【課題】本発明は、新規な死ドメイン含有レセプター５（ＤＲ５）タンパク質を提供することを課題とする。
【解決手段】本発明によって、腫瘍壊死（ＴＮＦ）レセプターファミリーのメンバーであり、そしてＴＲＡＩＬに結合する死ドメイン含有レセプター５（ＤＲ５）タンパク質が提供される。詳細には、ヒトＤＲ５タンパク質をコードする単離された核酸分子が提供される。ＤＲ５ポリペプチドもまた提供され、ベクター、宿主細胞、およびこれらを産生する組換え方法も提供される。本発明はさらに、アンタゴニストおよびＤＲ５活性のアンタゴニストを同定するためのスクリーニング方法に関する。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
発明の分野
本発明は、レセプターの腫瘍壊死因子ファミリーの新規なメンバーに関する。より詳細には、ヒト死ドメイン含有レセプター５（すなわち、単純に「ＤＲ５」）をコードする単離された核酸分子が提供される。ＤＲ５ポリペプチドもまた提供され、ベクター、宿主細胞、およびこれらを産生するための組換え方法も提供される。本発明はさらに、ＤＲ５活性のアゴニストおよびアンタゴニストを同定するためのスクリーニング方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
関連分野
多数の生物学的作用（例えば、特定の刺激への応答および天然の生物学的プロセス）は、サイトカインのような因子によって制御される、多くのサイトカインは、レセプターを係合し、そして細胞内応答を産生することによって、レセプターを通して作用する。
【０００３】
例えば、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）αおよびβはサイトカインであり、これは多数の生物学的プロセスを制御するＴＮＦレセプターを通して作用し、このプロセスとしては、感染およびショックの導入および炎症性疾患に対する防御が挙げられる。ＴＮＦ分子は、「ＴＮＦリガンド」スーパーファミリーに属し、そしてそれらのレセプターまたは対抗リガンド「ＴＮＦレセプター」スーパーファミリーとともに作用する。従来、ＴＮＦリガンドスーパーファミリーの９のメンバーが同定されており、そしてＴＮＦレセプタースーパーファミリーの１０のメンバーが特徴付けられている。
【０００４】
リガンドとしては、ＴＮＦα、リンフォトキシンα（ＬＴ−α、ＴＮＦβとしてもまた公知である）、ＬＴ−β（複合体異種三量体のＬＴ−α−βに見出される）、ＦａｓＬ、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ２７Ｌ、ＣＤ３０Ｌ、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、および神経成長因子（ＮＧＦ）が挙げられる。ＴＮＦレセプターのスーパーファミリーとしては、ｐ５５ＴＮＦレセプター、ｐ７５ＴＮＦレセプター、ＴＮＦレセプター関連タンパク質、ＦＡＳ抗原、またはＡＰＯ−１、ＣＤ４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、低親和性ｐ７５、およびＮＧＦレセプターが挙げられる（Ｍｅａｇｅｒ，Ａ．， Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ， ２２：２９１−２９５（１９９４））。
【０００５】
ＴＮＦリガンドスーパーファミリーの多くのメンバーは、活性化Ｔ細胞によって発現され、このことは、細胞個体発生および機能の基礎となる他の細胞型とのＴ細胞相互作用に必要であることを意味する。（Ｍｅａｇｅｒ，Ａ．，前出）。
【０００６】
ＴＮＦレセプターファミリーのいくつかのメンバーの必須の機能に関する考慮すべき見識は、これらのタンパク質の発現を回避する変異体の同定および創生から得られている。例えば、ＦＡＳ抗原およびそのリガンドに天然に存在する変異は、リンパ球増殖性疾患を引き起こし（Ｗａｔａｎａｂｅ−Ｆｕｋｕｎａｇａ，Ｒ．，ら、Ｎａｔｕｒｅ ３５６：３１４（１９９２））、これはおそらく、プログラムされた細胞死の失敗に反映する。ＣＤ４０リガンドの変異は、血漿中の高レベルの免疫グロブリンＭおよび低レベルの免疫グロブリンＧによって特徴付けられるＸ関連免疫欠損状態を引き起こし、これは欠陥のあるＴ細胞依存性Ｂ細胞活性化を引き起こす（Ａｌｌｅｎ，Ｒ．Ｃ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５９：９９０（１９９３））。低親和性神経成長因子レセプターの標的化変異は、末梢構造の欠陥のある感覚性新機軸（ｓｅｎｓｏｒｙ ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ）によって特徴付けられる障害を引き起こす（Ｌｅｅ，Ｋ．Ｆ．ら、Ｃｅｌｌ ６９：７３７（１９９２））。
【０００７】
ＴＮＦおよびＬＴ−αは、２つのＴＮＦレセプター（５５および７５ｋｄＴＮＦレセプター）に結合し得る。ＴＮＦおよびＬＴ−αによって誘発される（それらのレセプターを通じて作用する）多数の生物学的効果としては、移植された腫瘍の出血性壊死、細胞傷害性、内毒素ショックにおける役割、炎症、免疫調節、増殖および抗ウイルス応答、ならびに電離放射線の有害な効果に対する防御が挙げられる。ＴＮＦおよびＬＴ−αは、広範な疾患の病原性に関与し、これには、内毒素ショック、大脳マラリア、腫瘍、自己免疫疾患、ＡＩＤＳ、および移植片−宿主拒絶が挙げられる（Ｂｅｕｔｌｅｒ，ＢおよびＶｏｎ Ｈｕｆｆｅｌ，Ｃ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６４：６６７−６６８（１９９４））。ｐ５５レセプターにおける変異は、微生物感染に対する感受性を増加させる。
【０００８】
さらに、ＴＮＦＲ１（ｐ５５）およびＦａｓ付近の約８０アミノ酸ドメインが、「死ドメイン」として報告され、これはプログラムされた細胞死についての形質導入シグナルを担う（Ｔａｒｔａｇｌｉａら、Ｃｅｌｌ ７４：８４５（１９９３））。
【０００９】
アポトーシスまたはプログラムされた細胞死は、多細胞生物の正常な発生および恒常性に必須の生理学的プロセスである（Ｈ．Ｓｔｅｌｌｅｒ， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６７：１４４５−１４４９（１９９５））。アポトーシスの撹乱は、ガン、神経変性疾患、および後天性免疫疾患症候群を含むいくつかのヒト疾患の病原性に寄与する（Ｃ．Ｂ．Ｔｈｏｍｐｓｏｎ， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６７：１４５６−１４６２（１９９５））。近年、多くの注目が、２つの細胞表面死レセプターＦａｓ／ＡＰＯ−１およびＴＮＦＲ−１のシグナル形質導入および生物学的機能に集中している（Ｊ．Ｌ．Ｃｌｅｖｅｌａｎｄら、Ｃｅｌｌ ８１：４７９−４８２（１９９５）；Ａ．Ｆｒａｓｅｒら、Ｃｅｌｌ ８５：７８１−７８４（１９９６）；Ｓ．Ｎａｇａｔａら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６７：１４４９−５６（１９９５））。両方とも、ＴＮＦレセプターファミリーのメンバーであり、これらはまた、とりわけ、ＴＮＦＲ−２、低親和性ＮＧＦＲ、ＣＤ４０、およびＣＤ３０を含む（Ｃ．Ａ．Ｓｍｉｔｈら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４８：１０１９−２３（１９９０）；Ｍ．Ｔｅｗａｒｉら、ｉｎ Ｍｏｄｕｌａｒ Ｔｅｘｔｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｍ． Ｐｕｒｔｏｎ， Ｈｅｌｄｉｎ， Ｃａｒｌ編、（Ｃｈａｐｍａｎ ａｎｄ Ｈａｌｌ， Ｌｏｎｄｏｎ， １９９５））。ファミリーメンバーは、それらの細胞外ドメインにおけるシステインリッチ反復の存在によって規定されるが、Ｆａｓ／ＡＰＯ−１およびＴＮＦＲ−１もまた、細胞内相同性の領域（適切には「死ドメイン」と称され、これはＤｒｏｓｏｐｈｉｌａ ｓｕｉｃｉｄｅ遺伝子ｒｅａｐｅｒの遠縁にあたる）を共有する（Ｐ．Ｇｏｌｓｔｅｉｎら、Ｃｅｌｌ ８１：１８５−１８６（１９９５）；Ｋ．Ｗｈｉｔｅら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６４：６７７−８３（１９９４））。この共有された死ドメインは、両方のレセプターが、最近まで未確認のままの、関連セットのシグナル形質導入分子と相互作用することが示唆される。Ｆａｓ／ＡＰＯ−１の活性化は、死ドメイン含有アダプター分子ＦＡＤＤ／ＭＯＲＴ１（Ａ．Ｍ．Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎら、Ｃｅｌｌ ８１：５０５−１２（１９９５）；Ｍ．Ｐ．Ｂｏｌｄｉｎら、Ｊ．Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７０：７７９５−８（１９９５）；Ｆ．Ｃ．Ｋｉｓｃｈｋｅｌら、ＥＭＢＯ １４：５５７９−５５８８（１９９５））を補充し、これは順に、ＦＬＩＣＥ／ＭＡＣＨ１（プロアポトーシスプロテアーゼのＩＣＥ／ＣＥＤ−３ファミリーのメンバー）に結合し、そしておそらく活性化する（Ｍ．Ｍｕｚｉｏら、Ｃｅｌｌ ８５：８１７−８２７（１９９６）；Ｍ．Ｐ．Ｂｏｌｄｉｎら、Ｃｅｌｌ ８５：８０３−８１５１（１９９６））。Ｆａｓ／ＡＰＯ−１の中心の役割は、細胞死を引き起こすことであるが、ＴＦＮＲ−１は、その多くがＮＦ−ｋＢを活性化する能力に由来する多様な生物学的活性の整列を合図し得る（Ｌ．Ａ．Ｔａｒｔａｇｌｉａら、Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｔｏｄａｙ １３：１５１−３（１９９２））。従って、ＴＮＦＲ−１は、多価アダプター分子ＴＲＡＤＤを補充し、これはＦＡＤＤに類似し、死ドメインもまた含む（Ｈ．Ｈｓｕら、Ｃｅｌｌ ８１：４９５−５０４（１９９５）；Ｈ．Ｈｓｕ，ら、Ｃｅｌｌ ８４：２９９−３０８（１９９６））。ＦＡＤＤ、ＴＲＡＦ２、およびＲＩＰを含むシグナル分子の数との関連を通じて、ＴＲＡＤＤは、アポトーシスおよびＮＦ−ｋＢ活性化の両方を合図し得る（Ｈ．Ｈｓｕら、Ｃｅｌｌ ８４：２９９−３０８（１９９６）Ｃｅｌｌ ８４：２９９−３０８（１９９６）；Ｈ．Ｈｓｕら、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ４：３８７−３９６（１９９６））。
【００１０】
近年、新たなアポトーシス誘導性ＴＮＦリガンドが発見されている。Ｓ．Ｒ．Ｗｉｌｅｙら（Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ３：６７３−６８２（１９９５））は、分子を「ＴＮＦ関連アポトーシス誘導性リガンド」または単純に「ＴＲＡＩＬ］と命名した。この分子はまた、「Ａｐｏ−２リガンド」または「Ａｐｏ−２Ｌ」とも称された。Ｒ．Ｍ．Ｐｉｔｔら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ． ２７１：１２６８７−１２６９０（１９９６）。この分子はまた、同時継続中の米国特許分割出願第６０／０１３，４０５号にも開示された。便宜上、この分子は、本明細書中でＴＲＡＩＬとして称される。
【００１１】
ＦＡＳリガンド（この転写物は、刺激されたＴ細胞に非常に制限されるようである）とは異なり、有意なレベルのＴＲＡＩＬが、多くのヒト組織（例えば、脾臓、胚、前立腺、胸腺、卵巣、小腸、結腸、末梢血リンパ球、胎盤、腎臓）において検出され、そしていくつかの細胞株によって連続的に転写される。ＴＲＡＩＬはＦａｓリガンドから独立して作用することが示されている（Ｗｉｌｅｙら、前出）。ＴＲＡＩＬはＦａｓ／Ａｐｏ−１Ｌによる死伝達と同様の時間枠内で、迅速にアポトーシスを活性化するが、ＴＮＦ誘導性アポトーシスより早いことが示されている。Ｓ．Ａ．Ｍａｒｓｔｅｒｓら、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙ ６：７５０−７５２（１９９６）。ＴＲＡＩＬのＴＮＦＲ−１、Ｆａｓ、または近年同定されたＤＲ３への結合の不能性は、ＴＲＡＩＬは、独特のレセプターと相互作用し得ることを示唆する。
【００１２】
ＴＲＡＩＬについてのいくつかの独特のレセプターは、すでに同定されている。同時継続中の米国分割特許出願番号第６０／０３５，７２２号において、ＤＲ４（ＴＲＡＩＬについての新規な死ドメイン含有レセプター）が開示された。Ｐａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７６，１１１−１１３（１９９７年４月）を参照のこと。ＴＲ５レセプター（同時継続中の米国分割特許出願番号第６０／０３５，４９６号の主題）は、ＴＲＡＩＬに結合することが示されている。同時継続中の米国分割特許出願番号第６０／ｘｘｘｘｘｘにおいて、ＴＲ１０レセプターもまたＴＲＡＩＬに結合し、これはＤＲ４との配列相同性に起因することが予測された。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
ＴＮＦファミリーリガンドおよびＴＮＦファミリーレセプターの効果は変化し、そして哺乳動物系の生物学的プロセスにおいて正常および異常の両方の多数の機能に影響する。それゆえ、正常および疾患状態の両方において生物学的活性に影響するこのようなレセプターおよびリガンドの同定および特徴づけのための明確な必要性が存在する。特に、ＴＲＡＩＬに結合するさらなる新規なレセプターを単離および特徴付ける必要性が存在する。
【課題を解決するための手段】
【００１４】
発明の要旨
本発明は、単離された核酸分子を提供し、これは、図１（配列番号２）に示されるアミノ酸配列または１９９７年３月７日にＡＴＣＣ受託番号９７９２０として寄託されたｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む
本発明はまた、組換えベクター（本発明の単離された核酸分子を含む）を提供し、そして組換えベクターを含む宿主細胞、ならびにこのようなベクターおよび宿主細胞を作成する方法、およびＤＲ５ポリペプチドまたはペプチドの組換え技術による産生のためにそれらを使用するための方法を提供する。
【００１５】
本発明はさらに、本明細書中に記載されるポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列を有する単離されたＤＲ５ポリペプチドを提供する。
【００１６】
本発明はまた、ＤＲ５タンパク質のレベルを検出するための定量的および診断用アッセイのような診断用アッセイを提供する。従って、例えば、正常なコントロール組織サンプルと比較してＤＲ５またはその可溶性形態の過剰発現を検出するための本発明による診断用アッセイが、腫瘍の存在を検出するのに使用され得る。
【００１７】
腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）ファミリーリガンドは、最も多面性のサイトカインの中にあることが公知であり、これは、細胞毒性、抗ウイルス活性、免疫調節活性、およびいくつかの遺伝子の転写調節を含む大多数の細胞性応答を含む。ＴＮＦファミリーリガンドに対する細胞性応答は、正常な生理学的応答だけでなく、増加したアポトーシスに関連する疾患またはアポトーシスの阻害も含む。アポトーシス（プログラムされた細胞死）は、免疫系の末梢Ｔリンパ球の欠失に関与する生理学的機構であり、そしてその調節不全は、多数の異なる病原性プロセスを導き得る。増加した細胞生存に関連する疾患、またはアポトーシスの阻害としては、ガン、自己免疫疾患、ウイルス感染、炎症、移植片対宿主疾患、急性移植片拒絶、および慢性移植片拒絶が挙げられる。増加したアポトーシスに関連する疾患としては、ＡＩＤＳ、神経変性障害、脊髄形成異常症候群、虚血性障害、毒素誘導性肝臓疾患、敗血症性ショック、悪液質、および摂食障害が挙げられる。
【００１８】
従って、本発明はさらに、ＴＮＦファミリーリガンドによって誘導されるアポトーシスを増強するための方法を提供し、これは、ＤＲ５ポリペプチドを発言する細胞に、ＤＲ５媒介性伝達を増加し得るアゴニストの有効量を投与する工程を包含する。好ましくは、ＤＲ５媒介性伝達は、疾患を処置するために増加され、ここで減少したアポトーシスが示される。
【００１９】
さらなる局面において、本発明は、ＴＮＦファミリーリガンドによって誘導されるアポトーシスを阻害するための方法に関し、これはＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞に、ＤＲ５媒介性伝達を減少し得るアンタゴニストの有効量を投与する工程を包含する。好ましくは、ＤＲ５媒介性伝達は、疾患を処置するために減少され、ここで増加したアポトーシスが示される。
【００２０】
本発明のいずれの候補体「アゴニスト」または「アンタゴニスト」がアポトーシスを増強または阻害し得るかどうか、当該分野で公知のＴＮＦファミリーリガンド／レセプター細胞応答アッセイを用いて決定され得、これは以下により詳細に記載される。従って、さらなる局面において、スクリーニング方法は、候補体アゴニストまたはアンタゴニストがＴＮＦファイリーリガンドに対する細胞応答を増強または阻害し得るかどうかを決定する工程が提供される。この方法は、ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞を、候補体化合物およびＴＮＦファミリーリガンドと接触させる工程、細胞応答をアッセイする工程、ならびに細胞応答を標準的な細胞応答と比較する工程を含み、候補体化合物の非存在下でリガンドとの接触がなされ、それにより、標準を超える増加した細胞応答は、候補化合物がリガンド／レセプター伝達経路のアゴニストであることを示し、そして標準に比べて減少した細胞応答は、候補体化合物が、リガンド／レセプター伝達経路のアンタゴニストであることを示す。本発明によって、ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞は、内因性または外因的に投与されたＴＮＦファミリーリガンドのいずれかと接触させられ得る。
【００２１】
したがって、本発明は、以下を提供する。
１．単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約−５１〜約３６０を含むポリヌクレオチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約−５０〜約３６０を含むポリヌクレオチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約１〜約３６０を含むポリヌクレオチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）ＤＲ５細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）ＤＲ５膜貫通ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）ＤＲ５細胞内ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）ＤＲ５死ドメインをコードするヌクレオチド配列；および
（ｊ）上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、または（ｉ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列に少なくとも９５％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
２．上記ポリヌクレオチドが配列番号１のヌクレオチド配列を有する、項目１に記載の核酸分子。
３．上記ポリヌクレオチドが、配列番号２のアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する、項目１に記載の核酸分子。
４．上記ポリヌクレオチドが、配列番号２のアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドをコードする配列番号１のヌクレオチド配列を有する、項目１に記載の核酸分子。
５．上記ポリヌクレオチドが、ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンの完全ヌクレオチド配列を有する、項目１に記載の核酸分子。
６．上記ポリヌクレオチドが、ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによてコードされるアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する、項目１に記載の核酸分子。
７．上記ポリヌクレオチドが、ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する、項目１に記載の核酸分子。
８．単離された核酸分子であって、項目１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、または（ｊ）のヌクレオチド配列と同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチド配列に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を含み、ここで上記ハイブリダイズするポリヌクレオチドが、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、アデノシンヌクレオチドのみまたはチミジンヌクレオチドのみからなるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにハイブリダイズしない、単離された核酸分子。
９． 項目１に記載の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、または（ｉ）のアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
１０．配列番号２のアミノ酸残基約１１〜約５９を含むポリペプチド；配列番号２のアミノ酸残基約６８〜約１１３を含むポリペプチド；配列番号２のアミノ酸残基約１７３〜約２２０を含むポリペプチド；および配列番号２のアミノ酸残基約２２４〜約３１９を含むポリペプチド、からなる群より選択されるＤＲ５ポリペプチドのエピトープ保有部分をコードする、項目９に記載の単離された核酸分子。
１１．ＤＲ５細胞外ドメインをコードする、項目１に記載の単離された核酸分子。
１２．ＤＲ５膜貫通ドメインをコードする、項目１に記載の単離された核酸分子。
１３．ＤＲ５細胞内ドメインをコードする、項目１に記載の単離された核酸分子。
１４．組換えベクターを作製する方法であって、項目１に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入する工程を包含する、方法。
１５．項目１４に記載の方法によって産生される、組換えベクター。
１６．組換え宿主細胞を作製する方法であって、項目１に記載の単離された核酸分子を宿主細胞に挿入する工程を包含する、方法。
１７．項目１６に記載の方法によって産生される、組換え宿主細胞。
１８．ＤＲ５ポリペプチドを産生するための組換え方法であって、項目１７に記載の組換え宿主細胞を、上記ポリペプチドが発現されるような条件下で培養する工程、および上記ポリペプチドを回収する工程、を包含する組換え方法。
１９．単離されたＤＲ５ポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約−５１〜約３６０；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約−５０〜約３６０；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約１〜約３６０；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｆ）ＤＲ５細胞外ドメインのアミノ酸配列；
（ｇ）ＤＲ５膜貫通ドメインのアミノ酸配列；
（ｈ）ＤＲ５細胞内ドメインのアミノ酸配列；
（ｉ）ＤＲ５死ドメインのアミノ酸配列；および
（ｊ）（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、または（ｊ）のポリペプチドのいずれか１つのエピトープ保有部分のアミノ酸配列、
からなる群より選択される配列に少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたＤＲ５ポリペプチド。
２０．ＤＲ５タンパク質のエピトープ保有部分を含む単離されたポリペプチドであって、ここで上記部分が、配列番号２のアミノ酸残基約１１〜約５９を含むポリペプチド；配列番号２のアミノ酸残基約６８〜約１１３を含むポリペプチド；配列番号２のアミノ酸残基約１７３〜約２２０を含むポリペプチド；および配列番号２のアミノ酸残基約２２４〜約３１９を含むポリペプチド、からなる群より選択される、単離されたポリペプチド。
２１．項目１９に記載のＤＲ５ポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
２２．単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）クローンＨＡＰＢＵ１３Ｒ（配列番号６）のヌクレオチド配列；
（ｂ）クローンＨＳＢＢＵ７６Ｒ（配列番号７）のヌクレオチド配列；
（ｃ）図１（配列番号１）に示される配列の部分のヌクレオチド配列であって、ここで上記部分が、ヌクレオチド２８４〜１，３６２の少なくとも５０の連続するヌクレオチドを含む、ヌクレオチド配列；および
（ｄ）上記の（ａ）、（ｂ）、または（ｃ）のヌクレオチド配列のいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列に、少なくとも９５％同一の配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
２３．ＤＲ５ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで、少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を除いて、上記ポリペプチドは、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約−５１〜約３６０を含むポリヌクレオチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約−５０〜約３６０を含むポリヌクレオチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約１〜約３６０を含むポリヌクレオチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡによってコードされるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｆ）ＤＲ５細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｇ）ＤＲ５膜貫通ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｈ）ＤＲ５細胞内ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｉ）全てまたは一部の膜貫通ドメインが欠失される、ＤＲ５レセプター細胞外および細胞内ドメインをコードするヌクレオチド配列；ならびに
（ｊ）ＤＲ５死ドメインをコードするヌクレオチド配列；
（ｋ）上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、または（ｊ）のいずれかに相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択される配列を有する、単離された核酸分子。
２４．単離されたＤＲ５ポリペプチドであって、ここで、少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を除いて、上記ポリペプチドは、以下：
（ａ）配列番号２のアミノ酸約−５１〜約３６０；
（ｂ）配列番号２のアミノ酸約−５０〜約３６０；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸約１〜約３６０；
（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡによってコードされるアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドのアミノ酸配列；
（ｆ）ＤＲ５レセプター細胞外ドメインをコードするアミノ酸配列；
（ｇ）ＤＲ５レセプター膜貫通ドメインをコードするアミノ酸ド配列；
（ｈ）ＤＲ５レセプター細胞内ドメインをコードするアミノ酸配列；
（ｉ）膜貫通ドメインの全てまたは部分が欠失されるＤＲ５レセプター細胞内ドメインおよび細胞外ドメインのアミノ酸配列；
（ｊ）ＤＲ５死ドメインをコードするアミノ酸配列；および
（ｋ）上記の（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、（ｄ）、（ｅ）、（ｆ）、（ｇ）、（ｈ）、（ｉ）、または（ｊ）のポリペプチドのいずれか１つのエピトープ保有部分のアミノ酸配列、
