾性は分配正確さと直接関連してもよい。一部の態様では、空気容量７００ａを減少させると、ピペッティング正確さおよび精度を双方とも改善しうる。
【００８６】
一部の態様において、試薬容器、分光光度計キュベット６６０、およびＰＣＲ壁内で流体の徹底的混合を促すために、反復吸引／分配サイクルが用いられ、および／またはロボットアーム２３０が多軸並進でピペットのチップを動かすように指示される。
【００８７】
一部の態様において、トレー１４および／またはピペットヘッド２２０は、使用済みチップ６５３をピペットチップアダプター２２０ａから取り外す一以上のフィーチャーを保有してもよい（図８Ｂ）。図２６Ａ〜２６Ｃにおいて示されるように、ピペットヘッド２２０は使用済みピペットラック６５０に近いコンテナの一部との接触で軸旋回するレバー２２１を保有しうる。図２６Ｃにおいて示されるように、レバー２２１の外端との接触で、レバー２２１が軸旋回して、使用済みピペットチップ６５３をアダプター２２０ａからラック６５０の受容スペースへ押し出すように、コンテナ側壁１４ｗまたはそこに保持された部材が曲げられる。即ち、ピペットヘッド２２０が使用済みラック６５０の方へ下向きに動くと、レバー２２１が壁１４ｗと接触し、こうしてレバーの一端を上方へおよびピペットチップ６５３の端部を下方へ動かして、使用済みチップをラック６５０へ押し出す。他の解放形態も用いてよい。例えば、使用済みラック６５０はピペットチップ６５３の上方運動を制限して、アダプター２２０ａからチップを引く、押すもしくは強いるかまたは取り外すように形成されてもよい。
【００８８】
ピペットヘッド２２０および／またはアダプター２１０は流体ラインおよびロードセル配線と連結してもよく、これらは柔軟性のあるバリア１６および柔軟性のある導管を通り抜けてシャシ７０へ戻るように上げられる。ロードセル配線は、無菌または新ピペットチップと連絡するロードセンサーとつながっている。ロードセルはアダプター２２０ａへの新ピペットの装填を制御するために用いられるデータを提供する。例えば、ロボットアームは約５Ｎ〜約５０Ｎの力でピペットヘッド２２０を下進させて、ピペットチップ６５１が適正に取り付けられるよう指示する。アダプター２１０は、該アダプター２１０をピペットヘッド２２０、以下の例に限定されないが、係合／解放ハンドル機構へ固定および解放するためのカラーも保有しうる。
【００８９】
例示の柔軟性のあるバリア
図９Ａ〜９Ｅは本発明の態様に従う例示の柔軟性のあるバリア１６を示す。いかなる適切な物質も該バリアに用いられる。バリア１６は、空気、湿気、およびエタノール蒸気に対して実質的に不透過性である。十分な柔軟性を失いまたは透過性に影響を与えることなく、バリア１６は成形可能である。一部の態様において、バリア１６は低密度ポリエチレンを含んでなるが、他の代替物はある範囲のウレタン物質を含有しうる。具体的な態様において、柔軟性のあるバリアはFrederica、Delaware所在のＩＬＣ Dover Companyから入手しうる“ARMORFLEX”物質であるか、またはそれを含んでなる。
【００９０】
柔軟性のあるバリア１６の形状によれば、限定なくまたは該柔軟性のあるバリアの拘束もしくは捕捉なく、隔離コンテナ１２の内部への十分なロボット運動を許容して、ピペットヘッド（または他の内部インターフェース）アクセスを行なわせることができる。柔軟性のあるバリア１６がトレー１４へ密封されて隔離コンテナ１２を形成すれば、成形された柔軟性のあるバリア１６の形状は実質的に自立性である（例えば、それは隔離コンテナ中へ崩壊しない）。
【００９１】
一部の態様において、バリア１６の部分９１０は、例えばピペットヘッド２２０、他の流体移動デバイスおよび／または他の操作ツールのような、コンテナ内でサンプルを操作するためのデバイスと一体化、収納、保持、取り付け、噛合、密封、支持、または相互作用するように適合化されてもよい。部分９１０は実質的に中央部分でもよい。バリア１６は“湾曲部”９２０として記載される一以上のホールド、プリーツ、またはアンジュレーションを保有してもよく、そのうち一部は他と実質的に同心状である。一連の実質上垂直向き階段状部分１７１、１７２、１７３として示された、少なくとも一つの階段状部分１７を部分９１０が保有しうることを、図９Ｂは示す。
【００９２】
一部の態様において、例えば図９Ｃおよび９Ｄにおいて示されるように、バリア１６は一以上の放射状湾曲部９３０を保有してもよい。放射状および／または同心状湾曲部はピペットヘッド（または他の内部操作ツールインターフェース）の全範囲運動の容易化を助け、ピペットヘッドの運動に際してバリア形状の制御を助けられてもよい。リム９４０、フランジ、または他のフィーチャーは、バリア１６をトレー１４へ固定、密封、固定、取り付け、または接着させるための表面を設けてもよい。
【００９３】
図９Ｃおよび９Ｄにおいて示されるように、柔軟性のあるバリア１６は、ヘッド２２０の望ましい動きを可能にする、一連の実質的に同心状のホールド、プリーツ、または湾曲部へ引き伸ばされまたは形成される、単一シートの物質を含んでなる。バリアシートの外周区域１６ｔは中心区域１６ｃと異なる厚さを有してよい。一部の具体的態様では、作製に際し、厚い物質が真空形成時に中心へ引き寄せられて、バリアシート１６の薄い中心区域と厚い周囲区域を形成する。中心区域１６ｃは、バリア１６が作業スペース１８から離れるに従い小から大へとアレンジされた、一連の円柱状工程１７１〜１７３を保有する。他の態様において、単一シートの物質よりむしろ、柔軟性のあるバリア１６は同一または異なる適切な物質の複数の連結した密封されたセグメント（示さず）を含んでもよい。
【００９４】
図９Ｅは、後でロボットアーム２０への係合のために、ピペットヘッド２２０の下部分へ密封可能に取り付けられた柔軟性のあるバリア１６を示す。ロボットアームカップラー９１０ｃはバリア１６の外部に存在する。図９Ｆは、カップラー９１０ｃを係合するように形成された協同カップラー２１０ｃを示す。図９Ｇにおいて示すように、フィンガー２１１は、カップラーボディ９１０ａの隙間へ入り、バリア１６を解放可能に係合するように形成される。アセンブリーが（下部コンテナトレー１４なしに）図９Ｈにおいて示される。
【００９５】
例示のサーマルブロックアセンブリー
図１０において示されるように、核酸処理システムはサーマルブロックアセンブリー１０００またはいずれか他の温度制御デバイスを組み込んでもよい。例えば、核酸処理システムは核酸を合成および増幅するためのサーマルサイクラーを組み込める。サーマルブロックアセンブリー１０００は、例えば、マルチウェルストリップまたはプレート、例えばＰＣＲプレート６１０を入れるように形成されるサーマル（ヒーター）ブロック３０、およびリッド機構３１０により作動されてＰＣＲプレート６１０をカバーするサーマルサイクラー加熱リッド１０１０を保有してもよい。例えば、一部の態様において、サーマルサイクラーアセンブリーは本工程のｃＤＮＡ合成、ｃＤＮＡ増幅、ＩＶＴ ＲＮＡ合成、およびＤＮＡ除去工程に用いられる。様々な種類のサーマルブロックおよび／またはサーマルサイクラーデバイスが利用しうる。
【００９６】
図１０において示されるように、ＰＣＲプレート６１０が隔離コンテナトレー１４へ組み込んでもよい。一部の態様において、ＰＣＲプレート６１０の周囲はトレー１４のベースで形成されるオープン（実質的長方形）区域へ密封される。プレート６１０の下部分は、プレート６１０におけるウェル６１１の開口が密封されたコンテナ１２の内側から接近可能でありながら、サーマルサイクラーヒーターブロック３０を係合する（典型的には、そこに存在する）ように、トレーのベースから下方へ伸びる。ウェル６１１の下方へ伸びる部分がサーマルサイクラーまたは温度制御デバイスと直接接触した状態でいられるように、ＰＣＲプレート６１０は隔離コンテナトレー１４へ密封される。
【００９７】
一部の態様では、コンプライアントガスケット、Ｏ−リング、または他のシーリング機構もＰＣＲプレート６１０を隔離コンテナトレー１４へ取り付けるために用いられてもよい。コンプライアントガスケットは熱スエージ加工クランピングフィーチャーで取り付けられてもよい。一部の態様では、重ね成形熱可塑性エラストマー（ＴＰＥ）シール１０３０が、図１０において示されるように、ＰＣＲプレート６１０を隔離コンテナトレー１４へ取り付けて密封するために用いられる。他の態様では、ＰＣＲプレートフィーチャーが隔離コンテナトレー支持体へ形成、例えば成形および／または機械加工されてもよい。他の態様では、グルー、テープ、および／または接着剤もＰＣＲプレート６１０をトレー１４へ取り付けるために用いられてもよい。
【００９８】
リッド、例えば加熱されるサーマルサイクラーリッド１０１０も、蒸発による反応液の喪失を減らすために用いてよい。リッド１０１０は、一部または各ＰＣＲウェル６１１から蒸発流体を逃さないように、および／またはコンテナ１２の内部の隔離を維持するために、例えば柔軟性のあるシール４３０により裏打ちしてもよい。リッド１０１０は、リッドまたは反応混合物以外の表面において蒸気を凝縮させないために、加熱してもよい。ＰＣＲウェルのすべてへの接近を可能にするため、サーマルサイクラーリッド１０１０はシーリング圧力を放出するよう垂直に上げられ、次いで実質上水平に引き込まれ、それにより柔軟性のあるリッドシール４３０を取り出してもよい。
【００９９】
リッド１０１０の自動運動を制御するための駆動系(drive system)３１０も、図３において示されるように、処理システム１０の作業表面２００へ搭載してよい。他の態様において、リッド駆動系３１０は作業表面２００上または下で他の箇所に搭載してもよい。ここで図１１に関して、例示のリッド駆動系３１０は引き込み位置にあるリッド１０１０と共に示される。アーム１１２２がリッド１０１０へ接続され、モーター１１５０と連絡している、こうして例えば、リッドシール（スリーブとして記載される）が図１２において示されるようにリッド１０１０とコンテナの内部との間に配置された、トレー１４の壁における副入口／出口隙間１４ａを介して、コンテナ１２内外へのリッド１０１０の運動を可能にしている。ロボットツールまたは手動インプットもシール４３０を介してよい。
【０１００】
図１３Ａは、引き伸ばし時のリッドシール４３０のチャンバー４３０ｃ内部における、コンテナ１２中リッド１０１０の例示形態を示す。図１３Ｂは、引き込み形態にあるコンテナ１２外のリッド１０１０を示す。
【０１０１】
アーム１１２２は水平のみならず垂直にもリッド１０１０を向けるよう形成しうる。図１１および１２において示された態様において、駆動系３１０は、例えばリッド１０１０がコンテナ１２内でＰＣＲプレート６１０上に置かれた場合に、リッド１０１０の垂直運動を行なえる、垂直運動機構１１２４を保有する。垂直運動機構１１２４は、例えば、一以上のバイアス部材１１５２を用いて、リッド１０１０をプレート６１０および／またはブロック３０（図１０）で密封するために十分な下方向き力を出してもよい。一以上のモーター１１５０、アクチュエーター、ギア、リンケージ、または他の電気‐機械デバイスが、水平および／または垂直運動を駆動するために用いられてもよい。図１２において示されるように、駆動系３１０はスロット１１２３ｓ付き上部プレート１１２３を保有する。アーム１１２２はスロット１１２３ｓでスライドするキール１１２２ｋを保有する。駆動系３１０は、ピボット１１２７およびバイアス部材１１５２を介して上部プレート１１２３へ取り付けられた、下部プレート１１２６も保有する。垂直駆動１１２４は上部および下部プレート１１２３、１１２６へ取り付けられ、リッド１０１０がコンテナ内で伸びた形態にあると、上部プレート１１２３を引き降ろしてリッド１０１０を下げるように形成される。
【０１０２】
駆動系３１０の一部は、シール４３０が、リッド１０１０において適切に動くよう促すために、スリーブまたはリッドシール４３０の内部表面へ物理的に取り付けられる。図１１において示されるように、一部の態様において、真空カップ１１４０は柔軟性のあるリッドシール４３０を係合して、サーマルサイクラーリッド１０１０の垂直および水平運動時にシール４３０を適所に留まらせるよう、リッド１０１０に組み込まれてもよい。他の態様において、リッドシール４３０は他の手法で取り付けても、またはリッド１０１０と整合してそれと協調して動くほど十分に柔軟でもよい。
【０１０３】
一部の態様において、隔離コンテナ１２と柔軟性のあるリッドシール４３０との信頼可能な密封を促すために、固定プレートまたは他のクランピング部材が、例えばトレー１４の外壁に対するリッドシールでの一以上のシーリングリブ（示さず）を介して、シール４３０のエッジ部分に対して押し付けるように用いられてもよい。他の態様において、リッドシール４３０は、例えばＰＣＲプレート６１０に関して前記されたようなＴＰＥを用いて、トレー１４に重ね成形されてもよい。Ｏ−リング、ガスケット、接着剤、テープ、およびマウンティングまたはシーリング部材が、リッドシール４３０とトレー１４とで密封され、接続させるために用いられてもよい。図１３Ａはリッド１０１０およびシール４３０が係合位置でトレー１８の内部区域へ伸びたリッド機構３１０を示し、一方図１３Ｂはコンテナ１４の壁から引き込まれたリッド１０１０を示す。図１３Ａはサーマルサイクラーおよび９６ウェルプレート上で適所にあるリッド１０１０を示す。図１３Ｃは、リッド１０１０がトレー１８の内部区域へ伸びた、リッド機構３１０の部分側面斜視破断図を示す。
【０１０４】
例示の廃棄および溶出システム
様々な精製手段が、核酸、タンパク質、細胞、組織などのサンプルを処理するために用いられる。このような精製デバイスとしては磁気ビーズ、サイズ排除膜、結合プレート、フィルター、および結合カラムがあるが、それらに限定されない。このようなデバイスは当業者に知られている。
【０１０５】
ある態様において、処理システム１０は腫瘍全ＲＮＡ単離、ｃＤＮＡ精製、およびＩＶＴ ＲＮＡ精製用の結合カラムから溶出させる技術を用いる。結合カラム１４１０（図１４）はシリカ膜を保有できる。真空溶出プロトコールが隔離コンテナデザインへ組み込める。他の態様では、磁気溶出プロトコールがコンテナへ組み込める。
【０１０６】
一以上の種類／大きさの結合カラムが用いられてもよい。例えば、一部の態様では、結合カラム（例えば、Qiagen RNeasyカラム）が処理されるＲＮＡ、ｃＤＮＡ、およびＩＶＴ ＲＮＡの量に適した結合能を有することから、それらが用いられる。追加の、小さなQiagen“Mini”カラムも、ＲＮＡを濃縮する能力をもたせるために保有させうる。
【０１０７】
溶出容器を廃棄液で汚染させないために、廃棄および溶出ステーション６３２、６３０各々が、例えば図６において示されるように分離できる。一部の態様では、マニホールド５０が結合カラムを保持するために用いられる（図１４および１５参照）。マニホールド５０は、一以上の様々な大きさ／種類の結合カラム、例えばQiagenマキシ‐、ミディ、‐および／またはミニ結合カラム１４１０を保持するように形成しうる。マニホールド５０は、各結合カラム用のウェル５０ｗ、ピペットヘッド２２０持上げ用のリフティング部材、またはアーム形成リフト部材５０ｈ、および未使用結合カラムを閉じるために用いられる一以上のスライド可動性リッド１４３０を保有してもよい。リッド１４３０は、ヘッド２２０によりリッド１４３０を所望方向へスライドさせるハンドル１４３０ｈを保有しうる。他の態様において、マニホールド５０は、所望の工程に際して用いられる他の種類の支持体またはデバイスを保持するように形成してもよい。リフト部材５０ｈは、ステーション間においてマニホールド５０の運動を促す一以上の（図示のような）ハンドル、ウイング、フランジ、または他のフィーチャーを含めて、いかなる適切なリフトとして形成してもよい。
【０１０８】
図１５は、コンテナ１２の二以上のステーションまたはエリア間において、例えば廃棄および溶出ステーション６３２、６３０各々間でマニホールド５０を動かすための機構および方法の例を示す。ピペットヘッド２２０およびロボット２０は、２ステーション内外へ、即ち両者間で結合カラムマニホールド５０およびカラム１４１０を動かすために用いられてもよい。示された態様において、マニホールド５０はピペットヘッド２２０で対応フィーチャー５２０と連結するハンドル５０ｈ、ウイング、または他のフィーチャーを保有してもよく、ロボット２０および結合マニホールド５０間の係合を簡素化するために用いられる。
【０１０９】
各単離および精製工程は異なるセットのカラムを用いられる、ピペットヘッドロボットはリッド１４３０を転位させて適切なセットの未使用カラムを閉じるために用いられてもよい。これはマニホールド５０を通る気流を減少または最少化させ、単離および／または精製処理工程に際して十分に高い真空をポンプに作らせる。滅菌後に結合カラム１４１０のオペレーター取扱いを減らすために、カラム１４１０がマニホールド５０へ積載されてもよく、アセンブリーが適切な包装に密封されて、マニホールド５０でガンマ線滅菌される。使用およびまたはアセンブリー施設（例えば適切なクリーンルーム）において、隔離コンテナを積載する場合に、オペレーターは該包装をマニホールド５０から取り外し、結合カラムを直接取扱う必要なしにそれを廃棄ステーション６３２へ置ける。
【０１１０】
廃棄および溶出ステーション形態は柔軟性のあるおよび／または計量可能である。マニホールド５０デザインは、９６ウェルフォーマット、または他の種類のプレート、ウェル、またはカラム、またはマキシ‐、ミディ‐、およびミニカラム１４１０の組合せの変更に合う修正または使用を行なえるほど十分に大きくてよい。
【０１１１】
ここで図１６および１７に関して、溶出ステーション６３０は結合カラムの最終アウトプット（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡなどを含有する流体）を捕捉するように形成された溶出トレー１６１０を保有できる。ＤＮＡおよびＲＮＡ間で生じうる交差汚染を阻止および／または防止するために、各結合カラム１４１０は溶出トレー１６１０でその下にそれ自体の容器１６１２を有しうる。一部の態様において、溶出工程は高真空を用いるが、これは結合カラム１４１０で有意な気流を作れる。溶出容器１６１２は、プールされた流体から気流をそらせながら、仮にあったとしても飛び跳ねた流体を脇に流して収集容器にプールしうるよう形成されてもよい。追加のフィーチャーでは、ある容器から他へ流れる気流を減少または最少化させてもよい。トレー１６１０の更なる記載は図２９Ａ〜２９Ｃにおいて見られる。
【０１１２】
廃棄ステーション６３２は廃棄トレー１６３０および廃棄トレーカバー１６４０を保有してもよい。廃棄トレーカバー１６４０は、廃棄ステーション６３２に保有される廃棄液の蒸発を最少化させるため、廃棄トレー１６３０へ組み込んでもよい。廃棄トレーカバー１６４０は、すべての廃棄液を一以上の（中心部として示された）ドレインホール１６４１へ流下させて、そこでそれが廃棄ステーション６３２内においてカバー１６４０下の主気流から保護されるように形成されてもよい。図３０Ａおよび３０Ｂは、溶出トレー１６１０と実質的に類似して形成されたトレーカバーを用いる複数の廃棄ドレインホール１６４１を用いた、廃棄トレーカバー１６４０の他の態様を示す。廃棄トレーカバー１６４０下の密封された環境において、廃棄液のすぐ上の空気は高い湿度を維持し、そのため更なる蒸発を減らせる。トレーカバー１６４０の更なる記載は図３０Ａ〜３０Ｂにおいて見られる。
【０１１３】
一部の態様において、真空システム１６００は、コンテナ１２中くまなく空気を循環させる。一部の態様において、隔離コンテナ真空システム１６００はフィルターの必要性を解消するように形成される。真空システムは、ポンプヘッド１６０２から、例えばピンチバルブ３３０（図１７）を介して、廃棄６３２および溶出６３０ステーションへ接続された管類１６５０、典型的には柔軟性のある管類を含んでなる。ポンプヘッドの出口は吸引された空気を隔離コンテナ１２へ逆送させる。
【０１１４】
図１７は真空システム１６００の一つの態様による循環路を示す。この態様では、管類１６５０および使い捨てポンプヘッド１６０２が製造に際して隔離コンテナトレー１４へ取り付けられてもよい。これらは、隔離コンテナトレー１４と連結されたアセンブリーの一部として滅菌および輸送される。隔離コンテナ１２が積載および密封されると、真空システム１６００は処理の残りをずっと閉じたままでいられる。処理システム１０への隔離コンテナの搭載中、真空管類１６５０がピンチバルブ３３０へ挿入され、使い捨てポンプヘッド１６０２が真空ポンプ３２０へ接続される。一部の態様において、ポンプ３２０は真空が要される場合のみ作動する。ピンチバルブ３３０は真空を適切なステーションへ向けるために用いられてもよい。処理が終了した場合、管類１６５０はバルブ３３０から抜き取られてもよく、ポンプヘッド１６０２がポンプ３２０から外される。管類１６５０およびポンプヘッド１６０２は、隔離コンテナ１２の残りとともに、一回用使い捨てにしうる。
【０１１５】
図１８は、処理システム１０の作業表面２００で適所にあるトレー１４の破断図を示し、ピンチバルブ３３０および使い捨てポンプヘッド１６０２の例示箇所を示す。ペルチェプレート３７０および３７２は、トレー１４の後壁１４ｐのセグメントおよびトレー１４のベースにある廃棄ステーションキャッチメントを各々冷却してもよい。壁セグメント１４ｐは実質的に平坦で（典型的には実質的に垂直だが、傾斜してもよい）、プレート３７２の受容スペースを形成するように内側へ突き出してもよい。壁１４ｐはプレート３７２と協同して凝縮壁を形成するように形状化されてもよい。図１８においては、サーマルサイクラーリッド駆動系３１０がシール４３０なしで適所にコンテナ中へ伸びたリッドと共に示され、使い捨てポンプヘッド１６０２が柔軟性のある真空ポンプ管類１６５０なしで適所に示されることに注目される。
【０１１６】
例示の工程制御および／または収量測定システム
一部の態様において、使い捨てキュベット６６０、２０６０が、例えば図１９Ａおよび図２０Ｆにおいて示されるように用いられる。例えば、キュベット６６０、２０６０がトレー１４の底部から垂直下方へ伸びるように、一以上のキュベット６６０、２０６０が隔離コンテナトレー１４へ固定または解放可能に搭載されてもよい。
【０１１７】
一部の態様では、サンプル、例えば核酸もしくはタンパク質の濃度および／または純度が分光光度計１９００ｓ（図３、１９Ｂ）およびキュベット６６０（図１９Ａ、２０Ｆ）を用いて測定されるか、あるいは濃度測定用の代替光学的方法、例えばフルオロメーターがシステムへ同様に組み込まれる。
【０１１８】
一部の態様では、図１９Ａにおいて示されるように、一以上の使い捨て濃度キュベット６６０がガスケットまたはＯ−リングのような柔軟性のあるシーリング部材１９１８によりトレー１４へ密封可能に搭載される。トレー１４は、シーリング部材１９１８に対してしっかりキュベット６６０を保持し、こうしてキュベット６６０をトレー１４へ密封して、密封された処理環境を隔離コンテナ内で維持するように、留め具１９２０を係合する搭載部材１４ｍを保有している。示されるように、キュベット６６０は硬質上部リップ６６１として形成される外側エッジを保有しうる。留め具１９２０は、リップ１９０１を背にする内側直立アーム１９２１と、搭載部材１４ｍを係合してキュベット６６０をトレー１４へ押し付ける外側アーム１９２２を保有している。キュベット６６０は、典型的にはその下部分に、キュベット測定ウィンドー６６０ｗを保有する。
【０１１９】
一方、キュベット６６０（またはキュベット２０６０）はトレーへ成形、重ね成形、機械的固定、溶剤接着、接着剤固定などしうる。分光光度計１９００ｓ（図３）は処理システム１０に、例えば隔離コンテナ１２の真下に搭載されうる。分光光度計１９００ｓは、隔離コンテナ外に留まりながら、キュベット６６０（図２０Ｆ）で吸光度測定するように形成できる。
【０１２０】
一部の態様では、キュベットが再使用不要なように、各測定用のキュベット６６０、２０６０がある。処理システム１０は、必要とされる各測定毎にキュベット６６０から６６０へ分光光度計キュベットホルダー３６０（例えば、図３、１９Ｂ参照）を動かせるように形成しうる。一部の態様において、キュベット６６０および／または２０６０はトレー１４から取り外され、洗浄されて、次のトレー１４で再使用される。他の態様において、取り外し可能キュベット６６０、２０６０は一回用のみ（一回用使い捨て）である。
【０１２１】
様々な種類の分光光度計が知られ、核酸濃度および純度測定に利用される。分光光度計１９００ｓは処理システム１０と連絡して、連結されたコントローラーにより制御される。例えば、処理システム１０は分光光度計１９００ｓに測定するよう命令でき、分光光度計１９００ｓは典型的には紫外線波長、例えば約２６０および／または２８０ｎｍで、または対象のいずれか他の波長で、吸光度測定に戻ることができる。加えて、分光光度計１９００ｓのジオメトリー、特にキュベットホルダー３６０のそれは、全体システムの他の構成部品と一体化できる。
【０１２２】
図１９Ｂは、図２０Ｆにおいて（４）キュベット６６０として示される、いくつかのキュベット６６０間で単一検出器ヘッドを動かすために用いられる分光光度計ヘッド機構を示す。ロボット作動プラットホームは、分光光度計キュベットホルダー３６０を位置決めするため、例えばキュベット６６０間で上げる、下げる、および横移動(traverse)させるために用いられる。分光光度計１９００ｓおよび光源は、例えばシステムの左側または右側において、システムの電気キャビネットに搭載されてもよい。分光光度計１９００ｓおよび光源が据付けられたままでキュベットホルダー３６０を動かせるために、光ファイバーも用いられてもよい。即ち、図１９Ｂにおいて示されるように、分光光度計駆動機構は単一検出器ヘッド１９００ｈを動かして異なるキュベット６６０の各々を順次保持するために用いられる。検出器ヘッド１９００ｈの検出器は複数（典型的には二本）の光ファイバーで分光光度計１９００ｓに連結される。他の態様では、各キュベット６６０が個別キュベットホルダー３６０に入れられ、測定のため分光光度計と連絡するように光源を多数キュベットホルダー（示さず）へ接続している光ファイバー間で光源が切り替えられる。
【０１２３】
サンプルの容量測定は収量を求めるために濃度測定とともに用いられてもよい。一部の態様において、容量測定ユニット２０００は、例えば図２０Ａ〜２０Ｅにおいて示されるように、専用容器においてピペッティングシステムおよび流体センサーを利用する。例えば：
・図２０Ａは検出器ヘッド２００２で空のキュベット２０６０を示し、そこでは二つのＩＲエミッター２０１０からの光がキュベット２０６０を通過せず、反射光について二つのＩＲレシーバー２０２０により受容される。
・例えば図２０Ｂにおいて示されるように、測定される流体２０４０が容量キュベット２０６０にプールされると、二つのＩＲエミッター２０１０からの光がキュベット２０６０へ通されて、反射光について二つのＩＲレシーバー２０２０により受容されない。
・制御システムが測定容器２０６０の底部でシステム２０００により検出される流体の存在を測定している場合、図２０Ｃにおいて示されるようにサンプル２０４０をピペットチップ６５１へ吸引するためにピペットヘッド２２０が用いられる。
・図２０Ｄにおいて示されるように、センサーシステム２０００が流体の不在を報告すると、シリンジポンプ３５０（図３）が止められ、吸引された容量が電子的に測定および記録される。このように、キュベット２０６０は底部にプリズムデザインを有する。検出器で光源を用いると、機器は反射に基づきキュベット２０６０中における流体の存在または非存在を調べることができる。これは、分注装置(pipetting device)とともに、液体が存在しないシグナルを受けるまでそれが取り出す液体を測定することにより、容量を測定する。図２０Ｅは、システム２０００が間隔をあけた複数の検出器ブロック２００２を用いることができ、各々がそれ自体ペアのトランスミッター２０１０を有することを示す。各ブロック２００２は、容量測定システム２０００を用いて容量測定を行なうために、各キュベット２０６０を保持してそれと協同するように形成できる。
【０１２４】
図２０Ｆにおいて示されるように、トレー１４は複数の容量キュベット２０６０（例えば、容量測定キュベット）および複数の分光光度計キュベット６６０（キュベット６６０は濃度測定に用いられる）を保有できる。分光光度計キュベット６６０は、BioRad“trUViewキュベット”のような標準ＵＶ可視プラスチック使い捨て用品でもよい。デバイス１０は測定用の分光光度計構成部品を保有しうる。適切な分光光度計構成部品は、Dunedin，Floridaにビジネス拠点を有する、Ocean Opticsから得られる。
【０１２５】
例示の工程構成貯蔵システム
一部の態様では、試薬容器が隔離コンテナ１２内に試薬、サンプル、および混合容量の流体組合せを含有するために用いられる。様々な異なるキャパシティの試薬容器が、工程に際して用いられるある範囲の流体容量を入れるために用いられてもよい。
【０１２６】
試薬汚染、蒸発、またはこぼれの危険を減らすために、試薬を含有する各容器は、トレー１４への充填前に、典型的にはトップ表面において、例えばポリプロピレンライニングホイルにより密封される。シールはピペットチップ６５１で穴あけされるように形成できる。シールは試薬を適切な試薬容器へ充填および密封させ、汚染、こぼれ、または蒸発の危険なく貯蔵させうる。
【０１２７】
試薬ラック６２０の例が図２１Ａにおいて示される。ラック６２０はいかなる望ましい配置を有してもよく、あらゆる試薬容器の大きさをとることができ、いかなる工程にも適合させうる。示された例において、試薬トレーまたはラック６２０は、例えばサンプルおよび試薬を含有してもよい、異なる大きさのいくつかの容器２１１０、２１１２、２１１４、典型的には管、並びに混合容器を収納するためのベース２１００を保有している。容器の各々はベース２１００内において支持され、容器が適所にしっかり保たれるよう、カバー２１２０がラック６２０にクリップまたは取り付けられる。カバー２１２０は、下に保持された容器にピペットチップを接近させうる、隙間を保有している。
【０１２８】
一部の態様では、試薬、サンプル、または他の流体がサブアセンブリーとしてラック６２０に充填され、次いでラック６２０がトレー１４へ積載される。一部の態様において、試薬ラック６２０の設計は、それが一方向のみで隔離コンテナトレーへ置かれるようなものである。一方、試薬ラック６２０は成形しても、または隔離コンテナトレー１４の一体部分としてもよい。試薬は一体試薬トレーへ直接充填されてもよく、または試薬を含有した管または他の容器が試薬トレーへ置かれてもよい。所定のラック箇所（アドレス）に容器２１１０、２１１２、２１１４を置けば、工程で正しい時間に正しい容器（試薬）をロボットインターフェースで自動的に係合させられる。
【０１２９】
一部の態様では、ピペットチップが他の非類似試薬を運ぶ必要性なく、トレーレイアウトですべての容器への接近を可能にでき、そのため試薬の交差汚染の機会を減らせる。もちろん、例えば行なわれる望ましい工程に応じて、他の形態も用いられてもよい。
【０１３０】
図２１Ｂは、（試薬）液体を取り出す前に、容器２１１０、２１１２、２１１４で各々シールを開けるためにマルチポイント（三点として示される）穴あけ配列が用いられることを示す。即ち、ピペッティング正確さを促すために（典型的には、中心箇所で）現実の取り出し穴あけへ動く前に、二つの外部箇所でシールカバーリングを穴あけするようピペット６５１が指示される。
