磁性色素
【課題】極めて低濃度で存在する被検物の検出を容易に行う方法や、被検物の単離または測定に干渉しうる多くの他の物質を容易に排除する方法、また、生体試料から核酸を抽出する際にキャリーオーバーや汚染の危険性が排除されている方法など、新しい試料調製法に用いることができる新しい磁性色素を提供すること。
【解決手段】磁性コアと、ＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 、アルカリ金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる、磁性ガラス粒子。
【解決手段】磁性コアと、ＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 、アルカリ金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる、磁性ガラス粒子。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、試料中の被検物、特に、核酸のその後の検出のための、生体試料を調製する方法等に用いることができる新しい磁性色素に関する。
【背景技術】
【０００２】
試料調製は、しばしば、生体試料中の被検物を検出する方法での特殊な要求を満たす必要がある。一方では、被検物は、極めて低濃度でしばしば存在し、他方では、その被検物の単離または測定に干渉しうる多くの他の物質がその試料中に存在する。
【０００３】
特許文献１は、液体中に被検物を含む試料を、本質的に細孔を持たないか、直径＜１０ｎｍの細孔を有するガラス外表面を有する磁性粒子と、該被検物が該粒子表面に結合するような条件下に接触させ、結合した被検物を試料液から分離する、被検物、特に、核酸を生体試料から単離する方法を開示する。特許文献１に記載の方法は、生体試料から被検物を精製することには極めて適している。しかしながら、容易には自動試料調製に応用できない。
【０００４】
また、非特許文献１は、サイズに応じて分画された酸化ケイ素を用いる、生体試料から核酸を精製するためのプロトコールを記載する。しかしながら、この方法は、複雑で、自動化には適さず、さらに、キャリーオーバーの危険がある。
【０００５】
特許文献２に記載の核酸抽出方法では、試料を溶解し、該試料中に存在する核酸を超常磁性金属粒子に結合させ、これらを試料容器からピペットで取り出すことで、他の試料成分から分離する。本方法の短所は、被検物を試料からピペットで取り出さなければならないという必要性のために損失がおこるであろう。さらに、いくつかの反応容器の使用のため、キャリーオーバーと汚染の危険がある。
【特許文献１】国際公開第９６／４１８１１号パンフレット
【特許文献２】欧州特許出願公開第０ ７５７ １０６号明細書（ＥＰ−Ａ−０ ７５７ １０６）
【非特許文献１】Ｂｏｏｍら（Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２８（１９９０）４９５−５０３）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明の課題は、従来技術の状況の短所が少なくとも部分的には排除されている、新しい試料調製法等に用いることができる新しい磁性色素を提供することであった。具体的には、新しい方法を自動化することが可能であり、できる限り単純な温度プロファイルを持つべきである。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本課題は、
（ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が該吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）反応容器から非結合試料成分を除去するステップ、
（ｅ）被検物が吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートし、
（ｆ）該吸着マトリックスから溶出物を分離するステップ、
を含む、生体試料からの被検物の単離方法に用いられて達成される。
【０００８】
本発明のもう一つの側面は、
（ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が該吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）該吸着マトリックスから非結合試料成分を分離するステップ、
（ｅ）被検物が該吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｆ）溶出物を該吸着マトリックスから分離するステップ、を含み、少なくともステップ（ｃ）と（ｄ）とが本質的に同じ温度で行なわれる、
生体試料からの被検物の単離方法に用いられる磁性色素である。
【０００９】
即ち、本発明は、
〔１〕 磁性コアと、ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、アルカリ金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる磁性ガラス粒子、
〔２〕 ガラスコートがさらにＡｌ2Ｏ3 およびアルカリ土類金属酸化物を含む、前記〔１〕記載の磁性ガラス粒子、ならびに
〔３〕 ガラスコートが、ＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 およびＮａ2Ｏ、またはＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、Ａｌ2 Ｏ3、Ｋ2 ＯおよびＣａＯを含んでなる、前記〔１〕または〔２〕記載の磁性ガラス粒子
に関する。
【発明の効果】
【００１０】
本発明の磁性色素は、試料中の被検物、特に、核酸のその後の検出のための、生体試料を調製する方法等を簡略化することができるという優れた効果を奏する。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１１】
本発明の方法は、試料溶解緩衝液の存在下での固体吸着マトリックスへの被検物の選択的結合に基づき、ここで、好ましくは、ＤＮＡ、例えば、染色体ＤＮＡ、断片化された染色体ＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、ウイルスＤＮＡなど、またはＲＮＡ、例えば、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｒＲＮＡもしくはウイルスＲＮＡなどの核酸である被検物は、タンパク質や細胞片などの試料の不純物から分離される。前記試料は、血液、血漿、尿などの体液、組織試料、培養細胞の試料などのいかなる生体試料でもよい。
【００１２】
本発明の方法で使用される吸着マトリックスは、前記反応条件下で、被検物の実質的に選択的な結合を保証できる。粒子状の吸着マトリックス（好ましくはガラス表面を含有するもの）を使用することが好ましい。磁性ガラス粒子（特に、本質的に細孔を持たないか、直径が１０ｎｍ未満の細孔を持つガラス外表面を有する国際公開第９６／４１８１１号パンフレットに記載の磁性粒子）は、特に好ましい。１０〜６０μｍの粒子サイズを持つ強磁性粒子は、特に好ましい。そのような粒子は、例えば、雲母とその上に固定化された磁性粒子とで作製されたコアであって、ガラスの層で包まれているものを含有しうる。国際公開第９６／４１８１１号パンフレットでは、磁性粒子は、個々の反応容器に固体型として、例えば、錠剤または粉末として、入れられるが、本発明の磁性粒子を懸濁物の形態で使用される。約５〜２０ｍｇ／ｍｌの濃度のアルコール懸濁物は特に好適であることが判明した。意外にも、この磁性ガラス粒子の高い比重（ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｄｅｎｓｉｔｙ）にも関わらず、その懸濁物は、極めて再現性よく保存容器から抜き取ることができ、それがこの方法の自動化を可能にすることがわかった。
【００１３】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットに記載のガラス粒子は、本発明の方法に良好な結果を与えるが、特に良い結果は、そのガラス相が下記金属酸化物：ＳｉＯ2 、Ｂ2 Ｏ3 、アルカリ金属酸化物、例えば、Ｋ2Ｏおよび／またはＮａ2 Ｏなど、ならびに任意にＡｌ2 Ｏ3 とアルカリ土類金属酸化物、例えば、ＣａＯなど、を含むガラス粒子で得られる。これらの金属酸化物の含有量は、好ましくは次のとおりである：５０〜９５モル％ ＳｉＯ2 、０．２〜３０モル％ Ｂ2 Ｏ3 、０〜１０モル％ Ａｌ2 Ｏ3、０〜２０モル％ アルカリ土類金属酸化物および０．２〜２０モル％ アルカリ金属酸化物であり、各パーセンテージは、前記ガラス相の総重量に基づく。
【００１４】
ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、Ｋ2 Ｏ、Ａｌ2 Ｏ3 およびＣａＯを含むガラス相は、ＲＮＡの単離に特に適していることが判明している。ＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 およびＮａ2 Ｏを含むガラス相は、ＤＮＡの単離に特に適していることが判明している。
【００１５】
本発明の方法では、吸着マトリックスは、好ましくは、試料中に存在する被検物、特に、核酸を定量的に結合するのに必要とされる最少量に相当する量で加えられるか、あるいはその量は、それよりいくらか多く、この量を好ましくはせいぜい５０％、特に好ましくはせいぜい２０％上回る。様々なタイプの試料中の核酸の予想量は、−それが既知でない場合には−、一般的技術、例えば、フェノール／クロロホルム抽出とそれに続く光学密度の測定などによって前もって決定できる。
【００１６】
本発明の方法のステップ（ａ）は、反応容器中で試料を溶解することを含む。通常、この溶解は、試料中に存在する細胞を変性条件下で溶解することによって、例えば、プロテアーゼと変性緩衝液を添加することにより行なわれる。プロテイナーゼＫ、プロナーゼ、エラスターゼおよび／またはリゾチームをプロテイナーゼとして使用することが好ましい。プロテイナーゼＫの使用は特に好ましい。
【００１７】
プロテアーゼ消化は、カオトロピック化合物、例えば、尿素または尿素誘導体、好ましくは、カオトロピック塩−特に好ましくはグアニジニウム塩酸塩（特にＤＮＡの単離用）やグアニジニウムチオシアネート（特にＲＮＡの単離用）などのグアニジニウム塩または過塩素酸塩もしくはヨウ化物−を含む変性緩衝液中で行なわれる。グアニジニウム塩については、１〜３モル／ｌの範囲の濃度が好ましい。