からなる群より選択される配列を有する、単離されたＤＲ５ポリペプチド。
２５．項目１９のポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
２６．項目２１に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
２７．項目２４に記載のポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
２８．異種ポリペプチドに融合された、項目１９に記載のポリペプチドを含む、融合タンパク質。
２９．上記核酸が、ＤＲ５ポリペプチドに対する抗体によって結合され得るタンパク質をコードし、ここで上記ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸配列を有する、項目８に記載の単離された核酸。
３０．組換えベクターを作製する方法であって、項目８に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入する工程を包含する、方法。
３１．項目３０に記載の方法によって産生される、組換えベクター。
３２．組換え宿主細胞を作製する方法であって、項目８に記載の単離された核酸分子を宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。
３３．項目３２に記載の方法によって産生される、組換え宿主。
３４．ポリペプチドを産生するための組換え方法であって、項目３３に記載の宿主細胞を、上記ポリペプチドが発現されるような条件下で培養する工程、および上記ポリペプチドを回収する工程、を包含する組換え方法。
【発明を実施するための最良の形態】
【００２２】
好ましい実施態様の詳細な説明
本発明は、図１（配列番号２）で示されるアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチド、またはポリペプチドのフラグメントをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子を提供する。本発明のＤＲ５ポリペプチドは、ＴＮＦＲファミリーの、他の既知の死ドメイン含有レセプター（図２のヒトＴＮＦＲ−１、ＤＲ３、およびＦａｓを含む）と配列相同性を共有する。図１（配列番号１）に示されるヌクレオチド配列は、ＨＬＹＢＸ８８のようなｃＤＮＡクローンの配列決定によって得られ、このクローンは、１９９７年３月７日にアメリカンタイプカルチャーコレクション、１２３０１ Ｐａｒｋ Ｌａｗｎ Ｄｒｉｖｅ， Ｒｏｃｋｉｌｌｅ， Ｍａｒｙｌａｎｄ ２０８５２に寄託され、そして受託番号９７９２０が与えられた。寄託されたクローンは、ｐＳｐｏｒｔ １プラスミド（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ， Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ， ＭＤ）に含まれる。
【００２３】
核酸分子
他に示されない限り、本明細書中でＤＮＡ分子を配列決定することによって決定されたすべてのヌクレオチド配列は、自動化ＤＮＡ配列決定機（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ， Ｉｎｃ．のＭｏｄｅｌ ３７３）を用いて決定され、そして本明細書中で決定されたＤＮＡ分子によってコードされるポリペプチドのすべてのアミノ酸配列は、上記のように決定されるＤＮＡ配列の翻訳によって推定された。従って、この自動化アプローチによって決定された任意のＤＮＡ配列について当該分野において公知のように、本明細書中で決定される任意のヌクレオチド配列はいくつかの誤りを含み得る。自動化によって決定されるヌクレオチド配列は、配列決定されるＤＮＡ分子の実際のヌクレオチド配列に対して、代表的には少なくとも約９０％同一、より代表的には少なくとも約９５％〜少なくとも約９９．９％同一である。実際の配列は、当該分野において周知の手動ＤＮＡ配列決定方法を含む他のアプローチによってさらに正確に決定され得る。当該分野においてまた公知のように、実際の配列と比較して、決定されたヌクレオチド配列における単一の挿入または欠失は、ヌクレオチド配列の翻訳においてフレームシフトを引き起こし、その結果、決定されたヌクレオチド配列によってコードされる推定アミノ酸配列は、配列決定されたＤＮＡ分子によって実際にコードされるアミノ酸配列（このような挿入または欠失の点にて始まる）とは完全に異なる。
【００２４】
本明細書中で提供される情報（例えば、配列番号１に示される核酸配列）を使用して、ＤＲ５ポリペプチドをコードする本発明の核酸分子は、出発物質としてｍＲＮＡを使用してｃＤＮＡをクローニングするための手順のような、標準的なクローニングおよびスクリーニング手順を使用して得られ得る。本発明の例示となる、本発明の核酸分子は、以下のヒト組織のｃＤＮＡライブラリーで同定された：一次樹状細胞、内皮組織、脾臓、慢性リンパ性白血病、およびヒト胸腺間質細胞。
【００２５】
配列番号１のＤＲ５ ｃＤＮＡの決定されたヌクレオチド配列は、約４１１アミノ酸残基のタンパク質をコードするオープンリーディングフレームを含み、その開始コドンは、約５１アミノ酸残基のリーダー配列を有する、図１（配列番号１）に示されるヌクレオチド配列の１３０〜１３２位にある。公知のＴＮＦレセプターファミリーのメンバーの、本発明のＤＲ５ポリペプチドは、複数のシステインリッチドメインにわたって有意な配列相同性を含む、図２に示されるヒトＴＮＦＲ１、ＦＡＳ、およびＤＲ３ポリペプチドと高度な相同性を共有する。ＤＲ５が、他の死ドメイン含有レセプターに対して示す相同性は、ＤＲ５もまたアポトーシスを誘導する能力を有する死ドメイン含有レセプターであることを強く示す。ＤＲ５はまた現在、ＴＲＡＩＬに結合することが示されている。
【００２６】
示されるように、本発明はまた、本発明のＤＲ５タンパク質の成熟形態を提供する。シグナル仮説によれば、哺乳動物細胞によって分泌されるタンパク質は、一旦粗面小胞体を横切って成長するタンパク質鎖の搬出が開始されると成熟タンパク質から切断される、シグナルまたは分泌リーダー配列を有する。大部分の哺乳動物細胞および昆虫細胞でさえも、分泌タンパク質を同じ特異性で切断する。しかし、いくつかの場合では、分泌タンパク質の切断は完全に単一ではなく、タンパク質において２種類以上の成熟種を生じる。さらに、分泌タンパク質の切断特異性は、究極的には完全タンパク質の一次構造によって決定され、すなわち、それはポリペプチドのアミノ酸配列に固有なものであることが長い間知られていた。
【００２７】
それゆえに、本発明は、ＡＴＣＣ受託番号９７９２０として同定される宿主中に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされ、そして図１（配列番号２）に示されるようなアミノ酸配列を有する、成熟ＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を提供する。ＡＴＣＣ受託番号９７９２０として同定される宿主に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５タンパク質によって、寄託された宿主中のベクターに含まれるクローンのヒトＤＮＡ配列によってコードされる完全オープンリーディングフレームの、哺乳動物細胞（例えば、以下に記載するようなＣＯＳ細胞）中での発現によって産生されるＤＲ５タンパク質の成熟形態が意味される。以下に示すように、ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５は、コンピュータ分析に基づく予測された切断部位の正確さに依存して、配列番号２に示された予測された「成熟」ＤＲ５タンパク質（アミノ酸約１〜約３６０）と異なり得るか、または異ならなくてもよい。
【００２８】
タンパク質が分泌リーダーおよびリーダー配列の切断点を有するかどうかを予測する方法は、利用可能である。例えば、ＭｃＧｅｏｃｈ（Ｖｉｒｕｓ Ｒｅｓ． ３：２７１−２８６ （１９８５））およびｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅ（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． １４：４６８３−４６９０ （１９８６））の方法が使用され得る。これらの方法の各々の公知の哺乳動物分泌タンパク質の切断点の予測の正確さは、７５〜８０％の範囲内にある。ｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅ， 前出。しかし、２つの方法は、所定のタンパク質に対して常に同じ予測された切断点を産生するわけではない。
【００２９】
今回の場合、本発明の完全ＤＲ５ポリペプチドの予測アミノ酸配列は、コンピュータープログラム（「ＰＳＯＲＴ」）によって分析された。Ｋ．ＮａｋａｉおよびＭ．Ｋａｎｅｈｉｓａ， Ｇｅｎｏｍｉｃｓ １４：８９７−９１１ （１９９２） を参照のこと。ＰＳＯＲＴは、アミノ酸配列に基づいてタンパク質の細胞内位置を予測するための熟達したシステムである。この位置付けのコンピューター予測の一部として、ＭｃＧｅｏｃｈおよびｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅの方法が取り入れられる。ＰＳＯＲＴプログラムによる分析は、図１におけるアミノ酸５１と５２の間（配列番号２の−１と１の間）の切断部位を予測した。その後、完全アミノ酸配列を目視検査によってさらに分析し、ｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅの（−１，−３）規則の単純形態を適用した。ｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅ、前出。従って、ＤＲ５タンパク質のリーダー配列は、図１の下線を付したアミノ酸残基約１〜約５１（配列番号２の約−５１〜約１に対応する）からなると予測され、一方予測された成熟ＤＲ５タンパク質は、図１の残基約５２〜約４１１（配列番号２の約１〜約３６０に対応する）からなる。
【００３０】
示されるように、本発明の核酸分子は、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）の形態、またはＤＮＡ（例えば、クローニングによって得られるか、または合成的に生成されるｃＤＮＡおよびゲノムＤＮＡを含む）の形態で存在し得る。ＤＮＡは、二本鎖または一本鎖であり得る。一本鎖ＤＮＡは、コード鎖（センス鎖としても知られる）であり得るか、または非コード鎖（アンチセンス鎖とも呼ばれる）であり得る。
【００３１】
「単離された」核酸分子によって、ネイティブな環境から取り出された核酸分子（ＤＮＡまたはＲＮＡ）が意図される。例えば、ベクター中に含まれる組換えＤＮＡ分子は、本発明の目的のために単離されると考えられる。単離されたＤＮＡ分子のさらなる例は、異種宿主細胞において維持される組換えＤＮＡ分子、または溶液中の（部分的または実質的に）精製されたＤＮＡ分子を含む。単離されたＲＮＡ分子は、本発明のＤＮＡ分子のインビボまたはインビトロでのＲＮＡ転写物を含む。本発明に従う単離された核酸分子は、合成的に生成されたこのような核酸分子をさらに含む。
【００３２】
本発明の単離された核酸分子は、配列番号１に示されるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を含むＤＲ５ ＤＮＡ分子；成熟ＤＲ５タンパク質のコード配列を含むＤＮＡ分子；および上記のＤＮＡ分子とは実質的に異なる配列を含むが、遺伝コードの縮重に起因して、なおＤＲ５タンパク質をコードするＤＮＡ分子を含む。当然ながら、遺伝コードは当業者には公知である。従って、当業者にとっては、このような縮重改変体を生成することは日常的である。
【００３３】
別の局面において、本発明は、１９９７年３月７日にＡＴＣＣ受託番号９７９２０として寄託されたプラスミド中に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するＤＲ５ポリペプチドをコードする、単離された核酸分子を提供する。さらなる実施態様において、成熟ＤＲ５ポリペプチドまたはＮ末端メチオニンを欠く完全長ＤＲ５ポリペプチドをコードする核酸分子が提供される。本発明はさらに、配列番号１に示されるヌクレオチド配列、または上記の寄託されたクローンに含まれるＤＲ５ ｃＤＮＡのヌクレオチド配列、あるいは上記の配列の１つに相補的な配列を有する核酸分子を有する単離された核酸分子を提供する。このような単離された分子、特にＤＮＡ分子は、染色体を用いるインサイチュハイブリダイゼーションによる遺伝子マッピングのためのプローブ、および例えばノーザンブロット分析によってヒト組織中のＤＲ５遺伝子の発現を検出するためのプローブとして有用である。
【００３４】
本発明はさらに、本明細書中に記載される単離された核酸分子のフラグメントに関する。寄託されたｃＤＮＡのヌクレオチド配列、配列番号１に示されるヌクレオチド配列、またはそれらに相補的な鎖を有する単離されたＤＮＡ分子のフラグメントによって、少なくとも約１５ｎｔ、そしてより好ましくは少なくとも２０ｎｔ、なおより好ましくは少なくとも３０ｎｔ、そしてさらにより好ましくは、少なくとも約４０、５０、１００、１５０、２００、２５０、３００、４００、または５００ｎｔ長のＤＮＡフラグメントが意図される。これらのフラグメントは、本明細書で議論するような、診断用プローブおよびプライマーを含むがこれらには限定されない多くの使用法を有する。もちろん、より大きいＤＮＡフラグメント（５００〜１５００ｎｔ長）もまた、本発明に従って、寄託されたｃＤＮＡのヌクレオチド配列または配列番号１に示される配列の、全てではないとしても大部分に対応するフラグメントのように有用である。例えば、少なくとも２０ｎｔ長のフラグメントによって、寄託されたＤＮＡのヌクレオチド配列または配列番号１に示されるヌクレオチド配列からの、２０以上の連続する塩基を含むフラグメントが意図される。
【００３５】
本発明の好ましい核酸フラグメントは以下をコードする核酸分子を含むが、これらに限定されない：ＤＲ５細胞外ドメインを含むポリペプチド（図１のアミノ酸残基約５２〜約１８４（配列番号２の約１から約１３３））；ＤＲ５膜貫通ドメインを含むポリペプチド（図１のアミノ酸残基約１８５〜約２０８（配列番号２の約１３４〜約１５７））；ＤＲ５細胞内ドメインを含むポリペプチド（図１のアミノ酸残基約２０９〜約４１１（配列番号２の約１５８〜約３６０））；およびＤＲ５死ドメインを含むポリペプチド（図１のアミノ酸残基約３２４〜約３９１（配列番号２の約２７３〜約３４０））。これらのドメインの位置はコンピューターグラフィックスによって予測されているので、当業者は、これらのドメインを構成するアミノ酸残基が、各々のドメインを定義するために使用される基準に依存して、わずかに変化し得る（例えば、約１〜１５残基）ことを理解する。
【００３６】
本発明の好ましい核酸フラグメントは、アミノ末端メチオニンをコードするヌクレオチド（配列番号１のヌクレオチド１３０〜１３２）を欠く、完全長ＤＲ５ポリペプチドをコードする。なぜならそのメチオニンは天然に切断され、そしてこのような配列は、おそらく遺伝的に操作するＤＲ５発現ベクターにおいて有用であることが知られるからである。このようなポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドはまた、本発明によって意図される。
【００３７】
本発明の好ましい核酸フラグメントは、さらに、ＤＲ５タンパク質のエピトープ保有部分をコードする核酸分子を含む。特に、本発明のこのような核酸フラグメントは、以下をコードする核酸分子を含むが、これらに限定されない：図１のアミノ酸残基約６２〜約１１０（配列番号２の約１１〜約５９）を含むポリペプチド；図１のアミノ酸残基約１１９〜約１６４（配列番号２の約６８〜約１１３）を含むポリペプチド；図１のアミノ酸残基約２２４〜約２７１（配列番号２の約１７３〜約２２０）を含むポリペプチド；および図１のアミノ酸残基約２７５〜約３７０（配列番号２の約２２４〜約３１９）を含むポリペプチド。本発明者らは、上記のポリペプチドフラグメントがＤＲ５タンパク質の抗原領域であることを決定した。ＤＲ５タンパク質の、他のこのようなエピトープ保有部分を決定する方法は、下記で詳細に記載される。
【００３８】
さらに、本発明は、以下の関連するｃＤＮＡクローン：ＨＡＰＢＵ１３Ｒ（配列番号６）、およびＨＳＢＢＵ７６Ｒ（配列番号７）から決定された、配列番号１の広い部分に関連するヌクレオチド配列を有する核酸分子を提供する。ＨＡＰＢＵ１３ＲおよびＨＳＢＢＵ７６Ｒのヌクレオチド配列は、図４に示される。
【００３９】
さらに、本発明は、配列番号１の残基２８４〜１，３６２、好ましくは２８４〜６８１の少なくとも約３０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約５０ヌクレオチドの任意の部分を含むポリヌクレオチドを含む。
【００４０】
別の局面において、本発明は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、上記の本発明の核酸分子、例えばＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローン中のポリヌクレオチドの一部にハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子を提供する。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」によって、４２℃で、以下：５０％ホルムアミド、５×ＳＣＣ（１５０ ｍＭ ＮａＣｌ、１５ ｍＭ クエン酸三ナトリウム）、５０ ｍＭ リン酸ナトリウム（ｐＨ ７．６）、５×デンハルト溶液、１０％ 硫酸デキストラン、および２０ ｇ／ｍｌ変性剪断サケ精子ＤＮＡを含む溶液中での一晩のインキュベーションを行い、その後約６５℃で０．１×ＳＳＣ中でフィルターを洗浄することが意図される。
【００４１】
ポリヌクレオチドの「部分」にハイブリダイズするポリヌクレオチドによって、少なくとも約１５ヌクレオチド（ｎｔ）、そしてより好ましくは少なくとも約２０ｎｔ、なおより好ましくは少なくとも約３０ｎｔ、そしてさらになおより好ましくは少なくとも約３０〜７０または８０〜１５０ｎｔ、あるいは全長の参照ポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチド（ＤＮＡまたはＲＮＡのいずれか）が意図される。これらは、上記でそして下記でより詳細に議論されるように、診断用プローブおよびプライマーとして有用である。
【００４２】
「少なくとも２０ｎｔ長」のポリヌクレオチドの部分によって、例えば、参照ポリヌクレオチド（例えば、寄託されたｃＤＮＡまたは配列番号１に示されるようなヌクレオチド配列）のヌクレオチド配列からの２０以上の連続するヌクレオチドが意図される。
【００４３】
当然ながら、ポリＡ配列（例えば、図１（配列番号１）に示されるＤＲ５ ｃＤＮＡの３’末端ポリ（Ａ）トラクト）またはＴ（もしくはＵ）残基の相補的ストレッチのみにハイブリダイズするポリヌクレオチドは、本発明の核酸の部分にハイブリダイズするために使用される本発明のポリヌクレオチドには含まれない。なぜなら、このようなポリヌクレオチドは、ポリ（Ａ）ストレッチまたはその相補物（例えば、特に任意の二本鎖ｃＤＮＡクローン）を含む任意の核酸分子にハイブリダイズするからである。
【００４４】
示されるように、ＤＲ５ポリペプチドをコードする本発明の核酸分子は、以下：それ自体成熟ポリペプチドをコードする配列；成熟ポリペプチドのコード配列および付加的配列（例えば、プレタンパク質配列またはプロタンパク質配列またはプレプロタンパク質配列のようなリーダー配列あるいは分泌配列をコードする配列）；上記の付加的コード配列を含むかまたは含まない、成熟ポリペプチドのコード配列を、さらなる非コード配列（例えば、イントロンならびに非コード５’および３’配列（例えば、スプライシングシグナルおよびポリアデニル化シグナルを含む、転写、ｍＲＮＡプロセシングにおいて役割（例えば、リボソーム結合およびｍＲＮＡの安定性）を担う転写される非翻訳配列）を含むがこれらに限定されない）；さらなる機能性を提供するようなさらなるアミノ酸をコードするさらなるコード配列とともに含み得るがこれらに限定されない。従って、例えば、ポリペプチドは、マーカー配列（例えば、融合されたポリペプチドの精製を容易にするペプチド）に融合され得る。本発明のこの局面の特定の好ましい実施態様において、マーカー配列は、とりわけ、ヘキサヒスチジンペプチド（例えば、ｐＱＥベクター（Ｑｉａｇｅｎ， Ｉｎｃ．）において提供されるタグ）であり、それらの多くは市販されている。例えば、Ｇｅｎｔｚら、Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８６： ８２１−８２４ （１９８９）に記載されるように、ヘキサヒスチジンは、融合タンパク質の簡便な精製を提供する。「ＨＡ」タグは、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する精製のために有用な別のペプチドであり、これは、Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ ３７： ７６７−７７８ （１９８４）により記載されている。以下に議論するように、他のこのような融合タンパク質は、ＮまたはＣ末端にてＦｃに融合されるＤＲ５レセプターを含む。
【００４５】
本発明はさらに、ＤＲ５レセプターの一部分、アナログ、または誘導体をコードする、本発明の核酸分子の改変体に関する。改変体は、天然の対立遺伝子改変体のように、天然に存在し得る。「対立遺伝子改変体」によって、生物の染色体上の所定の遺伝子座を占める遺伝子のいくつかの代わりの形態の１つが意図される。Ｇｅｎｅｓ ＩＩ， Ｌｅｗｉｎ， Ｂ．編、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ （１９８５）。天然に存在しない改変体は、当該分野で公知の変異誘発技術を用いて生成され得る。
【００４６】
このような改変体には、ヌクレオチドの置換、欠失、または付加により産生される改変体が含まれる。この置換、欠失、または付加には１つ以上のヌクレオチドが含まれ得る。改変体は、コード領域、非コード領域、または両方において変化し得る。コード領域における変化は、保存的または非保存的アミノ酸置換、欠失、または付加を生じ得る。これらの間で特に好ましいのは、サイレントな置換、付加、および欠失であり、これらはＤＲ５レセプター、またはそれらの一部の特性および活性を変化させない。この点に関してまた特に好ましいのは、保存的置換である。
【００４７】
本発明のさらなる実施態様は、（ａ）配列番号２のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；（ｂ）配列番号２のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするが、アミノ末端メチオニンを欠いているヌクレオチド配列；（ｃ）配列番号２の約１〜約３６０位のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；（ｄ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；（ｅ）ＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する成熟ＤＲ５ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；（ｆ）配列番号２の約１〜約１３３位のアミノ酸配列を有するＤＲ５細胞外ドメイン、またはＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡによってコードされるＤＲ５細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列；（ｇ）配列番号２の約１３４〜約１５７位のアミノ酸配列を有するＤＲ５膜貫通ドメイン、またはＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡクローンによってコードされるＤＲ５膜貫通ドメインをコードするヌクレオチド配列；（ｈ）配列番号２の約１５８〜約３６０位のアミノ酸配列を有するＤＲ５細胞内ドメイン、またはＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡによってコードされるＤＲ５細胞内ドメインをコードするヌクレオチド配列；（ｉ）配列番号２の約２７３〜約３４０位のアミノ酸配列を有するＤＲ５死ドメイン、またはＡＴＣＣ受託番号９７９２０に含まれるｃＤＮＡによってコードされるＤＲ５死ドメインをコードするヌクレオチド配列；および（ｊ）上記の（ａ）（ｂ）（ｃ）（ｄ）（ｅ）（ｆ）（ｇ）（ｈ）または（ｉ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的な配列に対して、少なくとも９０％同一、およびより好ましくは少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である、単離された核酸分子を含む。
【００４８】
ＤＲ５ポリペプチドをコードする参照ヌクレオチド配列に、例えば、少なくとも９５％「同一な」ヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによって、そのポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が、ＤＲ５ポリペプチドをコードする参照ヌクレオチド配列の各１００ヌクレオチドあたり５つまでの点変異をポリヌクレオチド配列が含み得ることを除いて、参照配列に同一であることが意図される。言い換えれば、参照ヌクレオチド配列と少なくとも９５％同一であるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを得るために、参照配列における５％までのヌクレオチドが欠失され得るか、もしくは別のヌクレオチドで置換され得るか、または参照配列において全ヌクレオチドの５％までの多数のヌクレオチドが、参照配列中に挿入され得る。参照（照会）配列は、図１（配列番号１）に示される全体のＤＲ５ヌクレオチド配列、または本明細書中に記載される任意のポリヌクレオチドフラグメントであり得る。
【００４９】
実際問題として、任意の特定の核酸分子が、例えば、配列番号１に示されるヌクレオチド配列または寄託されたｃＤＮＡクローンのヌクレオチド配列に少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるかどうかは、Ｂｅｓｔｆｉｔプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐａｃｋａｇｅ， Ｖｅｒｓｉｏｎ ８ ｆｏｒ Ｕｎｉｘ（登録商標）， Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ， Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐａｒｋ， ５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒｉｖｅ， Ｍａｄｉｓｏｎ， ＷＩ ５３７１１）のような公知のコンピュータープログラムを用いて従来通りに決定され得る。Ｂｅｓｔｆｉｔは、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎ、Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｍａｔｈｅｍａｔｉｃｓ ２：４８２−４８９ （１９８１）の局所的相同性アルゴリズムを用いて、２つの配列間の最も相同性の高いセグメントを見出す。Ｂｅｓｔｆｉｔまたは任意の他の配列整列プログラムを使用して、特定の配列が、本発明による参照配列に、例えば９５％同一であるか否かを決定する場合、パラメーターは、もちろん、同一性のパーセントが、参照ヌクレオチド配列の全長にわたって計算されるように、そして参照配列の総ヌクレオチド数の５％までの相同性におけるギャップが許容されるように、設定される。
【００５０】
