ポリペプチド及びグラム陽性ポリペプチドを含有する免疫化組成物並びにこれらの使用方法
本発明は、ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）から単離可能な単離ポリペプチドを提供する。本発明はまた、１又は複数のポリペプチドを含む組成物、及びポリペプチドを作製及び使用するための方法を提供する。
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９２％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号３９９のアミノ酸１〜２６と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項２】
配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号４１５のアミノ酸１〜５と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項３】
ＡＴＣＣ１９６３６又はＡＴＣＣ２５９０４から選択された黄色ブドウ球菌（S. aureus）での攻撃から動物を保護する、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項４】
医薬として許容される担体をさらに含んでなる、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９５％の配列類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１に記載の組成物。
【請求項６】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９２％の配列同一性有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２に記載の組成物。
【請求項９】
前記ポリペプチドが、配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２に記載の組成物。
【請求項１０】
少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる請求項１又は２に記載の組成物であって、ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である組成物。
【請求項１１】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３５３、配列番号３５４、配列番号３５５、配列番号３５６、配列番号３５７、配列番号３５８、配列番号３５９、配列番号３６０、配列番号３６１、配列番号３６２、配列番号３６３、配列番号３６４、配列番号３６５、配列番号３６６、配列番号３６７、配列番号３６８、配列番号３６９、配列番号３７０、配列番号３７１、配列番号３７２、配列番号３７３、配列番号３７４、配列番号３７５、配列番号３７６、配列番号３７７、配列番号３７８、配列番号３７９、配列番号３８０、配列番号３８１、配列番号３８２、配列番号３８３、配列番号３８４、配列番号３８５、配列番号３８６、配列番号３８７、配列番号３８８、配列番号３８９、配列番号３９０、配列番号３９１、配列番号３９２、配列番号３９３、配列番号３９４、配列番号３９５、配列番号３９６、配列番号４１９、配列番号４２０、配列番号４２１、配列番号４２２、配列番号４２３、配列番号４２４、配列番号４２５、配列番号４２６、配列番号４２７、配列番号４２８、又は配列番号４２９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１２】
少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる請求項１に記載の組成物であって、ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる組成物。
【請求項１３】
前記第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１４】
少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる請求項２に記載の組成物であって、ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる組成物。
【請求項１５】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
鉄キレート剤非含有の培地において成長させた場合に、黄色ブドウ球菌（S. aureus）から単離可能であり、且つ１５０ｋＤａ、１３２ｋＤａ、１２０ｋＤａ、７５ｋＤａ、５８ｋＤａ、５０ｋＤａ、４４ｋＤａ、４３ｋＤａ、４１ｋＤａ、４０ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチド；又はこのような単離ポリペプチドの組合せをさらに含んでなる、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項１７】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項１８】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項１９】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２０】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２１】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２２】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象へ組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２３】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
前記第二のポリペプチドが、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、８８ｋＤａ、５５ｋＤａ、３８ｋＤａ、３７ｋＤａ、３６ｋＤａ、３５ｋＤａ、又は３３ｋＤａの分子量を有する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記組成物が：配列番号３５３、配列番号３５４、配列番号３５５、配列番号３５６、配列番号３５７、配列番号３５８、配列番号３５９、配列番号３６０、配列番号３６１、配列番号３６２、配列番号３６３、配列番号３６４、配列番号３６５、配列番号３６６、配列番号３６７、配列番号３６８、配列番号３６９、配列番号３７０、配列番号３７１、配列番号３７２、配列番号３７３、配列番号３７４、配列番号３７５、配列番号３７６、配列番号３７７、配列番号３７８、配列番号３７９、配列番号３８０、配列番号３８１、配列番号３８２、配列番号３８３、配列番号３８４、配列番号３８５、配列番号３８６、配列番号３８７、配列番号３８８、配列番号３８９、配列番号３９０、配列番号３９１、配列番号３９２、配列番号３９３、配列番号３９４、配列番号３９５、配列番号３９６、配列番号４１９、配列番号４２０、配列番号４２１、配列番号４２２、配列番号４２３、配列番号４２４、配列番号４２５、配列番号４２６、配列番号４２７、配列番号４２８、又は配列番号４２９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１７〜１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