【００１８】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットに記載の試料調製法とは対照的に、固体吸着マトリックスは、試料を溶解した後に専ら添加される。本手順は、吸着マトリックスへの不要な試料成分、例えばタンパク質などの、より顕著に低い非特異的結合をもたらす。
【００１９】
ステップ（ｃ）では、溶解緩衝液中で好ましくはカオトロピック条件下でインキュベートすることにより、被検物が吸着マトリックスに選択的に結合される。
【００２０】
本発明の方法のステップ（ｄ）は、吸着マトリックスからの非結合試料成分の分離を含む。本目的のため、非結合試料成分を反応容器から除去することが好ましい。これは、任意に数回、少なくとも５０％（ｖ／ｖ）、特に好ましくは少なくとも６０％（ｖ／ｖ）の量のエタノール、プロパノールおよびアセトンなどの、水と混和する溶媒を含有することが好ましい洗浄緩衝液を加えて除去することによって達成される。
【００２１】
本発明の方法のステップ（ｃ）、（ｄ）および／または（ｅ）は、好ましくは、外部手段を加えないで連続的または間欠的（すなわち混合相と、反応溶液が静止している相とが交互にくる）に混合しながら行なわれる。この混合は、好ましくは、反応容器をその縦軸を中心として、回転方向を数回逆転させながら回転させることによって行なわれる。前記混合容器は、特に好ましくは、正確にその縦軸のまわりを回転し、回転方向の変更は、液体のメニスカスのたわみが前もって定めたカットオフ値未満にとどまるように行なわれる。かかる混合方法は、国際公開第９１／１５７６８号パンフレットと欧州特許出願公開第０ ４３５ ４８１号明細書（ＥＰ−Ａ−０ ４３５ ４８１）に記述されている。
【００２２】
ステップ（ｃ）および／または（ｅ）の継続時間は、好ましくはせいぜい２０分であり、連続的混合または短周期、好ましくは最大２分の好ましい短周期での間欠的混合を含む。特に良い結果は、２０秒間の混合と４０秒間の静止とを含む１分周期での間欠的混合によって得られた。
【００２３】
磁性粒子を吸着マトリックスとして使用する場合、反応容器に液体を添加すること、連続的に混合しながら液体を反応容器から吸引することが可能であり、吸引工程の間、該粒子は、反応容器中に保持される。この混合手順により、本発明の方法は、様々なタイプの試料に適合するように柔軟に調節することが可能にする。さらに、液相に磁性粒子の均一な分布が常にあることを保証する。
【００２４】
本発明の方法のステップ（ｅ）は、吸着マトリックスからの被検物の溶出を含む。先行技術から知られているように、これには、本質的に有機溶媒を含まない低塩緩衝液を使用できる。しかしながら、意外にも、溶出緩衝液は、酵素、例えば核酸を操作するために使用されるＲＮアーゼ、ＤＮアーゼ、制限エンドヌクレアーゼ、リガーゼ、ターミナルトランスフェラーゼおよび／またはポリメラーゼなどの酵素などのさらなる試薬類を含みうることがわかった。被検物が例えばＤＮＡである場合、不要なＲＮＡの含有量を減少させるために、溶出時に、ＤＮアーゼ−フリーのＲＮアーゼを加えることが可能である。一方、被検物がＲＮＡである場合、溶出時にＲＮアーゼ−フリーのＤＮアーゼを加えることが可能である。制限エンドヌクレアーゼなどの他の酵素も同様の方法で加えうる。本発明の方法によって単離される核酸が続いて増幅にかけられる場合は、その溶出時に、増幅緩衝液、ヌクレオチド類、プライマー、ポリメラーゼおよび緩衝塩類を含む核酸増幅マスターミックスも加えることができる。
【００２５】
本発明の方法のステップ（ｆ）は、吸着マトリックスから溶出物を分離することを含む。この分離は、通常の方法、例えば沈降によって行なうことができるが、好ましくは磁性分離によって行なう。
【００２６】
本発明の方法によって単離された被検物は、続いて公知の方法で、例えば、核酸の場合であれば、増幅とそれに続く検出や、先に増幅を行なわない検出もしくは配列決定などによってさらに処理できる。この目的のために、様々な被検物は、ＨＩＶ、ＨＣＶ、ＨＢＶなどの様々なウイルスなど溶出物のアリコートで決定されうる。
【００２７】
本発明の方法の重要な特徴は、多くのステップを、または任意に全てのステップでさえ、本質的に同じ温度（すなわち±２．５℃の温度範囲内）で行なうことができるという点である。この温度は、好ましくは室温から７０℃まで、特に好ましくは室温から４０℃までの範囲にあり、最も好ましくは室温、すなわち約１８〜３２℃である。本発明の方法の好ましい態様では、少なくともステップ（ｃ）の吸着とステップ（ｄ）の洗浄とがこの温度で行なわれる。他のステップ、特にステップ（ａ）の溶解および／またはステップ（ｅ）の溶出も、この温度で行なうことが特に好ましい。例えば、血液試料中のＨＩＶの決定のために、全試料調製を一律の温度で行なうことができる。任意に、本発明の方法のステップ（ｆ）の後に、特定の被検物についての増幅収率を向上させる、上昇された温度における後処理ステップを追加してもよい。他の被検物には、前処理および／または上昇された温度における溶出を行なう必要があるかもしれない。この場合、前記上昇された温度は、４０℃を超える温度から９５℃まで、例えば約７０℃の範囲にあることが好ましい。
【００２８】
本発明の方法は、自動装置で行なわれることが好ましい。そのような装置の例を以下に記載する。また本発明の試料調製法では、少なくともステップ（ａ）から（ｅ）を一つの反応容器で行なうこと、すなわち別の反応容器への移動がないことも好ましい。このことは、その方法をかなり簡略化すると共に、汚染の危険の低下にもつながる。
【００２９】
本発明のさらなる主題は、
（ａ）プロテアーゼ、
（ｂ）試料溶解緩衝液、
（ｃ）洗浄緩衝液、
（ｄ）溶出緩衝液、および
（ｅ）磁性ガラス粒子の懸濁物、
を含有してなる、特に上述の方法を実施するのに適した試薬キットである。
【００３０】
本発明のさらなる主題は、そのガラス相がＳｉＯ2 、Ｂ2 Ｏ3 およびＮａ2 Ｏを含む磁性ガラス粒子を含有したＤＮＡ単離用試薬キットと、そのガラス相がＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 、Ａｌ2 Ｏ3 、ＣａＯおよびＫａ2Ｏを含む磁性ガラス粒子を含有したＲＮＡ単離用試薬キットである。
【００３１】
最後に、本発明の他の主題は、
−試料調製装置（１）、
−試薬用保持装置（２）、
−７０℃以下、特に、４０℃以下の操作温度を具備する試料調製用反応容器のための第１保持装置（３）、
−冷却手段および／または加熱手段を任意に含む、反応容器のための第２保持装置（４ａ、４ｂ、４ｃ）、および
−ロボットツール装置（５）
を含有した、生体試料から被検物を単離するための装置である。
【００３２】
本発明の装置は、好ましくは試料調製の４つの主要ステップ、すなわち試料の溶解、放出された被検物、例えば核酸の固体吸着マトリックス、例えば磁性ガラス粒子への吸着、該吸着マトリックスの洗浄、および該吸着マトリックスからの被検物の溶出を実施するのに、１つの反応容器が使用されるように設計される。
【００３３】
本装置は、試料調製用の反応容器を保持するための第１保持装置が、少なくとも、固体吸着マトリックスへの被検物の吸着のため、該吸着マトリックスの洗浄とに使用されるように設計される。また、好ましい態様では、前記第１保持装置が、試料溶解および／または吸着マトリックスからの被検物の溶出に使用される。試料調製用の反応容器は、好ましくは少なくとも１ｍｌ、例えば１〜５ｍｌの容量を有する。
【００３４】
第２保持装置は、被検物を保存および／またはさらに処理するための反応容器、例えば、通常、試料の調製に使用される反応容器とは異なる形状を持つＰＣＲ容器などのために設計される。保存および／または追加処理用の反応容器は、好ましくは５００μｌまで、例えば、５０〜２００μｌの容量を有する。さらに第２保持装置は、被検物を含む試料を処理するのに必要な試薬類、例えば、ＰＣＲマスターミックスのための容器を含むことができる。
【００３５】
本発明の装置は、試料調製の１もしくは数ステップおよび／または後処理ステップを、第２保持装置中において、高温で行なわれうるように設計できる。本目的のために、第２保持装置は、試料の溶解、吸着マトリックスからの試料の溶出および溶出後の後処理ステップから選択された少なくとも一つの処理ステップのための反応容器を保持するように設計できる。
【００３６】
第１保持装置は、好ましくは磁性分離のための手段を含む。また、反応容器を混合する、具体的には、それらをその縦軸を中心として回転させることによって混合するための手段を含むことが好ましい。そのような手段は、第２保持装置に任意に供給されてもよい。
【００３７】
ロボットツールは、一般に自動ピペッティング装置を含有し、任意に、例えば第１保持装置と第２保持装置との間で反応容器を輸送するための手段を含有する。また、キャップ開閉ユニットを組み込んでもよい。
【００３８】
本発明の装置の特定の態様を以下に詳細に示す。図１に示す態様では、試料調製装置（１）は、試薬用保持装置（２）と、混合および磁性分離機能を持ち、好ましくは４０℃以下の温度、特に好ましくは室温を与える試料調製用反応容器のための保持装置（３）とを含む。本装置は、さらに別の反応容器（４ａ）（例えば４℃から室温までの温度を有するＰＣＲ容器のための保持ステーションを含有する。本装置は、さらに、Ｘ、ＹおよびＺ方向の移動を可能にする、ピペッティングと反応容器を取り扱うための自動装置（５）を含む。本発明の装置の本態様では、試料調製の４つの主要ステップ、すなわち溶解、吸着、洗浄および溶出が、第１保持装置中の単一の反応容器で行なわれる。溶出物は、保存され、さらなる試薬類、例えばＰＣＲマスターミックスが第２保持装置で加えられる。さらなる処理、例えば、続いてＰＣＲを行なうために、容器を適切な装置、例えばサーモサイクラー（示していない）に移す。
【００３９】
図２に示す態様では、装置が、さらなる処理用の反応容器、例えばＰＣＲ容器を保持するように設計され、かつ、４℃（ＰＣＲマスターミックスの冷却）から吸着マトリックスから溶出した後に、溶出物を加熱するための９５℃までの温度を設定するための具備を持つ、第２保持装置（４ｂ）を含む。キャップカウンター加熱（ｃａｐ ｃｏｕｎｔｅｒ−ｈｅａｔｉｎｇ）は、ＰＣＲ容器のキャップでの結露を防ぐのに好ましい。
【００４０】