【０１３１】
例示のアリコート取出しシステム
システム１０における自動処理に際し、サンプルおよび／または産品の一以上のアリコートが工程評価、制御、品質試験、および／または別の処理のための貯蔵に用いられてもよい（例えば、図４および５のアリコート管４４０参照）。
【０１３２】
一部の態様において、隔離コンテナ１２および処理システム１０は、隔離コンテナ１２の密封性を毀損することなく、処理に際してアリコート取り出しを行なえる。複数の柔軟性のある管がコンテナ１２の内部サンプル捕捉区域と流体連絡でき、オペレーターにより外部から接近可能となるようシステム１０から伸びている。各々の柔軟性のある管は予め密封されるか、または閉鎖端部を有している。コンテナ１２が閉鎖されたままで、各アリコートが個別にラベルされたコンテナ４４０、例えば管へ吸引されてもよい。オペレーターまたは自動シーラーは、例えば流体の捕捉アリコートの上流で、例えばＲＦ管シーラーまたは他のシールクロージャー機構を用いることにより、管４４０へアリコートを密封する。密封されると、アリコート管は隔離コンテナから取り外され、貯蔵、試験、または更なる処理のために取り出される。
【０１３３】
一部の態様において、アリコートアセンブリー４０はアリコート流体を管４４０へ吸引するために用いられ、コンテナ１２の内部から管へ流体を抜き出すためにクランピング部材およびアリコート管類４４０の弾性を利用する。この機構は管類が短時間で固定され易くするように自動化され、こうしてクランピング変形により起きる管類の弾性の変化の可能性を減らしている。
【０１３４】
図２２はアリコートアセンブリー４０を用いた例示方法２２００を示し、アリコート管４４０をアリコート流体４４５で充填するために用いられる一連の工程（左から右および上から下へ）を示す。示されるように、閉鎖末端４４１のアリコート管４４０がウェル１４ｗ下でトレー１４へ密封可能に取り付けられる。この例では、クランピング部材（管エクスプレッサー）２２１０が（第二および第三図において示されるように）管から空気を追い出すために一以上のアリコート管４４０へプレスされる。管が留め具２２１０で完全に圧縮される（上部クランピング部材２２１１が管および他の留め具表面に対して押し下げられる）のに応じて空気が排出された後または排出されている間、アリコート物質４４５が管４４０と連絡しているウェル１４ｗに充填または分配される。後にクランピング力の放出で、流体４４５のアリコートが弾性管内の負圧により管４４０へ引き込まれる。管シーラー２２２０（例えばＲＦウェルダー）も、アリコート管を（４４２で）密封し、場合によりシールの上流で切断して、管内でサンプル４４５を隔離するために用いられてもよい。他のシーリング材機構も用いられてもよい。
【０１３５】
コンテナを組み立てる例示方法
図２３Ａは、処理用の閉鎖システムをオペレーターに作製させるために用意される、キット２５００の分解組立図である。キット２５００は、トレー１４、結合マニホールド５０、ピペットチップラック６５０（およびピペットチップ６５１）、およびキュベット２０６０、６６０を保有しうる。トレー１４は、取り付けられるアリコート管４４０および／または取り付けられる真空ヘッドおよび関連管類と共に包装されて、使用現場へ輸送される。各構成部品は、輸送および取扱い用の無菌パッケージ中で滅菌および包装（または包装、次いで滅菌）される。各構成部品は使用箇所で表面滅菌してもよく、各構成部品のアセンブリーは、クラス１０，０００、１０００、または更には１００クリーンルームにあってもよい。各構成部品は別々に用意しても、または他の組合せで予め積載してもよい。
【０１３６】
図２３Ｂは、図２３Ａにおいて示されたキットの部分組立図である。図２３Ｃは、図２３Ｂにおいて示された部分組立キットの底面図である。図２３Ｄは、コンテナまたはトレー１４と共にまたはそれとは別に輸送される個別構成部品の組立て前における、図２３Ａにおいて示されたコンテナ１４の上面図である。
【０１３７】
図２４は、（例えば、一以上の生物サンプルから核酸を無菌処理するために）本発明の態様に従い隔離コンテナ１２を各々密封する例示方法を示す。このような無菌処理のために、隔離コンテナアセンブリー１２のバリア１６およびトレー１４の部分は個別に前包装および滅菌されてもよい。隔離コンテナ１２が処理に必要とされる場合、トレー１４およびバリア１６は積載のために生物学的安全キャビネットまたは相当するクリーンで制御されたエリアへ移動されてもよい。
【０１３８】
図２３Ａにおいて示されるように、隔離コンテナ１２のトレー１４は、望ましい工程で用いられるサンプルおよび試薬を含んでなる一以上の試薬トレー６２０と共に積載されてもよい。トレー１４の組立ておよび／または積載は、上記のようにトロリー３９９（図２７）に載せたトレー１４により行なわれる。一以上のピペットチップラック６５０および結合カラムマニホールド５０もトレー１４の作業エリア１８へ積載されてもよい。一部の態様では、例えば図２０Ｆにおいて示されるように、一以上のキュベット６６０、２０６０がトレーのベースへ取り付けられる。行なわれる望ましいアッセイまたは工程に応じて、他のサンプル、被検体、試薬、容器、他の消耗品、デバイス、ツール、および／または他の物品もトレー１４へ積載されてもよい。
【０１３９】
一部の態様において、すべての望ましい物品がトレー１４内に置かれまたはそこへ取り付けられた後、例えば、図２４において示されるように、組立てられた隔離コンテナ１２を密封するためにバリア１６がトレー１４へ取り付けられる。一部の態様では、柔軟性のあるバリア１６をトレー１４へ密封するためにＯ−リング２４００が用いられてもよい。Ｏ−リングは、ぴったりとバリア１６に嵌めてトレー１４の周囲スロットへ押し当てられる。他の態様では、一以上のガスケット、クリップ、留め具、ファスナー、接着剤、および／または他の取付け手段も用いられてもよい。
【０１４０】
図２７において示されるように、トレー１４は輸送に際してトロリーの保持表面へロックされる。トレー１４が積載されてバリア１６で密封された後、隔離コンテナ１２は処理システム１０の作業表面２００へ移動される。一方で、隔離コンテナが組立てられて滅菌される。次いで、試薬およびサンプルが標準無菌移動法を用いてまたは他の閉鎖手段により密封された隔離コンテナへ導入される。トロリーも、組立てに際してトレー１４を保持するために用いられる。一方、別のバリアアイソレータートロリーアセンブリーカートも隔離コンテナ１２を組み立てる場合に用いられてもよい（示さず）。このようなバリアアイソレータートロリーはバリアアイソレーター自体へ組み込んでもよく、下記のように輸送トロリーとかみ合える。
【０１４１】
隔離コンテナアセンブリー１２はシステム１０へ設置されてもよく、サンプルを処理するために用いられる機器の各ピースへ接続される。正しいアライメントを保証するために、硬質トレー１４が作業表面２００に固定されてもよい。柔軟性のあるバリア１６およびピペットヘッド２２０がロボットピペットヘッドアダプター２１０へ接続されてもよい（例えば、図２参照）。例えば図１２において示されるように、例えば真空カップ１１４０または他のファスナーもしくは取付け手段を用いて、サーマルサイクラー蒸発シール４３０がサーマルサイクラーリッド１０１０へ接続されてもよく、廃棄および溶出ステーション用の真空管類および使い捨てポンプヘッドが対応するバルブおよびポンプへ差し込まれる。隔離コンテナを取り出すために、逆の手順が用いられてもよい。
【０１４２】
図２５は、本発明の態様に従い製造現場で行なわれる操作のフローチャートである。示されるように、インプットサンプル３０００が（典型的には患者収集場所または対象者試料貯蔵現場から）用意される。時間に敏感な場合は、製造現場における受け取りのために１２〜４８時間（例えば、一夜）以内で試料が輸送される。製造現場においては、隔離コンテナ１２がバリアアイソレーター（ブロック３０１０）で作製され、サンプルもコンテナへの積載前に調製（例えば、ホモゲナイズ、混合、および／または遠心）されるてもよい（ブロック３０００ｐ）。隔離コンテナ構成部品、例えば、トレー１４、バリア１６、およびコンテナ内容物の外部包装が滅菌される（ブロック３００２）。組立ておよび密封された隔離コンテナが組み立てられ（ブロック３００４）、密封された状態を確認するために完全な状態で試験される（ブロック３００６）。
【０１４３】
閉鎖組立て隔離コンテナは、処理用の機器へ動かせる（ブロック３０２０）。示されるように、患者サンプルからＲＮＡがシリカ膜カラムと適切なＲＮＡ結合および溶出試薬を用いて単離される（ブロック３０２２）。濃度および容量測定が収量を計算するために行なわれ、濃度が標準化される（ブロック３０２４）。ｃＤＮＡが逆転写（ＲＴ）反応により合成され、ＰＣＲで増幅され、シリカ膜カラムと適切なｃＤＮＡ結合および溶出試薬を用いて精製される（ブロック３０２６）。濃度および容量測定が収量を計算するために行なわれ、濃度が標準化される（ブロック３０２８）。ＩＶＴ ＲＮＡが得られたｃＤＮＡから産生され、ＤＮＡアーゼにより処理され、シリカ膜カラムと適切なＲＮＡ結合および溶出試薬を用いて精製される（ブロック３０３０）。濃度および容量測定が収量を計算するために行なわれ、濃度が標準化されて（ブロック３０３２）、最終増幅ＲＮＡを得る（ブロック３０３４）。ＲＮＡ使い捨て用品は、システムがなお密封されて環境から隔離されていることを確認し、それにより工程に際して汚染がなかったことを保証するために、完全性が調べられる（ブロック３０３６）。中間および／または最終産品は一以上のアリコート量としてアウトプットされる（ブロック３０５０）。
【０１４４】
図２９Ａ〜２９Ｃは例示の溶出トレー１６１０を示す。示されるように、容器１６１２は、各容器１６１２の使用に際して飛散を阻止するために、間隔をあけて傾斜化される。上方へ伸びるバリア１６１４の片側に二以上の容器１６１２が存在し、主管状受容部分１６１５が浅いチャンネル１６１６へと合流するが、これは下方へテーパー化し、それが管状ボディ部分１６１５の方へ行くと深くかつ狭くなる。チャンネル１６１６の前方部分も、飛散物を捕捉して液体を主管状部分１６１５へ流させるよう、内側かつ下方へテーパー化する。
【０１４５】
図３０Ａ〜３０Ｂは廃棄トレーカバー１６４０の類似形態を示すが、容器の先端１６３２は開いているか、または廃棄物を廃棄ステーション６３２へ排出するための隙間を有している。
【０１４６】
図３１は、コンテナの内部状態を測定するためか、または構成部品（ヒーター、クーラー、ロボットアームムーブメントなど）の自動制御を行なえる望ましいフィードバックをもたらすために用いられる、センサー４０１０、４０２０、４０３０と連絡する制御回路４０００の概略図である。示されるように、制御回路４０００はユーザーインターフェース６１（図１）と連絡しうる。センサーには、ロードセンサー４０１０、温度センサー４０２０、および圧力センサー４０３０がある。ロードセンサー４０１０は、ロボットアームで加えられる係合力を制御して新たなピペットを係合するために用いられる荷重力データを提供するように、新たなピペットラックと連絡できる。温度センサー４０２０は、内部環境または閉鎖コンテナ環境（例えば、ワークステーションの一以上）内の具体的箇所に関する温度データを提供できる。圧力センサー４０３０は、単離または精製操作に際して、閉鎖環境および／または真空の、完全に密封された状態かを測定するために用いられる。センサーの各々または一部のマルチセンサーが用いられ、他のセンサーも用いてよい。制御回路４０００は全体的または部分的にシステム１０あるいは全体的または部分的にコンテナ１２に存在してもよい。
【０１４７】
当業者に明らかなように、本発明の態様は、方法、システム、データ処理システム、またはコンピュータープログラム製品として具体化されてもよい。したがって、本発明は、ここでは“回路”または“モジュール”とすべて一般的に称される、完全なソフトウェア態様またはソフトウェアとハードウェア面を合わせた態様の形態をとってもよい。更に、本発明は、コンピューター使用可能プログラムコードを媒体で具体化させるコンピューター使用可能蓄積媒体において、コンピュータープログラム製品の形態をとってもよい。ハードディスク、ＣＤ‐ＲＯＭ、光蓄積デバイス、伝達媒体、例えばインターネットまたはイントラネットを支持するもの、または磁気もしくは他の電子蓄積デバイスを含めて、いかなる適切なコンピューター読取可能媒体も利用してもよい。
【０１４８】
本発明の操作を行なうためのコンピュータープログラムコードは、Graph、LadderまたはＳＬＣのようなＰＬＣコードにより書き込んでもよい。しかしながら、コンピューターコードは、代わりにまたは加えて、オブジェクト指向プログラミングランゲージ、例えばJava（登録商標）、SmalltalkまたはＣ＋＋および／または汎用操作プログラミングランゲージ、例えば“Ｃ”プログラミングランゲージで、あるいは視覚指向プログラミング環境、例えばVisualBasicを用いて書き込んでもよい。
【０１４９】
プログラムコードのある部分（または全部）は、全体的にシステムコンピューターの一以上で、部分的にシステムコンピューターで、スタンドアローンソフトウェアパッケージとして、部分的にシステムコンピューターおよび部分的にリモートコンピューターで、または全体的にリモートコンピューターで遂行されてもよい。後者のシナリオにおいて、リモートコンピューターはローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）またはワイドエリアネットワーク（ＷＡＮ）を介してシステムコンピューターへ接続されるか、あるいは接続が（例えば、インターネットサービスプロバイダーを用いるインターネットを介して）外部コンピューターと行なわれてもよい。一部の態様では、一部のプログラムコードがローカルコンピューターで遂行され、一部のプログラムコードが一以上のローカルおよび／またはリモートサーバーで遂行されてもよい。連絡は、イメージングモダリティから得られる容量データセットを用いて、リアルタイムまたはほぼリアルタイムまたはオフラインで行なわれる。
【０１５０】
本発明は、本発明の態様に従う方法、システム、コンピュータープログラム製品、並びにデータおよび／またはシステムアーキテクチャー構造のフローチャート図および／またはブロック図を参照して、一部記載されている。図の各ブロックおよび／またはブロックの組合せがコンピュータープログラム指令で履行されることが、理解されるであろう。これらのコンピュータープログラム指令は、コンピューターまたは他のプログラム可能データ処理装置のプロセッサーを介して遂行する指令が、ブロックで特定される機能／行為を履行するための手段をもたらすように、機械を作り出す一般目的コンピューター、特殊目的コンピューター、または他のプログラム可能データ処理装置のプロセッサーへ送られてもよい。
【０１５１】
これらのコンピュータープログラム指令は、コンピューター読取可能記憶または記憶装置(storage)に蓄えられた指令がブロックで特定される機能／行為を履行する指令手段を保有した製品をもたらすように、コンピューターまたは他のプログラム可能データ処理装置を具体的に機能させるコンピューター読取可能記憶または記憶装置に蓄えてもよい。
【０１５２】
コンピュータープログラム指令は、コンピューターまたは他のプログラム可能装置で遂行する指令が、ブロックで特定される機能／行為を履行するための手段をもたらすように、コンピューターまたは他のプログラム可能装置で行なわれる一連の作動工程にコンピューター履行工程を行なわせるため、コンピューターまたは他のプログラム可能データ処理装置へ積載してもよい。
【０１５３】
図３２において示されるように、本発明の態様は、レンダリングの作動を行なうまたは指示するために用いられ、プロセッサー回路４１００、メモリー４１３６、およびインプット／アウトプット回路４１４６を保有する、データ処理システム４１１６として形成されてもよい。データ処理システムは、例えばプログラム可能ロジックコントローラー（ＰＬＣ）、パーソナルコンピューター、ワークステーション、サーバー、ルーターなどのうち一以上に組み込まれてもよい。システム４１１６は、一つの機械または複数の機械間に存在する。プロセッサー４１００はアドレス／データバス４１４８を介してメモリー４１３６と連絡し、アドレス／データバス４１４９を介してインプット／アウトプット回路４１４６と連絡する。インプット／アウトプット回路４１４６は、例えばインターネットプロトコール（ＩＰ）接続を用いて、メモリー（メモリーおよび／または蓄積媒体）４１３６と他のコンピューターシステムまたはネットワークとの間で情報を伝達するために用いられる。これらの構成部品は、ここで記載されているように作動するよう形成される、多くの汎用データ処理システムで用いられるもののような、汎用構成部品でよい。
【０１５４】
特に、プロセッサー４１００は市販またはカスタムマイクロプロセッサー、マイクロコントローラー、デジタルシグナルプロセッサーなどである。メモリー４１３６には、本発明の態様に従い用いられる機能性回路またはモジュールを履行するために用いられるソフトウェアおよびデータを保有した、あらゆるメモリーデバイスおよび／または蓄積媒体を含んでよい。メモリー４１３６には次の種類のデバイス：ＲＯＭ、ＰＲＯＭ、ＥＰＲＯＭ、ＥＥＰＲＯＭ、フラッシュメモリー、ＳＲＡＭ、ＤＲＡＭ、および磁気ディスクがあるが、それらに限定されない。本発明の一部の態様において、メモリー４１３６は連想記憶装置（ＣＡＭ）でもよい。
【０１５５】
更に図３２において示されるように、メモリー（および／または蓄積媒体）４１３６は、データ処理システムで用いられるソフトウェア、およびデータのいくつかのカテゴリー：作動システム４１５２、アプリケーションプログラム４１５４、インプット／アウトプットデバイスドライバー４１５８、およびデータ１４５６を保有してよい。当業者に明らかなように、作動システム４１５２はデータ処理システムで使用に適したいずれかの作動システム、例えばＩＢＭ、ＯＳ／２、ＡＩＸ、もしくはｚＯＳ作動システムまたはMicrosoft Windows ９５、Windows ９８、Windows２０００、WindowsＸＰ、またはWindowsＣＥ作動システム、Unix（登録商標）またはLinuxであってもよい。ＩＢＭ、ＯＳ／２、ＡＩＸおよびｚＯＳは米国、他の国または双方におけるInternational Business Machines Corporationの商標名であり、一方Linuxは米国、他の国または双方におけるLinus Torvaldsの商標名である。MicrosoftおよびWindowsは米国、他の国または双方におけるMicrosoft Corporationの商標名である。インプット／アウトプットデバイスドライバー４１５８は、典型的には、インプット／アウトプット回路４１４６およびあるメモリー４１３６構成部品のようなデバイスと連絡するために、アプリケーションプログラム４１５４により作動システム４１５２を介して接近されるソフトウェアルーチンを保有している。アプリケーションプログラム４１５４は、本発明の一部態様に従い回路およびモジュールの様々な特徴を履行するプログラムの例である。最後に、データ１４５６は、メモリー４１３６に存在しうるアプリケーションプログラム４１５４、作動システム４１５２、インプット／アウトプットデバイスドライバー４１５８および他のソフトウェアプログラムにより用いられる静的および動的データを表す。
【０１５６】
データ１４５６は、（実質的にリアルタイム、アーカイブまたは蓄積された）工程配列データセット４１２６および／または閉鎖環境センサーフィードバックデータ４１２７を保有してもよい。更に図３２において示されるように、本発明の一部態様によると、アプリケーションプログラム４１５４は自動工程配列および測定モジュール４１２５を保有する。アプリケーションプログラム４１５４はローカルサーバー（またはプロセッサー）および／またはデータベースまたはリモートサーバー（またはプロセッサー）および／またはデータベース、またはローカルおよびリモートデータベースおよび／またはサーバーの組合せに置かれてもよい。
【０１５７】
本発明は、図３２においてアプリケーションプログラム４１５４を参照して説明されているが、当業者に明らかなように、他の形態も本発明の範囲内に属する。例えば、アプリケーションプログラム４１５４よりむしろ、これらの回路およびモジュールは作動システム４１５２またはデータ処理システムの他のこのようなロジカル部分へ組み込んでもよい。更に、アプリケーションプログラム４１５４が単一データ処理システムで説明されているが、当業者に明らかなように、このような機能性は、例えば上記のクライアント／サーバーアレンジメントの種類に応じて、一以上のデータ処理システムにまたがり分配してもよい。このように、他のアレンジメントおよび／またはデータ処理システム間の機能の分割により提供されるように、本発明は図３２において示された形態に限定されると解釈するべきでない。例えば、図３２は様々な回路およびモジュールを有するとして説明されているが、これら回路またはモジュールのうち一以上が本発明の範囲から逸脱することなく結合または分離されていてもよい。
【０１５８】
他の態様
前記の例示システム１０は本発明の様々な態様および特徴を説明するために呈示されたが、本発明の範囲を核酸処理のシステム、デバイス、および方法に限定するためのものではない。むしろ、例えば、典型的には閉鎖コンテナで、物品を作製、組立て、処理、または操作するシステムおよび方法を含めて、様々な他の適用が本発明の範囲内に属する、と当業者であれば理解するであろう。下記の項目は、本発明の装置および方法が用いられる適用の追加例を呈示す。
【０１５９】
他の生物学および／または薬的適用の例
他の態様において、本発明は供給源から閉鎖環境の標的へ物質、例えば流体を移動する方法を提供し、ここで閉鎖環境は本出願で記載されているような装置のコンテナ中の内部区域またはチャンバーとして規定される。移動される流体としては、例えば生物学的物質、薬物、毒素、単離物、放射性同位元素、ウイルス、細菌、真核細胞、抽出物、被検体、生物試料、例えば血液、血漿、唾液など、ワクチン、核酸、タンパク質、食品、およびそれらの懸濁物、混合物などを含めたその他がある。
【０１６０】
本システムおよび方法の適用によると、例えば、閉鎖環境内へ移動される物質の汚染がコンテナ外の環境に存在しうる物体により避けられることを見出した。ある態様において、該システムおよび方法は、限定されないが、無菌性アッセイ、犯罪科学分析、または例えば臨床分野で用いられる生物学的物質の純度を試験する品質制御アッセイのような診断アッセイのための、またはそこにおいて物質を処理するための、物質の調製に関する。他の態様において、本方法は実験および／または臨床向けに薬物および生物学的物質、例えばワクチンおよび核酸の調製または製造のためである。本発明のシステムおよび方法で使用に適した様々なアッセイおよび方法論が、例えばUnited States Pharmacopeia,United States Pharmacopeia and National Formulary(USP 29-NF24)(2006),U.S.Department of Health and Human Services,Guidance for Industry:Sterile Drug Products Produced by Aseptic Processing - Current Good Manufacturing Practice(September 2004)で記載されているように、当業者に知られ、その各々が引用することにより本明細書の開示の一部とされる。
【０１６１】
流体が移動される標的は、移動流体を保持するように意図された、例えば管、バイアル、容器などのように、いかなる容器でもよいことが、当業者により理解されるであろう。一部の態様において、標的は結合カラム、サイズ排除カラム、クロマトグラフィー媒体、またはフィルターなどのような支持体である。しかしながら、提供される方法の具体的適用に応じて、あらゆるフロースルーデバイス、即ち移動流体の一以上の成分を流体の他の成分から捕捉および／または分離および／または濃縮するように意図されたあらゆるデバイスが用いられる。
【０１６２】
図１４は、閉鎖環境に置かれた結合カラム１４１０が、例えば核酸を含有する移動流体の標的である、例示装置の形態の例である。他の態様では、図１４において記載されたマニホールドが上記フィルターまたは他のデバイスと適合するように適合化される。
【０１６３】
一部の態様において、本発明により提供されるシステムおよび方法によれば、細胞抽出物からＲＮＡを単離して、単離されたＲＮＡの少なくとも一つのＲＮＡ分子から核酸産物を増幅させる工程を含んでなる、増幅核酸産物の無菌製造を行なえ、その際に単離および増幅工程は本出願で記載されているような装置のコンテナで内部区域またはチャンバーとして規定されているような閉鎖環境で行なわれ、それにより増幅核酸産物を無菌的に製造できる。
【０１６４】
増幅核酸産物の無菌製造のためのある態様において、増幅核酸産物は病原体から、例えばウイルス病原体から誘導される。ある態様において、増幅核酸産物はヒト腫瘍ＲＮＡから誘導される。ヒト腫瘍ＲＮＡからの増幅核酸産物は、例えばワクチンの製造または免疫療法において用いられる。
【０１６５】
本方法は、無菌条件下において、物質、例えば米国法典連邦規則第２１編で規定されているような生物学的物質、核酸、および／またはタンパク質などの滅菌に用いられる。臨床分野において、このような物質の調製に関するガイドラインは、例えばU.S.Department of Health and Human Services,Guidance for Industry:Sterile Drug Products Produced by Aseptic Processing - Current Good Manufacturing Practice(September 2004)において記載されている。
【０１６６】
このように、ある態様において、供給源からの物質を含んでなる流体をフィルターへ移動し、フィルター通過後の物質を容器へ集める、物質の滅菌のための方法が提供され、そこでは供給源、フィルター、および容器が本出願において記載されているような装置のコンテナで内部チャンバーまたは区域として規定されているような閉鎖環境に保有されている。滅菌用のフィルターは、例えばWhatman Inc.（Florham Park，ＮＪ）から市販されている。
【０１６７】
物質を移動すこと、例えば物質をバイアルへ分配することは、物質が病原体、例えばＨＩＶウイルス、または他のある微生物を含むか、または生物毒素または放射性物質を含むならば危険であることも、認められるであろう。本発明の態様で規定されているような閉鎖環境においてこのような物質を容器へ移動することは、移動を行なう個体への危険物質の潜在的な暴露を減らすために用いられる。このように、ある態様において、危険物質が供給源から、閉鎖環境、例えば本出願において記載されているような装置のコンテナに存在する標的へ移動される方法が提供される。これらの方法は、当業者に知られるように、危険物質が供給源および標的間で移動される様々な操作およびアッセイに適用される。
【０１６８】
本発明の装置は、タンパク質精製、核酸精製、および他の分子生物学的工程を典型とする他の分野に用いてもよい。このような適用には細胞溶解（例えば、細胞の機械的、カオトロピック、熱または酵素溶解）、高分子精製（例えば、イオン交換、ビーズ、分子量カットオフ）、および回収（シリカ溶出、ビーズ溶出、膜溶出）があるが、それらに限定されない。
【０１６９】
例示のリソグラフィー、マイクロ作製、および関連適用
本発明の態様は、クリーンルーム条件が用いられるまたは単離が望まれる状況、例えばリソグラフィーおよび組立て工程で用いられる。一部の態様において、本発明の装置はクリーンルーム分類について米国連邦標準２０９ｂにおいて記載のクラス１、クラス１０、クラス１００、クラス１０００、クラス１０，０００、またはクラス１００，０００クリーンルームの条件を満たす。引用することにより本明細書の開示の一部とされる、１９７３年４月２４日付のFederal Standard No.209B,1992,”Clean Room and Work Station Requirements,Controlled Environment”参照。このように、本発明の態様はクリーンルーム環境を用いる広域スペクトルの工程に用いられる。このような工程にはウェハーパターニング（フォトマスキング、マスキング、フォトリソグラフィー、マイクロリソグラフィーとしても知られる）、ドーピング（例えば、熱拡散、イオン注入）、熱処理（例えば、熱、輻射）のようなリソグラフィー工程を含むが、それらに限定されない。本発明の装置で行なわれる具体的なパターニング工程には、（ｉ）レジストアプリケーション（ポジティブまたはネガティブ）、（ii）高圧水銀、Ｘ線、またはＥ‐ビームへの暴露（例えば、接触、接近、走査プロジェクション、およびステッパー）、(iii)イメージング（例えば、単層レジスト、多層レジスト、アンチリフレクター層の適用、軸外光照明、平坦化、コントラスト強調）、および（iv）エッチ（例えば、湿式化学‐液体／蒸気、ドライ、プラズマ、リフト‐オフ、イオンミリング、反応性イオンエッチング）があるが、それらに限定されない。具体的な熱処理工程にはホットプレート、対流、急熱処理（ＲＴＰ）、および赤外があるが、それらに限定されない。これらリソグラフィー工程の更なる記載は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Van Zant,Microchip Fabrication,Fourth Edition,Chapter 4,2000,McGraw-Hill,New Yorkにおいて記載されている。
【０１７０】
一般的なリソグラフィー技術に加えて、本発明の装置は次世代リソグラフィー、例えば超紫外線リソグラフィー、Ｘ線リソグラフィー（例えば、ＬＩＧＡ）、荷電粒子ビームリソグラフィー（例えば、電子ビーム、イオンビーム）、走査プローブリソグラフィー（例えば、走査型トンネル顕微鏡リソグラフィー、原子間力顕微鏡リソグラフィー、走査型電気化学顕微鏡リソグラフィー）、ソフトリソグラフィー（例えば、レプリカ成形、マイクロコンタクト印刷、キャピラリーでのマイクロ成形、マイクロ移動成形、溶媒補助マイクロ成形、エラストマー相移動マスクを用いる近接場コンフォーマルフォトリソグラフィー）および三次元リソグラフィー（例えば、ホログラフリソグラフィー、非平面基板上リソグラフィー）を収納するために用いられる。このような技術は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,2002,CRC Press LLC Boca Raton,Florida,pp.48-68において記載されている。
【０１７１】
本発明の態様は、例えば免疫センサーにおいて検出現場で競合する非特異的タンパク質吸収の問題を扱う、タンパク質パターニングマイクロリソグラフィー技術に用いられる。例えば、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Clementi et al.,Structure and Motion:Membranes,Nucleic Acids and Proteins,Adenine Press,Schenectady,New York,1985参照。
【０１７２】