前記第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２０〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２９に記載の方法。
【請求項３０】
前記組成物が：鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に黄色ブドウ球菌（S. aureus）から単離可能であり、且つドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、１５０ｋＤａ、１３２ｋＤａ、１２０ｋＤａ、７５ｋＤａ、５８ｋＤａ、５０ｋＤａ、４４ｋＤａ、４３ｋＤａ、４１ｋＤａ、４０ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチド；又はこのような単離ポリペプチドの組合せをさらに含んでなる、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記対象が哺乳類である、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
前記哺乳類がヒトである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）が黄色ブドウ球菌（S. aureus）である、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３５】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７から選択されたアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３６】
対象におけるコロニー形成を減少するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によってコロニー形成された対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項３７】
対象において感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３８】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３９】
対象におけるコロニー形成を減少するのための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によってコロニー形成された対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項４０】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドに特異的に結合する抗体をさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記第二のポリペプチドが、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、８８ｋＤａ、５５ｋＤａ、３８ｋＤａ、３７ｋＤａ、３６ｋＤａ、３５ｋＤａ、又は３３ｋＤａの分子量を有する、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３５３、配列番号３５４、配列番号３５５、配列番号３５６、配列番号３５７、配列番号３５８、配列番号３５９、配列番号３６０、配列番号３６１、配列番号３６２、配列番号３６３、配列番号３６４、配列番号３６５、配列番号３６６、配列番号３６７、配列番号３６８、配列番号３６９、配列番号３７０、配列番号３７１、配列番号３７２、配列番号３７３、配列番号３７４、配列番号３７５、配列番号３７６、配列番号３７７、配列番号３７８、配列番号３７９、配列番号３８０、配列番号３８１、配列番号３８２、配列番号３８３、配列番号３８４、配列番号３８５、配列番号３８６、配列番号３８７、配列番号３８８、配列番号３８９、配列番号３９０、配列番号３９１、配列番号３９２、配列番号３９３、配列番号３９４、配列番号３９５、配列番号３９６、配列番号４１９、配列番号４２０、配列番号４２１、配列番号４２２、配列番号４２３、配列番号４２４、配列番号４２５、配列番号４２６、配列番号４２７、配列番号４２８、又は配列番号４２９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
前記組成物が少なくとも１つの第二のポリペプチドに特異的に結合する抗体をさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、そして該第二のポリペプチドが、配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
前記第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドに特異的に結合する抗体をさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり：該第二のポリペプチドが配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項３７〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記組成物が：鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に黄色ブドウ球菌（S. aureus）から単離可能であり、且つドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、１５０ｋＤａ、２９２ｋＤａ、１２０ｋＤａ、７５ｋＤａ、５８ｋＤａ、５０ｋＤａ、４４ｋＤａ、４３ｋＤａ、４１ｋＤａ、４０ｋＤａの分子量を有するポリペプチド；又はこのような単離ポリペプチドの組合せに特異的に結合する抗体をさらに含んでなる、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４８】
前記対象が哺乳類である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
前記哺乳類がヒトである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）が黄色ブドウ球菌（S. aureus）である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５３】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５４】
ポリペプチドに特異的に結合する抗体を検出するためのキットであって、別々の容器中に：
配列番号４０８又は配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチド；及び、
ポリペプチドに特異的に結合する抗体を検出する試薬、
を含んでなるキット。
【請求項５５】