図３に示す本発明の装置の態様は、ＰＣＲ容器と試料調製容器をも保持するように設計された反応容器用第２保持装置（４ｃ）が設けられている。この第２保持装置では、例えば４℃までの冷却と例えば９５℃までの加熱とが、溶解物および／または溶出物を加熱するために可能である。この場合も、反応容器のキャップでの結露を防止するためにキャップカウンター加熱が施される。
【００４１】
本発明のさらなる態様（図示していない）では、第１保持装置は、≦７０℃の範囲の温度を設定するように設計される。第２保持装置は、−図３に示すように−試料処理容器と試料調製容器とを冷却し加熱するのに適している。
【００４２】
本発明の装置は、特に上述したような方法で使用できる。
【００４３】
さらに本願を図面と実施例により、より詳細に説明する。
【００４４】
実施例１．磁性ガラス粒子の調製
２種類のゾルを使用した。前記ゾルは、下記：
ゾル１：（ＳｉＯ2 ：Ｂ2Ｏ3 ：Ｎａ2 Ｏ＝４０：８：２）
として調製した。
【００４５】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットの実施例１および２の手順と同様に、酸化物のアルコラートを上記のモル比で共に撹拌し、均一な相を形成させた。しかしながら、変更点は、ＨＣｌを使用しなかったことである。
【００４６】
次に、１００ｍｌのゾル中３０ｇのイリオジン６００黒雲母（ｉｒｉｏｄｉｎ ６００ Ｂｌａｃｋ Ｍｉｃａ）（Ｍｅｒｋ）を撹拌した。
【００４７】
ゾル２：（ＳｉＯ2 ：Ｂ2 Ｏ3 ：Ｋ2 Ｏ：Ａｌ2 Ｏ3 ：ＣａＯ＝７６：１５：５：２：２）
【００４８】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットの実施例１および２に記載の手順と同様に、酸化物のアルコラートを上記のモル比で共に撹拌し、均一な相を形成させた。しかしながら、変更点は、ＨＣｌを使用しなかったことである。
【００４９】
次に、ゾル１００ｍｌ中３０ｇのイリオジン６００黒雲母（ｉｒｉｏｄｉｎ ６００ Ｂｌａｃｋ Ｍｉｃａ）（Ｍｅｒｋ）を撹拌した。
【００５０】
次に前記ゾルを噴霧乾燥処理に供した。
【００５１】
噴霧乾燥により、得られた粉末を沈降による微粉の分離、窒素雰囲気下（６０ｌ／ｈ体積流量）に１Ｋ／分の加熱速度での温度処理にかけ、６００〜７００℃の範囲の圧縮温度で１時間維持した。次に、オーブンを３００℃に冷却し、この温度で１時間、酸素でフラッシュした。室温に冷却した後、磁性ガラス粒子を取り出し、粗い物質を分離するために、５０μｍ篩を篩にかけた。
【００５２】
ゾル１から得られる磁性ガラス粒子は、ＤＮＡの単離に特に適している。ゾル２から得られるガラス粒子は、ＲＮＡの単離に特に適している。
【００５３】
２．核酸、例えばＤＮＡの単離のための試料調製用の標準プロトコール
下記標準プロトコールは、全血や培養細胞などの生体試料から核酸を単離するのに適している。この方法で得られる核酸は、ＰＣＲによる増幅、制限消化またはサザンブロットに、溶出後直接使用できる。
【００５４】
反応キットは、
１．結合緩衝液（４．７モル／ｌ グアニジニウム塩酸塩、１０ｍｍｏｌ／ｌ 尿素、１０ｍｍｏｌ／ｌ トリス塩酸、２０％ ＴｒｉｔｏｎR Ｘ−１０ ０、ｐＨ５．７）
２．凍結乾燥プロテイナーゼＫ（濃度２０ｍｇ／ｍｌまでＨ2 Ｏに溶解）
３．洗浄緩衝液〔５６％（ｖ／ｖ）エタノール、２０ｍｍｏｌ／ｌ ＮａＣｌ 、１０ｍｍｏｌ／ｌ トリス塩酸、ｐＨ７．５〕
４．溶出緩衝液（１０ｍｍｏｌ／ｌ トリス ｐＨ８．５）
５．磁性ガラス粒子（ＭＰＧ）
ａ）それぞれが７．５ｍｇのガラス粒子を含む錠剤、又は
ｂ）１５％ガラス粒子のエタノール懸濁物
を含む。
【００５５】
キット成分は、安定であり、室温で保存できる。プロテイナーゼＫの水への溶解後は、溶液を等分して−２０℃で保存すべきである。凍結溶液は、１２ヶ月間安定である。
【００５６】
標準プロトコール
１． 試料２００μｌを２ｍｌ反応容器に添加し、２００μｌの結合緩衝液およびプロテイナーゼＫ溶液４０μｌとに混合する。次に、それを１０分間インキュベートする。インキュベーションは、好ましくは、室温で行なう。しかしながら、特定の状況下では、インキュベーション温度を７０℃まで上げることもできる。
２． インキュベーション後に、イソプロパノール２００μｌとＭＧＰ錠剤（または二者択一的にＭＧＰ懸濁物２００μｌ）を加え、室温で５分間インキュベートする。
３． 反応容器を磁性粒子分離装置（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｍａｎｎｈｅｉｍ社、カタログ番号１ ６４１ ７９４）に入れ、約１分間分離する。
４． 上清を捨て、反応容器をＭＰ分離装置から取り出す。
５． 洗浄緩衝液５００μｌの添加後に、その反応容器の内容物を混合し、再びＭＰ分離装置に約１分間入れる。
６． 上清を捨てる。ステップ５を３回繰り返す。直前の洗浄処理後に、残留している洗浄緩衝液を完全に除去する。
７． 溶出のために、７０℃に任意に予備加熱される１００μｌの溶出緩衝液を加える。次にそれを混合し、室温で５分間インキュベートする。試料をＭＰ分離装置に入れ、その上清を新しい反応容器に移す。
８． この方法で得られた核酸、例えばＤＮＡは、安定であり、ついで、さらに直接処理されるか、４℃で保存されうる。
【００５７】
上記のプロトコールは、マイクロタイタープレート、例えばディープウェルマイクロタイタープレート（例えば、Ｒｉｔｔｅｒ、Ｊ．Ｊ．Ｂｉｏａｎａｌｙｔｉｃ）にも同様に使用されうる。
【００５８】
３．ＰＣＲによるクラミジア・トラコーマティスＤＮＡ検出
３．１ 試料調製のためのマニュアル標準プロトコール
２００μｌの尿試料と２４０μｌの結合緩衝液／プロテイナーゼＫ溶液（５：１）とを２ｍｌ反応容器にピペッティングし、ボルテックス混合に供して、７０℃で１０分間インキュベートする。次に、試料を５分間室温に冷却する。
【００５９】
前記試料にＭＧＰのイソプロパノール溶液２００μｌをピペットで加える。その後直ちにボルテックス混合する。次に前記試料を、例えば、サーモミキサー ５４３６〔エッペンドルフ（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ）〕などのミキサー中で１５分間インキュベートする。
【００６０】
試料を磁性分離装置に移すことによってＭＧＰを濃縮する。１分後に上清をピペットで完全に除去する。
【００６１】
ＭＧＰに０．５ｍｌの洗浄緩衝液をピペットで加える。試料をボルテックス混合に供した後、磁性分離装置に移す。１分後に上清をピペットで除去する。この洗浄手順をさらに２回繰り返す。
【００６２】
ＭＧＰに２００ｍｌの溶出緩衝液を加える。試料をサーモミキサー中、１４００ｒｐｍ、７０℃で１０分間インキュベートする。結露した水を短い遠心分離により集める。試料を磁性分離装置に移し、１分後に１８０μｌの溶出物を取り出す。前記溶出物を新しい反応容器にピペッティングし、４℃（保存期間が＜２４時間の場合）または−２０℃（より長い保存期間の場合）で保存する。
【００６３】
５０μｌの溶出物をＰＣＲに使用する：評価は、電気化学発光による。
【００６４】
３．２ 半自動化処理に関するプロトコール
３．１に記載のボルテックス混合とサーモブロックでの加熱の代わりに、混合と加熱とが混合および加熱モジュールで行なわれる半自動化処理を行なう。図４は、マニュアル標準プロトコール（ボルテックス）と半自動化処理（ＭＴＭ）との間のクラミジアの決定（試料：尿１００ｍｌにつき１００基本抗体（ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ａｎｔｉｂｏｄｙ）；６重測定）の比較を表す。自動化によって感度が損なわれないことがわかる。
【００６５】
３．３ 室温での半自動化プロトコール
試料調製を３．２項に記述したように行なう。しかしながら、溶解および溶出を室温で行なう。
【００６６】
３．４ 室温での半自動化試料調製プロトコールとその後の溶出物の後処理
３．３項に記載のように試料調製を行なう。溶出後に、７０℃で１０分間のインキュベーションを行なう。
【００６７】
図５は、セクション３．２、３．３および３．４に記載の試料調製プロトコール間のクラミジアの決定（試料：ＳＷＥ１、０クラミジア基本抗体（ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ａｎｔｉｂｏｄｙ；ＥＡＢ）／ｍｌ尿、ＳＷＥ２：１０ＥＡＢ／ｍｌ尿、ＳＷＥ３：１００ＥＡＢ／ｍｌ尿およびＳＷＥ４：１０００ＥＡＢ／ｍｌ尿）の比較を表わす。標準プロトコールが室温での試料調製（ＲＴプロトコールＭＴＭ）と比較して、クラミジアの決定に関してより高感度であることがわかる。しかしながら、室温での試料調製とその後の溶出物の後処理（後処理を伴うＲＴプロトコールＭＴＭ）の結果は、この効果がほとんど補われうることを示している。したがって、試料調製そのものの間には温度ステップが必要でないということは意外である。
【００６８】
溶解、吸着、洗浄および溶出の各ステップを≦４０℃の温度で行なうことができ、キャップカウンター加熱と温度調節が必要でないので、それによって自動化が簡略化されるため、本知見により、試料調製処理をかなり簡略化することができる。
【００６９】
４．ＰＣＲによるＨＩＶ−ＲＮＡ検出
４．１ 試料調製に関するマニュアル標準プロトコール
凍結血漿を３７℃で５分間融解し、さらなる処理のために氷上で冷却する。
【００７０】
５０μｌのプロテイナーゼＫ溶液（２５ｍｇ／ｍｌ）を１．５ｍｌのＳａｒｓｔｅｄｔ反応容器にピペッティングする。２５０μｌの試料をこれに加え、ボルテックスミキサーで混合する。次に３００μｌの溶解緩衝液を加え、再びボルテックス混合する。
【００７１】
これを１３，０００ｒｐｍのエッペンドルフ ミキサー上、室温で１０分間インキュベートする。次に３００μｌのＭＧＰ懸濁物（６ｍｇ／ｍｌ ＭＧＰ、イソパノール中）を加え、ボルテックス混合し、継続して混合しながら室温で２０分間インキュベートする。ＭＧＰを磁性分離装置で分離し、その上清を完全に取り除く。
【００７２】
前記ＭＧＰに洗浄緩衝液７５０μｌを加える。ＭＧＰを再懸濁し、上述のように分離する。洗浄操作を４回繰り返し、最後に洗浄緩衝液を注意深く取り除く。
【００７３】
次に溶出緩衝液１００μｌを加え、ＭＧＰを再懸濁する。エッペンドルフ サーモミキサー（１３，０００ｒｐｍ）上、８０℃で１５分間のインキュベーション後に、９０μｌの溶出物を新しい反応容器に移す。続いて行なうＲＴ−ＰＣＲによるＨＩＶ決定には、４０μｌの溶出物を使用する。
【００７４】
４．２ 試料調製に関する半自動化標準プロトコール