特定の実施態様において、参照（照会）配列（本発明の配列）と対象配列との間の同一性はまた、グローバル配列アラインメントともいい、Ｂｒｕｔｌａｇら（Ｃｏｍｐ． Ａｐｐ． Ｂｉｏｓｃｉ． ６：２３７−２４５ （１９９０））のアルゴリズムに基づくＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを使用して決定される。同一性パーセントを計算するためのＤＮＡ配列のＦＡＳＴＤＢアラインメントに使用される好ましいパラメーターは以下である：マトリックス＝単一、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝４、ミスマッチペナルティー＝１、結合ペナルティー＝３０、ランダム化グループ長＝０、カットオフスコア＝１、ギャップペナルティー＝５、ギャプサイズペナルティー＝０．０５、ウィンドウサイズ＝５００、または対象核酸配列の長さのうち、どちらか短い方。この実施態様に従って、内部の欠損ではなく、５’または３’欠損のために、対象配列が照会配列よりも短い場合には、同一性パーセントを計算する場合に、ＦＡＳＴＤＢプログラムが対象配列の５’および３’欠損を考慮しないという事実を考慮した結果に対して、手作業の補正がなされる。５’または３’末端で欠損されている対象配列にとっては、照会配列と比較して、同一性パーセントは、照会配列の全塩基のパーセントとして、一致しない／アラインしない対象配列の５’および３’である照会配列の塩基の数を計算することによって補正される。ヌクレオチドが一致する／アラインするかどうかの決定は、ＦＡＳＴＤＢ配列アラインメントの結果によって決定される。次いでこのパーセントは、パーセント同一性から減ぜられ、特定のパラメーターを使用して上記のＦＡＳＴＤＢプログラムによって計算され、最終的なパーセント同一性スコアに到達する。この訂正されたスコアは、本実施態様の目的に使用されるものである。対象配列の５’および３’塩基の外側の塩基のみが、照会配列と一致しない／アラインしないＦＡＳＴＤＢアラインメントによって示されるように、パーセント同一性スコアを手作業で調整する目的のために計算される。例えば、９０塩基対象配列が、パーセント同一性を決定するために１００塩基照会配列にアラインされる。対象配列の５’末端に欠損が生じており、それゆえにＦＡＳＴＤＢアラインメントは５’末端の最初の１０塩基の一致／アラインメントを示さない。１０の不対塩基は、配列の１０％を示し（５’および３’末端の塩基の番号は、照会配列の一致した塩基数／全塩基数ではない）、ゆえにＦＡＳＴＤＢプログラムによって計算されるパーセント同一性スコアから１０％が引かれる。残りの９０塩基が完全に一致した場合、最終的なパーセント同一性は９０％である。別の例において、９０塩基対象配列は、１００塩基照会配列と比較される。今回の欠損は内部の欠損であるので、照会配列に一致しない／アラインしない対象配列の５’または３’には塩基が存在しない。 この場合、ＦＡＳＴＤＢによって計算されたパーセント同一性は、手作業で補正されない。もう一度述べると、照会配列と一致しない／アラインしない対象配列の５’および３’の塩基のみが、手作業で補正される。他の手作業の補正は、本実施態様の目的のためにはなされない。
【００５１】
本出願は、核酸分子が、ＤＲ５活性を有するポリペプチドをコードするか否かに関係なく、配列番号１に示される核酸配列、その寄託されたｃＤＮＡの核酸配列、またはそれらのフラグメントに対して少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である核酸分子に関する。これは、特定の核酸分子がＤＲ５活性を有するポリペプチドをコードしない場合でさえ、当業者は、核酸分子をどのように使用するか（例えば、ハイブリダイゼーションプローブ、またはポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）のプライマーとして）をなお知るからである。ＤＲ５活性を有するポリペプチドをコードしない、本発明の核酸分子の使用としては、とりわけ（１）ｃＤＮＡライブラリーにおけるＤＲ５遺伝子またはその対立遺伝子改変体を単離すること；（２）Ｖｅｒｍａら、Ｈｕｍａｎ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ： Ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｂａｓｉｃ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ， Ｐｅｒｇａｍｏｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ （１９８８） によりに記載されるような、ＤＲ５遺伝子の正確な染色体位置を提供するための分裂中期染色体展開物に対するインサイチュハイブリダイゼーション（例えば、「ＦＩＳＨ」）；および（３）特定の組織におけるＤＲ５ ｍＲＮＡ発現を検出するためのノーザンブロット分析、が挙げられる。
【００５２】
しかし、配列番号１に示される核酸配列、寄託されたｃＤＮＡの核酸配列、またはそれらのフラグメントに対して、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である配列を有し、実際、ＤＲ５タンパク質活性を有するポリペプチドをコードする、核酸分子が好ましい。「ＤＲ５活性を有するポリペプチド」により、特定の生物学的アッセイにおいて測定される場合に、本発明のＤＲ５タンパク質（全長タンパク質、または好ましくは成熟タンパク質のいずれか）の活性に、必ずしも同一である必要はないが、類似の活性を示すポリペプチドが意図される。例えば、ＤＲ５タンパク質活性は、本質的には、以前に記載された通り（Ａ．Ｍ． Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎら、Ｃｅｌｌ ８１： ５０５−１２ （１９９５）； Ｍ．Ｐ． Ｂｏｌｄｉｎら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７０：７７９５−８（１９９５）； Ｆ．Ｃ． Ｋｉｓｃｈｋｅｌら、ＥＭＢＯ １４：５５７９−５５８８（１９９５）； Ａ．Ｍ． Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７１： ４９６１−４９６５（１９９６））および以下の実施例５に示される通りに行われる細胞死アッセイを用いて測定され得る。ＭＣＦ７細胞において、全長ＤＲ５、または候補死ドメインを含むレセプターをコードするプラスミドが、緑色蛍光タンパク質をコードするｐＬａｎｔｅｒｎレポーター構築物を用いて同時トランスフェクトされる。ＤＲ５でトランスフェクトされた細胞の核は、ＤＡＰＩ染色により評価される場合、アポトーシス形態を示す。ＴＮＦＲ−１およびＦａｓ／ＡＰＯ−１と同様に（Ｍ．Ｍｕｚｉｏら、Ｃｅｌｌ ８５：８１７−８２７（１９９６）； Ｍ．Ｐ． Ｂｏｌｄｉｎら、Ｃｅｌｌ ８５： ８０３−８１５（１９９６）； Ｍ． Ｔｅｗａｒｉら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７０： ３２５５−６０（１９９５））、ＤＲ５誘導性アポトーシスは、ＩＣＥ様プロテアーゼのインヒビター（ＣｒｍＡおよびｚ−ＶＡＤ−ｆｍｋ）により、好ましくはブロックされる。
【００５３】
もちろん、遺伝コードの縮重に起因して、当業者は、寄託されたｃＤＮＡの核酸配列、配列番号１に示される核酸配列、またはそれらのフラグメントに対して少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である配列を有する多数の核酸分子が、「ＤＲ５タンパク質活性を有する」ポリペプドをコードすることをすぐに認識する。実際、これらのヌクレオチド配列の縮重改変体は全て、多くの場合、同じポリペプチドをコードするので、このことは、上記の比較アッセイを行わずとも当業者には明らかである。縮重改変体ではないような核酸分子については、理にかなった数のものがまた、ＤＲ５タンパク質活性を有するポリペプチドをコードすることが、当該分野でさらに認識される。このことは、当業者が、アミノ酸の置換（例えば、１つの脂肪族アミノ酸の、第二の脂肪族アミノ酸への置換）はタンパク質の機能に有意な影響を与える可能性が低いか、または可能性がないかのいずれかであることを完全に知っているからである。
【００５４】
例えば、表現型的にサイレントなアミノ酸置換を行う方法に関するガイダンスが、Ｂｏｗｉｅ，Ｊ．Ｕ．らの「Ｄｅｃｉｐｈｅｒｉｎｇ ｔｈｅ Ｍｅｓｓａｇｅ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ： Ｔｏｌｅｒａｎｃｅ ｔｏ Ａｍｉｎｏ Ａｃｉｄ Ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎｓ」，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４７：１３０６−１３１０（１９９０）において提供されている。ここで、著者らは、タンパク質が、アミノ酸置換に対して驚くべきほど寛容であることを示している。
【００５５】
ポリヌクレオチドアッセイ
本発明はまた、相補的なポリヌクレオチドを検出するためのＤＲ５ポリヌクレオチドの、例えば、診断試薬としての使用に関する。機能不全に関連する変異形態のＤＲ５の検出は、例えば、腫瘍または自己免疫疾患のような、ＤＲ５またはその可溶性形態の過小発現（ｕｎｄｅｒｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ）、過剰発現、または変化された発現を生じる疾患、またはその疾患に対する感受性の診断を加え得るか、または定義し得る診断ツールを提供する。
【００５６】
ＤＲ５遺伝子に変異を有する個体は、種々の技術により、ＤＮＡレベルにおいて検出され得る。診断のための核酸は、患者の細胞（例えば、血液由来）、尿、唾液、組織生検、および剖検材料から得られ得る。ゲノムＤＮＡは、検出のために直接的に使用され得るか、または分析の前にＰＣＲを用いることにより、酵素的に増幅され得る（Ｓａｉｋｉら、Ｎａｔｕｒｅ ３２４：１６３−１６６（１９８６））。ＲＮＡまたはｃＤＮＡはまた、同様の方法で使用され得る。例として、ＤＲ５をコードする核酸に対して相補的なＰＣＲプライマーが、ＤＲ５の発現および変異を、同定および分析するために使用され得る。例えば、欠失および挿入が、正常の遺伝子型との比較した増幅産物のサイズの変化により検出され得る。点変異は、放射標識されたＤＲ５ ＲＮＡか、あるいは放射標識されたＤＲ５アンチセンスＤＮＡ配列に対して、増幅されたＤＮＡをハイブリダイズすることにより同定され得る。完全にマッチした配列が、ＲＮａｓｅＡ消化により、または融解温度の差によりミスマッチ二重鎖から区別され得る。
【００５７】
参照遺伝子と変異を有する遺伝子との間の配列の相違がまた、直接的なＤＮＡ配列決定により示され得る。さらに、クローンＤＮＡセグメントは、特異的ＤＮＡセグメントを検出するためのプローブとして用いられ得る。このような方法の感度は、適切なＰＣＲの使用、または別の増幅方法により非常に増強され得る。例えば、配列決定プライマーは、二本鎖ＰＣＲ産物、または改変されたＰＣＲにより生成される一本鎖テンプレート分子が使用される。配列決定は、放射標識されたヌクレオチドを用いる従来の手順により、または蛍光タグを用いる自動配列決定手順により行われる。
【００５８】
ＤＮＡ配列の差異に基づく遺伝子試験は、変性剤を含むかまたは含まないゲル上でのＤＮＡフラグメントの電気泳動移動度における変化の検出により達成され得る。小配列の欠失および挿入は、高分解能のゲル電気泳動により可視化され得る。異なる配列のＤＮＡフラグメントは、変性ホルムアミドグラジエントゲル上で識別され得、ここで異なるＤＮＡフラグメントの移動度は、それらの特異的な融解温度または部分融解温度（ｐａｒｔｉａｌ ｍｅｌｔｉｎｇ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ）に従って、ゲルの異なる位置に遅延する（例えば、Ｍｙｅｒｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３０：１２４２（１９８５）を参照のこと）。
【００５９】
特定の位置での配列変化はまた、ヌクレアーゼプロテクションアッセイ（例えば、ＲＮａｓｅおよびＳｌ保護）または化学切断法により示され得る（例えば、Ｃｏｔｔｏｎら、Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８５：４３９７−４４０１（１９８５））。
【００６０】
従って、特異的ＤＮＡ配列の検出は、以下を含むがこれらに限定されない方法により達成され得る：ハイブリダイゼーション、ＲＮａｓｅプロテクション、化学切断、直接的なＤＮＡの配列決定、または制限酵素の使用（例えば、ゲノムＤＮＡの制限断片長多型（「ＲＦＬＰ」）およびサザンブロッティング）。
【００６１】
より慣習的なゲル電気泳動およびＤＮＡの配列決定に加えて、変異はまた、インサイチュ分析により検出され得る。
【００６２】
ベクターおよび宿主細胞
本発明はまた、本発明のＤＮＡ分子を含むベクター、本発明のベクターを用いて遺伝子操作された宿主細胞、および組換え技術による本発明のポリペプチドの産生に関する。
【００６３】
宿主細胞は、本発明の核酸分子を取り込みそして本発明のポリペプチドを発現するように遺伝子操作され得る。ポリヌクレオチドは単独で、または他のポリヌクレオチドとともに導入され得る。そのような他のポリヌクレオチドは独立して導入され得るか、同時導入され得るか、または本発明のポリヌクレオチドと連結して導入され得る。
【００６４】
本発明のこの局面に従って、ベクターは例えば、プラスミドベクター、一本鎖または二本鎖ファージベクター、一本鎖または二本鎖のＲＮＡウイルスベクターまたはＤＮＡウイルスベクターであり得る。このようなベクターは、ＤＮＡおよびＲＮＡを細胞へ導入するための周知の技術により、ポリヌクレオチド（好ましくは、ＤＮＡ）として細胞に導入され得る。ウイルスベクターは複製コンピテントまたは複製欠損であり得る。後者の場合、ウイルスの増殖は一般的に、相補性宿主細胞においてのみ、生じる。
【００６５】
特定の局面において、ベクターの中で好ましいのは、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドの発現のためのベクターである。一般的に、このようなベクターは、発現されるポリヌクレオチドに作動可能に連結され、宿主における発現に対して効果的である、シス作用性調節領域を含む。適切なトランス作用性因子は、宿主により供給されるか、相補性ベクターにより供給されるか、または宿主に導入される際のベクター自身により供給されるかのいずれかである。
【００６６】
非常に種々の発現ベクターが、本発明のポリペプチドを発現するために使用され得る。このようなベクターは、染色体性ベクター、エピソーム性ベクター、およびウイルス由来のベクターを含み、これらには、例えば、細菌プラスミド由来のベクター、バクテリオファージ由来のベクター、酵母エピソーム由来のベクター、酵母染色体エレメント由来のベクター、バキュロウイルス、ＳＶ４０のようなパポバウイルス、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、ニワトリポックスウイルス、仮性狂犬病ウイルスおよびレトロウイルスのようなウイルス由来のベクター、ならびにそれらの組み合わせに由来するベクター（例えば、コスミドおよびファージミドのような、プラスミドおよびバクテリオファージの遺伝エレメント由来のベクター）が挙げられ、これらの全てが本発明のこの局面に従って、発現のために使用され得る。一般的に、ポリペプチドを発現するためのポリヌクレオチドを、宿主中で維持、増殖、または発現するのに適切な任意のベクターは、この点に関して、発現のために使用され得る。
【００６７】
発現ベクターにおけるＤＮＡ配列は、適切な発現調節配列に作動可能に連結されおり、発現調節配列としては、例えば、ｍＲＮＡ転写を指向するプロモーターが挙げられる。このようなプロモーターの代表的としては、ファージλＰＬプロモーター、Ｅ．ｃｏｌｉ ｌａｃプロモーター、ｔｒｐプロモーター、およびｔａｃプロモーター、ＳＶ４０初期プロモーターおよびＳＶ４０後期プロモーター、ならびにレトロウイルスＬＴＲのプロモーターが挙げられる（周知のプロモーターのほんのいくつかを列挙したにすぎない）。一般的に、発現構築物は、転写（開始および終結）のための部位、そして転写された領域においては翻訳のためのリボソーム結合部位を含む。構築物により発現される成熟転写物のコード部分は、翻訳されるポリペプチドの始まりに翻訳開始ＡＵＧを含み、そして終わりに適切に配置される終結コドン（ＵＡＡ、ＵＧＡまたはＵＡＧ）を含む。
【００６８】
さらに、構築物は、発現を調節ならびに生じさせる調節領域を含み得る。一般的に、このような領域は、とりわけ、リプレッサー結合部位およびエンハンサーのように、転写制御により作動する。
【００６９】
増殖および発現のためのベクターは一般的に、選択マーカーを含む。このようなマーカーはまた、増幅のために適切であり得るか、またはそのベクターはこの目的のためにさらなるマーカーを含み得る。この点に関して、発現ベクターは、好ましくは、形質転換された宿主細胞の選択のための表現型形質を提供する１つ以上の選択マーカー遺伝子を含む。このようなマーカーとしては、真核生物細胞の培養についてはジヒドロ葉酸レダクターゼ、ネオマイシン耐性、ならびにＥ．ｃｏｌｉおよび他の細菌の培養については、テトラサイクリンもしくはアンピシリン耐性遺伝子が挙げられるが、これらに限定されない。
【００７０】
本明細書中の他の箇所に記載したような適切なＤＮＡ配列を含むベクター、ならびに適切なプロモーター、および他の適切な調節配列は、所望のポリペプチドを宿主中に発現するのに適切な種々の周知の技術を使用して、適切な宿主に導入され得る。適切な宿主の代表的な例としては、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ細胞、およびＳａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ細胞）；真菌細胞（例えば、酵母細胞）；昆虫細胞（例えば、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓ２細胞およびＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ Ｓｆ９細胞）；動物細胞（例えば、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、およびＢｏｗｅｓ黒色腫細胞）；ならびに植物細胞が挙げられる。上記の宿主細胞のための適切な培養培地および条件は当該分野で公知である。
【００７１】
細菌における使用に好ましいベクターの中には、ｐＱＥ７０、ｐＱＥ６０、およびｐＱＥ−９（Ｑｉａｇｅｎ から入手可能）；ｐＢＳベクター、Ｐｈａｇｅｓｃｒｉｐｔベクター、Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔベクター、ｐＮＨ８Ａ、ｐＮＨ１６ａ、ｐＮＨ１８Ａ、ｐＮＨ４６Ａ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅから入手可能）；ならびにｐｔｒｃ９９ａ、ｐＫＫ２２３−３、ｐＫＫ２３３−３、ｐＤＲ５４０、ｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａから入手可能）がある。好ましい真核生物ベクターの中には、ｐＷＬＮＥＯ、ｐＳＶ２ＣＡＴ、ｐＯＧ４４、ｐＸＴ１、およびｐＳＧ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅから入手可能）；ならびにｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧ、およびｐＳＶＬ（Ｐｈａｒｍａｃｉａから入手可能）がある。これらのベクターは、単に、多くの市販のベクターおよび当業者が入手可能な周知のベクターの例示のために単に列挙されただけである。
【００７２】
宿主細胞における発現のための適切なベクターおよびプロモーターの選択は、周知の手順であり、そして発現ベクターの構築、宿主へのベクターの導入および宿主における発現に必須な技術は、当該分野で日常的な技術である。
【００７３】
本発明はまた、上記に議論した上記の構築物を含む宿主細胞にも関する。宿主細胞は、高等真核生物細胞（例えば、哺乳動物細胞）もしくは下等真核生物細胞（例えば、酵母細胞）であり得るか、または宿主細胞は、細菌細胞のような原核生物細胞であり得る。挿入された遺伝子配列の発現を調節するか、または所望される特異的な様式で遺伝子産物を修飾およびプロセシングする、宿主株が選択され得る。特定のプロモーターからの発現は、特定のインデューサーの存在下で上昇し得；従って、遺伝子操作されたポリペプチドの発現は制御され得る。さらに、異なる宿主細胞は、タンパク質の翻訳および翻訳後プロセシングおよび修飾（例えば、リン酸化、切断）についての特徴および特異的な機構を有する。適切な細胞株が、発現される外来タンパク質（ｆｏｅｉｇｎ ｐｒｏｔｅｉｎ）の所望の修飾およびプロセシングを保証するために選択され得る。
【００７４】
宿主細胞への構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染または他の方法によってもたらされ得る。このような方法は、多くの標準的実験室マニュアルに記載されている（例えば、Ｄａｖｉｓら、Ｂａｓｉｃ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（１９８６））。
【００７５】
ポリペプチドは、融合タンパク質（（異なるタンパク質の）異種タンパク質配列へのペプチド結合を介して連結されたポリペプチドを含む）のような改変された形態で発現され得、そして分泌シグナルだけでなく、さらなる異種の機能的領域も含み得る。このような融合タンパク質は、適切なリーディングフレームにおいて、当該分野で公知の方法により、本発明のポリヌクレオチドと所望のアミノ酸配列をコードする所望の核酸配列とをお互いに連結することにより、そして当該分野で公知の方法により融合タンパク質産物を発現することによって作製され得る。あるいは、このような融合タンパク質は、タンパク質合成技術により（例えば、ペプチド合成機の使用により）作製され得る。従って、例えば、さらなるアミノ酸（特に、荷電したアミノ酸）の領域が、宿主細胞における、精製の間の、またはこれに続く取り扱いおよび保存の間の、安定性および持続性を改善するために、ポリペプチドのＮ末端に付加され得る。さらに、領域がまた、精製を容易にするためにポリペプチドへ付加され得る。そのような領域は、ポリペプチドの最終調製の前に除去され得る。とりわけ、分泌または排出を生じるため、安定性を改善するため、および精製を容易にするためのポリペプチドへのペプチド部分の付加は、当該分野で周知であり、そして日常的な技術である。好ましい融合タンパク質は、タンパク質の可溶化に有用な免疫グロブリン由来の異種領域を含む。例えば、ＥＰ−Ａ−０ ４６４ ５３３（カナダ国対応出願第２０４５８６９号）は、別のヒトタンパク質またはその一部とともに、免疫グロブリン分子の定常領域の種々の部分を含む融合タンパク質を開示する。多くの場合、融合タンパク質中のＦｃ部分は、治療および診断における使用に十分に有利であり、従って、例えば改善された薬物動態学的特性を生じる（ＥＰ−Ａ ０２３２ ２６２）。一方、いくつかの使用について、融合タンパク質が、記載される有利な様式で、発現され、検出され、そして精製された後に、Ｆｃ部分が欠失され得ることが望ましい。これは、Ｆｃ部分が、治療および診断における使用に対して障害となると判明する場合（例えば、融合タンパク質が免疫のための抗原として使用されるべき場合）である。薬物の発見において、例えばｈＩＬ−５レセプターのようなヒトタンパク質は、ｈＩＬ−５のアンタゴニストを同定するための高処理能力スクリーニングアッセイの目的でＦｃ部分と融合されている。Ｄ．Ｂｅｎｎｅｔｔら、Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ， ８：５２−５８（１９９５）、およびＫ．Ｊｏｈａｎｓｏｎら、Ｔｈｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ２７０：９４５９−９４７１（１９９５）を参照のこと。
【００７６】
ＤＲ５ポリペプチドは、標準的な方法（硫酸アンモニウム沈澱またはエタノール沈澱、酸抽出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、およびレクチンクロマトグラフィーを含むがこれらに限定されない）によって組換え細胞培養物から回収され、そして精製され得る。最も好ましくは、高速液体クロマトグラフィー（「ＨＰＬＣ」）が精製のために用いられる。ポリペプチドが、単離および／または精製の間に変性された場合、活性な立体配座を再生するために、タンパク質の再折りたたみについての周知の技術が用いられ得る。
【００７７】
本発明のポリペプチドは以下を含む：天然から精製された産物、化学合成手順の産物、および原核生物宿主または真核生物宿主（例えば、細菌細胞、酵母細胞、高等植物細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞を含む）から組換え技術によって産生された産物。組換え産生手順において用いられる宿主に依存して、本発明のポリペプチドは、グリコシル化されていても、またはグリコシル化されていなくてもよい。さらに、本発明のポリペプチドはまた、いくつかの場合、宿主媒介プロセスの結果として、改変された開始メチオニン残基を含み得る。
【００７８】
ＤＲ５ポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、種々の適用（特にＤＲ５の化学的特性および生物学的特性を利用する適用）のために本発明に従って使用され得る。これらの中には、腫瘍の処置、寄生生物、細菌、およびウイルスに対する抵抗性、Ｔ細胞、内皮細胞、および特定の造血細胞の増殖を誘導するため、再狭窄、対宿主性移植片病を処置するため、抗ウイルス応答を調節するため、およびアゴニストによるＤＲ５の刺激後の特定の自己免疫疾患を予防するための適用がある。さらなる適用は、細胞、組織、および生物体の障害の診断および処置に関する。本発明のこれらの局面は、以下にさらに議論される。
【００７９】
ＤＲ５ポリペプチドおよびフラグメント
本発明はさらに、寄託されたｃＤＮＡによってコードされるアミノ酸配列、もしくは配列番号２のアミノ酸配列を有する、単離されたＤＲ５ポリペプチド、または上記ポリペプチドの一部を含むポリペプチドもしくはペプチドを提供する。
【００８０】
ＤＲ５のいくつかのアミノ酸配列が、タンパク質の構造または機能に有意な影響を与えることなく、変更され得ることが当該分野において認識される。配列におけるこのような差異が意図される場合、タンパク質上に、活性を決定する重要な領域が存在することが覚えられておくべきである。このような領域は、通常はリガンド結合部位もしくは死ドメインを構成する残基、またはこれらのドメインに影響を与える三次構造を形成する残基を含む。
【００８１】
従って、本発明は、実質的なＤＲ５タンパク質活性を示すか、または以下に議論されるタンパク質の一部分のようなＤＲ５の領域を含むＤＲ５タンパク質のバリエーションをさらに含む。このような変異体は、欠失、挿入、逆位、反復、および型置換を含む。上記のように、どのアミノ酸の変化が表現型的にサイレントである可能性があるかに関するガイダンスは、Ｂｏｗｉｅ，Ｊ．Ｕ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４７：１３０６−１３１０（１９９０）において見出され得る。
【００８２】
従って、配列番号２のポリペプチドのフラグメント、誘導体またはアナログ、あるいは寄託されたｃＤＮＡによりコードされるポリペプチドのフラグメント、誘導体またはアナログは、（ｉ）少なくとも１つ以上のアミノ酸残基が保存アミノ酸残基もしくは非保存アミノ酸残基（好ましくは保存アミノ酸残基、そしてより好ましくは少なくとも１個であるが１０個より少ない保存アミノ酸残基）で置換され、そしてこのような置換されたアミノ酸残基は、遺伝コードによりコードされるものであってもよいしそうでなくともよいもの、または（ｉｉ）１つ以上のアミノ酸残基が置換基を含むもの、または（ｉｉｉ）成熟ポリペプチドが、ポリペプチドの半減期を増加させるための化合物（例えば、ポリエチレングリコール）のような別の化合物と融合したもの、または（ｉｖ）さらなるアミノ酸が成熟ポリペプチド（例えば、ＩｇＧ Ｆｃ融合領域ペプチド配列）、またはリーダー配列もしくは分泌配列、または成熟ポリペプチドもしくはプロタンパク質配列の精製に使用される配列と融合したものであり得る。このようなフラグメント、誘導体およびアナログは、本明細書の教示より当業者の範囲内であると考えられる。
【００８３】
特に興味深いのは、荷電したアミノ酸の、別の荷電したアミノ酸、および中性のアミノ酸、または負に荷電したアミノ酸との置換である。後者は、正の電荷が減少したタンパク質を生じてＤＲ５タンパク質の特徴を改善する。凝集の防止は非常に望ましい。タンパク質の凝集は活性を減少させるだけではなく、凝集体は免疫原性であり得ることから薬学的処方物を調製する場合にまた、問題であり得る（Ｐｉｎｃｋａｒｄら、Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：３３１−３４０（１９６７）；Ｒｏｂｂｉｎｓら、Ｄｉａｂｅｔｅｓ ３６：８３８−８４５（１９８７）；Ｃｌｅｌａｎｄら、Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｄｒｕｇ Ｃａｒｒｉｅｒ Ｓｙｓｔｅｍｓ １０：３０７−３７７（１９９３））。
【００８４】
アミノ酸の置換はまた、細胞表面のレセプターに対する結合の選択性を変化させ得る。Ｏｓｔａｄｅら、Ｎａｔｕｒｅ ３６１：２６６−２６８（１９９３）は、ＴＮＦ−レセプターの２つの公知の型の１つのみに対するＴＮＦ−αの選択的な結合を生じる特定の変異を記載する。従って、本発明のＤＲ５レセプターは、天然の変異または人工操作のいずれかに由来する１つ以上のアミノ酸の置換、欠失、または付加を含み得る。
【００８５】
示されるように、タンパク質の折り畳みまたは活性に有意には影響を与えない保存的アミノ酸置換のような、重要でない性質の変化が好ましい（表１を参照のこと）。
【００８６】
【表１】