前記８８ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される８８ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似であるマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
５５ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される５５ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３８ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３８ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３７ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３７ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３６ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３６ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３５ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３５ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３３ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３３ｋＤａのポリペプチドマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である、請求項２４又は４１に記載の方法。
【請求項５６】
配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９２％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号３９９のアミノ酸１〜２６と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項５７】
配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号４１５のアミノ酸１〜５と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項１】
配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９２％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号３９９のアミノ酸１〜２６と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項２】
配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号４１５のアミノ酸１〜５と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項３】
ＡＴＣＣ１９６３６又はＡＴＣＣ２５９０４から選択された黄色ブドウ球菌（S. aureus）での攻撃から動物を保護する、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項４】
医薬として許容される担体をさらに含んでなる、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９５％の配列類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１に記載の組成物。
【請求項６】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９２％の配列同一性有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
前記ポリペプチドが、配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２に記載の組成物。
【請求項９】
前記ポリペプチドが、配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２に記載の組成物。
【請求項１０】
少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる請求項１又は２に記載の組成物であって、ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である組成物。
【請求項１１】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３５３、配列番号３５４、配列番号３５５、配列番号３５６、配列番号３５７、配列番号３５８、配列番号３５９、配列番号３６０、配列番号３６１、配列番号３６２、配列番号３６３、配列番号３６４、配列番号３６５、配列番号３６６、配列番号３６７、配列番号３６８、配列番号３６９、配列番号３７０、配列番号３７１、配列番号３７２、配列番号３７３、配列番号３７４、配列番号３７５、配列番号３７６、配列番号３７７、配列番号３７８、配列番号３７９、配列番号３８０、配列番号３８１、配列番号３８２、配列番号３８３、配列番号３８４、配列番号３８５、配列番号３８６、配列番号３８７、配列番号３８８、配列番号３８９、配列番号３９０、配列番号３９１、配列番号３９２、配列番号３９３、配列番号３９４、配列番号３９５、配列番号３９６、配列番号４１９、配列番号４２０、配列番号４２１、配列番号４２２、配列番号４２３、配列番号４２４、配列番号４２５、配列番号４２６、配列番号４２７、配列番号４２８、又は配列番号４２９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１２】
少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる請求項１に記載の組成物であって、ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる組成物。
【請求項１３】
前記第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１４】
少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる請求項２に記載の組成物であって、ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる組成物。
【請求項１５】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