混合と加熱とを混合および加熱モジュールで行なったこと以外は、セクション４．１に記述したように試料調製を行なう。
【００７５】
４．３ 室温での半自動化プロトコール
すべてのステップを室温で行なうこと以外は、本質的に４．２項に記述したように試料調製を行なう。溶解、吸着および溶出のためのインキュベーション期間は、各ケースで１５分である。
【００７６】
図６に見られうるように、自動化と室温での試料調製（ＲＴプロトコールＭＴＭ）は、マニュアル試料調製での標準プロトコール（マニュアル）と比較して感度を損ねない。陰性、低陽性、中陽性および高陽性血漿試料で、再現性ある結果が得られる。
【００７７】
本発明の態様として、以下のものが挙げられる。
〔１〕 （ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が該吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）該反応容器から非結合試料成分を除去するステップ、
（ｅ）被検物が該吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートするステップ、および
（ｆ）該吸着マトリックスから溶出物を分離するステップ、
を含む、生体試料から被検物を単離する方法。
〔２〕 ステップ（ａ）がプロテアーゼと変性緩衝液とを添加することを含む、前記〔１〕記載の方法。
〔３〕 プロテアーゼとして、プロテイナーゼＫを使用する、前記〔２〕記載の方法。
〔４〕 グアニジニウム塩、特に、グアニジニウム塩酸塩および／またはグアニジニウムチオシアン酸塩を含む変性緩衝液を用いる、前記〔２〕記載の方法。
〔５〕 固体吸着マトリックスとして、磁性ガラス粒子を用いる、前記〔１〕〜〔４〕いずれかに記載の方法。
〔６〕 懸濁物の形態で磁性ガラス粒子を添加する、前記〔５〕記載の方法。
〔７〕 ガラス相がＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ およびＮａ２ Ｏを含むもの、またはＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、Ａｌ２ Ｏ３ 、ＣａＯおよびＫ２ Ｏを含むものであるガラス粒子を用いる、前記〔５〕または〔６〕記載の方法。
〔８〕 吸着マトリックスの添加量が、試料中に存在する被検物を定量的に結合するのに要する量の多くて５０％を超える量である、前記〔１〕〜〔７〕いずれかに記載の方法。
〔９〕 少なくともステップ（ｃ）、（ｄ）および／または（ｅ）の間、外部装置を加えることなく、連続的混合または断続的混合を行なう、前記〔１〕〜〔８〕いずれかに記載の方法。
〔１０〕 混合が、反応容器をその縦軸を中心として回転させることにより達成される、前記〔９〕記載の方法。
〔１１〕 ステップ（ｃ）および／または（ｅ）を行なう最大期間がそれぞれ２０分である、前記〔９〕または〔１０〕記載の方法。
〔１２〕 ステップ（ｄ）が、任意に数回繰り返される、洗浄緩衝液の添加および吸引を含む、前記〔１〕〜〔１１〕いずれかに記載の方法。
〔１３〕 水と混和できる有機溶媒を少なくとも５０％（ｖ／ｖ）の含有量で有する洗浄緩衝液を用いる、前記〔１２〕記載の方法。
〔１４〕 ステップ（ｅ）において、酵素などの助剤を添加する、前記〔１〕〜〔１３〕いずれかに記載の方法。
〔１５〕 ステップ（ｅ）における溶出のために、低塩緩衝液を用いる、前記〔１〕〜〔１４〕いずれかに記載の方法。
〔１６〕 ステップ（ｅ）の溶出のために、核酸増幅マスターミックスを添加する、前記〔１〕〜〔１４〕いずれかに記載の方法。
〔１７〕 少なくともステップ（ｃ）および（ｄ）を本質的に同じ温度で行なう、前記〔１〕〜〔１６〕いずれかに記載の方法。
〔１８〕 さらに、ステップ（ａ）および／またはステップ（ｅ）を本質的に同じ温度で行なう、前記〔１７〕記載の方法。
〔１９〕 温度が、室温〜４０℃の範囲にある、前記〔１７〕または〔１８〕記載の方法。
〔２０〕 温度が、１８℃〜３２℃の範囲にある、前記〔１７〕〜〔１９〕いずれかに記載の方法。
〔２１〕 ステップ（ａ）および／またはステップ（ｅ）を上昇された温度で行なう、前記〔１〕〜〔２０〕いずれかに記載の方法。
〔２２〕 上昇された温度における後処理ステップをステップ（ｆ）の後に行なう、前記〔１〕〜〔２１〕いずれかに記載の方法。
〔２３〕 上昇された温度が４０℃を超える温度〜９５℃の範囲にある、前記〔２１〕または〔２２〕記載の方法。
〔２４〕 （ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）吸着マトリックスから非結合試料成分を分離するステップ、
（ｅ）被検物が吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートするステップ、ならびに
（ｆ）吸着マトリックスから溶出物を分離するステップ、
を含み、ここで、少なくともステップ（ｃ）および（ｄ）を本質的に同じ温度で行なう、生体試料から被検物を単離する方法。
〔２５〕 被検物が核酸である、前記〔１〕〜〔２４〕いずれかに記載の方法。
〔２６〕 方法が自動装置で行なわれる、前記〔１〕〜〔２５〕いずれかに記載の方法。
〔２７〕 ステップ（ａ）〜（ｅ）を１つの反応容器で行なう、前記〔１〕または〔２４〕記載の方法。
〔２８〕 （ａ）プロテアーゼ、
（ｂ）試料溶解緩衝液、
（ｃ）洗浄緩衝液、
（ｄ）溶出緩衝液、および
（ｅ）磁性ガラス粒子の懸濁物、
を含有してなる、前記〔１〕〜〔２７〕いずれかに記載の方法を特に行なうための試薬キット。
〔２９〕 ガラス相がＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ およびＮａ２ Ｏを含むものである磁性ガラス粒子を含有してなる、ＤＮＡの単離用試薬キット。
〔３０〕 ガラス相がＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、Ａｌ２ Ｏ３ 、ＣａＯおよびＫ２ Ｏを含むものである磁性ガラス粒子を含有してなる、ＲＮＡの単離用試薬キット。
〔３１〕 − 試料調製装置（１）、
− 試薬用保持装置（２）、
− ７０℃以下、特に、４０℃以下の操作温度を具備する、試料調製用反応容器のための第１保持装置（３）、
− 冷却手段および／または加熱手段を任意に含む、反応容器のための第２保持装置（４ａ、４ｂ、４ｃ）、
−およびロボットツール装置（５）
を含有してなる、生体試料から被検物を単離するための装置。
〔３２〕 １つの反応容器が、試料を溶解すること、被検物を固体吸着マトリックスに吸着させること、該吸着マトリックスを洗浄すること、および該吸着マトリックスから被検物を溶出することのために用いられる、前記〔３１〕記載の装置。
〔３３〕 第１保持装置が、試料調製用および少なくとも被検物の固体吸着マトリックスへの吸着用並びに該吸着マトリックスの洗浄用の反応容器を保持するために用いられる、前記〔３１〕または〔３２〕のいずれかに記載の装置。
〔３４〕 第１保持装置が、さらに試料調製用、試料溶解用および／または吸着マトリックスからの被検物の溶出用の反応容器を保持するために用いられる、前記〔３３〕記載の装置。
〔３５〕 反応容器を保持するための第２保持装置が、被検物を保存するためおよび／またはさらに該被検物を処理するために用いられる、前記〔３１〕〜〔３４〕いずれかに記載の装置。
〔３６〕 試薬用容器を保持するための第２保持装置が、さらに試料を処理するために用いられる、前記〔３１〕〜〔３５〕いずれかに記載の装置。
〔３７〕 反応容器を保持するための第２保持装置が、試料を溶解すること、吸着マトリックスから試料を溶出することおよび溶出後の後処理ステップから選ばれる、上昇された温度における少なくとも１つの処理ステップのために用いられる、前記〔３１〕〜〔３６〕いずれかに記載の装置。
〔３８〕 第１保持装置が、磁性分離のための手段を含んでなる、前記〔３１〕〜〔３７〕いずれかに記載の装置。
〔３９〕 第１保持装置が、反応容器をその縦軸を中心とした回転により混合するための手段を含んでなる、前記〔３１〕〜〔３８〕いずれかに記載の装置。
〔４０〕 ロボットツールが、自動ピペッティング装置と、任意に反応容器を開閉するための手段とを含有してなる、前記〔３１〕〜〔３９〕いずれかに記載の装置。
〔４１〕 ロボットツールが、第１保持装置と第２保持装置との間で、反応容器を輸送するための手段を含有してなる、前記〔３１〕〜〔４０〕いずれかに記載の装置。
〔４２〕 磁性コアと、ＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、アルカリ金属酸化物、ならびに任意にＡｌ２ Ｏ３ およびアルカリ土類金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる磁性ガラス粒子。
〔４３〕 ガラスコートが、ＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ およびＮａ２ Ｏ、またはＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、Ａｌ２ Ｏ３ 、Ｋ２ ＯおよびＣａＯを含んでなる、前記〔４２〕記載のガラス粒子。
【図面の簡単な説明】
【００７８】
【図１】図１は、本発明の装置の第１の態様の概略図である。
【図２】図２は、本発明の装置の第２の態様の概略図である。
【図３】図３は、本発明の装置の第３の態様の概略図である。
【図４】図４は、マニュアル試料調製および半自動化試料調製を用いたＰＣＲによるクラミジア検出の結果を示す。
【図５】図５は、半自動化試料調製と試料調製中に様々な温度プロファイルを用いたＰＣＲによるクラミジア検出の結果を示す。
【図６】図６は、マニュアル試料調製（標準プロトコール）と室温での半自動化試料調製を用いたＰＣＲによるＨＩＶ検出の結果を示す。
【技術分野】
【０００１】
本発明は、試料中の被検物、特に、核酸のその後の検出のための、生体試料を調製する方法等に用いることができる新しい磁性色素に関する。
【背景技術】
【０００２】
試料調製は、しばしば、生体試料中の被検物を検出する方法での特殊な要求を満たす必要がある。一方では、被検物は、極めて低濃度でしばしば存在し、他方では、その被検物の単離または測定に干渉しうる多くの他の物質がその試料中に存在する。
【０００３】
