本発明の課題は、システイン残基をランダムにアミノ酸配列中に導入することによってジスルフィド結合をランダムに有するタンパク質を合成し、そのタンパク質の機能を解析することによって有用タンパク質を特定する方法であって、（ａ）少なくとも２以上のシステイン残基を含むタンパク質をコードするｍＲＮＡを１以上調製し、得られたｍＲＮＡのそれぞれをピューロマイシン又はピューロマイシン様化合物と連結してｍＲＮＡ−ピューロマイシン連結体（群）を得る工程；（ｂ）工程（ａ）で得られたｍＲＮＡ−ピューロマイシン連結体（群）と、翻訳系とを接触させてタンパク質を合成し、ｍＲＮＡ−ピューロマイシン−タンパク質連結体（群）を調製する工程；及び（ｃ）工程（ｂ）において調製されたｍＲＮＡ−ピューロマイシン−タンパク質連結体（群）と１以上の標的物質とを接触させ、ｍＲＮＡ−ピューロマイシン−タンパク質連結体（群）中のいずれかのタンパク質と該標的物質とが相互作用しているか否かを判定する工程を含む上記スクリーニング方法等によって解決される。
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本発明の課題は、固定化ｍＲＮＡ−ピューロマイシン連結体、この連結体を含むｍＲＮＡビーズ又はｍＲＮＡチップ、このｍＲＮＡチップから作製されるプロテインチップ、ｍＲＮＡビーズ又はｍＲＮＡチップを用いた診断キット、ｍＲＮＡ又はタンパク質の固相固定化法、タンパク質の固相合成法、前記固定化ｍＲＮＡ−ピューロマイシン連結体を用いるタンパク質と分子との相互作用を解析する方法等によって解決される。
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