鉄キレート剤非含有の培地において成長させた場合に、黄色ブドウ球菌（S. aureus）から単離可能であり、且つ１５０ｋＤａ、１３２ｋＤａ、１２０ｋＤａ、７５ｋＤａ、５８ｋＤａ、５０ｋＤａ、４４ｋＤａ、４３ｋＤａ、４１ｋＤａ、４０ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチド；又はこのような単離ポリペプチドの組合せをさらに含んでなる、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項１７】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項１８】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項１９】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２０】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２１】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２２】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象へ組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項２３】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
前記第二のポリペプチドが、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、８８ｋＤａ、５５ｋＤａ、３８ｋＤａ、３７ｋＤａ、３６ｋＤａ、３５ｋＤａ、又は３３ｋＤａの分子量を有する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記組成物が：配列番号３５３、配列番号３５４、配列番号３５５、配列番号３５６、配列番号３５７、配列番号３５８、配列番号３５９、配列番号３６０、配列番号３６１、配列番号３６２、配列番号３６３、配列番号３６４、配列番号３６５、配列番号３６６、配列番号３６７、配列番号３６８、配列番号３６９、配列番号３７０、配列番号３７１、配列番号３７２、配列番号３７３、配列番号３７４、配列番号３７５、配列番号３７６、配列番号３７７、配列番号３７８、配列番号３７９、配列番号３８０、配列番号３８１、配列番号３８２、配列番号３８３、配列番号３８４、配列番号３８５、配列番号３８６、配列番号３８７、配列番号３８８、配列番号３８９、配列番号３９０、配列番号３９１、配列番号３９２、配列番号３９３、配列番号３９４、配列番号３９５、配列番号３９６、配列番号４１９、配列番号４２０、配列番号４２１、配列番号４２２、配列番号４２３、配列番号４２４、配列番号４２５、配列番号４２６、配列番号４２７、配列番号４２８、又は配列番号４２９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなる、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１７〜１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
前記第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドをさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、該第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２０〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項２９に記載の方法。
【請求項３０】
前記組成物が：鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に黄色ブドウ球菌（S. aureus）から単離可能であり、且つドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、１５０ｋＤａ、１３２ｋＤａ、１２０ｋＤａ、７５ｋＤａ、５８ｋＤａ、５０ｋＤａ、４４ｋＤａ、４３ｋＤａ、４１ｋＤａ、４０ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチド；又はこのような単離ポリペプチドの組合せをさらに含んでなる、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記対象が哺乳類である、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
前記哺乳類がヒトである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）が黄色ブドウ球菌（S. aureus）である、請求項１７〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
対象における感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３５】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７から選択されたアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３６】
対象におけるコロニー形成を減少するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によってコロニー形成された対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項３７】
対象において感染症を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している又は罹患するリスクがある対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３８】
対象における症状を治療するための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によって生じる感染症に罹患している対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる方法。
【請求項３９】
対象におけるコロニー形成を減少するのための方法であって：
ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）によってコロニー形成された対象に組成物の有効量を投与する段階を含んでなり、
ここで該組成物が：配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチドを含んでなる方法。
【請求項４０】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドに特異的に結合する抗体をさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記第二のポリペプチドが、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、８８ｋＤａ、５５ｋＤａ、３８ｋＤａ、３７ｋＤａ、３６ｋＤａ、３５ｋＤａ、又は３３ｋＤａの分子量を有する、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３５３、配列番号３５４、配列番号３５５、配列番号３５６、配列番号３５７、配列番号３５８、配列番号３５９、配列番号３６０、配列番号３６１、配列番号３６２、配列番号３６３、配列番号３６４、配列番号３６５、配列番号３６６、配列番号３６７、配列番号３６８、配列番号３６９、配列番号３７０、配列番号３７１、配列番号３７２、配列番号３７３、配列番号３７４、配列番号３７５、配列番号３７６、配列番号３７７、配列番号３７８、配列番号３７９、配列番号３８０、配列番号３８１、配列番号３８２、配列番号３８３、配列番号３８４、配列番号３８５、配列番号３８６、配列番号３８７、配列番号３８８、配列番号３８９、配列番号３９０、配列番号３９１、配列番号３９２、配列番号３９３、配列番号３９４、配列番号３９５、配列番号３９６、配列番号４１９、配列番号４２０、配列番号４２１、配列番号４２２、配列番号４２３、配列番号４２４、配列番号４２５、配列番号４２６、配列番号４２７、配列番号４２８、又は配列番号４２９のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