【００８７】
機能に必須である、本発明のＤＲ５タンパク質におけるアミノ酸は、部位特異的変異誘発またはアラニン走査型変異誘発のような当該分野に公知の方法により同定され得る（ＣｕｎｎｉｎｇｈａｍおよびＷｅｌｌｓ、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１０８１−１０８５（１９８９））。後者の手順は、分子内の全ての残基に単一のアラニン変異を導入する。次いで、得られた変異分子は、レセプター結合（インビトロ）のような生物学的活性、またはインビトロ増殖活性について試験される。リガンド−レセプター結合に重要な部位はまた、結晶化、核磁気共鳴、または光親和性標識のような構造分析により決定され得る（Ｓｍｉｔｈら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ． ２２４：８９９−９０４（１９９２）およびｄｅ Ｖｏｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５５：３０６−３１２（１９９２））。
【００８８】
本発明のポリペプチドは、好ましくは単離された形態で提供される。「単離されたポリペプチド」によって、そのネイティブな環境から取り出されたポリペプチドが意図される。従って、組換え宿主細胞内で産生されるおよび／または含まれるポリペプチドは、本発明の目的のために単離されていると考えられる。組換え宿主細胞から部分的または実質的に精製されたポリペプチドもまた、「単離されたポリペプチド」として意図される。例えば、組換え的に産生されたバージョンのＤＲ５ポリペプチドは、ＳｍｉｔｈおよびＪｏｈｎｓｏｎ、Ｇｅｎｅ ６７：３１−４０（１９８８）に記載される一工程方法により実質的に精製され得る。
【００８９】
本発明のポリペプチドはまた、リーダーを含む寄託されたｃＤＮＡによりコードされるポリペプチド；リーダーを含まない、寄託されたｃＤＮＡによりコードされる成熟ポリペプチド（すなわち、成熟タンパク質）；配列番号２におけるアミノ酸約−５１〜約３６０を含むポリペプチド；配列番号２におけるアミノ酸約−５０〜約３６０を含むポリペプチド；配列番号２におけるアミノ酸約１〜約３６０を含むポリペプチド；細胞外ドメインを含むポリペプチド；膜貫通ドメインを含むポリペプチド；細胞内ドメインを含むポリペプチド；全てまたは一部の膜貫通ドメインが欠失している、細胞外ドメインおよび細胞内ドメインを含むポリペプチド；および死ドメインを含むポリペプチド；ならびに上記のポリペプチドに少なくとも８０％同一、より好ましくは少なくとも９０％または９５％同一、なおさらに好ましくは少なくとも９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるポリペプチドを含み、そしてまた少なくとも３０アミノ酸を、そしてより好ましくは少なくとも５０アミノ酸を有するこのようなポリペプチドの部分をも含む。
【００９０】
ＤＲ５ポリペプチドの参照アミノ酸配列に少なくとも、例えば、９５％「同一の」アミノ酸配列を有するポリペプチドにより、そのポリペプチド配列が、ＤＲ５ポリペプチドの参照アミノ酸の各１００アミノ酸毎に５つまでのアミノ酸変化を含み得ることを除いて、そのポリペプチドのアミノ酸配列は参照配列と同一であることが意図される。言い換えれば、参照アミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドを得るために、参照配列においてアミノ酸残基の５％までが、欠失されるかもしくは別のアミノ酸で置換され得、または参照配列における総アミノ酸残基の５％までの多数のアミノ酸が参照配列に挿入され得る。これらの参照配列の変化は、参照アミノ酸配列のアミノ末端位置もしくはカルボキシ末端位置で、または参照配列の残基間で個々に、もしくは参照配列内で１つ以上の連続した基中のいずれかに散在した、これらの末端位置の間のどこかで起こり得る。
【００９１】
実際問題として、任意の特定のポリペプチドが、例えば、図１（配列番号２）に示されるアミノ酸配列、寄託されたｃＤＮＡクローンによりコードされるアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントに対して、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるかどうかは、Ｂｅｓｔｆｉｔプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐａｃｋａｇｅ， Ｕｎｉｘ（登録商標）用バージョン８、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ， Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐａｒｋ， ５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒｉｖｅ， Ｍａｄｉｓｏｎ， ＷＩ ５３７１１）のような公知のコンピュータープログラムを使用して従来通りに決定され得る。特定の配列が、本発明による参照配列に、例えば、９５％同一であるかどうかを決定するために、Ｂｅｓｔｆｉｔまたは任意の他の配列アラインメントプログラムを使用する場合、当然のことながら、同一性の百分率が参照アミノ酸配列の全長にわたって計算され、そして参照配列内のアミノ酸残基の総数の５％までの相同性におけるギャップが許容されるようにパラメーターが設定される。
【００９２】
特定の実施態様では、全体的な配列アラインメントとしても言及される、参照（問い合わせ）配列（本発明の配列）と対象配列との間の同一性は、Ｂｒｕｔｌａｇら（Ｃｏｍｐ． Ａｐｐ． Ｂｉｏｓｃｉ． ６：２３７−２４５（１９９０））のアルゴリズムに基くＦＡＳＴＤＢコンピュータープログラムを用いて決定される。ＦＡＳＴＤＢアミノ酸アラインメントにおいて用いられる好ましいパラメーターは、以下の通りである：Ｍａｔｒｉｘ＝ＰＡＭ ０、ｋ−ｔｕｐｌｅ＝２、Ｍｉｓｍａｔｃｈ Ｐｅｎａｌｔｙ＝１、Ｊｏｉｎｉｎｇ Ｐｅｎａｌｔｙ＝２０、Ｒａｎｄｏｍｉｚａｔｉｏｎ Ｇｒｏｕｐ Ｌｅｎｇｔｈ＝０、Ｃｕｔｔｏｆ Ｓｃｏｒｅ＝１、Ｗｉｎｄｏｗ Ｓｉｚｅ＝配列の長さ、Ｇａｐ Ｐｅｎａｌｔｙ＝５、Ｇａｐ Ｓｉｚｅ Ｐｅｎａｌｔｙ＝０．０５、Ｗｉｎｄｏｗ Ｓｉｚｅ＝５００または対象アミノ酸配列の長さのうちで短い方。この実施態様によれば、対象配列が、内部欠失ではなく、Ｎ末端欠失またはＣ末端欠失に起因して問い合わせ配列よりも短い場合、ＦＡＳＴＤＢプログラムが、全体の同一性パーセントを計算する場合には、対象配列のＮ末端短縮化およびＣ末端短縮化を計上しないという事実を考慮して結果に対して手動の補正が行なわれる。問い合わせ配列に対してＮ末端およびＣ末端で短縮化された対象配列については、同一性パーセントは、対応する対象残基とマッチ／アラインメントしない対象配列のＮ末端およびＣ末端である問い合わせ配列の残基の数を、問い合わせ配列の全塩基のパーセントとして計算することにより補正される。残基がマッチ／アラインメントするか否かの決定は、ＦＡＳＴＤＢ配列アラインメントの結果により決定される。次いで、この百分率が、特定されたパラメーターを用いて上記のＦＡＳＴＤＢプログラムにより計算された同一性パーセントから引かれて、最終的な同一性スコアのパーセントに到達する。この最終的な同一性スコアのパーセントは、この実施態様の目的のために用いられるものである。問い合わせ配列とマッチ／アラインメントしない、対象配列のＮ末端およびＣ末端についての残基のみ、同一性スコアのパーセントを手動で調整する目的のために考慮される。すなわち、問い合わせ残基のみが、対象配列の最も遠いＮ末端およびＣ末端の残基の外側に位置する。例えば、９０アミノ酸残基の対象配列は、１００残基の問い合わせ配列とアラインメントされて、同一性パーセントが決定される。欠失は対象配列のＮ末端で生じ、それゆえ、ＦＡＳＴＤＢアラインメントは、Ｎ末端における最初の１０残基については、マッチ／アラインメントを示さない。１０個の対合していない残基は、１０％の配列を表し（マッチしなかったＮ末端およびＣ末端における残基の数／問い合わせ配列における残基の総数）、従って、１０％がＦＡＳＴＤＢプログラムにより計算される同一性スコアのパーセントから引かれる。残りの９０残基が完全にマッチしていた場合、最終的な同一性％は９０％である。別の例では、９０残基の対象配列は、１００残基の問い合わせ配列と比較される。今度は、欠失が内部欠失である場合、従って問い合わせとマッチ／アラインメントしない対象配列の残基はＮ末端にもＣ末端にも存在しない場合である。この場合、ＦＡＳＴＤＢにより計算される同一性パーセントは、手動では補正されない。再度、ＦＡＳＴＤＢアラインメントにおいて提示されるように、問い合わせ配列とマッチ／アラインメントしない、対象配列のＮ末端およびＣ末端の外側に位置する残基のみが、手動で補正される。他の手動の補正は、この実施態様の目的では行なわれない。
【００９３】
本発明のポリペプチドは、当業者に周知の方法を用いるＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルまたは分子ふるいゲル濾過カラムでの分子量マーカーとして用いられ得る。
【００９４】
本発明者らは、ＤＲ５ポリペプチドが、３つの主な構造ドメインを示す、４１１残基のタンパク質であることを見出した。第１に、リガンド結合ドメインは、図１における残基約５２〜約１８４内（配列番号２におけるアミノ酸残基約１〜約１３３）に同定された。第２に、膜貫通ドメインは、図１における残基約１８５〜約２０８内（配列番号２におけるアミノ酸残基約１３４〜約１５７）に同定された。第３に、細胞内ドメインは、図１における残基約２０９〜約４１１内（配列番号２におけるアミノ酸残基約１５８〜約３６０）に同定された。重要なことには、細胞内ドメインは、残基約３２４から約３９１（配列番号２におけるアミノ酸残基約２７３〜約３４０）に死ドメインを含む。図１に示されるさらに好ましいポリペプチドのフラグメントは、残基約５２〜約４１１（配列番号２におけるアミノ酸残基約１〜約３６０）の成熟タンパク質、ならびに細胞外ドメインおよび細胞内ドメインの全てまたは一部を含むが膜貫通ドメインを欠く可溶性ポリペプチドを含む。
【００９５】
本発明はさらに、リーダーを含む、寄託されたｃＤＮＡクローンによりコードされるＤＲ５ポリペプチド、ならびに成熟タンパク質、細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、細胞内ドメイン、死ドメイン、およびそれらの全ての組合せから選択されるＤＲ５ポリペプチドフラグメントを提供する。
【００９６】
別の局面において、本発明は、本明細書中に記載のポリペプチドのエピトープ保有部分を含む、ペプチドまたはポリペプチドを提供する。このポリペプチド部分のエピトープは、本発明のポリペプチドの免疫原性または抗原性のエピトープである。「免疫原性エピトープ」は、タンパク質全体が免疫原である場合、抗体応答を誘発するタンパク質の一部分として定義される。他方、抗体が結合し得るタンパク質分子の領域は、「抗原性エピトープ」として定義される。タンパク質の免疫原性エピトープの数は一般的に、抗原性エピトープの数よりも少ない。例えば、Ｇｅｙｓｅｎら，Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８１：３９９８−４００２（１９８３）を参照のこと。
【００９７】
抗原性エピトープを保有する（すなわち、抗体が結合し得るタンパク質分子の領域を含む）ペプチドまたはポリペプチドの選択に関して、タンパク質配列の一部を模倣する比較的短い合成ペプチドが、その部分的に模倣されたタンパク質と反応する抗血清を日常的に誘発し得ることが当該分野で周知である。例えば、Ｓｕｔｃｌｉｆｆｅ，Ｊ．Ｇ．，Ｓｈｉｎｎｉｃｋ，Ｔ．Ｍ．，Ｇｒｅｅｎ，Ｎ．およびＬｅａｒｎｅｒ，Ｒ．Ａ．，「Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｔｈａｔ Ｒｅａｃｔ Ｗｉｔｈ Ｐｒｅｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ Ｓｉｔｅｓ ｏｎ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ」，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２１９：６６０−６６６（１９８３）を参照のこと。タンパク質反応性血清を誘発し得るペプチドは、タンパク質の一次配列で頻繁に示され、そして簡単な化学的法則のセットにより特徴付けられ得、そしてインタクトなタンパク質の免疫優性領域（すなわち、免疫原性エピトープ）にも、アミノ末端またはカルボキシル末端にも、制限されない。
【００９８】
それゆえ、本発明の抗原性エピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドは、本発明のポリペプチドに特異的に結合する抗体（モノクローナル抗体を含む）を惹起するために有用である。例えば、Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ ３７：７６７−７７８（１９８４）の７７７頁を参照のこと。従って、本発明の抗原性エピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドは、本発明のポリペプチドのアミノ酸配列に含まれる、少なくとも７個の、より好ましくは少なくとも９個、そして最も好ましくは少なくとも約１５個〜約３０個の間のアミノ酸の配列を、好ましくは含む。
【００９９】
ＤＲ５特異的抗体の生成のために使用され得る、抗原性ポリペプチドまたはペプチドの制限されない例として、以下のものが含まれる：図１におけるアミノ酸残基約６２〜約１１０（配列番号２における約１１〜約５９）を含むポリペプチド；図１におけるアミノ酸残基約１１９〜約１６４（配列番号２における約６８〜約１１３）を含むポリペプチド；図１におけるアミノ酸残基約２２４〜約２７１（配列番号２における約１７３〜約２２０）を含むポリペプチド；および図１におけるアミノ酸残基約２７５〜約３７０（配列番号２における約２２４〜約３１９）を含むポリペプチド。上記に示すように、本発明者らは、上記ポリペプチドフラグメントが、ＤＲ５タンパク質の抗原性領域であると決定した。
【０１００】
本発明のエピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドは、任意の従来の手段により生成され得る。Ｈｏｕｇｔｈｅｎ，Ｒ．Ａ， 「Ｇｅｎｅｒａｌ Ｍｅｔｈｏｄ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｒａｐｉｄ Ｓｏｌｉｄ−Ｐｈａｓｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ Ｌａｒｇｅ Ｎｕｍｂｅｒｓ ｏｆ Ｐｅｐｔｉｄｅｓ： Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｏｆ Ａｎｔｉｇｅｎ−Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ａｔ ｔｈｅ Ｌｅｖｅｌ ｏｆ Ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ Ａｍｉｎｏ Ａｃｉｄｓ」， Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８２：５１３１−５１３５（１９８５）。この「Ｓｉｍｕｌｔａｎｅｏｕｓ Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（ＳＭＰＳ）」プロセスは、Ｈｏｕｇｔｈｅｎらに対する米国特許第４，６３１，２１１号（１９８６）でさらに記載される。
【０１０１】
当業者が理解するように、本発明のＤＲ５ポリペプチドおよび上記のそのエピトープ保有フラグメントは、免疫グロブリン（ＩｇＧ）の定常ドメインの一部と合わされ得、キメラポリペプチドを生じる。これらの融合タンパク質は、精製を促進し、そしてインビボで半減期の増加を示す。これは、例えば、ヒトＣＤ４−ポリペプチドの最初の２つのドメインおよび哺乳動物免疫グロブリンのＨ鎖またはＬ鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質について示されている（ＥＰＡ ３９４，８２７；Ｔｒａｕｎｅｃｋｅｒら、Ｎａｔｕｒｅ ３３１：８４−８６（１９８８））。ＩｇＧ部分によるジスルフィド結合二量体構造を有する融合タンパク質はまた、他の分子との結合および中和において、単量体ＤＲ５タンパク質またはタンパク質フラグメント単独よりも効率的であり得る（Ｆｏｕｎｔｏｕｌａｋｉｓら、Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ ２７０：３９５８−３９６４（１９９５））。
【０１０２】
ポリペプチドアッセイ
本発明はまた、正常レベルおよび異常レベルの決定を含む、細胞および組織におけるＤＲ５タンパク質またはその可溶性形態のレベルの検出のための定量的および診断アッセイのような診断アッセイに関する。従って、例えば、正常コントロール組織サンプルと比較した、ＤＲ５またはその可溶性形態の過剰発現を検出するための本発明による診断アッセイは、例えば、腫瘍の存在を検出するために用いられ得る。宿主由来のサンプルにおけるタンパク質（例えば、本発明のＤＲ５タンパク質またはその可溶性形態）のレベルを決定するために用いられ得るアッセイ技術は、当業者に周知である。このようなアッセイ方法は、放射免疫アッセイ、競合的結合アッセイ、ウェスタンブロット分析、およびＥＬＩＳＡアッセイを含む。
【０１０３】
生物学的サンプル中のＤＲ５タンパク質レベルのアッセイは、当該分野で公知の任意の方法を用いて行い得る。「生物学的サンプル」によって、ＤＲ５レセプタータンパク質またはｍＲＮＡを含有する、個体、細胞株、組織培養物、または他の供給源から得られた、任意の生物学的サンプルが意図される。生物学的サンプル中のＤＲ５タンパク質のレベルをアッセイするために好ましいのは、抗体に基く技術である。例えば、組織におけるＤＲ５タンパク質発現は、古典的な免疫組織学的方法を用いて研究され得る（Ｊａｌｋａｎｅｎ，Ｍ．ら，Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０１：９７６−９８５（１９８５）；Ｊａｌｋａｎｅｎ，Ｍ．ら，Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０５：３０８７−３０９６（１９８７））。ＤＲ５タンパク質遺伝子発現を検出するために有用な、抗体に基づく他の方法には、免疫アッセイ（例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）および放射免疫アッセイ（ＲＩＡ））が挙げられる。
【０１０４】
適切な標識が当該分野で公知であり、そして、これには酵素標識（例えば、グルコースオキシダーゼ）、放射性同位体（例えば、ヨウ素（^１２５Ｉ、^１２１Ｉ）、炭素（^１４Ｃ）、イオウ（^３５Ｓ）、トリチウム（^３Ｈ）、インジウム（^１１２Ｉｎ）、およびテクネチウム（^９９ｍＴｃ））、蛍光標識（例えば、フルオレセインおよびローダミン）およびビオチンが含まれる。
【０１０５】
治療
腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）ファミリーのリガンドは、最も多面性のサイトカインの１つであることが公知であり、多数の細胞応答（細胞傷害性、抗ウイルス活性、免疫調節活性、およびいくつかの遺伝子の転写調節を含む）を誘導する（Ｇｏｅｄｄｅｌ， Ｄ．Ｖ．ら， 「Ｔｕｍｏｒ Ｎｅｃｒｏｓｉｓ Ｆａｃｔｏｒｓ： Ｇｅｎｅ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ」， Ｓｙｍｐ． Ｑｕａｎｔ． Ｂｉｏｌ． ５１：５９７−６０９ （１９８６）， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ； Ｂｅｕｔｌｅｒ， Ｂ．およびＣｅｒａｍｉ， Ａ．， Ａｎｎｕ． Ｒｅｖ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． ５７：５０５−５１８ （１９８８）； Ｏｌｄ， Ｌ．Ｊ．， Ｓｃｉ． Ａｍ． ２５８：５９−７５ （１９８８）； Ｆｉｅｒｓ， Ｗ．， ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ． ２８５：１９９−２２４ （１９９１））。ＴＮＦファミリーのリガンドは、ＴＮＦファミリーのレセプター（本発明のＤＲ５を含む）に結合することにより、このような種々の細胞応答を誘導する。ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞、およびＤＲ５リガンドに対する強力な細胞応答を有すると考えられる細胞は、初代樹状細胞、内皮組織、脾臓、慢性リンパ性白血病、およびヒト胸腺支質細胞を含む。「ＴＮＦファミリーのリガンドに対する細胞応答」により、ＴＮＦファミリーのリガンドにより誘導される、細胞、細胞株、組織、組織培養物、または患者に対する、任意の遺伝子型変化、表現型変化、および／または形態学的変化を意図する。示されたように、このような細胞応答は、ＴＮＦファミリーのリガンドに対する正常な生理学的応答だけでなく、アポトーシスの増加またはアポトーシスの阻害に関連する疾患をも含む。アポトーシス（プログラム細胞死）は、免疫系からの末梢Ｔリンパ球の欠損に関与する生理学的機構であり、そしてその調節不全は、多数の異なる病原性プロセスを導き得る（Ａｍｅｉｓｅｎ， Ｊ．Ｃ．， ＡＩＤＳ ８：１１９７−１２１３（１９９４）； Ｋｒａｍｍｅｒ， Ｐ．Ｈ．ら， Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． ６：２７９−２８９ （１９９９４））。
【０１０６】
増加した細胞生存またはアポトーシスの阻害に関連する疾患は、ガン（例えば、濾胞性リンパ腫、ｐ５３変異を有するガン、およびホルモン依存性腫瘍（例えば、乳ガン、前立腺ガン、カポージ肉腫、および卵巣ガン））；自己免疫障害（例えば、全身性エリテマトーデスおよび免疫関連糸球体腎炎慢性関節リウマチ）およびウイルス感染（例えば、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、およびアデノウイルス）、炎症；対宿主性移植片病、急性移植片拒絶、および慢性移植片拒絶を含む。増加したアポトーシスに関連する疾患は、ＡＩＤＳ；神経変性障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症、色素性網膜炎、小脳変性）；骨髄形成異常症候群（例えば、再生不良性貧血）、虚血性損傷（例えば、心筋梗塞、発作、および再灌流障害により引き起こされるもの）、毒素誘導性肝臓疾患（例えば、アルコールにより引き起こされるもの）、敗血症性ショック、悪液質、および食欲不振を含む。
【０１０７】
従って、１つの局面では、本発明は、ＴＮＦファミリーリガンドにより誘導されるアポトーシスを増強するための方法に関し、この方法は、ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞に、ＤＲ５媒介シグナル伝達を増加させ得る有効量のＤＲ５リガンド、アナログ、またはアゴニストを投与する工程を含む。好ましくは、ＤＲ５媒介シグナル伝達は、疾患を処置するために増加され、ここで、減少したアポトーシスまたは減少したサイトカインおよび接着分子の発現が示される。アゴニストは、可溶性形態のＤＲ５およびＤＲ５ポリペプチドに対するモノクローナル抗体を含み得る。
【０１０８】
さらなる局面では、本発明は、ＴＮＦファミリーリガンドにより誘導されるアポトーシスを阻害するための方法に関し、この方法は、ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞に、ＤＲ５媒介シグナル伝達を減少させ得る有効量のアンタゴニストを投与する工程を含む。好ましくは、ＤＲ５媒介シグナル伝達は、疾患を処置するために減少され、ここで、増加したアポトーシスまたはＮＦκＢ発現が示される。アンタゴニストは、可溶性形態のＤＲ５およびＤＲ５ポリペプチドに対するモノクローナル抗体を含み得る。
【０１０９】
「アゴニスト」により、アポトーシスを亢進または増強し得る、天然に存在する化合物および合成化合物が意図される。「アンタゴニスト」により、アポトーシスを阻害し得る、天然に存在する化合物および合成化合物が意図される。本発明の任意の候補「アゴニスト」または「アンタゴニスト」が、アポトーシスを増強し得るかまたは阻害し得るかは、以下でより詳細に記載されるアッセイを含む、当該分野で公知のＴＮＦファミリーのリガンド／レセプター細胞応答アッセイを用いて決定され得る。