本発明のデバイス、システム、装置、および方法は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,2002,CRC Press LLC Boca Raton,FloridaのChapter ２で開示されるような、ドライエッチング技術、例えば物理的エッチング（例えば、イオンエッチング、スパッタリング、イオンビームミリング）、プラズマエッチング（例えば、ラジカルエッチング）、物理的／化学的エッチング、深反応性イオンエッチング、無プラズマの蒸気相エッチング、ドライエッチング、および単結晶反応性エッチング金属化（ＳＣＲＥＡＭ）を行なうために用いられる。
【０１７３】
本発明の装置は引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,2002,CRC Press LLC Boca Raton,FloridaのChapter ３において開示されるような、シリコン成長、シリコンのドーピング、シリコンの酸化、物理的蒸気拡散（例えば、熱蒸発、スパッタリング、分子ビームエピタキシー、レーザースパッター蒸着、アブレーション蒸着、イオンプレーティング、クラスタービーム技術）、化学的蒸着、シルクスクリーニング（スクリーン印刷）、ゾル‐ゲル蒸着、プラズマスプレー法、スプレー熱分解およびプラズマビーム蒸着のような付着技術でパターン移動を行なうために用いられる。
【０１７４】
本発明の態様は、ある種類のアレイ形態でよくアレンジされる、化学および生物学的センサーに有機物質を蒸着させるための技術を包含した、BIOMEMS分野において用いられる蒸着およびアレイ方法において特に有用であってもよい。このような技術は、例えば有機ガス透過性膜、イオン選択性膜、ヒドロゲル、室温ガスセンサーに必要な有機単層、イオン選択性電極、酵素センサー、免疫センサーとＤＮＡおよびタンパク質アレイを作るために用いられる。本発明の装置で履行されるBIOMEMS分野の具体的技術は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,pp.159-167,2002,CRC Press LLC Boca Raton,Floridaにおいて開示されるような、スピンコーティング、ディップコーティング、、プラスチックスプレー法、鋳造、活字鋳造(type casting)、グロー放電（プラズマ）重合、Langmuir-Blogett工程、インクジェット法、マイクロスポット法、および機械的マイクロスポット法である。
【０１７５】
本発明の態様は、小さなデバイス（例えば、集積回路）の包装のような、他のクリーンルーム分野にも用いられる。本発明の装置を用いて行なえる具体的包装技術としては、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,pp.478-508,2002,CRC Press LLC Boca Raton,Floridaにおいて開示される、集積回路の包装、ダイシング、キャビティシーリングおよびボンディング、マルチ‐チップ包装、並びにパーティショニングがあるが、それらに限定されない。
【０１７６】
本発明の態様は、リソグラフィー工程でフォトレジストの分野に用いられる。例えば、本発明の装置はクリーンルーム環境で基板にポジティブまたはネガティブフォトレジストを載せるために用いられる。このように、レジストスピンコーティング、ソフトベーク、ハードベーク、デベロップメント、暴露後ベーク、および多層レジスト工程のような工程が、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Levinson,Principles of Lithography,SPIE Press,Bellingham,Washington,2001,Chapter 3で開示されるように、本発明の装置で行なえる。本発明の装置は、リソグラフィー工程、例えば光学リソグラフィー、電子ビームリソグラフィー、Ｘ線リソグラフィー、深ＵＶレジストアプリケーション、フォトマスク作製、並びに引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Microlithography,Micromachining and Microfabrication,ed.Rai-Choudhury,SPIE Press,Bellingham,Washington,2001,Chapter 1-6において記載されているようなリソグラフィーにおけるメトロロジー法に用いられる。本発明のシステム、デバイス、装置、および方法は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Handbook of Photovoltaic Science and Engineering,Luque and Gegedu eds.,John Wiley & Sons,West Sussex,England,2003,pp.271-279において開示されるように、リン拡散、エッジアイソレーション、ＡＲＣ蒸着、フロントコンタクト印刷、バックコンタクト印刷、コファイアリング、テスティングおよびソーティングに限定されないが、それらを含めた光電池を作製するために用いられる方法を履行するために、更に用いられる。
【０１７７】
ここで引用されたすべての参考文献は、各個別刊行物または特許または特許出願が引用することにより本明細書の開示の一部とされる具体的かつ個別に示されるのと同程度に、引用することにより本明細書の開示の一部とされる。しかしながら、引用することにより本明細書の開示の一部とされた文献は、係属出願またはそれで発行する特許の請求項要素の解釈を狭めるようには用いられない。
【０１７８】
前述の記載および図面は本発明の態様を表しているが、添付請求項において規定されるような本発明の精神および範囲から逸脱することなく、様々な付加、修正、および置換がそこでなしうると理解されるであろう。特に、本発明が、その精神または本質的特徴から逸脱することなく、他の特別な形態、構造、アレンジ、割合と他の要素、物質および構成部品で具体化されうることは、当業者に明らかであろう。したがって、現在開示される態様はすべての点において限定ではなく説明としてみなされるべきで、本発明の範囲は添付された請求項により示されており、前述の記載に限定されない。
【図面の簡単な説明】
【０１７９】
本発明の他の特徴は、添付図面と合わせて読むことにより、その例示態様の下記詳細な記載からより容易に理解され、そこでは同一参照番号は同一要素を表す。図面は単独でまたは他の特徴と合わせて用いられるある特徴を図解するための単なる例示にすぎず、本発明が示された態様に限定されることはない。一つの態様または図に関して示された特徴は、他の態様または図で用いられてもよい。
【図１】図１は、本発明の態様に従う処理システムの斜視図である。
【図２】図２は、作業表面に隔離コンテナを保有する、図１のシステムの上部分の側面図である。
【図３】図３は、隔離コンテナなしで示された、図１のシステムの作業表面の一つの態様の斜視図である。
【図４】図４は、柔軟性のあるバリアが本発明の態様に従い、まだ取り付けられていない、隔離コンテナアセンブリーの斜視図である。
【図５】図５は、本発明の態様に従う隔離コンテナアセンブリーの破断(cutaway)斜視図である。
【図６】図６は、図５の隔離コンテナアセンブリーの破断斜視図である。
【図７Ａ】図７Ａおよび７Ｂは、本発明の態様に従うシリンジポンプシステムの側面図である。
【図７Ｂ】図７Ａおよび７Ｂは、本発明の態様に従うシリンジポンプシステムの側面図である。
【図８Ａ】図８Ａおよび８Ｂは、本発明の態様に従い流体ポンプシステムと協同するように適合させたピペットヘッドの横断側面図である。
【図８Ｂ】図８Ａおよび８Ｂは、本発明の態様に従い流体ポンプシステムと協同するように適合させたピペットヘッドの横断側面図である。
【図８Ｃ】図８Ｃは、本発明の態様に従い、図８Ａのピペットヘッドにおいて用いられる柔軟性のある隔離隔壁の上面図である。
【図８Ｄ】図８Ｄは、図８Ｃにおいて示された柔軟性のある隔離隔壁の断面図である。
【図９Ａ】図９Ａおよび９Ｂは、本発明の態様に従う柔軟性のあるバリアの、各々斜視および断面図である。
【図９Ｂ】図９Ａおよび９Ｂは、本発明の態様に従う柔軟性のあるバリアの、各々斜視および断面図である。
【図９Ｃ】図９Ｃおよび９Ｄは、柔軟性のあるバリアの他の態様の、各々斜視および横断側面図である。
【図９Ｄ】図９Ｄおよび９Ｄは、柔軟性のあるバリアの他の態様の、各々斜視および横断側面図である。
【図９Ｅ】図９Ｅは、本発明の態様に従い、部分断面図により示されたバリアにおけるカップラー、一体カップラーを有する柔軟性のあるバリアの斜視図である。
【図９Ｆ】図９Ｆは、本発明の態様に従い、図９Ｅにより示されたバリアカップラーを係合するように形成されたカップラーを有するロボットアームの一部の斜視図である。
【図９Ｇ】図９Ｇは、透明に破線で示された内部構成部品を覆う外部ハウジングを有する、（柔軟性のあるバリアなしで）図９Ｅおよび９Ｆにより示された構成部品のアセンブリーの斜視図である、
【図９Ｈ】図９Ｈは、柔軟性のあるバリアが本発明の態様に従い取り付けられた、図９Ｇにより示されたアセンブリーの斜視図である。
【図１０】図１０は、本発明の態様に従うＰＣＲプレートおよびサーマルサイクラーリッドアセンブリーの断面図である。
【図１１】図１１は、本発明の態様に従いサーマルサイクラーリッド駆動系を有する、サーマルサイクラーアセンブリーの斜視図である。
【図１２】図１２は、本発明の態様に従い、コンテナの柔軟性のあるサーマルサイクラーリッドシールの使用時における、図１１のサーマルサイクラーリッド駆動系の斜視図である。
【図１３Ａ】図１３Ａおよび１３Ｂは、本発明の態様に従うコンテナの作業スペース内外へのサーマルリッドの運動に際する、図１２のリッドシールの断面図である。
【図１３Ｂ】図１３Ａおよび１３Ｂは、本発明の態様に従うコンテナの作業スペース内外へのサーマルリッドの運動に際する、図１２のリッドシールの断面図である。
【図１３Ｃ】図１３Ｃは、図１３Ａおよび１３Ｂにおいて示されたリッドシールおよびコンテナの部分破断側面斜視図である。
【図１４】図１４は、本発明の態様に従いＤＮＡおよびＲＮＡ結合カラムを収納するためのマニホールドの斜視図である。
【図１５】図１５は、本発明の態様に従いステーション間でマニホールドを動かすためのピペットヘッドと係合時における、図１４のマニホールドの斜視図である。
【図１６】図１６は、本発明の態様に従い隔離コンテナで使用前の閉鎖真空システムを表した概略側面図である。
【図１７】図１７は、本発明の態様に従う隔離コンテナで使用時の、図１６の真空システムの概略側面図である。
【図１８】図１８は、本発明の態様に従い湿度および蒸気濃度を制御するための冷却ユニットを示す、隔離トレーの破断での処理システム作業表面の斜視図である。
【図１９Ａ】図１９Ａは、本発明の態様に従い隔離トレーへ取り付けられたキュベットの断面斜視図である。
【図１９Ｂ】図１９Ｂは、本発明の態様に従う分光光度計キュベット測定システムの協同構成部品の側面斜視図である。
【図２０Ａ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｂ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｃ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｄ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｅ】図２０Ｅは、本発明の態様に従い図２０Ａ〜２０Ｄに関して記載されているように作動しうる、マルチキュベット容量測定システムの上面、側面斜視図である。
【図２０Ｆ】図２０Ｆは、本発明の態様に従いコンテナの区画下へ出たキュベットを表す、図４および５において示されたコンテナの底面斜視図である。
【図２１Ａ】図２１Ａは、本発明の態様に従う試薬ラックの斜視図である。
【図２１Ｂ】図２１Ｂは、本発明の態様に従う穴あけ技術を表す、図２１Ａにおいて示された試薬ラックの概略上面斜視図である。
【図２２】図２２は、本発明の態様に従うアリコート管機構の作動を示した、一連の概略図である。
【図２３Ａ】図２３Ａは、本発明の態様に従い隔離コンテナトレー中へ積載される構成部品を示した図である。
【図２３Ｂ】図２３Ｂは、本発明の態様に従い図２３Ａにおいて示されたキット構成部品を用いる、部分組立てコンテナの上面斜視図である。
【図２３Ｃ】図２３Ｃは、図２３Ｂにおいて示された部分組立てキットの底面図である。
【図２３Ｄ】図２３Ｄは、キット構成部品が本発明の態様に従い使用現場で取り付け前の、図２３Ａにおいて示されたキットにおけるコンテナの上面図である。
【図２４】図２４は、本発明の態様に従う柔軟性のあるバリアでのトレーのシーリングを示した、図２３Ａの隔離コンテナトレーの分解組立図である。
【図２５】図２５は、本発明の態様に従い行なわれる作動のフローチャートである。
【図２６Ａ】図２６Ａおよび２６Ｂは、本発明の態様に従うレバー付きピペットヘッドの拡大側面斜視図である。
【図２６Ｂ】図２６Ａおよび２６Ｂは、本発明の態様に従うレバー付きピペットヘッドの拡大側面斜視図である。
【図２６Ｃ】図２６Ｃは、本発明の態様に従いピペットチップを解放するようなコンテナの内部表面との係合を示した、図２６Ａおよび２６Ｂにおいて示されたレバーの側面斜視図である。
【図２７】図２７は、本発明の態様に従い機器にコンテナを積載するために用いられる、トロリーの上面斜視図である。
【図２８Ａ】図２８Ａは、本発明の態様に従いロボットアームでコンテナを並べられる、バイアスアセンブリー形態による作業表面の拡大側面斜視図である。
【図２８Ｂ】図２８Ｂは、本発明の態様に従い所望方向にコンテナを押し出すために用いられるスプリングを示した、図２８Ａにおいて示される作業表面の一部の底面斜視図である。
【図２９Ａ】図２９Ａは、本発明の態様に従う溶出トレーの上面図である。
【図２９Ｂ】図２９Ｂは、図２９Ａにおいて示されたトレーの底面斜視図である。
【図２９Ｃ】図２９Ｃは、図２９Ａにおいて示されたトレーの上面斜視図である。
【図３０Ａ】図３０Ａは、廃棄トレーカバーの上面斜視図である。
【図３０Ｂ】図３０Ｂは、図３０Ａにおいて示されたトレーカバーの底面斜視図である。
【図３１】図３１は、本発明により考えられる自動システムで用いられる回路のブロック図である。
【図３２】図３２は、本発明の態様に従うデータ処理システムのブロック図である。
【関連出願】
【０００１】
この出願は２００６年１月１８日付で出願された米国仮出願第６０／７６０，０８７号に対する優先権の利益を主張しており、その内容はここですべて記述されるとして、引用することにより本明細書の開示の一部とされる。
【発明の背景】
【０００２】
発明の分野
本発明は、サンプルおよび物質の自動処理に関し、閉鎖環境において核酸を処理するために特に適している。
【０００３】
背景技術
核酸ベース増幅反応は、試験サンプルで病気の診断および／または病原生物の特定を補助するために、研究所および臨床検査室において広く用いられている。このような増幅反応は、例えば、患者自身の腫瘍細胞に由来する自己ワクチンを含めた、ワクチンの開発にも用いられる。腫瘍組織から単離された核酸の増幅によれば、小さな腫瘍からでも自己ワクチン生産を行え、したがって最小の全身腫瘍組織量(tumor burden)の患者も治療しうる機会を得られる。
【０００４】
一般的には、現在知られている増幅スキームは、変性温度、プライマーアニーリング温度、およびアンプリコン（核酸の酵素増幅の産物）合成温度間の温度の連続サイクリングにより酵素増幅反応が行なわれるか否か、または温度が酵素増幅工程（等温増幅）を通して一定に保たれるか否かに基づいて、概して二つのクラスに分類される。典型的なサイクリング核酸増幅技術（サーマルサイクリング）は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）およびリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）である。このような反応の具体的プロトコールは、例えばShort Protocols in Molecular Biology,2nd Edition,A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology,(Eds.Ausubel et al.,John Wiley & Sons,New York,1992)chapter 15において記載されている。等温反応としては、転写媒介増幅（ＴＭＡ）、核酸配列ベース増幅（ＮＡＳＢＡ）、および鎖置換増幅（ＳＤＡ）がある。
【０００５】
核酸増幅は、例えば米国特許第４，６８３，１９５号、第４，６８３，２０２号、第５，１３０，２３８号、第４，８７６，１８７号、第５，０３０，５５７号、第５，３９９，４９１号、第５，４０９，８１８号、第５，４８５，１８４号、第５，４０９，８１８号、第５，５５４，５１７号、第５，４３７，９９０号、および第５，５５４，５１６号において記載されている。これらの特許において記載された方法がクローニングを要することなく核酸の増幅および検出を行なえ、核酸配列の高感度アッセイに寄与していることは周知である。しかしながら、核酸増幅で可能な検出の感度とともに、極少量の望ましくない外来核酸配列による汚染の危険が極めて大きいことも、同様によく認識されている。増幅反応の有用性は、望ましくない外来核酸および他の汚染物の導入を制御する方法により高められる。
【０００６】
特に、例えば自家療法用のワクチンのような治療剤の生産を含めた、生物サンプルの処理のために、現行の適正製造基準（ＧＭＰ）は典型的には無菌環境で製造を要する。
【０００７】
したがって、核酸および他のサンプルを処理するための自動システムおよび方法を提供する必要性が当業界に存在する。
【発明の概要】
【０００８】
本発明の態様は、一以上のサンプルの自動処理のためのシステム、装置、および方法に関する。該システムは閉鎖環境において物品を操作するために用いられ、医学、診断、バイオテクノロジー、エレクトロニクス、およびナノテクノロジーの分野で特に有用である。本発明の態様は、組織、血液、血液製品、核酸（例えば、ＲＮＡ、ＤＮＡ）、タンパク質、細胞培養物などに限定されないが、それらを含めた生物サンプルの処理と特に関連している。
【０００９】
本発明の態様は、閉鎖コンテナにおいて一以上の物品を操作するための装置を提供する。ここでは“隔離コンテナ”とも称される該コンテナは、扱われるいくつかの物品を保持しうるように形成された内部チャンバーを形成するトレーと、内部エリアをカバーしてコンテナトレーで密封するように形成および寸法化された柔軟性のあるバリアとを含んでなる。内部エリア内において物品を操作するためのツールが、柔軟性のあるバリアに取り付けられているか、またはそれとともにもしくはその中に組み込まれる。
【００１０】
該ツールは、ロボットデバイスに取り付けられるよう構成された、バリアの外側から接近可能な第一インターフェースを有しうる。柔軟性のあるバリアがコンテナで密封された場合内部エリア内に配置されるように、該ツールはバリアの反対側から伸びる第二インターフェースも保有できる。ロボットデバイスが第一インターフェースに取り付けられた場合、該ツールはコンテナ内で物品を操作しうるように形成できる。一部の態様において、閉鎖コンテナ中、一以上の物品としては、例えば、核酸、他のサンプル、試薬、洗浄液、ピペットチップ、容器、他の消耗品、および／またはそれらの組合せがある。他のツールまたはデバイス、例えばコンテナ内においてサンプルまたは他の物品を処理、操作、測定、分析、サンプリング、および／または貯蔵するためのツールもしくはデバイスも、コンテナ内に配置してよい。
【００１１】
一部の態様において、核酸および他のサンプルの自動処理のためのシステムおよび方法は、トレーと、該トレーで密封するように形成された柔軟性のあるバリアとの一回用使い捨て隔離コンテナアセンブリーを保有し、それにより密封されたトレー内に閉鎖作業エリアを設ける。閉鎖作業エリアは無菌でもよい。
【００１２】
ピペットヘッドおよび／または他のサンプル操作デバイスが、バリアの内側に取り付けられ、そしてバリアは密封された作業エリア内で物品を操作するために用いられるロボットアームまたは他のデバイスのためのインターフェースを保有できる。バリアがトレーに密封されている場合、該バリアはロボットまたは他の操作デバイスからトレーの内容物を分離している。バリアは柔軟性があり、ロボットアームによりトレーの作業エリア中くまなくピペットヘッドまたは他のサンプル操作デバイスを動かせる。核酸サンプルを処理するための全サンプル、試薬、ピペットチップ、および他の消耗品、ツールもしくはデバイスが、処理に際して隔離コンテナにより設けられた閉鎖区画内に留められてもよい。
【００１３】
他の態様において、核酸（例えば、ＲＮＡおよび／またはＤＮＡ）を処理する方法は、例えばオペレーター、他の対象者、または外部環境から、対象物質を望ましくない生物物質において汚染の危険を減らすために、使い捨て（一回用）隔離コンテナを利用する。一部の態様において、隔離コンテナは、次のもの：腫瘍組織、血液、血液製品、細胞、病原体などのうち一種以上に限定されないが、それらを含めた生物サンプルからのＲＮＡ単離用に設計されている。具体的な態様において、生物サンプルは腫瘍ホモゲネートを含んでなり、システムは清澄化された腫瘍ホモゲネートをインビトロ転写（ＩＶＴ）ＲＮＡへ変換するためのすべての特徴および機能性を発揮する。
【００１４】
典型的には、隔離コンテナの内側のみが対象物質に暴露され、それにより処理システムで生じうる汚染を防ぎ、システムにより処理される連続対象サンプル間における洗浄の必要性を減らす。一部の態様において、処理システムは一つの隔離コンテナにおいて諸サンプルを一度に処理する。他の態様において、該システムは二以上の隔離コンテナにおいて諸サンプルを実質上同時に処理しうるように形成できる。
【００１５】
一部の態様において、本発明は、隔壁(diaphragm)によりサンプルデバイスから分離された、作業液および作業液ポンプを含んでなる、流体の移動用の装置を提供する。使用時、隔壁越しに伝えられる圧力の変化により、例えば作業液ポンプが作業液の圧力を変えた場合における隔壁の動きにより、サンプルまたは他の流体がサンプルデバイス中へ吸引またはそこから排出される。一つの態様において、サンプルデバイスは、流体サンプルを取込、分配、および／または混合するための、および／またはサンプル、試薬または他の流体をある箇所から他の箇所へ移動するためのピペットチップまたは他の管である。ピペットチップまたは管はいかなる適切な形状および大きさでもよい。
【００１６】
更に他の態様において、本発明は、少なくとも一つの光源またはエミッターと少なくとも一つのレシーバー（キュベットが流体を含有しているかまたは空であるかに応じてレシーバーが光路における変化を検出しうる光路で形成されたキュベット）およびキュベットから取り出された流体の容量を調べられるようにレシーバーと連絡した流体移動デバイスを含んでなる、流体の容量を測定するための装置を提供する。
【００１７】
他の態様は、生物サンプル処理コンテナに関する。該コンテナは、第一ワークステーションがサーマルブロック（例えば、シングル管、マルチウェルプレートまたはストリップ、ＰＣＲプレートなど）でインキュベート用の容器を保持するように形成され、第二ワークステーションが試薬を保持するように形成され、および第三ワークステーションがピペットを保持するように形成された、実質的に硬質のボディを有する一回用使い捨てトレーを含む。
【００１８】
一部の態様は、トレーに密封して、密封された閉鎖内部チャンバーを形成するように形状化された外部エッジ部分を有する、柔軟性のあるバリアに関する。該柔軟性のあるバリアはエラストマーを含有し、バリアの中央部分でロボットアームインターフェースに密封可能に取り付けられる。
【００１９】
更に他の態様は、自動ピペットチップ取外しシステムに関する。該システムは：（ａ）側壁を有するトレー、および（ｂ）トレー側壁と接触し、それにより該側壁との接触でレバーをピボットへ押しやり、操作ツールにより保持された各使用済みピペットチップを解放するように形成された、外方へ伸びるレバーを有する操作ツールと一体化したロボットアームを保有する。一部の態様において、トレーは操作ツールレバーと接触する傾斜側壁を有する。
【００２０】
一部の態様は、液体を処理するためのシステムに関する。該システムは：（ａ）ロボットアーム、および（ｂ）ロボットアームと協同する操作ツール（該ツールは、ピペットチップを解放可能に係合し、カバーの付いた穴あきオープニングの一つを介して容器から流体を取り出す前に、自動的に並進して異なる間隔の箇所で複数回にわたり容器のカバーを穴あけするように形成される）を含む。
【００２１】
他の態様は溶出トレーに関する。該トレーは、上方へ伸びるバリアの第一側面に複数およびバリアの反対側面に複数の、間隔をあけた複数の容器を有する無菌生体適合性溶出トレーである。該容器は、その各側面に伸びて主管状部分の方向で下方へテーパー化する、チャンネルを有する。
【００２２】
更に他の態様は、自動処理システムにおいて使用されるキットに関する。該キットは：（ａ）トレーとそれに密封可能に取り付けられるよう構成された柔軟性のあるバリアを含んでなる一回用使い捨てコンテナ、（ｂ）第一ワークステーションでコンテナに存在するように形成された一回用使い捨て試薬ラック、（ｃ）コンテナに存在するように形成された一回用使い捨て結合カラムマニホールド(manifold)、および（ｄ）コンテナに存在するように形成された一回用使い捨てピペットラックを保有する。
【００２３】
一部の態様は、液体を移動する方法に関する。該方法は：（ａ）ピペットチップを解放可能に保持するインターフェースツールを動かすために、ロボットアームをプログラムで指示し、（ｂ）ピペットチップを用いて複数回にわたり標的液体を保持する容器のシーリング材を自動的に穴あけし、次いで（ｃ）ピペットチップを用いて穴あきシーリング材付き容器から液体を自動的に取り出す、ことを含む。
【００２４】
一部の態様は、ピペットから液体を放出させる方法に関する。該方法は：（ａ）ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かし、閉鎖コンテナにおいて受容表面付近に先端を置いて下方角度方向にピペットを向けさせるために、ロボットアームをプログラムで指示し、（ｂ）次いで下方向き角度のピペットを平面に沿い実質上直線的に自動で動かしながら、ピペットから流動性物質を放出させる、ことを含む
【００２５】
更に他の態様は、液体をピペットに吸引する方法に関する。該方法は：（ａ）ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かして、閉鎖コンテナで標的流体を保持する容器を係合するために、ロボットアームをプログラムで指示し、次いで（ｂ）容器の内側でピペットを自動的に動かして容器において液体を混ぜ、次いで（ｃ）混ぜられた液体をピペットへ吸引する、ことを含む。
一部の態様において、該方法は液体を混ぜるために液体を吸引および分配することもできる（一回または多数回）。
【００２６】
更に他の態様は、閉鎖システムでサンプルを処理する自動化方法に関する。該方法は：（ａ）柔軟性のあるバリアを有する密封可能閉鎖コンテナにサンプルを用意し、および（ｂ）サンプルを処理するため閉鎖コンテナが密封されたままで、柔軟性のあるバリアと協同して、一連の作動により閉鎖コンテナの内側においてインターフェースツールを動かすために、ロボットアームをプログラムで指示する、ことを含む。
【００２７】
該方法は、場合により次のうち一以上を含んでもよい：（ｃ）増幅中に複数の時間でサンプルの容量および濃度を電子的かつ自動的に測定する、（ｄ）使用前、使用後、および／または使用中に閉鎖コンテナの密封の完全性を電子的かつ自動的に測定する、および（ｅ）閉鎖システムの密封された状態を毀損することなくアリコート容器で少なくとも一つの増幅ＲＮＡサンプルを捕捉する。
【００２８】
本発明の更に他の態様は、閉鎖コンテナで物品を操作するための装置に関する。該装置は：（ａ）操作対象となる複数の物品を保持しうるように形成された内部区域を有するコンテナ、および（ｂ）閉鎖ループでコンテナの内部区域内に密封された空気を循環させるように形成された再循環真空システム、を含む。
【００２９】
本発明の方法の態様に関して、ここでは一部の態様が記載されているが、本発明はシステムおよびコンピュータープログラム製品としても具体化できることが理解されるであろう。しかも、システム、装置、方法、またはコンピュータープログラムの請求項の一つの種類に関して請求項で記載されるいずれの特徴も、請求項で記載される作動または特徴のいずれか他の種類として請求項で記載または実施しうる、ことが注記される。
【００３０】
本発明の態様による他のシステム、方法、システム構成部品、および／またはコンピュータープログラム製品は、下記の図面および詳細な記載のレビューから当業者に明らかであるまたは明らかとなる。すべてのこのような追加のシステム、方法、および／またはコンピュータープログラム製品がこの記載の範囲内に含まれ、本発明の範囲内にあり、添付の請求項により保護される。
【発明の具体的説明】
【００３１】
本発明は修正および代替形態により実施してもよいが、その具体的な態様が図面において例示として示され、詳細に記載されている。しかしながら、本発明を開示された具体的な態様に限定されるものではなく、逆に本発明は本発明の精神および範囲内に属するすべての修正物、相当物、および代替物に及ぶと理解されるべきである。同一の参照番号は、図面の記載を通して、同一要素を表す。
【００３２】
図面において、ある線の太さ、層、構成部品、要素、または特徴は、明確化のために誇張されることがある。別記されない限り、破線は、任意の特徴、作動、または隠れた構成部品を表す。請求項において、記載された方法は、そこでそのように述べられていない限り、示された工程の順序に限定されない。
【００３３】
ここで用いられる技術は具体的な態様を記載する目的のためだけに用いられ、本発明を限定するものではない。ここで用いられているような単数形“ａ”、“ａｎ”、および“ｔｈｅ”は、内容が明らかにそれ以外を示すのでない限り、複数形も含む意味である。用語“含んでなる”は、この明細書で用いられている場合、記載された特徴、整数、工程、作動、要素、および／または構成部品の存在を表すが、一以上の他の特徴、整数、工程、作動、要素、構成部品、および／またはそのグループの存在または付加を除外するものではないことが、更に理解されるであろう。ここで用いられているような用語“および／または”は、関連掲載物品のいずれかおよびその一以上のすべての組合せを含む。ここで用いられている“Ｘ〜Ｙ”および“約Ｘ〜Ｙ”のような語句は、ＸおよびＹを含むと解釈されるべきである。ここで用いられている“約Ｘ〜Ｙ”および“約Ｘ〜約Ｙ”のような語句は、“約Ｘ〜約Ｙ”を意味する。ここで用いられている“約ＸからＹまで”のような語句は、“約Ｘから約Ｙまで”を意味する。
【００３４】
別に定義されていない限り、ここで用いられているすべての用語（専門および科学用語を含む）は、本発明が属する当業者により通常、理解されるものと同様の意味を有する。常用される辞書において定義されている用語は、明細書および関連業界の関係でそれらの意味と一致した意味を有するとして解釈されるべきであり、ここで明らかにそのように定義されていない限り、理想化されたまたは過度に形式的な意味で解釈されるべきでないことが、更に理解されるであろう。周知の機能または構成は、簡略化および／または明確化のため詳細に記載されないこともある。