特許文献１は、液体中に被検物を含む試料を、本質的に細孔を持たないか、直径＜１０ｎｍの細孔を有するガラス外表面を有する磁性粒子と、該被検物が該粒子表面に結合するような条件下に接触させ、結合した被検物を試料液から分離する、被検物、特に、核酸を生体試料から単離する方法を開示する。特許文献１に記載の方法は、生体試料から被検物を精製することには極めて適している。しかしながら、容易には自動試料調製に応用できない。
【０００４】
また、非特許文献１は、サイズに応じて分画された酸化ケイ素を用いる、生体試料から核酸を精製するためのプロトコールを記載する。しかしながら、この方法は、複雑で、自動化には適さず、さらに、キャリーオーバーの危険がある。
【０００５】
特許文献２に記載の核酸抽出方法では、試料を溶解し、該試料中に存在する核酸を超常磁性金属粒子に結合させ、これらを試料容器からピペットで取り出すことで、他の試料成分から分離する。本方法の短所は、被検物を試料からピペットで取り出さなければならないという必要性のために損失がおこるであろう。さらに、いくつかの反応容器の使用のため、キャリーオーバーと汚染の危険がある。
【特許文献１】国際公開第９６／４１８１１号パンフレット
【特許文献２】欧州特許出願公開第０ ７５７ １０６号明細書（ＥＰ−Ａ−０ ７５７ １０６）
【非特許文献１】Ｂｏｏｍら（Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２８（１９９０）４９５−５０３）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明の課題は、従来技術の状況の短所が少なくとも部分的には排除されている、新しい試料調製法等に用いることができる新しい磁性色素を提供することであった。具体的には、新しい方法を自動化することが可能であり、できる限り単純な温度プロファイルを持つべきである。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本課題は、
（ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が該吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）反応容器から非結合試料成分を除去するステップ、
（ｅ）被検物が吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートし、
（ｆ）該吸着マトリックスから溶出物を分離するステップ、
を含む、生体試料からの被検物の単離方法に用いられて達成される。
【０００８】
本発明のもう一つの側面は、
（ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が該吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）該吸着マトリックスから非結合試料成分を分離するステップ、
（ｅ）被検物が該吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｆ）溶出物を該吸着マトリックスから分離するステップ、を含み、少なくともステップ（ｃ）と（ｄ）とが本質的に同じ温度で行なわれる、
生体試料からの被検物の単離方法に用いられる磁性色素である。
【０００９】
即ち、本発明は、
〔１〕 磁性コアと、ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、アルカリ金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる磁性ガラス粒子、
〔２〕 ガラスコートがさらにＡｌ2Ｏ3 およびアルカリ土類金属酸化物を含む、前記〔１〕記載の磁性ガラス粒子、ならびに
〔３〕 ガラスコートが、ＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 およびＮａ2Ｏ、またはＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、Ａｌ2 Ｏ3、Ｋ2 ＯおよびＣａＯを含んでなる、前記〔１〕または〔２〕記載の磁性ガラス粒子
に関する。
【発明の効果】
【００１０】
本発明の磁性色素は、試料中の被検物、特に、核酸のその後の検出のための、生体試料を調製する方法等を簡略化することができるという優れた効果を奏する。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１１】
本発明の方法は、試料溶解緩衝液の存在下での固体吸着マトリックスへの被検物の選択的結合に基づき、ここで、好ましくは、ＤＮＡ、例えば、染色体ＤＮＡ、断片化された染色体ＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ、ウイルスＤＮＡなど、またはＲＮＡ、例えば、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｒＲＮＡもしくはウイルスＲＮＡなどの核酸である被検物は、タンパク質や細胞片などの試料の不純物から分離される。前記試料は、血液、血漿、尿などの体液、組織試料、培養細胞の試料などのいかなる生体試料でもよい。
【００１２】
本発明の方法で使用される吸着マトリックスは、前記反応条件下で、被検物の実質的に選択的な結合を保証できる。粒子状の吸着マトリックス（好ましくはガラス表面を含有するもの）を使用することが好ましい。磁性ガラス粒子（特に、本質的に細孔を持たないか、直径が１０ｎｍ未満の細孔を持つガラス外表面を有する国際公開第９６／４１８１１号パンフレットに記載の磁性粒子）は、特に好ましい。１０〜６０μｍの粒子サイズを持つ強磁性粒子は、特に好ましい。そのような粒子は、例えば、雲母とその上に固定化された磁性粒子とで作製されたコアであって、ガラスの層で包まれているものを含有しうる。国際公開第９６／４１８１１号パンフレットでは、磁性粒子は、個々の反応容器に固体型として、例えば、錠剤または粉末として、入れられるが、本発明の磁性粒子を懸濁物の形態で使用される。約５〜２０ｍｇ／ｍｌの濃度のアルコール懸濁物は特に好適であることが判明した。意外にも、この磁性ガラス粒子の高い比重（ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｄｅｎｓｉｔｙ）にも関わらず、その懸濁物は、極めて再現性よく保存容器から抜き取ることができ、それがこの方法の自動化を可能にすることがわかった。
【００１３】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットに記載のガラス粒子は、本発明の方法に良好な結果を与えるが、特に良い結果は、そのガラス相が下記金属酸化物：ＳｉＯ2 、Ｂ2 Ｏ3 、アルカリ金属酸化物、例えば、Ｋ2Ｏおよび／またはＮａ2 Ｏなど、ならびに任意にＡｌ2 Ｏ3 とアルカリ土類金属酸化物、例えば、ＣａＯなど、を含むガラス粒子で得られる。これらの金属酸化物の含有量は、好ましくは次のとおりである：５０〜９５モル％ ＳｉＯ2 、０．２〜３０モル％ Ｂ2 Ｏ3 、０〜１０モル％ Ａｌ2 Ｏ3、０〜２０モル％ アルカリ土類金属酸化物および０．２〜２０モル％ アルカリ金属酸化物であり、各パーセンテージは、前記ガラス相の総重量に基づく。
【００１４】
ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、Ｋ2 Ｏ、Ａｌ2 Ｏ3 およびＣａＯを含むガラス相は、ＲＮＡの単離に特に適していることが判明している。ＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 およびＮａ2 Ｏを含むガラス相は、ＤＮＡの単離に特に適していることが判明している。
【００１５】
本発明の方法では、吸着マトリックスは、好ましくは、試料中に存在する被検物、特に、核酸を定量的に結合するのに必要とされる最少量に相当する量で加えられるか、あるいはその量は、それよりいくらか多く、この量を好ましくはせいぜい５０％、特に好ましくはせいぜい２０％上回る。様々なタイプの試料中の核酸の予想量は、−それが既知でない場合には−、一般的技術、例えば、フェノール／クロロホルム抽出とそれに続く光学密度の測定などによって前もって決定できる。
【００１６】
本発明の方法のステップ（ａ）は、反応容器中で試料を溶解することを含む。通常、この溶解は、試料中に存在する細胞を変性条件下で溶解することによって、例えば、プロテアーゼと変性緩衝液を添加することにより行なわれる。プロテイナーゼＫ、プロナーゼ、エラスターゼおよび／またはリゾチームをプロテイナーゼとして使用することが好ましい。プロテイナーゼＫの使用は特に好ましい。
【００１７】
プロテアーゼ消化は、カオトロピック化合物、例えば、尿素または尿素誘導体、好ましくは、カオトロピック塩−特に好ましくはグアニジニウム塩酸塩（特にＤＮＡの単離用）やグアニジニウムチオシアネート（特にＲＮＡの単離用）などのグアニジニウム塩または過塩素酸塩もしくはヨウ化物−を含む変性緩衝液中で行なわれる。グアニジニウム塩については、１〜３モル／ｌの範囲の濃度が好ましい。
【００１８】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットに記載の試料調製法とは対照的に、固体吸着マトリックスは、試料を溶解した後に専ら添加される。本手順は、吸着マトリックスへの不要な試料成分、例えばタンパク質などの、より顕著に低い非特異的結合をもたらす。
【００１９】
ステップ（ｃ）では、溶解緩衝液中で好ましくはカオトロピック条件下でインキュベートすることにより、被検物が吸着マトリックスに選択的に結合される。
【００２０】
本発明の方法のステップ（ｄ）は、吸着マトリックスからの非結合試料成分の分離を含む。本目的のため、非結合試料成分を反応容器から除去することが好ましい。これは、任意に数回、少なくとも５０％（ｖ／ｖ）、特に好ましくは少なくとも６０％（ｖ／ｖ）の量のエタノール、プロパノールおよびアセトンなどの、水と混和する溶媒を含有することが好ましい洗浄緩衝液を加えて除去することによって達成される。
【００２１】
本発明の方法のステップ（ｃ）、（ｄ）および／または（ｅ）は、好ましくは、外部手段を加えないで連続的または間欠的（すなわち混合相と、反応溶液が静止している相とが交互にくる）に混合しながら行なわれる。この混合は、好ましくは、反応容器をその縦軸を中心として、回転方向を数回逆転させながら回転させることによって行なわれる。前記混合容器は、特に好ましくは、正確にその縦軸のまわりを回転し、回転方向の変更は、液体のメニスカスのたわみが前もって定めたカットオフ値未満にとどまるように行なわれる。かかる混合方法は、国際公開第９１／１５７６８号パンフレットと欧州特許出願公開第０ ４３５ ４８１号明細書（ＥＰ−Ａ−０ ４３５ ４８１）に記述されている。
