【課題】不死化し変形した細胞にしばしば起こる、遺伝子のメチル化現象を解明し、腫瘍抑制に有用なメチル化遺伝子の新規な検査法を提供する。
【解決手段】ヌクレオチド配列対照物（一以上の既知の場所にメチルシトシン、未修飾シトシン、ウラシルをもつ合成ヌクレオチド）の連結によりプラスミドを造り、このプラスミドを線状にしてゲノム核酸サンプルの模倣体を産生し、この模倣体をメチル化検査法に供し、メチル化検査法の有効性を評価するための方法に使用する。 （もっと読む）

【課題】本発明は、すい臓がんを診断する方法を提供する。
【解決手段】本発明は、原発不明転移の原発巣を同定する方法を提供する。その方法は、転移性細胞を含むサンプルを入手し；少なくとも２つの異なるがんに関連するバイオマーカーを評価し；バイオマーカーから得られたデータを組み合わせ、あるアルゴリズムにして（そのアルゴリズムは、基準に対してバイオマーカーを標準化し；各々のバイオマーカーの感受性と特異性を最適化させるカットオフを課し、それらのがんに係る罹患率を加重し、原発巣組織を選択する）；そのアルゴリズムによって決定された最も高い確率に基づいて原発巣を決定するか、もしくは、そのがんが特定のがん集団に由来しないことを決定し；そして、任意に、１個以上の更なる、異なるがんに特異的なバイオマーカーを評価し、更なるバイオマーカーに対してステップを反復する；ことによる。 （もっと読む）

【課題】高次真核生物ではCpGジヌクレオチドにおいて、DNAは、グアノシンに対して5'に位置するシトシンでのみメチル化される。この修飾は、遺伝子発現に対する重要な調節作用を有する。正常な非メチル化CpG島の異常メチル化は、特定の腫瘍サプレッサー遺伝子または特定のヒト癌の改善に関連するその他の遺伝子の転写不活性化に関連している。良性前立腺過形成と前立腺癌を区別するメチル化特異的PCR(MSP)プライマーおよびプローブのデザイニングは、複雑である。新規のプライマーおよびプローブの組み合わせによって、さらに頑健で、一貫したアッセイを得ることができる。
【解決手段】各種遺伝子のメチル化状態を検出するための方法、キットおよび組成物は、前立腺癌などの増殖性疾患と疑われる疾患を含む各種診断応用で有用である。 （もっと読む）

【課題】原発不明がんの原発巣を同定するための材料、方法、アルゴリズム、キット等を提供する。
【解決手段】本発明は、原発不明転移の原発巣を同定する方法を提供する。その方法は、転移性細胞を含むサンプルを入手し；少なくとも２つの異なるがんに関連するバイオマーカーを評価し；バイオマーカーから得られたデータを組み合わせ、あるアルゴリズムにして（そのアルゴリズムは、基準に対してバイオマーカーを標準化し；各々のバイオマーカーの感受性と特異性を最適化するカットオフを課し、それらのがんに係る罹患率を加重し、原発巣組織を選択する）；そのアルゴリズムによって決定された最も高い確率に基づいて原発巣を決定するか、もしくは、そのがんが特定のがん集団に由来しないことを決定し；そして、任意に、１個以上の更なる、異なるがんに特異的なバイオマーカーを評価し、更なるバイオマーカーに対してステップを反復する；ことによる。 （もっと読む）

【課題】リンパ節陰性患者における遠隔再発の予測に対して、乳癌予後判定手段が、最近、記述されているが、目下、骨への再発リスクに限定した患者の識別に利用できる診断ツールは、ほとんどない。患者の骨への癌再発リスクを具体的に識別し、当該患者が適切な治療を受けるのを確実なものとすることが求められている。
【解決手段】乳癌の骨への再発を予測する方法を、遺伝子群の発現を分析することによって実施する。キットを含有するマイクロアレーなどの様々な媒体での遺伝子発現プロファイルが含まれる。 （もっと読む）

【課題】 甲状腺癌腫と良性甲状腺病変を識別するための、ＤＮＡチップに基づく分析等の分析において使用できる特性を同定する。
【解決手段】 本発明は、甲状腺癌腫の診断、甲状腺癌腫と良性甲状腺病変との間の識別、未確定の甲状腺小結節の甲状腺穿刺吸引試料の検定、ならびに、患者のプロトコルおよび転帰の決定を対象とする方法と、構成物と、物品とを提供する。 （もっと読む）

【課題】エストロゲン受容体の発現状態を決定する方法を提供する。
【解決手段】ＥＲ＋の腫瘍とＥＲ−腫瘍間で有意差のある発現をする、有意なｐ値の１４７の遺伝子および１１２の遺伝子が、ＬＣＭデータセットおよび組織塊データセットそれぞれから同定された。６１の遺伝子は共通のデータセットで見出され、さらに８５の遺伝子がＬＣＭデータセットに特有であり、５１の遺伝子が腫瘍塊データセットにのみ存在した。８５の遺伝子についての遺伝子オントロジーを用いた経路分析により、エンドサイトーシス、セラミド産生、Ｒａｓ／ＥＲＫ／Ａｒｋカスケード、およびＪＡＴ−ＳＴＡＴ経路に関与した遺伝子がＥＲに関係する役割を果たしていることが示唆された。ＬＣＭによって採取した腫瘍細胞の遺伝子プロファイリングは、上皮腫瘍細胞の研究および特徴付け、ならびにＥＲに関連するシグナル伝達経路の知見を得る上で特有のアプローチを提供する。 （もっと読む）

【課題】急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）を有する患者の予後を予測すること。
【解決手段】癌、好ましくは、造血系悪性腫瘍患者を治療する方法は、患者の遺伝子発現プロフィールおよび／または分子マーカーを分析して患者の状態および／または予後を決定することを含む。本発明はまた、非再発性または非難治性患者がファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤（ＦＴＩ）、および、場合によっては他の治療薬による治療に応答する可能性があるかどうか分析する方法も提供する。これらの方法はまた、患者の治療をモニタリングするため、かつ、治療過程を選択するためにも有用である。ＦＴＩ処置に応答して変調される遺伝子が提供され、プロフィールの作成に用いられる。 （もっと読む）

【課題】最近、マイクロアレー遺伝子発現プロファイリングが用いられ、肺腺癌患者の予後サインを定義できるようになったが、扁平上皮癌集団における予後の遺伝子発現プロファイルを調査した大規模な研究は行われていない。
【解決手段】肺癌予後判定を提供する方法が、一群の遺伝子を分析することによって実施される。本願には、マイクロアレーなどの様々な媒体における遺伝子発現プロファイルが、マイクロアレーを含有するキットとして含まれる。 （もっと読む）

【課題】分子マーカーの存在または非存在により、患者がＦＴＩに応答する可能性が高いか否かを決定する治療方法を提供すること。
【解決手段】癌患者、好ましくは悪性血液疾患の患者を治療する方法であって、患者の遺伝子発現プロファイル及び／または分子マーカーを分析して、患者がファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤（ＦＴＩｓ）及び、場合によっては他の薬物での治療に応答する可能性が高いか否かを決定するステップを含む。この方法は、患者の治療の監視及び治療方法の選択に有用である。ＦＴＩ治療に応答して調節された遺伝子を提供し、これを用いて遺伝子発現プロファイルを作成する。 （もっと読む）