【０１１０】
１つのこのようなスクリーニング手順は、本発明のレセプターを発現するようにトランスフェクトしたメラニン保有細胞の使用を含む。このようなスクリーニング技術は、１９９２年２月６日に公開されたＰＣＴ ＷＯ ９２／０１８１０に記載される。このようなアッセイは、例えば、本発明のレセプターポリペプチドの活性化を阻害（または増強）する化合物についてスクリーニングするために、レセプターをコードするメラニン保有細胞を、ＴＮＦファミリーのリガンドおよび候補アンタゴニスト（またはアゴニスト）の両方と接触させることにより、用いられ得る。リガンドにより生成されるシグナルの阻害または増強は、化合物が、リガンド／レセプターシグナル伝達経路のアンタゴニストまたはアゴニストであることを示す。
【０１１１】
他のスクリーニング技術は、レセプター活性化により引き起こされる細胞外ｐＨの変化を測定する系においてレセプターを発現する細胞（例えば、トランスフェクトされたＣＨＯ細胞）の使用を含む。例えば、化合物は、本発明のレセプターポリペプチドを発現する細胞と接触され得、そして２次メッセンジャー応答（例えば、シグナル伝達またはｐＨ変化）が測定されて、潜在的な化合物がレセプターを活性化するかまたは阻害するかが決定され得る。
【０１１２】
別のこのようなスクリーニング技術は、レセプターをコードするＲＮＡを、Ｘｅｎｏｐｕｓ卵母細胞に導入してレセプターを一過性に発現する工程を含む。次いで、レセプター卵母細胞は、レセプターリガンドおよびスクリーニングされる化合物と接触され得、続いてレセプターの活性化を阻害すると考えられる化合物についてのスクリーニングの場合はカルシウムシグナルの阻害または活性化の検出が行なわれる。
【０１１３】
別のスクリーング技術は、細胞において構築物を発現させる工程を含み、ここで、レセプターは、ホスホリパーゼＣまたはＤに結び付けられる。このような細胞は、内皮細胞、平滑筋細胞、胎児性腎臓細胞などを含む。スクリーニングは、レセプターの活性化またはレセプターの活性化の阻害をホスホリパーゼシグナルから検出することにより、本明細書中の上記の通りに達成され得る。
【０１１４】
別の方法は、本発明のレセプターポリペプチドの活性化を阻害する化合物（アンタゴニスト）を、細胞表面にレセプターを有する細胞に対する標識化リガンドの結合の阻害を決定することによりスクリーニングする工程を含む。このような方法は、真核生物細胞を、この細胞がその表面上にレセプターを発現するように、レセプターをコードするＤＮＡでトランスフェクトする工程、およびこの細胞を公知のリガンドの標識化形態の存在下で化合物と接触させる工程を含む。リガンドは、例えば、放射能により標識され得る。レセプターに結合した標識化リガンドの量は、例えば、レセプターの放射能を測定することにより測定される。化合物が、レセプターに結合する標識化リガンドの減少により決定されるようにレセプターに結合する場合、レセプターに対する標識化リガンドの結合は阻害される。
【０１１５】
本発明のアゴニストおよびアンタゴニストについてさらなるスクリーニングアッセイは、Ｔａｒｔａｇｌｉａ， Ｌ．Ａ．およびＧｏｅｄｄｅｌ， Ｄ．Ｖ．， Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ． ２６７：４３０４−４３０７（１９９２）に記載される。
【０１１６】
従って、さらなる局面では、候補アゴニストまたはアンタゴニストがＴＮＦファミリーのリガンドに対する細胞応答を増強し得るかまたは阻害し得るかを決定するためのスクリーニング方法が提供される。この方法は、ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞を、候補化合物およびＴＮＦファミリーのリガンドと接触させる工程、細胞応答をアッセイする工程、および標準的な細胞応答に対してこの細胞応答を比較する工程（標準は、候補化合物の非存在下でリガンドとの接触が行なわれる場合にアッセイされる）を含み、ここで標準を超える増加した細胞応答は、候補化合物がリガンド／レセプターシグナル伝達経路のアゴニストであることを示し、そして標準と比較して減少した細胞応答は、候補化合物がリガンド／レセプターシグナル伝達経路のアンタゴニストであることを示す。「細胞応答をアッセイすること」により、候補化合物および／またはＴＮＦファミリーのリガンドに対する細胞応答を定性的または定量的に測定する（例えば、Ｔ細胞増殖またはトリチウム化チミジン標識における増加または減少を決定または評価すること）ことが意図される。本発明により、ＤＲ５ポリペプチドを発現する細胞は、内因的または外因的のいずれかの投与されたＴＮＦファミリーのリガンドと接触され得る。
【０１１７】
本発明によるアゴニストは、天然に存在する化合物および合成化合物（例えば、ＴＮＦファミリーのリガンドペプチドフラグメント、トランスフォーミング増殖因子、神経伝達物質（例えば、グルタミン酸、ドパミン、Ｎ−メチル−Ｄ−アスパラギン酸）、腫瘍サプレッサー（ｐ５３）、細胞溶解性Ｔ細胞および代謝拮抗物質など）を含む。好ましいアゴニストは、化学療法薬（例えば、シスプラチン、ドキソルビシン、ブレオマイシン、シトシンアラビノシド、ナイトロジェンマスタード、メトトレキサート、およびビンクリスチン）を含む。他には、エタノールおよび−アミロイドペプチドを含む（Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６７：１４５７−１４５８（１９９５））。さらに好ましいアゴニストは、ＤＲ５ポリペプチドに対して惹起されたポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体、またはそれらのフラグメントを含む。ＴＮＦファミリーのレセプターに対して惹起されたこのようなアゴニスト抗体は、Ｔａｒｔａｇｌｉａ， Ｌ．Ａ．ら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８８：９２９２−９２９６（１９９１）； ならびにＴａｒｔａｇｌｉａ， Ｌ．Ａ．およびＧｏｅｄｄｅｌ， Ｄ．Ｖ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ． ２６７（７）：４３０４−４３０７（１９９２） に開示される。ＰＣＴ出願ＷＯ ９４／０９１３７もまた参照のこと。
【０１１８】
本発明によるアンタゴニストは、天然に存在する化合物および合成化合物（例えば、ＣＤ４０リガンド、中性アミノ酸、亜鉛、エストロゲン、アンドロゲン、ウイルス遺伝子（例えば、アデノウイルスＥｌＢ、バキュロウイルスｐ３５およびＩＡＰ、牛痘ウイルスｃｒｍＡ、エプスタイン−バーウイルスＢＨＲＦ１、ＬＭＰ−１、アフリカ豚コレラウイルスＬＭＷ５−ＨＬ、ならびにヘルペスウイルスｙｌ３４．５）、カルパインインヒビター、システインプロテアーゼインヒビター、ならびに腫瘍プロモーター（例えば、ＰＭＡ、フェノバルビタール、およびα−ヘキサクロロシクロヘキサン）など）を含む。
【０１１９】
他の潜在的なアンタゴニストは、アンチセンス分子を含む。アンチセンス技術が、アンチセンスＤＮＡもしくはＲＮＡを介して、または三重らせん形成を介して、遺伝子発現を制御するために使用され得る。アンチセンス技術は、例えば、Ｏｋａｎｏ，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．５６：５６０（１９９１）；Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｓ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ Ｒａｔｏｎ，ＦＬ．（１９８８）に考察される。三重らせん形成は、例えば、Ｌｅｅら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ６：３０７３（１９７９）；Ｃｏｏｎｅｙら，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４１：４５６（１９８８）；およびＤｅｒｖａｎら，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５１：１３６０（１９９１）に考察される。この方法は、相補的なＤＮＡまたはＲＮＡに対するポリヌクレオチドの結合に基く。
【０１２０】
例えば、本発明の成熟ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの５’コード部分は、約１０〜４０塩基対長のアンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドを設計するために用いられ得る。ＤＮＡオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子領域に相補的であり、それによりレセプターの転写および産生を防止するように設計される。アンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドは、インビボでｍＲＮＡにハイブリダイズし、そしてレセプターポリペプチドへのｍＲＮＡ分子の翻訳をブロックする。
【０１２１】
１つの実施態様では、本発明のＤＲ５アンチセンス核酸は、外来性配列からの転写により細胞内で産生される。例えば、ベクターまたはその部分は転写され、本発明のアンチセンス核酸（ＲＮＡ）を産生する。このようなベクターは、ＤＲ５アンチセンス核酸をコードする配列を含む。このようなベクターは、転写されて所望のアンチセンスＲＮＡを生成し得る限り、エピソーム性であり続け得るか、または染色体に組込まれることとなり得る。このようなベクターは、当該分野で標準的な組換えＤＮＡ技術法により構築され得る。ベクターは、脊椎動物細胞における複製および発現のために用いられる、当該分野で公知のプラスミド性、ウイルス性、または他のものであり得る。ＤＲ５をコードする配列またはそのフラグメントの発現は、脊椎動物、好ましくはヒト細胞において作用する当該分野で公知の任意のプロモーターによって行なわれ得る。このようなプロモーターは、誘導性または構成性であり得る。このようなプロモーターは、ＳＶ４０初期プロモーター領域（ＢｅｒｎｏｉｓｔおよびＣｈａｍｂｏｎ， Ｎａｔｕｒｅ ２９：３０４−３１０ （１９８１））、ラウス肉腫ウイルスの３’の長い末端反復配列に含まれるプロモーター（Ｙａｍａｍｏｔｏら、Ｃｅｌｌ ２２：７８７−７９７ （１９８０））ヘルペスチミジンプロモーター（Ｗａｇｎｅｒら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． Ｕ．Ｓ．Ａ． ７８：１４４１−１４４５ （１９８１））、メタロチオネイン遺伝子の調節配列（Ｂｒｉｎｓｔｅｒら， Ｎａｔｕｒｅ ２９６：３９−４２（１９８２））などを含むがこれらに限定されない。
【０１２２】
本発明のアンチセンス核酸は、ＤＲ５遺伝子のＲＮＡ転写物の少なくとも一部に相補的な配列を含む。しかし、好ましいとはいえ、絶対的な相補性は要求されない。本明細書で言及される「ＲＮＡの少なくとも一部に相補的な」配列とは、ＲＮＡとハイブリダイズして安定な二重鎖を形成し得るに充分な相補性を有する配列；二本鎖ＤＲ５アンチセンス核酸の場合、二重鎖ＤＮＡの一本鎖が試験され得るか、または三重らせん形成がアッセイされ得ることを意味する。ハイブリダイズする能力は、相補性の程度およびアンチセンス核酸の長さの両方に依存する。一般に、ハイブリダイズする核酸が大きければ大きいほど、より多くの塩基がＤＲ５ ＲＮＡとミスマッチであり、これは、安定な二重鎖を含み得、そして安定な二重鎖（もしくは三重らせんの場合もあり得る）を依然として形成し得る。当業者は、ハイブリダイズした複合体の融点を決定する標準的な手順の使用により、ミスマッチの許容される程度を確認し得る。
【０１２３】
本発明の潜在的なアンタゴニストはまた、触媒性ＲＮＡまたはリボザイム（例えば、１９９０年１０月４日に公開された、ＰＣＴ国際公開ＷＯ ９０／１１３６４；Ｓａｒｖｅｒら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４７：１２２２−１２２５（１９９０）を参照のこと）を含む。部位特異的認識配列でｍＲＮＡを切断するリボザイムがＤＲ５ ｍＲＮＡｓを破壊するために使用され得る場合、ハンマーヘッド型リボザイムの使用が好ましい。ハンマーヘッド型リボザイムは、標的ｍＲＮＡと相補的な塩基対を形成する隣接領域によって決定される位置でｍＲＮＡを切断する。唯一必要なことは、標的ｍＲＮＡが以下の２塩基の配列を有することである：５’−ＵＧ−３’。ハンマーヘッド型リボザイムの構築および産生は、当該分野で周知であり、そしてＨａｓｅｌｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ， Ｎａｔｕｒｅ ３３４：５８５−５９１（１９８８）に完全に記載されている。ＤＲ５のヌクレオチド配列内に、多数の潜在的なハンマーヘッド型リボザイム切断部位が存在する（図１）。好ましくは、リボザイムは、切断認識部位がＤＲ５ ｍＲＮＡの５’末端に近接するように（すなわち、非機能性ｍＲＮＡ転写の効率を増大させ、そして細胞内蓄積を最小限にするように）操作される。リボザイムをコードするＤＮＡ構築物は、ＤＮＡをコードするアンチセンスの導入について上に記載されるのと同様の様式で細胞に導入され得る。アンチセンス分子とは異なり、リボザイムは触媒性であるので、より低い細胞内濃度が効率のために必要とされる。
【０１２４】
本発明のさらなるアンタゴニストには、ＤＲ５の可溶性形態（すなわち、全長レセプターの細胞外領域からのリガンド結合ドメインを含むＤＲ５フラグメント）が含まれる。このような可溶性形態のレセプター（天然に存在し得るか、または合成され得る）は、ＴＮＦ−ファミリーリガンドへの結合について細胞表面ＤＲ５と競合することによって、ＤＲ５媒介性シグナリングと拮抗する。従って、リガンド結合ドメインを含む可溶性形態のレセプターは、ＴＮＦ−ファミリーリガンドによって誘導されるアポトーシスを阻害し得る、新規のサイトカインである。これはモノマーとして発現され得るが、好ましくはダイマーまたはトリマーとして発現される。なぜなら、これらはモノマー形態の可溶性レセプターよりも、アンタゴニスト（例えば、ＩｇＧＦｃ−ＴＮＦレセプターファミリー融合体）として優れていることが示されているからである。他のこのようなサイトカインが当該分野で公知であり、これにはＦａｓリガンドによって誘導されるアポトーシスを制限するように生理学的に作用するＦａｓ Ｂ（マウスＦａｓレセプターの可溶性形態）が含まれる（Ｈｕｇｈｅｓ， Ｄ．Ｐ．およびＣｒｉｓｐｅ， Ｉ．Ｎ．， Ｊ． Ｅｘｐ． Ｍｅｄ． １８２：１３９５−１４０１ （１９９５））。
【０１２５】
本明細書中で使用される用語「抗体」（Ａｂ）または「モノクローナル抗体」（ｍＡｂ）は、抗原に結合し得るインタクトな分子およびそのフラグメント（例えば、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）_２フラグメントのような）を含むことを意味する。Ｆａｂ、Ｆａｂ’、およびＦ（ａｂ’）_２フラグメントはインタクトな抗体のＦｃフラグメントを欠いており、循環からより迅速に除去され、そしてインタクトな抗体の非特異的組織結合をほとんど有し得ない（Ｗａｈｌら、Ｊ． Ｎｕｃｌ． Ｍｅｄ． ２４：３１６−３２５ （１９８３））。
【０１２６】
本発明の抗体は、本発明のＤＲ５免疫原を使用する、任意の種々の標準的な方法によって調製され得る。示されるように、このようなＤＲ５免疫原には、全長ＤＲ５ポリペプチド（これはリーダー配列を含み得るか、または含まなくてもよい）およびＤＲ５ポリペプチドフラグメント（例えば、リガンド結合ドメイン、膜貫通ドメイン、細胞内ドメイン、および死ドメイン）が含まれる。
【０１２７】
本発明の抗体は、本発明のポリペプチド配列の位置および活性に関して、当該分野で公知の方法（例えば、これらのポリペプチドを画像化するため、適切な生理学的サンプルにおけるそのレベルを測定するためなど）において使用され得る。抗体はまた、ＤＲ５のアゴニストおよびアンタゴニストとして、イムノアッセイおよび治療法における使用もまた有する。
【０１２８】
ＤＲ５ドメインを結合するタンパク質および他の化合物もまた、本発明の候補アゴニストおよびアンタゴニストである。このような結合化合物は、酵母ツーハイブリッド系を使用して「捕獲」され得る（ＦｉｅｌｄｓおよびＳｏｎｇ， Ｎａｔｕｒｅ ３４０：２４５−２４６ （１９８９））。酵母ツーハイブリッド系の改変バージョンは、Ｒｏｇｅｒ Ｂｒｅｎｔおよび共同研究者らによって記載されている（Ｇｙｕｒｉｓ， Ｊ．ら、Ｃｅｌｌ ７５：７９１−８０３ （１９９３）； Ｚｅｒｖｏｓ， Ａ．Ｓ．ら、Ｃｅｌｌ ７２：２２３−２３２ （１９９３））。好ましくは、酵母ツーハイブリッド系は、ＤＲ５リガンド結合ドメインまたはＤＲ５細胞内ドメインのいずれかに結合する化合物を捕獲するために、本発明に従って使用される。このような化合物は、本発明の良い候補アゴニストおよびアンタゴニストである。
【０１２９】
「ＴＮＦ−ファミリーリガンド」によって、ＴＮＦレセプターファミリーのメンバーに結合し得る、天然に存在するリガンド、組換えリガンド、および合成リガンドが意図され、これは、リガンド／レセプターシグナリング経路を誘導し得る。ＴＮＦリガンドファミリーのメンバーには、ＤＲ５リガンド、ＴＲＡＩＬ、ＴＮＦ−α、リンホトキシン−α（ＬＴ−α、ＴＮＦ−βとしても公知である）、ＬＴ−β（複合体へテロトリマーＬＴ−α２−βに見出される）、ＦａｓＬ、ＣＤ４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、および神経成長因子（ＮＧＦ）が含まれるが、これらに限定されない。ＤＲ５およびその誘導体（フラグメントを含む）ならびにそのアナログのＴＲＡＩＬに結合する能力を決定するために行われ得るアッセイの例は、以下の実施例６に記載される。
【０１３０】
本発明の例示的な治療適用は、以下でより詳細に議論される。ＡＩＤＳを規定する免疫不全の状態は、二次的にＣＤ４^＋ Ｔリンパ球の数および機能を低減させる。最近の報告は、３．５×１０^７細胞と２×１０^９細胞との間にあるＣＤ４^＋ Ｔ細胞の日毎の減少を評価する（Ｗｅｉ Ｘ．ら、Ｎａｔｕｒｅ ３７３：１１７−１２２（１９９５））。ＨＩＶ感染の設定におけるＣＤ４^＋ Ｔ細胞減少の１つの原因は、ＨＩＶ誘導性アポトーシスであると考えられている。実際、ＨＩＶ誘導性アポトーシス細胞死は、インビトロだけでなく、より重要なことに、感染した個体においても実証されている（Ａｍｅｉｓｅｎ，Ｊ．Ｃ．， ＡＩＤＳ ８：１１９７−１２１３ （１９９４）；Ｆｉｎｋｅｌ， Ｔ．Ｈ．、およびＢａｎｄａ， Ｎ．Ｋ．， Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ， Ｉｍｍｕｎｏｌ． ６：６０５−６１５ （１９９５）；Ｍｕｒｏ−Ｃａｃｈｏ， Ｃ．Ａ．ら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ． １５４：５５５５−５５６６ （１９９５））。さらに、アポトーシスおよびＣＤ４^＋ Ｔリンパ球減少は、ＡＩＤＳの種々の動物モデルにおいて密接に関連しており（Ｂｒｕｎｎｅｒ， Ｔ．ら、Ｎａｔｕｒｅ ３７３：４４１−４４４ （１９９５）；Ｇｏｕｇｅｏｎ， Ｍ．Ｌ．ら、ＡＩＤＳ Ｒｅｓ． Ｈｕｍ， Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ ９： ５５３−５６３ （１９９３））、そして、アポトーシスは、ウイルス複製がＡＩＤＳを生じない動物モデルにおいては観察されない（Ｇｏｕｇｅｏｎ， Ｍ．Ｌ．ら、ＡＩＤＳ Ｒｅｓ． Ｈｕｍ． Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ ９：５５３−５６３ （１９９３））。さらなるデータは、ＨＩＶ感染個体からの、感染されていないが初回刺激されたまたは活性化されたＴリンパ球が、ＴＮＦファミリーリガンドＦａｓＬに遭遇した後、アポトーシスを受けることを示す。ＨＩＶ感染の後、死を生じる単球細胞株を使用することによって、ＨＩＶでのＵ９３７細胞の感染がＦａｓＬの新規の発現を生じ、そしてそのＦａｓＬがＨＩＶ誘導性アポトーシスを媒介することを示されている（Ｂａｄｌｅｙ， Ａ．Ｄ．ら、Ｊ．Ｖｉｒｏｌ． ７０：１９９−２０６（１９９６））。さらに、ＴＮＦファミリーリガンドは、非感染性マクロファージにおいて検出可能であり、そしてその発現は、非感染ＣＤ４ Ｔリンパ球の選択的な殺傷を生じるＨＩＶ感染後、アップレギュレートされた（Ｂａｄｌｅｙ， Ａ．Ｄ．ら、Ｊ．Ｖｉｒｏｌ． ７０：１９９−２０６（１９９６））。従って、本発明によって、ＨＩＶ^＋個体を処置する方法が提供され、これは、本発明のアンタゴニストを投与して、ＣＤ４ Ｔリンパ球の選択的な殺傷を減少させる工程を包含する。投与および投薬量の態様は、以下で詳細に議論される。
【０１３１】
同種移植片拒絶において、レシピエント動物の免疫系は、前もって応答に対して初回刺激されていない。なぜなら、ほとんどの部分の免疫系は、環境抗原によってのみ初回刺激されるからである。同じ種の他のメンバーからの組織は同じ様式では提示されていない（例えば、ウイルスおよび細菌は提示されている）。同種移植片拒絶の場合、免疫抑制レジメは、免疫系がエフェクター段階に及ばないように予防するように設計される。しかし、異種移植片拒絶の免疫プロフィールは、同種移植片拒絶よりも疾患再発に類似し得る。疾患再発の場合、免疫系は、ネイティブな島細胞の破壊によって示されるように、すでに活性化されている。それゆえ、疾患再発において、免疫系は、すでにエフェクター段階である。本発明のアゴニストは、同種移植片および異種移植片の両方に対して免疫応答を抑制し得る。なぜなら、活性化され、そしてエフェクター細胞に分化されるリンパ球はＤＲ５ポリペプチドを発現し、それによって、アポトーシスを増強する化合物の影響を受けやすいからである。従って、本発明は、さらに、免疫特権（ｐｒｉｖｉｌｅｇｅｄ）組織を作成する方法を提供する。
【０１３２】
ＤＲ５アンタゴニストは、炎症性疾患（例えば、リウマチ様関節炎、骨関節炎、乾癬、敗血症、および炎症性腸疾患）の処置に有用であり得る。
【０１３３】
さらに、ＤＲ５のリンパ芽球発現に起因して、可溶性ＤＲ５アゴニストまたはアンタゴニストのｍＡＢは、この形態のガンを処置するために使用され得る。さらに、可溶性ＤＲ５または中和性ｍＡＢは、種々の慢性および急性形態の炎症（例えば、リウマチ様関節炎、骨関節炎、乾癬、敗血症、および炎症性腸疾患）を処置するために使用され得る。
【０１３４】
投与の様態
本明細書中に記載されるアゴニストまたはアンタゴニストは、インビトロ、エキソビボ、またはインビボで、本発明のレセプターを発現する細胞に投与され得る。アゴニストまたはアンタゴニストの「有効量」の投与によって、ＴＮＦファミリーリガンドに対する細胞性応答を増強または阻害するに十分な化合物（ポリペプチドを含む）の量が意図される。詳細には、アゴニストまたはアンタゴニストの「有効量」の投与によって、ＤＲ５媒介性アポトーシスを増強または阻害するに有効な量が意図される。もちろん、アポトーシスが増強されることが所望される場合、本発明のアゴニストは、ＴＮＦファミリーリガンドとともに同時投与され得る。当業者は、アゴニストまたはアンタゴニストの有効量が経験的に決定され得、そして純粋な形態または薬学的に受容可能な塩、エステル、またはプロドラッグの形態で使用され得ることを理解する。アゴニストまたはアンタゴニストは、１つ以上の薬学的に受容可能な賦形剤（すなわち、キャリア）と組み合わせて、組成物において投与され得る。
【０１３５】
ヒト患者に投与される場合、本発明の化合物および組成物の日毎の全使用量は、有効な医学的判断の範囲内で担当医によって決定されることが理解される。任意の特定の患者についての特定の治療有効用量レベルは、医学分野において周知の因子に基づく。
【０１３６】
一般的な定義として、用量あたり非経口的に投与されるＤＲ５ポリペプチドの全薬学的有効量は、患者の体重あたり、約１μｇ／ｋｇ／日〜１０ｍｇ／ｋｇ／日の範囲でありるが、上記のように、これは治療的な決定の問題である。より好ましくは、この用量は、ホルモンについて、少なくとも０．０１ｍｇ／ｋｇ／日であり、そしてヒトについて最も好ましくは約０．０１と１ｍｇ／ｋｇ／日との間である。連続的に与えられる場合、ＤＲ５アゴニストまたはアンタゴニストは、代表的には、約１μｇ／ｋｇ／時間〜約５０μｇ／ｋｇ／時間の投薬速度で、例えば、ミニポンプを使用して、１〜４注入／日か、または連続的な皮下注入のいずれかによって投与される。静脈内バッグ（ｉｎｔｒａｖｅｎｏｕｓ ｂａｇ）溶液もまた使用され得る。
【０１３７】