【００２２】
ステップ（ｃ）および／または（ｅ）の継続時間は、好ましくはせいぜい２０分であり、連続的混合または短周期、好ましくは最大２分の好ましい短周期での間欠的混合を含む。特に良い結果は、２０秒間の混合と４０秒間の静止とを含む１分周期での間欠的混合によって得られた。
【００２３】
磁性粒子を吸着マトリックスとして使用する場合、反応容器に液体を添加すること、連続的に混合しながら液体を反応容器から吸引することが可能であり、吸引工程の間、該粒子は、反応容器中に保持される。この混合手順により、本発明の方法は、様々なタイプの試料に適合するように柔軟に調節することが可能にする。さらに、液相に磁性粒子の均一な分布が常にあることを保証する。
【００２４】
本発明の方法のステップ（ｅ）は、吸着マトリックスからの被検物の溶出を含む。先行技術から知られているように、これには、本質的に有機溶媒を含まない低塩緩衝液を使用できる。しかしながら、意外にも、溶出緩衝液は、酵素、例えば核酸を操作するために使用されるＲＮアーゼ、ＤＮアーゼ、制限エンドヌクレアーゼ、リガーゼ、ターミナルトランスフェラーゼおよび／またはポリメラーゼなどの酵素などのさらなる試薬類を含みうることがわかった。被検物が例えばＤＮＡである場合、不要なＲＮＡの含有量を減少させるために、溶出時に、ＤＮアーゼ−フリーのＲＮアーゼを加えることが可能である。一方、被検物がＲＮＡである場合、溶出時にＲＮアーゼ−フリーのＤＮアーゼを加えることが可能である。制限エンドヌクレアーゼなどの他の酵素も同様の方法で加えうる。本発明の方法によって単離される核酸が続いて増幅にかけられる場合は、その溶出時に、増幅緩衝液、ヌクレオチド類、プライマー、ポリメラーゼおよび緩衝塩類を含む核酸増幅マスターミックスも加えることができる。
【００２５】
本発明の方法のステップ（ｆ）は、吸着マトリックスから溶出物を分離することを含む。この分離は、通常の方法、例えば沈降によって行なうことができるが、好ましくは磁性分離によって行なう。
【００２６】
本発明の方法によって単離された被検物は、続いて公知の方法で、例えば、核酸の場合であれば、増幅とそれに続く検出や、先に増幅を行なわない検出もしくは配列決定などによってさらに処理できる。この目的のために、様々な被検物は、ＨＩＶ、ＨＣＶ、ＨＢＶなどの様々なウイルスなど溶出物のアリコートで決定されうる。
【００２７】
本発明の方法の重要な特徴は、多くのステップを、または任意に全てのステップでさえ、本質的に同じ温度（すなわち±２．５℃の温度範囲内）で行なうことができるという点である。この温度は、好ましくは室温から７０℃まで、特に好ましくは室温から４０℃までの範囲にあり、最も好ましくは室温、すなわち約１８〜３２℃である。本発明の方法の好ましい態様では、少なくともステップ（ｃ）の吸着とステップ（ｄ）の洗浄とがこの温度で行なわれる。他のステップ、特にステップ（ａ）の溶解および／またはステップ（ｅ）の溶出も、この温度で行なうことが特に好ましい。例えば、血液試料中のＨＩＶの決定のために、全試料調製を一律の温度で行なうことができる。任意に、本発明の方法のステップ（ｆ）の後に、特定の被検物についての増幅収率を向上させる、上昇された温度における後処理ステップを追加してもよい。他の被検物には、前処理および／または上昇された温度における溶出を行なう必要があるかもしれない。この場合、前記上昇された温度は、４０℃を超える温度から９５℃まで、例えば約７０℃の範囲にあることが好ましい。
【００２８】
本発明の方法は、自動装置で行なわれることが好ましい。そのような装置の例を以下に記載する。また本発明の試料調製法では、少なくともステップ（ａ）から（ｅ）を一つの反応容器で行なうこと、すなわち別の反応容器への移動がないことも好ましい。このことは、その方法をかなり簡略化すると共に、汚染の危険の低下にもつながる。
【００２９】
本発明のさらなる主題は、
（ａ）プロテアーゼ、
（ｂ）試料溶解緩衝液、
（ｃ）洗浄緩衝液、
（ｄ）溶出緩衝液、および
（ｅ）磁性ガラス粒子の懸濁物、
を含有してなる、特に上述の方法を実施するのに適した試薬キットである。
【００３０】
本発明のさらなる主題は、そのガラス相がＳｉＯ2 、Ｂ2 Ｏ3 およびＮａ2 Ｏを含む磁性ガラス粒子を含有したＤＮＡ単離用試薬キットと、そのガラス相がＳｉＯ2、Ｂ2 Ｏ3 、Ａｌ2 Ｏ3 、ＣａＯおよびＫａ2Ｏを含む磁性ガラス粒子を含有したＲＮＡ単離用試薬キットである。
【００３１】
最後に、本発明の他の主題は、
−試料調製装置（１）、
−試薬用保持装置（２）、
−７０℃以下、特に、４０℃以下の操作温度を具備する試料調製用反応容器のための第１保持装置（３）、
−冷却手段および／または加熱手段を任意に含む、反応容器のための第２保持装置（４ａ、４ｂ、４ｃ）、および
−ロボットツール装置（５）
を含有した、生体試料から被検物を単離するための装置である。
【００３２】
本発明の装置は、好ましくは試料調製の４つの主要ステップ、すなわち試料の溶解、放出された被検物、例えば核酸の固体吸着マトリックス、例えば磁性ガラス粒子への吸着、該吸着マトリックスの洗浄、および該吸着マトリックスからの被検物の溶出を実施するのに、１つの反応容器が使用されるように設計される。
【００３３】
本装置は、試料調製用の反応容器を保持するための第１保持装置が、少なくとも、固体吸着マトリックスへの被検物の吸着のため、該吸着マトリックスの洗浄とに使用されるように設計される。また、好ましい態様では、前記第１保持装置が、試料溶解および／または吸着マトリックスからの被検物の溶出に使用される。試料調製用の反応容器は、好ましくは少なくとも１ｍｌ、例えば１〜５ｍｌの容量を有する。
【００３４】
第２保持装置は、被検物を保存および／またはさらに処理するための反応容器、例えば、通常、試料の調製に使用される反応容器とは異なる形状を持つＰＣＲ容器などのために設計される。保存および／または追加処理用の反応容器は、好ましくは５００μｌまで、例えば、５０〜２００μｌの容量を有する。さらに第２保持装置は、被検物を含む試料を処理するのに必要な試薬類、例えば、ＰＣＲマスターミックスのための容器を含むことができる。
【００３５】
本発明の装置は、試料調製の１もしくは数ステップおよび／または後処理ステップを、第２保持装置中において、高温で行なわれうるように設計できる。本目的のために、第２保持装置は、試料の溶解、吸着マトリックスからの試料の溶出および溶出後の後処理ステップから選択された少なくとも一つの処理ステップのための反応容器を保持するように設計できる。
【００３６】
第１保持装置は、好ましくは磁性分離のための手段を含む。また、反応容器を混合する、具体的には、それらをその縦軸を中心として回転させることによって混合するための手段を含むことが好ましい。そのような手段は、第２保持装置に任意に供給されてもよい。
【００３７】
ロボットツールは、一般に自動ピペッティング装置を含有し、任意に、例えば第１保持装置と第２保持装置との間で反応容器を輸送するための手段を含有する。また、キャップ開閉ユニットを組み込んでもよい。
【００３８】
本発明の装置の特定の態様を以下に詳細に示す。図１に示す態様では、試料調製装置（１）は、試薬用保持装置（２）と、混合および磁性分離機能を持ち、好ましくは４０℃以下の温度、特に好ましくは室温を与える試料調製用反応容器のための保持装置（３）とを含む。本装置は、さらに別の反応容器（４ａ）（例えば４℃から室温までの温度を有するＰＣＲ容器のための保持ステーションを含有する。本装置は、さらに、Ｘ、ＹおよびＺ方向の移動を可能にする、ピペッティングと反応容器を取り扱うための自動装置（５）を含む。本発明の装置の本態様では、試料調製の４つの主要ステップ、すなわち溶解、吸着、洗浄および溶出が、第１保持装置中の単一の反応容器で行なわれる。溶出物は、保存され、さらなる試薬類、例えばＰＣＲマスターミックスが第２保持装置で加えられる。さらなる処理、例えば、続いてＰＣＲを行なうために、容器を適切な装置、例えばサーモサイクラー（示していない）に移す。
【００３９】
図２に示す態様では、装置が、さらなる処理用の反応容器、例えばＰＣＲ容器を保持するように設計され、かつ、４℃（ＰＣＲマスターミックスの冷却）から吸着マトリックスから溶出した後に、溶出物を加熱するための９５℃までの温度を設定するための具備を持つ、第２保持装置（４ｂ）を含む。キャップカウンター加熱（ｃａｐ ｃｏｕｎｔｅｒ−ｈｅａｔｉｎｇ）は、ＰＣＲ容器のキャップでの結露を防ぐのに好ましい。
【００４０】
図３に示す本発明の装置の態様は、ＰＣＲ容器と試料調製容器をも保持するように設計された反応容器用第２保持装置（４ｃ）が設けられている。この第２保持装置では、例えば４℃までの冷却と例えば９５℃までの加熱とが、溶解物および／または溶出物を加熱するために可能である。この場合も、反応容器のキャップでの結露を防止するためにキャップカウンター加熱が施される。
【００４１】
本発明のさらなる態様（図示していない）では、第１保持装置は、≦７０℃の範囲の温度を設定するように設計される。第２保持装置は、−図３に示すように−試料処理容器と試料調製容器とを冷却し加熱するのに適している。
【００４２】
本発明の装置は、特に上述したような方法で使用できる。
【００４３】
さらに本願を図面と実施例により、より詳細に説明する。
【００４４】
実施例１．磁性ガラス粒子の調製
２種類のゾルを使用した。前記ゾルは、下記：
ゾル１：（ＳｉＯ2 ：Ｂ2Ｏ3 ：Ｎａ2 Ｏ＝４０：８：２）
として調製した。
【００４５】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットの実施例１および２の手順と同様に、酸化物のアルコラートを上記のモル比で共に撹拌し、均一な相を形成させた。しかしながら、変更点は、ＨＣｌを使用しなかったことである。
【００４６】
次に、１００ｍｌのゾル中３０ｇのイリオジン６００黒雲母（ｉｒｉｏｄｉｎ ６００ Ｂｌａｃｋ Ｍｉｃａ）（Ｍｅｒｋ）を撹拌した。
【００４７】
ゾル２：（ＳｉＯ2 ：Ｂ2 Ｏ3 ：Ｋ2 Ｏ：Ａｌ2 Ｏ3 ：ＣａＯ＝７６：１５：５：２：２）
【００４８】
国際公開第９６／４１８１１号パンフレットの実施例１および２に記載の手順と同様に、酸化物のアルコラートを上記のモル比で共に撹拌し、均一な相を形成させた。しかしながら、変更点は、ＨＣｌを使用しなかったことである。
【００４９】