【００３５】
第一、第二などの用語が様々な要素、構成部品、区域、層、および／または項目を記載するためにここで用いられているが、これらの要素、構成部品、区域、層、および／または項目はこれらの用語により限定されるべきでないことが理解されるであろう。これらの用語は、ある要素、構成部品、区域、層、または項目を他の区域、層、または項目から区別するためだけに用いられる。このように、以下で記載される第一の要素、構成部品、区域、層、または項目は、本発明の開示から逸脱することなく、第二の要素、構成部品、区域、層、または項目と称することもできる。作動（または工程）の順番は、特に他で示されない限り、請求項または図面において呈示された順序に限定されない。
【００３６】
“閉鎖システム”または“閉鎖コンテナ”という用語は、処理に際してシステムまたはコンテナ中へ（またはから）の外在または外部物質の導入を阻止または防止するために、完全でなければ、実質上閉鎖的に密封されて作動する、各々システムおよびコンテナに関する。閉鎖システムは汚染を阻止または防止するように形成される。一部の態様において、閉鎖システムまたはコンテナの構成部品は製造現場で使用前に前滅菌され、使用箇所で滅菌され、および／または各閉鎖システムが使用前に組立て、および閉鎖された後で滅菌される。閉鎖システムまたはコンテナは、ある大気条件下でわずかな目標または既定漏れ率まで圧力‐または真空気密(vacuum-tight)である。漏れ率は、真空もしくは圧力センサー試験を用いる内部および／または外部センサー、または他の漏れチェックシステムなどにより調べられてもよい。典型的な大気条件は、海面からそれ以上の標高まで、装置の所在位置により変化してもよい。しかしながら、本発明の態様で考えられる閉鎖システムは海洋（水面下、深海）、飛行、および／または宇宙環境でも用いられてもよく、密封性はその大気条件で目標漏れ率を実質的に十分に維持しうる。閉鎖システムまたはコンテナは、閉鎖システムの完全性の毀損なしに、それらの各所定目的のために利用することができる。閉鎖システムまたはコンテナは無菌性を維持しながら標的流体サンプルの流体移動に適合化でき、および／または閉鎖システムの完全性を維持しながら他の閉鎖システムに接続可能である。工程に際して大気または他の構成部品に開いた流路で、フィルターが場合により用いられる。フィルターは、所望のクリーンレベルまたはクラスまで濾過して、クラス１００，０００、クラス１０，０００、クラス１０００フィルター、または更にはクラス１００フィルターのような閉鎖状態をとれるように形成されてもよい。
【００３７】
“隔離コンテナ”という用語は、内部構成部品を保持、格納、および／または隔離し、外部病原体、微生物など、および／または外部環境において存在しうる他の物質から隔離して、そこに保持された一以上の物品またはサンプルを処理しうるように形成された、コンテナに関する。隔離コンテナは一回用使い捨てコンテナでもよい。一部の態様において、隔離コンテナ中のサンプルは、例えば組織（例えば、清澄化された腫瘍ホモゲネート）中の核酸をＩＶＴ ＲＮＡへ処理するための、核酸であるか、またはそれを含んでなる。
【００３８】
“一回用使い捨て”という用語は、再使用されない構成部品に関する。換言すれば、その意図した使用、即ち標的サンプルの処理または調製を終えた後、それは捨てられる。標的産品の処理／調製後にその内容物のいかなる不注意な外部放出または暴露も阻止するために、隔離コンテナがその内部構成部品をそこに保持して閉鎖の密封された状態で捨てられる閉鎖システムを保持するために、隔離コンテナは一回用使い捨てでよい（そのようにラベルしてもよい）。
【００３９】
“アリコート”という用語は、標的流体の所望量に関する、流体の量は既定および／または特定範囲内にある。“アリコート管”という用語は、コンテナから流体アリコートの取出しを行なえる管に関する。典型的には、“アリコート管”という用語は、隔離コンテナの閉鎖状態または密封された完全性を毀損することなく、少なくとも一つ（典型的には複数）の流体アリコートを入れられるように、隔離コンテナの内部と連絡した管に関する。アリコート管は柔軟性があり、かつ無菌でもよく、ＰＶＣのようなエラストマーを含んでなる。
【００４０】
“キュベット”という用語は、容器内に含まれる物質、典型的には流体の機械的、電気的、または光学的測定、典型的には濃度または容量測定を行なえるように形成された容器に関する。キュベットは、典型的には約０．００１ｍＬ〜約５．０ｍＬの範囲内で、比較的少量の流体を保持するようにサイズ化される。
【００４１】
“ピペットチップ”という用語は、流体、典型的には液体を少量、典型的には約０．１μＬ〜約１０００μＬの量で取込および／または放出しうる、両端で開く管に関する。該管は、典型的にはヘッドから下方先端にかけてテーパー化(tapering)した、不規則もしくは一定の周囲形状または大きさを有する。“ピペット”は複数のかみ合い可能な(matable)構成部品により形成される。即ち、ピペットはチップ部分およびヘッド部分を有する。ヘッド部分は、処理に際して異なるピペットチップと解放可能に取り付けられる、ロボットデバイスへ（間接的に）取り付けられた操作ツールに形成される。異なる容量の大きさのピペットも単一コンテナ／処理システムにおいて用いてもよい。
【００４２】
“Human Machine Interface（ＨＭＩ）”との用語は当業者に周知であり、オペレーターに機械へ入力、指示させ、それと相互作用させるインターフェースに関し、プログラムで情報を提供してオペレーターからの制御指令を受け取る“Graphic User Interface（ＧＵＩ）”付きの電子ディスプレーを典型的には含む。
【００４３】
“無菌”という用語は、コンテナの内部処理空間において外部病原微生物および／または望ましくない外来物質による標的サンプルの汚染を阻止または防止する、および／またはコンテナの内容物による近位外部環境の汚染を阻止または防止する、処理状態に関する。
【００４４】
“結合カラム”という用語は、サンプルまたはその誘導体の諸成分を分離するために用いられる、濾過／溶出カラムに関する。一部の態様において、結合カラムは核酸（例えば、ＤＮＡおよび／またはＲＮＡ）単離または精製に用いることができる。一部の態様において、結合カラムはシリカ膜を保有してもよい。
【００４５】
“トレー”という用語は、一以上の構成部品を保持するために十分な剛性を有した支持体に関する。トレーは実質的に平坦でも、またはボウル様形状を有してもよい。トレーは他の形状および形態を有してもよい。トレーは一体ウェルまたは保持区域を形成するように形成しても、またはデバイスもしくはコンテナ、典型的には少なくとも一つの処理ワークステーションと関連したそれらの構成部品と密封可能にかみ合う、および／またはそれらを保持するように形成されてもよい。
【００４６】
“ユーザー”という用語は、オペレーター、プログラマー、および／またはメンテナーに関する一般名である。
【００４７】
“ロボット”という用語は、規定された処理工程または作動を行なうよう望ましい方向へ翻訳することがプログラムにより指示される、自動デバイスに関する。“ロボット”という用語は広く用いられ、多軸並進の固定設置ロボットアーム、並びに全可動ロボットおよび他の適切なロボットデバイスを含む。
【００４８】
本発明はシステム、方法および／またはコンピュータープログラム製品として具体化されてもよい。したがって、本発明はハードウェアおよび／またはソフトウェア（ファームウェア、レジデントソフトウェア、マイクロコードなどを含む）で具体化されてもよい。更に、本発明は、指令遂行システムによるまたはそれと連携した使用のためにコンピューター使用可能またはコンピューター読取可能プログラムコードを媒体で具体化させたコンピューター使用可能またはコンピューター読取可能蓄積媒体において、コンピュータープログラム製品の形態をとってもよい。本明細書に照らして、コンピューター使用可能またはコンピューター読取可能媒体は、指令遂行システム、装置もしくはデバイスによるまたはそれと連携した使用のために、プログラムを保有、蓄積、伝達、伝播、または輸送しうる、いかなる媒体であってもよい。
【００４９】
コンピューター使用可能またはコンピューター読取可能媒体は、例えば電子、磁気、光、電磁気、赤外線または半導体システム、装置、デバイスまたは伝播媒体であってもよく、それらに限定されない。コンピューター読取可能媒体の更に具体的な例（非包括的リスト）としては次のものがある：一以上のワイヤ、ポータブルコンピューターディスケット、ランダムアクセスメモリー（ＲＡＭ）、読み出し専用メモリー（ＲＯＭ）、消去可能なプログラム可能読み出し専用メモリー（ＥＰＲＯＭまたはフラッシュメモリー）、光ファーバー、およびポータブルコンパクトディスク読み出し専用メモリー（ＣＤ‐ＲＯＭ）を有する電気コネクション。コンピューター使用可能またはコンピューター読取可能媒体は、紙もしくは他の適切な媒体でもよく、そこにプログラムがプリントされ、プログラムが例えば紙または他の媒体の光学式走査で電子的に捕捉されると、必要であれば適切に編集、解釈、または処理され、次いでコンピューター（電子）メモリーに蓄積されることに留意する。
【００５０】
閉鎖環境において、自動処理のための装置および方法が以下で記載されている。該システムは、例えば閉鎖環境で何かを処理、作製、組立て、または操作するために用いられ、医学、犯罪科学、治療、診断、バイオテクノロジー、エレクトロニクス、およびナノテクノロジーの分野で特に有用である。記載の便宜上、本発明の様々な態様および特徴が、核酸処理のためのシステムの関係において、ここでは記載されている。しかしながら、以下の記載は本発明の単なる説明にすぎず、限定されるものではない、と当業者であれば理解するであろう。例えば閉鎖コンテナで何らかの物品を作製、組立て、処理、または操作するためのシステムおよび方法を含めて、様々な他の適用も本発明の範囲内とみなされる。
【００５１】
例示の自動システムの概観
概観として、図１に関し、システム１０は、内部チャンバー（内部作業エリアまたは区域としても記載され、“エリア”という用語が広く用いられているが、二次元数理的ではない）付き閉鎖コンテナアセンブリー１２内で一以上の物品を操作する、ロボットアーム２０で形成しうる。一部の態様において、コンテナアセンブリー１２は、処理されるおよび／またはそれ以外で操作対象となる複数の物品を保持するように形成された、内部区域１８を有する。柔軟性のあるバリア１６は、コンテナトレー１４の内部をカバーし、それで密封するように、形成および寸法取りされる。チャンバー内で物品を操作するためのツールが柔軟性のあるバリア１６へ取り付けられまたはその中に組み込まれ、バリア１６がトレー１４へ取り付けられた場合に、内部区域中へ伸びる。バリアがコンテナトレーで密封されまたはそれへ取り付けられた場合に、ツールがコンテナの外側からロボットデバイスにより操作されるように、該ツールはバリアの外側から接近可能なアダプターまたは他のインターフェースを有しうる。トレー１４は、閉鎖コンテナで一以上の物品または工程構成部品または流体を保持するための、一以上の作業スペース、エリア、ステーション、ラック、ホルダー、容器、ウェル、または他のデバイスを保有するように形成される。他のツールまたはデバイスがコンテナ内に配置されてもまたはそこから接近可能でもよく、例えばサンプルまたは他の物品を処理、操作、測定、分析、サンプリング、および／または貯蔵するためのツールもしくはデバイスがコンテナのチャンバー内に存在してもよい。
【００５２】
ここで図面に戻ると、図１は例示の自動核酸処理システム１０を示す。システム１０はコンテナアセンブリー１２を保有してもよい。コンテナアセンブリー１２は隔離コンテナ１２でもよい。システム１０は、コンテナアセンブリー１２内でおよび／またはそれと関連して物品を操作するための、ロボット２０（典型的にはロボットアーム）または他の自動もしくは手動指示可能デバイスも保有する。コンテナアセンブリー１２はトレー１４と柔軟性のあるバリア１６を含んでなる。バリア１６はトレー１４で密封またはそれと取り付けられるよう構成される。バリア１６の最外周端部分１６ｐはコンテナトレー１４を密封可能に係合でき、コンテナアセンブリー１２内に閉鎖無菌作業エリア１８を設ける。一部の態様において、コンテナアセンブリー１２またはそのいずれか一部は一回用使い捨てである。具体的な態様において、サンプルは密封されたコンテナを開けることなくコンテナの外部で排出、収集、または捕捉され、密封されたコンテナ１２は残留内容物と共に“そのまま”捨てられる。
【００５３】
トレー１４は実質的に硬質であって、成形されたボディでもよい。一部の態様において、トレー１４は医療グレード（ＵＳＰクラスVIまたは他の適切なグレード）の成形ポリマーを含んでなる。トレー１４のボディは、内部目視性を呈する視覚性のために、一以上の実質的にクリアな半透明または透明の光沢区域を含んでなる。トレー１４は、バイオバーデンおよび微粒子を阻止および／または最少化するために、クリーンルームモールドおよびクリーンルーム成形施設で成形される。トレー１４は、例えばＶＨＰ（蒸気過酸化水素）、ガンマ線照射、またはエチレンオキシド蒸気過酸化水素による表面汚染除去のような、一般的滅菌技術を用いることにより、柔軟性のあるバリア１６を密封する前にまたはその後に滅菌される。輸送のために、トレー１４は密封された二重プラスチック包装／袋詰めのように二重エラストマー無菌包装物質で梱包される。
【００５４】
バリア１６は、コンテナアセンブリー１２の密封された完全性を毀損することなく、垂直に約４〜２４インチおよび水平にトレー１４の少なくともほぼ幅と長さで、密封されたコンテナアセンブリー１２の作業エリア１８内でロボット２０にツールを動かせるように形成される。一部の態様において、ロボット２０は、密封の密封された完全性を毀損することなく、密封されたコンテナアセンブリー１２で６〜１２インチの垂直運動を有するよう、内部インターフェースに命令しうる。バリア１６は、コンテナ１２の内部容量を過度に圧縮または減損することなく、ロボット２０の望ましい運動範囲を確保する上で十分な空気容量をもたらすよう、トレー１４との相関でサイズ化され、そして形成される。
【００５５】
一部の態様において、システム１０は、組織、血液、血液製品、核酸、タンパク質、細胞培養物などに限定されないが、それらを含めた生物サンプルをコンテナアセンブリー１２内において処理するために用いられる。このような態様において、コンテナ１２は、例えば生物サンプル、試薬、洗浄液、ピペット、ピペットチップ、容器、他の消耗品、またはそれらいずれかの組合せのような物品を含んでもよい。
【００５６】
示されたように、システム１０は自立式、自給式ユニットであってもよい。システム１０は、自動システム１０の隔離コンテナアセンブリー１２および他の構成部品、例えばロボット２０、サーマルブロック３０（例えば、ヒートブロックおよび／または冷却ブロックなど）、アリコート・リトリーバル・アセンブリー４０および処理されたサンプルを集めるための関連機構、ユーザーインターフェース６０、および以下の項目において記載されているような様々な他の構成部品および機構を支持するためのハウジングまたはシャシ７０を保有する。サーマルブロック３０は、例えば、図１０、１１において示されるように、サーマルブロックアセンブリー１０００と協同してもよい。
【００５７】
処理システム１０の一部の態様において、オペレーターまたはメンテナーは通常作動のためにシステム１０のフロントへ接近することのみを要してもよい。図１において示されるように、一以上のアクセスドア１１０が、隔離コンテナ１２を取り付けるまたは取り外す際に、接近性をもたらすため、例えば実質上垂直に持ち上げるか、または側面もしくは他の方向に開けることで開いてもよい。
【００５８】
一部の態様において、システム１０の自動性により、ドア１１０は作動時にオペレーターがシステムの各パートを動かさないように防いでもよい。システム１０は、システムが作動している際にドア１１０を開けないようオペレーターを阻止または防止するため、電子的に制御されたインターロックまたは他の機構を組み込んでもよい。インターロックされたガードを開くための補助手動装置も装備でき、このような補助手動装置は例えば電力が得られない場合に用いられてもよい。ＨＭＩ（Human Machine Interface）とも称されるユーザーインターフェース６０は、オペレーターに処理作動を開始させまたはシステム１０を制御させうるように形成でき、アクセスドア１１０に隣接するシャシ７０のフロントに設置しうる。ある態様では、ＨＭＩのディスプレースクリーン６１および制御（タッチスクリーン、キーパッド、または他のインプット）も、立ちながらユーザーにそれらを視認および作動させるように置いてもよい。一部の態様において、システム１０の背面および側面はオペレーターにより日常的に接近される必要はない。結果的に、システムは壁または他のシステムを背にして置ける。
【００５９】
一部の態様において、シャシ７０の下部は、オペレーター相互作用を要しない、電子制御システム、電源、および他の構成部品を保有しうる。これらの構成部品は、偶発的流体浸入から構成部品を保護し、生じうる電気ハザードからオペレーターを保護する、専用エンクロージャーに収納される。取り外し可能パネル１２０、１３０、１４０は、エンクロージャーの内側で電気構成部品および／または他の構成部品へ接近しうるように保有されてもよい。一部の態様において、訓練されたサービス員のみが、これらエンクロージャーの内側に近づくことを許されるか、または要求される。サービスアクセスパネルは、例えばパネルを取り外してシステムを作動継続させることを許諾または拒否するために、インターロックしてもまたはしなくてもよい。
【００６０】
図２は、作業表面２００に隔離コンテナ１２を保有した、システム１０の上部分の拡大側面図を示す。例えば、示されたようにバリアがトレー１４へ取り付けられた場合に、ピペットヘッド２２０の少なくとも一部分がコンテナ１２の内部作業エリア１８中へ伸びるように、ピペットヘッド２２０および／または他の操作デバイスがバリア１６へ取り付けられるか、またはそれとともにもしくはその中に組み込まれている。ピペットヘッド２２０は、ロボットデバイス２０のアーム２３０の端部で解放可能にアダプター２１０と接続するように形成されたインターフェースをバリア１６の反対側に保有する。一部の態様において、ピペットヘッド２２０または他の操作デバイスはバリア１６を物理的に通り抜けず、アダプターでロボットまたは他のデバイスと必ずしも連結していなくてよい。むしろ、このようなピペットヘッドはバリアの内側と取り付けまたは一体化し、例えばバリアの反対側に取り付けられたロボットアーム２３０を用いて、バリア１６の反対側から作動または操作される。他の態様において、（実質的に不透過性である）バリア１６と一体化されたピペットヘッドまたは他のサンプル操作デバイスは、バリア１６を介して操作デバイスを支持および／またはそれと連絡する磁石または他のデバイスにより作動してもよい。
【００６１】
バリア１６がトレー１４に密封されている場合、バリア１６はピペットヘッド２２０を操作するロボット２０または他のデバイスからトレー１４の内容物を分離する。バリア１６およびトレー１４間の密封は気密であり、それによりコンテナ１２内に閉鎖環境をもたらす。一部の態様において、バリア１６は柔軟性があり、ロボットアーム２３０によりトレー１４内の作業エリア１８中くまなくピペットヘッド２２０を動かせる。例えば、生物サンプル、試薬、ピペットチップ、または他の消耗品を含めた、核酸サンプルの処理に関与するすべての物品または物質と、サンプルを処理するための他のツールまたはデバイスとは、処理に際して閉鎖作業エリア１８内に留まれる。トレー１４は、このような物品を収納するために、トレー１４のベース２４０またはトレー１４の他の部分と成形、形成、取り付け、または一体化された、いくつかのフィーチャーまたはステーション２４２を含んでもよい。
【００６２】
示されたように、ロボットデバイス２０はシャシ７０の壁に取り付けられてもよい。他の態様において、ロボットデバイス２０は作業表面２００または他の支持構造体に取り付けられたアーム、ガントリー、またはリンケージシステムを含んでもよい。適切なロボットデバイスが当業界において知られている。以下の例には限定されないが、Staubli ＴＸ９０ロボット、Epson Ｅ２Ｌ Scaraロボット、Kawasaki Ｆ Seriesロボット、Yamaha ＹＫＬ Scaraロボット、ＳＴ Robotics Ｒ１７ロボットなどが含まれる。一部の態様において、ロボットデバイス２０は、FANUCLR MATE 200iB 5C、６軸ロボット、または他の適切な多軸ロボットデバイスであり、例えば、サンプルの処理に際しピペットチップを用い結合カラムマニホールドをスライドまたは持ち上げて、流体の吸引および移動のような望ましい操作を閉鎖コンテナ１２内部において自動的に行なうために用いられる。
【００６３】
多軸ロボットアームは、ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かし、いくつか異なる方向にピペットを向けて、吸引または分配時に液体の混合を助けるために用いられる。例えば、ピペットは閉鎖コンテナ中の受容容器で受容表面近くに先端がある状態で下方角度方向に向けられ、次いで自動的に下方向き角度のピペットが（マスタードの典型的な積層または分配に類似して）面に沿い実質上直線的に動かされ、その際にピペットから流動性物質を放出する。他の態様において、吸引前に容器において液体を混ぜ、次いで混ぜた液体をピペットへ吸引するように、ロボットアームが自動的にピペットを動かせる。一方または加えて、一部の態様において、液体は該液体を混ぜるために少なくとも一回吸引および分配される。一部の態様において、受容または分配容器はリップを有し、ロボットアームはピペットチップに指示してリップの周囲を動かせるように形成される。
【００６４】
図３において示されるように、フロントアクセスドア１１０の内側に置かれる水平作業表面２００は、例えば、隔離コンテナ１２と相互作用する様々な構成部品および機構を支持してもよい。作業表面２００は、処理に際して、アセンブリーサポートトロリー(trolley)３９９（図２７）に構成部品を係合してコンテナを並べさせるガイドスロット３９０ｓ、あるいは隔離コンテナ１２（例えば、図２のベース２４０）へ向けて解放可能に固定する他のロケーションフィーチャーを含めて、一以上のガイドスロット３９０ｓを保有しうる。
【００６５】
図２７において示されるように、システム１０とドッキングしうるトロリー３９９上にコンテナアセンブリー１２が作製される。トロリー３９９は、システム１０の支持表面上でガイド３９０により形成されるスロット３９０ｓと並ぶ、スロット３９９ｓを保有する。コンテナアセンブリー１２をシステム１０へ移動するために、オペレーターはシステム１０付近でトロリーを転がし、こうしてトロリー３９９がシステム１０のガイド３９０と並べられる。オペレーターがコンテナアセンブリー１２を持ち上げることなく、コンテナアセンブリー１２はシステム１０のスロット３９０ｓで適正な作動位置にスライドする。
【００６６】
図２８Ａおよび２８Ｂにおいて示されるように、作業表面２００は適所にある場合、コンテナ１２の下部分と接触するローラーガイド３８１、３８２を保有する。ローラーガイド３８２は、ワークステーション箇所の登録のためにロボットアームと望ましいアライメントにある最内部スロット壁３９０に対してぴったり適合するように、内側へコンテナ１２をバイアスさせるスプリング３８３と連絡しうる。
【００６７】
再び図３に戻ると、作業表面２００は、コンテナ内で区域、容器、または標的対象もしくは箇所を加熱および／または冷却するためのインキュベーションデバイスのような、温度制御デバイスを支持してもよい。このようなデバイスは当業者に知られている。ある態様において、システム１０は、例えば、ある核酸増幅反応または他の反応もしくは工程に際してＰＣＲプレート６１０（図６）または他の容器もしくは構成部品の温度を制御するためのサーマルサイクラー３０、およびこのような反応に際してサーマルサイクラー３０を選択的にカバーするためのサーマルサイクラーリッド機構３１０を保有する。ある態様にでは、真空ポンプアセンブリー３２０およびピンチバルブアセンブリー３３０が、処理に際して隔離コンテナ１２内において真空および空気の循環の制御をもたらす。真空ポンプアセンブリー３２０は、一回用使い捨て真空ヘッド１６０２、および関連管類(tubing)１６５０を解放可能に係合しうる（図２３Ｂ）。作業表面２００は、ここで更に記載のように、コンテナアセンブリー１２により保持される構成部品と分光光度計１９００ｓを連絡させうるように、コンテナアセンブリー１２も保持しうる。
【００６８】
一以上のシリンジポンプ３５０（例えば、二つのポンプとして示される）は、ピペットヘッド２２０の吸引および分配作用を駆動させるために用いられる（図２）。一部の態様において、シリンジポンプ３５０は、ピペットヘッド２２０の作動のための真空および圧力をもたらす、図２において示されたピペットヘッドアダプター２１０を介して、例えばリザーバー３４０から作業液を送り出すために用いられてもよい。作業液は実質的に非圧縮性であってもよく、例えば約５０％エタノールの水溶液を含んでなる。他の流体、空気さえも用いてもよい。ポンプ機構およびピペットヘッド２２０の例示態様の追加詳細が、図７および８と関連して以下で更に詳細に記載されている。
【００６９】
図３に戻ると、キュベットホルダー３６０（図１９Ａにおいて分光光度計キュベットも参照）は、処理に際して望ましい作動で自動濃度測定を行なうために、シャシ７０の下部分で典型的に存在する分光光度計１９９０ｓと連結させうる。場合により、作業表面２００は一以上の冷却フィーチャー、例えば冷却機のような熱交換器を保有してもよく、ペルチェ（Peltier）冷却プレート３７０および３７２が隔離コンテナ１２のある部分を係合して密封されたコンテナ１２内で湿度および蒸気濃度の制御を助けるために置かれる。レバー３８０または他の機構もしくはデバイスも、作業表面２００において適所に隔離コンテナを固定するために用いられてもよい。
【００７０】
一部の態様において、ＲＮＡ処理システムは、大規模生産システムおよびデータ管理ツールまたはシステムから隔離されて、スタンドアローン式に作動してもよい。内部または外部コンピューターシステムがサブシステムの自動構成部品を制御および／または測定してもよい。ユーザーは、例えば、システムを作動させて状態を測定するために、インターフェース６０と相互作用してもよい。他の態様において、システム１０は他のシステムまたは監視ステーション（異なる部屋または異なる施設にあってもよい）と連絡しうる。
【００７１】
様々な構成部品およびアセンブリーの追加の詳細、および使用の例示方法が、以下の項目において記載されている。
【００７２】
例示の隔離コンテナ
隔離コンテナアセンブリー１２に関して、トレー１４および柔軟性のあるバリア１６が更に詳細に記載されている。トレー１４は、内部作業エリア１８を保有し、例えば、望ましいアッセイまたは工程用の容器、ピペットチップ、結合カラム、他の支持体、および／または他の消耗品またはデバイスを保持するための一以上のラック、マニホールド、または他のホルダーを含めて、コンテナ１２内に物品を保持するためのいくつかのインサート、空洞、ラックもしくはラック搭載フィーチャー、および／またはステーション２４２を含んでもよい。望ましい最終状態または産品へ物質を処理するために用いられるすべての物品がコンテナ内に保持され、即ちシステム用の消耗品は自給式であり、コンテナの内部を汚染する危険を最少化するためまたはサンプルに環境もしくはユーザーを汚染させないために、処理に際して密封される。バリア１６は、例えば図５において示されるようなトレー１４の環状エッジ４５２付近に、トレー１４で解放可能にまたは恒久的に密封するよう形成された最外周端部分１６ｐ（図５）を有する。バリア１６がトレー１４において密封されている場合、ピペットヘッド２２０および／または他のサンプル操作ツールもしくはデバイスの少なくとも一部はバリア１６から作業エリア１８中へ伸びている。
【００７３】
一部の態様において、バリア１６は硬質トップエッジ４５２に沿いトレー１４を係合している（図５）。バリア１６の最外周端部分１６ｐはトップエッジ４５２に接触して存在する（図５）。トップエッジ４５２は、バリア１６を締め付けてトレー１４に対してバリアを密封するＯ−リング（示さず）を入れる、ギャップスペース付き立上りリップとして形成されてもよい。
【００７４】
閉鎖システムまたは環境を作るために、隔離コンテナトレー１４およびバリア１６は、コンテナ１２内の物品と、コンテナで物品を処理するために用いられる外部デバイス、機構、および装置のピースとの間に、物理的バリアを形成するように形成されてもよい。例えば、柔軟性のあるサーマルサイクラーリッドシール４３０が、図４において示されるように、トレー１４の壁４５０内に組み込まれてもよい。このようなシール４３０はリッド１０１０を入れるスリーブまたは閉鎖チャンネルを包囲および形成し（図１１）、リッド機構３１０とコンテナ１２の内部エリア１８内の物品との間に物理的バリアを設けながら、サーマルサイクラーブロック３０による加熱時に、サーマルサイクラーリッド機構３１０によりトレー１４の側壁にある隙間１４ａ（図５）へリッドを伸ばし、サンプルをカバーさせるために用いられてもよい。
【００７５】
しかも、冷却プレート３７０、３７２は、隔離作業エリア内でどの物品とも接触することなく、コンテナ１２内の温度変化を知らせるように、トレー１４の外表面の各部分を係合してもよい。一部の態様において、冷却プレートは、隔離作業エリア／スペース内に保持された（試薬のような）物品の温度を制御しうるよう、トレー１４／コンテナ１２の外表面の各部分と係合してもよい。
【００７６】
同様に、図３において示されるように、キュベットホルダー３６０は濃度および／または容量の測定を行なえるようトレー１４のベース２４０から伸びるキュベット６６０（図６）を選択的に係合するが、ホルダー３６０はコンテナ１２内のどの物品とも接触しなくてもよい。そのため、一部の態様では、サンプルと直接接触するよう要求される試薬、消耗品、およびツールまたはデバイスのみが、隔離コンテナ内に保有される。このような形態はいくつかの利点を有する。例えば、サンプルはそれ自身の隔離環境において処理され、および／またはコンテナ外に存在する処理装置はサンプルと接触せず、そのため生じうる汚染から保護される。処理の終わりに、例えば収集サンプルまたは隔離コンテナの完全性を毀損することなく、以下で更に記載されているように、所望数のアリコートがアリコート管４４０（図４）に集められてもよく、コンテナ１２から取り出されてもよい。一部の態様において、例えば、密封された隔離コンテナ１２は、サンプル物質で汚染された構成部品とともに、処理サイクル後に捨てられる。
【００７７】
図５および６は、隔離トレー１４および柔軟性のあるバリア１６を含めた、例示の隔離コンテナ１２の一部構成部品の追加の詳細を示す。内部作業エリア１８は、例えばベース２４０と一以上の壁４５０で囲まれてもよく。バリア１６は、以下の別項目で更に詳細に記載されている、ピペットヘッド２２０または他のデバイスもしくはツールを保有しうる。バリア１６がトレー１４で密封された場合に、作業エリア１８が閉鎖された、典型的には気密な区画となるように、バリア１６は、例えばトレー１４の環状エッジ４５２に沿うシール５１０において、トレー１４でカバーおよび密封するように形成しうる。