投薬はまた、ＲＩＡ技術によって決定されるように、患者特異的様式で設定され、予め決定された濃度のアゴニストまたはアンタゴニストを血液に提供し得る。従って、患者投薬は、ＲＩＡによって測定される場合、５０〜１０００ｎｇ／ｍｌ、好ましくはほぼ１５０から５００ｎｇ／ｍｌで、血液レベルを通して継続的な進行を達成するように調製され得る。
【０１３８】
アゴニストまたはアンタゴニスト（本発明のＤＲ５ポリヌクレオチドおよびポリペプチドを含む）および薬学的に受容可能なキャリアまたは賦形剤を含む薬学的組成物が提供され、これらは、経口的に、直腸に、非経口的に、槽内に、膣内に、腹腔内に、局所的に（粉末、軟膏、ドロップ、または経皮パッチによるように）、頬内または経口スプレーもしくは経鼻スプレーとして投与され得る。重要なことに、アゴニストおよびＴＮＦ−ファミリーリガンドの同時投与によって臨床的副作用は、より低い容量の、リガンドおよびアゴニストの両方を使用することによって低減され得る。アゴニストは、特定の治療適用の緊急性に依存して、ＴＮＦ−ファミリーリガンドの前、後、または同時のいずれかで「同時投与され」得ることが理解される。「薬学的に受容可能なキャリア」は、非毒性固体、半固体または液体賦形剤、希釈剤、カプセル用材料、または任意の型の処方補助物を意味する。特定の実施態様において、「薬学的に受容可能な」とは、連邦政府、または合衆国、または米国薬局方に列挙される管理局、または動物（より特には、ヒト）における使用のための他の一般に認識される薬局方によって認可されることを意味する。本態様に従う適切な薬学的キャリアの非限定的な例は、Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎによる「Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ」に提供され、そしてこれには、水および油（石油、動物、野菜または合成起源の油、例えば、落花生油、大豆油、鉱油、ゴマ油などを含む）のような滅菌液が含まれる。水は、薬学的組成物が静脈内に投与される場合、好ましいキャリアである。生理食塩水溶液および水性デキストロースおよびグリセロール溶液が、特に注入可能な溶液のために液体キャリアとして使用され得る。
【０１３９】
本明細書で使用される用語「非経口」とは、静脈内、筋肉内、腹腔内、胸骨下（ｉｎｔｒａｓｔｅｒｎａｌ）、皮下、および関節内注射および注入を包含する、投与様態をいう。
【０１４０】
非経口注入のための本発明の薬学的組成物は、薬学的に受容可能な滅菌溶液または非水性溶液、分散液、懸濁液、またはエマルジョン、ならびに使用直前に滅菌注射用溶液または分散液へ再構成するための滅菌粉末が含まれ得る。
【０１４１】
界面活性剤（例えば、ＣＨＡＰＳまたはＮＲ−４０）を緩衝液とともに含むことによって適切に可溶化される場合、可溶性ＤＲ５ポリペプチドに加えて、膜貫通領域を含むＤＲ５ポリペプチドもまた使用され得る。
【０１４２】
染色体アッセイ
本発明の核酸分子はまた、染色体同定に有用である。この配列は、個々のヒト染色体における特定の位置に特異的に標的化され、そしてハイブリダイズし得る。本発明による染色体へのＤＮＡのマッピングは、それらの配列を、疾患に関連した遺伝子と相関づけるのに重要な第一歩である。
【０１４３】
これに関して特定の好ましい実施態様では、本明細書中で開示されるｃＤＮＡおよび／またはポリヌクレオチドは、ＤＲ５遺伝子のゲノムＤＮＡをクローニングするために用いられる。これは、一般的に市販されている、種々の周知の技術およびライブラリーを用いて達成され得る。次いで、この目的のために周知の技術を用いるインサイチュ染色体マッピングのためにゲノムＤＮＡが使用される。
【０１４４】
さらに、配列は、ｃＤＮＡからＰＣＲプライマー（好ましくは、１５〜２５ｂｐ）を調製することにより、染色体にマッピングされ得る。遺伝子の３’非翻訳領域のコンピューター分析を用いて、ゲノムＤＮＡにおいて１つを超えるエキソンにまたがらない従って、増幅プロセスを複雑化する、プライマーを迅速に選択する。次いで、これらのプライマーは、個々のヒト染色体を含有する体細胞ハイブリッドのＰＣＲスクリーニングのために用いられる。
【０１４５】
中期染色体スプレッド（ｓｐｒｅａｄ）へのｃＤＮＡクローンの蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（「ＦＩＳＨ」）は、一工程で、正確な染色体位置を提供するために用いられ得る。この技術は、５０または６０ｂｐ程度の短さのｃＤＮＡを用いて行われ得る。この技術の概説については、Ｖｅｒｍａら、Ｈｕｍａｎ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ： ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｂａｓｉｃ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ， Ｐｅｒｇａｍｏｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ （１９８８）を参照のこと。
【０１４６】
一旦、配列が正確な染色体位置にマッピングされると、染色体上の配列の物理学的な位置が、遺伝子マップデータと相関づけられ得る。このようなデータは、例えば、Ｖ． ＭｃＫｕｓｉｃｋ， Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ Ｉｎ Ｍａｎ（Ｊｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉｎｓ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ， Ｗｅｌｃｈ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｌｉｂｒａｒｙからオンラインで入手可能である）に見出される。次いで、同じ染色体領域にマッピングされた遺伝子と疾患との間の関係が、連鎖分析（物理学的に隣接した遺伝子の同時遺伝）によって同定される。
【０１４７】
次に、罹患個体と非罹患個体との間でのｃＤＮＡまたはゲノム配列における差異を決定することが必要である。変異が罹患個体のいくらかまたは全てにおいて認められるが、いずれの正常個体でも認められない場合、従って、この変異は、おそらく疾患の原因因子である。
【０１４８】
本発明に一般的に記載されるように、以下の実施例を参照することにより、本発明は、より迅速に理解されるが、以下の実施例は、例示の目的で提供され、限定は意図されない。
【実施例】
【０１４９】
（実施例１）
Ｅ．ｃｏｌｉにおける発現および精製
寄託されたｃＤＮＡクローン（ＡＴＣＣ番号９７９２０）における成熟ＤＲ５タンパク質をコードするＤＮＡ配列を、ＤＲ５タンパク質のアミノ末端配列および遺伝子の３’側のベクター配列に特異的なＰＣＲオリゴヌクレオチドプライマーを使用して増幅する。クローニングを容易にする制限部位を含むさらなるヌクレオチドを、それぞれ５’および３’配列に付加する。
【０１５０】
Ｅ．ｃｏｌｉにおけるＤＲ５細胞外ドメインの発現のために、以下のプライマーを使用する：５’プライマーは、５’− ＣＧＣＣＣＡＴＧＧＡＧＴＣＴ ＧＣＴＣＴＧＡＴＣＡＣ −３’（配列番号８）の配列を有し、下線を付したＮｃｏＩ部位を含み；そして３’プライマーは、５’− ＣＧＣＡＡＧＣＴＴＴＴＡＧＣＣＴＧＡＴＴＣ ＴＴＴＧＴＧＧＡＣ −３’（配列番号９）の配列を有し、そして下線を付したＨｉｎｄＩＩＩ部位を含む。
【０１５１】
制限部位は、細菌性発現ベクターｐＱＥ６０における制限酵素部位に都合が良い。これを、本実施例の細菌性発現のために使用する（Ｑｉａｇｅｎ， Ｉｎｃ．，９２５９ Ｅｔｏｎ Ａｖｅｎｕｅ， Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ， ＣＡ， ９１３１１）。ｐＱＥ６０はアンピシリン抗生物質耐性（「Ａｍｐ^ｒ」）をコードし、そして細菌の複製起点（「ｏｒｉ」）、ＩＰＴＧ誘導性プロモーター、およびリボソーム結合部位（「ＲＢＳ」）を含む。
【０１５２】
増幅されたＤＲ５ ＤＮＡおよびベクターｐＱＥ６０の両方を、ＮｃｏＩおよびＨｉｎｄＩＩＩで消化し、そして消化されたＤＮＡを、次いで互いに連結する。制限化されたｐＱＥ６０ベクターへＤＲ５タンパク質ＤＮＡを挿入することによって、ＤＲ５タンパク質コード領域をベクターのＩＰＴＧ誘導性プロモーターの下流に配置し、そして作動可能にこのプロモーターおよびＤＲ５タンパク質の翻訳に適切に位置付けられた開始ＡＵＧとインフレームで連結する。
【０１５３】
連結混合物を、標準的な手順を用いて、コンピテントなＥ．ｃｏｌｉ細胞に形質転換する。このような手順は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第２版；Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ， Ｎ．Ｙ． （１９８９）に記載される。プラスミドｐＲＥＰ４の複数のコピー（これは、ｌａｃリプレッサーを発現し、そしてカナマイシン耐性（「Ｋａｎ^ｒ」）を付与する）を含有するＥ．ｃｏｌｉ株Ｍ１５／ｒｅｐ４を本明細書中に記載の例示的実施例を行うにあたって使用する。この株（これは、ＤＲ５タンパク質を発現するのに適切である多くの株の内の単に一つの株である）は、Ｑｉａｇｅｎ，（前出）から市販されている。
【０１５４】
形質転換体を、アンピシリンおよびカナマイシンの存在下でＬＢプレート上で増殖するそれらの能力により同定する。プラスミドＤＮＡを耐性コロニーから単離し、そしてクローン化ＤＮＡの同定を、制限分析、ＰＣＲ、およびＤＮＡ配列決定により確認する。
【０１５５】
所望の構築物を含むクローンを、アンピシリン（１００μｇ／ｍｌ）およびカナマイシン（２５μｇ／ｍｌ）の両方を補充したＬＢ培地における液体培養中で一晩（「Ｏ／Ｎ」）増殖させる。Ｏ／Ｎ培養物を用いて約１：１００〜１：２５０の希釈で大規模培養に接種する。細胞を、０．４と０．６との間の、６００ｎｍでの光学密度（「ＯＤ６００」）にまで増殖させる。次いで、イソプロピル−Ｂ−Ｄ−チオガラクトピラノシド（「ＩＰＴＧ」）を最終濃度１ｍＭまで加えて、ｌａｃＩリプレッサーを不活化することにより、ｌａｃリプレッサー感受性プロモーターからの転写を誘導する。細胞をさらに３〜４時間引き続きインキュベートする。
【０１５６】
次いで、標準的な方法によって、細胞を遠心分離により採集し、そして破壊する。封入体を日常的な回収技術を使用して破壊細胞から精製し、そしてタンパク質を封入体から８Ｍの尿素中へ可溶化する。可溶性タンパク質を含む８Ｍ尿素溶液を、２×リン酸緩衝化生理食塩水（「ＰＢＳ」）中のＰＤ−１０カラムに通し、それによって尿素を除去し、緩衝液を交換し、そしてタンパク質を再折りたたみさせる。タンパク質を、エンドトキシンを除去するために、さらなるクロマトグラフィー工程によって精製する。次いで、それを滅菌ろ過する。滅菌ろ過タンパク質調製物を、９５μ／ｍｌの濃度で２×ＰＢＳ中に保存する。
【０１５７】
（実施例２）
哺乳動物細胞における発現
代表的な哺乳動物発現ベクターは、プロモーターエレメント（ｍＲＮＡの転写の開始を媒介する）、タンパク質コード配列、ならびに転写の終結および転写物のポリアデニル化に必要なシグナルを含む。さらなるエレメントとしては、エンハンサー、Ｋｏｚａｋ配列、ならびにＲＮＡスプライシングのためのドナー部位およびアクセプター部位に隣接する介在配列が挙げられる。非常に効率的な転写を、ＳＶ４０由来の初期および後期プロモーター、レトロウイルス（例えば、ＲＳＶ、ＨＴＬＶＩ、ＨＩＶＩ）由来の長末端反復（ＬＴＲ）ならびにサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）の初期プロモーターを用いて達成し得る。しかし、細胞性シグナル（例えば、ヒトアクチンプロモーター）もまた使用され得る。本発明の実施における使用に適切な発現ベクターとしては、例えば、ｐＳＶＬおよびｐＭＳＧ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ， Ｕｐｐｓａｌａ， Ｓｗｅｄｅｎ）、ｐＲＳＶｃａｔ（ＡＴＣＣ ３７１５２）、ｐＳＶ２ｄｈｆｒ（ＡＴＣＣ ３７１４６）、ならびにｐＢＣ１２ＭＩ（ＡＴＣＣ ６７１０９）のようなベクターが挙げられる。使用され得る哺乳動物宿主細胞としては、ヒトＨｅｌａ２９３細胞、Ｈ９細胞およびＪｕｒｋａｔ細胞、マウスＮＩＨ３Ｔ３細胞およびＣ１２７細胞、Ｃｏｓ１細胞、Ｃｏｓ７細胞およびＣＶ１細胞、ウズラＱＣ１−３細胞、マウスＬ細胞、ならびにチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞が挙げられる。
【０１５８】
あるいは、目的の遺伝子は、染色体に組み込まれたその遺伝子を含む安定な細胞株において発現され得る。選択マーカー（例えば、ｄｈｆｒ、ｇｐｔ、ネオマイシン、ハイグロマイシン）との同時トランスフェクションは、トランスフェクトされた細胞の同定および単離を可能にする。
【０１５９】
トランスフェクトされた遺伝子もまた増幅され、大量のコードされたタンパク質を発現し得る。ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ ＤＨＦＲ ）マーカーは、目的の遺伝子の数百または数千ものコピーを有する細胞株を開発するのに有用である。別の有用な選択マーカーは、酵素グルタミンシンターゼ（ＧＳ）である（Ｍｕｒｐｈｙら、Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ． ２２７：２７７−２７９（１９９１）；Ｂｅｂｂｉｎｇｔｏｎら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：１６９−１７５（１９９２））。これらのマーカーを使用して、哺乳動物細胞を選択培地において増殖させ、そして最も高い耐性を有する細胞を選択する。これらの細胞株は、染色体に組み込まれた増幅された遺伝子を含む。チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞は、タンパク質の産生にしばしば使用される。
【０１６０】
発現ベクターｐＣ１およびｐＣ４は、ラウス肉腫ウイルスの強力なプロモーター（ＬＴＲ）（Ｃｕｌｌｅｎら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ５： ４３８−４４７（１９８５年３月））およびＣＭＶ−エンハンサーのフラグメント（Ｂｏｓｈａｒｔら、Ｃｅｌｌ ４１：５２１−５３０（１９８５））を含む。複数のクローニング部位（例えば、制限酵素切断部位ＢａｍＨＩ、ＸｂａＩ、およびＡｓｐ７１８を有する）は、目的の遺伝子のクローニングを容易にする。ベクターはさらに、ラットプレプロインシュリン遺伝子の３’イントロン、ポリアデニル化、および終結シグナルを含む。
【０１６１】
クローニングおよびＣＨＯ細胞における発現
ベクターｐＣ４を、ＤＲ５ポリペプチドの発現のために使用する。プラスミドｐＣ４は、プラスミドｐＳＶ２−ｄｈｆｒ（ＡＴＣＣ受託番号３７１４６）の誘導体である。このプラスミドは、ＳＶ４０初期プロモーターの制御下で、マウスＤＨＦＲ遺伝子を含む。これらのプラスミドでトランスフェクトされるジヒドロ葉酸活性を欠如するチャイニーズハムスター卵巣細胞または他の細胞は、化学治療剤メトトレキサート（ＭＴＸ）を補充した選択培地（αマイナスＭＥＭ、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）中で細胞を増殖させることによって選択され得る。メトトレキサート（ＭＴＸ）に耐性である細胞におけるＤＨＦＲ遺伝子の増幅は、よく考証されている（例えば、Ａｌｔ， Ｆ．Ｗ．， Ｋｅｌｌｅｍｓ， Ｒ．Ｍ．， Ｂｅｒｔｉｎｏ， Ｊ．Ｒ．およびＳｃｈｉｍｋｅ， Ｒ．Ｔ．， Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２５３：１３５７−１３７０（１９７８）Ｈａｍｌｉｎ， Ｊ．Ｌ．およびＭａ， Ｃ．， Ｂｉｏｃｈｅｍ． ｅｔ Ｂｉｏｐｈｙｓ． Ａｃｔａ， １０９７：１０７−１４３（１９９０）Ｐａｇｅ， Ｍ．Ｊ．およびＳｙｄｅｎｈａｍ， Ｍ．Ａ． １９９１， Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：６４−６８（１９９１）を参照のこと）。漸増濃度のＭＴＸにおける細胞増殖は、ＤＨＦＲ遺伝子の増幅の結果として、標的酵素ＤＨＦＲを過剰産生することによって薬物への耐性を生じる。第２の遺伝子がＤＨＦＲ遺伝子に連結される場合、通常、同時増幅され、そして過剰発現される。増幅した遺伝子の１，０００を超えるコピーを有する細胞株を開発するためにこのアプローチを使用し得ることは、当該分野において公知である。続いて、メトトレキサートが取り除かれる場合、宿主細胞の１つ以上の染色体に組み込まれた増幅遺伝子を含む細胞株が得られる。
【０１６２】
プラスミドｐＣ４は、目的の遺伝子の発現のために、ラウス肉腫ウイルスの長末端反復（ＬＴＲ）の強力なプロモーター（Ｃｕｌｌｅｎら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ５：４３８−４４７ （１９８５年３月））、およびヒトサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）の前初期遺伝子のエンハンサーから単離されたフラグメント（Ｂｏｓｈａｒｔら、Ｃｅｌｌ ４１：５２１−５３０ （１９８５））を含む。プロモーターの下流には、遺伝子の組み込みを可能にする以下の単一の制限酵素切断部位、ＢａｍＨＩ、ＸｂａＩおよびＡｓｐ７１８が存在する。これらのクローニング部位の後ろに、プラスミドは、ラットプレプロインスリン遺伝子の３’イントロンおよびポリアデニル化部位を含む。他の高効率プロモーターもまた、発現のために使用され得る（例えば、ヒトβアクチンプロモーター、ＳＶ４０初期もしくは後期プロモーター、または他のレトロウイルス（例えば、ＨＩＶおよびＨＴＬＶＩ）由来の長末端反復）。ＣｌｏｎｔｅｃｈのＴｅｔ−ＯｆｆおよびＴｅｔ−Ｏｎ遺伝子発現系ならびに同様の系は、哺乳動物細胞において調節された方法でＤＲ５ポリペプチドを発現するために使用され得る（Ｇｏｓｓｅｎ， Ｍ．， およびＢｕｊａｒｄ， Ｈ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８９： ５５４７−５５５１（１９９２））。ｍＲＮＡのポリアデニル化のために、他のシグナル（例えば、ヒト成長ホルモン由来またはグロビン遺伝子由来）も同様に使用され得る。
【０１６３】
染色体に組み込まれた目的の遺伝子を保有する安定な細胞株もまた、選択マーカー（例えば、ｇｐｔ、Ｇ４１８、またはヒグロマイシン）と同時トランスフェクションする際に選択し得る。開始時に１つより多い選択マーカー（例えば、Ｇ４１８およびメトトレキサート）を使用することは有利である。
【０１６４】
プラスミドｐＣ４を制限酵素ＢａｍＨＩで消化し、次いでウシ腸ホスフェートを使用して、当該分野で公知の手順により脱リン酸化する。次いで、ベクターを１％アガロースゲルから単離する。
【０１６５】
完全なポリぺプチドをコードするＤＮＡ配列を、遺伝子の所望の部分の５’および３’配列に対応するＰＣＲオリゴヌクレオチドプライマーを使用して増幅する。下線を付したＢａｍＨＩ部位、Ｋｏｚａｋ配列、およびＡＵＧ開始コドンを含む５’プライマーは、以下の配列を有する：
５’−ＣＧＣＧＧＡＴＣＣＧＣＣＡＴＣＡＴＧＧＡＡＣＡＡＣＧＧＧＧＡＣＡＧＡＡＣ−３’（配列番号１０）。
下線を付したＡｓｐ７１８部位を含む３’プライマーは、以下の配列を有する：５’−ＣＧＣＧＧＴＡＣＣＴＴＡＧＧＡＣＡＴＧＧＣＡＧＡＧＴＣ−３’（配列番号１１）。
【０１６６】
増幅されたフラグメントを、エンドヌクレアーゼＢａｍＨＩおよびＡｓｐ７１８で消化し、次いで、１％アガロースゲル上で再び精製する。次いで、単離したフラグメントおよび脱リン酸化したベクターを、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼで連結する。次いで、Ｅ．ｃｏｌｉ ＨＢ１０１またはＸＬ−１ Ｂｌｕｅ細胞を形質転換し、そしてプラスミドｐＣ４に挿入したフラグメントを含有する細菌を、例えば、制限酵素分析を使用して同定する。
【０１６７】
活性ＤＨＦＲ遺伝子を欠損するチャイニーズハムスター卵巣細胞をトランスフェクションのために使用する。５μｇの発現プラスミドｐＣ４を、リポフェクチン法（Ｆｅｌｇｎｅｒら、前出）を使用して、０．５μｇのプラスミドｐＳＶｎｅｏと同時トランスフェクトする。プラスミドｐＳＶ２−ｎｅｏは、優性選択マーカー（Ｇ４１８を含む一群の抗生物質に対する耐性を付与する酵素をコードするＴｎ５由来のｎｅｏ遺伝子）を含む。細胞を、１ｍｇ／ｍｌのＧ４１８を補充したαマイナスＭＥＭに播種する。２日後、細胞をトリプシン処理し、そして１０、２５、または５０ｎｇ／ｍｌのメトトレキサートおよび１ｍｇ／ｍｌ Ｇ４１８を補充したαマイナスＭＥＭ中のハイブリドーマクローニングプレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ， Ｇｅｒｍａｎｙ）に播種する。約１０〜１４日後、単一のクローンをトリプシン処理し、次いで異なる濃度のメトトレキサート（５０ｎＭ、１００ｎＭ、２００ｎＭ、４００ｎＭ、８００ｎＭ）を用いて、６ウェルペトリ皿または１０ｍｌフラスコに播種する。次いで、最高濃度のメトトレキサートで増殖するクローンを、さらに高濃度のメトトレキサート（１μＭ、２μＭ、５μＭ、１０ｍＭ、２０ｍＭ）を含む新たな６ウェルプレートに移す。同じ手順を、１００〜２００μＭの濃度で増殖するクローンが得られるまで繰り返す。所望の遺伝子産物の発現を、例えば、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびウェスタンブロットによって、または逆相ＨＰＬＣ分析によって分析する。
【０１６８】
ＣＯＳ細胞でのクローニングおよび発現
発現プラスミドｐＤＲ５−ＨＡを、ＤＲ５タンパク質の可溶性細胞外ドメインをコードするｃＤＮＡを、発現ベクターｐｃＤＮＡＩ／ＡｍｐまたはｐｃＤＮＡＩＩＩ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｉｎｃ．から入手可能）中にクローニングすることにより作製する。発現ベクターｐｃＤＮＡＩ／ａｍｐは以下を含む：（１）Ｅ．ｃｏｌｉおよび他の原核生物細胞での増殖に有効なＥ．ｃｏｌｉ複製起点；（２）プラスミド含有原核生物細胞の選択のためのアンピシリン耐性遺伝子；（３）真核生物細胞での増殖のためのＳＶ４０複製起点；（４）ｃＤＮＡが都合良くＣＭＶプロモーターの発現制御下に置かれ、そしてポリリンカー中の制限部位によりＳＶ４０イントロンおよびポリアデニル化シグナルに作動可能に連結し得るように配置された、ＣＭＶプロモーター、ポリリンカー、ＳＶ４０、およびポリアデニル化シグナル。その３’末端にインフレームで融合したＤＲ５ポリぺプチドの細胞外ドメインおよびＨＡタグをコードするＤＮＡフラグメントを、組換えタンパク質発現がＣＭＶプロモーターによって指向されるように、ベクターのポリリンカー領域にクローニングする。ＨＡタグは、Ｗｉｌｓｏｎら、Ｃｅｌｌ ３７：７６７ （１９８４）により記載されるインフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する。標的タンパク質へのＨＡタグの融合により、ＨＡエピトープを認識する抗体を有する組換えタンパク質の検出と回収が容易になる。
【０１６９】
プラスミド構築ストラテジーは、以下の通りである。寄託クローンのＤＲ５ ｃＤＮＡを、Ｅ．ｃｏｌｉでのＤＲ５の発現のためのベクター構築について上で詳しく記載した都合の良い制限部位を含むプライマーを用いて増幅する。発現されたＤＲ５の検出、精製、および特徴付けを容易にするために、プライマーの１つは、上記のように赤血球凝集素タグ（「ＨＡタグ」）を含む。
【０１７０】
好適なプライマーとしては、この実施例で使用される以下のものがあげられる。下線のＢａｍＨＩ部位を含む５’プライマーは、以下の配列を有する：５’−ＣＧＣＧＧＡＴＣＣＧＣＣＡＴＣＡＴＧＧＡＡＣＡＡＣＧＧＧＧＡＣＡＧＡＡＣ−３’（配列番号１０）。下線を付したＡｓｐ７１８制限配列を含む３’プライマーは、以下の配列を有する：５’−ＣＧＣＧＧＴＡＣＣＴＴＡＧＣＣＴＧＡＴＴＣＴＴＴＴＧＧＡＣ−３’（配列番号１２）。
【０１７１】
ＰＣＲ増幅ＤＮＡフラグメント、およびベクター、ｐｃＤＮＡＩ／Ａｍｐを、ＢａｍＨＩおよびＡｓｐ７１８で消化し、次いで連結する。連結混合物を、Ｅ．ｃｏｌｉ株ＳＵＲＥ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｓｙｓｔｅｍｓ、１１０９９ Ｎｏｒｔｈ Ｔｏｒｒｅｙ Ｐｉｎｅｓ Ｒｏａｄ，Ｌａ Ｊｏｌｌａ，ＣＡ ９２０３７から入手可能）に形質転換し、形質転換した培養物をアンピシリン培地プレートにプレートし、次いでこれをインキュベートしてアンピシリン耐性コロニーを増殖させる。プラスミドＤＮＡを耐性コロニーから単離し、そして制限分析またはその他の手段により、ＤＲ５ポリぺプチドの細胞外ドメインをコードするフラグメントの存在について試験する。