次に、ゾル１００ｍｌ中３０ｇのイリオジン６００黒雲母（ｉｒｉｏｄｉｎ ６００ Ｂｌａｃｋ Ｍｉｃａ）（Ｍｅｒｋ）を撹拌した。
【００５０】
次に前記ゾルを噴霧乾燥処理に供した。
【００５１】
噴霧乾燥により、得られた粉末を沈降による微粉の分離、窒素雰囲気下（６０ｌ／ｈ体積流量）に１Ｋ／分の加熱速度での温度処理にかけ、６００〜７００℃の範囲の圧縮温度で１時間維持した。次に、オーブンを３００℃に冷却し、この温度で１時間、酸素でフラッシュした。室温に冷却した後、磁性ガラス粒子を取り出し、粗い物質を分離するために、５０μｍ篩を篩にかけた。
【００５２】
ゾル１から得られる磁性ガラス粒子は、ＤＮＡの単離に特に適している。ゾル２から得られるガラス粒子は、ＲＮＡの単離に特に適している。
【００５３】
２．核酸、例えばＤＮＡの単離のための試料調製用の標準プロトコール
下記標準プロトコールは、全血や培養細胞などの生体試料から核酸を単離するのに適している。この方法で得られる核酸は、ＰＣＲによる増幅、制限消化またはサザンブロットに、溶出後直接使用できる。
【００５４】
反応キットは、
１．結合緩衝液（４．７モル／ｌ グアニジニウム塩酸塩、１０ｍｍｏｌ／ｌ 尿素、１０ｍｍｏｌ／ｌ トリス塩酸、２０％ ＴｒｉｔｏｎR Ｘ−１０ ０、ｐＨ５．７）
２．凍結乾燥プロテイナーゼＫ（濃度２０ｍｇ／ｍｌまでＨ2 Ｏに溶解）
３．洗浄緩衝液〔５６％（ｖ／ｖ）エタノール、２０ｍｍｏｌ／ｌ ＮａＣｌ 、１０ｍｍｏｌ／ｌ トリス塩酸、ｐＨ７．５〕
４．溶出緩衝液（１０ｍｍｏｌ／ｌ トリス ｐＨ８．５）
５．磁性ガラス粒子（ＭＰＧ）
ａ）それぞれが７．５ｍｇのガラス粒子を含む錠剤、又は
ｂ）１５％ガラス粒子のエタノール懸濁物
を含む。
【００５５】
キット成分は、安定であり、室温で保存できる。プロテイナーゼＫの水への溶解後は、溶液を等分して−２０℃で保存すべきである。凍結溶液は、１２ヶ月間安定である。
【００５６】
標準プロトコール
１． 試料２００μｌを２ｍｌ反応容器に添加し、２００μｌの結合緩衝液およびプロテイナーゼＫ溶液４０μｌとに混合する。次に、それを１０分間インキュベートする。インキュベーションは、好ましくは、室温で行なう。しかしながら、特定の状況下では、インキュベーション温度を７０℃まで上げることもできる。
２． インキュベーション後に、イソプロパノール２００μｌとＭＧＰ錠剤（または二者択一的にＭＧＰ懸濁物２００μｌ）を加え、室温で５分間インキュベートする。
３． 反応容器を磁性粒子分離装置（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｍａｎｎｈｅｉｍ社、カタログ番号１ ６４１ ７９４）に入れ、約１分間分離する。
４． 上清を捨て、反応容器をＭＰ分離装置から取り出す。
５． 洗浄緩衝液５００μｌの添加後に、その反応容器の内容物を混合し、再びＭＰ分離装置に約１分間入れる。
６． 上清を捨てる。ステップ５を３回繰り返す。直前の洗浄処理後に、残留している洗浄緩衝液を完全に除去する。
７． 溶出のために、７０℃に任意に予備加熱される１００μｌの溶出緩衝液を加える。次にそれを混合し、室温で５分間インキュベートする。試料をＭＰ分離装置に入れ、その上清を新しい反応容器に移す。
８． この方法で得られた核酸、例えばＤＮＡは、安定であり、ついで、さらに直接処理されるか、４℃で保存されうる。
【００５７】
上記のプロトコールは、マイクロタイタープレート、例えばディープウェルマイクロタイタープレート（例えば、Ｒｉｔｔｅｒ、Ｊ．Ｊ．Ｂｉｏａｎａｌｙｔｉｃ）にも同様に使用されうる。
【００５８】
３．ＰＣＲによるクラミジア・トラコーマティスＤＮＡ検出
３．１ 試料調製のためのマニュアル標準プロトコール
２００μｌの尿試料と２４０μｌの結合緩衝液／プロテイナーゼＫ溶液（５：１）とを２ｍｌ反応容器にピペッティングし、ボルテックス混合に供して、７０℃で１０分間インキュベートする。次に、試料を５分間室温に冷却する。
【００５９】
前記試料にＭＧＰのイソプロパノール溶液２００μｌをピペットで加える。その後直ちにボルテックス混合する。次に前記試料を、例えば、サーモミキサー ５４３６〔エッペンドルフ（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ）〕などのミキサー中で１５分間インキュベートする。
【００６０】
試料を磁性分離装置に移すことによってＭＧＰを濃縮する。１分後に上清をピペットで完全に除去する。
【００６１】
ＭＧＰに０．５ｍｌの洗浄緩衝液をピペットで加える。試料をボルテックス混合に供した後、磁性分離装置に移す。１分後に上清をピペットで除去する。この洗浄手順をさらに２回繰り返す。
【００６２】
ＭＧＰに２００ｍｌの溶出緩衝液を加える。試料をサーモミキサー中、１４００ｒｐｍ、７０℃で１０分間インキュベートする。結露した水を短い遠心分離により集める。試料を磁性分離装置に移し、１分後に１８０μｌの溶出物を取り出す。前記溶出物を新しい反応容器にピペッティングし、４℃（保存期間が＜２４時間の場合）または−２０℃（より長い保存期間の場合）で保存する。
【００６３】
５０μｌの溶出物をＰＣＲに使用する：評価は、電気化学発光による。
【００６４】
３．２ 半自動化処理に関するプロトコール
３．１に記載のボルテックス混合とサーモブロックでの加熱の代わりに、混合と加熱とが混合および加熱モジュールで行なわれる半自動化処理を行なう。図４は、マニュアル標準プロトコール（ボルテックス）と半自動化処理（ＭＴＭ）との間のクラミジアの決定（試料：尿１００ｍｌにつき１００基本抗体（ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ａｎｔｉｂｏｄｙ）；６重測定）の比較を表す。自動化によって感度が損なわれないことがわかる。
【００６５】
３．３ 室温での半自動化プロトコール
試料調製を３．２項に記述したように行なう。しかしながら、溶解および溶出を室温で行なう。
【００６６】
３．４ 室温での半自動化試料調製プロトコールとその後の溶出物の後処理
３．３項に記載のように試料調製を行なう。溶出後に、７０℃で１０分間のインキュベーションを行なう。
【００６７】
図５は、セクション３．２、３．３および３．４に記載の試料調製プロトコール間のクラミジアの決定（試料：ＳＷＥ１、０クラミジア基本抗体（ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ａｎｔｉｂｏｄｙ；ＥＡＢ）／ｍｌ尿、ＳＷＥ２：１０ＥＡＢ／ｍｌ尿、ＳＷＥ３：１００ＥＡＢ／ｍｌ尿およびＳＷＥ４：１０００ＥＡＢ／ｍｌ尿）の比較を表わす。標準プロトコールが室温での試料調製（ＲＴプロトコールＭＴＭ）と比較して、クラミジアの決定に関してより高感度であることがわかる。しかしながら、室温での試料調製とその後の溶出物の後処理（後処理を伴うＲＴプロトコールＭＴＭ）の結果は、この効果がほとんど補われうることを示している。したがって、試料調製そのものの間には温度ステップが必要でないということは意外である。
【００６８】
溶解、吸着、洗浄および溶出の各ステップを≦４０℃の温度で行なうことができ、キャップカウンター加熱と温度調節が必要でないので、それによって自動化が簡略化されるため、本知見により、試料調製処理をかなり簡略化することができる。
【００６９】
４．ＰＣＲによるＨＩＶ−ＲＮＡ検出
４．１ 試料調製に関するマニュアル標準プロトコール
凍結血漿を３７℃で５分間融解し、さらなる処理のために氷上で冷却する。
【００７０】
５０μｌのプロテイナーゼＫ溶液（２５ｍｇ／ｍｌ）を１．５ｍｌのＳａｒｓｔｅｄｔ反応容器にピペッティングする。２５０μｌの試料をこれに加え、ボルテックスミキサーで混合する。次に３００μｌの溶解緩衝液を加え、再びボルテックス混合する。
【００７１】
これを１３，０００ｒｐｍのエッペンドルフ ミキサー上、室温で１０分間インキュベートする。次に３００μｌのＭＧＰ懸濁物（６ｍｇ／ｍｌ ＭＧＰ、イソパノール中）を加え、ボルテックス混合し、継続して混合しながら室温で２０分間インキュベートする。ＭＧＰを磁性分離装置で分離し、その上清を完全に取り除く。
【００７２】
前記ＭＧＰに洗浄緩衝液７５０μｌを加える。ＭＧＰを再懸濁し、上述のように分離する。洗浄操作を４回繰り返し、最後に洗浄緩衝液を注意深く取り除く。
【００７３】
次に溶出緩衝液１００μｌを加え、ＭＧＰを再懸濁する。エッペンドルフ サーモミキサー（１３，０００ｒｐｍ）上、８０℃で１５分間のインキュベーション後に、９０μｌの溶出物を新しい反応容器に移す。続いて行なうＲＴ−ＰＣＲによるＨＩＶ決定には、４０μｌの溶出物を使用する。
【００７４】
４．２ 試料調製に関する半自動化標準プロトコール
混合と加熱とを混合および加熱モジュールで行なったこと以外は、セクション４．１に記述したように試料調製を行なう。
【００７５】
４．３ 室温での半自動化プロトコール
すべてのステップを室温で行なうこと以外は、本質的に４．２項に記述したように試料調製を行なう。溶解、吸着および溶出のためのインキュベーション期間は、各ケースで１５分である。
【００７６】
図６に見られうるように、自動化と室温での試料調製（ＲＴプロトコールＭＴＭ）は、マニュアル試料調製での標準プロトコール（マニュアル）と比較して感度を損ねない。陰性、低陽性、中陽性および高陽性血漿試料で、再現性ある結果が得られる。
【００７７】
本発明の態様として、以下のものが挙げられる。
〔１〕 （ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が該吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）該反応容器から非結合試料成分を除去するステップ、
（ｅ）被検物が該吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートするステップ、および
（ｆ）該吸着マトリックスから溶出物を分離するステップ、
を含む、生体試料から被検物を単離する方法。
〔２〕 ステップ（ａ）がプロテアーゼと変性緩衝液とを添加することを含む、前記〔１〕記載の方法。
〔３〕 プロテアーゼとして、プロテイナーゼＫを使用する、前記〔２〕記載の方法。
〔４〕 グアニジニウム塩、特に、グアニジニウム塩酸塩および／またはグアニジニウムチオシアン酸塩を含む変性緩衝液を用いる、前記〔２〕記載の方法。
〔５〕 固体吸着マトリックスとして、磁性ガラス粒子を用いる、前記〔１〕〜〔４〕いずれかに記載の方法。
〔６〕 懸濁物の形態で磁性ガラス粒子を添加する、前記〔５〕記載の方法。