【００７８】
トレー１４は実質的に硬質であり、収納するためにトレーで成形、形成され、それと取り付けまたは一体化された、いくつかのフィーチャーおよび／またはステーション２４２を保有しうる。下記構成部品の一部または全部は、トレー１４へ組み込まれるフィーチャーの例である：
・溶出６３０および廃棄６３２ステーション、
・真空入口および出口、
・分光光度計（濃度）キュベット６６０（図１９Ａ）、
・他の容器またはキュベット、例えば容量測定キュベット２０６０（図２０Ａ〜Ｅ）、
・温度制御デバイスで加熱および／または冷却されてもよいサーマルサイクラーＰＣＲプレート６１０および／または他の支持体または容器、
・ラック６２０における試薬容器６２２、
・ラック６５０におけるピペットチップ６５１、
・例えば、使用済みピペットチップ６５３のための、一以上の追加チップラック６５０または他の使い捨てコンテナ、
・例えば、核酸処理用の一以上の結合カラムを保有してもよい、結合カラムマニホールド５０、および
・アウトプット：例えば核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ、腫瘍全ＲＮＡ、および／または増幅腫瘍インビトロ転写ＲＮＡなど）、微生物、細胞、薬剤などを処理するための一以上のアリコート管４４０。
【００７９】
一部の態様において、柔軟性のあるバリア１６は、バリアの片側でロボットデバイス２０と連結し、バリア１６の内側で内部構成部品と連結する操作ツールで密封し、それを支持する。該ツールは、ピペットヘッド２２０および追加の操作フィーチャー、例えば内部構成部品を係合するためのハンドル５２０または他のフィーチャーもしくは機構、例えば廃棄および溶出ステーション６３２、６３０間にマニホールドを各々移動するための結合カラムマニホールド５０におけるハンドル５０ｈ（図５）を保有しうる。柔軟性のあるバリア１６は、トレー１４で収納されたすべての望ましい内部構成部品に接近しうるほど、十分にピペットヘッド２２０を動かせられる。ヘッド２２０は、廃棄６３２および溶出６３０ステーションへおよび／またはから結合カラムを移動できるように、結合カラムマニホールド５０も係合しうる。示されていないが、内部インターフェースは複数の連続的に取付け可能なインターフェースでもよい。即ち、ピペットヘッドまたは第一インターフェースは閉鎖コンテナ内で解放可能に保持され、他の操作ツールと交換されうる。操作ツールの選択は、トレー１４および／または内部操作ツールラック（示さず）により行なわれる。
【００８０】
ミキサーおよび／または遠心機も、例えば望まれる生物サンプルまたは他の物質のような液体またはサンプルを混合、ホモゲナイズ、分離、もしくは混合または処理するために、トレーと協同するか、またはそれに組み込んでよい（示さず）。他の態様においては、出発物質が予め混合され、次いでラック６２０または他の箇所に置かれる。ミキサーは、望ましい物質を混ぜられる回転ヘッドミキサー、磁気ミキサー、またはホモゲナイザーである。
【００８１】
例示のピペッティングシステム
図７ＡおよびＢに関して、ピペットヘッド２２０およびアダプター２１０アセンブリーを含んでなるピペッティングシステム７００が、隔離コンテナ１２内において流体移動を行なうために用いられてもよい。閉鎖隔離コンテナデザインと一致するように、ピペットヘッド２２０は、移動される流体とピペットポンプ機構とのバリアを維持するように形成される。フィルターおよび／または柔軟性のある隔壁７１０は、隔離コンテナ１２の内部と外部との物理的汚染抵抗バリアを設けられる。
【００８２】
一部の態様において、高い容量正確さをもたらすために、ピペッティングシステム７００は二本のポジティブ・ディスプレースメント・シリンジポンプ３５０‐１、３５０‐２、例えば一本は低容量移動（例えば、約１μＬ〜約５０μＬ）および一本は高容量（例えば、約５１μＬ〜約１０００μＬ）を用いてもよい。他の態様では、異なるリザーバー付きの単一ポンプチャンバーまたは作業液を計量する手段付きの単一リザーバーが用いられる。ポンプチャンバーは、（実質的に硬質の）管類および緩衝液（作業液）を介して、柔軟性のある隔壁７１０へ圧式で接続されてもよい。緩衝液は、ピペッティングシステム７００の弾性を減少または最少化しうる、実質的または全体的に非圧縮性の圧媒液である。ロボットアーム２３０は作業スペースで望ましい箇所にピペットヘッド２２０を置くために用いられる。ピペット移動中に試薬キャリーオーバーの可能性を減らすため、使い捨てチップ６５１が流体の取扱いに用いられてもよい。即ち、各移動後に、使用済みチップが“トラッシュ”容器、典型的には使用済みラックへ廃棄され、無菌ラックまたはサプライステーションから異なる新たな無菌チップが次の移動に用いられてもよい。ピペッティングシステム７００の例示態様の他の構成部品が図７Ａおよび７Ｂにおいて示される。
【００８３】
一部の態様において、ピペッティングシステム７００は初回使用前にピペットラインから液体を導入して空気を除去するように準備され、新たな閉鎖コンテナ１２の処理の開始時のような、異なるピペットヘッド２２０がピペットヘッドアダプター２１０へ接続される各時点の前に準備されてもよい。例えば、ブリードラインがソレノイドバルブ７４１を介してピペットヘッドのブリード口を作業液リザーバーへ接続する。空気をポンプ３５０から放出させ、流体ライン２２２、２２３（図８Ａ）、およびピペットヘッド２２０を経て、作業液リザーバー３４０へ戻すように、バルブ７４１が始動順序に際して開けられてもよい。ロボットアーム２３０は流体ラインをピペットヘッド２２０へ向けるように指示され、こうしてそれらは始動に際して曲げられる。システム７００が始動されると、ブリードバルブ７４１が閉じられてもよく、ピペットヘッド２２０は流体移動を行なう用意が整う。ＲＮＡ工程の完了時に、ブリードバルブ７４１が流体ライン２２２、２２３、およびピペットヘッド２２０を排液するために用いられる。流体ラインを空気で満たすと、ピペットヘッドの切離しに際する液こぼれの可能性を防げてもよい。
【００８４】
図８Ａおよび８Ｂは、圧力をピペットヘッド２２０からピペットチップ６５１、６５３へ伝えるための圧力伝達機構８００の作動の断面図を示す。一部の態様において、例えばリザーバー３４０からの圧媒作業液は柔軟性のある隔離隔壁７１０を作動させ（図８Ｃおよび８Ｄも参照）、作業液とピペットにより吸引される流体との物理的分離を維持しながらピペッティング作用を駆動させる。作業液のリザーバーは、他の側で作業空気から密封された隔壁７１０の片側に存在しうる。柔軟性のある隔壁７１０は、作業液３４０と内部ピペットチップアダプター２２０ａ（即ち、ピペットヘッド）および吸引された流体との間で、ヘッド２２０に存在する。図１５は隔壁および上部アセンブリーなしでアダプター２２０ａを示す。
【００８５】
図８Ａおよび８Ｂに関して、隔壁７１０の変位は隔壁７１０下でピペットチップアダプター２２０中の作業空気容量７００ａに影響を与え、それにより（典型的には配分）量の液体をピペットチップに取り込ませるかまたは放出させる。ピペッティングシステム７００の全体的弾性は分配正確さと直接関連してもよい。一部の態様では、空気容量７００ａを減少させると、ピペッティング正確さおよび精度を双方とも改善しうる。
【００８６】
一部の態様において、試薬容器、分光光度計キュベット６６０、およびＰＣＲ壁内で流体の徹底的混合を促すために、反復吸引／分配サイクルが用いられ、および／またはロボットアーム２３０が多軸並進でピペットのチップを動かすように指示される。
【００８７】
一部の態様において、トレー１４および／またはピペットヘッド２２０は、使用済みチップ６５３をピペットチップアダプター２２０ａから取り外す一以上のフィーチャーを保有してもよい（図８Ｂ）。図２６Ａ〜２６Ｃにおいて示されるように、ピペットヘッド２２０は使用済みピペットラック６５０に近いコンテナの一部との接触で軸旋回するレバー２２１を保有しうる。図２６Ｃにおいて示されるように、レバー２２１の外端との接触で、レバー２２１が軸旋回して、使用済みピペットチップ６５３をアダプター２２０ａからラック６５０の受容スペースへ押し出すように、コンテナ側壁１４ｗまたはそこに保持された部材が曲げられる。即ち、ピペットヘッド２２０が使用済みラック６５０の方へ下向きに動くと、レバー２２１が壁１４ｗと接触し、こうしてレバーの一端を上方へおよびピペットチップ６５３の端部を下方へ動かして、使用済みチップをラック６５０へ押し出す。他の解放形態も用いてよい。例えば、使用済みラック６５０はピペットチップ６５３の上方運動を制限して、アダプター２２０ａからチップを引く、押すもしくは強いるかまたは取り外すように形成されてもよい。
【００８８】
ピペットヘッド２２０および／またはアダプター２１０は流体ラインおよびロードセル配線と連結してもよく、これらは柔軟性のあるバリア１６および柔軟性のある導管を通り抜けてシャシ７０へ戻るように上げられる。ロードセル配線は、無菌または新ピペットチップと連絡するロードセンサーとつながっている。ロードセルはアダプター２２０ａへの新ピペットの装填を制御するために用いられるデータを提供する。例えば、ロボットアームは約５Ｎ〜約５０Ｎの力でピペットヘッド２２０を下進させて、ピペットチップ６５１が適正に取り付けられるよう指示する。アダプター２１０は、該アダプター２１０をピペットヘッド２２０、以下の例に限定されないが、係合／解放ハンドル機構へ固定および解放するためのカラーも保有しうる。
【００８９】
例示の柔軟性のあるバリア
図９Ａ〜９Ｅは本発明の態様に従う例示の柔軟性のあるバリア１６を示す。いかなる適切な物質も該バリアに用いられる。バリア１６は、空気、湿気、およびエタノール蒸気に対して実質的に不透過性である。十分な柔軟性を失いまたは透過性に影響を与えることなく、バリア１６は成形可能である。一部の態様において、バリア１６は低密度ポリエチレンを含んでなるが、他の代替物はある範囲のウレタン物質を含有しうる。具体的な態様において、柔軟性のあるバリアはFrederica、Delaware所在のＩＬＣ Dover Companyから入手しうる“ARMORFLEX”物質であるか、またはそれを含んでなる。
【００９０】
柔軟性のあるバリア１６の形状によれば、限定なくまたは該柔軟性のあるバリアの拘束もしくは捕捉なく、隔離コンテナ１２の内部への十分なロボット運動を許容して、ピペットヘッド（または他の内部インターフェース）アクセスを行なわせることができる。柔軟性のあるバリア１６がトレー１４へ密封されて隔離コンテナ１２を形成すれば、成形された柔軟性のあるバリア１６の形状は実質的に自立性である（例えば、それは隔離コンテナ中へ崩壊しない）。
【００９１】
一部の態様において、バリア１６の部分９１０は、例えばピペットヘッド２２０、他の流体移動デバイスおよび／または他の操作ツールのような、コンテナ内でサンプルを操作するためのデバイスと一体化、収納、保持、取り付け、噛合、密封、支持、または相互作用するように適合化されてもよい。部分９１０は実質的に中央部分でもよい。バリア１６は“湾曲部”９２０として記載される一以上のホールド、プリーツ、またはアンジュレーションを保有してもよく、そのうち一部は他と実質的に同心状である。一連の実質上垂直向き階段状部分１７１、１７２、１７３として示された、少なくとも一つの階段状部分１７を部分９１０が保有しうることを、図９Ｂは示す。
【００９２】
一部の態様において、例えば図９Ｃおよび９Ｄにおいて示されるように、バリア１６は一以上の放射状湾曲部９３０を保有してもよい。放射状および／または同心状湾曲部はピペットヘッド（または他の内部操作ツールインターフェース）の全範囲運動の容易化を助け、ピペットヘッドの運動に際してバリア形状の制御を助けられてもよい。リム９４０、フランジ、または他のフィーチャーは、バリア１６をトレー１４へ固定、密封、固定、取り付け、または接着させるための表面を設けてもよい。
【００９３】
図９Ｃおよび９Ｄにおいて示されるように、柔軟性のあるバリア１６は、ヘッド２２０の望ましい動きを可能にする、一連の実質的に同心状のホールド、プリーツ、または湾曲部へ引き伸ばされまたは形成される、単一シートの物質を含んでなる。バリアシートの外周区域１６ｔは中心区域１６ｃと異なる厚さを有してよい。一部の具体的態様では、作製に際し、厚い物質が真空形成時に中心へ引き寄せられて、バリアシート１６の薄い中心区域と厚い周囲区域を形成する。中心区域１６ｃは、バリア１６が作業スペース１８から離れるに従い小から大へとアレンジされた、一連の円柱状工程１７１〜１７３を保有する。他の態様において、単一シートの物質よりむしろ、柔軟性のあるバリア１６は同一または異なる適切な物質の複数の連結した密封されたセグメント（示さず）を含んでもよい。
【００９４】
図９Ｅは、後でロボットアーム２０への係合のために、ピペットヘッド２２０の下部分へ密封可能に取り付けられた柔軟性のあるバリア１６を示す。ロボットアームカップラー９１０ｃはバリア１６の外部に存在する。図９Ｆは、カップラー９１０ｃを係合するように形成された協同カップラー２１０ｃを示す。図９Ｇにおいて示すように、フィンガー２１１は、カップラーボディ９１０ａの隙間へ入り、バリア１６を解放可能に係合するように形成される。アセンブリーが（下部コンテナトレー１４なしに）図９Ｈにおいて示される。
【００９５】
例示のサーマルブロックアセンブリー
図１０において示されるように、核酸処理システムはサーマルブロックアセンブリー１０００またはいずれか他の温度制御デバイスを組み込んでもよい。例えば、核酸処理システムは核酸を合成および増幅するためのサーマルサイクラーを組み込める。サーマルブロックアセンブリー１０００は、例えば、マルチウェルストリップまたはプレート、例えばＰＣＲプレート６１０を入れるように形成されるサーマル（ヒーター）ブロック３０、およびリッド機構３１０により作動されてＰＣＲプレート６１０をカバーするサーマルサイクラー加熱リッド１０１０を保有してもよい。例えば、一部の態様において、サーマルサイクラーアセンブリーは本工程のｃＤＮＡ合成、ｃＤＮＡ増幅、ＩＶＴ ＲＮＡ合成、およびＤＮＡ除去工程に用いられる。様々な種類のサーマルブロックおよび／またはサーマルサイクラーデバイスが利用しうる。
【００９６】
図１０において示されるように、ＰＣＲプレート６１０が隔離コンテナトレー１４へ組み込んでもよい。一部の態様において、ＰＣＲプレート６１０の周囲はトレー１４のベースで形成されるオープン（実質的長方形）区域へ密封される。プレート６１０の下部分は、プレート６１０におけるウェル６１１の開口が密封されたコンテナ１２の内側から接近可能でありながら、サーマルサイクラーヒーターブロック３０を係合する（典型的には、そこに存在する）ように、トレーのベースから下方へ伸びる。ウェル６１１の下方へ伸びる部分がサーマルサイクラーまたは温度制御デバイスと直接接触した状態でいられるように、ＰＣＲプレート６１０は隔離コンテナトレー１４へ密封される。
【００９７】
一部の態様では、コンプライアントガスケット、Ｏ−リング、または他のシーリング機構もＰＣＲプレート６１０を隔離コンテナトレー１４へ取り付けるために用いられてもよい。コンプライアントガスケットは熱スエージ加工クランピングフィーチャーで取り付けられてもよい。一部の態様では、重ね成形熱可塑性エラストマー（ＴＰＥ）シール１０３０が、図１０において示されるように、ＰＣＲプレート６１０を隔離コンテナトレー１４へ取り付けて密封するために用いられる。他の態様では、ＰＣＲプレートフィーチャーが隔離コンテナトレー支持体へ形成、例えば成形および／または機械加工されてもよい。他の態様では、グルー、テープ、および／または接着剤もＰＣＲプレート６１０をトレー１４へ取り付けるために用いられてもよい。
【００９８】
リッド、例えば加熱されるサーマルサイクラーリッド１０１０も、蒸発による反応液の喪失を減らすために用いてよい。リッド１０１０は、一部または各ＰＣＲウェル６１１から蒸発流体を逃さないように、および／またはコンテナ１２の内部の隔離を維持するために、例えば柔軟性のあるシール４３０により裏打ちしてもよい。リッド１０１０は、リッドまたは反応混合物以外の表面において蒸気を凝縮させないために、加熱してもよい。ＰＣＲウェルのすべてへの接近を可能にするため、サーマルサイクラーリッド１０１０はシーリング圧力を放出するよう垂直に上げられ、次いで実質上水平に引き込まれ、それにより柔軟性のあるリッドシール４３０を取り出してもよい。
【００９９】
リッド１０１０の自動運動を制御するための駆動系(drive system)３１０も、図３において示されるように、処理システム１０の作業表面２００へ搭載してよい。他の態様において、リッド駆動系３１０は作業表面２００上または下で他の箇所に搭載してもよい。ここで図１１に関して、例示のリッド駆動系３１０は引き込み位置にあるリッド１０１０と共に示される。アーム１１２２がリッド１０１０へ接続され、モーター１１５０と連絡している、こうして例えば、リッドシール（スリーブとして記載される）が図１２において示されるようにリッド１０１０とコンテナの内部との間に配置された、トレー１４の壁における副入口／出口隙間１４ａを介して、コンテナ１２内外へのリッド１０１０の運動を可能にしている。ロボットツールまたは手動インプットもシール４３０を介してよい。
【０１００】
図１３Ａは、引き伸ばし時のリッドシール４３０のチャンバー４３０ｃ内部における、コンテナ１２中リッド１０１０の例示形態を示す。図１３Ｂは、引き込み形態にあるコンテナ１２外のリッド１０１０を示す。
【０１０１】
アーム１１２２は水平のみならず垂直にもリッド１０１０を向けるよう形成しうる。図１１および１２において示された態様において、駆動系３１０は、例えばリッド１０１０がコンテナ１２内でＰＣＲプレート６１０上に置かれた場合に、リッド１０１０の垂直運動を行なえる、垂直運動機構１１２４を保有する。垂直運動機構１１２４は、例えば、一以上のバイアス部材１１５２を用いて、リッド１０１０をプレート６１０および／またはブロック３０（図１０）で密封するために十分な下方向き力を出してもよい。一以上のモーター１１５０、アクチュエーター、ギア、リンケージ、または他の電気‐機械デバイスが、水平および／または垂直運動を駆動するために用いられてもよい。図１２において示されるように、駆動系３１０はスロット１１２３ｓ付き上部プレート１１２３を保有する。アーム１１２２はスロット１１２３ｓでスライドするキール１１２２ｋを保有する。駆動系３１０は、ピボット１１２７およびバイアス部材１１５２を介して上部プレート１１２３へ取り付けられた、下部プレート１１２６も保有する。垂直駆動１１２４は上部および下部プレート１１２３、１１２６へ取り付けられ、リッド１０１０がコンテナ内で伸びた形態にあると、上部プレート１１２３を引き降ろしてリッド１０１０を下げるように形成される。
【０１０２】
駆動系３１０の一部は、シール４３０が、リッド１０１０において適切に動くよう促すために、スリーブまたはリッドシール４３０の内部表面へ物理的に取り付けられる。図１１において示されるように、一部の態様において、真空カップ１１４０は柔軟性のあるリッドシール４３０を係合して、サーマルサイクラーリッド１０１０の垂直および水平運動時にシール４３０を適所に留まらせるよう、リッド１０１０に組み込まれてもよい。他の態様において、リッドシール４３０は他の手法で取り付けても、またはリッド１０１０と整合してそれと協調して動くほど十分に柔軟でもよい。
【０１０３】
一部の態様において、隔離コンテナ１２と柔軟性のあるリッドシール４３０との信頼可能な密封を促すために、固定プレートまたは他のクランピング部材が、例えばトレー１４の外壁に対するリッドシールでの一以上のシーリングリブ（示さず）を介して、シール４３０のエッジ部分に対して押し付けるように用いられてもよい。他の態様において、リッドシール４３０は、例えばＰＣＲプレート６１０に関して前記されたようなＴＰＥを用いて、トレー１４に重ね成形されてもよい。Ｏ−リング、ガスケット、接着剤、テープ、およびマウンティングまたはシーリング部材が、リッドシール４３０とトレー１４とで密封され、接続させるために用いられてもよい。図１３Ａはリッド１０１０およびシール４３０が係合位置でトレー１８の内部区域へ伸びたリッド機構３１０を示し、一方図１３Ｂはコンテナ１４の壁から引き込まれたリッド１０１０を示す。図１３Ａはサーマルサイクラーおよび９６ウェルプレート上で適所にあるリッド１０１０を示す。図１３Ｃは、リッド１０１０がトレー１８の内部区域へ伸びた、リッド機構３１０の部分側面斜視破断図を示す。
【０１０４】
例示の廃棄および溶出システム
様々な精製手段が、核酸、タンパク質、細胞、組織などのサンプルを処理するために用いられる。このような精製デバイスとしては磁気ビーズ、サイズ排除膜、結合プレート、フィルター、および結合カラムがあるが、それらに限定されない。このようなデバイスは当業者に知られている。
【０１０５】
ある態様において、処理システム１０は腫瘍全ＲＮＡ単離、ｃＤＮＡ精製、およびＩＶＴ ＲＮＡ精製用の結合カラムから溶出させる技術を用いる。結合カラム１４１０（図１４）はシリカ膜を保有できる。真空溶出プロトコールが隔離コンテナデザインへ組み込める。他の態様では、磁気溶出プロトコールがコンテナへ組み込める。
【０１０６】
一以上の種類／大きさの結合カラムが用いられてもよい。例えば、一部の態様では、結合カラム（例えば、Qiagen RNeasyカラム）が処理されるＲＮＡ、ｃＤＮＡ、およびＩＶＴ ＲＮＡの量に適した結合能を有することから、それらが用いられる。追加の、小さなQiagen“Mini”カラムも、ＲＮＡを濃縮する能力をもたせるために保有させうる。
【０１０７】
溶出容器を廃棄液で汚染させないために、廃棄および溶出ステーション６３２、６３０各々が、例えば図６において示されるように分離できる。一部の態様では、マニホールド５０が結合カラムを保持するために用いられる（図１４および１５参照）。マニホールド５０は、一以上の様々な大きさ／種類の結合カラム、例えばQiagenマキシ‐、ミディ、‐および／またはミニ結合カラム１４１０を保持するように形成しうる。マニホールド５０は、各結合カラム用のウェル５０ｗ、ピペットヘッド２２０持上げ用のリフティング部材、またはアーム形成リフト部材５０ｈ、および未使用結合カラムを閉じるために用いられる一以上のスライド可動性リッド１４３０を保有してもよい。リッド１４３０は、ヘッド２２０によりリッド１４３０を所望方向へスライドさせるハンドル１４３０ｈを保有しうる。他の態様において、マニホールド５０は、所望の工程に際して用いられる他の種類の支持体またはデバイスを保持するように形成してもよい。リフト部材５０ｈは、ステーション間においてマニホールド５０の運動を促す一以上の（図示のような）ハンドル、ウイング、フランジ、または他のフィーチャーを含めて、いかなる適切なリフトとして形成してもよい。
【０１０８】
図１５は、コンテナ１２の二以上のステーションまたはエリア間において、例えば廃棄および溶出ステーション６３２、６３０各々間でマニホールド５０を動かすための機構および方法の例を示す。ピペットヘッド２２０およびロボット２０は、２ステーション内外へ、即ち両者間で結合カラムマニホールド５０およびカラム１４１０を動かすために用いられてもよい。示された態様において、マニホールド５０はピペットヘッド２２０で対応フィーチャー５２０と連結するハンドル５０ｈ、ウイング、または他のフィーチャーを保有してもよく、ロボット２０および結合マニホールド５０間の係合を簡素化するために用いられる。
【０１０９】
各単離および精製工程は異なるセットのカラムを用いられる、ピペットヘッドロボットはリッド１４３０を転位させて適切なセットの未使用カラムを閉じるために用いられてもよい。これはマニホールド５０を通る気流を減少または最少化させ、単離および／または精製処理工程に際して十分に高い真空をポンプに作らせる。滅菌後に結合カラム１４１０のオペレーター取扱いを減らすために、カラム１４１０がマニホールド５０へ積載されてもよく、アセンブリーが適切な包装に密封されて、マニホールド５０でガンマ線滅菌される。使用およびまたはアセンブリー施設（例えば適切なクリーンルーム）において、隔離コンテナを積載する場合に、オペレーターは該包装をマニホールド５０から取り外し、結合カラムを直接取扱う必要なしにそれを廃棄ステーション６３２へ置ける。
【０１１０】
廃棄および溶出ステーション形態は柔軟性のあるおよび／または計量可能である。マニホールド５０デザインは、９６ウェルフォーマット、または他の種類のプレート、ウェル、またはカラム、またはマキシ‐、ミディ‐、およびミニカラム１４１０の組合せの変更に合う修正または使用を行なえるほど十分に大きくてよい。
【０１１１】
ここで図１６および１７に関して、溶出ステーション６３０は結合カラムの最終アウトプット（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡなどを含有する流体）を捕捉するように形成された溶出トレー１６１０を保有できる。ＤＮＡおよびＲＮＡ間で生じうる交差汚染を阻止および／または防止するために、各結合カラム１４１０は溶出トレー１６１０でその下にそれ自体の容器１６１２を有しうる。一部の態様において、溶出工程は高真空を用いるが、これは結合カラム１４１０で有意な気流を作れる。溶出容器１６１２は、プールされた流体から気流をそらせながら、仮にあったとしても飛び跳ねた流体を脇に流して収集容器にプールしうるよう形成されてもよい。追加のフィーチャーでは、ある容器から他へ流れる気流を減少または最少化させてもよい。トレー１６１０の更なる記載は図２９Ａ〜２９Ｃにおいて見られる。
【０１１２】
廃棄ステーション６３２は廃棄トレー１６３０および廃棄トレーカバー１６４０を保有してもよい。廃棄トレーカバー１６４０は、廃棄ステーション６３２に保有される廃棄液の蒸発を最少化させるため、廃棄トレー１６３０へ組み込んでもよい。廃棄トレーカバー１６４０は、すべての廃棄液を一以上の（中心部として示された）ドレインホール１６４１へ流下させて、そこでそれが廃棄ステーション６３２内においてカバー１６４０下の主気流から保護されるように形成されてもよい。図３０Ａおよび３０Ｂは、溶出トレー１６１０と実質的に類似して形成されたトレーカバーを用いる複数の廃棄ドレインホール１６４１を用いた、廃棄トレーカバー１６４０の他の態様を示す。廃棄トレーカバー１６４０下の密封された環境において、廃棄液のすぐ上の空気は高い湿度を維持し、そのため更なる蒸発を減らせる。トレーカバー１６４０の更なる記載は図３０Ａ〜３０Ｂにおいて見られる。
【０１１３】
一部の態様において、真空システム１６００は、コンテナ１２中くまなく空気を循環させる。一部の態様において、隔離コンテナ真空システム１６００はフィルターの必要性を解消するように形成される。真空システムは、ポンプヘッド１６０２から、例えばピンチバルブ３３０（図１７）を介して、廃棄６３２および溶出６３０ステーションへ接続された管類１６５０、典型的には柔軟性のある管類を含んでなる。ポンプヘッドの出口は吸引された空気を隔離コンテナ１２へ逆送させる。
【０１１４】
図１７は真空システム１６００の一つの態様による循環路を示す。この態様では、管類１６５０および使い捨てポンプヘッド１６０２が製造に際して隔離コンテナトレー１４へ取り付けられてもよい。これらは、隔離コンテナトレー１４と連結されたアセンブリーの一部として滅菌および輸送される。隔離コンテナ１２が積載および密封されると、真空システム１６００は処理の残りをずっと閉じたままでいられる。処理システム１０への隔離コンテナの搭載中、真空管類１６５０がピンチバルブ３３０へ挿入され、使い捨てポンプヘッド１６０２が真空ポンプ３２０へ接続される。一部の態様において、ポンプ３２０は真空が要される場合のみ作動する。ピンチバルブ３３０は真空を適切なステーションへ向けるために用いられてもよい。処理が終了した場合、管類１６５０はバルブ３３０から抜き取られてもよく、ポンプヘッド１６０２がポンプ３２０から外される。管類１６５０およびポンプヘッド１６０２は、隔離コンテナ１２の残りとともに、一回用使い捨てにしうる。
【０１１５】
図１８は、処理システム１０の作業表面２００で適所にあるトレー１４の破断図を示し、ピンチバルブ３３０および使い捨てポンプヘッド１６０２の例示箇所を示す。ペルチェプレート３７０および３７２は、トレー１４の後壁１４ｐのセグメントおよびトレー１４のベースにある廃棄ステーションキャッチメントを各々冷却してもよい。壁セグメント１４ｐは実質的に平坦で（典型的には実質的に垂直だが、傾斜してもよい）、プレート３７２の受容スペースを形成するように内側へ突き出してもよい。壁１４ｐはプレート３７２と協同して凝縮壁を形成するように形状化されてもよい。図１８においては、サーマルサイクラーリッド駆動系３１０がシール４３０なしで適所にコンテナ中へ伸びたリッドと共に示され、使い捨てポンプヘッド１６０２が柔軟性のある真空ポンプ管類１６５０なしで適所に示されることに注目される。
【０１１６】
例示の工程制御および／または収量測定システム
一部の態様において、使い捨てキュベット６６０、２０６０が、例えば図１９Ａおよび図２０Ｆにおいて示されるように用いられる。例えば、キュベット６６０、２０６０がトレー１４の底部から垂直下方へ伸びるように、一以上のキュベット６６０、２０６０が隔離コンテナトレー１４へ固定または解放可能に搭載されてもよい。
【０１１７】
一部の態様では、サンプル、例えば核酸もしくはタンパク質の濃度および／または純度が分光光度計１９００ｓ（図３、１９Ｂ）およびキュベット６６０（図１９Ａ、２０Ｆ）を用いて測定されるか、あるいは濃度測定用の代替光学的方法、例えばフルオロメーターがシステムへ同様に組み込まれる。
【０１１８】
一部の態様では、図１９Ａにおいて示されるように、一以上の使い捨て濃度キュベット６６０がガスケットまたはＯ−リングのような柔軟性のあるシーリング部材１９１８によりトレー１４へ密封可能に搭載される。トレー１４は、シーリング部材１９１８に対してしっかりキュベット６６０を保持し、こうしてキュベット６６０をトレー１４へ密封して、密封された処理環境を隔離コンテナ内で維持するように、留め具１９２０を係合する搭載部材１４ｍを保有している。示されるように、キュベット６６０は硬質上部リップ６６１として形成される外側エッジを保有しうる。留め具１９２０は、リップ１９０１を背にする内側直立アーム１９２１と、搭載部材１４ｍを係合してキュベット６６０をトレー１４へ押し付ける外側アーム１９２２を保有している。キュベット６６０は、典型的にはその下部分に、キュベット測定ウィンドー６６０ｗを保有する。
【０１１９】
一方、キュベット６６０（またはキュベット２０６０）はトレーへ成形、重ね成形、機械的固定、溶剤接着、接着剤固定などしうる。分光光度計１９００ｓ（図３）は処理システム１０に、例えば隔離コンテナ１２の真下に搭載されうる。分光光度計１９００ｓは、隔離コンテナ外に留まりながら、キュベット６６０（図２０Ｆ）で吸光度測定するように形成できる。
【０１２０】
一部の態様では、キュベットが再使用不要なように、各測定用のキュベット６６０、２０６０がある。処理システム１０は、必要とされる各測定毎にキュベット６６０から６６０へ分光光度計キュベットホルダー３６０（例えば、図３、１９Ｂ参照）を動かせるように形成しうる。一部の態様において、キュベット６６０および／または２０６０はトレー１４から取り外され、洗浄されて、次のトレー１４で再使用される。他の態様において、取り外し可能キュベット６６０、２０６０は一回用のみ（一回用使い捨て）である。