【０１７２】
組換えＤＲ５の発現のために、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８９）に記載されるように、ＤＥＡＥ−ＤＥＸＴＲＡＮを用いて、上述のように、ＣＯＳ細胞を発現ベクターでトランスフェクトする。細胞を、このベクターによるＤＲ５の発現の条件下でインキュベートする。
【０１７３】
ＤＲ５−ＨＡ融合タンパク質の発現を、例えば、Ｈａｒｌｏｗら、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第２版、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８８）に記載の方法を用いて、放射標識および免疫沈降法により検出する。この目的のため、トランスフェクションの２日後、細胞を^３５Ｓ−システイン含有培地で８時間インキュベートすることにより標識する。上述のＷｉｌｓｏｎらにより記載されるように、細胞および培地を回収し、そして細胞を洗浄し、そして界面活性剤含有ＲＩＰＡ緩衝液：１５０ｍＭ ＮａＣｌ、１％ＮＰ−４０、０．１％ＳＤＳ、１％ ＮＰ−４０、０．５％ＤＯＣ、５０ｍＭ ＴＲＩＳ、ｐＨ７．５で溶解する。タンパク質を、ＨＡ特異的モノクロナール抗体を用い、細胞溶解物および培養培地から沈殿させる。次いで、沈殿させたタンパク質を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびオートラジオグラフィーにより分析する。期待されるサイズの発現産物は細胞溶解物中に見いだされ、ネガティブコントロールには見いだされない。
【０１７４】
この実施例での発現に使用するプライマーセットは、この実施例でＣＨＯ発現について使用するｐＣ４、この実施例でのＣＯＳ発現についてのｐｃＤＮＡＩ／Ａｍｐ、および以下の実施例でのバキュロウイルス発現について使用するｐＡ２と適合性である。従って、例えば、ＣＨＯ発現について増幅された完全なＤＲ５コードフラグメントはまた、ＣＯＳ発現についてのｐｃＤＮＡＩ／Ａｍｐまたはバキュロウイルス発現についてのｐＡ２に連結され得る。
【０１７５】
（実施例３）
バキュロウイルス発現系におけるＤＲ５の可溶性細胞外ドメインのクローニングおよび発現
この例示的な実施例において、プラスミドシャトルベクターｐＡ２を使用して、完全なタンパク質をコードするクローン化ＤＮＡ（その天然に付随するシグナル配列を含む）を、バキュロウイルスへ挿入し、標準的な方法（例えば、Ｓｕｍｍｅｒｓら、Ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ Ｖｅｃｔｏｒｓ ａｎｄ Ｉｎｓｅｃｔ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｐｒｏｃｅｄｕｒｅｓ， Ｔｅｘａｓ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｓｔａｔｉｏｎ Ｂｕｌｌｅｔｉｎ Ｎｏ． １５５５ （１９８７）に記載される方法）を使用してＤＲ５タンパク質を発現させる。この発現ベクターは、Ａｕｔｏｇｒａｐｈ ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ核多角体病ウイルス（ＡＣＭＮＰＶ）の強力なポリヘドロンプロモーター、続いて都合の良い制限部位を含む。組換えウイルスの平易な選択のために、プラスミドは、同じ方向で、弱いＤｒｏｓｏｐｈｉｌａプロモーターの制御下で、Ｅ．ｃｏｌｉ由来のβガラクトシダーゼ遺伝子、続いて、ポリヘドリン遺伝子のポリアデニル化シグナルを含む。挿入遺伝子は、クローニングされたポリヌクレオチドを発現する生存ウイルスを生成するために、野生型ウイルスのＤＮＡとの細胞媒介性相同組換えのためのウイルス配列を両側に隣接させている。当業者に容易に理解されるように、構築物が転写、翻訳、分泌などのための適切に配置されたシグナル（例えば、インフレームのＡＵＧおよび必要ならばシグナルペプチド）を提供する限り、多くの他のバキュロウイルスベクター（例えば、ｐＡｃ３７３、ｐＶＬ９４１、およびｐＡｃＩＭＩ）が、ｐＡ２の代わりに使用され得る。このようなベクターは、例えば、Ｌｕｃｋｏｗら、Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １７０： ３１−３９ （１９８９）に記載される。
【０１７６】
寄託されたクローン（ＡＴＣＣ番号９７９２０）のＤＲ５タンパク質の可溶性細胞外ドメインをコードするｃＤＮＡ配列を、この遺伝子の５’配列および３’配列に対応するＰＣＲオリゴヌクレオチドプライマーを用いて増幅する。
【０１７７】
ＤＲ５に対する５’プライマーは、下線を付したＢａｍＨＩ制限酵素部位を含む、配列５’ＣＧＣＧＧＡＴＣＣＧＣＣＡＴＣＡＴＧＧＡＡＣＡＡＣＧＧＧＧＡＣＡＧＡＡＣ−３’（配列番号１０）を有する。発現ベクター中に挿入されて、以下に記載のように、ＤＲ５をコードする増幅されたフラグメントの５’末端は、効率的な切断シグナルペプチドを提供する。真核生物細胞における翻訳の開始のための効率的なシグナルは、Ｋｏｚａｋ， Ｍ．， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． １９６：９４７−９５０ （１９８７）に記載されるように、構築物のベクター部分に適切に配置される。
【０１７８】
ＤＲ５についての３’プライマーは、下線を付したＡｓｐ７１８制限、続いて図１中のＤＲ５ヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド、続いて終止コドンを含む配列５’−ＣＧＣＧＧＴＡＣＣＴＴＡＧＣＣＴＧＡＴＴＣＴＴＴＧＴＧＧＡＣ−３’（配列番号１２）を有する。
【０１７９】
増幅されたフラグメントを、市販のキット（「Ｇｅｎｅｃｌｅａｎ」ＢＩＯ １０１ Ｉｎｃ．， Ｌａ Ｊｏｌｌａ， Ｃａ）を用いて１％アガロースゲルから単離する。次いで、このフラグメントを、ＢａｍＨＩおよびＡｓｐ７１８で消化し、そして再度１％アガロースゲル上で精製する。このフラグメントを「Ｆ１」と命名する。
【０１８０】
プラスミドを、制限酵素ＢａｍＨＩおよびＡｓｐ７１８で消化し、そして必要に応じて、当該分野で公知の日常的な手順を用いて、仔ウシ腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化し得る。次いで、このＤＮＡを市販のキット（「Ｇｅｎｅｃｌｅａｎ」ＢＩＯ １０１ Ｉｎｃ．， Ｌａ Ｊｏｌｌａ， Ｃａ．）を用いて１％アガロースゲルから単離する。このベクターＤＮＡを本明細書中で「Ｖ１」と命名する。
【０１８１】
フラグメントＦ１と脱リン酸化プラスミドＶ１とを、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼで連結する。Ｅ．ｃｏｌｉ ＨＢ１０１細胞またはＸＬ−１ Ｂｌｕｅ細胞（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｓｙｓｔｅｍｓ， Ｌａ Ｊｏｌｌａ， ＣＡ）のような他の適切なＥ．ｃｏｌｉ宿主を、連結混合物で形質転換し、そして培養プレートに塗布する。ヒトＤＲ５を有するプラスミドを含む細菌を、ＰＣＲ法を用いて同定する。このＰＣＲ法では、プライマーの一つを用いてその遺伝子を増幅し、そして第２のプライマーは、十分にベクター内に由来し、その結果、ＤＲ５遺伝子フラグメントを含むそれらの細菌コロニーのみがＤＮＡの増幅を示す。クローニングされたフラグメントの配列を、ＤＮＡ配列決定によって確認する。このプラスミドを、本明細書中で、ｐＢａｃ ＤＲ５と命名する。
【０１８２】
５μｇのプラスミドｐＢａｃ ＤＲ５を、Ｆｅｌｇｎｅｒら、Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８４：７４１３−７４１７ （１９８７）によって記載されるリポフェクチン法を用いて、１．０μｇの市販の線状化バキュロウイルスＤＮＡ（「ＢａｃｕｌｏＧｏｌｄ^ＴＭ ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ＤＮＡ」， Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ， Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ， ＣＡ．）とともに同時トランスフェクトする。１μｇのＢａｃｕｌｏＧｏｌｄ^ＴＭウイルスＤＮＡおよび５μｇのプラスミドｐＢａｃ ＤＲ５を、５０μｌの無血清グレース培地（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｉｎｃ．， Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ， ＭＤ）を含むマイクロリッタープレートの無菌ウェル中で混合する。その後、１０μｌのリポフェクチンおよび９０μｌのグレース培地を添加し、混合し、そして室温にて１５分間インキュベートする。次いで、このトランスフェクション混合物を、１ｍｌの無血清グレース培地を有する３５ｍｍ組織培養プレート内に播種されたＳｆ９昆虫細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ １７１１）に滴下する。プレートを、前後に揺らして新たに添加された溶液を混合する。次いで、プレートを２７℃で５時間インキュベートする。５時間後、トランスフェクション溶液をプレートから除去し、そして１０％ウシ胎仔血清を補充した１ｍｌのグレース昆虫培地を添加する。プレートをインキュベーターに戻し、そして培養を２７℃で４日間続ける。
【０１８３】
４日後、上清を回収し、そしてＳｕｍｍｅｒｓおよびＳｍｉｔｈ（前出）に記載されるようにプラークアッセイを行う。「Ｂｌｕｅ Ｇａｌ」（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｉｎｃ．， Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ， ＭＤ）を有するアガロースゲルを、青く染色されたプラークを産生するｇａｌ発現クローンの容易な同定および単離を可能にするために用いる。（このタイプの「プラークアッセイ」の詳細な説明はまた、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｉｎｃ．、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ ，ＭＤによって配布される昆虫細胞培養およびバキュロウイルス学のための使用者ガイド（第９〜１０頁）においても見い出され得る）。適切なインキュベーションの後、青く染色されたプラークを、マイクロピペッター（例えば、エッペンドルフ）のチップで拾う。次いで、組換えウイルスを含む寒天を、２００μｌのグレース培地を含む微小遠心管中に再懸濁する。そして、組換えバキュロウイルスを含む懸濁液を用いて、３５ｍｍディッシュに播種された昆虫Ｓｆ９細胞に感染させる。４日後、これらの培養ディッシュの上清を回収し、次いでそれらを４℃で保存する。この組換えウイルスをＶ−ＤＲ５と称する。
【０１８４】
ＤＲ５遺伝子の発現を確認するために、Ｓｆ９細胞を、１０％熱不活化ＦＢＳを補充したグレース培地中で増殖させる。細胞を、約２（約１〜約３）の感染多重度（「ＭＯＩ」）にて組換えバキュロウイルスＶ−ＤＲ５で感染させる。６時間後、その培地を除去し、そしてメチオニンおよびシステインを除いたＳＦ９００ ＩＩ培地（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｉｎｃ．， Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ， ＭＤから入手可能）に置き換える。放射性標識されたタンパク質が所望される場合、４２時間後、５μＣｉの^３５Ｓ−メチオニンおよび５μＣｉの^３５Ｓ−システイン（Ａｍｅｒｓｈａｍから入手可能）を添加する。細胞をさらに１６時間インキュベートし、次いで細胞を遠心分離により収集する。上清中のタンパク質ならびに細胞内タンパク質をＳＤＳ−ＰＡＧＥ、続いて（放射性標識されていれば）オートラジオグラフィーにより分析する。精製タンパク質のアミノ末端のアミノ酸配列の微小配列決定を用いて、成熟タンパク質のアミノ末端配列を決定し得、従って分泌シグナルペプチドの切断点および長さを決定し得る。
【０１８５】
（実施例４）
ＤＲ５遺伝子発現の組織分布
ヒト組織におけるＤＲ５遺伝子の発現を調べるため、とりわけ上述のＳａｍｂｒｏｏｋらにより記載される方法を使用してノーザンブロット分析を行った。ＤＲ５タンパク質（配列番号１）の全ヌクレオチド配列を含有するｃＤＮＡプローブを、ｒｅｄｉｐｒｉｍｅ^ＴＭＤＮＡ標識システム（Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ）を使用して、製造業者の指示にしたがって^３２Ｐで標識した。標識後、ＣＨＲＯＭＡ ＳＰＩＮ−１００^ＴＭカラム（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．）を用いて、製造元プロトコル番号ＰＴ１２００−１に従ってプローブを精製した。次に、精製標識プローブを、ＤＲ５ ｍＲＮＡについて種々のヒト組織を試験するために使用した。
【０１８６】
種々のヒト組織（Ｈ）またはヒト免疫系組織（ＩＭ）を含むＭｕｌｔｉｐｌｅ Ｔｉｓｓｕｅ Ｎｏｒｔｈｅｒｎ（ＭＴＮ）ブロットをＣｌｏｎｔｅｃｈ（Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ ＣＡ）から入手し、ＥｘｐｒｅｓｓＨｙｂ^ＴＭハイブリダイゼーション溶液（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）を用いて、製造業者のプロトコル番号ＰＴ１１９０−１に従って標識プローブで試験した。ハイブリダイゼーションおよび洗浄の後、ブロットを−７０℃で一晩でフィルムにマウントおよび曝露した。フィルムを標準的な手順に従って感光した。ＤＲ５の発現を、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、子宮、小腸、結腸、末梢血白血球（ＰＢＬ）、リンパ節、骨髄、および胎児肝臓において検出した。
【０１８７】
ＤＲ５の発現をまた、以下のガン細胞株、ＨＬ６０（前骨髄球白血病）、Ｈｅｌａ細胞Ｓ３、Ｋ５６２（慢性骨髄性白血病）、ＭＯＬＴ４（リンパ芽球白血病）、Ｒａｊｉ（バーキットリンパ腫）、ＳＷ４８０（結腸直腸腺ガン）、Ａ５４９（肺ガン）、およびＧ３６１（メラノーマ）においてノーザンブロットによって評価し、そして試験した細胞株の全てにおいて検出した。
【０１８８】
（実施例５）
哺乳動物細胞におけるＤＲ５誘導アポトーシス
Ｆａｓ／ＡＰＯ−１およびＴＮＦＲ−１の哺乳動物細胞における過剰発現は、レセプター活性化を模倣する（Ｍ． Ｍｕｚｉｏら、Ｃｅｌｌ ８５：８１７−８２７ （１９９６）； Ｍ． Ｐ． Ｂｏｌｄｉｎら、Ｃｅｌｌ ８５：８０３−８１５ （１９９６））。従って、この系を、アポトーシスの誘導におけるＤＲ５の機能的役割を研究するために利用する。この実施例は、ＭＣＦ７ヒト乳ガン細胞およびヒト類上皮ガン（Ｈｅｌａ）細胞の両方において、ＤＲ５の過剰発現がアポトーシスを誘導したことを実証する。
【０１８９】
実験の設計
細胞死アッセイを、本質的に以前に記載されるように行った（Ａ．Ｍ． Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎら、Ｃｅｌｌ ８１：５０５−１２ （１９９５）； Ｍ．Ｐ． Ｂｏｌｄｉｎら、Ｊ． Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７０：７７９５−８ （１９９５）； Ｆ．Ｃ． Ｋｉｓｃｈｋｅｌら、ＥＭＢＯ １４：５５７９−５５８８ （１９９５）； Ａ．Ｍ． Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎら、Ｊ Ｂｉｏｌ Ｘｈｅｍ ２７１： ４９６１−４９６５ （１９９６））。簡単には、ＭＣＦ−７ヒト乳ガンクローン細胞株およびＨｅｌａ細胞を、ベクター、ＤＲ５、ＤＲ５D（５２−４１１）、またはＴＮＦＲ−１と、βガラクトシダーゼレポーター構築物と一緒に同時トランスフェクトした。
【０１９０】
ＭＣＦ７およびＨｅｌａ細胞を、リポフェクタミン手順（ＧＩＢＣＯ−ＢＲＬ）を使用して、製造業者の指示に従ってトランスフェクトした。２９３細胞を、ＣａＰＯ_４沈澱を使用してトランスフェクトした。トランスフェクションの２４時間後に、以前に記載のように（Ａ．Ｍ． Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎら、Ｃｅｌｌ ８１：５０５−１２ （１９９５）： Ｍ．Ｐ． Ｂｏｌｄｉｎら、Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７０：７７９５−８ （１９９５）； Ｆ．Ｃ． Ｋｉｓｃｈｋｅｌら、ＥＭＢＯ １４：５５７９−５５８８ （１９９５））、細胞を固定してＸ−Ｇａｌで染色し、そして顕微鏡で観察した。図５に示すデータ（平均±ＳＤ）は、円形のアポトーシス細胞のパーセントを総βガラクトシダーゼポジティブ細胞の関数として表す（ｎ＝３）。ＤＲ５の過剰発現は、ＭＣＦ７（図５Ａ）およびＨｅｌａ細胞（図５Ｂ）の両方においてアポトーシスを誘導した。
【０１９１】
ＭＣＦ７細胞をまた、ｚ−ＶＡＤ−ｆｍｋ（２０μｌ）（Ｅｎｚｙｍｅ Ｓｙｓｔｅｍｓ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ， Ｄｕｂｌｉｎ， ＣＡ）の存在下で、ＤＲ５発現構築物でトランスフェクトするか、または３倍過剰のＣｒｍＡ（Ｍ． Ｔｅｗａｒｉら、Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７０：３２５５−６０ （１９９５））もしくはＦＡＤＤ−ＤＮ発現構築物、もしくはベクター単独でトランスフェクトした。図５Ｃに示すデータは、ＤＲ５によって誘導されたアポトーシスが、カスパーゼインヒビターによって弱められるが、優性ネガティブＦＡＤＤによっては弱められないことを示す。
【０１９２】
図５Ｄに示されるように、ＤＲ５は、ＦＡＤＤまたはＴＲＡＤＤとはインビボで会合しなかった。２９３細胞を、カルシウムリン酸沈澱を使用して、示された発現構築物とともに同時トランスフェクトした。トランスフェクションの後（４０時間で）、細胞溶解物を調製し、そしてＦｌａｇ Ｍ２抗体アフィニティーゲル（ＩＢＩ， Ｋｏｄａｋ）で免疫沈降させ、そしてＦＡＤＤまたはｍｙｃ−タグ化ＴＲＡＤＤ（ｍｙｃ−ＴＲＡＤＤ）の存在を、ＦＡＤＤに対するポリクローナル抗体またはｍｙｃに対する西洋わさびペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）結合体化抗体（ＢＭＢ）を用いる免疫ブロッティングによって検出した（Ｂａｋｅｒ， Ｓ．Ｊ．ら、Ｏｎｃｏｇｅｎｅ １２：１（１９９６）； Ｃｈｉｎｎａｉｙａｎ， Ａ．Ｍ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７４：９９０ （１９９６））。
【０１９３】
図５Ｅに示すように、ＦＬＩＣＥ２−ＤＮは、ＤＲ５誘導アポトーシスをブロックする。２９３細胞を、ＤＲ５またはＴＮＦＲ−１発現構築物と同時トランスフェクトし、そして示されたように４倍過剰のＣｒｍＡ、ＦＬＩＣＥ−ＤＮ、ＦＬＩＣＥ ２−ＤＮ、またはベクター単独とともに、βガラクトシダーゼの報告された構築物の存在下で同時トランスフェクトした。細胞を染色し、そして２５〜３０時間後に試験した。
【０１９４】
結果
ＤＲ５の過剰発現は、ＭＣＦ７ヒト乳ガン細胞（図５Ａ）およびヒト類上皮ガン（Ｈｅｌａ）細胞（図５Ｂ）の両方において、アポトーシスを誘導した。トランスフェクトした細胞のほとんどは、アポトーシスを経験している細胞に特徴的な形態学的な変化（Ｅａｒｎｓｈａｗ， Ｗ．Ｃ．， Ｃｕｒｒ． Ｂｉｏｌ． ７：３３７ （１９９５））を示し、円形になり濃縮されて、そしてディッシュから脱離した。死ドメインの欠失は、殺傷能力を消失させた。ＤＲ４と同様に、ＤＲ５誘導アポトーシスは、カスパーゼインヒビター、ＣｒｍＡおよびｚ−ＶＡＤ−ｆｍｋによってブロックされたが、優性ネガティブＦＡＤＤは効果がなかった（図５Ｃ）。これと一致して、ＤＲ５はＦＡＤＤおよびＴＲＡＤＤとインビボで相互作用しなかった（図５Ｄ）。新たに同定したＦＬＩＣＥ様分子の優性ネガティブバージョン、ＦＬＩＣＥ２（Ｖｉｎｃｅｎｚ， Ｃら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７２：６５７８ （１９９７））は、効率的にＤＲ５誘導アポトーシスをブロックしたのに対し、優性ネガティブＦＬＩＣＥは、ブロックした条件下で部分的な効果を有するのみであった。ＴＮＦＲ−１は、アポトーシスを効率的に誘導した（図５Ｅ）。まとめると、証拠は、ＲＤ５が、ＦＬＩＣＥ２および下流のカプラーゼの活性化を包含するアポトーシスプログラムに参加しているが、ＦＡＤＤとは独立であることを示唆する。
【０１９５】
（実施例６）
ＤＲ５の細胞外ドメインは、細胞傷害性リガンド−−ＴＲＩＬに結合し、そしてＴＲＩＬ−誘導アポトーシスをブロックする
上記で議論されるように、ＴＲＡＩＬ／Ａｐｏ２Ｌは、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）リガンドファミリーに属し、そしてその死ドメインがレセプターＤＲ４（両方の細胞型において発現される）を含有するにもかかわらず、多くの形質転換細胞株の迅速な細胞死を誘導するが、通常組織では誘導しない細胞傷害性リガンドである。この実施例は、本発明のレセプターＲＤ５もまたＴＲＡＩＬに結合することを示す。
【０１９６】
ＤＲ５およびＤＲ４の細胞外リガンド結合システインリッチドメインの類似性を仮定することによって、本発明者らは、ＤＲ５がまたＴＲＡＩＬに結合することを理論づける。このことを確認するために、ＤＲ５の可溶性細胞外リガンド結合ドメインを、ヒト免疫グロブリン（ＩｇＧ）のＦｃ部分に対する融合物として発現した。
【０１９７】
図６Ａに示すように、ＤＲ５−Ｆｃは、特異的にＴＲＡＩＬに結合するが、関連する細胞傷害性リガンドＴＮＦαには結合しなかった。この実験において、ＤＲ５、ＤＲ４、ＴＲＩＤ、またはＴＮＦＲ１のＦｃ細胞外ドメインおよび対応するリガンドを調製し、そして結合アッセイをＰａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７６：１１１ （１９９７）に記載されるように行った。それぞれのＦｃ融合物を、プロテインＧセファローズとともに沈澱させ、そして共沈した可溶性リガンドを、抗Ｆｌａｇ（Ｂａｂｃｏ）または抗ｍｙｃ−ＨＲＰ（ＢＭＢ）を用いたイムノブロッティングによって検出した。図６Ａの下部パネルは、結合アッセイにおいて存在するインプットＦｃ融合物を示す。
【０１９８】
さらに、ＤＲ５−Ｆｃは、ＴＲＡＩＬのアポトーシスを誘導する能力をブロックした（図６Ｂ）。ＭＣＦ７細胞を、等量のＦｃ融合物またはＦｃ単独の存在下で、可溶性ＴＲＡＩＬ（２００ｎｇ／ｍｌ）で処置した。６時間後、細胞を固定し、そしてＰａｎら（同書）に記載されるように試験した。図６Ｂに示すデータ（平均±ＳＤ）は、計数される総核のうちのアポトーシス核のパーセントである（ｎ＝４）。
【０１９９】
最後に、ＤＲ５−Ｆｃは、ＴＮＦＲ１−Ｆｃが完全にＴＮＦα殺傷を消失させる条件下で、アポトーシスＴＮＦα誘導細胞死に対する効果を有さなかった（図６Ｃ）。ＭＣＦ７細胞を、等量のＦｃ融合物またはＦｃ単独の存在下で、ＴＮＦα（４０ｎｇ／ｍｌ； Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ， Ｉｎｃ．）で処理した。核を染色し、そして１１〜１５時間後に試験した。
【０２００】
ＴＲＡＩＬのためのレセプターとしてＤＲ５を新たに同定したことは、ＴＲＡＩＬ開始シグナル伝達の生物学にさらなる複雑性を加える。
【０２０１】
本発明が、前述の説明および実施例において具体的に記載されるものとは異なった様式で実施され得ることは、明らかである。
【０２０２】
本発明の多くの改変および変形は、上記の教示を参考にして可能であり、それゆえ、添付の請求の範囲内にある。
【０２０３】
本明細書中で参照される全ての特許、特許出願、および刊行物の全開示は、本明細書中で参考として援用される。
【０２０４】
【表２】