前記組成物が少なくとも１つの第二のポリペプチドに特異的に結合する抗体をさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり、そして該第二のポリペプチドが、配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
前記第二のポリペプチドが：配列番号４０８、配列番号４０９、配列番号４１０、配列番号４１１、配列番号４１２、配列番号４１３、配列番号４１４、配列番号４１５、配列番号４１６、配列番号４１７、又は配列番号４１８のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記組成物が、少なくとも１つの第二のポリペプチドに特異的に結合する抗体をさらに含んでなり、
ここで該第二のポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり：該第二のポリペプチドが配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項３７〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
前記第二のポリペプチドが：配列番号３９７、配列番号３９８、配列番号３９９、配列番号４００、配列番号４０１、配列番号４０２、配列番号４０３、配列番号４０４、配列番号４０５、配列番号４０６、又は配列番号４０７のいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも８５％の類似性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記組成物が：鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に黄色ブドウ球菌（S. aureus）から単離可能であり、且つドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル上における電気泳動によって決定される場合、１５０ｋＤａ、２９２ｋＤａ、１２０ｋＤａ、７５ｋＤａ、５８ｋＤａ、５０ｋＤａ、４４ｋＤａ、４３ｋＤａ、４１ｋＤａ、４０ｋＤａの分子量を有するポリペプチド；又はこのような単離ポリペプチドの組合せに特異的に結合する抗体をさらに含んでなる、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４８】
前記対象が哺乳類である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
前記哺乳類がヒトである、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
前記ブドウ球菌属（Staphylococcus spp.）が黄色ブドウ球菌（S. aureus）である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５３】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項３４〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５４】
ポリペプチドに特異的に結合する抗体を検出するためのキットであって、別々の容器中に：
配列番号４０８又は配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも８０％の配列類似性を有する単離ポリペプチド；及び、
ポリペプチドに特異的に結合する抗体を検出する試薬、
を含んでなるキット。
【請求項５５】
前記８８ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される８８ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似であるマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
５５ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される５５ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３８ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３８ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３７ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３７ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３６ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３６ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３５ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３５ｋＤａのポリペプチドのマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能であり；
３３ｋＤａの分子量を有する単離ポリペプチドが、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）ＡＴＣＣ株１９６３６によって発現される３３ｋＤａのポリペプチドマスフィンガープリントと少なくとも８０％類似のマスフィンガープリントを有し、
ここで該ポリペプチドは、鉄キレート剤を含んでなる培地においてインキュベートさせた場合に、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）から単離可能であり、そして鉄キレート剤非含有の培地中で成長させた場合に、単離不可能である、請求項２４又は４１に記載の方法。
【請求項５６】
配列番号３９７のアミノ酸配列と少なくとも９２％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号３９９のアミノ酸１〜２６と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【請求項５７】