【０１２１】
様々な種類の分光光度計が知られ、核酸濃度および純度測定に利用される。分光光度計１９００ｓは処理システム１０と連絡して、連結されたコントローラーにより制御される。例えば、処理システム１０は分光光度計１９００ｓに測定するよう命令でき、分光光度計１９００ｓは典型的には紫外線波長、例えば約２６０および／または２８０ｎｍで、または対象のいずれか他の波長で、吸光度測定に戻ることができる。加えて、分光光度計１９００ｓのジオメトリー、特にキュベットホルダー３６０のそれは、全体システムの他の構成部品と一体化できる。
【０１２２】
図１９Ｂは、図２０Ｆにおいて（４）キュベット６６０として示される、いくつかのキュベット６６０間で単一検出器ヘッドを動かすために用いられる分光光度計ヘッド機構を示す。ロボット作動プラットホームは、分光光度計キュベットホルダー３６０を位置決めするため、例えばキュベット６６０間で上げる、下げる、および横移動(traverse)させるために用いられる。分光光度計１９００ｓおよび光源は、例えばシステムの左側または右側において、システムの電気キャビネットに搭載されてもよい。分光光度計１９００ｓおよび光源が据付けられたままでキュベットホルダー３６０を動かせるために、光ファイバーも用いられてもよい。即ち、図１９Ｂにおいて示されるように、分光光度計駆動機構は単一検出器ヘッド１９００ｈを動かして異なるキュベット６６０の各々を順次保持するために用いられる。検出器ヘッド１９００ｈの検出器は複数（典型的には二本）の光ファイバーで分光光度計１９００ｓに連結される。他の態様では、各キュベット６６０が個別キュベットホルダー３６０に入れられ、測定のため分光光度計と連絡するように光源を多数キュベットホルダー（示さず）へ接続している光ファイバー間で光源が切り替えられる。
【０１２３】
サンプルの容量測定は収量を求めるために濃度測定とともに用いられてもよい。一部の態様において、容量測定ユニット２０００は、例えば図２０Ａ〜２０Ｅにおいて示されるように、専用容器においてピペッティングシステムおよび流体センサーを利用する。例えば：
・図２０Ａは検出器ヘッド２００２で空のキュベット２０６０を示し、そこでは二つのＩＲエミッター２０１０からの光がキュベット２０６０を通過せず、反射光について二つのＩＲレシーバー２０２０により受容される。
・例えば図２０Ｂにおいて示されるように、測定される流体２０４０が容量キュベット２０６０にプールされると、二つのＩＲエミッター２０１０からの光がキュベット２０６０へ通されて、反射光について二つのＩＲレシーバー２０２０により受容されない。
・制御システムが測定容器２０６０の底部でシステム２０００により検出される流体の存在を測定している場合、図２０Ｃにおいて示されるようにサンプル２０４０をピペットチップ６５１へ吸引するためにピペットヘッド２２０が用いられる。
・図２０Ｄにおいて示されるように、センサーシステム２０００が流体の不在を報告すると、シリンジポンプ３５０（図３）が止められ、吸引された容量が電子的に測定および記録される。このように、キュベット２０６０は底部にプリズムデザインを有する。検出器で光源を用いると、機器は反射に基づきキュベット２０６０中における流体の存在または非存在を調べることができる。これは、分注装置(pipetting device)とともに、液体が存在しないシグナルを受けるまでそれが取り出す液体を測定することにより、容量を測定する。図２０Ｅは、システム２０００が間隔をあけた複数の検出器ブロック２００２を用いることができ、各々がそれ自体ペアのトランスミッター２０１０を有することを示す。各ブロック２００２は、容量測定システム２０００を用いて容量測定を行なうために、各キュベット２０６０を保持してそれと協同するように形成できる。
【０１２４】
図２０Ｆにおいて示されるように、トレー１４は複数の容量キュベット２０６０（例えば、容量測定キュベット）および複数の分光光度計キュベット６６０（キュベット６６０は濃度測定に用いられる）を保有できる。分光光度計キュベット６６０は、BioRad“trUViewキュベット”のような標準ＵＶ可視プラスチック使い捨て用品でもよい。デバイス１０は測定用の分光光度計構成部品を保有しうる。適切な分光光度計構成部品は、Dunedin，Floridaにビジネス拠点を有する、Ocean Opticsから得られる。
【０１２５】
例示の工程構成貯蔵システム
一部の態様では、試薬容器が隔離コンテナ１２内に試薬、サンプル、および混合容量の流体組合せを含有するために用いられる。様々な異なるキャパシティの試薬容器が、工程に際して用いられるある範囲の流体容量を入れるために用いられてもよい。
【０１２６】
試薬汚染、蒸発、またはこぼれの危険を減らすために、試薬を含有する各容器は、トレー１４への充填前に、典型的にはトップ表面において、例えばポリプロピレンライニングホイルにより密封される。シールはピペットチップ６５１で穴あけされるように形成できる。シールは試薬を適切な試薬容器へ充填および密封させ、汚染、こぼれ、または蒸発の危険なく貯蔵させうる。
【０１２７】
試薬ラック６２０の例が図２１Ａにおいて示される。ラック６２０はいかなる望ましい配置を有してもよく、あらゆる試薬容器の大きさをとることができ、いかなる工程にも適合させうる。示された例において、試薬トレーまたはラック６２０は、例えばサンプルおよび試薬を含有してもよい、異なる大きさのいくつかの容器２１１０、２１１２、２１１４、典型的には管、並びに混合容器を収納するためのベース２１００を保有している。容器の各々はベース２１００内において支持され、容器が適所にしっかり保たれるよう、カバー２１２０がラック６２０にクリップまたは取り付けられる。カバー２１２０は、下に保持された容器にピペットチップを接近させうる、隙間を保有している。
【０１２８】
一部の態様では、試薬、サンプル、または他の流体がサブアセンブリーとしてラック６２０に充填され、次いでラック６２０がトレー１４へ積載される。一部の態様において、試薬ラック６２０の設計は、それが一方向のみで隔離コンテナトレーへ置かれるようなものである。一方、試薬ラック６２０は成形しても、または隔離コンテナトレー１４の一体部分としてもよい。試薬は一体試薬トレーへ直接充填されてもよく、または試薬を含有した管または他の容器が試薬トレーへ置かれてもよい。所定のラック箇所（アドレス）に容器２１１０、２１１２、２１１４を置けば、工程で正しい時間に正しい容器（試薬）をロボットインターフェースで自動的に係合させられる。
【０１２９】
一部の態様では、ピペットチップが他の非類似試薬を運ぶ必要性なく、トレーレイアウトですべての容器への接近を可能にでき、そのため試薬の交差汚染の機会を減らせる。もちろん、例えば行なわれる望ましい工程に応じて、他の形態も用いられてもよい。
【０１３０】
図２１Ｂは、（試薬）液体を取り出す前に、容器２１１０、２１１２、２１１４で各々シールを開けるためにマルチポイント（三点として示される）穴あけ配列が用いられることを示す。即ち、ピペッティング正確さを促すために（典型的には、中心箇所で）現実の取り出し穴あけへ動く前に、二つの外部箇所でシールカバーリングを穴あけするようピペット６５１が指示される。
【０１３１】
例示のアリコート取出しシステム
システム１０における自動処理に際し、サンプルおよび／または産品の一以上のアリコートが工程評価、制御、品質試験、および／または別の処理のための貯蔵に用いられてもよい（例えば、図４および５のアリコート管４４０参照）。
【０１３２】
一部の態様において、隔離コンテナ１２および処理システム１０は、隔離コンテナ１２の密封性を毀損することなく、処理に際してアリコート取り出しを行なえる。複数の柔軟性のある管がコンテナ１２の内部サンプル捕捉区域と流体連絡でき、オペレーターにより外部から接近可能となるようシステム１０から伸びている。各々の柔軟性のある管は予め密封されるか、または閉鎖端部を有している。コンテナ１２が閉鎖されたままで、各アリコートが個別にラベルされたコンテナ４４０、例えば管へ吸引されてもよい。オペレーターまたは自動シーラーは、例えば流体の捕捉アリコートの上流で、例えばＲＦ管シーラーまたは他のシールクロージャー機構を用いることにより、管４４０へアリコートを密封する。密封されると、アリコート管は隔離コンテナから取り外され、貯蔵、試験、または更なる処理のために取り出される。
【０１３３】
一部の態様において、アリコートアセンブリー４０はアリコート流体を管４４０へ吸引するために用いられ、コンテナ１２の内部から管へ流体を抜き出すためにクランピング部材およびアリコート管類４４０の弾性を利用する。この機構は管類が短時間で固定され易くするように自動化され、こうしてクランピング変形により起きる管類の弾性の変化の可能性を減らしている。
【０１３４】
図２２はアリコートアセンブリー４０を用いた例示方法２２００を示し、アリコート管４４０をアリコート流体４４５で充填するために用いられる一連の工程（左から右および上から下へ）を示す。示されるように、閉鎖末端４４１のアリコート管４４０がウェル１４ｗ下でトレー１４へ密封可能に取り付けられる。この例では、クランピング部材（管エクスプレッサー）２２１０が（第二および第三図において示されるように）管から空気を追い出すために一以上のアリコート管４４０へプレスされる。管が留め具２２１０で完全に圧縮される（上部クランピング部材２２１１が管および他の留め具表面に対して押し下げられる）のに応じて空気が排出された後または排出されている間、アリコート物質４４５が管４４０と連絡しているウェル１４ｗに充填または分配される。後にクランピング力の放出で、流体４４５のアリコートが弾性管内の負圧により管４４０へ引き込まれる。管シーラー２２２０（例えばＲＦウェルダー）も、アリコート管を（４４２で）密封し、場合によりシールの上流で切断して、管内でサンプル４４５を隔離するために用いられてもよい。他のシーリング材機構も用いられてもよい。
【０１３５】
コンテナを組み立てる例示方法
図２３Ａは、処理用の閉鎖システムをオペレーターに作製させるために用意される、キット２５００の分解組立図である。キット２５００は、トレー１４、結合マニホールド５０、ピペットチップラック６５０（およびピペットチップ６５１）、およびキュベット２０６０、６６０を保有しうる。トレー１４は、取り付けられるアリコート管４４０および／または取り付けられる真空ヘッドおよび関連管類と共に包装されて、使用現場へ輸送される。各構成部品は、輸送および取扱い用の無菌パッケージ中で滅菌および包装（または包装、次いで滅菌）される。各構成部品は使用箇所で表面滅菌してもよく、各構成部品のアセンブリーは、クラス１０，０００、１０００、または更には１００クリーンルームにあってもよい。各構成部品は別々に用意しても、または他の組合せで予め積載してもよい。
【０１３６】
図２３Ｂは、図２３Ａにおいて示されたキットの部分組立図である。図２３Ｃは、図２３Ｂにおいて示された部分組立キットの底面図である。図２３Ｄは、コンテナまたはトレー１４と共にまたはそれとは別に輸送される個別構成部品の組立て前における、図２３Ａにおいて示されたコンテナ１４の上面図である。
【０１３７】
図２４は、（例えば、一以上の生物サンプルから核酸を無菌処理するために）本発明の態様に従い隔離コンテナ１２を各々密封する例示方法を示す。このような無菌処理のために、隔離コンテナアセンブリー１２のバリア１６およびトレー１４の部分は個別に前包装および滅菌されてもよい。隔離コンテナ１２が処理に必要とされる場合、トレー１４およびバリア１６は積載のために生物学的安全キャビネットまたは相当するクリーンで制御されたエリアへ移動されてもよい。
【０１３８】
図２３Ａにおいて示されるように、隔離コンテナ１２のトレー１４は、望ましい工程で用いられるサンプルおよび試薬を含んでなる一以上の試薬トレー６２０と共に積載されてもよい。トレー１４の組立ておよび／または積載は、上記のようにトロリー３９９（図２７）に載せたトレー１４により行なわれる。一以上のピペットチップラック６５０および結合カラムマニホールド５０もトレー１４の作業エリア１８へ積載されてもよい。一部の態様では、例えば図２０Ｆにおいて示されるように、一以上のキュベット６６０、２０６０がトレーのベースへ取り付けられる。行なわれる望ましいアッセイまたは工程に応じて、他のサンプル、被検体、試薬、容器、他の消耗品、デバイス、ツール、および／または他の物品もトレー１４へ積載されてもよい。
【０１３９】
一部の態様において、すべての望ましい物品がトレー１４内に置かれまたはそこへ取り付けられた後、例えば、図２４において示されるように、組立てられた隔離コンテナ１２を密封するためにバリア１６がトレー１４へ取り付けられる。一部の態様では、柔軟性のあるバリア１６をトレー１４へ密封するためにＯ−リング２４００が用いられてもよい。Ｏ−リングは、ぴったりとバリア１６に嵌めてトレー１４の周囲スロットへ押し当てられる。他の態様では、一以上のガスケット、クリップ、留め具、ファスナー、接着剤、および／または他の取付け手段も用いられてもよい。
【０１４０】
図２７において示されるように、トレー１４は輸送に際してトロリーの保持表面へロックされる。トレー１４が積載されてバリア１６で密封された後、隔離コンテナ１２は処理システム１０の作業表面２００へ移動される。一方で、隔離コンテナが組立てられて滅菌される。次いで、試薬およびサンプルが標準無菌移動法を用いてまたは他の閉鎖手段により密封された隔離コンテナへ導入される。トロリーも、組立てに際してトレー１４を保持するために用いられる。一方、別のバリアアイソレータートロリーアセンブリーカートも隔離コンテナ１２を組み立てる場合に用いられてもよい（示さず）。このようなバリアアイソレータートロリーはバリアアイソレーター自体へ組み込んでもよく、下記のように輸送トロリーとかみ合える。
【０１４１】
隔離コンテナアセンブリー１２はシステム１０へ設置されてもよく、サンプルを処理するために用いられる機器の各ピースへ接続される。正しいアライメントを保証するために、硬質トレー１４が作業表面２００に固定されてもよい。柔軟性のあるバリア１６およびピペットヘッド２２０がロボットピペットヘッドアダプター２１０へ接続されてもよい（例えば、図２参照）。例えば図１２において示されるように、例えば真空カップ１１４０または他のファスナーもしくは取付け手段を用いて、サーマルサイクラー蒸発シール４３０がサーマルサイクラーリッド１０１０へ接続されてもよく、廃棄および溶出ステーション用の真空管類および使い捨てポンプヘッドが対応するバルブおよびポンプへ差し込まれる。隔離コンテナを取り出すために、逆の手順が用いられてもよい。
【０１４２】
図２５は、本発明の態様に従い製造現場で行なわれる操作のフローチャートである。示されるように、インプットサンプル３０００が（典型的には患者収集場所または対象者試料貯蔵現場から）用意される。時間に敏感な場合は、製造現場における受け取りのために１２〜４８時間（例えば、一夜）以内で試料が輸送される。製造現場においては、隔離コンテナ１２がバリアアイソレーター（ブロック３０１０）で作製され、サンプルもコンテナへの積載前に調製（例えば、ホモゲナイズ、混合、および／または遠心）されるてもよい（ブロック３０００ｐ）。隔離コンテナ構成部品、例えば、トレー１４、バリア１６、およびコンテナ内容物の外部包装が滅菌される（ブロック３００２）。組立ておよび密封された隔離コンテナが組み立てられ（ブロック３００４）、密封された状態を確認するために完全な状態で試験される（ブロック３００６）。
【０１４３】
閉鎖組立て隔離コンテナは、処理用の機器へ動かせる（ブロック３０２０）。示されるように、患者サンプルからＲＮＡがシリカ膜カラムと適切なＲＮＡ結合および溶出試薬を用いて単離される（ブロック３０２２）。濃度および容量測定が収量を計算するために行なわれ、濃度が標準化される（ブロック３０２４）。ｃＤＮＡが逆転写（ＲＴ）反応により合成され、ＰＣＲで増幅され、シリカ膜カラムと適切なｃＤＮＡ結合および溶出試薬を用いて精製される（ブロック３０２６）。濃度および容量測定が収量を計算するために行なわれ、濃度が標準化される（ブロック３０２８）。ＩＶＴ ＲＮＡが得られたｃＤＮＡから産生され、ＤＮＡアーゼにより処理され、シリカ膜カラムと適切なＲＮＡ結合および溶出試薬を用いて精製される（ブロック３０３０）。濃度および容量測定が収量を計算するために行なわれ、濃度が標準化されて（ブロック３０３２）、最終増幅ＲＮＡを得る（ブロック３０３４）。ＲＮＡ使い捨て用品は、システムがなお密封されて環境から隔離されていることを確認し、それにより工程に際して汚染がなかったことを保証するために、完全性が調べられる（ブロック３０３６）。中間および／または最終産品は一以上のアリコート量としてアウトプットされる（ブロック３０５０）。
【０１４４】
図２９Ａ〜２９Ｃは例示の溶出トレー１６１０を示す。示されるように、容器１６１２は、各容器１６１２の使用に際して飛散を阻止するために、間隔をあけて傾斜化される。上方へ伸びるバリア１６１４の片側に二以上の容器１６１２が存在し、主管状受容部分１６１５が浅いチャンネル１６１６へと合流するが、これは下方へテーパー化し、それが管状ボディ部分１６１５の方へ行くと深くかつ狭くなる。チャンネル１６１６の前方部分も、飛散物を捕捉して液体を主管状部分１６１５へ流させるよう、内側かつ下方へテーパー化する。
【０１４５】
図３０Ａ〜３０Ｂは廃棄トレーカバー１６４０の類似形態を示すが、容器の先端１６３２は開いているか、または廃棄物を廃棄ステーション６３２へ排出するための隙間を有している。
【０１４６】
図３１は、コンテナの内部状態を測定するためか、または構成部品（ヒーター、クーラー、ロボットアームムーブメントなど）の自動制御を行なえる望ましいフィードバックをもたらすために用いられる、センサー４０１０、４０２０、４０３０と連絡する制御回路４０００の概略図である。示されるように、制御回路４０００はユーザーインターフェース６１（図１）と連絡しうる。センサーには、ロードセンサー４０１０、温度センサー４０２０、および圧力センサー４０３０がある。ロードセンサー４０１０は、ロボットアームで加えられる係合力を制御して新たなピペットを係合するために用いられる荷重力データを提供するように、新たなピペットラックと連絡できる。温度センサー４０２０は、内部環境または閉鎖コンテナ環境（例えば、ワークステーションの一以上）内の具体的箇所に関する温度データを提供できる。圧力センサー４０３０は、単離または精製操作に際して、閉鎖環境および／または真空の、完全に密封された状態かを測定するために用いられる。センサーの各々または一部のマルチセンサーが用いられ、他のセンサーも用いてよい。制御回路４０００は全体的または部分的にシステム１０あるいは全体的または部分的にコンテナ１２に存在してもよい。
【０１４７】
当業者に明らかなように、本発明の態様は、方法、システム、データ処理システム、またはコンピュータープログラム製品として具体化されてもよい。したがって、本発明は、ここでは“回路”または“モジュール”とすべて一般的に称される、完全なソフトウェア態様またはソフトウェアとハードウェア面を合わせた態様の形態をとってもよい。更に、本発明は、コンピューター使用可能プログラムコードを媒体で具体化させるコンピューター使用可能蓄積媒体において、コンピュータープログラム製品の形態をとってもよい。ハードディスク、ＣＤ‐ＲＯＭ、光蓄積デバイス、伝達媒体、例えばインターネットまたはイントラネットを支持するもの、または磁気もしくは他の電子蓄積デバイスを含めて、いかなる適切なコンピューター読取可能媒体も利用してもよい。
【０１４８】
本発明の操作を行なうためのコンピュータープログラムコードは、Graph、LadderまたはＳＬＣのようなＰＬＣコードにより書き込んでもよい。しかしながら、コンピューターコードは、代わりにまたは加えて、オブジェクト指向プログラミングランゲージ、例えばJava（登録商標）、SmalltalkまたはＣ＋＋および／または汎用操作プログラミングランゲージ、例えば“Ｃ”プログラミングランゲージで、あるいは視覚指向プログラミング環境、例えばVisualBasicを用いて書き込んでもよい。
【０１４９】
プログラムコードのある部分（または全部）は、全体的にシステムコンピューターの一以上で、部分的にシステムコンピューターで、スタンドアローンソフトウェアパッケージとして、部分的にシステムコンピューターおよび部分的にリモートコンピューターで、または全体的にリモートコンピューターで遂行されてもよい。後者のシナリオにおいて、リモートコンピューターはローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）またはワイドエリアネットワーク（ＷＡＮ）を介してシステムコンピューターへ接続されるか、あるいは接続が（例えば、インターネットサービスプロバイダーを用いるインターネットを介して）外部コンピューターと行なわれてもよい。一部の態様では、一部のプログラムコードがローカルコンピューターで遂行され、一部のプログラムコードが一以上のローカルおよび／またはリモートサーバーで遂行されてもよい。連絡は、イメージングモダリティから得られる容量データセットを用いて、リアルタイムまたはほぼリアルタイムまたはオフラインで行なわれる。
【０１５０】
本発明は、本発明の態様に従う方法、システム、コンピュータープログラム製品、並びにデータおよび／またはシステムアーキテクチャー構造のフローチャート図および／またはブロック図を参照して、一部記載されている。図の各ブロックおよび／またはブロックの組合せがコンピュータープログラム指令で履行されることが、理解されるであろう。これらのコンピュータープログラム指令は、コンピューターまたは他のプログラム可能データ処理装置のプロセッサーを介して遂行する指令が、ブロックで特定される機能／行為を履行するための手段をもたらすように、機械を作り出す一般目的コンピューター、特殊目的コンピューター、または他のプログラム可能データ処理装置のプロセッサーへ送られてもよい。
【０１５１】
これらのコンピュータープログラム指令は、コンピューター読取可能記憶または記憶装置(storage)に蓄えられた指令がブロックで特定される機能／行為を履行する指令手段を保有した製品をもたらすように、コンピューターまたは他のプログラム可能データ処理装置を具体的に機能させるコンピューター読取可能記憶または記憶装置に蓄えてもよい。
【０１５２】
コンピュータープログラム指令は、コンピューターまたは他のプログラム可能装置で遂行する指令が、ブロックで特定される機能／行為を履行するための手段をもたらすように、コンピューターまたは他のプログラム可能装置で行なわれる一連の作動工程にコンピューター履行工程を行なわせるため、コンピューターまたは他のプログラム可能データ処理装置へ積載してもよい。
【０１５３】
図３２において示されるように、本発明の態様は、レンダリングの作動を行なうまたは指示するために用いられ、プロセッサー回路４１００、メモリー４１３６、およびインプット／アウトプット回路４１４６を保有する、データ処理システム４１１６として形成されてもよい。データ処理システムは、例えばプログラム可能ロジックコントローラー（ＰＬＣ）、パーソナルコンピューター、ワークステーション、サーバー、ルーターなどのうち一以上に組み込まれてもよい。システム４１１６は、一つの機械または複数の機械間に存在する。プロセッサー４１００はアドレス／データバス４１４８を介してメモリー４１３６と連絡し、アドレス／データバス４１４９を介してインプット／アウトプット回路４１４６と連絡する。インプット／アウトプット回路４１４６は、例えばインターネットプロトコール（ＩＰ）接続を用いて、メモリー（メモリーおよび／または蓄積媒体）４１３６と他のコンピューターシステムまたはネットワークとの間で情報を伝達するために用いられる。これらの構成部品は、ここで記載されているように作動するよう形成される、多くの汎用データ処理システムで用いられるもののような、汎用構成部品でよい。
【０１５４】
特に、プロセッサー４１００は市販またはカスタムマイクロプロセッサー、マイクロコントローラー、デジタルシグナルプロセッサーなどである。メモリー４１３６には、本発明の態様に従い用いられる機能性回路またはモジュールを履行するために用いられるソフトウェアおよびデータを保有した、あらゆるメモリーデバイスおよび／または蓄積媒体を含んでよい。メモリー４１３６には次の種類のデバイス：ＲＯＭ、ＰＲＯＭ、ＥＰＲＯＭ、ＥＥＰＲＯＭ、フラッシュメモリー、ＳＲＡＭ、ＤＲＡＭ、および磁気ディスクがあるが、それらに限定されない。本発明の一部の態様において、メモリー４１３６は連想記憶装置（ＣＡＭ）でもよい。
【０１５５】
更に図３２において示されるように、メモリー（および／または蓄積媒体）４１３６は、データ処理システムで用いられるソフトウェア、およびデータのいくつかのカテゴリー：作動システム４１５２、アプリケーションプログラム４１５４、インプット／アウトプットデバイスドライバー４１５８、およびデータ１４５６を保有してよい。当業者に明らかなように、作動システム４１５２はデータ処理システムで使用に適したいずれかの作動システム、例えばＩＢＭ、ＯＳ／２、ＡＩＸ、もしくはｚＯＳ作動システムまたはMicrosoft Windows ９５、Windows ９８、Windows２０００、WindowsＸＰ、またはWindowsＣＥ作動システム、Unix（登録商標）またはLinuxであってもよい。ＩＢＭ、ＯＳ／２、ＡＩＸおよびｚＯＳは米国、他の国または双方におけるInternational Business Machines Corporationの商標名であり、一方Linuxは米国、他の国または双方におけるLinus Torvaldsの商標名である。MicrosoftおよびWindowsは米国、他の国または双方におけるMicrosoft Corporationの商標名である。インプット／アウトプットデバイスドライバー４１５８は、典型的には、インプット／アウトプット回路４１４６およびあるメモリー４１３６構成部品のようなデバイスと連絡するために、アプリケーションプログラム４１５４により作動システム４１５２を介して接近されるソフトウェアルーチンを保有している。アプリケーションプログラム４１５４は、本発明の一部態様に従い回路およびモジュールの様々な特徴を履行するプログラムの例である。最後に、データ１４５６は、メモリー４１３６に存在しうるアプリケーションプログラム４１５４、作動システム４１５２、インプット／アウトプットデバイスドライバー４１５８および他のソフトウェアプログラムにより用いられる静的および動的データを表す。
【０１５６】
データ１４５６は、（実質的にリアルタイム、アーカイブまたは蓄積された）工程配列データセット４１２６および／または閉鎖環境センサーフィードバックデータ４１２７を保有してもよい。更に図３２において示されるように、本発明の一部態様によると、アプリケーションプログラム４１５４は自動工程配列および測定モジュール４１２５を保有する。アプリケーションプログラム４１５４はローカルサーバー（またはプロセッサー）および／またはデータベースまたはリモートサーバー（またはプロセッサー）および／またはデータベース、またはローカルおよびリモートデータベースおよび／またはサーバーの組合せに置かれてもよい。
【０１５７】
本発明は、図３２においてアプリケーションプログラム４１５４を参照して説明されているが、当業者に明らかなように、他の形態も本発明の範囲内に属する。例えば、アプリケーションプログラム４１５４よりむしろ、これらの回路およびモジュールは作動システム４１５２またはデータ処理システムの他のこのようなロジカル部分へ組み込んでもよい。更に、アプリケーションプログラム４１５４が単一データ処理システムで説明されているが、当業者に明らかなように、このような機能性は、例えば上記のクライアント／サーバーアレンジメントの種類に応じて、一以上のデータ処理システムにまたがり分配してもよい。このように、他のアレンジメントおよび／またはデータ処理システム間の機能の分割により提供されるように、本発明は図３２において示された形態に限定されると解釈するべきでない。例えば、図３２は様々な回路およびモジュールを有するとして説明されているが、これら回路またはモジュールのうち一以上が本発明の範囲から逸脱することなく結合または分離されていてもよい。
【０１５８】
他の態様
前記の例示システム１０は本発明の様々な態様および特徴を説明するために呈示されたが、本発明の範囲を核酸処理のシステム、デバイス、および方法に限定するためのものではない。むしろ、例えば、典型的には閉鎖コンテナで、物品を作製、組立て、処理、または操作するシステムおよび方法を含めて、様々な他の適用が本発明の範囲内に属する、と当業者であれば理解するであろう。下記の項目は、本発明の装置および方法が用いられる適用の追加例を呈示す。
【０１５９】
他の生物学および／または薬的適用の例
他の態様において、本発明は供給源から閉鎖環境の標的へ物質、例えば流体を移動する方法を提供し、ここで閉鎖環境は本出願で記載されているような装置のコンテナ中の内部区域またはチャンバーとして規定される。移動される流体としては、例えば生物学的物質、薬物、毒素、単離物、放射性同位元素、ウイルス、細菌、真核細胞、抽出物、被検体、生物試料、例えば血液、血漿、唾液など、ワクチン、核酸、タンパク質、食品、およびそれらの懸濁物、混合物などを含めたその他がある。
【０１６０】
本システムおよび方法の適用によると、例えば、閉鎖環境内へ移動される物質の汚染がコンテナ外の環境に存在しうる物体により避けられることを見出した。ある態様において、該システムおよび方法は、限定されないが、無菌性アッセイ、犯罪科学分析、または例えば臨床分野で用いられる生物学的物質の純度を試験する品質制御アッセイのような診断アッセイのための、またはそこにおいて物質を処理するための、物質の調製に関する。他の態様において、本方法は実験および／または臨床向けに薬物および生物学的物質、例えばワクチンおよび核酸の調製または製造のためである。本発明のシステムおよび方法で使用に適した様々なアッセイおよび方法論が、例えばUnited States Pharmacopeia,United States Pharmacopeia and National Formulary(USP 29-NF24)(2006),U.S.Department of Health and Human Services,Guidance for Industry:Sterile Drug Products Produced by Aseptic Processing - Current Good Manufacturing Practice(September 2004)で記載されているように、当業者に知られ、その各々が引用することにより本明細書の開示の一部とされる。
【０１６１】
流体が移動される標的は、移動流体を保持するように意図された、例えば管、バイアル、容器などのように、いかなる容器でもよいことが、当業者により理解されるであろう。一部の態様において、標的は結合カラム、サイズ排除カラム、クロマトグラフィー媒体、またはフィルターなどのような支持体である。しかしながら、提供される方法の具体的適用に応じて、あらゆるフロースルーデバイス、即ち移動流体の一以上の成分を流体の他の成分から捕捉および／または分離および／または濃縮するように意図されたあらゆるデバイスが用いられる。
【０１６２】