〔７〕 ガラス相がＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ およびＮａ２ Ｏを含むもの、またはＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、Ａｌ２ Ｏ３ 、ＣａＯおよびＫ２ Ｏを含むものであるガラス粒子を用いる、前記〔５〕または〔６〕記載の方法。
〔８〕 吸着マトリックスの添加量が、試料中に存在する被検物を定量的に結合するのに要する量の多くて５０％を超える量である、前記〔１〕〜〔７〕いずれかに記載の方法。
〔９〕 少なくともステップ（ｃ）、（ｄ）および／または（ｅ）の間、外部装置を加えることなく、連続的混合または断続的混合を行なう、前記〔１〕〜〔８〕いずれかに記載の方法。
〔１０〕 混合が、反応容器をその縦軸を中心として回転させることにより達成される、前記〔９〕記載の方法。
〔１１〕 ステップ（ｃ）および／または（ｅ）を行なう最大期間がそれぞれ２０分である、前記〔９〕または〔１０〕記載の方法。
〔１２〕 ステップ（ｄ）が、任意に数回繰り返される、洗浄緩衝液の添加および吸引を含む、前記〔１〕〜〔１１〕いずれかに記載の方法。
〔１３〕 水と混和できる有機溶媒を少なくとも５０％（ｖ／ｖ）の含有量で有する洗浄緩衝液を用いる、前記〔１２〕記載の方法。
〔１４〕 ステップ（ｅ）において、酵素などの助剤を添加する、前記〔１〕〜〔１３〕いずれかに記載の方法。
〔１５〕 ステップ（ｅ）における溶出のために、低塩緩衝液を用いる、前記〔１〕〜〔１４〕いずれかに記載の方法。
〔１６〕 ステップ（ｅ）の溶出のために、核酸増幅マスターミックスを添加する、前記〔１〕〜〔１４〕いずれかに記載の方法。
〔１７〕 少なくともステップ（ｃ）および（ｄ）を本質的に同じ温度で行なう、前記〔１〕〜〔１６〕いずれかに記載の方法。
〔１８〕 さらに、ステップ（ａ）および／またはステップ（ｅ）を本質的に同じ温度で行なう、前記〔１７〕記載の方法。
〔１９〕 温度が、室温〜４０℃の範囲にある、前記〔１７〕または〔１８〕記載の方法。
〔２０〕 温度が、１８℃〜３２℃の範囲にある、前記〔１７〕〜〔１９〕いずれかに記載の方法。
〔２１〕 ステップ（ａ）および／またはステップ（ｅ）を上昇された温度で行なう、前記〔１〕〜〔２０〕いずれかに記載の方法。
〔２２〕 上昇された温度における後処理ステップをステップ（ｆ）の後に行なう、前記〔１〕〜〔２１〕いずれかに記載の方法。
〔２３〕 上昇された温度が４０℃を超える温度〜９５℃の範囲にある、前記〔２１〕または〔２２〕記載の方法。
〔２４〕 （ａ）反応容器中において、試料を溶解するステップ、
（ｂ）固体吸着マトリックスを添加するステップ、
（ｃ）被検物が吸着マトリックスに結合するような条件下で、インキュベートするステップ、
（ｄ）吸着マトリックスから非結合試料成分を分離するステップ、
（ｅ）被検物が吸着マトリックスから溶出されるような条件下で、インキュベートするステップ、ならびに
（ｆ）吸着マトリックスから溶出物を分離するステップ、
を含み、ここで、少なくともステップ（ｃ）および（ｄ）を本質的に同じ温度で行なう、生体試料から被検物を単離する方法。
〔２５〕 被検物が核酸である、前記〔１〕〜〔２４〕いずれかに記載の方法。
〔２６〕 方法が自動装置で行なわれる、前記〔１〕〜〔２５〕いずれかに記載の方法。
〔２７〕 ステップ（ａ）〜（ｅ）を１つの反応容器で行なう、前記〔１〕または〔２４〕記載の方法。
〔２８〕 （ａ）プロテアーゼ、
（ｂ）試料溶解緩衝液、
（ｃ）洗浄緩衝液、
（ｄ）溶出緩衝液、および
（ｅ）磁性ガラス粒子の懸濁物、
を含有してなる、前記〔１〕〜〔２７〕いずれかに記載の方法を特に行なうための試薬キット。
〔２９〕 ガラス相がＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ およびＮａ２ Ｏを含むものである磁性ガラス粒子を含有してなる、ＤＮＡの単離用試薬キット。
〔３０〕 ガラス相がＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、Ａｌ２ Ｏ３ 、ＣａＯおよびＫ２ Ｏを含むものである磁性ガラス粒子を含有してなる、ＲＮＡの単離用試薬キット。
〔３１〕 − 試料調製装置（１）、
− 試薬用保持装置（２）、
− ７０℃以下、特に、４０℃以下の操作温度を具備する、試料調製用反応容器のための第１保持装置（３）、
− 冷却手段および／または加熱手段を任意に含む、反応容器のための第２保持装置（４ａ、４ｂ、４ｃ）、
−およびロボットツール装置（５）
を含有してなる、生体試料から被検物を単離するための装置。
〔３２〕 １つの反応容器が、試料を溶解すること、被検物を固体吸着マトリックスに吸着させること、該吸着マトリックスを洗浄すること、および該吸着マトリックスから被検物を溶出することのために用いられる、前記〔３１〕記載の装置。
〔３３〕 第１保持装置が、試料調製用および少なくとも被検物の固体吸着マトリックスへの吸着用並びに該吸着マトリックスの洗浄用の反応容器を保持するために用いられる、前記〔３１〕または〔３２〕のいずれかに記載の装置。
〔３４〕 第１保持装置が、さらに試料調製用、試料溶解用および／または吸着マトリックスからの被検物の溶出用の反応容器を保持するために用いられる、前記〔３３〕記載の装置。
〔３５〕 反応容器を保持するための第２保持装置が、被検物を保存するためおよび／またはさらに該被検物を処理するために用いられる、前記〔３１〕〜〔３４〕いずれかに記載の装置。
〔３６〕 試薬用容器を保持するための第２保持装置が、さらに試料を処理するために用いられる、前記〔３１〕〜〔３５〕いずれかに記載の装置。
〔３７〕 反応容器を保持するための第２保持装置が、試料を溶解すること、吸着マトリックスから試料を溶出することおよび溶出後の後処理ステップから選ばれる、上昇された温度における少なくとも１つの処理ステップのために用いられる、前記〔３１〕〜〔３６〕いずれかに記載の装置。
〔３８〕 第１保持装置が、磁性分離のための手段を含んでなる、前記〔３１〕〜〔３７〕いずれかに記載の装置。
〔３９〕 第１保持装置が、反応容器をその縦軸を中心とした回転により混合するための手段を含んでなる、前記〔３１〕〜〔３８〕いずれかに記載の装置。
〔４０〕 ロボットツールが、自動ピペッティング装置と、任意に反応容器を開閉するための手段とを含有してなる、前記〔３１〕〜〔３９〕いずれかに記載の装置。
〔４１〕 ロボットツールが、第１保持装置と第２保持装置との間で、反応容器を輸送するための手段を含有してなる、前記〔３１〕〜〔４０〕いずれかに記載の装置。
〔４２〕 磁性コアと、ＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、アルカリ金属酸化物、ならびに任意にＡｌ２ Ｏ３ およびアルカリ土類金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる磁性ガラス粒子。
〔４３〕 ガラスコートが、ＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ およびＮａ２ Ｏ、またはＳｉＯ２ 、Ｂ２ Ｏ３ 、Ａｌ２ Ｏ３ 、Ｋ２ ＯおよびＣａＯを含んでなる、前記〔４２〕記載のガラス粒子。
【図面の簡単な説明】
【００７８】
【図１】図１は、本発明の装置の第１の態様の概略図である。
【図２】図２は、本発明の装置の第２の態様の概略図である。
【図３】図３は、本発明の装置の第３の態様の概略図である。
【図４】図４は、マニュアル試料調製および半自動化試料調製を用いたＰＣＲによるクラミジア検出の結果を示す。
【図５】図５は、半自動化試料調製と試料調製中に様々な温度プロファイルを用いたＰＣＲによるクラミジア検出の結果を示す。
【図６】図６は、マニュアル試料調製（標準プロトコール）と室温での半自動化試料調製を用いたＰＣＲによるＨＩＶ検出の結果を示す。
【特許請求の範囲】
【請求項１】
磁性コアと、ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、アルカリ金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる磁性ガラス粒子。
【請求項２】
ガラスコートがさらにＡｌ2Ｏ3 およびアルカリ土類金属酸化物を含む、請求項１記載の磁性ガラス粒子。
【請求項３】
ガラスコートが、ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 およびＮａ2Ｏ、またはＳｉＯ2 、Ｂ2 Ｏ3、Ａｌ2 Ｏ3、Ｋ2 ＯおよびＣａＯを含んでなる、請求項１または２記載の磁性ガラス粒子。
【請求項１】
磁性コアと、ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 、アルカリ金属酸化物を含むガラスコートとを含有してなる磁性ガラス粒子。
【請求項２】
ガラスコートがさらにＡｌ2Ｏ3 およびアルカリ土類金属酸化物を含む、請求項１記載の磁性ガラス粒子。
【請求項３】
ガラスコートが、ＳｉＯ2 、Ｂ2Ｏ3 およびＮａ2Ｏ、またはＳｉＯ2 、Ｂ2 Ｏ3、Ａｌ2 Ｏ3、Ｋ2 ＯおよびＣａＯを含んでなる、請求項１または２記載の磁性ガラス粒子。
【図１】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【図２】
【図３】
【図４】
【図５】
【図６】
【公開番号】特開２００８−１３４２３９（Ｐ２００８−１３４２３９Ａ）
【公開日】平成２０年６月１２日（２００８．６．１２）
【国際特許分類】
【出願番号】特願２００７−２８０１７９（Ｐ２００７−２８０１７９）
【出願日】平成１９年１０月２９日（２００７．１０．２９）
【分割の表示】特願２０００−５１３８６３（Ｐ２０００−５１３８６３）の分割
【原出願日】平成１０年９月２９日（１９９８．９．２９）
【出願人】（５９９０４４４７８）ロシュ ダイアグノスティックス ゲーエムベーハー (2)
【Ｆターム（参考）】
【公開日】平成２０年６月１２日（２００８．６．１２）
【国際特許分類】
【出願日】平成１９年１０月２９日（２００７．１０．２９）
【分割の表示】特願２０００−５１３８６３（Ｐ２０００−５１３８６３）の分割
【原出願日】平成１０年９月２９日（１９９８．９．２９）
【出願人】（５９９０４４４７８）ロシュ ダイアグノスティックス ゲーエムベーハー (2)
【Ｆターム（参考）】
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