【０２０５】
【表３】

【０２０６】
（配列表）
【０２０７】
【表４】

【０２０８】
【表５】

【０２０９】
【表６】

【０２１０】
【表７】

【０２１１】
【表８】

【０２１２】
【表９】

【０２１３】
【表１０】

【０２１４】
【表１１】

【０２１５】
【表１２】

【０２１６】
【表１３】

【０２１７】
【表１４】

【０２１８】
【表１５】

【図面の簡単な説明】
【０２１９】
【図１Ａ】図１は、ＤＲ５のヌクレオチド配列（配列番号１）および推定アミノ酸配列（配列番号２）を示す。アミノ酸１〜５１（下線を付した）は、シグナルペプチドを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約−５１〜約−１）；アミノ酸５２〜１８４は、細胞外ドメインを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約１〜約１３３）；アミノ酸１８５〜２０８（下線を付した）は、膜貫通ドメインを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約１３４〜約１５７）；そしてアミノ酸２０９〜４１１は、細胞内ドメインを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約１５８〜３６０）、そのアミノ酸３２４〜３９１（斜字体）は死ドメインを構成する（配列番号２のアミノ酸残基約２７３〜約３４０）と予測される。
【図１Ｂ】図１は、ＤＲ５のヌクレオチド配列（配列番号１）および推定アミノ酸配列（配列番号２）を示す。アミノ酸１〜５１（下線を付した）は、シグナルペプチドを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約−５１〜約−１）；アミノ酸５２〜１８４は、細胞外ドメインを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約１〜約１３３）；アミノ酸１８５〜２０８（下線を付した）は、膜貫通ドメインを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約１３４〜約１５７）；そしてアミノ酸２０９〜４１１は、細胞内ドメインを構成し（配列番号２のアミノ酸残基約１５８〜３６０）、そのアミノ酸３２４〜３９１（斜字体）は死ドメインを構成する（配列番号２のアミノ酸残基約２７３〜約３４０）と予測される。
【図２Ａ】図２は、ＤＲ５（ＨＬＹＢＸ８８）、ヒト腫瘍壊死因子レセプター１（ｈ ＴＮＦＲ１）（配列番号３）、ヒトＦａｓタンパク質（配列番号４）、およびレセプター３を含む死ドメイン（配列番号５）のアミノ酸配列間の類似性領域を示す。比較は、ＤＮＡ Ｓｔａｒ ｓｕｉｔｅ プログラムに含まれる、Ｍｅｇａｌｉｇｎプログラムで、Ｃｌｕｓｔａｌ法を使用して行われた。
【図２Ｂ】図２は、ＤＲ５（ＨＬＹＢＸ８８）、ヒト腫瘍壊死因子レセプター１（ｈ ＴＮＦＲ１）（配列番号３）、ヒトＦａｓタンパク質（配列番号４）、およびレセプター３を含む死ドメイン（配列番号５）のアミノ酸配列間の類似性領域を示す。比較は、ＤＮＡ Ｓｔａｒ ｓｕｉｔｅ プログラムに含まれる、Ｍｅｇａｌｉｇｎプログラムで、Ｃｌｕｓｔａｌ法を使用して行われた。
【図２Ｃ】図２は、ＤＲ５（ＨＬＹＢＸ８８）、ヒト腫瘍壊死因子レセプター１（ｈ ＴＮＦＲ１）（配列番号３）、ヒトＦａｓタンパク質（配列番号４）、およびレセプター３を含む死ドメイン（配列番号５）のアミノ酸配列間の類似性領域を示す。比較は、ＤＮＡ Ｓｔａｒ ｓｕｉｔｅ プログラムに含まれる、Ｍｅｇａｌｉｇｎプログラムで、Ｃｌｕｓｔａｌ法を使用して行われた。
【図３】図３は、ＤＲ５アミノ酸配列の分析を示す。α、β、ターン、およびコイル領域；親水性および疎水性；両親媒性領域；可撓性領域；抗原性指数、および表面確率が示されている。「抗原性指数−Ｊａｍｅｓｏｎ−Ｗｏｌｆ」のグラフでは、図１に示されるアミノ酸残基約６２〜約１１０、約１１９〜約１６４、約２２４〜約２７１、および約２７５〜約３７０が、示されるＤＲ５タンパク質の高度な抗原性領域に一致する。図１におけるこれらの高度に抗原性のフラグメントは、配列番号２の以下のフラグメントにそれぞれ一致する：アミノ酸残基約１１〜約５９、約６８〜約１１３、約１７３〜約２２０、および約２２４〜約３１９。
【図４】図４は、図１（配列番号１）に示されるヌクレオチド配列に関連する２つのｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列（ＨＡＰＢＵ１３ＲおよびＨＳＢＢＵ７６Ｒ）を示す。
【図５Ａ】図５Ａは、ＤＲ５過剰発現によって誘導されるＭＣＦ７ヒト乳癌細胞におけるアポトーシスを示す棒グラフである。図５Ｂは、ＤＲ５過剰発現によって誘導されるヒト類表皮癌（Ｈｅｌａ）細胞におけるアポトーシスを示す棒グラフである。図５Ｃは、ＤＲ５に誘導されるアポトーシスが、カスパーゼ（ｃａｓｐａｓｅ）インヒビターであるＣｒｍＡおよびｚ−ＶＡＤ−ｆｍｋによってブロックされるが、優性ネガティブなＦＡＤＤは効果がないことを示す棒グラフである。図５Ｄは、ＤＲ４と同様に、ＤＲ５は、インビボではＦＡＤＤおよびＴＲＡＤＤと相互作用しないことを示す示すイムノブロットである。図５Ｅは、新しく同定した、ＦＬＩＣＥ様分子の優性ネガティブバージョン（ｖｅｒｓｉｏｎ）である、ＦＬＩＣＥ２（Ｖｉｎｃｅｎｚ， Ｃ．ら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７２：６５７８ （１９９７））が効率的にＤＲ５誘導性のアポトーシスをブロックするが、一方優性ネガティブＦＬＩＣＥは、それがブロックした条件下で部分的な効果のみ有したことを示す棒グラフである。ＴＮＦＲ−１がアポトーシスを効果的にブロックしたことも示す。
【図５Ｄ】図５Ａは、ＤＲ５過剰発現によって誘導されるＭＣＦ７ヒト乳癌細胞におけるアポトーシスを示す棒グラフである。図５Ｂは、ＤＲ５過剰発現によって誘導されるヒト類表皮癌（Ｈｅｌａ）細胞におけるアポトーシスを示す棒グラフである。図５Ｃは、ＤＲ５に誘導されるアポトーシスが、カスパーゼ（ｃａｓｐａｓｅ）インヒビターであるＣｒｍＡおよびｚ−ＶＡＤ−ｆｍｋによってブロックされるが、優性ネガティブなＦＡＤＤは効果がないことを示す棒グラフである。図５Ｄは、ＤＲ４と同様に、ＤＲ５は、インビボではＦＡＤＤおよびＴＲＡＤＤと相互作用しないことを示す示すイムノブロットである。図５Ｅは、新しく同定した、ＦＬＩＣＥ様分子の優性ネガティブバージョン（ｖｅｒｓｉｏｎ）である、ＦＬＩＣＥ２（Ｖｉｎｃｅｎｚ， Ｃ．ら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７２：６５７８ （１９９７））が効率的にＤＲ５誘導性のアポトーシスをブロックするが、一方優性ネガティブＦＬＩＣＥは、それがブロックした条件下で部分的な効果のみ有したことを示す棒グラフである。ＴＮＦＲ−１がアポトーシスを効果的にブロックしたことも示す。
【図５Ｅ】図５Ａは、ＤＲ５過剰発現によって誘導されるＭＣＦ７ヒト乳癌細胞におけるアポトーシスを示す棒グラフである。図５Ｂは、ＤＲ５過剰発現によって誘導されるヒト類表皮癌（Ｈｅｌａ）細胞におけるアポトーシスを示す棒グラフである。図５Ｃは、ＤＲ５に誘導されるアポトーシスが、カスパーゼ（ｃａｓｐａｓｅ）インヒビターであるＣｒｍＡおよびｚ−ＶＡＤ−ｆｍｋによってブロックされるが、優性ネガティブなＦＡＤＤは効果がないことを示す棒グラフである。図５Ｄは、ＤＲ４と同様に、ＤＲ５は、インビボではＦＡＤＤおよびＴＲＡＤＤと相互作用しないことを示す示すイムノブロットである。図５Ｅは、新しく同定した、ＦＬＩＣＥ様分子の優性ネガティブバージョン（ｖｅｒｓｉｏｎ）である、ＦＬＩＣＥ２（Ｖｉｎｃｅｎｚ， Ｃ．ら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７２：６５７８ （１９９７））が効率的にＤＲ５誘導性のアポトーシスをブロックするが、一方優性ネガティブＦＬＩＣＥは、それがブロックした条件下で部分的な効果のみ有したことを示す棒グラフである。ＴＮＦＲ−１がアポトーシスを効果的にブロックしたことも示す。
【図６Ａ】図６Ａは、ＤＲ５−Ｆｃ（ならびにＤＲ４およびＴＲＩＤ）が、特異的にＴＲＡＩＬに結合するが、関連する細胞毒性リガンドＴＮＦαに結合しないことを示すイムノブロットである。図６Ａの下部のパネルは、結合アッセイ中に存在するＦｃ融合物の入力を示す。図６Ｂは、ＤＲ５−ＦｃがＴＲＡＩＬのアポトーシスを誘導する能力をブロックしたことを示す棒グラフである。図６Ｂに示されるデータ（平均±ＳＤ）は、計数された全核（ｎ＝４）中のアポトーシス性の核のパーセントである。図６Ｃは、ＴＮＦＲ１−Ｆｃが完全にＴＮＦα殺傷を無効にした条件下で、ＤＲ５−Ｆｃはアポトーシス性ＴＮＦα誘導細胞死に効果を有さなかったことを示す棒グラフである。
【図６Ｃ】図６Ａは、ＤＲ５−Ｆｃ（ならびにＤＲ４およびＴＲＩＤ）が、特異的にＴＲＡＩＬに結合するが、関連する細胞毒性リガンドＴＮＦαに結合しないことを示すイムノブロットである。図６Ａの下部のパネルは、結合アッセイ中に存在するＦｃ融合物の入力を示す。図６Ｂは、ＤＲ５−ＦｃがＴＲＡＩＬのアポトーシスを誘導する能力をブロックしたことを示す棒グラフである。図６Ｂに示されるデータ（平均±ＳＤ）は、計数された全核（ｎ＝４）中のアポトーシス性の核のパーセントである。図６Ｃは、ＴＮＦＲ１−Ｆｃが完全にＴＮＦα殺傷を無効にした条件下で、ＤＲ５−Ｆｃはアポトーシス性ＴＮＦα誘導細胞死に効果を有さなかったことを示す棒グラフである。

【特許請求の範囲】
【請求項１】
死ドメイン含有レセプター５。

【図１Ａ】

【図１Ｂ】

【図２Ａ】

【図２Ｂ】

【図２Ｃ】

【図３】

【図４】

【図５Ａ】

【図５Ｄ】

【図５Ｅ】

【図６Ａ】

【図６Ｃ】

【公開番号】特開２００８−８１５０３（Ｐ２００８−８１５０３Ａ）
【公開日】平成２０年４月１０日（２００８．４．１０）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−２６０４２７（Ｐ２００７−２６０４２７）
【出願日】平成１９年１０月３日（２００７．１０．３）
【分割の表示】特願平１０−５４０７９０の分割
【原出願日】平成１０年３月１７日（１９９８．３．１７）
【出願人】（５９７０１８３８１）ヒューマン　ジノーム　サイエンシーズ，　インコーポレイテッド (44)
【氏名又は名称原語表記】Ｈｕｍａｎ　Ｇｅｎｏｍｅ　Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，　Ｉｎｃ．
【Ｆターム（参考）】