図１４は、閉鎖環境に置かれた結合カラム１４１０が、例えば核酸を含有する移動流体の標的である、例示装置の形態の例である。他の態様では、図１４において記載されたマニホールドが上記フィルターまたは他のデバイスと適合するように適合化される。
【０１６３】
一部の態様において、本発明により提供されるシステムおよび方法によれば、細胞抽出物からＲＮＡを単離して、単離されたＲＮＡの少なくとも一つのＲＮＡ分子から核酸産物を増幅させる工程を含んでなる、増幅核酸産物の無菌製造を行なえ、その際に単離および増幅工程は本出願で記載されているような装置のコンテナで内部区域またはチャンバーとして規定されているような閉鎖環境で行なわれ、それにより増幅核酸産物を無菌的に製造できる。
【０１６４】
増幅核酸産物の無菌製造のためのある態様において、増幅核酸産物は病原体から、例えばウイルス病原体から誘導される。ある態様において、増幅核酸産物はヒト腫瘍ＲＮＡから誘導される。ヒト腫瘍ＲＮＡからの増幅核酸産物は、例えばワクチンの製造または免疫療法において用いられる。
【０１６５】
本方法は、無菌条件下において、物質、例えば米国法典連邦規則第２１編で規定されているような生物学的物質、核酸、および／またはタンパク質などの滅菌に用いられる。臨床分野において、このような物質の調製に関するガイドラインは、例えばU.S.Department of Health and Human Services,Guidance for Industry:Sterile Drug Products Produced by Aseptic Processing - Current Good Manufacturing Practice(September 2004)において記載されている。
【０１６６】
このように、ある態様において、供給源からの物質を含んでなる流体をフィルターへ移動し、フィルター通過後の物質を容器へ集める、物質の滅菌のための方法が提供され、そこでは供給源、フィルター、および容器が本出願において記載されているような装置のコンテナで内部チャンバーまたは区域として規定されているような閉鎖環境に保有されている。滅菌用のフィルターは、例えばWhatman Inc.（Florham Park，ＮＪ）から市販されている。
【０１６７】
物質を移動すこと、例えば物質をバイアルへ分配することは、物質が病原体、例えばＨＩＶウイルス、または他のある微生物を含むか、または生物毒素または放射性物質を含むならば危険であることも、認められるであろう。本発明の態様で規定されているような閉鎖環境においてこのような物質を容器へ移動することは、移動を行なう個体への危険物質の潜在的な暴露を減らすために用いられる。このように、ある態様において、危険物質が供給源から、閉鎖環境、例えば本出願において記載されているような装置のコンテナに存在する標的へ移動される方法が提供される。これらの方法は、当業者に知られるように、危険物質が供給源および標的間で移動される様々な操作およびアッセイに適用される。
【０１６８】
本発明の装置は、タンパク質精製、核酸精製、および他の分子生物学的工程を典型とする他の分野に用いてもよい。このような適用には細胞溶解（例えば、細胞の機械的、カオトロピック、熱または酵素溶解）、高分子精製（例えば、イオン交換、ビーズ、分子量カットオフ）、および回収（シリカ溶出、ビーズ溶出、膜溶出）があるが、それらに限定されない。
【０１６９】
例示のリソグラフィー、マイクロ作製、および関連適用
本発明の態様は、クリーンルーム条件が用いられるまたは単離が望まれる状況、例えばリソグラフィーおよび組立て工程で用いられる。一部の態様において、本発明の装置はクリーンルーム分類について米国連邦標準２０９ｂにおいて記載のクラス１、クラス１０、クラス１００、クラス１０００、クラス１０，０００、またはクラス１００，０００クリーンルームの条件を満たす。引用することにより本明細書の開示の一部とされる、１９７３年４月２４日付のFederal Standard No.209B,1992,”Clean Room and Work Station Requirements,Controlled Environment”参照。このように、本発明の態様はクリーンルーム環境を用いる広域スペクトルの工程に用いられる。このような工程にはウェハーパターニング（フォトマスキング、マスキング、フォトリソグラフィー、マイクロリソグラフィーとしても知られる）、ドーピング（例えば、熱拡散、イオン注入）、熱処理（例えば、熱、輻射）のようなリソグラフィー工程を含むが、それらに限定されない。本発明の装置で行なわれる具体的なパターニング工程には、（ｉ）レジストアプリケーション（ポジティブまたはネガティブ）、（ii）高圧水銀、Ｘ線、またはＥ‐ビームへの暴露（例えば、接触、接近、走査プロジェクション、およびステッパー）、(iii)イメージング（例えば、単層レジスト、多層レジスト、アンチリフレクター層の適用、軸外光照明、平坦化、コントラスト強調）、および（iv）エッチ（例えば、湿式化学‐液体／蒸気、ドライ、プラズマ、リフト‐オフ、イオンミリング、反応性イオンエッチング）があるが、それらに限定されない。具体的な熱処理工程にはホットプレート、対流、急熱処理（ＲＴＰ）、および赤外があるが、それらに限定されない。これらリソグラフィー工程の更なる記載は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Van Zant,Microchip Fabrication,Fourth Edition,Chapter 4,2000,McGraw-Hill,New Yorkにおいて記載されている。
【０１７０】
一般的なリソグラフィー技術に加えて、本発明の装置は次世代リソグラフィー、例えば超紫外線リソグラフィー、Ｘ線リソグラフィー（例えば、ＬＩＧＡ）、荷電粒子ビームリソグラフィー（例えば、電子ビーム、イオンビーム）、走査プローブリソグラフィー（例えば、走査型トンネル顕微鏡リソグラフィー、原子間力顕微鏡リソグラフィー、走査型電気化学顕微鏡リソグラフィー）、ソフトリソグラフィー（例えば、レプリカ成形、マイクロコンタクト印刷、キャピラリーでのマイクロ成形、マイクロ移動成形、溶媒補助マイクロ成形、エラストマー相移動マスクを用いる近接場コンフォーマルフォトリソグラフィー）および三次元リソグラフィー（例えば、ホログラフリソグラフィー、非平面基板上リソグラフィー）を収納するために用いられる。このような技術は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,2002,CRC Press LLC Boca Raton,Florida,pp.48-68において記載されている。
【０１７１】
本発明の態様は、例えば免疫センサーにおいて検出現場で競合する非特異的タンパク質吸収の問題を扱う、タンパク質パターニングマイクロリソグラフィー技術に用いられる。例えば、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Clementi et al.,Structure and Motion:Membranes,Nucleic Acids and Proteins,Adenine Press,Schenectady,New York,1985参照。
【０１７２】
本発明のデバイス、システム、装置、および方法は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,2002,CRC Press LLC Boca Raton,FloridaのChapter ２で開示されるような、ドライエッチング技術、例えば物理的エッチング（例えば、イオンエッチング、スパッタリング、イオンビームミリング）、プラズマエッチング（例えば、ラジカルエッチング）、物理的／化学的エッチング、深反応性イオンエッチング、無プラズマの蒸気相エッチング、ドライエッチング、および単結晶反応性エッチング金属化（ＳＣＲＥＡＭ）を行なうために用いられる。
【０１７３】
本発明の装置は引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,2002,CRC Press LLC Boca Raton,FloridaのChapter ３において開示されるような、シリコン成長、シリコンのドーピング、シリコンの酸化、物理的蒸気拡散（例えば、熱蒸発、スパッタリング、分子ビームエピタキシー、レーザースパッター蒸着、アブレーション蒸着、イオンプレーティング、クラスタービーム技術）、化学的蒸着、シルクスクリーニング（スクリーン印刷）、ゾル‐ゲル蒸着、プラズマスプレー法、スプレー熱分解およびプラズマビーム蒸着のような付着技術でパターン移動を行なうために用いられる。
【０１７４】
本発明の態様は、ある種類のアレイ形態でよくアレンジされる、化学および生物学的センサーに有機物質を蒸着させるための技術を包含した、BIOMEMS分野において用いられる蒸着およびアレイ方法において特に有用であってもよい。このような技術は、例えば有機ガス透過性膜、イオン選択性膜、ヒドロゲル、室温ガスセンサーに必要な有機単層、イオン選択性電極、酵素センサー、免疫センサーとＤＮＡおよびタンパク質アレイを作るために用いられる。本発明の装置で履行されるBIOMEMS分野の具体的技術は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,pp.159-167,2002,CRC Press LLC Boca Raton,Floridaにおいて開示されるような、スピンコーティング、ディップコーティング、、プラスチックスプレー法、鋳造、活字鋳造(type casting)、グロー放電（プラズマ）重合、Langmuir-Blogett工程、インクジェット法、マイクロスポット法、および機械的マイクロスポット法である。
【０１７５】
本発明の態様は、小さなデバイス（例えば、集積回路）の包装のような、他のクリーンルーム分野にも用いられる。本発明の装置を用いて行なえる具体的包装技術としては、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Madou,Fundamentals of Microfabrication,Second Edition,pp.478-508,2002,CRC Press LLC Boca Raton,Floridaにおいて開示される、集積回路の包装、ダイシング、キャビティシーリングおよびボンディング、マルチ‐チップ包装、並びにパーティショニングがあるが、それらに限定されない。
【０１７６】
本発明の態様は、リソグラフィー工程でフォトレジストの分野に用いられる。例えば、本発明の装置はクリーンルーム環境で基板にポジティブまたはネガティブフォトレジストを載せるために用いられる。このように、レジストスピンコーティング、ソフトベーク、ハードベーク、デベロップメント、暴露後ベーク、および多層レジスト工程のような工程が、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Levinson,Principles of Lithography,SPIE Press,Bellingham,Washington,2001,Chapter 3で開示されるように、本発明の装置で行なえる。本発明の装置は、リソグラフィー工程、例えば光学リソグラフィー、電子ビームリソグラフィー、Ｘ線リソグラフィー、深ＵＶレジストアプリケーション、フォトマスク作製、並びに引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Microlithography,Micromachining and Microfabrication,ed.Rai-Choudhury,SPIE Press,Bellingham,Washington,2001,Chapter 1-6において記載されているようなリソグラフィーにおけるメトロロジー法に用いられる。本発明のシステム、デバイス、装置、および方法は、引用することにより本明細書の開示の一部とされる、Handbook of Photovoltaic Science and Engineering,Luque and Gegedu eds.,John Wiley & Sons,West Sussex,England,2003,pp.271-279において開示されるように、リン拡散、エッジアイソレーション、ＡＲＣ蒸着、フロントコンタクト印刷、バックコンタクト印刷、コファイアリング、テスティングおよびソーティングに限定されないが、それらを含めた光電池を作製するために用いられる方法を履行するために、更に用いられる。
【０１７７】
ここで引用されたすべての参考文献は、各個別刊行物または特許または特許出願が引用することにより本明細書の開示の一部とされる具体的かつ個別に示されるのと同程度に、引用することにより本明細書の開示の一部とされる。しかしながら、引用することにより本明細書の開示の一部とされた文献は、係属出願またはそれで発行する特許の請求項要素の解釈を狭めるようには用いられない。
【０１７８】
前述の記載および図面は本発明の態様を表しているが、添付請求項において規定されるような本発明の精神および範囲から逸脱することなく、様々な付加、修正、および置換がそこでなしうると理解されるであろう。特に、本発明が、その精神または本質的特徴から逸脱することなく、他の特別な形態、構造、アレンジ、割合と他の要素、物質および構成部品で具体化されうることは、当業者に明らかであろう。したがって、現在開示される態様はすべての点において限定ではなく説明としてみなされるべきで、本発明の範囲は添付された請求項により示されており、前述の記載に限定されない。
【図面の簡単な説明】
【０１７９】
本発明の他の特徴は、添付図面と合わせて読むことにより、その例示態様の下記詳細な記載からより容易に理解され、そこでは同一参照番号は同一要素を表す。図面は単独でまたは他の特徴と合わせて用いられるある特徴を図解するための単なる例示にすぎず、本発明が示された態様に限定されることはない。一つの態様または図に関して示された特徴は、他の態様または図で用いられてもよい。
【図１】図１は、本発明の態様に従う処理システムの斜視図である。
【図２】図２は、作業表面に隔離コンテナを保有する、図１のシステムの上部分の側面図である。
【図３】図３は、隔離コンテナなしで示された、図１のシステムの作業表面の一つの態様の斜視図である。
【図４】図４は、柔軟性のあるバリアが本発明の態様に従い、まだ取り付けられていない、隔離コンテナアセンブリーの斜視図である。
【図５】図５は、本発明の態様に従う隔離コンテナアセンブリーの破断(cutaway)斜視図である。
【図６】図６は、図５の隔離コンテナアセンブリーの破断斜視図である。
【図７Ａ】図７Ａおよび７Ｂは、本発明の態様に従うシリンジポンプシステムの側面図である。
【図７Ｂ】図７Ａおよび７Ｂは、本発明の態様に従うシリンジポンプシステムの側面図である。
【図８Ａ】図８Ａおよび８Ｂは、本発明の態様に従い流体ポンプシステムと協同するように適合させたピペットヘッドの横断側面図である。
【図８Ｂ】図８Ａおよび８Ｂは、本発明の態様に従い流体ポンプシステムと協同するように適合させたピペットヘッドの横断側面図である。
【図８Ｃ】図８Ｃは、本発明の態様に従い、図８Ａのピペットヘッドにおいて用いられる柔軟性のある隔離隔壁の上面図である。
【図８Ｄ】図８Ｄは、図８Ｃにおいて示された柔軟性のある隔離隔壁の断面図である。
【図９Ａ】図９Ａおよび９Ｂは、本発明の態様に従う柔軟性のあるバリアの、各々斜視および断面図である。
【図９Ｂ】図９Ａおよび９Ｂは、本発明の態様に従う柔軟性のあるバリアの、各々斜視および断面図である。
【図９Ｃ】図９Ｃおよび９Ｄは、柔軟性のあるバリアの他の態様の、各々斜視および横断側面図である。
【図９Ｄ】図９Ｄおよび９Ｄは、柔軟性のあるバリアの他の態様の、各々斜視および横断側面図である。
【図９Ｅ】図９Ｅは、本発明の態様に従い、部分断面図により示されたバリアにおけるカップラー、一体カップラーを有する柔軟性のあるバリアの斜視図である。
【図９Ｆ】図９Ｆは、本発明の態様に従い、図９Ｅにより示されたバリアカップラーを係合するように形成されたカップラーを有するロボットアームの一部の斜視図である。
【図９Ｇ】図９Ｇは、透明に破線で示された内部構成部品を覆う外部ハウジングを有する、（柔軟性のあるバリアなしで）図９Ｅおよび９Ｆにより示された構成部品のアセンブリーの斜視図である、
【図９Ｈ】図９Ｈは、柔軟性のあるバリアが本発明の態様に従い取り付けられた、図９Ｇにより示されたアセンブリーの斜視図である。
【図１０】図１０は、本発明の態様に従うＰＣＲプレートおよびサーマルサイクラーリッドアセンブリーの断面図である。
【図１１】図１１は、本発明の態様に従いサーマルサイクラーリッド駆動系を有する、サーマルサイクラーアセンブリーの斜視図である。
【図１２】図１２は、本発明の態様に従い、コンテナの柔軟性のあるサーマルサイクラーリッドシールの使用時における、図１１のサーマルサイクラーリッド駆動系の斜視図である。
【図１３Ａ】図１３Ａおよび１３Ｂは、本発明の態様に従うコンテナの作業スペース内外へのサーマルリッドの運動に際する、図１２のリッドシールの断面図である。
【図１３Ｂ】図１３Ａおよび１３Ｂは、本発明の態様に従うコンテナの作業スペース内外へのサーマルリッドの運動に際する、図１２のリッドシールの断面図である。
【図１３Ｃ】図１３Ｃは、図１３Ａおよび１３Ｂにおいて示されたリッドシールおよびコンテナの部分破断側面斜視図である。
【図１４】図１４は、本発明の態様に従いＤＮＡおよびＲＮＡ結合カラムを収納するためのマニホールドの斜視図である。
【図１５】図１５は、本発明の態様に従いステーション間でマニホールドを動かすためのピペットヘッドと係合時における、図１４のマニホールドの斜視図である。
【図１６】図１６は、本発明の態様に従い隔離コンテナで使用前の閉鎖真空システムを表した概略側面図である。
【図１７】図１７は、本発明の態様に従う隔離コンテナで使用時の、図１６の真空システムの概略側面図である。
【図１８】図１８は、本発明の態様に従い湿度および蒸気濃度を制御するための冷却ユニットを示す、隔離トレーの破断での処理システム作業表面の斜視図である。
【図１９Ａ】図１９Ａは、本発明の態様に従い隔離トレーへ取り付けられたキュベットの断面斜視図である。
【図１９Ｂ】図１９Ｂは、本発明の態様に従う分光光度計キュベット測定システムの協同構成部品の側面斜視図である。
【図２０Ａ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｂ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｃ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｄ】図２０Ａ〜２０Ｄは、本発明の態様に従い容積キュベットで容量を測定するシステムの作動の例であり、各図は容積キュベット測定システムの断面図である。
【図２０Ｅ】図２０Ｅは、本発明の態様に従い図２０Ａ〜２０Ｄに関して記載されているように作動しうる、マルチキュベット容量測定システムの上面、側面斜視図である。
【図２０Ｆ】図２０Ｆは、本発明の態様に従いコンテナの区画下へ出たキュベットを表す、図４および５において示されたコンテナの底面斜視図である。
【図２１Ａ】図２１Ａは、本発明の態様に従う試薬ラックの斜視図である。
【図２１Ｂ】図２１Ｂは、本発明の態様に従う穴あけ技術を表す、図２１Ａにおいて示された試薬ラックの概略上面斜視図である。
【図２２】図２２は、本発明の態様に従うアリコート管機構の作動を示した、一連の概略図である。
【図２３Ａ】図２３Ａは、本発明の態様に従い隔離コンテナトレー中へ積載される構成部品を示した図である。
【図２３Ｂ】図２３Ｂは、本発明の態様に従い図２３Ａにおいて示されたキット構成部品を用いる、部分組立てコンテナの上面斜視図である。
【図２３Ｃ】図２３Ｃは、図２３Ｂにおいて示された部分組立てキットの底面図である。
【図２３Ｄ】図２３Ｄは、キット構成部品が本発明の態様に従い使用現場で取り付け前の、図２３Ａにおいて示されたキットにおけるコンテナの上面図である。
【図２４】図２４は、本発明の態様に従う柔軟性のあるバリアでのトレーのシーリングを示した、図２３Ａの隔離コンテナトレーの分解組立図である。
【図２５】図２５は、本発明の態様に従い行なわれる作動のフローチャートである。
【図２６Ａ】図２６Ａおよび２６Ｂは、本発明の態様に従うレバー付きピペットヘッドの拡大側面斜視図である。
【図２６Ｂ】図２６Ａおよび２６Ｂは、本発明の態様に従うレバー付きピペットヘッドの拡大側面斜視図である。
【図２６Ｃ】図２６Ｃは、本発明の態様に従いピペットチップを解放するようなコンテナの内部表面との係合を示した、図２６Ａおよび２６Ｂにおいて示されたレバーの側面斜視図である。
【図２７】図２７は、本発明の態様に従い機器にコンテナを積載するために用いられる、トロリーの上面斜視図である。
【図２８Ａ】図２８Ａは、本発明の態様に従いロボットアームでコンテナを並べられる、バイアスアセンブリー形態による作業表面の拡大側面斜視図である。
【図２８Ｂ】図２８Ｂは、本発明の態様に従い所望方向にコンテナを押し出すために用いられるスプリングを示した、図２８Ａにおいて示される作業表面の一部の底面斜視図である。
【図２９Ａ】図２９Ａは、本発明の態様に従う溶出トレーの上面図である。
【図２９Ｂ】図２９Ｂは、図２９Ａにおいて示されたトレーの底面斜視図である。
【図２９Ｃ】図２９Ｃは、図２９Ａにおいて示されたトレーの上面斜視図である。
【図３０Ａ】図３０Ａは、廃棄トレーカバーの上面斜視図である。
【図３０Ｂ】図３０Ｂは、図３０Ａにおいて示されたトレーカバーの底面斜視図である。
【図３１】図３１は、本発明により考えられる自動システムで用いられる回路のブロック図である。
【図３２】図３２は、本発明の態様に従うデータ処理システムのブロック図である。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
操作対象となる複数の物品を保持しうるように形成された内部区域を有するコンテナと、
密封可能にコンテナに取り付けられるよう構成された柔軟性のあるバリアと、そして
該柔軟性のあるバリアとともにまたはその中に組み込まれたツール（ここで、該ツールは第一インターフェースおよび第二インターフェースを有し、第一インターフェースは、コンテナの内部区域の外側の前記バリアの第一の面においてロボットデバイスに取り付けられるよう構成され、第二インターフェースは、柔軟性のあるバリア下においてコンテナの内部区域内に配置され、前記柔軟性のあるバリアが密封可能にコンテナに取り付けられた場合に内部区域において物品を操作しうるように構成される）と、
を含んでなる、閉鎖コンテナ内において物品を操作するための装置。
【請求項２】
前記複数の物品が核酸サンプルを含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項３】
前記ツールが分注装置の構成部品を含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項４】
前記コンテナが、核酸サンプルを処理するための複数のステーションを更に含んでなる、請求項２に記載の装置。
【請求項５】
少なくとも一つの核酸結合カラムを保持するように形成されたマニホールドを更に含んでなり、該マニホールドが複数のステーションのうち少なくとも二つの間で移動するように形成される、請求項４に記載の装置。
【請求項６】
前記マニホールドがハンドルを含んでなり、前記第二インターフェースが少なくとも二つのステーションへ、および該ステーションからマニホールドを動かすためのハンドルを係合するように形成される、請求項５に記載の装置。
【請求項７】
前記少なくとも二つのステーションが溶出ステーションおよび廃棄ステーションを含んでなる、請求項６に記載の装置。
【請求項８】
複数のステーションのうち少なくとも一つが試薬ステーションを含んでなる、請求項４に記載の装置。
【請求項９】
試薬ステーション内に配置された試薬ラックを更に含んでなり、該試薬ラックが核酸サンプルを処理するための複数の試薬を保持する、請求項８に記載の装置。
【請求項１０】
前記コンテナのベースへ密封されて、サーマルブロックに適合するように設計された、単一ウェルおよびマルチウェル容器を更に含んでなり、該容器がコンテナの内部区域から接近可能である、請求項１に記載の装置。
【請求項１１】
前記コンテナが、コンテナの側壁へ密封可能に連結され、側壁の隙間越しに伸びて閉鎖された柔軟性のあるサイドエントリーチャンネルを形成する柔軟性のあるシールを更に含んでなり、該柔軟性のあるサイドエントリーチャンネルが、柔軟性のあるシール内の側壁で隙間内外にリッドを往復させ、垂直に閉じて容器をカバーするように移動させ、それにより柔軟性のある密封がコンテナ内で閉鎖環境を維持しながらコンテナの内部区域内外にリッドを移動させる、請求項１０に記載の装置。
【請求項１２】
前記柔軟性のあるシールに保持されながら前記コンテナの側壁隙間内外にリッドを自動的に移動させるための自動駆動系付きの駆動部材を更に含んでなる、請求項１１に記載の装置。
【請求項１３】
前記コンテナから外方へ伸びて、コンテナの内部区域と流体連絡している複数のアリコート管とを更に含んでなり、処理される流体サンプルを入れるように複数のアリコート管が形成される、請求項１に記載の装置。
【請求項１４】
処理される複数のサンプルを複数のアリコート管へ取り込むためのアリコート管エクスプレッサーを更に含んでなる、請求項１３に記載の装置。
【請求項１５】
前記アリコート管エクスプレッサーが、複数のアリコート管のうち一以上を密封するための管シーラーを含んでなる、請求項１４に記載の装置。
【請求項１６】
分注装置が：
前記コンテナ内に貯蔵されたピペットチップを解放可能に係合するためのピペットチップアダプター、
前記コンテナの外部において流体ポンプと連絡するための作業液チャンバー、および
作業液チャンバーをピペットチップアダプターから隔離して、流体ポンプからピペットチップアダプターへ圧力を伝えるための隔壁またはフィルター
を含んでなる、請求項３に記載の装置。
【請求項１７】
サンプルを定量するための分光光度計を更に含んでなり、コンテナが該コンテナのベースへキュベットを密封するためのコネクターを含んでなり、該キュベットが分光光度計により定量されるサンプルを保持するように形成される、請求項１に記載の装置。
【請求項１８】
前記柔軟性のあるバリアがコンテナへ密封される場合に、閉鎖ループにおいてコンテナの内部区域内に密封された空気を循環させるように形成された再循環真空システムを更に含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項１９】
前記真空システムが一回用使い捨て真空ヘッドおよび柔軟性のある管類を含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項２０】
前記密封されたコンテナ内において、湿度および／または蒸気濃度を制御するための少なくとも一つの熱交換デバイスを更に含んでなる、請求項１９に記載の装置。
【請求項２１】
前記コンテナおよびバリアが一回用使い捨てである、請求項１に記載の装置。
【請求項２２】
前記閉鎖システムの閉鎖状態に影響を与えることなく、前記コンテナが密封されたままで、処理された流体がコンテナから排出され、コンテナおよびバリアが閉鎖システム使い捨て用品を形成するように使用中および使用後に密封されたままである、請求項１３に記載の装置。
【請求項２３】
閉鎖容器と連絡する圧力センサーと、閉鎖コンテナにおいて圧力を測定して密封の完全性を確認しうるように形成された圧力センサーと連絡する制御回路とを更に含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項２４】
コンテナポジションガイドを有する作業表面付きハウジングを更に含んでなり、柔軟性のあるバリアとともにコンテナを保持して、コンテナポジションガイドを用いて作業表面上の適正な作動位置へ閉鎖コンテナをスライド可能に移動できるように、オペレーターにトロリーをハウジングと並べさせうるように形成されたトロリーを、前記装置が更に含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項２５】
作業表面コンテナポジションガイドが間隔をあけたスロットを含んでなり、トロリーが作業表面上のスロットと並ぶ対応スロットを含んでなり、それにより閉鎖コンテナがトロリーから作業表面の適正な作動位置へスライド可能に移動される、請求項２４に記載の装置。
【請求項２６】
ロボットアーム下において望ましい作動位置へ閉鎖コンテナを押し出すように、作業表面で閉鎖コンテナに対して押し出すスプリングバイアス部材を更に含んでなる、請求項２４に記載の装置。
【請求項２７】
複数の処理ステーションを含んでなる内部を有した一回用使い捨てコンテナを用意し、
少なくとも一つの試薬および少なくとも一つのサンプルを該コンテナへ充填し、
該コンテナを柔軟性のあるバリアで密封し（該柔軟性のあるバリアは柔軟性のあるバリアとともにまたはその中に組み込まれたピペットヘッドを含んでなり、該ピペットヘッドは、コンテナの内部にピペットチップを係合するためバリアの片側から伸びるピペットチップアダプターと、ロボットアームのピペットヘッドアダプターを入れるためのバリアの反対側における容器とを有する）、
ロボットアームが密封したコンテナの外部に存在するように、ロボットアームのピペットヘッドアダプターをピペットヘッドに取り付け、
コンテナにおいて一以上の処理ステーション間でサンプルおよび試薬を移動するためにコンテナの外部からロボットアームを用いてピペットヘッドを操作し、および
一以上の処理ステーションにおいて少なくとも一つのサンプルを処理する、
ことを含んでなる、サンプルを処理するための方法。
【請求項２８】
前記複数の処理ステーションが、ＰＣＲプレート、溶出ステーション、および廃棄ステーションを含んでなる、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記コンテナを密封する前に、結合カラムを保持する少なくとも一つのマニホールドをコンテナへ積載することを更に含んでなり、該マニホールドが溶出ステーションおよび廃棄ステーション内で適合するように形成される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記処理工程が、溶出ステーションおよび廃棄ステーション位置間でマニホールドを移動することを含んでなる、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記処理に際してコンテナ内において、閉鎖容量を維持することを更に含んでなる、請求項２７に記載の方法。
【請求項３２】
前記閉鎖容量を維持することが、コンテナ内において空気を再循環させることを含んでなる、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記閉鎖容量を維持することが、コンテナ内において湿度および／または蒸気濃度を制御することを含んでなる、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
作業液を送り出すためのポンプ、
作業液を介してポンプと連絡する隔壁（ここで、該隔壁は作業液および作業液ポンプを流体サンプルから隔離するように形成される）、および