配列番号４０８のアミノ酸配列と少なくとも９８％の配列類似性を有する単離ポリペプチドに特異的に結合する抗体を含んでなる組成物であって、但し、該単離ポリペプチドがアミノ末端において１又は複数のさらなるアミノ酸を含む場合には、該１又は複数のさらなるアミノ酸が配列番号４１５のアミノ酸１〜５と比較して、少なくとも１つのアミノ酸の欠失又は少なくとも１つのアミノ酸の置換を含むことを条件とする組成物。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３２】
【図３３】
【図３４】
【図３５】
【図３６】
【図３７】
【図３８】
【図３９】
【図４０】
【図４１】
【図４２】
【図４３】
【図４４】
【図４５】
【図４６】
【図４７】
【図４８】
【図４９】
【図５０】
【図５１】
【図５２】
【図５３】
【図５４】
【図５５】
【図５６】
【図５７】
【図５８】
【図５９】
【図６０】
【図６１】
【図６２】
【図６３】
【図６４】
【図６５】
【図６６】
【図６７】
【図６８】
【図６９】
【図７０】
【図７１】
【図７２】
【図７３】
【図７４】
【図７５】
【図７６】
【図７７】
【図７８】
【図７９】
【図８０】
【図８１】
【図８２】
【図８３】
【図８４】
【図８５】
【図８６】
【図８７】
【図８８】
【図８９】
【図９０】
【図９１】
【図９２】
【図９３】
【図９４】
【図９５】
【図９６】
【図９７】
【図９８】
【図９９】
【図１００】
【図１０１】
【図１０２】
【図１０３】
【図１０４】
【図１０５】
【図１０６】
【図１０７】
【図１０８】
【図１０９】
【図１１０】
【図１１１】
【図１１２】
【図１１３】
【図１１４】
【図１１５】
【図１１６】
【図１１７】
【図１１８】
【図１１９】
【図１２０】
【図１２１】
【図１２２】
【図１２３】
【図１２４】
【図１２５】
【図１２６】
【図１２７】
【図１２８】
【図１２９】
【図１３０】
【図１３１】
【図１３２】
【図１３３】
【図１３４】
【図１３５】
【図１３６】
【図１３７】
【図１３８】
【図１３９】
【図１４０】
【図１４１】
【図１４２】
【図１４３】
【図１４４】
【図１４５】
【図１４６】
【図１４７】
【図１４８】
【図１４９】
【図１５０】
【図１５１】
【図１５２】
【図１５３】
【図１５４】
【図１５５】
【図１５６】
【図１５７】
【図１５８】
【図１５９】
【図１６０】
【図１６１】
【図１６２】
【図１６３】
【図１６４】
【図１６５】
【図１６６】
【図１６７】
【図１６８】
【図１６９】
【図１７０】
【図１７１】
【図１７２】
【図１７３】
【図１７４】
【図１７５】
【図１７６】
【図１７７】
【図１７８】
【図１７９】
【図１８０】
【図１８１】
【図１８２】
【図１８３】
【図１８４】
【図１８５】
【図１８６】
【図１８７】
【図１８８】
【図１８９】
【図１９０】
【図１９１】
【図１９２】
【図１９３】
【図１９４】
【図１９５】
【図１９６】
【図１９７】
【図１９８】
【図１９９】
【図２００】
【図２０１】
【図２０２】
【図２０３】
【図２０４】
【図２０５】
【図２０６】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図７】
【図８】
【図９】
【図１０】
【図１１】
【図１２】
【図１３】
【図１４】
【図１５】
【図１６】
【図１７】
【図１８】
【図１９】
【図２０】
【図２１】
【図２２】
【図２３】
【図２４】
【図２５】
【図２６】
【図２７】
【図２８】
【図２９】
【図３０】
【図３１】
【図３２】
【図３３】
【図３４】
【図３５】
【図３６】
【図３７】
【図３８】
【図３９】
【図４０】
【図４１】
【図４２】
【図４３】
【図４４】
【図４５】
【図４６】
【図４７】
【図４８】
【図４９】
【図５０】
【図５１】
【図５２】
【図５３】
【図５４】
【図５５】
【図５６】
【図５７】
【図５８】
【図５９】
【図６０】
【図６１】
【図６２】
【図６３】
【図６４】
【図６５】
【図６６】
【図６７】
【図６８】
【図６９】
【図７０】
【図７１】
【図７２】
【図７３】
【図７４】
【図７５】
【図７６】
【図７７】
【図７８】
【図７９】
【図８０】
【図８１】
【図８２】
【図８３】
【図８４】
【図８５】
【図８６】
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【図８８】
【図８９】
【図９０】
【図９１】
【図９２】
【図９３】
【図９４】
【図９５】
【図９６】
【図９７】
【図９８】
【図９９】
【図１００】
【図１０１】
【図１０２】
【図１０３】
【図１０４】
【図１０５】
【図１０６】
【図１０７】
【図１０８】
【図１０９】
【図１１０】
【図１１１】
【図１１２】
【図１１３】
【図１１４】
【図１１５】
【図１１６】
【図１１７】
【図１１８】
【図１１９】
【図１２０】
【図１２１】
【図１２２】
【図１２３】
【図１２４】
【図１２５】
【図１２６】
【図１２７】
【図１２８】
【図１２９】
【図１３０】
【図１３１】
【図１３２】
【図１３３】
【図１３４】
【図１３５】
【図１３６】
【図１３７】
【図１３８】
【図１３９】
【図１４０】
【図１４１】
【図１４２】
【図１４３】
【図１４４】
【図１４５】
【図１４６】
【図１４７】
【図１４８】
【図１４９】
【図１５０】
【図１５１】
【図１５２】
【図１５３】
【図１５４】
【図１５５】
【図１５６】
【図１５７】
【図１５８】
【図１５９】
【図１６０】
【図１６１】
【図１６２】
【図１６３】
【図１６４】
【図１６５】
【図１６６】
【図１６７】
【図１６８】
【図１６９】
【図１７０】
【図１７１】
【図１７２】
【図１７３】
【図１７４】
【図１７５】
【図１７６】
【図１７７】
【図１７８】
【図１７９】
【図１８０】
【図１８１】
【図１８２】
【図１８３】
【図１８４】
【図１８５】
【図１８６】
【図１８７】
【図１８８】
【図１８９】
【図１９０】
【図１９１】
【図１９２】
【図１９３】
【図１９４】
【図１９５】
【図１９６】
【図１９７】
【図１９８】
【図１９９】
【図２００】
【図２０１】
【図２０２】
【図２０３】
【図２０４】
【図２０５】
【図２０６】
【公表番号】特表２０１２−５２１４４１（Ｐ２０１２−５２１４４１Ａ）
【公表日】平成２４年９月１３日（２０１２．９．１３）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２０１２−５０２１６４（Ｐ２０１２−５０２１６４）
【出願日】平成２２年３月２３日（２０１０．３．２３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２０１０／０２８３２６
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／１１１２７３
【国際公開日】平成２２年９月３０日（２０１０．９．３０）
【出願人】（５０７２４６１９８）エピトピックス，リミティド ライアビリティ カンパニー (5)
【Ｆターム（参考）】
【公表日】平成２４年９月１３日（２０１２．９．１３）
【国際特許分類】
【出願日】平成２２年３月２３日（２０１０．３．２３）
【国際出願番号】ＰＣＴ／ＵＳ２０１０／０２８３２６
【国際公開番号】ＷＯ２０１０／１１１２７３
【国際公開日】平成２２年９月３０日（２０１０．９．３０）
【出願人】（５０７２４６１９８）エピトピックス，リミティド ライアビリティ カンパニー (5)
【Ｆターム（参考）】
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