隔壁およびサンプルと連絡する管（ここで、該管は隔壁と連絡する管腔を有する）
を含んでなり、該隔壁は圧力の変化が管腔中へ流体を引き込むかまたはそこから流体を排出するように、作業液における圧力の変化を管の管腔へ伝えるように形成される、流体の移動のための装置。
【請求項３５】
前記管が解放可能なピペットチップを含んでなる、請求項３４に記載の装置。
【請求項３６】
サンプルコンテナの既定位置の方へシグナルを発するように形成された少なくとも一つのエミッター、
該シグナルがサンプルコンテナと相互作用した後でシグナルを受け取るように形成された少なくとも一つのレシーバー（該レシーバーにより受け取られるシグナルの変化は、流体が上記既定位置より降下した場合を示す）、および
該レシーバーおよびサンプルコンテナと連絡した流体移動デバイス
を含んでなり、該流体移動デバイスは、流体が前記既定位置より降下したことをレシーバーが検出した場合に、それがサンプルコンテナから取り出された流体の容量を調べる、流体の容量を測定するための装置。
【請求項３７】
前記エミッターが光エミッターであり、前記シグナルが光を含んでなる、請求項３６に記載の装置。
【請求項３８】
前記流体移動デバイスがピペットの少なくとも一部を含んでなる、請求項３６に記載の装置。
【請求項３９】
前記サンプルコンテナがキュベットを含んでなる、請求項３６に記載の装置。
【請求項４０】
前記エミッターと、連続的に連絡する複数のサンプルコンテナとを更に含んでなる、請求項３９に記載の装置。
【請求項４１】
光を放出するための少なくとも一つの光源、
光源から光を受け取るための少なくとも一つのレシーバー、
キュベット（キュベットが流体を含有しているかまたは空であるかに応じて、そこを通る光路の変化が検出される）、および
キュベットが空であることをレシーバーが検出した場合、キュベットから取り出された流体の容量を調べられるようにレシーバーと連絡した流体移動デバイス
を含んでなる、流体の容量を測定するための装置。
【請求項４２】
前記流体移動デバイスがピペットの少なくとも一部を含んでなる、請求項４１に記載の装置。
【請求項４３】
複数の区域が間隔をあけたワークステーションを形成する、実質的に硬質のボディを有する第一部材、および
複数のワークステーションにわたり閉鎖チャンバーを形成するように第一部材へ密封可能に取り付けられた柔軟性のあるバリア部材（該柔軟性のあるバリアは実質的に不透過性であり、柔軟性のあるバリア部材は該バリアへ密封可能に取り付けられた操作ツールを含んでなり、該ツールは柔軟性のあるバリア下の閉鎖チャンバーに存在する第一内部インターフェースと閉鎖チャンバー外に存在する第二外部インターフェースを有する）
を含んでなる、処理コンテナ。
【請求項４４】
前記バリアおよび第一部材が一回用使い捨てである、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４５】
前記第一部材が外部冷却要素をぴったり入れるように形成された壁セグメントを有し、作動時に、該壁セグメントがコンテナ内で凝縮壁を形成するように冷却要素と協同している、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４６】
第一部材がサイドエントリーレシービング隙間を有する側壁を含んでなり、該サイドエントリーレシービング隙間が、少なくとも一つの物品をコンテナの内部区域へ出入させるように形成された、実質的に横方向へ伸びるスリーブで密封可能にカバーされる、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４７】
ワークステーション区域のうち一つがＰＣＲプレートを保持するように形成され、ワークステーション区域の他がピペットチップ入れピペットラックを保持するように形成され、ワークステーション区域の他が密封された試薬容器のトレーを保持するように形成される、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４８】
第一ワークステーションがＰＣＲプレートを保持するように形成され、第二ワークステーションが試薬を保持するように形成され、および第三ワークステーションが無菌ピペットを保持するように形成された、実質的に硬質のボディを有する一回用使い捨て無菌トレーを含んでなる、生物サンプル処理コンテナ。
【請求項４９】
トレーに密封して、密封された閉鎖内部チャンバーを形成するように外部エッジ部分を形成させた柔軟性のあるバリアであって、
エラストマーを含んでなり、バリアの中央部分でロボットアームインターフェースへ密封可能に取り付けられている、柔軟性のあるバリア。
【請求項５０】
前記柔軟性のあるバリアが実質的に不透過性である、請求項４９に記載のバリア。
【請求項５１】
前記柔軟性のあるバリアが複数の放射状プリーツを含んでなる、請求項４９に記載のバリア。
【請求項５２】
柔軟性のあるバリアの中央部分が、複数の実質上垂直向き階段状部分を含んでなる、請求項４９に記載のバリア。
【請求項５３】
側壁を有するトレー、および
トレー側壁と接触し、それにより該側壁との接触でレバーをピボットへ押しやり、操作ツールにより保持された各使用済みピペットチップを解放するように形成された、外方へ伸びるレバーを有する操作ツールと一体化したロボットアーム
を含んでなる、自動ピペットチップ取外しシステム。
【請求項５４】
傾斜側壁下および付近でピペットチップラックを実質上水平に保持するトレーのベースへ向けて、トレー側壁が下方に傾斜している、請求項５３に記載のシステム。
【請求項５５】
ピペットチップラックと連絡するロードセンサーを更に含んでなり、前進して標的ピペットチップに対し約５Ｎ〜５０Ｎ荷重を加えて、ピペットチップラックにより保持された各ピペットチップを係合するために、操作ツールが形成される、請求項５３に記載のシステム。
【請求項５６】
ロボットアーム、および
ロボットアームと協同する操作ツール（該ツールは、ピペットチップを解放可能に係合し、カバーに付いた穴あきオープニングの一つで容器から流体を取り出す前に、自動的に並進して異なる間隔をあけた箇所で複数回にわたり容器のカバーを穴あけするように形成される）
を含んでなる、液体を処理するためのシステム。
【請求項５７】
容器の一部が上方へ伸びるバリアの第一側面に位置し、容器の他がバリアの反対側面に位置した、間隔をあけた複数の容器を有する無菌生体適合性溶出トレーを含んでなり、該容器の各々が、その各側面に伸びて主管状部分の方向で下方へテーパー化するチャンネルを有する、溶出トレー。
【請求項５８】
トレーと、それへ密封可能に取り付けられるよう構成された柔軟性のあるバリアとを含んでなる一回用使い捨てコンテナ、
第一ワークステーションでコンテナに存在するように形成された一回用使い捨て試薬ラック、
コンテナに存在するように形成された一回用使い捨て結合カラムマニホールド、および
コンテナに存在するように形成された一回用使い捨てピペットラック
を含んでなる、自動処理システムで使用のためのキット。
【請求項５９】
前記コンテナに存在して使用済みピペットを保持するように形成された第二ピペットラックを更に含んでなる、請求項５８に記載のキット。
【請求項６０】
トレーへ取り付けられ、作動時にコンテナにおいて空気を再循環させるように形成された、管類付きの一回用使い捨て真空ポンプヘッドを更に含んでなる、請求項５８に記載のキット。
【請求項６１】
前記コンテナに存在して、ワークステーション間で動くように形成されたハンドル付きマニホールドを更に含んでなる、請求項５８に記載のキット。
【請求項６２】
ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かし、閉鎖コンテナにおいて受容表面付近に先端を置いて下方角度方向にピペットを向けさせるために、ロボットアームをプログラムで指示し、
次いで下方向き角度のピペットを平面に沿い実質上直線的に自動で動かしながら、ピペットから流動性物質を放出させる、
ピペットから液体を放出させる方法。
【請求項６３】
柔軟性のあるバリアを有する密封可能閉鎖コンテナにサンプルを用意し、および
サンプルを処理するため閉鎖コンテナが密封されたままで、柔軟性のあるバリアと協同して、一連の作動により閉鎖コンテナの内側でインターフェースツールを動かすために、ロボットアームをプログラムで指示する
ことを含んでなる、閉鎖システムにおけるサンプルの処理方法。
【請求項６４】
増幅中に複数の時間でサンプルの容量および濃度を電子的で、自動的に測定することを更に含んでなる、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
閉鎖システムの密封された状態を毀損することなく、少なくとも一つの処理されたサンプルをアリコート容器に捕捉することを更に含んでなる、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
閉鎖コンテナの密封の完全性を電子的で自動的に測定することを更に含んでなる、請求項６３に記載の方法。
【請求項６７】
操作対象となる複数の物品を保持しうるように内部区域を形成させたコンテナ、および
閉鎖ループにおいてコンテナの内部区域内に密封された空気を循環させるように形成された再循環真空システム
を含んでなる、閉鎖コンテナ内において物品を操作するための装置。
【請求項１】
操作対象となる複数の物品を保持しうるように形成された内部区域を有するコンテナと、
密封可能にコンテナに取り付けられるよう構成された柔軟性のあるバリアと、そして
該柔軟性のあるバリアとともにまたはその中に組み込まれたツール（ここで、該ツールは第一インターフェースおよび第二インターフェースを有し、第一インターフェースは、コンテナの内部区域の外側の前記バリアの第一の面においてロボットデバイスに取り付けられるよう構成され、第二インターフェースは、柔軟性のあるバリア下においてコンテナの内部区域内に配置され、前記柔軟性のあるバリアが密封可能にコンテナに取り付けられた場合に内部区域において物品を操作しうるように構成される）と、
を含んでなる、閉鎖コンテナ内において物品を操作するための装置。
【請求項２】
前記複数の物品が核酸サンプルを含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項３】
前記ツールが分注装置の構成部品を含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項４】
前記コンテナが、核酸サンプルを処理するための複数のステーションを更に含んでなる、請求項２に記載の装置。
【請求項５】
少なくとも一つの核酸結合カラムを保持するように形成されたマニホールドを更に含んでなり、該マニホールドが複数のステーションのうち少なくとも二つの間で移動するように形成される、請求項４に記載の装置。
【請求項６】
前記マニホールドがハンドルを含んでなり、前記第二インターフェースが少なくとも二つのステーションへ、および該ステーションからマニホールドを動かすためのハンドルを係合するように形成される、請求項５に記載の装置。
【請求項７】
前記少なくとも二つのステーションが溶出ステーションおよび廃棄ステーションを含んでなる、請求項６に記載の装置。
【請求項８】
複数のステーションのうち少なくとも一つが試薬ステーションを含んでなる、請求項４に記載の装置。
【請求項９】
試薬ステーション内に配置された試薬ラックを更に含んでなり、該試薬ラックが核酸サンプルを処理するための複数の試薬を保持する、請求項８に記載の装置。
【請求項１０】
前記コンテナのベースへ密封されて、サーマルブロックに適合するように設計された、単一ウェルおよびマルチウェル容器を更に含んでなり、該容器がコンテナの内部区域から接近可能である、請求項１に記載の装置。
【請求項１１】
前記コンテナが、コンテナの側壁へ密封可能に連結され、側壁の隙間越しに伸びて閉鎖された柔軟性のあるサイドエントリーチャンネルを形成する柔軟性のあるシールを更に含んでなり、該柔軟性のあるサイドエントリーチャンネルが、柔軟性のあるシール内の側壁で隙間内外にリッドを往復させ、垂直に閉じて容器をカバーするように移動させ、それにより柔軟性のある密封がコンテナ内で閉鎖環境を維持しながらコンテナの内部区域内外にリッドを移動させる、請求項１０に記載の装置。
【請求項１２】
前記柔軟性のあるシールに保持されながら前記コンテナの側壁隙間内外にリッドを自動的に移動させるための自動駆動系付きの駆動部材を更に含んでなる、請求項１１に記載の装置。
【請求項１３】
前記コンテナから外方へ伸びて、コンテナの内部区域と流体連絡している複数のアリコート管とを更に含んでなり、処理される流体サンプルを入れるように複数のアリコート管が形成される、請求項１に記載の装置。
【請求項１４】
処理される複数のサンプルを複数のアリコート管へ取り込むためのアリコート管エクスプレッサーを更に含んでなる、請求項１３に記載の装置。
【請求項１５】
前記アリコート管エクスプレッサーが、複数のアリコート管のうち一以上を密封するための管シーラーを含んでなる、請求項１４に記載の装置。
【請求項１６】
分注装置が：
前記コンテナ内に貯蔵されたピペットチップを解放可能に係合するためのピペットチップアダプター、
前記コンテナの外部において流体ポンプと連絡するための作業液チャンバー、および
作業液チャンバーをピペットチップアダプターから隔離して、流体ポンプからピペットチップアダプターへ圧力を伝えるための隔壁またはフィルター
を含んでなる、請求項３に記載の装置。
【請求項１７】
サンプルを定量するための分光光度計を更に含んでなり、コンテナが該コンテナのベースへキュベットを密封するためのコネクターを含んでなり、該キュベットが分光光度計により定量されるサンプルを保持するように形成される、請求項１に記載の装置。
【請求項１８】
前記柔軟性のあるバリアがコンテナへ密封される場合に、閉鎖ループにおいてコンテナの内部区域内に密封された空気を循環させるように形成された再循環真空システムを更に含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項１９】
前記真空システムが一回用使い捨て真空ヘッドおよび柔軟性のある管類を含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項２０】
前記密封されたコンテナ内において、湿度および／または蒸気濃度を制御するための少なくとも一つの熱交換デバイスを更に含んでなる、請求項１９に記載の装置。
【請求項２１】
前記コンテナおよびバリアが一回用使い捨てである、請求項１に記載の装置。
【請求項２２】
前記閉鎖システムの閉鎖状態に影響を与えることなく、前記コンテナが密封されたままで、処理された流体がコンテナから排出され、コンテナおよびバリアが閉鎖システム使い捨て用品を形成するように使用中および使用後に密封されたままである、請求項１３に記載の装置。
【請求項２３】
閉鎖容器と連絡する圧力センサーと、閉鎖コンテナにおいて圧力を測定して密封の完全性を確認しうるように形成された圧力センサーと連絡する制御回路とを更に含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項２４】
コンテナポジションガイドを有する作業表面付きハウジングを更に含んでなり、柔軟性のあるバリアとともにコンテナを保持して、コンテナポジションガイドを用いて作業表面上の適正な作動位置へ閉鎖コンテナをスライド可能に移動できるように、オペレーターにトロリーをハウジングと並べさせうるように形成されたトロリーを、前記装置が更に含んでなる、請求項１に記載の装置。
【請求項２５】
作業表面コンテナポジションガイドが間隔をあけたスロットを含んでなり、トロリーが作業表面上のスロットと並ぶ対応スロットを含んでなり、それにより閉鎖コンテナがトロリーから作業表面の適正な作動位置へスライド可能に移動される、請求項２４に記載の装置。
【請求項２６】
ロボットアーム下において望ましい作動位置へ閉鎖コンテナを押し出すように、作業表面で閉鎖コンテナに対して押し出すスプリングバイアス部材を更に含んでなる、請求項２４に記載の装置。
【請求項２７】
複数の処理ステーションを含んでなる内部を有した一回用使い捨てコンテナを用意し、
少なくとも一つの試薬および少なくとも一つのサンプルを該コンテナへ充填し、
該コンテナを柔軟性のあるバリアで密封し（該柔軟性のあるバリアは柔軟性のあるバリアとともにまたはその中に組み込まれたピペットヘッドを含んでなり、該ピペットヘッドは、コンテナの内部にピペットチップを係合するためバリアの片側から伸びるピペットチップアダプターと、ロボットアームのピペットヘッドアダプターを入れるためのバリアの反対側における容器とを有する）、
ロボットアームが密封したコンテナの外部に存在するように、ロボットアームのピペットヘッドアダプターをピペットヘッドに取り付け、
コンテナにおいて一以上の処理ステーション間でサンプルおよび試薬を移動するためにコンテナの外部からロボットアームを用いてピペットヘッドを操作し、および
一以上の処理ステーションにおいて少なくとも一つのサンプルを処理する、
ことを含んでなる、サンプルを処理するための方法。
【請求項２８】
前記複数の処理ステーションが、ＰＣＲプレート、溶出ステーション、および廃棄ステーションを含んでなる、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記コンテナを密封する前に、結合カラムを保持する少なくとも一つのマニホールドをコンテナへ積載することを更に含んでなり、該マニホールドが溶出ステーションおよび廃棄ステーション内で適合するように形成される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記処理工程が、溶出ステーションおよび廃棄ステーション位置間でマニホールドを移動することを含んでなる、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記処理に際してコンテナ内において、閉鎖容量を維持することを更に含んでなる、請求項２７に記載の方法。
【請求項３２】
前記閉鎖容量を維持することが、コンテナ内において空気を再循環させることを含んでなる、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記閉鎖容量を維持することが、コンテナ内において湿度および／または蒸気濃度を制御することを含んでなる、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
作業液を送り出すためのポンプ、
作業液を介してポンプと連絡する隔壁（ここで、該隔壁は作業液および作業液ポンプを流体サンプルから隔離するように形成される）、および
隔壁およびサンプルと連絡する管（ここで、該管は隔壁と連絡する管腔を有する）
を含んでなり、該隔壁は圧力の変化が管腔中へ流体を引き込むかまたはそこから流体を排出するように、作業液における圧力の変化を管の管腔へ伝えるように形成される、流体の移動のための装置。
【請求項３５】
前記管が解放可能なピペットチップを含んでなる、請求項３４に記載の装置。
【請求項３６】
サンプルコンテナの既定位置の方へシグナルを発するように形成された少なくとも一つのエミッター、
該シグナルがサンプルコンテナと相互作用した後でシグナルを受け取るように形成された少なくとも一つのレシーバー（該レシーバーにより受け取られるシグナルの変化は、流体が上記既定位置より降下した場合を示す）、および
該レシーバーおよびサンプルコンテナと連絡した流体移動デバイス
を含んでなり、該流体移動デバイスは、流体が前記既定位置より降下したことをレシーバーが検出した場合に、それがサンプルコンテナから取り出された流体の容量を調べる、流体の容量を測定するための装置。
【請求項３７】
前記エミッターが光エミッターであり、前記シグナルが光を含んでなる、請求項３６に記載の装置。
【請求項３８】
前記流体移動デバイスがピペットの少なくとも一部を含んでなる、請求項３６に記載の装置。
【請求項３９】
前記サンプルコンテナがキュベットを含んでなる、請求項３６に記載の装置。
【請求項４０】
前記エミッターと、連続的に連絡する複数のサンプルコンテナとを更に含んでなる、請求項３９に記載の装置。
【請求項４１】
光を放出するための少なくとも一つの光源、
光源から光を受け取るための少なくとも一つのレシーバー、
キュベット（キュベットが流体を含有しているかまたは空であるかに応じて、そこを通る光路の変化が検出される）、および
キュベットが空であることをレシーバーが検出した場合、キュベットから取り出された流体の容量を調べられるようにレシーバーと連絡した流体移動デバイス
を含んでなる、流体の容量を測定するための装置。
【請求項４２】
前記流体移動デバイスがピペットの少なくとも一部を含んでなる、請求項４１に記載の装置。
【請求項４３】
複数の区域が間隔をあけたワークステーションを形成する、実質的に硬質のボディを有する第一部材、および
複数のワークステーションにわたり閉鎖チャンバーを形成するように第一部材へ密封可能に取り付けられた柔軟性のあるバリア部材（該柔軟性のあるバリアは実質的に不透過性であり、柔軟性のあるバリア部材は該バリアへ密封可能に取り付けられた操作ツールを含んでなり、該ツールは柔軟性のあるバリア下の閉鎖チャンバーに存在する第一内部インターフェースと閉鎖チャンバー外に存在する第二外部インターフェースを有する）
を含んでなる、処理コンテナ。
【請求項４４】
前記バリアおよび第一部材が一回用使い捨てである、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４５】
前記第一部材が外部冷却要素をぴったり入れるように形成された壁セグメントを有し、作動時に、該壁セグメントがコンテナ内で凝縮壁を形成するように冷却要素と協同している、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４６】
第一部材がサイドエントリーレシービング隙間を有する側壁を含んでなり、該サイドエントリーレシービング隙間が、少なくとも一つの物品をコンテナの内部区域へ出入させるように形成された、実質的に横方向へ伸びるスリーブで密封可能にカバーされる、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４７】
ワークステーション区域のうち一つがＰＣＲプレートを保持するように形成され、ワークステーション区域の他がピペットチップ入れピペットラックを保持するように形成され、ワークステーション区域の他が密封された試薬容器のトレーを保持するように形成される、請求項４３に記載のコンテナ。
【請求項４８】
第一ワークステーションがＰＣＲプレートを保持するように形成され、第二ワークステーションが試薬を保持するように形成され、および第三ワークステーションが無菌ピペットを保持するように形成された、実質的に硬質のボディを有する一回用使い捨て無菌トレーを含んでなる、生物サンプル処理コンテナ。
【請求項４９】
トレーに密封して、密封された閉鎖内部チャンバーを形成するように外部エッジ部分を形成させた柔軟性のあるバリアであって、
エラストマーを含んでなり、バリアの中央部分でロボットアームインターフェースへ密封可能に取り付けられている、柔軟性のあるバリア。
【請求項５０】
前記柔軟性のあるバリアが実質的に不透過性である、請求項４９に記載のバリア。
【請求項５１】
前記柔軟性のあるバリアが複数の放射状プリーツを含んでなる、請求項４９に記載のバリア。
【請求項５２】
柔軟性のあるバリアの中央部分が、複数の実質上垂直向き階段状部分を含んでなる、請求項４９に記載のバリア。
【請求項５３】
側壁を有するトレー、および
トレー側壁と接触し、それにより該側壁との接触でレバーをピボットへ押しやり、操作ツールにより保持された各使用済みピペットチップを解放するように形成された、外方へ伸びるレバーを有する操作ツールと一体化したロボットアーム
を含んでなる、自動ピペットチップ取外しシステム。
【請求項５４】
傾斜側壁下および付近でピペットチップラックを実質上水平に保持するトレーのベースへ向けて、トレー側壁が下方に傾斜している、請求項５３に記載のシステム。
【請求項５５】
ピペットチップラックと連絡するロードセンサーを更に含んでなり、前進して標的ピペットチップに対し約５Ｎ〜５０Ｎ荷重を加えて、ピペットチップラックにより保持された各ピペットチップを係合するために、操作ツールが形成される、請求項５３に記載のシステム。
【請求項５６】
ロボットアーム、および
ロボットアームと協同する操作ツール（該ツールは、ピペットチップを解放可能に係合し、カバーに付いた穴あきオープニングの一つで容器から流体を取り出す前に、自動的に並進して異なる間隔をあけた箇所で複数回にわたり容器のカバーを穴あけするように形成される）
を含んでなる、液体を処理するためのシステム。
【請求項５７】
容器の一部が上方へ伸びるバリアの第一側面に位置し、容器の他がバリアの反対側面に位置した、間隔をあけた複数の容器を有する無菌生体適合性溶出トレーを含んでなり、該容器の各々が、その各側面に伸びて主管状部分の方向で下方へテーパー化するチャンネルを有する、溶出トレー。
【請求項５８】
トレーと、それへ密封可能に取り付けられるよう構成された柔軟性のあるバリアとを含んでなる一回用使い捨てコンテナ、
第一ワークステーションでコンテナに存在するように形成された一回用使い捨て試薬ラック、
コンテナに存在するように形成された一回用使い捨て結合カラムマニホールド、および
コンテナに存在するように形成された一回用使い捨てピペットラック
を含んでなる、自動処理システムで使用のためのキット。
【請求項５９】
前記コンテナに存在して使用済みピペットを保持するように形成された第二ピペットラックを更に含んでなる、請求項５８に記載のキット。
【請求項６０】
トレーへ取り付けられ、作動時にコンテナにおいて空気を再循環させるように形成された、管類付きの一回用使い捨て真空ポンプヘッドを更に含んでなる、請求項５８に記載のキット。
【請求項６１】
前記コンテナに存在して、ワークステーション間で動くように形成されたハンドル付きマニホールドを更に含んでなる、請求項５８に記載のキット。
【請求項６２】
ピペットを解放可能に保持するインターフェースツールを動かし、閉鎖コンテナにおいて受容表面付近に先端を置いて下方角度方向にピペットを向けさせるために、ロボットアームをプログラムで指示し、
次いで下方向き角度のピペットを平面に沿い実質上直線的に自動で動かしながら、ピペットから流動性物質を放出させる、
ピペットから液体を放出させる方法。
【請求項６３】
柔軟性のあるバリアを有する密封可能閉鎖コンテナにサンプルを用意し、および
サンプルを処理するため閉鎖コンテナが密封されたままで、柔軟性のあるバリアと協同して、一連の作動により閉鎖コンテナの内側でインターフェースツールを動かすために、ロボットアームをプログラムで指示する
ことを含んでなる、閉鎖システムにおけるサンプルの処理方法。
【請求項６４】
増幅中に複数の時間でサンプルの容量および濃度を電子的で、自動的に測定することを更に含んでなる、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
閉鎖システムの密封された状態を毀損することなく、少なくとも一つの処理されたサンプルをアリコート容器に捕捉することを更に含んでなる、請求項６３に記載の方法。
【請求項６６】
閉鎖コンテナの密封の完全性を電子的で自動的に測定することを更に含んでなる、請求項６３に記載の方法。
【請求項６７】
操作対象となる複数の物品を保持しうるように内部区域を形成させたコンテナ、および
閉鎖ループにおいてコンテナの内部区域内に密封された空気を循環させるように形成された再循環真空システム
を含んでなる、閉鎖コンテナ内において物品を操作するための装置。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図８Ｃ】
【図８Ｄ】
【図９Ａ】
【図９Ｂ】
【図９Ｃ】
【図９Ｄ】
【図９Ｅ】
【図９Ｆ】
【図９Ｇ】
【図９Ｈ】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３Ａ】
【図１３Ｂ】
【図１３Ｃ】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８Ａ】
【図１９Ａ】
【図１９Ｂ】
【図２０Ａ】
【図２０Ｂ】
【図２０Ｃ】
【図２０Ｄ】
【図２０Ｅ】
【図２０Ｆ】
【図２１Ａ】
【図２１Ｂ】
【図２２】
【図２３Ａ】
【図２３Ｂ】
【図２３Ｃ】
【図２３Ｄ】
【図２４】
【図２５】
【図２６Ａ】
【図２６Ｂ】
【図２６Ｃ】
【図２７】
【図２８Ａ】
【図２８Ｂ】
【図２９Ａ】
【図２９Ｂ】
【図２９Ｃ】
【図３０Ａ】
【図３０Ｂ】
【図３１】
【図３２】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図８Ｃ】
【図８Ｄ】
【図９Ａ】
【図９Ｂ】
【図９Ｃ】
【図９Ｄ】
【図９Ｅ】
【図９Ｆ】
【図９Ｇ】
【図９Ｈ】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３Ａ】
【図１３Ｂ】
【図１３Ｃ】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８Ａ】
【図１９Ａ】
【図１９Ｂ】
【図２０Ａ】
【図２０Ｂ】
【図２０Ｃ】
【図２０Ｄ】
【図２０Ｅ】
【図２０Ｆ】
【図２１Ａ】
【図２１Ｂ】
【図２２】
【図２３Ａ】
【図２３Ｂ】
【図２３Ｃ】
【図２３Ｄ】
【図２４】
【図２５】
【図２６Ａ】
【図２６Ｂ】
【図２６Ｃ】
【図２７】
【図２８Ａ】
【図２８Ｂ】
【図２９Ａ】
【図２９Ｂ】
【図２９Ｃ】
【図３０Ａ】
【図３０Ｂ】
【図３１】
【図３２】
【公表番号】特表２００９−５３５０１５（Ｐ２００９−５３５０１５Ａ）
【公表日】平成２１年１０月１日（２００９．１０．１）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００８−５５１３３６（Ｐ２００８−５５１３３６）
【出願日】平成１９年１月１７日（２００７．１．１７）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００７／００１１７０
【国際公開番号】ＷＯ２００８／０１８９０４
【国際公開日】平成２０年２月１４日（２００８．２．１４）
【出願人】（５０５１８２９１５）アルゴス セラピューティクス，インコーポレイティド (8)
【出願人】（３０７０２３１２２）キリンファーマ株式会社 (11)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２１年１０月１日（２００９．１０．１）
【国際特許分類】
【出願日】平成１９年１月１７日（２００７．１．１７）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２００７／００１１７０
【国際公開番号】ＷＯ２００８／０１８９０４
【国際公開日】平成２０年２月１４日（２００８．２．１４）
【出願人】（５０５１８２９１５）アルゴス セラピューティクス，インコーポレイティド (8)
【出願人】（３０７０２３１２２）キリンファーマ株式会社 (11)
【Ｆターム（参考）】
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